View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1343_low_136 (Length: 306)

Name: NF1343_low_136
Description: NF1343
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1343_low_136
NF1343_low_136
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (1-277)||(34963341-34963613)
chr6 (1-277)||(30676632-30676904)
chr6 (1-277)||(19858841-19859107)
chr6 (1-277)||(24422521-24422787)
chr6 (1-277)||(33861768-33862034)
chr6 (1-277)||(33864252-33864518)
chr6 (4-277)||(12742291-12742554)
chr6 (1-277)||(8055003-8055269)
chr6 (1-277)||(18334514-18334780)
chr6 (1-277)||(19005020-19005286)
chr6 (1-241)||(22782231-22782467)
chr6 (1-277)||(1540833-1541099)
chr6 (1-277)||(2291102-2291368)
chr6 (1-277)||(26924562-26924828)
chr6 (1-240)||(25688507-25688742)
chr6 (1-241)||(25656633-25656869)
chr6 (27-277)||(1595523-1595763)
chr6 (49-241)||(25754813-25755001)
chr6 (49-277)||(20556864-20557080)
chr6 (62-229)||(18456735-18456898)
chr6 (63-241)||(3852001-3852175)
chr6 (67-241)||(16448514-16448685)
chr6 (104-229)||(18461895-18462020)
chr6 (62-277)||(19847932-19848145)
chr6 (104-277)||(17287772-17287940)
chr6 (126-277)||(18409825-18409975)
chr6 (104-277)||(25629331-25629499)
chr6 (1-79)||(12942363-12942441)
chr6 (120-271)||(16496227-16496373)
chr6 (123-277)||(20593750-20593899)
chr6 (104-247)||(29060541-29060685)
chr6 (1-78)||(28289257-28289334)
chr6 (104-268)||(20360936-20361095)
chr6 (136-277)||(23992398-23992540)
chr6 (1-74)||(18913994-18914067)
chr6 (149-229)||(18821866-18821946)
chr6 (123-277)||(19303536-19303684)
chr6 (104-277)||(22780203-22780371)
chr6 (5-74)||(18937252-18937321)
chr6 (146-268)||(20638301-20638418)
chr6 (136-277)||(20076677-20076812)
chr6 (79-233)||(25644335-25644487)
chr6 (1-58)||(31630569-31630626)
chr6 (1-78)||(15875469-15875546)
chr6 (120-277)||(25603377-25603535)
chr6 (120-277)||(25611715-25611873)
chr6 (187-277)||(25714394-25714478)
chr6 (1-57)||(23992604-23992663)
chr6 (62-273)||(8227448-8227651)
chr6 (1-42)||(19847890-19847931)
chr6 (187-247)||(27333277-27333338)
chr6 (187-247)||(27394017-27394078)
chr6 (1-45)||(17377770-17377814)
chr6 (104-233)||(20109153-20109283)
chr6 (196-269)||(16965378-16965451)
chr6 (201-270)||(22080799-22080862)
chr6 (196-265)||(16929658-16929727)
chr6 (147-271)||(35245569-35245686)
chr6 (243-275)||(31155504-31155536)
chr6 (1-32)||(1598266-1598297)
chr6 (187-233)||(9098573-9098620)
chr6 (243-277)||(4185928-4185962)
chr6 (243-277)||(4738664-4738698)
chr6 (127-268)||(23019394-23019528)
chr6 (195-247)||(1561304-1561356)
chr6 (195-231)||(28496539-28496575)
chr6 (195-231)||(29808950-29808986)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (1-277)||(32214843-32215115)
chr2 (1-241)||(6725999-6726235)
chr2 (1-241)||(21154982-21155218)
chr2 (1-277)||(18808917-18809183)
chr2 (1-277)||(23709454-23709720)
chr2 (1-277)||(23711935-23712201)
chr2 (1-277)||(39682287-39682553)
chr2 (1-277)||(23130836-23131102)
chr2 (1-277)||(23133303-23133569)
chr2 (1-277)||(34402444-34402710)
chr2 (1-277)||(571371-571637)
chr2 (1-277)||(23135564-23135830)
chr2 (1-277)||(24898117-24898384)
chr2 (1-277)||(24900600-24900867)
chr2 (1-277)||(24903077-24903344)
chr2 (1-277)||(24905554-24905821)
chr2 (1-277)||(24908029-24908296)
chr2 (1-277)||(28577073-28577339)
chr2 (1-277)||(32039420-32039686)
chr2 (1-277)||(24367748-24368014)
chr2 (1-277)||(26505353-26505619)
chr2 (1-277)||(26507831-26508097)
chr2 (1-241)||(22105416-22105653)
chr2 (9-277)||(45029784-45030042)
chr2 (1-241)||(38967378-38967614)
chr2 (63-241)||(43137303-43137477)
chr2 (62-277)||(24529511-24529717)
chr2 (1-160)||(24642776-24642933)
chr2 (104-247)||(23060514-23060658)
chr2 (104-247)||(23076443-23076587)
chr2 (1-79)||(20261381-20261459)
chr2 (104-247)||(22337116-22337260)
chr2 (104-277)||(22731210-22731378)
chr2 (120-277)||(25616156-25616314)
chr2 (147-271)||(38134-38252)
chr2 (104-277)||(22738156-22738323)
chr2 (167-241)||(24643034-24643108)
chr2 (120-271)||(23285848-23285990)
chr2 (120-241)||(298806-298929)
chr2 (64-273)||(19671811-19672010)
chr2 (1-78)||(10684685-10684764)
chr2 (1-78)||(23707244-23707323)
chr2 (1-78)||(24918196-24918275)
chr2 (120-277)||(23660000-23660151)
chr2 (120-271)||(23654378-23654524)
chr2 (1-57)||(25616365-25616421)
chr2 (187-271)||(23040249-23040327)
chr2 (1-78)||(24671081-24671160)
chr2 (187-268)||(7679567-7679647)
chr2 (187-270)||(22134266-22134346)
chr2 (49-122)||(22173799-22173868)
chr2 (64-268)||(23708558-23708752)
chr2 (1-78)||(24681500-24681579)
chr2 (106-271)||(23103375-23103533)
chr2 (62-102)||(29601478-29601518)
chr2 (149-273)||(20309089-20309206)
chr2 (1-42)||(24529469-24529510)
chr2 (127-234)||(28405990-28406099)
chr2 (187-247)||(8946658-8946718)
chr2 (104-174)||(7709-7779)
chr2 (195-233)||(18786971-18787009)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (1-277)||(19618094-19618366)
chr4 (1-277)||(14970629-14970901)
chr4 (1-277)||(15118274-15118540)
chr4 (1-277)||(12229-12495)
chr4 (1-277)||(52312484-52312750)
chr4 (1-241)||(3515011-3515247)
chr4 (1-241)||(18215196-18215432)
chr4 (1-241)||(19242703-19242940)
chr4 (1-277)||(44615262-44615528)
chr4 (1-277)||(18239341-18239607)
chr4 (1-277)||(50222261-50222527)
chr4 (1-277)||(1837431-1837697)
chr4 (1-245)||(15355246-15355487)
chr4 (1-277)||(44773005-44773275)
chr4 (49-241)||(51463838-51464026)
chr4 (49-241)||(23803235-23803423)
chr4 (49-241)||(12610954-12611135)
chr4 (26-277)||(7641139-7641370)
chr4 (62-241)||(44102218-44102393)
chr4 (62-273)||(15402684-15402886)
chr4 (62-271)||(15367673-15367873)
chr4 (62-273)||(15369999-15370200)
chr4 (73-277)||(44928873-44929068)
chr4 (62-273)||(15371183-15371385)
chr4 (62-229)||(21815568-21815731)
chr4 (62-247)||(15373484-15373666)
chr4 (65-271)||(16223515-16223712)
chr4 (67-241)||(20149833-20150004)
chr4 (104-241)||(54798730-54798868)
chr4 (104-271)||(12902740-12902902)
chr4 (127-241)||(14280320-14280434)
chr4 (104-247)||(7798775-7798919)
chr4 (136-277)||(52873375-52873511)
chr4 (104-241)||(8574845-8574981)
chr4 (104-247)||(7088878-7089022)
chr4 (1-79)||(15534343-15534421)
chr4 (1-78)||(36038033-36038110)
chr4 (104-247)||(7893704-7893848)
chr4 (123-241)||(14038655-14038774)
chr4 (104-246)||(22636437-22636580)
chr4 (104-240)||(16377499-16377634)
chr4 (1-78)||(14048740-14048817)
chr4 (1-78)||(15496993-15497070)
chr4 (1-77)||(52873100-52873176)
chr4 (104-277)||(44052806-44052974)
chr4 (68-229)||(22353852-22354010)
chr4 (1-78)||(49547696-49547773)
chr4 (104-247)||(6899892-6900035)
chr4 (1-58)||(362268-362325)
chr4 (1-78)||(14746539-14746618)
chr4 (104-247)||(16270212-16270355)
chr4 (120-243)||(23374351-23374475)
chr4 (120-247)||(16239962-16240089)
chr4 (163-247)||(3096294-3096379)
chr4 (62-229)||(13788-13953)
chr4 (62-233)||(52243131-52243302)
chr4 (195-268)||(39706356-39706423)
chr4 (147-271)||(14053321-14053439)
chr4 (26-78)||(19857607-19857659)
chr4 (64-233)||(43198492-43198661)
chr4 (187-270)||(8846343-8846418)
chr4 (187-268)||(15551803-15551879)
chr4 (187-271)||(17046470-17046549)
chr4 (187-234)||(12774021-12774069)
chr4 (187-233)||(12288269-12288316)
chr4 (105-174)||(15464908-15464977)
chr4 (120-229)||(6190481-6190592)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (1-277)||(13543993-13544265)
chr3 (1-277)||(12567528-12567800)
chr3 (1-277)||(17463152-17463418)
chr3 (1-277)||(45606829-45607095)
chr3 (1-277)||(7781269-7781535)
chr3 (1-277)||(8899068-8899334)
chr3 (1-277)||(16454203-16454469)
chr3 (1-277)||(34159300-34159566)
chr3 (1-277)||(55476465-55476731)
chr3 (1-241)||(10247645-10247881)
chr3 (1-277)||(6469056-6469322)
chr3 (1-241)||(16282733-16282969)
chr3 (1-277)||(13154177-13154444)
chr3 (1-277)||(28848533-28848799)
chr3 (1-277)||(38961813-38962079)
chr3 (1-241)||(9707529-9707765)
chr3 (1-241)||(41123894-41124127)
chr3 (1-277)||(13151712-13151979)
chr3 (38-277)||(17446614-17446842)
chr3 (1-277)||(8499492-8499760)
chr3 (1-277)||(15412403-15412671)
chr3 (49-237)||(50242830-50243014)
chr3 (62-241)||(29172565-29172741)
chr3 (62-241)||(17672630-17672805)
chr3 (1-277)||(27165224-27165492)
chr3 (62-229)||(53070636-53070799)
chr3 (62-277)||(12119707-12119913)
chr3 (1-277)||(53301426-53301695)
chr3 (114-241)||(15977519-15977646)
chr3 (49-229)||(43550448-43550625)
chr3 (134-277)||(55500916-55501053)
chr3 (104-241)||(36166602-36166738)
chr3 (128-277)||(14972831-14972975)
chr3 (104-277)||(17487833-17488001)
chr3 (104-277)||(17499315-17499483)
chr3 (104-235)||(21618459-21618589)
chr3 (123-277)||(40213716-40213864)
chr3 (104-234)||(14576809-14576939)
chr3 (120-277)||(23083353-23083505)
chr3 (104-277)||(25476361-25476529)
chr3 (136-277)||(26686864-26687000)
chr3 (64-277)||(43840909-43841114)
chr3 (1-78)||(54520985-54521062)
chr3 (104-277)||(13442251-13442419)
chr3 (1-76)||(29544764-29544839)
chr3 (104-268)||(20698411-20698570)
chr3 (120-277)||(46822236-46822394)
chr3 (120-271)||(12399192-12399338)
chr3 (149-241)||(10556989-10557081)
chr3 (149-241)||(44494813-44494905)
chr3 (120-234)||(14572603-14572717)
chr3 (1-71)||(12305315-12305385)
chr3 (134-247)||(18438535-18438649)
chr3 (120-272)||(30029816-30029968)
chr3 (107-230)||(42386428-42386552)
chr3 (1-78)||(15977696-15977773)
chr3 (149-241)||(17737240-17737335)
chr3 (120-277)||(24153201-24153352)
chr3 (104-277)||(11424739-11424903)
chr3 (1-78)||(11913972-11914051)
chr3 (134-268)||(12511037-12511172)
chr3 (62-273)||(24340660-24340863)
chr3 (1-57)||(46822445-46822501)
chr3 (1-58)||(10557091-10557148)
chr3 (62-129)||(17248224-17248287)
chr3 (62-273)||(37642202-37642405)
chr3 (192-277)||(45577947-45578026)
chr3 (104-230)||(23274705-23274832)
chr3 (187-241)||(28194697-28194752)
chr3 (64-229)||(52523666-52523831)
chr3 (187-270)||(12174318-12174393)
chr3 (73-174)||(22147474-22147571)
chr3 (64-167)||(2051138-2051238)
chr3 (187-268)||(14234473-14234549)
chr3 (195-270)||(16097315-16097381)
chr3 (1-36)||(17444738-17444773)
chr3 (187-244)||(32307681-32307739)
chr3 (195-247)||(13210395-13210447)
chr3 (187-270)||(15470911-15470986)
chr3 (187-270)||(16103767-16103842)
chr3 (187-270)||(49668135-49668210)
chr3 (235-270)||(9512907-9512942)
chr3 (235-270)||(9520882-9520917)
chr3 (187-248)||(14665397-14665458)
chr3 (32-69)||(15977663-15977700)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-276)||(10742-11013)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-276)||(9211-9482)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (1-276)||(21840736-21841007)
chr1 (1-277)||(16361885-16362158)
chr1 (1-277)||(23593656-23593923)
chr1 (1-277)||(13988840-13989106)
chr1 (1-277)||(21923213-21923479)
chr1 (1-277)||(21475009-21475275)
chr1 (1-277)||(29776662-29776928)
chr1 (1-241)||(29298141-29298376)
chr1 (1-277)||(31612287-31612553)
chr1 (1-277)||(22122989-22123256)
chr1 (1-241)||(16275285-16275522)
chr1 (1-241)||(15859930-15860167)
chr1 (62-277)||(13212844-13213050)
chr1 (62-241)||(21707171-21707346)
chr1 (62-241)||(21711713-21711888)
chr1 (62-277)||(21346935-21347141)
chr1 (49-229)||(45574812-45574989)
chr1 (62-241)||(21342100-21342276)
chr1 (67-241)||(40389158-40389329)
chr1 (62-277)||(432986-433190)
chr1 (104-277)||(50210189-50210361)
chr1 (120-272)||(22468688-22468841)
chr1 (187-277)||(20454613-20454703)
chr1 (104-271)||(27250705-27250867)
chr1 (123-277)||(34509757-34509906)
chr1 (104-277)||(22532246-22532414)
chr1 (120-277)||(20135158-20135316)
chr1 (1-56)||(22050811-22050866)
chr1 (120-271)||(21026663-21026809)
chr1 (149-271)||(20847175-20847292)
chr1 (62-229)||(21896193-21896358)
chr1 (25-78)||(43543214-43543267)
chr1 (1-45)||(27161561-27161605)
chr1 (65-229)||(21861510-21861672)
chr1 (173-275)||(21161698-21161792)
chr1 (195-244)||(21754049-21754098)
chr1 (187-270)||(33680994-33681069)
chr1 (187-233)||(16758664-16758711)
chr1 (190-241)||(21714549-21714600)
chr1 (62-229)||(35261018-35261180)
chr1 (195-233)||(52928038-52928076)
chr1 (195-232)||(20918620-20918657)
chr1 (235-268)||(22921968-22922001)
chr1 (104-172)||(22354548-22354616)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-277)||(11256-11529)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-277)||(501052-501324)
scaffold0001 (62-277)||(85562-85768)
scaffold0001 (187-234)||(160698-160746)
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (1-243)||(16413238-16413476)
chr8 (1-277)||(1484376-1484642)
chr8 (1-277)||(5853214-5853480)
chr8 (1-277)||(20403201-20403467)
chr8 (1-277)||(14409366-14409632)
chr8 (1-277)||(15203153-15203419)
chr8 (1-277)||(22001727-22001993)
chr8 (1-277)||(4483255-4483520)
chr8 (1-277)||(20046117-20046383)
chr8 (1-277)||(4542295-4542561)
chr8 (1-245)||(45290616-45290857)
chr8 (1-277)||(19896239-19896509)
chr8 (1-277)||(14823748-14824015)
chr8 (1-241)||(19936925-19937164)
chr8 (1-232)||(15070571-15070800)
chr8 (62-277)||(41598162-41598367)
chr8 (62-277)||(26223890-26224098)
chr8 (64-229)||(19801367-19801527)
chr8 (49-241)||(25484245-25484426)
chr8 (1-132)||(24485966-24486093)
chr8 (1-105)||(32810067-32810171)
chr8 (104-277)||(18818385-18818553)
chr8 (104-277)||(7372755-7372923)
chr8 (127-247)||(16092341-16092462)
chr8 (104-277)||(28649020-28649192)
chr8 (104-277)||(21923904-21924072)
chr8 (136-277)||(23406356-23406492)
chr8 (108-247)||(6759259-6759396)
chr8 (120-277)||(18678094-18678252)
chr8 (120-268)||(21918992-21919135)
chr8 (120-277)||(23648524-23648682)
chr8 (104-241)||(26225269-26225405)
chr8 (104-247)||(20536209-20536353)
chr8 (104-277)||(26219691-26219857)
chr8 (120-277)||(32121703-32121861)
chr8 (104-277)||(22875042-22875209)
chr8 (104-247)||(22626737-22626880)
chr8 (104-277)||(18879212-18879375)
chr8 (147-271)||(31971240-31971358)
chr8 (1-58)||(38550033-38550090)
chr8 (1-57)||(32121912-32121968)
chr8 (147-271)||(45131017-45131134)
chr8 (62-273)||(13597554-13597757)
chr8 (62-273)||(13508022-13508225)
chr8 (73-273)||(17612059-17612250)
chr8 (1-78)||(1326959-1327042)
chr8 (147-271)||(16199664-16199782)
chr8 (1-57)||(18677987-18678043)
chr8 (187-268)||(6520354-6520430)
chr8 (187-268)||(38855310-38855386)
chr8 (1-67)||(16401952-16402020)
chr8 (1-58)||(27472339-27472395)
chr8 (1-58)||(20982649-20982710)
chr8 (62-229)||(20498581-20498746)
chr8 (134-271)||(5866280-5866412)
chr8 (187-268)||(17140902-17140978)
chr8 (127-239)||(21285606-21285719)
chr8 (195-272)||(21389518-21389589)
chr8 (195-272)||(21778844-21778915)
chr8 (32-78)||(35026849-35026895)
chr8 (187-247)||(21490996-21491057)
chr8 (187-270)||(23760903-23760978)
chr8 (187-233)||(983465-983512)
chr8 (198-268)||(21249370-21249434)
chr8 (198-268)||(21255208-21255272)
chr8 (195-234)||(21673718-21673757)
chr8 (32-78)||(2418860-2418906)
chr8 (195-272)||(21396048-21396119)
chr8 (195-272)||(21790541-21790612)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (24-277)||(12194-12443)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-277)||(20721-20987)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-277)||(37795-38061)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (1-277)||(94385-94651)
scaffold0023 (1-243)||(17362-17600)
scaffold0023 (82-241)||(44458-44614)
scaffold0023 (116-268)||(100363-100507)
scaffold0023 (187-268)||(119861-119937)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (1-277)||(456295-456561)
chr7 (1-277)||(15376635-15376901)
chr7 (1-277)||(16232494-16232760)
chr7 (1-277)||(20385045-20385311)
chr7 (1-277)||(21189517-21189783)
chr7 (1-277)||(32125465-32125731)
chr7 (1-277)||(41522891-41523157)
chr7 (1-277)||(41525353-41525619)
chr7 (1-241)||(11393209-11393445)
chr7 (1-277)||(14949044-14949310)
chr7 (1-277)||(27216834-27217100)
chr7 (1-277)||(18640246-18640512)
chr7 (1-277)||(24702212-24702478)
chr7 (1-279)||(18430684-18430952)
chr7 (1-277)||(11972470-11972736)
chr7 (1-277)||(16410033-16410299)
chr7 (1-282)||(16213653-16213924)
chr7 (1-277)||(24704662-24704925)
chr7 (1-277)||(13869320-13869588)
chr7 (104-277)||(24275139-24275312)
chr7 (1-190)||(26355903-26356090)
chr7 (1-190)||(26358355-26358542)
chr7 (62-277)||(44116483-44116688)
chr7 (63-241)||(3386337-3386511)
chr7 (49-229)||(13647344-13647521)
chr7 (62-241)||(17061898-17062073)
chr7 (62-209)||(12756654-12756797)
chr7 (64-277)||(20110530-20110723)
chr7 (62-241)||(38898359-38898535)
chr7 (1-96)||(13841157-13841252)
chr7 (104-241)||(3564340-3564478)
chr7 (1-133)||(15081869-15081999)
chr7 (126-241)||(48273396-48273512)
chr7 (119-241)||(13831377-13831499)
chr7 (120-271)||(26211978-26212125)
chr7 (1-79)||(11303409-11303487)
chr7 (104-277)||(9509166-9509334)
chr7 (104-268)||(12698817-12698977)
chr7 (1-78)||(14269984-14270061)
chr7 (1-78)||(16108611-16108688)
chr7 (1-90)||(18627717-18627806)
chr7 (1-78)||(8468803-8468880)
chr7 (104-277)||(18456389-18456556)
chr7 (1-78)||(23664875-23664952)
chr7 (120-247)||(38227482-38227609)
chr7 (1-78)||(8940335-8940414)
chr7 (134-268)||(10589025-10589154)
chr7 (1-78)||(29796771-29796850)
chr7 (1-78)||(29800590-29800669)
chr7 (1-78)||(38898150-38898229)
chr7 (223-277)||(16213599-16213653)
chr7 (127-277)||(15144037-15144177)
chr7 (120-271)||(15211433-15211586)
chr7 (62-233)||(2280056-2280225)
chr7 (144-271)||(16386263-16386386)
chr7 (127-247)||(22072914-22073036)
chr7 (187-268)||(67731-67807)
chr7 (195-268)||(47831793-47831860)
chr7 (1-58)||(45847683-45847739)
chr7 (62-273)||(19486681-19486884)
chr7 (195-271)||(11996095-11996165)
chr7 (134-268)||(34200772-34200901)
chr7 (147-271)||(40443374-40443492)
chr7 (195-270)||(811199-811265)
chr7 (187-268)||(28505357-28505433)
chr7 (195-270)||(44014165-44014231)
chr7 (146-241)||(14932752-14932848)
chr7 (146-241)||(15356187-15356283)
chr7 (146-241)||(15360301-15360397)
chr7 (187-234)||(18005660-18005708)
chr7 (195-268)||(16495388-16495455)
chr7 (187-241)||(18154901-18154955)
chr7 (104-161)||(15116568-15116624)
chr7 (127-233)||(16056343-16056449)
chr7 (195-247)||(15754955-15755007)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (1-277)||(264690-264956)
chr5 (1-277)||(29345954-29346220)
chr5 (1-277)||(39363358-39363624)
chr5 (1-277)||(42245287-42245553)
chr5 (1-277)||(20908986-20909252)
chr5 (1-277)||(29348427-29348693)
chr5 (1-277)||(29350900-29351166)
chr5 (1-277)||(32027367-32027633)
chr5 (4-277)||(10732865-10733128)
chr5 (1-277)||(39245110-39245376)
chr5 (1-241)||(29329938-29330171)
chr5 (4-241)||(20917877-20918106)
chr5 (1-241)||(38619438-38619676)
chr5 (1-241)||(23064515-23064753)
chr5 (62-277)||(20901991-20902198)
chr5 (62-277)||(2154596-2154802)
chr5 (64-277)||(11581184-11581387)
chr5 (62-241)||(36154766-36154938)
chr5 (67-241)||(18319021-18319192)
chr5 (62-241)||(31061072-31061248)
chr5 (62-277)||(10775659-10775864)
chr5 (67-241)||(24067111-24067282)
chr5 (104-277)||(23390472-23390640)
chr5 (120-271)||(21729056-21729202)
chr5 (120-271)||(21808381-21808527)
chr5 (123-277)||(9077929-9078078)
chr5 (120-271)||(22075001-22075148)
chr5 (104-247)||(25421533-25421677)
chr5 (104-228)||(25431414-25431539)
chr5 (149-277)||(21997555-21997678)
chr5 (128-247)||(1096468-1096588)
chr5 (146-271)||(8286860-8286981)
chr5 (123-277)||(24529197-24529346)
chr5 (120-277)||(17517193-17517351)
chr5 (1-78)||(9776521-9776598)
chr5 (104-277)||(22412161-22412328)
chr5 (106-247)||(24493570-24493711)
chr5 (1-78)||(37804825-37804902)
chr5 (120-247)||(13025312-13025439)
chr5 (120-247)||(13095496-13095623)
chr5 (1-57)||(17517086-17517142)
chr5 (104-190)||(20766096-20766181)
chr5 (79-229)||(22144068-22144215)
chr5 (148-271)||(21292991-21293107)
chr5 (1-42)||(20901949-20901990)
chr5 (187-247)||(21329556-21329617)
chr5 (5-42)||(2154558-2154595)
chr5 (62-167)||(40725935-40726037)
chr5 (187-270)||(22959591-22959666)
chr5 (150-238)||(18418590-18418678)
chr5 (187-268)||(19660894-19660970)
chr5 (186-241)||(20806845-20806900)
chr5 (195-270)||(21565529-21565595)
chr5 (202-247)||(21502231-21502276)
chr5 (104-245)||(37723906-37724046)
chr5 (195-270)||(19668882-19668951)
chr5 (187-268)||(36314563-36314639)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-277)||(13921-14187)
scaffold0230 (1-32)||(23453-23484)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-282)||(4663-4934)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (1-277)||(136654-136920)
scaffold0028 (1-277)||(139123-139389)
scaffold0028 (1-277)||(144061-144327)
scaffold0028 (1-277)||(134185-134451)
scaffold0028 (1-277)||(141592-141858)
scaffold0028 (123-270)||(132645-132784)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-277)||(13366-13632)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-277)||(40374-40640)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (62-277)||(158433-158638)
scaffold0003 (104-233)||(339926-340053)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (62-277)||(29905-30111)
scaffold0149 (1-42)||(30112-30153)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (49-241)||(110-298)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (49-241)||(82076-82264)
scaffold0037 (195-233)||(22738-22776)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (62-241)||(9753-9929)
scaffold0145 (104-247)||(32943-33086)
scaffold0145 (104-247)||(38762-38905)
scaffold0145 (1-40)||(9932-9971)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (62-241)||(4301-4476)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (62-241)||(16788-16963)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (49-277)||(12038-12250)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-277)||(38578-38846)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (62-229)||(79267-79430)
scaffold0056 (104-268)||(17191-17356)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (49-241)||(1250-1439)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (62-277)||(4188-4393)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (62-237)||(2111-2283)
scaffold0247 (62-273)||(17964-18167)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (62-229)||(20363-20524)
scaffold0031 (104-277)||(128728-128895)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (62-241)||(161072-161248)
scaffold0007 (62-166)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (104-277)||(22860-23027)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-105)||(6083-6187)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (104-277)||(3162-3334)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (104-241)||(26041-26179)
scaffold0122 (104-241)||(44683-44821)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (104-241)||(116434-116570)
scaffold0022 (1-78)||(53794-53873)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (104-277)||(1828-1996)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (104-277)||(51890-52058)
scaffold0011 (104-271)||(167954-168116)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (104-247)||(16576-16720)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (104-277)||(13188-13356)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (104-271)||(1024-1186)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (104-277)||(3127-3294)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (104-234)||(4522-4652)
scaffold0228 (104-234)||(12104-12234)
scaffold0228 (104-234)||(22056-22186)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (120-277)||(32949-33100)
scaffold0120 (120-277)||(45905-46056)
scaffold0120 (127-277)||(16090-16235)
scaffold0120 (186-277)||(17388-17473)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (1-78)||(1591-1668)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-78)||(3186-3263)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (104-277)||(3447-3615)
scaffold0292 (104-277)||(320-487)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (134-271)||(28397-28529)
scaffold0046 (195-271)||(1980-2050)
scaffold0046 (134-268)||(11278-11407)
scaffold0046 (195-268)||(4538-4605)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (134-277)||(8456-8594)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (120-271)||(4832-4978)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (104-239)||(39486-39621)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (104-239)||(75191-75326)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-72)||(27958-28029)
scaffold0114 (147-271)||(15483-15601)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (104-277)||(8509-8673)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (104-247)||(6097-6244)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (104-271)||(1935-2097)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-78)||(645-724)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (1-78)||(4225-4304)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-78)||(1248-1327)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (1-78)||(15083-15162)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (1-78)||(15194-15273)
scaffold0106 (187-277)||(15298-15382)
scaffold0106 (187-271)||(1272-1351)
scaffold0106 (195-271)||(7249-7319)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (104-230)||(24278-24406)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (104-183)||(3506-3585)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-78)||(35987-36065)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (5-78)||(10813-10886)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (104-240)||(25904-26040)
scaffold0026 (104-247)||(39859-40002)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (104-233)||(8481-8611)
scaffold0621 (187-270)||(6519-6597)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (147-271)||(32050-32167)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (62-273)||(11445-11648)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (147-271)||(13480-13598)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (158-247)||(4713-4803)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (62-273)||(38193-38396)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (62-233)||(27686-27855)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (169-229)||(11982-12042)
scaffold0503 (62-139)||(12039-12112)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-78)||(6858-6937)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (84-161)||(13092-13165)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (147-241)||(11462-11557)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (64-183)||(13158-13274)
scaffold0175 (192-277)||(250-329)
scaffold0175 (195-268)||(34109-34176)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (149-277)||(39890-40012)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (134-271)||(20893-21026)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (187-277)||(4893-4977)
scaffold0395 (104-172)||(939-1006)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (187-277)||(121743-121827)
scaffold0021 (104-229)||(174785-174909)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (195-268)||(1102-1169)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (195-268)||(6597-6664)
scaffold0333 (195-268)||(13977-14044)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (195-268)||(6191-6258)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (195-268)||(15845-15912)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (104-268)||(10401-10558)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (62-233)||(16037-16206)
scaffold0357 (62-229)||(13147-13313)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (134-241)||(15668-15776)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (62-174)||(53486-53595)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (62-174)||(225482-225590)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (195-239)||(1091-1135)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (187-270)||(19251-19326)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (187-234)||(129919-129967)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (195-270)||(2713-2779)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (195-270)||(45860-45926)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (62-229)||(12587-12751)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (62-167)||(7996-8098)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (123-270)||(32085-32224)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (104-168)||(27911-27975)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (104-227)||(4545-4669)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (1-32)||(416-447)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (235-270)||(2905-2940)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (149-271)||(16265-16380)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (104-183)||(6676-6755)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (190-241)||(23846-23897)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (149-229)||(1051-1132)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (244-274)||(1160-1190)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (195-268)||(1137-1204)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (195-241)||(36457-36503)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (187-268)||(14756-14829)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (187-234)||(5657-5705)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34963613 - 34963341
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963613 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 34963514  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963513 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 34963418  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963417 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 34963341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 30676632 - 30676904
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676632 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 30676731  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30676732 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 30676827  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676828 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 30676904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 19858841 - 19859107
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19858841 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 19858940  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858941 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 19859036  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19859037 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggactatataag 19859107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24422787 - 24422521
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24422787 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24422688  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422687 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 24422592  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24422591 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24422521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33862034 - 33861768
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33862034 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 33861935  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861934 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 33861839  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  33861838 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 33861768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33864518 - 33864252
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33864518 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 33864419  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864418 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 33864323  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  33864322 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 33864252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12742554 - 12742291
Alignment:
Q  4 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12742554 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 12742455  T
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742454 tt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 12742359  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  12742358 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 12742291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8055269 - 8055003
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8055269 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 8055170  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8055169 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgtta 8055074  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  8055073 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 8055003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 18334514 - 18334780
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18334514 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 18334613  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334614 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 18334709  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  18334710 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 18334780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19005286 - 19005020
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19005286 atattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 19005187  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005186 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 19005091  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19005090 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 19005020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22782467 - 22782231
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22782467 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 22782368  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22782367 tactt----gaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 22782272  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22782271 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 1540833 - 1541099
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1540833 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcat 1540932  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540933 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 1541028  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1541029 tttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 1541099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 2291102 - 2291368
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2291102 atattgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 2291201  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291202 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 2291297  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  2291298 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 2291368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 26924562 - 26924828
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26924562 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 26924661  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26924662 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgtta 26924757  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26924758 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 26924828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25688742 - 25688507
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  25688742 atattgtccatgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtat 25688643  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25688642 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgtta 25688547  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagat 240  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  25688546 tttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25656869 - 25656633
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25656869 atattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtat 25656770  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    || ||    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25656769 tagtt----gaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgtta 25656674  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25656673 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595523
Alignment:
Q  27 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattactt----gaattatatgtgaataa 1595668  T
Q  127 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtct 226  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  1595667 ttgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 1595568  T
Q  227 aagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1595567 aagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 1595523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754813
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcat 25754906  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25754905 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 277
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557080
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||     
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcat 20556957  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||      |||||    
T  20556958 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaa------gatga 20557051  T
Q  249 tgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20557052 tgaagttccaaattattggattatataag 20557080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 18456803  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18456802 gtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852175
Alignment:
Q  63 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatg 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatg 3852096  T
Q  163 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3852097 tcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448685
Alignment:
Q  67 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 16448609  T
Q  166 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448610 tgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18462020 - 18461895
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18462020 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattt 18461921  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  18461920 aactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19848145
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||| || || |||  ||||||| || ||||||||||| |||    
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattattt----gaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatattttta 19848027  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaa 259  Q
    |||  |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19848028 tgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaa 19848127  T
Q  260 attattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19848128 attattggactatttaag 19848145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 17287772 - 17287940
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  17287772 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatt 17287871  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17287872 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 17287940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 277
Target Start/End: Original strand, 18409825 - 18409975
Alignment:
Q  126 attgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggt 224  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  18409825 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  225 ctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatgatgatg--tttccaaattattggattatataag 18409975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 25629331 - 25629499
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  25629331 ttacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatt 25629430  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25629431 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 25629499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 12942441 - 12942363
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942441 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16496373 - 16496227
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16496373 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 16496274  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496273 gtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 16496227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593750
Alignment:
Q  123 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtc 221  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| || || |||| ||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  222 ggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 20593750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29060685 - 29060541
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  29060685 ttacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 29060586  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  29060585 taactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatg 29060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 28289257 - 28289334
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28289257 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 20360936 - 20361095
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  20360936 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatt 20361035  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  20361036 taactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaa------aatgatgatgttccaaattattgga 20361095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992398
Alignment:
Q  136 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T
Q  235 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992440 taagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaag 23992398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18914067 - 18913994
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18914067 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 229
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821946
Alignment:
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 277
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303684
Alignment:
Q  123 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtc 221  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  222 ggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| |||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 19303684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 22780203 - 22780371
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||  ||||||||||    
T  22780203 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatt 22780302  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22780303 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 22780371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18937321 - 18937252
Alignment:
Q  5 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18937321 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 268
Target Start/End: Original strand, 20638301 - 20638418
Alignment:
Q  146 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||      |    
T  20638301 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaa------g 20638394  T
Q  245 atgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20638395 atgatgatgttccaaattattgga 20638418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076677
Alignment:
Q  136 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  235 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
     ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20076713 gaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 20076677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  79 tgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 178  Q
    |||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgca----ttacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgca 25644392  T
Q  179 tactg-ttgtgttgctgt-tgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25644391 tactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 31630569 - 31630626
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630569 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15875546 - 15875469
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15875546 atattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Original strand, 25603377 - 25603535
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    ||||||||||||| || || || ||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||  | || ||||||||||| |||||||||  | ||||    
T  25603377 tgaataattgagatgtagt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatga 25603475  T
Q  219 gtcggtctaagttga-ttaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25603476 gtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgttccaaattattggactatttaag 25603535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Original strand, 25611715 - 25611873
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    ||||||||||||| || || || ||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||  | || ||||||||||| |||||||||  | ||||    
T  25611715 tgaataattgagatgtagt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatga 25611813  T
Q  219 gtcggtctaagttga-ttaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611814 gtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgttccaaattattggactatttaag 25611873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714394
Alignment:
Q  187 tgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 25714394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 23992663 - 23992604
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat---gatgttttaagatgttgat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23992663 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227651
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattatta 8227543  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttcca 258  Q
    | ||||| || ||||| ||||||  |  ||||||| |  |||  |||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||      ||||||||||    
T  8227544 tatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgt------tgatgttcca 8227636  T
Q  259 aattattggactatt 273  Q
    |||||||||||||||    
T  8227637 aattattggactatt 8227651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 19847890 - 19847931
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847890 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 19847931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333338
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394078
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27394078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 17377770 - 17377814
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 45  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377770 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20109283 - 20109153
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| | ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||      
T  20109283 ttacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttta 20109185  T
Q  202 ttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20109184 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Original strand, 16965378 - 16965451
Alignment:
Q  196 tgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggac 269  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16965378 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgttccaaattattggac 16965451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 270
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080862
Alignment:
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaa------gatgatgatgttccaaattattggact 22080862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 265
Target Start/End: Original strand, 16929658 - 16929727
Alignment:
Q  196 tgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattatt 265  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16929658 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgttccaaattatt 16929727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35245686 - 35245569
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      |    
T  35245686 aattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------g 35245596  T
Q  245 atgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  35245595 atgatgatgttccaaattattggacta 35245569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 275
Target Start/End: Original strand, 31155504 - 31155536
Alignment:
Q  243 tgatgatgatgttccaaattattggactattta 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31155504 tgatgatgatgttccaaattattggactattta 31155536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 1598297 - 1598266
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598297 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 9098573 - 9098620
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9098573 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Original strand, 4185928 - 4185962
Alignment:
Q  243 tgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4185928 tgatgacgatgttccaaattattggactatttaag 4185962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Original strand, 4738664 - 4738698
Alignment:
Q  243 tgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738664 tgatgacgatgttccaaattattggactatttaag 4738698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019394
Alignment:
Q  127 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggt 224  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| || || |||||||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  225 ctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    ||||| |||  ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  23019429 ctaagatga--aa------gatgatgatgttccaaattattgga 23019394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561304
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 1561304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 231
Target Start/End: Original strand, 28496539 - 28496575
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagtt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28496539 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 231
Target Start/End: Original strand, 29808950 - 29808986
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagtt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29808950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 32214843 - 32215115
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214843 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 32214942  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32214943 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgtta 32215038  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215039 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 32215115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6726235 - 6725999
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6726235 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 6726136  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726135 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 6726040  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6726039 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21154982 - 21155218
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21154982 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21155081  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155082 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 21155177  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21155178 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18809183 - 18808917
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18809183 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 18809084  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809083 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 18808988  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  18808987 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 18808917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 23709454 - 23709720
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23709454 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 23709553  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709554 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 23709649  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23709650 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23709720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 23711935 - 23712201
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23711935 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 23712034  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712035 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 23712130  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23712131 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23712201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39682553 - 39682287
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39682553 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 39682454  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682453 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 39682358  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  39682357 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 39682287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23131102 - 23130836
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23131102 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 23131003  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131002 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 23130907  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23130906 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23130836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23133569 - 23133303
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23133569 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 23133470  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133469 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 23133374  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23133373 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23133303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 34402444 - 34402710
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34402444 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 34402543  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402544 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 34402639  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  34402640 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 34402710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 571637 - 571371
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  571637 atattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 571538  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571537 tactt----gaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 571442  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  571441 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 571371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23135830 - 23135564
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  23135830 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 23135731  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135730 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 23135635  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23135634 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23135564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 24898117 - 24898384
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24898117 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24898216  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898217 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 24898312  T
Q  201 tttaact-aagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24898313 tttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24898384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 24900600 - 24900867
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24900600 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24900699  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900700 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 24900795  T
Q  201 tttaact-aagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24900796 tttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24900867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 24903077 - 24903344
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24903077 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24903176  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903177 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 24903272  T
Q  201 tttaact-aagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24903273 tttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24903344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 24905554 - 24905821
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24905554 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24905653  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905654 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 24905749  T
Q  201 tttaact-aagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24905750 tttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24905821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 24908029 - 24908296
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24908029 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24908128  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908129 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 24908224  T
Q  201 tttaact-aagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24908225 tttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24908296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28577339 - 28577073
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28577339 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 28577240  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28577239 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgtta 28577144  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  28577143 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 28577073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 32039420 - 32039686
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32039420 atattgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32039519  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32039520 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgtta 32039615  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  32039616 tttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 32039686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24368014 - 24367748
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24368014 atattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24367915  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367914 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 24367819  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24367818 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------aatgatgaagttccaaattattggattatataag 24367748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26505619 - 26505353
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26505619 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 26505520  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26505519 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 26505424  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26505423 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 26505353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26508097 - 26507831
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26508097 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 26507998  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26507997 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 26507902  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26507901 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 26507831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22105653 - 22105416
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22105653 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 22105554  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtt 199  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  22105553 t----acttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtt 22105458  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22105457 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45030042
Alignment:
Q  9 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttact 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    |    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattac----t 45029879  T
Q  109 tgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaacta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45029880 tgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaacta 45029979  T
Q  209 agatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    || || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  45029980 agctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 45030042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38967614 - 38967378
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38967614 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcat 38967516  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 199  Q
    || ||    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  38967515 taatt----gaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgtt 38967420  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38967419 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137303
Alignment:
Q  63 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatg 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 43137382  T
Q  163 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43137381 tcatgttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529717
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattattt----gaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattatta 24529606  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||    
T  24529607 tgtcatgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaa 24529700  T
Q  261 ttattggactatttaag 277  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  24529701 ttattggattatataag 24529717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 24642776 - 24642933
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642776 atattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 24642875  T
Q  99 attacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24642876 attac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23060658 - 23060514
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  | |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  23060658 ttacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 23060559  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23060558 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23060514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23076587 - 23076443
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  23076587 ttacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 23076488  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  23076487 taactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20261459 - 20261381
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261459 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22337260 - 22337116
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  22337260 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatt 22337161  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22337160 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22337116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 22731210 - 22731378
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  22731210 ttacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatt 22731309  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22731310 taactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 22731378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25616314 - 25616156
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  25616314 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616214 gtcagtctaagttgattaagatgttaataatgatgttccaaattattggactatttaag 25616156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Original strand, 38134 - 38252
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      ||    
T  38134 aattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------ga 38226  T
Q  246 tgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38227 tgatgatgttccaaattattggacta 38252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 22738156 - 22738323
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||  |||||||||||    
T  22738156 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatttaatgttgttattt 22738255  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22738256 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 22738323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643108
Alignment:
Q  167 gctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23285990 - 23285848
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23285990 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 23285895  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285894 gtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 23285848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 241
Target Start/End: Original strand, 298806 - 298929
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatg 217  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  298806 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 298905  T
Q  218 agtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  298906 agtcggtctaagttgattaagatg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671811
Alignment:
Q  64 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| |    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcatt----acttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatat 19671916  T
Q  164 catgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaat 261  Q
    |||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | | |||||||      |||||||||||||    
T  19671915 catgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaat 19671823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 10684685 - 10684764
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10684685 atattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 23707244 - 23707323
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23707244 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24918275 - 24918196
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918275 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23660151 - 23660000
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  23660151 tgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatga 23660053  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23660052 gtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 23660000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Original strand, 23654378 - 23654524
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | || || |||||||||||||||||| || ||||    
T  23654378 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatga 23654477  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654478 gtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 23654524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25616421 - 25616365
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25616421 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040327
Alignment:
Q  187 tgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 23040327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24671160 - 24671081
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24671160 atattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 24671081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7679647 - 7679567
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg--gatgatgttccaaattattgga 7679567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134346
Alignment:
Q  187 tgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||   |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtcta---tgatgatgatgatgatgatgatgttccaaattattggact 22134346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtga 122  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708752
Alignment:
Q  64 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatg 162  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||  |||||| || | ||| || ||||||||||| ||||     
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttata 23708653  T
Q  163 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||| |||||| | ||||||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||      |||||||||||||||||    
T  23708654 tcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aa------gatgatgatgttccaaa 23708744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24681579 - 24681500
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24681579 atattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttatat 24681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 23103375 - 23103533
Alignment:
Q  106 acttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattta 204  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  | ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  23103375 acttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttattta 23103472  T
Q  205 actaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||| || ||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23103473 actaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaaatattggacta 23103533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20309206 - 20309089
Alignment:
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||         
T  20309206 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg----- 20309115  T
Q  247 gatgatgttccaaattattggactatt 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  20309114 -atgatgttccaaattattggactatt 20309089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 24529469 - 24529510
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529469 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatatgatg 24529510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405990
Alignment:
Q  127 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggt 224  Q
    |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  225 ctaagttgat 234  Q
    ||||||||||    
T  28405999 ctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8946718 - 8946658
Alignment:
Q  187 tgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8946718 tgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8946658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 174
Target Start/End: Original strand, 7709 - 7779
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttt 174  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  7709 ttacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 233
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 19618094 - 19618366
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618094 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 19618193  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19618194 tac----ttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 19618289  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19618290 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgttccaaactattggactatttaag 19618366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 14970629 - 14970901
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14970629 atattgttcataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtat 14970728  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  14970729 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgtta 14970824  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970825 tttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 14970901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 15118274 - 15118540
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15118274 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15118373  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118374 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 15118469  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15118470 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 15118540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 12229 - 12495
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12229 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 12328  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12329 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 12424  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  12425 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 12495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 52312750 - 52312484
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52312750 atattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 52312651  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312650 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 52312555  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  52312554 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 52312484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3515247 - 3515011
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515247 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 3515148  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3515147 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttt 3515052  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3515051 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18215196 - 18215432
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18215196 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 18215295  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18215296 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 18215391  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18215392 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19242940 - 19242703
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19242940 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgca 19242841  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 199  Q
    ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19242840 ttactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtt 19242745  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19242744 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44615528 - 44615262
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44615528 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 44615429  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615428 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgtta 44615333  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  44615332 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 44615262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 18239341 - 18239607
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18239341 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 18239440  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18239441 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgtta 18239536  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  18239537 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 18239607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 50222261 - 50222527
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  50222261 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcat 50222360  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50222361 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgtta 50222456  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  50222457 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 50222527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 1837431 - 1837697
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  1837431 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcat 1837530  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837531 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 1837626  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1837627 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 1837697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 15355246 - 15355487
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15355246 atattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca- 15355344  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 199  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15355345 ---ttaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgtt 15355441  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 245  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355442 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 15355487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 44773005 - 44773275
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat----gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44773005 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 44773104  T
Q  97 gcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgtt 196  Q
    |||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773105 gcattac----ttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgtt 44773200  T
Q  197 gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  44773201 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 44773275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464026
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattattt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcat 51463933  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  51463934 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803423
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||     
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattac----ttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcat 23803330  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23803331 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610954
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcat 12611040  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12611039 ttgatattattatgtcatgctgtttt-------tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 7641139 - 7641370
Alignment:
Q  26 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaata 125  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||||    
T  7641139 tatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca----ttacttgaattatatgtaaata 7641234  T
Q  126 attgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtc 225  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7641235 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt----------ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7641324  T
Q  226 taagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  7641325 taagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 7641370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102218
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattat 44102298  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44102297 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402684
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc----gttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 15402791  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | | |||||||      ||||||||||||    
T  15402790 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaa 15402697  T
Q  261 ttattggactatt 273  Q
    |||||||||||||    
T  15402696 ttattggactatt 15402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367673
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc----gttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 15367778  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | | |||||||      ||||||||||||    
T  15367777 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaa 15367684  T
Q  261 ttattggacta 271  Q
    |||||||||||    
T  15367683 ttattggacta 15367673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15369999
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-----agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 15370106  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | | ||||||||      |||||||||||    
T  15370105 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgtt------gatgttccaaa 15370012  T
Q  261 ttattggactatt 273  Q
    |||||||||||||    
T  15370011 ttattggactatt 15369999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 277
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929068
Alignment:
Q  73 ttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtt 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtt 44928968  T
Q  173 tttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  44928969 tttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggatta 44929062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371183
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc----gttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattatta 15371290  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | | |||||||      ||||||||||||    
T  15371289 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaa 15371196  T
Q  261 ttattggactatt 273  Q
    |||||||||||||    
T  15371195 ttattggactatt 15371183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattat 21815663  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21815664 gtcatgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373484
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc----gttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattatta 15373571  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15373570 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223515
Alignment:
Q  65 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagtt----gaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgt 16223617  T
Q  164 catgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaatta 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | | ||||||||      ||||||||||||||    
T  16223616 catgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgtt------gatgttccaaatta 16223523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149833
Alignment:
Q  67 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtca 20149909  T
Q  166 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20149908 tgctgtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 20149833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 54798730 - 54798868
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54798730 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatt 54798829  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  54798830 caactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12902902 - 12902740
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  12902902 ttacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 12902803  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902802 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 12902740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280320
Alignment:
Q  127 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtct 226  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  227 aagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7798919 - 7798775
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  7798919 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 7798820  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7798819 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7798775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 277
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873511
Alignment:
Q  136 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  235 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
     ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52873475 gaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 52873511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 8574845 - 8574981
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8574845 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttattt 8574943  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8574944 aactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatg 8574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7089022 - 7088878
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  7089022 ttacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 7088923  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7088922 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7088878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15534421 - 15534343
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534421 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 36038110 - 36038033
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038110 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7893848 - 7893704
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  7893848 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatt 7893749  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7893748 taactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7893704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14038774 - 14038655
Alignment:
Q  123 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtc 221  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14038774 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 14038675  T
Q  222 ggtctaagttgattaagatg 241  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  14038674 agtctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22636580 - 22636437
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  22636580 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatt 22636481  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 246  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22636480 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Original strand, 16377499 - 16377634
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  16377499 ttacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 16377596  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagat 240  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  16377597 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14048817 - 14048740
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048817 atattgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 15496993 - 15497070
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15496993 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 52873100 - 52873176
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52873100 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44052974 - 44052806
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  44052974 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatt 44052875  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44052874 taactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 44052806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353852
Alignment:
Q  68 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatg 22353915  T
Q  168 ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
     ||||  |  |  |||  | || ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22353914 ttgttgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 49547696 - 49547773
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49547696 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6900035 - 6899892
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  6900035 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatt 6899937  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6899936 taactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6899892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 362325 - 362268
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362325 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 14746539 - 14746618
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14746539 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Original strand, 16270212 - 16270355
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  16270212 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatt 16270310  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16270311 taattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 16270355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Original strand, 23374351 - 23374475
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23374351 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 23374450  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgtt 243  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||    
T  23374451 gtcgttctaagttgttgaagatgtt 23374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 247
Target Start/End: Original strand, 16239962 - 16240089
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||||| ||||||||||| |||| || ||||    
T  16239962 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatga 16240060  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  16240061 gttggtctaagttgatgaagatgatgatg 16240089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096294
Alignment:
Q  163 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 3096294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13953
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||    ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac----ttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 13883  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    | ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  13884 tatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243302
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    ||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgca----ttacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgtta 52243226  T
Q  161 tgtcatg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    | |||||  |||  |||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52243227 tatcatgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706423
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 39706423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Original strand, 14053321 - 14053439
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || || || |||||||||||||||| || |||||||| |||||| || | ||      |    
T  14053321 aattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaa------g 14053412  T
Q  245 atgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14053413 atgatgatgttccaaattattggacta 14053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857607
Alignment:
Q  26 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  64 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatg 162  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||  ||||     
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattactt----gaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttata 43198587  T
Q  163 tcatgctgt-ttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    |||||   | ||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43198588 tcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846343
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 8846343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551803
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 15551803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046470
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 17046470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12774069 - 12774021
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12774069 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 12288269 - 12288316
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12288269 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 174
Target Start/End: Original strand, 15464908 - 15464977
Alignment:
Q  105 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttt 174  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464908 tacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6190592 - 6190481
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacg-ttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaat 216  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||  | |||||||||| | | |||||||||| || ||    
T  6190592 tgaataattgagatgattgttcgcttaca-ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcat 6190494  T
Q  217 gagtcggtctaag 229  Q
    |||||||||||||    
T  6190493 gagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13544265 - 13543993
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544265 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 13544166  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13544165 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgtta 13544070  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544069 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaag 13543993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12567800 - 12567528
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567800 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 12567701  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12567700 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgtta 12567605  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567604 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgtttatgatgttccaaattattggactatttaag 12567528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17463418 - 17463152
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17463418 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 17463319  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463318 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 17463223  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  17463222 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 17463152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 45606829 - 45607095
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45606829 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 45606928  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606929 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 45607024  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  45607025 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 45607095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 7781269 - 7781535
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7781269 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 7781368  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781369 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 7781464  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  7781465 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 7781535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8899334 - 8899068
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8899334 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 8899235  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899234 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 8899139  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  8899138 tttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 8899068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 16454203 - 16454469
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16454203 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 16454302  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454303 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 16454398  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  16454399 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 16454469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34159566 - 34159300
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34159566 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 34159467  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159466 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 34159371  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  34159370 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 34159300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 55476731 - 55476465
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  55476731 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 55476632  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476631 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 55476536  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  55476535 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 55476465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 10247645 - 10247881
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10247645 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 10247744  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10247745 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgtta 10247840  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10247841 tttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 6469056 - 6469322
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6469056 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 6469155  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469156 tacttc----aattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 6469251  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  6469252 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 6469322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16282733 - 16282969
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16282733 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 16282832  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282833 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 16282928  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16282929 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 13154177 - 13154444
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13154177 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 13154276  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154277 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 13154372  T
Q  201 tttaact-aagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13154373 tttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 13154444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 28848533 - 28848799
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  28848533 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 28848632  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848633 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 28848728  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  28848729 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 28848799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 38961813 - 38962079
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38961813 atattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 38961912  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961913 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 38962008  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  38962009 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------aatgatgaagttccaaattattggattatataag 38962079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 9707529 - 9707765
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9707529 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 9707628  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9707629 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 9707724  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9707725 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41124127 - 41123894
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41124127 atattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 41124028  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  41124027 t----acttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgtta 41123935  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41123934 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 13151712 - 13151979
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13151712 atattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 13151811  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151812 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 13151907  T
Q  201 tttaact-aagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13151908 tttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 13151979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 277
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446842
Alignment:
Q  38 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaatgatatgtgaataattgagacgttg 17446709  T
Q  138 ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaa 237  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  17446710 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaa 17446808  T
Q  238 gatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
          |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  17446809 ------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 17446842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8499760 - 8499492
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8499760 atattgtccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgca 8499661  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgt 198  Q
    ||| |||     ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  8499660 ttaattag----attatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgt 8499565  T
Q  199 tatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  8499564 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 8499492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15412671 - 15412403
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  15412671 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgca 15412572  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgt 198  Q
    | | |||     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  15412571 tcaattag----attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgt 15412476  T
Q  199 tatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15412475 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 15412403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242830
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcat 50242919  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaa 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  50242918 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172741
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 29172660  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29172661 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672630
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattattt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattat 17672710  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17672709 gtcatgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27165492 - 27165224
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  27165492 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgca 27165393  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttg 197  Q
     ||||||    |||||||| |||||| ||||||  ||| |||||| || ||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||||| | | |||||| |||    
T  27165392 atactta----aattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttg 27165298  T
Q  198 ttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  27165297 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 27165224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 53070731  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  53070732 gtcttgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119913
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattag----attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 12119802  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||    
T  12119803 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaa 12119896  T
Q  261 ttattggactatttaag 277  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  12119897 ttattggattatataag 12119913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 53301426 - 53301695
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |    
T  53301426 atattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgta 53301525  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-tt 196  Q
         |||||||||||||| |||||| ||||||  |||  |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| ||    
T  53301526 ----atacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgttt 53301620  T
Q  197 gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  53301621 gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 53301695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977519
Alignment:
Q  114 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  214 aatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcat 43550543  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43550544 ttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500916
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  234 ttaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  55500953 ttaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 55500916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36166738 - 36166602
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  36166738 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttattt 36166640  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36166639 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14972975 - 14972831
Alignment:
Q  128 tgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtct 226  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14972975 tgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14972876  T
Q  227 aagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14972875 aagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 14972831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17488001 - 17487833
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  17488001 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatt 17487902  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17487901 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 17487833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17499483 - 17499315
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  17499483 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatt 17499384  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17499383 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 17499315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21618589 - 21618459
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21618589 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttattt 21618491  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgatt 235  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21618490 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 277
Target Start/End: Original strand, 40213716 - 40213864
Alignment:
Q  123 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcg 222  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  40213716 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcg 40213815  T
Q  223 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  40213816 gtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 40213864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Original strand, 14576809 - 14576939
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  14576809 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatt 14576907  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14576908 taactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Original strand, 23083353 - 23083505
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  23083353 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 23083452  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23083453 gtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 23083505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 25476361 - 25476529
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  25476361 ttacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttt 25476460  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25476461 taactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 25476529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26687000 - 26686864
Alignment:
Q  136 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  26687000 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 26686901  T
Q  235 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
     ||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26686900 gaa------gatgatgatgttccaaattattggactatataag 26686864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840909
Alignment:
Q  64 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatg 162  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgca----ttacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatg 43841019  T
Q  163 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||      ||| ||||||||||||||    
T  43841018 tcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaa------gataatgatgttccaaat 43840925  T
Q  262 tattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  43840924 tattggattatataag 43840909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 54521062 - 54520985
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521062 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13442419 - 13442251
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| |||||||||    
T  13442419 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatt 13442320  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13442319 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 13442251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 29544764 - 29544839
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 76  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544764 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 20698411 - 20698570
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  20698411 ttacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 20698510  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  20698511 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 20698570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 46822394 - 46822236
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| || ||||    
T  46822394 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822294 gtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaag 46822236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12399338 - 12399192
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12399338 tgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 12399239  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399238 gtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 12399192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10557081 - 10556989
Alignment:
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10557081 ttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494813
Alignment:
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14572717 - 14572603
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14572717 tgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14572619  T
Q  219 gtcggtctaagttgat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  14572618 gtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12305385 - 12305315
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 71  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305385 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438535
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttg 232  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 18438550  T
Q  233 attaagatgttgatg 247  Q
    || |||||| |||||    
T  18438549 atgaagatgatgatg 18438535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029816
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| | || |||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 272  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029869 gtcagtctaagttgaatgagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 30029816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42386552 - 42386428
Alignment:
Q  107 cttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaa 205  Q
    ||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  42386552 cttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 42386453  T
Q  206 ctaagatgaatgagtcggtctaagt 230  Q
    ||||  || ||||||||||||||||    
T  42386452 ctaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15977773 - 15977696
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15977773 atattgtccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737240
Alignment:
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Original strand, 24153201 - 24153352
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||| | |||||||||||||| || ||||    
T  24153201 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatga 24153299  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24153300 gtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24153352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 11424739 - 11424903
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||||||||||   |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  11424739 ttacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatt 11424834  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11424835 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 11424903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 11913972 - 11914051
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11913972 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511037
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttg 232  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  233 attaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12511072 attaagatgttgataatgatgttccaaattattgga 12511037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340863
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattatta 24340755  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttcca 258  Q
    | ||||| || || || ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | | |||||||      ||||||||||    
T  24340756 tatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttcca 24340848  T
Q  259 aattattggactatt 273  Q
    |||||||||||||||    
T  24340849 aattattggactatt 24340863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 46822501 - 46822445
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46822501 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 10557148 - 10557091
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557148 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 129
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca----ttatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642405
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattatta 37642297  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttcca 258  Q
    | ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |  |||  |||||||| || ||||||||||| |||| | | |||||||      ||||||||||    
T  37642298 tatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgt------tgatgttcca 37642390  T
Q  259 aattattggactatt 273  Q
    |||||||||||||||    
T  37642391 aattattggactatt 37642405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 277
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578026
Alignment:
Q  192 ctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 45578026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23274832 - 23274705
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttat 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| ||||||     
T  23274832 ttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaa 23274734  T
Q  202 ttaactaagatgaatgagtcggtctaagt 230  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  23274733 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194697
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  64 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatg 162  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || | |||||| ||||     
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgca----ttacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttata 52523761  T
Q  163 tcatg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    |||||  ||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52523762 tcatgaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 12174318 - 12174393
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174318 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 12174393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  73 ttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtt 172  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| ||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtt 22147569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 167
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  64 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatg 162  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || |||||||| ||||     
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttata 2051233  T
Q  163 tcatg 167  Q
    |||||    
T  2051234 tcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14234549 - 14234473
Alignment:
Q  187 tgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  14234549 tgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 14234473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16097381 - 16097315
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097381 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 16097315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 17444738 - 17444773
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444738 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32307739 - 32307681
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32307739 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgttg 32307681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Original strand, 13210395 - 13210447
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  13210395 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 13210447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15470986 - 15470911
Alignment:
Q  187 tgttgctgt-tgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  15470986 tgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------agatgatgatgttccaaattattggact 15470911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16103842 - 16103767
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103842 tgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 16103767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 49668135 - 49668210
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  49668135 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat---------gatgatgatgttccaaattattggact 49668210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9512942 - 9512907
Alignment:
Q  235 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512942 taagatgatgatgatgatgttccaaattattggact 9512907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9520917 - 9520882
Alignment:
Q  235 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520917 taagatgatgatgatgatgttccaaattattggact 9520882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665397
Alignment:
Q  187 tgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14665397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977663
Alignment:
Q  32 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 15977663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11013 - 10742
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11013 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 10914  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10913 tactta----aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 10818  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaa 276  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10817 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataacaatgttccaaattattggactatttaa 10742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9482 - 9211
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 9383  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9382 tactta----aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgtta 9287  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaa 276  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9286 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataacgatgttccaaattattggactatttaa 9211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21841007 - 21840736
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841007 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 21840908  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21840907 tactta----aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 21840812  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaa 276  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21840811 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataacaatgttccaaattattggactatttaa 21840736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16362158 - 16361885
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16362158 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgca 16362059  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 199  Q
    ||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16362058 ttactt----gaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgtt 16361963  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361962 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 16361885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 23593656 - 23593923
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23593656 atattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgca 23593755  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 199  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593756 ttac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 23593851  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23593852 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23593923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13989106 - 13988840
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13989106 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 13989007  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989006 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 13988911  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13988910 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 13988840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 21923213 - 21923479
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21923213 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21923312  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923313 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 21923408  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21923409 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 21923479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 21475009 - 21475275
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21475009 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21475108  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475109 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 21475204  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21475205 tttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 21475275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29776928 - 29776662
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29776928 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29776829  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776828 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 29776733  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  29776732 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 29776662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29298376 - 29298141
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29298376 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcat 29298277  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298276 t----acttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 29298182  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29298181 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31612553 - 31612287
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31612553 atattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 31612454  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31612453 tactt----gaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgtta 31612358  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  31612357 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 31612287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 22122989 - 22123256
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22122989 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca- 22123087  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctg-ttgtt 199  Q
       |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22123088 ---ttacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgct 22123184  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  22123185 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 22123256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16275285 - 16275522
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  16275285 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgca- 16275383  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 199  Q
       ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||    
T  16275384 ---ttaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgtt 16275480  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16275481 atttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15859930 - 15860167
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  15859930 atattgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgca- 15860028  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 199  Q
       ||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15860029 ---ttgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgtt 15860125  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15860126 atttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213050
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 13212939  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||    
T  13212940 tgtcatgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaa 13213033  T
Q  261 ttattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||||    
T  13213034 ttattggactatttaag 13213050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707171
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacat----gatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattct 21707251  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21707250 gtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711713
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacat----gatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattct 21711793  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21711792 gtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346935
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 21347046  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||    
T  21347045 tgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaa 21346952  T
Q  261 ttattggactatttaag 277  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  21346951 ttattggattatataag 21346935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcat 45574907  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45574908 ttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342100
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaatt----gaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 21342181  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21342180 tgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389158
Alignment:
Q  67 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtca 40389234  T
Q  166 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40389233 tgctgtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 432986
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 433095  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaa 259  Q
    |||| || |||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||    
T  433094 tgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaa 433004  T
Q  260 attattggactatttaag 277  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  433003 attattggattatataag 432986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 50210189 - 50210361
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  50210189 ttacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 50210288  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||    
T  50210289 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg--tttccaaattattggattatataag 50210361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 272
Target Start/End: Original strand, 22468688 - 22468841
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||  | ||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  22468688 tgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 22468787  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 272  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22468788 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgttccaaatttttggactat 22468841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 277
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454703
Alignment:
Q  187 tgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgttccaaattattggactatttaag 20454703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 271
Target Start/End: Original strand, 27250705 - 27250867
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  27250705 ttacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatt 27250804  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250805 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 27250867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509757
Alignment:
Q  123 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtc 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  222 ggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||| ||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 34509757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22532414 - 22532246
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   |||||| || ||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  22532414 ttacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 22532315  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||  || |||||| ||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22532314 taactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 22532246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20135316 - 20135158
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | || |||| ||||| |||||||||| || ||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatataag 20135158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 22050811 - 22050866
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050811 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21026809 - 21026663
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21026809 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatga 21026710  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||      | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026709 gtcggtctaagtt------gttgacgatgatgatgttccaaattattggacta 21026663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 271
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847292
Alignment:
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      ||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatg 20847268  T
Q  248 atgatgttccaaattattggacta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20847269 atgatgttccaaattattggacta 20847292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896358
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |    ||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacat----gaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 21896288  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  21896289 tatcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543214
Alignment:
Q  25 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 27161561 - 27161605
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161561 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  65 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgt 163  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||    ||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| |    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac----ttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatat 21861605  T
Q  164 catgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    ||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21861606 catgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161698
Alignment:
Q  173 tttgtatactgttgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgat---------gatgatgatgttccaaattattggacta 21161702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21754098 - 21754049
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 244  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21754098 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgttg 21754049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33681069 - 33680994
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  33681069 tgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga---------agatgatgatgttccaaattattggact 33680994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16758711 - 16758664
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16758711 tgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714549
Alignment:
Q  190 tgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 21714549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    ||||||| | |||||  ||||||   |||||| || || |||||||| |||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattactt----gaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgtta 35261110  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    | |||||||||||| | ||||||  | |||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  35261111 tatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 233
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20918657 - 20918620
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttg 232  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20918657 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 268
Target Start/End: Original strand, 22921968 - 22922001
Alignment:
Q  235 taagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22921968 taagatgatgatgatgatgttccaaattattgga 22922001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 172
Target Start/End: Original strand, 22354548 - 22354616
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtt 172  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354548 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11529 - 11256
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11529 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgca 11430  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 199  Q
    ||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11429 ttactt----gaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtt 11334  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11333 atttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatgataatgttccaaattattggactatttaag 11256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 501324 - 501052
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501324 atattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 501225  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  501224 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgtta 501129  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  501128 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgttccaaattattggactatttaag 501052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85768
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattatta 85657  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||      |||||||| ||||||||    
T  85658 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaa------gatgatgaagttccaaa 85751  T
Q  261 ttattggactatttaag 277  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  85752 ttattggattatataag 85768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 160746 - 160698
Alignment:
Q  187 tgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  160746 tgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16413238 - 16413476
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413238 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 16413337  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16413338 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 16413433  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 243  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413434 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1484642 - 1484376
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1484642 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 1484543  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484542 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 1484447  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1484446 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 1484376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 5853214 - 5853480
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5853214 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 5853313  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853314 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 5853409  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5853410 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 5853480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20403467 - 20403201
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20403467 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20403368  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403367 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 20403272  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20403271 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 20403201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 14409366 - 14409632
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14409366 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 14409465  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14409466 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 14409561  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  14409562 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 14409632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 15203153 - 15203419
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15203153 atattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15203252  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203253 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 15203348  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15203349 tttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 15203419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22001993 - 22001727
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22001993 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 22001894  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001893 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 22001798  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  22001797 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 22001727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4483520 - 4483255
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4483520 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 4483421  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483420 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 4483325  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
     ||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  4483324 -ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 4483255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 20046117 - 20046383
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20046117 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20046216  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046217 tac----ttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 20046312  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20046313 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 20046383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 4542295 - 4542561
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4542295 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 4542394  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4542395 tactt----gaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgtta 4542490  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  4542491 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 4542561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 45290616 - 45290857
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  45290616 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcat 45290715  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 199  Q
    || ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45290716 taatt----gaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtt 45290811  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 245  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290812 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19896509 - 19896239
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttt-aagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19896509 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 19896410  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat---gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgtt 196  Q
    ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19896409 ttactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgtt 19896314  T
Q  197 gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19896313 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 19896239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14824015 - 14823748
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgc 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14824015 atattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 14823916  T
Q  99 attacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgt 198  Q
    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14823915 attactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgt 14823820  T
Q  199 tatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||  | || |||||| ||||||| ||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  14823819 tatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 14823748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 19936925 - 19937164
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  19936925 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgc 19937024  T
Q  99 attacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttg 197  Q
    |||  ||    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19937025 attgatt----gaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttg 19937120  T
Q  198 ttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19937121 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15070800 - 15070571
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||    
T  15070800 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgca 15070701  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgt 198  Q
    | | |||     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  15070700 tcaattag----attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgt 15070605  T
Q  199 tatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttg 232  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15070604 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598162
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 41598272  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||    
T  41598271 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaat 41598178  T
Q  262 tattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  41598177 tattggattatataag 41598162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223890
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatta----aattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 26224003  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaat 261  Q
    |||||||| |||||||||| || | | ||||||||||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  26224002 gtcatgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgat---gatgttccaaat 26223906  T
Q  262 tattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||||||    
T  26223905 tattggactatttaag 26223890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  64 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgt 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgt 19801462  T
Q  164 catgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  19801463 catgctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484426
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcat 25484340  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  25484341 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatg 25484426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 24485966 - 24486093
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24485966 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca- 24486064  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgaga 132  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24486065 ---ttacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 32810171 - 32810067
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32810171 atattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32810072  T
Q  101 tactt 105  Q
    |||||    
T  32810071 tactt 32810067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 18818385 - 18818553
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  18818385 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 18818484  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18818485 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 18818553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7372923 - 7372755
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  7372923 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 7372824  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7372823 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 7372755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 247
Target Start/End: Original strand, 16092341 - 16092462
Alignment:
Q  127 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtc 225  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16092341 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16092440  T
Q  226 taagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  16092441 taagttgatgaagatgatgatg 16092462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 28649020 - 28649192
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  28649020 ttacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatt 28649119  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||    
T  28649120 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg--tttccaaattattggattatataag 28649192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 21923904 - 21924072
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  21923904 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatt 21924003  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21924004 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatgtaag 21924072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406356
Alignment:
Q  136 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T
Q  235 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
     ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23406392 gaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 23406356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6759396 - 6759259
Alignment:
Q  108 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaac 206  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6759396 ttgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaac 6759300  T
Q  207 taagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6759299 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6759259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Original strand, 18678094 - 18678252
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| || ||||    
T  18678094 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678194 gtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaag 18678252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Original strand, 21918992 - 21919135
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21918992 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21919091  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  21919092 gtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 21919135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23648682 - 23648524
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | ||||||| |||||| ||||||||| || ||||    
T  23648682 tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatga 23648583  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23648582 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatataag 23648524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 26225269 - 26225405
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26225269 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttattt 26225367  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26225368 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20536353 - 20536209
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  20536353 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatt 20536254  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20536253 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26219857 - 26219691
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26219857 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttattt 26219759  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  26219758 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta------tgatgatgaagttccaaagtattggattatataag 26219691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32121861 - 32121703
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| || ||||    
T  32121861 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121761 gtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaag 32121703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22875209 - 22875042
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| || ||||    
T  22875209 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttgctgctgctatt 22875111  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22875110 taactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggactatataag 22875042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22626880 - 22626737
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  22626880 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatt 22626782  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22626781 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22626737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 18879212 - 18879375
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||     |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  18879212 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 18879306  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18879307 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 18879375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31971358 - 31971240
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      ||    
T  31971358 aattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------ga 31971266  T
Q  246 tgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31971265 tgatgatgttccaaattattggacta 31971240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 38550033 - 38550090
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550033 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 32121968 - 32121912
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32121968 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Original strand, 45131017 - 45131134
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      ||    
T  45131017 aattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------ga 45131108  T
Q  246 tgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45131109 tgatgatgttccaaattattggacta 45131134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597757
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |  | ||||||||||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattatta 13597649  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttcca 258  Q
    | ||||| || ||||| || ||| || |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | | |||||||      ||| ||||||    
T  13597650 tatcatgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgacgttcca 13597742  T
Q  259 aattattggactatt 273  Q
    |||||||||||||||    
T  13597743 aattattggactatt 13597757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508225
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattatta 13508117  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttcca 258  Q
    | ||||| || || || ||| ||  | |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | | |||||||      ||| ||||||    
T  13508118 tatcatgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgacgttcca 13508210  T
Q  259 aattattggactatt 273  Q
    |||||||||||||||    
T  13508211 aattattggactatt 13508225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 273
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612250
Alignment:
Q  73 ttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtt 172  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| ||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtt 17612154  T
Q  173 tttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    || | ||||||  | ||||| || |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | | |||||||      ||||||||||||||||||||||    
T  17612155 tt-gcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaattattggact 17612247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 1326959 - 1327042
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttata------tgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1326959 atattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgagatgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Original strand, 16199664 - 16199782
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      |    
T  16199664 aattgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------g 16199755  T
Q  245 atgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16199756 atgatgatgttccaaattattggacta 16199782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 18677987 - 18678043
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 57  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18677987 atattatccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgat 18678043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6520430 - 6520354
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  6520430 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 6520354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Original strand, 38855310 - 38855386
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  38855310 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 38855386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 16401952 - 16402020
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttga 67  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||    
T  16401952 atattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttga 16402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 27472339 - 27472395
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472339 atattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 20982649 - 20982710
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20982649 atattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagatgttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498581
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattactt----gaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 20498651  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    | |||||||  ||||  ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  20498650 tatcatgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 271
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866412
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagtt 231  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  232 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    | | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866379 gttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 5866412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17140978 - 17140902
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  17140978 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 17140902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285606
Alignment:
Q  127 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggt 224  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  225 ctaagttgattaaga 239  Q
    |||||||||||||||    
T  21285620 ctaagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 21389518 - 21389589
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 272  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389518 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggactat 21389589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 21778844 - 21778915
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 272  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778844 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggactat 21778915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026895
Alignment:
Q  32 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21491057 - 21490996
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21491057 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21490996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 23760903 - 23760978
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------agatgatgatgttccaaattattggact 23760978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 983465 - 983512
Alignment:
Q  187 tgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  983465 tgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249370
Alignment:
Q  198 ttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 21249370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255208
Alignment:
Q  198 ttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 21255208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21673757 - 21673718
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21673757 ttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Original strand, 2418860 - 2418906
Alignment:
Q  32 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  2418860 tatatatgatgtttcaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 21396048 - 21396119
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 272  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21396048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccacattattggactat 21396119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 21790541 - 21790612
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 272  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21790541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccacattattggactat 21790612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12443
Alignment:
Q  24 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattac----ttgaattaaatgtgaa 12289  T
Q  124 taattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcgg 223  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  12290 taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcgg 12389  T
Q  224 tctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12390 tctaagttgattaagatgttgatgatgatgtaccaaattattggactatttaag 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20987 - 20721
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20987 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20888  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20887 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 20792  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20791 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 20721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38061 - 37795
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38061 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 37962  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37961 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 37866  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  37865 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 37795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 94651 - 94385
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  94651 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 94552  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94551 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 94456  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  94455 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 94385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 17362 - 17600
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17362 atattgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcat 17461  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17462 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgtta 17557  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 243  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17558 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44458
Alignment:
Q  82 gatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgttttt-gtata 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44614 gatataattctatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtata 44519  T
Q  181 ctgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44518 ctgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 100507 - 100363
Alignment:
Q  116 tatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatg 213  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  100507 tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 100409  T
Q  214 aatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
     |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  100408 catgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattgga 100363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119861
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 119861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 456561 - 456295
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  456561 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 456462  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456461 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 456366  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  456365 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 456295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 15376635 - 15376901
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15376635 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15376734  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376735 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 15376830  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15376831 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 15376901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16232760 - 16232494
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16232760 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 16232661  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232660 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 16232565  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  16232564 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 16232494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 20385045 - 20385311
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20385045 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20385144  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385145 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 20385240  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20385241 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 20385311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 21189517 - 21189783
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21189517 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21189616  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189617 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 21189712  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21189713 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 21189783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32125731 - 32125465
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32125731 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32125632  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125631 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 32125536  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  32125535 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 32125465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41523157 - 41522891
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41523157 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 41523058  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523057 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 41522962  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  41522961 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 41522891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41525619 - 41525353
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41525619 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 41525520  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525519 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 41525424  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  41525423 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 41525353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 11393209 - 11393445
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11393209 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 11393308  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393309 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 11393404  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11393405 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 14949044 - 14949310
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14949044 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 14949143  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949144 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 14949239  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  14949240 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 14949310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27217100 - 27216834
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27217100 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 27217001  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217000 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 27216905  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  27216904 tttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 27216834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18640512 - 18640246
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18640512 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 18640413  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640412 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 18640317  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  18640316 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaaggtccaaattattggactatataag 18640246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24702478 - 24702212
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24702478 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24702379  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702378 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 24702283  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24702282 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24702212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18430952 - 18430684
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18430952 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 18430853  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18430852 tactt----gaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgtta 18430757  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagtg 279  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18430756 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataagtg 18430684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11972736 - 11972470
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11972736 atattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 11972637  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972636 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 11972541  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  11972540 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 11972470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16410299 - 16410033
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||    
T  16410299 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtat 16410200  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410199 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 16410104  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  16410103 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 16410033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16213924 - 16213653
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16213924 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcat 16213825  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16213824 tactt----gaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 16213729  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagtgatg 282  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16213728 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataagagatg 16213653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24704925 - 24704662
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24704925 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24704826  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704825 t----acttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 24704733  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24704732 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24704662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13869588 - 13869320
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  13869588 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgca 13869489  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgt 198  Q
    | | |||     ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  13869488 tcaattag----attatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgt 13869393  T
Q  199 tatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13869392 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 13869320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24275312 - 24275139
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24275312 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 24275213  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24275212 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgttccaaattattggactatttaag 24275139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 26355903 - 26356090
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26355903 atattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 26356002  T
Q  99 attacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtt 190  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26356003 attac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtt 26356090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 26358355 - 26358542
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26358355 atattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 26358454  T
Q  99 attacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtt 190  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26358455 attac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtt 26358542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116483
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgctt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 44116593  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaat 261  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||    
T  44116592 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaat 44116499  T
Q  262 tattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  44116498 tattggattatataag 44116483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386337
Alignment:
Q  63 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatg 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatg 3386416  T
Q  163 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3386415 tcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcat 13647426  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13647425 ttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062073
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattat 17061993  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17061994 gtcatgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756797
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattat 12756749  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 209  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12756750 gtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaa 12756797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110530
Alignment:
Q  64 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgt 20110628  T
Q  164 catgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaatta 263  Q
    |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||    
T  20110627 catgctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaatta 20110544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898535
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattatta 38898454  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898455 tgtcatgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13841252 - 13841157
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatat 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13841252 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 3564340 - 3564478
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  3564340 ttacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 3564439  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3564440 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 15081869 - 15081999
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15081869 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 15081968  T
Q  99 attacttacttgaattatatgtgaataattgagac 133  Q
    |    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15081969 a----ttaattgaattatatgtgaataattgagac 15081999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273396
Alignment:
Q  126 attgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggt 224  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  225 ctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831377
Alignment:
Q  119 gtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26212125 - 26211978
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26212125 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatga 26212026  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||| | ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  26212025 gtcggtctaagttgttgaaga-----atgatgatgttccaaattattggacta 26211978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 11303487 - 11303409
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303487 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9509334 - 9509166
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  9509334 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatt 9509235  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9509234 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 9509166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12698977 - 12698817
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttat 201  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  12698977 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 12698878  T
Q  202 ttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  12698877 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 12698817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 14269984 - 14270061
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14269984 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 16108611 - 16108688
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108611 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18627806 - 18627717
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 90  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627806 atattttccgtgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 8468880 - 8468803
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468880 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 18456389 - 18456556
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| | ||||||    
T  18456389 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctatcgttatt 18456487  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  18456488 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 18456556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 23664875 - 23664952
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23664875 atattgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38227609 - 38227482
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  38227609 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 38227511  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  38227510 gtcggtctaagtagatgaagatgatgatg 38227482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 8940414 - 8940335
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8940414 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589025
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttg 232  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T
Q  233 attaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
       ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  10589054 tcgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 10589025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 29796850 - 29796771
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29796850 atattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 29800669 - 29800590
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800669 atattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 38898150 - 38898229
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38898150 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16213653 - 16213599
Alignment:
Q  223 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213653 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 16213599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 277
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144177
Alignment:
Q  127 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtct 226  Q
    |||||| ||||||| ||| || |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 15144136  T
Q  227 aagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||          ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15144137 aagttga----------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 15144177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15211586 - 15211433
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatg 217  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||  | || ||||||||||| ||||||||| || |||    
T  15211586 tgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatg 15211488  T
Q  218 agtcggtctaagttga-ttaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15211487 agtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgttccaaattattggacta 15211433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280225
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||    ||||||||| |||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattattt----gaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattatta 2280151  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    | |||||||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2280152 tatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 271
Target Start/End: Original strand, 16386263 - 16386386
Alignment:
Q  144 tacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||        
T  16386263 tacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa---- 16386358  T
Q  242 ttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386359 --gatgatgatgttccaaattattggacta 16386386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072914
Alignment:
Q  127 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  | ||||| || |||||||||||||||| || ||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  225 ctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 67807 - 67731
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  67807 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 67731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831793
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 47831793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 45847683 - 45847739
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45847683 atattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486884
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataactt----gaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattatta 19486776  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttcca 258  Q
    | ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |  |||  |||||||| || ||||||||||| |||| | | |||||||      ||||||||||    
T  19486777 tatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgt------tgatgttcca 19486869  T
Q  259 aattattggactatt 273  Q
    |||||||||||||||    
T  19486870 aattattggactatt 19486884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996165
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 11996165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200772
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagtt 231  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  232 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    | | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  34200802 gttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 34200772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40443492 - 40443374
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||| || | ||      |    
T  40443492 aattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaa------g 40443401  T
Q  245 atgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40443400 atgatgatattccaaattattggacta 40443374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 270
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811265
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 811265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Original strand, 28505357 - 28505433
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  28505357 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 28505433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014165
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 44014165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 241
Target Start/End: Original strand, 14932752 - 14932848
Alignment:
Q  146 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14932752 caattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 241
Target Start/End: Original strand, 15356187 - 15356283
Alignment:
Q  146 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15356187 caattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 241
Target Start/End: Original strand, 15360301 - 15360397
Alignment:
Q  146 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15360301 caattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18005708 - 18005660
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18005708 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16495455 - 16495388
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  16495455 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 16495388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154955
Alignment:
Q  187 tgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 18154955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15116624 - 15116568
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  15116624 ttacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056343
Alignment:
Q  127 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggt 224  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||||  | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  225 ctaagttga 233  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755007
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 264690 - 264956
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  264690 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 264789  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264790 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 264885  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  264886 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 264956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29346220 - 29345954
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29346220 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29346121  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29346120 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgtta 29346025  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  29346024 tttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 29345954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39363624 - 39363358
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39363624 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 39363525  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363524 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 39363429  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  39363428 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 39363358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 42245287 - 42245553
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  42245287 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 42245386  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245387 tac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 42245482  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  42245483 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 42245553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20909252 - 20908986
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20909252 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 20909153  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20909152 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgtta 20909057  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20909056 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 20908986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29348693 - 29348427
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29348693 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29348594  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29348593 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttctta 29348498  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  29348497 tttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 29348427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29351166 - 29350900
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29351166 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29351067  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29351066 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttctta 29350971  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  29350970 tttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 29350900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32027633 - 32027367
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32027633 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32027534  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32027533 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgtta 32027438  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  32027437 tttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 32027367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 277
Target Start/End: Original strand, 10732865 - 10733128
Alignment:
Q  4 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  10732865 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattac 10732964  T
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732965 ----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 10733060  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  10733061 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 10733128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39245376 - 39245110
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  39245376 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcat 39245277  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245276 tactt----gaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 39245181  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  39245180 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 39245110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29330171 - 29329938
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29330171 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgattatta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29330075  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330074 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 29329979  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29329978 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 20917877 - 20918106
Alignment:
Q  4 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  20917877 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgc----t 20917972  T
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917973 ttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 20918068  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20918069 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38619676 - 38619438
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  38619676 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgca 38619577  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgt 198  Q
    | | |||     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||    
T  38619576 tcaattag----attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgt 38619481  T
Q  199 tatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38619480 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38619438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23064753 - 23064515
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  23064753 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgca 23064654  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgt 198  Q
    | | |||     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||    
T  23064653 tcaattag----attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgt 23064558  T
Q  199 tatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23064557 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902198
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattattt----gaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattatta 20902086  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatgatgatgttccaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||      |||||||| |||||||    
T  20902087 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaa------gatgatgaagttccaa 20902180  T
Q  260 attattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20902181 attattggactatttaag 20902198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154802
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattattt----gaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattatta 2154691  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||    
T  2154692 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaa 2154785  T
Q  261 ttattggactatttaag 277  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  2154786 ttattggattatataag 2154802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 277
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581387
Alignment:
Q  64 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattac----ttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgt 11581279  T
Q  164 catgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaatta 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||    
T  11581280 catgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaatta 11581373  T
Q  264 ttggactatttaag 277  Q
    ||||| ||| ||||    
T  11581374 ttggattatataag 11581387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154938
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 36154861  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36154862 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319192
Alignment:
Q  67 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 18319116  T
Q  166 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18319117 tgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061072
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaatta----aattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattatta 31061153  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31061152 tgtcatgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775864
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 10775753  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||    
T  10775754 tgtcatgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaa 10775847  T
Q  261 ttattggactatttaag 277  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  10775848 ttattggattatataag 10775864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067111
Alignment:
Q  67 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtca 24067187  T
Q  166 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||    
T  24067186 tgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 23390472 - 23390640
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23390472 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatt 23390571  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23390572 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 23390640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Original strand, 21729056 - 21729202
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21729056 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21729155  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729156 gtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 21729202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Original strand, 21808381 - 21808527
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21808381 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21808480  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808481 gtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 21808527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9078078 - 9077929
Alignment:
Q  123 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtc 221  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  9078078 ataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtc 9077979  T
Q  222 ggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
     |||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9077978 agtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 9077929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22075148 - 22075001
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22075148 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatga 22075049  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||| | ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  22075048 gtcggtctaagttgttgaaga-----atgatgatgttccaaattattggacta 22075001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25421677 - 25421533
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  25421677 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatt 25421578  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25421577 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25431539 - 25431414
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  25431539 ttacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 25431440  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaa 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431439 taactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 277
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997678
Alignment:
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatg 21997648  T
Q  248 atgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21997649 atgatgttccaaattattggattatataag 21997678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1096588 - 1096468
Alignment:
Q  128 tgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtct 226  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1096588 tgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 1096489  T
Q  227 aagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  1096488 aagttgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 271
Target Start/End: Original strand, 8286860 - 8286981
Alignment:
Q  146 caattgatattattatgtcatgctgttttt-gtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||          
T  8286860 caattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------ 8286953  T
Q  244 gatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8286954 gatgatgatgttccaaattactggacta 8286981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529197
Alignment:
Q  123 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtc 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  222 ggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||| ||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24529197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Original strand, 17517193 - 17517351
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  17517193 tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17517293 gtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgtttcaaattattggactatttaag 17517351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9776598 - 9776521
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9776598 atattgtcaatgattggtgaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22412328 - 22412161
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| | | ||||||    
T  22412328 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttatt 22412230  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  22412229 taactaagctacatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 22412161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24493711 - 24493570
Alignment:
Q  106 acttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttattta 204  Q
    ||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||| |||    
T  24493711 acttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttactta 24493613  T
Q  205 actaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24493612 accaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 24493570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 37804825 - 37804902
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37804825 atattgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13025439 - 13025312
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||| | || ||||    
T  13025439 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatga 13025341  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13025340 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13025312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13095623 - 13095496
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||| | || ||||    
T  13095623 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatga 13095525  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13095524 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13095496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 17517086 - 17517142
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17517086 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 190
Target Start/End: Original strand, 20766096 - 20766181
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtt 190  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766096 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  79 tgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgca 22144121  T
Q  179 tact-gttgtgttgctgt-tgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    ||||   | ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22144120 tactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Original strand, 21292991 - 21293107
Alignment:
Q  148 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || | ||      |||    
T  21292991 attgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaa------gat 21293082  T
Q  247 gatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21293083 gatgatgttccaaattattggacta 21293107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 20901949 - 20901990
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901949 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 20901990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329617
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21329617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 42
Target Start/End: Original strand, 2154558 - 2154595
Alignment:
Q  5 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154558 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 2154595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725935
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattatta 40725942  T
Q  161 tgtcatg 167  Q
    | |||||    
T  40725941 tatcatg 40725935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 22959591 - 22959666
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959591 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 22959666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  150 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtta-tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660970
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 19660970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806900
Alignment:
Q  186 gtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 20806900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21565595 - 21565529
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565595 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 21565529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 247
Target Start/End: Original strand, 21502231 - 21502276
Alignment:
Q  202 ttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21502231 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21502276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37724046 - 37723906
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgt-tgttat 201  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  | ||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | ||||||||| ||||||    
T  37724046 ttacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttat 37723950  T
Q  202 ttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 245  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  37723949 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668882
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatga------tgatgatgatgttccaaattattggact 19668882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314563
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 36314563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14187 - 13921
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14187 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 14088  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14087 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 13992  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13991 tttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 13921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 23453 - 23484
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23453 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4934 - 4663
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4934 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 4835  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4834 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 4739  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagtgatg 282  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  4738 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta------ggatgatgaggttccaaattattggattatataagagatg 4663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 136920 - 136654
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  136920 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 136821  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  136820 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgtta 136725  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  136724 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 136654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 139389 - 139123
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  139389 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 139290  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  139289 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgtta 139194  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  139193 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 139123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 144327 - 144061
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  144327 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 144228  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  144227 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgtta 144132  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  144131 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 144061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 134451 - 134185
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  134451 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 134352  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  134351 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgtta 134256  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  134255 tttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 134185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 141858 - 141592
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  141858 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 141759  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  141758 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgtta 141663  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  141662 tttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 141592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132645
Alignment:
Q  123 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagt 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| || | ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  221 cggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    ||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  132685 cggtctaagatgat---------gatgatgatgttccaaattattggact 132645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13632 - 13366
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  13632 atattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 13533  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13532 tactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 13437  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13436 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 13366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40640 - 40374
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40640 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 40541  T
Q  101 tacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40540 tactt----gaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 40445  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  40444 tttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 40374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158638
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 158528  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||    
T  158529 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaat 158622  T
Q  262 tattggactatttaag 277  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  158623 tattggattatataag 158638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Original strand, 339926 - 340053
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||    
T  339926 ttacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgttgt-gttatt 340022  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  340023 taactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29905
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattattt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattat 30016  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagtt-gattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||      |||||||| ||||||||    
T  30015 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaa------gatgatgaagttccaaa 29922  T
Q  261 ttattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||||    
T  29921 ttattggactatttaag 29905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 30153 - 30112
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 30112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 110
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcat 203  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  202 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82076
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcat 82169  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  82168 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 233
Target Start/End: Original strand, 22738 - 22776
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9753
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattattt----gaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattatta 9834  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9833 tgtcattctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33086 - 32943
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  33086 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatt 32988  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  32987 taattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 32943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38905 - 38762
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  38905 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatt 38807  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38806 taattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatg 38762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 9971 - 9932
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 40  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9971 atattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4301
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattactt----gaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattat 4381  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4380 gtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16788
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 16868  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16867 gtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12038
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaa 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcat 12155  T
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||    
T  12154 ttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatga 12067  T
Q  249 tgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  12066 tgaagttccaaattattggattatataag 12038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 38578 - 38846
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  38578 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgca 38677  T
Q  100 ttacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttg 197  Q
         |||||||||||||| | |||| ||||||  ||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||    
T  38678 ----atacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttg 38772  T
Q  198 ttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  38773 ttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 38846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattat 79362  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  79363 gtcatgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 17191 - 17356
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgttttt--gtatactgt-tgtgttgctgttgtta 200  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||    
T  17191 ttacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 17290  T
Q  201 tttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  17291 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg--tttccaaattattgga 17356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1439
Alignment:
Q  49 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttaca 147  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgca 1345  T
Q  148 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1346 tttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4188
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 4299  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaa 260  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||    
T  4298 tgtcatgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaa 4205  T
Q  261 ttattggactatttaag 277  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  4204 ttattggattatataag 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2283
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattatta 2206  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  2207 tgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18167
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattatta 18059  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttcca 258  Q
    | ||||| || || || ||| ||  | |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | | |||||||      ||||||||||    
T  18060 tatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttcca 18152  T
Q  259 aattattggactatt 273  Q
    |||||||||||||||    
T  18153 aattattggactatt 18167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20524
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 20457  T
Q  162 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20458 gtcatgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 128895 - 128728
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |  | || ||||||| |||||||||    
T  128895 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgcttttgttattt 128796  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| || |||||| ||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  128795 aactaagttgcatgagttggtctaatttgattaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 128728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161248
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaatt----gaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattatta 161167  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  161168 tgtcattatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 166
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca----ttaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattatta 164668  T
Q  161 tgtcat 166  Q
    ||||||    
T  164669 tgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23027 - 22860
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23027 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactggtgtgttgctgttgttattt 22928  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  22927 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 22860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6187 - 6083
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  6187 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcat 6088  T
Q  101 tactt 105  Q
    |||||    
T  6087 tactt 6083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 3162 - 3334
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  3162 ttacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 3261  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||    
T  3262 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg--tttccaaattattggattatataag 3334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 26041 - 26179
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  26041 ttacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 26140  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26141 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 44683 - 44821
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44683 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatt 44782  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44783 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 116570 - 116434
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 203  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  116570 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttattt 116472  T
Q  204 aactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  116471 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 53794 - 53873
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53794 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1996 - 1828
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1996 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatt 1897  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1896 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 1828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 52058 - 51890
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  52058 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatt 51959  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  51958 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 51890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 271
Target Start/End: Original strand, 167954 - 168116
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  167954 ttacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatt 168053  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  168054 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 168116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Original strand, 16576 - 16720
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16576 ttacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatt 16675  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16676 taactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 16720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13356 - 13188
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  13356 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 13257  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13256 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 13188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 271
Target Start/End: Original strand, 1024 - 1186
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  1024 ttacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatt 1123  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1124 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 3127 - 3294
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  3127 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatt 3225  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3226 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 3294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4652 - 4522
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4652 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatt 4553  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  4552 taactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12234 - 12104
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12234 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatt 12135  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  12134 taactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22186 - 22056
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22186 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatt 22087  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  22086 taactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Original strand, 32949 - 33100
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  32949 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatga 33047  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33048 gtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 33100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 46056 - 45905
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  46056 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatga 45958  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45957 gtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 45905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16090
Alignment:
Q  127 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtc 225  Q
    |||||| | ||||| ||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16136  T
Q  226 taagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16135 taagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 16090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 277
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17473
Alignment:
Q  186 gtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 17473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1668 - 1591
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1668 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3263 - 3186
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3263 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3615 - 3447
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||    
T  3615 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatt 3516  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3515 taactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 320
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  | ||||  ||||||||||    
T  487 ttacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatactgcctatgttattgttgttatt 389  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  388 taactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaa------gatgatgatgttccaaattattagactatataag 320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28397
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttg 232  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  233 attaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    || ||      ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28429 atgaa------gatgatgatgttccaaactattggacta 28397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1980
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 1980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11278
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagtt 231  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  232 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    | | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  11308 gttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 11278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4538
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8456
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttg 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  8594 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 8495  T
Q  233 attaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    || ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8494 atgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 8456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4978 - 4832
Alignment:
Q  120 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatga 218  Q
    |||||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  4978 tgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatga 4879  T
Q  219 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4878 gtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 4832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39621 - 39486
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  39621 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatt 39523  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaaga 239  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  39522 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 239
Target Start/End: Original strand, 75191 - 75326
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  75191 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatt 75289  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaaga 239  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  75290 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 28029 - 27958
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28029 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Original strand, 15483 - 15601
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | ||      ||    
T  15483 aattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaa------ga 15575  T
Q  246 tgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15576 tgatgatgttccaaattattggacta 15601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 8509 - 8673
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||   |||||||    
T  8509 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatt 8604  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8605 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 8673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Original strand, 6097 - 6244
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg----ttgtgttgctgttgtt 199  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |  ||||| |||||||    
T  6097 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgtt 6196  T
Q  200 atttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6197 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2097 - 1935
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 202  Q
    |||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  | ||| |||||||||| |    
T  2097 ttacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaat 1998  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 1935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 724 - 645
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  724 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 4225 - 4304
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4225 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 1248 - 1327
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1248 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15162 - 15083
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15162 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 15194 - 15273
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15194 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 277
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15382
Alignment:
Q  187 tgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 15382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1351 - 1272
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 1272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7249
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 7249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Original strand, 24278 - 24406
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttat 201  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  24278 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 24377  T
Q  202 ttaactaagatgaatgagtcggtctaagt 230  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24378 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 183
Target Start/End: Original strand, 3506 - 3585
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 183  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3506 ttacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 35987 - 36065
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  35987 atattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttgatgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 78
Target Start/End: Original strand, 10813 - 10886
Alignment:
Q  5 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  10813 tgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttgagtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26040 - 25904
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  26040 ttacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatt 25942  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagat 240  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  25941 taactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40002 - 39859
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  40002 ttacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatt 39904  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    |||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  39903 taactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8611 - 8481
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  | ||||| |||| |||||    
T  8611 ttacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttat 8513  T
Q  202 ttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8512 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6597 - 6519
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6597 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt------gatgatgatgatgatgttccaaattattggact 6519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32167 - 32050
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      ||    
T  32167 aattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------ga 32076  T
Q  246 tgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32075 tgatgatgttccaaattattggacta 32050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11445
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattatta 11553  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttcca 258  Q
    | ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||  ||||||| | | |||||||      ||||||||||    
T  11552 tatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgt------tgatgttcca 11460  T
Q  259 aattattggactatt 273  Q
    |||||||||||||||    
T  11459 aattattggactatt 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13598 - 13480
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 245  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      |     
T  13598 aattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gt 13506  T
Q  246 tgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13505 tgatgatgttccaaattattggacta 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4713
Alignment:
Q  158 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38396
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattatta 38288  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttcca 258  Q
    | ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||  ||||||| | | |||||||      ||||||||||    
T  38289 tatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgt------tgatgttcca 38381  T
Q  259 aattattggactatt 273  Q
    |||||||||||||||    
T  38382 aattattggactatt 38396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27855
Alignment:
Q  62 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacta----gaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgtta 27781  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatact-gttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    | |||||||| ||||| |||||   | ||||| || |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27782 tatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  169 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12039
Alignment:
Q  62 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 139  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgctt----gaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 6858 - 6937
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  6858 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  84 tataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttc----aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Original strand, 11462 - 11557
Alignment:
Q  147 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gttgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  11462 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13158
Alignment:
Q  64 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatg 162  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgca----ttacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatg 13179  T
Q  163 tcatgctgtttttgtatactg 183  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13178 tcatgctgtttttgtatactg 13158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 250
Alignment:
Q  192 ctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaa------gataatgatgttccaaattattggattatataag 250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34109
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 34109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40012 - 39890
Alignment:
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||      ||||    
T  40012 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaa------gatg 39920  T
Q  248 atgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39919 atgatgttccaaattattggattatataag 39890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21026 - 20893
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagtt 231  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  | |||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||     
T  21026 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtc 20927  T
Q  232 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    | | |||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  20926 gttgaagatgt------tgatgttccaaattattggacta 20893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 277
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4977
Alignment:
Q  187 tgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 4977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 172
Target Start/End: Original strand, 939 - 1006
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtt 172  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  939 ttacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121743
Alignment:
Q  187 tgttgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 277  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 121743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 174909 - 174785
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttat 201  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||    
T  174909 ttacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttat 174813  T
Q  202 ttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  174812 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1169
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6597
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 6597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13977
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 13977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6258
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 6258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15912
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 15912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 10401 - 10558
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttat 201  Q
    |||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||| ||||||     
T  10401 ttacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaa 10497  T
Q  202 ttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  10498 ttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 10558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16206
Alignment:
Q  62 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||  ||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattac----ttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgtta 16132  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatact-gttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttga 233  Q
    | ||||| || ||||| |||||   | ||||| || |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16133 tatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13147
Alignment:
Q  62 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattg-agacgttgttgacttacaattgatattatt 159  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||  ||  ||| |||||||| || || |||||||| ||    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactt----gaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgtt 13218  T
Q  160 atgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    || |||||||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  13217 atatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15668
Alignment:
Q  134 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagtt 231  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  232 gattaagatg 241  Q
    ||||||||||    
T  15677 gattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 174
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53595
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||    ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac----ttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 53581  T
Q  161 tgtcatgctgtttt 174  Q
    | ||||| ||||||    
T  53582 tatcatgttgtttt 53595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225482
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatt----acttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattatta 225496  T
Q  161 tgtcatgctgtttt 174  Q
    | ||| ||||||||    
T  225495 tatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1091
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaaga 239  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19326 - 19251
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19326 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 19251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 129967 - 129919
Alignment:
Q  187 tgttgctgt-tgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  129967 tgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 270
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2779
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 2779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 270
Target Start/End: Original strand, 45860 - 45926
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 45926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12587
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||     ||||||||| | | || |||||| |||| |||||| || |||||||| |||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-----gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 12657  T
Q  161 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    | |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12656 tatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 167
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8098
Alignment:
Q  62 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||    ||||||||||| |||||  || ||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattac----ttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattatta 8091  T
Q  161 tgtcatg 167  Q
    | |||||    
T  8092 tatcatg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32085
Alignment:
Q  123 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagt 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || ||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  221 cggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    ||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  32125 cggtctaagatgat---------gatgatgatgttccaaattattggact 32085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27975 - 27911
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgc 168  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27975 ttacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4669 - 4545
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt 202  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| | |||||||||| || || ||||| | ||| ||||||  | || || ||||||||||    
T  4669 ttacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatt 4570  T
Q  203 taactaagatgaatgagtcggtcta 227  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  4569 taactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 447 - 416
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  447 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 270
Target Start/End: Original strand, 2905 - 2940
Alignment:
Q  235 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2905 taagatgatgatgatgatgttccaaattattggact 2940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16380 - 16265
Alignment:
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      |||    
T  16380 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gat 16290  T
Q  247 gatgatgttccaaattattggacta 271  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  16289 gatgatgttccaaattattagacta 16265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6755 - 6676
Alignment:
Q  104 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 183  Q
    |||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  6755 ttacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactg 6676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23846
Alignment:
Q  190 tgctgttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 23846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1132 - 1051
Alignment:
Q  149 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaag 229  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1132 ttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 274
Target Start/End: Original strand, 1160 - 1190
Alignment:
Q  244 gatgatgatgttccaaattattggactattt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1160 gatgatgatgttccaaattattggactattt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Original strand, 1137 - 1204
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  1137 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 1204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36457
Alignment:
Q  195 ttgttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatg 241  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 36457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 268
Target Start/End: Original strand, 14756 - 14829
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 268  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  14756 tgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattgga 14829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5705 - 5657
Alignment:
Q  187 tgttgctgtt-gttatttaactaagatgaatgagtcggtctaagttgat 234  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5705 tgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University