View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1343_low_195 (Length: 213)

Name: NF1343_low_195
Description: NF1343
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1343_low_195
NF1343_low_195
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (7-187)||(45235921-45236101)
chr8 (20-187)||(27932282-27932449)
chr8 (20-187)||(29108874-29109041)
chr8 (20-187)||(24870076-24870242)
chr8 (9-187)||(1063365-1063543)
chr8 (7-187)||(32302916-32303097)
chr8 (7-187)||(17220573-17220748)
chr8 (7-187)||(11255060-11255236)
chr8 (21-187)||(24927819-24927985)
chr8 (30-183)||(34776945-34777098)
chr8 (7-166)||(2075907-2076066)
chr8 (7-185)||(39445630-39445799)
chr8 (7-167)||(4230791-4230951)
chr8 (7-168)||(28977185-28977346)
chr8 (7-187)||(1012474-1012655)
chr8 (7-187)||(20399448-20399628)
chr8 (7-187)||(34139304-34139483)
chr8 (7-187)||(17469112-17469291)
chr8 (7-187)||(24568796-24568974)
chr8 (19-187)||(43113678-43113845)
chr8 (109-187)||(40248423-40248501)
chr8 (7-92)||(40248494-40248579)
chr8 (10-121)||(35215364-35215474)
chr8 (31-189)||(14186205-14186358)
chr8 (7-128)||(29089567-29089685)
chr8 (7-182)||(36131974-36132147)
chr8 (20-130)||(34021348-34021456)
chr8 (20-86)||(31325134-31325199)
chr8 (127-186)||(30481474-30481533)
chr8 (128-172)||(9642418-9642462)
chr8 (132-179)||(27056615-27056662)
chr8 (134-186)||(29918590-29918642)
chr8 (156-187)||(2075863-2075894)
chr8 (60-123)||(4594274-4594336)
chr8 (141-187)||(37961014-37961060)
chr8 (134-186)||(8545402-8545454)
chr8 (67-123)||(40789483-40789538)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (7-187)||(7314700-7314880)
chr2 (7-187)||(12193879-12194059)
chr2 (7-187)||(13705413-13705593)
chr2 (20-189)||(10920515-10920684)
chr2 (9-187)||(45256682-45256860)
chr2 (7-187)||(8915989-8916169)
chr2 (20-187)||(24414184-24414351)
chr2 (7-187)||(37106556-37106729)
chr2 (20-187)||(37999353-37999520)
chr2 (7-187)||(36128158-36128339)
chr2 (7-187)||(13830593-13830773)
chr2 (20-189)||(10208480-10208649)
chr2 (7-187)||(30846802-30846983)
chr2 (7-187)||(42798040-42798221)
chr2 (7-187)||(9632243-9632423)
chr2 (20-187)||(45115428-45115595)
chr2 (7-148)||(18106181-18106322)
chr2 (20-187)||(6027941-6028108)
chr2 (7-187)||(31942238-31942417)
chr2 (7-114)||(37472854-37472961)
chr2 (7-187)||(44746161-44746341)
chr2 (7-187)||(14540643-14540818)
chr2 (20-187)||(19104893-19105059)
chr2 (7-127)||(16226839-16226958)
chr2 (20-83)||(16105488-16105551)
chr2 (128-179)||(22900772-22900823)
chr2 (131-179)||(15546725-15546773)
chr2 (42-121)||(30978795-30978873)
chr2 (7-70)||(37319799-37319862)
chr2 (60-123)||(38342657-38342719)
chr2 (42-123)||(4427794-4427874)
chr2 (61-105)||(17598816-17598859)
chr2 (51-123)||(26755631-26755703)
chr2 (134-186)||(30696908-30696960)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (7-187)||(18354132-18354312)
chr1 (7-187)||(45866237-45866417)
chr1 (7-187)||(17092011-17092191)
chr1 (7-186)||(40087516-40087695)
chr1 (9-187)||(17134806-17134984)
chr1 (7-187)||(24236813-24236993)
chr1 (7-187)||(50426713-50426887)
chr1 (7-161)||(42707908-42708062)
chr1 (7-187)||(19572564-19572743)
chr1 (7-187)||(42439722-42439902)
chr1 (20-187)||(36187272-36187439)
chr1 (7-187)||(23966729-23966910)
chr1 (7-187)||(29936273-29936453)
chr1 (7-167)||(39616160-39616320)
chr1 (7-183)||(3628041-3628219)
chr1 (7-166)||(5180902-5181061)
chr1 (7-187)||(28297790-28297971)
chr1 (7-187)||(34610930-34611110)
chr1 (7-187)||(49250825-49251005)
chr1 (20-187)||(51421728-51421895)
chr1 (7-187)||(34060077-34060251)
chr1 (27-187)||(16408823-16408979)
chr1 (7-167)||(24710715-24710875)
chr1 (24-187)||(29871337-29871499)
chr1 (7-187)||(44615527-44615707)
chr1 (7-187)||(44792862-44793042)
chr1 (7-187)||(9982942-9983121)
chr1 (7-166)||(20774489-20774649)
chr1 (7-187)||(12494868-12495047)
chr1 (7-187)||(49741059-49741238)
chr1 (94-187)||(13390357-13390450)
chr1 (24-187)||(34673334-34673496)
chr1 (20-189)||(16433217-16433379)
chr1 (21-110)||(13020559-13020648)
chr1 (20-145)||(35936911-35937035)
chr1 (84-187)||(23490823-23490926)
chr1 (10-125)||(44632250-44632364)
chr1 (60-186)||(2514678-2514804)
chr1 (128-185)||(34085213-34085270)
chr1 (7-56)||(13390306-13390355)
chr1 (135-186)||(16903508-16903559)
chr1 (63-128)||(24159994-24160058)
chr1 (67-123)||(12718904-12718959)
chr1 (60-128)||(36616797-36616864)
chr1 (60-124)||(38733902-38733965)
chr1 (7-78)||(23493497-23493568)
chr1 (135-185)||(10778621-10778671)
chr1 (19-104)||(8679669-8679753)
chr1 (157-186)||(23058473-23058502)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (7-190)||(35311679-35311861)
chr5 (7-189)||(17853343-17853524)
chr5 (7-187)||(4582975-4583155)
chr5 (7-187)||(28045511-28045691)
chr5 (20-189)||(42987530-42987699)
chr5 (7-187)||(3564780-3564960)
chr5 (9-187)||(1218615-1218791)
chr5 (7-187)||(22694954-22695134)
chr5 (7-187)||(29246004-29246184)
chr5 (20-187)||(4920695-4920862)
chr5 (7-187)||(12834627-12834808)
chr5 (7-187)||(40517662-40517842)
chr5 (7-187)||(12866604-12866785)
chr5 (7-187)||(15890063-15890242)
chr5 (30-187)||(6092571-6092728)
chr5 (7-187)||(5908741-5908921)
chr5 (7-183)||(13402061-13402235)
chr5 (20-187)||(6155971-6156138)
chr5 (20-187)||(30996466-30996632)
chr5 (21-187)||(6369566-6369732)
chr5 (7-188)||(27302787-27302965)
chr5 (22-178)||(27088414-27088568)
chr5 (20-149)||(20973576-20973705)
chr5 (7-187)||(12447238-12447417)
chr5 (7-170)||(3573081-3573243)
chr5 (7-190)||(38006519-38006701)
chr5 (11-187)||(2985008-2985183)
chr5 (7-187)||(30115340-30115519)
chr5 (7-187)||(35194042-35194221)
chr5 (7-153)||(33862271-33862415)
chr5 (24-190)||(8453423-8453587)
chr5 (7-187)||(2412779-2412958)
chr5 (7-92)||(10126964-10127049)
chr5 (21-187)||(18206888-18207054)
chr5 (128-187)||(10127058-10127117)
chr5 (22-129)||(42717742-42717849)
chr5 (71-183)||(33420388-33420498)
chr5 (52-123)||(2681096-2681166)
chr5 (42-123)||(20634050-20634130)
chr5 (42-123)||(20650164-20650244)
chr5 (88-152)||(15564573-15564637)
chr5 (60-123)||(34259148-34259210)
chr5 (157-187)||(20973549-20973579)
chr5 (157-186)||(28569075-28569104)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (7-187)||(31752318-31752498)
chr4 (7-187)||(48459343-48459523)
chr4 (20-187)||(47550406-47550573)
chr4 (7-187)||(47239438-47239618)
chr4 (7-187)||(39046815-39046994)
chr4 (20-187)||(32585363-32585531)
chr4 (7-187)||(6382325-6382506)
chr4 (7-187)||(5902667-5902847)
chr4 (7-187)||(7608832-7609012)
chr4 (7-158)||(42774623-42774774)
chr4 (7-187)||(31918611-31918792)
chr4 (19-187)||(21423735-21423903)
chr4 (20-187)||(44317409-44317577)
chr4 (20-187)||(43893103-43893270)
chr4 (20-187)||(11122922-11123089)
chr4 (7-187)||(11027934-11028115)
chr4 (10-187)||(19534321-19534497)
chr4 (7-187)||(26564694-26564873)
chr4 (9-187)||(6482088-6482266)
chr4 (7-187)||(1724363-1724542)
chr4 (7-187)||(42299653-42299832)
chr4 (50-187)||(55826676-55826814)
chr4 (7-167)||(4766389-4766546)
chr4 (7-187)||(37348986-37349165)
chr4 (7-138)||(425686-425816)
chr4 (19-172)||(7985189-7985342)
chr4 (20-189)||(12825512-12825680)
chr4 (25-108)||(15987372-15987455)
chr4 (24-187)||(28695195-28695357)
chr4 (7-177)||(13770518-13770687)
chr4 (8-189)||(39188379-39188557)
chr4 (10-187)||(32596237-32596413)
chr4 (7-187)||(37107274-37107453)
chr4 (50-168)||(13015323-13015446)
chr4 (7-92)||(53906429-53906514)
chr4 (7-121)||(9230146-9230262)
chr4 (109-187)||(53906358-53906436)
chr4 (132-185)||(10302071-10302124)
chr4 (128-187)||(15987315-15987374)
chr4 (7-114)||(29755456-29755562)
chr4 (25-140)||(39375160-39375272)
chr4 (51-123)||(18423474-18423545)
chr4 (134-186)||(33516126-33516178)
chr4 (88-123)||(16216793-16216828)
chr4 (128-169)||(43309468-43309509)
chr4 (7-55)||(13015557-13015605)
chr4 (134-186)||(42907875-42907927)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (7-187)||(17885326-17885506)
chr7 (7-171)||(37182136-37182300)
chr7 (7-187)||(38139844-38140025)
chr7 (7-187)||(16866030-16866210)
chr7 (23-187)||(44734409-44734573)
chr7 (20-187)||(7779882-7780049)
chr7 (20-187)||(30650505-30650672)
chr7 (7-187)||(45885817-45885997)
chr7 (20-187)||(37196050-37196217)
chr7 (7-189)||(17851715-17851897)
chr7 (7-187)||(45379967-45380148)
chr7 (21-189)||(25979967-25980135)
chr7 (7-183)||(41741506-41741681)
chr7 (7-182)||(44794084-44794259)
chr7 (7-158)||(44985981-44986130)
chr7 (7-187)||(12980238-12980418)
chr7 (7-187)||(18125280-18125460)
chr7 (7-187)||(39316856-39317036)
chr7 (20-187)||(21702533-21702700)
chr7 (7-187)||(35074330-35074511)
chr7 (7-187)||(43507294-43507486)
chr7 (7-167)||(24753037-24753196)
chr7 (24-187)||(3920417-3920579)
chr7 (21-187)||(41103528-41103697)
chr7 (7-176)||(25905489-25905659)
chr7 (49-187)||(44658501-44658639)
chr7 (20-187)||(39456067-39456232)
chr7 (7-187)||(18825924-18826103)
chr7 (20-187)||(37579137-37579303)
chr7 (7-187)||(38152763-38152928)
chr7 (51-187)||(16811635-16811770)
chr7 (7-185)||(27850380-27850556)
chr7 (7-187)||(45708917-45709094)
chr7 (7-187)||(2630625-2630805)
chr7 (77-186)||(3226999-3227108)
chr7 (7-187)||(5376947-5377126)
chr7 (15-185)||(46127237-46127403)
chr7 (109-187)||(10072429-10072507)
chr7 (10-187)||(24425246-24425421)
chr7 (28-187)||(26622834-26622992)
chr7 (7-187)||(16078875-16079054)
chr7 (7-187)||(25782959-25783138)
chr7 (35-187)||(26004526-26004675)
chr7 (20-177)||(23328484-23328641)
chr7 (7-86)||(3227696-3227775)
chr7 (7-92)||(10072350-10072436)
chr7 (7-86)||(26004673-26004752)
chr7 (128-185)||(8906643-8906700)
chr7 (47-123)||(21750665-21750740)
chr7 (132-185)||(5565361-5565414)
chr7 (139-179)||(10995894-10995934)
chr7 (128-174)||(27896540-27896586)
chr7 (139-185)||(33841071-33841117)
chr7 (108-153)||(3274765-3274810)
chr7 (51-123)||(18683857-18683928)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (7-187)||(20086865-20087044)
chr3 (7-186)||(29842164-29842343)
chr3 (7-186)||(48390870-48391048)
chr3 (9-187)||(22535893-22536071)
chr3 (7-187)||(34025810-34025990)
chr3 (7-187)||(39728527-39728707)
chr3 (7-183)||(43582434-43582609)
chr3 (7-187)||(44172482-44172662)
chr3 (7-187)||(44179182-44179362)
chr3 (7-187)||(44252603-44252783)
chr3 (19-187)||(44639143-44639310)
chr3 (22-187)||(17146202-17146367)
chr3 (7-186)||(34154274-34154449)
chr3 (21-187)||(23580698-23580863)
chr3 (7-187)||(49579920-49580100)
chr3 (7-173)||(10823759-10823925)
chr3 (20-189)||(44106842-44107011)
chr3 (7-187)||(6738446-6738626)
chr3 (7-187)||(29284192-29284372)
chr3 (7-187)||(39655325-39655505)
chr3 (7-187)||(44953487-44953667)
chr3 (20-187)||(52198023-52198191)
chr3 (7-187)||(52572465-52572645)
chr3 (20-187)||(7469830-7469997)
chr3 (20-171)||(49025550-49025701)
chr3 (7-187)||(4557357-4557536)
chr3 (7-187)||(34119515-34119692)
chr3 (16-176)||(30682687-30682846)
chr3 (7-187)||(53631761-53631940)
chr3 (60-187)||(23154116-23154242)
chr3 (24-187)||(42758248-42758410)
chr3 (20-125)||(48306650-48306755)
chr3 (7-187)||(4016096-4016275)
chr3 (7-187)||(31126847-31127026)
chr3 (24-187)||(54317018-54317180)
chr3 (7-187)||(19111592-19111770)
chr3 (7-142)||(23547069-23547204)
chr3 (7-152)||(41937089-41937233)
chr3 (7-181)||(830866-831039)
chr3 (120-187)||(48305693-48305760)
chr3 (98-153)||(23910330-23910385)
chr3 (126-187)||(23546994-23547055)
chr3 (128-176)||(30616344-30616392)
chr3 (9-128)||(14208260-14208377)
chr3 (88-123)||(1772538-1772573)
chr3 (132-178)||(10043343-10043389)
chr3 (140-186)||(30904868-30904914)
chr3 (42-123)||(23330033-23330113)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (7-187)||(32853700-32853880)
chr6 (20-187)||(10142570-10142737)
chr6 (20-187)||(12141254-12141421)
chr6 (22-187)||(24225569-24225734)
chr6 (7-187)||(10188125-10188305)
chr6 (7-187)||(27534540-27534720)
chr6 (20-187)||(5863435-5863602)
chr6 (7-187)||(2367182-2367362)
chr6 (7-187)||(3483975-3484155)
chr6 (43-190)||(27738664-27738811)
chr6 (7-174)||(14032413-14032579)
chr6 (16-187)||(12309444-12309608)
chr6 (7-187)||(12678146-12678324)
chr6 (7-183)||(14505943-14506118)
chr6 (20-187)||(24602908-24603074)
chr6 (7-187)||(7393939-7394118)
chr6 (63-187)||(32053000-32053124)
chr6 (16-186)||(14254824-14254993)
chr6 (7-187)||(30816114-30816296)
chr6 (109-187)||(32532498-32532576)
chr6 (47-187)||(11762342-11762481)
chr6 (7-92)||(32532420-32532505)
chr6 (7-118)||(14410954-14411064)
chr6 (16-118)||(14245113-14245214)
chr6 (21-82)||(32052927-32052988)
chr6 (126-186)||(20349039-20349099)
chr6 (136-187)||(15498309-15498360)
chr6 (88-123)||(9458234-9458269)
chr6 (148-187)||(14410907-14410946)
chr6 (157-186)||(28079749-28079778)
chr6 (134-186)||(256545-256597)
chr6 (126-186)||(34346058-34346118)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (7-168)||(4113-4275)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (7-187)||(10157-10333)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (7-186)||(197380-197558)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (7-187)||(14632-14811)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (7-187)||(33250-33429)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (20-187)||(90467-90633)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (7-153)||(6263-6408)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (7-127)||(32642-32761)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (7-121)||(36012-36128)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (7-175)||(33440-33611)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (7-84)||(14299-14376)
scaffold0014 (108-140)||(14268-14300)
[»] scaffold1630 (1 HSPs)
scaffold1630 (7-73)||(1479-1545)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (52-123)||(16847-16917)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 45235921 - 45236101
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45235921 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 45236020  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45236021 aataacataacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatggatatgggttcggggtgggtacctatata 45236101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 27932282 - 27932449
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27932282 tcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat 27932381  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27932382 atcaacataaaataattttttacatttgggacggatatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 27932449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29109041 - 29108874
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29109041 tcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatatgacat 29108942  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29108941 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacatatata 29108874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24870242 - 24870076
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24870242 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttt-attaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacat 24870144  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24870143 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggctcggggtgggtacctatata 24870076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 1063365 - 1063543
Alignment:
Q  9 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 108  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1063365 caacaatacgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcgtttaaatatcaatggtaatttttatcaacatgacaattatcaaacaaaa 1063464  T
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1063465 taacaagacatatcaacataaagtaattttttacacttgggatggatttgggtatgagttcggggtgggtacttatata 1063543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 32302916 - 32303097
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32302916 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 32303015  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32303016 aataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 32303097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 17220573 - 17220748
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17220573 tccaccaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 17220672  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  17220673 aataacatgacatatcaacataaagtaatcttttacatttgggacgggtatg-----gggttcggggtgggtacctatata 17220748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11255236 - 11255060
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   | ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11255236 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatgac---ggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaa 11255140  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11255139 aataacat-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatata 11255060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 24927819 - 24927985
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24927819 cactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacata 24927918  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24927919 tccacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 24927985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 183
Target Start/End: Original strand, 34776945 - 34777098
Alignment:
Q  30 atttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataa 129  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34776945 atttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataa 34777044  T
Q  130 aataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34777045 aataattttttacatttgggatggatttgggtatgggttcggggtgggtaccta 34777098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2076066 - 2075907
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2076066 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 2075967  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatggg 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2075966 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatggg 2075907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39445799 - 39445630
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39445799 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgatcatt-aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 39445701  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    |||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39445700 aataacatgacatatctac--------attttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctata 39445630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4230951 - 4230791
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4230951 tccaacaataagctcacttttacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 4230852  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 167  Q
    |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4230851 aataacataatgtatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggt 4230791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28977346 - 28977185
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28977346 tccaacaataagttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 28977247  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggtt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  28977246 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtgtgggtt 28977185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 1012474 - 1012655
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||    |||||||||||||    
T  1012474 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtacttttta-taacacagcaattatcaaacaa 1012572  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata--attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1012573 aataacatggcatatcaacataaagtagttttttttgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 1012655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 20399448 - 20399628
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatc-aaaca 105  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||  ||| |    
T  20399448 tccagcaagatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttggttggtcctttaaatatcaatgctagtttttat-aacacgacaattatataaaaa 20399546  T
Q  106 aaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20399547 aaataacatggtatatcaacataaaataattttttgcattcgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtatctatata 20399628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 34139304 - 34139483
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  34139304 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttgtttactcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 34139402  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||   |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34139403 aataacatggtctatcaacataaagtaatttttttgcattcgggacgggtttgggtat-ggttcggggtgggtacctatata 34139483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 17469112 - 17469291
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||| |||| |  |||||||||||||    
T  17469112 tccaacaatatgttcactttaaaattttttagacccattgatttagtttctcctttaaatatcaatggtagcttttat-aacaaggcaattatcaaacaa 17469210  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||| | || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17469211 aataacatggcatatcaacataaagtagttttctgcagttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatata 17469291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 24568796 - 24568974
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||    |||||||||||||    
T  24568796 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagttttta-taacacatcaattatcaaacaa 24568894  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24568895 aataac-tgacatatcaacataaagtagttttctccattcgggacggatttgagtatgggttcggggtggatacctatata 24568974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43113845 - 43113678
Alignment:
Q  19 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||| |||    
T  43113845 ttcactttaacatttgttataccgattgatttagttgctccttcaaatatcaatgatagtttttat-aacacgacaattatctaacaaaataacataaca 43113747  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| || || |||| | |||| | ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43113746 tatcaacatgaagtagttttctgcattcgagacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatata 43113678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40248501 - 40248423
Alignment:
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40248501 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcgggatgggtacctatata 40248423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40248579 - 40248494
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 92  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40248579 tccaacaatattctcactttaacatttgttagactgaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatga 40248494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 121
Target Start/End: Original strand, 35215364 - 35215474
Alignment:
Q  10 aacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  35215364 aacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctccattaaatatcaagggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaat 35215462  T
Q  110 aacatgacatat 121  Q
    |||||| |||||    
T  35215463 aacatggcatat 35215474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 14186205 - 14186358
Alignment:
Q  31 tttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaa 130  Q
    ||||||||||  | ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||     |||| ||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14186205 tttgttagaccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagttt-----aacacgactgttatcaaacaaaataacatggcatattaacataaa 14186299  T
Q  131 ataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
     ||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14186300 ttaattttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcagggtgagtacctatatatc 14186358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 29089567 - 29089685
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  | | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  29089567 tccaacaatatgtttactttaa-atttgttagacccattaatttagttgctcctttaaatatcaatgatag-ttttaataacacaataattatcaaacaa 29089664  T
Q  107 aataacatgacatatcaacata 128  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  29089665 aataacat-acataccaacata 29089685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36132147 - 36131974
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||| || | ||||| ||| |  ||||||| | |||| || ||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  36132147 tccagcaatatgctcattttaacatttgtttgaccgattaatttaattgcttctttaaattttaatggtaatttttat-aacacggcaattatcaaacaa 36132049  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacct 182  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||    
T  36132048 aataacatgacatat-aacataaaataactttctgcattcgggacggatttgtgtatgagttcggggtggatacct 36131974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Original strand, 34021348 - 34021456
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34021348 tcactttaacatttgttagattaattgatttcgttgctcctttaaatatcaatagtagttttta-tataatgacaattatcaaacaaaataacat-acat 34021445  T
Q  120 atcaacataaa 130  Q
    |||||||||||    
T  34021446 atcaacataaa 34021456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Original strand, 31325134 - 31325199
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta 86  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31325134 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatc-tttaaatatcaatggtagtttttatta 31325199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30481533 - 30481474
Alignment:
Q  127 taaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30481533 taaattaattttttacattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatat 30481474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9642462 - 9642418
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9642462 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggg 9642418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27056662 - 27056615
Alignment:
Q  132 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 179  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27056662 taattttttacatttgggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggta 27056615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Original strand, 29918590 - 29918642
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||    
T  29918590 attttttacatttgggacgggtttgtgtatggtttcggggtgggtacatatat 29918642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 187
Target Start/End: Original strand, 2075863 - 2075894
Alignment:
Q  156 atgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2075863 atgggtatgggttcggggtgggtacctatata 2075894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4594336 - 4594274
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4594336 tttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 4594274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37961060 - 37961014
Alignment:
Q  141 acatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37961060 acatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgtgtacctatata 37961014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8545454 - 8545402
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8545454 attttctacatttgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtatctatat 8545402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Original strand, 40789483 - 40789538
Alignment:
Q  67 atcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40789483 atcaatgaaagttcttat-atcatgatagttatcaaaccaaataacatgacatatca 40789538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7314880 - 7314700
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7314880 tccaacaatatgcccactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgatatttatcaaacaa 7314781  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7314780 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtgtgggtatgggttcggggtgggaacctatata 7314700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12194059 - 12193879
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12194059 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatgtagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 12193960  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||    
T  12193959 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatggatatggattcgaggtgggtatctatata 12193879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13705593 - 13705413
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13705593 tccaacaatacgctcactttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 13705494  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13705493 aataacatgacatatcaacataaagtaatttttcacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatata 13705413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 10920515 - 10920684
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10920515 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 10920614  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10920615 atcaacataaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtggatacctatatatc 10920684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 45256682 - 45256860
Alignment:
Q  9 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 108  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45256682 caacaatacgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 45256781  T
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45256782 taacaagacatatcaaaataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacttatata 45256860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8916169 - 8915989
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8916169 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttaatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 8916070  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8916069 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 8915989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24414351 - 24414184
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24414351 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 24414252  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24414251 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 24414184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 37106556 - 37106729
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37106556 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 37106655  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37106656 aataacat-atatatcaacataaagtaattttttacatttgggac------gggtatgggttcggagtgggtacctatata 37106729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 37999353 - 37999520
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37999353 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgattctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 37999452  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37999453 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacttatata 37999520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36128339 - 36128158
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36128339 tccaacaataagttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 36128240  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36128239 aataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatata 36128158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 13830593 - 13830773
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13830593 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatttacatgacaattatcaaacaa 13830692  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13830693 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacaggtttgagtatgggttcggggtgggtacttatata 13830773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10208649 - 10208480
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10208649 tcactttcacatttgtaagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 10208550  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10208549 attaacataaagtaattttttacatttgggactggtttgagtatgggttcggggtaggtacctatatatc 10208480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 30846802 - 30846983
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30846802 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 30846901  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30846902 aataacataacatatcaacataaagtagtttttttacaattgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 30846983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42798221 - 42798040
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42798221 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42798122  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42798121 aataacataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgtgtatgggttcggggtgggtacttatata 42798040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 9632243 - 9632423
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  9632243 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaa 9632342  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9632343 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatata 9632423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 45115428 - 45115595
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45115428 tcactttaacatttattagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat 45115527  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45115528 atcaacataatgtaattttttacatttgggatgggtttaactatgggttcgggatgggtacctatata 45115595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18106322 - 18106181
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18106322 tccaacaataagttcactttcacatttgttagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 18106223  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgg 148  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106222 aataacataatgtatcaacataaaataattttttacatttgg 18106181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6028108 - 6027941
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| | |    
T  6028108 tcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggctt 6028009  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028008 atcaacataaaatacttttctgcattcaggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 6027941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31942417 - 31942238
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  31942417 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgactgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 31942319  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| || |||| | |||||| ||| | | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31942318 aataacatggcatatcagcataaagtagttttctgcatttgtgacaggtttggttatgggtttggggtgggtacttatata 31942238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37472961 - 37472854
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37472961 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 37472862  T
Q  107 aataacat 114  Q
    ||||||||    
T  37472861 aataacat 37472854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44746341 - 44746161
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||| ||    
T  44746341 tccaacaatatgctcactctaacatttgttagacggaataatttatttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataaccattacaatgatcaaataa 44746242  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| ||| |  |||||||| ||||||    
T  44746241 aataacatggcatatcaagataaagtgattttctacatttgggacgggtttgagtatgagtttgaagtgggtacatatata 44746161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 14540643 - 14540818
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||     |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  14540643 tccagcaatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttaaatatcg----tagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 14540737  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| | || |||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  14540738 aataacatgacatatcaacataaagtaattttctacgttcgggacggatttgagtatggattccgagtgggtgcctatata 14540818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19105059 - 19104893
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||     
T  19105059 tcactttaacatttgttagaccgatcgatttagttgctcttttaaatatcgatagtagtttttat-aacacggcaattattaaacaaaataacatgacac 19104961  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
     |||||||||| ||||||| | |||| ||||||| | || |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  19104960 gtcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgagtatggattcgaggtggatacctatata 19104893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16226958 - 16226839
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  16226958 tccaacaatatattcactttaacatttcttagaccaattgatttagttgctaatttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaataa 16226860  T
Q  107 aataacatgacatatcaacat 127  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  16226859 aataacatgacaaatcaacat 16226839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Original strand, 16105488 - 16105551
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagttttta 83  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  16105488 tcactttaacatttgttagacataatgatttagttgatctgtgaaatatcaatggtaattttta 16105551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Original strand, 22900772 - 22900823
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22900772 aaaataattttttacgtttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggta 22900823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Original strand, 15546725 - 15546773
Alignment:
Q  131 ataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 179  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  15546725 ataattttttacatttgggaagggtatgggtatgggttcagggtgggta 15546773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 121
Target Start/End: Original strand, 30978795 - 30978873
Alignment:
Q  42 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 121  Q
    |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30978795 gaataattcagttgctcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 30978873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 37319799 - 37319862
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatca 70  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||    
T  37319799 tccagcaatatgttcattttaacatttgttagaccgattgatttagttgctactttaaatatca 37319862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38342719 - 38342657
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38342719 tttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 38342657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 4427794 - 4427874
Alignment:
Q  42 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||| ||| ||||| || |||||  |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4427794 gaataattaagttgctcctttaaccatcaatgaaagttcttat-atcatgatagttatcaaaccaaataacatgacatatca 4427874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Original strand, 17598816 - 17598859
Alignment:
Q  61 ttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaaca 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17598816 ttaaatatcaatgattgttttta-taacatgacaattatcaaaca 17598859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 123
Target Start/End: Original strand, 26755631 - 26755703
Alignment:
Q  51 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26755631 agttgctcctttaactatcaatgaaagttctttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatatca 26755703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Original strand, 30696908 - 30696960
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30696908 attttttacatttgggataggtttgggtatgagttcggggtgggtacatatat 30696960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18354312 - 18354132
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18354312 tccaacaatatgttcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 18354213  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  18354212 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtatgggtatcggttcggggtgggaacttatata 18354132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45866417 - 45866237
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45866417 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 45866318  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45866317 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgagtttggggtgggtacctatata 45866237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17092191 - 17092011
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17092191 tccaacaatatgttcactttaacatttattagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 17092092  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  17092091 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggcatgggttcggggtgagtgcctatata 17092011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40087695 - 40087516
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40087695 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 40087596  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40087595 aataacatgatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggtacctatat 40087516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 17134806 - 17134984
Alignment:
Q  9 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17134806 caacaatatgttcactttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 17134905  T
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17134906 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatatgggacgagtatgggtatgggttcggggatggtacctatata 17134984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24236993 - 24236813
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24236993 tccaacaataagtccactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 24236894  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24236893 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 24236813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 50426887 - 50426713
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50426887 tccaacaatatgctcactttaacatttgtaagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 50426788  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50426787 aataacatgacatatcaacataaagtaaatttttacatttgggac------gggtatgggttcggggtgggtacctatata 50426713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42708062 - 42707908
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42708062 tccaacaatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42707963  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42707962 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggt 42707908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19572743 - 19572564
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19572743 tccaccaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaa-tatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 19572645  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19572644 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 19572564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42439902 - 42439722
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42439902 tccaacaataagctcactttaacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42439803  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42439802 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgagtttggatatgggttcggggtgggtacctatata 42439722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36187439 - 36187272
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36187439 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 36187340  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36187339 atcaacataaaataactttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatata 36187272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 23966729 - 23966910
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23966729 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatactttaaatatcaatagtagtttttataaacatgacaattatcaaacaa 23966828  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23966829 aataacataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 23966910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 29936273 - 29936453
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  29936273 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaa 29936372  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29936373 aataacattacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 29936453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 39616160 - 39616320
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39616160 tccaacaatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttaactgatcatttaaatatcaatggtaatttttattaacatgataattagcaaacaa 39616259  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39616260 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggt 39616320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3628219 - 3628041
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3628219 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatattaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 3628120  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataa--ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3628119 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttttacatttgggactggaatgagtatgggttcggggtgggtaccta 3628041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 5180902 - 5181061
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5180902 tccaacaatatgctcactttaaaatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 5181001  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatggg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  5181002 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttggaacgggtatgggtttggg 5181061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 28297790 - 28297971
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28297790 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 28297889  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28297890 aataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 28297971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 34610930 - 34611110
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34610930 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 34611029  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34611030 aataatataacatatcaacataaagtagtattttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatata 34611110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49251005 - 49250825
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49251005 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatcaacatgacaattatcaaacaa 49250906  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49250905 aatagcataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtggatacctatata 49250825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 51421728 - 51421895
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51421728 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatagcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacat 51421827  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51421828 atcaacatagagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 51421895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34060251 - 34060077
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34060251 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggttgtttttattaacatgacaattatcaaacaa 34060152  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34060151 aataacat-acatatcaacataaagtaatttttttacaattgggac------gggtatgggttcggagtgggtacctatata 34060077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 187
Target Start/End: Original strand, 16408823 - 16408979
Alignment:
Q  27 aacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  16408823 aacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat----aca 16408918  T
Q  127 taaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| | | | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16408919 taaagtaattttttacatttggagcgggtttagctatgggttcggggtcggtacctatata 16408979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 24710715 - 24710875
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24710715 tccaacaataagctcattttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 24710814  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 167  Q
    |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  24710815 aataacataatgtatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggt 24710875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29871499 - 29871337
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29871499 tttaatatttgttagaccgattgatgtagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacatgggaattatcaaacaaaataacatgacatatca 29871401  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29871400 acataaaataattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcagggtgggtacctatata 29871337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44615707 - 44615527
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  44615707 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 44615609  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||  ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44615608 aataacatggcatatcaagataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatata 44615527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 44792862 - 44793042
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  44792862 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 44792960  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||  ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44792961 aataacatggcatatcaagataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatata 44793042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9983121 - 9982942
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  9983121 tccagcaatatgctcactttaacatttgttagaccgattaatttagttgctcctttgaatatcaatggtagttttgat-aacatgagaattatcaaacaa 9983023  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| | |||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9983022 aataacatgatatattaacataaagtaattttctgcattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 9982942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 20774489 - 20774649
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20774489 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaataaaagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 20774588  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatggg 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20774589 aataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatggg 20774649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 12494868 - 12495047
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||| |  |||||| ||||||    
T  12494868 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgataaatttagttgctcctttaaatatcagtggtagtttttat-aacacgccaattataaaacaa 12494966  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12494967 aataacatgtcatgtcaacatatagtagttttctacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtacctatata 12495047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49741238 - 49741059
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  49741238 tccaacaatatgttcactttaacatttgttaaaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaa 49741140  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||| | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49741139 aataacataacatattaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 49741059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 187
Target Start/End: Original strand, 13390357 - 13390450
Alignment:
Q  94 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13390357 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctatata 13390450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34673496 - 34673334
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34673496 tttaacatttgttagaccggttgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 34673398  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||| || |||| | | || || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34673397 acataaagtagttttcttcgttcggaacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 34673334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16433379 - 16433217
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |     | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16433379 tcactttaatatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataat----acaattatcaaacaaaataacatgacat 16433284  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||  || | |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16433283 atcaacataaagtaattttctgcatttggggtgggtttgggtatgggttcgg---gggtacctatatatc 16433217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Original strand, 13020559 - 13020648
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaata 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13020559 cactttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 13020648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35937035 - 35936911
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35937035 tcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttgt-aacacggaaattatcaaacaaaataacatgacat 35936937  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatt 145  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35936936 atcaacataaagtaattttctacatt 35936911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23490926 - 23490823
Alignment:
Q  84 ttaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  23490926 ttaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaattagttttttacatttgggacgggttttggtatgggttcggggtgggtaccta 23490827  T
Q  184 tata 187  Q
    ||||    
T  23490826 tata 23490823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 44632364 - 44632250
Alignment:
Q  10 aacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 109  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  44632364 aacaatatgatcactttaacatttgttagacctattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgacaattgtcaaacaaaat 44632266  T
Q  110 aacatgacatatcaac 125  Q
    || ||| |||||||||    
T  44632265 aatatggcatatcaac 44632250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Original strand, 2514678 - 2514804
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat-atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||| | | |     
T  2514678 tttaaatatcaatggtagtttttatta-cacggcaattatcaaacaaaataacatgacatgttcaacataaaataattttatgcattcgggacagattta 2514776  T
Q  159 ggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||  |||||||||| || ||||||    
T  2514777 ggtatgtattcggggtggatatctatat 2514804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 185
Target Start/End: Original strand, 34085213 - 34085270
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34085213 aaaataattttttacatttaggacgagtatgggtatgggttcggggtgggtacatata 34085270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 56
Target Start/End: Original strand, 13390306 - 13390355
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttga 56  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13390306 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacgaaatgatttagttga 13390355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 186
Target Start/End: Original strand, 16903508 - 16903559
Alignment:
Q  135 ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16903508 ttttttacattcgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatat 16903559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24160058 - 24159994
Alignment:
Q  63 aaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacata 128  Q
    |||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24160058 aaatatcaatgacaatttttat-aatatgacaattatcaaatcaaataacatgacatatcaacata 24159994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12718959 - 12718904
Alignment:
Q  67 atcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12718959 atcaatgaaagttcttat-atcatgataattatcaaaccaaataacatgacatatca 12718904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 128
Target Start/End: Original strand, 36616797 - 36616864
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacata 128  Q
    |||||||||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36616797 tttaaatatcaacgacaatttttat-aacttgacaattatcaaaccaaataacatgacataacaacata 36616864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 124
Target Start/End: Original strand, 38733902 - 38733965
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 124  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  38733902 tttaaatatcaatgacaatttttat-aacatgacaattatcaaaccaaataacatagcatatcaa 38733965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23493568 - 23493497
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagt 78  Q
    |||||||| | | ||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23493568 tccaacaataagctcacttccacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagt 23493497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10778671 - 10778621
Alignment:
Q  135 ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  10778671 ttttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtggatatctata 10778621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 8679753 - 8679669
Alignment:
Q  19 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaac 104  Q
    |||||||||||||||  | |||  ||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||    
T  8679753 ttcactttaacatttccttgactaaatgatttgattgctcctttaaatatcaatgataattttta-taacatgatgatcatcaaac 8679669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Original strand, 23058473 - 23058502
Alignment:
Q  157 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23058473 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 23058502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 35311679 - 35311861
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35311679 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 35311778  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35311779 aataacat-acatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggagtgggtacctatatatct 35311861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17853524 - 17853343
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17853524 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 17853425  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17853424 aataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtatctatatatc 17853343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 4582975 - 4583155
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4582975 tccaacaatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 4583074  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4583075 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggggtgggaacctatata 4583155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 28045511 - 28045691
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatt-aacatgataattatcaaaca 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  28045511 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatttaacataacaattataaaaca 28045610  T
Q  106 aaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28045611 aaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-gggtgggtacctatata 28045691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42987699 - 42987530
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42987699 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 42987600  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42987599 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatc 42987530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3564960 - 3564780
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3564960 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 3564861  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggt-gggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  3564860 aataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttggaacgggtatggatatgggttcggagtagggtacctatata 3564780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 1218615 - 1218791
Alignment:
Q  9 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 108  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1218615 caacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagttttt-ttaacatgacaattatcaaacaaaa 1218713  T
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1218714 taacat-acaaatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtacctatata 1218791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22695134 - 22694954
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22695134 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatatagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 22695035  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22695034 aataacattacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctctata 22694954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29246184 - 29246004
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  29246184 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgattcattaaatatcaatggtagtgtttattaacataacaattatcaaacaa 29246085  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29246084 aataacatgacataccaacataaaataattttttacatttgggatgggtatgggtatgggtttggggtgggtacctatata 29246004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 4920695 - 4920862
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4920695 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 4920794  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4920795 atcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatata 4920862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12834808 - 12834627
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12834808 tccaccaatatgctcactttaacatttgttagacgtaacgatttaattgatcattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 12834709  T
Q  107 aataacat-gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12834708 aataacatagacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtaggtacctatata 12834627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 40517662 - 40517842
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40517662 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 40517761  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40517762 aataacataacatatcaacataaaataattttttacctttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtaactatata 40517842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12866785 - 12866604
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12866785 tccaccaatatgctcactttaacatttgttagacgtaacaatttaattgatcattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 12866686  T
Q  107 aataacat-gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12866685 aataacatagacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgcggtgggtacctatata 12866604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 15890063 - 15890242
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||    
T  15890063 tccaccaatatgttcactttaacatttgttagacgtaattatttaattgatccttcaaatatcaatggtagttttcattaatatgacaattatcaaataa 15890162  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15890163 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-gggtgggtacctatata 15890242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6092728 - 6092571
Alignment:
Q  30 atttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataa 129  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6092728 atttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataa 6092629  T
Q  130 aataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6092628 agtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 6092571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5908921 - 5908741
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5908921 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 5908822  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  5908821 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgtgtacatatata 5908741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13402235 - 13402061
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13402235 tccaacaatatgctcattttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 13402136  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  13402135 aataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatcggt-tgggttcggagtgggtaccta 13402061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6156138 - 6155971
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6156138 tcactttaacatttgttagacggaatgatttatttgctcctttaaatatcaatgatattttttattaccatgacaattatcaaacaaaataacatgtcat 6156039  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6156038 ataaacataaagtaattttcaacatttgtgacggttttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 6155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 30996466 - 30996632
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  30996466 tcactttaacatt-gttagacggaatgatttatttgatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcat 30996564  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30996565 atcaacttaaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtgtgtgttcggggtgggtacctatata 30996632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 6369566 - 6369732
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  6369566 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaacatcaacggtagttttcattaacatgataattatcaaacaaaataacacgacgca 6369665  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6369666 tcaacataaagtaattttttacattttggacgggttaaagtatgggttcggggtgggtacatatata 6369732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27302965 - 27302787
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |   | |||||||| |||||||||||||    
T  27302965 tccaacaatatgatcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtacgt---agtaacatgacaattatcaaacaa 27302869  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatat 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27302868 aataacatgacatattaacataaagtaattttttacgtttgggacgtgtatgactatggattcggggtgggtacctatatat 27302787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27088568 - 27088414
Alignment:
Q  22 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 121  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27088568 actttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacataacaattatcaaacaaaataacat-acatat 27088471  T
Q  122 caacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggt 178  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27088470 caacataaaataattttctacattcgagacgggtttgggtatgggttcggggtgggt 27088414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20973705 - 20973576
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20973705 tcactttaatattttttagacggaatgatttagttgatactttacatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataccatgacat 20973606  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttggg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20973605 atcaacataaagtaattttttacatttggg 20973576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 12447238 - 12447417
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||  || || |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  12447238 tccaacaatatattcactttaacatttgttagatcgattgatttaactgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 12447336  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12447337 aataacatgacatattaacataaagtagttttctatatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatata 12447417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 3573081 - 3573243
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||     
T  3573081 tccagcaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttgaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacag 3573179  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | || |||||||||||    
T  3573180 aataacatgacatatcaacataaaataattttctacattcgggaggggtttgagtatgggttcg 3573243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38006701 - 38006519
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| || | ||  ||||||||||||    
T  38006701 tccaacaatatgctcgttttaacaattgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 38006603  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38006602 aataacatgacatattaacataaattaattttcaacattcgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 38006519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 2985008 - 2985183
Alignment:
Q  11 acaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaata 110  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||    
T  2985008 acaatatgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacaacaattatcaaataaaata 2985106  T
Q  111 acatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||| | | ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  2985107 acatgacatatcaatataaaataattttctatattcgagacagatttgggtatggtttcgggatgagtacctatata 2985183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 30115340 - 30115519
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  30115340 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagactgatcgatttagttgctcctttaaatataaatggtggtttttat-aacacggcaattatcaaacaa 30115438  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  30115439 aataacatagcatatcaacataaaataattttatgcattcgggacgggtttgaatatgggttcgggatgggtaccaatata 30115519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35194221 - 35194042
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  35194221 tccagcaatatgttcactttaacattttttagaccaattgatttagtttattctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacagcaattatcaaacaa 35194123  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35194122 aataacatagcatattaacataaagtaattttctacattcgggacgggtttgagtatgagtttggggtgggtacctatata 35194042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33862415 - 33862271
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  33862415 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagccc-attgatttagttggtcatttaaatatcaatcgtagtttttac-aacatgacaattatcaaacaa 33862318  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  33862317 aataacatggcatatcaacataaaatagttttctgcattcgggacgg 33862271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8453587 - 8453423
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| |    
T  8453587 tttaacatttgtttgaccgaatgatttagttactcctttaaatatcaatggtaattttta-taacatgacaattattaaacaaaataac--gacatatta 8453491  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacg-gttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 190  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||  || |||||| ||||||||||||||    
T  8453490 acataaactaattttctacatttgggacgagttttgagtatgactttggggtgtgtacctatatatct 8453423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2412958 - 2412779
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| | ||  | |||||||||||||    
T  2412958 tccaacaatatgctcactttaatatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaattgtagtttttatga-cacaacaattatcaaacaa 2412860  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||  ||||||  | ||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  2412859 aataacatgacatatcaatataaagtaattttctgcatacgggacgagtttgggtattggttcaggatgggtacatatata 2412779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 10126964 - 10127049
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 92  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10126964 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatga 10127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 18206888 - 18207054
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataa-ttatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||| |||| |  || |||| ||||||||||||||| |||    
T  18206888 cactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattagtagtttttat-aacacggcaaattattaaacaaaataacatggcat 18206986  T
Q  120 atcaacata-aaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18206987 atcaacatagaagtaattttctacattcgggacgggtttgaatatgggttc-gggtgggtacctatata 18207054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Original strand, 10127058 - 10127117
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127058 aaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 10127117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 42717849 - 42717742
Alignment:
Q  22 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatc-aaacaaaataacatgacata 120  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||     
T  42717849 actttaacatttgttagaccggttgatttagtttctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgacaattatcaaaacaaaatatcatggcatg 42717751  T
Q  121 tcaacataa 129  Q
    |||||||||    
T  42717750 tcaacataa 42717742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33420498 - 33420388
Alignment:
Q  71 atgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcg 170  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| | |||||||||||||     
T  33420498 atgatagtttttat-aacacgacaattatcaaataaaataacatgacatatcaatataaaat-attttctacattcaagacgggtttgggtatgggttca 33420401  T
Q  171 gggtgggtaccta 183  Q
    |  ||||||||||    
T  33420400 gaatgggtaccta 33420388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Original strand, 2681096 - 2681166
Alignment:
Q  52 gttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2681096 gttgatcctttaactatcaatgaaagttcttattt-catgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 2681166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 20634050 - 20634130
Alignment:
Q  42 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||| |||| |||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20634050 gaataatttggttgttcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 20634130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 20650164 - 20650244
Alignment:
Q  42 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||| |||| |||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20650164 gaataatttggttgttcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 20650244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 152
Target Start/End: Original strand, 15564573 - 15564637
Alignment:
Q  88 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacg 152  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  15564573 catgacaattttcaaaaaaaataacatgacatatcaatgtaaagtaattttctacattcgggacg 15564637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Original strand, 34259148 - 34259210
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34259148 tttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 34259210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20973579 - 20973549
Alignment:
Q  157 tgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20973579 tgggtatgggttcggggtgggtacctatata 20973549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28569104 - 28569075
Alignment:
Q  157 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28569104 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 28569075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 31752318 - 31752498
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31752318 tccagcaatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcattgttagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 31752417  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31752418 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggaacctatata 31752498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 48459343 - 48459523
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48459343 tccaacaatatgctcactttaacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 48459442  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48459443 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 48459523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47550573 - 47550406
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47550573 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 47550474  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47550473 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 47550406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47239618 - 47239438
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47239618 tccagcaatatgctcactttaacatttgataaatgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 47239519  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  47239518 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtatgggtatgggttcagggtgggaacctatata 47239438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 39046815 - 39046994
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39046815 tccaacaatatgctcattttaacatttgttagacggaatgatttagttaatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 39046914  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39046915 aataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggagtgggtacctatata 39046994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 32585363 - 32585531
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgat-agtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32585363 tcactttaacaattgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgattagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagaca 32585462  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32585463 tataaacataaagtaagtttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatata 32585531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6382506 - 6382325
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6382506 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 6382407  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6382406 aataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 6382325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5902847 - 5902667
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5902847 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 5902748  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5902747 aataagataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 5902667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 7608832 - 7609012
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7608832 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatgacagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 7608931  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608932 aataacataacatatcaacatagagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 7609012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 42774623 - 42774774
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42774623 tccaacaatatgttcattttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42774722  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42774723 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacattttggacgggtatg 42774774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31918792 - 31918611
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31918792 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 31918693  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31918692 aataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtaactatata 31918611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 21423735 - 21423903
Alignment:
Q  19 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  21423735 ttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataaca 21423834  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21423835 tatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgtgtatgggtttggggtgggtacctatata 21423903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 44317409 - 44317577
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44317409 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatcgtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44317508  T
Q  120 atcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44317509 atcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 44317577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 43893103 - 43893270
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43893103 tcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 43893202  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  43893203 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgaattcggggtggatacctatata 43893270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11123089 - 11122922
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||    
T  11123089 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtactttttattaacatgacaattataaaacaaaataacaaaacat 11122990  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11122989 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 11122922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 11027934 - 11028115
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11027934 tccaacaataagatcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatataaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 11028033  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11028034 aataacataacatatcaatataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatata 11028115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Original strand, 19534321 - 19534497
Alignment:
Q  10 aacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 109  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  19534321 aacaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttagatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaat 19534419  T
Q  110 aacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19534420 aacatgacatatcaacataaaataattttctacattcgtgacgggtttgggtatgagttcgaggtgggtacctatata 19534497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 26564694 - 26564873
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||    
T  26564694 tccaacaatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgttccgttaaatatcaatgatagtttttat-aacacggcagttatcaaacaa 26564792  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    | |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26564793 actaacatgacatatcaacataaagtagttttctgcatttgggacgggtttgggtatggtttcggggtgggtacctatata 26564873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6482266 - 6482088
Alignment:
Q  9 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  6482266 caacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgttagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaa 6482168  T
Q  109 taacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6482167 taacatggcatatcaatataaattagtttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 6482088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1724542 - 1724363
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||    ||||||| |||||    
T  1724542 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatctaacaa 1724444  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1724443 aataacatgacatatcaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 1724363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 42299653 - 42299832
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  42299653 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagagaggatgatttagttgctcatttaaatatcaacagtagtttttattaacaagacaattatcaaacaa 42299752  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42299753 aataacatggcatatcaacataaagt-actttttatatttgggacgtgtttgagtatgggttcagggtgggtacctatata 42299832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 55826814 - 55826676
Alignment:
Q  50 tagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgg 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  55826814 tagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacgtgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgg 55826715  T
Q  149 gacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55826714 gacgggtttggatatgggttcggggtgggtacctatata 55826676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4766546 - 4766389
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagt-ttttattaacatgataattatcaaaca 105  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  4766546 tccaacaatatgtttactttaacatttgttagaggtaatgatttagtttatcctttaaatatcaatgatagttttttattaacatgacaattatcaaata 4766447  T
Q  106 aaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||| |||| || |||||    
T  4766446 aaataacataacatatcaacataaagta----tttacatttgggacgggtatgagtttgggt 4766389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 37348986 - 37349165
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  37348986 tccagcaatatgctcactttaagatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaacggtagtttttat-aacgcgagaattatcaaacaa 37349084  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37349085 aataacatggcatatcaacataaaataattttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtggatacctatata 37349165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 138
Target Start/End: Original strand, 425686 - 425816
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  425686 tccagcaatatgttcactttaagatttgttagaccgattgatttagttgttcttttaaatatcaatggtagttttta-taacatgacaattatcaaacaa 425784  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataatttt 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  425785 aataacatggcatatcaacataaagtaatttt 425816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7985342 - 7985189
Alignment:
Q  19 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  7985342 ttcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcatttaaatatcaacggtagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgact 7985243  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggg 172  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  7985242 tatcaacataaaatacttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggg 7985189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12825680 - 12825512
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12825680 tcactttaatatttattagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaattttagtttttat-aacacgataattatcaaacaaaataacatgatat 12825582  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    ||||||||||| ||||||| | || | ||||| | | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  12825581 atcaacataaagtaattttctgcactcgggacaggtttgggtataggttcagggtgggtacgtatatatc 12825512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15987455 - 15987372
Alignment:
Q  25 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15987455 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 15987372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28695357 - 28695195
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  28695357 tttaacatttgttaaaccgaatgatttagttgctcctttaaatattaatgatagttttta-taacgtgacaattatcaaataaaataacattgcatatca 28695259  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||  |||||  || ||||| ||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28695258 acataaagcaatttcctatatttgagacgagtttgggtatgagttcggggtgagtacctatata 28695195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13770687 - 13770518
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || || |||||| |||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  13770687 tccaacaatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgctccttcaaatattaatggtcgtttttat-aacacggtaattatcaaacaa 13770589  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtggg 177  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  13770588 aataacatggcttattaacataaaatagttttatgcattcgggacgggtttgagtatgagttcggggtggg 13770518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 39188379 - 39188557
Alignment:
Q  8 ccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||||||  ||||| || | ||||||||||||    
T  39188379 ccaacaatatgttcactttaacatttgttagaacgattgatttagttttttctttaaatataaatggtagttttt--taacacgacagttatcaaacaaa 39188476  T
Q  108 ataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |  | |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39188477 ataacatgacatatcaacataaaacaattttatgcattcgggatgagtttggacatgggtttggggt-ggtacctatatatc 39188557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32596413 - 32596237
Alignment:
Q  10 aacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 109  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  32596413 aacaatatgctcactttaaaatttgttagacttaatgatttagttgttccttcaaatattaatgctagtttttat-aacatgacaattatcaaaccaaat 32596315  T
Q  110 aacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | |||   | |||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  32596314 gacatggtatatcaacataaaataattttctacattcgagacaagtttgggtatgagtttgaggtggggacctatata 32596237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 37107274 - 37107453
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  37107274 tccagcaatatgctcattttaatatttgtcagaccgattgatttagttgcttctttaaataccaatggtagtttttat-aacatggcaattatcaaacaa 37107372  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||    | | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  37107373 aataacatgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatatattttggtataaattcggggtgggtacctatata 37107453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13015446 - 13015323
Alignment:
Q  50 tagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta-----acatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 144  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||| |     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015446 tagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacatgaaaatgaaaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 13015347  T
Q  145 ttgggacggttatgggtatgggtt 168  Q
    | | ||||| | || |||||||||    
T  13015346 tcgagacgggtttgagtatgggtt 13015323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 53906514 - 53906429
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 92  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53906514 tccaacaatacgttcactttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatccattaaatatcaatagtagtttttattaacatga 53906429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 121
Target Start/End: Original strand, 9230146 - 9230262
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcacttt-aacatttgttagacggaatgatttagttgatct--tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaa 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||    
T  9230146 tccaacaatatgttcacttttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacagttatcaaa 9230244  T
Q  104 caaaataacatgacatat 121  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9230245 caaaataacatgacatat 9230262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 53906436 - 53906358
Alignment:
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53906436 taacatgacatatcaacatgaagtaattttttacatttgggacgagtttagatatgggttcggggtgggtacctatata 53906358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 185
Target Start/End: Original strand, 10302071 - 10302124
Alignment:
Q  132 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10302071 taattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcggggtgggtacatata 10302124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15987374 - 15987315
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15987374 aaaataattttttatatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatata 15987315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 29755562 - 29755456
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||  |  |||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  29755562 tccaacaatatactcattttaacatttgttagatcgattgatttagttacttctttaaatatcaatggtagtgttta-taacacggtaattatcaaacaa 29755464  T
Q  107 aataacat 114  Q
    ||||||||    
T  29755463 aataacat 29755456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 140
Target Start/End: Original strand, 39375160 - 39375272
Alignment:
Q  25 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 124  Q
    |||||||||||| ||  || | ||||||||| || ||||||||| | || |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39375160 ttaacatttgttcgattgatttatttagttgttcctttaaatattagtggtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataacatgac--atcaa 39375256  T
Q  125 cataaaataatttttt 140  Q
    | |||| |||||||||    
T  39375257 cgtaaagtaatttttt 39375272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 123
Target Start/End: Original strand, 18423474 - 18423545
Alignment:
Q  51 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18423474 agttgctcctttaactatcaatgaaagtttttat-atcaagatagttatcaaaccaaataacatgacatatca 18423545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33516178 - 33516126
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33516178 attttttacatttgagacgggtttgggtataggttcggggtgggtacttatat 33516126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16216828 - 16216793
Alignment:
Q  88 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16216828 catgataattatcaaaccaaataacatgacatatca 16216793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 43309468 - 43309509
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttc 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  43309468 aaaataattttttacatttgagacaggtatgggtatgggttc 43309509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 13015605 - 13015557
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg 55  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13015605 tccaataatatgttcactttaacatctgttagaccgaataatttagttg 13015557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Original strand, 42907875 - 42907927
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||| |||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42907875 attttctacattcgggacgagtttgggtatgggctcggggtgggtacctatat 42907927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 17885326 - 17885506
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17885326 tccaacaatatgttcactttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattgacatgacaattatcaaacaa 17885425  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17885426 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggttggaacctatata 17885506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Original strand, 37182136 - 37182300
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37182136 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacacaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 37182235  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcgg 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37182236 aataacatgacatatcaacataagataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgg 37182300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38140025 - 38139844
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38140025 tccaacaatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 38139926  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataatt-ttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38139925 aataacatgacatatcaatataaaataatttttttacatttgagacgggtttggttatgggttcggggtgggtacttatata 38139844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 16866030 - 16866210
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16866030 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatcatttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 16866129  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16866130 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 16866210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44734573 - 44734409
Alignment:
Q  23 ctttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatc 122  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44734573 ctttaatatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaataaaataacatgacatatc 44734474  T
Q  123 aacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44734473 aacataaagtaattttttacatttgggacggatatgtgtatgggttcggggtgggtacctatata 44734409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 7779882 - 7780049
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7779882 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 7779981  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7779982 atcaacataaaataaatttttacatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatata 7780049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 30650505 - 30650672
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30650505 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacat 30650604  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30650605 atcaacataaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 30650672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45885997 - 45885817
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45885997 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgattaagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 45885898  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45885897 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggattttggtatgggttcggggtgggtacctatata 45885817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37196217 - 37196050
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  37196217 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttatatatcaatggtagtttttattaacatgacagttatcaaacaaaataacataacat 37196118  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37196117 atcaacataaagtaattttttacatttatgacgggtttgggtatggattcggggtgggtagctatata 37196050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Original strand, 17851715 - 17851897
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17851715 tccaacaaaaagctcactttcacatttattagataaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 17851814  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17851815 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatc 17851897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 45379967 - 45380148
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45379967 tccaacaatacgctcactttaacatttgttagacgaactgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 45380066  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380067 aataacatgacatgtcaacataaagtaatttttttacatttgggacgagtttaggtatgggttcggggtgggtacctatata 45380148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25980135 - 25979967
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25980135 cactttaacatttgttagacggaatgatttatttaatcctttaaatatcaatgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatt 25980036  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  25980035 tcaacataaaataattttttacatttggaaaggatttgggtatgagtttggggtgggtacatatatatc 25979967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41741681 - 41741506
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41741681 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccgttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 41741582  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  41741581 aataacatgacatatcagtataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttc-gggtgggtaccta 41741506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44794259 - 44794084
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44794259 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaagtatcaatggtagtttttagtaacatgacaattatcaaacaa 44794160  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacct 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44794159 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacct 44794084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44986130 - 44985981
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44986130 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44986031  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatg 158  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44986030 aataacat-acatatcaacat-aaataattttttacatttgggacgggtatg 44985981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 12980238 - 12980418
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  12980238 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgaaaattatcaaacaa 12980336  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12980337 aataacatggcatatcaacataaaatattttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 12980418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18125460 - 18125280
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18125460 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgattctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 18125361  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18125360 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgcgttcggggtgggtacctatata 18125280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 39316856 - 39317036
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39316856 tccaccaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaatcgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 39316955  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||| ||| ||||||    
T  39316956 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgagacggatatgggtatgagttcaggatggatacatatata 39317036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 21702533 - 21702700
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21702533 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatataaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 21702632  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702633 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggttggggtatgggttcggggtgggtacctatata 21702700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 35074330 - 35074511
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35074330 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 35074429  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35074430 aataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggttgggtacctatata 35074511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 43507294 - 43507486
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaa---- 102  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||        
T  43507294 tccaacaatatgctcactttaaaatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaa 43507393  T
Q  103 --------acaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43507394 aataacatacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtataggtatgggttcagggtgggtgcctatata 43507486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 24753037 - 24753196
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24753037 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcttt-aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 24753135  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggt 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24753136 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggt 24753196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Original strand, 3920417 - 3920579
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3920417 tttaacatttgttagaccgattcatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 3920515  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3920516 acataaaataattttctacattcgggacagttttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 3920579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 41103528 - 41103697
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatca---atgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  41103528 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcatcaatggtaatttgtattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagag 41103627  T
Q  118 atatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41103628 atatcaacataaaataattttttacatttaggacgggtttatgtatgggttcggggtgggtacttatata 41103697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 25905489 - 25905659
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | |||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25905489 tccaacaataagctcaccttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 25905588  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggt-tatgggtatgggttcggggtgg 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  25905589 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgatgtttgggtatgagttcggggtgg 25905659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44658639 - 44658501
Alignment:
Q  49 ttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgg 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44658639 ttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaatatttttttacatttgg 44658540  T
Q  149 gacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
     |||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44658539 tacgggtttgggtatgggttcgggataggtacctatata 44658501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39456232 - 39456067
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39456232 tcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttccaatatcaatggtaatttttattaccatggcaattatcaaacaaaataacatgacat 39456133  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39456132 atcaacataaagtaa-tttttacatttgggacgggtatgagtat-ggttcggggtgggtacctatata 39456067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18826103 - 18825924
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  18826103 tccaataatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcttttatatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 18826005  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18826004 aataacatggcatatcaacgtaaaataattttctgtatttgggatgggtttgggtacgggttcggggtgggtacctatata 18825924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 37579137 - 37579303
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  37579137 tcactttaacatttgttagatggattgatttagttgctcatttaaatatcaatgataatttttat-aacatgacaattatcaaacaaaataacatggcat 37579235  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    | ||||||||| ||||||| | |||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37579236 agcaacataaagtaattttctgcatttgagacagctttgggtataggttcggggtgggtacctatata 37579303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 38152763 - 38152928
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||               |||||||||||||    
T  38152763 tccaacaatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttagatatcaatggtagt---------------aattatcaaacaa 38152847  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38152848 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatata 38152928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 187
Target Start/End: Original strand, 16811635 - 16811770
Alignment:
Q  51 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttggga 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16811635 agttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataatatatcaacataaagtaattttttacatttggga 16811734  T
Q  151 cggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16811735 cggctttgggtatgggttc-gggtgggtatctatata 16811770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27850556 - 27850380
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  27850556 tccaacaatatgctca-tttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgaaagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 27850459  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27850458 aataacatgacatatcatcgtaaagtaattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctata 27850380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45709094 - 45708917
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45709094 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaatatgacaattatcaaacaa 45708995  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45708994 aataatataacatatcaacataaagta---ttttacattttggacgggtttaggtatgagttcggggtgggtacctatata 45708917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2630805 - 2630625
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| | |  |||||||||||||    
T  2630805 tccaacaatatgttcactttaacatttgatagaccgattgatttagttgctcatttaaatatcaatggtagttttta-taatacggcaattatcaaacaa 2630707  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2630706 aataacatggcatatcaacataaagtagtttttttgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatata 2630625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3227108 - 3226999
Alignment:
Q  77 gtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgg 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  3227108 gtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggatgtgtatgagtatgggttcggggtgg 3227009  T
Q  177 gtacctatat 186  Q
    ||||||||||    
T  3227008 gtacctatat 3226999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 5376947 - 5377126
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  5376947 tccaacaatatgctcattttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 5377045  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5377046 aattacatgatatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 5377126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 46127403 - 46127237
Alignment:
Q  15 aatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacat 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  46127403 aatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagttatta-taacacgacaatgatcaaacaaaataacat 46127305  T
Q  115 gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    |||||||   |||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||| | |||| |||||||||||||    
T  46127304 gacatat---cataaaataattttctgcatttgggacgggtttgagtatgagatcggtgtgggtacctata 46127237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 187
Target Start/End: Original strand, 10072429 - 10072507
Alignment:
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10072429 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 10072507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Original strand, 24425246 - 24425421
Alignment:
Q  10 aacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat 109  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  24425246 aacaatatgctcactttaacatttgttagaccggttgatttatttg-tcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgataattatcaaacagaat 24425343  T
Q  110 aacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| | |||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  24425344 aacatggcatatcaacatatagtaattttatgcatttggaacgggtttggaaatggggtcagggtgggtacctatata 24425421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 26622834 - 26622992
Alignment:
Q  28 acatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacat 127  Q
    ||||||||| |||  | ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26622834 acatttgtttgaccaattgatttaattgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacaacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacat 26622932  T
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26622933 aaaataattttttgcattcgaaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 26622992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 16078875 - 16079054
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16078875 tccaacaatatgttcactttaacattttttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaagggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 16078973  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||   ||||  | ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  16078974 aataacatggcatatcaacgtaaagtaattttctgtattcatgacgagtttgggtataggtttggggtgggcacctatata 16079054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25783138 - 25782959
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||| ||| || || ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  25783138 tccaacaatgtgctcactttaatatttattataccgattgatttagttgctcctttaaatattgatgatagtttttat-aacactgcaattatcaaacaa 25783040  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25783039 aataatatgagatattaacataaagtaattttctgcattcgggacggattttggtatgagttcggggtgggtacctatata 25782959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26004675 - 26004526
Alignment:
Q  35 ttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataa 134  Q
    |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26004675 ttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aagaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaa 26004577  T
Q  135 ttttttacatttgggacg-gttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||| | |||| ||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26004576 ttttctgcattcggggcgagtt---ggtatgggttcggggtgggtatctatata 26004526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Original strand, 23328484 - 23328641
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||    
T  23328484 tcactttagcatttattagaccgattgatttagttattcctttaaatatcaatgataattttta-tagcacgacaattatcaaacaaaataacaagacat 23328582  T
Q  120 atcaacat-aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtggg 177  Q
     ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  23328583 gtcaacataaaaataattttctccattcgggacgggtttgggtataggatcggggtggg 23328641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3227775 - 3227696
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta 86  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3227775 tccaacaatatgctcacttcaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatta 3227696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 10072350 - 10072436
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatag-tttttattaacatga 92  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10072350 tccaacgatatgctcactttaacatttgttaggcggaatgatttagttgatcatttaattatcaatggtagttttttattaacatga 10072436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26004752 - 26004673
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta 86  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26004752 tccaacaatatgctcattttaacatttgttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatggtagtttttatta 26004673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8906700 - 8906643
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8906700 aaaataattttttacatttggaacaggtatggatatgggttcggggtgggtacatata 8906643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 21750665 - 21750740
Alignment:
Q  47 atttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21750665 atttagttggtcttttaactatcaatgaaagttcatat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 21750740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5565414 - 5565361
Alignment:
Q  132 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5565414 taattttttacatttgggatgtgtatgggtatgggttaggggtgggtacatata 5565361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10995934 - 10995894
Alignment:
Q  139 ttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggta 179  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10995934 ttacatttggaacgggtatgggtatgggttcggggtgggta 10995894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27896586 - 27896540
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggt 174  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27896586 aaaataattttttatattcgggacgggtatgggtatgagttcggggt 27896540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Original strand, 33841071 - 33841117
Alignment:
Q  139 ttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctata 185  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  33841071 ttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgagtacatata 33841117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3274810 - 3274765
Alignment:
Q  108 ataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  3274810 ataacatgacatatcaacataatgtaattttctacattcgggacgg 3274765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 123
Target Start/End: Original strand, 18683857 - 18683928
Alignment:
Q  51 agttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18683857 agttgatcatttaactatcaatgaaaattcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatatca 18683928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 20086865 - 20087044
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20086865 tccaacaatatgcccactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaagcaa 20086964  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20086965 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagta-gggttcggggtgggtacctatata 20087044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Original strand, 29842164 - 29842343
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29842164 tccaacaatatgctcacttcaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 29842263  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29842264 aataacatgacaaatcaacataaagtaattttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatat 29842343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 48391048 - 48390870
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48391048 tccaacaatatgttcacttcaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagttttt-ttaacatgacaattatcaaacaa 48390950  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48390949 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacgttcgggacgggtatgggtatgggttcaggatgggtacctatat 48390870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22536071 - 22535893
Alignment:
Q  9 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 108  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22536071 caacaatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 22535972  T
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22535971 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttaggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtgcctgtata 22535893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 34025810 - 34025990
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34025810 tccaacaatatgctccctttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaa 34025909  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  34025910 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtggaaacctatata 34025990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 39728527 - 39728707
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  39728527 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacagaacaattatcaaacaa 39728626  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39728627 aataacattacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 39728707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 43582434 - 43582609
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43582434 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatatcaatggtagtttttatttacatgataattatcaaacaa 43582533  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  43582534 aataacatgacatatcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttc-gggtgggtaccta 43582609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 44172482 - 44172662
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44172482 tccaacaatacgctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44172581  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44172582 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 44172662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 44179182 - 44179362
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44179182 tccaacaatacgctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44179281  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44179282 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 44179362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 44252603 - 44252783
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44252603 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44252702  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44252703 aataacataacatatcaacataaagtagttttttatatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 44252783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 44639143 - 44639310
Alignment:
Q  19 ttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44639143 ttcactttcacatttgttagata-aatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 44639241  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44639242 tatcaacataaaataattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 44639310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17146367 - 17146202
Alignment:
Q  22 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 121  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17146367 actttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatat 17146268  T
Q  122 caacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17146267 caacataaagtaattttttacatttgggaagggtttgtgtatgggttcggggtggatacctatata 17146202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Original strand, 34154274 - 34154449
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34154274 tccaacaatatgttcactttaatatttgttagacataatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 34154373  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34154374 aata-----acatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 34154449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 23580698 - 23580863
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacata 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23580698 cactttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acata 23580796  T
Q  121 tcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23580797 tcaacataaaataattttttacatttgggataagtgtgggtatgggttcggagtgggtacctatata 23580863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 49579920 - 49580100
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  49579920 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaatcatcaaacaa 49580019  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49580020 aataacataacatatcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcgaggtgggtacctatata 49580100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10823925 - 10823759
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10823925 tccaacaataagttcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 10823826  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcgggg 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  10823825 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggagaggtttgggtatgggttcgggg 10823759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44107011 - 44106842
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44107011 tcactttcacatttgtaagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 44106912  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatc 189  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44106911 attaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtagatacctatatatc 44106842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6738626 - 6738446
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6738626 tccaccaatatgctcactttaacatctgttagacataatgatttaattgatccttccaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 6738527  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6738526 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatggatttggggtgggtacctatata 6738446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 29284192 - 29284372
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29284192 tccaacaataagctcactttcacatttgttaaacaaaattatttagttgatcttttaaatattaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 29284291  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29284292 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatctgggacgggtttgggtatgggttcgggctgggtacctatata 29284372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39655505 - 39655325
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39655505 tccaacaataagctcactttcacatttgttagagaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 39655406  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39655405 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgagacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatata 39655325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44953667 - 44953487
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44953667 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44953568  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44953567 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgagtatgagttcggggtgagtacctatata 44953487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 52198023 - 52198191
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaat-aacatgaca 118  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  52198023 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataaacatagca 52198122  T
Q  119 tatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52198123 tatcaacgtaaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 52198191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 52572465 - 52572645
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52572465 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 52572564  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  52572565 aataacataacatattaacataaagtaattttttacatttgggacgggcttgagtatggattcggggtgggtccctatata 52572645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7469997 - 7469830
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7469997 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacat 7469898  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||| ||||||| || | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7469897 atccacataaagtagtgttttacatttgggacgggtttgtgtatgggttcggggtgggtacctatata 7469830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 171
Target Start/End: Original strand, 49025550 - 49025701
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49025550 tcactttcacatttattagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacataacaattatcaaacaaaataacataacat 49025649  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcgg 171  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  49025650 atcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgg 49025701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4557536 - 4557357
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  4557536 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaa 4557438  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4557437 aataacatgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 4557357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 34119515 - 34119692
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  34119515 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcatttcaatatcaatgttagttttta-taacacgacaattatcaaacaa 34119613  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||  ||| |||||||||| ||| || |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34119614 aata--atggcatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 34119692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 30682687 - 30682846
Alignment:
Q  16 atgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30682687 atgttcactttaacatttgttagaacgaatgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacatgaccattatcaaacaaaataacatg 30682785  T
Q  116 acatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgg 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| | || |||| |||||| |||||    
T  30682786 acatatcaacataaagtaattttctacattcaggacgggtttgagtataggttcgaggtgg 30682846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 53631761 - 53631940
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  53631761 tccaacaatatgctcactttatcatttgttagaccgatcgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaa 53631859  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53631860 aataacatggcatatcaacataaagtaattttctagattcgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtacctatata 53631940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23154242 - 23154116
Alignment:
Q  60 tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgg 159  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||     
T  23154242 tttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggataggtatga 23154144  T
Q  160 gtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23154143 gtatgggttcggagtgggtacctatata 23154116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Original strand, 42758248 - 42758410
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42758248 tttaacatttgttagaccggttgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 42758346  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||| ||||||| | | || ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42758347 acataaagtaattttcttcgttcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgcatacctatata 42758410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 48306755 - 48306650
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  48306755 tcactttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacaa 48306656  T
Q  120 atcaac 125  Q
    ||||||    
T  48306655 atcaac 48306650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4016275 - 4016096
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||| ||  |||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  4016275 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcgatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaa 4016177  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| | |||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4016176 aataacatgacatatcaacataaggtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggagtgggtacctatata 4016096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31127026 - 31126847
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||    
T  31127026 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttat-aatacgacaattatcaaacaa 31126928  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  || |||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31126927 aataacatggcatatcaacacaatgtagttttctgcatttgggacgagtttgggtatgagttcggggtggatacctatata 31126847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Original strand, 54317018 - 54317180
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54317018 tttaacatttgttagacatgttgatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 54317116  T
Q  124 acataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54317117 acataaagtaattttcttcgtttgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtacctatata 54317180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 19111592 - 19111770
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  19111592 tccaacaatatgatcactttaacatttgttataccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgaaaattatcaaacaa 19111690  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| | |||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19111691 aataacatgacatat-aacataaagtaattttctacattttgtacgggtttgggcatgggtttagggtgggtacttatata 19111770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23547204 - 23547069
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23547204 tccaacaataagctcactttcacatttgttaaacaaaattatttagttgatcctttaaatataaatgctagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 23547105  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttac 142  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  23547104 aataacataacatattaacataaagtagttttttac 23547069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41937233 - 41937089
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  41937233 tccaacaacatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcatttcaatatcaatgttagtcttta-taacacgacaattatcaaacaa 41937135  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacg 152  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| || |||| | |||||| ||||    
T  41937134 aataatatgacatgtcaacacaaagtagttttctgcatttgagacg 41937089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Original strand, 830866 - 831039
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||||||    
T  830866 tccagcaatatgctcacgttaacattttttagaccaattgatttagtttctccttaaaatatcaatgatagtttttat-aagacggcaattatcaaacaa 830964  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacc 181  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  830965 aataacatagcatattaacataaagtaattttctgcattcgggacgaatttgggtatgggttcagggtgggtacc 831039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48305760 - 48305693
Alignment:
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48305760 atcaacataaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatata 48305693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23910385 - 23910330
Alignment:
Q  98 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23910385 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttctacattcgggacgg 23910330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23547055 - 23546994
Alignment:
Q  126 ataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23547055 ataaagtagttttttacatttgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 23546994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30616392 - 30616344
Alignment:
Q  128 aaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgg 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30616392 aaaataattttttacgtttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgg 30616344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 14208260 - 14208377
Alignment:
Q  9 caacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaa 108  Q
    |||||| || |||| ||||||||||  | ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  14208260 caacaatattttcattttaacatttccttgactgaatgattttgttgctcctttaaatatcaatgaca-ttttta-taacatgacaattatcaaaccaaa 14208357  T
Q  109 taacatgacatatcaacata 128  Q
    ||||||   |||||||||||    
T  14208358 taacatagtatatcaacata 14208377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1772573 - 1772538
Alignment:
Q  88 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1772573 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 1772538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10043389 - 10043343
Alignment:
Q  132 taattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggt 178  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10043389 taattttttatattcgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggt 10043343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30904914 - 30904868
Alignment:
Q  140 tacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30904914 tacattcgagacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatat 30904868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 23330033 - 23330113
Alignment:
Q  42 gaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||| ||||||||| || ||||| ||||||| | |||| |||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23330033 gaataatttagttgctcgtttaactatcaataaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccgaataacatgacatatca 23330113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 32853700 - 32853880
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32853700 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 32853799  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32853800 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 32853880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10142737 - 10142570
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10142737 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 10142638  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10142637 atcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatata 10142570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 12141254 - 12141421
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  12141254 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgttagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacgt 12141353  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12141354 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 12141421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 24225569 - 24225734
Alignment:
Q  22 actttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 121  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24225569 actttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatat 24225668  T
Q  122 caacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24225669 caacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggcatgggttcggggtgggtacctatata 24225734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10188305 - 10188125
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10188305 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcgaacaa 10188206  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10188205 aataacataatatatcaacataaaataattttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 10188125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 27534540 - 27534720
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27534540 tccaacaataagttcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgattctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 27534639  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27534640 aataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatggattcggggtgggtacctatata 27534720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5863602 - 5863435
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5863602 tcactttcacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataacat 5863503  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5863502 atcaacataaaatatttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtatctatata 5863435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 2367182 - 2367362
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2367182 tccaacaataagctcactttaacatttgttagacaaaatgatttagtttatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 2367281  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2367282 aataacataacatatccacataaagtaattttttccatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatata 2367362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3484155 - 3483975
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  3484155 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatgaaacaa 3484056  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3484055 aataacataacatatccacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 3483975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 190
Target Start/End: Original strand, 27738664 - 27738811
Alignment:
Q  43 aatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttac 142  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27738664 aatgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcatacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttac 27738763  T
Q  143 atttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatatct 190  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27738764 atttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatatct 27738811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 14032413 - 14032579
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  14032413 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacacaacaattatcaaacaa 14032511  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14032512 aataacatgacatatcaacataaagtaattttatgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggt 14032579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 12309444 - 12309608
Alignment:
Q  16 atgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatg 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||       || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12309444 atgtttactttaacatttgttagacgaaatgatttaattgcccctttaaatatcaatgatagt-------aatatgacaattatcaaacaaaataacatg 12309536  T
Q  116 acatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12309537 acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatcggttcggggtgggtacatatata 12309608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12678324 - 12678146
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  12678324 tccagcaatatgctcactttaac-tttattagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgataatttttat-aacacgacaattatcaaacaa 12678227  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12678226 aataacatgacatatcaatataaaataattttctcaattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatata 12678146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 14505943 - 14506118
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  14505943 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttat-aacacgacaattatcaaacaa 14506041  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtaccta 183  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  14506042 aataacgtgacatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacgggtttaagtatgggttcggggtgggtaccta 14506118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24603074 - 24602908
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||     
T  24603074 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgtcaattatcaaacaaaataacatggcac 24602976  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24602975 atcaacataaagtaattttctacattcgtgatgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatata 24602908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7394118 - 7393939
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7394118 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatgttagttttta-taacacggtaattatcaaacaa 7394020  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||  ||| |  | || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7394019 aataatatgatataccaacataaaataaatttatgcattcaggatgagtttgagtatgggttcggggtggatacctatata 7393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 187
Target Start/End: Original strand, 32053000 - 32053124
Alignment:
Q  63 aaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggta 162  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  32053000 aaatatcattgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtatttttttacattttggacgggtttgggta 32053099  T
Q  163 tgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||    
T  32053100 tgggtttggggtgggtacatatata 32053124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 14254824 - 14254993
Alignment:
Q  16 atgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatta-acatgataattatcaaacaaaataacat 114  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  14254824 atgttgactttaacatttattagaccgaatgatttaatcgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacatca-aatt-tcaaacaaaataacat 14254921  T
Q  115 gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14254922 gacatatcaacataaagttattatttgcatttgggacgaatttgggtatgggttcatggtgggtacctatat 14254993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 30816114 - 30816296
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||    
T  30816114 tccaacaatatgtacactttaacatttgttagaccgattgatttaggtgctcctttaaatgtcaatggtagttttta-taacacggcaattatccaacaa 30816212  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata---attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30816213 aataacatcacatatcaacataaagtagtttttttttgcattcgggacgggtttggatatgggttcggggtgggttcctatata 30816296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 187
Target Start/End: Original strand, 32532498 - 32532576
Alignment:
Q  109 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32532498 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatata 32532576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 187
Target Start/End: Original strand, 11762342 - 11762481
Alignment:
Q  47 atttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacattt 146  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11762342 atttagttgctcctataaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatataacaaaataacatggcatatcaacataaagtaattttctacattt 11762440  T
Q  147 gggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  11762441 gggatgggtttgggtatgagttcggggtggacacctatata 11762481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 32532420 - 32532505
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatga 92  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32532420 tccaataatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttggtcctttaaatatcattggtagtttttattaacatga 32532505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14411064 - 14410954
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  14411064 tccagcaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgatggttttta-taacacgacaattatcaaacaa 14410966  T
Q  107 aataacatgaca 118  Q
    ||||||| ||||    
T  14410965 aataacacgaca 14410954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Original strand, 14245113 - 14245214
Alignment:
Q  16 atgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  14245113 atgttcactttaacatttattagaccgaatgatttagtcgctcctttaaatattaatggtagttttta-taacacgacaattttcaaacaaaataacatg 14245211  T
Q  116 aca 118  Q
    |||    
T  14245212 aca 14245214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 32052927 - 32052988
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagttttt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  32052927 cactttaacatttgttagacggaatgatttatttaatcctttaaatatcaatgtaagttttt 32052988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 186
Target Start/End: Original strand, 20349039 - 20349099
Alignment:
Q  126 ataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20349039 ataaattaattttttacatttgcaacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatat 20349099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Original strand, 15498309 - 15498360
Alignment:
Q  136 tttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15498309 tttttacatttgggacgggtttgggtgtgggttcgggatgggtacctatata 15498360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 123
Target Start/End: Original strand, 9458234 - 9458269
Alignment:
Q  88 catgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9458234 catgataattatcaaaccaaataacatgacatatca 9458269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14410946 - 14410907
Alignment:
Q  148 ggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14410946 ggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 14410907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28079778 - 28079749
Alignment:
Q  157 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28079778 tgggtatgggttcggggtgggtacctatat 28079749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 256597 - 256545
Alignment:
Q  134 attttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||| ||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  256597 attttctacatttaggaggggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatat 256545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34346118 - 34346058
Alignment:
Q  126 ataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34346118 ataaattaattttctacattcggaacggatttgggtatagattcggggtgggtacctatat 34346058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 4113 - 4275
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4113 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 4212  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacggttatgggtatgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  4213 aataacatgacatatcaacataaagtattttttttacatttgggacgagtttgggtatgggtt 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 10157 - 10333
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   | ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10157 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatgac---ggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaa 10253  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10254 aataacat-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatata 10333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 197558 - 197380
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  197558 tccagcaaaatgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacaaggtaattatcaaacaa 197460  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatat 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| | ||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  197459 aataacatggcatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgggtatagattcggtttgggtacctatat 197380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 14632 - 14811
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  14632 tccagcaatatgctcactttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttac-aacacaataattatcaaacaa 14730  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  14731 aataatatatcatatcaacattaaataattttctacatttgggacgagtttgggtatgtgttcaaggtgggtacctatata 14811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 33250 - 33429
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  33250 tccaacaatatgtttactttaacaattgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatcgtagtttttat-aacacaacaattaccaaacaa 33348  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| || |||| | |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33349 aataacatggcatgtcaacataaagtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatata 33429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 90467 - 90633
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||| || ||||    |||||| ||||||||||||||| |||    
T  90467 tcactttaatatttgttagaccgattgatttatttgctcctttaaatatcaatggttgttttaat-aacacatcaattattaaacaaaataacatggcat 90565  T
Q  120 atcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatata 187  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||  | || |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  90566 atcaacataaaataattttctgcattcaggacgaatttgtgtatgggttcggggagggtaccaatata 90633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 6263 - 6408
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||| |||||| || |||||| || || || || ||||||||||    
T  6263 tccagcaatatgttcactttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatttcaatggtaattttta-tagcacgacaactatcaaacaa 6361  T
Q  107 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgg 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||    
T  6362 aataacatggcatatcaacataaagtaactttctgcatttgagacgg 6408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 32761 - 32642
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||  |||    
T  32761 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgatc-attaaatatcactggtagtttttattaccatgaccattatcactcaa 32663  T
Q  107 aataacatgacatatcaacat 127  Q
    ||| ||||||| |||| ||||    
T  32662 aatcacatgacctatctacat 32642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 121
Target Start/End: Original strand, 36012 - 36128
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcacttt-aacatttgttagacggaatgatttagttgatct--tttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaa 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||    
T  36012 tccaacaatatgttcacttttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacagttatcaaa 36110  T
Q  104 caaaataacatgacatat 121  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36111 caaaataacatgacatat 36128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 33440 - 33611
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaa-ca 105  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  33440 tccaacaatatgttcactttaatatttgttacaccgactgatttaattgcttctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgaaaattatcaaatca 33538  T
Q  106 ---aaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtg 175  Q
       |||||||||| ||||||| |||||| || |||| | |||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  33539 aataaataacatggcatatcatcataaagtagttttctgcatttgtgacgggtttggttatgggtttggggtg 33611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14376 - 14299
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttat 84  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  14376 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttaattgttcctttaaatatcaatggtagtttttat 14299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14300 - 14268
Alignment:
Q  108 ataacatgacatatcaacataaaataatttttt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14300 ataacatgacatatcaacataaaatagtttttt 14268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1630 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1630
Description:

Target: scaffold1630; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 1479 - 1545
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatg 73  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1479 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatg 1545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Original strand, 16847 - 16917
Alignment:
Q  52 gttgatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 123  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16847 gttggtcttttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgataattatcaaaccaaataacatggcatatca 16917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University