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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1348_low_48 (Length: 380)
Name: NF1348_low_48
Description: NF1348
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1348_low_48 |
 | |
|
| [»] scaffold0239 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1335 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0380 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0734 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0264 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0154 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0983 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0789 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0037 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0011 (3 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0768 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0366 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1515 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0427 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0308 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0654 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0007 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0444 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0166 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0060 (3 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0459 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0074 (3 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0330 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0172 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0027 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0262 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0533 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0130 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0015 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0236 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0005 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0140 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0475 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0024 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0001 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0187 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0496 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0268 (1 HSPs) |
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| [»] scaffold0263 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 207)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15286599 - 15286253
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15286599 |
attgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataactttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
15286500 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaacttaatcatacaatttgggacg |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15286499 |
ttttcctttatcttttttatattatttattaagaacaattttataaaacaactcataatatatttttttcacataaaacttaatcatacaatttgagacg |
15286400 |
T |
|
| Q |
201 |
gatggatggagtagtcattattacaatcaattaaatttacaattataacatatactaacaaggaaacaaggaataataactattcaatgttttcttatta |
300 |
Q |
| |
|
|| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15286399 |
gaggga----gtgctcattgttacaatcaattaaatttacaattataacatatactaacaaggaaacaaggaataataactattcaatgttttgttatta |
15286304 |
T |
|
| Q |
301 |
ccatttgaaggcaattacaagaaataataatattgacttgtaatcagaaac |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15286303 |
ccatttgaaggcaattacaagaaataataatattgacttgtaatccgaaac |
15286253 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15466968 - 15466622
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15466968 |
attgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataactttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
15466869 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaacttaatcatacaatttgggacg |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15466868 |
ttttcctttatcttttttatattatttattaagaacaattttataaaacaactcataatatatttttttcacataaaacttaatcatacaatttgagacg |
15466769 |
T |
|
| Q |
201 |
gatggatggagtagtcattattacaatcaattaaatttacaattataacatatactaacaaggaaacaaggaataataactattcaatgttttcttatta |
300 |
Q |
| |
|
|| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15466768 |
gaggga----gtgctcattgttacaatcaattaaatttacaattataacatatactaacaaggaaacaaggaataataactattcaatgttttgttatta |
15466673 |
T |
|
| Q |
301 |
ccatttgaaggcaattacaagaaataataatattgacttgtaatcagaaac |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15466672 |
ccatttgaaggcaattacaagaaataataatattgacttgtaatccgaaac |
15466622 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 9724626 - 9724801
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9724626 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
9724725 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9724726 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
9724801 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12988220 - 12988046
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12988220 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttctttcaattc |
12988121 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
12988120 |
tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
12988046 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 29342749 - 29342923
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
29342749 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaattc |
29342848 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29342849 |
tttcatttatttttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttctacacaa |
29342923 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 28719724 - 28719899
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28719724 |
attgtcccaaattatatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgattatttattactctctcttctttcaatt |
28719823 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28719824 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
28719899 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1513562 - 1513388
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1513562 |
ttgtcccaaattatatgccgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctatcttctttcaattc |
1513463 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
1513462 |
tttcatttatctttcccatattatatattatggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
1513388 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3598880 - 3598706
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3598880 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatattatttttcttattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattc |
3598781 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3598780 |
tttcatttattttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaa |
3598706 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26394058 - 26393884
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26394058 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattc |
26393959 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
26393958 |
tttcatttatctttcacatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttcaacacaa |
26393884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 9470849 - 9471024
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9470849 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattaccctctcttctttcaatt |
9470948 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
9470949 |
ctttcatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaa |
9471024 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 21545298 - 21545457
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21545298 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaatta |
21545397 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21545398 |
tttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
21545457 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 28712377 - 28712552
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28712377 |
attgtcccaaattatatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgattatttattactctctcttctttcaatt |
28712476 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28712477 |
ctttcatttatctttcccatattatttaataagaacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
28712552 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31602952 - 31602793
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31602952 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaatta |
31602853 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31602852 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
31602793 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42827723 - 42827551
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
42827723 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgctacgtttcctattataaccttagctatttattactc--tcttatttcaattc |
42827626 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42827625 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
42827551 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34141656 - 34141482
Alignment:
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2 |
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101 |
Q |
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34141656 |
ttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttgtttttcctattatatccttaactatttattactctttattctttcaatta |
34141557 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
34141556 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
34141482 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 34356557 - 34356731
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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|
| T |
34356557 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatacaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
34356656 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
34356657 |
tttcatttctcttttccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
34356731 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 39628885 - 39629059
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
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|
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|
|
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39628984 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
39628985 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaa |
39629059 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 39638435 - 39638609
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
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|
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|
|
| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagttatttattactctctcttctttcaattc |
39638534 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39638535 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaa |
39638609 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44263345 - 44263171
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
44263345 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgcaactttaatgttatttttcgtattataaccttcactatttattactctcttttctttcaattc |
44263246 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
44263245 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaa |
44263171 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26805060 - 26804891
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5 |
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104 |
Q |
| |
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| T |
26805060 |
tcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattcttt |
26804961 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacac |
174 |
Q |
| |
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| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
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| T |
26804960 |
catttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacac |
26804891 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25838711 - 25838539
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25838711 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
25838612 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacac |
174 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25838611 |
ttttatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacac |
25838539 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 543812 - 543637
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100 |
Q |
| |
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| T |
543812 |
ttgtaccaaattatatgtcgctttacaatacccatgtaacattaatgttactttttccaattataacattaattatttattactccctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
543712 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatattttccacacaa |
543637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 11181285 - 11181460
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| Q |
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100 |
Q |
| |
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11181384 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
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|
| T |
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atttcatttatttttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaa |
11181460 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 28727366 - 28727541
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| Q |
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Q |
| |
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|
|
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
28727466 |
ctttcatttatctttcccatattatttaataagaacaattttataaaacaactcataatatctattttccacacaa |
28727541 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 29867299 - 29867474
Alignment:
| Q |
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Q |
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|
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|
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29867398 |
T |
|
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |
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|
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29867399 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaatacctcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 44052914 - 44053089
Alignment:
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Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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attgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaacattaatgttactttttctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
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44053014 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaa |
44053089 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
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|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
4924448 |
ttgtcctaaattatatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttccaattataactttaactatttattattatctcttctttcaattt |
4924547 |
T |
|
| Q |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
4924548 |
tttcatttatctttctcatattatttattaagggcaattttgtaaaacaactcataatatcttttttctacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5449540 - 5449366
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
|
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 13429111 - 13429285
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| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
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13429111 |
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13429210 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
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105 |
Q |
| |
|
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T |
|
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ctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
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Q |
| |
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|
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ctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
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| |
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|
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atttatctttctcataatatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
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| |
|
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|
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
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Target Start/End: Complemental strand, 548226 - 548088
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137 |
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138 |
attttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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|
| T |
548126 |
attttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaa |
548088 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4395503 - 4395330
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2 |
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101 |
Q |
| |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattatatcat-aactatatattactctctcttatttcaattc |
4395405 |
T |
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102 |
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176 |
Q |
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| T |
4395404 |
tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
4395330 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7427408 - 7427234
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2 |
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101 |
Q |
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7427408 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
7427309 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
7427308 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
7427234 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10709338 - 10709164
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2 |
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101 |
Q |
| |
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10709338 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactcatgcaacattaatattacttttccaattacaaccttaattaattattactccctcttctttcaattc |
10709239 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
10709238 |
tttcatttatcttccccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatattttccacacaa |
10709164 |
T |
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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
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Target Start/End: Original strand, 30526200 - 30526374
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101 |
Q |
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| T |
30526200 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaacaatttattactctctcttctttcaattc |
30526299 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
30526300 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
30526374 |
T |
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Target: chr8; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 17833951 - 17834117
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100 |
Q |
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attgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttaat---------tctttcaatt |
17834041 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
17834042 |
ctttcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
17834117 |
T |
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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17949675 - 17949504
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtctcaaattatatgtcgctttacggtaccaatgaaatattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactccttcttctttcaatta |
17949576 |
T |
|
| Q |
102 |
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172 |
Q |
| |
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| T |
17949575 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctcttttccac |
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T |
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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 42981243 - 42981410
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| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
42981243 |
aaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatt |
42981342 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
42981343 |
tatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2120498 - 2120324
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2 |
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Q |
| |
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| T |
2120498 |
ttgtcccaaattatacgttgttttacaatgtcaatgcaacattaatgttacttttcctattataatcttaactgtttattactctctcttctttcaattc |
2120399 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatctttcacatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccatacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14433387 - 14433213
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Q |
| |
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| T |
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14433288 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
14433287 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
14433213 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
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Q |
| |
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18673510 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
18673511 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactaataatatatctttcccacacaa |
18673585 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
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Target Start/End: Original strand, 22578248 - 22578422
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| |
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22578248 |
ttgtcccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
22578348 |
tttcatttatctttccaatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
22578422 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 27667511 - 27667685
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Q |
| |
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| T |
27667511 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttaatactctttcttttttcaattc |
27667610 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
27667611 |
tttcatttatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
27667685 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
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Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattatatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattc |
35631169 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
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tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
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Q |
| |
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| T |
38044957 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctattttctttcaatta |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
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tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
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Q |
| |
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30852017 |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
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| T |
30852117 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
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gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
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|
| T |
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gtcccaaattgtatgtcactttataatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctt |
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T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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tcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
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Q |
| |
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| T |
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attgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaatt |
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T |
|
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101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
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|
| T |
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ctttcatttatctttcacatatcatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
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| |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
24616559 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattgtatccttaactatttattactt--tcttctttcaattc |
24616656 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
24616657 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
24616731 |
T |
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Target: chr8; HSP #53
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9 |
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108 |
Q |
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| T |
37664966 |
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37664867 |
T |
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| Q |
109 |
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176 |
Q |
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| T |
37664866 |
tatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctattttccacacaa |
37664799 |
T |
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
600289 |
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600190 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
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cttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #55
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Q |
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| T |
2031628 |
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2031529 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
2031528 |
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2031454 |
T |
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Q |
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| T |
5371583 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctattctttcaagtc |
5371682 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
5371683 |
ttttatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
5371757 |
T |
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Q |
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| T |
5830985 |
ttgtcccaaattttatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccataactatttattactctctcttctttcaattc |
5831084 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
5831085 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctccttcccacacaa |
5831159 |
T |
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Target: chr8; HSP #58
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Q |
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| T |
14810116 |
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14810017 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
14810016 |
cttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaa |
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T |
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
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19715270 |
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19715369 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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19715370 |
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19715444 |
T |
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Target: chr8; HSP #60
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101 |
Q |
| |
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29938333 |
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29938432 |
T |
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
29938433 |
cttcatttatctttcctatattatttattgaggacaattttgtaaaacaacccataatatctctttcccacacaa |
29938507 |
T |
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30087966 - 30087792
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Q |
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30087867 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
30087866 |
cttcatttatctttcctatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaa |
30087792 |
T |
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Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
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Target Start/End: Complemental strand, 35544231 - 35544057
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101 |
Q |
| |
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| T |
35544231 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatttccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
35544131 |
cttcatttatttttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaa |
35544057 |
T |
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Target: chr8; HSP #63
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Target Start/End: Complemental strand, 38896697 - 38896523
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Q |
| |
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|
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| T |
38896697 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttattttttcaattc |
38896598 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
38896597 |
tttcatttatctttcctatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
38896523 |
T |
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Target: chr8; HSP #64
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Target Start/End: Original strand, 42927158 - 42927332
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101 |
Q |
| |
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| T |
42927158 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
42927257 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42927258 |
tttcatttatctttctcatttcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
42927332 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
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2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
42946658 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattc |
42946559 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
42946558 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaa-aactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
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|
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aatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctcccttctttcaattctttcatttatcttactcatattatttattaag |
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T |
|
| Q |
134 |
aacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
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gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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2 |
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
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31873558 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
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1 |
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100 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
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attgtctcaaattatacgccgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaatt |
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T |
|
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
| T |
8378228 |
atttcatttatctttcccatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatatatttctcacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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104 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |
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|
| T |
23606229 |
tcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcctt |
23606328 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
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| |
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aaattgtatgtcgctttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattactctgtcttctttcaattccttcatt |
30597180 |
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|
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tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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| T |
30597179 |
tatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
30597112 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 34908723 - 34908898
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100 |
Q |
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34908723 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttctttttttcaatt |
34908822 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
34908823 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
34908898 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2099202 - 2099033
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2 |
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101 |
Q |
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2099202 |
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2099103 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
2099102 |
cttcatttatctttccc-----atttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
2099033 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18203257 - 18203083
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2 |
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101 |
Q |
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18203257 |
ttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactttttcttatttcaattc |
18203158 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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tttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 28868764 - 28868938
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101 |
Q |
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28868863 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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28868864 |
tttcatctatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #75
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101 |
Q |
| |
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|||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |
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32395275 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctattttctttcaattc |
32395176 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
32395175 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
32395101 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 36652477 - 36652651
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2 |
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101 |
Q |
| |
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36652477 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacatttatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattc |
36652576 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
36652577 |
ttttacttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaa |
36652651 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39169028 - 39168854
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
39169028 |
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39168929 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
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Target: chr8; HSP #78
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Target Start/End: Original strand, 1953315 - 1953472
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101 |
Q |
| |
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1953315 |
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1953414 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
1953415 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaattcataat |
1953472 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 23897723 - 23897880
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
23897723 |
ttgttccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
23897822 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
23897823 |
tttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
23897880 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #80
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Target Start/End: Original strand, 6247657 - 6247832
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Q |
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|
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6247657 |
attgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtccttaactatttattacttttttttctttcaatt |
6247756 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
6247757 |
ccttcatttatctttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaa |
6247832 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22453550 - 22453379
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| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
22453550 |
tcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgagaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattcctt |
22453451 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
22453450 |
catttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
22453379 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #82
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 29949140 - 29949315
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Q |
| |
|
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|
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| T |
29949140 |
ttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccagtgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
29949239 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatat-tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29949240 |
cttcatttatctttcccatatcaatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #83
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104 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39284242 |
tcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattcctt |
39284341 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
39284342 |
catttatctttcctatataatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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| T |
6878655 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgattataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #85
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #86
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Q |
| |
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16861888 |
T |
|
| Q |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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|||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #87
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| |
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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|||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #88
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| |
|
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|
|
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|
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
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| |
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|
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Target: chr8; HSP #89
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34 |
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133 |
Q |
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44053228 |
T |
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134 |
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176 |
Q |
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| T |
44053229 |
aacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaa |
44053271 |
T |
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Target: chr8; HSP #90
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Target Start/End: Complemental strand, 32629825 - 32629657
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107 |
Q |
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32629726 |
T |
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108 |
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176 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #91
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9 |
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108 |
Q |
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| T |
30157626 |
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30157527 |
T |
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| Q |
109 |
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176 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr8; HSP #92
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Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40734931 - 40734759
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8 |
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103 |
Q |
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| T |
40734931 |
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40734832 |
T |
|
| Q |
104 |
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176 |
Q |
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| T |
40734831 |
tcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #93
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Target Start/End: Complemental strand, 42192464 - 42192289
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100 |
Q |
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42192464 |
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T |
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| Q |
101 |
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176 |
Q |
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| T |
42192364 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #94
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Target Start/End: Complemental strand, 42373245 - 42373077
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101 |
Q |
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| T |
42373245 |
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42373148 |
T |
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| Q |
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172 |
Q |
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| T |
42373147 |
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42373077 |
T |
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Q |
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596985 |
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T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
597084 |
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T |
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Target: chr8; HSP #96
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
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26746871 |
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26746970 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
26746971 |
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26747045 |
T |
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Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 28848999 - 28849173
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Q |
| |
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| T |
28848999 |
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28849098 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
28849099 |
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28849173 |
T |
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Target: chr8; HSP #98
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Target Start/End: Complemental strand, 40325561 - 40325387
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Q |
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40325462 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
40325461 |
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T |
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41256439 - 41256265
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Q |
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41256340 |
T |
|
| Q |
102 |
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Q |
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| T |
41256339 |
tttaatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #100
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Target Start/End: Complemental strand, 42159234 - 42159076
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Q |
| |
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42159234 |
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T |
|
| Q |
116 |
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174 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 1042416 - 1042585
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Q |
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| T |
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1042515 |
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| Q |
105 |
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174 |
Q |
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| T |
1042516 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #102
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Target Start/End: Original strand, 4393931 - 4394088
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4393931 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcttattatatccttaactattaattcctctctcttctttcgatta |
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T |
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| Q |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
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| T |
4394031 |
tttcatttatctttctcatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #103
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T |
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
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| T |
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tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
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Target Start/End: Complemental strand, 6010353 - 6010176
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Q |
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T |
|
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
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Q |
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cattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #105
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Query Start/End: Original strand, 2 - 178
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Q |
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T |
|
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97 |
aattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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| T |
14762479 |
aattctttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatttcttttccatacaaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #106
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| |
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899601 |
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T |
|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
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cttcatttatctttcccttatcatttatagaggacaattttgtaaaacagctcataatatttctttcccaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #107
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aaattatatgtcattttacattaccaatgcaatattaatgttactttttctattataaccttagttatttattagtctctcttcttttaattctttcatt |
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tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #108
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Target Start/End: Original strand, 9267686 - 9267801
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108 |
Q |
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9267686 |
aaattatatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatt |
9267785 |
T |
|
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109 |
tatctttctcatatta |
124 |
Q |
| |
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|
|
| T |
9267786 |
tatctttcccatatta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #109
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 24612886 - 24613061
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
24612886 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttcatattatatcattaactatttattgctctctcttctttcaatt |
24612985 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
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24612986 |
ccttcatttatctttcttatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaatccataatatctcttttccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37965076 - 37964901
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100 |
Q |
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|
| T |
37965076 |
attgttccaaattgtatatcactttacaatactaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactttttcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37964976 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcatgatatctctttcctacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #111
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39645947 - 39645775
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2 |
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101 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
39645848 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
39645847 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataa--ttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #112
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43537047 - 43536872
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100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
43537047 |
attgttccaaattatatgtagctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttccgattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
43536948 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
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| T |
43536947 |
atttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
43536872 |
T |
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Target: chr8; HSP #113
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 45439555 - 45439732
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2 |
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98 |
Q |
| |
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|
| T |
45439555 |
ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgtaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaatttttactctctcttctttcaa |
45439654 |
T |
|
| Q |
99 |
ttttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45439655 |
ttatttcatttatctttctcatatcattcattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #114
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 1366789 - 1366963
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| Q |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
1366789 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattattccttcttctttcaatta |
1366888 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
1366889 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttttcttccccacacaa |
1366963 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #115
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Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4631177 - 4631012
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| Q |
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101 |
Q |
| |
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|||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| || |
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| T |
4631177 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcttattatatcattaactatttattactctatcttctttcttttc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4631077 |
atttatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctcttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #116
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Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 6796142 - 6796299
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
6796142 |
attgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatatctttaactatttattactctttcttttttcaatt |
6796241 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6796242 |
ctttcatttatatttcccatatcatttattaagaacaatttagtaaaataactcataa |
6796299 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #117
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Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 31692776 - 31692933
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31692776 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttatctattaattactctctcttctttcaatta |
31692875 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31692876 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
31692933 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #118
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7884528 - 7884353
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||| |
|
|
| T |
7884528 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactttcttttcttttaatt |
7884429 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
7884428 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
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Target Start/End: Complemental strand, 17524812 - 17524637
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Q |
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|
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|
|
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attgtcccaaattatatgtcgttttacgataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
17524713 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
17524712 |
atttcatttatctttttcataccatttattagagataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
17524637 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #120
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 18526375 - 18526549
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18526375 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctatcttctttcaatt |
18526474 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| || ||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
18526475 |
atatcatttatcttttccatacca-ttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #121
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
4135730 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccagtgaaacattaatgttattttttctattatatcattaattatttattactctttcttttttcaattc |
4135829 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
4135830 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #122
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Query Start/End: Original strand, 5 - 159
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104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
4174581 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatactaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaaatattt |
4174680 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
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catttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaatagctcataat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #123
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || |
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|
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T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #124
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| |
|
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|
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactca |
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Q |
| |
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|
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atttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaactca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #125
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Q |
| |
|
||||| |||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
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|
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T |
|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
5062262 |
ttttatttatttttcctatatcatttattaaggacaattttataaaacaactgataatatatcttttccacacaaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #126
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| |
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tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
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5733278 |
tatctttct-atataatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
5733210 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #127
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Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 8738016 - 8738192
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Q |
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8738016 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttgcttttcctattatatcttttactatttattgccttctctactttcaagtc |
8738115 |
T |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
8738116 |
atttatttatcttttccatatcatttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatttcttttccacacaaaa |
8738192 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #128
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Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27919664 - 27919488
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2 |
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101 |
Q |
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27919664 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatcattcattatttattgccttctctacttccaagtc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27919564 |
attcatttatctttcacatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
27919488 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28074500 - 28074337
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2 |
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101 |
Q |
| |
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|
|
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
28074401 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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28074400 |
ttttatttatcttttccat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #130
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Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14584844 - 14584677
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108 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| || |
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14584844 |
aaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctcttttctttcaattatttcatt |
14584745 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
14584744 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #131
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Target Start/End: Original strand, 17911022 - 17911157
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
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|
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17911022 |
ttacaataccaatgaaacattaatgttaatttttctattatattcttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatc |
17911121 |
T |
|
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17911122 |
atttattaaggacaatttagtaagacaactcataat |
17911157 |
T |
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Target: chr8; HSP #132
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Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23681949 - 23681799
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23681949 |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23681856 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaccaactcataat |
23681799 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 45186962 - 45187129
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || |
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|
| T |
45186962 |
aaattatatgtcgctttacagtaccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatt |
45187061 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
45187062 |
tatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacaa |
45187129 |
T |
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Target: chr8; HSP #134
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
41541218 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacataaatgttaaatttcatattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattc |
41541119 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
41541118 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaagataattttgtaaagcaactcataatatctctttcccatacaa |
41541044 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
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15225981 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15225982 |
tttcatttatattttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
15226039 |
T |
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Target: chr8; HSP #136
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
20091214 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattt |
20091115 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattattt |
127 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
20091114 |
tttcatttatctttcccatatcattt |
20091089 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 24523984 - 24524101
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7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24523984 |
ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacgttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactttatcttctttcaattctttta |
24524083 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatatta |
124 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24524084 |
tttatcttttccatatta |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
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26513731 |
ttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26513831 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaagcaactcataat |
26513888 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
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Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |
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| T |
37954716 |
ttgtctcaaattgtatgtcactttacactacaaatgaaatattaatgttaccttttctattatatccttaattatttattattctttcttctttcaattc |
37954617 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37954616 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
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T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #140
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Q |
| |
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|
| T |
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ttgtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctat---atcattaactattttttactctttcttctttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #141
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gctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
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gctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatatcatttattttttccat |
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T |
|
| Q |
121 |
attatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |
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|
| T |
16736552 |
accatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #142
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Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||| |
|
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
21582861 |
tttcatttatctttcccata-catttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctttttcccacacaa |
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121 |
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| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |
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ctttacaattacaatgaaacattaatttttcttttcttattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatatttctcata |
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T |
|
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122 |
ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| |||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
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tcatttattaaggaaatttttttaaaacaactcacaatatctctttcccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #144
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |
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|
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T |
|
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101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
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Q |
| |
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|||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #145
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||| |||||| || |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| |
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| T |
38194605 |
ttttatttatcctttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacaa |
38194531 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 3457067 - 3457219
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101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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| T |
3457067 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac-----attactctctcttctttcaatta |
3457161 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
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| T |
3457162 |
tttcatttattttttccatactatttattaagaataattttgtaaaacaactcataat |
3457219 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 16421902 - 16422079
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100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16421902 |
attgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagt |
16422001 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16422002 |
cgttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
16422079 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 6806715 - 6806874
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6806715 |
attgtcacaaattatatgtcgttatacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatattcttaact-tttattactctatcttctttcaatt |
6806813 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||| |||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
6806814 |
ctttcatttatcattctaatataatttattaaggatagttttgtaaaaccactcatgatat |
6806874 |
T |
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Target: chr8; HSP #149
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Query Start/End: Original strand, 241 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15272751 - 15272663
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| Q |
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329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15272751 |
aattataacatatactaacaaggaaacaaggaataataagtattcaatgttttgttattaagatttgaaggcaattaaaagaaataata |
15272663 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15453120 - 15453032
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| Q |
241 |
aattataacatatactaacaaggaaacaaggaataataactattcaatgttttcttattaccatttgaaggcaattacaagaaataata |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15453120 |
aattataacatatactaacaaggaaacaaggaataataagtattcaatgttttgttattaagatttgaaggcaattaaaagaaataata |
15453032 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 29440907 - 29441083
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||| | |
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|
| T |
29440907 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaagcattaatattatttttcctattatatccttaaccattttctactttctcttcttccaagtc |
29441006 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29441007 |
attcatttatctttcctatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaatttataatatcccttttccacacaaaa |
29441083 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3562511 - 3562340
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| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
3562511 |
tcccaaattataagtcgttttacaataccgatgaaccattaatgttattttttctattatacccttaactgtttattactc--tcttctttcaattcttc |
3562414 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
3562413 |
aatttatttctctcgtaccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcaaaatgtctctttcccatacaaaa |
3562340 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9792306 - 9792132
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
9792306 |
ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatattactttttctattatatccttaaatatttattactctatcttctttcaactc |
9792207 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
9792206 |
cttcatttatctttcttgtatcctttattaatgacaattttataaaattgctcataatatctctttcccacacaa |
9792132 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 15595495 - 15595625
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| Q |
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accaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttatt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15595495 |
accaatgcaactttaatattactttccctattataatcttaactatttataactttcttttctttcaattctttcatttatttttctcatattatttatt |
15595594 |
T |
|
| Q |
131 |
aagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15595595 |
aaggataattttgtaaaacaactcataatat |
15595625 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #155
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Target Start/End: Original strand, 27421265 - 27421395
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| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |
|
|
| T |
27421265 |
tgtcccaaattatatgccgctttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcttattatatctttaactatttattactctatcttatttcaattat |
27421364 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaag |
133 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27421365 |
ttaatttatctttttcataccatttattaag |
27421395 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #156
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Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 38451004 - 38451154
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| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
38451004 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
38451103 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || ||||| | | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38451104 |
tatcttttccataccatatattagggataattttgtaaaacaattcataat |
38451154 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
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2 |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
12000523 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattc |
12000622 |
T |
|
| Q |
98 |
--------attttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
12000623 |
tttcatttattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaa |
12000709 |
T |
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Target: chr8; HSP #158
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
31231113 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcgtattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattc |
31231014 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatcttt |
115 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
31231013 |
cttcatttatcttt |
31231000 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 34865666 - 34865843
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||| | |
|
|
| T |
34865666 |
attgtcccaaattgtatgtagctttacaatatcaatgaatcattaatgttattttttctattatatctttaactatttattactctctctcattccaagt |
34865765 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34865766 |
cattcatttattttttcaatgtcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaaaa |
34865843 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #160
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| || |
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|
| T |
24450567 |
aaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttcgattatatccttaagtatttattactctttcttccttcaattctttcatt |
24450666 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24450667 |
tatttttctcgaatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatat |
24450719 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #161
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ctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40483790 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataatcttaactatttattactctatcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
40483889 |
T |
|
| Q |
122 |
ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40483890 |
t-----------gacaattttgtaaaataactcataatatattttttccacacaa |
40483933 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #162
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
12113577 |
ttgtctcaaattgtatgtcgctttacaatatcagtgaaaaattaatgttacttttcctattatatcct-----atttattactc--ttttttttcaattc |
12113485 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
12113484 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #163
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ctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttccttt-atctttctcat |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| || ||||| || |
|
|
| T |
17505143 |
ctttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctctattctttcaattctttgatttaatttttctaat |
17505242 |
T |
|
| Q |
121 |
attatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17505243 |
atattttattaaggacaattttgtaaaacaagtcataatatttcttt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #164
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115 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
23550708 |
atgtctctttacaatactaatgaaacattaatgttactttttttattatatcattaactatttattattttctcttctttcaattctttaatttatcttt |
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T |
|
| Q |
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ctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
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Q |
| |
|
|| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
23550808 |
cttatactatctattaaagacaattttgtaaaacaactcgtaatatttatttcccacacaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #165
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117 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| |
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| T |
37390961 |
ctttacaataccaatgaaacattaacgttactttttctattatatatatccttaactatttattactcttttttctttcaattatttcatttatctttct |
37390862 |
T |
|
| Q |
118 |
catattatttattaagaacaa-ttttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
37390861 |
catatcatttatgaaggataatttttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
37390802 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11589033 - 11588924
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11589033 |
attgtcacaaattatatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaatt |
11588934 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttccttta |
110 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
11588933 |
ctttcattta |
11588924 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38367675 - 38367518
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| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||| || |
|
|
| T |
38367675 |
gtcctaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactttttcttttttcaattctt |
38367576 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
38367575 |
tcatttatctttcctatatcattttttaaggataattttgtaaaacaatttataatat |
38367518 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 16863984 - 16864139
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| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||||| |||| | | |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
16863984 |
caaattataagttgttttacaattccaacgaagcattaatgttatttttttgattatattcttaactacttattactctatctactttcaattctttaat |
16864083 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16864084 |
ttatctttcatataccattaattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
16864139 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38503210 - 38503065
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| Q |
9 |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| || | |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38503210 |
aaattatatgttgttttacaatataccaatgaaacattaatgttacttcttctattatatccataatgatttattactctatcttctttcaattttttca |
38503111 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaact |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38503110 |
tttatctttctcatatcattta-taagtacaattttacaaaacaact |
38503065 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #170
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30 |
taccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttat |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11018490 |
taccaatgcaacattaatgttaatttttctattataatcttaattatttcttattatcccttttttcaattctttcatttatctttc-catattatttat |
11018588 |
T |
|
| Q |
130 |
taagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
11018589 |
taaagaaaattttgtaaaacaattcataatatcttttttccacacaa |
11018635 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Original strand, 35455468 - 35455603
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| Q |
23 |
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122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
35455468 |
tttacaatactaatgaaacattaatgttattttttctattatatctttaactatttattactc--tcttcttttaattctttaatttatctttcatatac |
35455565 |
T |
|
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataata |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35455566 |
catttattaaggataattttgtaaaccaactcataata |
35455603 |
T |
|
Back To:
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Target: chr8; HSP #172
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Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 44012263 - 44012419
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| Q |
12 |
ttatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttat |
111 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| | | ||| ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
44012263 |
ttataagtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcactaactatttattattatcttttcgttcaattctttaatttat |
44012362 |
T |
|
| Q |
112 |
ctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44012363 |
ctttctcataccatttattgaggataatgttgtaaaacaactcataatatttctttt |
44012419 |
T |
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Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 167348 - 167461
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaa--cattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
167348 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatataaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaa-ttcttca |
167446 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
167447 |
tttatctttctcata |
167461 |
T |
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Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32642636 - 32642464
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |
|
|
| T |
32642636 |
ttgtcccaaattatatatcattttccaataccaataaaacatttatgttacttttcc-attatatcctttactatttattaaaatatgttttttcaattc |
32642538 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32642537 |
tttcatttatcttatccatactatttattaaggacaatttt-taaaataactcataatatctcttttccacacaa |
32642464 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11587897 - 11587823
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
11587897 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaa |
11587823 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
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Target Start/End: Original strand, 16999294 - 16999408
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| Q |
62 |
tataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16999294 |
tatatccttaactatttattactctctattctttcaattccttcatttatcttttctatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatat |
16999393 |
T |
|
| Q |
162 |
atcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |
|
|
| T |
16999394 |
ctctttcccacacaa |
16999408 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Original strand, 18185426 - 18185568
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | || ||| || |
|
|
| T |
18185426 |
aaattataggtcgctttacaataacaataaagtattaatgttacttttcttattataactttaattatttattactttatcttcttttagttctttaatt |
18185525 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaa |
151 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18185526 |
tatttttctcataccatttattaaagacaattttgtaaaacaa |
18185568 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 36821853 - 36822030
Alignment:
| Q |
3 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
36821853 |
tgtcccaaattatatgtcgttttacaataccactaaaaaattaatgttacatttcctattatatcctcaactatttattacttttttttttctttcaatt |
36821952 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
36821953 |
ctttaatttatcttttccatgccaattattgaggacaactttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaaaa |
36822030 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
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2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | |||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||| | || | |||||||||||| || |||||| || |
|
|
| T |
28482079 |
ttgtcccaaattataagttgttttacaatttcaatgaagcattaatgttactttttctattatacctttcattatttattactctccctactttcagttc |
28481980 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28481979 |
tttaatttgtctttcttatatcgtttattaaagatatttttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8567050 - 8566998
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| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8567050 |
tttatctttttcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaacttataat |
8566998 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33987494 - 33987336
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| Q |
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tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatat |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33987494 |
tttataataccaataaaacattaatgttatttttgatattatatccttaactatttattattttctgttttttcaattttttaatttatcttttccatat |
33987395 |
T |
|
| Q |
123 |
tatttat---taagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||||| | || |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
33987394 |
catttattaataaggacaattttgtaaaacagtttatcatatctattttccacacaaaa |
33987336 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 178
Target Start/End: Original strand, 38870306 - 38870394
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| Q |
90 |
ttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
38870306 |
ttctttcaattctttcatttatttttctcgtataatttattaaggacaattttgtaaaataactcatatcatatttttcccacacaaaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6900108 - 6899943
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| Q |
11 |
attatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttccttta |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| | | ||||||||||||| |||| | || |
|
|
| T |
6900108 |
attatatgtcattttacaataccaacgaaacattaatgttaattttcctataatatcc-taactatttatcattttttcttctttcaattctttcatata |
6900010 |
T |
|
| Q |
111 |
tctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
| ||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||| |||| |
|
|
| T |
6900009 |
t-ttttttatatcttttattaaggacaattttgcaaaacatctcataatatcttttttacacagaaaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
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2 |
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65 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43414056 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattata |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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| Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
38832843 |
tttacaataccaatgaagcattaatcttacgttttctattataacat-aactatttattaccttctcttctttcaatttcttaatttatctttctcatac |
38832745 |
T |
|
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38832744 |
catatattaaagataatgttgtaaaacaactcataatat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #186
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60 |
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Q |
| |
|
|||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
9634906 |
attataccattaactatatattagtctctcttctttcaattctttaatttatttttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaccttgtaat |
9635005 |
T |
|
| Q |
160 |
atatcttttccacacaaaact |
180 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
9635006 |
atctttttcccatacaaaact |
9635026 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40824242 - 40824096
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
40824242 |
aaattatatatcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcttattat--ctttaactatttatta----------tttcaattttttaatt |
40824155 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
40824154 |
tatctttctcataccgtcaattaagaataattttgtaaaataacttataatatttcttt |
40824096 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 100
Target Start/End: Original strand, 19713070 - 19713161
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
19713070 |
aaattataagtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttattaatataatcttaactatttataactctctctgctttcaatt |
19713161 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 4408007 - 4408072
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataac |
67 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| |
|
|
| T |
4408007 |
ttgtcccaaattatatgttgcgttacaataccaatacaacattaatgttactttttctatgataac |
4408072 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31230614 - 31230543
Alignment:
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
31230614 |
cctttatctttcccatatcatgtatagaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
31230543 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 173
Target Start/End: Original strand, 9268083 - 9268133
Alignment:
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9268083 |
tatttattaaggacaattttataaaataactcataatatctcttttccaca |
9268133 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15272807 - 15272766
Alignment:
| Q |
215 |
tcattattacaatcaattaaatttacaattataacatatact |
256 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15272807 |
tcattagtacaatcaaataaatttacaattataacatatact |
15272766 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15453176 - 15453135
Alignment:
| Q |
215 |
tcattattacaatcaattaaatttacaattataacatatact |
256 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15453176 |
tcattagtacaatcaaataaatttacaattataacatatact |
15453135 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 50
Target Start/End: Original strand, 23597307 - 23597352
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgtt |
50 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
23597307 |
tcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgtt |
23597352 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 176
Target Start/End: Original strand, 24524346 - 24524399
Alignment:
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
24524346 |
tatttattaaagacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccatacaa |
24524399 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #196
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 159
Target Start/End: Original strand, 38777314 - 38777422
Alignment:
| Q |
52 |
tttttcctattataaccttaactatttattactc-aatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaaca |
150 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| |||| | |
|
|
| T |
38777314 |
ttttttctattacaccattaattatttattactctaatcttctttcaattttttaatttattttttccatattattaattaatgataattttctaaatta |
38777413 |
T |
|
| Q |
151 |
actcataat |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
38777414 |
actcataat |
38777422 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 161
Target Start/End: Original strand, 1214739 - 1214782
Alignment:
| Q |
118 |
catattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1214739 |
catattatttattaaggacaattttataaaacaattcataatat |
1214782 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 166
Target Start/End: Original strand, 17854439 - 17854486
Alignment:
| Q |
119 |
atattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17854439 |
atatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatttctt |
17854486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 36466893 - 36466830
Alignment:
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttcca |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
36466893 |
ttatctttctcataccatttattaaagataattttgtaaatcaactcataatatcttttttcca |
36466830 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 38870231 - 38870286
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctatta |
63 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
38870231 |
caaattatatgtcgttttacaataccaataaaatattaatgttattttttctatta |
38870286 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29803685 - 29803647
Alignment:
| Q |
125 |
tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29803685 |
tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatat |
29803647 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Original strand, 16998936 - 16998997
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctatta |
63 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
16998936 |
ttgtcctaaattatatgtcactttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatatta |
16998997 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 24530135 - 24530090
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgtt |
50 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24530135 |
tcccaaattatatgtcattttacaataacaatgaaacattaatgtt |
24530090 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 116
Target Start/End: Original strand, 36648591 - 36648648
Alignment:
| Q |
59 |
tattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttc |
116 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36648591 |
tattatatcattaactatttattactgtctcttctttcaattttttaatttatctttc |
36648648 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 28072042 - 28071965
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttat |
80 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28072042 |
attgtctcaaattaaacgtcgttttacaataataatgaaacattaatgttatttttc--gttatatccttaactatttat |
28071965 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41190005 - 41189973
Alignment:
| Q |
136 |
caattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41190005 |
caattttgtaaaacaactcataatatatatttt |
41189973 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44010247 - 44010136
Alignment:
| Q |
47 |
tgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaa |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||| |||||||||| || |||||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
44010247 |
tgttgtttttcgtattatacccttaactaattattactctatatt-tttcagttgtttaatttatctttcatattatatttaataaggatgattttgtaa |
44010149 |
T |
|
| Q |
147 |
aacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| |
|
|
| T |
44010148 |
aataagtcataat |
44010136 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 168)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 35288158 - 35288332
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35288158 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaatta |
35288257 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35288258 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
35288332 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 13987588 - 13987763
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13987588 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
13987687 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13987688 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccatacaa |
13987763 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36302930 - 36302759
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
36302930 |
tcccaaattatatgtcgctttacaacaccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattcttt |
36302831 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36302830 |
catttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
36302759 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35809465 - 35809291
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35809465 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacctatgcaatattaatgttatttttccaattataaccttaattatttattactccctcttctttcaattc |
35809366 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
35809365 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
35809291 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39729799 - 39729625
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
39729799 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaattc |
39729700 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39729699 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaa |
39729625 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27366473 - 27366298
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
27366473 |
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27366374 |
T |
|
| Q |
101 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
27366373 |
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27366298 |
T |
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Target: chr5; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 8050431 - 8050605
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2 |
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101 |
Q |
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8050431 |
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8050530 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
8050531 |
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8050605 |
T |
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Target: chr5; HSP #8
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Target Start/End: Complemental strand, 23320522 - 23320358
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12 |
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111 |
Q |
| |
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| T |
23320522 |
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23320423 |
T |
|
| Q |
112 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
23320422 |
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23320358 |
T |
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Target: chr5; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 26256348 - 26256516
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8 |
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107 |
Q |
| |
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| T |
26256348 |
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26256447 |
T |
|
| Q |
108 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
26256448 |
ttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaa |
26256516 |
T |
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Target: chr5; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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2 |
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattattc--tcttctttcaattc |
37881572 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
37881571 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcaaaatatctcttttccacacaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #11
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
13662450 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttattttttctattataactttaactatttattactc--tcttatttcaattc |
13662353 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
13662352 |
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13662278 |
T |
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Target: chr5; HSP #12
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108 |
Q |
| |
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| T |
25538090 |
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25538189 |
T |
|
| Q |
109 |
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168 |
Q |
| |
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| T |
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tatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttt |
25538249 |
T |
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Target: chr5; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19282680 - 19282510
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
19282680 |
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19282583 |
T |
|
| Q |
102 |
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173 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctcttttccaca |
19282510 |
T |
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101 |
Q |
| |
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| T |
9461401 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattgctctctcttttttcaattc |
9461500 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
9461501 |
cttcatttatctttctcatattatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
9461575 |
T |
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Target: chr5; HSP #15
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
9591397 |
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9591496 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
9591497 |
tttcatttatttttcccatattatttattaaggacagttttgtaaaacaactcacaatatctcttttccacacaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 40040948 - 40041115
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
40040948 |
aaattgtatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatt |
40041047 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
40041048 |
tatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
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101 |
Q |
| |
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| T |
4047841 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaactaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctatcttctttcaattt |
4047742 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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|
| T |
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cttcatttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
4047667 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
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| T |
4456436 |
ttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattc |
4456535 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
4456536 |
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4456610 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
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| T |
9246068 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcttattatatcattaactatttattactatctcttcttttaattt |
9246167 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
9246168 |
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9246242 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #20
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Q |
| |
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| T |
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27187352 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
27187351 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
27187277 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
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Q |
| |
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| T |
36302497 |
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36302398 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
36302397 |
cttcatttatttttcccatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
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Q |
| |
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| T |
42940809 |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
42940909 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
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30077373 |
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
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Q |
| |
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11130194 |
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T |
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| T |
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cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
11130368 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 12360830 - 12361004
Alignment:
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2 |
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101 |
Q |
| |
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12360830 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
12360929 |
T |
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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| T |
12360930 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatattactttcccacacaa |
12361004 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27293537 - 27293363
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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27293537 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaacaatttattactctctcttctttcaattc |
27293438 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27293437 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
27293363 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 29816247 - 29816421
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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29816247 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
29816346 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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29816347 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttccaacacaa |
29816421 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34607034 - 34606860
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
34607034 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
34606935 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
34606934 |
tttcatttatctttctcatatcttttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
34606860 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36347445 - 36347271
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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36347445 |
ttgtcccaaattgtacgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
36347346 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
36347345 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
36347271 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33893 - 33717
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
33893 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttgcaataccaatgaaacaataatgttttttttcctactatatcattaaatattcattactctatcttcttttaattc |
33794 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
33793 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaaaa |
33717 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2606653 - 2606485
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| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2606653 |
caaattatatctcgctttacaatacaaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcgt |
2606554 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
2606553 |
ttatctttcccgtatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
2606485 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 173
Target Start/End: Original strand, 2881866 - 2882034
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| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2881866 |
tcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatattatttttcctattataacattaactatttattactatctcttctttcaattcttt |
2881965 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2881966 |
catttatattttccatattatttattaaggacaattttataaaacaattcataatatattttttccaca |
2882034 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 12659049 - 12659222
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctaatataaccttaaatatttattactc--tctcccctcaatt |
12659146 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
12659147 |
cttttatttatctttcccatgtaatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaa |
12659222 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 43359695 - 43359867
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
43359695 |
ttgttccaacttatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacac |
174 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
43359795 |
cttcatttatctttctcatattatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
43359867 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
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937835 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctatctt-tttcaattc |
937933 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttc-----tcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
937934 |
tttcatttatctttcccatattatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccgcacaa |
938013 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27807979 - 27807807
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101 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27807979 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactc--tcttctttcaattc |
27807882 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27807881 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
27807807 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 28024604 - 28024778
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |
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|
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28024604 |
attgtctcaaattatatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgatactttttctattataactttaattatttattactctatcttctttcaatt |
28024703 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
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|
| T |
28024704 |
ctttcatttatttttc-catataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
28024778 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
34163165 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattt |
34163264 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaa-gaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
34163265 |
tttcatttatctttcctatatcatttattaaggaataattttgtaaaacaactcataatatctctttaccacacaa |
34163340 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
35870072 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
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atttcatttatctttctcataccatttattaaggataattttgtaaaataactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
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Q |
| |
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|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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5378204 |
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
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|
| T |
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cttcatttatctttcctatattatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
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| |
|
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T |
|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
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| T |
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20495579 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
20495580 |
tttcatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaa |
20495654 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39896038 - 39895864
Alignment:
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
39896038 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattactgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
39895939 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
39895938 |
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39895864 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18094716 - 18094547
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| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
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| T |
18094716 |
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18094617 |
T |
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| Q |
105 |
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174 |
Q |
| |
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| T |
18094616 |
catttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacac |
18094547 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41348972 - 41348805
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
41348972 |
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41348877 |
T |
|
| Q |
102 |
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178 |
Q |
| |
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| T |
41348876 |
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41348805 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 7458618 - 7458793
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100 |
Q |
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| T |
7458618 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattaccctattttctttcaatt |
7458717 |
T |
|
| Q |
101 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
7458718 |
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7458793 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 35189220 - 35189392
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
35189220 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactc--tcttctttcaattc |
35189317 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
35189318 |
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35189392 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43403472 - 43403300
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
43403472 |
ttgttccaaattatatgtcgcattacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactc--tcttctttcaattc |
43403375 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
43403374 |
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43403300 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8042588 - 8042434
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ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
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| T |
8042588 |
ccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttctcttctttcaattccttca |
8042489 |
T |
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| Q |
107 |
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161 |
Q |
| |
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| T |
8042488 |
tttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
8042434 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 8542803 - 8542977
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
8542803 |
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8542902 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
8542903 |
cttcatttatatttcccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
8542977 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21772875 - 21772713
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| Q |
13 |
tatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatc |
112 |
Q |
| |
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| T |
21772875 |
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21772776 |
T |
|
| Q |
113 |
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175 |
Q |
| |
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| T |
21772775 |
tttcttatatcatttattaaggataattttgtaaaataattcataatatctctttcccacaca |
21772713 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25784769 - 25784595
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| Q |
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101 |
Q |
| |
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| T |
25784769 |
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25784670 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
25784669 |
tttcatttatctttcccatatcatttatgaaggataattttgtaaaaaaactcataatatttctttcccacacaa |
25784595 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34382060 - 34381886
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
34382060 |
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34381961 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
34381960 |
tttcatttatgtttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
34381886 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 39527474 - 39527648
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
39527474 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctcccttctttcaatta |
39527573 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
39527574 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
39527648 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
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Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 8035786 - 8035943
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101 |
Q |
| |
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| T |
8035786 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
8035885 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
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|
| T |
8035886 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
8035943 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15268509 - 15268336
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| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
15268509 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttgttttttctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaattcttt |
15268410 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| |
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| T |
15268409 |
aatttattttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccatacaaaa |
15268336 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Original strand, 11312995 - 11313159
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
11312995 |
aaattatatgtcgttttacaataccaatgaaagattaatgtttcttttcctattatatccttaactatttattacactctcttctttcagtttcttcatt |
11313094 |
T |
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| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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| T |
11313095 |
tatctttctcatatcatttactaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
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Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6517646 - 6517475
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4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
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| T |
6517646 |
gtcccaaattgtatgtcatttgacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctt |
6517547 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
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| T |
6517546 |
ttatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgcaaaacaactcataatatctctttcccacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
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100 |
Q |
| |
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| T |
10164718 |
attgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccctaactatttattactctttctcctttcaatt |
10164817 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
10164818 |
ttttcatttatcttttctatgacatttattaagaacaatcttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaa |
10164893 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 18048616 - 18048791
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| |
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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18048716 |
atttcatttatcttttccataccatttcttaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40915645 - 40915478
Alignment:
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
40915645 |
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40915546 |
T |
|
| Q |
109 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
40915545 |
tatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
40915478 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 440084 - 439926
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
440084 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaatt |
439985 |
T |
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| Q |
101 |
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159 |
Q |
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| T |
439984 |
atttcatttatcttttccatatcatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
439926 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 2914466 - 2914640
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
2914466 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaatta |
2914565 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
2914566 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 7414658 - 7414832
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
7414658 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaattatacttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattc |
7414757 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
7414758 |
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7414832 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14153735 - 14153561
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
14153735 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactctttattttttcaattc |
14153636 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
14153635 |
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14153561 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20656497 - 20656323
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
20656497 |
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20656398 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
20656397 |
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20656323 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24781204 - 24781046
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
24781204 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
24781105 |
T |
|
| Q |
101 |
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159 |
Q |
| |
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| T |
24781104 |
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24781046 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 32292496 - 32292670
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
32292496 |
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32292595 |
T |
|
| Q |
102 |
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Q |
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| T |
32292596 |
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32292670 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 34900240 - 34900082
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
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34900141 |
T |
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| Q |
101 |
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159 |
Q |
| |
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| T |
34900140 |
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34900082 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38394365 - 38394191
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
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| T |
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38394266 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
38394265 |
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38394191 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 40555112 - 40555269
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
40555112 |
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40555211 |
T |
|
| Q |
102 |
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159 |
Q |
| |
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| T |
40555212 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
40555269 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 8225651 - 8225815
Alignment:
| Q |
2 |
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99 |
Q |
| |
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| T |
8225651 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaataattaatgttacttttcctattatatccttaacaatttattactctctcttctttcaatat |
8225750 |
T |
|
| Q |
100 |
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161 |
Q |
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| T |
8225751 |
aatttcttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29619456 - 29619285
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
29619456 |
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29619357 |
T |
|
| Q |
102 |
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173 |
Q |
| |
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| T |
29619356 |
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29619285 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 4431555 - 4431729
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
4431555 |
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T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
4431655 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 4744747 - 4744921
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
4744747 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgatacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
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tttcatttatctttcctataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttattttccccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 15856344 - 15856518
Alignment:
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Q |
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| T |
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ttgtctcaaattatatgtcgttttacaatatcaataaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctctattctttcaattc |
15856443 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
15856444 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
15856518 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 19712525 - 19712699
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Q |
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ttgtcctaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaatta |
19712624 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
19712625 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 22510443 - 22510617
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| |
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T |
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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| T |
22510543 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
22510617 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22635776 - 22635602
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| |
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22635776 |
ttgtcacaaattgtatgttgctttacgatataaatgcaactttaatgtcactttttctattataacattaactatttattactctctcttatttcaattc |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| T |
22635676 |
ttttatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaa |
22635602 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #81
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Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 28377680 - 28377851
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
28377680 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacgataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatattcttaattatttattactt--ttttttttcaattc |
28377777 |
T |
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| Q |
102 |
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175 |
Q |
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| T |
28377778 |
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28377851 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 32706774 - 32706948
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2 |
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101 |
Q |
| |
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32706774 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttagaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaatta |
32706873 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
32706874 |
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32706948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
39990439 |
ttgttccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatt-attattcttttttctttcaattc |
39990341 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
39990340 |
tttcatttatcttt-tcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacacaa |
39990267 |
T |
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Target: chr5; HSP #84
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Target Start/End: Original strand, 9641062 - 9641219
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
9641062 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattactccctcttctttcaatta |
9641161 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
9641162 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
9641219 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #85
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Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29000941 - 29000780
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| Q |
15 |
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114 |
Q |
| |
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| T |
29000941 |
tatgtcactttagaataccaatggaacattaatgttactttttctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
29000842 |
T |
|
| Q |
115 |
tctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
29000841 |
tctcatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
29000780 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #86
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Query Start/End: Original strand, 3 - 176
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| Q |
3 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttt |
102 |
Q |
| |
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| T |
34381608 |
tgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctctaactatttattactctttctcatttcaatttt |
34381509 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
34381508 |
ttcatttatcttttccataacatttattaaggatcgttttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaa |
34381435 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #87
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Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9577709 - 9577538
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4 |
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103 |
Q |
| |
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| T |
9577709 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctattctttcaattatt |
9577610 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
9577609 |
tcatttatcttttccata-catttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
9577538 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 10370590 - 10370765
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
10370590 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatattaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
10370689 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
10370690 |
cttcatttatctttccccatatcatttattgaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
10370765 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
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Target Start/End: Original strand, 12503896 - 12504047
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10 |
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109 |
Q |
| |
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| T |
12503896 |
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12503995 |
T |
|
| Q |
110 |
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161 |
Q |
| |
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| T |
12503996 |
atctttcccatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatat |
12504047 |
T |
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Target: chr5; HSP #90
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Target Start/End: Original strand, 14341795 - 14341945
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101 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
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| T |
14341795 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacactaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttca---- |
14341890 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
14341891 |
-----tttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
14341945 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 35080309 - 35080468
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
35080309 |
ttgtctcaaattgtatgtcattttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaaatc |
35080408 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
35080409 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
35080468 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #92
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Target Start/End: Original strand, 9201172 - 9201318
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101 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
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| T |
9201172 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattc |
9201271 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaa |
148 |
Q |
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| T |
9201272 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaa |
9201318 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #93
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9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
9248978 |
aaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatt |
9249077 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
9249078 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
9249128 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #94
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
29665357 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
29665456 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
29665457 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaa |
29665531 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40365531 - 40365373
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1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
40365531 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcatattatatccttaattattaattactctctcttcttttaatt |
40365432 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
40365431 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #96
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Q |
| |
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ttgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcata----ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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tttaatttatcttttccataccatttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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11248061 |
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|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #98
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106 |
Q |
| |
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T |
|
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tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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117 |
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| |
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2123894 |
gtcgttttacaataccgatgaaacattaatattatttttcttattatatcattaactatttattattctctcttctttcatttctttaatttatctttct |
2123795 |
T |
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| Q |
118 |
catattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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| T |
2123794 |
cataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaa |
2123734 |
T |
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Target: chr5; HSP #100
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Target Start/End: Original strand, 8883244 - 8883413
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104 |
Q |
| |
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tcccaaattatatgtcgctttacaataccgatgaaaaattaatattatttttcctattatattattaactatttattgctc--tcttctttcaattcctt |
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T |
|
| Q |
105 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
8883342 |
catttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
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2 |
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101 |
Q |
| |
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18473223 |
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18473126 |
T |
|
| Q |
102 |
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161 |
Q |
| |
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| T |
18473125 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaagcaactcataatat |
18473066 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22801922 - 22801766
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5 |
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104 |
Q |
| |
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| T |
22801922 |
tcccaaattatatgtcactttataataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatctttaactatttattactttttcttctttcaattcttt |
22801823 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |
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| T |
22801822 |
catttatctttctcatatcatttattaaggataattttataaaataactcataatat |
22801766 |
T |
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Target: chr5; HSP #103
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Target Start/End: Original strand, 6334993 - 6335155
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100 |
Q |
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|
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|
|
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attgtcccaaattatatgttactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattatatccttaattatttattaccccttcttctttca--- |
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T |
|
| Q |
101 |
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172 |
Q |
| |
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| T |
6335090 |
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T |
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Target: chr5; HSP #104
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39 |
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138 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
26630452 |
aacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattcttttatttatctttcctatattatttattaaggacaa |
26630551 |
T |
|
| Q |
139 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttttccacac |
174 |
Q |
| |
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| T |
26630552 |
ttttgtaaaacaactaataatatcttttttccacac |
26630587 |
T |
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Target: chr5; HSP #105
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9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
32833614 |
aaattatatgtcgctttacaatcccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
32833713 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
32833714 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
32833781 |
T |
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Target: chr5; HSP #106
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21195275 - 21195101
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
21195275 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttcactattaattactctctcttctttcaatta |
21195176 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
21195175 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataatattgtaaaacaattaataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 18026138 - 18025981
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101 |
Q |
| |
|
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| T |
18026138 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatatttatgttacttttcctattctatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
18026039 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
18026038 |
tttcatttatcttttacataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
18025981 |
T |
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Target: chr5; HSP #108
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106 |
Q |
| |
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| T |
18652252 |
ccaaatgatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatctccttgactattaattaccctctcttctttcaattatttca |
18652351 |
T |
|
| Q |
107 |
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156 |
Q |
| |
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| T |
18652352 |
tttatctttctcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
18652401 |
T |
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Target: chr5; HSP #109
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Q |
| |
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|
| T |
37337068 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaagtc |
37337167 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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| T |
37337168 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10934989 - 10934817
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4 |
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Q |
| |
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| T |
10934989 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactccctcttctttcaattatt |
10934890 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
10934889 |
tcatttattttttccatatcatttattagggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
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101 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
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| T |
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ttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
13978364 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13978363 |
ttttatttatctttctcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #112
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Q |
| |
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33629968 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataataccaataaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctattctttcaa |
33629869 |
T |
|
| Q |
99 |
ttttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
33629868 |
ttatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #113
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9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
27535045 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctctcttcttttaattatttcatt |
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T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
27534945 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #114
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Q |
| |
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40275420 |
attgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaagt |
40275321 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|
| T |
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cattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #115
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100 |
Q |
| |
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| T |
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attgtcctaaattatatgttgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc--tcttctttcaatt |
14640141 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
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14640140 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #116
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| |
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|
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attttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
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| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #118
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| T |
5847043 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttataatactaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc--tcttctttcaatta |
5846946 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
5846945 |
ttttatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
5846871 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Original strand, 6923069 - 6923209
Alignment:
| Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctt |
114 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
6923069 |
tatgtcactttacaatactaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactcttttttctttcaattctttcattta---- |
6923164 |
T |
|
| Q |
115 |
tctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6923165 |
--tcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatat |
6923209 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35584953 - 35584790
Alignment:
| Q |
1 |
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95 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
35584953 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaataaaatatttatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttcttt |
35584854 |
T |
|
| Q |
96 |
caattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35584853 |
caattatttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
35584790 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 23991753 - 23991851
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaat |
99 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
23991753 |
attgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattaatttctcttctttcaat |
23991851 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Original strand, 3633969 - 3634125
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |
|
|
| T |
3633969 |
tcccaaattgtatgtcactttacaatactaatgaaacattaacgttatttttccaattatatctttaactatttattactattttttctttcaactcttt |
3634068 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3634069 |
catttatcttttccatatcatttattaatgataattttgtaaaacaactcataatat |
3634125 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10602071 - 10601909
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactc---aatcttctttcaa |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |
|
|
| T |
10602071 |
ttgtcccaaattatatgtagctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttttttttttttcaa |
10601972 |
T |
|
| Q |
99 |
ttttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10601971 |
ttcctttatttatcttttccatatcatttattaaggacaattttataaaataactcataatat |
10601909 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2620281 - 2620122
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2620281 |
attgtcacaaattatatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaacgttacttttcctattatatgcttaactattaattacttcctcttctttcaatt |
2620182 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttatt-aagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2620181 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaaggataattttgtaaaacaactcataat |
2620122 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21582753 - 21582582
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21582753 |
tcccaaattatatattgttttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcattaattattaattactccctcttctttcaattattt |
21582654 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
21582653 |
catttatcttttccataccatttattaagcataattttgtaaaacaactcctaatttctcttccccacacaa |
21582582 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 150
Target Start/End: Original strand, 21486683 - 21486821
Alignment:
| Q |
12 |
ttatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
21486683 |
ttatatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttactttttctgttatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttat |
21486782 |
T |
|
| Q |
112 |
ctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaaca |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
21486783 |
cttttccataacatttattaaggaaaattttgtaaaaca |
21486821 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 176
Target Start/End: Original strand, 37410708 - 37410850
Alignment:
| Q |
34 |
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133 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37410708 |
aatgaaacattaattttacttttcttattatatccttaactatttattactttttcttcttttaattctttcatttatctttctcatatcatttattaag |
37410807 |
T |
|
| Q |
134 |
aacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
37410808 |
gataattttgtaaaataactcataatatctttttttcacacaa |
37410850 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31196292 - 31196116
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||| | |
|
|
| T |
31196292 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaataaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtc |
31196193 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||| ||||| |||| |
|
|
| T |
31196192 |
attcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatctatttcccacataaaa |
31196116 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3099268 - 3099149
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
3099268 |
aaattgtatgtcactttacgataccaattaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactcattcttctttcaattctttcatt |
3099169 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattattta |
128 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3099168 |
tatttttctcatatcattta |
3099149 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 105
Target Start/End: Original strand, 5288889 - 5288992
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5288889 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttattttttctattataattttaattatttattactatctcttctttcaattc |
5288988 |
T |
|
| Q |
102 |
tttc |
105 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
5288989 |
tttc |
5288992 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 37148221 - 37148099
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| Q |
39 |
aacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaa |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
37148221 |
aacattaatgttatttttctttttatatccttaactatttattactctctcttctttcacttctttaatttatttttctcatactatttattaaaagcaa |
37148122 |
T |
|
| Q |
139 |
ttttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37148121 |
ttttgtaaaacaactcgtaatat |
37148099 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10832760 - 10832663
Alignment:
| Q |
76 |
tttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10832760 |
tttattactctctcttctttcaattttttcatttatcttttccatattatttataatggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccaca |
10832663 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 39630556 - 39630713
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
39630556 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttacgatactaatgaaatattgatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttataatta |
39630655 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39630656 |
tttaatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
39630713 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2993257 - 2993129
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| Q |
39 |
aacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaa |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2993257 |
aacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctatcttcttcgaattctttcatttttttttctcatatcttttattaagaacaa |
2993158 |
T |
|
| Q |
139 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
| || ||||| || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2993157 |
tcttataaaataagtcataatatttcttt |
2993129 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 16626286 - 16626464
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaac--attaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaa |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
16626286 |
attgtcccaaattatatgtcgctttataataccaataaatattattaatgttactttttctattatatccttaactatttattattttctctcatttcaa |
16626385 |
T |
|
| Q |
99 |
ttttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16626386 |
gtcattcatttatctttttcatgtc-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
16626464 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
16745349 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttt-cctattata----------tttatcactctctcttctttcaattccttcatt |
16745437 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
16745438 |
tatcattctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccaaacaa |
16745505 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
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2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |
|
|
| T |
13090106 |
ttgtcctaaattctacgtcgctttacaataccaatgaagcattaatattatttttcttattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtc |
13090007 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
13090006 |
attcatttatttttcctatatcatttactaaggacaattttataaaacaattcataatatccctttccaacacaaaa |
13089930 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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Target Start/End: Original strand, 1313247 - 1313345
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| Q |
2 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1313247 |
ttgtcccaaattgtaagtcactttacaataccaatgaaacatcaatattatttttcctattatacacttaactatttattactctctcttctttcaatt |
1313345 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15251363 - 15251251
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
15251363 |
ttgtcccaaattataagttgctttacaataccaatgaaacattgatgttatttttccttttat-accataactatttattactctcttttctttcaattc |
15251265 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatcttt |
115 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
15251264 |
tttaatttatcttt |
15251251 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 161
Target Start/End: Original strand, 4211820 - 4211977
Alignment:
| Q |
3 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttt |
102 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | | |||||||||| |
|
|
| T |
4211820 |
tgtcccaacttataagtcggtttacaatttcgatgaaatattaatgttgtttttc-tattataatcttaaatatttattattctttttattttcaatttt |
4211918 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4211919 |
ttaatttatctttctcatattatttgttaaagatatttttgtataacaacttataatat |
4211977 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4911624 - 4911467
Alignment:
| Q |
11 |
attatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctatta-taaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttccttt |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
4911624 |
attatatgtcgttttataatatcaataatacattaacgttattttttctattactataattaactatttattattctctcttctttcaattgtttaattt |
4911525 |
T |
|
| Q |
110 |
atctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4911524 |
atatttatcatagcatttattaaggacaattttataaaacaacacataatatatcttt |
4911467 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4890092 - 4890012
Alignment:
| Q |
96 |
caattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
4890092 |
caattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaa |
4890012 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Original strand, 1122501 - 1122599
Alignment:
| Q |
78 |
tattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
1122501 |
tattactctttcttttttcaattatttcatttgtctttcccatataatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
1122599 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Original strand, 31747854 - 31747971
Alignment:
| Q |
42 |
attaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31747854 |
attaatgttacttttcctgttatatccttaattatttattactctctattctttcgattctttaatttatattttccatactatttattaaggacaattt |
31747953 |
T |
|
| Q |
142 |
tgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31747954 |
tgtaaaacaactaataat |
31747971 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 590378 - 590283
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttca |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
590378 |
attgtcccaaattatatgtcgttttagaatcccaatacaactttaatgttacttttcctattataacctt-actatctattactatttcttctttca |
590283 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 13102914 - 13103025
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
13102914 |
attgttccaaattatatgtcgctttacaatat---------attaatgttattctttctattataaccttaactatttattaatctttcttctttcaatt |
13103004 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
13103005 |
ctttcatttatctttcacata |
13103025 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 121
Target Start/End: Original strand, 13032973 - 13033052
Alignment:
| Q |
42 |
attaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
13032973 |
attaatgttattctttctattataaccttaactatttattaatctttcttctttcaattctttcatttatctttcacata |
13033052 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Original strand, 15251408 - 15251510
Alignment:
| Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttct |
117 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| | | |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15251408 |
gtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctactataccataaactgtttattactctctcttctttcaattcttt-atttatctttct |
15251506 |
T |
|
| Q |
118 |
cata |
121 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
15251507 |
cata |
15251510 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31196036 - 31195966
Alignment:
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
31196036 |
tttatctttctcatatcatttattaaggacaattt-gtaaaacaactcataatatctatttcccacacaaaa |
31195966 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40029673 - 40029619
Alignment:
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40029673 |
tttatctttctcatactatttattaaggacaattttataaaacaactcataatat |
40029619 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 9375306 - 9375233
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttatt |
81 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9375306 |
caaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaatattaatgttaattttgctattatatccttaactatttatt |
9375233 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16284931 - 16284878
Alignment:
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16284931 |
tatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaa |
16284878 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Original strand, 37410447 - 37410556
Alignment:
| Q |
34 |
aatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaag |
133 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37410447 |
aatgaaacattaattttacttttcttattatatccttagctatttattaccttttcttcttttaattctttcatttatctttctcatatcatttattaag |
37410546 |
T |
|
| Q |
134 |
aacaattttg |
143 |
Q |
| |
|
| ||||||| |
|
|
| T |
37410547 |
gataattttg |
37410556 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 28119110 - 28119013
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaat |
99 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
28119110 |
attgtcctaaattataaaccgttttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta-caccttaactgtttattactctctattctttcaat |
28119013 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 4890169 - 4890113
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattata |
65 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4890169 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
4890113 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Original strand, 13033180 - 13033236
Alignment:
| Q |
120 |
tattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
13033180 |
tattatttattaaggacaattttgtaaatcaattcataatatctcttttgcacacaa |
13033236 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
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Alignment:
| Q |
120 |
tattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
13103153 |
tattatttattaaggacaattttgtaaatcaattcataatatctcttttgcacacaa |
13103209 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1887357 - 1887204
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| | || ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||| || || |
|
|
| T |
1887357 |
ttgtcccaaattataagtcgttttagaatatcaaagaaatattaatgtttcttttcctaccataccctttactatctattactc--tcttcttcca--tt |
1887262 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1887261 |
tttaatttctctttctcataccattaatgaaggataattttgtaaaataactcataat |
1887204 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
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| Q |
11 |
attatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttccttta |
110 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||| || || |||| |||| |||| |||| |
|
|
| T |
24806805 |
attataggtagctttacaatatcaatgaaaaattaatgttaatttttctatgatgtctttaactatttattattcttcctccttttaattctttcattta |
24806904 |
T |
|
| Q |
111 |
tctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat-atatctttt |
168 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
24806905 |
tctttttcatat--cttattaaagataattttgtaaaacaactcatgataatatctttt |
24806961 |
T |
|
Back To:
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Target: chr5; HSP #160
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Alignment:
| Q |
112 |
ctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
86719 |
ctttcccatatcatttatcgaggagaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
86653 |
T |
|
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| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4745543 |
ttaactatttattactttttcttcttttaattttttaatttatttttttcataccatttgttaagg-caattttgtaaaacaacttataatat |
4745634 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #162
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttatt |
81 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6436156 |
aaattataaatcgttttacaatactaattaaatattaatgttattttttctattatacccttaactatttatt |
6436084 |
T |
|
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgt |
49 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
4060813 |
ttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaatcattaatgt |
4060766 |
T |
|
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| Q |
110 |
atctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataata |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7770849 |
atctttctcatattatttattaatgccaattttttaaaacaacttataata |
7770799 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26091818 - 26091781
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26091818 |
atttattaaggacaattttgtaaaacacctcataatat |
26091781 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 178
Target Start/End: Original strand, 39049755 - 39049840
Alignment:
| Q |
93 |
tttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
39049755 |
tttcaattttttaatttatctttttaatactatttattaaagacaattttataagacaattcataatatctttttaccacgcaaaa |
39049840 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 78
Target Start/End: Original strand, 40485035 - 40485108
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactattt |
78 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40485035 |
tcccaaattataaaccgttttacaatatcaatgaaacattattgttattttttatattatagccttaactattt |
40485108 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 40871394 - 40871467
Alignment:
| Q |
88 |
tcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40871394 |
tcttctttcaattatttaatttatttttcacataccctttattaaggataattttgtaaaacaactaataatat |
40871467 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:
Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1475 - 1300
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1475 |
attgtcccaacttatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
1376 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1375 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
1300 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15969 - 15795
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15969 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
15870 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
15869 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
15795 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 214)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33610329 - 33610155
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33610329 |
ttgtcccaaattataggtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactccatcttctttcaatta |
33610230 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
33610229 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcatttccacacaa |
33610155 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 43408310 - 43408484
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43408310 |
ttgtcccaaattatatgttgctttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaatta |
43408409 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
43408410 |
tttcatttatctttcccatattatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaa |
43408484 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 173
Target Start/End: Original strand, 11363095 - 11363259
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11363095 |
tcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactc----ttctttcaattcttt |
11363190 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11363191 |
catttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccaca |
11363259 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1672936 - 1672762
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
1672936 |
ttgtcctaaattatacgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaattc |
1672837 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1672836 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
1672762 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 5925347 - 5925514
Alignment:
| Q |
7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5925347 |
ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactc--tcttctttcaattctttca |
5925444 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5925445 |
tttatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaataattcataatatctcttttccacacaa |
5925514 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 32048037 - 32048210
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
32048037 |
ttgtcccaaattatatatcgctttacaataccaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactc-ctcttctttcgattc |
32048135 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
32048136 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatcttttttccacacaa |
32048210 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29756759 - 29756586
Alignment:
| Q |
3 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttt |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
29756759 |
tgtcccaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattct |
29756660 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29756659 |
ttcatttatctttctcgtattatttattaaggacaaatttgtaaaacgactcataatatctcttttccacacaa |
29756586 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 53722198 - 53722358
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
53722198 |
attgttccaaattatatatcgctttacaacaccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatatcttctttcaatt |
53722297 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53722298 |
atttcatttatctttcccatgttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
53722358 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 51571795 - 51571954
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
51571795 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatggtacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaatta |
51571894 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51571895 |
tttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
51571954 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 44035185 - 44035359
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44035185 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatattacttttccaattataactttaattaattattactccatcttctttcaattc |
44035284 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
44035285 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
44035359 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 49818321 - 49818495
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
49818321 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
49818420 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
49818421 |
tttcatttctctttaccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaa |
49818495 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 37056658 - 37056831
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |
|
|
| T |
37056658 |
attgtccaaaattgtatgtcgctttacaataccaatacaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattagtc--tcttatttcaatt |
37056755 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37056756 |
ctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatattttccacacaa |
37056831 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 10659242 - 10659417
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10659242 |
attgtctcaaattatacgtcgcttaacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
10659341 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
10659342 |
ctttcatttatctttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
10659417 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29361568 - 29361393
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
29361568 |
attgtcccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgcaactttaatgttatttttcttattataaccttaactatttattactctcttttatttcaatt |
29361469 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29361468 |
ctttaatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
29361393 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2510264 - 2510090
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
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2510264 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactttctcttctttcaattc |
2510165 |
T |
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
2510164 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
2510090 |
T |
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Target: chr3; HSP #16
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Target Start/End: Complemental strand, 38783680 - 38783506
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2 |
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101 |
Q |
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38783680 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
38783581 |
T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
38783580 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
38783506 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40710751 - 40710577
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
40710751 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaacattaattttacttttcctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaattc |
40710652 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
40710651 |
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40710577 |
T |
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Target: chr3; HSP #18
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Target Start/End: Original strand, 43600911 - 43601085
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2 |
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101 |
Q |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttatattataaccttagctatttattactctctattcttttaattc |
43601010 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
43601011 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccatacaa |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 47054039 - 47054213
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
47054039 |
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47054138 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
47054139 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
47054213 |
T |
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Target: chr3; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 7 - 176
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| Q |
7 |
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106 |
Q |
| |
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| T |
51166516 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttca |
51166417 |
T |
|
| Q |
107 |
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176 |
Q |
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| T |
51166416 |
tttatctttcccatatcatttattaaggacaattttataaaataactcataatatttctttcccacacaa |
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T |
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Target: chr3; HSP #21
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| Q |
5 |
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104 |
Q |
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| T |
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tcccaaattatatgtcactttacgataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactcttttttttttcaattcttt |
13759775 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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catttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttctacacaa |
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100 |
Q |
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attgtcctaaattatatgtcgctttataataccaatgcaatattaatgttatttttcctattataaccttaactgtttattactctctcttctttcaatt |
38551015 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
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| T |
38551016 |
ttttcatttatttttcccatataatttattaaggattattttgtaaaacaactcataatatctctttt |
38551083 |
T |
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Target: chr3; HSP #23
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9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
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aaattatatttcattttacaataccaatgcaacattaacgttactttttctattataaccttaactatttattactctattttctttcaattctttcatt |
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T |
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| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
47142351 |
tatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Q |
| |
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| T |
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ttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
8104372 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
8104373 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
8104447 |
T |
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Target: chr3; HSP #25
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Q |
| |
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| T |
29343245 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaattc |
29343344 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
29343345 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Q |
| |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaattc |
30744994 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
30744995 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaa |
30745069 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
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| T |
33593190 |
ttgtctcaaaatttatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttaattatttattactctctcttctttcaattc |
33593091 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
33593090 |
tttcatttatttttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
33593016 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
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101 |
Q |
| |
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| T |
33600321 |
ttgtctcaaaatttatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttaattatttattactctctcttctttcaattc |
33600222 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
33600221 |
tttcatttatttttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaattc |
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
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| T |
39259401 |
tttcatttatctttcccaagttatttgttaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcgttaactatttattactctttcttctttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatctttcctatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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| T |
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tttaatttatctttctcatacaatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
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ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgaaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
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101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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54677757 |
tttcatttatctttcccatatcatttattatggacaattttgtaaaacaactcataatatctctt |
54677821 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 23307818 - 23307993
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Q |
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attgtcccaaattatatgttgttttacaatactaatgtaacattaatgttactttttctattataactttaactatttattgctctctcttctttcaatt |
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T |
|
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
23307918 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaatcacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
23307993 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 30358761 - 30358933
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2 |
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101 |
Q |
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
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Target Start/End: Original strand, 52915066 - 52915237
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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52915066 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
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| T |
52915166 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5137710 - 5137536
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
5137710 |
ttgttccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
5137611 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
5137610 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaa |
5137536 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 17378214 - 17378388
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
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17378313 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
17378314 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
17378388 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19961064 - 19960890
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2 |
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Q |
| |
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| T |
19961064 |
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19960965 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
19960964 |
cttcatttatctttctcatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 24089371 - 24089545
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
24089371 |
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24089470 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
24089471 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttttaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 30190366 - 30190540
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Q |
| |
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| T |
30190366 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattaccctctcttctttcaattc |
30190465 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
30190466 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
30190540 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42939814 - 42939640
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Q |
| |
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| T |
42939814 |
ttgtcctaaattatatgtcactttacaataccaatgaagcattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattc |
42939715 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
42939714 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaa |
42939640 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47109301 - 47109127
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
47109202 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
47109201 |
tttcatttatctttctcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
47109127 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 47241205 - 47241379
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Q |
| |
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|
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47241205 |
ttgtcccaaattgtatgccactttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattc |
47241304 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
47241305 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaa |
47241379 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52060510 - 52060336
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| Q |
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101 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
52060510 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactccctcttctttcaattc |
52060411 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
52060410 |
tttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
52060336 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
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Target Start/End: Complemental strand, 37331422 - 37331253
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ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
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Q |
| |
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ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttattttttcaattataacattaactatttattatgatctcttctttcaattctttca |
37331323 |
T |
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| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
37331322 |
tttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
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Query Start/End: Original strand, 4 - 176
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4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
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Q |
| |
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| T |
27848922 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctt |
27848823 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
27848822 |
tcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 2 - 161
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
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cttcatttatctttctcatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
35084417 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
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Target Start/End: Complemental strand, 240712 - 240538
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Q |
| |
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240712 |
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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| T |
240612 |
ttttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatatcttttccatacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
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| |
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T |
|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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catcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaacccataatatctctttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
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2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
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| T |
23609472 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaattc |
23609373 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
23609372 |
cttcatttatctttcctatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
23609298 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25904147 - 25903973
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
25904147 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcttgttatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
25904048 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25904047 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
25903973 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 28227014 - 28227188
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
28227014 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttaggataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattc |
28227113 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
28227114 |
tttcatttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
28227188 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 34663473 - 34663647
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
34663473 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattc |
34663572 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
34663573 |
cttcatttatttttcccatatcatttattgagaataattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacacaa |
34663647 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 41751144 - 41751318
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
41751144 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
41751243 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
41751244 |
ctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
41751318 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 43175777 - 43175951
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
43175777 |
ttgtccaaaattatatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
43175876 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
43175877 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
43175951 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45824124 - 45823951
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
45824124 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattc |
45824026 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45824025 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
45823951 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4392570 - 4392409
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
4392570 |
ttgtcctaaattgtatgtcgatttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
4392471 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4392470 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatat |
4392409 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 45347235 - 45347067
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
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|
| T |
45347235 |
tcccaaattatacgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttagttttcctattatctccttaactatttattactctatcttttttcaattcttt |
45347136 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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| T |
45347135 |
catttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcgtaatatctctttaccaca |
45347067 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 52262266 - 52262426
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
52262266 |
attgtcccaaattatacgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatacccttaactatttattactctctcttctttcattt |
52262365 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
52262366 |
ctttaatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatat |
52262426 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 335923 - 335756
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
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| T |
335923 |
aaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatt |
335824 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
335823 |
tatctttcccatataatttatcgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctttttcccacacaa |
335756 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2929921 - 2929754
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
2929921 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattctttcatt |
2929822 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
2929821 |
tatctttctcatataatttattaaggataattttgtaaaacaactgataatatctctttcccacacaa |
2929754 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4822911 - 4822745
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4822911 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacat-aatgttacttttcctattataaccttagttatttattactttcttttctttcaattctttcatt |
4822813 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
4822812 |
tatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttctacacaa |
4822745 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8333673 - 8333506
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
8333673 |
aaattatatgttgttttacaatactaatgcaacattaatattactttttctattataaccttaactatttattactctctcttcttttaattctttcatt |
8333574 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
8333573 |
tatttttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactgataatatctcttttccacacaa |
8333506 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 15019828 - 15019995
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15019828 |
aaattatatgtcgctttacaataccaacgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatt |
15019927 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15019928 |
tatctttctcatatcatttattgaggtcaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
15019995 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23513130 - 23512958
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2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
23513130 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttataacacccatgcaacattaatgttgctttttcaattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
23513031 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
23513030 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgt--aacaactcataatatctattttccacacaa |
23512958 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 48333753 - 48333925
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
48333753 |
ttgtcccaaattatatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactc--tattctttcaattc |
48333850 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
48333851 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
48584123 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
48584024 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgt-aaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
48584023 |
cttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaaataactcataatatatctttcccatacaa |
48583948 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
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2 |
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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50622740 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacgataccaatgaaaaaataatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
50622641 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttc |
169 |
Q |
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50622640 |
ctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc |
50622573 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 51865739 - 51865906
Alignment:
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9 |
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108 |
Q |
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| T |
51865739 |
aaattataagtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatt |
51865838 |
T |
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| Q |
109 |
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176 |
Q |
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| T |
51865839 |
tatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcacaatatctctttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54747946 - 54747774
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2 |
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101 |
Q |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttctattatatccttaattgtttattgct--atcttctttcaattc |
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T |
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102 |
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176 |
Q |
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54747848 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaa |
54747774 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 8108478 - 8108652
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaagttaatgttacctttcctattatatccctaactatttattactctctcttctttcaattc |
8108577 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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8108578 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaa |
8108652 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9508743 - 9508569
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101 |
Q |
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ttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaatattaatgttactttttctattatattcttaactatttattactctctcttctttcaattc |
9508644 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
9508643 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtagaaaaactcataatatctctttcccacacaa |
9508569 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9516718 - 9516544
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2 |
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101 |
Q |
| |
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9516718 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaatattaatgttactttttctattatattcttaactatttattactctctcttctttcaattc |
9516619 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
9516618 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtagaaaaactcataatatctctttcccacacaa |
9516544 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 12569335 - 12569509
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
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| T |
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12569434 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
12569435 |
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12569509 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 13545799 - 13545973
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
13545898 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
13545899 |
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13545973 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 19602214 - 19602388
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101 |
Q |
| |
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19602214 |
ttgtcctaaattgtatatcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
19602313 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
19602314 |
ttttatttattttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataacatctcttttccacacaa |
19602388 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 21272671 - 21272845
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| Q |
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101 |
Q |
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| T |
21272671 |
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21272770 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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tttcatttatttttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatccattttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 31725665 - 31725839
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101 |
Q |
| |
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| T |
31725665 |
ttgttccaaattatatttcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattctctcttctttcaattc |
31725764 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
31725765 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
31725839 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
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ttgttccaaattgtatgttgctttacaatatcaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
36669290 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
| T |
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cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38483571 - 38483397
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Q |
| |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
38483471 |
cttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
|
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49384491 |
ttgtcccaaattgtatgtcg-tttacaataccaatgaaatattattgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctctgctttcaattc |
49384393 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
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cttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #85
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Query Start/End: Original strand, 9 - 173
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Q |
| |
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aaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatt |
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T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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46195759 |
tatctttccaatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
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100 |
Q |
| |
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attgtcctaaattatttatcgttttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaatt |
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T |
|
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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|||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
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|
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atttcatttatcttttccatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatttctcttttccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
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Q |
| |
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| T |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaatt |
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|
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101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
| T |
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atttcatttatctttcccataccatttattaacgataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #88
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| |
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||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || |
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|
| T |
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T |
|
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tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #89
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101 |
Q |
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| T |
15999057 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgctacttttcctattatatccttaatcatttattactctctcttctttcaattc |
15998959 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
15998958 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgagtacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
15998884 |
T |
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
24978872 |
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24978971 |
T |
|
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102 |
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176 |
Q |
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| T |
24978972 |
tttcatttatctttcctatatcatttattaagaataattttgtagaacaactcataatatctctttctcacacaa |
24979046 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #91
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 29674902 - 29675076
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2 |
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101 |
Q |
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29674902 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttatctattaattactctctcttctttcaatta |
29675001 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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tttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Target: chr3; HSP #92
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101 |
Q |
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| T |
32100320 |
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32100221 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
32100220 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaa |
32100146 |
T |
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Target: chr3; HSP #93
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101 |
Q |
| |
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| T |
41265554 |
ttgtcccaaattatatgttgttttacaataccaataaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaatta |
41265653 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
41265654 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
41265728 |
T |
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98 |
Q |
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| T |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtccttaactatttattacttttttttttctttcaa |
41637024 |
T |
|
| Q |
99 |
ttttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
41637023 |
ttccttcatttatctttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
41636946 |
T |
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101 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactcccaattctttcaatta |
43185486 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
43185487 |
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T |
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Q |
| |
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| T |
43599613 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tattacttttcctattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattc |
43599711 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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cttcatttatctttcacatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
43599786 |
T |
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101 |
Q |
| |
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52040488 |
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52040389 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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cttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
40643359 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttattttttcaattt |
40643458 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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| T |
40643459 |
tttcatttatctttccgatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
40643524 |
T |
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Target: chr3; HSP #99
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4 |
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103 |
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| |
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46336741 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttatttttcttattataacc------atttattactctctcttcttccaattctt |
46336834 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
|
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tcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctttttttcacacaa |
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T |
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135 |
Q |
| |
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|
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49893168 |
tgcaacattaatgttactttttctattataaccttagctatttattactctctattctttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaagga |
49893069 |
T |
|
| Q |
136 |
caattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
49893068 |
caattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Target: chr3; HSP #101
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Q |
| |
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| T |
23782108 |
ttgtctcaaattgtatatcactttacattaccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttcttttaattc |
23782207 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
23782208 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
23782267 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #102
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Q |
| |
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| T |
33193200 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacctttcatattatatctttaactatttattactc--tcttctttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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33193102 |
cttcatttatatttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
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T |
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Q |
| |
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38096079 |
aaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacattttctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatt |
38096178 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
38096179 |
tatctttctcatatcatttattgatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
41979918 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttatttttcctatcatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattc |
41980016 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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41980017 |
attcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
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| |
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|
| T |
45218760 |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
45218858 |
cttcatttatctttc-catatcatttattgatgacaattttgtaaaacaacttataatatctttttcccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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29227409 |
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |
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|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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T |
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
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atttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #108
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Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39144638 - 39144480
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108 |
Q |
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39144638 |
aaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctctcttatttcaattctttaatt |
39144539 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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|
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39144538 |
tatctttctcatatcacttatcaaggacaattttgtaaaacaactctaaatatctcttt |
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T |
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Target: chr3; HSP #109
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Q |
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ttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactcttcctattatatccttaactattaattactctttcttctttcaatta |
43109734 |
T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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43109735 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28686401 - 28686236
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
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28686302 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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|
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| T |
28686301 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
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T |
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Target: chr3; HSP #111
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Target Start/End: Original strand, 31170426 - 31170603
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Q |
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attgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcattatttattgccttctctacttccaagt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31170526 |
cattcatttatttttctcatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaaaa |
31170603 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33840039 - 33839863
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2 |
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99 |
Q |
| |
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33840039 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactcttttttttttttcaat |
33839940 |
T |
|
| Q |
100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
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|
| T |
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tccttcatttatctttcctatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacacaa |
33839863 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 41935950 - 41936127
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| || |||| | |
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|
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41935950 |
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41936049 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41936050 |
cattcatttatcttttccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 47916053 - 47915884
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9 |
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108 |
Q |
| |
|
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| T |
47916053 |
aaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattatttaatt |
47915954 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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| T |
47915953 |
tatctttctcatacaatttattaaggataattttataaaacaactaataatatatatttttcacacaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 32758510 - 32758682
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100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |
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| T |
32758510 |
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32758609 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
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32758610 |
catttatttatctttctaatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaca |
32758682 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53655199 - 53655031
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8 |
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107 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |
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|
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53655199 |
caaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattaccctctcttctttcaattccttcat |
53655100 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
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ttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
53655031 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #117
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Target Start/End: Complemental strand, 21216905 - 21216746
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101 |
Q |
| |
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| T |
21216905 |
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21216806 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|
| T |
21216805 |
tttcatttaactttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
21216746 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
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Target Start/End: Original strand, 22926078 - 22926253
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|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||| |
|
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22926078 |
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T |
|
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101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
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22926178 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #119
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Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Original strand, 29652036 - 29652209
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Q |
| |
|
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|
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| T |
29652036 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcttattactattatatccttaactatttattattctttctttttt |
29652135 |
T |
|
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caattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttcc |
170 |
Q |
| |
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||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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caattctttcatttatctttcacatatcatttattaaggacaa-tttgtaaaacaactcataatatttcttttcc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #120
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Target Start/End: Complemental strand, 34817144 - 34816969
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| |
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T |
|
| Q |
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
|
| T |
34817044 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #121
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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| |
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|
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T |
|
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
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| |
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|
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #123
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| |
|
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|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
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117 |
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| |
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T |
|
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118 |
catattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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|
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catattatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #125
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| |
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|
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| |
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Target: chr3; HSP #126
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| T |
49780465 |
ttgtcccaaattatatgccgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttaattttcctattatattcttaactattaattactccctcttctttcaatta |
49780366 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
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| T |
49780365 |
tttcatttatcttttctataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaa |
49780291 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54080349 - 54080175
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| |
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| T |
54080349 |
ttgtcctaaattgtatatcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattctttcttttttcaattc |
54080250 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
54080249 |
tttcatttatctttctcatatcatttattagagataattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaa |
54080175 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18019683 - 18019523
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| Q |
7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |
|
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| T |
18019683 |
ccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaaaattaattttacttttcctattacaaccttaaccatttattactc---------tctattttttca |
18019593 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18019592 |
tttatctttcccatattatttattaaggacaattttgttaaataactcataatatctcttttccacacaa |
18019523 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
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Target Start/End: Original strand, 23656314 - 23656447
Alignment:
| Q |
42 |
attaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
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|
| T |
23656314 |
attaatgttacttttcctattataaccataattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaagataattt |
23656413 |
T |
|
| Q |
142 |
tgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23656414 |
tgtaagacaactcataatatctcttttccacaca |
23656447 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48910578 - 48910402
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| Q |
2 |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||| |
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| T |
48910578 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatcattaactatttattactctttcttttttttcaat |
48910479 |
T |
|
| Q |
100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
48910478 |
tatttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaccaactcataatatatttttcccacacaa |
48910402 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49610185 - 49610028
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
49610185 |
ttgtcccagattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaatta |
49610086 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49610085 |
tttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
49610028 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9151415 - 9151243
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || |
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| T |
9151415 |
aaattatatgtcattttacaatatcaatgcaacatcaatgatacttttactattataatcttagttatttattactctctcttctttcaattctttaatt |
9151316 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcat-----attatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9151315 |
tatctttctcatggtgtattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
9151243 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35958089 - 35957931
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||| |||||| | ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
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| T |
35958089 |
ttgtcccaaattataagtagctttaaaataccgaagca---ttaatgctacttttcctattatacccttaactatttattactttctcttttttcaattt |
35957993 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35957992 |
tttattttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatat |
35957931 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 49384129 - 49384252
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
49384129 |
attgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatacaatattaatgttatttttcctattataactttaactttttattactttatcttctttcaatt |
49384228 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatatta |
124 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49384229 |
ctttcatttatttttctcatatta |
49384252 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 52804923 - 52804764
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
52804923 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatatcgatgttatttttcctattatatccttaactatttattattttctcttctttcaattc |
52804824 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
52804823 |
cttcatttatttttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaataattcataatat |
52804764 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 54241064 - 54240893
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || | | ||||||||||| |
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| T |
54241064 |
ttgtccgaaattgtatgtcgttttacaataccgatgaaaaataaatgttacttttcctattatatccttaattatttatcaccctctattctttcaatta |
54240965 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
54240964 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaca |
54240893 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 50106293 - 50106118
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
50106293 |
attgtcctaaattatacgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattttatccttaactatttatcactc--tcttctttcaatt |
50106196 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
50106195 |
ctttaatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctatttcccacacaaaa |
50106118 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52870676 - 52870502
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| | || ||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
52870676 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattcttaattactccctattctttcaatta |
52870577 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
52870576 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaa |
52870502 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Original strand, 8724322 - 8724486
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8724322 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
8724421 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||| ||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8724422 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttataaaataactcataatttatctt |
8724486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Original strand, 9076209 - 9076373
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| Q |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9076209 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
9076308 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||| ||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9076309 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttataaaataactcataatttatctt |
9076373 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20394230 - 20394054
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||| ||| || |
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|
| T |
20394230 |
ttgttccaaattgtacgtcgctttacaataccgatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgccttccctacttccaagtt |
20394131 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20394130 |
attcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
20394054 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42662697 - 42662521
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||| | |
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|
| T |
42662697 |
ttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtc |
42662598 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42662597 |
attcatttatctttcacatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaa |
42662521 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
4756352 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttaagataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
4756451 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|
| T |
4756452 |
tttaatttatcttt-tcaatttatttaataaggacaattttgtaaaataactcgtaatat |
4756510 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || |
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| T |
31171621 |
aaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttactttttctattatatcattaactattaattactctatcttctttcaattatttcatt |
31171522 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
31171521 |
tatcttttccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactaataatttctcttccccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
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44 |
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139 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
40501041 |
taatgttattttttctattataaccttaactatttattactatatcttctttcaattttttcatttatctttctcatattattaatttattaaggagaat |
40500942 |
T |
|
| Q |
140 |
tttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40500941 |
tttgaaaaacaactcataatatctctttt |
40500913 |
T |
|
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8096844 |
attgtcccaaattatatgtcgttttacaatagcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttca--- |
8096748 |
T |
|
| Q |
101 |
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167 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||| ||||| |
|
|
| T |
8096747 |
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8096687 |
T |
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Target: chr3; HSP #147
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| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |
|
|
| T |
54103985 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
54103886 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
54103885 |
ttatttatctttttcat-----------aggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
54103824 |
T |
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| ||| | |
|
|
| T |
43190729 |
attgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcatattatatcattaactatttactactttctcttcttccaagt |
43190630 |
T |
|
| Q |
101 |
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178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43190629 |
cattcatttatctttccgatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatatccattttccacacaaaa |
43190552 |
T |
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Target: chr3; HSP #149
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Target Start/End: Complemental strand, 51380263 - 51380093
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
51380263 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaata----tgaaatattaatgttactttttctattatatccttgactattaattactctctcttctttcaatta |
51380168 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
51380167 |
tttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
51380093 |
T |
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8 |
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107 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| |||| |||| || |||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | |
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|
| T |
1540699 |
caaattgtatgtcactttagaatattaatgaaatattagtgttatcttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcat |
1540798 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
1540799 |
ttatttttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaccaactcataatatctctttcccacacaa |
1540867 |
T |
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Query Start/End: Original strand, 1 - 167
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100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3429084 |
attgtctcaaattatttgtcgttttacaataccaatgaagtattaatgttatttttcttattatatcct-aattatttattactctctcttctttcaatt |
3428986 |
T |
|
| Q |
101 |
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167 |
Q |
| |
|
||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
3428985 |
ctttaatttatcattttcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttt |
3428919 |
T |
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| Q |
42 |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9783238 |
attaatgttacttttcctaatatatccttaactatttattattctctcttctttcaattccttcctttatcttttccatatcatttattgagaacaattt |
9783139 |
T |
|
| Q |
142 |
tgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
9783138 |
tgtaaaacaactcataatatctctttcccgcacaa |
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T |
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Target: chr3; HSP #153
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
16661508 |
ttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacatttattttactttttctattatatctttaactatttattaccttttcttcttttaattc |
16661409 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
16661408 |
tttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatcttttttccacacaa |
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T |
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Query Start/End: Original strand, 8 - 176
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| Q |
8 |
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107 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
27039114 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
27039015 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
27039014 |
ttatctttctcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaa |
27038957 |
T |
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3 |
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100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
32852205 |
tgtcctaaattataagtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttccaattatgcccttaactatttattactctattttttttttcaatt |
32852106 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactc |
154 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32852105 |
atttaatttatctttctcataccatttattgaggacaattttgtaaaacaactc |
32852052 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #156
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Target Start/End: Original strand, 39290579 - 39290677
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| Q |
2 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39290579 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttctcattatatccttaactatttattactctatcttctttcaatt |
39290677 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #157
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
3442862 |
attgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaaatattaatgttatttttcctattatatcatcaactatctattactctatcttatttca |
3442763 |
T |
|
| Q |
98 |
attttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| | | |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
3442762 |
attcattcatttatctttctaacaccatttattaaggaccattttataaaacaacacataatatatttttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #158
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107 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
27834344 |
caaattgtatgtcg-tttacaatattaataaaacattaatgttatttttcctatcatatccttaattatttattactctctcttcttttaattctttcat |
27834442 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaacttaatcatacaatttgggacgga |
202 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27834443 |
ttatctatcacatatcatttagtaaggataattttgtaaaacaactcataatatcactttccaacacaaaa---tgtcatacaatttgggacgga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #159
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107 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
44976350 |
caaattatatgttattttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattacattctcttctttcaattatttcat |
44976449 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
44976450 |
ttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||| ||| | |
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|
| T |
7674146 |
attgtcctaaattgtatttcgttttacaatatcaatgaatcattaatgttgcttttcctattatatcattcactatttattgtcttctctacttccaagt |
7674047 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
7674046 |
cattcatttatctttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
42490084 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
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T |
|
| Q |
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tttcctttatctttctc |
118 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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tttcatttatctttctc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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107 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||| | |||| || || |||||| |||| | | |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
23005742 |
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23005841 |
T |
|
| Q |
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ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttcca |
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| |
|
|||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 390767 - 390590
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacc-aatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| | |
|
|
| T |
390767 |
ttgttccaaattgtatgtcgctttacaatacccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgtcttctctactttcaagt |
390668 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
390667 |
cattcatttatctttcacatatcatttattaaagacaattttataaaacaactcataatatctcttctccacacaaaa |
390590 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26367415 - 26367249
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
26367415 |
attgtccaaaattatatgttgttttacaatactaataaaatattaatgttactttttctattatatc-ttaattgtttattactttatcttctttgaatt |
26367317 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgt-aaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26367316 |
ccttcatttatctttcccatataatttattaagaacaatttggtaaaaacaactcataatatctcttt |
26367249 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43190989 - 43190818
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || ||||||||| || || |||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
43190989 |
ttgtctcaaattatatatcattttacaatatcagtgaaacattaacgttattttttctattatatcattaactacttattactttatcttcttttcattc |
43190890 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
43190889 |
tttaatttatctttctcataccatttacaaaggacaattttgtaaaacaacttataatatatatttcccaca |
43190818 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6466507 - 6466398
Alignment:
| Q |
67 |
ccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
6466507 |
ccttaactatttattgctctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttt |
6466408 |
T |
|
| Q |
167 |
ttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
6466407 |
tcccacacaa |
6466398 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 9794514 - 9794590
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatt |
77 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9794514 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactatt |
9794590 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21817575 - 21817463
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |
|
|
| T |
21817575 |
caaattatatgtcgttttaccataccaatgaaacattaatgttatttttcccgttatattcttaactatttattactctctcttccttcaattctttctt |
21817476 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcat |
120 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |
|
|
| T |
21817475 |
ttatctttttcat |
21817463 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 176
Target Start/End: Original strand, 14780987 - 14781110
Alignment:
| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14780987 |
ttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaac |
14781086 |
T |
|
| Q |
153 |
tcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
14781087 |
tcataatttctcttccccacacaa |
14781110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3671619 - 3671445
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
3671619 |
ttgtcccaaattgtatgtcacgttacaataccaatgaaacattaatgttacttttccaattatatcattatgtatttattactctttattccttcaattc |
3671520 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
3671519 |
tttcatttatatttcctatatcatttagtaaagataattttgtaaaactacttgtaatatctctttcccacacaa |
3671445 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 48897220 - 48897119
Alignment:
| Q |
60 |
attataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgt-aaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
48897220 |
attatatccttaactatttattactct-tcatctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaatttcgtaaaaacaactcataa |
48897122 |
T |
|
| Q |
159 |
tat |
161 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
48897121 |
tat |
48897119 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7554638 - 7554513
Alignment:
| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaac |
152 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7554638 |
tttttctattatactcttaactatttattactttctgttcttttaattctttaatttatttttctcataccatttattaaggataattatgtaaaacaac |
7554539 |
T |
|
| Q |
153 |
tcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7554538 |
tcataatatatcttttccatacaaaa |
7554513 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30767861 - 30767752
Alignment:
| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30767861 |
ttaattatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaattactcataatatctctttc |
30767762 |
T |
|
| Q |
169 |
ccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
30767761 |
ctacacaaaa |
30767752 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25134751 - 25134656
Alignment:
| Q |
59 |
tattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactca |
155 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25134751 |
tattatatctttaactatttattactctctcttcttttaattctttattttatctttctcatac-atttattaagaacaattttgtaaaacaactca |
25134656 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 29040469 - 29040640
Alignment:
| Q |
6 |
cccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttc |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29040469 |
cccaaattatacgtcgctttacaatagcaatgaagcattaacgttacttttt-tattatgtctttaactatttattaccatctcttttttcaattttttt |
29040567 |
T |
|
| Q |
106 |
ctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
29040568 |
atttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacatgtcataatctctcttttctacataaaa |
29040640 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 42938007 - 42938162
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
42938007 |
ttgtcctaaattatatgttgcttcacaatac-aacgaaacattaatgttattttttccattatatcattgactatttgttactctctcatctttcaattc |
42938105 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
42938106 |
tttcatttacttttcacatatcatttattaaggataattttataaaacaactcataa |
42938162 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 3835300 - 3835375
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattact |
84 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3835300 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattact |
3835375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 35846951 - 35847030
Alignment:
| Q |
97 |
aattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35846951 |
aattctttcatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaa |
35847030 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45674282 - 45674184
Alignment:
| Q |
76 |
tttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
45674282 |
tttattactc--tcttctttcaattcctttatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacaca |
45674185 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40164189 - 40164107
Alignment:
| Q |
94 |
ttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
40164189 |
ttcaattctttcatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacaa |
40164107 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14343909 - 14343824
Alignment:
| Q |
93 |
tttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
14343909 |
tttcaattctttaatttatccttctcatataatttattaaggacaatattgtaaaacaactcataatatctctttttcatacaaaa |
14343824 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 30696483 - 30696555
Alignment:
| Q |
88 |
tcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30696483 |
tcttctttcaatttttac-tttatctttcatatactatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
30696555 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44697276 - 44697215
Alignment:
| Q |
117 |
tcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44697276 |
tcatattatttattaagaacaattttgaaaaacaactcataaaatctctttcccacacaaaa |
44697215 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Original strand, 9196802 - 9196866
Alignment:
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttcca |
171 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9196802 |
tttatatttctcataccatttattaagtacaattttgtaaaacaactcataatatattttttcca |
9196866 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 140
Target Start/End: Original strand, 24552746 - 24552833
Alignment:
| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaatt |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24552746 |
tttttctattatacccataattatttattactcaattttctttcagttattttatctatctttctcatattatttattaaggacaatt |
24552833 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 140
Target Start/End: Original strand, 24555831 - 24555918
Alignment:
| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaatt |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24555831 |
tttttctattatacccataattatttattactcaattttctttcagttattttatatatctttctcatattatttattaaggacaatt |
24555918 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 140
Target Start/End: Original strand, 24558885 - 24558972
Alignment:
| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaatt |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24558885 |
tttttctattatacccataattatttattactcaattttctttcagttattttatctatctttctcatattatttattaaggacaatt |
24558972 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 4493426 - 4493353
Alignment:
| Q |
10 |
aattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattac |
83 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4493426 |
aattataagtcgctttacaatattaatgaaacattaatgttacttttcctattatacccttaactatgtattac |
4493353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54769201 - 54769056
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||| | |||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
54769201 |
aaattatatgtcattttacaatacatataaaacattaatggtattttttctattatagcattaaatacttactactttatcttatttcaattatttaatt |
54769102 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactc |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54769101 |
tatctttcgtataccatttattatggacaattttgtaaaacaactc |
54769056 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 161
Target Start/End: Original strand, 49615394 - 49615499
Alignment:
| Q |
54 |
tttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaact |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| || | |||| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
49615394 |
tttcctattatatccttaactatttattactc--tatttttttaactctttcttttatctttctcgtatcatttattaaggataatttctcaaaacaact |
49615491 |
T |
|
| Q |
154 |
cataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
49615492 |
cataatat |
49615499 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 159
Target Start/End: Original strand, 9795284 - 9795353
Alignment:
| Q |
90 |
ttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9795284 |
ttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
9795353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Original strand, 19562766 - 19562926
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctatta---taaccttaactatttattactcaatcttctttcaa |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| || |
|
|
| T |
19562766 |
ttgtcccaaattatacgtctctttaaaatatcaataaagcattaatgtcaattttcctattacaccatccttaactatttattacttactcttcttttaa |
19562865 |
T |
|
| Q |
99 |
ttttttcctttatctttctcata----ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactca |
155 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19562866 |
ctctttaatttatctttcccataccatttattaattaaggataattttgtaaaacaactca |
19562926 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45207637 - 45207584
Alignment:
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataata |
160 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45207637 |
tttatttttcccatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataata |
45207584 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21815903 - 21815851
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
21815903 |
atttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
21815851 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 19538456 - 19538562
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattata--accttaactatttattactcaatcttctttcaa |
98 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| | | |||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
19538456 |
attgtcacaaattatatgtccatttacaataccaatgaaacattaatgtcactctttctattacaccatcttaactatttattactctttcttcttttaa |
19538555 |
T |
|
| Q |
99 |
ttttttc |
105 |
Q |
| |
|
|| |||| |
|
|
| T |
19538556 |
ttctttc |
19538562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 47895181 - 47895256
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattact |
84 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47895181 |
aaattgtatgtcgttttacaatatcaatgaataattaatgttactttttctattatatccttaactatttattact |
47895256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 29852164 - 29852106
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctatta |
63 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29852164 |
tcccaaattataagtcgctttacaaatacaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
29852106 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 161
Target Start/End: Original strand, 43649641 - 43649715
Alignment:
| Q |
87 |
atcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43649641 |
atcttctttcaattttttaacttatatttcacatatcatttattaaagaaaattttgtaaaacaacttataatat |
43649715 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 161
Target Start/End: Original strand, 49384533 - 49384571
Alignment:
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49384533 |
tatttattaagaacaattttataaaacaactcataatat |
49384571 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 40164262 - 40164201
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctatta |
63 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40164262 |
ttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta |
40164201 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32151393 - 32151280
Alignment:
| Q |
52 |
tttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcata----ttatttattaagaacaattttgtaaa |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| || || |||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
32151393 |
tttttcctattatttcattaactatttattactctttcttctttcaattctttaatttattttttccataccatttgttaattaaggacaattttataaa |
32151294 |
T |
|
| Q |
148 |
acaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |
|
|
| T |
32151293 |
acaacttataatat |
32151280 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 151
Target Start/End: Original strand, 34344482 - 34344546
Alignment:
| Q |
87 |
atcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaa |
151 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34344482 |
atcttttttcaattctttaatttatctttctcatactatttattaaagacaattttataaaacaa |
34344546 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 176
Target Start/End: Original strand, 42490461 - 42490513
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
42490461 |
atttattaaggataattttgtaaaacgactcataatatctctttcccacacaa |
42490513 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50106108 - 50106072
Alignment:
| Q |
140 |
tttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
50106108 |
tttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
50106072 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Original strand, 3835381 - 3835432
Alignment:
| Q |
125 |
tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
3835381 |
tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
3835432 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Original strand, 47895569 - 47895628
Alignment:
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaa---caattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
47895569 |
tttatctttctcatatcgtttattaataaggacaattttgtaaagcaactcataatatat |
47895628 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 1721461 - 1721520
Alignment:
| Q |
97 |
aattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcata |
157 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1721461 |
aattctttcatttatttttctcacatgatt-attaaggacaattttgtaaaacaactcata |
1721520 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 176
Target Start/End: Original strand, 23782352 - 23782404
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
23782352 |
atttattgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttccaacacaa |
23782404 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30744074 - 30743978
Alignment:
| Q |
25 |
tacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || |||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30744074 |
tacaatatcaatgaaatattaattttacttttcttattatactcttagctatttattactctatattctttcgattctttaatttatttttctcata |
30743978 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31229678 - 31229602
Alignment:
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31229678 |
tttcatttatttttcttgtatcatttatttaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttctcacacaaaa |
31229602 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 163
Target Start/End: Original strand, 39290698 - 39290726
Alignment:
| Q |
135 |
acaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39290698 |
acaattttgtaaaacaactcataatatat |
39290726 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Original strand, 51998393 - 51998441
Alignment:
| Q |
119 |
atattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |
|
|
| T |
51998393 |
atattatttattaacgacaattttgtaaaacaatttataatatttcttt |
51998441 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 224)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 8330182 - 8330357
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
8330182 |
attgtcctaaattatatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaattatttattactctctattctttcaatt |
8330281 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8330282 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
8330357 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 31787111 - 31787286
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31787111 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
31787210 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31787211 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
31787286 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 17180715 - 17180889
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2 |
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101 |
Q |
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|
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17180715 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
17180814 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17180815 |
tttcgtttatctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaa |
17180889 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 48747277 - 48747451
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2 |
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101 |
Q |
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48747277 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttagctattttttactctctcttctttcaattc |
48747376 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
48747377 |
tttcgtttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaa |
48747451 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 52666855 - 52667029
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
52666855 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaatgccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
52666954 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
52666955 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
52667029 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
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9 |
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108 |
Q |
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aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttcttttaattctttcatt |
42788005 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
42788006 |
tatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
42788073 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
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2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
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|
| T |
21362489 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctattttctttcaattc |
21362588 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
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|
| T |
21362589 |
tttcatttatcttttccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 4 - 176
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4 |
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103 |
Q |
| |
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| T |
49872544 |
gtcccaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatggtacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctt |
49872643 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
49872644 |
tcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
49872716 |
T |
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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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52001247 |
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52001148 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 8307829 - 8308003
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101 |
Q |
| |
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| T |
8307829 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatattatttttcttattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
8307928 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
8307929 |
tttcatttatctttcccttattatttattaaagacaattttgtaaaacaacttataatatttcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
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101 |
Q |
| |
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13896602 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccattgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactagttattactctttcttctttcaattc |
13896503 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
13896502 |
tttcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttttcacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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| Q |
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Q |
| |
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15824354 |
ttgttccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
15824255 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
15824254 |
ttttatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24322757 - 24322583
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2 |
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Q |
| |
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|
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| T |
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24322658 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24322657 |
tttcatttatctttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaa |
24322583 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43555060 - 43554886
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| Q |
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Q |
| |
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|
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43555060 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaactatttattattatctcttctttcaattc |
43554961 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
43554960 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttcaacacaa |
43554886 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16128783 - 16128623
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100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16128783 |
attgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataactttaactatttattactatctcttctttcaatt |
16128684 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16128683 |
ctttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
16128623 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
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Target Start/End: Original strand, 8878804 - 8878979
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Q |
| |
|
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|
| T |
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attgtctcaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
8878903 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
8878904 |
ctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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Q |
| |
|
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attgtcgcaaattatacgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatctattaccctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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| T |
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ctttaatttatctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
| T |
4750338 |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16051886 - 16051712
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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|
| T |
25984518 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
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| |
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ttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgatacttttcctattataaccttaactatttattactc--tcttctttcaattc |
30469655 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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|
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| T |
30469656 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
30469721 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 27952648 - 27952821
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
27952648 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaatt |
27952747 |
T |
|
| Q |
101 |
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174 |
Q |
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| T |
27952748 |
ctttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
27952821 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 13352494 - 13352670
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
13352494 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcccattatatccttaactatttattactctatcttctttcaattc |
13352593 |
T |
|
| Q |
102 |
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178 |
Q |
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|
| T |
13352594 |
tttaatttatctttctcatacaacttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacacaaaa |
13352670 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26541260 - 26541086
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
26541260 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
26541161 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
26541160 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
26541086 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 28011110 - 28011284
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
28011110 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactacttattactctctcttatttcaattc |
28011209 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
28011210 |
tttcatttatttttcccatattatttattacggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaa |
28011284 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 42709719 - 42709892
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
42709719 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaata-aacattaatgttattttttcgattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
42709817 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
42709818 |
cttcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataacatatcttttccacacaa |
42709892 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 39655396 - 39655572
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| Q |
2 |
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99 |
Q |
| |
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|
| T |
39655396 |
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39655495 |
T |
|
| Q |
100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |
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|
| T |
39655496 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgcaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
39655572 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 3163219 - 3163390
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
| T |
3163219 |
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3163315 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
3163316 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
3163390 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 10426569 - 10426729
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16 |
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115 |
Q |
| |
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| T |
10426569 |
atgtcgctttacaatagcaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaactatttattactccatcttctttcaattacttcatttatattt |
10426668 |
T |
|
| Q |
116 |
ctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
10426669 |
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10426729 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12959536 - 12959358
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| Q |
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
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attgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatacaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
12959437 |
T |
|
| Q |
101 |
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176 |
Q |
| |
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|
| T |
12959436 |
ctttcatttatctttcccatattatttattattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttttcacacaa |
12959358 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2619577 - 2619410
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9 |
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108 |
Q |
| |
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|
| T |
2619577 |
aaattatatgtcgattaacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactccctcttctttcaattctttaatt |
2619478 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
2619477 |
tatctttctcatattatttattaaggatcattttgtaaaacatctcataatatcttttttccacacaa |
2619410 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9265023 - 9264851
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
| T |
9265023 |
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9264924 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
9264923 |
tttcatttatctttctcatatta--tattaaggacaattttgtaaaacaactcataatattttttttccagacaa |
9264851 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26061901 - 26061726
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| Q |
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Q |
| |
|
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|
| T |
26061901 |
attgtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcatattataaccttaactatttattactatatcttttttcaatt |
26061802 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
26061801 |
ctttcatttatattttccatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
26061726 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49980502 - 49980331
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tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
49980502 |
tcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaattatttattactctatcttctttcaattcctt |
49980403 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
49980402 |
catttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
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| T |
16010959 |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
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cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
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| T |
16011600 |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
16011500 |
cttcatttatctttccgatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
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|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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| T |
34347414 |
cttcatttatctttcttatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
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Q |
| |
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|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
34967469 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
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| |
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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|
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 42643151 - 42643325
Alignment:
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2 |
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101 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42643151 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
42643250 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42643251 |
cttcatttatctttcctatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
42643325 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44343882 - 44343708
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
44343882 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
44343783 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
44343782 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
44343708 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 50776212 - 50776378
Alignment:
| Q |
9 |
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107 |
Q |
| |
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| T |
50776212 |
aaattatatgtcgcttttacaatacccatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaatcatttattactctat--tctttcaattctttcat |
50776309 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
50776310 |
ttatctttcccatattatttattaagcacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
50776378 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8462519 - 8462348
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
8462519 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
8462420 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8462419 |
cttcatttattattctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaca |
8462348 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13985508 - 13985333
Alignment:
| Q |
2 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
13985508 |
ttgtctcaaattatatgttgatttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaacttatttattactctctcttctttcaatt |
13985409 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
13985408 |
ccttcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
13985333 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 18127377 - 18127552
Alignment:
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
18127377 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttcttttaattc |
18127476 |
T |
|
| Q |
102 |
tttccttt-atctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
18127477 |
cttcatttaatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
18127552 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5653726 - 5653552
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
5653726 |
ttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctcttttcttttaattt |
5653627 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
5653626 |
tttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
5653552 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8712116 - 8711942
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
8712116 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
8712017 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
8712016 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
8711942 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16630092 - 16629918
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
16630092 |
ttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
16629993 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16629992 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaa |
16629918 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 26834871 - 26835045
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26834871 |
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26834970 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
26834971 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
26835045 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31925305 - 31925131
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31925305 |
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31925206 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
31925205 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
31925131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 46398642 - 46398816
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| Q |
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | || |
|
|
| T |
46398642 |
ttgtctcaaattatatgttgctttacaatacccatgcaacattaatgttgctttttcaattataaccttaattaattattactccctcttcttttagttc |
46398741 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
46398742 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
46398816 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
50942664 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
50942763 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
50942764 |
tttcatttatttttctcattttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
50942838 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
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100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
40132269 |
attgtcacaaattatttgtcgctttacgatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaatt |
40132368 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
40132369 |
ttttaatttatctttctcataccatatattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |
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|
| T |
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ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattgtatccttagttatttattactctctcttctttcaattctttca |
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T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttatctttcctatattatttattaaggacaaatttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52833642 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctccctcttctttcaattc |
52833741 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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|
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52833742 |
attcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcgtaatatctcttt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
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| |
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T |
|
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tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
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tcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
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| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |
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aaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactcactcttctttcaatttattcatt |
2994284 |
T |
|
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109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
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tatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaccaactcacaatatctctttcccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattatttttcctattatatccttaactatttattactc--tctcctttcaattc |
6920871 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
6920870 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaa |
6920796 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
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Target Start/End: Original strand, 19010820 - 19010992
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2 |
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101 |
Q |
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19010820 |
ttgtcccaaattatatgtcgatttacaatactaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattgctc--tcttctttcaattc |
19010917 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |
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| T |
19010918 |
cttcatttatctttcacatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcattcccacacaa |
19010992 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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100 |
Q |
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46762158 |
attgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcttattataaccttaactatttattactatattttctttcaa-- |
46762255 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
46762256 |
-------ttatctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatgttttttttccacacaa |
46762324 |
T |
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Target: chr1; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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2 |
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101 |
Q |
| |
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14202975 |
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14203074 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaaacaa |
14203149 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 24589541 - 24589715
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
24589640 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
24589641 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
24589715 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26333522 - 26333348
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
26333522 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattgctctttcttttttcaattc |
26333423 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
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tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
26333348 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Original strand, 29095290 - 29095455
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
29095290 |
ttgtcccaaattatatgttgctttacgataccaatgaaaaattaatgtttcttttcctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaattt |
29095389 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
29095390 |
cttcatttatctttcccatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
29095455 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29361482 - 29361309
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29361482 |
ttgtcctaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattc |
29361383 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29361382 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacaca |
29361309 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 173
Target Start/End: Original strand, 40100531 - 40100697
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| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
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| T |
40100531 |
tcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaagtatttattactc--tcttctttcaatttctt |
40100628 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
40100629 |
catttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatttcttttccaca |
40100697 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 46160381 - 46160554
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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| T |
46160381 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
46160480 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
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|
| T |
46160481 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggaaaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacaca |
46160554 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 11353609 - 11353777
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107 |
Q |
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| T |
11353609 |
caaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatatcattaactatttattactttttcttctttcaattttttcat |
11353708 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
11353709 |
ttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
11353777 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40052379 - 40052211
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| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
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|
| T |
40052379 |
caaattatatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactcttttttctttcaattattttat |
40052280 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
40052279 |
ttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaa |
40052211 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6540703 - 6540528
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Q |
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| T |
6540703 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaatt |
6540604 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
6540603 |
gtttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
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Query Start/End: Original strand, 9 - 176
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
28646199 |
aaattatatgttgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatt |
28646298 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
28646299 |
tatctttcccatgttatttgttaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttctacacaa |
28646366 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38238909 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattaattttcctattatatccttaactatttattactc--tctcctttcaattc |
38239006 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
38239007 |
cttcatttatctttcacatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
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Q |
| |
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||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
29672346 |
ttgtctcaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactgt-tcttctttcaattc |
29672444 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
29672445 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
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||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
32162350 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |
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42219825 |
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42219726 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
42219725 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
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| |
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T |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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tttcatttatctttcccatatcatttattaaacataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
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Target Start/End: Original strand, 48355794 - 48355968
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2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
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|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |
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| T |
48355794 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccgatgaaacattaatgttacttttcatattataacattaactatttattcctctctcttctttcaagtc |
48355893 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
48355894 |
ttttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatcttttttccatacaa |
48355968 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 2458530 - 2458707
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
2458530 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
2458629 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |
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| T |
2458630 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaaaa |
2458707 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7572543 - 7572367
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
7572543 |
ttgtcgcaaattatttgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcatattgtatccttaactatttattactctcccttcttttaattt |
7572444 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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| T |
7572443 |
tttcatttatctttcttatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcgctttcccacacaaaa |
7572367 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 23624884 - 23625060
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| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
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||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| |
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| T |
23624884 |
attgttccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttttttttttcaat |
23624983 |
T |
|
| Q |
100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
23624984 |
tctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
23625060 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42334490 - 42334322
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
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| T |
42334490 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcat |
42334391 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42334390 |
ttatctttcccatatcatttattaatgataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
42334322 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 9066367 - 9066538
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| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
9066367 |
tcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttagctatttattactctctcttatttcaattcctt |
9066466 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
9066467 |
tatttatttttcccatatcatttattgatgacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
9066538 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15575103 - 15574928
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
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| T |
15575103 |
attgtctcaaattgtatgccactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatcatatcttcaactatttattactctttcttctttaaatt |
15575004 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
15575003 |
atttcatttatcttttccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
15574928 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 41529159 - 41529326
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
41529159 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactttttcttttttcaattctttcatt |
41529258 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
41529259 |
tatatttcctatatcattcattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
41529326 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 51560789 - 51560948
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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|
| T |
51560789 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatattattttttctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattc |
51560888 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
51560889 |
attcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
51560948 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31045581 - 31045407
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
31045581 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttttcttttaattc |
31045482 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
31045481 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttaacacacaa |
31045407 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 39282575 - 39282749
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
39282575 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactgtttcttttttcaaatc |
39282674 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
39282675 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctctttcccacacaa |
39282749 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40403935 - 40403761
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
40403935 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattgtatctttaactatttattaccctctcttctttcaattc |
40403836 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
40403835 |
cttcatttatctttcccatataatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
40403761 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 42379234 - 42379408
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
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ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattattgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
42379333 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
42379334 |
attcatttatctttcccatatcatttatcgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49419599 - 49419426
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| Q |
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Q |
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| T |
49419599 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattc |
49419500 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
49419499 |
cttcatttatctttcccatatcatttatcgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctc-tttccacacaa |
49419426 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #91
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Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35369633 - 35369473
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
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| T |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttct--catattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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atttcatttatcttttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #92
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Target Start/End: Complemental strand, 1037699 - 1037528
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ttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctctcttctttcaat |
1037600 |
T |
|
| Q |
100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttcca |
171 |
Q |
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ttctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttcca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #93
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99 |
Q |
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| T |
1044605 |
ttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctctcttctttcaat |
1044506 |
T |
|
| Q |
100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttcca |
171 |
Q |
| |
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| T |
1044505 |
ttctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttcca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
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Target Start/End: Complemental strand, 5467133 - 5466957
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Q |
| |
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ttgtcctaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcccattatatccttaactatttattactctctattctttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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| T |
5467033 |
tttaatttatcattctcatacaacttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
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9 |
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39782563 |
T |
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161 |
Q |
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| T |
39782564 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #96
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Target Start/End: Complemental strand, 46436522 - 46436346
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Q |
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T |
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176 |
Q |
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| T |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 51983998 - 51983838
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2 |
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101 |
Q |
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T |
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102 |
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161 |
Q |
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| T |
51983898 |
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T |
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Target: chr1; HSP #98
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101 |
Q |
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23825240 |
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23825141 |
T |
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| Q |
102 |
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177 |
Q |
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23825140 |
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T |
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9 |
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108 |
Q |
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35096662 |
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35096761 |
T |
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| Q |
109 |
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176 |
Q |
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| T |
35096762 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35379753 - 35379578
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100 |
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T |
|
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Q |
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35379653 |
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35379578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39673737 - 39673562
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T |
|
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101 |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #102
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Target Start/End: Complemental strand, 41457939 - 41457768
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104 |
Q |
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41457840 |
T |
|
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105 |
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Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 44789310 - 44789485
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| |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #104
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Target Start/End: Original strand, 52688180 - 52688355
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T |
|
| Q |
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Q |
| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #105
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12967041 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
12967042 |
ttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #106
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Q |
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T |
|
| Q |
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176 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr1; HSP #107
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Target Start/End: Complemental strand, 31023829 - 31023667
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T |
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| Q |
101 |
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Q |
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31023729 |
ctttaatctatctttttcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatat |
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Q |
| |
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T |
|
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Q |
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cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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T |
|
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ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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T |
|
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tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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T |
|
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tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #113
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Target: chr1; HSP #114
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 3550031 - 3550205
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2 |
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101 |
Q |
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3550031 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttccttttgtatccttaactatttattactcttttttttttcaattc |
3550130 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
3550131 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaataacttataatatctctttcccacacaa |
3550205 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3552798 - 3552624
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
3552798 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttcttttttatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
3552699 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
3552698 |
tttcatttatttttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
3552624 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 4227789 - 4227963
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
4227789 |
ttgttccaaattgtatgtcattttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
4227888 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
4227889 |
tttaatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaa |
4227963 |
T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #117
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Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 13387571 - 13387725
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
13387571 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
13387670 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
13387671 |
catttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
13387725 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #118
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 30679316 - 30679490
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
30679316 |
ttgtctcaaattgtatgttgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
30679415 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
30679416 |
cttcatttatttttcccatatcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
30679490 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #119
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Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31500766 - 31500608
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100 |
Q |
| |
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| T |
31500766 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactgttaattactctctcttctttcaatt |
31500667 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
31500666 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
31500608 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32049571 - 32049398
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
32049571 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgta-tttttccttttatatccttaactattcattactctttcttttttcaattc |
32049473 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
32049472 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaataacttataatatctcttttccacacaa |
32049398 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49251803 - 49251629
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|||||||||| | ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
49251803 |
ttgtcccaaaatgtatctcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattgtatccttaactatttattactttttcttctttcaattc |
49251704 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
49251703 |
tttcatttatctttcccatgtcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctttttcccacacaa |
49251629 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #122
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Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 1395722 - 1395879
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2 |
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
1395722 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactacctcttctttcaatta |
1395821 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
1395822 |
tttcatttatcttttccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
1395879 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 28121297 - 28121454
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
28121297 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
28121396 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
28121397 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
28121454 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33488140 - 33487983
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33488140 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
33488041 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
33488040 |
tttcatttatcttttccatacaatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 52703411 - 52703588
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100 |
Q |
| |
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|
|
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52703411 |
attgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgtcttctctactctcaagt |
52703510 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
52703511 |
cattcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaa |
52703588 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 45467294 - 45467138
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| Q |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
45467294 |
ttgtcccaaattgtatgttactttacaatatcaatgaaacattaatgctatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattc |
45467195 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
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|
| T |
45467194 |
tttcatttatctttcacatatcatttattaaggataatttcttaaaacaactcataa |
45467138 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
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aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
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| |
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| T |
47038543 |
aaattgtatgtcattttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcgtaactatttattactatttcttttttcaattctttcatt |
47038444 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
47038443 |
tatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
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101 |
Q |
| |
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| T |
22172667 |
ttgttccaaattgtatgtcactttagaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattact--ttcttttttcaattc |
22172570 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
22172569 |
tttcatttttctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #129
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
32145396 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatattacttttcctattatatcctcaactatttattactttctcttctttcaattc |
32145495 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
32145496 |
cttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #130
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Q |
| |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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ttttacttatttttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #131
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108 |
Q |
| |
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| T |
39501733 |
aaattgtatgttgttttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcattaactatttattactctcttttctttcaattccttcatt |
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T |
|
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109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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| T |
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tatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccatacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #132
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Query Start/End: Original strand, 2 - 161
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| |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
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tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
51905676 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #133
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Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 2733883 - 2734041
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Q |
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attgtcccaaattatatgtcgttttatgataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactccctcttctttcaatt |
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T |
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| Q |
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
2733983 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
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Q |
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7318815 |
ttgtcccaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactactaattactctctcttctttcaatta |
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
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7318715 |
tttaatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8768687 - 8768513
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
8768687 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttatctattaattactctctcttctttcaatta |
8768588 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8768587 |
tttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaataactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #136
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Target Start/End: Complemental strand, 31583328 - 31583170
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Q |
| |
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|
| T |
31583328 |
attgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttttaatt |
31583229 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
31583228 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
31583170 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 42728260 - 42728434
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
42728260 |
ttgtctcaagttgtatgtagctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
42728359 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
42728360 |
cttcatttatatcttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcgttcccacacaa |
42728434 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #138
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Query Start/End: Original strand, 2 - 159
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| Q |
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Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |
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| T |
23549442 |
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23549343 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
23549342 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
23549285 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 4226282 - 4226445
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
4226282 |
ttgtcccaaattatatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaaatc |
4226381 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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| T |
4226382 |
ttttatttatctttctcat-----------aggacaattttgtaaaacagctcataatatcttttttccacacaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
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108 |
Q |
| |
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| T |
48509747 |
aaattatatgtcgttttataatagcaatgaaacattt-tgttattttttctattataattttaactatttattacttactcttctttcaatttttta-tt |
48509844 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttc |
169 |
Q |
| |
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| T |
48509845 |
tatcttttccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttc |
48509905 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
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104 |
Q |
| |
|
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|
| T |
3788093 |
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3788192 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| ||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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| T |
3788193 |
catttttcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
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Target Start/End: Complemental strand, 32871480 - 32871349
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126 |
Q |
| |
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| T |
32871480 |
caataccaattaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttcttttaattctttcatttatctttcctgtatcatt |
32871381 |
T |
|
| Q |
127 |
tattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
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|
|
| T |
32871380 |
tattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
32871349 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #143
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Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 20793379 - 20793537
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| Q |
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
20793379 |
attgtcctaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttattttttttattatatccttaattattaattactctatcttctttcaatt |
20793478 |
T |
|
| Q |
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
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| |
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|
| T |
20793479 |
atttcatttatttttttcataccatttattaaggataattttgtaaaataactcataat |
20793537 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48363609 - 48363435
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| Q |
2 |
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
48363609 |
ttgttccaaattatatgccgctttacaatactaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccgtaactattaattactctctcttctttcaatta |
48363510 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
48363509 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 51417602 - 51417448
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5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
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| T |
51417602 |
tcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctcttttctttcaattattt |
51417503 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
51417502 |
tatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
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Q |
| |
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| T |
14795150 |
aaattatatgtcgctttacgataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtcattaactatttattactctcttttcttttaattccttcgtt |
14795051 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
14795050 |
tatctttcccat-ttaattattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #147
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aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
27999671 |
aaattatatgtcactttacaatactaatgtaacgttaatgttacttttcctattataactttaattatttattactccctcttctttcaattcttttatt |
27999770 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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100 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
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attgtaccaaattatatgtcgttttataatac-aattaaacattaatgttatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaata |
46569062 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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ctttcatttatctttc-cata-tatttgttaaggacaattttgtaaaacaacttatattatctctttcacacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #149
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gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
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23827375 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
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|
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tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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| T |
23827475 |
ttatttatctttcccatat-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #150
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| |
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttcca |
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| |
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26448165 |
ctttaatttatctttcacatttcatttattaaggacaattttgtaacacaactcacaatatcttttttcca |
26448095 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #151
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| |
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41621010 |
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41620911 |
T |
|
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109 |
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159 |
Q |
| |
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| T |
41620910 |
tatcttttccataccatttatttgggataattttgtaaaacaactcataat |
41620860 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #152
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Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10977912 - 10977739
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5 |
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103 |
Q |
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10977912 |
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10977813 |
T |
|
| Q |
104 |
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177 |
Q |
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| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |
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| T |
10977812 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26551711 - 26551534
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1 |
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100 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
101 |
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178 |
Q |
| |
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| T |
26551611 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
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Target Start/End: Complemental strand, 28359864 - 28359708
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19 |
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118 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |
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28359864 |
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28359766 |
T |
|
| Q |
119 |
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176 |
Q |
| |
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28359765 |
atatcatttattgaggaaaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31681773 - 31681596
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100 |
Q |
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31681674 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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||| ||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||| |
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31681673 |
cattcatttatctttcttatgtcatttactaaggacaattttgtaaaataattaataatatccatttcccacacaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 49367478 - 49367301
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100 |
Q |
| |
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| T |
49367478 |
attgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattcatgttacttttcctattatatccttcactatttattgctttctctacttctaagt |
49367379 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
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|
| T |
49367378 |
cattcatttatcttttttatatcatttattaaggtcaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 46272976 - 46272809
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9 |
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107 |
Q |
| |
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| T |
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46272878 |
T |
|
| Q |
108 |
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176 |
Q |
| |
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|
| T |
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ttatctttctcatatcttttattgaggacaattttgtaaaacaacgcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #158
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Query Start/End: Original strand, 4 - 167
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4 |
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103 |
Q |
| |
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| T |
6049742 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaagaattaatattatttttc-tattattttcttaactatttattactctctcttcttttaattatt |
6049840 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |
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|
| T |
6049841 |
taatttatctttcatatatcatctattaagaacaattttataaaacaaatcataatatctcttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19316624 - 19316457
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108 |
Q |
| |
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19316624 |
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19316525 |
T |
|
| Q |
109 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
19316524 |
catcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatatatttcccacacaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50309944 - 50309770
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Q |
| |
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|
| T |
50309944 |
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T |
|
| Q |
101 |
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176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
50309845 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #161
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |
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|
| T |
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attgtcacaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatattacttttcttattatatctttaactatttattactctctattctttcaatt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
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Q |
| |
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||| | ||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |
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| T |
16436198 |
ccttcatctatcttttccatatcatttattaaggataattttataaaacagctcataatatctcttt |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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| Q |
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gctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcat |
120 |
Q |
| |
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| T |
34186479 |
gctttacaatatcaatgaaacattaatattactttttctattataaccttaattatgtattactctatctttttttaattttttaatttatatttctcat |
34186380 |
T |
|
| Q |
121 |
attatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
34186379 |
actatttattaaagataattttgtaaaacaacttataatatttcttt |
34186333 |
T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #163
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Target Start/End: Original strand, 25792206 - 25792366
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108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || || |||| ||||| || |
|
|
| T |
25792206 |
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25792296 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
25792297 |
tatcattcgcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatcttttttccacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
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Q |
| |
|
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| T |
52177825 |
attgtctcaaattgtatgtctctttacaataccaatgaatcattaatattacttttcctattatatcattcactatttatttcattttctacttccaagt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52177925 |
catttatttatctttctcatatcatttattaagaacaattttgcaaaacgactcataatatctctttcccacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #165
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tttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8012613 |
tttattactctctcttctttcaagtcttttatttatttttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaca |
8012514 |
T |
|
| Q |
176 |
a |
176 |
Q |
| |
|
| |
|
|
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a |
8012513 |
T |
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Target: chr1; HSP #166
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| | |
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10085754 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacactaccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttctctcattccaagtc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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attcatttattttttcaatgtcatttattaaatacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #167
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| || | |
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|
| T |
17179505 |
ttgtcccaaattgtatgttactttacaataccaatgaagaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttactactttctcttcttctaagtc |
17179406 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
17179405 |
attcatttatctttcatatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatatccttttcccacacaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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114 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
45269198 |
tatgtcgttttataatctcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttatttcaattatttcatttatctt |
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T |
|
| Q |
115 |
tctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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|
| T |
45269098 |
ttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #169
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| |
|
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|
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| T |
11030084 |
tcccaaattataagtcgttttacaatacgtatgaaaaattaatgttacttttcttattatacccttgactatttattattctctcttctttcaatttttt |
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T |
|
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cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
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| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #170
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48110896 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaatatgaatgaaacattaacgttgcatttc-tattatatcattaactatttaatactctatcttctttca---- |
48110802 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
48110801 |
-----tttatctttcccatatcatttatcaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttctagacaaaa |
48110730 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 39640310 - 39640457
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39640310 |
attgtcctaaattatacgtcgcttaacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaattattaattactatctcttctttcaatt |
39640409 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaa |
148 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
39640410 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaa |
39640457 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 290510 - 290397
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
290510 |
ttgtcccaaattatatgccgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactatctcttctttcaatta |
290411 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatcttt |
115 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||| |
|
|
| T |
290410 |
ttccatttatcttt |
290397 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
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Target Start/End: Original strand, 16966705 - 16966851
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| Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
16966705 |
atatgtcgctttacaataacaatgaaacattaatattatttttcatattatatctttacatatttattactctcacttcttttaattt--------atct |
16966796 |
T |
|
| Q |
114 |
ttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
16966797 |
ttctcatatcatttattaagaacaattttgtaaaataactcataagatctctttt |
16966851 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35150232 - 35150087
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| Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatat |
122 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| | |||| | |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35150232 |
tttacgatatcaatgaaactttaatgttattttttctattatacctttaattgcttattactttctcttctttcaattatttaatttatctttctcatat |
35150133 |
T |
|
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35150132 |
aatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctctttt |
35150087 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6519761 - 6519637
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| Q |
54 |
tttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaact |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6519761 |
tttcctattatatcatgaactatttattactcttccttctttcaattctttaatttatttttctcatatcatttattaaagataattttgtaaaacaact |
6519662 |
T |
|
| Q |
154 |
cataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6519661 |
cataatatttctttctcacacaaaa |
6519637 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 36633303 - 36633176
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36633303 |
ttgtctcaaattatatgttgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcatattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattc |
36633205 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttatt |
130 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
36633204 |
cttcatttatctttcccatatcatttatt |
36633176 |
T |
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Target: chr1; HSP #177
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Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 83146 - 83063
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattact |
84 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
83146 |
attgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattact |
83063 |
T |
|
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Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5432283 - 5432200
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| Q |
93 |
tttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
5432283 |
tttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaagtataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
5432200 |
T |
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Target: chr1; HSP #179
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Target Start/End: Original strand, 17772950 - 17773088
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |
|
|
| T |
17772950 |
caaattataagtcatttcacaatacaaataaaacattaatgttatttttcttattatacccttaactatttattactctctcatttttcaattttttaat |
17773049 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaa |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
17773050 |
ttatctttttcaaatcatttattaagtataattttgtaa |
17773088 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10758798 - 10758689
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| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| || ||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10758798 |
ttaactatctattactctatcttctttcaattatttcattcatcatttccatatcatttattaaagacgattttgtaaaacaactcataatatttctttc |
10758699 |
T |
|
| Q |
169 |
ccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
10758698 |
ccacacaaaa |
10758689 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 173
Target Start/End: Original strand, 36317680 - 36317801
Alignment:
| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgt-aaaacaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36317680 |
ttttcctattataatcttaactatttattattttatattctttcaattatttcattttattttcccatattatttattaaggataattttgtaaaaacaa |
36317779 |
T |
|
| Q |
152 |
ctcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
36317780 |
ctcataatatctctttttcaca |
36317801 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9411047 - 9410945
Alignment:
| Q |
74 |
tatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
9411047 |
tatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaaggacaattttgtaaaataacttataatatatctttcccaaa |
9410948 |
T |
|
| Q |
174 |
caa |
176 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
9410947 |
caa |
9410945 |
T |
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Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 52551701 - 52551568
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| Q |
45 |
aatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgt |
144 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || || | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52551701 |
aatgttatttttcttactacatccttaactattaaatactctatcttctttcaattcttatatttatctttttcatatcatttatcaagaacaattttgt |
52551602 |
T |
|
| Q |
145 |
aaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
52551601 |
aaaacaacttatagtatttccttctcacacaaaa |
52551568 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28979792 - 28979661
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| Q |
39 |
aacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaa |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||| | || |
|
|
| T |
28979792 |
aacattaatgttacttttcctattatatctttaactgtttattgctctctcttctttcaattctattatttatctttctcatactatttatcaaggataa |
28979693 |
T |
|
| Q |
139 |
ttttgt--aaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||| | |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28979692 |
ttttataaaaaaaaactcataatatatctttt |
28979661 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 178
Target Start/End: Original strand, 31181318 - 31181394
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31181318 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataacatctctttcccacacaaaa |
31181394 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 38606217 - 38606134
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactc |
85 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38606217 |
attgtcctaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat-attttaactatttattactc |
38606134 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Original strand, 39739468 - 39739594
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| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaac |
152 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39739468 |
tttttctattatatccttaattatttattactctctcttttttcaattctttaatttatcttttccataccatttattaagaacaattttgtaaaataac |
39739567 |
T |
|
| Q |
153 |
tcataatatatctttt--ccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39739568 |
ttataa-atatctttttcccacacaaaa |
39739594 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #188
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Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 24583872 - 24583947
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatt |
77 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24583872 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatt |
24583947 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36633177 - 36633094
Alignment:
| Q |
93 |
tttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
36633177 |
tttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
36633094 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || ||| || |
|
|
| T |
6596897 |
aaattatgtgtcgctttacgatactaaagaaacattaatgttaatttttctattatattcttaac-atttattactatctcttctttcgcttctttaatt |
6596995 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6596996 |
tatctttcccataccatttattaaggacaattttgtaaaacaa |
6597038 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #191
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| Q |
10 |
aattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaa---tcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
32472750 |
aattataagtcgttttacaataacaatgaaacattaatgtactttt-cctaatatacctttaactatttattattattatctcttctttcaattatttaa |
32472848 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
32472849 |
tttatcttt-tcatataatttattaaggacaattttgtaaaataactcaaaatatctcttt |
32472908 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
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| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
16967012 |
tttatctttctcatatcatttattaagaacaattttgtaaaataactcataagatctctttt |
16967073 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #193
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67 |
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166 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |
|
|
| T |
29091737 |
ccttaactatt-attactctatcttttttcaattttttaatttatttttctgatattatctattaaggacaattttatagaaaaactcataatatatttt |
29091835 |
T |
|
| Q |
167 |
tt |
168 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
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29091836 |
tt |
29091837 |
T |
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Target: chr1; HSP #194
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| Q |
59 |
tattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
47562541 |
tattatactcttaactatttactactattacttctttcaattctttaatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttataaaacaatacataa |
47562640 |
T |
|
| Q |
159 |
tatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
47562641 |
tatatatttt |
47562650 |
T |
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Target: chr1; HSP #195
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13 |
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112 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
52551826 |
tatacgtcgttttacaatatcaatgattcattaatattatttttcttattacatccttaactatttaatactctctcttctttcaattctttcatttatc |
52551727 |
T |
|
| Q |
113 |
tttctcatattatttat |
129 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
52551726 |
tttttcatatcatttat |
52551710 |
T |
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Target: chr1; HSP #196
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8 |
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107 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | || ||| | |||||||||||||| | |
|
|
| T |
487509 |
caaattataaatcgttttatgataccaatgaaacattaatgtttttttt--tattataaccttaaccatctcttcctctcttttctttcaatttttaaat |
487606 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaac |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
487607 |
ttatctttatcgtataatttattaaggaaaattttgtaaaac |
487648 |
T |
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39 |
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138 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || || |||||||||| || | |
|
|
| T |
25163220 |
aacattaatgttacatttcctattatactcttgactatttattactt--tcttctttcaattctttagtttatctttttcctagtatttattaaagacta |
25163123 |
T |
|
| Q |
139 |
ttttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
25163122 |
ttttgtaaaacaacttaaaatatat |
25163098 |
T |
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33 |
caatgcaacattaatgttgtttttcct-attataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttatta |
131 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||| || |
|
|
| T |
40332502 |
caatgaaacattaatgttttttttttttattataacattaattatttattactctatcttttttcaattcttttatttatttttttcataccatttaata |
40332601 |
T |
|
| Q |
132 |
agaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| || | ||||||| |
|
|
| T |
40332602 |
aggacaattttgtaaaataatttataatat |
40332631 |
T |
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100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | |||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
9902016 |
attgtctcaaattagaagtcgttttataatatcaataagacattaatgttatttttc-tattatactcttaactatttattgctctctctt--ttcaatt |
9902112 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactc |
154 |
Q |
| |
|
| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9902113 |
taat---ttatttttctcatgtgatttattaagaacaattttgtaaaacaactc |
9902163 |
T |
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23 |
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122 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| || | || |||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17633654 |
tttacgatacgaatgaaacattaatgttatattt---attatacccttaactatttatttctgtcttttttttcaattctttaatttatctttttcatac |
17633750 |
T |
|
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17633751 |
tatttattaatgacacttttgtaaaataactcataatat |
17633789 |
T |
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
26060731 |
aaattataagtcgttttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcatattacacctttaactatttattactatctcttctttcaattctttaatt |
26060632 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
||| |||| |||| |
|
|
| T |
26060631 |
tatatttcccata |
26060619 |
T |
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| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaa |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
3875747 |
ttaactatttattactttatcttctttcaattcttttatttatctttctcatatcattaatgaaggataattttgtaaaa |
3875826 |
T |
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgt |
49 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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34022410 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgt |
34022363 |
T |
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
35691738 |
aaattataagtcattttacaataccaataaaacattaattttactttttatattatacccttaattatttattactcaa--ttctttcaaatttttaatt |
35691641 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattt |
141 |
Q |
| |
|
||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35691640 |
tatttttc-cataacatttatgaagaacaattt |
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T |
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8 |
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107 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
41617652 |
caaattataaatcgttttacaataccagtgaaacattaatgttactttttctattatacttttaactatttattactattttttctttcaattctttaat |
41617553 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
41617552 |
ttatctttc |
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T |
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41 |
cattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaatt |
140 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||| || | | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
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cattaatgctattttttctattgtattcttaactatttattactc--ttttctttctattctttaatttatttttcccacaccaattattaaggacaatt |
16689270 |
T |
|
| Q |
141 |
ttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
16689269 |
ttgtaaaacaa-tcataatatctctttcccatacaaaa |
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T |
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tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27352406 |
tttatatttctcatataatttattaaagacaattttataaaacaactcataatat |
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T |
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tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30093776 |
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T |
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122 |
ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46288096 |
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tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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178 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| | ||| ||||||||| |
|
|
| T |
47945884 |
tcttgttttaattctttcatttatcttttttatattatttattaaggacaattttataaaacaattcgtaatatctttttctcacacaaaa |
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T |
|
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4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattata |
65 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5432400 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaattaaacattaatgttacttttcctattata |
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T |
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tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcc-tattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || ||| || |||||||||| || | |
|
|
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48070512 |
tttacaataccaatgaaattttaatgttattttttcatattatgaccttaactatttattactc--ttttcttttaactttatcatttatctttcgcaca |
48070415 |
T |
|
| Q |
122 |
ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| || |||| |||||| ||||| |||| ||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
48070414 |
ccattaatgtagaataattttataaaataacttataatctttctttcccatacaaaa |
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T |
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98 |
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |
|
|
| T |
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Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4321142 |
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T |
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| |
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|||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 27288888 - 27288853
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaat |
36 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27288888 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaat |
27288853 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14794914 - 14794860
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
14794914 |
atttattaaggataattttataaaacaactcataatttatctttcccatacaaaa |
14794860 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 31181264 - 31181306
Alignment:
| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaa |
46 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
31181264 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaagcattaa |
31181306 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 178
Target Start/End: Original strand, 42334650 - 42334720
Alignment:
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||| |
|
|
| T |
42334650 |
ttatctttctcgtatcatttatcaaggataattttgtaaaacaacgcataatacatttttccaacacaaaa |
42334720 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7038092 - 7038035
Alignment:
| Q |
119 |
atattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
7038092 |
atatcatttattaaggacaatattgtaaaacaattcttaatatctcttttccatacaa |
7038035 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 159
Target Start/End: Original strand, 50972931 - 50972995
Alignment:
| Q |
94 |
ttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50972931 |
ttcaattctttaatttatctttcacatac-atttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
50972995 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 290388 - 290336
Alignment:
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
290388 |
tttatcttttccatatcatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
290336 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Original strand, 46529980 - 46530036
Alignment:
| Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactattta |
79 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
46529980 |
tttataataccaataaaacattaacgttatttttcctattatatcattaactattta |
46530036 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 230)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 2409785 - 2409959
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2409785 |
ttgtcccaaattatatgtctctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
2409884 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2409885 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaataaatcataatatatcttttccacacaa |
2409959 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19807059 - 19806891
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
19807059 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattattttat |
19806960 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19806959 |
ttatctttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacatctcataatatttcttttccacacaa |
19806891 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20788374 - 20788200
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20788374 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaatta |
20788275 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
20788274 |
tttcatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcatttcctcacaa |
20788200 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29832304 - 29832130
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29832304 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
29832205 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29832204 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaa |
29832130 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 32402721 - 32402881
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32402721 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaatt |
32402820 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32402821 |
atttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
32402881 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 39915813 - 39915989
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39915813 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttccaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactttctcttctttcaattc |
39915912 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
39915913 |
tttcatttatctttctcatattatttattaagatcaattttataaaacaactcataatatctcattttcacacaaaa |
39915989 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41608861 - 41608689
Alignment:
| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |
|
|
| T |
41608861 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctcttatttcaattctt |
41608762 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41608761 |
tcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
41608689 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4294167 - 4293993
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
4294167 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
4294068 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
4294067 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacatctcataatatctctttcccacacaa |
4293993 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 23237043 - 23237217
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23237043 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattc |
23237142 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
23237143 |
tttcatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaa |
23237217 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 26799387 - 26799561
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26799387 |
ttgtcccaaattatatgtcattttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattatttattactccctcttctttcaattc |
26799486 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
26799487 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttattttccacacaa |
26799561 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53334095 - 53333921
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
53334095 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattgatgttactttttctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattc |
53333996 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
53333995 |
tttcatttatatttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
53333921 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1607030 - 1606857
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
1607030 |
attgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattgtaaccttaacgatttattactctcttttttttcaatt |
1606931 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacac |
174 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1606930 |
atttcatttatctttttcatattatttatttaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacac |
1606857 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 37912490 - 37912660
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37912490 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
37912589 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37912590 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaac----cataatatctcttttccacacaa |
37912660 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 37669962 - 37670133
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
37669962 |
tcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattcttt |
37670061 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
37670062 |
catttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcacaatatctctttcccacacaa |
37670133 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30088836 - 30088662
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
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| T |
30088836 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
30088737 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
30088736 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaa |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 37730992 - 37730818
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2 |
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101 |
Q |
| |
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37730992 |
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T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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37730892 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49235997 - 49235823
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2 |
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101 |
Q |
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ttgtcccaaattctatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
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T |
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102 |
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Q |
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attcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
49235823 |
T |
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Target: chr4; HSP #18
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Target Start/End: Complemental strand, 26707394 - 26707230
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| |
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ttatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgctacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttatttcaattctttcatttat |
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T |
|
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26707294 |
ctttcccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #19
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Target Start/End: Original strand, 13494145 - 13494320
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T |
|
| Q |
101 |
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176 |
Q |
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| T |
13494245 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17609213 - 17609042
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| Q |
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104 |
Q |
| |
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| T |
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tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattattt |
17609114 |
T |
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| Q |
105 |
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176 |
Q |
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| T |
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catttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
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Target Start/End: Original strand, 34735961 - 34736132
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Q |
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T |
|
| Q |
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172 |
Q |
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34736061 |
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34736132 |
T |
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Target: chr4; HSP #22
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T |
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168 |
Q |
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44197390 |
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44197457 |
T |
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Target: chr4; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49651088 - 49650913
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Q |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
49650988 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaagaacagttctgtaaaacaattcataacatcttttttccacacaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
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| T |
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27383573 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
27383572 |
ttttatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
27383498 |
T |
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Target: chr4; HSP #25
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Target Start/End: Original strand, 43566038 - 43566213
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Q |
| |
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43566038 |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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| T |
43566136 |
ctttcatttatttttcacatattatttattaaggacaattttgtagaacaattcataatatctcttttccacacaaaa |
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T |
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Q |
| |
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T |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttc |
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Q |
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| T |
25367382 |
ttttatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc |
25367315 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
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| T |
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T |
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| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
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ctttcatttatttttc-catattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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T |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
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tttcatttatctttcccatgttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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attcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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103 |
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| |
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tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgt-aaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
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tcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctcttttccaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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104 |
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cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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2401366 |
ctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
2401441 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32397509 - 32397334
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
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attgtcacgaattatatgtcgttttacaatacctatgtaacattaatgttattttttctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaatt |
32397410 |
T |
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
32397409 |
cttttatttatttttcccatattatttattaaggacaattttttaaaacatttcataatatttcttttccacacaa |
32397334 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48510875 - 48510700
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
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48510875 |
attgtcccaaattatatgtcgttttacattaccaatgcaacattaatgttacttttccaattgtaaccttaactatttatttttatctcttctttcaatt |
48510776 |
T |
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| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
48510775 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatattttttttccacacaa |
48510700 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11248986 - 11248812
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
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| T |
11248986 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
11248887 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
11248886 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
11248812 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 23222514 - 23222688
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
23222514 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctgttatatccttaactatctattactctttcttctttcaattc |
23222613 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
23222614 |
tttcatttatctttctcgtatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctattttccacacaa |
23222688 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42507774 - 42507600
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
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| T |
42507774 |
ttgtcccaaattgtatatcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
42507675 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
42507674 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
42507600 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47869279 - 47869105
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttttttcaattc |
47869180 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
47869179 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
47869105 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 34447675 - 34447847
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
34447675 |
ttgtcccaaattatatgtcgcttcacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
34447774 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacac |
174 |
Q |
| |
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| T |
34447775 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
34447847 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 35836101 - 35836269
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| Q |
8 |
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107 |
Q |
| |
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| T |
35836101 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattattctctcttctttcaaatcttttat |
35836200 |
T |
|
| Q |
108 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
35836201 |
ttatctttccaatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
35836269 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1788832 - 1788673
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
1788832 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccgataaaacattaatgttacttttcctattatatcgttaattatctattactctctcttctttcaattc |
1788733 |
T |
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| Q |
102 |
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161 |
Q |
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| T |
1788732 |
tttcatttatctatctcatatcatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
1788673 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36878679 - 36878520
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
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| T |
36878679 |
ttgtcctaaattgtacgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattc |
36878580 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
36878579 |
tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
36878520 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41458931 - 41458759
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
41458931 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactc--tcttctttcaattc |
41458834 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
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attcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
41458759 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 56038654 - 56038483
Alignment:
| Q |
2 |
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Q |
| |
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| T |
56038654 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
56038555 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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| T |
56038554 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccaca |
56038483 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10125719 - 10125545
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
10125719 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
10125620 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
10125619 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20540491 - 20540317
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Q |
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| T |
20540491 |
ttgttccaaattatatgtcgttttataatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
20540392 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
20540391 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25771216 - 25771042
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101 |
Q |
| |
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| T |
25771216 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacatcaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
25771116 |
tttcatttatttttttcatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29495001 - 29494827
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101 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatac |
29494902 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
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cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
29494827 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
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| T |
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tttcatttatctttcccatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
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| |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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33244907 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
43587708 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaatacaaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
43587807 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
43587808 |
ttttatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaaacaa |
43587882 |
T |
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Target: chr4; HSP #53
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
48380616 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
48380715 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
48380716 |
tttcatttattttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
48380790 |
T |
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2 |
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101 |
Q |
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18052755 |
ttgtcctaaattgtatgtcgatttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
18052854 |
T |
|
| Q |
102 |
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163 |
Q |
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18052855 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatat |
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T |
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103 |
Q |
| |
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gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttccaattatatccttaagtatttattactctttattccttcaattctt |
26882867 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
26882868 |
tcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
26882940 |
T |
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Q |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatatccttaactattaattactccctcttctttcaatt |
23138176 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
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atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttctccacacaa |
23138252 |
T |
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| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
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| T |
33501366 |
gtcccaaattggatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaagtctt |
33501465 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
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| T |
33501466 |
ttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacaca |
33501537 |
T |
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Target: chr4; HSP #58
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Q |
| |
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| T |
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34246896 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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atttcatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctatttcccacacaa |
34246972 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 55925703 - 55925878
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Q |
| |
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| T |
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55925802 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
55925803 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
55925878 |
T |
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Target: chr4; HSP #60
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Target Start/End: Original strand, 5388201 - 5388375
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101 |
Q |
| |
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ttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
5388300 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
5388301 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaa |
5388375 |
T |
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Target: chr4; HSP #61
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Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactttttcttctttcaattc |
10555235 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctttttcccacacaa |
10555160 |
T |
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Target: chr4; HSP #62
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101 |
Q |
| |
|
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| T |
13880494 |
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13880593 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
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| T |
13880594 |
cttcatttatctttcccatatcaattattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
13880668 |
T |
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Q |
| |
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| T |
22019133 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttttttcaattc |
22019232 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
22019233 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaa |
22019307 |
T |
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101 |
Q |
| |
|
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|
| T |
22100958 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactatctcttctttcaatta |
22101057 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
22101058 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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101 |
Q |
| |
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26740356 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
26740355 |
ctttatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
26740281 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| | |
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| T |
42168320 |
ttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaacgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaaatc |
42168419 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42168420 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
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122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
596367 |
tttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttctcatat |
596268 |
T |
|
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
596267 |
catttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
596214 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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3 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttt |
102 |
Q |
| |
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||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
23137729 |
tgtcccaaattgtaggtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcc |
23137828 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
23137829 |
ttcatttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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26483225 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttaccttttctattatatacttaactatttattactatctcttctttcaattc |
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26483125 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
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tttcctttatctttctcatattatttatta |
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| |
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32882264 |
ttttatttatctttctcatattgtttatta |
32882293 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49226610 - 49226465
Alignment:
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29 |
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128 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
49226610 |
ataccaatgcaatattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactc--tcttctttcaattctttcatttatttttcccatattattta |
49226513 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
49226512 |
ttaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
49226465 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 51487786 - 51487627
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
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|
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|
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attgtcccaaattatatgtcactttacaatatcaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaactatttattattatctcttctttcaatt |
51487687 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51487686 |
ctttcatttatatttctcatatta-ttattaaagacaattttgtaaaacaactcacaatat |
51487627 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 39417841 - 39418016
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1 |
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100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
39417841 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaagtattaattaccctctcttctttcaatt |
39417940 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39417941 |
atttcatttatatttctcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
39418016 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 20180410 - 20180584
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2 |
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101 |
Q |
| |
|
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| T |
20180410 |
ttgtcccaaattgtacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactcttttttttttcaattc |
20180509 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
20180510 |
tttcatttatctttcccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
20180584 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
31648572 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgagaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
31648473 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||| ||||| |||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
31648472 |
cttcatttatttttcccatatcatttattgaggacaattgtgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
31648398 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 34002213 - 34002371
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
34002213 |
attgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaatt |
34002312 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
34002313 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
34002371 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42629820 - 42629646
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
42629820 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattc |
42629721 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
42629720 |
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42629646 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 46390750 - 46390923
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
46390750 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttactttttctattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattc |
46390848 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
46390849 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
46390923 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 52920822 - 52920652
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
52920822 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattgtttcttttttcaattc |
52920723 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
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|
| T |
52920722 |
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52920652 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 55968584 - 55968758
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
55968584 |
ttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
55968683 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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| T |
55968684 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaatgataattttgtaaaataaatcataatatctctttcccacacaa |
55968758 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7258147 - 7257982
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101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7258147 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttagctatttattactctttcttctttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7258047 |
tttcatttatttttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
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T |
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Back To:
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106 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17678575 |
caaattgtatgtcactttacaatactaatgaaaacattaatgttatttttcatattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattttttca |
17678674 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17678675 |
tttatcattctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcgtaatatct-ttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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101 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
25063848 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
25063749 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
25063748 |
tttcatttatcttttttataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
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9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
27956054 |
aaattatatatcgctttaaaataccaatgcaac-------ttacttttcctattataaccttaattatttattactctattttctttcaattctttcatt |
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T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27955961 |
tatctttcccatattatttattaagaacaaatttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
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101 |
Q |
| |
|
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| T |
35877081 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttccaatactaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttgtttcaattc |
35876982 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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|
| T |
35876981 |
ttttatttaattttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #86
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107 |
Q |
| |
|
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| T |
41858762 |
caaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcat |
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T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
41858862 |
ttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #87
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| |
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
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Q |
| |
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|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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| |
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||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #89
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Query Start/End: Original strand, 8 - 176
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| |
|
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|
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6628919 |
caaattatatgtcactttagaatatcaattaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcctttttcaattctttcat |
6629018 |
T |
|
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108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
6629019 |
ttatctttctcatataatttaataaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
6629087 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 19877796 - 19877972
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
19877796 |
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19877895 |
T |
|
| Q |
102 |
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178 |
Q |
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| T |
19877896 |
tttaatttatctttcccatacaacttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaaaa |
19877972 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #91
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Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Original strand, 21634615 - 21634770
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5 |
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104 |
Q |
| |
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| T |
21634615 |
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21634713 |
T |
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| Q |
105 |
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161 |
Q |
| |
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| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
21634714 |
catttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
21634770 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36871481 - 36871313
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| Q |
8 |
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107 |
Q |
| |
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| T |
36871481 |
caaattatacgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcagttccttcat |
36871382 |
T |
|
| Q |
108 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
36871381 |
ttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #93
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Target Start/End: Original strand, 3506060 - 3506219
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9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
3506060 |
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3506159 |
T |
|
| Q |
109 |
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168 |
Q |
| |
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| T |
3506160 |
tatctttcccatattatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttt |
3506219 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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100 |
Q |
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| T |
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16605328 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
16605329 |
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16605404 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23949769 - 23949605
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| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattata----accttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
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| T |
23949769 |
caaattatatgtcgctttacaatataaatgcaacattaatgttattttttctattatatataaccttaactatttatcactctcttttcttttaattatt |
23949670 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
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| T |
23949669 |
tcttttatctttctaatattatttattaagaacaattttttaaaacaactcatgatatctctttt |
23949605 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 27851213 - 27851384
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| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
27851213 |
tcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattattt |
27851312 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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|
| T |
27851313 |
catttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcactttcccacacaa |
27851384 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33600022 - 33599863
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
33600022 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactttttcttctttcaattc |
33599923 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
33599922 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataacttataatat |
33599863 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 37390545 - 37390712
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |
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| T |
37390545 |
aaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcttt |
37390644 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37390645 |
tatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaa |
37390712 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41988194 - 41988027
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
41988194 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattaccttctcttctttcaaatccttcatt |
41988095 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
41988094 |
tatcttttccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
41988027 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 53690280 - 53690455
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
53690280 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaatt |
53690379 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
53690380 |
atttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaa |
53690455 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 56299728 - 56299887
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| Q |
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101 |
Q |
| |
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| T |
56299728 |
ttgttccaaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattaatctctcttctttcaattt |
56299827 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
56299828 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatat |
56299887 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #102
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Target Start/End: Complemental strand, 8178204 - 8178038
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100 |
Q |
| |
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| T |
8178204 |
attgtcccacattatatgttgctttacaataccaataaaacattaatgtaatttttcatattatatcctttactatttattactctctcttatttcaatt |
8178105 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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| T |
8178104 |
ctttcatttatctttcccatataatttattgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttt |
8178038 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
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| T |
22320572 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
22320671 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
22320672 |
tttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
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| T |
30049510 |
ttgtcccaaattatatgttgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
30049609 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
30049610 |
tttcatttatcttttccatgctatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaa |
30049684 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #105
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
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| T |
36937241 |
ttgtcccaaattatatgtctctttacaataccaataaaaaattaatattactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
36937340 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
36937341 |
cttcatttatctttcacatatcatttattgaagataattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #106
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Q |
| |
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| T |
43050208 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactccctcttcttttaatta |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
43050308 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #107
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| |
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T |
|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
|
|||| |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #108
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2 |
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101 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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| T |
22842948 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
22843047 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
22843048 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
22843105 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 28002557 - 28002714
Alignment:
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
28002557 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
|
| T |
28002657 |
tttcatttatcttttccatactatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
28002714 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
29753194 |
ttgtcccaaattagatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaattattaattactctttcttctttcaatta |
29753095 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
29753094 |
tttcatttatcttttccatacaatttattatggataattttgtaaaacaactcataat |
29753037 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33924950 - 33924785
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
33924950 |
ttgtcccagattatatgtcactttacaattccaataaaacattaatgttacttttcctattatatctttaattatttattactctttcttctttcaattc |
33924851 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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| T |
33924850 |
ttttatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
33924785 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37175408 - 37175251
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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| T |
37175408 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
37175309 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
37175308 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
37175251 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 54315095 - 54315272
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100 |
Q |
| |
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|||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||| ||| | |
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| T |
54315095 |
attgtctcaaattgtatgtcgcattacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgctttctctacttccaagt |
54315194 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
54315195 |
cattcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
54315272 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #114
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Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9542601 - 9542429
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| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
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| T |
9542601 |
gtcccaaattatatgtcactttgcaataccaatgaaacattaacgttaattttcctattatgtccctaactatttgttactctctcttctttcaattctt |
9542502 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
9542501 |
tcatttaacttttccatatcatttattaagaacaatttagtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
9542429 |
T |
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Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38794037 - 38793885
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22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |
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| T |
38794037 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttatgtttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
38793938 |
T |
|
| Q |
122 |
ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacac |
174 |
Q |
| |
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| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
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| T |
38793937 |
tcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
38793885 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #116
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 288386 - 288561
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100 |
Q |
| |
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| T |
288386 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattattgttacttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttcaatt |
288485 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
288486 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
288561 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 23662568 - 23662742
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| Q |
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100 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
23662568 |
attgtcccaaattgtatgtcactttacaatactaatgaaatattaatgttacttttcctaatatatcattaattatttattactctttcttctttcaatt |
23662667 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
23662668 |
ctttcatttatttttc-catatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaa |
23662742 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 13800374 - 13800547
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
13800374 |
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13800472 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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|
| T |
13800473 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
13800547 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #119
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Target Start/End: Complemental strand, 16833843 - 16833677
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100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |
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|
| T |
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attgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattacataattaactattaattactctctcttctttctatt |
16833744 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16833743 |
cattcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
16833677 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29290349 - 29290175
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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|||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||| |
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| T |
29290349 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaatattaatgttacttttcctattatattcttaattatttattactctttattttttcaattc |
29290250 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
29290249 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
29290175 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
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101 |
Q |
| |
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|||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| |
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| T |
34491921 |
ttgttccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactctttcgtttttcaattc |
34491822 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
34491821 |
tttcatttatttttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccccacaa |
34491747 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38852875 - 38852701
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
38852875 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcttattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
38852776 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
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| T |
38852775 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #123
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
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| T |
41414306 |
attgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
41414206 |
atttcatttatctttttcataccatttattaaggataattttgtaaaataactcataat |
41414148 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Query Start/End: Original strand, 1 - 159
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
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atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #125
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Q |
| |
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| T |
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ttgtcctaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
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Q |
| |
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| T |
52183998 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #126
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8 |
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107 |
Q |
| |
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| T |
22128769 |
caaattatatatcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatcttttctattatatcattaactatttattactctattttcttttaattctttcat |
22128868 |
T |
|
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108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| T |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #127
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Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 31486897 - 31487068
Alignment:
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2 |
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101 |
Q |
| |
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|
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| T |
31486897 |
ttgtcccaagttgtatgtcactttacaataccaatgagttattaatgttatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattc |
31486996 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacac |
174 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
31486997 |
tttcatttatctttcccat-tcatttattaatgataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
31487068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 46674903 - 46675062
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
46674903 |
ttgtctcaaattttatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaactatctattactctttcttctttcaattt |
46675002 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcc-tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
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| T |
46675003 |
tttccatttatatttctcatatcatttattaa-tgtaattttgtaaaacaattcataatat |
46675062 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Original strand, 30418749 - 30418904
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| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| || |
|
|
| T |
30418749 |
gtcccaaattatatgtcgctttagaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattagtctctcttctttcaattatt |
30418848 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30418849 |
tcatttatcttttccataccatttattaaggataattttataaaacaactcataat |
30418904 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 51779576 - 51779735
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
51779576 |
ttgtcctaaattatatatcgttttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattattctctcttcttttaattc |
51779675 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
51779676 |
cttcatttaattttctcatatcatttattaaggacgattttgtaaaacaactcataatat |
51779735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 16032333 - 16032507
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
16032333 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccctaactattaattactctctcttctttcaatta |
16032432 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16032433 |
tttcatttatcttttccatgccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
16032507 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23511333 - 23511159
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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| T |
23511333 |
ttgtcccaaattgtatgtttctttataataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
23511234 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
23511233 |
tttcatttatcttttccataacatctattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaa |
23511159 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42133789 - 42133620
Alignment:
| Q |
11 |
attatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatct--tctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| || |
|
|
| T |
42133789 |
attatatgtcgctttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcccattatatccttaattatttattactctctctcttctttcaattctttaatt |
42133690 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
42133689 |
tatcttttccatacaatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttttcacacaaaa |
42133620 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 47170924 - 47170766
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47170924 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactaataattattctctcttctttcaatt |
47170825 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
47170824 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaatacaactcataat |
47170766 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 51234950 - 51234776
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
51234950 |
ttgtcccaaattgtacgtcattttagaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattc |
51234851 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
51234850 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcacaatatctctttcccacacaa |
51234776 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 52397931 - 52397773
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| |
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| T |
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attgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcttattatatcattaactattaattactttctcttctttcaatt |
52397832 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
| T |
52397831 |
atttcatttatcattttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
52397773 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 388085 - 388262
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Q |
| |
|
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|
| T |
388085 |
attgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattagtgttacttttcctattatatccttcactatttattgcattctctacttccaagt |
388184 |
T |
|
| Q |
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
388185 |
cattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
388262 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 7770496 - 7770671
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7770496 |
ttgtctcaaattatatgtcactttacaatac-aaggaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttactgttctctctcttctttcaat |
7770594 |
T |
|
| Q |
100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
7770595 |
tccttcatttatctttcccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
7770671 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 54270811 - 54270976
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100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
54270811 |
attgtcctaaattatatttcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactattaattactttctcttctttcaatt |
54270910 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54270911 |
atttcatttatcttttccataccttatattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatctt |
54270976 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44622455 - 44622282
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| Q |
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101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
44622455 |
ttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattactc--tcttttttcaatta |
44622358 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttct-catattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
44622357 |
tttcatttatttttttccataccatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50690649 - 50690482
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107 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | |
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| T |
50690649 |
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T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
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ttatcattcccataacattta-taaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #142
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Query Start/End: Original strand, 39 - 178
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138 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
26855399 |
aacattaatgttacttttcctgttatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcccatacaatttattaaggacaa |
26855498 |
T |
|
| Q |
139 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
26855499 |
ttttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaaaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #143
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||| |
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|
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T |
|
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
29977039 |
ctttcatttaattttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctcttttccatacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13252395 |
ttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactatctcttctttca---- |
13252300 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
13252299 |
-----tttatttttc-catatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
13252231 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #145
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Query Start/End: Original strand, 9 - 159
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| |
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|
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109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30609380 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
30609430 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Original strand, 6284026 - 6284183
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4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
6284026 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcatattatgtccttaactatttattattatctcttctttcaattctt |
6284125 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
6284126 |
taatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaagcaactcataatat |
6284183 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
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31 |
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130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
15986582 |
accaatgcaacattaatgttactttttcaattgtaaccttaactatttattattattttttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttatt |
15986483 |
T |
|
| Q |
131 |
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176 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
15986482 |
aaggataattttgtaaaacaactcataatatctttcttccacacaa |
15986437 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
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Target Start/End: Original strand, 23153709 - 23153874
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| Q |
13 |
tatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatc |
112 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |
|
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| T |
23153709 |
tatatgtcactttataataccaatgaaatattaatgttactttttctgttatgtcattaactatttattactctctcgtctttcaattctttaatttatc |
23153808 |
T |
|
| Q |
113 |
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178 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
23153809 |
tttctcatactatttactaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttttacacaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #149
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Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Original strand, 34018751 - 34018888
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39 |
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138 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |
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|
| T |
34018751 |
aacattaatgttaatttttgtattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataa |
34018850 |
T |
|
| Q |
139 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
34018851 |
ttttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaa |
34018888 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #150
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Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36507564 - 36507387
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
36507564 |
attgtcccaaattgtattttgctttacaataccaatgaaacattaattttatttttcctattatatatttaactatttattactttatctcattccaagt |
36507465 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
36507464 |
cattcatttatcttttccatatcatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaaacaaaa |
36507387 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 51817182 - 51817017
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | || |||||||| |
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| T |
51817182 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcattaactatttattactcttttttttttcaattc |
51817083 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
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|
| T |
51817082 |
ttttatttatctttcccagatcatttataaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
51817017 |
T |
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Target: chr4; HSP #152
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Query Start/End: Original strand, 42 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13394531 - 13394399
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| Q |
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141 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |
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|
| T |
13394531 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaagacaattt |
13394432 |
T |
|
| Q |
142 |
tgtaaaacaactcataatatatcttttccacac |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13394431 |
tgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
13394399 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13397670 - 13397538
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| Q |
42 |
attaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |
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| T |
13397670 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaagacaattt |
13397571 |
T |
|
| Q |
142 |
tgtaaaacaactcataatatatcttttccacac |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13397570 |
tgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
13397538 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42179687 - 42179524
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
42179687 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattgatgttacttttcctattataaccttaactattcattactctctcttctttcaagtc |
42179588 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
42179587 |
ttttatttatctttcccat-----------agaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaa |
42179524 |
T |
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Target: chr4; HSP #155
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Target Start/End: Complemental strand, 8591904 - 8591753
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25 |
tacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatatta |
124 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8591904 |
tacaataccaatgaaatatcaatgttacctttcctattatatccttagctatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatca |
8591805 |
T |
|
| Q |
125 |
tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
8591804 |
tttattaaagataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaa |
8591753 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #156
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Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9583786 - 9583622
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |
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| T |
9583786 |
aaattatatgtcgctttacgatactaataaaatattagtgttacttttcccattatatctttaactatttagtactc--tcttctttcaatttttttatt |
9583689 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
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|
| T |
9583688 |
tatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatccctttcccacaca |
9583622 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9589481 - 9589317
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9589481 |
aaattatatgtcgctttacgatactaataaaatattagtgttacttttcccattatatctttaactatttagtactc--tcttctttcaatttttttatt |
9589384 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
9589383 |
tatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatccctttcccacaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #158
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caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttc-ctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10699438 |
caaattataagtcggtttaaaataccaatgaagaattaatgttatttttttctattataccattaattatttattactctctcttctttcaattctttaa |
10699339 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10699338 |
tttatctttcgcatagtatttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatttcttttccatacaaaa |
10699267 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
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| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttc-ctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10913208 |
caaattataagtcggtttaaaataccaatgaagaattaatgttatttttttctattataccattaattatttattactctctcttctttcaattctttaa |
10913109 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10913108 |
tttatctttcgcatagtatttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatttcttttccatacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #160
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101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37787920 |
ttgtcctaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactc--tcttctttcaatta |
37788017 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||| || |||| |||||||| | | |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
37788018 |
tttcatttatcctttccataccatttattagggataattttgtaaaataactcataatttctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #161
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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100 |
Q |
| |
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|||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| | |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
43609305 |
attgtctcaaactgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatatgttac----tctttcttcaatt |
43609400 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
43609401 |
ctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcaaaatatctctttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactatctcttctttcaatt |
44570934 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatcttt |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |
|
|
| T |
44570935 |
atttcatttatcttt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #163
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Query Start/End: Original strand, 9 - 176
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aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |
|
|
| T |
6920653 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
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T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6920753 |
tatcttttccat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
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39 |
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| |
|
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|
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aacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttatta-tctctcttctttcaattctttaatttatctttctcataccatttattaaggaaaa |
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T |
|
| Q |
139 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
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| |
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|
| T |
32385461 |
ttttgtaaaataattcataatatctatttcccacacaaaa |
32385422 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 14604248 - 14604401
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8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
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| T |
14604248 |
caaattatatgtcgctttacaataccaacgaaacattaatgtaacttttcctattataactttaactagttattattctcgcttctttccattctttaat |
14604347 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
14604348 |
ttatcattctcataccatttattaaggataattttgtaaaataacacataatat |
14604401 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22496700 - 22496523
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
22496700 |
attgtcccaaattgtatgtgtctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcgctatttattgcattctctacttccaagt |
22496601 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|
| T |
22496600 |
catttatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacgactcataatatatctttcccacataaaa |
22496523 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 14965380 - 14965556
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |
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| T |
14965380 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttgcaatactaatgaagcattaatgttatttttcctattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtc |
14965479 |
T |
|
| Q |
102 |
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178 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |
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| T |
14965480 |
attcatttatctttcccatatcatttactaaagataattttgtaaaacaattcaaaatatccattttccacgcaaaa |
14965556 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30649826 - 30649650
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| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
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| T |
30649826 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattttatcctttaactcttaattgctccctattctttcaat |
30649727 |
T |
|
| Q |
100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
30649726 |
tattttatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
30649650 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6154199 - 6154054
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| Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactattta--ttactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctc |
118 |
Q |
| |
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| T |
6154199 |
gctttacaatatcaatgaaacattaatgttaattttcctattataccattaactatttacgttactctttcttctttcaattttttaatttatttttcgc |
6154100 |
T |
|
| Q |
119 |
atattatttattaagaacaattttgt-aaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
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||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
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|
| T |
6154099 |
ataccatttattaaggacaattttgtgaacacaactcataatatat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 10754463 - 10754633
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| Q |
8 |
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107 |
Q |
| |
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| T |
10754463 |
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10754562 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |
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|
| T |
10754563 |
ttatctttcgcatggtatttattaaggaaaattttgtaaaacaattcataatatttcttttccatacaaaa |
10754633 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 10968232 - 10968402
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| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
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||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| | ||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||| | |
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|
| T |
10968232 |
caaattataagtcggtttaaaataccaatgaagaattaatgttactttttctattatacctttaactaatcattactctctattctttcaattctttaat |
10968331 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|
| T |
10968332 |
ttatctttcgcatggtatttattaaggaaaattttgtaaaacaattcataatatttcttttccatacaaaa |
10968402 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 23138300 - 23138434
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| Q |
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141 |
Q |
| |
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| T |
23138300 |
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23138399 |
T |
|
| Q |
142 |
tgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23138400 |
tgtaaaacaactcataatttctcttctccacacaa |
23138434 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29462739 - 29462583
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |
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|
| T |
29462739 |
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29462642 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |
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|
| T |
29462641 |
tatctttcctatatcatttattaaagacaattttgtagaataactcataatatctcttt |
29462583 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 35340648 - 35340806
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
35340648 |
aaattataaatcgttttacaataccaatgaaacattaataatattttttctattatacccttgacaaattattattttatcttctttcaattctttaatt |
35340747 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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| T |
35340748 |
tatctttcttataccatttatcaagaacaattttgtaaaacaattcataatatctcttt |
35340806 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39603436 - 39603322
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| Q |
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ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |
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|
| T |
39603436 |
ttttcctattatacccttaactatttattactttttcttctttcaattttttaatttatctttcccataccatttattaaggacaattttgtaaagcaac |
39603337 |
T |
|
| Q |
153 |
tcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
39603336 |
tcagaatatctcttt |
39603322 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #176
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Query Start/End: Original strand, 7 - 176
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| Q |
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ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
46481652 |
ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacgttaatgttatttttcttattgtaaccttaacgatttattactctctcttttttcaattatttc- |
46481554 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
46481553 |
-----------------atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
46481501 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #177
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caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
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|
| T |
26478180 |
caaattatatgtcgctttatattatcaatgaaacattaatact---tttccgattatatccttaactatttattgctctcttttttttcaattattttat |
26478084 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26478083 |
ttatttttccaatatcatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
26478024 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41947803 - 41947626
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
41947803 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaataattaatgtttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaagt |
41947704 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |
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|
| T |
41947703 |
cattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttccaacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #179
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
18872445 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32860857 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatttttaactatttattactctttcttctttcaattc |
32860758 |
T |
|
| Q |
102 |
tttc |
105 |
Q |
| |
|
|||| |
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| T |
32860757 |
tttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #181
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159 |
Q |
| |
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19721332 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcttataccatttattaaggacaaatttgtaaaacaactcataat |
19721233 |
T |
|
| Q |
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atatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||||||||| |
|
|
| T |
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atttatttctcacacaaaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #182
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168 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29832828 |
ttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaaggattattttgtaaaacaactcataatatctctttc |
29832927 |
T |
|
| Q |
169 |
ccacaca |
175 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
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ccacaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #183
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105 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
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|
| T |
36609896 |
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36609797 |
T |
|
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106 |
ctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||| |
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|
| T |
36609796 |
ttttatctttcccatatcatttataaaggataattttataaaacaactcctaat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #184
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74 |
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173 |
Q |
| |
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|
| T |
50534180 |
tatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctttctcatattatttattgaggacaattttgtaatacaactcataatatat-ttttccaca |
50534278 |
T |
|
| Q |
174 |
caa |
176 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
50534279 |
caa |
50534281 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 75
Target Start/End: Original strand, 50533812 - 50533885
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaacta |
75 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
50533812 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaacta |
50533885 |
T |
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Target: chr4; HSP #186
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Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Original strand, 6328202 - 6328360
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| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6328202 |
gtcctaaattataactcgctttacaatac-aatgaatcattaatgctattttttatattataccattaactatttattactttcccttctttcagttttt |
6328300 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaaga--acaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6328301 |
tactttatctttctcataccatttattaagaggacaattttataaaataactcataatat |
6328360 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
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Target Start/End: Original strand, 33517370 - 33517549
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| || |
|
|
| T |
33517370 |
aaattatatatcgttttacaatatcaatgagatattaatgttgttttttctattatatcattaactagttattactctaacttcttttaattctttaatt |
33517469 |
T |
|
| Q |
109 |
tatc-tttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaacttaatcata |
188 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
33517470 |
tatcttttttcatacattttattaaagagaattttgtaaaacaactcataatatttcatttctacataaaa-ttaatcata |
33517549 |
T |
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Target: chr4; HSP #188
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Target Start/End: Original strand, 20978098 - 20978197
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| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgt-aaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20978098 |
ttaactatttattactctatcttatttcaattctttcatttatctttttcatatcatttattaaggatagttttgtaaaaacaactcataatatttcttt |
20978197 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 23621681 - 23621778
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
23621681 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatt-atgttacttttcctattatatccttaatcatttattactctcttttctttcaatt |
23621778 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #190
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Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 6893231 - 6893323
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| Q |
68 |
cttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6893231 |
cttaactatttat-actctttcttctttcaattatttcatttatctttccaatatcatttattaagtataattttgtaaaacaactcataatat |
6893323 |
T |
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Target: chr4; HSP #191
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Query Start/End: Original strand, 33 - 166
Target Start/End: Original strand, 9033593 - 9033726
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| Q |
33 |
caatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaa |
132 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9033593 |
caatggaacattaatgttactttttctattatagtcataaatatttattactttccctttttacaattctttcatttatctttttcatataatttattaa |
9033692 |
T |
|
| Q |
133 |
gaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9033693 |
ggataattttgtaaaacaactcataatatctctt |
9033726 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #192
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Target Start/End: Complemental strand, 19625211 - 19625112
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| Q |
68 |
cttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19625211 |
cttaactatttatcactttctcttctttcaattattttttttatctttctcatatcatttattaaagacaaatttgtaaaacaattcataatatctcttt |
19625112 |
T |
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Target: chr4; HSP #193
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Query Start/End: Original strand, 98 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32859923 - 32859860
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| Q |
98 |
attttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32859923 |
attttttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
32859860 |
T |
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Target: chr4; HSP #194
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Query Start/End: Original strand, 52 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31372553 - 31372427
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| Q |
52 |
tttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaa |
151 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | |||||||||||||| || | ||| ||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31372553 |
ttttttctattatacctttaactatttattattctcttttccttcaattcttaaatttatatttcttataccattcattatgaacaattttgtaaaacaa |
31372454 |
T |
|
| Q |
152 |
ctcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31372453 |
ctcataatatctcttttccatacaaaa |
31372427 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 51624917 - 51625054
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| Q |
28 |
aataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattattt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
51624917 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctcttttctttcaggtcttttatttatcttttccat------- |
51625009 |
T |
|
| Q |
128 |
attaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51625010 |
----aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
51625054 |
T |
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Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Original strand, 53988255 - 53988387
Alignment:
| Q |
28 |
aataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattattt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
53988255 |
aataccaataaaacattaatgttctttttgctattatacatttaactatttattaccctctctt-tttaaatattttaatttatctttttcataccattt |
53988353 |
T |
|
| Q |
128 |
attaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
53988354 |
attaaggacaattttgtaaaataattcataatat |
53988387 |
T |
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Target: chr4; HSP #197
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Target Start/End: Original strand, 18316820 - 18316893
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| Q |
10 |
aattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattac |
83 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18316820 |
aattataagtcgctttacaatattaatgaaacattaatgttacttttcctattatacccttaactatgtattac |
18316893 |
T |
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Target: chr4; HSP #198
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Target Start/End: Original strand, 24323238 - 24323313
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactc |
85 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24323238 |
aaattatatgtcgttttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcctattat-tctttaactatttattactc |
24323313 |
T |
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Target: chr4; HSP #199
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100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25200169 |
attgtctcaaattatttgtcgttttacagtactaatgaatcattaatgttattttttatattatatcattaactagttattactctctcttctttcaatt |
25200268 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttc |
105 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
25200269 |
atttc |
25200273 |
T |
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattata |
65 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29832477 |
attgtcccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
29832541 |
T |
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| Q |
95 |
tcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34498208 |
tcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
34498280 |
T |
|
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttatta |
82 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
37041148 |
ttgtcccagattatatgtcgctttacaataccactgaagcattaatgttacttttcctattatgccctcaactattcatta |
37041068 |
T |
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgtt |
50 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
55852219 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgcaaaattaatgtt |
55852171 |
T |
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattat |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
32295404 |
attgtcccaaattatacgtcgccttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcttattat |
32295341 |
T |
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| Q |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | | || |||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
51747606 |
attgacccaaattataagctgtttgacaatatcaatgaaacattaatattatttttcttattatacctttaactacttattattcactctttcttcaatt |
51747507 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcat |
156 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
51747506 |
gattaatttatttttctcataccattaattgagaataattttataaaacaactcat |
51747451 |
T |
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107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53484150 |
tttatatttctcatactatttattaaggaaaattttgtaaaacaactcataatat |
53484204 |
T |
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attaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattattt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22395970 |
attaatgttgtttttc-tattatactcataactatttattactttatcttctttcaatcctttaatttatctttcttatattattt |
22395886 |
T |
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109 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
49877653 |
aattataagtcgttttacaatatcaatgaagtattaatgttaatttttctattatacacataactatttattattgtctattcttcgaattttttaattt |
49877752 |
T |
|
| Q |
110 |
atctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
49877753 |
atctttctcatacaatttactatagacagttttataaaacaactcataatatttcttt |
49877810 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #209
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5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacatt-aatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
50174407 |
tcccaaattataattcgctttacaataccaatgaagtattaaatgttacttttcctactataccctcaactatttattact--gtcttctttcaattatt |
50174504 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttc |
116 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
50174505 |
taatttatctttc |
50174517 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #210
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Query Start/End: Original strand, 139 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5907839 - 5907800
Alignment:
| Q |
139 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5907839 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttttacacacaaaa |
5907800 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #211
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Target Start/End: Complemental strand, 38052418 - 38052371
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttcca |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
38052418 |
atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatgtattttcca |
38052371 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #212
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Target Start/End: Original strand, 5483952 - 5484006
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| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
5483952 |
atttattaacaacaattttgtaaaacaactcgtaatatctattttccatacaaaa |
5484006 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 6892605 - 6892674
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaacta |
75 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6892605 |
attgtcccaaattatatgtcgttttacaaaaccaatgaaacattca-----tttttcctattatatccttaacta |
6892674 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
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Target Start/End: Complemental strand, 1173609 - 1173528
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| Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || ||||||| || ||||| |||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1173609 |
tttacaatacctatacatcattaatattttttttactatcataccctttactatttattattctatcttcttttaatttttt |
1173528 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11116547 - 11116466
Alignment:
| Q |
34 |
aatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatcttt |
115 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
11116547 |
aatgaaacattaatgttacttgtcttattatacccttaactatttattactatctcttctttcaattctttgatttatcttt |
11116466 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #216
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Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 13398024 - 13397980
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaa |
46 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
13398024 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaa |
13397980 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #217
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Target Start/End: Original strand, 41855038 - 41855101
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaa |
72 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
41855038 |
aaattataagtcgttttacaatataaatgaaacattaatgttattttttctattataacattaa |
41855101 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #218
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Query Start/End: Original strand, 74 - 161
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| Q |
74 |
tatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41855118 |
tattaattactctctcttctttcaattctttaatttatttttctcataaaatttactaaagacaattttataaaacaactcacaatat |
41855205 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #219
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Target Start/End: Original strand, 13529649 - 13529743
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttcttt |
95 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13529649 |
attgtcccaaattatatgtggctttacaatactaatgaaaacttattgttactttttgtattatatgtttaaatatttattactctattttcttt |
13529743 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #220
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Query Start/End: Original strand, 23 - 100
Target Start/End: Original strand, 13967728 - 13967806
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| Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattata-accttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
13967728 |
tttacaataccaatgaaacatcaatgttacttttcttattacataccttaagtatttattactctttattctttcaatt |
13967806 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #221
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Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24569788 - 24569746
Alignment:
| Q |
113 |
tttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactca |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24569788 |
tttctcatatcatttatcaagaacaattttgtaaaaaaactca |
24569746 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 48
Target Start/End: Original strand, 34016810 - 34016856
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatg |
48 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34016810 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatg |
34016856 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 47709045 - 47708991
Alignment:
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
47709045 |
tttatctttttcatatcatttattaagaatgattttgtaaaacaatttataatat |
47708991 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 49228139 - 49228105
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaat |
36 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49228139 |
ttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaat |
49228105 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 986374 - 986266
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| Q |
52 |
tttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
986374 |
tttttcttagtatacctttaactatttattactctatctttttccaattttataatttatctttc-cataccgtttattaaggagaattttgtaaaataa |
986276 |
T |
|
| Q |
152 |
ctcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
986275 |
ttcaaaatat |
986266 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3727187 - 3727042
Alignment:
| Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgtt-gtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||| | | |
|
|
| T |
3727187 |
tttacaataccaattaaacattaatgttatttttttctattatatctttacctatttattactcttccttatttaaattttttaatttatcattcttaaa |
3727088 |
T |
|
| Q |
122 |
ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| |||| | || ||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
3727087 |
aaatttgttaaggacatttttatcaatcaactgataatatttcttt |
3727042 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 10672825 - 10672874
Alignment:
| Q |
129 |
ttaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10672825 |
ttaaggacaattttgtaaaataattcataatatttcttttccatacaaaa |
10672874 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 10886465 - 10886514
Alignment:
| Q |
129 |
ttaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10886465 |
ttaaggacaattttgtaaaataattcataatatttcttttccatacaaaa |
10886514 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22493859 - 22493750
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| Q |
58 |
ctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcata |
157 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | | ||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
22493859 |
ctattatactcttaactatttattactttctctactttcaattctttaatgtttcttttcgatatcatttattaaggataattttataaaacaactcaca |
22493760 |
T |
|
| Q |
158 |
atatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
| T |
22493759 |
atatctcttt |
22493750 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Original strand, 24323321 - 24323361
Alignment:
| Q |
113 |
tttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaact |
153 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24323321 |
tttctcatttaatttattaaggacaattttgtaaaacaact |
24323361 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 151683 - 151857
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
151683 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcttattataaccttaagcatttattactccatcttctttcaatta |
151782 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
151783 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
151857 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 201)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 18975982 - 18976155
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
18975982 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcgttcaattc |
18976081 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18976082 |
tttcatttatctttctcatatta-ttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatatcttttccacacaa |
18976155 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 30264470 - 30264644
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
30264470 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaattc |
30264569 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |
|
|
| T |
30264570 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctccttttcacacaa |
30264644 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39983498 - 39983326
Alignment:
| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
39983498 |
gtcccaaattatatgtcgctttaaaatactaatacaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaattctt |
39983399 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39983398 |
tcatttatatttctcatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
39983326 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32328081 - 32327906
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
32328081 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgatatttttcctattataaccttaattatttattaccctttcttctttcaatt |
32327982 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32327981 |
ctttcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
32327906 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32267768 - 32267593
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32267768 |
attgtctcaaattatacgtcattttaaaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaatt |
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T |
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176 |
Q |
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| T |
32267668 |
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32267593 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42912450 - 42912275
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1 |
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100 |
Q |
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42912450 |
attgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaatt |
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T |
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| Q |
101 |
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176 |
Q |
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42912350 |
cttccatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaaaaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
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3 |
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102 |
Q |
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tgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttattttttctattataaccttaactatttattactatcttttctttcaattct |
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T |
|
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103 |
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176 |
Q |
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ttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccatacaa |
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T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #8
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104 |
Q |
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24302826 |
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24302727 |
T |
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| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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24302726 |
catttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42584572 - 42584397
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Q |
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attgtcctaaattatatgtcgcttaacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
101 |
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176 |
Q |
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| T |
42584472 |
ctttaatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacatctcataatatcttttttccacacaa |
42584397 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 29410324 - 29410150
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2 |
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101 |
Q |
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29410324 |
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29410225 |
T |
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| Q |
102 |
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Q |
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| T |
29410224 |
tttcatttatcttacccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
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Q |
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| T |
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1643645 |
T |
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| Q |
102 |
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175 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 46774152 - 46774325
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Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
46774252 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 584615 - 584440
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| |
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T |
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| Q |
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176 |
Q |
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| T |
584515 |
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584440 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 39403935 - 39403772
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Q |
| |
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| T |
39403935 |
tcccaaattgtatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
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T |
|
| Q |
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cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
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39403835 |
tatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
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| |
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| T |
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T |
|
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103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
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ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctctcttttttcaattc |
22326665 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaatctcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
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tttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttctacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaactatttattattatctcttctttcaattc |
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
41877843 |
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41877917 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
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47988342 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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| |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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102 |
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176 |
Q |
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| T |
39199189 |
tttcatttatctttcttatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
39199263 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43073969 - 43073804
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
43073969 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattaccctctcttctttca---- |
43073874 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
43073873 |
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43073804 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 44481029 - 44481203
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
44481029 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
44481128 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
44481129 |
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44481203 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 10316592 - 10316770
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
10316592 |
ttgtcccaaattatatttcgttttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
10316691 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
10316692 |
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10316770 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21849888 - 21849710
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1 |
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97 |
Q |
| |
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| T |
21849888 |
attgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactatttctattagtataaccttaactatttattactatctcttctatca |
21849789 |
T |
|
| Q |
98 |
attttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
21849788 |
atactttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaa |
21849710 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24685666 - 24685494
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
24685666 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattc |
24685567 |
T |
|
| Q |
102 |
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174 |
Q |
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| T |
24685566 |
tttcatttatctttccaatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
24685494 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 22369550 - 22369721
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
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| T |
22369550 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatggaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctctcttttttcaattcttt |
22369649 |
T |
|
| Q |
105 |
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176 |
Q |
| |
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| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |
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| T |
22369650 |
catttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataaaatctcttttccacacaa |
22369721 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 8611856 - 8612030
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
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| T |
8611856 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
8611955 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
8611956 |
ctttatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaa |
8612030 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 18234928 - 18235102
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
18234928 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttaattttcctattatatccttaactatttattactgtttcttttttcaattc |
18235027 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
18235028 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
18235102 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 37115775 - 37115949
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
37115775 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
37115874 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
37115875 |
cttcatttatctttcacatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
37115949 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16875894 - 16875742
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9 |
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108 |
Q |
| |
|
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| T |
16875894 |
aaattatatgtcgctttacaataccagtgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttatttcaattatttcatt |
16875795 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16875794 |
tatttttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
16875742 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28234377 - 28234205
Alignment:
| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
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| T |
28234377 |
gtcccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcttaattatttattactctttcttttttcaattctt |
28234278 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
28234277 |
tcatttatctttctcatatcatttagtaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
28234205 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41887810 - 41887637
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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| T |
41887810 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaatatcaaggcaatattaatgttacttttcctattataactttaattatttattactc--tcttctttcaatt |
41887713 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
41887712 |
ctttcatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaatttataatatctcttttccacacaa |
41887637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 2887295 - 2887470
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Q |
| |
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| T |
2887295 |
attgtctcaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattgatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
2887394 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
2887395 |
ctttcatttatctttcccgtattatttattaaggacaaatttgtaaaacgacttataatatctcttttccatacaa |
2887470 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6696860 - 6696685
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Q |
| |
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| T |
6696860 |
attgtcccaaattatatttcgttttacaataccaatgaaacattaatgttattttttttattatatccttaattatttattactctttcttctttcaatt |
6696761 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
6696760 |
atttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
6696685 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
|
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| T |
6882883 |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
6882983 |
cattcatttatctttctcatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
6883058 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 25756386 - 25756561
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100 |
Q |
| |
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|||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
25756386 |
attgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaacgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaatt |
25756485 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
25756486 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttctcacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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100 |
Q |
| |
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| T |
38074543 |
attgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccctaactatttattattctttctcctttcaatt |
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T |
|
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101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
38074643 |
atttcatttatcttttccataacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
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Q |
| |
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||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
42121944 |
ttgtctcaaattatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactttttcttctttcaattc |
42122043 |
T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaa |
177 |
Q |
| |
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|||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |
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|
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42122044 |
tttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaatagctcataatatctcttttccacacaaa |
42122119 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
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Target Start/End: Complemental strand, 10657213 - 10657052
Alignment:
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9 |
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108 |
Q |
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| T |
10657213 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactccctcttctttcaattatttcatt |
10657114 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgt-aaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
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|
| T |
10657113 |
tatttttcccatattat---ttaaggataattttgtaaaaataactcataatatatcttttccac |
10657052 |
T |
|
Back To:
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Target: chr7; HSP #43
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2 |
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101 |
Q |
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29409369 |
ttgttccaaattatacgtcgctttacaatacaaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattgctctctcttctttcaattc |
29409468 |
T |
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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29409469 |
cttcatttatctttctcatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaa |
29409543 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 44186925 - 44187099
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2 |
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101 |
Q |
| |
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44186925 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactcttttttttttcaattc |
44187024 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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44187025 |
tttcatttatctttcccatgtcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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101 |
Q |
| |
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44894812 |
ttgtcacaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattc |
44894713 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
44894712 |
attcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
44894638 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47578918 - 47578744
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101 |
Q |
| |
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ttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctattttctttcatttc |
47578819 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
47578818 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatatttttcccacacaa |
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T |
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Target: chr7; HSP #47
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Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 32467850 - 32468007
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Q |
| |
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32467850 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttgactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
32467950 |
tttcatttatctttcccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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Target: chr7; HSP #48
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Target Start/End: Complemental strand, 17611544 - 17611369
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Q |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatactaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
17611445 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
17611444 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 25428222 - 25428397
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Q |
| |
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25428222 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttctttttttcaatt |
25428321 |
T |
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| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtacaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27119087 - 27118912
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100 |
Q |
| |
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27118988 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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ctttcgtttatatttcacatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaa |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 2648943 - 2649117
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| |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatctttcatatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
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Target Start/End: Complemental strand, 4513598 - 4513424
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
4513498 |
cttcatttatctttcccatatcatttatagaggacaatttagtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
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Target Start/End: Original strand, 5528427 - 5528601
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| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5528527 |
cttcatttatttttctcatatcatttattgaggacaatttcgtaaaacaactcatgatatctcttttccacacaa |
5528601 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26913830 - 26913654
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|
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T |
|
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98 |
attttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26913732 |
attccttcatttatctttctcatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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cttcatttatctttcccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
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|
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
|
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cttcatttatttttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactaataatatctttttcccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
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Q |
| |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
40768615 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
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Q |
| |
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|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
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|
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
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ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
46373142 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
46373141 |
cttcatttatcttttccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaattcataatatctttttcccacacaa |
46373067 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29155731 - 29155558
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
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| T |
29155731 |
tgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattgtatccttagctatttattagtctctcttatttcaattcc |
29155632 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
29155631 |
ttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
29155558 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19866515 - 19866339
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
19866515 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttatttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtc |
19866416 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|
|
| T |
19866415 |
attcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
19866339 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 39961123 - 39960948
Alignment:
| Q |
1 |
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95 |
Q |
| |
|
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|
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39961123 |
attgtcctaaattatatgtcgctttacaatacttatgcaacattaatgttttttttttttttctattataaccttaactatttattactctctcttcttt |
39961024 |
T |
|
| Q |
96 |
caattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
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|
| T |
39961023 |
taattcttta-tttatctttctcatattatttattaagaataattttgtaaaacatctcataatatcttttttccac |
39960948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 9818131 - 9818306
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| Q |
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100 |
Q |
| |
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| T |
9818131 |
attgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccttaagtatttattactctatcttctttcactt |
9818230 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
9818231 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaa |
9818306 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 10720056 - 10720231
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| Q |
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100 |
Q |
| |
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| T |
10720056 |
attgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccttaagtatttattactctatcttctttcactt |
10720155 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
10720156 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaa |
10720231 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12118858 - 12118684
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
12118858 |
ttgtcccaaactgtatgtcattttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaaatc |
12118759 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12118758 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaa |
12118684 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 21177254 - 21177428
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
21177254 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaatta |
21177353 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
21177354 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactaataatttctcttccccacacaa |
21177428 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23726614 - 23726440
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23726614 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattactttttctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattc |
23726515 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
23726514 |
cttaatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
23726440 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 31466091 - 31466265
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|
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| T |
31466091 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaatta |
31466190 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31466191 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
31466265 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 37277726 - 37277884
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37277726 |
attgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaatt |
37277825 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37277826 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
37277884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 39430124 - 39430298
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
39430124 |
ttgtcccaaattatatgtcgcttgacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccatattctttcaatta |
39430223 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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|
| T |
39430224 |
tttcatttatctttttcgtaccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
39430298 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 39938640 - 39938805
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39938640 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttactttttctattataaccttagttatttattactctctcttctttca---- |
39938735 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
39938736 |
-----tttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaa |
39938805 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 40020345 - 40020518
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101 |
Q |
| |
|
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|
| T |
40020345 |
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40020443 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
40020444 |
cttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttctacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 46578665 - 46578830
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aattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttccttt |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |
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|
| T |
46578665 |
aattatatgtcgcattacaatactcatgcaacattaatgttactttttcaattataaccttaattaattattactccttcttctttcaattctttcattt |
46578764 |
T |
|
| Q |
110 |
atctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
46578765 |
atctttcccata-tatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
46578830 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
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Query Start/End: Original strand, 7 - 176
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| Q |
7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
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| T |
3225483 |
ccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatatattactcttttttctttcaattccttca |
3225582 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
3225583 |
tttatctttctcatgtcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 2 - 167
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
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37798190 |
T |
|
| Q |
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37798191 |
cttcatttatttttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
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40353870 |
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|
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101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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|
| T |
40353773 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
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| |
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|
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ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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|
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ctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatatcttttctacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9417841 - 9417665
Alignment:
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2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| || |||| | |
|
|
| T |
9417841 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaaatc |
9417742 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9417741 |
attcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
9417665 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 17832956 - 17833132
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
17832956 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcctattatatccttaactattaattagtctctcttctttcaatta |
17833055 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |
|
|
| T |
17833056 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaaaa |
17833132 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 23059113 - 23059288
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23059113 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
23059212 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgt-aaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||| ||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
23059213 |
cttcatttatttttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaaacaactcataatatctctttcctacacaa |
23059288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28472307 - 28472133
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
28472307 |
attgtcccaaattgtatgtcgctttacaatac-aatgaaacattaatgttacttttcctattacatccttaactatttattactctttcttcttttaatt |
28472209 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |
|
|
| T |
28472208 |
ctttcatttatatttcccatgacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaatctattttccacacaa |
28472133 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32827343 - 32827168
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaatt-atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32827343 |
ttgtcccaaatttatatgtctctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
32827244 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
32827243 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
32827168 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32827857 - 32827702
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| Q |
3 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttt |
102 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
32827857 |
tgtcacaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttcttttaattct |
32827758 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
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||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
32827757 |
ttcatttatatttcccatgacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
32827702 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Original strand, 44452231 - 44452389
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44452231 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgttac-----------ttttcctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattc |
44452319 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttcca |
171 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
44452320 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttcca |
44452389 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45823197 - 45823033
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45823197 |
ttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactc--tcttctttcaattc |
45823100 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctt-tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45823099 |
tttcattgtatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
45823033 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34275693 - 34275519
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
34275693 |
ttgtctcaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattactctctcttttttcaattc |
34275594 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
34275593 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
34275519 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 36916709 - 36916883
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|
|
| T |
36916709 |
ttgtcccaaattataaatcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatattatattcttaactatttattactctatcttctttcaattc |
36916808 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
36916809 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
36916883 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 40704432 - 40704605
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40704432 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatg-aatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
40704530 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
40704531 |
ttacatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
40704605 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9603876 - 9603723
Alignment:
| Q |
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tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatat |
122 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9603876 |
tttacgatatcaatgaaacattaattttactttttttattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatat |
9603777 |
T |
|
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
9603776 |
tatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
9603723 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9831447 - 9831294
Alignment:
| Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatat |
122 |
Q |
| |
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||||| ||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
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| T |
9831447 |
tttacgatatcaatgaaacattaattttactttttttattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatat |
9831348 |
T |
|
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
9831347 |
tatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
9831294 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22707003 - 22706826
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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| T |
22707003 |
attgtgccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttatttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagt |
22706904 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22706903 |
cattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaa |
22706826 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 22918216 - 22918379
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22918216 |
ttgtcccaaattatatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
22918315 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22918316 |
ttttatttatctttctcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaa |
22918379 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32466396 - 32466221
Alignment:
| Q |
2 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32466396 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaatattaatgttacttttcctattatattcttgactattaattactctctcttctttcaatt |
32466297 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
32466296 |
atttcatttatctttctcataccatttattaaggataattttataaaacaactcataatttctctttcccacacaa |
32466221 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42688757 - 42688590
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |
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| T |
42688757 |
aaattgtatctcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatt |
42688658 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
42688657 |
tatctttcccatatcatttattgatgacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
42688590 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47834390 - 47834216
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
47834390 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactttctcttatttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||| ||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |
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|
| T |
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cttcatttttctttcccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 7979036 - 7979193
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|
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102 |
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159 |
Q |
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| T |
7979136 |
tttcatttatcttttctataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
7979193 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27116651 - 27116494
Alignment:
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
27116651 |
ttgtcccaaattatatatcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
27116552 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
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| T |
27116551 |
tttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 28703586 - 28703743
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
28703586 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactatctcttctttcaatta |
28703685 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
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| T |
28703686 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
28703743 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 30803327 - 30803484
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
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30803327 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatattacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
30803426 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
30803427 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
30803484 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36669766 - 36669610
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
36669766 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
36669667 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
36669666 |
tttcatttat-tttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
36669610 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 43576780 - 43576937
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
43576780 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctattctttcaatta |
43576879 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
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|
| T |
43576880 |
ttttatttatcttttccataccatttattagggataattttataaaacaactcataat |
43576937 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43884364 - 43884207
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
43884364 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaatta |
43884265 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
43884264 |
tatcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactgataat |
43884207 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #104
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Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5114097 - 5113925
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4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
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| T |
5114097 |
gtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattccctcttctttcaattctt |
5113998 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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| T |
5113997 |
tcattcatctttcgcatatca--tagtaagggtaattttgcaaaacaactcataatatctctttcccacaaaaaa |
5113925 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11910670 - 11910498
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
11910670 |
ttgtcccaaattatatgccgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattgttc--tcttctttcaattc |
11910573 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
11910572 |
cttcatttatttttcccatatcatatattgaagacaattttgtaaaacaactcaaaatatctctttcccacacaa |
11910498 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 12263692 - 12263867
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100 |
Q |
| |
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| T |
12263692 |
attgtcctaaattatatgtcgctttacaagaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccccattctttcaatt |
12263791 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
12263792 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
12263867 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 29669314 - 29669489
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| Q |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
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| T |
29669314 |
attgtccaaaattatatgtcgctttacaataacaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
29669413 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
29669414 |
attttatttatcttttccataccatttattaggaataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
29669489 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30440634 - 30440468
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
30440634 |
ttgtcacaaattatatgttgctttacaatactaatgcaatattaatgttattttttcttttataccattaactatttattattctctcttctttcaattc |
30440535 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttcca |
171 |
Q |
| |
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|
| T |
30440534 |
tttcattta---ttctcatgttatttattatggacaattttgtaaaacaactcgtaatatctcttttcca |
30440468 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 35542010 - 35542177
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aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || |
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| T |
35542010 |
aaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaataaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaattacttcatt |
35542109 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
35542110 |
tattttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
35542177 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 37411120 - 37411292
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caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactattta----ttactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
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| T |
37411120 |
caaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattgtttttttttttttttttcaattcat |
37411219 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
37411220 |
tcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcgtctccacacaa |
37411292 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42149831 - 42149669
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Q |
| |
|
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|
| T |
42149831 |
attgtctcaaattatatgtcgctttacaatagcaatgcaacattaatgctacttttcctat-------------atttattactctctcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
42149744 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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Q |
| |
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|
| T |
48339488 |
attgtcccaaattatatgtcgttttacaataccgatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactatcgcttctttcaatt |
48339587 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
48339588 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #113
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Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27131549 - 27131380
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
27131549 |
aaattataagtcactttgcaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatacagttaactatttattattcttctttctctcaatttttttatt |
27131450 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|
| T |
27131449 |
tatctttctcatactatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #114
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
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| T |
5680440 |
ttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtt |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
5680340 |
ttttatttatcttttccat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #115
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Q |
| |
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|
| T |
5705492 |
ttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtt |
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttttatttatcttttccat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #116
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28 |
aataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattattt |
127 |
Q |
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3264413 |
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3264511 |
T |
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167 |
Q |
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| T |
3264512 |
attaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
3264551 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #117
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Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 12804425 - 12804587
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101 |
Q |
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12804425 |
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12804520 |
T |
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| Q |
102 |
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173 |
Q |
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| T |
12804521 |
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12804587 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28536999 - 28536880
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
28536999 |
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28536900 |
T |
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| Q |
102 |
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Q |
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| T |
28536899 |
cttcatttatctttctcata |
28536880 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38510148 - 38509977
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
38510148 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaataaaagattaatgttacttttcctattatattcttaacaatttattacactctcttctttcaattc |
38510049 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
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| T |
38510048 |
cttcatttatcttttccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcacaatatctctttcccaca |
38509977 |
T |
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Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Original strand, 42940934 - 42941089
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| Q |
4 |
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103 |
Q |
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| T |
42940934 |
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42941033 |
T |
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| Q |
104 |
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159 |
Q |
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| T |
42941034 |
tcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
42941089 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #121
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Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3458572 - 3458414
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100 |
Q |
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| T |
3458572 |
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3458473 |
T |
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| Q |
101 |
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159 |
Q |
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| T |
3458472 |
atttcatttatcttttctataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
3458414 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 22624357 - 22624531
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2 |
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101 |
Q |
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| T |
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22624456 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
22624457 |
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22624531 |
T |
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Target: chr7; HSP #123
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Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25547944 - 25547778
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7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
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| T |
25547944 |
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T |
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| Q |
107 |
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173 |
Q |
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| T |
25547844 |
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T |
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Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 47604712 - 47604562
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108 |
Q |
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| T |
47604712 |
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47604613 |
T |
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| Q |
109 |
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159 |
Q |
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| T |
47604612 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
47604562 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31582215 - 31582042
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
31582215 |
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31582116 |
T |
|
| Q |
105 |
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178 |
Q |
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| T |
31582115 |
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31582042 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #126
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Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 33616421 - 33616578
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101 |
Q |
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| T |
33616421 |
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33616520 |
T |
|
| Q |
102 |
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159 |
Q |
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| T |
33616521 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
33616578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40537019 - 40536849
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
40537019 |
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40536920 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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| T |
40536919 |
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40536849 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #128
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Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4503861 - 4503693
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| Q |
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aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
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| T |
4503861 |
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4503762 |
T |
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| Q |
109 |
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176 |
Q |
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| T |
4503761 |
tatcttttccataccatttattaagggataattttgtaaatcaactcataatttctcttccccacacaa |
4503693 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #129
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Query Start/End: Original strand, 2 - 161
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |
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| T |
10439436 |
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10439340 |
T |
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| Q |
102 |
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161 |
Q |
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| T |
10439339 |
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10439280 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #130
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |
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| T |
10453146 |
ttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttactttttctattatatccttaaccatttgttactc--tcttctttcaattc |
10453050 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|
| T |
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cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #131
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15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctt----tcaattttttccttta |
110 |
Q |
| |
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tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaactatttattactttttttttttcttttcaattctttcaatta |
19785709 |
T |
|
| Q |
111 |
tctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
19785708 |
tctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #132
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Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24166844 - 24166692
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aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
24166844 |
aaattaaaagtcactttacaataccaatgcaacattaatgttacttttctcattctaatcttaactatttattattctctcttctttcaattctttcatt |
24166745 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
24166744 |
tgtctttctcatatttttcactaagaacaattttgtaaaataacttataatat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 19293087 - 19293265
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99 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcccagattgtatgtcgcttcacaatatcaatgaaacattaatgttatttttctattattatatccttaactatttactactttctcttcttccaag |
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T |
|
| Q |
100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |
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| T |
19293187 |
tcattcatttatctttctcatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatattcctttcccacacaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #134
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caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
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23709608 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcatctttcaattatttcat |
23709707 |
T |
|
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ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
23709708 |
ttatcttttccataccatttattagagataattttgtaaaacaactcataat |
23709759 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
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1 |
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100 |
Q |
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| T |
26941421 |
attgtccaaaattatacgtcgctttacactatcaataaaacattaattttacttttcctattatatctttaactatttattactttatcttctttcaatt |
26941322 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
26941321 |
atttaatttatcttttacttatcatttattaaggacaactttgtaaaacaacttataatatatatttt |
26941254 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27059777 - 27059624
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27059777 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttcaatta |
27059678 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27059677 |
tttcatttatcttttccatacta--tattaag--gaattttgtaaaataactcataat |
27059624 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 24161684 - 24161834
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||| |||| || |
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|
| T |
24161684 |
aaattatatgtcattttacgataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaattattaattattctctcttctttcaattatttcatt |
24161783 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24161784 |
tatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
24161834 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 35497699 - 35497873
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
35497699 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatctttaaccatttattactctctcttctatcaattc |
35497798 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
35497799 |
cttcatttatcttttctatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttccaacacaa |
35497873 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Original strand, 41820905 - 41820995
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttc |
92 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41820905 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaactatttattactctatcttc |
41820995 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 45042016 - 45042193
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| | ||| ||| ||| | |
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|
| T |
45042016 |
attgtcccaaattgtatgtcgctttagaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatcattcactatttattgccttctctacttccaagt |
45042115 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
45042116 |
cattcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaaaa |
45042193 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45780888 - 45780726
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45780888 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttca---- |
45780793 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
45780792 |
--------atctttcccatatcatttattgaggacaaatttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
45780726 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 42259168 - 42259327
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||||| || |||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42259168 |
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42259266 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
42259267 |
ctttcttttatctttctcgtatcatttattaaggacaattttgtaaaacgacttataatat |
42259327 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42808483 - 42808308
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42808483 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaattattaattacttcctcttctttcaatta |
42808384 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaa-gaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
42808383 |
tttcatttatcttttccataccatttattaagggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaa |
42808308 |
T |
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Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 46944684 - 46944553
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| Q |
46 |
atgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttcttt-caattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgt |
144 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
46944684 |
atgtcgtttttcctattatatctttaactatttattactcattctttttttcaattctttcatttatatttcccatatcatttattaaggacaattttat |
46944585 |
T |
|
| Q |
145 |
aaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
46944584 |
aaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
46944553 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 180
Target Start/End: Original strand, 6202914 - 6203067
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| Q |
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caataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatt |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||| || ||| |
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|
| T |
6202914 |
caataccaatgaaatatgaatgttacttttcttattatatctttaactatttattactttattttctttcaattctttcgtttatctttttcacataatt |
6203013 |
T |
|
| Q |
127 |
tattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaact |
180 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
6203014 |
tattaaggacacttttttaaagcaactcataatatatctttacgacacaaaact |
6203067 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 8670412 - 8670577
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8670412 |
attgtctcaaattatacgtcgctttacaatacaaataaaatattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactatctcttctttcaatt |
8670511 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
8670512 |
ccttcatttatttttccgatataattttttaaggacaattttgtaaaaaaaatcataatatctctt |
8670577 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Original strand, 6186545 - 6186672
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| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaac |
152 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6186545 |
ttttcttattatatctttaactatttattacattattttctttcaattttttcatttatctttttcacatgatttattaaggacaattttttaaaacaac |
6186644 |
T |
|
| Q |
153 |
tcataatatatcttttccacacaaaact |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
6186645 |
tcataatatatctttacgatacaaaact |
6186672 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Original strand, 6193061 - 6193188
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| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaac |
152 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6193061 |
ttttcttattatatctttaactatttattacattattttctttcaattttttcatttatctttttcacatgatttattaaggacaattttttaaaacaac |
6193160 |
T |
|
| Q |
153 |
tcataatatatcttttccacacaaaact |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
6193161 |
tcataatatatctttacgatacaaaact |
6193188 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 35421853 - 35421740
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35421853 |
ttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
35421754 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatcttt |
115 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
35421753 |
cttcatttatcttt |
35421740 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24924410 - 24924294
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24924410 |
ttgtctcaatttgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactttctcttctttcaattc |
24924311 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctc |
118 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24924310 |
cttcatttatctttctc |
24924294 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 46342776 - 46342939
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
46342776 |
attgtcacaaattataagtcgctttacaataccattgaaacagtaatgttactttttctattataaccttgactatttattgttctattttctttcaatt |
46342875 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatct |
165 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
46342876 |
ctttaatttatcttttccacaacatttattaaggacaattttttaaaacaagt-ataatatatct |
46342939 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #152
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Query Start/End: Original strand, 2 - 100
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13439360 |
ttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaattatttattactatctcttctttcaatt |
13439458 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 32777848 - 32778014
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | || ||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
32777848 |
attgccccaaattataagtcgctttacaactccaatgaagcactaatgctatttttcttattatatccttaactaattaatactctctctactttcaatt |
32777947 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| |||| |||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32777948 |
ctttaatttatccttcccataccatttatgatggacgattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
32778014 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #154
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Query Start/End: Original strand, 8 - 102
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| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttt |
102 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
42520123 |
caaattataagtcgctttacaatatcattgaaacattaatgttacttttcctataatacccttaactatttattactctttcttctttcaatttt |
42520217 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #155
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1 |
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Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||| || |||||| | |||| | |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||| | |
|
|
| T |
7170701 |
attgttccaaattataagtcgtattacaatatccatgaaatattaatatcactttttcaattatacctttaactatttattaccctatattctttcaact |
7170800 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
7170801 |
ctttaatatatctttctcataccatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccatacaaaa |
7170878 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24729733 - 24729634
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24729733 |
attgtcccaacttatatgttgttttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaatt |
24729634 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 4089298 - 4089360
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctatta |
63 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4089298 |
attgtcccaaattatatgtagctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
4089360 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 12848251 - 12848405
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactc-aatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||||||| ||| |
|
|
| T |
12848251 |
caaattatatgtcaatttacaatatcaataaaacattaatattatttttcctattatatctctaactatttattactctttttttttttcaattctttaa |
12848350 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12848351 |
tttatctttctcataccatttgttaatgataattttgtaaaacaattcataatat |
12848405 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 39003937 - 39004091
Alignment:
| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactattt-attactcaatcttctttcaatttt |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
39003937 |
gtcccaaattataagccgttttacaataccaatgaaacttaaataatacttttcctattatacccttaactattttattactttctcttatttcaattct |
39004036 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcata |
157 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39004037 |
ttaatttatctttcccataccatttattaaagacaattttgtaaaacaagtcata |
39004091 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 150
Target Start/End: Original strand, 10543886 - 10543977
Alignment:
| Q |
59 |
tattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaaca |
150 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10543886 |
tattatatctttaattatttattactctttcttctttcatttttttaatttatcattctcataccatttattaagaacaattttgtaaaaca |
10543977 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 178
Target Start/End: Original strand, 21443132 - 21443251
Alignment:
| Q |
59 |
tattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
21443132 |
tattatatccttaactatttattactttatcttatttcaattctttaatttatctttctcgtatcatttattaaagataattttgtaaaactacttataa |
21443231 |
T |
|
| Q |
159 |
tatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
21443232 |
catctctttcccatacaaaa |
21443251 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 18517193 - 18517306
Alignment:
| Q |
42 |
attaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18517193 |
attaatgttaatttttctattatatcattaattatttattactttatcttctttgaattctttcatttatcgttttcatatcgtttattaaggacaattt |
18517292 |
T |
|
| Q |
142 |
tgtaaaacaactca |
155 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |
|
|
| T |
18517293 |
tataaaacaactca |
18517306 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 27045097 - 27045270
Alignment:
| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt-t |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||| | || | ||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || || ||| ||| | |
|
|
| T |
27045097 |
gtcccaaattgtatatcgctttatactatcgatgaaacattaattttacttttaatattatatccttagctatttattactctattttttttttattcat |
27045196 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
27045197 |
ttattttatctttctcgtatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatcgctttcccacacaa |
27045270 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39693928 - 39693871
Alignment:
| Q |
119 |
atattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
39693928 |
atattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacaa |
39693871 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17288772 - 17288663
Alignment:
| Q |
42 |
attaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
17288772 |
attaatgttgttttttctagtatatcttcaactatttattactc--ttttctttcaattttttaatttatatttcttatataatttattaagtataattt |
17288675 |
T |
|
| Q |
142 |
tgtaaaacaact |
153 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |
|
|
| T |
17288674 |
tgtaagacaact |
17288663 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25651110 - 25651022
Alignment:
| Q |
88 |
tcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
25651110 |
tcttcttttaattctttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatcttttttctacacaa |
25651022 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40011406 - 40011245
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttc-aat |
99 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
40011406 |
attgtctcaaattatatgtcgttttacaataccattgaagtattaatgtaactttttctattatatctttaaatatttattact--atcttctttcaaat |
40011309 |
T |
|
| Q |
100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
| ||| ||| || ||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
40011308 |
tctttaatttgtcattctcgtaccatttattaaggacaattttctaaaacaacttctaatatat |
40011245 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Original strand, 553872 - 553975
Alignment:
| Q |
58 |
ctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcata |
157 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||| |||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
553872 |
ctattatactcttaactatttattactctatcatcttttaaatctttaatttagcttttccatgtcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcata |
553971 |
T |
|
| Q |
158 |
atat |
161 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
553972 |
atat |
553975 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 178
Target Start/End: Original strand, 4089650 - 4089760
Alignment:
| Q |
68 |
cttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
4089650 |
cttaactatttattactatctcttcattcaattcttttatttttctttttcatactatttattaacgataattttgcaaaacaactcataatatcttttt |
4089749 |
T |
|
| Q |
168 |
tccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |
|
|
| T |
4089750 |
tccatacaaaa |
4089760 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22369104 - 22369002
Alignment:
| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22369104 |
ttaactatttattactta----tctttcaattctt-catttatttttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatttctttc |
22369010 |
T |
|
| Q |
169 |
ccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
22369009 |
ccacacaa |
22369002 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 39694868 - 39694810
Alignment:
| Q |
73 |
ctatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaag |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39694868 |
ctatttattactc--tcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
39694810 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 10200539 - 10200483
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattata |
65 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10200539 |
aaattatatgttgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
10200483 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Original strand, 29478340 - 29478444
Alignment:
| Q |
58 |
ctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt-ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcat |
156 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29478340 |
ctattataccattaactatttattactcttttttctttcaattattttaatttagctttctaataacatttattaaagaaaattttgtaaaacaactcat |
29478439 |
T |
|
| Q |
157 |
aatat |
161 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
29478440 |
aatat |
29478444 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 25651225 - 25651150
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatt |
77 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
25651225 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttgcaataccaatgaaacattaattttacttttcctattatatctttaactatt |
25651150 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 160
Target Start/End: Original strand, 27299737 - 27299828
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| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataata |
160 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27299737 |
ttaactatgtattactctctcttcttttaattatttaatttatctttctcgtaccatttattaaagacacttttgtaaaacaactcataata |
27299828 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28696327 - 28696187
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| Q |
25 |
tacaataccaatgcaacattaatg----ttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcat |
120 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
28696327 |
tacaatatcaatgaaacattaatgctattttttttttctattatattattaactatttattactttcttctttttcaattatttaatttatctttctgat |
28696228 |
T |
|
| Q |
121 |
attatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28696227 |
accatttcttaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
28696187 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #177
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Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3340736 - 3340666
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| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaa |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
3340736 |
tttatctttcacataccatttattaagaacaattttgtaaaacaatacataatatctctttcccatacaaa |
3340666 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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| Q |
88 |
tcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
9140701 |
tcttcttccaattccttcatttatctttctaatttcatttattaaggacaattttataaaacaaatcataatatctctttaccaca |
9140786 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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| Q |
88 |
tcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17230811 |
tcttctttcaattttttaatttatttttcccatacaatttagtaaggacaattttgtaaaacaacttataatat |
17230884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 178
Target Start/End: Original strand, 22603930 - 22604031
Alignment:
| Q |
77 |
ttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||| |
|
|
| T |
22603930 |
ttattactctcttttctttcagttttttcatttatcttttccatatcacttattaaggataattttataaaacaactcataatacatatttcccccacaa |
22604029 |
T |
|
| Q |
177 |
aa |
178 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
22604030 |
aa |
22604031 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24923497 - 24923440
Alignment:
| Q |
119 |
atattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
24923497 |
atatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
24923440 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 48841273 - 48841114
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactattta---ttactcaatcttctttca |
97 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | || ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| || || ||||| |
|
|
| T |
48841273 |
attgtcctaaattatctttcattttacaatatcaatgaagcattaatgttaattttcttattatatccttaattatttagtattactctatattatttca |
48841174 |
T |
|
| Q |
98 |
attttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcata |
157 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
48841173 |
attctttaatttatctttcacataccatttattagggacaatttaaaaaaacaactcata |
48841114 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28536748 - 28536696
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
28536748 |
atttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
28536696 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40065543 - 40065475
Alignment:
| Q |
93 |
tttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40065543 |
tttcaattctttaatttatttttctcatactatttagtaaggacaattttgtaaaacaattcataatat |
40065475 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 508982 - 508923
Alignment:
| Q |
45 |
aatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
508982 |
aatgttgttttttctattatatctttaactatttattactctctcttcttttaatttttt |
508923 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 176
Target Start/End: Original strand, 13446134 - 13446184
Alignment:
| Q |
126 |
ttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
13446134 |
ttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
13446184 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 121
Target Start/End: Original strand, 33746110 - 33746229
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| Q |
6 |
cccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactat----ttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
33746110 |
cccaaattataagtagttttacaataccagtgaaacattcatgttaatttttctagtatacctttaactatttaattattattctatcttctttcaatta |
33746209 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
33746210 |
tttaatttatctttctcata |
33746229 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3336958 - 3336918
Alignment:
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3336958 |
tatttattaagaacaattttttaaaataactcataatatat |
3336918 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 149
Target Start/End: Original strand, 9488314 - 9488394
Alignment:
| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaac |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9488314 |
ttaactatttattattttgttttctttcaattttttcatttatctttccgatattatttcttaaagacaatttagtaaaac |
9488394 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 100
Target Start/End: Original strand, 42521416 - 42521472
Alignment:
| Q |
44 |
taatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42521416 |
taatgttacttttcctataatacccttaactatttattactctttcttctttcaatt |
42521472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Original strand, 27330369 - 27330408
Alignment:
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaa |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27330369 |
ttatctttctcatatcatgtattaagaacaattttgtaaa |
27330408 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 9140635 - 9140693
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcct |
59 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9140635 |
attgtcccaaattatatgtcattttacaataccaataaaatattaatgttacttttcct |
9140693 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 9658625 - 9658719
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttcttt |
95 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
9658625 |
attgtcccaaattatatgtggctttacaatactaatgaaaacttattgttactttttgtattatatgtttaaatatttattactctattttcttt |
9658719 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 148
Target Start/End: Original strand, 20268663 - 20268749
Alignment:
| Q |
62 |
tataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaa |
148 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||| | |||||| ||||| |
|
|
| T |
20268663 |
tatatcctcaactatttattactcccacttctttcaattttttaatttatctttcacatatcattaataaaggataattttataaaa |
20268749 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 178
Target Start/End: Original strand, 21553445 - 21553580
Alignment:
| Q |
41 |
cattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaatt |
140 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||| || |||||||| |||| | | |||||| || |||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
21553445 |
cattaatgttattttttatattatatcattaattatttattattc--tcttctttaaattatataatttatcgttttcatatcatttattaagaatgata |
21553542 |
T |
|
| Q |
141 |
ttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||| | |||| || |||||| |
|
|
| T |
21553543 |
ttgtaaaacaattaataatatctatttttcatacaaaa |
21553580 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41844302 - 41844264
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatata |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
41844302 |
atttattaagaacaattttgtaaaacagctcaaaatata |
41844264 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 161
Target Start/End: Original strand, 7720828 - 7720865
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7720828 |
atttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatat |
7720865 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14054256 - 14054155
Alignment:
| Q |
59 |
tattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||||||| || || ||||| || ||| ||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14054256 |
tattataccattaaatatttattactttattttttttcagttctttaatttatttttctcatgtaattaattaaggtcaattttgtaaaacaacttataa |
14054157 |
T |
|
| Q |
159 |
ta |
160 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
14054156 |
ta |
14054155 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14364284 - 14364183
Alignment:
| Q |
59 |
tattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||||||| || || ||||| || ||| ||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14364284 |
tattataccattaaatatttattactttattttttttcagttctttaatttatttttctcatgtaattaattaaggtcaattttgtaaaacaacttataa |
14364185 |
T |
|
| Q |
159 |
ta |
160 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
14364184 |
ta |
14364183 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Original strand, 9407696 - 9407838
Alignment:
| Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||| |||||||||| || | |
|
|
| T |
9407696 |
tttacaataccattgaattattaatgttgttttttc---tataaccttaactctttattactttctcatttttcaattctttaatttatctttc-aattt |
9407791 |
T |
|
| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttc |
169 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
9407792 |
catttattaagaatttttttataaaacaacttatactatatattttc |
9407838 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 46551785 - 46551717
Alignment:
| Q |
93 |
tttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| ||||||||| || || |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
46551785 |
tttcaactctttcatttatctttatcgtactatttattaaaaataattttgtaaaacaatttataatat |
46551717 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 198)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2443518 - 2443344
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2443518 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctctcttctttcaattc |
2443419 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2443418 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaa |
2443344 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41787124 - 41786950
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41787124 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
41787025 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
41787024 |
tttcatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatcttttttccacacaa |
41786950 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 518508 - 518680
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
518508 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactc--tcttctttcaattc |
518605 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
518606 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaa |
518680 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1666997 - 1666823
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1666997 |
ttgtcccaaattatatgccgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttctttcaattc |
1666898 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
1666897 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcatttccacacaa |
1666823 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3873649 - 3873475
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |
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| T |
3873649 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctttgctatttattactctcttttctttcaattc |
3873550 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3873549 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaa |
3873475 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21134645 - 21134471
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21134645 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattctctcttctttcaattc |
21134546 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
21134545 |
tttcatttatatttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaataattcataatatctcttttccatacaa |
21134471 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5005262 - 5005087
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
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| T |
5005262 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
5005163 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
5005162 |
ctttcatttatcttttccatattatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
5005087 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 6713929 - 6714103
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
6713929 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattaattattactctatcttctttcaattc |
6714028 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
6714029 |
tttcatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
6714103 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 29027012 - 29027186
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
29027012 |
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29027111 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
29027112 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
29027186 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 44421619 - 44421793
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
44421619 |
ttgtcccgaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattaattattactctctcttctttcaattc |
44421718 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
44421719 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
44421793 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26850061 - 26849887
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
26850061 |
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26849962 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
26849961 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
26849887 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39927729 - 39927555
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
39927729 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
39927630 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
39927629 |
ttttatttatctttcccataatatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
39927555 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 19576089 - 19576263
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19576089 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctatcttctttcaattc |
19576188 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
19576189 |
cttcatttatttttcccatgtcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
19576263 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24000363 - 24000189
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
24000363 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtttcttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattc |
24000264 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
24000263 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
24000189 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40425199 - 40425025
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| Q |
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101 |
Q |
| |
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| T |
40425199 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgcaactttaatattatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattc |
40425100 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
40425099 |
tttcatttatttttttcatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
40425025 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 3870805 - 3870973
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caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
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| T |
3870805 |
caaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctttgctatttattactctcttttctttcaattctttcat |
3870904 |
T |
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| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
3870905 |
ttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaa |
3870973 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
5669245 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactatctcttctttcaattc |
5669146 |
T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
5669145 |
cttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatccctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14943502 - 14943328
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
14943502 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
14943403 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
14943402 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
14943328 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
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| T |
19240853 |
ttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataatcttaactatttattactctctcttctttcaaatc |
19240754 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
19240753 |
ttttatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
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2 |
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Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattt |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
34036241 |
cttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
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ttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaattatttattactctttcttttttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
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4 |
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Q |
| |
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T |
|
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103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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|
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12208379 - 12208203
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Q |
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12208379 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaatgccaatgcaacgttaatgatattttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaat |
12208280 |
T |
|
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100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12208279 |
tcttttatttatctttctcatatcatttattaaggatatttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
12208203 |
T |
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Target: chr2; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 27183101 - 27183270
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104 |
Q |
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tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactc--tcttctttcaattcctt |
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T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
27183199 |
catttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcgtaatatctctttcccacacaa |
27183270 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 27832643 - 27832812
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5 |
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104 |
Q |
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tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactc--tcttctttcaattcctt |
27832740 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |
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|
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catttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcgtaatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31909815 - 31909655
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100 |
Q |
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|
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|
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
31909715 |
atttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27341826 - 27341652
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1 |
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100 |
Q |
| |
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attgtctcaaattgtatgtcacttttcaataccaatgaaacattaatgtt-tttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaatt |
27341728 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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|
| T |
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ctttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
27341652 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 6596509 - 6596683
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
6596509 |
ttgtctcaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatccttaactatttattactttttcttctttcaatta |
6596608 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
6596609 |
tttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28181726 - 28181552
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
28181726 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttgctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
28181627 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28181626 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
28181552 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 41095968 - 41096142
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
41095968 |
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41096067 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
41096068 |
cttcatttatctttttcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Original strand, 27244931 - 27245100
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4 |
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103 |
Q |
| |
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|
| T |
27244931 |
gtcccaaattgtatgtcacttttgaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctt |
27245030 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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| T |
27245031 |
tcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaca |
27245100 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
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| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
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aaattatatgtcactttacaataccaatacaacattaatgttactttttctgttataatcttaattatttattaccctctcttctttcaattctttcatt |
11154372 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
11154371 |
tatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccagacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 12192449 - 12192624
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| |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatc-tttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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tttcatttatcttttttcatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 36068147 - 36068318
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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|
| T |
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tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 2 - 172
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Q |
| |
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9047477 |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
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9047377 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
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| T |
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14527891 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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| |
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ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatta |
14885160 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
| T |
14885161 |
tttcatttatctttcccatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
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| |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
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| |
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
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| |
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
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19275180 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcatctttcaattc |
19275081 |
T |
|
| Q |
102 |
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175 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
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| T |
19275080 |
tttcatttatctttcccatatca-ttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatcttttctacaca |
19275008 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 28330787 - 28330960
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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|
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| T |
28330787 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaattc |
28330886 |
T |
|
| Q |
102 |
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175 |
Q |
| |
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||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
28330887 |
attcatttatctttcctatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacaca |
28330960 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 42056084 - 42056253
Alignment:
| Q |
7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
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| T |
42056084 |
ccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatgtttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttca |
42056183 |
T |
|
| Q |
107 |
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176 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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| T |
42056184 |
tttatctttcccatatcatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
42056253 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 12467674 - 12467846
Alignment:
| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
|
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| T |
12467674 |
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12467773 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
12467774 |
tcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
12467846 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 29513410 - 29513570
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
29513410 |
attgtcctaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgatactttttctattataaccttaattatttattaccctttcttctttcaatt |
29513509 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29513510 |
ctttcatttatttttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatat |
29513570 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 10877354 - 10877521
Alignment:
| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |
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| T |
10877354 |
aaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcatt |
10877453 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
10877454 |
tatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
10877521 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 22061022 - 22061181
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |
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| T |
22061022 |
ttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattattctttcttctttcaatta |
22061121 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
22061122 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttataaaacaactcataatat |
22061181 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 29360791 - 29360958
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| |
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|
| T |
29360791 |
ttgtcccaaattaccggtcgctttacaataccaatgaaacattaattttactttttctattatatctttaactatttattactctctattctttcaattt |
29360890 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttc |
169 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29360891 |
tttcttttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttc |
29360958 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 325370 - 325196
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
325370 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
325271 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
325270 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatcgctttcccacacaa |
325196 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 23494485 - 23494659
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
23494485 |
ttgtcccaaattatatgtcactttacaatactaatgcaacattaatgttactttttcaattgtaaccttaactatttattattatctcttctttcaattc |
23494584 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
23494585 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaatttataatatttttttttcacacaa |
23494659 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 176
Target Start/End: Original strand, 25556919 - 25557061
Alignment:
| Q |
34 |
aatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaag |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25556919 |
aatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactttctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
25557018 |
T |
|
| Q |
134 |
aacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25557019 |
gataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
25557061 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28786962 - 28786788
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28786962 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
28786863 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
28786862 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
28786788 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 39407819 - 39407993
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
39407819 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccactgaaacattaatgttatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattc |
39407918 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
39407919 |
tttcgtttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcgcacacaa |
39407993 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7491691 - 7491518
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| Q |
3 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttt |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7491691 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaaccatttattactatctcttctttcaattcc |
7491592 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
7491591 |
ttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
7491518 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10198058 - 10197881
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10198058 |
attgtcccaaattataagtcgttttacaataccaatgaaacatcaatgttactttttctattatacccttgactatttattactttatcttctttcaatt |
10197959 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
10197958 |
ctttaatttatctttcccataacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaaaa |
10197881 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40171776 - 40171603
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40171776 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactttttcttctttcaattc |
40171677 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
40171676 |
tttcatttattttttccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttacccacaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1684376 - 1684197
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1684376 |
attgtcccaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatctttaattatttattactctttcttctttcaatt |
1684277 |
T |
|
| Q |
101 |
t--tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1684276 |
caattttatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaa |
1684197 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29843901 - 29843741
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1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29843901 |
attgtctcaaattgcatgtcactatacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaatt |
29843802 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29843801 |
ccttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
29843741 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
5443893 |
aaattatatgtcgttttacaatatcaatgtaatattaatgttattttttctattatatctttaactatttattactatctattctttcaattctttcatt |
5443794 |
T |
|
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109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
5443793 |
tatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
5443726 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5748697 - 5748522
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
5748697 |
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5748598 |
T |
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176 |
Q |
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| T |
5748597 |
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5748522 |
T |
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Target: chr2; HSP #61
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Q |
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8247278 |
T |
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| Q |
101 |
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176 |
Q |
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| T |
8247277 |
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8247202 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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1 |
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100 |
Q |
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| T |
11216634 |
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T |
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| Q |
101 |
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176 |
Q |
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| T |
11216734 |
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11216809 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
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Target Start/End: Complemental strand, 30549809 - 30549634
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100 |
Q |
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30549809 |
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30549710 |
T |
|
| Q |
101 |
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176 |
Q |
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| T |
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30549634 |
T |
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Target: chr2; HSP #64
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Target Start/End: Complemental strand, 32674627 - 32674457
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5 |
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104 |
Q |
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| T |
32674627 |
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32674528 |
T |
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| Q |
105 |
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176 |
Q |
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| T |
32674527 |
catttatctttctcatatca-ttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
32674457 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
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Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 38150568 - 38150735
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9 |
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108 |
Q |
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| T |
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38150667 |
T |
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| Q |
109 |
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176 |
Q |
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| T |
38150668 |
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38150735 |
T |
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101 |
Q |
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1204955 |
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1205054 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
1205055 |
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1205129 |
T |
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Q |
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2048237 |
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2048138 |
T |
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| Q |
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159 |
Q |
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| T |
2048137 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
2048079 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
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13849404 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
13849403 |
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13849329 |
T |
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
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| T |
22375257 |
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22375158 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
22375157 |
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22375083 |
T |
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Target: chr2; HSP #70
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101 |
Q |
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32068454 |
ttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
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| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
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| T |
32068354 |
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32068280 |
T |
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Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33677362 - 33677195
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
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| T |
33677362 |
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33677265 |
T |
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| Q |
109 |
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178 |
Q |
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| T |
33677264 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #72
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Q |
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| T |
37985566 |
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37985665 |
T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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| T |
37985666 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #73
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Q |
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T |
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| Q |
102 |
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176 |
Q |
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tttcatttatctttttcataccatttattatggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #74
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Q |
| |
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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3 |
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Q |
| |
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T |
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| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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| T |
44709971 |
ttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcacaatat |
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tttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatat |
122 |
Q |
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| T |
3628603 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaattatttattagtctctcttctttcaagtcttttatttatctttcctatat |
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T |
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| Q |
123 |
tatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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tatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
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tttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
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| |
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
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| |
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| T |
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tttcatttatcttttccatacaatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
38959935 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4646631 - 4646467
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
4646631 |
ttgtcccaaattgtatatcactttataataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaaccatttattactctttcttctttcaattc |
4646532 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4646531 |
tttcatttatttttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctt |
4646467 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Original strand, 5421476 - 5421647
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataac-cttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
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| T |
5421476 |
ttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatttcttaactatttattactctctctcctttcaatt |
5421575 |
T |
|
| Q |
101 |
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172 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5421576 |
ccttcctttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccac |
5421647 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 6579743 - 6579918
Alignment:
| Q |
2 |
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
6579743 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaataaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactgtttattactctttctttttttcaatt |
6579842 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
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ctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttgcccacacaa |
6579918 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 13375354 - 13375513
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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| T |
13375354 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatcttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
13375453 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
13375454 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
13375513 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19166413 - 19166246
Alignment:
| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || |
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|
| T |
19166413 |
aaattatataccgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatt |
19166314 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
19166313 |
tatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaacccataatatcttttttccacacaa |
19166246 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 36845860 - 36846031
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
36845860 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctttcttctttcaatt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
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| T |
36845960 |
atttcatttatattttccatacaatttattaaggataattttgtaaatcaactcataatttctcttctccac |
36846031 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43521633 - 43521458
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |
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| T |
43521633 |
attgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttcactattaattactctctcttctttcaatt |
43521534 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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| T |
43521533 |
atttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
43521458 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 16198438 - 16198592
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
16198438 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttgtttttcctattatatccttaactattatttactctctcttctttcaattattt |
16198537 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
16198538 |
catttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaacccataat |
16198592 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22154251 - 22154077
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
22154251 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactcactcttctttcaatta |
22154152 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
22154151 |
tttcatttattttttccataccatttattagggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccacacaa |
22154077 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8444236 - 8444079
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
8444137 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
8444136 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
8444079 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 9527493 - 9527670
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
9527493 |
attgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaatt |
9527592 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|
| T |
9527593 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaaaa |
9527670 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14780941 - 14780784
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|
| T |
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ttgtcccaaattatatgtccctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctttcttctttcaatta |
14780842 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
14780841 |
tttcatttattttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaactcataat |
14780784 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Original strand, 16062571 - 16062736
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
16062571 |
ttgtctcaaattgtatgtcactgtagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactttttcttttttcaattc |
16062670 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
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|
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| T |
16062671 |
tttcatttatctttcccgtataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
16062736 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 28248500 - 28248674
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
28248500 |
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28248597 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|
| T |
28248598 |
tttaatttatcttttccataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccaaacaaaa |
28248674 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41285842 - 41285685
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
41285842 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
41285743 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
41285742 |
tttaatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
41285685 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #94
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
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| T |
8059853 |
attgtcctaaattatatgtcgctttacaatacagatgcaacaacaatgttacttttcttattataaccttaattatttattactctctcttttttcaatt |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
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| |
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|
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8059953 |
ctttcatttatttttcccatattatttattaatgacaattttgtaaaacaattcataatat |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #95
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7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
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| T |
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ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
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T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
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| |
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31072549 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #96
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Target Start/End: Complemental strand, 22050707 - 22050532
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| |
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|
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101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
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22050607 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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1 |
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| |
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101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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| T |
37111141 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
37111066 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #98
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 1780332 - 1780497
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
1780332 |
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1780427 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
1780428 |
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1780497 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #99
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Target Start/End: Complemental strand, 14309143 - 14308973
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
14309143 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
14309044 |
T |
|
| Q |
102 |
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172 |
Q |
| |
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| T |
14309043 |
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14308973 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #100
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Target Start/End: Original strand, 12363662 - 12363839
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100 |
Q |
| |
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12363761 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |
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|
| T |
12363762 |
cattcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctatttcccacacaaaa |
12363839 |
T |
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Target: chr2; HSP #101
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15 |
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114 |
Q |
| |
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39235208 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattccttaatttatctt |
39235109 |
T |
|
| Q |
115 |
tctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
39235108 |
tcctatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
39235047 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 40649093 - 40649270
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100 |
Q |
| |
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attgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagt |
40649192 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
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|
| T |
40649193 |
cattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
40649270 |
T |
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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Q |
| |
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|
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
| T |
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atttcatttatcttttccataccatttattagagatacttttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
6026916 |
T |
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Target: chr2; HSP #104
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Target Start/End: Complemental strand, 8341699 - 8341548
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22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |
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| T |
8341699 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcata |
8341600 |
T |
|
| Q |
122 |
ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
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| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |
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| T |
8341599 |
tcatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctctttcccaca |
8341548 |
T |
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Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1420904 - 1420730
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2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
1420904 |
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1420805 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
1420804 |
cttaatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
1420730 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29432922 - 29432764
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
29432922 |
attgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactatctcttcttttaatt |
29432823 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
29432822 |
atttcatttatcttttccatatcatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
29432764 |
T |
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Target: chr2; HSP #107
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 36173999 - 36174172
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |
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|
| T |
36173999 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatatt-tatccttaactattaattactctaccttctttcaatta |
36174097 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
36174098 |
tttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
36174172 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #108
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Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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38993530 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc--tcttctttcaatta |
38993627 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38993628 |
tttcatttatattttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
38993685 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #109
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39958399 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcctattatatccttaactattaattactttatcttctttcaatta |
39958300 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| || ||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
39958299 |
tatcatttattttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaa |
39958225 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #110
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Q |
| |
|
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| T |
41186825 |
ttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaa-tc |
41186923 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
41186924 |
cttcatttatttttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacttaaaatatctctttcccacacaa |
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T |
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Target: chr2; HSP #111
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158 |
Q |
| |
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| T |
4898162 |
tattataaccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatcctttacatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataa |
4898063 |
T |
|
| Q |
159 |
tatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
4898062 |
tatctcttttccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #112
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tattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
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| T |
4945556 |
tattataaccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatcctttacatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataa |
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T |
|
| Q |
159 |
tatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
4945456 |
tatctcttttccacacaa |
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Q |
| |
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|
| T |
27863039 |
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27862940 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27862939 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaattcataat |
27862882 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |
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|
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #115
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| |
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|
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1221277 |
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T |
|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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| T |
1221177 |
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| |
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T |
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| Q |
102 |
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178 |
Q |
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|| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
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| T |
18450068 |
attaatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
18449992 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #117
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Target Start/End: Original strand, 34213170 - 34213333
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2 |
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Q |
| |
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|||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
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| T |
34213170 |
ttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
34213269 |
T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
34213270 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #118
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Query Start/End: Original strand, 2 - 158
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2 |
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101 |
Q |
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34504384 |
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34504483 |
T |
|
| Q |
102 |
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158 |
Q |
| |
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| T |
34504484 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #119
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Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 38448157 - 38448329
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4 |
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103 |
Q |
| |
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| T |
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gtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatgttgtatccttaactatttattaccctctcttctttcaattcct |
38448256 |
T |
|
| Q |
104 |
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176 |
Q |
| |
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|
| T |
38448257 |
tcatttatctttcccatatcatttattgatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccgcacaa |
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T |
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Target: chr2; HSP #120
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Q |
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4826440 |
T |
|
| Q |
109 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
4826441 |
taaccttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
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Target: chr2; HSP #121
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9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
8495328 |
aaattatatgtcactttacaataccaataaaatatttatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
8495427 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
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| T |
8495428 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
8495478 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #122
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Target Start/End: Original strand, 21288894 - 21289068
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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| T |
21288894 |
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T |
|
| Q |
102 |
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176 |
Q |
| |
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|
| T |
21288994 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcttttctccacacaa |
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T |
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Target: chr2; HSP #123
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Target Start/End: Original strand, 27863081 - 27863195
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Q |
| |
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|
| T |
27863081 |
tataaccttaactatttattgctatctcttctttcaattctttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
27863180 |
T |
|
| Q |
162 |
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176 |
Q |
| |
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| |||||||||||| |
|
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| T |
27863181 |
cttttttccacacaa |
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T |
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Target: chr2; HSP #124
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Q |
| |
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| T |
36598819 |
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36598720 |
T |
|
| Q |
101 |
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159 |
Q |
| |
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|
| T |
36598719 |
atttcatttatattttccatactatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
36598661 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 15848667 - 15848844
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100 |
Q |
| |
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| T |
15848667 |
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15848766 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|
| T |
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cattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
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T |
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Target: chr2; HSP #126
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Target Start/End: Complemental strand, 20925933 - 20925760
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104 |
Q |
| |
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| T |
20925933 |
tcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaacgttatttttcctattatattcttaactatttattactttctctcattccaaatcatt |
20925834 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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| ||||| |||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20925833 |
catttatttttcccatgtcatttattaattacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30564218 - 30564049
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| Q |
7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
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| T |
30564218 |
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T |
|
| Q |
107 |
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176 |
Q |
| |
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|
| T |
30564118 |
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T |
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Target: chr2; HSP #128
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Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 30780099 - 30780239
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
|
| Q |
102 |
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142 |
Q |
| |
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| T |
30780199 |
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30780239 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #129
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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Q |
| |
|
||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
43681099 |
attgtcctaagtcatatgtcgttttacaataccaatataacattagtgttatttttttctattataaccttaactatttattactctttcttctttcaat |
43681198 |
T |
|
| Q |
100 |
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Q |
| |
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|
| T |
43681199 |
tctttcatttatctttcccatgttatttattaaggataattttataaaataac-aataatacctcttttccacacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 45423277 - 45423437
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Q |
| |
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|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| ||| || ||||||||| || | ||||||||||| |
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|
| T |
45423277 |
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45423376 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|
| T |
45423377 |
ctttcatttatctttctcatatcatttattaaaaacaattttataaaacaacttataatat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #131
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Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3376663 - 3376497
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108 |
Q |
| |
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||||| ||||||| ||||||||| | | | || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |
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| T |
3376663 |
aaattgtatgtcgttttacaatatcgacgaaaaattaatgttattttttctattatatccttaacaatttattactctctcttctttcaatttcttcatt |
3376564 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3376563 |
tatctttcccatattatttattgaggataatttt-taaaacaactcataatatctctttctcacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #132
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Q |
| |
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|
| T |
9110688 |
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9110787 |
T |
|
| Q |
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ttttcctttatcttt |
115 |
Q |
| |
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atttcatttatcttt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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101 |
Q |
| |
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|||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || |
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| T |
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ttgttccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatcattaactatttattaccatttcttttttcaa-tt |
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
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|
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cttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #134
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
15269551 |
attatatgtcgttttacaataccaaaaaaacattaatgttacttttcatattactatccttagctatttattactctatcttctttcaattctttcattt |
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T |
|
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110 |
atctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
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| |
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||||||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||| |
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ctctttctcataccattttttaaggagaaatttgtaaaacaactcataatatctcttt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #135
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ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattattctctcttatttcaatta |
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T |
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| Q |
102 |
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159 |
Q |
| |
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| T |
43446676 |
tatcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactgataat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #136
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108 |
Q |
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17399810 |
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17399909 |
T |
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| Q |
109 |
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176 |
Q |
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17399910 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaatttataatttctcttccccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #137
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101 |
Q |
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19505871 |
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19505772 |
T |
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| Q |
102 |
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161 |
Q |
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| T |
19505771 |
attcatttatctttcctatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatat |
19505712 |
T |
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Target: chr2; HSP #138
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2 |
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Q |
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29411967 |
T |
|
| Q |
97 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
29411968 |
aattatttcatttatcttttttataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
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T |
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115 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
116 |
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178 |
Q |
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| T |
22060804 |
ctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataaaa |
22060866 |
T |
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Target: chr2; HSP #140
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Q |
| |
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| T |
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42695714 |
T |
|
| Q |
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167 |
Q |
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| T |
42695715 |
atttaatttatctttctcataacatttattaaggacatttatgtaaaacaactcataatatctcttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
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| T |
42801142 |
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T |
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| Q |
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153 |
Q |
| |
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42801043 |
ctttcatttatctatcatatatcatttattaaaaacaattttgtaaaacaact |
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T |
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108 |
Q |
| |
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| T |
9053576 |
aaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttattttttctattttatccttaactattaattactctctcttctttcaattaatttatt |
9053675 |
T |
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| Q |
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tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
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| T |
9053676 |
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T |
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Target: chr2; HSP #143
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118 |
Q |
| |
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| T |
14834053 |
gctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttttcc |
14834152 |
T |
|
| Q |
119 |
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176 |
Q |
| |
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| T |
14834153 |
ataccatttattaaggataattttgt-aaacaactcataattaatcttcgccacacaa |
14834209 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43257471 - 43257337
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141 |
Q |
| |
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| T |
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attaatgttacttttcttattatatcattaattatttattactttttcttctttcaattcttttatttatttttcccatataatttattaaggacaattt |
43257372 |
T |
|
| Q |
142 |
tgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
43257371 |
tgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #145
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Q |
| |
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| T |
39293389 |
ttgtctcaaattataaatcgttttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttatcattatatattttttcaattc |
39293488 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttat---taagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39293489 |
tttaatttatctctctcataacatttataactatagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcatacaaaa |
39293568 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #146
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 40171934 - 40172099
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
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| T |
40171934 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgacacattaatgttactttttctattatatctttaattatttattac-------tctttc--ttt |
40172024 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
40172025 |
tttcatttatcttacccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaa |
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T |
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Target: chr2; HSP #147
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Q |
| |
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|||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||| | |
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44987757 |
attgtctcaaattgtatgtcacattacaataccaatgaatcattaatgttactttttttattatatccttcactatttattgtcttttctgcttccaagt |
44987856 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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cattcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcatattatctctttcccacacaaaa |
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T |
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Q |
| |
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12123108 |
attgtcctaaattatacgtcgttttataatatcaataaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctccattctttcaa-t |
12123010 |
T |
|
| Q |
101 |
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161 |
Q |
| |
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| T |
12123009 |
ttttaatttatctttcacataccatttattaaagataattttgtagaacaactcataatat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #149
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
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Q |
| |
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T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| T |
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104 |
Q |
| |
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13196408 |
tcccaaattatatatcattttacaataccaatgaaacattaatattattttttctattatatgcttaattatttattactc--ttttatttcaattctat |
13196505 |
T |
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| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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13196506 |
aatttatctttttcataccatttattatggacaattttgtaaaacaacccataatat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
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aacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattagtctctcttctttcaattctttcttttatttttc-catatcatttatgaaggacaa |
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T |
|
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Q |
| |
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|||||||||| ||||||| |
|
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21884448 |
ttttgtaaaataactcat |
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Target: chr2; HSP #152
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| |
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ctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttactactc--tcttctttcaa-tccttcatttatctttcctgta |
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T |
|
| Q |
122 |
ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2893864 |
-catttattagggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #153
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Q |
| |
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atatgttgctttacaataccaatgaagcattaatgttacttttttctattatatccttaattatttattgccctctcatatttcaattctttaatttatc |
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T |
|
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tttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataata |
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
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3 |
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| T |
13197105 |
tgtctcaaattatatatcgctttacaataccaattaaacattaatgatattttttttattatattattaattatttattactctctcttcttttaatttt |
13197006 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| || || ||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
13197005 |
ttaatatatctttttcgtaccatttattaaaagcaattttctaaaacaacttataatgtatatttt |
13196940 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 14723837 - 14724016
Alignment:
| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttg-------tttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttc |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || || | ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14723837 |
gtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaatattaatgttactccctcttctttcaattatttcattaactattaattactccctcttctttc |
14723936 |
T |
|
| Q |
97 |
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176 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
14723937 |
aattatttcatttatcttttcaatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctttcccacacaa |
14724016 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15041148 - 15041040
Alignment:
| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaac |
152 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15041148 |
ttttcatattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattctttgatttatctttctgataccatttattaaggacaatattgtaaaacaac |
15041049 |
T |
|
| Q |
153 |
tcataatat |
161 |
Q |
| |
|
| ||||||| |
|
|
| T |
15041048 |
ttataatat |
15041040 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36174595 - 36174442
Alignment:
| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
36174595 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgaaacatt-atgttatttttcctattatatccttaattatttattaccctctcttctttca------ |
36174503 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | |||||||||| | || |||||||| |||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
36174502 |
---tttatctttttcatgtcatttattaaggaaaactttgtaaatcaactcgtaatatctcttt |
36174442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36602175 - 36602092
Alignment:
| Q |
93 |
tttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
36602175 |
tttcaattctttaatttatctttttcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
36602092 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 625932 - 626106
Alignment:
| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||| | ||| ||||||||| || |
|
|
| T |
625932 |
gtcccaaattataaatcgctttaaaataccaatgaagcattaatgttgttttttccataataactctacctatttattagtatctctcctttcaattctt |
626031 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||| || || | ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
626032 |
taatttatctttctcataccattaataaatgataattttgtaaaacaattcataatttttctttcccatacaaaa |
626106 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 173
Target Start/End: Original strand, 4079799 - 4079903
Alignment:
| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4079799 |
ttaactatttattactctctcttctttcaattcatttatctgtcttttccatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttc |
4079898 |
T |
|
| Q |
169 |
ccaca |
173 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
4079899 |
ccaca |
4079903 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 6312259 - 6312343
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactc |
85 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6312259 |
attgtctcaaattgtatgtcactttacaataccgatgaaacattaatgttatttttgttattatatccttaactatttattactc |
6312343 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 4553362 - 4553461
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
4553362 |
attgtcacaaattatatgtcattttacaataccattgaaacaataatgttgcttttcttattatatccttaattatttattattctctcttctttcaatt |
4553461 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Original strand, 7669758 - 7669849
Alignment:
| Q |
70 |
taactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7669758 |
taactatttattactttttcttctttcaattctttcattcttatttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
7669849 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 167
Target Start/End: Original strand, 37742751 - 37742849
Alignment:
| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37742751 |
ttaattatttattactttctcttctatcaattatttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaattcatagtatatcttt |
37742849 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 27525005 - 27525178
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
27525005 |
attgtcccaaattatatggggattttcaatatcaatcaagcattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttcttttaatt |
27525104 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||| || |||| | |||||| | |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
27525105 |
ctttaaattatcctttccata----tcattaaggataattttgtaaaacagcccataatatctctttaccatacaaaa |
27525178 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 32864019 - 32864178
Alignment:
| Q |
8 |
caaattata-tgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| || || |||| ||| | |||| || |||||||| ||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
32864019 |
caaattataatgtcgcgttacaatatcaatgatgtattaatgttattctttctatcatatcattaatcatatattactctatcttcttttaattctttaa |
32864118 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32864119 |
tttatctttctcatactattt-ttaaagacaattttgtaaaactactcataatatctcttt |
32864178 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4898366 - 4898311
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttc |
57 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
4898366 |
ttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgcaactttaatgttatttttc |
4898311 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4945760 - 4945705
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttc |
57 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
4945760 |
ttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgcaactttaatgttatttttc |
4945705 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 161
Target Start/End: Original strand, 8001601 - 8001718
Alignment:
| Q |
44 |
taatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttg |
143 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| |||||| | ||| | |||| || || |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
8001601 |
taatgttatttttcttattatgtccttaattgtttctcactctatattttttcaatttttttatttatctttcccatatcatttattaatgacaatttta |
8001700 |
T |
|
| Q |
144 |
taaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8001701 |
taaaaaaactcataatat |
8001718 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 44019766 - 44019842
Alignment:
| Q |
3 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactattta |
79 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
44019766 |
tgtccaaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatctttaactattta |
44019842 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5274617 - 5274514
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| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaac |
152 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5274617 |
tttttctattatacccttaactatttattactc--tcttctttca---------tttatttttctcatactatttattaaagacaattttataaaacaac |
5274529 |
T |
|
| Q |
153 |
tcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5274528 |
tcataatatctcttt |
5274514 |
T |
|
Back To:
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Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
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| Q |
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attgtcccaaattatatgtcgcttt---acaataccaatgcaacattaatgtt |
50 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27862734 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaacaataccaatgcaacattaatgtt |
27862786 |
T |
|
Back To:
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Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 161
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| Q |
69 |
ttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
16268098 |
ttaactatttattagtctttattctttcaattttttcatttatttttgtcatatcatttactaaagacgattttgtaaaataattcataatat |
16268190 |
T |
|
Back To:
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactc |
85 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28464197 |
aaattataagtcgctttacaatatcaatgaagtattaatgttatttttcatattattttcttaactatttattactc |
28464273 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
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| Q |
4 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataacctta |
71 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
8983447 |
gtcccaaattatatgttgctttacaataccaacaaaaaattaatgttatttttcatattatatcctta |
8983514 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #176
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Query Start/End: Original strand, 2 - 101
Target Start/End: Original strand, 12598270 - 12598368
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12598270 |
ttgtcacaaattatatatcactttacaataccaataaaatattaatgttattttt-ctatcatatatttaactgtttattactctctcttctttcaattt |
12598368 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #177
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Query Start/End: Original strand, 10 - 148
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| Q |
10 |
aattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaacta-tttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||| || | | || |||| ||||| ||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
35155759 |
aattatatgtcactttacaataccaatgacgcataattgttacttttccaattatatcccttattagtttactactctatcttttttcaattctttaatt |
35155660 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaa |
148 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
35155659 |
tatctttcccataacatttattatggacaattttgtaaaa |
35155620 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #178
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Alignment:
| Q |
41 |
cattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttccttta |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
13995449 |
cattaatgttatttttcctattatattattaactatttattactcgctcatctttcaattctttcattta |
13995380 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Original strand, 11825792 - 11825848
Alignment:
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11825792 |
tttatctttcacataccacttattaaggacaattttgtaaaacaacgcataatatat |
11825848 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 35020353 - 35020305
Alignment:
| Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataacctt |
70 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
35020353 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatcctt |
35020305 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 40346479 - 40346415
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattata |
65 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| || |||| |||||||| |
|
|
| T |
40346479 |
attgtcccaaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatattactttttctattata |
40346415 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 44653669 - 44653621
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgtt |
50 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
44653669 |
ttgtcccaaattatatattgctttacaataccaatgaaatattaatgtt |
44653621 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 40
Target Start/End: Original strand, 5900879 - 5900910
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaa |
40 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5900879 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaa |
5900910 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 169
Target Start/End: Original strand, 11134931 - 11134978
Alignment:
| Q |
122 |
ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttc |
169 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11134931 |
ttattttttaagattaattttgtaaaacaactcataatatattttttc |
11134978 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 33713652 - 33713573
Alignment:
| Q |
3 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttatta |
82 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||| |
|
|
| T |
33713652 |
tgtctcaaattatatgtcgttttacaataccagtgaagaattaatgttactttttctattaaatcgttaactatttatta |
33713573 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 43428451 - 43428549
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||| || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
43428451 |
attgtcacaaattatatgttgttttacgataataataaaatattaatgtt-tttttcttattatatccttaactattttttactatttcttctttcaatt |
43428549 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 161
Target Start/End: Original strand, 43428568 - 43428638
Alignment:
| Q |
90 |
ttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
43428568 |
ttctttcaattctttaatttattttt-tcatactatttattaagaacaattttgttaaaccactgataatat |
43428638 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 167
Target Start/End: Original strand, 4979024 - 4979145
Alignment:
| Q |
46 |
atgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaa-ttttgt |
144 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| | || ||| | ||||||| | |||| |||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
4979024 |
atgttattttttctattatatctttaactatttattattctctcttctttc-agttcttcatctatcttttttatatcatttgttaaggccaatttttgt |
4979122 |
T |
|
| Q |
145 |
aaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4979123 |
aaaacagctcataatatctcttt |
4979145 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Original strand, 42017927 - 42017961
Alignment:
| Q |
13 |
tatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaat |
47 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42017927 |
tatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaat |
42017961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 153
Target Start/End: Original strand, 42784374 - 42784419
Alignment:
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaact |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42784374 |
tttatctttctcatatcattt-ttaagaacaattttataaaacaact |
42784419 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 42
Target Start/End: Original strand, 14833008 - 14833041
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaaca |
42 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14833008 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaca |
14833041 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 178
Target Start/End: Original strand, 15242838 - 15242875
Alignment:
| Q |
141 |
ttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15242838 |
ttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaaaa |
15242875 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 26775166 - 26775234
Alignment:
| Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattac |
83 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
26775166 |
atatgtcactttacaataccaatgcatcattaatgat-tttttcctatcatatcctttatcatttattac |
26775234 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Original strand, 31839066 - 31839162
Alignment:
| Q |
71 |
aactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
31839066 |
aactatttattagtctctcttctttcaactctttaatttatctttctcataccatttaaaaag-ataattttgtaaaacaatttataatatctctttt |
31839162 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36888033 - 36887996
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36888033 |
atttattaagaacaattttataaaacaacttataatat |
36887996 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 4996939 - 4997054
Alignment:
| Q |
52 |
tttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaa-ttttgtaaaaca |
150 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| | || ||| | ||||||| | |||| |||| ||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4996939 |
tttttcttattatatctttaactatttattattctctcttctttc-agttcttcatctatcttttttatatcatttgttaaggccaatttttgtaaaaca |
4997037 |
T |
|
| Q |
151 |
actcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4997038 |
gctcataatatctcttt |
4997054 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 7669677 - 7669733
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattata |
65 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
7669677 |
aaattatatgtcgttttacaatatcgatgaaacattaatgctacttttcctattata |
7669733 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 178
Target Start/End: Original strand, 31391030 - 31391134
Alignment:
| Q |
74 |
tatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| || | ||| ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
31391030 |
tatttattactctttattcttttaaatctttaatttatctatctaatacgatttattaatgacaattttgtaataaaactcagaatatattttttccata |
31391129 |
T |
|
| Q |
174 |
caaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
31391130 |
caaaa |
31391134 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 139)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2010307 - 2010131
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2010307 |
ttgtcccaaattatatgttgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactttctcttctttcaattc |
2010208 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2010207 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaa |
2010131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 6850052 - 6850224
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6850052 |
attgtcctaaattatatgtcgctttacaatactaatgcagcattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaatt |
6850151 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6850152 |
atttcatttatctttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccaca |
6850224 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 5489633 - 5489796
Alignment:
| Q |
10 |
aattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttccttt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
5489633 |
aattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaactatttattactttatcttctttcaattatttcattt |
5489732 |
T |
|
| Q |
110 |
atctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5489733 |
atctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccaca |
5489796 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 32609834 - 32610009
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32609834 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaatt |
32609933 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
32609934 |
ctttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaaaaactcataatatcttttttccacacaa |
32610009 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 24430192 - 24430366
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24430192 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacatttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattc |
24430291 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
24430292 |
tttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
24430366 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6792012 - 6791853
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6792012 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatatcttctttcaattc |
6791913 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6791912 |
tttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
6791853 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 11130156 - 11130327
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11130156 |
attgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttattttgcttattataaccttaactatttattactttatcttctttcaatt |
11130255 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |
|
|
| T |
11130256 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttttaatatcttttttccac |
11130327 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9660464 - 9660290
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
9660464 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcttattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
9660365 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
9660364 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
9660290 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6335181 - 6335011
Alignment:
| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6335181 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactc--tcttatttcaattctt |
6335084 |
T |
|
| Q |
104 |
tcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6335083 |
tcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaa |
6335011 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 16970461 - 16970634
Alignment:
| Q |
3 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttt |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | |
|
|
| T |
16970461 |
tgtcccaaatgatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctgttataaccttaaatatttattactctctcttctttcagttct |
16970560 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16970561 |
ttcatttatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaccaactcataatatctcttttccacacaa |
16970634 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28075253 - 28075084
Alignment:
| Q |
7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
28075253 |
ccaaattatatgtcgctttacaatacctatgcaacattaatattacttttcctattataaccttaaatatttattactctctcttctttcaattctttta |
28075154 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28075153 |
ttgatcttttccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
28075084 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 1352514 - 1352688
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1352514 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattc |
1352613 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
1352614 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatctttcccatacaa |
1352688 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 20605612 - 20605786
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |
|
|
| T |
20605612 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattaatctcttttctttcaattc |
20605711 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
20605712 |
tttcatttatctttcccatgttatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctcttttctacacaa |
20605786 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 29344019 - 29344192
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29344019 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactttctcttctttcaattc |
29344118 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
29344119 |
tttcatttatctttccca-attattcattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaa |
29344192 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 30238851 - 30239028
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
30238851 |
attgttccaaattatatgtcgttttaaaatactaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaattatttattactctctcttttttcaatt |
30238950 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
30238951 |
ttttcatttatcttttccatattatttattaagaacaaatttgtaaaacaactcttaatatctctttttcacgcaaaa |
30239028 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 11000410 - 11000583
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
11000410 |
attgtcccaaattatatatcgctttacaataccaatgcaacaataatgttactttttctattataaccttaattatttattactctttattctttcaatt |
11000509 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11000510 |
atttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacatctcata--atatcttttccacacaa |
11000583 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 8550211 - 8550386
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| Q |
2 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8550211 |
ttgtcccaaattatatgtcgcttttataatacccatgcaatattaatgttacttttccaattataaccttaattatttattactccttcttctttcaatt |
8550310 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
8550311 |
ctttcatttttctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
8550386 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 11172928 - 11173102
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11172928 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
11173027 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
11173028 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
11173102 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13631301 - 13631127
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13631301 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattc |
13631202 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
13631201 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
13631127 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 14499151 - 14499325
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14499151 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccattgaaacattaacgttatttttcctattatatccttaaatatttattactctctcttctttcaattc |
14499250 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
14499251 |
tttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
14499325 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 29818225 - 29818400
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29818225 |
attgtcccaaattatatgtcgctttagaatatcaatgcaacattaatcttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
29818324 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
29818325 |
ctttcatttatttttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctcttttccatacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 31492922 - 31493097
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31492922 |
attgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaatt |
31493021 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
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ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
31493097 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 31498311 - 31498486
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31498311 |
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31498410 |
T |
|
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101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
31498411 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
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3787135 |
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
3787235 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
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| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
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|
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tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8415242 - 8415068
Alignment:
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2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
8415242 |
ttgtcccatattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
8415143 |
T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
8415142 |
cttcatttatcttttccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
8415068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 9961358 - 9961532
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9961358 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
9961457 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
9961458 |
cttcatttatctttcctatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
9961532 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14311005 - 14310831
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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| T |
14311005 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
14310906 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
14310905 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
14310831 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25526891 - 25526717
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25526891 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
25526792 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
25526791 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
25526717 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 29901238 - 29901412
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29901238 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattattgttactttttcaattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
29901337 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
29901338 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaatgcataatatctattttccacacaa |
29901412 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31949379 - 31949205
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31949379 |
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31949280 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
31949279 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
31949205 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 32142418 - 32142591
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |
|
|
| T |
32142418 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctatctt-tttcatttc |
32142516 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
32142517 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaa |
32142591 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32393701 - 32393528
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32393701 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcc |
32393602 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
32393601 |
ttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaa |
32393528 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 11615395 - 11615567
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11615395 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
11615494 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctt-tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
11615495 |
cttcattgtatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaca |
11615567 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 3819644 - 3819819
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3819644 |
attgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaatt |
3819743 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
3819744 |
atttcatttatcttttccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
3819819 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 3888612 - 3888779
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
3888612 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcgtt |
3888711 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
3888712 |
tatctttcacatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
3888779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17275476 - 17275309
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || |
|
|
| T |
17275476 |
aaattatatgtcgctttacaatatcagtgcaacattaatgttatttttcctattataactttaactatttattactctctcttcttttaattctttcatt |
17275377 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
17275376 |
tatgtttcccatataatttattaaggacaagtttgtaaaacaactaataatatctattttccacacaa |
17275309 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1228240 - 1228066
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1228240 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatctttaactatttattactatctcttctttcaattc |
1228141 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1228140 |
cttcatttatctttctcatattatttattgaggataattttataaaacaactcataatatatctttcccacacaa |
1228066 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 4130895 - 4131069
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4130895 |
ttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctaatatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
4130994 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4130995 |
tttcatttatcttttccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatttatctttcccatacaa |
4131069 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 8201503 - 8201677
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8201503 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaacaatttattactttctcttctttcaattc |
8201602 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8201603 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10629555 - 10629381
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
10629555 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactttatcttctttcaatta |
10629456 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
| T |
10629455 |
tttcatttatctttttcatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
10629381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
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Q |
| |
|
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| T |
12499709 |
ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttaatactctctcttttttcaattc |
12499610 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12499609 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
12499535 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
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Q |
| |
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|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |
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| T |
12509192 |
ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttaatactctctcttttttcaattc |
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T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
12509292 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
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| |
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| T |
26409090 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacattaccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattc |
26409189 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
26409190 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaa |
26409264 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30739390 - 30739216
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
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| T |
30739390 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgatacattaatattatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattc |
30739291 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
30739290 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
30739216 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 12058612 - 12058786
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12058612 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttatttctc--tcttctttcaattc |
12058709 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
12058710 |
tttcatttatctatctcatatcatttattaaggacaactttgtaaaacaactcataatatcactttccaacacaaaa |
12058786 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15989827 - 15989662
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| |
|
|
| T |
15989827 |
ttgtcccaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattaatctttcttatttcaattc |
15989728 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15989727 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
15989662 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27080573 - 27080396
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
27080573 |
attgtcctaaattatatgtcactttgcaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcactaactattcattactctctcttcttttaatt |
27080474 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
27080473 |
ctttcatttatctttcacatatcatttattaagaacaattttgtaaaacaactcatattatctttttcccacacaaaa |
27080396 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8493636 - 8493465
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
8493636 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
8493537 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
8493536 |
tttcattcatctttcccatatgatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaca |
8493465 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 1778866 - 1779039
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1778866 |
ttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttt-cctattatatccttaactatttattactctcccttctttcaattc |
1778964 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
1778965 |
attcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
1779039 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 9461617 - 9461791
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9461617 |
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9461716 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9461717 |
atttatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactaataatatatctttctcacacaa |
9461791 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12507038 - 12506864
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| |
|
|
| T |
12507038 |
ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttatttctttttcttttttcaattc |
12506939 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12506938 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
12506864 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 14304389 - 14304563
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14304389 |
ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
14304488 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
14304489 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
14304563 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 29017070 - 29017227
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29017070 |
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29017169 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29017170 |
tttcatttatctttttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
29017227 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 78387 - 78239
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| Q |
28 |
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127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
78387 |
aataccaatgcaacattaatgtcacttttccgattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattattt |
78288 |
T |
|
| Q |
128 |
attaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
78287 |
attaaggacaattttgtaaaacaacccataatatcttttttccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 6612417 - 6612592
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6612417 |
ttgtcccaaattgtacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
6612516 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctt-tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| || |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
6612517 |
cttcattgtatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16466401 - 16466226
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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attgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaatt |
16466302 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
16466301 |
atttcatttatctttttcataccatttatcaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
16466226 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 29455393 - 29455559
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29455393 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcagcattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactttctcttctttca--- |
29455489 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
29455490 |
------tttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaactactcataatatctctttttcacacaa |
29455559 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9038485 |
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9038387 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9038386 |
cttcatttatctttttcatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16524756 - 16524582
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2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
16524756 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctattctttcaatta |
16524657 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
16524656 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
16524582 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 17360642 - 17360816
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Q |
| |
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|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
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| T |
17360642 |
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17360741 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
17360742 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #62
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| |
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| |
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|
|
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #63
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Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 34283386 - 34283543
Alignment:
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2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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| T |
34283386 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaatta |
34283485 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34283486 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
34283543 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 1228444 - 1228612
Alignment:
| Q |
8 |
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107 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |
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| T |
1228444 |
caaattgtatgtcactttacaatatcaataaaacattaatgttatttttccgattatatccttaagtatttattactctttcttccttcaattctttcat |
1228543 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |
|
|
| T |
1228544 |
ttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataacatctctttcccacacaa |
1228612 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4981376 - 4981201
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |
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|
| T |
4981376 |
attgtcgcaaattatatgtcgctttacaatactaataaaatattaatgttactttttctattatgtctttaactatttattactctcttttctttcaatt |
4981277 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
4981276 |
cattcatttatctttctcatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaa |
4981201 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 24178273 - 24178444
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |
|
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| T |
24178273 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattt |
24178372 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
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| T |
24178373 |
catttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
24178444 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Original strand, 6833789 - 6833931
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
6833789 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattatctcttctttcaatta |
6833888 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgt |
144 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6833889 |
tttcatttatcttttccatgttatttattaaggacaattttgt |
6833931 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 21858589 - 21858743
Alignment:
| Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| |||| |
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| T |
21858589 |
ctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctattctttcaattccttcatttatctttcccata |
21858688 |
T |
|
| Q |
122 |
ttatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
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| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
21858689 |
tcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
21858743 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Original strand, 11173326 - 11173451
Alignment:
| Q |
53 |
ttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaac |
152 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
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|
| T |
11173326 |
tttttctattataaccttaactatttattactctatcttatttcaattcttacatttatttttctcatattatttattaagtacaagtttgtaaaacaac |
11173425 |
T |
|
| Q |
153 |
tcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
11173426 |
tcataatatctcttttccacacaaaa |
11173451 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7897008 - 7896847
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7897008 |
ttgttccaaattatatgt-gctttgcaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttca---- |
7896914 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7896913 |
-----tttatatttctcatattatttattaaggaaaattttgtaaaacaacccataatatattttttccaca |
7896847 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 15497892 - 15498059
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
15497892 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccggaactatttattgctctctcttcattcaatttcttcatt |
15497991 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
15497992 |
tatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaa |
15498059 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24053181 - 24053010
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24053181 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattattatctcttctttcaattattt |
24053082 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
24053081 |
catttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaaaaactcataatttatcttccccacacaa |
24053010 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14600673 - 14600515
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14600673 |
attgtcctaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactttctcttctttcaatt |
14600574 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14600573 |
atttcatttattttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
14600515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 17941651 - 17941824
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17941651 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaataaaa-attaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactatctcttctttcaattc |
17941749 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
17941750 |
cttcatttatctttcccatatcatttgttaaggacaattttataaaacaattcataatatctctttcccacacaa |
17941824 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 19098562 - 19098735
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19098562 |
ttgttccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattgctctctcttcattcaattc |
19098661 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
19098662 |
cttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaac-cataatatctctttcccatacaa |
19098735 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 33254377 - 33254551
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33254377 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacatttcatattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattc |
33254476 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
33254477 |
atttatttatctttcccatattatttattgaggataattttgtaaaacaactcgtaatatctctttctcacacaa |
33254551 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 30240248 - 30240425
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||| | |
|
|
| T |
30240248 |
attgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatttccttcactatttattaccttctctactctcaagt |
30240347 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30240348 |
cattcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
30240425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 4148310 - 4148198
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4148310 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaatacgaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactc--tcttctttcaatt |
4148213 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatcttt |
115 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
4148212 |
cttttatttatcttt |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7245924 - 7245768
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| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
7245924 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatcttatttttcctattatatctttaactatttattgctc--tcttctttcaattcattcat |
7245827 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
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||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
7245826 |
ttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacttataatatctctt |
7245768 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16465859 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaatattaatgttattttttctattataaccttagtaatttattactctatcttctttcaattc |
16465958 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa-tatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16465959 |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 31003947 - 31004121
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
31003947 |
ttgtcccaaattatatgtcattttacaatagcaatgaaacattaatgttactttttcgattatatcattaagtatttattactctttcttccttcaattc |
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T |
|
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102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 31503930 - 31504064
Alignment:
| Q |
42 |
attaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31503930 |
attaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattt |
31504029 |
T |
|
| Q |
142 |
tgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
31504030 |
tgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
31504064 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 3337424 - 3337588
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3337424 |
ttgtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttca---- |
3337519 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacaca |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
3337520 |
-----tttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacaca |
3337588 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35040074 - 35039897
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||| ||| | |
|
|
| T |
35040074 |
attgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacatttcctattatatccttcactatttattgcattctctacttccaagt |
35039975 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35039974 |
cattcatttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaa |
35039897 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 7358515 - 7358683
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
7358515 |
caaattatatgtcactttacaatatcaatcaaacattaatgttactttttttattatattcttaattatttattactttttcttctttcaattctttcat |
7358614 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
7358615 |
ttatttttcccatatcatttattaaggaaaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
7358683 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30510993 - 30510817
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||| ||| | |
|
|
| T |
30510993 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtc |
30510894 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
30510893 |
attcatttatctttcccatttcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaaaa |
30510817 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 10133724 - 10133890
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
10133724 |
aaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacaatcatgttactttttctattacatccttaactatttattactctttctt-tttcaattctttcatt |
10133822 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
10133823 |
tatctttcttatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacacaa |
10133890 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21139987 - 21139835
Alignment:
| Q |
5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21139987 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc--tcttctttcaattattt |
21139890 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21139889 |
catttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaataactcataat |
21139835 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2603634 - 2603460
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || | || |||||||| |
|
|
| T |
2603634 |
ttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgtaactttttctattatatccttaactatttattattcttttttttttcaattc |
2603535 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
2603534 |
ttacatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
2603460 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Original strand, 200120 - 200257
Alignment:
| Q |
39 |
aacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaa |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| || ||||||||||||| | |||||||| | || |
|
|
| T |
200120 |
aacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattctttcttttttcaattctttcattcatctttctcatatcaattattaaggataa |
200219 |
T |
|
| Q |
139 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
200220 |
ttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
200257 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6334945 - 6334801
Alignment:
| Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
6334945 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctt |
6334846 |
T |
|
| Q |
115 |
tctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6334845 |
ttccataccatttattagagataattttgtaaaacaactcataat |
6334801 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11213617 - 11213497
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
11213617 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataactttagttatttattactctcttttctttcaattctttcat |
11213518 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattattta |
128 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11213517 |
ttatctttcccatattattta |
11213497 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 32588719 - 32588895
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |
|
|
| T |
32588719 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaagctttaatgttattttttctattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtc |
32588818 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
32588819 |
attcatttatctttcctatatcatttactaatgacaattttgtaaaacaattcataatatccctttcccacacaaaa |
32588895 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1114552 - 1114433
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
1114552 |
ttgtcccaaattatacgtcgctttacaattccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttttttcaattc |
1114453 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcata |
121 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1114452 |
cttcatttatttttctcata |
1114433 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 290387 - 290556
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
290387 |
caaataatatgtcgctttacaataccaatg-aacattaattttattttttatattatatctttaactatttattactctctcttctttcaactctttaat |
290485 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |
|
|
| T |
290486 |
ttttctttttcataccatttattaaggacgattttgtaaaacaactcataatatctattttctactcaaaa |
290556 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 176
Target Start/End: Original strand, 4657897 - 4658019
Alignment:
| Q |
54 |
tttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaact |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4657897 |
tttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatcttttctatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaact |
4657996 |
T |
|
| Q |
154 |
cataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
4657997 |
cataatatctttttcccacacaa |
4658019 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7885332 - 7885163
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
7885332 |
aaattatttttcgttttacaataataataaaacattaatgttactttttctattatatcattagctatttattactctctcttctttcaattatttaatt |
7885233 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7885232 |
tatctttcttatactatttattaaggacaattttgtaaaataactaataatatctcttttccatacaaaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 176
Target Start/End: Original strand, 10027871 - 10027983
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| Q |
64 |
taaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
10027871 |
taaccttaactatttattactctctcttctttcgattctttcatttatcttttccatattatttattaagaataattttgtaaaacaattcataatattt |
10027970 |
T |
|
| Q |
164 |
cttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
10027971 |
tttttccacacaa |
10027983 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13587101 - 13586925
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||| |||| || || | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| | |
|
|
| T |
13587101 |
ttgtcccaaattataaatcactttacaaaaccagtgaaatagtaatgttgatttttctattataacctaaactatttattactttctatcctttcaaatc |
13587002 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| |
|
|
| T |
13587001 |
tttaatttatctttctcataatatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctatttttcatacaaaa |
13586925 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31872818 - 31872662
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3 |
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102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| |||| ||||| | |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31872818 |
tgtcccaaattatactttgctttaaaatatcaatgaagcattaatgctatttttcttattatattcttaactatttataactcactcttctttcaatttt |
31872719 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31872718 |
tttatttatctttctcataccatttattaaagataattttgtaaaataactcataat |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 18105679 - 18105840
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13 |
tatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatc |
112 |
Q |
| |
|
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| T |
18105679 |
tatacgtcgctttacaatacta-tgaaatattaatgatattttttctattatatccttcactatttattactctttttt-tttcaattccatcatttatc |
18105776 |
T |
|
| Q |
113 |
tttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
18105777 |
tttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
18105840 |
T |
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Target: chr6; HSP #102
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Target Start/End: Complemental strand, 34219135 - 34218973
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114 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
34219135 |
tatgtcgttttacaataccaatgaatcattaatattatttcttctattatatccttaactatttattactttatctcctttcatgtgattcatttatctt |
34219036 |
T |
|
| Q |
115 |
tctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34219035 |
tc-catatcatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttctcacacaaaa |
34218973 |
T |
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Target: chr6; HSP #103
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Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5609523 - 5609365
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100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
5609523 |
attgtctcaaattatatgtcgttttacaa--cccatgaaatattaatgttagttttcctattatatcattaactatttattactctcacttttttcaaat |
5609426 |
T |
|
| Q |
101 |
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161 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5609425 |
ctttcatttatttttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatat |
5609365 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #104
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Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9225651 - 9225475
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |
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|
| T |
9225651 |
attgtcccaaattgtgtgtcgctttacaataccaatgaagcattaatgttatttttcatattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagt |
9225552 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9225551 |
cattaatttatctttctcatatcaatt-ctaaggacaattttgtaaaacagttcataatatccattttccacacaaaa |
9225475 |
T |
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Target: chr6; HSP #105
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Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21072208 - 21072048
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100 |
Q |
| |
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||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||| || |||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||| | |
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|
| T |
21072208 |
attgtcctaaatcatatgtcattttgcaataccaatgaagaattaatattactttttctattatatccgtagctatttattactctctcttctttcaaat |
21072109 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21072108 |
ctttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
21072048 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #106
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Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21047488 - 21047321
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100 |
Q |
| |
|
||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| | |
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|
| T |
21047488 |
attgtcctaagtcatatgtcattttgcaataccaatgaagaattaatattattttttctattatatccgtagctatttattactctcacttctttcaaat |
21047389 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21047388 |
ctttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttt |
21047321 |
T |
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Target: chr6; HSP #107
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Target Start/End: Complemental strand, 10364708 - 10364595
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
10364708 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
10364609 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatcttt |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |
|
|
| T |
10364608 |
tttcatttatcttt |
10364595 |
T |
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Target: chr6; HSP #108
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Query Start/End: Original strand, 2 - 176
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| Q |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
690498 |
ttgtcccaaattatatgttactttataataccaatgaaacattaatgttacttttc-tattataaccttaactatttattactctcttttctttcaagtt |
690400 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
690399 |
ttttatttatctttttaat-----------aggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaa |
690336 |
T |
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Target: chr6; HSP #109
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167 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17441915 |
cttaattatttattactatctcttctttcaattatttcttttatcattcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctcttt |
17442014 |
T |
|
| Q |
168 |
tccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
17442015 |
cccacacaa |
17442023 |
T |
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Target: chr6; HSP #110
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107 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
33841290 |
caaattatatatcgctttacaatacgaa----acattaatattactttttctattatattcttaactatttattactt--ttttttttcaattctttaat |
33841383 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33841384 |
ttatctttctcgtaccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatttctttcccacacaaaa |
33841454 |
T |
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Target: chr6; HSP #111
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88 |
tcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12278579 |
tcttctttcaattctttcgtttatctttctcatatcatttattatggacaattttgtaaaacaactcataatat |
12278506 |
T |
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Target: chr6; HSP #112
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3 |
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102 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||| | | || ||||||||| | |||||||||||||| | |
|
|
| T |
7595903 |
tgtcctaaattatatgtcactttacaatatcaataaaacatcaatgttttttttc-tattatatcttgaattatttattattatatcttctttcaattct |
7596001 |
T |
|
| Q |
103 |
ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7596002 |
ttaatttatctttccgacaccatttattaaggaaaattgtgtaaaacaactcataatatttcttt |
7596066 |
T |
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Target: chr6; HSP #113
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Target Start/End: Complemental strand, 31560504 - 31560335
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| Q |
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caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
31560504 |
caaattatatgtcgatttgcaataccaatgaagaattaattttacttttc-tattatatcttcaactatttatt-ctc--tcttctttcaattttttcat |
31560409 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatatt---atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31560408 |
ttatcgttaacatattttcatttattaaggacaaatttgtaaaacaacgtataatatattttttccacacaaaa |
31560335 |
T |
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Target: chr6; HSP #114
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Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Original strand, 31858247 - 31858411
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| Q |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
31858247 |
ttgtcccaaattatatatcgtattaaaatatcaatgaaatattaatgttattttttttattatatccttaactatttattactacctcttcattcaatta |
31858346 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| || ||||||| | | |||| |||| |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
31858347 |
tttaatttatctttctcatatcatctattaaggatagttttttaaagcaacatataatatctctt |
31858411 |
T |
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Target: chr6; HSP #115
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Query Start/End: Original strand, 53 - 161
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Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19687914 |
ttttcctattagatccttaactatttaatactc----ttcttttaattttttcatttatttttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaac |
19687819 |
T |
|
| Q |
153 |
tcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
19687818 |
tcataatat |
19687810 |
T |
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Target: chr6; HSP #116
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Query Start/End: Original strand, 8 - 159
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8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||| ||| || | ||||| | ||||| | ||| | |||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
32614634 |
caaattataagtcattttacaataccgatgaaatactaatgatattttttttcttacacccttaactttttattaatctctcttctttcaattctttaat |
32614733 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32614734 |
ttatctttctcttatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataat |
32614785 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #117
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tttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttt--ttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaac |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||| || |||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
30662472 |
tttttcctatcatatctttaactatttattactctctcctcttttaattttatttattttatctttcgtatgtcatttattaaggataattttgtaaaac |
30662373 |
T |
|
| Q |
150 |
aactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30662372 |
aactcataatatatcttt |
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T |
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Target: chr6; HSP #118
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71 |
aactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
25509963 |
aactatttattaatc--tcttcttttaattctttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataacatgtcttt |
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T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttatt |
81 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
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ttgtctcaaattatatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatattcttaattatttatt |
17441778 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
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88 |
tcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22816252 |
tcttctttcacttctttaatttatcttttccatatcgtttattaagaacaattttgtaaaacaactcacaatatatcttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #121
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1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacat |
43 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78567 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacat |
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T |
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Target: chr6; HSP #122
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10 |
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109 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |
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|
| T |
31712746 |
aattataagtcgctttaaaatatcaatggaacattaattttactttttctcttatacttttagctatttattactctatcttctttcaattctttaattc |
31712647 |
T |
|
| Q |
110 |
atctttct-catattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|| ||| | |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31712646 |
atttttttgcataacatttattaagaatagttttgtaaaacatttcataatatctcttt |
31712588 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #123
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| Q |
71 |
aactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
26046358 |
aactatttattaatc--tcttcttttaattctttaatttatcattctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataacatgtcttt |
26046264 |
T |
|
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| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
2309489 |
ttatgtttctcatataatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccac |
2309553 |
T |
|
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Target: chr6; HSP #125
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| Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactca |
86 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12278968 |
ctttacaataccaatgaaacattaattttacttttcctattatatctttaactatttattactca |
12278904 |
T |
|
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Target: chr6; HSP #126
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Target Start/End: Original strand, 14386592 - 14386680
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| Q |
88 |
tcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
14386592 |
tcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
14386680 |
T |
|
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Target: chr6; HSP #127
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| Q |
60 |
attataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt--ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcata |
157 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
24660184 |
attatatccttaactatttattaatttctcttctttcaattctttttaatttatctttcttatatcatatattaagtacagttttgtaaaacaattcaga |
24660283 |
T |
|
| Q |
158 |
atatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
| T |
24660284 |
atatctcttt |
24660293 |
T |
|
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Target: chr6; HSP #128
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| Q |
120 |
tattatttattaagaacaattttgt-aaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4147932 |
tattatttattaaggacaattttgtaaaaaaaactcataatatctcttttccacacaa |
4147875 |
T |
|
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Target: chr6; HSP #129
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| Q |
106 |
ctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
290812 |
ctttacctttctcatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcgtaatatatttttctcacacaaaa |
290884 |
T |
|
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Target: chr6; HSP #130
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Target Start/End: Original strand, 24718319 - 24718403
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactc |
85 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24718319 |
attgtcctaaattatatgtcattttacaatatcaataaaacattattgttacttttcttattatacccttaactatttactactc |
24718403 |
T |
|
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Target: chr6; HSP #131
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Target Start/End: Complemental strand, 10364575 - 10364517
Alignment:
| Q |
118 |
catattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
10364575 |
catatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaa |
10364517 |
T |
|
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Target: chr6; HSP #132
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Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 35030387 - 35030549
Alignment:
| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | | | |||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
35030387 |
attgtcccaaattaaaagctgttttacaattccaatgaaatatcaatgttacttttcctattataccattaattatttattactctctttactttcaatt |
35030486 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || |||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35030487 |
ctttaatttatctctcacataccatgtattaatgaaaatttcataaaataactcataatatat |
35030549 |
T |
|
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Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Original strand, 3331776 - 3331944
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| || ||| | |||||| ||||||| || |
|
|
| T |
3331776 |
aaattatatatcgttttaaaataccaataaaaatttaatgttattttttctattatattattacctatttctttctctcttttcttttaatttttaa-tt |
3331874 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
3331875 |
tacctttttcataccatttattaaagataactttgtaaaacaactcataatatctattttccatacaaaa |
3331944 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 172
Target Start/End: Original strand, 2311595 - 2311659
Alignment:
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
2311595 |
ttatatttcacatataatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttaccac |
2311659 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32655086 - 32655043
Alignment:
| Q |
124 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttt |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
32655086 |
atttattaagaacaattttgtaaaacacctaataatatctcttt |
32655043 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Original strand, 21944872 - 21944922
Alignment:
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataa |
158 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21944872 |
ttatttttctcatatcatgtattaattacaattttgtaaaacaactcataa |
21944922 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6087113 - 6087080
Alignment:
| Q |
130 |
taagaacaattttgtaaaacaactcataatatat |
163 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6087113 |
taaggacaattttgtaaaacaactcataatatat |
6087080 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 290737 - 290813
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| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattact |
84 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
290737 |
caaattatatgtttctttacaatatcaatgaagcattaatgttacttttcatattatataattaattatttattact |
290813 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 31503698 - 31503734
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatg |
37 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31503698 |
attgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatg |
31503734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1335 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1335
Description:
Target: scaffold1335; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1400 - 1233
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
1400 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgtaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcttccaattctttcatt |
1301 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1300 |
tatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaa |
1233 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0380 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:
Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16234 - 16067
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| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
16234 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttatctatttattactctcttttctttcaattctttcatt |
16135 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
16134 |
tatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaa |
16067 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0734 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0734
Description:
Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6484
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
6310 |
ttgtctcaatttatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagctatttattactctcttttctttcaattc |
6409 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6410 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatcaattccacacaa |
6484 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0264 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:
Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18917 - 18743
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
18917 |
ttgtcccaaattgtatgtctctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactttctcttatttcaattc |
18818 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18817 |
tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
18743 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0154 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:
Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 6614 - 6783
Alignment:
| Q |
7 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
6614 |
ccaaattatatgtcgctttataataccaatgcaacattaatgctacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttatttcaattctttca |
6713 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6714 |
tttatctttcccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
6783 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4212 - 4044
Alignment:
| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
4212 |
caaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatattcttaactatttattactctttcttctttcaattctttcat |
4113 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
4112 |
ttatctttgtcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
4044 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0983 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:
Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1308 - 1134
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1308 |
ttgtcccaaattatatgtcgcttcacaatatcaatgcaacattaatattacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattc |
1209 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
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| T |
1208 |
tttcatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttcgacacaa |
1134 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
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Target Start/End: Complemental strand, 25999 - 25825
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101 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25999 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
25900 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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| T |
25899 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
25825 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0789 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
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Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 3353 - 3528
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3353 |
attgtcccaaattatatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgatacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
3452 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
3453 |
ctttcatttatttttcccatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaa |
3528 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 98905 - 99079
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
98905 |
ttgtcccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
99004 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
99005 |
ttttatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
99079 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 63387 - 63561
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
63387 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
63486 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
63487 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaa |
63561 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1284 - 1459
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
1284 |
attgtcccaagttatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattgattactctctcttctttcaaat |
1383 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
1384 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
1459 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13915 - 13757
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13915 |
attgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccccattctttcaatt |
13816 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13815 |
atttcatttatcttttccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
13757 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0768 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0768
Description:
Target: scaffold0768; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6139 - 5980
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
6139 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattatctcttctttcaatta |
6040 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6039 |
tttcatttatcttttccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
5980 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0366 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:
Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 293 - 133
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| Q |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
293 |
attgtcccaaattatatgtcgttttacagtaccaatgcaacattaatgttacttttccaattgtaaccttaactatttattattatctcttctttcaatt |
194 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
133 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13042 - 12884
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| Q |
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13042 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
12943 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12942 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
12884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1515 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1515
Description:
Target: scaffold1515; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 1488 - 1659
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| Q |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1488 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttaattttcctattatattcttaactatttattactttgtcttctttcaattc |
1587 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccaca |
173 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1588 |
cttcatttatctttcccatattatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccaca |
1659 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0427 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:
Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 5274 - 5448
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
5274 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattc |
5373 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
5374 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaa |
5448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0308 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:
Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 20710 - 20875
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
20710 |
attgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaatattaatgctactttttctattataaccttaactatttattaccctctcttctttcaatt |
20809 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20810 |
ctttcagttatctttcccatattatttactaaggacgattttgtaaaacaactcataatatctctt |
20875 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0654 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0654
Description:
Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3067 - 2900
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| Q |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaaca---ttaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaa |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3067 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaataatattaatgctactttttccattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
2968 |
T |
|
| Q |
99 |
ttttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2967 |
ttctttcatttatctttcccatattatttactaaggactattttgtaaaacaactcataatatctctt |
2900 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8636
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaattttatttttcctattatatccttaactattaattattctctcttctttcaatta |
8578 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8579 |
tttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
8636 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0007 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:
Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
2967 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccattgcaacaat--tgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctctcctttcaattc |
3064 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
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|||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3065 |
tttcgtttatttttcccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatat |
3124 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0444 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:
Target: scaffold0444; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 7637 - 7812
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7637 |
attgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
7736 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
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|
| T |
7737 |
atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttttcttccccacacaa |
7812 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0166 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:
Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23587 - 23429
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
23587 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
23488 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23487 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
23429 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21658 - 21491
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
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Q |
| |
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||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |
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|
| T |
21658 |
aaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattttttactctttcttctttcaattctttcatt |
21559 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
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Q |
| |
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||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |
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|
| T |
21558 |
tattttccccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatttcttttttccacacaa |
21491 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28106 - 27946
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2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacatta---atgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaa |
98 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| | ||| | || |||||| |
|
|
| T |
28106 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttataatatcaatgaaacattattaatgttactttttcttttatacttttaactatttagttctc--ttttttttcaa |
28009 |
T |
|
| Q |
99 |
ttttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28008 |
ttctttaatttattttttccctatgatttattaaggacaattttgtaagacaactcataatat |
27946 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 71922 - 71762
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacatta---atgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaa |
98 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||| || || |||||| |
|
|
| T |
71922 |
ttgtctcaaattataagtcgctttataatatcaatgaaacattattaatgttactttttcttttatacttttaactatttagtact--attttttttcaa |
71825 |
T |
|
| Q |
99 |
ttttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
71824 |
ttctttaatttattttttccctatgatttattaaggacaattttgtaagacaactcataatat |
71762 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0459 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:
Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11735 - 11577
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11735 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
11636 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11635 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataat |
11577 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:
Target: scaffold0074; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 17501 - 17658
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2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17501 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttccctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaatta |
17600 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17601 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataatttggtaaaacaactcataat |
17658 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
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Target Start/End: Original strand, 45815 - 45912
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| Q |
75 |
atttattactcaatcttctttcaattttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccac |
172 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45815 |
atttattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcacatattatttattaaggacaattttgtaaaacagctcataatatctcttttccac |
45912 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 45623 - 45706
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| Q |
1 |
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84 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45623 |
attgtcccaaattatatgtcgtgttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaactatttattact |
45706 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0330 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:
Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13938 - 13766
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13938 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttacaatacaaatgaaacgttaatgttacttttcctattatatccttaactattt--tactctttcttctttcaattc |
13841 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
13840 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaagcaactcataatatcactttcccacacaa |
13766 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0172 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:
Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18431 - 18257
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
18431 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattaccctcttttctttcaattc |
18332 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||| ||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
18331 |
cttcatttatcttttccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacgaataatatcactttcccacacaa |
18257 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 188828 - 188718
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
188828 |
attgtcccaaattatatgtcgatttacaataccaatgcaacattaatattatttttcctattataaccttaactatttattactgtctcttctttcaatt |
188729 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttat |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
| T |
188728 |
ctttcatttat |
188718 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 13359 - 13525
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| Q |
8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
13359 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattata--cttaactattaattactctctcttcttttaattatttcat |
13456 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
13457 |
ttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
13525 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0027 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:
Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11232 - 11056
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||| | |
|
|
| T |
11232 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtc |
11133 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11132 |
attcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaa |
11056 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0262 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:
Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 3808 - 3975
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9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctt |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
3808 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatatcatt |
3907 |
T |
|
| Q |
109 |
tatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
3908 |
tatcttttccataccatttattaaggataattttgtataacaactgataatttctcttccccacacaa |
3975 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0533 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:
Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 7249 - 7407
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attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
7249 |
attgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttctatt |
7348 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7349 |
atttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaaatcataat |
7407 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:
Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23116 - 22942
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
101 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| || |||| |||||||| |
|
|
| T |
23116 |
ttgttccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactactaattattctctcttgtttcaatta |
23017 |
T |
|
| Q |
102 |
tttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
23016 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttacccacacaa |
22942 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0015 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:
Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 20499 - 20675
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| Q |
1 |
attgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
20499 |
attgtcctaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaattattaatgttaccttttctattatatcttta-ctatttattactttctcttcttccaatt |
20597 |
T |
|
| Q |
101 |
ttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
20598 |
cattcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcccaaacaaaa |
20675 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0236 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:
Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 20318 - 20471
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5 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaatttttt |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | ||||| | ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20318 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttactttttctattatatcctt-actattaactactctcttttctttcaattattt |
20416 |
T |
|
| Q |
105 |
cctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataat |
159 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20417 |
catttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
20471 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
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8 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
213130 |
caaattatatgtcgctttacaataccaacgaaacattaatgtaacttttcctattataactttaactagttattattctcgcttctttccattctttaat |
213031 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
213030 |
ttatcattctcataccatttattaaggataattttgtaaaataacacataatat |
212977 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0140 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:
Target: scaffold0140; HSP #1
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| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttg-tttttcctattataaccttaactatttattactcaatcttctttc-aat |
99 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
18363 |
ttgtctcaaattgtatgtcactttataataccaatgaaatattaatgtttattttttctattatatccttaattatttatttctctttcttttttttaat |
18264 |
T |
|
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100 |
tttttcctttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
| ||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
18263 |
tcttttatttatttttcctatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
18187 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0475 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:
Target: scaffold0475; HSP #1
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54 |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
5193 |
tttcctattatatccttaactatttattactctttcttctt-caattctttcatttattctttct-atatctatttattaaggacaattttgtaaaacaa |
5290 |
T |
|
| Q |
152 |
ctcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
5291 |
ctcataatat |
5300 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0024 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:
Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 42684 - 42745
Alignment:
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctttt |
168 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
42684 |
tttatatttcttatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttt |
42745 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Original strand, 524334 - 524415
Alignment:
| Q |
2 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattac |
83 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
524334 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacaataatgttacttttcctattatatccttaactatttattac |
524415 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0187 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:
Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10524 - 10370
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactattt--attactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
10524 |
aaattataagtagctttacaatatcaataaaatattaatgttactttttctattataatcttagttatctctattactctctcttctatcaattctttaa |
10425 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10424 |
tttatcattctcataccatttattaagggcaattttgtaaaacaactcataatat |
10370 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20852 - 20698
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactattt--attactcaatcttctttcaattttttcc |
106 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
20852 |
aaattataagtagctttacaatatcaataaaatattaatgttactttttctattataatcttagttatctctattactctctcttctatcaattctttaa |
20753 |
T |
|
| Q |
107 |
tttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20752 |
tttatcattctcataccatttattaagggcaattttgtaaaacaactcataatat |
20698 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0496 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:
Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12772 - 12704
Alignment:
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccacacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
12772 |
ttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaa |
12704 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 133899 - 134052
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttc-ctattataaccttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcct |
107 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||| ||| | || | |||||||||||| || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
133899 |
aaattataagtcgttttacaatagcaatgaaatattaatgttatttttttctatcataccatttattatttattactctcactaatttcaattctttaat |
133998 |
T |
|
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
133999 |
ttatctttctcgtacaatttattaaggacaaatttgtaaaataactcataatat |
134052 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0268 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:
Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 20383 - 20439
Alignment:
| Q |
9 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattata |
65 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20383 |
aaattatatgttactttacaatatcaatgaaacataaatgttatttttcctattata |
20439 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0263 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:
Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Original strand, 14077 - 14135
Alignment:
| Q |
108 |
ttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatctt |
166 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| |
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|
| T |
14077 |
ttatctttttcatatcatttattaaagacaattttgtaaaacagcttataatatctctt |
14135 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 39824 - 39889
Alignment:
| Q |
19 |
tcgctttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataaccttaactatttattact |
84 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39824 |
tcgctttataatatcaatgaaacattaatgttattttttctgttatacttttaactatttattact |
39889 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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