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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13472_low_4 (Length: 235)

Name: NF13472_low_4
Description: NF13472
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13472_low_4
NF13472_low_4
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (15-150)||(36468796-36468931)
chr3 (15-148)||(33248656-33248789)
chr3 (15-137)||(20962631-20962751)
chr3 (17-149)||(4742363-4742495)
chr3 (15-137)||(7652595-7652717)
chr3 (24-150)||(48167551-48167677)
chr3 (15-137)||(9990062-9990184)
chr3 (15-137)||(52307458-52307580)
chr3 (15-137)||(10385442-10385565)
chr3 (15-137)||(8626290-8626413)
chr3 (15-137)||(27849924-27850046)
chr3 (15-148)||(37023357-37023490)
chr3 (15-137)||(23382971-23383094)
chr3 (15-137)||(22098647-22098769)
chr3 (17-126)||(23396965-23397074)
chr3 (15-96)||(11260201-11260282)
chr3 (23-149)||(27104697-27104823)
chr3 (15-75)||(20837760-20837820)
chr3 (90-148)||(2357901-2357959)
chr3 (91-137)||(11257858-11257904)
chr3 (15-55)||(22098333-22098373)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (15-149)||(31879265-31879399)
chr7 (15-151)||(12089818-12089954)
chr7 (15-149)||(2478327-2478461)
chr7 (15-134)||(2796939-2797058)
chr7 (15-137)||(8107261-8107383)
chr7 (15-148)||(31882777-31882910)
chr7 (15-147)||(31663875-31664007)
chr7 (15-137)||(10345679-10345801)
chr7 (15-137)||(23795760-23795882)
chr7 (15-148)||(3544240-3544373)
chr7 (15-137)||(2632063-2632185)
chr7 (15-137)||(19471607-19471729)
chr7 (15-149)||(12184526-12184661)
chr7 (15-137)||(22321173-22321296)
chr7 (15-150)||(24483412-24483545)
chr7 (15-137)||(31157648-31157771)
chr7 (15-137)||(6173182-6173304)
chr7 (15-137)||(22825275-22825397)
chr7 (15-137)||(45500084-45500206)
chr7 (15-148)||(12191508-12191642)
chr7 (15-97)||(1954593-1954675)
chr7 (15-79)||(4704809-4704873)
chr7 (90-124)||(4704776-4704810)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (15-148)||(55327438-55327571)
chr4 (15-148)||(35416058-35416191)
chr4 (15-149)||(26372992-26373126)
chr4 (15-149)||(21668265-21668399)
chr4 (15-149)||(21677029-21677163)
chr4 (15-148)||(1188631-1188764)
chr4 (15-148)||(30217749-30217881)
chr4 (15-148)||(52619169-52619302)
chr4 (15-137)||(4838509-4838631)
chr4 (15-137)||(5272936-5273058)
chr4 (15-137)||(22048348-22048470)
chr4 (15-137)||(40994920-40995042)
chr4 (18-137)||(33239586-33239705)
chr4 (15-125)||(26070394-26070504)
chr4 (15-128)||(42532267-42532381)
chr4 (16-148)||(46691400-46691531)
chr4 (15-137)||(324105-324228)
chr4 (15-137)||(44428762-44428886)
chr4 (15-125)||(19247214-19247322)
chr4 (17-115)||(42272045-42272143)
chr4 (17-125)||(24576812-24576924)
chr4 (48-137)||(19730893-19730982)
chr4 (23-148)||(20949422-20949546)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (15-148)||(28457239-28457372)
chr2 (15-148)||(36556924-36557057)
chr2 (18-150)||(23924392-23924524)
chr2 (14-146)||(28006750-28006882)
chr2 (15-150)||(14701311-14701446)
chr2 (15-137)||(42700347-42700469)
chr2 (15-150)||(8679155-8679290)
chr2 (15-148)||(27258051-27258184)
chr2 (15-137)||(43992180-43992301)
chr2 (15-137)||(36039635-36039757)
chr2 (15-148)||(36667250-36667383)
chr2 (15-137)||(29224381-29224504)
chr2 (15-137)||(29337680-29337803)
chr2 (15-148)||(13229704-13229837)
chr2 (15-148)||(32523597-32523730)
chr2 (23-151)||(24662486-24662614)
chr2 (81-148)||(31759011-31759078)
chr2 (81-149)||(9783633-9783701)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (15-150)||(40999464-40999599)
chr1 (15-148)||(20225724-20225857)
chr1 (15-150)||(16131168-16131303)
chr1 (15-137)||(16832156-16832278)
chr1 (15-148)||(11738160-11738293)
chr1 (19-148)||(13217410-13217539)
chr1 (15-137)||(39000554-39000676)
chr1 (15-137)||(33491571-33491693)
chr1 (15-128)||(12167598-12167711)
chr1 (15-137)||(431713-431836)
chr1 (15-137)||(38121305-38121427)
chr1 (15-137)||(9667069-9667191)
chr1 (15-137)||(49249730-49249853)
chr1 (59-148)||(25242523-25242612)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (15-149)||(16959218-16959351)
chr8 (15-137)||(11308360-11308482)
chr8 (15-137)||(9067540-9067662)
chr8 (15-137)||(22181243-22181365)
chr8 (15-137)||(41576704-41576826)
chr8 (15-137)||(28370760-28370883)
chr8 (15-137)||(8742656-8742778)
chr8 (15-137)||(28925515-28925638)
chr8 (15-137)||(3299468-3299590)
chr8 (15-137)||(27348693-27348815)
chr8 (15-137)||(34006146-34006268)
chr8 (23-148)||(13848689-13848814)
chr8 (34-137)||(16583062-16583166)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (15-148)||(6270557-6270690)
chr5 (15-148)||(27166460-27166593)
chr5 (15-137)||(16903982-16904104)
chr5 (15-137)||(9405091-9405213)
chr5 (15-137)||(30606449-30606571)
chr5 (15-137)||(34456962-34457084)
chr5 (17-128)||(7315873-7315984)
chr5 (15-137)||(11722649-11722771)
chr5 (15-137)||(14345127-14345249)
chr5 (15-137)||(24836389-24836511)
chr5 (15-137)||(11767421-11767544)
chr5 (15-137)||(33435269-33435391)
chr5 (15-137)||(34869117-34869239)
chr5 (15-137)||(31846616-31846735)
chr5 (23-137)||(42800980-42801094)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (15-149)||(115929-116063)
scaffold0019 (15-137)||(168781-168903)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (15-148)||(21595890-21596023)
chr6 (15-149)||(32806124-32806258)
chr6 (15-148)||(25055919-25056052)
chr6 (15-148)||(24160616-24160749)
chr6 (15-137)||(9932177-9932300)
chr6 (15-137)||(3539714-3539837)
chr6 (15-128)||(26514809-26514923)
chr6 (15-148)||(6778222-6778355)
chr6 (15-137)||(5670649-5670772)
chr6 (15-137)||(8667598-8667720)
chr6 (15-137)||(16698576-16698698)
chr6 (15-85)||(5988427-5988497)
chr6 (90-148)||(14479843-14479901)
chr6 (23-120)||(26604996-26605093)
chr6 (23-148)||(15643077-15643203)
chr6 (22-59)||(14479775-14479812)
chr6 (15-60)||(24879532-24879577)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (15-137)||(11577-11699)
scaffold0298 (15-137)||(15347-15469)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (15-137)||(175268-175390)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (15-137)||(28272-28394)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (15-137)||(349979-350101)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (15-137)||(9409-9532)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (15-137)||(12861-12984)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (15-137)||(11859-11983)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (15-137)||(25022-25145)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (15-137)||(7398-7519)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (15-70)||(75892-75947)
scaffold0014 (92-151)||(75664-75723)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (15-76)||(402-463)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (23-128)||(15851-15955)
scaffold0059 (23-128)||(14605-14710)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (23-149)||(6191-6317)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (30-70)||(45670-45710)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 36468931 - 36468796
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
36468931 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaagtgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 36468832  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat 150  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
36468831 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaat 36468796  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 33248656 - 33248789
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||    
33248656 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattataattatgtgt 33248755  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
33248756 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 33248789  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20962751 - 20962631
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
20962751 acaaacaatttatacccaaacact--atgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacagaaacgatcctattatacttacgtgt 20962654  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
20962653 aaatagttttatgagatgtaaaa 20962631  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 4742495 - 4742363
Alignment:
17 aaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
4742495 aaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgtaa 4742396  T
117 atagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
    |||||||||  | |||||||| | |||||||||    
4742395 atagttttaatacatgtaaaaatcttacatcaa 4742363  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7652717 - 7652595
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
7652717 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 7652618  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
7652617 aaatagttttatgagaggtaaaa 7652595  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 48167677 - 48167551
Alignment:
24 ttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
48167677 ttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtcgaaacgatcctattatacttacgtataaatagttt 48167578  T
124 tatgatatgtaaaacttttacatcaat 150  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||    
48167577 tatgacatgtaaaaatcttacatcaat 48167551  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 9990062 - 9990184
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
9990062 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 9990161  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
9990162 aaatagttttatgagaggtaaaa 9990184  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52307580 - 52307458
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||    
52307580 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacacgatcctattatacttacgtgt 52307481  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
52307480 aaatagttttatgagaggtaaaa 52307458  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10385565 - 10385442
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
10385565 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 10385466  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
10385465 taaatagttttatgagaggtaaaa 10385442  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 8626290 - 8626413
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
8626290 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 8626389  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
8626390 taaatagttttatgagaggtaaaa 8626413  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27850046 - 27849924
Alignment:
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    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||| || |||    
27850046 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgtggacacgatcctattatactcacatgt 27849947  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
27849946 aaatagttttatgagatggaaaa 27849924  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 37023357 - 37023490
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |  ||||| ||||||||||||||||    
37023357 acaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgtaactccctgtggactcgatcatattatacttacgtgt 37023456  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
37023457 aaatagttttatgagatgtaaaaatcttacatca 37023490  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 23382971 - 23383094
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
23382971 acaaacaattaatacccaaacacttaacgtcacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 23383070  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
23383071 taaatagttttatgagaggtaaaa 23383094  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 22098647 - 22098769
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||||||| || |||    
22098647 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgtttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctattatactcacatgt 22098746  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
22098747 aaatagttttatgagatggaaaa 22098769  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 23396965 - 23397074
Alignment:
17 aaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||||    
23396965 aaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatg-aatacgcaactccctgtggatacgatcctatatatacttacgtgta 23397063  T
116 aatagttttat 126  Q
    |||||||||||    
23397064 aatagttttat 23397074  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11260282 - 11260201
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgat 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
11260282 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaagtccctgcggaaacgat 11260201  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Original strand, 27104697 - 27104823
Alignment:
23 tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| || |||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||| || | |||||||||    
27104697 tttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacacaacttcctacagaaacgatcatattatactcacttataaatagtt 27104796  T
123 ttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||    
27104797 atatgacatgtaaaaatcttacatcaa 27104823  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Original strand, 20837760 - 20837820
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatac 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
20837760 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtaaaaatgcttatgaaatac 20837820  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 148
Target Start/End: Original strand, 2357901 - 2357959
Alignment:
90 aaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
2357901 aaacgatcatattatacttacgtgtaaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 2357959  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11257904 - 11257858
Alignment:
91 aacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
11257904 aacgatcctattatacttatgtgtaaatagttttatgagatgtaaaa 11257858  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 22098333 - 22098373
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
22098333 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattg 22098373  T

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Target: chr7 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 31879265 - 31879399
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
31879265 acaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 31879364  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
31879365 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaa 31879399  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12089954 - 12089818
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
12089954 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 12089855  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaatc 151  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
12089854 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaatc 12089818  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 2478327 - 2478461
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
2478327 acaaacaatttatacccaagcacttaatgtgaaaaatattgtggaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 2478426  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
2478427 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaa 2478461  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2797058 - 2796939
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
2797058 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttttgaaatacgcaactccatgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 2796959  T
115 aaatagttttatgatatgta 134  Q
    |||||||||||||| |||||    
2796958 aaatagttttatgacatgta 2796939  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8107383 - 8107261
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
8107383 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 8107284  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
8107283 aaatagttttatgagaggtaaaa 8107261  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 31882777 - 31882910
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||    
31882777 acaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgcggaaacgatcctattatactcacgtgt 31882876  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |   |||||||||| |||||||| ||||||||||    
31882877 agtaagttttatgacatgtaaaatttttacatca 31882910  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31664007 - 31663875
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||    
31664007 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcaaccccttgcaaaaacgatcctattatacttacgtgt 31663908  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatc 147  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||||    
31663907 aaatggttttatgacatgtaaaaatcttacatc 31663875  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10345801 - 10345679
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
10345801 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 10345702  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
10345701 aaatagttttatgagaggtaaaa 10345679  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 23795760 - 23795882
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
23795760 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 23795859  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
23795860 aaatagttttatgagaggtaaaa 23795882  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3544373 - 3544240
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||| |||    
3544373 acaaacactttatacccaaacatttaatgcgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacaattctattatacttacttgt 3544274  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
3544273 aaatagttttatgacatgtaaaaactttacatca 3544240  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 2632063 - 2632185
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||||    
2632063 acaaataatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatactcacgtgt 2632162  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
2632163 aaatagttttatgagaggtaaaa 2632185  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19471729 - 19471607
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
19471729 acaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 19471630  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
19471629 aaatagttttatgagatggaaaa 19471607  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 12184526 - 12184661
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |  ||||||||| |||||| |||||    
12184526 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgtggattcgatcctatatatactcacgtg 12184625  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
12184626 taaatagttttatgagatgtaaaaatcttacatcaa 12184661  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22321296 - 22321173
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
22321296 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 22321197  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
22321196 taaatagttttatgagaggtaaaa 22321173  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 24483412 - 24483545
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||    
24483412 acaaacaatttatacccaaacacttgatgtgataaatattatgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcgaaaa-tatcctgttatacttacgtgt 24483510  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat 150  Q
    |||||  ||||||| |||||||| | ||||||||||    
24483511 aaataactttatgacatgtaaaa-tcttacatcaat 24483545  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31157771 - 31157648
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
31157771 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 31157672  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
31157671 taaatagttttatgagaggtaaaa 31157648  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 6173182 - 6173304
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||    
6173182 acaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacatgt 6173281  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
6173282 aaatagttttatgagaggtaaaa 6173304  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 22825275 - 22825397
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||    
22825275 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattatgaaaatgcttatgaaatacacaactctctatggacacgatcctattatactcacgtgt 22825374  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
22825375 aaatagttttatgagatggaaaa 22825397  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 45500206 - 45500084
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| ||||||||| ||||||    
45500206 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgagaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtagaaacgatcatattatactcacgtgt 45500107  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||| ||||| ||||||||    
45500106 aaatagttctatgacatgtaaaa 45500084  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 12191508 - 12191642
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |  ||||||||| |||||| |||||    
12191508 acaaacaatttataccctaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggattcgatcctatatatactcacgtg 12191607  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
12191608 taaatagttttatgagttgtaaaaatcttacatca 12191642  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Original strand, 1954593 - 1954675
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatc 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
1954593 acaaacaatttatacccaagcacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgcggaaacgatc 1954675  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 4704873 - 4704809
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaa 79  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
4704873 acaaacaatttatacccaagcacttaatgtgataaatactgtgaaaatacttatgaaatatgcaa 4704809  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4704810 - 4704776
Alignment:
90 aaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtttt 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
4704810 aaacgattctattatacttacgtgtaaatagtttt 4704776  T

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Target: chr4 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 55327438 - 55327571
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
55327438 acaatcaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcatattatacttacgtgt 55327537  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
55327538 aaatagttttatgatatgtaaaaatcttacatca 55327571  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 35416191 - 35416058
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
35416191 acaaataatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 35416092  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
35416091 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 35416058  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26373126 - 26372992
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||    
26373126 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgcggaaacgatcctatcatacttacgtgt 26373027  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
26373026 aaatagttttatgaaatgtaaaaatcttacatcaa 26372992  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21668399 - 21668265
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
21668399 acaaacactttatacctaaacactttatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 21668300  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
21668299 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaa 21668265  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21677163 - 21677029
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
21677163 acaaacactttatacctaaacactttatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 21677064  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
21677063 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaa 21677029  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 1188631 - 1188764
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
1188631 acaaacaatttatacccacacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacggaaacgatcctattatactaacgtgt 1188730  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||  | |||||||| | ||||||||    
1188731 aaatagttttaatacatgtaaaaatcttacatca 1188764  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30217881 - 30217749
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
30217881 acaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgcgaaaacgatcttattatacttacgtgt 30217782  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||| | ||||||| |||||||| | ||||||||    
30217781 aaat-ggtttatgacatgtaaaaatcttacatca 30217749  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 52619169 - 52619302
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||    
52619169 acaaacaatttataaacaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccgtgcggaaacgatcctgttatacttacgtgt 52619268  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
52619269 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 52619302  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4838631 - 4838509
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
4838631 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 4838532  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
4838531 aaatagttttatgagaggtaaaa 4838509  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5273058 - 5272936
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
5273058 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 5272959  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
5272958 aaatagttttatgagaggtaaaa 5272936  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 22048348 - 22048470
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
22048348 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 22048447  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
22048448 aaatagttttatgagaggtaaaa 22048470  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40995042 - 40994920
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||    
40995042 acaaacactttatacccaaacacttaatgtgacaagtattgtgaaaatgcatatgaaatacgcaactccctgtagaaacgatcttattatacttacgtgt 40994943  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
40994942 aaatagttttatgacatgtaaaa 40994920  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 33239586 - 33239705
Alignment:
18 aacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
33239586 aacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgtaaa 33239685  T
118 tagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||| |||| | ||||||    
33239686 tagtttaatgagaggtaaaa 33239705  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 26070394 - 26070504
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
26070394 acaaacaatttgttcccaaacaattaatgtggcaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgt 26070493  T
115 aaatagtttta 125  Q
    |||||||||||    
26070494 aaatagtttta 26070504  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 42532381 - 42532267
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||     
42532381 acaaacaatttatacccaaacagttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttacgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctatatatactcacgta 42532282  T
114 taaatagttttatga 128  Q
    |||||||||||||||    
42532281 taaatagttttatga 42532267  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 46691531 - 46691400
Alignment:
16 caaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgta 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||    
46691531 caaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaacattatgaaaatacttatgaaatacgcaactccttacaaaaacgatcctattatactcacatgta 46691432  T
116 aatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    ||||| ||||| | |||||||| | ||||||||    
46691431 aatag-tttatcacatgtaaaaatcttacatca 46691400  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 324105 - 324228
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||| | |||    
324105 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatactcatgtg 324204  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
324205 taaatagttttatgagaggtaaaa 324228  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 44428886 - 44428762
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaac-tccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||| |||||||||||    
44428886 acaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttccctgtggacacgatcctatatatacttacgt 44428787  T
113 gtaaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
44428786 gtaaatagttttatgagaggtaaaa 44428762  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19247322 - 19247214
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||    
19247322 acaaacaatttatactcaaacacttaatgggataaacattgtgaaaatac--atgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcttattatactcacgtgt 19247225  T
115 aaatagtttta 125  Q
    |||||||||||    
19247224 aaatagtttta 19247214  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Original strand, 42272045 - 42272143
Alignment:
17 aaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgta 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
42272045 aaacactttatacccaaacacttaaagtgataaatattgtgaacatacttatgaaatatgcaactccatgcggaaacgatcctattatacttacgtgta 42272143  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24576924 - 24576812
Alignment:
17 aaacaatttataccc-aaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgct---tatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
24576924 aaacaatttataccccaaacatttaatgtgataaacattgtgaaaatactaattatgaaatacgcaattccctacgaaaacgatcatattatactcatgt 24576825  T
113 gtaaatagtttta 125  Q
    |||||||||||||    
24576824 gtaaatagtttta 24576812  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19730982 - 19730893
Alignment:
48 aaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||    
19730982 aaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacatgtgaaaagttttatgagaggtaaaa 19730893  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Original strand, 20949422 - 20949546
Alignment:
23 tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| || |||||||||| ||  || || ||||| ||||||||| || ||||||||| |    
20949422 tttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacgcaacttccagcggaatcgatcttattatactcacatgtaaatag-t 20949520  T
123 ttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||    
20949521 ttatgacatgtaaaaatcttacatca 20949546  T

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Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 28457372 - 28457239
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
28457372 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcatattatacttacgtgt 28457273  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
28457272 aaatagttttatgacatgtaaaaatattacatca 28457239  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36557057 - 36556924
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
36557057 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgcggaaacgatcatattatacttacgtgt 36556958  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
36556957 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 36556924  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23924524 - 23924392
Alignment:
18 aacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
23924524 aacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacggaaacgatcctattatactcacgtgtaaa 23924425  T
118 tagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat 150  Q
    ||||||||||| ||||| || | ||||||||||    
23924424 tagttttatgacatgtacaaatcttacatcaat 23924392  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 28006750 - 28006882
Alignment:
14 cacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
28006750 cacaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaacttcctacggaaacgatcctattatacttacgtg 28006849  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaacttttacat 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
28006850 taaatagttttatgacatgtaaaaatcttacat 28006882  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 14701311 - 14701446
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
14701311 acaaacaatttatactcaaacactcaatgtgataaatattatgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatccaattatacttacgtgt 14701410  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat 150  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
14701411 aaatagttttatgacatgtaaaaatattacatcaat 14701446  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 42700469 - 42700347
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
42700469 acaaacaatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 42700370  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
42700369 aaatagttttatgagatgtaaaa 42700347  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8679290 - 8679155
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
8679290 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaattattcaactccctgtggaaacgatcctattatacttacgtgt 8679191  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat 150  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
8679190 aaatagttttatgagatgtaaaaatcttacatcaat 8679155  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 27258051 - 27258184
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||    
27258051 acaaacactttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctgcggaaacaatcatattatacttacgtgt 27258150  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
27258151 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 27258184  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 43992180 - 43992301
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||    
43992180 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgtg-gaacgatcctattatacttacgtgt 43992278  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
43992279 aaatagttttatgacatgtaaaa 43992301  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36039757 - 36039635
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    
36039757 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcatatgaaatacgcaactccttgtgaacacgatcctattatacttacgtgt 36039658  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
36039657 aaatagttttatgagatggaaaa 36039635  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36667383 - 36667250
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||    
36667383 acaaacaatttatattcaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacatgt 36667284  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||  | |||||||| | ||||||||    
36667283 aaatagttttaatacatgtaaaaatcttacatca 36667250  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 29224381 - 29224504
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||| |||||    
29224381 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatactcacgtg 29224480  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
29224481 taaatagttttatgagaggtaaaa 29224504  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 29337680 - 29337803
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||| |||||    
29337680 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatactcacgtg 29337779  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
29337780 taaatagttttatgagaggtaaaa 29337803  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13229837 - 13229704
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||    
13229837 acaaacaatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattataaaaatgcttataaaatacgcaactccatgtggaaacgatcatattatacttacgtgt 13229738  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
13229737 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 13229704  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 32523597 - 32523730
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||||||    
32523597 acaaacactttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgtttatgaaatatgcaactccctgcagaaacaatcatattatagttacgtgt 32523696  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
32523697 aaataattttatgacatgtaaaaatcttacatca 32523730  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24662614 - 24662486
Alignment:
23 tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt 122  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||  ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
24662614 tttatacccaaacacctaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacgcaactccctgcagaaacgatcctattatactcacgtgtaaatagtt 24662515  T
123 ttatgatatgtaaaacttttacatcaatc 151  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||||    
24662514 atatgacatgtaaaaatcttacatcaatc 24662486  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 31759011 - 31759078
Alignment:
81 tccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
31759011 tccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 31759078  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 9783701 - 9783633
Alignment:
81 tccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||||    
9783701 tccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgtaaagagttttatgacatgtaataatcttacatcaa 9783633  T

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Target: chr1 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 40999599 - 40999464
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
40999599 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaattacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 40999500  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat 150  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
40999499 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaat 40999464  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20225857 - 20225724
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
20225857 acaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtaaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgcggaaacgatcctattatactttcgtgt 20225758  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
20225757 aaatagttttatgacatgtaaaactcttacatca 20225724  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 16131168 - 16131303
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||    
16131168 acaaacaatttatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccgtgcggaaacgatcctattatacttacttgt 16131267  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaat 150  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
16131268 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaat 16131303  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16832278 - 16832156
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
16832278 acaaacaatttatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgt 16832179  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
16832178 aaatagttttatgagatgtaaaa 16832156  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11738293 - 11738160
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
11738293 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaattattgtgaaaatgcttatgaaatacgaaactccctgcggaaatgatcctattatacttacgtgt 11738194  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
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11738193 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 11738160  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13217539 - 13217410
Alignment:
19 acaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
13217539 acaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgtaaat 13217440  T
119 agttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
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13217439 aattttatgacatgtaaaaatcttacatca 13217410  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39000676 - 39000554
Alignment:
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39000676 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 39000577  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
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39000576 aaatagttttatgagaggtaaaa 39000554  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33491693 - 33491571
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
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33491693 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtagacacgatcctattatacttacgtgt 33491594  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
33491593 aaatagttttatgagaggtaaaa 33491571  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12167711 - 12167598
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
12167711 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgtttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 12167612  T
115 aaatagttttatga 128  Q
    ||||||||||||||    
12167611 aaatagttttatga 12167598  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 431836 - 431713
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
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431836 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 431737  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
431736 taaatagttttatgagaggtaaaa 431713  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38121427 - 38121305
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||    
38121427 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcttattatacttacgtgt 38121328  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||| |||||||| | ||||||    
38121327 aaataattttatgagaggtaaaa 38121305  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9667191 - 9667069
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
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9667191 acaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgcgaaaatgcttatgaactacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 9667092  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
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9667091 aaatagttttatgagaggtaaaa 9667069  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 49249730 - 49249853
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| ||||||||||||    
49249730 acaaacaatttatatccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctatggacacgatcatatatatacttacgtg 49249829  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
49249830 taaatagttttatgagaggtaaaa 49249853  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 148
Target Start/End: Original strand, 25242523 - 25242612
Alignment:
59 aaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||| | |||| | ||| | || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||    
25242523 aaatgcttatgacacacgctaatccttgcggaaacaatcatattatactcacgtgtaaatagttatataacatgtaaaaatcttacatca 25242612  T

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Target: chr8 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 16959218 - 16959351
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
16959218 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgt 16959317  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
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16959318 aaatagttttatgaca-gtaaaaatcttacatcaa 16959351  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11308482 - 11308360
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
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11308482 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 11308383  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
11308382 aaatagttttatgagaggtaaaa 11308360  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9067662 - 9067540
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
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9067662 acaaacaatttatacccaaacacttaaagtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 9067563  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
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9067562 aaatagttttatgagaggtaaaa 9067540  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 22181243 - 22181365
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
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22181243 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 22181342  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
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22181343 gaatagttttatgagatggaaaa 22181365  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41576826 - 41576704
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
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41576826 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 41576727  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
41576726 aaatagttttatgagaggtaaaa 41576704  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 28370760 - 28370883
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
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28370760 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctatggacacgatcctatatatacttacatg 28370859  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
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28370860 taaatagttttatgagaggtaaaa 28370883  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8742778 - 8742656
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
8742778 acaaacaatttatacccaaacatttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 8742679  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
8742678 aaatagttttatgagaggtaaaa 8742656  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28925638 - 28925515
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
28925638 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgggaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 28925539  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
28925538 taaatagttttatgagaggtaaaa 28925515  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 3299468 - 3299590
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||    
3299468 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtaacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttatgtgt 3299567  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
3299568 aaatagttttatgagaggtaaaa 3299590  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 27348693 - 27348815
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||| |||||||||||||||||    
27348693 acaaacaatttataccccaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaattccctgtggacacgattctattatacttacgtgt 27348792  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
27348793 aaatagttttatgagaggtaaaa 27348815  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34006268 - 34006146
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||     
34006268 acaaataatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattgtaaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctgtggacacgatcctattatacttacgtgc 34006169  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
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34006168 aaatagttttatgagatggaaaa 34006146  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13848814 - 13848689
Alignment:
23 tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||  || |||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||    
13848814 tttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaattgcttaagatatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacttgtaaatagtt 13848715  T
123 ttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||    
13848714 ttatgacatgtaaaaatcttacatca 13848689  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 137
Target Start/End: Original strand, 16583062 - 16583166
Alignment:
34 acacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtgtaaatagttttatgatatg 132  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
16583062 acacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgtggacacgatcctatatatacttacgtgtaaatagttttatgagagg 16583161  T
133 taaaa 137  Q
    |||||    
16583162 taaaa 16583166  T

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Target: chr5 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 6270557 - 6270690
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
6270557 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgcaatacgcaactccctacgaaaatgatcctattatactcacgtgt 6270656  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
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6270657 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 6270690  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27166593 - 27166460
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
27166593 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactgacgtgt 27166494  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
27166493 aaatagttttatgagatgtaaaaatcttacatca 27166460  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16904104 - 16903982
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
16904104 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 16904005  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
16904004 aaatagttttatgagaggtaaaa 16903982  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 9405091 - 9405213
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
9405091 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 9405190  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
9405191 aaatagttttatgagaggtaaaa 9405213  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30606571 - 30606449
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30606571 acaaacaatttataccctaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 30606472  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
30606471 aaatagttttatgagaggtaaaa 30606449  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 34456962 - 34457084
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
34456962 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 34457061  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
34457062 aaatagttttatgagaggtaaaa 34457084  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 7315873 - 7315984
Alignment:
17 aaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaa 116  Q
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7315873 aaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgtaa 7315972  T
117 atagttttatga 128  Q
    ||||||||||||    
7315973 atagttttatga 7315984  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11722771 - 11722649
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
11722771 acaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 11722672  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
11722671 aaatagttttatgagaggtaaaa 11722649  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 14345127 - 14345249
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
14345127 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaacattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 14345226  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
14345227 aaatagttttatgagaggtaaaa 14345249  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 24836389 - 24836511
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||    
24836389 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctttggacacgatcctattatacttacgtgt 24836488  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
24836489 aaatagttttatgagaggtaaaa 24836511  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 11767421 - 11767544
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
11767421 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 11767520  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
11767521 taaatagttttatgagaggtaaaa 11767544  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 33435269 - 33435391
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | |||||||||||||||||||||||    
33435269 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctttgtggacacgatcctattatacttacgtgt 33435368  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
33435369 aaatagttttatgagaggtaaaa 33435391  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34869239 - 34869117
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || |||    
34869239 acaaacaatttatacctaaacacttaatatgataaatattatgaaaatacttatgaaatacgcaatttcctacggaaacgatcctattatactcacatgt 34869140  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
34869139 aaatagttttatgacatgtaaaa 34869117  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 31846616 - 31846735
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
31846616 acaaacaatttatacccaaacacct---gtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctatggacacgatcctattatacttacgtgt 31846712  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
31846713 aaatagttttatgagaggtaaaa 31846735  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 42800980 - 42801094
Alignment:
23 tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt 122  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||  ||||||||| || |  ||||||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
42800980 tttatacccaaacacttaatataataaatgatgttgaaatgcttaagatacgcgcaactccatgcggaaacgatcctattatagtcacgtgtaaatagtt 42801079  T
123 ttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||| ||||||||    
42801080 ttatgacatgtaaaa 42801094  T

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Target: scaffold0019 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 116063 - 115929
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
116063 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgt 115964  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
115963 aaatagttttaatatatgtaaaaatcttacatcaa 115929  T

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Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 168903 - 168781
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
168903 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 168804  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    || ||||||||||| | ||||||    
168803 aagtagttttatgagaagtaaaa 168781  T

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Target: chr6 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21596023 - 21595890
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
21596023 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcacctccctgcggaaacgatcctattatactcacgtgt 21595924  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
21595923 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 21595890  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32806258 - 32806124
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||    
32806258 acaaacaaattatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggaaacgatcctatcatacttacgtgt 32806159  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
32806158 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaa 32806124  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25056052 - 25055919
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
25056052 acaaacaatttatactcaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcttattatacttacgtgt 25055953  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||  | |||||||| | ||||||||    
25055952 aaatagttttaatacatgtaaaaatcttacatca 25055919  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24160749 - 24160616
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||    
24160749 acaaataatttatacccaaccacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgcggaaacgatcctattatacttacatgt 24160650  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
     ||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
24160649 taatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 24160616  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9932300 - 9932177
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
9932300 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 9932201  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||| |||||||||| | ||||||    
9932200 taaagagttttatgagaggtaaaa 9932177  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 3539714 - 3539837
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||||    
3539714 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacacgatcctatatatacttacgtg 3539813  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
3539814 taaatagttttatgagaggtaaaa 3539837  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26514923 - 26514809
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | | |||||||| ||||||||||||    
26514923 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacaagatcctatatatacttacgtg 26514824  T
114 taaatagttttatga 128  Q
    |||||||||||||||    
26514823 taaatagttttatga 26514809  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 6778222 - 6778355
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||| || |||    
6778222 acaaacaatttatacccaaatacttaaagtgataaacattgtgaatatgcttatgaaatatgcaactccctgcagaaacgatcatattatactcacatgt 6778321  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
6778322 aaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatca 6778355  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5670772 - 5670649
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||| |||||| |||||    
5670772 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaaaacgcaactccctgtggacacgatcctatatatactcacgtg 5670673  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
5670672 taaatagttttatgagaggtaaaa 5670649  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 8667598 - 8667720
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
8667598 acaaacaatttataccctaacacttaacttgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 8667697  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
8667698 aaatagttttatgagaggtaaaa 8667720  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 16698576 - 16698698
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | | || ||||||||||||| ||||||    
16698576 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcttgtggacacaatcctattatactcacgtgt 16698675  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
16698676 aaatagttttatgagatggaaaa 16698698  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5988497 - 5988427
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccct 85  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
5988497 acaaacattttatacccaaacagttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccct 5988427  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 148
Target Start/End: Original strand, 14479843 - 14479901
Alignment:
90 aaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
14479843 aaacaatcctattatacttacatgtaaatagttttatgagatgtaaaaatcttacatca 14479901  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Original strand, 26604996 - 26605093
Alignment:
23 tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatag 120  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||| | ||| |  ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
26604996 tttatacccaaacacttaagatgataaatatcgttaaaatgcttatcagatacgctagtccgtgtgaaaatgatcctaatatactcacgtataaatag 26605093  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Original strand, 15643077 - 15643203
Alignment:
23 tttatacccaaacacttaatgtgataaa-tattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagt 121  Q
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15643077 tttacacccaaacacttaatatgataaaatgatgttgaaatgcttgagatatgtgcaactccctgcaaaaatgatccaattatactcacgtgtaaatact 15643176  T
122 tttatgatatgtaaaacttttacatca 148  Q
    | ||||| |||||||| | ||||||||    
15643177 tatatgacatgtaaaaatcttacatca 15643203  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 59
Target Start/End: Original strand, 14479775 - 14479812
Alignment:
22 atttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
14479775 atttatacccaaacacttaatgtgacaaaaattgtgaa 14479812  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Original strand, 24879532 - 24879577
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaa 60  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||    
24879532 acaaacaatttatacccaaatacttaaaatgataaatattatgaaa 24879577  T

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Target: scaffold0298 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11699 - 11577
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
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11699 acaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 11600  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
11599 aaatagttttatgagaggtaaaa 11577  T

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Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15469 - 15347
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
15469 acaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 15370  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
15369 aaatagttttatgagaggtaaaa 15347  T

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Target: scaffold0015 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 175268 - 175390
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
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175268 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 175367  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
175368 aaatagttttatgagaggtaaaa 175390  T

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Target: scaffold0159 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28394 - 28272
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
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28394 acaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 28295  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
28294 aaatagttttatgagaggtaaaa 28272  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 350101 - 349979
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
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350101 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgt 350002  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
350001 aaatagttttgtgagaggtaaaa 349979  T

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Target: scaffold0336 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 9409 - 9532
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
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9409 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 9508  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
9509 taaatagttttatgagaggtaaaa 9532  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 12861 - 12984
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
12861 acaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 12960  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
12961 taaatagttttatgagaggtaaaa 12984  T

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Target: scaffold0444 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11983 - 11859
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaac-tccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||| |||||||||||    
11983 acaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttccctgtggacacgatcctatatatacttacgt 11884  T
113 gtaaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
11883 gtaaatagttttatgagaggtaaaa 11859  T

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Target: scaffold0076 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25145 - 25022
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctat-tatacttacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
25145 acaaacaatttatacccaaacacttaacgcggcaaatattgtgaaaatgcctatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatatacttacgtg 25046  T
114 taaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
25045 taaatagttttatgagaggtaaaa 25022  T

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Target: scaffold0147 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 7398 - 7519
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||| ||||||    
7398 acaaacaatttatatccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactcccggtggacac-atcctattatactcacgtgt 7496  T
115 aaatagttttatgatatgtaaaa 137  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
7497 aaatagttttatgagaggtaaaa 7519  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 75947 - 75892
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatga 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
75947 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatga 75892  T

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Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 75723 - 75664
Alignment:
92 acgatcctattatacttacgtgtaaatagttttatgatatgtaaaacttttacatcaatc 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
75723 acgatcctattatactcacgtgtaaatagttttatgacatgtaaaaatcttacatcaatc 75664  T

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Target: scaffold0457 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 402 - 463
Alignment:
15 acaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacg 76  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
402 acaaacattttaaacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgagatacg 463  T

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Target: scaffold0059 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15955 - 15851
Alignment:
23 tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
15955 tttaaacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgtttaagatatacgcaacttcctgcgaaaacgatcctattatactcacgtgtaaa-agtt 15857  T
123 ttatga 128  Q
    ||||||    
15856 ttatga 15851  T

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Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14710 - 14605
Alignment:
23 tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| || ||| ||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
14710 tttaaacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatatgcaactctctgcggaaacgatcctattatactcatgtgtaaatagtt 14611  T
123 ttatga 128  Q
    | ||||    
14610 taatga 14605  T

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Target: scaffold0060 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6317
Alignment:
23 tttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacgaaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagtt 122  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||  || || | ||||| || |||||||| | ||||||| || |||||||||||    
6191 tttatacccaaatacttaagatgataaatattgtttaaatgcttatgaggtaagctagtccctgcggaaacgatcatgttatactcacatgtaaatagtt 6290  T
123 ttatgatatgtaaaacttttacatcaa 149  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||    
6291 atatgacatgtaaaaatcttacatcaa 6317  T

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Target: scaffold0045 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 45710 - 45670
Alignment:
30 ccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatga 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
45710 ccaaacacttaatgtgataaatattgcgaaaatgcttatga 45670  T

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