View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13443_high_11 (Length: 359)

Name: NF13443_high_11
Description: NF13443
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13443_high_11
NF13443_high_11
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (11-359)||(6261-6609)
scaffold0310 (45-359)||(1-315)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (6-359)||(7283908-7284261)
chr7 (54-341)||(3895089-3895376)
chr7 (54-359)||(15822327-15822632)
chr7 (54-359)||(11287463-11287768)
chr7 (54-359)||(45452063-45452367)
chr7 (54-341)||(44865294-44865582)
chr7 (54-359)||(12369735-12370041)
chr7 (54-341)||(143703-143991)
chr7 (54-331)||(35094890-35095166)
chr7 (54-359)||(39046523-39046824)
chr7 (54-359)||(12759033-12759340)
chr7 (54-359)||(26070161-26070465)
chr7 (54-359)||(26093948-26094252)
chr7 (50-358)||(47289828-47290138)
chr7 (54-341)||(13862828-13863113)
chr7 (54-359)||(12248015-12248322)
chr7 (55-341)||(16569902-16570189)
chr7 (55-341)||(16595473-16595760)
chr7 (54-359)||(49047569-49047875)
chr7 (13-359)||(13377575-13377924)
chr7 (21-359)||(17223797-17224139)
chr7 (54-359)||(13274833-13275129)
chr7 (13-359)||(16914781-16915129)
chr7 (50-341)||(9838943-9839236)
chr7 (50-341)||(48356708-48357001)
chr7 (6-85)||(111121-111200)
chr7 (6-85)||(126739-126818)
chr7 (6-85)||(32493898-32493977)
chr7 (50-341)||(9611371-9611665)
chr7 (271-341)||(3049647-3049717)
chr7 (271-341)||(42056410-42056480)
chr7 (271-340)||(2028986-2029055)
chr7 (271-339)||(2190307-2190375)
chr7 (43-268)||(14271782-14272009)
chr7 (271-341)||(111390-111460)
chr7 (271-341)||(126479-126549)
chr7 (54-350)||(31501228-31501526)
chr7 (13-85)||(3060272-3060344)
chr7 (6-85)||(1936869-1936948)
chr7 (271-341)||(32494167-32494237)
chr7 (206-341)||(16919623-16919758)
chr7 (156-315)||(28722200-28722359)
chr7 (54-268)||(34241101-34241317)
chr7 (156-248)||(14935517-14935609)
chr7 (156-248)||(15363110-15363202)
chr7 (54-127)||(25124407-25124482)
chr7 (13-70)||(13389693-13389750)
chr7 (271-315)||(1937133-1937177)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (6-359)||(1427-1780)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (54-359)||(12349434-12349740)
chr3 (54-359)||(50111946-50112252)
chr3 (54-359)||(8631836-8632142)
chr3 (54-341)||(54424076-54424364)
chr3 (54-359)||(317405-317709)
chr3 (54-341)||(13817576-13817862)
chr3 (54-359)||(16995956-16996260)
chr3 (54-359)||(19570586-19570889)
chr3 (54-338)||(17100720-17101004)
chr3 (54-338)||(17101405-17101689)
chr3 (54-359)||(14298467-14298773)
chr3 (54-359)||(14304094-14304400)
chr3 (54-341)||(16181842-16182128)
chr3 (54-359)||(22144167-22144473)
chr3 (54-359)||(6154226-6154532)
chr3 (54-359)||(35123742-35124047)
chr3 (54-359)||(17938620-17938925)
chr3 (54-328)||(34439237-34439513)
chr3 (54-341)||(14295502-14295790)
chr3 (54-341)||(14301129-14301417)
chr3 (49-341)||(17522780-17523072)
chr3 (113-341)||(55440803-55441032)
chr3 (54-293)||(38527841-38528079)
chr3 (54-359)||(3578135-3578440)
chr3 (153-359)||(53898450-53898656)
chr3 (158-341)||(19260839-19261022)
chr3 (54-341)||(11060902-11061189)
chr3 (176-359)||(6146764-6146947)
chr3 (54-359)||(11328859-11329162)
chr3 (54-359)||(17139554-17139861)
chr3 (54-359)||(16880169-16880477)
chr3 (54-359)||(12560131-12560437)
chr3 (58-359)||(14059112-14059414)
chr3 (54-158)||(6146664-6146769)
chr3 (13-339)||(17191607-17191936)
chr3 (159-359)||(12488727-12488927)
chr3 (130-303)||(11196291-11196457)
chr3 (113-337)||(39656594-39656817)
chr3 (54-188)||(14527975-14528110)
chr3 (46-341)||(3576323-3576621)
chr3 (262-359)||(12349834-12349931)
chr3 (6-85)||(7854306-7854385)
chr3 (13-268)||(17204818-17205076)
chr3 (6-85)||(3992874-3992953)
chr3 (6-85)||(19232090-19232169)
chr3 (54-341)||(30207280-30207570)
chr3 (6-85)||(54037976-54038055)
chr3 (6-85)||(55513194-55513273)
chr3 (271-341)||(3992614-3992684)
chr3 (132-359)||(15876114-15876341)
chr3 (6-85)||(2844515-2844594)
chr3 (265-359)||(14528118-14528213)
chr3 (271-341)||(2844255-2844325)
chr3 (11-85)||(15857120-15857194)
chr3 (271-341)||(16261517-16261587)
chr3 (271-341)||(53771105-53771175)
chr3 (159-268)||(47784767-47784876)
chr3 (271-341)||(30153006-30153076)
chr3 (271-341)||(38167978-38168048)
chr3 (271-341)||(54685422-54685492)
chr3 (54-341)||(14814658-14814948)
chr3 (6-85)||(17955832-17955915)
chr3 (271-341)||(23492437-23492507)
chr3 (271-341)||(33341945-33342015)
chr3 (4-85)||(16743991-16744072)
chr3 (271-341)||(7854046-7854116)
chr3 (275-341)||(17956109-17956175)
chr3 (271-341)||(45581695-45581765)
chr3 (6-85)||(45581955-45582034)
chr3 (54-341)||(9590648-9590937)
chr3 (159-341)||(12953028-12953210)
chr3 (271-341)||(54038245-54038315)
chr3 (54-248)||(14080666-14080863)
chr3 (13-248)||(13301323-13301559)
chr3 (13-248)||(13311979-13312215)
chr3 (43-88)||(15550919-15550964)
chr3 (13-90)||(38810868-38810945)
chr3 (54-127)||(51961031-51961106)
chr3 (158-248)||(6228625-6228715)
chr3 (54-180)||(11882113-11882240)
chr3 (327-359)||(19946744-19946776)
chr3 (156-248)||(31412331-31412423)
chr3 (156-248)||(50313344-50313436)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (6-341)||(15319-15654)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (54-359)||(22737-23043)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (54-359)||(717-1023)
scaffold0673 (63-341)||(6749-7028)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (6-303)||(20274-20572)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (54-359)||(11603-11909)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (11-341)||(11584115-11584448)
chr5 (54-341)||(21397156-21397444)
chr5 (54-358)||(24183027-24183332)
chr5 (54-338)||(4865330-4865613)
chr5 (54-359)||(1168100-1168405)
chr5 (54-358)||(28261568-28261867)
chr5 (54-359)||(20712122-20712428)
chr5 (54-356)||(11337081-11337384)
chr5 (54-359)||(19405583-19405891)
chr5 (54-333)||(21646636-21646914)
chr5 (121-341)||(24475644-24475861)
chr5 (93-341)||(21906781-21907011)
chr5 (54-341)||(3673926-3674215)
chr5 (13-341)||(19862273-19862604)
chr5 (54-337)||(16595576-16595860)
chr5 (76-248)||(23981433-23981606)
chr5 (54-359)||(23493965-23494272)
chr5 (49-359)||(5450731-5451044)
chr5 (54-359)||(7728466-7728774)
chr5 (54-341)||(28902255-28902545)
chr5 (54-341)||(28938650-28938940)
chr5 (13-341)||(21222462-21222791)
chr5 (54-341)||(432527-432815)
chr5 (271-341)||(21650759-21650829)
chr5 (50-341)||(21617080-21617374)
chr5 (271-341)||(2031874-2031944)
chr5 (271-341)||(11342749-11342819)
chr5 (54-268)||(21310603-21310819)
chr5 (271-331)||(21205000-21205060)
chr5 (54-341)||(23466521-23466787)
chr5 (54-268)||(21297069-21297285)
chr5 (13-341)||(37983428-37983758)
chr5 (114-248)||(22885799-22885932)
chr5 (273-338)||(22053963-22054028)
chr5 (276-338)||(18531200-18531262)
chr5 (156-248)||(29918122-29918214)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (54-341)||(55376494-55376780)
chr4 (54-341)||(44055979-44056266)
chr4 (54-356)||(30457952-30458255)
chr4 (54-359)||(53704629-53704934)
chr4 (54-359)||(23269829-23270135)
chr4 (73-359)||(45458769-45459056)
chr4 (54-359)||(16732215-16732520)
chr4 (54-341)||(12837096-12837383)
chr4 (58-341)||(8872372-8872654)
chr4 (54-359)||(34395303-34395609)
chr4 (54-341)||(44346891-44347177)
chr4 (54-359)||(21959359-21959664)
chr4 (54-341)||(53907604-53907882)
chr4 (54-269)||(20813442-20813658)
chr4 (54-341)||(819826-820099)
chr4 (54-341)||(52265403-52265691)
chr4 (54-359)||(27961017-27961324)
chr4 (54-341)||(13809405-13809693)
chr4 (54-359)||(15044874-15045181)
chr4 (54-341)||(30232391-30232679)
chr4 (54-359)||(18494224-18494529)
chr4 (135-347)||(47535042-47535254)
chr4 (54-359)||(15109243-15109550)
chr4 (16-341)||(7185701-7186027)
chr4 (195-359)||(41165983-41166147)
chr4 (6-85)||(54118120-54118199)
chr4 (6-85)||(25119059-25119138)
chr4 (54-341)||(41256263-41256552)
chr4 (95-341)||(18276498-18276743)
chr4 (6-85)||(5682380-5682459)
chr4 (271-341)||(14951826-14951896)
chr4 (271-341)||(15272433-15272503)
chr4 (13-341)||(15013137-15013465)
chr4 (54-341)||(14901296-14901584)
chr4 (271-327)||(5682648-5682704)
chr4 (271-341)||(25119328-25119398)
chr4 (13-341)||(7964565-7964894)
chr4 (273-347)||(10104380-10104454)
chr4 (50-341)||(38764773-38765066)
chr4 (265-347)||(40885676-40885758)
chr4 (273-338)||(15675219-15675284)
chr4 (13-90)||(41165808-41165885)
chr4 (156-248)||(40904932-40905024)
chr4 (271-338)||(31115697-31115764)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (54-359)||(20573087-20573393)
chr8 (54-359)||(41246704-41247009)
chr8 (54-337)||(20561526-20561810)
chr8 (54-359)||(22234700-22235004)
chr8 (54-356)||(37611717-37612020)
chr8 (54-359)||(20481651-20481955)
chr8 (54-359)||(19992952-19993255)
chr8 (54-359)||(21681048-21681356)
chr8 (197-359)||(20653944-20654106)
chr8 (13-358)||(21198005-21198352)
chr8 (54-229)||(25122618-25122793)
chr8 (45-359)||(23837244-23837561)
chr8 (54-359)||(39446660-39446967)
chr8 (211-359)||(20647882-20648030)
chr8 (54-327)||(22981351-22981622)
chr8 (58-158)||(7000524-7000624)
chr8 (43-268)||(17285341-17285570)
chr8 (159-359)||(38533695-38533895)
chr8 (50-341)||(26011558-26011848)
chr8 (50-341)||(5854678-5854971)
chr8 (6-85)||(16404852-16404931)
chr8 (6-85)||(24716714-24716793)
chr8 (50-341)||(15933362-15933655)
chr8 (6-85)||(274767-274846)
chr8 (6-85)||(641003-641082)
chr8 (6-85)||(826809-826888)
chr8 (54-144)||(20529748-20529839)
chr8 (6-85)||(39115599-39115678)
chr8 (271-341)||(274507-274577)
chr8 (271-341)||(641272-641342)
chr8 (271-341)||(827078-827148)
chr8 (271-341)||(16039002-16039072)
chr8 (50-341)||(29306481-29306776)
chr8 (13-341)||(33528489-33528819)
chr8 (271-341)||(41506930-41507000)
chr8 (271-341)||(39115339-39115409)
chr8 (271-341)||(24716983-24717053)
chr8 (50-341)||(22742828-22743122)
chr8 (159-341)||(22735839-22736021)
chr8 (271-312)||(24385873-24385914)
chr8 (54-341)||(38635541-38635831)
chr8 (278-348)||(22497329-22497399)
chr8 (135-243)||(23151810-23151918)
chr8 (54-90)||(31194217-31194253)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (54-359)||(32898836-32899142)
chr6 (54-331)||(18570353-18570630)
chr6 (54-359)||(16086063-16086369)
chr6 (54-359)||(16106562-16106868)
chr6 (54-359)||(22440980-22441285)
chr6 (121-359)||(31628314-31628552)
chr6 (54-359)||(18432689-18432994)
chr6 (54-339)||(13014603-13014890)
chr6 (54-341)||(18777210-18777481)
chr6 (54-359)||(18398984-18399290)
chr6 (54-359)||(25367130-25367438)
chr6 (43-341)||(22361649-22361948)
chr6 (13-358)||(21623215-21623563)
chr6 (159-359)||(18381684-18381884)
chr6 (54-337)||(21410944-21411228)
chr6 (173-359)||(28195108-28195295)
chr6 (271-347)||(18583375-18583451)
chr6 (6-85)||(18583641-18583720)
chr6 (6-85)||(19983144-19983223)
chr6 (6-85)||(35015009-35015088)
chr6 (271-341)||(26089799-26089869)
chr6 (54-347)||(17083093-17083386)
chr6 (54-341)||(18629502-18629791)
chr6 (271-341)||(15742341-15742411)
chr6 (271-341)||(23994987-23995057)
chr6 (50-268)||(17556909-17557127)
chr6 (271-341)||(18002617-18002687)
chr6 (271-341)||(35015278-35015348)
chr6 (206-341)||(25651301-25651436)
chr6 (54-223)||(33324874-33325046)
chr6 (276-359)||(25744331-25744414)
chr6 (54-223)||(35135906-35136078)
chr6 (114-248)||(29605607-29605739)
chr6 (54-245)||(16887685-16887879)
chr6 (271-325)||(19983412-19983466)
chr6 (54-245)||(15079606-15079795)
chr6 (273-341)||(35009569-35009637)
chr6 (114-248)||(22848172-22848304)
chr6 (275-341)||(29665938-29666004)
chr6 (327-359)||(18823565-18823597)
chr6 (327-359)||(18839420-18839452)
chr6 (273-337)||(27740907-27740971)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (54-359)||(9983-10289)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (54-359)||(117857-118164)
scaffold0035 (54-359)||(109356-109663)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (54-359)||(60852-61159)
scaffold0001 (89-359)||(70552-70823)
scaffold0001 (54-193)||(79785-79925)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (54-346)||(9783959-9784249)
chr1 (54-359)||(49967696-49968002)
chr1 (95-359)||(21718274-21718537)
chr1 (54-359)||(22403005-22403311)
chr1 (61-341)||(41212136-41212415)
chr1 (54-341)||(35054820-35055108)
chr1 (54-238)||(35522247-35522432)
chr1 (13-359)||(20177221-20177570)
chr1 (159-341)||(27329757-27329938)
chr1 (54-341)||(16645976-16646266)
chr1 (54-341)||(51627558-51627847)
chr1 (54-341)||(16656702-16656992)
chr1 (271-359)||(35522432-35522520)
chr1 (13-268)||(13376711-13376969)
chr1 (6-85)||(21860335-21860414)
chr1 (6-85)||(41218729-41218808)
chr1 (4-85)||(41394528-41394609)
chr1 (12-85)||(44034829-44034902)
chr1 (50-341)||(37233750-37234043)
chr1 (296-359)||(9784238-9784301)
chr1 (271-342)||(15861547-15861618)
chr1 (54-341)||(17608992-17609281)
chr1 (54-248)||(22143256-22143451)
chr1 (271-341)||(21860075-21860145)
chr1 (271-341)||(44035092-44035162)
chr1 (271-341)||(22367083-22367152)
chr1 (54-341)||(21195078-21195368)
chr1 (54-223)||(19603279-19603449)
chr1 (54-248)||(8537803-8538000)
chr1 (54-248)||(8603042-8603239)
chr1 (273-338)||(20445747-20445812)
chr1 (273-338)||(20531512-20531577)
chr1 (54-248)||(49997174-49997371)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (54-359)||(254710-255015)
scaffold0011 (54-359)||(261316-261621)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (54-359)||(67-370)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (6-245)||(19802-20041)
scaffold0122 (6-245)||(24106-24345)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (54-359)||(132144-132451)
scaffold0021 (50-339)||(88341-88631)
scaffold0021 (54-341)||(11751-12041)
scaffold0021 (54-282)||(16022-16253)
scaffold0021 (54-282)||(25553-25784)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (73-359)||(252903-253190)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (54-359)||(190-496)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (54-359)||(25257-25563)
scaffold0158 (153-359)||(25004-25210)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (54-359)||(11464-11769)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (54-359)||(271216-271521)
chr2 (54-359)||(4448028-4448334)
chr2 (54-359)||(25875816-25876120)
chr2 (54-341)||(23836601-23836888)
chr2 (54-359)||(32465904-32466207)
chr2 (54-359)||(25602070-25602377)
chr2 (54-359)||(36890581-36890886)
chr2 (54-359)||(28974095-28974400)
chr2 (54-293)||(27261916-27262156)
chr2 (54-359)||(24571188-24571493)
chr2 (54-359)||(22579758-22580060)
chr2 (49-341)||(68056-68351)
chr2 (13-359)||(43645939-43646289)
chr2 (54-338)||(31146073-31146360)
chr2 (6-85)||(22284279-22284358)
chr2 (6-85)||(19794581-19794660)
chr2 (6-85)||(20627190-20627269)
chr2 (6-85)||(22275046-22275125)
chr2 (6-88)||(15633535-15633617)
chr2 (265-341)||(6879501-6879577)
chr2 (6-85)||(43642833-43642912)
chr2 (159-346)||(22775206-22775393)
chr2 (159-346)||(22780584-22780771)
chr2 (13-248)||(19666685-19666921)
chr2 (275-341)||(21274174-21274240)
chr2 (271-341)||(22274786-22274856)
chr2 (271-331)||(22284029-22284089)
chr2 (275-339)||(9653021-9653085)
chr2 (13-248)||(19660037-19660273)
chr2 (54-233)||(23821534-23821714)
chr2 (54-233)||(23830613-23830793)
chr2 (229-341)||(25305509-25305622)
chr2 (206-341)||(9636809-9636944)
chr2 (54-248)||(19669003-19669199)
chr2 (273-338)||(24341519-24341584)
chr2 (273-341)||(25265520-25265588)
chr2 (312-359)||(27261852-27261899)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (54-341)||(4627-4913)
scaffold0447 (54-341)||(9241-9527)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (54-359)||(5143-5447)
scaffold0480 (54-359)||(8776-9083)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (54-359)||(9033-9339)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (54-359)||(7615-7922)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (54-341)||(14938-15224)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (54-359)||(85378-85683)
scaffold0014 (54-358)||(159346-159651)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (54-359)||(1363-1667)
scaffold0359 (54-341)||(11548-11837)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (54-341)||(7235-7522)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (54-359)||(112441-112746)
scaffold0022 (54-338)||(102815-103102)
scaffold0022 (174-359)||(109636-109821)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (115-359)||(4987-5231)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (54-341)||(24623-24911)
scaffold0037 (271-357)||(95023-95109)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (54-333)||(48219-48496)
scaffold0068 (54-333)||(61667-61944)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (54-359)||(38344-38650)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (54-339)||(4351-4635)
[»] scaffold0016 (6 HSPs)
scaffold0016 (54-359)||(164261-164565)
scaffold0016 (6-85)||(166116-166195)
scaffold0016 (12-85)||(162036-162109)
scaffold0016 (271-341)||(162299-162369)
scaffold0016 (271-341)||(166385-166455)
scaffold0016 (13-269)||(116410-116664)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (54-359)||(70659-70964)
scaffold0031 (95-351)||(31098-31352)
scaffold0031 (50-341)||(97088-97381)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (54-341)||(33726-34014)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (54-359)||(471-777)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (54-359)||(21558-21862)
scaffold0120 (54-359)||(31257-31561)
scaffold0120 (54-163)||(47445-47554)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (58-358)||(1963-2263)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (50-341)||(46229-46521)
scaffold0034 (54-341)||(40722-41010)
scaffold0034 (6-85)||(80188-80267)
scaffold0034 (271-341)||(79928-79998)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (15-178)||(1-164)
[»] scaffold0342 (3 HSPs)
scaffold0342 (95-341)||(6004-6251)
scaffold0342 (6-85)||(304-383)
scaffold0342 (271-341)||(572-642)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (158-341)||(146665-146848)
scaffold0025 (50-341)||(53410-53703)
scaffold0025 (118-248)||(85690-85818)
scaffold0025 (273-338)||(8917-8982)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (54-205)||(2961-3112)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (54-359)||(33622-33929)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (54-339)||(3385-3671)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (13-341)||(76699-77030)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (54-284)||(7927-8157)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (54-341)||(2211-2499)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (50-341)||(197143-197436)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (43-341)||(6907-7208)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (258-359)||(618-719)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (13-359)||(35524-35873)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (50-341)||(69521-69814)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (135-341)||(2589-2795)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (159-341)||(6725-6907)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (264-359)||(32249-32344)
scaffold0091 (264-359)||(41959-42054)
[»] scaffold0686 (3 HSPs)
scaffold0686 (12-85)||(5735-5808)
scaffold0686 (12-85)||(5941-6014)
scaffold0686 (271-341)||(6204-6274)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (160-359)||(28582-28781)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (113-359)||(93728-93973)
scaffold0032 (271-341)||(55645-55715)
scaffold0032 (13-248)||(104477-104713)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (271-341)||(17525-17595)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (13-341)||(31084-31414)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (54-359)||(8056-8363)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (273-341)||(89584-89652)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (6-85)||(31132-31211)
scaffold0184 (271-341)||(31401-31471)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (6-85)||(41633-41712)
scaffold0078 (271-341)||(41373-41443)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (297-359)||(3345-3407)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (271-341)||(1099-1169)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (271-341)||(13507-13577)
scaffold0251 (271-341)||(21481-21551)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (271-341)||(15013-15083)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (54-223)||(1440-1611)
scaffold0456 (54-223)||(8585-8756)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (271-341)||(6664-6734)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (271-341)||(9628-9698)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (54-248)||(1242-1438)
scaffold0409 (54-248)||(9497-9693)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (6-85)||(30418-30497)
scaffold0116 (297-341)||(30155-30199)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (6-85)||(42678-42754)
scaffold0132 (273-341)||(13571-13639)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (54-223)||(89760-89929)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (54-222)||(10845-11014)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (278-341)||(10094-10157)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (271-341)||(12641-12711)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (271-341)||(186647-186716)
scaffold0004 (271-341)||(193609-193678)
scaffold0004 (50-248)||(27654-27856)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (173-359)||(11140-11326)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (271-341)||(149-219)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (54-245)||(22323-22516)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (54-150)||(70201-70298)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (54-248)||(855-1052)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (50-341)||(23562-23855)
scaffold0080 (13-268)||(43651-43908)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (21-85)||(1371-1435)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (206-341)||(22063-22198)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (206-341)||(108074-108208)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (278-341)||(373-436)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (276-341)||(41713-41778)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (265-341)||(17428-17504)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (265-341)||(61341-61417)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (273-341)||(51312-51380)


Alignment Details
Target: scaffold0310 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 359
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6609
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 6360  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6361 tgataagtgcttaattggatgaattgattaactgttcataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataa 6460  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaatt 310  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6461 ttggattgttgttagttgaaatacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaatt 6560  T
Q  311 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6561 gtgataagtttaatgatcaattgatgttgttattgatatgtcttgttgt 6609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 45 - 359
Target Start/End: Original strand, 1 - 315
Alignment:
Q  45 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaaatg 100  T
Q  145 gtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 244  Q
     | |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  101 ttaataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaag 200  T
Q  245 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttttt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  201 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgtt 300  T
Q  345 gatatgtcatgttgt 359  Q
    |||||||||||||||    
T  301 gatatgtcatgttgt 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 7283908 - 7284261
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7283908 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 7284007  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7284008 ttatatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtgtgaagttatg 7284107  T
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgtt 305  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  7284108 gatgattgaattgttattagttgaattgtatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgtt 7284207  T
Q  306 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7284208 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgt 7284261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3895376 - 3895089
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  3895376 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataatt 3895277  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  3895276 gatgaaattcatgctctaattctgatgaaatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgaaaaa 3895177  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3895176 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 3895089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 15822327 - 15822632
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  15822327 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcagttatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 15822426  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  15822427 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttg-gatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaaatgtatgaa 15822525  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15822526 aatggtatatgttgaaaatatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 15822625  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  15822626 atgttgt 15822632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11287768 - 11287463
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  11287768 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 11287670  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11287669 tgatgaaattagtgctctgattatgttgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 11287570  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||    
T  11287569 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtc 11287470  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  11287469 atgttgt 11287463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 45452063 - 45452367
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  45452063 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 45452162  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45452163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 45452262  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  45452263 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaatttgtga--catgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtc 45452360  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  45452361 atgttgt 45452367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44865582 - 44865294
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44865582 taaggtaagggggttaga-ttcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 44865484  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  44865483 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtgtatga- 44865385  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44865384 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgtt 44865294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 12369735 - 12370041
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  12369735 taaggtaagggggttagatttcatcattatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 12369834  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12369835 tgattaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttacggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 12369934  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||     
T  12369935 atgggtatctgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtg 12370034  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  12370035 atgttgt 12370041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 143991 - 143703
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  143991 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtataaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 143892  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  143891 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 143794  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  143793 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgtt 143703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35095166 - 35094890
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35095166 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 35095067  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag-aa 252  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  35095066 gatgaaattcatgctctaattgtgataacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtatatgaaa 35094968  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 331  Q
     | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||    
T  35094967 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaat 35094890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 39046523 - 39046824
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39046523 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 39046622  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||    ||| ||    
T  39046623 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattattgttagttgaattgtatgttcaa---ttgaaaa 39046719  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||    
T  39046720 atgagtatatg-tgaaaatat-ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtc 39046817  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  39046818 atgttgt 39046824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12759340 - 12759033
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  12759340 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataa 12759241  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |    
T  12759240 atgatgaaatttgtgctccaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaaatgtgaaa 12759141  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  12759140 aaggggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagt 12759041  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  12759040 catgttgt 12759033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 26070161 - 26070465
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  26070161 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26070257  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070258 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26070357  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  26070358 aaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 26070457  T
Q  352 catgttgt 359  Q
     |||||||    
T  26070458 gatgttgt 26070465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 26093948 - 26094252
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  26093948 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26094044  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26094045 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26094144  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  26094145 aaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 26094244  T
Q  352 catgttgt 359  Q
     |||||||    
T  26094245 gatgttgt 26094252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 50 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47290138 - 47289828
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 147  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47290138 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaaatgcttaattggatgaattgattaattgttc 47290039  T
Q  148 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gt 245  Q
    |||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47290038 ataaatgatgaaattcgagctctaattatgatgccatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgt 47289940  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttg 345  Q
    |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  47289939 atga-aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctg 47289841  T
Q  346 atatgtcatgttg 358  Q
     || |||||||||    
T  47289840 ttaagtcatgttg 47289828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 13862828 - 13863113
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||||  ||||      
T  13862828 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaa----gcttaattgggtgaatagattaattgtccataaa 13862923  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13862924 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 13863023  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  13863024 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgtt 13863113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 12248015 - 12248322
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  12248015 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattacttgttcata 12248112  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12248113 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgtttaaagtatgag 12248212  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 349  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||     
T  12248213 aaaatagtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaa 12248312  T
Q  350 gtcatgttgt 359  Q
    || |||||||    
T  12248313 gtgatgttgt 12248322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 55 - 341
Target Start/End: Original strand, 16569902 - 16570189
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16569902 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16569999  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16570000 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16570099  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16570100 aatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgtt 16570189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 55 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16595760 - 16595473
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16595760 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16595663  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16595662 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16595563  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16595562 aatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgtt 16595473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 49047569 - 49047875
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |    
T  49047569 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtta-tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcaga 49047666  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || |  |||| |||||| | |||| |||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  49047667 attgttagaatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 49047766  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 349  Q
    |   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  49047767 agagtggtatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaa 49047865  T
Q  350 gtcatgttgt 359  Q
    || |||||||    
T  49047866 gtgatgttgt 49047875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377575
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-g 13377826  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgga 207  Q
    ||||| |||||| || ||||  | ||| ||||||||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||    
T  13377825 tatgaataagtgattcattgagt-aatcgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttga 13377727  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttg 306  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||| ||| ||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  13377726 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatactcaaattgattaattatgctatgttgttgttg 13377628  T
Q  307 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  13377627 aattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgt 13377575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 17223797 - 17224139
Alignment:
Q  21 aaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaatttt-caattatttgtatgat- 114  Q
    ||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||     
T  17223797 aaagtgaagcttgggctaagaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaatttttcaattattt-tatgatt 17223895  T
Q  115 aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 214  Q
    |||||||||||||  | |||  |||||||| ||| |  || |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||| |||||||||||    
T  17223896 aagtgcttaattgagtaaata-attaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattga 17223994  T
Q  215 attgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtg 313  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||     
T  17223995 attgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatactcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtt 17224093  T
Q  314 ataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
     ||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  17224094 gtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 17224139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13275129 - 13274833
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  13275129 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 13275032  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| | |||||| | | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  13275031 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatgag 13274932  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 349  Q
    ||  |||||||||           |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  13274931 aaagtggtatatg-----------ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaa 13274843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 16914781 - 16915129
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaa-ttttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | || ||  |||||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||| ||    
T  16914781 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtcctaattaaggtaaaggggttagaattcaatcacaatcatttagtgtaacttttcaattatt-gt 16914879  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||    
T  16914880 atgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgat 16914978  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttga 307  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||||| ||  | |||||| |||  ||||||||||||    
T  16914979 aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaacgttgaattgtgctatgttgttgttga 16915077  T
Q  308 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  16915078 attatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgt 16915129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9839236 - 9838943
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  ||||||||||     
T  9839236 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9839139  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  9839138 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9839039  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  9839038 atgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 9838943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 48357001 - 48356708
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 146  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||  | || |||||||||| |    
T  48357001 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcattcgttgtatgattaaatgcttaattgagt-aagtgattaattgtt 48356903  T
Q  147 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 246  Q
    ||||  || | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  48356902 catagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagta 48356803  T
Q  247 tgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    || |||  || |||||||||||  ||||||| || || |||||| ||   ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  48356802 tgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 48356708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 111121 - 111200
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  111121 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 111200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 126818 - 126739
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  126818 agaatcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 126739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 32493898 - 32493977
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32493898 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 32493977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9611665 - 9611371
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  ||||||||||     
T  9611665 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9611568  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  9611567 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9611468  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgct--caattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| |||  || ||||||||| || ||||||   || || |||||| |||  ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  9611467 atgtgaaagtgttatatgttg-aattatgcttctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 9611371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3049717 - 3049647
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3049717 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 3049647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 42056410 - 42056480
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42056410 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 42056480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2029055 - 2028986
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2029055 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgt 2028986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 2190307 - 2190375
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2190307 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttg 2190375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 268
Target Start/End: Original strand, 14271782 - 14272009
Alignment:
Q  43 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||    
T  14271782 ttggtgataattaaggtaagggaattagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-ga 14271879  T
Q  138 ttaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatg 237  Q
    ||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| || | ||||||| |||||||||| ||  |||| ||||    
T  14271880 ttaattgttcatagttg-tcaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatg 14271978  T
Q  238 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 268  Q
    ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  14271979 ttcaaagtatgtgaaaatgatatatgttgaa 14272009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 111390 - 111460
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  111390 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 111460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 126549 - 126479
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  126549 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 126479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31501526 - 31501228
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatca-taatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||| ||  |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  31501526 taaggtaagggggttagaattcaacaataatcaattagttgtaattttca-ttaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcat 31501429  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  |||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||| ||  ||||| ||   ||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||||||     
T  31501428 agttgatgaaattagtgatctaattatgaagatatgtttaaatacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgt 31501329  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 348  Q
    |||  || |||||  |||| | |||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| ||    
T  31501328 gaaaatgatatattgtgaata-atgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgtta 31501230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3060272
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatca 3060272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 1936869 - 1936948
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  1936869 agaatcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatca 1936948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 32494167 - 32494237
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  32494167 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 32494237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16919758 - 16919623
Alignment:
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgt 304  Q
    |||||| |||||||| || ||  |||| |||||||||| ||||||||  || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  16919758 gataatcgaattgttattggtgaaatttcatgttcaaaatatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgt 16919660  T
Q  305 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||  || || | |||||||||||||    
T  16919659 tgaattgtgataagaatcgtgtttaattgatgttgtt 16919623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28722359 - 28722200
Alignment:
Q  156 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagtt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||  |    
T  28722359 tgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 28722260  T
Q  256 ggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgat 315  Q
    | |||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  28722259 gatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgat 28722200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Original strand, 34241101 - 34241317
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||    
T  34241101 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgattaattgagt-aagtgattaattgttcata 34241199  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      |||| ||||||||| | || ||||||||  ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||| |    
T  34241200 gttgataaaattcgtgttataattatgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagtatgtg 34241299  T
Q  251 aagttggtatatgttgaa 268  Q
    ||  |  |||||||||||    
T  34241300 aaagtaatatatgttgaa 34241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14935609 - 14935517
Alignment:
Q  156 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  14935609 tgaaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 14935517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15363202 - 15363110
Alignment:
Q  156 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  15363202 tgaaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 15363110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124407
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 25124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389693
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 315
Target Start/End: Original strand, 1937133 - 1937177
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgat 315  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  1937133 tatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaattatgat 1937177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1427
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1780 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 1681  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1680 ttggatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcctatgtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 1581  T
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgtt 305  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||| |    
T  1580 aataattgaattgttgttggttgaattatatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgttgaattatgttatgtgattgat 1481  T
Q  306 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||    
T  1480 gaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgt 1427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 12349434 - 12349740
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||      
T  12349434 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgtccataaa 12349533  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12349534 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtataaatttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtgagaa 12349633  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12349634 gttgttatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 12349733  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  12349734 atgttgt 12349740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 50111946 - 50112252
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  50111946 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 50112045  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50112046 tgatgaaattcatgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 50112145  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  50112146 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtc 50112245  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  50112246 atgttgt 50112252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8632142 - 8631836
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  8632142 taaggtaagggggttaggattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattaattaattgttcttaag 8632043  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8632042 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtttgagaa 8631943  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  8631942 gttggtatatgttgaaaatatgcttatttagtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtc 8631843  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  8631842 atgttgt 8631836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 54424364 - 54424076
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt-aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  54424364 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 54424265  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54424264 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 54424165  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54424164 attgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 54424076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 317405 - 317709
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  317405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 317504  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  317505 gatgaaattcgtgctctaagtatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 317604  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca 353  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||    
T  317605 tgggtatgtg-tgaaaatatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtca 317703  T
Q  354 tgttgt 359  Q
    ||||||    
T  317704 tgttgt 317709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13817862 - 13817576
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13817862 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgtacatatgt 13817763  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 251  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  13817762 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 13817665  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13817664 aatgggtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 13817576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 16995956 - 16996260
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  16995956 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattattcataagt 16996055  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||     
T  16996056 ggtgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttacttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 16996155  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca 353  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||    
T  16996156 tgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtca 16996254  T
Q  354 tgttgt 359  Q
    ||||||    
T  16996255 tgttgt 16996260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 19570586 - 19570889
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19570586 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaatttttcatatgt 19570684  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||     
T  19570685 gatgaaatttgtgctctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 19570783  T
Q  254 ttg-gtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||    
T  19570784 atgagtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtc 19570882  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  19570883 atgttgt 19570889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17101004 - 17100720
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      
T  17101004 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17100906  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17100905 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaac 17100806  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17100805 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 17100720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17101689 - 17101405
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      
T  17101689 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17101591  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17101590 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaac 17101491  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17101490 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 17101405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14298773 - 14298467
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  14298773 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14298674  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  14298673 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatgat 14298574  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14298573 atggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtc 14298474  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  14298473 atgttgt 14298467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14304400 - 14304094
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  14304400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14304301  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  14304300 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatgat 14304201  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14304200 atggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtc 14304101  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  14304100 atgttgt 14304094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 16181842 - 16182128
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16181842 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 16181941  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| |    
T  16181942 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttaaattacatgttcaaagtgtatga-a 16182039  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | | ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16182040 aatgggtatgtg-tgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgtt 16182128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 22144167 - 22144473
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||      
T  22144167 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactttttgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaactgttcataac 22144266  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 250  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  22144267 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 22144364  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |    
T  22144365 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaag 22144464  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
     ||||||||    
T  22144465 ccatgttgt 22144473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 6154226 - 6154532
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6154226 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttctatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6154325  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag--tatgag 250  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  6154326 tcatgaaattcgtcctctaattataatgacatgtttagatgtatgaaattatgaatagttgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtttatga- 6154423  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |    
T  6154424 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaag 6154523  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  6154524 tcatgttgt 6154532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35124047 - 35123742
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  35124047 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35123948  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaa-agtatgaga 251  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||| |    
T  35123947 tgatgaaattcgtactttaattatgatgacgtgtttggatgtatgaaattatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttaaagtgtatgaaa 35123848  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35123847 ag--ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgt 35123750  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  35123749 catgttgt 35123742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17938925 - 17938620
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || |  |    
T  17938925 taagataagggggttagggttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcttgag 17938826  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||  |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17938825 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttggatgtataaagc-atggttaagcgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgagaa 17938727  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17938726 gttgatatatgttgaaaatatgcttaattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 17938627  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  17938626 atgttgt 17938620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 328
Target Start/End: Original strand, 34439237 - 34439513
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34439237 taaggtaaggagattagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 34439336  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttta-gatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  34439337 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttatgaggtatgaagttatggataaatgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaa 34439436  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatc 328  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34439437 aatgggtatgtgtttaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14295790 - 14295502
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||      
T  14295790 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14295692  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14295691 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14295592  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14295591 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgtt 14295502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14301417 - 14301129
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||      
T  14301417 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14301319  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14301318 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14301219  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14301218 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgtt 14301129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 341
Target Start/End: Original strand, 17522780 - 17523072
Alignment:
Q  49 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 147  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||    
T  17522780 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgagaagtgcttatttgggtgaattgattatttgttc 17522878  T
Q  148 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat 247  Q
    |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17522879 ataaatgatgaacttcgtgctctaattatgatgacagttttggatgtatgaagatgtggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat 17522978  T
Q  248 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17522979 aacaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgtt 17523072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 113 - 341
Target Start/End: Original strand, 55440803 - 55441032
Alignment:
Q  113 ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataatt 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  55440803 ataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatt 55440902  T
Q  213 gaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattg 311  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||| |||||||||    
T  55440903 gaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgatgaaaatatgctcaactggttgaattatactatgttgtggttgaattg 55441002  T
Q  312 tgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55441003 tgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 55441032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38528079 - 38527841
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  38528079 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaactatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 38527980  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 251  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  38527979 gatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 38527882  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 293  Q
    | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38527881 aatgggtatgtg-ggaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3578440 - 3578135
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||     
T  3578440 taaggtaagcgggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtaggaataagtgcttaattgggtaaattgattaattgttcataa 3578342  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3578341 atgatgatattcattctctaattatgatgacatgttga-atgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgttcaaagtatgaga 3578243  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  3578242 aaatagtatatgttgaaaatatgctcaactggttgaattacgctatgttgtggttgaattgcgataagtttcatgatcaattgat-ttgttgttgctaag 3578144  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  3578143 tcatgttgt 3578135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 359
Target Start/End: Original strand, 53898450 - 53898656
Alignment:
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgag 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||     
T  53898450 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatctatgaagttatgaataattgaattgt-gttagttgcattaaatgttcaaagtgtatgaa 53898548  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  53898549 aa-tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatg 53898647  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  53898648 tcatgttgt 53898656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Original strand, 19260839 - 19261022
Alignment:
Q  158 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttgg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  19260839 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 19260938  T
Q  258 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19260939 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 19261022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 11060902 - 11061189
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||      
T  11060902 taaggtaagggggttggaattcatcataatcataattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattaattatttgttaatgg 11060999  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11061000 atgatgaaattcgtgctctaattatgatca-atttttaaatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagttgaatttcaggttcaaagtatgaga 11061098  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  11061099 aaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgtt 11061189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 359
Target Start/End: Original strand, 6146764 - 6146947
Alignment:
Q  176 tgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||| ||||||||||||    
T  6146764 tgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgta-ttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgttgaaaatat 6146861  T
Q  274 gctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  6146862 gctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgt 6146947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 11328859 - 11329162
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  11328859 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 11328956  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| | |||||||||||||||     | || ||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  11328957 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtt-----gcataaagttgttaataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 11329051  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11329052 agaaagtggtatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgct 11329150  T
Q  348 atgtcatgttgt 359  Q
    | || |||||||    
T  11329151 aagtgatgttgt 11329162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17139861 - 17139554
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || ||||    
T  17139861 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattcttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaagtgttcat 17139764  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||||    
T  17139763 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatga 17139664  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 348  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17139663 gaaaatggtatatgttg-aaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgcta 17139565  T
Q  349 tgtcatgttgt 359  Q
     || |||||||    
T  17139564 agtgatgttgt 17139554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16880477 - 16880169
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||  | ||||||||||||| |||    
T  16880477 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaacaagtgtttaattgagt-aattgattaattgttca 16880380  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||| ||||| ||||||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  16880379 taattgtttgaattcgtgctccaattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatg 16880280  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtg-aattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| |    
T  16880279 agaaagtggtatatgtt-agaatatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgct 16880181  T
Q  348 atgtcatgttgt 359  Q
    | || |||||||    
T  16880180 aagtgatgttgt 16880169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 12560131 - 12560437
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  12560131 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 12560228  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||  ||| ||  |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  12560229 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgattgaatgcttgaagttattgatacttgaatttttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 12560328  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 349  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| ||     
T  12560329 aaagtggtatatgt-gaaaatatgcccaactggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaa 12560427  T
Q  350 gtcatgttgt 359  Q
    || |||||||    
T  12560428 gtgatgttgt 12560437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 359
Target Start/End: Original strand, 14059112 - 14059414
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtg 154  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| ||||   ||    
T  14059112 gtaagggggttataattcatcataatcattttagtgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgact-aattgactaattgttcatgattg 14059209  T
Q  155 atgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagt 254  Q
     |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||      
T  14059210 ttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaa 14059309  T
Q  255 tggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca 353  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||| ||||| |    
T  14059310 tgacatatgttgaaa-tatgctcaatttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtga 14059408  T
Q  354 tgttgt 359  Q
    ||||||    
T  14059409 tgttgt 14059414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Original strand, 6146664 - 6146769
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6146664 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6146763  T
Q  153 tgatga 158  Q
    ||||||    
T  6146764 tgatga 6146769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191607
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||| || |    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcacaatcattttagtgtaatttttcaattgtt-g 17191838  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgga 207  Q
    |||||  || ||||||||||  | ||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||    
T  17191837 tatgaacaattgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 17191739  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttg 306  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || | ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||   |||||||| ||    
T  17191738 taatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatttatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgctg 17191640  T
Q  307 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 339  Q
    ||||||||||||  ||||| | |||||||||||    
T  17191639 aattgtgataagaatcatgtttaattgatgttg 17191607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 359
Target Start/End: Original strand, 12488727 - 12488927
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 258  Q
    ||||| ||||||| |||||||    ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||  || |    
T  12488727 aattcatgctctaattatgatattgtgtttggatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 12488826  T
Q  259 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgtt 357  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||    
T  12488827 atatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtt 12488925  T
Q  358 gt 359  Q
    ||    
T  12488926 gt 12488927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 303
Target Start/End: Original strand, 11196291 - 11196457
Alignment:
Q  130 tgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 229  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11196291 tgaattgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgctctaataatgatgatatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 11196390  T
Q  230 attacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 303  Q
    |||  ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  11196391 attttatgt--------tgagaaaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgatttgttgttg 11196457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39656817 - 39656594
Alignment:
Q  113 ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataatt 212  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||  || | |||| ||||||| | ||||||||  ||||||  || |||||| ||   |||||||    
T  39656817 ataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaatccgtgctccaattatgatgttatgtttgaatttatgaaattggtgataatt 39656719  T
Q  213 gaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattg 311  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39656718 gaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattg 39656620  T
Q  312 tgataagtttcatgatcaattgatgt 337  Q
    |  |||| |||||| |||||||||||    
T  39656619 ttgtaagattcatgttcaattgatgt 39656594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Original strand, 14527975 - 14528110
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||     
T  14527975 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgttcataa 14528073  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttt 188  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14528074 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 14528110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 341
Target Start/End: Original strand, 3576323 - 3576621
Alignment:
Q  46 gtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||  | ||| |||||    
T  3576323 gtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtt-gtacgaataagtgcttaattgagtaaat-gatta 3576420  T
Q  141 attggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttc 240  Q
    |||| ||| |  || |  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  3576421 attgttcaaagttgttataattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttc 3576520  T
Q  241 aaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 339  Q
    || |||||||||  || ||||| ||| || ||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||    
T  3576521 aatgtatgagaaagtgatatatattg-aattatgctcaaattgatggattatgctatgttgttgttgaattgtgataagagtcatgtttgattgatgttg 3576619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 359
Target Start/End: Original strand, 12349834 - 12349931
Alignment:
Q  262 tgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  12349834 tgttgataatatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgt 12349931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7854385 - 7854306
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7854385 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7854306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17205076 - 17204818
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||| |  |    
T  17205076 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattccatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtg-g 17204978  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgga 207  Q
    || ||  |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||    
T  17204977 tacgaacaagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 17204879  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 268  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  17204878 taatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 17204818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3992953 - 3992874
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3992953 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 3992874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 19232169 - 19232090
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  19232169 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatca 19232090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30207570 - 30207280
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||    
T  30207570 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattca 30207473  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||   | |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||    
T  30207472 tactggttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatg 30207373  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgc-tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||  || ||||||||| || ||||| | ||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  30207372 agaaagtgatatatgttg-aattatgcttaaattgatgaattgtgctatgttgttgttcaattgtgataagattcaagttcaattgaagttgtt 30207280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 54037976 - 54038055
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  54037976 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 54038055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55513273 - 55513194
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  55513273 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 55513194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3992684 - 3992614
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3992684 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 3992614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15876341 - 15876114
Alignment:
Q  132 aattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaat 231  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||  |  |||    
T  15876341 aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgataatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgttgatgaaat 15876242  T
Q  232 tacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcat-tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatca 329  Q
    |  |||||| |||||||||||  || ||||| ||| ||  || ||| ||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15876241 tttatgttccaagtatgagaaagtgatatatcttg-aatgatactcaaattgttggattat-cataagttgttgttgaattgtgataagattcatgttca 15876144  T
Q  330 attgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    |||||||||||| ||| || || |||||||    
T  15876143 attgatgttgttgttggtaagtgatgttgt 15876114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2844594 - 2844515
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2844594 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 2844515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Original strand, 14528118 - 14528213
Alignment:
Q  265 tgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  14528118 tgaaaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 14528213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2844325 - 2844255
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2844325 tatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 2844255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857194
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 15857194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16261587 - 16261517
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16261587 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 16261517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 53771175 - 53771105
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  53771175 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 53771105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 268
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784876
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || |    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 47784866  T
Q  259 atatgttgaa 268  Q
    ||||||||||    
T  47784867 atatgttgaa 47784876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30153076 - 30153006
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  30153076 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 30153006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38168048 - 38167978
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38168048 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgtt 38167978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 54685422 - 54685492
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  54685422 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 54685492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 14814658 - 14814948
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  14814658 taaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgctcat 14814756  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||     
T  14814757 agttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 14814856  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||  || |||||  || || | ||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  14814857 gaaaatgatatattgtg-aattgtgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgtt 14814948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 17955832 - 17955915
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttag----agctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17955832 agaatcataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 17955915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23492507 - 23492437
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23492507 tatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 23492437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33342015 - 33341945
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  33342015 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 33341945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 85
Target Start/End: Original strand, 16743991 - 16744072
Alignment:
Q  4 ggagaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  16743991 ggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatca 16744072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7854116 - 7854046
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  7854116 tatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 7854046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 341
Target Start/End: Original strand, 17956109 - 17956175
Alignment:
Q  275 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  17956109 ctcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 17956175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45581765 - 45581695
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  45581765 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 45581695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45582034 - 45581955
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaag-ggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  45582034 agaatcataggagaaaaa-tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatca 45581955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 9590648 - 9590937
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||| || || || ||||||| |||||    
T  9590648 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaaattgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtggttaattgttcata 9590746  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || | |||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||| || || ||   |||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||| |    
T  9590747 gttgttaaaatccgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcattaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgtg 9590846  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||  ||||||    || || ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  9590847 aaagtggtatgatatg-aattatgctcaatttgttgaattatgctatgttgttgttgagttctgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 9590937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12953210 - 12953028
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 258  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||  ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  |||  || |    
T  12953210 aattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattagattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgtt 12953111  T
Q  259 atatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||  ||||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||    
T  12953110 atatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagatttatgtttaattgatgttgtt 12953028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 54038245 - 54038315
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  54038245 tatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 54038315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14080863 - 14080666
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||    
T  14080863 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaactatg-gtatgaataagtgtttaattggataaat-gattaattgtgca 14080766  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||  || | |||||||||||| |  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||||    
T  14080765 tagatgttaaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgtggttagtgaatttgcatgttcaaagtatg 14080666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 13301323 - 13301559
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtat 111  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  ||||||    
T  13301323 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgttgtat 13301422  T
Q  112 ga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataa 210  Q
    || |||||||||||||| || || |||||| | | || ||  || |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||  ||  ||||| ||   |||||    
T  13301423 gattaagtgcttaattgaat-aagtgattattggttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataa 13301521  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||||||| ||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  13301522 ttgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 13301559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 13311979 - 13312215
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtat 111  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  ||||||    
T  13311979 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgttgtat 13312078  T
Q  112 ga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataa 210  Q
    || |||||||||||||| || || |||||| | | || ||  || |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||  ||  ||||| ||   |||||    
T  13312079 gattaagtgcttaattgaat-aagtgattattggttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataa 13312177  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||||||| ||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  13312178 ttgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 13312215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15550964 - 15550919
Alignment:
Q  43 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 88  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15550964 ttggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatcactt 15550919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810945
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 90  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttt 38810945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961106
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 51961106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 248
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228715
Alignment:
Q  158 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatg 6228715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 11882113 - 11882240
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || || |||||| ||| || ||     
T  11882113 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaacttttaatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcttag 11882211  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatg 180  Q
     || |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11882212 atgttgaatttcatgctctaattatgatg 11882240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19946776 - 19946744
Alignment:
Q  327 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19946776 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgt 19946744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 248
Target Start/End: Original strand, 31412331 - 31412423
Alignment:
Q  156 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  31412331 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 31412423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50313436 - 50313344
Alignment:
Q  156 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||   || ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  50313436 tgaaattcgtgctcttgttataatgatatgtttgagtgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 50313344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 15319 - 15654
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15319 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatcacttttgtaattttaaattat 15418  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15419 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 15518  T
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat-gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgt 304  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | || | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15519 gacaattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtataaaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttga 15617  T
Q  305 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15618 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgtt 15654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23043 - 22737
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  23043 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatcaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 22944  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22943 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttttgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 22844  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  22843 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtc 22744  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  22743 atgttgt 22737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 717 - 1023
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  717 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattgattgttcatatg 816  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  817 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagatgaattacatgttcaaagtatgaaaa 916  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  917 atgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtc 1016  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  1017 atgttgt 1023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 63 - 341
Target Start/End: Original strand, 6749 - 7028
Alignment:
Q  63 ggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaat 161  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6749 ggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgatcagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 6848  T
Q  162 tcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgagaagttggta 259  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || | ||||    
T  6849 tcgtgctctaattacgaggacatgtttagatgtatgaagttatgaatagttgaattgttgttggttgaattacatgttcagagtgtatga-aaatgggta 6947  T
Q  260 tatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6948 tgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 7028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20572 - 20274
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20572 agaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 20473  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20472 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 20373  T
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20372 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggttaattatgctttgttgttg 20274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11909
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11603 taagctaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 11702  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  11703 tgatgaaatttgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggatgaattacatgttcaaagtatgaaaa 11802  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  11803 atgggtattagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtc 11902  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  11903 atgttgt 11909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584115
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgta 11584349  T
Q  111 tgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  11584348 tgataagtgcttaattggatgaattaattaattgttcatgagtggtgaaattcgtgctctatttatgatgacatatttggatgtatgaagttatgaataa 11584249  T
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc---attgttgttgttga 307  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  11584248 ttgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtatgaaaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttga 11584149  T
Q  308 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  11584148 attgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 11584115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21397444 - 21397156
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21397444 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 21397345  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  21397344 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 21397247  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21397246 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 21397156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Original strand, 24183027 - 24183332
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  24183027 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 24183126  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||    
T  24183127 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtcatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttcaaagtgtatgaa 24183226  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24183227 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtc 24183326  T
Q  353 atgttg 358  Q
    ||||||    
T  24183327 atgttg 24183332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4865613 - 4865330
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  4865613 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 4865514  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  4865513 ggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 4865414  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    | |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4865413 tgggtat-gggtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgtt 4865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 1168100 - 1168405
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||||||||||||| |||||      
T  1168100 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaaatgcttattttggtgaattgattaattgttcataaa 1168198  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168199 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataatagaatggttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 1168298  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  1168299 aatgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtc 1168398  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  1168399 atgttgt 1168405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28261867 - 28261568
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28261867 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 28261768  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  28261767 ggtgaaattcgtgctctagttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaa- 28261669  T
Q  254 ttggtatatgt-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |  |||    
T  28261668 -----atatgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtc 28261574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20712428 - 20712122
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||     
T  20712428 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttgcaattttcaattacttgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataa 20712329  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  20712328 -tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataactgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgaaa 20712230  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  20712229 aatgggtatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagt 20712130  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  20712129 catgttgt 20712122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 356
Target Start/End: Original strand, 11337081 - 11337384
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  11337081 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattggttaattgttcataa 11337179  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11337180 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 11337279  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  11337280 atatggtaaatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 11337379  T
Q  352 catgt 356  Q
    |||||    
T  11337380 catgt 11337384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19405891 - 19405583
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19405891 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 19405793  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19405792 aatgatgaaatttatgctctaattatgatgacatatttgaatgtatgaagttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 19405693  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 349  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  19405692 aaaagggtatatgttgaaaatatgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtat 19405593  T
Q  350 gtcatgttgt 359  Q
    || |||||||    
T  19405592 gtgatgttgt 19405583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 333
Target Start/End: Original strand, 21646636 - 21646914
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||    
T  21646636 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttattgcaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaaatgttcatatg 21646734  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  21646735 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttaaaagtgtatgaa 21646833  T
Q  253 gttggtatatgt-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 333  Q
      |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21646834 aatgg-gtatgtatgaaaatatgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattg 21646914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24475861 - 24475644
Alignment:
Q  121 ttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24475861 ttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-t 24475763  T
Q  221 gttagttgaattacatgttcaaa--gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  24475762 gttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-aaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatg 24475667  T
Q  319 tttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  24475666 tttcatgatcaattgttgttgtt 24475644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 93 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21907011 - 21906781
Alignment:
Q  93 aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagat 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21907011 aattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagac 21906912  T
Q  193 gtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 292  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||                  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21906911 atatgaagttatggataattgaattgatgttggttgaattacatgttcaaagta------------------tgaaaatatgttcaattgatgaattatg 21906830  T
Q  293 cattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21906829 ctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 21906781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3674215 - 3673926
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  3674215 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 3674118  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||  || ||||| | ||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||    
T  3674117 aattgttagaattcgtgctcaaattatgatgatatgtttgaatacattaagttgttgataattgaattgttgttagggaaatttcatgatcaaagtatga 3674018  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3674017 gaaagtggtatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 3673926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19862604 - 19862273
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||    
T  19862604 taggagctaaagtgaagtttaggctaaaaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgt 19862505  T
Q  110 atga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggat 208  Q
    |||| ||||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||    
T  19862504 atgaataagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgat 19862406  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttga 307  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  19862405 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 19862307  T
Q  308 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  19862306 attgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgtt 19862273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16595860 - 16595576
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| ||||    
T  16595860 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcat 16595763  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||    
T  16595762 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgttcaaagtatga 16595663  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 337  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||   ||||| ||||||||| || | || |||||| |||||||||||    
T  16595662 gaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgttatgttgatgttgaattatgttgagattcatgttcaattgatgt 16595576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 248
Target Start/End: Original strand, 23981433 - 23981606
Alignment:
Q  76 atcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctattt 174  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23981433 atcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaatttagtgcattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaatt 23981532  T
Q  175 atgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  23981533 atgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 23981606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23494272 - 23493965
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||  |||||||| ||||    
T  23494272 taaggtaagggggttagaaatcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aatcaattaattgttcat 23494175  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  23494174 aattgttagaattcgtgctccaactatgatgacatgttcgaatgcatgaagttgtggaaaattgaattgttattagtggaattttatgttcaaagtatga 23494075  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 348  Q
      | | |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  23494074 agaataggtatatgttgaga-tatgcgaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 23493976  T
Q  349 tgtcatgttgt 359  Q
     || |||||||    
T  23493975 agtgatgttgt 23493965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 5450731 - 5451044
Alignment:
Q  49 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaatt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || | || | ||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  5450731 ataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gcataaataaatgcttaattgagt-aattgattaatt 5450828  T
Q  144 ggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa 243  Q
    | |||||  || |  ||||| ||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  5450829 gttcataattgttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 5450928  T
Q  244 gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttt 342  Q
    |||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||     
T  5450929 gtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataaaattcatgttcaactgatgttgttg 5451027  T
Q  343 ttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||| || || |||||||    
T  5451028 ttgctaagtgatgttgt 5451044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7728774 - 7728466
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||| |||  |||  |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  7728774 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgtaaattttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 7728676  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||||||| ||| | |||||| |  || |||  ||| ||||| ||   ||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  7728675 aattgttagaattcgtactccaattatgaagttatatttgaatggatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 7728576  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 348  Q
    |||  || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  7728575 gaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 7728477  T
Q  349 tgtcatgttgt 359  Q
     || |||||||    
T  7728476 agtgatgttgt 7728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28902545 - 28902255
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  28902545 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28902448  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||  || | | |||||||||||||    
T  28902447 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28902348  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||  || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  28902347 agaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgtt 28902255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28938940 - 28938650
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  28938940 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28938843  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||  || | | |||||||||||||    
T  28938842 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28938743  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||  || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  28938742 agaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgtt 28938650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222791
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||  ||||||||| |||||||| ||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggggttagagttcaatcataattatttagtgtaatttttcaattatt-gt 21222560  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  |  |||||||||||| |||||  || |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||    
T  21222561 atgattaagtgcttaattgagt--attgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 21222658  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttga 307  Q
    |||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  |||  || |||||||||||  ||||||| || || | |||| |||  ||||||||||||    
T  21222659 aattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgtttaattgtgctatgttgttgttga 21222757  T
Q  308 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  21222758 attgtgataagattcatgttcaattaatgttgtt 21222791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 432815 - 432527
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||    
T  432815 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttactgcaatttttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgatcata 432718  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || | ||||||| |||| | ||||||||| ||||||  ||| ||| |||| | |||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||    
T  432717 attgttaaaattcgcgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgag 432618  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||  || ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  432617 aaaatgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatactatgttgttgttggattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgtt 432527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21650829 - 21650759
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21650829 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 21650759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21617374 - 21617080
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||  |||||||||     
T  21617374 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagggattaattgt 21617277  T
Q  146 tcatatgtgatga-aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 244  Q
    ||||  ||  | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| |||    
T  21617276 tcattagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttccaag 21617177  T
Q  245 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||  |||  || |||||||||||  ||||||| || || |||||| | |  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  21617176 tatatgaaagtgttatatgttgaac-tatgctctaaatgttgaattgttctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 21617080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2031944 - 2031874
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  2031944 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 2031874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11342819 - 11342749
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  11342819 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 11342749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Original strand, 21310603 - 21310819
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  21310603 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 21310701  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || |    
T  21310702 aatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21310801  T
Q  251 aagttggtatatgttgaa 268  Q
    ||  || |||||||||||    
T  21310802 aaaatgatatatgttgaa 21310819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21205060 - 21205000
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21205060 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 21205000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23466787 - 23466521
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  23466787 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattattgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgattaattgtgt-aattgattaattgttcataa 23466690  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     |  |  ||||||||||| | |||||   ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||| |||||||||||||    
T  23466689 ttattagaattcgtgctccaattatggcaacatgtttgtatgtaagaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgaga 23466591  T
Q  252 agt-tggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |   |||| |||||||||| ||||||||||||||                    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23466590 aaaatggtgtatgttgaaa-tatgctcaattggt--------------------tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 23466521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Original strand, 21297069 - 21297285
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  21297069 taaggtaagggggttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 21297167  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || | |||||||| |||||  |||||||| ||||||  | | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || |    
T  21297168 aatgttaaaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21297267  T
Q  251 aagttggtatatgttgaa 268  Q
    ||  || |||||||||||    
T  21297268 aaaatgatatatgttgaa 21297285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37983758 - 37983428
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  37983758 taggagctaaagtgaagcttgggctagaaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 37983659  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggata 209  Q
    |||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || | ||||| ||||||||| |||| ||| || |||  ||| ||||| ||   ||||    
T  37983658 tgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaatttgtgctctatctatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtgata 37983560  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaa 308  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||| |||  || |||||  || || ||||||| || || |||||| |||  |||| ||||||||    
T  37983559 attgaattgttgttggtgaaattgcatattcaaagtatgtgaaagtgatatattgtg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaa 37983461  T
Q  309 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||| || ||  ||||| | |||||||||||||    
T  37983460 ttgtaatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 37983428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22885932 - 22885799
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattg 213  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||   || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||    
T  22885932 taagtgcttaattgaat-aattgataatttgttcatggttgttgaaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattg 22885834  T
Q  214 aattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  22885833 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 22885799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 338
Target Start/End: Original strand, 22053963 - 22054028
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  22053963 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 22054028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 338
Target Start/End: Original strand, 18531200 - 18531262
Alignment:
Q  276 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  18531200 tcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 18531262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29918214 - 29918122
Alignment:
Q  156 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  29918214 tgaaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 29918122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 55376494 - 55376780
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55376494 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttttgaaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 55376593  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||     
T  55376594 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttctaagtatgaaaaa 55376693  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55376694 tgggtatgtg-tgaaaatatactcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 55376780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44056266 - 44055979
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  44056266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 44056167  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44056166 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat-tttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 44056068  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44056067 atgaatatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 44055979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30458255 - 30457952
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  30458255 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttgaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 30458156  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30458155 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatggataattaaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaaa 30458056  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||    
T  30458055 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtc 30457956  T
Q  353 atgt 356  Q
    ||||    
T  30457955 atgt 30457952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 53704629 - 53704934
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53704629 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 53704728  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  53704729 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaa 53704828  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||    
T  53704829 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtc 53704927  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  53704928 atgttgt 53704934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 23269829 - 23270135
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23269829 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 23269928  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  23269929 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 23270026  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  23270027 aaatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaag 23270126  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  23270127 tcatgttgt 23270135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 359
Target Start/End: Original strand, 45458769 - 45459056
Alignment:
Q  73 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctcta 171  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45458769 ttcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaatttgtgctcta 45458868  T
Q  172 tttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaat 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||    
T  45458869 attatgatgacatgtttagatgtatgaagtgatagataattgaattgttgttagttgaattacatgctcaaaatatgagaagtttgtatatgttaaagat 45458968  T
Q  272 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45458969 atgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgt 45459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16732520 - 16732215
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttc-aattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  16732520 taaggtaaagaggttagaattcatcataatcattattgcaattttttaattagt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 16732422  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732421 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 16732322  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||    
T  16732321 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtc 16732222  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  16732221 atgttgt 16732215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 12837096 - 12837383
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      
T  12837096 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgaatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 12837194  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12837195 tgatgatattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 12837294  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12837295 attggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgtt 12837383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 58 - 341
Target Start/End: Original strand, 8872372 - 8872654
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatg 157  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  8872372 gtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtg 8872471  T
Q  158 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttgg 257  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | ||    
T  8872472 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagctatgaatgattgaagtgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatggg 8872571  T
Q  258 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8872572 tatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgtt 8872654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34395609 - 34395303
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||      
T  34395609 taaggtaagggggttagaattcatcattatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaactgattaattgttcataaa 34395510  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgag 250  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  34395509 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtaatgaataattgaattgt-gttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 34395411  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34395410 aa-tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatg 34395312  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  34395311 tcatgttgt 34395303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44347177 - 44346891
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  44347177 taaggtaagggagttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 44347078  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag-aa 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  44347077 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtaagaaa 44346979  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  44346978 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgtt 44346891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 21959359 - 21959664
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||      
T  21959359 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattaattgattgttcataaa 21959458  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  21959459 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaaatgtatgaagttatggatatttgaattgttgttgattgaattacat-ctcaaagtatgaaaa 21959557  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  21959558 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtc 21959657  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  21959658 atgttgt 21959664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 53907604 - 53907882
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||    
T  53907604 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtagttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggat--------taattgttcatatgt 53907695  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||     
T  53907696 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttattagttggattgtatgttcaaagtatgaaaaa 53907795  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  53907796 tgggtatgtg-tgaaaatatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaattgttgttgtt 53907882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Original strand, 20813442 - 20813658
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  20813442 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttaaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20813541  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20813542 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 20813641  T
Q  253 gttggtatatgttgaaa 269  Q
     | ||||| ||||||||    
T  20813642 atgggtatgtgttgaaa 20813658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 819826 - 820099
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  819826 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 819925  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||     | ||| ||    
T  819926 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt-gttg--------gtt-----tgtga-aa 820010  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  820011 atgtgtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 820099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 52265403 - 52265691
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  52265403 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgtttaattgggt-aattgattaattgttcata 52265500  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||    
T  52265501 gatgatgaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgag 52265600  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  52265601 aaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgtt 52265691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27961324 - 27961017
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  27961324 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattgttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 27961227  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27961226 aattgttagaatccgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttatgaataattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatga 27961127  T
Q  250 -gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||   | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27961126 agaagt-ggtatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgttatattgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgtt 27961029  T
Q  348 atgtcatgttgt 359  Q
    | || |||||||    
T  27961028 aagtgatgttgt 27961017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 13809405 - 13809693
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  13809405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcata 13809502  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  13809503 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgag 13809602  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13809603 aaaatggtatatgttg-aaatatgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgtt 13809693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15045181 - 15044874
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  15045181 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 15045084  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  15045083 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15044984  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 348  Q
    |||  || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  15044983 gaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 15044885  T
Q  349 tgtcatgttgt 359  Q
     || |||||||    
T  15044884 agtgatgttgt 15044874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 30232391 - 30232679
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  30232391 taaggtaagagggttagaattcatcataatcacttattgcaattttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcat 30232488  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||| ||||||||||     
T  30232489 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgt 30232587  T
Q  250 gaa--gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||  || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30232588 gaaaagtgggt-tatgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 30232679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 18494224 - 18494529
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||  | ||||||| ||||| |||||     
T  18494224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatg-gtatgaataggtgcttaattgtgt-aattgatcaattgttcataa 18494321  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     || |  ||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||| |||||||||||||    
T  18494322 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgttcgtatgtatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgaga 18494420  T
Q  252 agt-tggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 349  Q
    |   ||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||| ||     
T  18494421 aaaatggtatatgttgaaa-tgtgctcaattggttggatgatgctatgttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaa 18494519  T
Q  350 gtcatgttgt 359  Q
    || |||||||    
T  18494520 gtgatgttgt 18494529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 347
Target Start/End: Original strand, 47535042 - 47535254
Alignment:
Q  135 tgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattac 234  Q
    |||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  47535042 tgattaattgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 47535141  T
Q  235 atgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 333  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  47535142 aagttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagaatcatgttcaattg 47535240  T
Q  334 atgttgtttttgat 347  Q
    | |||||| |||||    
T  47535241 acgttgttgttgat 47535254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 15109243 - 15109550
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||    
T  15109243 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattcat 15109340  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |   | |  ||||| ||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  15109341 aatagttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15109440  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 348  Q
    |||  || ||||||||| || ||| ||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  15109441 gaaagtgatatatgttg-aattatactcaaattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 15109539  T
Q  349 tgtcatgttgt 359  Q
     || |||||||    
T  15109540 agtaatgttgt 15109550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Original strand, 7185701 - 7186027
Alignment:
Q  16 gagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat 114  Q
    |||| ||||||||||| | ||||  | || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||||    
T  7185701 gagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaaggaggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgat 7185800  T
Q  115 -aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattg 213  Q
     ||||||||||||| || || |||||||||| |||||  || | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||    
T  7185801 taagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattg 7185899  T
Q  214 aattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgt 312  Q
    |||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||| |||  || ||||||||| || | ||| | || || |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7185900 aattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatatgttg-aattgtgcactaaatgatgaattgtgctatgttgttgttgaattgt 7185998  T
Q  313 gataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| || |||||| | |||||||||||||    
T  7185999 gatgagattcatgtttaattgatgttgtt 7186027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 359
Target Start/End: Original strand, 41165983 - 41166147
Alignment:
Q  195 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgc 293  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  41165983 atgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgc 41166081  T
Q  294 attgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
      ||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  41166082 tatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 41166147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 54118120 - 54118199
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54118120 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 54118199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 25119059 - 25119138
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  25119059 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatca 25119138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 41256263 - 41256552
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  41256263 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 41256361  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||     
T  41256362 agttgttgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgttga-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 41256460  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||  || |||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||| ||   |||| | |||||||||||||    
T  41256461 gaaaatgatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaaccatgtttaattgatgttgtt 41256552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18276743 - 18276498
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatg 193  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | |  |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||    
T  18276743 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-atgtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatg 18276646  T
Q  194 tatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatg 292  Q
     ||||| ||   ||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || |||||| ||    
T  18276645 catgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagcatgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtg 18276547  T
Q  293 cattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |  | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  18276546 ctatattgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 18276498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 5682380 - 5682459
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  5682380 agaatcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatca 5682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14951896 - 14951826
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  14951896 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 14951826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 15272433 - 15272503
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  15272433 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgtt 15272503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 15013137 - 15013465
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||  | ||| || ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||| || || ||    
T  15013137 taggagctaaagtgaagcttgagctaggatttg-tgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaattttcatttgtt-gt 15013234  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggat 208  Q
    ||| | ||||||||||||| || || |||||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||   |||    
T  15013235 atgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgtttaaattcgtgctctaattatgatgatatgttga-atgcatgaaattgatgat 15013332  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttga 307  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||   |||||||||||    
T  15013333 aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgacatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttga 15013431  T
Q  308 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||| ||  ||||| | ||||||| |||||    
T  15013432 attgtgatgagaatcatgtttaattgatattgtt 15013465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14901584 - 14901296
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||    
T  14901584 taaggtaagggggttaaatttcatcataatcattttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 14901487  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    || || |  ||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||||||||| || | || ||||| ||||||||| ||  |||| ||||||  ||||||||    
T  14901486 atttgttataattcgtgctctaattatgacaatatgtttgaatgtatgaaattgttgaaaattg-attgttgttggtgaaatttcatgtttgaagtatga 14901388  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||  || ||||||||  |||||||||| || || |||||||||   |||| || |||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  14901387 gaaagtgatatatgtt-taaatatgctcaaaatgttgaattatgatatgttattattgaattgtggtaagaatcatattcaattgatgttgtt 14901296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 327
Target Start/End: Original strand, 5682648 - 5682704
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5682648 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 5682704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 25119328 - 25119398
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  25119328 tatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 25119398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 7964565 - 7964894
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||| | || |  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  7964565 taggagctaaagtgaagtttgggcaaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 7964664  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggata 209  Q
    |||| |||||||||||||  | || ||| |||||| |||||  || | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   ||||    
T  7964665 tgattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgttcatagttgttaaaatccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgata 7964763  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaa 308  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||  |||||||||||||    
T  7964764 attgaattgttgttggtgaaattgcatgttc-aagtatgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaa 7964861  T
Q  309 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    || |||| ||  ||||| | ||||||| |||||    
T  7964862 ttatgatgagaatcatgtttaattgattttgtt 7964894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 347
Target Start/End: Original strand, 10104380 - 10104454
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10104380 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttgat 10104454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38765066 - 38764773
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgataa-gtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||| ||| || ||||||||| ||      
T  38765066 taattaaggtaagagggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgataaagtgcttagttgaat-aattgattatttt- 38764969  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || ||||||||||||| || |||||  || ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  38764968 tcatagttgttgaaattcgtgctttaattatggggatatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagt 38764869  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| |||  || |||||  || || | ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  38764868 atgtgaaaatgttatattgtg-aattgtgctcaaattgttgaattatgcgatgttgttgttcaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 38764773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Original strand, 40885676 - 40885758
Alignment:
Q  265 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40885676 tgaaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttgat 40885758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 338
Target Start/End: Original strand, 15675219 - 15675284
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  15675219 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 15675284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41165885
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 90  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataatcattttt 41165885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 248
Target Start/End: Original strand, 40904932 - 40905024
Alignment:
Q  156 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  40904932 tgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 40905024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31115764 - 31115697
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  31115764 tatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 31115697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 20573087 - 20573393
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  20573087 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20573186  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  20573187 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 20573286  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20573287 aagggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 20573386  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  20573387 atgttgt 20573393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41247009 - 41246704
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||      
T  41247009 taaggtaagggggttagagttcatcataatcacttattgtaattttcaattagttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataaa 41246910  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||    
T  41246909 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaattgttgttggttgaattacatgttaaaagtaggaaaa 41246810  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  41246809 atgggtatatgatg-aaatatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtc 41246711  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  41246710 atgttgt 41246704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 337
Target Start/End: Original strand, 20561526 - 20561810
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  20561526 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20561625  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20561626 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 20561725  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 337  Q
     |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20561726 attggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 20561810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 22234700 - 22235004
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  22234700 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgaatgaattgattaattgttcataagt 22234799  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 251  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |    
T  22234800 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacgtgtttagatgtatgaagttatgaataatttaattg-tgttagttgaattacatgctcaaagtgtatga-a 22234897  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||    
T  22234898 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagt 22234996  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  22234997 catgttgt 22235004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37612020 - 37611717
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  37612020 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataag 37611921  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  37611920 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 37611823  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |    
T  37611822 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaag 37611723  T
Q  351 tcatgt 356  Q
    ||||||    
T  37611722 tcatgt 37611717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20481955 - 20481651
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||       
T  20481955 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaat-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgttcatgga 20481858  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20481857 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 20481758  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  20481757 atggatatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtc 20481658  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  20481657 atgttgt 20481651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 19992952 - 19993255
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  19992952 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttttgtaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 19993050  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 251  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |    
T  19993051 gatgaaatccgtactctaattatgatgacatgtttagatgtacgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacttgttcaaagtgtatga-a 19993148  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |  ||    
T  19993149 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagt 19993247  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  19993248 catgttgt 19993255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21681356 - 21681048
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  21681356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaatttgttgaattgattaattgttcata 21681258  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21681257 aatgataaaattcgtgatctaattatgatgacatatttgaatgtataagtttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgtttaaagtatgag 21681158  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 349  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  21681157 agaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtat 21681058  T
Q  350 gtcatgttgt 359  Q
    || |||||||    
T  21681057 gtgatgttgt 21681048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 197 - 359
Target Start/End: Original strand, 20653944 - 20654106
Alignment:
Q  197 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  20653944 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgctaa 20654043  T
Q  297 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  20654044 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgt 20654106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198352
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcattataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gt 21198103  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||    
T  21198104 atgattaagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagat 21198202  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttga 307  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||    
T  21198203 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgttatgttgttgttga 21198301  T
Q  308 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 358  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  21198302 attgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttg 21198352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25122793 - 25122618
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  25122793 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 25122694  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 229  Q
    ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25122693 gatcaaattcgtgctccaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgctagttga 25122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23837561 - 23837244
Alignment:
Q  45 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgta---attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||   |||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  23837561 ggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttaatatagattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gatt 23837464  T
Q  140 aattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgtt 239  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||    
T  23837463 aattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgtt 23837364  T
Q  240 caaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  23837363 caaagtatgagaaagtgatatatgttg-aactatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgtt 23837265  T
Q  339 gtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||| ||| || || |||||||    
T  23837264 gttgttgctaagtgatgttgt 23837244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 39446660 - 39446967
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  39446660 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 39446757  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  39446758 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatga 39446857  T
Q  250 -gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
     ||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  39446858 agaagt-gttatatgttgaaa-tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgct 39446955  T
Q  348 atgtcatgttgt 359  Q
    | || |||||||    
T  39446956 aagtgatgttgt 39446967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 359
Target Start/End: Original strand, 20647882 - 20648030
Alignment:
Q  211 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaatt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  20647882 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaatt 20647981  T
Q  311 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  20647982 gtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgt 20648030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22981622 - 22981351
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |    
T  22981622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatt--ttgtatgaataagtgcttaattgggt-aattgattaattgttcaga 22981526  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
    ||  |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  22981525 tg--atgaaatttgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 22981428  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 327  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22981427 aaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgat 22981351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Original strand, 7000524 - 7000624
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatg 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7000524 gtaagggggttagttttcatcataatcacttttttaattttcaattatttgtatgataagtgcttaataggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 7000623  T
Q  158 a 158  Q
    |    
T  7000624 a 7000624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17285570 - 17285341
Alignment:
Q  43 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  17285570 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgattaagtgcttaattgaat-aattg 17285473  T
Q  137 attaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacat 236  Q
    | |||||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  17285472 aataattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcat 17285373  T
Q  237 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 268  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  17285372 gttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 17285341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38533895 - 38533695
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 258  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||  ||||    
T  38533895 aattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatctcatgttcaaagtatgagaaaatggt 38533796  T
Q  259 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgtt 357  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||    
T  38533795 atatgttgaaa-tatgctcaaattattgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgtt 38533697  T
Q  358 gt 359  Q
    ||    
T  38533696 gt 38533695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26011848 - 26011558
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||  | || ||||||||||     
T  26011848 taattaaggtaagggggtta---ttcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgtttaattgagt-aagtgattaattgt 26011754  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  26011753 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagt 26011654  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||    
T  26011653 atgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgtt 26011558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5854971 - 5854678
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||     
T  5854971 taattaaggtaaggaggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 5854874  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  5854873 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgataattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaagt 5854774  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||  |||  || |||||||||||  ||||||| || || ||| || |||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  5854773 atatgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgagttgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 5854678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 16404852 - 16404931
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16404852 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 16404931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 24716714 - 24716793
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24716714 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 24716793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15933655 - 15933362
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgtt-catcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||     
T  15933655 taattaaggtaagggggttagaattaaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 15933558  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  15933557 tcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 15933458  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| |||  || || |||||| || ||||||| || || |||||| ||   ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  15933457 atgtgaaagtgttaaatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 15933362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 274846 - 274767
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  274846 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 274767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 641003 - 641082
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  641003 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 641082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 826809 - 826888
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  826809 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 826888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 144
Target Start/End: Original strand, 20529748 - 20529839
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattg 144  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20529748 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattg 20529839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39115678 - 39115599
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39115678 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatca 39115599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 274577 - 274507
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  274577 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 274507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 641272 - 641342
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  641272 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 641342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 827078 - 827148
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  827078 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 827148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 16039002 - 16039072
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16039002 tatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 16039072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29306776 - 29306481
Alignment:
Q  50 taattaaggtaag-ggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattg 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  29306776 taattaaggtaagaggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattgattg 29306678  T
Q  145 gtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 244  Q
     |||||  || | | ||||||||||||  |||||||| |||||   ||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  | ||  ||||||||||    
T  29306677 ttcatagatgttaatattcgtgctctaactatgatgatatgttctaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgtatgttcaaag 29306578  T
Q  245 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | || |||  || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||    
T  29306577 tttgtgaaaatgatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgtt 29306481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33528819 - 33528489
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||    
T  33528819 taggagctaaagtgaagtttgagctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 33528720  T
Q  111 tgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggata 209  Q
    |||| ||||||||||||| || || |||||||||| || ||  || |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||    
T  33528719 tgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcttagatgttgaattccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgata 33528621  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaa 308  Q
    ||||||||||||||  |  ||||  || |||  |||||  |||  || ||||||||| || | ||||| || || |||||| |||  |||||||||||||    
T  33528620 attgaattgttgttgatgaaattgtatcttcttagtatatgaaaatgatatatgttg-aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaa 33528522  T
Q  309 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||||    
T  33528521 ttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgtt 33528489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 41506930 - 41507000
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  41506930 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 41507000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39115409 - 39115339
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  39115409 tatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 39115339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 24716983 - 24717053
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||    
T  24716983 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgtt 24717053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22743122 - 22742828
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |||     
T  22743122 taattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgt 22743024  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || ||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||   || ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||    
T  22743023 tcatagttgttgaaattcgtgctttgattatggtgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 22742924  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| |||  || |||||  || || | ||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  22742923 atgtgaaaatgatatattgtg-aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 22742828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 341
Target Start/End: Original strand, 22735839 - 22736021
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagt-tgg 257  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||||| | ||| |||||||  | ||||||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||| | ||   ||     
T  22735839 aattcgtgctccaattatgataatatgttga-atgcatgaagtggttgataattgagttgttgttggtaaaacttcatgttcaaagtataaaaaaaatga 22735937  T
Q  258 tatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22735938 tatatgttgaat-tatgatcaaattgatgaattatactatgttgttgttggattgtgataagattcatgttcaattgatgttgtt 22736021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 312
Target Start/End: Original strand, 24385873 - 24385914
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgt 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24385873 tatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaattgt 24385914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 38635541 - 38635831
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || ||| |  ||| ||||    
T  38635541 taaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgaatctttgttcat 38635639  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||  ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| | ||||     
T  38635640 agttgttgaaattcgtgctctagttatcatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcataatatgc 38635739  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||  || |||||  || || ||| ||| ||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  38635740 gaaaatgatatattgtg-aattatactcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 38635831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 348
Target Start/End: Original strand, 22497329 - 22497399
Alignment:
Q  278 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 348  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  22497329 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgata 22497399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 243
Target Start/End: Original strand, 23151810 - 23151918
Alignment:
Q  135 tgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattac 234  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||||||| || | ||||||||| || |||  ||| |||||  ||  |||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  23151810 tgattaattgttcatatttgttaaaattcgtgttccaattatgatgatatatttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 23151909  T
Q  235 atgttcaaa 243  Q
    |||||||||    
T  23151910 atgttcaaa 23151918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 90
Target Start/End: Original strand, 31194217 - 31194253
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 90  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31194217 taaggtaagggggttagttttcatcataatcattttt 31194253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32899142 - 32898836
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||      
T  32899142 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 32899043  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32899042 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 32898943  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||    
T  32898942 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtc 32898843  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  32898842 atgttgt 32898836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18570630 - 18570353
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18570630 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 18570531  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  18570530 gatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgatgttatggataattgaattgttattagttaaattacatgttcaaagtatgaaaaa 18570431  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 331  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18570430 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 18570353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16086369 - 16086063
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  16086369 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 16086270  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  16086269 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattacatgttcaaagtacgaaaa 16086170  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16086169 atgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtc 16086070  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  16086069 atgttgt 16086063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16106868 - 16106562
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| || ||      
T  16106868 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattaattaattgttcgtaaa 16106769  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16106768 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 16106669  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16106668 atgagtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtc 16106569  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  16106568 atgttgt 16106562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22441285 - 22440980
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  22441285 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcatatat 22441186  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  | ||||||||||||| ||||||||| ||     
T  22441185 gatgaaattcgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtgatggggtgaattacatgttaaaagtatgaaaaa 22441086  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca 353  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||    
T  22441085 tgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtca 22440986  T
Q  354 tgttgt 359  Q
    ||||||    
T  22440985 tgttgt 22440980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 121 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31628552 - 31628314
Alignment:
Q  121 ttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtt 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31628552 ttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtattcgaattatgattacatgtttagatgtatgaagttattgataattgaattgtt 31628453  T
Q  221 gttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31628452 gttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtt 31628353  T
Q  321 tcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31628352 tcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgt 31628314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18432994 - 18432689
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||      
T  18432994 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaaattttcaattatt-gtatgaaaagagcttaattgggtgaattgattatttgttcataaa 18432896  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18432895 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatacttgaattgttgttgattgaattacatgttaaaagtatgaaaa 18432796  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  18432795 atgggtgtatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgtt 18432696  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  18432695 atgttgt 18432689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Original strand, 13014603 - 13014890
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat--ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13014603 taaggtaagggggttagaatttatcataatcacttattgtaattttcaattatgtttgtatgaaaagtgctaaattgggtgaattgattaattgttcata 13014702  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||     
T  13014703 agtgatgaaattcgtgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgtt-gaagtatgaa 13014801  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 339  Q
    || | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13014802 aaatgggtatgagttggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttg 13014890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18777481 - 18777210
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |||||      
T  18777481 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattggaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgt-----------------tcataaa 18777399  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18777398 agatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 18777299  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18777298 atgggtatgtgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgtt 18777210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18399290 - 18398984
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||    
T  18399290 taaggtaagggggttagaattcttcataatcattttagtgtaaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcata 18399193  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  18399192 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 18399093  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 349  Q
    ||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||     
T  18399092 aaaatagtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaa 18398994  T
Q  350 gtcatgttgt 359  Q
    || |||||||    
T  18398993 gtgatgttgt 18398984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 25367130 - 25367438
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  25367130 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattg-agcaattgattaattgttcat 25367227  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg-gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  25367228 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaagttttttgataatggaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatg 25367327  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
    ||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  25367328 agaaagtggtttatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 25367426  T
Q  348 atgtcatgttgt 359  Q
    | || |||||||    
T  25367427 aagtgatgttgt 25367438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 341
Target Start/End: Original strand, 22361649 - 22361948
Alignment:
Q  43 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |  || |||||    
T  22361649 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattg-agcaaatgatt 22361746  T
Q  140 aattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgtt 239  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||  |  |||| ||||||    
T  22361747 aattgttcatagatgataaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgtt 22361846  T
Q  240 caaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    |||||||||||||  ||  ||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  22361847 caaagtatgagaaagtgacataagttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgtt 22361945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623215
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattt-tcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| || |    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttctcaattgtt-g 21623465  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||    
T  21623464 tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcataaatgttagaattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttga 21623366  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttg 306  Q
    ||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  21623365 taattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 21623267  T
Q  307 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 358  Q
    ||||||| ||||  ||||| || |||||||||||| ||| || || ||||||    
T  21623266 aattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttgctaagtgatgttg 21623215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 359
Target Start/End: Original strand, 18381684 - 18381884
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 258  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || |||  ||  |||||||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || |    
T  18381684 aatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 18381783  T
Q  259 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgtt 357  Q
    ||||||||||  |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||    
T  18381784 atatgttgaat-tatgcttaaattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtt 18381882  T
Q  358 gt 359  Q
    ||    
T  18381883 gt 18381884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 337
Target Start/End: Original strand, 21410944 - 21411228
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  21410944 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattg-aggaattgactaattgttcat 21411041  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |   | |  |||| |||||| | ||||||||  |||| |  ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  21411042 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgttatgtatgaatgcatgaagttgttgataattgaatggttgttaaataaatttcatgttcaaagtatga 21411141  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 337  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||| ||| || | || ||||||  ||||||||||    
T  21411142 gaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgctatgttgatgttggattatgctgagattcatgtgcaattgatgt 21411228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Original strand, 28195108 - 28195295
Alignment:
Q  173 ttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaata 272  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||     
T  28195108 ttatgatgatatgtttgaatgtatgaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcatagtatgagaaaatggtatatgatg-aaatg 28195206  T
Q  273 tgctcaatt-ggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataag-tttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||| ||| || || |||||||    
T  28195207 tgctcaattagttgaattatgccatgatgttgttgaattgtgatgagattttatgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgt 28195295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18583451 - 18583375
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18583451 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgat 18583375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18583720 - 18583641
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18583720 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 18583641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 19983144 - 19983223
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19983144 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 35015009 - 35015088
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35015009 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 35015088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26089869 - 26089799
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26089869 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 26089799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 347
Target Start/End: Original strand, 17083093 - 17083386
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| |||||     
T  17083093 taaggtaagggggttagaattcattttaatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatag 17083191  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     || | | |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||| ||    
T  17083192 ttgttaatattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtg-ataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtga 17083290  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
    |  || |||||||||||  | ||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||    
T  17083291 aaatgatatatgttgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgat 17083386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 18629502 - 18629791
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||| ||||||| || || |||||||||| |||||    
T  18629502 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaattttttatttgttgtatgattaagtgtttaattgaat-aagtgattaattgttcata 18629600  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |    
T  18629601 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtg 18629700  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||  ||||||||  || || |||||||  | || |||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  18629701 aaagtggtatattgtg-aattatgctctgaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 18629791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 15742341 - 15742411
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15742341 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 15742411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23995057 - 23994987
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23995057 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 23994987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 268
Target Start/End: Original strand, 17556909 - 17557127
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatca-cttttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 146  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| || || ||||||||||||| || ||||||||| ||| |    
T  17556909 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatctagtgtaatttttcattaattgcattattaagtgcttaattgaat-aattgattatttgtt 17557007  T
Q  147 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 246  Q
    ||||  || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  17557008 catagttgtt-aaattcgtgctctaattatgatgatatgttt-gatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagta 17557105  T
Q  247 tgagaagttggtatatgttgaa 268  Q
    || |||  || |||||||||||    
T  17557106 tgtgaaagtgttatatgttgaa 17557127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 18002617 - 18002687
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18002617 tatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 18002687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 35015278 - 35015348
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  35015278 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 35015348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25651436 - 25651301
Alignment:
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||  |||||||||    
T  25651436 gataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgt 25651338  T
Q  305 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  25651337 tgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 25651301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33325046 - 33324874
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatt--ttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||  |||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33325046 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattatttcaattaat-gtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttca 33324949  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 223  Q
    ||  || | ||||||||||||||  || ||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  33324948 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt 33324874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 359
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744414
Alignment:
Q  276 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 25744414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 35135906 - 35136078
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  35135906 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattagat-aattgattaattgttca 35136003  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 223  Q
    ||  || | ||||||||||||||  || ||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  35136004 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgtt 35136078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29605739 - 29605607
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattg 213  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||  || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||    
T  29605739 taagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaa-ttagtgataattg 29605642  T
Q  214 aattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  29605641 aattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatg 29605607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Original strand, 16887685 - 16887879
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||| |||    
T  16887685 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgaat-aaatgattaattgttca 16887782  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    ||  || | ||||||||||||||  |||||| | ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||| ||||||| ||  | || ||||||||||||    
T  16887783 tagatgttaaaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaagt 16887879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 325
Target Start/End: Original strand, 19983412 - 19983466
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatg 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19983412 tatgctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatg 19983466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Original strand, 15079606 - 15079795
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  15079606 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattattt-tatgaataagggattaattggat-aattgattaattattcat 15079702  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |  || | ||||||||||||||  || ||||| |||||   ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  15079703 agatgtt-aaattcgtgctctaactaggatgatatgttgt-atgcatgaagttgaggataattgaattgttgtt-gtgaaattgcatgttcaaagt 15079795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 35009569 - 35009637
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  35009569 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22848304 - 22848172
Alignment:
Q  114 taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattg 213  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| ||| |||||  || ||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||| | ||| ||   ||||||||    
T  22848304 taagtgcttagttgaat-aattgatta-ttgttcatagttgttgaaattcgtgcattaattatgatgatatgtttaaatgcaagaaattggtgataattg 22848207  T
Q  214 aattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  22848206 aattgttgttggtgaaatttcatgttcatagtatg 22848172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29666004 - 29665938
Alignment:
Q  275 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||||||||| || |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  29666004 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgtt 29665938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 359
Target Start/End: Original strand, 18823565 - 18823597
Alignment:
Q  327 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18823565 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgt 18823597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 359
Target Start/End: Original strand, 18839420 - 18839452
Alignment:
Q  327 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18839420 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgt 18839452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27740971 - 27740907
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| |||   || |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  27740971 tgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 27740907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10289 - 9983
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  10289 taaggtaagggggttagaattcataataatcattattgcaaattttcaattctttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 10190  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaa--agtatgag 250  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  10189 tgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagagtatgaa 10090  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10089 aag--ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatg 9992  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  9991 tcatgttgt 9983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 117857 - 118164
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  117857 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 117955  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117956 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 118055  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |    
T  118056 aagttggtatatgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaag 118155  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  118156 tcatgttgt 118164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 109356 - 109663
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  109356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 109454  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109455 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 109554  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  109555 aaattggtatatattgaaaatatgataaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaag 109654  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  109655 tcatgttgt 109663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 61159 - 60852
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  61159 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 61060  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  61059 atgatgaaattcgtgctctaattatgataacatgtttagatgtatgatgttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaa 60960  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    | | ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  60959 aatgggtatgtgttaaaaatatacttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgt 60860  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  60859 catgttgt 60852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Original strand, 70552 - 70823
Alignment:
Q  89 ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttt 188  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  70552 ttgtaattttcaattatttgtaagaaaagtgcttatttggatgagttgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 70651  T
Q  189 agatgtatgaagtta-tggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa 287  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70652 agatgtatgaagttaatgaataattgatttattgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaagtaggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaa 70751  T
Q  288 ttatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  70752 ttatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgt 70823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 193
Target Start/End: Original strand, 79785 - 79925
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  79785 taagctaagggggttagaattgatcataatcactcattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 79884  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  79885 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatg 79925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 346
Target Start/End: Original strand, 9783959 - 9784249
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  9783959 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttactgcaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgataaattgttcataag 9784058  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9784059 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgagaa 9784158  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttga 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9784159 gttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgc---tttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttga 9784249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 49968002 - 49967696
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |      
T  49968002 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcacttattgtaattttcaattatttgcatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcaaaaa 49967903  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  49967902 tcatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaattataaaaa 49967803  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  49967802 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtc 49967703  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  49967702 atgttgt 49967696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 95 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21718537 - 21718274
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21718537 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgt 21718439  T
Q  195 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21718438 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatgtgttcaaaatatgctcaattggtgaattatgct 21718339  T
Q  295 ttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21718338 atgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgt 21718274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 22403005 - 22403311
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  22403005 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 22403104  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  22403105 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtctagatgtatgaagttatgaataattaaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 22403202  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| || |    
T  22403203 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaag 22403302  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  22403303 tcatgttgt 22403311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 61 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41212415 - 41212136
Alignment:
Q  61 agggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaa 160  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  41212415 agggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaa 41212316  T
Q  161 ttcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtat 260  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || | |||||    
T  41212315 ttcgtgctctaattatgatgacctgtttagaggtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaactgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtat 41212216  T
Q  261 atgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41212215 gtg-taaaaatatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgtt 41212136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35055108 - 35054820
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta-attttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||      
T  35055108 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttatttctattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattggttaattgttcataaa 35055009  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35055008 tgatttaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 35054909  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35054908 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 35054820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 238
Target Start/End: Original strand, 35522247 - 35522432
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  35522247 taaggtaagggagttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagggcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35522346  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35522347 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 35522432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177221
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-g 20177472  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgga 207  Q
    |||| | |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| | |||||| | ||    
T  20177471 tatgtttaagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttga 20177373  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttg 306  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  20177372 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 20177274  T
Q  307 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||| |||   ||| | ||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  20177273 aattgtggtaaaagtcaagttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 20177221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 341
Target Start/End: Original strand, 27329757 - 27329938
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa--gttg 256  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||| |||||||||| |||  || |    
T  27329757 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgg 27329855  T
Q  257 gtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27329856 gt-tatgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 27329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16646266 - 16645976
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  16646266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16646169  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||| ||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  16646168 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataatttaattgatgttggtaaaatttcatgttcaaagtatg 16646069  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||  || |||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16646068 agaaagtgatatatgttgaat-tattctcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgtt 16645976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 51627558 - 51627847
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  51627558 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagt-aattgattatttgttcat 51627655  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |   | |  |||| |||||| | ||||||||| ||| ||  ||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  51627656 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgatatgcttgaatgcatgaatttgttgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaagtatga 51627755  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51627756 gaaaatggtatatgttg-aaatatgttcaattggttgaattatgatatggtgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgtt 51627847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16656992 - 16656702
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  16656992 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16656895  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||  || | | |||||||||||||    
T  16656894 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 16656795  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||  || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  16656794 agaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgtt 16656702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 271 - 359
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522520
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgt 35522520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376969
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-g 13376809  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgga 207  Q
    |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | ||    
T  13376810 tatgattaagtgcttaatttagt-aattgattaattgttcatagatgatgagaatcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttga 13376908  T
Q  208 taattgaattgttgttagttg-aattacatgttcaaagtatg-agaagttggtatatgttgaa 268  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13376909 taattaaattgttg-tcgttgaaatttcatgttcaaagtatgaagaag-tggtatatgttgaa 13376969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21860414 - 21860335
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21860414 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 21860335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41218808 - 41218729
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41218808 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatca 41218729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41394609 - 41394528
Alignment:
Q  4 ggagaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41394609 ggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 41394528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034902
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 44034902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 37233750 - 37234043
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | || ||| ||||||     
T  37233750 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtattattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgt 37233847  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    | |||  || |  |||||||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  37233848 taatagttgttagaattcgtgctttagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaagt 37233947  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||  |||  || ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  37233948 atatgaaagtgatatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 37234043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 359
Target Start/End: Original strand, 9784238 - 9784301
Alignment:
Q  296 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9784238 tgttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgt 9784301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 271 - 342
Target Start/End: Original strand, 15861547 - 15861618
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  15861547 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttt 15861618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17609281 - 17608992
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || |||||| ||| ||||    
T  17609281 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattagttgatcat 17609184  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||||||||||||| ||||||||| || |||  ||| ||||| ||   |||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||      
T  17609183 agttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatat 17609084  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||  || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||    
T  17609083 gaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgtt 17608992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 22143256 - 22143451
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  22143256 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 22143352  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |  || | ||||||||||||||  ||||||||  |||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  22143353 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 22143451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21860145 - 21860075
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  21860145 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 21860075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 44035092 - 44035162
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  44035092 tatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 44035162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22367152 - 22367083
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22367152 tatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 22367083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21195368 - 21195078
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  21195368 taaggtaaggggtttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 21195270  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| ||||||     
T  21195269 agttgttaaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgt 21195170  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||  || |||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||    
T  21195169 gaaaatgatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattaatgttgtt 21195078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19603449 - 19603279
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  19603449 taaggtaagggggctagaattcatcataatca-tttagtgcaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 19603353  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 223  Q
    |  || | |||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||||||||| ||   ||||||||| ||||||||    
T  19603352 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgtt 19603279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 8537803 - 8538000
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | | ||||    
T  8537803 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8537901  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
       || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  8537902 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 8538000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 8603042 - 8603239
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | | ||||    
T  8603042 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8603140  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
       || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  8603141 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 8603239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20445812 - 20445747
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  20445812 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgtt 20445747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20531577 - 20531512
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  20531577 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgtt 20531512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 49997174 - 49997371
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcat-cataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  49997174 taaggtaagggggttagaattcaaacataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcat 49997272  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
       || ||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||  || |||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  49997273 gattgttgaaatttgtgccctagttatggtgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 49997371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 254710 - 255015
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  254710 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 254808  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 250  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  254809 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttg-tagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 254906  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  254907 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatg 255006  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  255007 tcatgttgt 255015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 261316 - 261621
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  261316 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 261414  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 250  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  261415 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtag-tagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 261512  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  261513 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatg 261612  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  261613 tcatgttgt 261621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 67
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 271  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  270 tgatgaaattcgtgctcta---atgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattgcatgttcaaagtatgagaa 174  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  173 attggtatatgttgaaaatatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtc 74  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    || ||||    
T  73 atcttgt 67  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 245
Target Start/End: Original strand, 19802 - 20041
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19802 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 19901  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19902 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 20001  T
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20002 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 20041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 245
Target Start/End: Original strand, 24106 - 24345
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24106 agaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattat 24205  T
Q  106 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 24305  T
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24306 aataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 24345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 132144 - 132451
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  132144 taaggtaagggggttggaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttctatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 132243  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  132244 atgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattatatgttcaaagtatgaaa 132343  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  132344 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagt 132443  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  132444 catgttgt 132451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 88631 - 88341
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||    
T  88631 taataaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgtcca 88532  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  88531 taaatgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaaatgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 88432  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 339  Q
    | || | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  88431 aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttg 88341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12041 - 11751
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  12041 taaggtaaggtggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtcaattgattaattgttcata 11943  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11942 aatgatgaatttcgtgctctaattatgatgacatgtttcaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 11843  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||   | |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11842 aaaaagatatgagttgaaaacatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 11751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16253 - 16022
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt-cat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  16253 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 16155  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16154 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 16055  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattg 282  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  16054 gaaaatgatatgagttgaaaatatgctccattg 16022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25784 - 25553
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt-cat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  25784 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 25686  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25685 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgttttaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 25586  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattg 282  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  25585 gaaaatgatatgagttgaaaatatgctccattg 25553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 359
Target Start/End: Original strand, 252903 - 253190
Alignment:
Q  73 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctcta 171  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||| |     
T  252903 ttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtgcataaatgataaaattcgtgctttg 253002  T
Q  172 tttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaat 271  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  253003 attatgatgacatgtttggatgtatgaagttagggataattgaattgttgttagttgaattacattttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaat 253102  T
Q  272 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  253103 atgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgt 253190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 190
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  496 taaggtaagggggttagaattaatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 397  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||| |  |||    
T  396 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaaattcatgtttcaagtgtatgaa 297  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  296 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 197  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  196 atgttgt 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25563 - 25257
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  25563 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 25464  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  |||    
T  25463 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25364  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  25363 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggc 25264  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  25263 atgttgt 25257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25210 - 25004
Alignment:
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  |||    
T  25210 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25111  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  25110 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggc 25011  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  25010 atgttgt 25004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11769
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||      
T  11464 taaggtatgggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaagtgtttaattgt-tgaattgattaattgttcataaa 11562  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11563 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgaaaa 11662  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11663 atgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtc 11762  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  11763 atgttgt 11769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 271521 - 271216
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||      
T  271521 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattattcataaa 271423  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  271422 tgaagaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 271323  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  271322 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 271223  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  271222 atgttgt 271216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 4448028 - 4448334
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||      
T  4448028 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttatatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataaa 4448127  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  4448128 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 4448227  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4448228 atgggtttgtgttgaaaatatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 4448327  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  4448328 atgttgt 4448334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 25875816 - 25876120
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25875816 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataagt 25875915  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  25875916 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 25876013  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||| |  ||    
T  25876014 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagt 25876112  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  25876113 catgttgt 25876120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 23836601 - 23836888
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23836601 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgaatgataagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataagt 23836700  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgaga 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| |    
T  23836701 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgt-gttagtggaattacatgttcaaagtgtatgaaa 23836799  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23836800 a-tgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgtt 23836888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32466207 - 32465904
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32466207 taaggtaagggg-ttagtcttcatcataatcacttttgaaaattttaattatttgtacgataagtgcttatttgaatgaattgattaattgttcatatgt 32466109  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  32466108 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 32466009  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca 353  Q
    | | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||    
T  32466008 tggatatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtca 32465910  T
Q  354 tgttgt 359  Q
    ||||||    
T  32465909 tgttgt 32465904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25602377 - 25602070
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  25602377 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatg 25602279  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25602278 gatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgag 25602179  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25602178 aaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatg 25602079  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  25602078 tcatgttgt 25602070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 36890581 - 36890886
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||      
T  36890581 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgttattttcaattatg-gtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 36890679  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890680 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatggcatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 36890779  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||     
T  36890780 aatggaatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtg 36890879  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  36890880 atgttgt 36890886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28974400 - 28974095
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||      
T  28974400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattatttcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 28974302  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28974301 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaa 28974202  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  28974201 aatggtatatgttgaaaatatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtc 28974102  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  28974101 atgttgt 28974095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27262156 - 27261916
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27262156 taaggtaagggagttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatg 27262058  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27262057 gatgatgaaatttgtgccctaattatgatgacatgtttggatgtataaagttatggataattgaattgttgttagttcaattacatgttcaaagtatgag 27261958  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 293  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27261957 aaattggtatatgttgaaaatatgctc-attggtgaattatgc 27261916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 24571188 - 24571493
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaat-tttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||     
T  24571188 taaggttagggggttagaattcatcataatcattattgcaatgtttcaattatt-gtatgaataaatgcttaattgggt-aattgattaattgttcatag 24571285  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||    
T  24571286 atgatgaaattcgtgctctaattttgatgacacgtttgaatgcatgaagttgtggatacttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaggtatgaga 24571385  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  24571386 aaatgatatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaag 24571484  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    | |||||||    
T  24571485 tgatgttgt 24571493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 22579758 - 22580060
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  22579758 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 22579855  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag- 250  Q
     || |  ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |  ||| |||| |||||||     
T  22579856 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagttat-gataattgaattgttgttggtgaaactttatgatcaaggtatgaga 22579954  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 349  Q
    ||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  22579955 aaaatgttatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgc---tttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatat 22580050  T
Q  350 gtcatgttgt 359  Q
    || |||||||    
T  22580051 gtgatgttgt 22580060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 68351 - 68056
Alignment:
Q  49 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaatt 143  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  68351 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaatagattaatt 68254  T
Q  144 ggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa 243  Q
    | |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  68253 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T
Q  244 gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  68153 gtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgtt 68056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43645939
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaattttcaattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| |||| | |  |||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcagtcataatcatttttagtgtaaatttccaattgttg 43646190  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgga 207  Q
    ||||| |||||| |||||||  | ||| ||||||||| ||| |  || |  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| |||||||| | ||    
T  43646189 tatgaataagtgtttaattgagtaaat-gattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttga 43646091  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttg 306  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  43646090 taattggattgttgttggtgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 43645992  T
Q  307 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    || |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  43645991 aactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 43645939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 338
Target Start/End: Original strand, 31146073 - 31146360
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||  ||    
T  31146073 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatcttttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaataagtgcttaactgagt-aattgattaattgtcca 31146171  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||  || |  |||||||| || | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||    
T  31146172 taattgttagaattcgtgttccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatg 31146271  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    ||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  31146272 agaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatg-tgttgttgaattgtaataagattcctgttcaattgatgtt 31146360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22284358 - 22284279
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22284358 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 22284279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 19794581 - 19794660
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19794581 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 19794660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 20627190 - 20627269
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  20627190 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatca 20627269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22275125 - 22275046
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22275125 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatca 22275046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15633617 - 15633535
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 88  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  15633617 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcactt 15633535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6879577 - 6879501
Alignment:
Q  265 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  6879577 tgaaaatatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgtt 6879501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 43642833 - 43642912
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  43642833 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatca 43642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 346
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775393
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 258  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||  |  |    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagttat 22775305  T
Q  259 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttga 346  Q
    ||||||||||  | || |||| ||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  22775306 atatgttgaat-tgtgttcaaatttatgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttga 22775393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 346
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780771
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 258  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||  |  |    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagttat 22780683  T
Q  259 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttga 346  Q
    ||||||||||  | || |||| ||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  22780684 atatgttgaat-tgtgttcaaatttatgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttga 22780771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19666921 - 19666685
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||    
T  19666921 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgta 19666823  T
Q  111 tg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggata 209  Q
    || |||| |||||||||| || || |||||||||| |||||  || | |||||| |||||||  ||| |||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||    
T  19666822 tgaataaatgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgata 19666724  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||||||||||| || ||  | || |||||||||||||||    
T  19666723 attgaattgtttttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 19666685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 341
Target Start/End: Original strand, 21274174 - 21274240
Alignment:
Q  275 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21274174 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 21274240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22274856 - 22274786
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  22274856 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgtt 22274786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22284089 - 22284029
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22284089 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaat 22284029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 9653021 - 9653085
Alignment:
Q  275 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||    
T  9653021 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttg 9653085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660037
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  |||  |||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaa-ggggttagaattcatcataatcactttagtgtaatttttcatttgttgta 19660175  T
Q  111 tga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggata 209  Q
    ||| |||||| |||| ||||  || |||||| ||| || ||  || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||   ||  ||||| ||   ||||    
T  19660174 tgattaagtgtttaa-tggaataagtgattatttgttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatgatatgttcgtatacatgaaattggtgata 19660076  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||| ||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  19660075 attgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 19660037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 233
Target Start/End: Original strand, 23821534 - 23821714
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  23821534 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23821631  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatta 233  Q
      || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23821632 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgattgaatta 23821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 233
Target Start/End: Original strand, 23830613 - 23830793
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  23830613 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23830710  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatta 233  Q
      || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23830711 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgattgaatta 23830793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25305622 - 25305509
Alignment:
Q  229 aattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttg-ttgttgaattgtgataagtttcatga 326  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || ||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||  |||||     
T  25305622 aatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatgtgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgattgttgaattgtggtaagagtcatgt 25305524  T
Q  327 tcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||    
T  25305523 tcaattgatgttgtt 25305509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9636944 - 9636809
Alignment:
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||  || |||||  ||||  ||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||    
T  9636944 gataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tatgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgt 9636846  T
Q  305 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  9636845 tgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 9636809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 19669003 - 19669199
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  19669003 taaggtaacggggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaatgattaattgttcat 19669100  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |  || | |||| | |||||||  |||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||| |||||||    
T  19669101 agatgttaaaatccatgctctaactatggtgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttctaagtatg 19669199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 338
Target Start/End: Original strand, 24341519 - 24341584
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  24341519 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 24341584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 25265520 - 25265588
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  25265520 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27261899 - 27261852
Alignment:
Q  312 tgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  27261899 tgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgt 27261852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4913 - 4627
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4913 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 4816  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  4815 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 4716  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  4715 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgtt 4627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9527 - 9241
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  9527 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 9430  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9429 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 9330  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  9329 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgtt 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 5143 - 5447
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5143 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttctaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 5242  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 251  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  5243 gatgaaattcgtgctcttattatgatgagatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 5340  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  5341 aataggtatgtg-cgaaaatatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 5439  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  5440 catgttgt 5447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 8776 - 9083
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  8776 taaggtaagggggttagagttcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggaaaattgattaattgttcata 8874  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8875 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 8974  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 349  Q
    ||  || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  8975 aaaatgatatatgttg-atatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaa 9073  T
Q  350 gtcatgttgt 359  Q
    || |||||||    
T  9074 gtgatgttgt 9083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9339 - 9033
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt--caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| | ||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||     
T  9339 taaggtaagggggttagaatttatcataatcattattgcaattttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaatttttcataa 9241  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 9141  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||    
T  9140 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagt 9041  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  9040 catgttgt 9033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7922 - 7615
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  7922 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 7823  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgac-atgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  7822 tgatgaaattcatgatctaattatgatgcctatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaa 7723  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  7722 aatgggtatatgatgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagt 7623  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  7622 catgttgt 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15224 - 14938
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatatgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 15125  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||| |    
T  15124 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttagattacatgttcaaagtgtatga-a 15027  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15026 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgtt 14938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 85683 - 85378
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||      
T  85683 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtttataaa 85585  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85584 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 85485  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  85484 attggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtc 85385  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  85384 atgttgt 85378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 159651 - 159346
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  159651 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtacgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 159553  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  159552 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatggcattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 159453  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
      || |||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  159452 aatgatatgagttgaaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 159353  T
Q  352 catgttg 358  Q
     ||||||    
T  159352 gatgttg 159346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1667 - 1363
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||      
T  1667 taaggcaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatt--caattatttgtatgaaaagtggttaattgaatgaattgattaattgtgtataaa 1570  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1569 tgatgaaattcgtgctctaatcatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttggtggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 1470  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1469 atgggtatgtgatgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 1370  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  1369 atgttgt 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 11548 - 11837
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  11548 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 11647  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||     
T  11648 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttcttggttgaattacatgttcaaagtgtatga- 11746  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11747 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgtt 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7235
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7522 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 7425  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7424 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 7325  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatt-gatgttgtt 341  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| |||||||||    
T  7324 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattggatgttgtt 7235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 112441 - 112746
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||      
T  112441 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtacttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 112539  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112540 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaacaattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 112639  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||    
T  112640 attggtatatgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtc 112739  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  112740 atgttgt 112746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 338
Target Start/End: Original strand, 102815 - 103102
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  102815 taaggtaaggggtttataattcatcataatcattttttgtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 102912  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  102913 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 103012  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    ||||  ||||||||| ||  |||||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  103013 agaaagtggtatatggtg-gaatatgctaaatttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgtt 103102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 109821 - 109636
Alignment:
Q  174 tatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatat 273  Q
    |||||||| ||||||  ||  |||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  109821 tatgatgatatgtttgaatccatgaagttgttgataattgaattgttgttaatgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaa-tat 109723  T
Q  274 gctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    |||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || || |||||||    
T  109722 gctcaaattgttgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 109636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5231 - 4987
Alignment:
Q  115 aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 214  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5231 aagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 5132  T
Q  215 attgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5131 attgttgttagttgaattacatgttcacagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtga 5032  T
Q  315 taagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  5031 taagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgt 4987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 24623 - 24911
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||      
T  24623 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgaaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgtccataaa 24722  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24723 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttattgataattaaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 24822  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24823 atgggtatgtgttgaacatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 24911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 95109 - 95023
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgtt 357  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||    
T  95109 tatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgtt 95023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 48496 - 48219
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48496 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 48398  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  48397 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatgaaaaa 48298  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 333  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48297 tgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattg 48219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 61944 - 61667
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  61944 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 61846  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  61845 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatgaaaaa 61746  T
Q  254 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 333  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  61745 tgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattg 61667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38650 - 38344
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  38650 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 38551  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  38550 tgatgaaatacgcgctctaattatgatgacatgtttagatttatgaatttatgaataattgaatttttgttggttgaattacatgttcaaaggaagagaa 38451  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||    
T  38450 atgggtatatgttgaaaatatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtc 38351  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  38350 atgttgt 38344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4635 - 4351
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4635 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacgtttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 4536  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 251  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  4535 gatgaaattcgtgctctaattataatgacatgtttagatgtatcaaattatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 4438  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 339  Q
    | | ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4437 aatgggtatgtg-tgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 6)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 164565 - 164261
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  164565 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaattgtatggtaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataagt 164466  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 251  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  164465 gatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 164368  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
    | | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||    
T  164367 aatgggtatgtg-tgaagatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagt 164269  T
Q  352 catgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  164268 catgttgt 164261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 166116 - 166195
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  166116 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 166195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162109
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 162109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 162299 - 162369
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  162299 tatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 162369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 166385 - 166455
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  166385 tatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 166455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116664
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt---tgtaattttcaattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||   ||||| |||  | |  ||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcatttttagtgtaaattttgaatggttgt 116509  T
Q  110 atg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggat 208  Q
    ||| |||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  | | ||||| || | |||    
T  116510 atgaataagtgcttaattgagtaaatt-attaattgctcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaaggcatgaaattgttgat 116608  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaa 269  Q
    |||||||||||     || |  || |||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  116609 aattgaattgt-----gtgggttttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgttgaaa 116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 70964 - 70659
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | | |||      
T  70964 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgtaattttcagttatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaatagtttataaa 70866  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  70865 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatt-catgttcaaagtatgagaa 70767  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
      ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  70766 aatggaatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctgatatat 70667  T
Q  352 catgttgt 359  Q
     |||||||    
T  70666 gatgttgt 70659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31352 - 31098
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31352 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattatttgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgt 31254  T
Q  195 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa-ttatgc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||     
T  31253 atgaagttatggataattgaattgtggttagttgaatt-catgttcaaagtataagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaatttgttaagttatg- 31156  T
Q  294 attgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 351  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  31155 tttgtagttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgt 31098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 97088 - 97381
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||  || | ||||||||||     
T  97088 taatgaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgatttagtgtttaattgagtg-agtgattaattgt 97185  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | | |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| || || ||   |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  97186 tcatagttgttaagattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaagt 97285  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||    
T  97286 atgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttggtgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatattgtt 97381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34014 - 33726
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 151  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  34014 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattact-gtatgattaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcgtaa 33916  T
Q  152 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 251  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33915 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 33816  T
Q  252 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815 aattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 33726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 471 - 777
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  471 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcatttattgctatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 568  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  569 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaaattatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgag 668  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 350  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  669 aaaatggtatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaag 768  T
Q  351 tcatgttgt 359  Q
    |||||||||    
T  769 tcatgttgt 777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21862 - 21558
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||      
T  21862 taaggtaagggggttataattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaaaggcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 21764  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21763 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 21665  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||    
T  21664 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtc 21565  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  21564 atgttgt 21558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31561 - 31257
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||      
T  31561 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 31463  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 252  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31462 tgatgaaattcatgatctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattaaatgttcaaagtatgagaa 31364  T
Q  253 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 352  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || |||    
T  31363 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtc 31264  T
Q  353 atgttgt 359  Q
    |||||||    
T  31263 atgttgt 31257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 47445 - 47554
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||      
T  47445 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 47543  T
Q  153 tgatgaaattc 163  Q
    |||||||||||    
T  47544 tgatgaaattc 47554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 58 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2263 - 1963
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgat 156  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  2263 gtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgctcataaatgat 2165  T
Q  157 gaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttg 256  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||    
T  2164 gaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgcgaaaatg 2065  T
Q  257 gtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatg 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  2064 gtatatgatgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatg-tgttgttgatttgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatg 1966  T
Q  356 ttg 358  Q
    |||    
T  1965 ttg 1963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46521 - 46229
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 148  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  46521 taattaaggtaagagggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 46423  T
Q  149 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttg-aattacatgttcaaagta- 246  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||     
T  46422 taaatgatgaaattcgtactctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtat 46323  T
Q  247 -tgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46322 gtgaaaagtgggt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 46229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41010 - 40722
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  41010 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaatagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 40912  T
Q  153 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttg-aattacatgttcaaagta--tga 249  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||  |||    
T  40911 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtatgtga 40812  T
Q  250 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
     |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40811 aaagtgggt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 40722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 80267 - 80188
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  80267 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 80188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 79998 - 79928
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  79998 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 79928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 1
Alignment:
Q  15 ggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgat 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgat 65  T
Q  115 aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  64 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctatttatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6251 - 6004
Alignment:
Q  95 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  6251 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgacgacatgtttgaatgt 6153  T
Q  195 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag-aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatg 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6152 atgaagttatggataattggattgttgttggtagaatttcatgttcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatg 6053  T
Q  293 cattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  6052 ctatgtggttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttgtt 6004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 304 - 383
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  304 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatca 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 572 - 642
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  572 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 146848 - 146665
Alignment:
Q  158 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttgg 257  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  146848 aaattcatgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 146749  T
Q  258 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  146748 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 146665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 53703 - 53410
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||     
T  53703 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 53606  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || |  ||||| ||||||| | ||||||| ||||||  ||| ||||  ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  53605 tcatagttgttagaattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 53506  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| |||| || ||||||||| || ||||||| || || | ||||||||  | |||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  53505 atgtgaaggtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttcaattatgctattttgttgatgaattgtgatgagattcatgttcaatggatgttgtt 53410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 85818 - 85690
Alignment:
Q  118 tgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaatt 217  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  85818 tgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaattggtgataattgaatt 85721  T
Q  218 gttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  85720 gttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 85690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8982 - 8917
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 338  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||||||||    
T  8982 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgtt 8917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 205
Target Start/End: Original strand, 2961 - 3112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2961 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataaatgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 3060  T
Q  154 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 205  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3061 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 3112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 33622 - 33929
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  33622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 33719  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 249  Q
    |  || |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  33720 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatga 33819  T
Q  250 -gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
     ||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33820 agaagt-gttatatgttgaaa-tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgct 33917  T
Q  348 atgtcatgttgt 359  Q
    | || |||||||    
T  33918 aagtgatgttgt 33929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3671 - 3385
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  3671 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 3574  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||    
T  3573 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttaatgttcaaagtatgag 3474  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 339  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3473 aaagtggtatatg-tgaaaatatgctcaattggtccaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttg 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 76699 - 77030
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-g 76797  T
Q  109 tatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgga 207  Q
    |||||| |||| ||||||||  | |||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||    
T  76798 tatgattaagtacttaattgagt-aattgagtaattgttcatagatgatgaaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttga 76896  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttg 306  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  76897 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgttcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 76995  T
Q  307 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  76996 aattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgtt 77030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8157 - 7927
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  8157 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 8060  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
    | || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  8059 tttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 7960  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 284  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7959 aaagtggtatatg-tgaaaatatgctcaattggt 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 2211 - 2499
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||    
T  2211 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgcaatttttaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattaatcata 2308  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 250  Q
      |  |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  2309 attattagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 2408  T
Q  251 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||  ||  |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  2409 aaagtgacatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgtt 2499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 197143 - 197436
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 146  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  197143 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattggat-aagtgattaattgtt 197241  T
Q  147 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 246  Q
    | ||  || |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  197242 cttagatgttgaatttcgggctctaattatgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaagta 197341  T
Q  247 tgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    || |||  || |||| |||| || ||||||| || || |||||| | |  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  197342 tgtgaaagtgttataagttg-aattatgctctaaatgttgaattgtcctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 197436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 341
Target Start/End: Original strand, 6907 - 7208
Alignment:
Q  43 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||  |||||||||  | |  |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||    
T  6907 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaattataatcattttaatgtaatttttcaatcgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gat 7005  T
Q  139 taattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 238  Q
    |  ||| |||||  ||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||  ||||    
T  7006 ttgttgttcataattgtcaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttaatgt 7105  T
Q  239 tcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 337  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  7106 tcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgtttaattatgttatgttgttattggattgtgataagaatcatgttcaattgatgt 7204  T
Q  338 tgtt 341  Q
    ||||    
T  7205 tgtt 7208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 258 - 359
Target Start/End: Original strand, 618 - 719
Alignment:
Q  258 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgtt 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||    
T  618 tatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgtt 717  T
Q  358 gt 359  Q
    ||    
T  718 gt 719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35524
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||| || |    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtt-g 35775  T
Q  109 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgga 207  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||  ||||||||| ||| |  |  |  ||||||||||| | | ||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||    
T  35774 tatgaataggtgcttaattgagtaaaa-gattaattgttcaaagttcttataattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattga 35676  T
Q  208 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttg 306  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||| ||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  35675 taattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatactcaaattgttgatttatgctatgttgttgttg 35577  T
Q  307 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    || |||| ||||  ||||| |||||||||||| || ||| || || |||||||    
T  35576 aaatgtggtaagagtcatgttcaattgatgtttttgttgctaagtgatgttgt 35524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 69814 - 69521
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||     
T  69814 taattaagataagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattg-agaaagtgattaattgt 69717  T
Q  146 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||    ||||||||||||||||  ||  |||| |||||| |||||    
T  69716 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgtttaaagt 69617  T
Q  246 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||| |||  || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  69616 atgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 69521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2589
Alignment:
Q  135 tgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattac 234  Q
    |||||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  2795 tgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgc 2696  T
Q  235 atgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 333  Q
    |||||||||||||  |||  || ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  2695 atgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattg 2597  T
Q  334 atgttgtt 341  Q
    ||||||||    
T  2596 atgttgtt 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6725
Alignment:
Q  159 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 258  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || |    
T  6907 aattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 6808  T
Q  259 atatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  6807 atatgttg-aattttgctcaaattgttgaattatgctatgctattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgtt 6725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32344 - 32249
Alignment:
Q  264 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||    
T  32344 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 32249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Original strand, 41959 - 42054
Alignment:
Q  264 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||    
T  41959 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 42054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5808
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 5808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6014
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6274
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  6204 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 6274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28781 - 28582
Alignment:
Q  160 attcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggta 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  || ||    
T  28781 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatgagaaagtgata 28682  T
Q  260 tatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 358  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||||  | ||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  28681 tatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatggtatgttgttgttgaattgtagtaagaattatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttg 28583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 359
Target Start/End: Original strand, 93728 - 93973
Alignment:
Q  113 ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgat-gaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataat 211  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||  || | ||||||||||||| | ||||||||| |||| |  ||| |||||||| | ||||||    
T  93728 ataagtgcttaattgggtaaatt-attaattgttcataactgttagaaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataat 93826  T
Q  212 tgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaatt 310  Q
    ||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||  |||| |||||  || ||||||| ||||    
T  93827 tgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatttgttg-aaatatgctcaaattattgaagtatgctatg-tgttgttaaatt 93924  T
Q  311 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||||||||| || ||| || |||||||    
T  93925 gtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttattaataagtgatgttgt 93973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 55715 - 55645
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55715 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 55645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 104477 - 104713
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgta 110  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||  |||||    
T  104477 taggagctaaagtgaagcttgggctaagaatttgtgctaattaaggtaagtgggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatt-gttgta 104575  T
Q  111 tg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggata 209  Q
    || |||| ||||||||| ||  || |||||||||| |||||  || | |||||| |||||||  |||||||| ||||||  ||| || || ||   ||||    
T  104576 tgaataattgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcatagatgttaaaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgata 104674  T
Q  210 attgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |||||||||||||| ||  | || || ||||||||||||    
T  104675 attgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaaagtatg 104713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 17525 - 17595
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17525 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 17595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31414 - 31084
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | || ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||    
T  31414 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gt 31316  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || |  ||||||||||||| ||||||||| || |||  ||| ||||| ||   |||    
T  31315 atgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgat 31217  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttga 307  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||  || |||||||||||  ||||||  || || |||||| |||  |||| |||||||    
T  31216 aattggattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctttaaatgttgaattgtgctatgttcttgttga 31118  T
Q  308 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  31117 attgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 31084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8363 - 8056
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  8363 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttaatgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 8266  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg- 248  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||     
T  8265 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgt 8166  T
Q  249 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 347  Q
    | ||| || ||  |  || |  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| |    
T  8165 ataag-tgctaacttatg-atttatgctcaattgggtgaattatgctatgttgttgtggaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgct 8068  T
Q  348 atgtcatgttgt 359  Q
    |||| |||||||    
T  8067 atgtgatgttgt 8056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 89584 - 89652
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  89584 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgtt 89652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 31132 - 31211
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  31132 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatca 31211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 31401 - 31471
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  31401 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 31471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41712 - 41633
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  41712 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatca 41633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41443 - 41373
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  41443 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 41373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3345
Alignment:
Q  297 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgt 3345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 1099 - 1169
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1099 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 13507 - 13577
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13507 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 13577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 21481 - 21551
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21481 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 21551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15083 - 15013
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15083 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 15013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 1440 - 1611
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  1440 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1537  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 223  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  1538 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 8585 - 8756
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  8585 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 8682  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 223  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  8683 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 6664 - 6734
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  6664 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgtt 6734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 9628 - 9698
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9628 tatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 9698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 1242 - 1438
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  1242 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aaatgattaattgttcat 1339  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| || || ||   |||||||| ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||    
T  1340 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatg 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9693
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  9497 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aaatgattaattgttcat 9594  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| || || ||   |||||||| ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||    
T  9595 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatg 9693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 30497 - 30418
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30497 agaatcatagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatca 30418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30199 - 30155
Alignment:
Q  297 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  30199 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 30155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42754 - 42678
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42754 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatca 42678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13639 - 13571
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  13639 tgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 89760 - 89929
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  89760 taaggtaagggggttagaattcatcataatctttttagtgtaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttcata 89857  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 223  Q
      || | |||||||||||| |  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||| |||||||||||||    
T  89858 gatg-ttaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgatacttgaattgttgtt 89929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11014 - 10845
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||| |||||    
T  11014 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtataattttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaata-attaattgttcata 10917  T
Q  151 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgt 222  Q
      || |  |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||| |||||||    
T  10916 gatgttataattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgt 10845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 341
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10157
Alignment:
Q  278 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 10157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 12641 - 12711
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  12641 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 12711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 186647 - 186716
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  186647 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 186716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 193609 - 193678
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  193609 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 193678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27856 - 27654
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||| | ||||||||||||| || ||| ||||| || |    
T  27856 taattaaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataaat-gattattttg 27758  T
Q  146 -tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 244  Q
     |||||  || ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||    
T  27757 ctcatagttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatag 27658  T
Q  245 tatg 248  Q
    ||||    
T  27657 tatg 27654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11326 - 11140
Alignment:
Q  173 ttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaata 272  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||  ||  |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || |||  || ||||||||| || ||    
T  11326 ttatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtgtgtgaaagtgatatatgttg-aatta 11228  T
Q  273 tgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgt 359  Q
    ||||| ||| | |||| |||||  | ||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  11227 tgctcaaatagttgaaatatgctatcttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgt 11140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Original strand, 149 - 219
Alignment:
Q  271 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  149 tatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgtt 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Original strand, 22323 - 22516
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22323 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgttattttttaatta-ttgtatgaataagtgattaattggatg-attgattgattgttcat 22420  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 245  Q
    |  || | ||||||||||||||  || ||| | ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||    
T  22421 agatgttaaaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagt 22516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Original strand, 70201 - 70298
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||| |||||    
T  70201 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttgtgaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaaatgtat-aattgattaattgttcata 70298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 855 - 1052
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 149  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||  || || |||||| ||| ||||    
T  855 taaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattaaat-aagtgattatttgttcat 953  T
Q  150 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 248  Q
    |  || | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  954 agttgttaaaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 23562 - 23855
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| | |  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||| |    
T  23562 taattaagataagggggttagaattcaatcataatgattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgtt 23660  T
Q  147 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 246  Q
    ||||  || ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||  ||  ||||| || | |||||||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||    
T  23661 catagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttttgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcatagta 23760  T
Q  247 tgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    || |||  || |||||  || || | ||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||||||    
T  23761 tgtgaaaatgatatattgtg-aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgacgttgtt 23855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 43651 - 43908
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgt 109  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||  | || ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||    
T  43651 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattgtt-gt 43749  T
Q  110 atgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggat 208  Q
    ||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || | |||||  ||||||| ||||||||  ||||||  ||| ||||| ||   |||    
T  43750 atgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattaatgctctaattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgat 43848  T
Q  209 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 268  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||||||    
T  43849 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaaggatatgaaagtgatatatgttgaa 43908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1435
Alignment:
Q  21 aaagtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 85  Q
    ||||||||| | ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1371 aaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatca 1435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22198 - 22063
Alignment:
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||  ||||  | ||||| || || ||||||  ||  |||||||||    
T  22198 gataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattgtgaat-tgtgctctaaatgttgaattgggctatgttgttgt 22100  T
Q  305 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||    
T  22099 tgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgtt 22063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 108208 - 108074
Alignment:
Q  206 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||  || || ||||||| || || |||||||||| ||||| ||||    
T  108208 gataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattatg-aattatgctctaaatgttgaattatgc-ttgttattgt 108111  T
Q  305 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||| |   ||||| | |||||||||||||    
T  108110 tgaattgtgatgaagatcatgtttaattgatgttgtt 108074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 373
Alignment:
Q  278 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  436 aattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgtt 373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41778 - 41713
Alignment:
Q  276 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  41778 tcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Original strand, 17428 - 17504
Alignment:
Q  265 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  17428 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 17504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Original strand, 61341 - 61417
Alignment:
Q  265 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  61341 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 61417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 51312 - 51380
Alignment:
Q  273 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  51312 tgctcaattggtgaattatgttatgtggttgatgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 51380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University