View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF13472_low_4 (Length: 235)
Name: NF13472_low_4
Description: NF13472
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF13472_low_4 |
 |  |
|
| [»] scaffold0019 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0298 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0015 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0159 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0002 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0336 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0444 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0076 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0147 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0457 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0059 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0060 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0045 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 36468931 - 36468796
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36468931 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaagtgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
36468832 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
36468831 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaat |
36468796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 33248656 - 33248789
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
33248656 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattataattatgtgt |
33248755 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
33248756 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
33248789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20962751 - 20962631
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20962751 |
acaaacaatttatacccaaacact--atgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacagaaacgatcctattatacttacgtgt |
20962654 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20962653 |
aaatagttttatgagatgtaaaa |
20962631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 4742495 - 4742363
Alignment:
| Q |
17 |
aaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaa |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4742495 |
aaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgtaa |
4742396 |
T |
 |
| Q |
117 |
atagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
4742395 |
atagttttaatacatgtaaaaatcttacatcaa |
4742363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7652717 - 7652595
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7652717 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
7652618 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
7652617 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
7652595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 48167677 - 48167551
Alignment:
| Q |
24 |
ttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48167677 |
ttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtcgaaacgatcctattatacttacgtataaatagttt |
48167578 |
T |
 |
| Q |
124 |
tatgatatgtaaaacttttacatcaat |
150 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
48167577 |
tatgacatgtaaaaatcttacatcaat |
48167551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 9990062 - 9990184
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9990062 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
9990161 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9990162 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
9990184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52307580 - 52307458
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52307580 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
52307481 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
52307480 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
52307458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10385565 - 10385442
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10385565 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
10385466 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
10385465 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
10385442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 8626290 - 8626413
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8626290 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
8626389 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
8626390 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
8626413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27850046 - 27849924
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
27850046 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgtggacacgatcctattatactcacatgt |
27849947 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
27849946 |
aaatagttttatgagatggaaaa |
27849924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 37023357 - 37023490
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | | ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37023357 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgtaactccctgtggactcgatcatattatacttacgtgt |
37023456 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
37023457 |
aaatagttttatgagatgtaaaaatcttacatca |
37023490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 23382971 - 23383094
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23382971 |
acaaacaattaatacccaaacacttaacgtcacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
23383070 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
23383071 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
23383094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 22098647 - 22098769
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
22098647 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgtttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctattatactcacatgt |
22098746 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
22098747 |
aaatagttttatgagatggaaaa |
22098769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 23396965 - 23397074
Alignment:
| Q |
17 |
aaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtgta |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23396965 |
aaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatg-aatacgcaactccctgtggatacgatcctatatatacttacgtgta |
23397063 |
T |
 |
| Q |
116 |
aatagttttat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
23397064 |
aatagttttat |
23397074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11260282 - 11260201
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgat |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
11260282 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaagtccctgcggaaacgat |
11260201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Original strand, 27104697 - 27104823
Alignment:
| Q |
23 |
tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| || | ||||||||| |
|
|
| T |
27104697 |
tttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacacaacttcctacagaaacgatcatattatactcacttataaatagtt |
27104796 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
27104797 |
atatgacatgtaaaaatcttacatcaa |
27104823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Original strand, 20837760 - 20837820
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatac |
75 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20837760 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtaaaaatgcttatgaaatac |
20837820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 148
Target Start/End: Original strand, 2357901 - 2357959
Alignment:
| Q |
90 |
aaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
2357901 |
aaacgatcatattatacttacgtgtaaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
2357959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11257904 - 11257858
Alignment:
| Q |
91 |
aacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11257904 |
aacgatcctattatacttatgtgtaaatagttttatgagatgtaaaa |
11257858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 22098333 - 22098373
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattg |
55 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
22098333 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattg |
22098373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 31879265 - 31879399
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31879265 |
acaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
31879364 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
31879365 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaa |
31879399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12089954 - 12089818
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12089954 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
12089855 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaatc |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
12089854 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaatc |
12089818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 2478327 - 2478461
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2478327 |
acaaacaatttatacccaagcacttaatgtgaaaaatattgtggaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
2478426 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
2478427 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaa |
2478461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2797058 - 2796939
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2797058 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttttgaaatacgcaactccatgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
2796959 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgta |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2796958 |
aaatagttttatgacatgta |
2796939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8107383 - 8107261
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8107383 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
8107284 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
8107283 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
8107261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 31882777 - 31882910
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31882777 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgcggaaacgatcctattatactcacgtgt |
31882876 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31882877 |
agtaagttttatgacatgtaaaatttttacatca |
31882910 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31664007 - 31663875
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31664007 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcaaccccttgcaaaaacgatcctattatacttacgtgt |
31663908 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatc |
147 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
31663907 |
aaatggttttatgacatgtaaaaatcttacatc |
31663875 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10345801 - 10345679
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10345801 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
10345702 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
10345701 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
10345679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 23795760 - 23795882
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23795760 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
23795859 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
23795860 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
23795882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3544373 - 3544240
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3544373 |
acaaacactttatacccaaacatttaatgcgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacaattctattatacttacttgt |
3544274 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3544273 |
aaatagttttatgacatgtaaaaactttacatca |
3544240 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 2632063 - 2632185
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2632063 |
acaaataatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatactcacgtgt |
2632162 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
2632163 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
2632185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19471729 - 19471607
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19471729 |
acaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
19471630 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
19471629 |
aaatagttttatgagatggaaaa |
19471607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 12184526 - 12184661
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
12184526 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgtggattcgatcctatatatactcacgtg |
12184625 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
12184626 |
taaatagttttatgagatgtaaaaatcttacatcaa |
12184661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22321296 - 22321173
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22321296 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
22321197 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
22321196 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
22321173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 24483412 - 24483545
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24483412 |
acaaacaatttatacccaaacacttgatgtgataaatattatgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcgaaaa-tatcctgttatacttacgtgt |
24483510 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat |
150 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
24483511 |
aaataactttatgacatgtaaaa-tcttacatcaat |
24483545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31157771 - 31157648
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31157771 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
31157672 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
31157671 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
31157648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 6173182 - 6173304
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6173182 |
acaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacatgt |
6173281 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
6173282 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
6173304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 22825275 - 22825397
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22825275 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattatgaaaatgcttatgaaatacacaactctctatggacacgatcctattatactcacgtgt |
22825374 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
22825375 |
aaatagttttatgagatggaaaa |
22825397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 45500206 - 45500084
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45500206 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgagaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtagaaacgatcatattatactcacgtgt |
45500107 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
45500106 |
aaatagttctatgacatgtaaaa |
45500084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 12191508 - 12191642
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
12191508 |
acaaacaatttataccctaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggattcgatcctatatatactcacgtg |
12191607 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
12191608 |
taaatagttttatgagttgtaaaaatcttacatca |
12191642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Original strand, 1954593 - 1954675
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatc |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
1954593 |
acaaacaatttatacccaagcacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgcggaaacgatc |
1954675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 4704873 - 4704809
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaa |
79 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4704873 |
acaaacaatttatacccaagcacttaatgtgataaatactgtgaaaatacttatgaaatatgcaa |
4704809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4704810 - 4704776
Alignment:
| Q |
90 |
aaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtttt |
124 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4704810 |
aaacgattctattatacttacgtgtaaatagtttt |
4704776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 55327438 - 55327571
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
55327438 |
acaatcaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcatattatacttacgtgt |
55327537 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
55327538 |
aaatagttttatgatatgtaaaaatcttacatca |
55327571 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 35416191 - 35416058
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35416191 |
acaaataatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
35416092 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
35416091 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
35416058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26373126 - 26372992
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26373126 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgcggaaacgatcctatcatacttacgtgt |
26373027 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
26373026 |
aaatagttttatgaaatgtaaaaatcttacatcaa |
26372992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21668399 - 21668265
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21668399 |
acaaacactttatacctaaacactttatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
21668300 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
21668299 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaa |
21668265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21677163 - 21677029
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21677163 |
acaaacactttatacctaaacactttatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
21677064 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
21677063 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaa |
21677029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 1188631 - 1188764
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1188631 |
acaaacaatttatacccacacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacggaaacgatcctattatactaacgtgt |
1188730 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
1188731 |
aaatagttttaatacatgtaaaaatcttacatca |
1188764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30217881 - 30217749
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30217881 |
acaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgcgaaaacgatcttattatacttacgtgt |
30217782 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
30217781 |
aaat-ggtttatgacatgtaaaaatcttacatca |
30217749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 52619169 - 52619302
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52619169 |
acaaacaatttataaacaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccgtgcggaaacgatcctgttatacttacgtgt |
52619268 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
52619269 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
52619302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4838631 - 4838509
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4838631 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
4838532 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
4838531 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
4838509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5273058 - 5272936
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5273058 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
5272959 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
5272958 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
5272936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 22048348 - 22048470
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22048348 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
22048447 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
22048448 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
22048470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40995042 - 40994920
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40995042 |
acaaacactttatacccaaacacttaatgtgacaagtattgtgaaaatgcatatgaaatacgcaactccctgtagaaacgatcttattatacttacgtgt |
40994943 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
40994942 |
aaatagttttatgacatgtaaaa |
40994920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 33239586 - 33239705
Alignment:
| Q |
18 |
aacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaa |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33239586 |
aacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgtaaa |
33239685 |
T |
 |
| Q |
118 |
tagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
33239686 |
tagtttaatgagaggtaaaa |
33239705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 26070394 - 26070504
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26070394 |
acaaacaatttgttcccaaacaattaatgtggcaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgt |
26070493 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagtttta |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
26070494 |
aaatagtttta |
26070504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 42532381 - 42532267
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
42532381 |
acaaacaatttatacccaaacagttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttacgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctatatatactcacgta |
42532282 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatga |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
42532281 |
taaatagttttatga |
42532267 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 46691531 - 46691400
Alignment:
| Q |
16 |
caaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgta |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
46691531 |
caaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaacattatgaaaatacttatgaaatacgcaactccttacaaaaacgatcctattatactcacatgta |
46691432 |
T |
 |
| Q |
116 |
aatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
46691431 |
aatag-tttatcacatgtaaaaatcttacatca |
46691400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 324105 - 324228
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
324105 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatactcatgtg |
324204 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
324205 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
324228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 44428886 - 44428762
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaac-tccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44428886 |
acaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttccctgtggacacgatcctatatatacttacgt |
44428787 |
T |
 |
| Q |
113 |
gtaaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
44428786 |
gtaaatagttttatgagaggtaaaa |
44428762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19247322 - 19247214
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19247322 |
acaaacaatttatactcaaacacttaatgggataaacattgtgaaaatac--atgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcttattatactcacgtgt |
19247225 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagtttta |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
19247224 |
aaatagtttta |
19247214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Original strand, 42272045 - 42272143
Alignment:
| Q |
17 |
aaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgta |
115 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42272045 |
aaacactttatacccaaacacttaaagtgataaatattgtgaacatacttatgaaatatgcaactccatgcggaaacgatcctattatacttacgtgta |
42272143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24576924 - 24576812
Alignment:
| Q |
17 |
aaacaatttataccc-aaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgct---tatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |
|
|
| T |
24576924 |
aaacaatttataccccaaacatttaatgtgataaacattgtgaaaatactaattatgaaatacgcaattccctacgaaaacgatcatattatactcatgt |
24576825 |
T |
 |
| Q |
113 |
gtaaatagtttta |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
24576824 |
gtaaatagtttta |
24576812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19730982 - 19730893
Alignment:
| Q |
48 |
aaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
19730982 |
aaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacatgtgaaaagttttatgagaggtaaaa |
19730893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Original strand, 20949422 - 20949546
Alignment:
| Q |
23 |
tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| || || || ||||| ||||||||| || ||||||||| | |
|
|
| T |
20949422 |
tttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacgcaacttccagcggaatcgatcttattatactcacatgtaaatag-t |
20949520 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
20949521 |
ttatgacatgtaaaaatcttacatca |
20949546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 28457372 - 28457239
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28457372 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcatattatacttacgtgt |
28457273 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
28457272 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatattacatca |
28457239 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36557057 - 36556924
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
36557057 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgcggaaacgatcatattatacttacgtgt |
36556958 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
36556957 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
36556924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23924524 - 23924392
Alignment:
| Q |
18 |
aacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaa |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23924524 |
aacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacggaaacgatcctattatactcacgtgtaaa |
23924425 |
T |
 |
| Q |
118 |
tagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
23924424 |
tagttttatgacatgtacaaatcttacatcaat |
23924392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 28006750 - 28006882
Alignment:
| Q |
14 |
cacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28006750 |
cacaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaacttcctacggaaacgatcctattatacttacgtg |
28006849 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaacttttacat |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
28006850 |
taaatagttttatgacatgtaaaaatcttacat |
28006882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 14701311 - 14701446
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14701311 |
acaaacaatttatactcaaacactcaatgtgataaatattatgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatccaattatacttacgtgt |
14701410 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
14701411 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatattacatcaat |
14701446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 42700469 - 42700347
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42700469 |
acaaacaatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
42700370 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
42700369 |
aaatagttttatgagatgtaaaa |
42700347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8679290 - 8679155
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8679290 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaattattcaactccctgtggaaacgatcctattatacttacgtgt |
8679191 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
8679190 |
aaatagttttatgagatgtaaaaatcttacatcaat |
8679155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 27258051 - 27258184
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27258051 |
acaaacactttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctgcggaaacaatcatattatacttacgtgt |
27258150 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
27258151 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
27258184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 43992180 - 43992301
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43992180 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgtg-gaacgatcctattatacttacgtgt |
43992278 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43992279 |
aaatagttttatgacatgtaaaa |
43992301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36039757 - 36039635
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36039757 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcatatgaaatacgcaactccttgtgaacacgatcctattatacttacgtgt |
36039658 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
36039657 |
aaatagttttatgagatggaaaa |
36039635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36667383 - 36667250
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
36667383 |
acaaacaatttatattcaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacatgt |
36667284 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
36667283 |
aaatagttttaatacatgtaaaaatcttacatca |
36667250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 29224381 - 29224504
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
29224381 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatactcacgtg |
29224480 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
29224481 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
29224504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 29337680 - 29337803
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
29337680 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatactcacgtg |
29337779 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
29337780 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
29337803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13229837 - 13229704
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13229837 |
acaaacaatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattataaaaatgcttataaaatacgcaactccatgtggaaacgatcatattatacttacgtgt |
13229738 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
13229737 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
13229704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 32523597 - 32523730
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
32523597 |
acaaacactttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgtttatgaaatatgcaactccctgcagaaacaatcatattatagttacgtgt |
32523696 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
32523697 |
aaataattttatgacatgtaaaaatcttacatca |
32523730 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24662614 - 24662486
Alignment:
| Q |
23 |
tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24662614 |
tttatacccaaacacctaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacgcaactccctgcagaaacgatcctattatactcacgtgtaaatagtt |
24662515 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttatgatatgtaaaacttttacatcaatc |
151 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
24662514 |
atatgacatgtaaaaatcttacatcaatc |
24662486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 31759011 - 31759078
Alignment:
| Q |
81 |
tccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
31759011 |
tccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
31759078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 9783701 - 9783633
Alignment:
| Q |
81 |
tccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
9783701 |
tccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgtaaagagttttatgacatgtaataatcttacatcaa |
9783633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 40999599 - 40999464
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40999599 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaattacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
40999500 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
40999499 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaat |
40999464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20225857 - 20225724
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20225857 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtaaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgcggaaacgatcctattatactttcgtgt |
20225758 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20225757 |
aaatagttttatgacatgtaaaactcttacatca |
20225724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 16131168 - 16131303
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16131168 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccgtgcggaaacgatcctattatacttacttgt |
16131267 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
16131268 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaat |
16131303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16832278 - 16832156
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16832278 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgt |
16832179 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16832178 |
aaatagttttatgagatgtaaaa |
16832156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11738293 - 11738160
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11738293 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaattattgtgaaaatgcttatgaaatacgaaactccctgcggaaatgatcctattatacttacgtgt |
11738194 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
11738193 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
11738160 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13217539 - 13217410
Alignment:
| Q |
19 |
acaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13217539 |
acaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgtaaat |
13217440 |
T |
 |
| Q |
119 |
agttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
13217439 |
aattttatgacatgtaaaaatcttacatca |
13217410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39000676 - 39000554
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39000676 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
39000577 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
39000576 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
39000554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33491693 - 33491571
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33491693 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtagacacgatcctattatacttacgtgt |
33491594 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
33491593 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
33491571 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12167711 - 12167598
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12167711 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgtttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
12167612 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatga |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
12167611 |
aaatagttttatga |
12167598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 431836 - 431713
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
431836 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
431737 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
431736 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
431713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38121427 - 38121305
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
38121427 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcttattatacttacgtgt |
38121328 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
38121327 |
aaataattttatgagaggtaaaa |
38121305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9667191 - 9667069
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9667191 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgcgaaaatgcttatgaactacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
9667092 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9667091 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
9667069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 49249730 - 49249853
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49249730 |
acaaacaatttatatccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctatggacacgatcatatatatacttacgtg |
49249829 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
49249830 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
49249853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 148
Target Start/End: Original strand, 25242523 - 25242612
Alignment:
| Q |
59 |
aaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| | ||| | || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
25242523 |
aaatgcttatgacacacgctaatccttgcggaaacaatcatattatactcacgtgtaaatagttatataacatgtaaaaatcttacatca |
25242612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 16959218 - 16959351
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16959218 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt |
16959317 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
16959318 |
aaatagttttatgaca-gtaaaaatcttacatcaa |
16959351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11308482 - 11308360
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11308482 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
11308383 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
11308382 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
11308360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9067662 - 9067540
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9067662 |
acaaacaatttatacccaaacacttaaagtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
9067563 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9067562 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
9067540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 22181243 - 22181365
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22181243 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
22181342 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
22181343 |
gaatagttttatgagatggaaaa |
22181365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41576826 - 41576704
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41576826 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
41576727 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
41576726 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
41576704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 28370760 - 28370883
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
28370760 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctatggacacgatcctatatatacttacatg |
28370859 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
28370860 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
28370883 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8742778 - 8742656
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8742778 |
acaaacaatttatacccaaacatttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
8742679 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
8742678 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
8742656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28925638 - 28925515
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28925638 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgggaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
28925539 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
28925538 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
28925515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 3299468 - 3299590
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3299468 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtaacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttatgtgt |
3299567 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
3299568 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
3299590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 27348693 - 27348815
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27348693 |
acaaacaatttataccccaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaattccctgtggacacgattctattatacttacgtgt |
27348792 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
27348793 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
27348815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34006268 - 34006146
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34006268 |
acaaataatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattgtaaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctgtggacacgatcctattatacttacgtgc |
34006169 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
34006168 |
aaatagttttatgagatggaaaa |
34006146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13848814 - 13848689
Alignment:
| Q |
23 |
tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
13848814 |
tttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaattgcttaagatatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacttgtaaatagtt |
13848715 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
13848714 |
ttatgacatgtaaaaatcttacatca |
13848689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 137
Target Start/End: Original strand, 16583062 - 16583166
Alignment:
| Q |
34 |
acacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtgtaaatagttttatgatatg |
132 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
16583062 |
acacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgtggacacgatcctatatatacttacgtgtaaatagttttatgagagg |
16583161 |
T |
 |
| Q |
133 |
taaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
16583162 |
taaaa |
16583166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 6270557 - 6270690
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6270557 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgcaatacgcaactccctacgaaaatgatcctattatactcacgtgt |
6270656 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
6270657 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
6270690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27166593 - 27166460
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27166593 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactgacgtgt |
27166494 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
27166493 |
aaatagttttatgagatgtaaaaatcttacatca |
27166460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16904104 - 16903982
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16904104 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
16904005 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
16904004 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
16903982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 9405091 - 9405213
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9405091 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
9405190 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9405191 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
9405213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30606571 - 30606449
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30606571 |
acaaacaatttataccctaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
30606472 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
30606471 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
30606449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 34456962 - 34457084
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34456962 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
34457061 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
34457062 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
34457084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 7315873 - 7315984
Alignment:
| Q |
17 |
aaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaa |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7315873 |
aaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgtaa |
7315972 |
T |
 |
| Q |
117 |
atagttttatga |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
7315973 |
atagttttatga |
7315984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11722771 - 11722649
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11722771 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
11722672 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
11722671 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
11722649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 14345127 - 14345249
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14345127 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaacattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
14345226 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
14345227 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
14345249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 24836389 - 24836511
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24836389 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctttggacacgatcctattatacttacgtgt |
24836488 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
24836489 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
24836511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 11767421 - 11767544
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11767421 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
11767520 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
11767521 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
11767544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 33435269 - 33435391
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33435269 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctttgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
33435368 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
33435369 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
33435391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34869239 - 34869117
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
34869239 |
acaaacaatttatacctaaacacttaatatgataaatattatgaaaatacttatgaaatacgcaatttcctacggaaacgatcctattatactcacatgt |
34869140 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34869139 |
aaatagttttatgacatgtaaaa |
34869117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 31846616 - 31846735
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31846616 |
acaaacaatttatacccaaacacct---gtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctatggacacgatcctattatacttacgtgt |
31846712 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
31846713 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
31846735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 42800980 - 42801094
Alignment:
| Q |
23 |
tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||| | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
42800980 |
tttatacccaaacacttaatataataaatgatgttgaaatgcttaagatacgcgcaactccatgcggaaacgatcctattatagtcacgtgtaaatagtt |
42801079 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |
|
|
| T |
42801080 |
ttatgacatgtaaaa |
42801094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0019 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:
Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 116063 - 115929
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
116063 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgt |
115964 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
115963 |
aaatagttttaatatatgtaaaaatcttacatcaa |
115929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 168903 - 168781
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
168903 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
168804 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
168803 |
aagtagttttatgagaagtaaaa |
168781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21596023 - 21595890
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21596023 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcacctccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgt |
21595924 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
21595923 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
21595890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32806258 - 32806124
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32806258 |
acaaacaaattatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggaaacgatcctatcatacttacgtgt |
32806159 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
32806158 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaa |
32806124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25056052 - 25055919
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25056052 |
acaaacaatttatactcaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcttattatacttacgtgt |
25055953 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
25055952 |
aaatagttttaatacatgtaaaaatcttacatca |
25055919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24160749 - 24160616
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24160749 |
acaaataatttatacccaaccacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgcggaaacgatcctattatacttacatgt |
24160650 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
24160649 |
taatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
24160616 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9932300 - 9932177
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9932300 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
9932201 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9932200 |
taaagagttttatgagaggtaaaa |
9932177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 3539714 - 3539837
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3539714 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
3539813 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
3539814 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
3539837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26514923 - 26514809
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26514923 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacaagatcctatatatacttacgtg |
26514824 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatga |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
26514823 |
taaatagttttatga |
26514809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 6778222 - 6778355
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
6778222 |
acaaacaatttatacccaaatacttaaagtgataaacattgtgaatatgcttatgaaatatgcaactccctgcagaaacgatcatattatactcacatgt |
6778321 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
6778322 |
aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca |
6778355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5670772 - 5670649
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
5670772 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaaaacgcaactccctgtggacacgatcctatatatactcacgtg |
5670673 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
5670672 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
5670649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 8667598 - 8667720
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8667598 |
acaaacaatttataccctaacacttaacttgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
8667697 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
8667698 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
8667720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 16698576 - 16698698
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16698576 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcttgtggacacaatcctattatactcacgtgt |
16698675 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
16698676 |
aaatagttttatgagatggaaaa |
16698698 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5988497 - 5988427
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccct |
85 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5988497 |
acaaacattttatacccaaacagttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccct |
5988427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 148
Target Start/End: Original strand, 14479843 - 14479901
Alignment:
| Q |
90 |
aaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
14479843 |
aaacaatcctattatacttacatgtaaatagttttatgagatgtaaaaatcttacatca |
14479901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Original strand, 26604996 - 26605093
Alignment:
| Q |
23 |
tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatag |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| | ||| | ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
26604996 |
tttatacccaaacacttaagatgataaatatcgttaaaatgcttatcagatacgctagtccgtgtgaaaatgatcctaatatactcacgtataaatag |
26605093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Original strand, 15643077 - 15643203
Alignment:
| Q |
23 |
tttatacccaaacacttaatgtgataaa-tattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagt |
121 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
15643077 |
tttacacccaaacacttaatatgataaaatgatgttgaaatgcttgagatatgtgcaactccctgcaaaaatgatccaattatactcacgtgtaaatact |
15643176 |
T |
 |
| Q |
122 |
tttatgatatgtaaaacttttacatca |
148 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
15643177 |
tatatgacatgtaaaaatcttacatca |
15643203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 59
Target Start/End: Original strand, 14479775 - 14479812
Alignment:
| Q |
22 |
atttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaa |
59 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
14479775 |
atttatacccaaacacttaatgtgacaaaaattgtgaa |
14479812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Original strand, 24879532 - 24879577
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaa |
60 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24879532 |
acaaacaatttatacccaaatacttaaaatgataaatattatgaaa |
24879577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0298 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:
Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11699 - 11577
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11699 |
acaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
11600 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
11599 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
11577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15469 - 15347
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15469 |
acaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
15370 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
15369 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
15347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0015 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:
Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 175268 - 175390
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
175268 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
175367 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
175368 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
175390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0159 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:
Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28394 - 28272
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28394 |
acaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
28295 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
28294 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
28272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:
Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 350101 - 349979
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
350101 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt |
350002 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
350001 |
aaatagttttgtgagaggtaaaa |
349979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0336 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:
Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 9409 - 9532
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9409 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
9508 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9509 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
9532 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 12861 - 12984
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12861 |
acaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
12960 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
12961 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
12984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0444 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:
Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11983 - 11859
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaac-tccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11983 |
acaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttccctgtggacacgatcctatatatacttacgt |
11884 |
T |
 |
| Q |
113 |
gtaaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
11883 |
gtaaatagttttatgagaggtaaaa |
11859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25145 - 25022
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25145 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgcggcaaatattgtgaaaatgcctatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg |
25046 |
T |
 |
| Q |
114 |
taaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
25045 |
taaatagttttatgagaggtaaaa |
25022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0147 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:
Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 7398 - 7519
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7398 |
acaaacaatttatatccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactcccggtggacac-atcctattatactcacgtgt |
7496 |
T |
 |
| Q |
115 |
aaatagttttatgatatgtaaaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
7497 |
aaatagttttatgagaggtaaaa |
7519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 75947 - 75892
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatga |
70 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
75947 |
acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatga |
75892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 75723 - 75664
Alignment:
| Q |
92 |
acgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaatc |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
75723 |
acgatcctattatactcacgtgtaaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaatc |
75664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0457 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:
Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 402 - 463
Alignment:
| Q |
15 |
acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacg |
76 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
402 |
acaaacattttaaacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgagatacg |
463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0059 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:
Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15955 - 15851
Alignment:
| Q |
23 |
tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
15955 |
tttaaacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgtttaagatatacgcaacttcctgcgaaaacgatcctattatactcacgtgtaaa-agtt |
15857 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttatga |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
15856 |
ttatga |
15851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14710 - 14605
Alignment:
| Q |
23 |
tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||| ||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
14710 |
tttaaacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatatgcaactctctgcggaaacgatcctattatactcatgtgtaaatagtt |
14611 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttatga |
128 |
Q |
| |
|
| |||| |
|
|
| T |
14610 |
taatga |
14605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6317
Alignment:
| Q |
23 |
tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || | ||||| || |||||||| | ||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
6191 |
tttatacccaaatacttaagatgataaatattgtttaaatgcttatgaggtaagctagtccctgcggaaacgatcatgttatactcacatgtaaatagtt |
6290 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttatgatatgtaaaacttttacatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
6291 |
atatgacatgtaaaaatcttacatcaa |
6317 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0045 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:
Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 45710 - 45670
Alignment:
| Q |
30 |
ccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatga |
70 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45710 |
ccaaacacttaatgtgataaatattgcgaaaatgcttatga |
45670 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University