View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13455_high_4 (Length: 349)

Name: NF13455_high_4
Description: NF13455
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13455_high_4
NF13455_high_4
[»] chr4 (101 HSPs)
chr4 (39-339)||(54189592-54189892)
chr4 (39-345)||(31969722-31970028)
chr4 (39-349)||(14987829-14988138)
chr4 (39-345)||(54412669-54412975)
chr4 (39-339)||(45424380-45424680)
chr4 (39-339)||(37464768-37465068)
chr4 (39-345)||(53717312-53717616)
chr4 (39-339)||(2481254-2481554)
chr4 (39-338)||(33703889-33704186)
chr4 (39-309)||(23268892-23269162)
chr4 (39-345)||(27535942-27536256)
chr4 (146-345)||(6611313-6611512)
chr4 (146-345)||(20877088-20877287)
chr4 (146-345)||(44379140-44379339)
chr4 (160-338)||(15240995-15241173)
chr4 (146-339)||(1617131-1617324)
chr4 (150-345)||(27488605-27488800)
chr4 (150-345)||(38055198-38055393)
chr4 (146-349)||(53875694-53875897)
chr4 (160-345)||(19913597-19913782)
chr4 (150-339)||(43289917-43290106)
chr4 (153-345)||(16700822-16701014)
chr4 (150-345)||(1756721-1756916)
chr4 (150-345)||(8591049-8591244)
chr4 (146-345)||(40428673-40428872)
chr4 (146-339)||(23704162-23704355)
chr4 (158-345)||(28032677-28032864)
chr4 (146-345)||(30423518-30423716)
chr4 (39-244)||(23261732-23261937)
chr4 (150-339)||(35490730-35490919)
chr4 (146-345)||(37968710-37968909)
chr4 (158-339)||(11639543-11639724)
chr4 (146-345)||(50353842-50354042)
chr4 (42-338)||(8932025-8932323)
chr4 (158-345)||(23776424-23776611)
chr4 (158-345)||(6688592-6688773)
chr4 (153-345)||(44784877-44785069)
chr4 (160-339)||(15669230-15669409)
chr4 (146-345)||(48909887-48910086)
chr4 (153-331)||(19164933-19165109)
chr4 (158-339)||(47632081-47632263)
chr4 (150-345)||(53353100-53353299)
chr4 (146-342)||(30171624-30171819)
chr4 (159-338)||(52139251-52139428)
chr4 (158-345)||(40680003-40680190)
chr4 (158-345)||(27583597-27583784)
chr4 (190-345)||(50055098-50055253)
chr4 (153-339)||(38071286-38071466)
chr4 (146-331)||(44375900-44376079)
chr4 (159-345)||(16703862-16704046)
chr4 (152-339)||(55344784-55344971)
chr4 (215-345)||(28360471-28360602)
chr4 (158-267)||(53408138-53408248)
chr4 (39-131)||(30171805-30171897)
chr4 (237-345)||(50053484-50053592)
chr4 (38-131)||(1617310-1617403)
chr4 (39-131)||(6688462-6688554)
chr4 (146-284)||(9595855-9595982)
chr4 (39-131)||(28032544-28032636)
chr4 (52-131)||(19164822-19164901)
chr4 (40-215)||(55344533-55344715)
chr4 (39-131)||(8590926-8591018)
chr4 (39-131)||(28360623-28360715)
chr4 (39-131)||(35490608-35490700)
chr4 (39-131)||(38055426-38055518)
chr4 (39-131)||(44784753-44784845)
chr4 (39-131)||(47632302-47632394)
chr4 (43-131)||(53875883-53875971)
chr4 (39-131)||(6611235-6611327)
chr4 (39-131)||(16701047-16701139)
chr4 (39-131)||(27488480-27488572)
chr4 (39-131)||(38071164-38071256)
chr4 (39-131)||(40428595-40428687)
chr4 (39-131)||(44379062-44379154)
chr4 (150-230)||(50055301-50055381)
chr4 (39-131)||(52139464-52139556)
chr4 (39-131)||(53408287-53408379)
chr4 (40-131)||(30423441-30423532)
chr4 (39-131)||(15240860-15240952)
chr4 (39-131)||(15669449-15669541)
chr4 (40-131)||(9595778-9595869)
chr4 (44-131)||(20877273-20877360)
chr4 (38-131)||(23704083-23704176)
chr4 (39-131)||(1756600-1756691)
chr4 (52-131)||(43289808-43289886)
chr4 (39-117)||(44376823-44376901)
chr4 (39-129)||(50055413-50055503)
chr4 (39-131)||(19913465-19913556)
chr4 (39-131)||(48910072-48910164)
chr4 (238-320)||(51780763-51780845)
chr4 (39-110)||(23776307-23776378)
chr4 (39-110)||(37968638-37968709)
chr4 (53-128)||(50354031-50354106)
chr4 (39-131)||(53353329-53353417)
chr4 (159-242)||(34615904-34615985)
chr4 (179-247)||(48748197-48748265)
chr4 (237-339)||(44548185-44548287)
chr4 (301-338)||(23265865-23265902)
chr4 (39-77)||(30171935-30171973)
chr4 (237-338)||(17493381-17493482)
chr4 (242-295)||(55344724-55344777)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (39-339)||(27679027-27679327)
chr5 (39-345)||(24105529-24105835)
chr5 (39-339)||(33491054-33491354)
chr5 (45-345)||(26602807-26603106)
chr5 (39-339)||(35782503-35782802)
chr5 (39-345)||(16069397-16069714)
chr5 (52-345)||(33991184-33991480)
chr5 (150-339)||(31883194-31883383)
chr5 (146-345)||(1165566-1165765)
chr5 (150-345)||(1579080-1579275)
chr5 (150-345)||(1605540-1605735)
chr5 (150-345)||(16737416-16737611)
chr5 (153-345)||(8374311-8374502)
chr5 (158-345)||(9008034-9008221)
chr5 (158-339)||(3386463-3386644)
chr5 (153-345)||(4120981-4121173)
chr5 (150-345)||(3921625-3921820)
chr5 (150-345)||(27420902-27421097)
chr5 (146-340)||(27025005-27025199)
chr5 (150-339)||(38598419-38598608)
chr5 (158-338)||(19358577-19358757)
chr5 (159-338)||(20992124-20992303)
chr5 (160-345)||(5203016-5203200)
chr5 (146-340)||(31410525-31410719)
chr5 (38-131)||(27421127-27421220)
chr5 (39-131)||(19358795-19358887)
chr5 (52-131)||(4121205-4121284)
chr5 (254-345)||(20992354-20992445)
chr5 (150-239)||(35420393-35420482)
chr5 (39-131)||(3386333-3386425)
chr5 (39-131)||(9007902-9007994)
chr5 (44-131)||(1165493-1165580)
chr5 (52-131)||(8374200-8374279)
chr5 (39-131)||(1579305-1579396)
chr5 (39-131)||(1605419-1605510)
chr5 (39-131)||(3921850-3921942)
chr5 (39-131)||(16737294-16737386)
chr5 (248-345)||(33284642-33284739)
chr5 (39-128)||(38598295-38598384)
chr5 (39-131)||(27025185-27025277)
chr5 (39-131)||(35420271-35420362)
chr5 (253-339)||(31638195-31638281)
chr5 (45-110)||(31410720-31410785)
chr5 (254-323)||(41818536-41818605)
chr5 (188-219)||(27024822-27024853)
chr5 (85-131)||(31883420-31883466)
chr5 (39-91)||(20992046-20992096)
chr5 (255-339)||(19516044-19516128)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (39-345)||(36746-37053)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (39-345)||(6086456-6086763)
chr6 (39-345)||(2837588-2837894)
chr6 (39-345)||(30691894-30692201)
chr6 (39-345)||(3955627-3955930)
chr6 (39-338)||(26704198-26704496)
chr6 (39-295)||(53001-53257)
chr6 (39-345)||(3347377-3347687)
chr6 (153-345)||(26946848-26947040)
chr6 (146-345)||(21893498-21893697)
chr6 (158-342)||(9459609-9459793)
chr6 (153-345)||(18613581-18613773)
chr6 (146-340)||(34887257-34887451)
chr6 (158-331)||(11167297-11167470)
chr6 (153-345)||(1153636-1153828)
chr6 (146-341)||(28199474-28199667)
chr6 (146-339)||(16306973-16307166)
chr6 (153-318)||(33464399-33464564)
chr6 (146-338)||(30698894-30699086)
chr6 (150-345)||(20726834-20727025)
chr6 (159-345)||(17261051-17261237)
chr6 (146-345)||(35198327-35198526)
chr6 (225-339)||(52885-52999)
chr6 (39-131)||(20727055-20727147)
chr6 (39-131)||(1153864-1153956)
chr6 (39-131)||(16306895-16306987)
chr6 (39-131)||(18613806-18613898)
chr6 (39-131)||(33464596-33464687)
chr6 (40-131)||(21893683-21893774)
chr6 (52-131)||(28199409-28199488)
chr6 (42-131)||(11167510-11167599)
chr6 (39-131)||(26946723-26946814)
chr6 (39-110)||(35198527-35198598)
chr6 (40-131)||(30698818-30698908)
chr6 (72-131)||(9459832-9459891)
chr6 (71-110)||(34887217-34887256)
chr6 (310-345)||(33463744-33463779)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (39-345)||(18594580-18594886)
chr8 (55-339)||(36491206-36491490)
chr8 (146-345)||(144437-144636)
chr8 (150-345)||(14422746-14422941)
chr8 (146-345)||(39206629-39206828)
chr8 (150-345)||(33278443-33278638)
chr8 (153-345)||(24113138-24113330)
chr8 (158-349)||(29938100-29938291)
chr8 (153-339)||(2042496-2042682)
chr8 (150-345)||(13110447-13110642)
chr8 (153-345)||(7791454-7791646)
chr8 (39-338)||(34998744-34999053)
chr8 (158-345)||(10836732-10836919)
chr8 (146-345)||(34842330-34842529)
chr8 (146-345)||(41575556-41575755)
chr8 (146-339)||(39218826-39219019)
chr8 (153-345)||(7774807-7774998)
chr8 (153-345)||(7812038-7812230)
chr8 (150-345)||(6144242-6144437)
chr8 (158-345)||(34679434-34679621)
chr8 (158-345)||(35118008-35118195)
chr8 (146-345)||(5320607-5320806)
chr8 (158-345)||(22260607-22260794)
chr8 (149-340)||(38167124-38167314)
chr8 (150-345)||(4035890-4036085)
chr8 (146-336)||(28639334-28639522)
chr8 (158-345)||(44804921-44805108)
chr8 (146-345)||(42571637-42571833)
chr8 (150-345)||(8021762-8021949)
chr8 (146-345)||(33287002-33287189)
chr8 (150-309)||(9807339-9807496)
chr8 (182-332)||(66180-66331)
chr8 (232-345)||(40117903-40118016)
chr8 (249-339)||(26783801-26783891)
chr8 (39-131)||(41575741-41575833)
chr8 (39-131)||(29938608-29938698)
chr8 (39-131)||(8021979-8022070)
chr8 (39-131)||(24113013-24113105)
chr8 (39-131)||(34679306-34679398)
chr8 (39-131)||(35117878-35117970)
chr8 (39-131)||(42571819-42571911)
chr8 (40-131)||(22260477-22260568)
chr8 (237-339)||(2322068-2322170)
chr8 (39-131)||(144622-144714)
chr8 (39-131)||(4036117-4036209)
chr8 (39-131)||(6144121-6144212)
chr8 (39-131)||(9807526-9807617)
chr8 (39-131)||(13110672-13110763)
chr8 (39-131)||(38167043-38167135)
chr8 (41-131)||(44804793-44804883)
chr8 (39-131)||(10836599-10836691)
chr8 (39-131)||(33286924-33287016)
chr8 (39-110)||(883012-883083)
chr8 (39-110)||(39219020-39219091)
chr8 (41-131)||(33278668-33278758)
chr8 (46-131)||(2042379-2042464)
chr8 (40-131)||(28639508-28639598)
chr8 (39-110)||(34842258-34842329)
chr8 (44-131)||(39206814-39206899)
chr8 (44-127)||(7792149-7792232)
chr8 (44-127)||(7812751-7812834)
chr8 (39-110)||(5320807-5320878)
chr8 (260-345)||(5005209-5005294)
chr8 (237-341)||(39220303-39220407)
chr8 (39-77)||(14422973-14423011)
chr8 (301-345)||(9806916-9806960)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (39-345)||(33358938-33359244)
chr7 (39-345)||(12101025-12101332)
chr7 (39-345)||(33846377-33846678)
chr7 (39-339)||(42673513-42673808)
chr7 (39-339)||(15655960-15656260)
chr7 (39-339)||(12097434-12097738)
chr7 (39-339)||(9452638-9452949)
chr7 (40-345)||(25748529-25748842)
chr7 (150-345)||(24792291-24792486)
chr7 (150-345)||(43067932-43068127)
chr7 (158-345)||(933327-933514)
chr7 (39-345)||(48865672-48865983)
chr7 (146-339)||(5280908-5281100)
chr7 (146-340)||(6394798-6394992)
chr7 (146-339)||(20346536-20346729)
chr7 (146-345)||(1803068-1803267)
chr7 (158-345)||(22649661-22649848)
chr7 (158-345)||(42964963-42965150)
chr7 (146-345)||(4477276-4477475)
chr7 (150-345)||(7164226-7164421)
chr7 (153-331)||(42204211-42204389)
chr7 (165-345)||(30180998-30181178)
chr7 (159-345)||(8630708-8630894)
chr7 (158-331)||(38866600-38866773)
chr7 (52-331)||(46891190-46891479)
chr7 (146-345)||(36890784-36890984)
chr7 (158-345)||(32041584-32041771)
chr7 (183-345)||(3511365-3511527)
chr7 (146-340)||(43156760-43156953)
chr7 (158-345)||(4347315-4347501)
chr7 (146-332)||(46134259-46134445)
chr7 (153-338)||(17753649-17753834)
chr7 (161-345)||(16894477-16894661)
chr7 (146-345)||(43021535-43021730)
chr7 (39-207)||(37705082-37705249)
chr7 (39-131)||(46134181-46134273)
chr7 (38-131)||(17753868-17753961)
chr7 (39-131)||(38866812-38866904)
chr7 (242-345)||(19828312-19828415)
chr7 (41-131)||(22649531-22649621)
chr7 (41-131)||(42964832-42964922)
chr7 (54-131)||(5281086-5281163)
chr7 (39-131)||(933553-933645)
chr7 (39-131)||(36890706-36890798)
chr7 (41-131)||(42204422-42204512)
chr7 (45-131)||(43021464-43021549)
chr7 (38-131)||(16894345-16894438)
chr7 (39-131)||(3511582-3511674)
chr7 (39-131)||(43067810-43067902)
chr7 (39-131)||(43156939-43157030)
chr7 (39-131)||(7164451-7164542)
chr7 (39-131)||(24792165-24792257)
chr7 (39-110)||(6394993-6395064)
chr7 (44-131)||(1803253-1803338)
chr7 (39-110)||(4477204-4477275)
chr7 (39-110)||(20346730-20346801)
chr7 (237-345)||(37005857-37005965)
chr7 (244-331)||(36849590-36849677)
chr7 (292-339)||(37705028-37705075)
chr7 (185-338)||(43405069-43405223)
chr7 (253-320)||(20163886-20163953)
chr7 (293-345)||(27691428-27691480)
chr7 (237-339)||(15655458-15655560)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (39-345)||(25999426-25999732)
chr3 (39-345)||(37697987-37698293)
chr3 (39-345)||(42307749-42308055)
chr3 (41-345)||(21581080-21581383)
chr3 (38-339)||(2895229-2895534)
chr3 (39-340)||(12117504-12117803)
chr3 (39-339)||(22174834-22175134)
chr3 (39-339)||(20842192-20842492)
chr3 (39-339)||(50528973-50529273)
chr3 (39-339)||(15520680-15520980)
chr3 (39-345)||(29445526-29445832)
chr3 (39-339)||(20699193-20699493)
chr3 (54-345)||(44609197-44609483)
chr3 (39-342)||(32359300-32359607)
chr3 (158-345)||(8042645-8042832)
chr3 (39-345)||(15519980-15520292)
chr3 (150-345)||(46452117-46452312)
chr3 (150-345)||(54870129-54870324)
chr3 (150-345)||(38856131-38856326)
chr3 (146-340)||(25494236-25494430)
chr3 (153-345)||(38933983-38934175)
chr3 (149-342)||(35226488-35226680)
chr3 (150-345)||(48924958-48925151)
chr3 (186-345)||(32244158-32244317)
chr3 (146-345)||(34700379-34700578)
chr3 (146-345)||(42104922-42105121)
chr3 (151-340)||(24835655-24835844)
chr3 (158-345)||(44688799-44688985)
chr3 (146-345)||(54534279-54534476)
chr3 (146-315)||(53028285-53028454)
chr3 (153-339)||(16354390-16354576)
chr3 (148-340)||(26122857-26123049)
chr3 (70-267)||(24366145-24366341)
chr3 (165-341)||(12915948-12916124)
chr3 (232-345)||(35643255-35643368)
chr3 (149-262)||(13696914-13697027)
chr3 (249-345)||(50529827-50529923)
chr3 (39-131)||(8042871-8042963)
chr3 (40-131)||(35643436-35643527)
chr3 (39-131)||(32244379-32244471)
chr3 (39-131)||(38934210-38934302)
chr3 (39-131)||(44689024-44689116)
chr3 (39-131)||(25494158-25494250)
chr3 (39-131)||(34700564-34700656)
chr3 (39-131)||(42104844-42104936)
chr3 (39-131)||(48924836-48924928)
chr3 (39-131)||(50528715-50528807)
chr3 (39-131)||(13697016-13697108)
chr3 (39-131)||(16354611-16354703)
chr3 (39-131)||(38856356-38856447)
chr3 (39-131)||(35226669-35226761)
chr3 (39-131)||(46451994-46452086)
chr3 (39-131)||(53028440-53028532)
chr3 (39-127)||(54870009-54870097)
chr3 (158-229)||(50528845-50528916)
chr3 (39-110)||(54534207-54534278)
chr3 (255-338)||(49128094-49128177)
chr3 (153-199)||(35643365-35643411)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (39-345)||(29288190-29288494)
chr1 (39-345)||(29078557-29078863)
chr1 (39-345)||(52753005-52753311)
chr1 (39-345)||(39260205-39260510)
chr1 (39-345)||(970383-970690)
chr1 (38-345)||(46761007-46761314)
chr1 (55-339)||(8120916-8121199)
chr1 (79-339)||(17587403-17587663)
chr1 (39-339)||(52696838-52697137)
chr1 (39-338)||(41928353-41928652)
chr1 (39-345)||(16052137-16052445)
chr1 (147-345)||(25897415-25897613)
chr1 (158-345)||(20089512-20089699)
chr1 (158-345)||(2347697-2347885)
chr1 (39-339)||(38171879-38172166)
chr1 (150-345)||(33510525-33510720)
chr1 (158-345)||(38829110-38829297)
chr1 (153-345)||(1170416-1170608)
chr1 (153-345)||(17591729-17591921)
chr1 (150-338)||(19715130-19715318)
chr1 (146-345)||(23498501-23498700)
chr1 (146-345)||(26663299-26663498)
chr1 (158-345)||(42370772-42370959)
chr1 (150-340)||(26580239-26580429)
chr1 (150-345)||(1940716-1940911)
chr1 (146-345)||(7145249-7145447)
chr1 (146-345)||(40149504-40149703)
chr1 (146-338)||(43905702-43905894)
chr1 (146-338)||(6765507-6765699)
chr1 (146-345)||(15203153-15203352)
chr1 (150-339)||(8079678-8079867)
chr1 (146-339)||(15717832-15718024)
chr1 (146-339)||(46409482-46409677)
chr1 (150-345)||(13996692-13996887)
chr1 (146-349)||(49146209-49146412)
chr1 (146-340)||(2473768-2473962)
chr1 (153-345)||(5215426-5215618)
chr1 (158-345)||(12682861-12683048)
chr1 (158-345)||(32671620-32671806)
chr1 (158-345)||(40092532-40092719)
chr1 (181-345)||(1168544-1168708)
chr1 (150-345)||(15554121-15554308)
chr1 (174-345)||(51359210-51359380)
chr1 (161-331)||(29695731-29695896)
chr1 (54-194)||(23323036-23323176)
chr1 (39-131)||(19715008-19715100)
chr1 (39-131)||(26580117-26580209)
chr1 (43-131)||(49146398-49146486)
chr1 (39-131)||(1940592-1940684)
chr1 (39-131)||(6765685-6765777)
chr1 (39-131)||(33510750-33510841)
chr1 (39-131)||(40092763-40092855)
chr1 (40-131)||(15718010-15718101)
chr1 (44-131)||(43905880-43905967)
chr1 (39-131)||(17591954-17592047)
chr1 (39-131)||(1170292-1170384)
chr1 (39-131)||(2347924-2348016)
chr1 (39-131)||(8079556-8079648)
chr1 (39-131)||(13996571-13996663)
chr1 (39-131)||(14004685-14004777)
chr1 (39-131)||(15554000-15554092)
chr1 (39-131)||(51359075-51359166)
chr1 (39-110)||(46409678-46409749)
chr1 (39-131)||(26663484-26663576)
chr1 (41-131)||(5215652-5215743)
chr1 (39-131)||(40149689-40149781)
chr1 (238-345)||(23322897-23323004)
chr1 (39-110)||(2473963-2474033)
chr1 (257-340)||(52086313-52086396)
chr1 (68-131)||(7145433-7145496)
chr1 (39-110)||(15203353-15203424)
chr1 (39-131)||(1170719-1170812)
chr1 (76-131)||(23498686-23498741)
chr1 (39-120)||(22887995-22888076)
chr1 (93-131)||(52086494-52086532)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (39-345)||(31517073-31517379)
chr2 (42-340)||(28329700-28329996)
chr2 (38-339)||(2178627-2178927)
chr2 (150-342)||(42937763-42937956)
chr2 (146-349)||(6174793-6174996)
chr2 (159-345)||(33906025-33906211)
chr2 (158-339)||(18806861-18807042)
chr2 (146-345)||(39635493-39635692)
chr2 (153-339)||(19383907-19384093)
chr2 (158-339)||(3873221-3873402)
chr2 (153-345)||(5733440-5733632)
chr2 (158-345)||(26323163-26323350)
chr2 (153-345)||(4016080-4016272)
chr2 (153-345)||(30270651-30270843)
chr2 (146-339)||(16066259-16066452)
chr2 (158-345)||(4232119-4232306)
chr2 (153-339)||(851044-851230)
chr2 (146-345)||(19901103-19901301)
chr2 (146-339)||(429863-430056)
chr2 (158-345)||(16588753-16588940)
chr2 (201-345)||(1108320-1108464)
chr2 (146-340)||(44947514-44947701)
chr2 (161-341)||(1482883-1483063)
chr2 (161-345)||(30420159-30420331)
chr2 (39-131)||(19901025-19901117)
chr2 (52-131)||(1482768-1482847)
chr2 (39-129)||(42937990-42938080)
chr2 (39-131)||(26323031-26323123)
chr2 (39-131)||(33905894-33905986)
chr2 (39-131)||(1109533-1109625)
chr2 (39-131)||(3873088-3873180)
chr2 (39-131)||(18806727-18806819)
chr2 (39-122)||(19383826-19383909)
chr2 (39-131)||(430042-430134)
chr2 (39-131)||(5733665-5733757)
chr2 (39-131)||(16066181-16066273)
chr2 (39-131)||(39635678-39635770)
chr2 (52-131)||(4016304-4016384)
chr2 (244-339)||(22101210-22101305)
chr2 (40-131)||(44947438-44947528)
chr2 (237-339)||(42446625-42446727)
chr2 (237-339)||(3585337-3585439)
chr2 (41-107)||(6174723-6174789)
chr2 (39-91)||(851262-851314)
chr2 (93-131)||(30270581-30270619)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (146-345)||(145210-145409)
scaffold0018 (39-131)||(145132-145224)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (153-345)||(267-459)
[»] scaffold0172 (2 HSPs)
scaffold0172 (153-339)||(10285-10471)
scaffold0172 (39-131)||(10504-10596)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (179-345)||(4-170)
[»] scaffold0920 (2 HSPs)
scaffold0920 (158-339)||(3757-3938)
scaffold0920 (44-131)||(3976-4063)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (186-339)||(22956-23109)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (179-341)||(4-165)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (39-131)||(3-95)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 101)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 54189892 - 54189592
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54189892 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 54189793  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189792 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 54189693  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189692 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 54189593  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  54189592 g 54189592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31970028 - 31969722
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31970028 tcttagttacgtttgttattttagtaagataagtatattgcaattttgttactgatacaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 31969929  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969928 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 31969829  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31969828 agctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttat 31969729  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  31969728 gggagta 31969722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 39 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14988138 - 14987829
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  14988138 tctttgttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagtaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatatttctt-t 14988040  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14988039 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggta 14987940  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14987939 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttat 14987840  T
Q  339 ggaagtatata 349  Q
    || ||||||||    
T  14987839 gggagtatata 14987829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 54412975 - 54412669
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54412975 tctttgttacgtttgttactttagtaagataagtatatagtaatttcgttactgatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatattccttca 54412876  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           | ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54412875 aaaaatatcataattaaaatgtatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggta 54412776  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54412775 agctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttat 54412676  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  54412675 gggagta 54412669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Original strand, 45424380 - 45424680
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45424380 tcttagttaggtgtgttactttagtaagataagtatacaacaattttgttactcatgtaccgcaaaagataactaacattataattaaaatattccttca 45424479  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45424480 aaaaaagttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggta 45424579  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45424580 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttat 45424679  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  45424680 g 45424680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37465068 - 37464768
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  37465068 tcttagttaggtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgcaaaagatgactaacattataattaaaatattccttca 37464969  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  37464968 aaaaaagttacaattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggta 37464869  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464868 aactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 37464769  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  37464768 g 37464768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 53717312 - 53717616
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  53717312 tcttagttacgtgtattactttagtaagataagtatataacaattttgttacttatgcaccaccaaagataaaaaacattataattaaaatattccttca 53717411  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53717412 aaaaa--ttataattaaaatatatcttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggta 53717509  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53717510 agctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttat 53717609  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  53717610 gggagta 53717616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Original strand, 2481254 - 2481554
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  2481254 tcttagttaggtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgtaccgcaaaagataactaaaattataattaaaatattccttca 2481353  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2481354 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggta 2481453  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2481454 agctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttat 2481553  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  2481554 g 2481554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 39 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33704186 - 33703889
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33704186 tcttagttaggtgtgttactttaataagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgcaaaaaataactaacattataattaaaatattcctt-a 33704088  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  33704087 aaaaaagttataattaaaatatatgttt-gaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggata 33703989  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703988 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 33703889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 23268892 - 23269162
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23268892 tcttagttacgtgtgttacttttgtaagataagtatatagcaattttgttactaatacaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 23268991  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23268992 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggta 23269091  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23269092 agctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 27535942 - 27536256
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaata-----ttc 133  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||     
T  27535942 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcac-gccaaagataactaacattataattaaaatatatttttt 27536040  T
Q  134 cttcnnnnnnnnttataat----taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagc 229  Q
     |||          | |||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536041 tttctaaaaacaaaaaaataaaataaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagc 27536140  T
Q  230 cagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaa 329  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27536141 tggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaag 27536240  T
Q  330 aaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||| ||||    
T  27536241 aaggcttatgggagta 27536256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 6611313 - 6611512
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6611313 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaa 6611412  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6611413 aatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 6611512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20877287 - 20877088
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20877287 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatctaaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 20877188  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20877187 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 20877088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 44379140 - 44379339
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44379140 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaa 44379239  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44379240 aatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagta 44379339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 15240995 - 15241173
Alignment:
Q  160 tatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15240995 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 15241094  T
Q  260 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241095 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 15241173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1617324 - 1617131
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1617324 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 1617225  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1617224 aatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 1617131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 27488605 - 27488800
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27488605 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 27488704  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27488705 taagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 27488800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38055393 - 38055198
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38055393 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatt 38055294  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38055293 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 38055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 53875897 - 53875694
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  53875897 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaa 53875798  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53875797 aatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagta 53875698  T
Q  346 tata 349  Q
    ||||    
T  53875697 tata 53875694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 160 - 345
Target Start/End: Original strand, 19913597 - 19913782
Alignment:
Q  160 tatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913597 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 19913696  T
Q  260 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19913697 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 19913782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 339
Target Start/End: Original strand, 43289917 - 43290106
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43289917 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatt 43290016  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43290017 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatg 43290106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16701014 - 16700822
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16701014 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttag 16700915  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16700914 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagta 16700822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 1756721 - 1756916
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1756721 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 1756820  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1756821 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta 1756916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 8591049 - 8591244
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8591049 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaaccgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 8591148  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8591149 taggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagta 8591244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 40428673 - 40428872
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40428673 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaa 40428772  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40428773 aatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagta 40428872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Original strand, 23704162 - 23704355
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23704162 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 23704261  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23704262 aatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatg 23704355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 28032677 - 28032864
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28032677 tatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagactta 28032776  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28032777 ttaaaatatggcataagcagcttatgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 28032864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 30423518 - 30423716
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30423518 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaa 30423616  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423617 aatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 30423716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 244
Target Start/End: Original strand, 23261732 - 23261937
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23261732 tcttagttacgtgtgttacttttgtaagataagtatatagcaattttgttactaatacaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 23261831  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23261832 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggta 23261931  T
Q  239 agctga 244  Q
    ||||||    
T  23261932 agctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 339
Target Start/End: Original strand, 35490730 - 35490919
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35490730 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 35490829  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35490830 taggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatg 35490919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 37968710 - 37968909
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37968710 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaa 37968809  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  37968810 aatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagta 37968909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 158 - 339
Target Start/End: Original strand, 11639543 - 11639724
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11639543 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggctta 11639642  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11639643 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatg 11639724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50354042 - 50353842
Alignment:
Q  146 ttataattaaac-tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 244  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50354042 ttataattaaaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctga 50353943  T
Q  245 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagt 344  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50353942 aaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 50353843  T
Q  345 a 345  Q
    |    
T  50353842 a 50353842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 338
Target Start/End: Original strand, 8932025 - 8932323
Alignment:
Q  42 tagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaata--ttccttcnn 139  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||       
T  8932025 tagttacatgtgttattttagtaagataagtatataacaattttgttacttatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatatatgttttttt 8932124  T
Q  140 nnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaa 239  Q
            | |||  |  ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||    
T  8932125 ttctaaaaacaatatatatatatattttgaaaaagtggatgcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaa 8932224  T
Q  240 gctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8932225 gctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttat 8932323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 23776424 - 23776611
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23776424 tatatgttttgaaagagtggatcctgagagaatcgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggctta 23776523  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23776524 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 23776611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 6688592 - 6688773
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6688592 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 6688691  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| ||||||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6688692 ttaaaatatggcataagca------gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 6688773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 44784877 - 44785069
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44784877 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttag 44784976  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  44784977 gcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagta 44785069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 160 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15669409 - 15669230
Alignment:
Q  160 tatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15669409 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatggaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttatt 15669310  T
Q  260 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15669309 aaagtatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatg 15669230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 48910086 - 48909887
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48910086 ttataattaaaatatatgtattgaaaaagtggatctggagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 48909987  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48909986 aatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagta 48909887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 331
Target Start/End: Original strand, 19164933 - 19165109
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19164933 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagaaaaacgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-gagggtaagctgaaaatttag 19165031  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165032 gcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 19165109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 158 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 47632263 - 47632081
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  47632263 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagctta 47632164  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacc-tttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47632163 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatg 47632081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 53353299 - 53353100
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53353299 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatttagagagaatcgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 53353200  T
Q  250 taggct----tattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  53353199 taggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagta 53353100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30171819 - 30171624
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  30171819 ttataattaaaatatatgttttgaaaa-gtggatccagagagaatcgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaa 30171721  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaa 342  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30171720 aatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaa 30171624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 52139428 - 52139251
Alignment:
Q  159 atatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttat 258  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  52139428 atatgttttgaaaaagtgtatccagaga--atcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttat 52139331  T
Q  259 taaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52139330 taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 52139251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 40680003 - 40680190
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40680003 tatatattttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggctta 40680102  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40680103 tgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagta 40680190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 27583597 - 27583784
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583597 tatatattttgaaaaagtggatccagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggctta 27583696  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  27583697 tgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagta 27583784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 345
Target Start/End: Original strand, 50055098 - 50055253
Alignment:
Q  190 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacta 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50055098 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacca 50055197  T
Q  290 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50055198 tgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 50055253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 339
Target Start/End: Original strand, 38071286 - 38071466
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| ||    
T  38071286 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcag 38071379  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38071380 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatg 38071466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44376079 - 44375900
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||      |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  44376079 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtagatccag------tcgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaa 44375986  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  44375985 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaa 44375900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 159 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16704046 - 16703862
Alignment:
Q  159 atatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttat 258  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16704046 atatgttttgaaaaagtggatacagaga--atcgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttat 16703949  T
Q  259 taaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16703948 taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagta 16703862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 339
Target Start/End: Original strand, 55344784 - 55344971
Alignment:
Q  152 ttaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaattta 251  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||     
T  55344784 ttaaaatatatgtcttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaatttt 55344883  T
Q  252 ggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||||||  |||| || || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55344884 ggcttattaaaatatggtataaacaactcatgcaaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatg 55344971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360471
Alignment:
Q  215 agctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttattta 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  314 cccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 28360471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 158 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 53408248 - 53408138
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccag-agggtaagctgaaaatttaggctt 256  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  53408248 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggctt 53408149  T
Q  257 attaaaatatg 267  Q
    | |||||||||    
T  53408148 aataaaatatg 53408138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30171897 - 30171805
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30171897 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaaaataactaacattataattaaaatat 30171805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 237 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053484
Alignment:
Q  237 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  337 atggaagta 345  Q
    |||| ||||    
T  50053492 atgggagta 50053484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1617403 - 1617310
Alignment:
Q  38 ttcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617403 ttcttagttacgtgtgttaatttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcactgccaaagataactaacattataattaaaatat 1617310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 6688462 - 6688554
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688462 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 6688554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 284
Target Start/End: Original strand, 9595855 - 9595982
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||               
T  9595855 ttataattaaaatatatattttggaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag----------- 9595943  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 284  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595944 agtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 28032544 - 28032636
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28032544 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattgtaattaaaatat 28032636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Original strand, 19164822 - 19164901
Alignment:
Q  52 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19164822 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 19164901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 55344533 - 55344715
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat-----tcc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |      
T  55344533 cttagttacgtatgttactttagtaaaataagtatataacaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatatatgttttt 55344632  T
Q  135 ttcnnnnnnnnttataattaaac--tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 215  Q
    |||         || || ||||   ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344633 ttcttaaaaaaataaaaataaaaaatatatgtcttgaaaaactggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 55344715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 8590926 - 8591018
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8590926 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatccacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 8591018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28360715 - 28360623
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28360715 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataattaacattataattaaaatat 28360623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 35490608 - 35490700
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35490608 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataaccaacattataattaaaatat 35490700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38055518 - 38055426
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055518 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaatcaaagataactaacattataattaaaatat 38055426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 44784753 - 44784845
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44784753 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaatatataacaattttgttactcatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 44784845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47632394 - 47632302
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632394 tcttagttacgtgtgatactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 47632302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 53875971 - 53875883
Alignment:
Q  43 agttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53875971 agttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgtcaaagataactaacattataattaaaatat 53875883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 6611235 - 6611327
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611235 tctttgttacgtgtgttaatttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 6611327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16701139 - 16701047
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16701139 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatatagcaattttgttacttatgcaccgctaaagataactaacattataataaaaatat 16701047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 27488480 - 27488572
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488480 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgtcaaagataactaacattataattaaaatat 27488572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 38071164 - 38071256
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071164 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcacaatcaaagataactaacattataattaaaatat 38071256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 40428595 - 40428687
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428595 tcttagttacgcgttttaaattagtaagataagtatatagcaattttgttacttatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 40428687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 44379062 - 44379154
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44379062 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttattcatgcaccgccaaagataagtaacattataattaaaatat 44379154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50055381 - 50055301
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055381 aattaaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 52139556 - 52139464
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52139556 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcacaaccaaatataactaacattataattaaaatat 52139464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 53408379 - 53408287
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408379 tcttagttatgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 53408287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Original strand, 30423441 - 30423532
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423441 cttagttacgtgtgttattttagtaagataagtatatatcaattttgttactcatgcaccatcaaagataactaacattataattaaaatat 30423532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 15240860 - 15240952
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15240860 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatatatcaattttgttacttatgcaccgttaaagataactaacattataattaaaatat 15240952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15669541 - 15669449
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669541 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatatatcaattttgttacttatgcaccgttaaagataactaacattataattaaaatat 15669449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Original strand, 9595778 - 9595869
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9595778 cttagttacgtgttttaaattagtaagataagtatatagcaattttgttacttatgcaccgccgaagatagctaacattataattaaaatat 9595869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20877360 - 20877273
Alignment:
Q  44 gttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877360 gttacgtgtgttaatttagtaagataagtatatatcaattttgttactcatgcaccggtaaagataactaacattataattaaaatat 20877273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Original strand, 23704083 - 23704176
Alignment:
Q  38 ttcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704083 ttcttagttacgtgttttaaattagtaaaataagtatatatcaattttgttgcttatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 23704176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 1756600 - 1756691
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756600 tcttagttacatgtgttactttggtaagataagtatatatcaattttattactcatgca-cgccaaagataactaacattataattaaaatat 1756691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Original strand, 43289808 - 43289886
Alignment:
Q  52 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43289808 tgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttactcatg-accgccaaagataaccaacattataattaaaatat 43289886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 44376901 - 44376823
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacat 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44376901 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatgtagtaattttgttactcatgcaccgtcaaagataactaacat 44376823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 50055503 - 50055413
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaat 129  Q
    ||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50055503 tcttagttatgtgtcttactttggtaagataagtatataacaattttgttactcatgcactgccaaagataattaacattataattaaaat 50055413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 19913465 - 19913556
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19913465 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatatatcaattt-gttacttatgcaccgctaaagataactaacattataattacaatat 19913556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 48910164 - 48910072
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48910164 tcttagttacgtgtgttaatttagtaagataagtatatagcaattttgttactcattcgcttccaaaattaactaacattataattaaaatat 48910072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 320
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  238 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 320  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Original strand, 23776307 - 23776378
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23776307 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccaccaaagataa 23776378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Original strand, 37968638 - 37968709
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37968638 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataaaaattttgttacttatgcaccgtcaaagataa 37968709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 50354106 - 50354031
Alignment:
Q  53 gttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaa 128  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  50354106 gttaatttagtaagataggtatatagcaattttgttactcatacactgttaaagataactaacattataattaaaa 50354031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 53353417 - 53353329
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || | ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53353417 tcttagttatgtgtcttactttggtaagataa---tatagcaattttgttactcatgcac-gccaaagacaactaacattataattaaaatat 53353329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34615985 - 34615904
Alignment:
Q  159 atatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagct 242  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  34615985 atatgttttgaaaaagtggatcaagagaaaatcgaaggaggttacataaatt--taagctctttattaaggcagaggataagct 34615904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48748265 - 48748197
Alignment:
Q  179 tccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaa 247  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  48748265 tccagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 339
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548287
Alignment:
Q  237 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  337 atg 339  Q
    |||    
T  44548285 atg 44548287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 338
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265902
Alignment:
Q  301 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 23265902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 30171973 - 30171935
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatata 77  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30171973 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatata 30171935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493381
Alignment:
Q  237 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  337 at 338  Q
    ||    
T  17493382 at 17493381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344777
Alignment:
Q  242 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataa 55344777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Original strand, 27679027 - 27679327
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27679027 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 27679126  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679127 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 27679226  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679227 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 27679326  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  27679327 g 27679327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 24105529 - 24105835
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24105529 tctttgttacgtttgttactttagtaagataagtatatagtaatttcgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 24105628  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105629 aaaaatattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 24105728  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105729 agctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 24105828  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  24105829 gggagta 24105835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Original strand, 33491054 - 33491354
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33491054 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatataacaattttgttattgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 33491153  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491154 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 33491253  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491254 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 33491353  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  33491354 g 33491354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 45 - 345
Target Start/End: Original strand, 26602807 - 26603106
Alignment:
Q  45 ttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcnnnnnnn 144  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  26602807 ttacgtgtgttagtttagtaagataagtatatatcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattcctt-taaaaaa 26602905  T
Q  145 nttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 244  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26602906 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactga 26603005  T
Q  245 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagt 344  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26603006 aaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 26603105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Original strand, 35782503 - 35782802
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35782503 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatatatcagttttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattcctt-a 35782601  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagc-cagagggt 237  Q
           ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  35782602 aaaaaaattataattaaaatacatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgt-aagcacggagggt 35782700  T
Q  238 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 337  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782701 aggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 35782800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16069714 - 16069397
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat---tcct 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||    
T  16069714 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttaatcatgcacaaccaaagataattaacattataattaaaatatatgttct 16069615  T
Q  136 tcnnnnnnnnt--------tataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa 227  Q
    |         |        || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069614 ttttctaaaatcaaaaaaataaaattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa 16069515  T
Q  228 gccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttta 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16069514 gccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacaccttta 16069415  T
Q  328 aaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  16069414 aaaaggcttatgggagta 16069397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 52 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33991480 - 33991184
Alignment:
Q  52 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat-----tccttcnnnnnnnnt 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |  |||             
T  33991480 tgttactttattaagataagtatatagcaattttgttactcatgcatcgccaaagataactaacattataattaaaatatatgtttgtttctaaaaaca- 33991382  T
Q  147 tataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaa 246  Q
     | || |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33991381 -aaaaataaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaa 33991283  T
Q  247 atttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991282 atttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 33991184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 150 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31883383 - 31883194
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31883383 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatt 31883284  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31883283 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 31883194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 1165566 - 1165765
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1165566 ttataattaaaatatatgttttgaaaaactggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaa 1165665  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165666 aatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 1165765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1579275 - 1579080
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1579275 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 1579176  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1579175 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 1579080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 1605540 - 1605735
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1605540 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 1605639  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1605640 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 1605735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 16737416 - 16737611
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16737416 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 16737515  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16737516 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagta 16737611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 8374311 - 8374502
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8374311 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttag 8374409  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374410 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 8374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 9008034 - 9008221
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9008034 tatatgttttgaaaaagtagatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 9008133  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9008134 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 9008221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 158 - 339
Target Start/End: Original strand, 3386463 - 3386644
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3386463 tatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 3386562  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386563 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 3386644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4121173 - 4120981
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4121173 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 4121074  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4121073 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagta 4120981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3921820 - 3921625
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  3921820 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatt 3921721  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3921720 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 3921625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27421097 - 27420902
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27421097 aattaaaatatatgttttaaaaatgtggatccagggagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 27420998  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27420997 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 27420902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27025199 - 27025005
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27025199 ttataatcaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaa 27025100  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  27025099 aatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgg 27025005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 339
Target Start/End: Original strand, 38598419 - 38598608
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38598419 aattaaaatatatgttttgaaaaaacggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatt 38598518  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38598519 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatg 38598608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 158 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19358757 - 19358577
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  19358757 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggctta 19358658  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19358657 ctaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttat 19358577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 159 - 338
Target Start/End: Original strand, 20992124 - 20992303
Alignment:
Q  159 atatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttat 258  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20992124 atatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttat 20992223  T
Q  259 taaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20992224 taaaatatggcataatcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 20992303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 160 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5203200 - 5203016
Alignment:
Q  160 tatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 259  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5203200 tatgttttgaaaa-gtggatctagagagaatcgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 5203102  T
Q  260 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5203101 gaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 5203016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31410719 - 31410525
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31410719 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcaaaagagaatcgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaa 31410620  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31410619 aatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgg 31410525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27421220 - 27421127
Alignment:
Q  38 ttcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421220 ttcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 27421127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19358887 - 19358795
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358887 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatatatcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 19358795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4121284 - 4121205
Alignment:
Q  52 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121284 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 4121205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 254 - 345
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992445
Alignment:
Q  254 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 20992445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 239
Target Start/End: Original strand, 35420393 - 35420482
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaa 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35420393 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386425
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3386333 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaaaataactaacattataattaaaatat 3386425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 9007902 - 9007994
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9007902 tctttgttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 9007994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Original strand, 1165493 - 1165580
Alignment:
Q  44 gttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165493 gttacgtgtgttaatttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 1165580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Original strand, 8374200 - 8374279
Alignment:
Q  52 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374200 tgttaatttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 8374279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1579396 - 1579305
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579396 tcttatttatgtgtgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttactcatgca-cgccaaagataactaacattataattaaaatat 1579305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 1605419 - 1605510
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605419 tcttatttatgtgtgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttactcatgca-cgccaaagataactaacattataattaaaatat 1605510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3921942 - 3921850
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921942 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttattcatgtaccgtcaaagataactaacattataattaaaatat 3921850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 16737294 - 16737386
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737294 tcttagttatgtatgttactttgataagataagtatatagcaattttgttactcatgtaccgtcaaagataactaacattataattaaaatat 16737386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 345
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284739
Alignment:
Q  248 tttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 33284739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 128
Target Start/End: Original strand, 38598295 - 38598384
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaa 128  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  38598295 tcttagttacgtgtgttactttaataagataagtatatagcaattttgtgactcatgcacaatcaaagataactaacattataattaaaa 38598384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27025277 - 27025185
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27025277 tcttagttacgtgttttaaattagtaagataagaatatagcaattttgttacttatgcatcgtcaaagataactaacattataatcaaaatat 27025185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 35420271 - 35420362
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35420271 tcttagttatgtgtgttattttggtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgtcaaagataactaa-attataattaaaatat 35420362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638195
Alignment:
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||  |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatg 31638195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 31410785 - 31410720
Alignment:
Q  45 ttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  31410785 ttacgtgtggtactttagtaagataagtatataacaattttcttacttatgcaccgcaaaagataa 31410720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 323
Target Start/End: Original strand, 41818536 - 41818605
Alignment:
Q  254 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacc 323  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818536 cttattaaaatacaatataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27024853 - 27024822
Alignment:
Q  188 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024853 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 27024822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31883466 - 31883420
Alignment:
Q  85 tgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883466 tgttactcatgcacaatcaaagataactaacattataattaaaatat 31883420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 20992046 - 20992096
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttact 91  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20992046 tcttagttacgtgttatactttagtaagataag--tatagcaattttgttact 20992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 339
Target Start/End: Original strand, 19516044 - 19516128
Alignment:
Q  255 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |   |||| |||||||||||  |||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  19516044 ttattaaaatattacataagcagtttatgaaattgatataagctatttttattactttgtccaaacgccgttaaaaagacttatg 19516128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37053 - 36746
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37053 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 36954  T
Q  139 nnnnnnn-ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggt 237  Q
            ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36953 aaaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggt 36854  T
Q  238 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36853 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgctta 36754  T
Q  338 tggaagta 345  Q
    ||| ||||    
T  36753 tgggagta 36746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 6086456 - 6086763
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6086456 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 6086555  T
Q  139 nnnnnnn-ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggt 237  Q
            ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086556 aaaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggt 6086655  T
Q  238 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6086656 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgctta 6086755  T
Q  338 tggaagta 345  Q
    ||| ||||    
T  6086756 tgggagta 6086763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2837894 - 2837588
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2837894 tcttagttatgtttgttactttaataagataagtatatagcaattttgttattgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 2837795  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837794 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 2837695  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837694 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 2837595  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  2837594 gggagta 2837588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30692201 - 30691894
Alignment:
Q  39 tcttagttacg-tttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttc 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692201 tcttagttacgatttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaaaataactaacattataattaaaatattccttc 30692102  T
Q  138 nnnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggt 237  Q
            ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  30692101 aacaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggt 30692002  T
Q  238 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692001 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 30691902  T
Q  338 tggaagta 345  Q
    ||| ||||    
T  30691901 tgggagta 30691894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 3955627 - 3955930
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3955627 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgatgaagataactaacattataattaaaatattccttca 3955726  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955727 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 3955823  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955824 agctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 3955923  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  3955924 gggagta 3955930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 39 - 338
Target Start/End: Original strand, 26704198 - 26704496
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26704198 tcttagttacgtgtgttacttcaataagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattcctt-a 26704296  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704297 aaaaaaattataatttaaatatatgttttggaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 26704396  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704397 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 26704496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 39 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 53257 - 53001
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53257 tctttgttacgtttgttactttagtaagataagtatatagtaatttcgtttctgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 53158  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53157 aaaaatattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 53058  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53057 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 3347377 - 3347687
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat----tcc 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    |      
T  3347377 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatatagcaattttgttacttatgcaccgctaaagataactaacattataataaaaatatatgtttt 3347476  T
Q  135 ttcnnnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagag 234  Q
    ||           | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3347477 tttctaaaaacaaaaaaataaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag 3347576  T
Q  235 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3347577 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggc 3347676  T
Q  335 ttatggaagta 345  Q
    |||||||||||    
T  3347677 ttatggaagta 3347687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 26946848 - 26947040
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26946848 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 26946947  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26946948 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 26947040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21893697 - 21893498
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21893697 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 21893598  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21893597 aaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 21893498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9459793 - 9459609
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9459793 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 9459694  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaa 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9459693 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaa 9459609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18613773 - 18613581
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18613773 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttag 18613674  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18613673 gcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 18613581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Original strand, 34887257 - 34887451
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34887257 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 34887356  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887357 aatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 34887451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11167470 - 11167297
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11167470 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggctta 11167371  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167370 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 11167297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1153828 - 1153636
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1153828 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaaacgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 1153729  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153728 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 1153636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Original strand, 28199474 - 28199667
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28199474 ttataattaaaatatatgttttgaaaa-gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 28199572  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga 341  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199573 aatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga 28199667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Original strand, 16306973 - 16307166
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16306973 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaataatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 16307072  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16307073 aatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatg 16307166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 153 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33464564 - 33464399
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33464564 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 33464465  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33464464 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 30698894 - 30699086
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  30698894 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaa 30698993  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30698994 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 30699086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20727025 - 20726834
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20727025 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggacccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatt 20726926  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20726925 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 20726834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 159 - 345
Target Start/End: Original strand, 17261051 - 17261237
Alignment:
Q  159 atatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttat 258  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17261051 atatgttttaaaaaaggggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttat 17261150  T
Q  259 taaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17261151 taaaatatagcataagcagcttatgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagta 17261237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35198526 - 35198327
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctcca-gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 244  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  35198526 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaagagagaatcgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactga 35198427  T
Q  245 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagt 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35198426 aaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagt 35198328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 225 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52885
Alignment:
Q  225 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  325 ttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||| |||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatg 52885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20727147 - 20727055
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20727147 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 20727055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1153956 - 1153864
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153956 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccaccaaagataactaacattataattaaaatat 1153864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 16306895 - 16306987
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16306895 tcttagttaggtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgtaccgcaaaagataactaacattataattaaaatat 16306987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18613898 - 18613806
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613898 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatatagcaattttgttacttatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 18613806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33464687 - 33464596
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464687 tcttagttacgtgtgttactt-agtaagataagtatatatcaattttgttactcatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 33464596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21893774 - 21893683
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893774 cttagttacgtgtgttaatttagtaagataaatatataacaattttgttactcatgcactgccaaagataactaacattataattaaaatat 21893683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Original strand, 28199409 - 28199488
Alignment:
Q  52 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199409 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttacacatgcaccaccaaagataactaacattataattaaaatat 28199488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11167599 - 11167510
Alignment:
Q  42 tagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167599 tagttacgtgtgttactttagtaagataaatatatagccattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 11167510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 26946723 - 26946814
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946723 tcttatttatgtgtgttactttggtaagataagtatataacaattttgttactcatgca-cgccaaagataactaacattataattaaaatat 26946814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 35198598 - 35198527
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35198598 tcttagttatgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttacttatgcaccgccaaagataa 35198527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Original strand, 30698818 - 30698908
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30698818 cttagttacgtgtgttaatttagtaagatagatatataacaattttgttact-acttactgccaaagataactaacattataattaaaatat 30698908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9459891 - 9459832
Alignment:
Q  72 tatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9459891 tatatagcaattttgttacttatgcacaaccaaagataactaacattgtaattaaaatat 9459832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 110
Target Start/End: Original strand, 34887217 - 34887256
Alignment:
Q  71 gtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34887217 gtatatagcaattttgttacttatgcaccgccaaagataa 34887256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 310 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463744
Alignment:
Q  310 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 33463744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18594886 - 18594580
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18594886 tctttgttacgtttgttactttagtaagataagtatatagtaatttcgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 18594787  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594786 aaaaatattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 18594687  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594686 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 18594587  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  18594586 gggagta 18594580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 55 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 36491490 - 36491206
Alignment:
Q  55 tactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcnnnnnnnnttataatta 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||    
T  36491490 tactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgtaccgcaaaagataactaacattataattaaaatattccttcaaaaaaagttataatta 36491391  T
Q  155 aactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggc 254  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36491390 aaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggc 36491291  T
Q  255 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36491290 ttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatg 36491206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 144636 - 144437
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  144636 ttataactaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 144537  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  144536 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 144437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14422941 - 14422746
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14422941 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 14422842  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14422841 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 14422746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39206828 - 39206629
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206828 ttataattaaaatatatgttttgaaaaggtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 39206729  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39206728 aatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 39206629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33278638 - 33278443
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33278638 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 33278539  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33278538 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagta 33278443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 24113138 - 24113330
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24113138 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 24113237  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24113238 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagta 24113330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 158 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29938291 - 29938100
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29938291 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggctta 29938192  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatata 349  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29938191 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatata 29938100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 339
Target Start/End: Original strand, 2042496 - 2042682
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2042496 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccggagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 2042595  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042596 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 2042682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13110642 - 13110447
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13110642 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 13110543  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13110542 taggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagta 13110447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7791646 - 7791454
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  7791646 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaa 7791547  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7791546 gcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 7791454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 338
Target Start/End: Original strand, 34998744 - 34999053
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacatt-ataattaaaata----ttc 133  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||    ||     
T  34998744 tcttagttatgtgtgtcactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgtactgtcaaagataactaacatttataattaaaatatatgttt 34998843  T
Q  134 cttcnnnnnnnn-----ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaag 228  Q
     |||             | | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34998844 gttctaaaaacaaaaaataaaaaataaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaag 34998943  T
Q  229 ccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaa 328  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34998944 ccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaa 34999043  T
Q  329 aaaggcttat 338  Q
    ||||||||||    
T  34999044 aaaggcttat 34999053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 10836732 - 10836919
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10836732 tatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 10836831  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10836832 ttaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 10836919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 34842330 - 34842529
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |    
T  34842330 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctgga 34842429  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34842430 aatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 34842529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41575755 - 41575556
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41575755 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaa 41575656  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41575655 aatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 41575556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39219019 - 39218826
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39219019 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 39218920  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39218919 aatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 39218826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7774998 - 7774807
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  7774998 taaaatatatgttttgaaaaagtggatc-agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaa 7774900  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7774899 gcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 7774807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7812230 - 7812038
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  7812230 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaa 7812131  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7812130 gcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagta 7812038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 6144242 - 6144437
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6144242 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatt 6144341  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  6144342 tatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagta 6144437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 34679434 - 34679621
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34679434 tatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 34679533  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34679534 ttaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 34679621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 35118008 - 35118195
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35118008 tatatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggctta 35118107  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35118108 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagta 35118195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5320806 - 5320607
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5320806 ttataattaaaatatatattttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaa 5320707  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5320706 aatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagta 5320607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 22260607 - 22260794
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22260607 tatatgttttgaaaaattggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 22260706  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  22260707 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagta 22260794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 149 - 340
Target Start/End: Original strand, 38167124 - 38167314
Alignment:
Q  149 taattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaat 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  38167124 taattaaaatatatgttttgaaaaa-tggttccagcgagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaat 38167222  T
Q  249 ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38167223 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgg 38167314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4036085 - 4035890
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4036085 aattaaaatatatgttttgaaaaattggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatt 4035986  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  4035985 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagta 4035890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28639522 - 28639334
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  28639522 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaa 28639425  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28639424 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagctt 28639334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 44804921 - 44805108
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44804921 tatatgttttgaaaaagtgaatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggctta 44805020  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44805021 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagta 44805108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42571833 - 42571637
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||    
T  42571833 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaa 42571734  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42571733 aatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagta 42571637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8021949 - 8021762
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||        ||||||||    
T  8021949 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatt 8021858  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8021857 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagta 8021762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 33287002 - 33287189
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||    
T  33287002 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagct------------agagggtaagctgaa 33287089  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33287090 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagta 33287189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 150 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9807496 - 9807339
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9807496 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagaaa--cgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatt 9807399  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9807398 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 332
Target Start/End: Original strand, 66180 - 66331
Alignment:
Q  182 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 280  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  66180 agagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagctt 66279  T
Q  281 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaag 332  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  66280 atgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaag 66331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 232 - 345
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118016
Alignment:
Q  232 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  332 ggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||| ||||    
T  40118003 ggcttatgggagta 40118016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 249 - 339
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783891
Alignment:
Q  249 ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 26783891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41575833 - 41575741
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41575833 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagtaattttgttactcatgcaccgtcaaagataactaacattataattaaaatat 41575741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 29938698 - 29938608
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938698 tcttagttacgt--gttactttagtaagataagtatatatcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 29938608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8022070 - 8021979
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8022070 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttactcatgca-cgccaaagataactaacattataattaaaatat 8021979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 24113013 - 24113105
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24113013 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatatagcaattttgttacttatgcaccgctaaagataactaacattataataaaaatat 24113105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 34679306 - 34679398
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34679306 tcttagttatgtgggttactttggtaagataactatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 34679398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 35117878 - 35117970
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35117878 tcttaattacgtgtgttactttagtaagataagtatatatcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 35117970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42571911 - 42571819
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571911 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatataataattttgttacccatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 42571819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Original strand, 22260477 - 22260568
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22260477 cttagttacgtgtgttacttcagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacatgataattaaaatat 22260568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 339
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322170
Alignment:
Q  237 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  337 atg 339  Q
    |||    
T  2322168 atg 2322170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 144714 - 144622
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  144714 tcttagttgcgtgtgttaatttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcactggcaaagataactaacattataactaaaatat 144622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4036209 - 4036117
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036209 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataaatatatagcaattttattattcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 4036117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 6144121 - 6144212
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144121 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttgctcatgca-cgccaaagataactaacattataattaaaatat 6144212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9807617 - 9807526
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807617 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatataacaattttgttactcatgca-cgccaaagataactaacattataattaaaatat 9807526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13110763 - 13110672
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110763 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatataacaattttgttactcatgca-cgccaaagataactaacattataattaaaatat 13110672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 38167043 - 38167135
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38167043 tcttagttacgtgtgttaatttagtaagataagtatatagcaactttgttactcatgcactgccaaagataactaacgttctaattaaaatat 38167135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 131
Target Start/End: Original strand, 44804793 - 44804883
Alignment:
Q  41 ttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44804793 ttagttacgtgtgttactttaataagataagtatataacaattttgtcactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 44804883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 10836599 - 10836691
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836599 tcttagttacgtgggttactttaataagataaatatataacaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 10836691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 33286924 - 33287016
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33286924 tcttaattacatgtgttaatttagtaagataagtatatagaaattttgttacccatgcactgccaaagataactaacattataattaaaatat 33287016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 883083 - 883012
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  883083 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttacttatgcaccgccaaagataa 883012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 39219091 - 39219020
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39219091 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttacttatgcaccgtcaaagataa 39219020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33278758 - 33278668
Alignment:
Q  41 ttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278758 ttagttatgtgtgttactttggtaagataaatatataacaattttgttactcatgtaccgtcaaagataactaacattataattaaaatat 33278668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 131
Target Start/End: Original strand, 2042379 - 2042464
Alignment:
Q  46 tacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2042379 tacgtgtgttactttagtaagataaacatatatcaattttgttacttatgcaccgctaaagataaataacattataattaaaatat 2042464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28639598 - 28639508
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639598 cttagttacgtgtgttaatttagtaagataaatatataacaattttgttattcatgcactgcc-aagataactaacattataattaaaatat 28639508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Original strand, 34842258 - 34842329
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34842258 tcttagttccgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttacttttgcaccgccaaagataa 34842329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 39206899 - 39206814
Alignment:
Q  44 gttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39206899 gttacgtgtgttaatttagtaagataagtatatagtaattttgttac--atgcaccgctaaagatagcgaacattataattaaaatat 39206814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 7792232 - 7792149
Alignment:
Q  44 gttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaa 127  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7792232 gttacgtgttttgctttagtaagataagtgtataacaattttattactcatgcaccgtcaaagataactaacattataattaaa 7792149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 7812834 - 7812751
Alignment:
Q  44 gttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaa 127  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7812834 gttacgtgtgttgctttagtaagataagtgtataacaattttattactcatgcaccgtcaaagataactaaaattataattaaa 7812751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 5320878 - 5320807
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5320878 tcttagttacgtgtgttactttagcaagataagtatataataattttgttatttatgcaccgccaaagataa 5320807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005209
Alignment:
Q  260 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagta 5005209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220303
Alignment:
Q  237 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  337 atgga 341  Q
    |||||    
T  39220307 atgga 39220303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14423011 - 14422973
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatata 77  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14423011 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatata 14422973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806916
Alignment:
Q  301 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagta 9806916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 33358938 - 33359244
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33358938 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatacaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 33359037  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33359038 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggta 33359137  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33359138 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttat 33359237  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    |||||||    
T  33359238 ggaagta 33359244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 12101025 - 12101332
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattcctt-c 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12101025 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattcctttc 12101124  T
Q  138 nnnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggt 237  Q
            ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12101125 aaaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggt 12101224  T
Q  238 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101225 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 12101324  T
Q  338 tggaagta 345  Q
    ||| ||||    
T  12101325 tgggagta 12101332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 33846377 - 33846678
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33846377 tctttgttacgtttgttactttagtaagataagtatatagtaatttcgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 33846476  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  33846477 aaaaatattataattaaaatatatgtcttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----ta 33846571  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846572 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 33846671  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  33846672 gggagta 33846678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 42673808 - 42673513
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  42673808 tcttagttaggtatattactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgcaaaagataactaacattataattaaaatattcctt-a 42673710  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42673709 aaaaaagttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggta 42673610  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673609 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 42673514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15656260 - 15655960
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15656260 tcttagttgggtgtgttacattagtaagatacgtatatagcaattttgttactcatgtactgcaaaagataactaaaattataattaaaatattccttca 15656161  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  15656160 aaaaaatttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggta 15656061  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15656060 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttat 15655961  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  15655960 g 15655960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Original strand, 12097434 - 12097738
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat----tcc 134  Q
    ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    |      
T  12097434 tcttagttatgtgtgttattttggtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccatcaaagataactaacattataattaaaatatatgtttg 12097533  T
Q  135 ttcnnnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagag 234  Q
    ||           | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12097534 tttctaaaaacaaaaaattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag 12097633  T
Q  235 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097634 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggc 12097733  T
Q  335 ttatg 339  Q
    |||||    
T  12097734 ttatg 12097738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9452949 - 9452638
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaata-------t 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  9452949 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccagcaaagataactaacattataattaaaatatatgtttt 9452850  T
Q  132 tccttcnnnnnnnnttataat----taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa 227  Q
    || |||          | |||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452849 tctttccaaaaacaaaaaaataaaataaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa 9452750  T
Q  228 gccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttta 327  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9452749 gccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacaccttta 9452650  T
Q  328 aaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||    
T  9452649 aaaaggcttatg 9452638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 40 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25748842 - 25748529
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaata--------t 131  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  25748842 cttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatataacaattttgatacttatacaccgtcaaagataactaacattataattaaaatatatgtttgt 25748743  T
Q  132 tccttcnnnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcca 231  Q
    | ||            | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25748742 ttctaaaaaaaaaaaaaaaattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg 25748643  T
Q  232 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748642 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 25748543  T
Q  332 ggcttatggaagta 345  Q
    | ||||||| ||||    
T  25748542 gacttatgggagta 25748529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 24792291 - 24792486
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24792291 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 24792390  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24792391 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 24792486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 43067932 - 43068127
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43067932 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 43068031  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43068032 taggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 43068127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 933514 - 933327
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  933514 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagattcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggctta 933415  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933414 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 933327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 48865983 - 48865672
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||      
T  48865983 tcttagttatgtgtgttactttggtaaaataagtatataacaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatatatgtttg 48865884  T
Q  139 nnnnnnnttataa----ttaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagag 234  Q
             | ||    ||||| ||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  48865883 tttctaaaaaaaaaaatttaaaatatatgttttggaaaaatggatc--gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgat 48865786  T
Q  235 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttta---aaaa 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  48865785 gttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaa 48865686  T
Q  332 ggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||    
T  48865685 ggcttatggaagta 48865672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5281100 - 5280908
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5281100 ttataattaaaatatatgttttgaaaa-gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 5281002  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5281001 aatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 5280908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6394992 - 6394798
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6394992 ttataattaaaatatatgtttggaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaa 6394893  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6394892 aatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgg 6394798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20346729 - 20346536
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20346729 ttataattaaaataaatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 20346630  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346629 aatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 20346536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1803267 - 1803068
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1803267 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaa 1803168  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1803167 aatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagta 1803068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 22649661 - 22649848
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22649661 tatatgttttgaaaaagtggatccagagaaaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggctta 22649760  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22649761 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 22649848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 42964963 - 42965150
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42964963 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggctta 42965062  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42965063 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 42965150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 4477276 - 4477475
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4477276 ttataattaaaatatatgtttggaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaa 4477375  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  4477376 aatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagta 4477475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7164421 - 7164226
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7164421 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagatagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 7164322  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  7164321 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagta 7164226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 153 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42204389 - 42204211
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42204389 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 42204290  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42204289 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaa 42204211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 345
Target Start/End: Original strand, 30180998 - 30181178
Alignment:
Q  165 tttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaat 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30180998 tttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaat 30181097  T
Q  265 atgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30181098 atggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 30181178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 159 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8630894 - 8630708
Alignment:
Q  159 atatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttat 258  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8630894 atatgttttgaaaaagttgatccagagagaatcgaaggggattacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttat 8630795  T
Q  259 taaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8630794 taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagta 8630708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38866773 - 38866600
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38866773 tatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgctta 38866674  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38866673 ttaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 38866600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 331
Target Start/End: Original strand, 46891190 - 46891479
Alignment:
Q  52 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat------tccttcnnnnnnnn 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |  |||            
T  46891190 tgttactttagtaaaataagtatataacaattttatcactcatccaccgccaaagataactaacattataattaaaatatatgttttttttctaaaacaa 46891289  T
Q  146 ttataat----taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagc 241  Q
     || |||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  46891290 ataaaataaaataaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagacaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagc 46891389  T
Q  242 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46891390 tgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 46891479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 36890784 - 36890984
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaa-gtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 244  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36890784 ttataattaaaatatatgttttgaaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctga 36890883  T
Q  245 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagt 344  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36890884 aaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagt 36890983  T
Q  345 a 345  Q
    |    
T  36890984 a 36890984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32041771 - 32041584
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32041771 tatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaataaggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggctta 32041672  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32041671 tgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagta 32041584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3511527 - 3511365
Alignment:
Q  183 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3511527 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 3511428  T
Q  283 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511427 gaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 3511365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43156953 - 43156760
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  43156953 ttataattaaaatatatgttttgaaaa-gtggatccggagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaa 43156855  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156854 aatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 43156760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4347501 - 4347315
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  4347501 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatagaagg-ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttg 4347403  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  4347402 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagta 4347315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 332
Target Start/End: Original strand, 46134259 - 46134445
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  46134259 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtgcatccagagagaatcgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaa 46134358  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaag 332  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46134359 aatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaag 46134445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17753834 - 17753649
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||    
T  17753834 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttag 17753735  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17753734 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttat 17753649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 345
Target Start/End: Original strand, 16894477 - 16894661
Alignment:
Q  161 atgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894477 atgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttatta 16894576  T
Q  261 aaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  16894577 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagta 16894661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 43021535 - 43021730
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  43021535 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaa 43021634  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||    |   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  43021635 aatttag----accgaaatatgccataagcagcttatgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagta 43021730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37705249 - 37705082
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  37705249 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccat-a 37705151  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataa 207  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||    
T  37705150 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcaagaaataatcgaagaaggttacataa 37705082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 46134181 - 46134273
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134181 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 46134273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17753961 - 17753868
Alignment:
Q  38 ttcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753961 ttcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatatagcacttttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 17753868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38866904 - 38866812
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38866904 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 38866812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828312
Alignment:
Q  242 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  342 agta 345  Q
    ||||    
T  19828315 agta 19828312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 131
Target Start/End: Original strand, 22649531 - 22649621
Alignment:
Q  41 ttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649531 ttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 22649621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 131
Target Start/End: Original strand, 42964832 - 42964922
Alignment:
Q  41 ttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964832 ttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 42964922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5281163 - 5281086
Alignment:
Q  54 ttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5281163 ttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 5281086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 933645 - 933553
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933645 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 933553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 36890706 - 36890798
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890706 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcctgcaccgtcaaagataactaacattataattaaaatat 36890798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42204512 - 42204422
Alignment:
Q  41 ttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42204512 ttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatatcaattttgttactcatgcaccaccaaagataattaacattataattaaaatat 42204422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 131
Target Start/End: Original strand, 43021464 - 43021549
Alignment:
Q  45 ttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021464 ttacgtgtgttactttagtaagataagtatata-caattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 43021549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Original strand, 16894345 - 16894438
Alignment:
Q  38 ttcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894345 ttcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatatatcaattttgttactcatgcaccactaaagataactaacattataattaaaatat 16894438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3511674 - 3511582
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511674 tcttagttacgtatgttactttagtaagataagtatatagcaattttgctactcatgtacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 3511582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 43067810 - 43067902
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43067810 tcttagttatgtgtgtttctttggtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 43067902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43157030 - 43156939
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43157030 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatataggaattttgttact-atgcaccgccaaagataactaatattataattaaaatat 43156939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7164542 - 7164451
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7164542 tcttagttacgtgtgttactttggtaagataagtatatatcaattttgttactcatgca-cgccaaaaataactaacattataattaaaatat 7164451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 24792165 - 24792257
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792165 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataaatatataacaattttgttactcatgcaccgtcaaagataactaacattataattaaaatat 24792257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 6395064 - 6394993
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6395064 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttacttatgcaccgccaaagataa 6394993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1803338 - 1803253
Alignment:
Q  44 gttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803338 gttacgtgtgttaatttagtaagataagtatataacaattttgttat--atgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 1803253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Original strand, 4477204 - 4477275
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4477204 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttacttatgcaccgccaaagataa 4477275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20346801 - 20346730
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20346801 tcttagttacgtgtgttaatttagtaagataagtatatagcaattttgttacttatgcatcgccaaagataa 20346730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 345
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37005965
Alignment:
Q  237 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  337 atggaagta 345  Q
    || ||||||    
T  37005957 atagaagta 37005965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 331
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849677
Alignment:
Q  244 aaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaa 36849677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37705028
Alignment:
Q  292 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 37705028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43405223 - 43405069
Alignment:
Q  185 gagaatcgaaggaggttacataaattc-ataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 283  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||| || ||||||    | |||||| |||| || |||||||||||||||   | || || ||||||    
T  43405223 gagaatcgaaggaggtcccttgaattccataagctccgtgataagccttgtgttaagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatg 43405124  T
Q  284 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43405123 aaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttat 43405069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 320  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 345
Target Start/End: Original strand, 27691428 - 27691480
Alignment:
Q  293 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  27691428 taaaatatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagta 27691480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 339
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655560
Alignment:
Q  237 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||  |||||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  337 atg 339  Q
    |||    
T  15655558 atg 15655560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25999732 - 25999426
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25999732 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatacaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 25999633  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999632 aaaaaaattataattaaaacatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 25999533  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999532 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 25999433  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    |||||||    
T  25999432 ggaagta 25999426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 37697987 - 37698293
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37697987 tctttgttacgtttgttactttagtaagataagtatatagtaatttcgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 37698086  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698087 aaaaatattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 37698186  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698187 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 37698286  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  37698287 gggagta 37698293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 42307749 - 42308055
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42307749 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattctttca 42307848  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307849 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 42307948  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42307949 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttat 42308048  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  42308049 gggagta 42308055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 41 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21581383 - 21581080
Alignment:
Q  41 ttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcnnn 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||        
T  21581383 ttagttacgtttgttactttagtaagataagcatataacaattttgttactgatgcaccgccaaaaataactaatattataattaaaatattcctt-aaa 21581285  T
Q  141 nnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaag 240  Q
         ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21581284 aaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaag 21581185  T
Q  241 ctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581184 ctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 21581085  T
Q  341 aagta 345  Q
     ||||    
T  21581084 gagta 21581080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 38 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2895534 - 2895229
Alignment:
Q  38 ttcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttc 137  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895534 ttcttagttaggtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgcaaaagataactaacattataattaaaatattccttc 2895435  T
Q  138 nnnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcata----agctccttgttaagccaga 233  Q
            ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  2895434 aaaaaaagttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccaga 2895335  T
Q  234 gggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895334 gggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaagg 2895235  T
Q  334 cttatg 339  Q
    ||||||    
T  2895234 cttatg 2895229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 39 - 340
Target Start/End: Original strand, 12117504 - 12117803
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  12117504 tcttagttacgtgtgttacttcaataagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattctt--a 12117601  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
            |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12117602 aaaaaaaatataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggta 12117701  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12117702 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttat 12117801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Original strand, 22174834 - 22175134
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22174834 tcttagttaggtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgtaccgcaaaagataactaaaattataattaaaatattccttca 22174933  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22174934 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagttgatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggta 22175033  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22175034 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttat 22175133  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  22175134 g 22175134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Original strand, 20842192 - 20842492
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20842192 tcttagttaggtgtgttactttagtaagataagtatataaccattttgttagtcatgcaccgcaaaagataactaacattataattaaaatattccttta 20842291  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20842292 aaaaaagttataattaaaatatatgttttgaaaaagttgatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggta 20842391  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842392 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 20842491  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  20842492 g 20842492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 50529273 - 50528973
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  50529273 tcttagttaggtgtcttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgtaccgcaaaagataactaaaattataattaaaatattccttca 50529174  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  50529173 aaaaaagttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggta 50529074  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50529073 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttat 50528974  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  50528973 g 50528973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15520980 - 15520680
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15520980 tcttagttaggtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgtaccgcaaaagataactaaaattataattaaaatattccttca 15520881  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15520880 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcgagagagaatcgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggta 15520781  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15520780 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttat 15520681  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  15520680 g 15520680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29445832 - 29445526
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  29445832 tcttagttacgtgtattactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccaccaaagataaaaaacattataattaaaatattccttca 29445733  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29445732 aaaaaaattataattaaaatatatcttttgaaaaagtggatccagatagaatggaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggta 29445633  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29445632 agctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttat 29445533  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  29445532 gggagta 29445526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20699493 - 20699193
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20699493 tcttagttaggtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgtaccgcaaaagataactaaaattataattaaaatattccttca 20699394  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  20699393 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcgagagagaatcgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggta 20699294  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20699293 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttat 20699194  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  20699193 g 20699193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 345
Target Start/End: Original strand, 44609197 - 44609483
Alignment:
Q  54 ttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcnnnnnnnnttataatt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  44609197 ttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactactgca-----aaagataactaaaattataattaaaatattccttcaaaaaaagttataatt 44609291  T
Q  154 aaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagg 253  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44609292 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttagg 44609391  T
Q  254 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  44609392 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagta 44609483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32359607 - 32359300
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat--tcctt 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  32359607 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataattatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatatatttttt 32359508  T
Q  137 cnnnnnnnnttataattaaac--tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagag 234  Q
               | |||||||   |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  32359507 tttctaaaaaaaaaattaaaaaatatatgcttggaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggag 32359408  T
Q  235 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  32359407 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagc 32359308  T
Q  335 ttatggaa 342  Q
    ||||||||    
T  32359307 ttatggaa 32359300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8042832 - 8042645
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8042832 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 8042733  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042732 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 8042645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 15519980 - 15520292
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||      
T  15519980 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacataataattaaattttttttttc 15520079  T
Q  139 nnnnnnnt------tataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccag 232  Q
                  || |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15520080 taaaaacaaaaaaataaaatttaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgg 15520179  T
Q  233 agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520180 agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaag 15520279  T
Q  333 gcttatggaagta 345  Q
    |||||||| ||||    
T  15520280 gcttatgggagta 15520292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 46452117 - 46452312
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46452117 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatt 46452216  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46452217 taggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 46452312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 54870129 - 54870324
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  54870129 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatt 54870228  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870229 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 54870324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38856326 - 38856131
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38856326 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 38856227  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38856226 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta 38856131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Original strand, 25494236 - 25494430
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25494236 ttataattaaaatatatgttttgaaaaactggattcagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaa 25494335  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25494336 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgg 25494430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38934175 - 38933983
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  38934175 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttag 38934076  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38934075 acttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagta 38933983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 149 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35226680 - 35226488
Alignment:
Q  149 taattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaat 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  35226680 taattaaaatatatgttttgaaaaa-tggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaat 35226582  T
Q  249 ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaa 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226581 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaa 35226488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 48924958 - 48925151
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  48924958 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatt 48925057  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  48925058 tagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagta 48925151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 186 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32244317 - 32244158
Alignment:
Q  186 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32244317 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 32244218  T
Q  286 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244217 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 32244158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34700578 - 34700379
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||    
T  34700578 ttataattaaaatatatgttttgaaaaaatggatccagagataatcaaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaa 34700479  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34700478 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 34700379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 42104922 - 42105121
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42104922 ttataattaaaatatatgttttgaaaaactgaattcagagggaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaa 42105021  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  42105022 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagta 42105121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Original strand, 24835655 - 24835844
Alignment:
Q  151 attaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaattt 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24835655 attaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagataatcgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattt 24835754  T
Q  251 aggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24835755 aggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgg 24835844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44688985 - 44688799
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44688985 tatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagctta 44688886  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44688885 ttaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagta 44688799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 54534279 - 54534476
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54534279 ttataattaaaatatatgtttggaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 54534378  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  54534379 aatttaggcttatt-gaatatggcataagcagcttat-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta 54534476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 53028454 - 53028285
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53028454 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 53028355  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  53028354 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatgataagctatttttatttatttacc 53028285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16354576 - 16354390
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16354576 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgcaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttag 16354477  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16354476 gcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 16354390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26123049 - 26122857
Alignment:
Q  148 ataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaa 247  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26123049 ataatttaaatatatgttttgaaaaagtagacctagagagaatcgaagaatgttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaa 26122950  T
Q  248 tttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26122949 tttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgg 26122857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24366341 - 24366145
Alignment:
Q  70 agtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcnnnnnnnnttataattaaactatatgttttga 169  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||        | |||| |||| ||||||||||||    
T  24366341 agtatataacaattttgttactcatgcaccgccaaagataattaacattatcattaaaatattccttcaaagaaaat-ataagtaaaatatatgttttga 24366243  T
Q  170 aaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatg 267  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24366242 aaaagtggatcaagagagaatctaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatg 24366145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 165 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12916124 - 12915948
Alignment:
Q  165 tttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaat 264  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  12916124 tttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaat 12916025  T
Q  265 atgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga 341  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12916024 atgacataagcagtttatgaaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttatgga 12915948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 232 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35643368 - 35643255
Alignment:
Q  232 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35643368 gagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaa 35643269  T
Q  332 ggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||    
T  35643268 ggcttatggaagta 35643255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13697027 - 13696914
Alignment:
Q  149 taattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaat 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13697027 taattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaat 13696928  T
Q  249 ttaggcttattaaa 262  Q
    ||||||||||||||    
T  13696927 ttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 249 - 345
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529923
Alignment:
Q  249 ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 50529923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8042963 - 8042871
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042963 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 8042871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35643527 - 35643436
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643527 cttagttatgtgtgttactttagtaagataagtatatatcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 35643436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32244471 - 32244379
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244471 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttagtcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 32244379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38934302 - 38934210
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934302 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatatagcaattttgttacttatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 38934210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44689116 - 44689024
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44689116 tcttaattacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 44689024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 25494158 - 25494250
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494158 tctttgttacgtgtgttaatttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 25494250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 34700656 - 34700564
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34700656 tctttgttacgtgtgttaatttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgcaaaagataactaacattataattaaaatat 34700564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 42104844 - 42104936
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42104844 tctttgttacgtgtgttaatttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 42104936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 48924836 - 48924928
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48924836 tcttagttatgtgtgttactttggtaacataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaatattataattaaaatat 48924928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 50528715 - 50528807
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528715 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttgctcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 50528807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13697108 - 13697016
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13697108 tcttagttacgcgtgttaatttagtaagataagtatatagcaactttgttactcatgcatcgccaaagataactaacattctaattaaaatat 13697016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16354703 - 16354611
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16354703 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaatatctagcaattttgttacttatgcaccactaaagataactaacattataattataatat 16354611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38856447 - 38856356
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856447 tcttagttacgtgtgttactttggtaagataagtatatatcaattttattactcatgca-cgccaaagataactaacattataattaaaatat 38856356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35226761 - 35226669
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  35226761 tcttagttacgtgtgttaatttagtaagataggtatatagcaactttgttactcatgcactgccaaagataactaacgttctaattaaaatat 35226669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 46451994 - 46452086
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46451994 tcttagttatgtgtgttattttggtaagataagtatataacaattttgttactcatgcacggtcaaagataactaacattataattaaaatat 46452086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 53028532 - 53028440
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028532 tcttagttatgtgtgttaatttagtaatataagtatataagaattttgttactcatgcactgccaaagataactaacattataattaaaatat 53028440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 127
Target Start/End: Original strand, 54870009 - 54870097
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaa 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  54870009 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcacaaccaaggataactaacataataattaaa 54870097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 229
Target Start/End: Original strand, 50528845 - 50528916
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagc 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528845 tatatgttttgaaaaagtggatccagatagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Original strand, 54534207 - 54534278
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  54534207 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttacttatacaccgccaaagataa 54534278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128094
Alignment:
Q  255 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttat 49128094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35643411 - 35643365
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggagg 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35643411 taaaatatatcttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggagg 35643365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29288494 - 29288190
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29288494 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgtaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 29288395  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288394 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggta 29288297  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288296 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 29288197  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  29288196 gggagta 29288190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29078863 - 29078557
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29078863 tcttagttacgtttgttagtttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttaa 29078764  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078763 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcaagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 29078664  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078663 agctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 29078564  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  29078563 gggagta 29078557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 52753005 - 52753311
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  52753005 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaacattccttca 52753104  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52753105 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggta 52753204  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52753205 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttat 52753304  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  52753305 gggagta 52753311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 39260205 - 39260510
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39260205 tcttagttgcgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 39260304  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260305 aaaaaa-ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 39260403  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39260404 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttat 39260503  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  39260504 gggagta 39260510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 970383 - 970690
Alignment:
Q  39 tcttagttacgttt-gttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttc 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  970383 tcttagttacgttttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattcttt- 970481  T
Q  138 nnnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggt 237  Q
            ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  970482 -aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggt 970580  T
Q  238 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac--tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggct 335  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  970581 aagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggct 970680  T
Q  336 tatggaagta 345  Q
    ||||| ||||    
T  970681 tatgggagta 970690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 46761314 - 46761007
Alignment:
Q  38 ttcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttc 137  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46761314 ttcttagttgcatgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcagcaccaaagataaataacattataattaaaatattccttc 46761215  T
Q  138 nnnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggt 237  Q
            ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46761214 aaaaaaagttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggt 46761115  T
Q  238 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46761114 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 46761015  T
Q  338 tggaagta 345  Q
    || |||||    
T  46761014 tgcaagta 46761007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 55 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8121199 - 8120916
Alignment:
Q  55 tactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcnnnnnnnnttataatta 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||    
T  8121199 tactttaatgagataagtatatagcaattttgttactcatgcac-gcaaaagataactaacattataattaaaatattccttcaaaaaaagttataatta 8121101  T
Q  155 aactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggc 254  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  8121100 aaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagc 8121001  T
Q  255 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8121000 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 8120916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 79 - 339
Target Start/End: Original strand, 17587403 - 17587663
Alignment:
Q  79 caattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcnnnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggc 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  17587403 caattttgttactcatgcaccgcaaaagataactaacattataattaaaatattccttcaaaaaaagttataattaaaatatatgttttgaaaaagtgga 17587502  T
Q  179 tccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagc 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17587503 tccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagc 17587602  T
Q  279 ttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17587603 ttatgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatg 17587663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 52697137 - 52696838
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||      
T  52697137 tcttagttaggtgtgttactttagtaagataagaatataacaattttgttactcatgtaccgcaaaagataattaaaattataattaaaatattcctt-a 52697039  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  52697038 aaaaaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggta 52696939  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52696938 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttat 52696839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 39 - 338
Target Start/End: Original strand, 41928353 - 41928652
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||      
T  41928353 tcttagttaaatgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatatatgtttt 41928452  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
             |  |  |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41928453 ttttctaaaaagaaaaaaaaatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggta 41928552  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928553 agctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 41928652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16052445 - 16052137
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  16052445 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatataaaaaaa 16052346  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatat--gttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaggg 236  Q
             ||||   || |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16052345 aactaaaaaataaaataaatatatatgttttgaaaaagtggatcaagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggg 16052246  T
Q  237 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16052245 taagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 16052146  T
Q  337 atggaagta 345  Q
    |||||||||    
T  16052145 atggaagta 16052137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 147 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25897613 - 25897415
Alignment:
Q  147 tataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaa 246  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897613 tataattaaaatatatattttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaa 25897514  T
Q  247 atttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25897513 atttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 25897415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20089699 - 20089512
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089699 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 20089600  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20089599 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagta 20089512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2347885 - 2347697
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2347885 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 2347786  T
Q  258 tt-aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2347785 ttaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 2347697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 38172166 - 38171879
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38172166 tcttagttagatgtgttacattagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccacaaaagataactaacattataattaaaatattccttca 38172067  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||    
T  38172066 aaaaaagttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggata 38171967  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38171966 agctgaaaatttaggc-------------acataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttat 38171880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33510720 - 33510525
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33510720 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 33510621  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33510620 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 33510525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38829297 - 38829110
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38829297 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 38829198  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829197 ttaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 38829110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 1170416 - 1170608
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1170416 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttag 1170515  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170516 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 1170608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17591921 - 17591729
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17591921 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttag 17591822  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17591821 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagta 17591729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 338
Target Start/End: Original strand, 19715130 - 19715318
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19715130 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatt 19715229  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19715230 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttat 19715318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23498700 - 23498501
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23498700 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaa 23498601  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23498600 aatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagta 23498501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26663498 - 26663299
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26663498 ttataattaaaatatatgttttgaaaaaatggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaa 26663399  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26663398 aatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 26663299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 42370772 - 42370959
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42370772 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 42370871  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42370872 ttaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 42370959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 150 - 340
Target Start/End: Original strand, 26580239 - 26580429
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26580239 aattaaaatatatgttttgaaaatgtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatt 26580338  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580339 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 26580429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 1940716 - 1940911
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1940716 aattaaaatatatgttttgaaaaagtagatccagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatt 1940815  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1940816 taggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 1940911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7145447 - 7145249
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7145447 ttataattaatatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaa 7145348  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7145347 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagta 7145249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40149703 - 40149504
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  40149703 ttataattaatatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaa 40149604  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  40149603 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta 40149504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43905894 - 43905702
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||    
T  43905894 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagacaatcgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaa 43905795  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905794 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 43905702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6765699 - 6765507
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6765699 ttataattaaaatatatgttttaaaaaagtggatcgagatagaatcgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaa 6765600  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6765599 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttat 6765507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15203352 - 15203153
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  15203352 ttataattaaaacatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaa 15203253  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15203252 aatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagta 15203153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 339
Target Start/End: Original strand, 8079678 - 8079867
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8079678 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattaagagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaact 8079777  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079778 taggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 8079867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15718024 - 15717832
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15718024 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaattgaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 15717925  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15717924 aatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatg 15717832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 46409677 - 46409482
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gccagagggtaagctg 243  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||    
T  46409677 ttataatgaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctg 46409578  T
Q  244 aaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409577 aaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 46409482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 13996692 - 13996887
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13996692 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatt 13996791  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13996792 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagta 13996887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 49146412 - 49146209
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  49146412 ttataattaaaatataagttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgacgttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaa 49146313  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  49146312 aatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagta 49146213  T
Q  346 tata 349  Q
    ||||    
T  49146212 tata 49146209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2473962 - 2473768
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  2473962 ttataattaaaatatatgttttgaaaatgtggatccaaagagactcgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaa 2473863  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2473862 aatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgg 2473768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5215618 - 5215426
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  5215618 taaaatatatgttttgaaaaggtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttag 5215519  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5215518 gcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagta 5215426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12683048 - 12682861
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12683048 tatatattttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggctta 12682949  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12682948 tgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 12682861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32671806 - 32671620
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  32671806 tatatgttttgaaaa-gtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggctta 32671708  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32671707 ttaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagta 32671620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40092719 - 40092532
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  40092719 tatatgttttgaaaaagtggatccagagaaaatcgaaaaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggctta 40092620  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40092619 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 40092532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 181 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1168708 - 1168544
Alignment:
Q  181 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 280  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1168708 cagagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1168609  T
Q  281 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1168608 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 1168544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 15554121 - 15554308
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15554121 aattaaaatatatgttttgaaaaaatggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatt 15554220  T
Q  250 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||   |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15554221 taggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa---atg-----ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 15554308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 345
Target Start/End: Original strand, 51359210 - 51359380
Alignment:
Q  174 gtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51359210 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 51359309  T
Q  274 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  51359310 gcaccttatgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagta 51359380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 161 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29695896 - 29695731
Alignment:
Q  161 atgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 260  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||| ||      || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29695896 atgttttgaaaaagtagatctagagagaattgaatgaggttacataatttt-----cttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatta 29695802  T
Q  261 aaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29695801 aaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaacacctttaaaaa 29695731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23323176 - 23323036
Alignment:
Q  54 ttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcnnnnnnnnttataatt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  23323176 ttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgtaccgcaaaagataactaaaattataattaaaatattccttcaaaaagagttataatt 23323077  T
Q  154 aaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaa 194  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23323076 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaa 23323036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 19715008 - 19715100
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715008 tcttagttacctgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 19715100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 26580117 - 26580209
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580117 tcttagttacgtgtgttactctagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 26580209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 49146486 - 49146398
Alignment:
Q  43 agttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49146486 agttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgctaaatataactaacattataattaaaatat 49146398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 1940592 - 1940684
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1940592 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttacttatgcaccgccaaagataaccaaaattataattaaaatat 1940684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6765777 - 6765685
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765777 tcttagttacgtgtgttaatttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcattgccaaagataactaacattataattaaaatat 6765685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33510841 - 33510750
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510841 tcttagttatgtgtgttactttggtaagataagtatatagcaattttgttactcatgca-cgccaaagataactaacattataattaaaatat 33510750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40092855 - 40092763
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092855 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatataacaattttgttactcatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 40092763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15718101 - 15718010
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15718101 cttagttacgtgtgttaatttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcattgtcaaagataactaacattataattaaaatat 15718010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43905967 - 43905880
Alignment:
Q  44 gttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905967 gttacgtgtgttaatttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 43905880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17592047 - 17591954
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgtta-ctgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592047 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatatagcaattttgttatcttatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 17591954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 1170292 - 1170384
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1170292 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataaacatatagcaattttgttatttatgcaccgctaaagataactaacattataataaaaatat 1170384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2348016 - 2347924
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2348016 tcttagttatgtgtgttactttagtaagataagtatatagaaattttgttactcatgtacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 2347924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 8079556 - 8079648
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079556 tcttagttatgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttattactcatgtacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 8079648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 13996571 - 13996663
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13996571 tcttagttacctgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcacaaccaaagataattaacattataattaaaatat 13996663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 14004685 - 14004777
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14004685 tcttagttacctgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcacaaccaaagataattaacattataattaaaatat 14004777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 15554000 - 15554092
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554000 tcttagttatgtgtgttattttagtaagataagtatataaaaattttgttactcatgcaccgtcaaagataactaacattataattaaaatat 15554092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 51359075 - 51359166
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359075 tcttagttacatgtgttactttagtaagataaatatatagcaattttgttactcatgca-caccaaagataactaacattataattaaaatat 51359166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 46409749 - 46409678
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46409749 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttacttatgcaccgccaaagataa 46409678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26663576 - 26663484
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663576 tctttgttacttgtgttaatttagtaagacaagtatataacaattttgttactcatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 26663484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5215743 - 5215652
Alignment:
Q  41 ttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccg-ccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5215743 ttagttacatgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgtactgcccaaagataactaacattatgattaaaatat 5215652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40149781 - 40149689
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40149781 tcttagttacgtgtgttaatttaataagataagtatatatcaattttgttactcatgtactgccaaagataaccaacattataattaatatat 40149689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 345
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323004
Alignment:
Q  238 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 337  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  338 tggaagta 345  Q
    ||| ||||    
T  23322997 tgggagta 23323004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 2474033 - 2473963
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2474033 tcttagttacgtgtgtta-tttagtaagataactatatagcaattttgttacttatgcaccgccaaagataa 2473963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086313
Alignment:
Q  257 attaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgg 52086313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7145496 - 7145433
Alignment:
Q  68 taagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7145496 taagtatatagcaattttgttacttatgtaccgccaaatataactaacattataattaatatat 7145433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15203424 - 15203353
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataa 110  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  15203424 tcttagttacctgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttatttaagcaccaccaaagataa 15203353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1170812 - 1170719
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaa-gataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1170812 tcttagttatgtgtgttactttaggaaagataagtatataacaattttgttactcatatacaaccaaagataactaagattataattaaaatat 1170719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23498741 - 23498686
Alignment:
Q  76 tagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23498741 tagcaattttgttacttatgcaccgtaaaagataactaacattataattaaaatat 23498686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 120
Target Start/End: Original strand, 22887995 - 22888076
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattat 120  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||     |||||||||||||||||    
T  22887995 tcttagttacgtgtattactctagtaagataagtatataacaattttattactcatgcacaatagaagataactaacattat 22888076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 52086532 - 52086494
Alignment:
Q  93 atgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  52086532 atgcaccgccaaagataactaccataataattaaaatat 52086494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 31517073 - 31517379
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcn 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31517073 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttca 31517172  T
Q  139 nnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggta 238  Q
           ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31517173 aaaaaaattataattaaaatatatcttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggta 31517272  T
Q  239 agctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517273 agctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 31517372  T
Q  339 ggaagta 345  Q
    || ||||    
T  31517373 gggagta 31517379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 42 - 340
Target Start/End: Original strand, 28329700 - 28329996
Alignment:
Q  42 tagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttcnnnn 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  28329700 tagttacgcgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccaccaaagataactaacattataattaaaatattccttcaaaa 28329799  T
Q  142 nnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagc 241  Q
        ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||    
T  28329800 aaaattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagc 28329897  T
Q  242 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329898 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 28329996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 38 - 339
Target Start/End: Original strand, 2178627 - 2178927
Alignment:
Q  38 ttcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatattccttc 137  Q
    ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178627 ttcttagttagctgtgttgctttagtaagataagtatatagcaattttgttactcgtgcaccgcaaaagataactaacattataattaaaatattccttc 2178726  T
Q  138 nnnnnnnnttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggt 237  Q
            ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2178727 aaaaaag-ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggt 2178825  T
Q  238 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2178826 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactta 2178925  T
Q  338 tg 339  Q
    ||    
T  2178926 tg 2178927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 150 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42937956 - 42937763
Alignment:
Q  150 aattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42937956 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatt 42937857  T
Q  250 taggc-ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaa 342  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937856 taggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaa 42937763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Original strand, 6174793 - 6174996
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6174793 ttataattaaaatacatgttttgaaaatgtggatccagagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 6174892  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6174893 aatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 6174992  T
Q  346 tata 349  Q
    ||||    
T  6174993 tata 6174996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 159 - 345
Target Start/End: Original strand, 33906025 - 33906211
Alignment:
Q  159 atatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttat 258  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33906025 atatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttat 33906124  T
Q  259 taaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33906125 taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 33906211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 158 - 339
Target Start/End: Original strand, 18806861 - 18807042
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18806861 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggctta 18806960  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806961 ttaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 18807042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39635692 - 39635493
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  39635692 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtgaatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaa 39635593  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39635592 aatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 39635493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 339
Target Start/End: Original strand, 19383907 - 19384093
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19383907 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 19384006  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19384007 gcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 19384093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 158 - 339
Target Start/End: Original strand, 3873221 - 3873402
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3873221 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 3873320  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873321 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 3873402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5733632 - 5733440
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5733632 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 5733533  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5733532 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagta 5733440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 26323163 - 26323350
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26323163 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 26323262  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  26323263 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagta 26323350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4016272 - 4016080
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4016272 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttag 4016173  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4016172 gcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 4016080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 30270651 - 30270843
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30270651 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttag 30270750  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30270751 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagta 30270843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Original strand, 16066259 - 16066452
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16066259 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagattatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaa 16066358  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  16066359 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatg 16066452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 4232119 - 4232306
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  4232119 tatatgttttgaaaaagtggattcagagataatcgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttg 4232218  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4232219 tgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagta 4232306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 851230 - 851044
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  851230 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaa 851131  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  851130 gcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatg 851044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 19901103 - 19901301
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||    
T  19901103 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagaaagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaa 19901202  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19901203 aatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagta 19901301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 430056 - 429863
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||    
T  430056 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagcgagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaa 429957  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  429956 aatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatg 429863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 16588753 - 16588940
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16588753 tatatgttttgaaaaagtggattcagagataatcgacggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggctta 16588852  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  16588853 tgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagta 16588940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 201 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108320
Alignment:
Q  201 tacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  301 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 1108320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Original strand, 44947514 - 44947701
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  44947514 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaa 44947613  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 340  Q
    |||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  44947614 aatttag-------caaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatgg 44947701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 161 - 341
Target Start/End: Original strand, 1482883 - 1483063
Alignment:
Q  161 atgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 260  Q
    |||||||||||| || | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1482883 atgttttgaaaatgtagatacagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttatta 1482982  T
Q  261 aaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1482983 aaatatggcataagcagcttatgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttatgga 1483063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 161 - 345
Target Start/End: Original strand, 30420159 - 30420331
Alignment:
Q  161 atgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 260  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||    
T  30420159 atgttttgaaaaagtggatcctgagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaag------------ctgaaaatttaggcttatta 30420246  T
Q  261 aaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30420247 aaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 30420331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 19901025 - 19901117
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19901025 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 19901117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Original strand, 1482768 - 1482847
Alignment:
Q  52 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1482768 tgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 1482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 42938080 - 42937990
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaat 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42938080 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaat 42937990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 26323031 - 26323123
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323031 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 26323123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 33905894 - 33905986
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33905894 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 33905986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1109625 - 1109533
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1109625 tcttagttacgtgtgttactttagtatgataagtatatagcaattttattactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 1109533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 3873088 - 3873180
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873088 tcttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatgacaattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 3873180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 18806727 - 18806819
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806727 tcttaattacatgtgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactcatgtacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 18806819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 122
Target Start/End: Original strand, 19383826 - 19383909
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataa 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  19383826 tcttagttacgtttgttaatttagtaagataagtatataacaattttgttactcacgccccgccaaagataactaacattataa 19383909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 430134 - 430042
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  430134 tcttagttacctgtgttaatttagtaatataaatatatagcaattttgttactcatgcactgtcaaagataactaacattataattaaaatat 430042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5733757 - 5733665
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5733757 tcttagttaagtatgttactttagtaagataaacatatagcaattttgttacttatgcaccgctaaagataactaacattgtaataaaaatat 5733665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 16066181 - 16066273
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||| |||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066181 tctttgttatgtgtgttagtgtagtaagataaatatatagcaattttgttactcatgcaccgctaaagataactaacattataattaaaatat 16066273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 39635770 - 39635678
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39635770 tcttagttacatgtgttactttagtaatataattaactagcaattttgttactaatgcaccaccaaagataactaacattataattaaaatat 39635678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4016384 - 4016304
Alignment:
Q  52 tgttactttagtaa-gataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016384 tgttactttagtaaagataagtatataacaattttgttatccatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 4016304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 339
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101305
Alignment:
Q  244 aaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatg 22101305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Original strand, 44947438 - 44947528
Alignment:
Q  40 cttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947438 cttagttacatgtgttaatttagtaagataaatatatagcaattt-gttacccatgcactgccaaagataactaacattataattaaaatat 44947528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 339
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446727
Alignment:
Q  237 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  337 atg 339  Q
    |||    
T  42446725 atg 42446727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585337
Alignment:
Q  237 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 336  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  337 atg 339  Q
    |||    
T  3585339 atg 3585337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 107
Target Start/End: Original strand, 6174723 - 6174789
Alignment:
Q  41 ttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaaga 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6174723 ttagttacgtgtgttactttagtaagataagtatatagtaatttggttactgatgcaacgccaaaga 6174789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 851314 - 851262
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttact 91  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  851314 tcttagttacgtgtgttactttattaagataagtatatagcaattttgttact 851262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 131
Target Start/End: Original strand, 30270581 - 30270619
Alignment:
Q  93 atgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30270581 atgcaccgccaaagataattaccattataattaaaatat 30270619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 145210 - 145409
Alignment:
Q  146 ttataattaaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  145210 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaa 145309  T
Q  246 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  145310 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta 145409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 145132 - 145224
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145132 tcttagttacgtgttttaaattagtaagataagtatatagtaattttgttacttatgcaccaccaaagataactaacattataattaaaatat 145224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 267 - 459
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  267 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaa 366  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  367 gcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagta 459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10471 - 10285
Alignment:
Q  153 taaactatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttag 252  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10471 taaaatatatgttttgaaaatgtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttag 10372  T
Q  253 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10371 gcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatg 10285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10596 - 10504
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10596 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagaatatagtaattttgttactcatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 10504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 4 - 170
Alignment:
Q  179 tccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4 tccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagc 103  T
Q  279 ttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagta 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  104 ttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 158 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3938 - 3757
Alignment:
Q  158 tatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctta 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3938 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggctta 3839  T
Q  258 ttaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3838 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatg 3757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4063 - 3976
Alignment:
Q  44 gttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4063 gttacgtgtgttactttagtaagataagtatataataattttgttactcatgcacaaccaaagataactaacattataattaaaatat 3976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 186 - 339
Target Start/End: Original strand, 22956 - 23109
Alignment:
Q  186 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22956 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 23055  T
Q  286 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23056 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 23109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 179 - 341
Target Start/End: Original strand, 4 - 165
Alignment:
Q  179 tccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  4 tccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagc 102  T
Q  279 ttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga 341  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103 atatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 3
Alignment:
Q  39 tcttagttacgtttgttactttagtaagataagtatatagcaattttgttactgatgcaccgccaaagataactaacattataattaaaatat 131  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  95 tcttagttacatgtgttactttagtaagataagtatataacaattttgttattcatgcaccgccaaagataagtaacattataattaaaatat 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University