View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13498_high_10 (Length: 412)

Name: NF13498_high_10
Description: NF13498
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13498_high_10
NF13498_high_10
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (17-392)||(5845-6221)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (16-392)||(138296-138673)
scaffold0021 (126-392)||(76589-76853)
scaffold0021 (146-288)||(10003-10148)
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (16-392)||(26071753-26072131)
chr7 (16-392)||(26095540-26095918)
chr7 (16-392)||(3893381-3893772)
chr7 (16-392)||(12753172-12753558)
chr7 (127-392)||(15824105-15824371)
chr7 (126-392)||(44863443-44863711)
chr7 (126-392)||(141869-142136)
chr7 (126-392)||(47287976-47288244)
chr7 (16-392)||(112784-113168)
chr7 (16-290)||(45453745-45454016)
chr7 (16-292)||(1938257-1938532)
chr7 (200-392)||(7286328-7286522)
chr7 (200-392)||(12545607-12545802)
chr7 (201-392)||(18305642-18305831)
chr7 (201-392)||(13867887-13868080)
chr7 (199-392)||(7290908-7291102)
chr7 (16-169)||(15913921-15914075)
chr7 (200-392)||(2192606-2192799)
chr7 (200-392)||(369143-369336)
chr7 (200-392)||(14253071-14253263)
chr7 (200-392)||(16480836-16481029)
chr7 (200-392)||(15952859-15953050)
chr7 (35-200)||(9058141-9058311)
chr7 (126-392)||(49049452-49049723)
chr7 (16-165)||(13388493-13388643)
chr7 (36-220)||(15761867-15762051)
chr7 (36-222)||(32496053-32496242)
chr7 (40-165)||(13376200-13376324)
chr7 (146-392)||(15629004-15629255)
chr7 (56-170)||(20587140-20587254)
chr7 (126-222)||(13867688-13867784)
chr7 (127-392)||(13272976-13273246)
chr7 (56-160)||(8565108-8565212)
chr7 (204-377)||(15762262-15762429)
chr7 (40-219)||(18255324-18255505)
chr7 (36-165)||(3058585-3058713)
chr7 (56-165)||(9322594-9322703)
chr7 (126-222)||(11285619-11285715)
chr7 (56-170)||(28718977-28719091)
chr7 (126-222)||(11582535-11582631)
chr7 (117-256)||(15952673-15952813)
chr7 (126-293)||(16571751-16571921)
chr7 (126-293)||(16593741-16593911)
chr7 (36-149)||(125378-125492)
chr7 (323-392)||(16571983-16572053)
chr7 (323-392)||(16593609-16593679)
chr7 (36-160)||(2027097-2027222)
chr7 (125-222)||(13038808-13038905)
chr7 (200-297)||(2024757-2024858)
chr7 (126-292)||(10862515-10862683)
chr7 (126-261)||(12249771-12249908)
chr7 (126-222)||(12545404-12545501)
chr7 (200-274)||(12545553-12545627)
chr7 (142-214)||(36051075-36051147)
chr7 (117-222)||(369364-369471)
chr7 (42-220)||(10988092-10988271)
chr7 (143-214)||(122987-123059)
chr7 (142-222)||(16210183-16210263)
chr7 (42-219)||(26010695-26010874)
chr7 (175-229)||(18305492-18305546)
chr7 (328-392)||(2024692-2024757)
chr7 (143-219)||(2192376-2192453)
chr7 (117-219)||(15518435-15518539)
chr7 (208-392)||(16416509-16416684)
chr7 (202-274)||(16480710-16480782)
chr7 (317-392)||(45455505-45455581)
chr7 (40-219)||(2436110-2436285)
chr7 (162-256)||(2024904-2024998)
chr7 (56-102)||(4483318-4483364)
chr7 (142-200)||(7291277-7291335)
chr7 (126-219)||(7821406-7821500)
chr7 (126-219)||(7828717-7828811)
chr7 (126-219)||(16416949-16417043)
chr7 (142-219)||(16480605-16480683)
chr7 (126-219)||(27103134-27103228)
chr7 (126-219)||(27110482-27110576)
chr7 (126-219)||(27175098-27175192)
chr7 (126-219)||(38785226-38785320)
chr7 (202-274)||(2192480-2192552)
chr7 (118-170)||(4483268-4483320)
chr7 (200-392)||(11582659-11582840)
chr7 (56-219)||(13757060-13757225)
chr7 (175-222)||(3055193-3055241)
chr7 (117-219)||(25293856-25293960)
chr7 (200-304)||(122854-122951)
chr7 (126-219)||(11514604-11514698)
chr7 (263-392)||(13038989-13039114)
chr7 (126-219)||(15443146-15443240)
chr7 (142-219)||(30263727-30263805)
chr7 (117-194)||(42057741-42057819)
chr7 (76-121)||(3193586-3193630)
chr7 (321-392)||(16209975-16210045)
chr7 (43-112)||(19066193-19066262)
chr7 (77-121)||(13460914-13460958)
chr7 (117-215)||(13912691-13912791)
[»] chr6 (91 HSPs)
chr6 (16-392)||(31626739-31627117)
chr6 (20-392)||(18775506-18775886)
chr6 (20-392)||(22428473-22428850)
chr6 (16-392)||(16104850-16105237)
chr6 (126-392)||(25646518-25646786)
chr6 (20-392)||(25745792-25746160)
chr6 (200-392)||(35017451-35017645)
chr6 (201-392)||(35011124-35011316)
chr6 (200-392)||(18128340-18128532)
chr6 (200-392)||(18578834-18579027)
chr6 (206-392)||(13622937-13623121)
chr6 (16-141)||(16083970-16084095)
chr6 (201-392)||(19627498-19627690)
chr6 (200-377)||(14628368-14628545)
chr6 (200-392)||(18004857-18005050)
chr6 (16-199)||(18128776-18128964)
chr6 (200-392)||(23975708-23975902)
chr6 (200-392)||(18843708-18843900)
chr6 (126-392)||(13016436-13016702)
chr6 (36-222)||(19984699-19984887)
chr6 (209-369)||(33316422-33316582)
chr6 (16-165)||(18383173-18383323)
chr6 (36-220)||(1554324-1554508)
chr6 (126-247)||(18422182-18422303)
chr6 (16-165)||(33323342-33323492)
chr6 (16-110)||(23151845-23151939)
chr6 (40-220)||(16238848-16239028)
chr6 (35-160)||(17790652-17790776)
chr6 (260-392)||(23151706-23151839)
chr6 (175-392)||(32896282-32896492)
chr6 (16-159)||(16889236-16889379)
chr6 (200-326)||(18825647-18825774)
chr6 (56-170)||(34965470-34965584)
chr6 (16-141)||(35137439-35137565)
chr6 (126-293)||(25369014-25369184)
chr6 (57-200)||(22846615-22846767)
chr6 (40-219)||(11214623-11214803)
chr6 (126-392)||(18397163-18397434)
chr6 (204-377)||(1553946-1554113)
chr6 (56-160)||(16134814-16134918)
chr6 (40-221)||(4989379-4989561)
chr6 (126-210)||(35017303-35017387)
chr6 (56-170)||(19852795-19852909)
chr6 (263-392)||(16827873-16828003)
chr6 (142-214)||(18740863-18740935)
chr6 (40-219)||(1659212-1659387)
chr6 (142-220)||(13622800-13622878)
chr6 (56-170)||(23220222-23220336)
chr6 (42-219)||(14628111-14628289)
chr6 (42-219)||(23976053-23976231)
chr6 (42-219)||(26088319-26088497)
chr6 (118-219)||(33316158-33316260)
chr6 (312-392)||(17787746-17787827)
chr6 (207-274)||(23975956-23976023)
chr6 (126-222)||(16827462-16827559)
chr6 (126-222)||(18004635-18004732)
chr6 (57-199)||(1651466-1651605)
chr6 (202-274)||(14628316-14628388)
chr6 (321-392)||(25173518-25173590)
chr6 (42-195)||(16650745-16650899)
chr6 (126-221)||(18825420-18825515)
chr6 (200-377)||(4989004-4989171)
chr6 (126-291)||(15738590-15738757)
chr6 (206-260)||(16238711-16238765)
chr6 (200-392)||(18740645-18740828)
chr6 (126-219)||(25174040-25174134)
chr6 (126-219)||(27655670-27655764)
chr6 (57-194)||(15861243-15861375)
chr6 (126-230)||(28196439-28196546)
chr6 (42-195)||(16557515-16557669)
chr6 (126-221)||(18843481-18843576)
chr6 (200-274)||(4989201-4989275)
chr6 (126-219)||(10487364-10487458)
chr6 (126-219)||(16377869-16377963)
chr6 (126-219)||(16385193-16385287)
chr6 (323-392)||(18422115-18422185)
chr6 (209-270)||(33316292-33316353)
chr6 (42-219)||(29870975-29871153)
chr6 (200-270)||(16827663-16827733)
chr6 (142-219)||(17343864-17343942)
chr6 (76-121)||(16374954-16374999)
chr6 (117-219)||(16230065-16230169)
chr6 (117-219)||(23993645-23993749)
chr6 (216-274)||(18004770-18004827)
chr6 (200-392)||(19984915-19985096)
chr6 (142-219)||(22227278-22227356)
chr6 (200-274)||(25173731-25173805)
chr6 (321-392)||(18835474-18835544)
chr6 (126-170)||(21930417-21930462)
chr6 (76-121)||(31162441-31162486)
chr6 (154-198)||(32896494-32896538)
[»] chr8 (99 HSPs)
chr8 (16-392)||(37605283-37605668)
chr8 (50-392)||(41243948-41244277)
chr8 (126-392)||(25120745-25121012)
chr8 (126-392)||(19994802-19995078)
chr8 (126-392)||(20479893-20480166)
chr8 (126-392)||(16416537-16416810)
chr8 (201-392)||(18610428-18610620)
chr8 (200-392)||(41508927-41509122)
chr8 (36-308)||(16203832-16204098)
chr8 (205-392)||(24719328-24719513)
chr8 (200-392)||(13664550-13664743)
chr8 (200-392)||(13723825-13724018)
chr8 (211-392)||(22008366-22008548)
chr8 (200-392)||(22909342-22909535)
chr8 (138-392)||(20655677-20655943)
chr8 (16-144)||(41245210-41245338)
chr8 (200-392)||(24108465-24108657)
chr8 (16-165)||(21192234-21192384)
chr8 (16-165)||(21696086-21696236)
chr8 (16-165)||(21199661-21199811)
chr8 (16-160)||(31195772-31195917)
chr8 (16-165)||(23835746-23835895)
chr8 (200-392)||(23509068-23509261)
chr8 (16-200)||(37655134-37655324)
chr8 (36-222)||(29758768-29758956)
chr8 (200-377)||(22323225-22323398)
chr8 (201-392)||(269950-270138)
chr8 (201-392)||(645782-645970)
chr8 (201-392)||(831517-831705)
chr8 (16-165)||(39448310-39448460)
chr8 (201-392)||(16043054-16043245)
chr8 (36-213)||(270226-270401)
chr8 (36-213)||(645519-645694)
chr8 (36-213)||(831254-831429)
chr8 (239-392)||(17343480-17343632)
chr8 (201-392)||(16041378-16041569)
chr8 (16-102)||(37609956-37610042)
chr8 (126-291)||(17731117-17731286)
chr8 (126-214)||(24719077-24719165)
chr8 (56-171)||(22498832-22498947)
chr8 (40-212)||(24930614-24930789)
chr8 (36-214)||(24387203-24387383)
chr8 (56-165)||(23116349-23116458)
chr8 (126-392)||(38531882-38532152)
chr8 (56-170)||(22312190-22312304)
chr8 (56-170)||(45560747-45560861)
chr8 (110-200)||(25294490-25294582)
chr8 (110-200)||(25756479-25756571)
chr8 (65-170)||(33170785-33170890)
chr8 (35-160)||(33612569-33612694)
chr8 (126-293)||(28543270-28543440)
chr8 (274-392)||(6776303-6776422)
chr8 (16-170)||(23153297-23153452)
chr8 (200-392)||(43375310-43375493)
chr8 (126-392)||(18768422-18768691)
chr8 (126-222)||(22008139-22008236)
chr8 (126-249)||(24108245-24108368)
chr8 (200-392)||(3433535-3433718)
chr8 (126-222)||(22323102-22323197)
chr8 (142-214)||(43375202-43375274)
chr8 (42-195)||(22089943-22090097)
chr8 (56-170)||(24238065-24238177)
chr8 (330-392)||(28543151-28543213)
chr8 (126-219)||(23509397-23509491)
chr8 (126-222)||(13664296-13664393)
chr8 (126-222)||(13723571-13723668)
chr8 (42-219)||(3433076-3433254)
chr8 (202-274)||(13664424-13664496)
chr8 (202-274)||(13723699-13723771)
chr8 (42-219)||(21853396-21853574)
chr8 (126-222)||(22909146-22909242)
chr8 (57-199)||(24547724-24547863)
chr8 (42-195)||(15320559-15320713)
chr8 (42-195)||(15500928-15501082)
chr8 (211-274)||(23509315-23509378)
chr8 (263-392)||(23631046-23631173)
chr8 (56-117)||(11543088-11543149)
chr8 (117-219)||(21846065-21846169)
chr8 (16-75)||(25294581-25294641)
chr8 (16-75)||(25756570-25756630)
chr8 (208-392)||(28835980-28836155)
chr8 (207-274)||(3433285-3433352)
chr8 (126-219)||(272786-272880)
chr8 (126-219)||(642969-643063)
chr8 (126-219)||(828775-828869)
chr8 (126-219)||(5236674-5236768)
chr8 (320-392)||(39448573-39448646)
chr8 (42-219)||(16874439-16874617)
chr8 (337-392)||(17731331-17731387)
chr8 (16-102)||(23148481-23148568)
chr8 (200-304)||(29758643-29758740)
chr8 (117-195)||(224737-224816)
chr8 (117-195)||(738360-738439)
chr8 (117-195)||(862255-862334)
chr8 (117-195)||(16675900-16675979)
chr8 (351-392)||(21695899-21695941)
chr8 (126-219)||(24662830-24662924)
chr8 (209-274)||(3433390-3433455)
chr8 (56-96)||(18043091-18043131)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (53-392)||(37760-38101)
[»] chr3 (134 HSPs)
chr3 (16-392)||(50113612-50113991)
chr3 (17-392)||(319099-319486)
chr3 (36-392)||(51159973-51160335)
chr3 (126-392)||(17098913-17099181)
chr3 (18-392)||(12351332-12351709)
chr3 (16-392)||(47786356-47786735)
chr3 (126-392)||(6148457-6148723)
chr3 (126-392)||(30204696-30204961)
chr3 (16-274)||(7852223-7852482)
chr3 (200-392)||(11812801-11812994)
chr3 (126-392)||(16183665-16183945)
chr3 (16-222)||(8630315-8630521)
chr3 (126-392)||(19572430-19572693)
chr3 (126-392)||(22145882-22146145)
chr3 (200-392)||(38166213-38166407)
chr3 (200-392)||(18737974-18738167)
chr3 (16-268)||(14060726-14060980)
chr3 (200-392)||(19944805-19944998)
chr3 (200-392)||(7851683-7851877)
chr3 (200-392)||(30140984-30141177)
chr3 (209-387)||(12796728-12796908)
chr3 (200-392)||(17936455-17936649)
chr3 (16-201)||(38812481-38812671)
chr3 (38-169)||(18008645-18008776)
chr3 (16-214)||(19230535-19230734)
chr3 (35-165)||(15874690-15874820)
chr3 (200-392)||(16819043-16819234)
chr3 (35-165)||(48420197-48420327)
chr3 (16-165)||(55442252-55442404)
chr3 (42-165)||(12490249-12490372)
chr3 (126-392)||(14287323-14287596)
chr3 (36-222)||(2048535-2048723)
chr3 (16-165)||(11330493-11330643)
chr3 (126-392)||(11199144-11199415)
chr3 (56-170)||(5229607-5229721)
chr3 (36-222)||(33340317-33340506)
chr3 (36-222)||(23490980-23491169)
chr3 (126-392)||(35121921-35122189)
chr3 (36-228)||(19945098-19945289)
chr3 (204-335)||(8630101-8630232)
chr3 (36-222)||(10737033-10737219)
chr3 (126-392)||(14296730-14297000)
chr3 (126-392)||(14302357-14302627)
chr3 (40-219)||(14846160-14846339)
chr3 (126-293)||(11062691-11062861)
chr3 (58-170)||(47983418-47983531)
chr3 (58-170)||(47992705-47992818)
chr3 (58-170)||(48001992-48002105)
chr3 (58-170)||(48011278-48011391)
chr3 (284-392)||(54045594-54045703)
chr3 (126-222)||(11813307-11813403)
chr3 (16-170)||(9592239-9592394)
chr3 (200-297)||(13815973-13816070)
chr3 (126-392)||(14523006-14523278)
chr3 (259-392)||(17958169-17958303)
chr3 (42-256)||(49230655-49230869)
chr3 (36-213)||(5227201-5227378)
chr3 (40-219)||(15939959-15940140)
chr3 (42-222)||(17913751-17913933)
chr3 (56-170)||(41660135-41660249)
chr3 (204-365)||(54686551-54686707)
chr3 (317-392)||(11062944-11063020)
chr3 (126-222)||(17957996-17958093)
chr3 (42-220)||(44227903-44228083)
chr3 (204-365)||(9304664-9304819)
chr3 (42-219)||(16819386-16819565)
chr3 (57-256)||(16259487-16259683)
chr3 (259-392)||(25057035-25057166)
chr3 (126-290)||(15516035-15516197)
chr3 (127-222)||(19262602-19262698)
chr3 (306-392)||(13815856-13815943)
chr3 (200-392)||(19230318-19230499)
chr3 (200-274)||(11813179-11813253)
chr3 (126-268)||(12563136-12563281)
chr3 (126-222)||(25057247-25057344)
chr3 (76-165)||(33370914-33371002)
chr3 (317-392)||(17536847-17536923)
chr3 (208-392)||(18908679-18908854)
chr3 (208-392)||(22273034-22273209)
chr3 (42-219)||(27839184-27839362)
chr3 (150-222)||(45581310-45581382)
chr3 (200-267)||(7851968-7852035)
chr3 (142-220)||(15860824-15860902)
chr3 (142-219)||(18905356-18905434)
chr3 (200-274)||(18908892-18908966)
chr3 (200-377)||(49230262-49230429)
chr3 (40-199)||(15613564-15613720)
chr3 (202-274)||(11813048-11813120)
chr3 (126-268)||(17137827-17137969)
chr3 (57-199)||(23081682-23081821)
chr3 (260-392)||(23490768-23490898)
chr3 (207-270)||(16819292-16819355)
chr3 (126-221)||(30141361-30141456)
chr3 (126-219)||(2450910-2451004)
chr3 (76-122)||(11517010-11517056)
chr3 (126-219)||(18909169-18909263)
chr3 (126-219)||(22273524-22273618)
chr3 (124-274)||(40938085-40938236)
chr3 (57-219)||(12266007-12266167)
chr3 (126-199)||(15574545-15574618)
chr3 (42-219)||(16745670-16745848)
chr3 (317-392)||(53900388-53900463)
chr3 (126-219)||(1469236-1469330)
chr3 (200-274)||(7851857-7851931)
chr3 (126-291)||(17536606-17536774)
chr3 (270-392)||(33340038-33340155)
chr3 (127-219)||(15470048-15470141)
chr3 (207-392)||(19262733-19262907)
chr3 (42-219)||(30151813-30151991)
chr3 (330-392)||(12563334-12563397)
chr3 (126-200)||(12951476-12951555)
chr3 (320-392)||(39654163-39654237)
chr3 (117-219)||(8269976-8270080)
chr3 (117-219)||(8277087-8277191)
chr3 (117-219)||(8305896-8306000)
chr3 (322-392)||(14061039-14061110)
chr3 (117-219)||(53769137-53769241)
chr3 (117-195)||(13956378-13956457)
chr3 (117-195)||(13977211-13977290)
chr3 (40-87)||(18905296-18905343)
chr3 (117-195)||(41268743-41268822)
chr3 (117-195)||(45859521-45859600)
chr3 (126-273)||(53900177-53900326)
chr3 (117-195)||(55314883-55314962)
chr3 (200-274)||(2451155-2451229)
chr3 (200-274)||(22273247-22273321)
chr3 (200-274)||(49230509-49230583)
chr3 (207-256)||(2451035-2451084)
chr3 (259-308)||(10736904-10736953)
chr3 (126-171)||(11883923-11883968)
chr3 (126-171)||(14291910-14291955)
chr3 (126-170)||(38377415-38377460)
chr3 (259-308)||(45581181-45581230)
chr3 (126-165)||(15989508-15989548)
[»] chr5 (96 HSPs)
chr5 (16-392)||(4863551-4863943)
chr5 (16-392)||(27185318-27185699)
chr5 (76-392)||(21661268-21661593)
chr5 (126-392)||(21392432-21392698)
chr5 (200-392)||(34937571-34937764)
chr5 (200-392)||(10307-10500)
chr5 (200-392)||(10780112-10780305)
chr5 (16-169)||(32967661-32967815)
chr5 (200-392)||(43445708-43445901)
chr5 (35-165)||(23492532-23492662)
chr5 (200-392)||(28257781-28257970)
chr5 (200-392)||(22885041-22885234)
chr5 (35-200)||(24226976-24227146)
chr5 (206-392)||(25211796-25211982)
chr5 (206-392)||(25275948-25276134)
chr5 (35-171)||(21615535-21615671)
chr5 (203-392)||(17473704-17473892)
chr5 (16-160)||(7727112-7727257)
chr5 (209-377)||(19497952-19498120)
chr5 (16-171)||(19860756-19860912)
chr5 (16-169)||(28888441-28888598)
chr5 (126-274)||(11582266-11582414)
chr5 (200-392)||(11579922-11580113)
chr5 (126-272)||(1170321-1170467)
chr5 (16-165)||(13793659-13793809)
chr5 (35-165)||(37189637-37189767)
chr5 (126-392)||(23453184-23453454)
chr5 (126-392)||(23460428-23460698)
chr5 (126-392)||(23464689-23464959)
chr5 (42-274)||(1221351-1221584)
chr5 (201-392)||(23986165-23986359)
chr5 (250-392)||(1171320-1171464)
chr5 (200-392)||(9732592-9732782)
chr5 (200-392)||(1221638-1221826)
chr5 (56-170)||(11964472-11964586)
chr5 (126-392)||(24184869-24185137)
chr5 (126-392)||(24470555-24470804)
chr5 (126-222)||(21653052-21653148)
chr5 (42-222)||(11213222-11213404)
chr5 (42-222)||(110604-110785)
chr5 (56-170)||(20455627-20455741)
chr5 (126-256)||(22884887-22885017)
chr5 (142-222)||(17473568-17473648)
chr5 (142-308)||(23510313-23510473)
chr5 (200-392)||(29192671-29192857)
chr5 (204-385)||(17907853-17908030)
chr5 (56-256)||(35792767-35792964)
chr5 (126-256)||(16534750-16534881)
chr5 (200-392)||(35793162-35793345)
chr5 (200-274)||(10554-10628)
chr5 (142-256)||(18779790-18779904)
chr5 (126-222)||(22368188-22368285)
chr5 (42-219)||(19498280-19498458)
chr5 (126-222)||(28257998-28258093)
chr5 (207-274)||(9732495-9732562)
chr5 (42-222)||(10779799-10779980)
chr5 (188-392)||(11338584-11338802)
chr5 (200-392)||(25944566-25944750)
chr5 (200-392)||(11340599-11340782)
chr5 (42-219)||(11341116-11341294)
chr5 (200-392)||(18780052-18780235)
chr5 (117-219)||(25425102-25425206)
chr5 (207-274)||(11341018-11341085)
chr5 (126-219)||(10831-10925)
chr5 (200-377)||(110990-111157)
chr5 (126-200)||(5452432-5452511)
chr5 (208-274)||(19498182-19498248)
chr5 (56-219)||(43445390-43445555)
chr5 (42-219)||(4201586-4201764)
chr5 (117-219)||(9732360-9732464)
chr5 (200-392)||(16534391-16534574)
chr5 (153-249)||(25211623-25211719)
chr5 (153-249)||(25275775-25275871)
chr5 (321-377)||(25424680-25424736)
chr5 (210-274)||(25944472-25944536)
chr5 (202-274)||(43445582-43445654)
chr5 (126-219)||(21075192-21075286)
chr5 (126-219)||(21933863-21933957)
chr5 (126-219)||(21940033-21940127)
chr5 (200-274)||(22368337-22368411)
chr5 (126-219)||(29192321-29192415)
chr5 (126-219)||(35580735-35580829)
chr5 (126-219)||(37010867-37010961)
chr5 (126-200)||(3672421-3672497)
chr5 (202-274)||(10780011-10780082)
chr5 (321-392)||(22368602-22368674)
chr5 (42-219)||(24594981-24595159)
chr5 (56-195)||(23327458-23327598)
chr5 (117-219)||(27008492-27008596)
chr5 (200-270)||(110888-110957)
chr5 (320-392)||(7726919-7726993)
chr5 (118-219)||(25902021-25902123)
chr5 (216-274)||(29192583-29192641)
chr5 (126-219)||(37051465-37051559)
chr5 (260-297)||(21653228-21653265)
chr5 (36-68)||(21649463-21649495)
[»] scaffold0011 (9 HSPs)
scaffold0011 (126-392)||(256560-256827)
scaffold0011 (142-222)||(125009-125089)
scaffold0011 (142-220)||(72028-72106)
scaffold0011 (142-220)||(76409-76487)
scaffold0011 (142-214)||(192985-193057)
scaffold0011 (262-392)||(72191-72317)
scaffold0011 (262-392)||(76572-76698)
scaffold0011 (263-392)||(125173-125298)
scaffold0011 (259-392)||(192768-192897)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (16-392)||(21961053-21961440)
chr4 (104-392)||(12837900-12838192)
chr4 (28-392)||(12901269-12901631)
chr4 (126-392)||(44345057-44345333)
chr4 (125-392)||(33738477-33738732)
chr4 (200-392)||(18166874-18167067)
chr4 (16-200)||(8873978-8874162)
chr4 (200-392)||(34393385-34393580)
chr4 (200-392)||(53909555-53909750)
chr4 (126-392)||(16366361-16366624)
chr4 (35-220)||(14899948-14900136)
chr4 (201-392)||(19699414-19699606)
chr4 (201-392)||(19709999-19710191)
chr4 (16-169)||(34197658-34197812)
chr4 (200-392)||(7134310-7134503)
chr4 (200-392)||(8372607-8372800)
chr4 (16-169)||(37958550-37958704)
chr4 (200-392)||(15274470-15274663)
chr4 (16-160)||(27959563-27959708)
chr4 (36-222)||(109957-110143)
chr4 (16-165)||(12245745-12245895)
chr4 (200-392)||(26678179-26678370)
chr4 (126-392)||(44054168-44054427)
chr4 (126-392)||(45460611-45460894)
chr4 (35-165)||(15852829-15852959)
chr4 (35-157)||(41167447-41167569)
chr4 (36-274)||(15211762-15212004)
chr4 (126-392)||(13244606-13244861)
chr4 (198-392)||(53706635-53706828)
chr4 (126-392)||(13811287-13811558)
chr4 (126-392)||(30236147-30236411)
chr4 (200-392)||(22356424-22356616)
chr4 (219-392)||(20813715-20813890)
chr4 (211-392)||(47355509-47355688)
chr4 (126-214)||(53909431-53909519)
chr4 (16-200)||(41257842-41258031)
chr4 (56-170)||(5372228-5372342)
chr4 (56-170)||(10238967-10239081)
chr4 (247-392)||(18294600-18294746)
chr4 (56-165)||(47469867-47469976)
chr4 (40-192)||(16521294-16521447)
chr4 (42-222)||(5684404-5684586)
chr4 (60-170)||(50223696-50223806)
chr4 (126-218)||(43283043-43283138)
chr4 (200-392)||(15211515-15211698)
chr4 (312-392)||(8874265-8874346)
chr4 (126-222)||(10642586-10642683)
chr4 (42-219)||(19999005-19999183)
chr4 (218-274)||(34393610-34393666)
chr4 (126-195)||(52267125-52267196)
chr4 (156-232)||(53706515-53706591)
chr4 (208-310)||(55378542-55378646)
chr4 (207-274)||(8372854-8372921)
chr4 (207-274)||(18167097-18167164)
chr4 (126-392)||(18496065-18496334)
chr4 (142-212)||(54119906-54119976)
chr4 (153-274)||(7134088-7134208)
chr4 (259-392)||(9293712-9293843)
chr4 (126-222)||(9293924-9294021)
chr4 (259-392)||(10642374-10642505)
chr4 (42-221)||(22356065-22356244)
chr4 (117-219)||(15138134-15138238)
chr4 (200-392)||(19998517-19998700)
chr4 (117-219)||(26678522-26678626)
chr4 (117-219)||(47355803-47355907)
chr4 (207-270)||(26678428-26678491)
chr4 (142-219)||(8372951-8373029)
chr4 (126-219)||(14994678-14994772)
chr4 (142-219)||(18167195-18167273)
chr4 (126-219)||(18246668-18246762)
chr4 (208-274)||(19998907-19998973)
chr4 (36-82)||(25120617-25120663)
chr4 (142-222)||(15274361-15274442)
chr4 (209-274)||(19998780-19998845)
chr4 (207-275)||(13751910-13751978)
chr4 (321-392)||(18246178-18246250)
chr4 (210-274)||(47355705-47355769)
chr4 (146-272)||(7848776-7848902)
chr4 (200-392)||(16520801-16520985)
chr4 (259-392)||(54120066-54120195)
chr4 (319-385)||(55378691-55378757)
chr4 (16-53)||(34393690-34393727)
chr4 (117-219)||(14950498-14950602)
chr4 (207-308)||(109828-109922)
chr4 (126-186)||(15043381-15043443)
chr4 (126-186)||(15110981-15111043)
chr4 (209-274)||(16521015-16521080)
chr4 (126-182)||(53706465-53706521)
chr4 (162-256)||(16521168-16521263)
chr4 (126-219)||(10487149-10487243)
chr4 (126-219)||(16329508-16329602)
chr4 (57-99)||(17213378-17213420)
chr4 (200-274)||(18246391-18246465)
chr4 (56-102)||(24237479-24237525)
chr4 (248-292)||(43283140-43283185)
chr4 (328-387)||(5684742-5684802)
chr4 (117-219)||(13049739-13049843)
chr4 (126-170)||(17377040-17377084)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (16-392)||(59865-60250)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (16-392)||(35053141-35053515)
chr1 (126-392)||(22407894-22408162)
chr1 (126-392)||(2422733-2422997)
chr1 (16-274)||(5676091-5676355)
chr1 (200-392)||(41217544-41217739)
chr1 (208-392)||(5676350-5676535)
chr1 (16-197)||(41217945-41218126)
chr1 (16-222)||(20444214-20444420)
chr1 (201-392)||(20252342-20252534)
chr1 (16-222)||(37845956-37846162)
chr1 (16-222)||(20529978-20530185)
chr1 (126-264)||(49966013-49966151)
chr1 (35-165)||(38035130-38035260)
chr1 (16-160)||(13378250-13378395)
chr1 (200-392)||(9786123-9786315)
chr1 (126-392)||(35524082-35524350)
chr1 (37-160)||(19601713-19601836)
chr1 (16-165)||(36357826-36357976)
chr1 (35-165)||(37235470-37235600)
chr1 (40-214)||(20929955-20930131)
chr1 (16-165)||(21193694-21193844)
chr1 (40-219)||(22226459-22226638)
chr1 (126-292)||(22836911-22837078)
chr1 (200-329)||(22250776-22250905)
chr1 (57-151)||(8539490-8539584)
chr1 (57-151)||(8604729-8604823)
chr1 (40-222)||(22352601-22352785)
chr1 (36-214)||(44036401-44036582)
chr1 (126-392)||(51657986-51658255)
chr1 (56-165)||(5769744-5769853)
chr1 (126-222)||(20895390-20895486)
chr1 (126-274)||(20956627-20956776)
chr1 (40-256)||(15862938-15863149)
chr1 (56-170)||(20821476-20821590)
chr1 (220-392)||(18505646-18505817)
chr1 (16-170)||(5471872-5472028)
chr1 (126-222)||(9785899-9785995)
chr1 (126-392)||(21716430-21716707)
chr1 (16-82)||(20526725-20526791)
chr1 (56-170)||(41213197-41213311)
chr1 (200-366)||(20895514-20895660)
chr1 (57-170)||(22144923-22145036)
chr1 (200-274)||(41217793-41217867)
chr1 (200-392)||(15863325-15863508)
chr1 (200-392)||(21857753-21857934)
chr1 (126-256)||(22250622-22250752)
chr1 (200-392)||(17146820-17147003)
chr1 (126-222)||(27673257-27673355)
chr1 (126-222)||(22365155-22365252)
chr1 (117-219)||(17147258-17147362)
chr1 (202-274)||(22352498-22352570)
chr1 (200-274)||(15863221-15863295)
chr1 (200-392)||(22352285-22352468)
chr1 (142-211)||(21857966-21858035)
chr1 (126-199)||(35935166-35935239)
chr1 (56-219)||(7642105-7642270)
chr1 (126-219)||(17003302-17003396)
chr1 (259-392)||(22364943-22365074)
chr1 (42-219)||(22034325-22034503)
chr1 (57-199)||(45050185-45050324)
chr1 (247-360)||(20589963-20590078)
chr1 (343-392)||(22080190-22080240)
chr1 (126-219)||(41392929-41393023)
chr1 (126-219)||(51451090-51451184)
chr1 (117-219)||(20826805-20826909)
chr1 (117-195)||(5073884-5073963)
chr1 (126-165)||(18505816-18505855)
chr1 (117-195)||(18602627-18602706)
chr1 (270-308)||(20444085-20444123)
chr1 (270-308)||(20529825-20529863)
chr1 (126-170)||(77632-77677)
chr1 (263-308)||(37846241-37846286)
chr1 (247-290)||(27673216-27673260)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (16-392)||(12488-12874)
[»] chr2 (94 HSPs)
chr2 (16-310)||(6877821-6878117)
chr2 (126-392)||(36892360-36892628)
chr2 (126-392)||(25877618-25877882)
chr2 (17-392)||(8886450-8886814)
chr2 (20-255)||(22861923-22862158)
chr2 (16-220)||(25600431-25600635)
chr2 (35-274)||(24088880-24089120)
chr2 (16-200)||(19434958-19435144)
chr2 (201-392)||(42180210-42180402)
chr2 (36-253)||(43644471-43644688)
chr2 (16-170)||(19658470-19658625)
chr2 (200-392)||(21276342-21276535)
chr2 (16-222)||(15631864-15632071)
chr2 (206-392)||(24966425-24966609)
chr2 (35-165)||(4795-4925)
chr2 (16-165)||(25304094-25304244)
chr2 (209-377)||(12638003-12638171)
chr2 (16-143)||(27260130-27260257)
chr2 (207-392)||(21140139-21140325)
chr2 (35-165)||(23823027-23823157)
chr2 (35-165)||(23824971-23825101)
chr2 (35-165)||(23832106-23832236)
chr2 (16-171)||(43641346-43641502)
chr2 (126-392)||(7319718-7319989)
chr2 (16-165)||(19670629-19670778)
chr2 (36-214)||(22282601-22282782)
chr2 (16-165)||(24296071-24296221)
chr2 (126-392)||(28972272-28972543)
chr2 (126-392)||(31832-32102)
chr2 (38-214)||(22273368-22273547)
chr2 (117-274)||(12643600-12643758)
chr2 (200-392)||(12643812-12644000)
chr2 (124-392)||(269422-269693)
chr2 (200-292)||(25600309-25600401)
chr2 (127-392)||(24573051-24573320)
chr2 (200-310)||(15631702-15631812)
chr2 (40-219)||(22692768-22692949)
chr2 (40-219)||(22697415-22697596)
chr2 (126-392)||(22581588-22581858)
chr2 (306-392)||(4450084-4450171)
chr2 (56-170)||(18534350-18534464)
chr2 (60-170)||(24272579-24272689)
chr2 (42-170)||(22137341-22137469)
chr2 (142-222)||(461139-461219)
chr2 (200-392)||(3801123-3801306)
chr2 (200-392)||(38706810-38706993)
chr2 (142-214)||(9654507-9654579)
chr2 (42-219)||(12637665-12637843)
chr2 (142-222)||(20629034-20629114)
chr2 (42-219)||(21140355-21140533)
chr2 (200-392)||(34822315-34822498)
chr2 (142-220)||(24966692-24966770)
chr2 (126-275)||(22691607-22691758)
chr2 (126-275)||(22696254-22696405)
chr2 (42-219)||(21276027-21276205)
chr2 (207-274)||(12637873-12637940)
chr2 (306-392)||(22691823-22691910)
chr2 (306-392)||(22696470-22696557)
chr2 (306-392)||(25600173-25600260)
chr2 (35-195)||(24687161-24687322)
chr2 (42-219)||(3800613-3800791)
chr2 (321-392)||(8941712-8941784)
chr2 (321-392)||(19888848-19888920)
chr2 (200-377)||(25210909-25211076)
chr2 (42-219)||(34822676-34822854)
chr2 (207-274)||(34822578-34822645)
chr2 (323-392)||(6877721-6877791)
chr2 (126-219)||(19888362-19888456)
chr2 (200-308)||(20629142-20629243)
chr2 (200-308)||(43644713-43644814)
chr2 (42-219)||(12726531-12726709)
chr2 (200-272)||(25211108-25211180)
chr2 (207-274)||(3800822-3800889)
chr2 (126-219)||(5889880-5889974)
chr2 (200-392)||(9654615-9654792)
chr2 (126-219)||(11232835-11232929)
chr2 (126-219)||(14908022-14908116)
chr2 (126-219)||(22514682-22514776)
chr2 (126-219)||(28777283-28777377)
chr2 (320-392)||(22654339-22654412)
chr2 (142-199)||(24828161-24828218)
chr2 (142-199)||(24832613-24832670)
chr2 (142-222)||(720835-720918)
chr2 (117-219)||(8942124-8942228)
chr2 (42-219)||(23773015-23773193)
chr2 (117-195)||(17398170-17398249)
chr2 (200-274)||(3800969-3801043)
chr2 (126-219)||(20013601-20013695)
chr2 (323-392)||(22273164-22273233)
chr2 (126-219)||(23818658-23818752)
chr2 (200-274)||(24089074-24089146)
chr2 (149-199)||(25211379-25211429)
chr2 (201-254)||(461007-461060)
chr2 (263-308)||(23806359-23806404)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (16-392)||(4425-4805)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (16-392)||(13964-14354)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (126-392)||(31038-31304)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (126-392)||(20860-21128)
scaffold0008 (125-392)||(28450-28719)
scaffold0008 (40-214)||(129700-129877)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (16-308)||(249025-249313)
[»] scaffold0447 (6 HSPs)
scaffold0447 (16-222)||(3095-3301)
scaffold0447 (200-274)||(2737-2811)
scaffold0447 (200-274)||(2865-2939)
scaffold0447 (200-267)||(2616-2683)
scaffold0447 (200-274)||(2993-3067)
scaffold0447 (306-392)||(2475-2561)
[»] scaffold0383 (7 HSPs)
scaffold0383 (16-222)||(5703-5909)
scaffold0383 (126-256)||(813-943)
scaffold0383 (200-267)||(5480-5547)
scaffold0383 (200-274)||(5601-5675)
scaffold0383 (200-392)||(328-511)
scaffold0383 (306-392)||(5339-5425)
scaffold0383 (200-274)||(641-715)
[»] scaffold0622 (3 HSPs)
scaffold0622 (16-274)||(7842-8108)
scaffold0622 (200-376)||(7453-7631)
scaffold0622 (200-277)||(7682-7759)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (125-392)||(7012-7287)
[»] scaffold0396 (4 HSPs)
scaffold0396 (16-220)||(13680-13884)
scaffold0396 (40-219)||(15922-16103)
scaffold0396 (200-293)||(13914-14007)
scaffold0396 (317-392)||(14078-14154)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (126-392)||(535-802)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (16-222)||(3129-3335)
scaffold0434 (200-392)||(2907-3101)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (16-274)||(3784-4044)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (126-392)||(1046-1307)
[»] scaffold0195 (8 HSPs)
scaffold0195 (16-275)||(19799-20067)
scaffold0195 (16-221)||(17776-17983)
scaffold0195 (16-169)||(8140-8293)
scaffold0195 (16-169)||(13529-13682)
scaffold0195 (200-392)||(17526-17716)
scaffold0195 (200-392)||(19556-19746)
scaffold0195 (320-392)||(8466-8539)
scaffold0195 (320-392)||(13855-13928)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (16-199)||(27067-27250)
scaffold0120 (312-377)||(26889-26954)
[»] scaffold0009 (5 HSPs)
scaffold0009 (208-392)||(236412-236597)
scaffold0009 (16-221)||(236652-236857)
scaffold0009 (36-274)||(270545-270785)
scaffold0009 (200-392)||(270329-270515)
scaffold0009 (76-120)||(255963-256007)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (200-392)||(27950-28145)
scaffold0116 (126-274)||(28179-28327)
scaffold0116 (200-274)||(28125-28199)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (16-255)||(56369-56615)
scaffold0051 (220-392)||(56206-56370)
[»] scaffold0269 (4 HSPs)
scaffold0269 (201-392)||(3055-3248)
scaffold0269 (200-392)||(281-477)
scaffold0269 (40-200)||(577-739)
scaffold0269 (126-214)||(3430-3518)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (201-392)||(30650-30843)
scaffold0049 (126-214)||(31002-31090)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (16-275)||(8493-8754)
scaffold0190 (337-392)||(8387-8443)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (200-392)||(13548-13740)
scaffold0359 (126-250)||(13434-13557)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (126-392)||(15006-15271)
scaffold0138 (201-392)||(26451-26642)
scaffold0138 (16-109)||(23915-24009)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (126-310)||(3707-3893)
scaffold0673 (306-392)||(3927-4014)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (200-392)||(4638-4831)
scaffold0483 (40-222)||(4250-4435)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (200-392)||(49478-49671)
scaffold0109 (40-222)||(49090-49275)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (126-285)||(26416-26575)
scaffold0037 (16-136)||(70883-71003)
scaffold0037 (132-392)||(66322-66592)
scaffold0037 (323-392)||(26590-26660)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (200-392)||(21633-21827)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (200-392)||(156183-156376)
scaffold0023 (200-392)||(85966-86149)
scaffold0023 (44-220)||(34811-34989)
scaffold0023 (207-274)||(156062-156129)
scaffold0023 (126-219)||(155937-156031)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (16-169)||(71768-71922)
scaffold0058 (320-392)||(72093-72166)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (209-392)||(2474-2658)
scaffold0342 (126-392)||(4078-4346)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (200-390)||(77600-77793)
scaffold0034 (142-200)||(77919-77977)
scaffold0034 (247-294)||(35999-36047)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (16-166)||(2112-2262)
scaffold0610 (320-392)||(2438-2511)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (209-392)||(14849-15032)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (16-165)||(106409-106559)
scaffold0022 (146-392)||(113902-114150)
scaffold0022 (40-219)||(6649-6830)
scaffold0022 (57-170)||(130409-130522)
scaffold0022 (40-219)||(58936-59117)
scaffold0022 (126-222)||(108058-108156)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (201-392)||(17735-17928)
scaffold0292 (126-222)||(18055-18151)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (206-392)||(499-683)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (200-377)||(29653-29830)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (55-232)||(68785-68964)
scaffold0031 (216-389)||(68597-68773)
scaffold0031 (16-63)||(69394-69441)
scaffold0031 (175-392)||(30314-30531)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (200-392)||(33395-33580)
scaffold0184 (36-214)||(32688-32869)
scaffold0184 (126-249)||(33725-33848)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (200-392)||(39264-39449)
scaffold0078 (36-214)||(39975-40156)
scaffold0078 (126-249)||(38996-39119)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (200-389)||(6984-7175)
scaffold0338 (126-210)||(7214-7298)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (16-165)||(4842-4991)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (243-392)||(23040-23190)
scaffold0158 (324-392)||(16376-16445)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (36-274)||(2627-2869)
scaffold0597 (200-392)||(2899-3083)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (142-392)||(19248-19489)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (202-361)||(94335-94495)
scaffold0044 (175-222)||(94695-94742)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (126-274)||(90600-90748)
scaffold0028 (35-144)||(78228-78337)
scaffold0028 (200-392)||(90802-91018)
scaffold0028 (58-219)||(128867-129026)
scaffold0028 (200-274)||(128730-128804)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (36-214)||(145016-145195)
scaffold0025 (36-214)||(147275-147454)
scaffold0025 (200-254)||(144926-144980)
scaffold0025 (200-254)||(147185-147239)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (16-165)||(7153-7303)
scaffold0095 (320-392)||(7416-7489)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (35-165)||(78342-78472)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (16-165)||(118094-118244)
scaffold0016 (126-210)||(163817-163901)
[»] scaffold0032 (5 HSPs)
scaffold0032 (38-220)||(54118-54300)
scaffold0032 (40-256)||(109582-109799)
scaffold0032 (200-274)||(109897-109971)
scaffold0032 (200-308)||(54011-54112)
scaffold0032 (201-254)||(110002-110055)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (36-214)||(197600-197778)
scaffold0004 (56-170)||(84942-85056)
scaffold0004 (56-170)||(26080-26194)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (123-392)||(1652-1925)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (200-335)||(16826-16961)
scaffold0315 (142-200)||(17070-17128)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (16-186)||(25101-25274)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (35-157)||(34006-34128)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (36-214)||(217246-217426)
scaffold0003 (208-392)||(5221-5396)
scaffold0003 (126-219)||(5661-5755)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (56-200)||(3244-3393)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (200-392)||(9930-10122)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (36-222)||(11532-11716)
scaffold0467 (259-308)||(11796-11845)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (40-219)||(4320-4501)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (126-385)||(6123-6386)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (43-214)||(5102-5274)
scaffold0266 (126-214)||(12788-12876)
[»] scaffold0346 (3 HSPs)
scaffold0346 (16-164)||(14101-14250)
scaffold0346 (200-276)||(15935-16011)
scaffold0346 (148-222)||(15833-15907)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (40-219)||(51511-51690)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (200-335)||(21158-21288)
scaffold0039 (126-222)||(20906-21002)
scaffold0039 (200-274)||(21030-21104)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (126-392)||(3125-3395)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (200-392)||(6410-6583)
scaffold0407 (126-222)||(6310-6406)
scaffold0407 (296-392)||(22-119)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (40-219)||(14779-14958)
scaffold0225 (40-219)||(28300-28479)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (35-170)||(211-346)
scaffold0786 (35-170)||(5266-5401)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (35-170)||(3799-3934)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (35-154)||(4568-4686)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (208-392)||(75550-75727)
scaffold0001 (126-197)||(72106-72177)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (36-160)||(1-126)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (211-334)||(25594-25718)
scaffold0134 (210-274)||(25735-25799)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (40-219)||(106479-106660)
scaffold0026 (200-392)||(27169-27352)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (126-291)||(31925-32093)
scaffold0103 (317-392)||(31776-31850)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (40-221)||(1292-1469)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (40-219)||(35-215)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (126-214)||(40010-40098)
scaffold0106 (321-392)||(37627-37697)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (56-160)||(55922-56026)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (204-365)||(44288-44443)
scaffold0066 (219-365)||(52457-52597)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (36-214)||(41190-41371)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (40-219)||(9426-9607)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (146-274)||(145283-145413)
scaffold0014 (320-392)||(144987-145060)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (40-214)||(7465-7641)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (270-365)||(12989-13085)
scaffold0130 (321-392)||(31120-31192)
scaffold0130 (216-274)||(31333-31391)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (142-220)||(1509-1587)
scaffold1140 (259-392)||(1298-1427)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (36-102)||(52771-52837)
scaffold0018 (36-102)||(56723-56789)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (200-392)||(804-987)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (127-219)||(1-94)
scaffold0384 (200-392)||(264-448)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (321-392)||(15167-15239)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (142-214)||(6826-6898)
scaffold0218 (200-392)||(6934-7115)
[»] scaffold0450 (2 HSPs)
scaffold0450 (306-392)||(4639-4725)
scaffold0450 (207-275)||(4528-4596)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (42-195)||(29855-30009)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (35-219)||(17586-17771)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (126-219)||(37768-37862)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (56-102)||(4532-4578)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (126-275)||(2839-2989)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (126-275)||(26542-26692)
scaffold0124 (126-219)||(3160-3254)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (76-120)||(12285-12329)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (126-219)||(25382-25476)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (351-392)||(7299-7341)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (145-218)||(7049-7125)


Alignment Details
Target: scaffold0240 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6221 - 5845
Alignment:
Q  17 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6221 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgtt 6122  T
Q  117 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgat 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6121 gcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattgat 6022  T
Q  217 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6021 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttaatgtaactatatgtatga 5922  T
Q  317 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  5921 gaatgttattattgatcaaatacatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 5845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 138296 - 138673
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  138296 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgt 138395  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  138396 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 138495  T
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatg 315  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  138496 tgattgtgtataaataattttgaattgatatttgttcatgaaacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtataagtatg 138595  T
Q  316 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  138596 aaaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgatgatgt 138673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 76853 - 76589
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  76853 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgca 76754  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||    
T  76753 tgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatatgaatattat 76654  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  76653 ta---atcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 76589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10148 - 10003
Alignment:
Q  146 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattg 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  10148 tggtaccacatgcatgtatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattgctgaaatgtgaatgatgattgtgtatgaataaatgtgatttg 10050  T
Q  243 atatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagata 288  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10049 atgattgttcatggcacatgtgattgatgattaattgatgtgagata 10003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 26071753 - 26072131
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26071753 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 26071852  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26071853 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 26071952  T
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26071953 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 26072052  T
Q  315 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26072053 gagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 26095540 - 26095918
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26095540 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 26095639  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26095640 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 26095739  T
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26095740 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 26095839  T
Q  315 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26095840 gagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26095918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3893772 - 3893381
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3893772 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 3893673  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  3893672 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 3893573  T
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaag- 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||     
T  3893572 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggttttgatgtaagt 3893473  T
Q  306 -----tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
         ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3893472 atatatatatttatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 3893381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12753558 - 12753172
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12753558 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttaaatacgatgtttttgt 12753459  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc---ttattgatatat----- 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   || |||| || |         
T  12753458 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttttgaaatgtgattg 12753359  T
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg-gggtttgatgtaag 305  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||   ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||| ||||    
T  12753358 gtgattggtgactgtgtatgaataactgcaaattgatgatttttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagaatgtgatataag 12753259  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12753258 tat-tatttgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgt 12753172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 127 - 392
Target Start/End: Original strand, 15824105 - 15824371
Alignment:
Q  127 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  15824105 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgtttggtgattatgtat 15824204  T
Q  227 gaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 326  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15824205 gaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 15824304  T
Q  327 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15824305 attgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 15824371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44863711 - 44863443
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44863711 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgta 44863612  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44863611 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgcgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtataagtatgagaatatta 44863512  T
Q  325 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  44863511 ttattgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 44863443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 142136 - 141869
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  142136 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggttattgtgta 142037  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142036 tgaataattgtgaattgatattcgttcatgacacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 141937  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  141936 tattgatcaagtgcatgatgattaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 141869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47288244 - 47287976
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  47288244 gtgacaaccttgggatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtaattggtgattgtgta 47288145  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47288144 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggtttttgatgtaagtatatgtacgagaatatta 47288045  T
Q  325 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47288044 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 47287976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 112784 - 113168
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  112784 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaaggattgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 112883  T
Q  116 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-------tgatat 205  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||       ||  ||    
T  112884 tgcatcgaaggtgacgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgttaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgat 112983  T
Q  206 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 305  Q
      ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  112984 tggtgattgataattgcgtatgaataaatgtgaattgttgtttgttcatgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattgagttttgatgtaag 113083  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||   |||| |   | || |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  113084 tattgatatgtg---actactattgatcaagtgcataatgtttattttgaaatattcatgctaaatgttatttggattatgatgatgt 113168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 290
Target Start/End: Original strand, 45453745 - 45454016
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||    
T  45453745 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacga---ttttgt 45453841  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||     
T  45453842 tgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaat-tgtgattgg 45453940  T
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatatt 290  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45453941 tgattgtgtatgaatagctgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatatt 45454016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 292
Target Start/End: Original strand, 1938257 - 1938532
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||      
T  1938257 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagagttgaactcttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttta 1938356  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    | |||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||     
T  1938357 t-catcaaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaacgtgattgg 1938455  T
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg 292  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1938456 tgattacgtatgcataattgtgtattgatatttgtccatgacacatgtgattggtggttattgatgtgagatattgg 1938532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 7286328 - 7286522
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  7286328 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttg 7286427  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  7286428 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgttgattatgatgatgt 7286522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 12545607 - 12545802
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||    
T  12545607 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattgttgatgtgagatattggggttttt 12545706  T
Q  298 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  12545707 gatgtaagtatatgtataagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgtaatgtggactatgatgatgt 12545802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 18305642 - 18305831
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18305642 gatatatgtgattgacgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttggt 18305741  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18305742 gtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18305831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 13867887 - 13868080
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tga 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||    
T  13867887 gatatatgtgattggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattgagattatga 13867986  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13867987 tataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 13868080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7291102 - 7290908
Alignment:
Q  199 ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttg 298  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7291102 ttgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttg 7291003  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7291002 atgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 7290908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 15913921 - 15914075
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15913921 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 15914020  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15914021 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 15914075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 2192606 - 2192799
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2192606 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 2192705  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  2192706 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatttggattatgataatgt 2192799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 369336 - 369143
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  369336 tgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattggtgatgattgatgtgagatattggggtttga 369237  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  369236 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 369143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 14253071 - 14253263
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14253071 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgt-catgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattggggtttga 14253169  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14253170 tgtaagtattgatttgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 14253263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 16480836 - 16481029
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16480836 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 16480935  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  16480936 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcatgtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 16481029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 15952859 - 15953050
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15952859 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttga 15952958  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  15952959 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgt 15953050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Original strand, 9058141 - 9058311
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9058141 ttgtagctttaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 9058240  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9058241 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 9058311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 49049452 - 49049723
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||    
T  49049452 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattgatgaaatgtgaatgattagtgt 49049551  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||| | ||    
T  49049552 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatg--gtatgaatatatatgtggat 49049649  T
Q  321 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49049650 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 49049723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13388643 - 13388493
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13388643 catcatagtcatgttgagtcttatagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaatacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttctg 13388544  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13388543 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 13388493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 220
Target Start/End: Original strand, 15761867 - 15762051
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  15761867 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 15761965  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  15761966 tttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 15762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Original strand, 32496053 - 32496242
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  32496053 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaacgcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 32496152  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32496153 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 32496242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13376324 - 13376200
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13376324 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgg-tgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgag 13376226  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13376225 gtgattcggtaccatatgcatttatg 13376200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15629255 - 15629004
Alignment:
Q  146 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattg 242  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  15629255 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtgcatgaataaatgtgagttg 15629156  T
Q  243 atatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattatta-ttgatcaagtac 339  Q
    ||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||  | ||||||| | ||||| ||||||    
T  15629155 atgattgttcataacacatctgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatg--gtatgaatatatatatggatattatgatttgattaagtac 15629058  T
Q  340 atgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15629057 atgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 15629004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Original strand, 20587140 - 20587254
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587140 actcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 20587239  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20587240 tgcatatatgtgtcg 20587254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 13867688 - 13867784
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13867688 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgt 13867784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13273246 - 13272976
Alignment:
Q  127 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 223  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  13273246 tgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtg 13273147  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 321  Q
     ||| |||| ||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||  ||| | || | |||| | |||    
T  13273146 catggataaatgtgatttgatgattgttccagacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatatcgggattatg--gtatgaatgtatatgtggata 13273049  T
Q  322 ttatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||    
T  13273048 ttattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcttgtcaactgttatgtgaattatgatgatgt 13272976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 8565108 - 8565212
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8565108 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttattgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 8565207  T
Q  156 tgcat 160  Q
    |||||    
T  8565208 tgcat 8565212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 377
Target Start/End: Original strand, 15762262 - 15762429
Alignment:
Q  204 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 302  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15762262 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 15762354  T
Q  303 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15762355 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 15762429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Original strand, 18255324 - 18255505
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  18255324 gttgtaaaagggctaagcgcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 18255422  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18255423 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18255505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3058713 - 3058585
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  3058713 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatataaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 3058615  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3058614 tttggagatttggtaccacatgcatttatg 3058585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 165
Target Start/End: Original strand, 9322594 - 9322703
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9322594 actcttttacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccaca 9322693  T
Q  156 tgcatgtatg 165  Q
    ||||| ||||    
T  9322694 tgcatatatg 9322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11285715 - 11285619
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11285715 gtgacgaccttgagttaatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattaatgattgt 11285619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28719091 - 28718977
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28719091 actcgtttacttcggtgataatgtaagacaggtgtgaaatcttacatgtgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgacttggtaccaca 28718992  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  28718991 tgcatatatgtgtcg 28718977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 11582535 - 11582631
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11582535 gtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 11582631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 256
Target Start/End: Original strand, 15952673 - 15952813
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  15952673 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagacttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgattgg 15952772  T
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 256  Q
     ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15952773 agattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 15952813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 293
Target Start/End: Original strand, 16571751 - 16571921
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 223  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| | |||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  16571751 gtgatgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 16571850  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 293  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16571851 tatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16571921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16593911 - 16593741
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 223  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| | |||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  16593911 gtgatgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 16593812  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 293  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16593811 tatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16593741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 125492 - 125378
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  125492 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtaaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 125393  T
Q  135 ttgaggtgatttggt 149  Q
    ||  || ||||||||    
T  125392 ttttggagatttggt 125378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 392
Target Start/End: Original strand, 16571983 - 16572053
Alignment:
Q  323 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16571983 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 16572053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16593679 - 16593609
Alignment:
Q  323 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16593679 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 16593609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2027222 - 2027097
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||| | |||||||||    
T  2027222 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagtcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcggaggtgacgacc 2027123  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 160  Q
    ||   | |||||||||||||||||||    
T  2027122 ttttcgagatttggtaccacatgcat 2027097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 222
Target Start/End: Original strand, 13038808 - 13038905
Alignment:
Q  125 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13038808 agtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagttttattgatatatgtgattggtgattgt 13038905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2024858 - 2024757
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatg----tgattggtgattattgatgtaagatattggggt 295  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2024858 tgatgtatatgattgatgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattgattggtgattattgatgtgagatattgcggt 2024759  T
Q  296 tt 297  Q
    ||    
T  2024758 tt 2024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 292
Target Start/End: Original strand, 10862515 - 10862683
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10862515 gtgacgaccttgaagtgatttgctactgcatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacataagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 10862614  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgg 292  Q
      ||| |||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  10862615 tcatg-ataaatgtg-gttgatgattgttcatgacacatgtgattggtggttacttaatgtaagatattgg 10862683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Original strand, 12249771 - 12249908
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 223  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||  ||| ||||    
T  12249771 gtgacgactttgaagtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatttcgaaatgtgattagtgaatgtg 12249870  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacat 261  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||    
T  12249871 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacat 12249908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 12545404 - 12545501
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgattt-ggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  12545404 gtgacgaccttgaggtgattttggtaccacatgcatatatgtgtcaattggtgcatatcatgacataagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 12545501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 12545553 - 12545627
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12545553 tgatatatgggattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtgattggtgatt 12545627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36051147 - 36051075
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051147 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataacataacatgagtcttattgatatatgtgattg 36051075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 369471 - 369364
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  369471 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattg 369372  T
Q  215 atgattgt 222  Q
     |||||||    
T  369371 gtgattgt 369364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10988271 - 10988092
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  10988271 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 10988174  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  10988173 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 10988092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 123059 - 122987
Alignment:
Q  143 atttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  123059 atttggcaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 122987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16210263 - 16210183
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  16210263 gatttggtaccacgtgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgatttgtgattgt 16210183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 26010695 - 26010874
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaa-gtgacgaccttgag 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||||||||      
T  26010695 tgtaaaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26010793  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  26010794 gagatttggcaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 26010874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Original strand, 18305492 - 18305546
Alignment:
Q  175 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  18305492 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgtttatgaa 18305546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2024757 - 2024692
Alignment:
Q  328 ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2024757 ttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 2024692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 219
Target Start/End: Original strand, 2192376 - 2192453
Alignment:
Q  143 atttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  2192376 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 2192453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 15518435 - 15518539
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15518435 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 15518534  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  15518535 gtgat 15518539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16416684 - 16416509
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 307  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  16416684 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 16416592  T
Q  308 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  16416591 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 16416509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 16480710 - 16480782
Alignment:
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16480710 atatttgtgattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 16480782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 392
Target Start/End: Original strand, 45455505 - 45455581
Alignment:
Q  317 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45455505 gaatatcattattgatcaagtatatgatttttgaattaaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 45455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2436285 - 2436110
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||| ||||| |||  | |||| || |||||||||||       
T  2436285 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgtgatgtgttttat-catcaaaggtgacgaccttttt 2436191  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  2436190 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 2436110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2024998 - 2024904
Alignment:
Q  162 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 256  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2024998 tatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2024904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 4483364 - 4483318
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 102  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4483364 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 4483318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7291335 - 7291277
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7291335 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 7291277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7821500 - 7821406
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7821500 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7821406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7828811 - 7828717
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7828811 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16417043 - 16416949
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  16417043 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 16416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Original strand, 16480605 - 16480683
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  16480605 gatttggtaccacatgcatttatgtatcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 16480683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 27103134 - 27103228
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27103134 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27103228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 27110482 - 27110576
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27110482 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27110576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27175192 - 27175098
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27175192 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27175098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 38785226 - 38785320
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  38785226 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 38785320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 2192480 - 2192552
Alignment:
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2192480 atatttgttattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 2192552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4483320 - 4483268
Alignment:
Q  118 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4483320 catcgaaggtgacgaccttgacgtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 4483268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 11582659 - 11582840
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||       |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  11582659 tgataaatgtggttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtccatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtga 11582751  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||| ||     ||||||||| ||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11582752 tgtaagtattaatgtgtg-----attattattaatcaaatgcatgatgtt--aattgaactattcatgataactgttatttggattatgataatgt 11582840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13757225 - 13757060
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 153  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  13757225 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 13757127  T
Q  154 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  13757126 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 13757060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3055241 - 3055193
Alignment:
Q  175 gtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  3055241 gtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 3055193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 25293856 - 25293960
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  25293856 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 25293955  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  25293956 gtgat 25293960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 122951 - 122854
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  122951 tgataaatgtaattggtgattgtgaattaatagttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtga 122859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11514698 - 11514604
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  11514698 gtgacgaccttgtagagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 11514604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 392
Target Start/End: Original strand, 13038989 - 13039114
Alignment:
Q  263 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattat 360  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     |||||||| |||||| | |||||||||   |||||| |||    
T  13038989 tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattatggatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 13039081  T
Q  361 tcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13039082 tcatgataactgttatttggattatgttgatgt 13039114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 15443146 - 15443240
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  15443146 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 15443240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Original strand, 30263727 - 30263805
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  30263727 gatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 30263805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Original strand, 42057741 - 42057819
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagt 194  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  42057741 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagt 42057819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 121
Target Start/End: Original strand, 3193586 - 3193630
Alignment:
Q  76 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  3193586 atgtaagacgggtgtgaaatgttacat-tgatgtttttgttgcatc 3193630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16210045 - 16209975
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16210045 attattattgatcaaatgcatgatgttaata--gaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 16209975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19066262 - 19066193
Alignment:
Q  43 gtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttt 112  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  19066262 gtaaaaggggtgtgctcttttacttcggcgaaaatgtaagacggacgtgaaatcttacataggatgtttt 19066193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 13460958 - 13460914
Alignment:
Q  77 tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 121  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13460958 tgtaatacgggagtgaaatcttacatttgatgtttttgttgcatc 13460914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Original strand, 13912691 - 13912791
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| |||  || |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  13912691 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccgtaagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 13912790  T
Q  215 a 215  Q
    |    
T  13912791 a 13912791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 91)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31627117 - 31626739
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31627117 catcatagtcgtgttgagaatgtagtcgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgt 31627018  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31627017 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 31626918  T
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31626917 tgattgtgtatgaataattgtgaattaatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 31626818  T
Q  315 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31626817 gagaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattaagatgatgt 31626739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18775886 - 18775506
Alignment:
Q  20 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  18775886 atagttgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtctttgttgta 18775787  T
Q  120 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-------gtgat 212  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||   | ||       |||||    
T  18775786 tcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacataagtcttatttgaaaatgtgaatggtgat 18775687  T
Q  213 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgt 312  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18775686 tggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatttttgtttatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattttt 18775587  T
Q  313 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18775586 ttttgaattttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 18775506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22428850 - 22428473
Alignment:
Q  20 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22428850 atagtcgtgttgagtttgtagttgtaaaagggttcaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcgtacatacgatgtttttgttgca 22428751  T
Q  120 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||| ||||    
T  22428750 tcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgat 22428651  T
Q  220 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtat--atgtatg 315  Q
    ||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||  || |||     
T  22428650 tgtgtatgaataactatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgatgtaagtattgatatatt 22428551  T
Q  316 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22428550 tgagtattattgttgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 22428473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16105237 - 16104850
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16105237 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 16105138  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||   || || |         
T  16105137 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggttatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtacatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgatta 16105038  T
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt-ggggtttgatgtaag 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16105037 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgataggtgattaattgatgtgagatattgggggtatgatgtaag 16104938  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16104937 tattgttatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttataacgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16104850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 25646518 - 25646786
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  25646518 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatttgattggtgattgtgtg 25646617  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 324  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25646618 tgaatagttgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaaatattggggttttgatgtaagtatatgtatgtgaatatta 25646717  T
Q  325 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25646718 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgt 25646786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 392
Target Start/End: Original strand, 25745792 - 25746160
Alignment:
Q  20 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25745792 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgca 25745891  T
Q  120 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----gtgat 212  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||  || || |     |||||    
T  25745892 tcgagggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataactgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgat 25745991  T
Q  213 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatg 311  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||  ||              
T  25745992 tggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacacgtgattggggatttattaatgtgagatattggggttt--tg---------- 25746079  T
Q  312 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25746080 -atgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 25746160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 35017451 - 35017645
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35017451 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttg 35017550  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35017551 atgtaagtatatctatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgatatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35017645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 35011124 - 35011316
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35011124 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgat 35011223  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35011224 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35011316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18128532 - 18128340
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18128532 tgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatatgattggagattattgatgtgagatattggggtttga 18128433  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18128432 tgtaagtatatgtatgggaatgtaattattgatcaagtgcatgatgtttaga-tgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18128340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18579027 - 18578834
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18579027 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttga 18578928  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18578927 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcatatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatcatgt 18578834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 13622937 - 13623121
Alignment:
Q  206 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13622937 atgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaag 13623036  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13623037 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 13623121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16084095 - 16083970
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16084095 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 16083996  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16083995 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggt 16083970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19627690 - 19627498
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19627690 gatatatatgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19627591  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19627590 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataataatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19627498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Original strand, 14628368 - 14628545
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14628368 tgatacatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 14628467  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    |||||||||   | || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  14628468 tgtaagtattgatgtgggaatattattaatgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatt 14628545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 18004857 - 18005050
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18004857 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 18004956  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  18004957 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatgttcatgttaactattatttggattatgataatgt 18005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18128964 - 18128776
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  18128964 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcgaagattatgtaagacaggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagt 18128865  T
Q  116 tgc-----atcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
     ||     |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18128864 ggcatcgaatcgaaggtgacgaactggaggtgatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 18128776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23975902 - 23975708
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23975902 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 23975803  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  ||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  23975802 tgtaagtattgatgtggga-aattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 23975708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 18843708 - 18843900
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18843708 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttg 18843807  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18843808 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattaaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18843900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 13016436 - 13016702
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgat--atgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||| |  || | || |||||| |||||||||||| |||  | |||||  | |||||||    
T  13016436 gtgacgaccttgagatgatatggtaccacatgcatatttgtgtcggtctatatacacatcatg-catgagtcttatcgattgaatgtgacaggtgattgt 13016534  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatat 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||    
T  13016535 gtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatattttttagaatat 13016633  T
Q  323 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||| | | ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  13016634 tattattgatcaaatgcttgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgtatttggattatgatgatgt 13016702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Original strand, 19984699 - 19984887
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  19984699 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 19984798  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19984799 ttttggatatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19984887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Original strand, 33316422 - 33316582
Alignment:
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33316422 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 33316521  T
Q  309 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaa 369  Q
       | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  33316522 tgatgtgggaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaa 33316582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 18383173 - 18383323
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18383173 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggtttagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttg 18383272  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18383273 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 18383323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1554508 - 1554324
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  1554508 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 1554410  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  1554409 tttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 1554324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18422303 - 18422182
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18422303 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgta 18422204  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatt 247  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18422203 tgaataattgtgaattgatatt 18422182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33323492 - 33323342
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33323492 catcatagtcatgttgagttttgcaattgtaaaagggttgagcttttttactacggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 33323393  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  33323392 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccaaatgcatttatg 33323342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23151939 - 23151845
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23151939 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtt 23151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16239028 - 16238848
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttga- 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||       
T  16239028 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttt 16238930  T
Q  139 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16238929 ggagattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 16238848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 17790652 - 17790776
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  17790652 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttatatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacc 17790750  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 160  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||    
T  17790751 tagaggtgattcggtaccacatgcat 17790776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 260 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23151839 - 23151706
Alignment:
Q  260 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  23151839 atgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaaata 23151740  T
Q  360 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23151739 tccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 23151706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 175 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32896492 - 32896282
Alignment:
Q  175 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-t 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32896492 gtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatt 32896393  T
Q  274 tattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattg 372  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||          |||||  ||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||    
T  32896392 tattgatatgagttattggggttatgatgtaagtat----------atatttatatcgatcaagtacataatgtttgaattaaattattcatggtaactg 32896303  T
Q  373 tta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  32896302 ttatttggattatgatgatgt 32896282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 159
Target Start/End: Original strand, 16889236 - 16889379
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  16889236 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagcgattttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tgttg 16889334  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 159  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16889335 atgcatcgaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgca 16889379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 326
Target Start/End: Original strand, 18825647 - 18825774
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 298  Q
    |||| ||| |||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18825647 tgatgtatatgattggtgattgttcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 18825746  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattatt 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18825747 atgtaagtatatatatgagaatattatt 18825774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34965584 - 34965470
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965584 actcttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 34965485  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  34965484 tgcatatatgtgtcg 34965470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 141
Target Start/End: Original strand, 35137439 - 35137565
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35137439 catcatagtcatgttgagttttgcagttgtaaaagggttgagctcttttactacgaagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 35137538  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 141  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35137539 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggt 35137565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 293
Target Start/End: Original strand, 25369014 - 25369184
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  25369014 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 25369113  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggg 293  Q
    | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25369114 gcatgaataaatgtg-attgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattacttaatgtaagatattggg 25369184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22846767 - 22846615
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat----gcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtacc 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  22846767 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatcgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgcggtgatttggtact 22846668  T
Q  153 acatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 200  Q
    |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22846667 acatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 22846615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11214803 - 11214623
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttga- 138  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||       
T  11214803 gttgtaaaatggttgagctcttttacttcggagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttt 11214705  T
Q  139 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11214704 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattgatgat 11214623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18397434 - 18397163
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatg--tgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | || | |   | || |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  18397434 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatataagtgccggtctagatacacatcatg-catgagtcttattggtgatttgtgattgatgatttt 18397336  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | |||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||| | |  |||| || |||||| |||| ||||    
T  18397335 gcatgaataaatgtgattggatacttgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagttgttgagatcgtgatatatgtatatatatgtgaat 18397236  T
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18397235 attattattgaccaagtacacgaagtttaaattgaaatattcatgttaaacgttatgtggattatgatgatgt 18397163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1554113 - 1553946
Alignment:
Q  204 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 302  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1554113 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 1554021  T
Q  303 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  1554020 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 1553946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16134918 - 16134814
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16134918 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgaagaccttgaggtgatttggtaccaca 16134819  T
Q  156 tgcat 160  Q
    |||||    
T  16134818 tgcat 16134814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4989561 - 4989379
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||    
T  4989561 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttg 4989464  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattg 221  Q
      | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  4989463 ttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattg 4989379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 35017303 - 35017387
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35017303 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 35017387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19852909 - 19852795
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19852909 actcttttatttcgatgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 19852810  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19852809 tgcatatatgtgtcg 19852795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 392
Target Start/End: Original strand, 16827873 - 16828003
Alignment:
Q  263 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattc 362  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  16827873 tgattgatgattattgatgtgagataatggggtttgatgtaagtattgacgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcc 16827972  T
Q  363 atgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    || |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16827973 atattaactgttatttggattatgataatgt 16828003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18740935 - 18740863
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18740935 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 18740863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Original strand, 1659212 - 1659387
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  1659212 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 1659306  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1659307 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaaatatgtgattggtgat 1659387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Original strand, 13622800 - 13622878
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13622800 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 13622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23220336 - 23220222
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23220336 actcttttacttcagtgataatataagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatggataacgaccttgaggtgatttggtaccaca 23220237  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23220236 tgcatatatgtgtcg 23220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 14628111 - 14628289
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  14628111 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 14628208  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  14628209 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 14628289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23976231 - 23976053
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  23976231 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23976134  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23976133 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23976053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26088497 - 26088319
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  26088497 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26088400  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26088399 gagatttggtaccacatgcatttatgcgtccataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 26088319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Original strand, 33316158 - 33316260
Alignment:
Q  118 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgat 216  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  33316158 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 33316257  T
Q  217 gat 219  Q
    |||    
T  33316258 gat 33316260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17787827 - 17787746
Alignment:
Q  312 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  17787827 tatgataatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattattattttgattatgatgatgt 17787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23976023 - 23975956
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23976023 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 23975956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 16827462 - 16827559
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  16827462 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcttgacatgagtcttaaatgatgtatgtgatttatgattgt 16827559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 18004635 - 18004732
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  18004635 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgagaaatgtgattggtgattgt 18004732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 199
Target Start/End: Original strand, 1651466 - 1651605
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  1651466 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 1651560  T
Q  155 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1651561 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 1651605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 14628316 - 14628388
Alignment:
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14628316 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 14628388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25173590 - 25173518
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25173590 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25173518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 16650745 - 16650899
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16650745 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16650843  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16650844 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16650899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 221
Target Start/End: Original strand, 18825420 - 18825515
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 221  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  18825420 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18825515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4989171 - 4989004
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  4989171 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 4989079  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    |||||||||  |||| |     |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  4989078 tgtaagtattaatgtgt-----tattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttatttgttatt 4989004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15738757 - 15738590
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||| |  ||| | | |||||||| ||||||||    
T  15738757 gtgacgacgttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatgatgacatgagtttatttggtgaaatgtgattaatgattgt 15738658  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 291  Q
      ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||  || |||||||||||||    
T  15738657 tcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacgtgtgaacggtgattgtttaatgtaagatattg 15738590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16238765 - 16238711
Alignment:
Q  206 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacaca 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16238765 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacaca 16238711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18740828 - 18740645
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || || ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||    
T  18740828 tgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttttgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatatctggatgtga 18740736  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18740735 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattcaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18740645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25174134 - 25174040
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  25174134 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 25174040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 27655670 - 27655764
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27655670 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 27655764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15861375 - 15861243
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  15861375 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 15861281  T
Q  157 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagt 194  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15861280 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 15861243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 230
Target Start/End: Original strand, 28196439 - 28196546
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  28196439 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatataagtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattat 28196538  T
Q  223 gtatgaat 230  Q
    | ||||||    
T  28196539 gcatgaat 28196546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 16557515 - 16557669
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16557515 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16557613  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    | ||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16557614 gagatttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16557669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 221
Target Start/End: Original strand, 18843481 - 18843576
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 221  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  18843481 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgcgtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18843576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4989275 - 4989201
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  4989275 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttattcatgatacatgtaattggtgatt 4989201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10487458 - 10487364
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10487458 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 10487364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 16377869 - 16377963
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16377869 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16377963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 16385193 - 16385287
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16385193 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16385287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18422185 - 18422115
Alignment:
Q  323 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  18422185 tattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 18422115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 270
Target Start/End: Original strand, 33316292 - 33316353
Alignment:
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  33316292 tgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgtttctgatacatgtgattggt 33316353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 29870975 - 29871153
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  29870975 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 29871072  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  29871073 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 29871153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 270
Target Start/End: Original strand, 16827663 - 16827733
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 270  Q
    |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16827663 tgatttatatgattggtgattatgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggt 16827733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Original strand, 17343864 - 17343942
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17343864 gattcggtaccacatgcatttacgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatataagtgattggtgat 17343942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16374999 - 16374954
Alignment:
Q  76 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  16374999 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttacatc 16374954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16230169 - 16230065
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  16230169 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 16230070  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  16230069 gtgat 16230065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23993749 - 23993645
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  23993749 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 23993650  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  23993649 gtgat 23993645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 18004770 - 18004827
Alignment:
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18004770 tgattgtgaatgaatagttgtgaattgatatt-gttcctgatacatgtgattggtgatt 18004827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 19984915 - 19985096
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||     ||||  |||| |||  |||||||| |||||||| ||| |||    
T  19984915 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaatcgataattgttca-----catg--attgatgacgattgatgtgagatattgaggtgtga 19985007  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    | |||||||  |||| |||     |||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19985008 tataagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 19985096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Original strand, 22227278 - 22227356
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22227278 gattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22227356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25173805 - 25173731
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  25173805 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 25173731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Original strand, 18835474 - 18835544
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18835474 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18835544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21930462 - 21930417
Alignment:
Q  126 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21930462 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 21930417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 121
Target Start/End: Original strand, 31162441 - 31162486
Alignment:
Q  76 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 121  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31162441 atgtaagacggatgtcaaatcttacatatgatgtttttgttgcatc 31162486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32896538 - 32896494
Alignment:
Q  154 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta 198  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32896538 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta 32896494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 99)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37605668 - 37605283
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  37605668 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgt 37605569  T
Q  116 tgcatcgaaagtgac-gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||    
T  37605568 tgcatcgaaggtgacagaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattg 37605469  T
Q  215 a-------tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 307  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37605468 atgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgaaatattggggtttgatgtaagta 37605369  T
Q  308 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  37605368 tatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttagattatgatgatgt 37605283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 50 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41244277 - 41243948
Alignment:
Q  50 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41244277 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggt 41244178  T
Q  150 accacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 249  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |              ||||||||||||||||||    
T  41244177 accacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgaatcttattgatatatgtgattgagg--------------attgtgtattgatatttg 41244092  T
Q  250 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41244091 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttta 41243992  T
Q  350 tattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41243991 aattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgt 41243948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25121012 - 25120745
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25121012 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttgataattgtgta 25120913  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120912 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatttatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 25120813  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25120812 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgt 25120745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 19994802 - 19995078
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  19994802 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgtg 19994901  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatg--------taagtatatgtatga 316  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||        ||  ||||| |||||    
T  19994902 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagttattggggttttgatgtatatatatatatatatatatga 19995001  T
Q  317 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  19995002 gaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactattattttgattatgatgatgt 19995078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20480166 - 20479893
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||     
T  20480166 gtgacgacattgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgctcggtgattatgtg 20480067  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagata-ttggggtttgatgtaagta------tatgtatgaga 318  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||      ||| |||||||    
T  20480066 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatatttgggttttgatgtaagtatatatgtatatatgaga 20479967  T
Q  319 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20479966 atatcatt-ttgatcaaatgcatgatgtttatattgaactatccatgttaagtgttattttgattatgatgatgt 20479893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16416810 - 16416537
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||     
T  16416810 gtgatgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattcatatatgtgttcggtgattgtgtg 16416711  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgaga 318  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||      ||| |||  ||    
T  16416710 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattattgattattgatgtgagatattggggttttgatgtgagtatatatgtatatatttga 16416611  T
Q  319 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  16416610 atatcattattgatcaa-tgtatgatgtttatattgaactatccatgttaattattattttgattatgatgatgt 16416537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18610620 - 18610428
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18610620 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 18610521  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18610520 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 18610428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 41508927 - 41509122
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41508927 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgagtggtgattattgatgtgagatattggggttttt 41509026  T
Q  298 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41509027 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcctgatgtttgaattgaaatatccatattaactgttatttggattatgatgatgt 41509122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 308
Target Start/End: Original strand, 16203832 - 16204098
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||   ||| | ||||||| |||||||||    
T  16203832 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgaattgatccatcgaaggtgacgacc 16203931  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataatt 234  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  16203932 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatattt 16204031  T
Q  235 gtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    ||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  16204032 gtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgtgagatattggagtgtgatgcaagtat 16204098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 205 - 392
Target Start/End: Original strand, 24719328 - 24719513
Alignment:
Q  205 tatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaa 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  24719328 tatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgcaa 24719427  T
Q  305 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24719428 gtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 24719513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 13664550 - 13664743
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13664550 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttga 13664649  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13664650 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 13664743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 13723825 - 13724018
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13723825 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttga 13723924  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13723925 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 13724018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Original strand, 22008366 - 22008548
Alignment:
Q  211 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatat 310  Q
    |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  22008366 attgatgattgtgtatgaataactatgaaatgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattg 22008465  T
Q  311 gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22008466 atgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttaactgttatttggattatgataatgt 22008548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 22909342 - 22909535
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||    
T  22909342 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatttgagatattgggatttga 22909441  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  22909442 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgt 22909535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 138 - 392
Target Start/End: Original strand, 20655677 - 20655943
Alignment:
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatatg-----tgattgatgattgtgtatga 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||  || || ||     |||||| |||||||||||||    
T  20655677 aggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatga 20655776  T
Q  229 ataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 326  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||  |||| | ||||||||    
T  20655777 ataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggatcatgatataagtatacatatgtggatattatt 20655876  T
Q  327 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20655877 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 20655943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41245338 - 41245210
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41245338 catcatagtcgtgttgaaattgtagttgtaaaatggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 41245239  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgat 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41245238 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgat 41245210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 24108465 - 24108657
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  24108465 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgacatattggagttttg 24108564  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  24108565 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 24108657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 21192234 - 21192384
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21192234 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21192333  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21192334 ttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgattcggtaccacatgcatttatg 21192384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21696236 - 21696086
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21696236 catcatagtcatgttgagttttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttg 21696137  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  21696136 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatg 21696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 21199661 - 21199811
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21199661 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21199760  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21199761 ttgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 21199811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Original strand, 31195772 - 31195917
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  31195772 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacgatatttttg 31195871  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 160  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31195872 ttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcat 31195917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23835895 - 23835746
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23835895 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttg 23835796  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  23835795 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtg-ttcggtaccacatgcatttatg 23835746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23509261 - 23509068
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  23509261 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgatgattgatgtgcgatattggggtttga 23509162  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |  | ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23509161 tgtaagtattgatgcgggaatattattattgaccaaatgtaggatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 23509068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 37655134 - 37655324
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37655134 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagaggggtgctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 37655233  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37655234 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggcaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 37655324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29758956 - 29758768
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt-tttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| | ||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  29758956 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 29758857  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29758856 ttttggagatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 29758768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Original strand, 22323225 - 22323398
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  22323225 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattgatgaatattgatgtgagatattggggtgtga 22323324  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    |||||| ||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22323325 tgtaagcattgttatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcatgttaactgttatt 22323398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 270138 - 269950
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  270138 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 270039  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270038 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 269950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 645782 - 645970
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  645782 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 645881  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  645882 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 645970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 831517 - 831705
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  831517 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 831616  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  831617 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 831705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 39448310 - 39448460
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattg-tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39448310 catcatagtcatgttgagtctggtagtcgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttg 39448409  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39448410 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 39448460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 16043054 - 16043245
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 299  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16043054 gatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttttga 16043153  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16043154 tgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16043245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 270401 - 270226
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  270401 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 270304  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 213  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  270303 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 270226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 213
Target Start/End: Original strand, 645519 - 645694
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  645519 tgtagttgtaaaagggttgatctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 645616  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 213  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  645617 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 645694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 213
Target Start/End: Original strand, 831254 - 831429
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  831254 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 831351  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 213  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  831352 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 831429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 239 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17343632 - 17343480
Alignment:
Q  239 attgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagta 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||   | || |||||||||||||||||||||     
T  17343632 attgatatttgttcatgacacatgtgattggcgattattgatgtgggatattggggtttgatg--agtattgatgtgggaatattattattgatcaagtg 17343535  T
Q  339 catgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17343534 catgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17343480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 16041378 - 16041569
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 299  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16041378 gatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttttga 16041477  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16041478 tgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 16041569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 37610042 - 37609956
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610042 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 37609956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 17731117 - 17731286
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  17731117 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 17731216  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 291  Q
    |||| ||||| ||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17731217 gtataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattaattgatgtgagatattg 17731286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 214
Target Start/End: Original strand, 24719077 - 24719165
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24719077 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatatgattg 24719165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 171
Target Start/End: Original strand, 22498832 - 22498947
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498832 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 22498931  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcga 171  Q
    ||||| |||| |||||    
T  22498932 tgcatatatgtgtcga 22498947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 24930614 - 24930789
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  24930614 gttgtaaaagagttgagctcttttacttcagagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 24930713  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgat 212  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24930714 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatacgtgat 24930789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Original strand, 24387203 - 24387383
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||   ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  24387203 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcaggggtgagcccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 24387302  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24387303 cttttga-gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatatgattg 24387383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 165
Target Start/End: Original strand, 23116349 - 23116458
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23116349 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccaca 23116448  T
Q  156 tgcatgtatg 165  Q
    ||||| ||||    
T  23116449 tgcatatatg 23116458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38532152 - 38531882
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||  || ||| | | ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  38532152 gtgacgaccttgaagtgatatggtaccccatgcatatatgtgtcgaactaggtgtacagcatgacatgagtcttatgggtgaaatgtgattgatgattgt 38532053  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || | | ||||||| |||  | ||    
T  38532052 gcat-aataattgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattacttaatgtaagatattgggattatggtatgagtatatatat--ggat 38531957  T
Q  321 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  38531956 attcttatttgattaagtgcatgatatttgaattgaattattcatgtttaactgttatatgaattatgatgatgt 38531882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22312304 - 22312190
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22312304 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgactttgaggtgatttggtaccaca 22312205  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22312204 tgcatatatgtgtcg 22312190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Original strand, 45560747 - 45560861
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45560747 actcttttaattcggtgataatgtaagacgggtgtaaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgttaccaca 45560846  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||||||||| ||||    
T  45560847 tgcatgtatgtgtcg 45560861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25294582 - 25294490
Alignment:
Q  110 ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25294582 ttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25294490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25756571 - 25756479
Alignment:
Q  110 ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25756571 ttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25756479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33170890 - 33170785
Alignment:
Q  65 cttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 164  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33170890 cttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatat 33170791  T
Q  165 gcgtcg 170  Q
    | ||||    
T  33170790 gtgtcg 33170785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 33612569 - 33612694
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||| | |||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  33612569 ttgtagctttaaaagggatgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 33612668  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33612669 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 33612694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28543440 - 28543270
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  28543440 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatttgattggtgattgt 28543342  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 293  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28543341 gcatgaataaatgtgatttgataattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattggg 28543270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 392
Target Start/End: Original strand, 6776303 - 6776422
Alignment:
Q  274 tattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgt 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  6776303 tattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgt 6776402  T
Q  374 ta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  6776403 tatttggattatgataatgt 6776422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 23153297 - 23153452
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  23153297 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatatactcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttg 23153396  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    || || |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23153397 ttacaccatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 23153452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 43375310 - 43375493
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  43375310 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtga 43375402  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  43375403 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 43375493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 18768422 - 18768691
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  18768422 gtgacgactttgaagtgaaatggtaccatatgcatgtatgtgtcgaacttggtgcataacatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattat 18768521  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | |||| ||| | || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || | | ||||||  |||  | ||    
T  18768522 gcatga-taaatatg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattggaattatggtatgagtata--tatttggat 18768617  T
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18768618 attattattgagtaagtacatgatatttgaattgatttattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 18768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 22008139 - 22008236
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22008139 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22008236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 249
Target Start/End: Original strand, 24108245 - 24108368
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| |||     
T  24108245 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtg 24108344  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttg 249  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  24108345 tgaataattgtgaattgatgtttg 24108368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 3433535 - 3433718
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3433535 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 3433627  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||    ||| | | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3433628 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 3433718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 22323102 - 22323197
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  22323102 gtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgataaatgtgtttggtgattgt 22323197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Original strand, 43375202 - 43375274
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43375202 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 43375274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 22089943 - 22090097
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22089943 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22090041  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  22090042 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 22090097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24238177 - 24238065
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24238177 actcttttacttcggcgataatgtaagatgg--acgaaatcgtacatacgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgagctgatttggtaccaca 24238080  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24238079 tgcatatatgtgtcg 24238065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 330 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28543213 - 28543151
Alignment:
Q  330 gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28543213 gatcaagtacatgatgttta-attgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 28543151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23509491 - 23509397
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23509491 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23509397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 13664296 - 13664393
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  13664296 gtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 13664393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 13723571 - 13723668
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  13723571 gtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 13723668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 3433076 - 3433254
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  3433076 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 3433173  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  3433174 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3433254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 13664424 - 13664496
Alignment:
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13664424 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 13664496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 13723699 - 13723771
Alignment:
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13723699 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 13723771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 21853396 - 21853574
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  21853396 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 21853493  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21853494 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21853574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 22909146 - 22909242
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||||||||||    
T  22909146 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcagatttgaaaatgtgattgatgattgt 22909242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24547863 - 24547724
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  24547863 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 24547769  T
Q  155 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24547768 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24547724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 15320559 - 15320713
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  15320559 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 15320657  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  15320658 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 15320713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 15500928 - 15501082
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  15500928 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 15501026  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  15501027 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 15501082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23509378 - 23509315
Alignment:
Q  211 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23509378 attgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 23509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 392
Target Start/End: Original strand, 23631046 - 23631173
Alignment:
Q  263 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattc 362  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  23631046 tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcc 23631142  T
Q  363 atgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  23631143 atgttaactgttatttggattatgataatgt 23631173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11543149 - 11543088
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttg 117  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11543149 actcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttg 11543088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 21846065 - 21846169
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21846065 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 21846164  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  21846165 gtgat 21846169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25294641 - 25294581
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatt 75  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25294641 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagatt 25294581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25756630 - 25756570
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatt 75  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25756630 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagatt 25756570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28836155 - 28835980
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 307  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  28836155 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 28836063  T
Q  308 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  28836062 tta--atgtgta-attattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcaggttaactgttatttggattatgataatgt 28835980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 3433285 - 3433352
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3433285 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcctgatacatgtgaatggtgatt 3433352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 272786 - 272880
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  272786 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 272880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 643063 - 642969
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  643063 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 642969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 828869 - 828775
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  828869 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 828775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5236768 - 5236674
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5236768 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5236674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Original strand, 39448573 - 39448646
Alignment:
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39448573 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 39448646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 16874439 - 16874617
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16874439 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16874536  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  16874537 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 16874617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 392
Target Start/End: Original strand, 17731331 - 17731387
Alignment:
Q  337 tacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17731331 tacatgatatttaaattgaatcattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 17731387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23148568 - 23148481
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 102  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23148568 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatgtgctctttaacttcggtgataatgtaagacgggtgtaaaatcttacat 23148481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29758740 - 29758643
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||       |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29758740 tgataaatgtaattggtgattgtgaatgaatagttgtgaattgataattgttaatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 29758648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Original strand, 224737 - 224816
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  224737 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 224816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Original strand, 738360 - 738439
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  738360 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 738439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Original strand, 862255 - 862334
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  862255 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 862334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Original strand, 16675900 - 16675979
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16675900 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16675979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21695941 - 21695899
Alignment:
Q  351 attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21695941 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 21695899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 24662830 - 24662924
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24662830 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 24662924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 3433390 - 3433455
Alignment:
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3433390 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3433455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 18043091 - 18043131
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatc 96  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  18043091 actcttttacttcgatgataatgtaagacgggtgtgaaatc 18043131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 53 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38101 - 37760
Alignment:
Q  53 tgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtacc 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  38101 tgaacttttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtacc 38002  T
Q  153 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttc 252  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38001 acatgcatgtacgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttagtgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttc 37902  T
Q  253 atgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttata 351  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37901 atgacacttgttattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaa 37802  T
Q  352 ttgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37801 ttgaaatatccatggtaactgttatttggattatgatgatgt 37760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 134)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 50113612 - 50113991
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  50113612 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgcaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttat 50113711  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50113712 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 50113811  T
Q  215 atgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgt 312  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||     
T  50113812 gtgattgtgtatgaataactgtggattgatgattattcatgatatatgtgattgatgattaattgatgtgagatattggggttctaatgtaagtat-tga 50113910  T
Q  313 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  50113911 atgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 50113991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 392
Target Start/End: Original strand, 319099 - 319486
Alignment:
Q  17 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  319099 atcatagtcgtgttgagattgtagtcgtaaaagggttgaactcttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgtt 319198  T
Q  117 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatat---at--gt 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||  ||    
T  319199 gcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgcgattggt 319298  T
Q  210 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaag-- 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||      
T  319299 gattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatatgagatattggggttttgatgtaagta 319398  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  319399 tatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 319486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 392
Target Start/End: Original strand, 51159973 - 51160335
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatctt----acatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgac 130  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    |||| ||||||   ||||| ||||||| |||||    
T  51159973 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgac 51160072  T
Q  131 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaat 230  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51160073 gaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgattggtgattgtgtatgaat 51160172  T
Q  231 aattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattg 330  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  51160173 aactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggtttgatgtaagtattgatttgagaatattattattg 51160272  T
Q  331 atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  51160273 atcaagtgcatgatgtttaaattgagatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 51160335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17099181 - 17098913
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17099181 gtgacaaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtg 17099082  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 324  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17099081 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatttatgagaatatta 17098982  T
Q  325 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17098981 ttattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 17098913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 12351332 - 12351709
Alignment:
Q  18 tcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttg 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12351332 tcatagtggtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttg 12351431  T
Q  118 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatg 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||   | |||||| || ||    
T  12351432 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccagtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacgtgagtcttgttttgaaatgtgactggtg 12351531  T
Q  218 attgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatg 315  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||  |||||||   ||||    
T  12351532 attgtgtatgaataattatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgacataagtattgatatg 12351631  T
Q  316 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     || ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12351632 tgagtattattgttgatcaactgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12351709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 47786356 - 47786735
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47786356 catcatagtcatgttgag-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttactttggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 47786454  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgat 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  47786455 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatagtaacacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgat 47786554  T
Q  213 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatat 310  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||| |||||||||    
T  47786555 tggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgagattagtgattaattgatgtgagatattgggattgtgatataagtatat 47786654  T
Q  311 gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||  |||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  47786655 atatgtgaaaactattattgatcaagtacatgatgtt--aattgatatattcatgataacagttatttggattatgatgatgt 47786735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 6148457 - 6148723
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||     
T  6148457 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatat--gtgattggtgattgtgtg 6148554  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 324  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6148555 tgaatacttgtgaattgatattcgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatgtgtatgagaatatta 6148654  T
Q  325 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6148655 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 6148723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30204961 - 30204696
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  30204961 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttgtg--tcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 30204864  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30204863 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaacattat 30204764  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30204763 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatccatattaacttttatttggattatgatgatgt 30204696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7852482 - 7852223
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7852482 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 7852383  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattg 214  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||   | |||||||||    
T  7852382 tggatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattg 7852283  T
Q  215 atgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
     ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  7852282 gtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgataaatgtgattggtgatt 7852223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11812994 - 11812801
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11812994 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 11812895  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11812894 tgtaagtataaatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 11812801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 16183665 - 16183945
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     
T  16183665 gtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtctg 16183764  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-------------gatgtaagtatatgt 312  Q
    ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || ||  ||||| |    
T  16183765 tgaatgattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttttgatatatatatatatatatatatatat 16183864  T
Q  313 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16183865 atgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 16183945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8630521 - 8630315
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  8630521 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagt 8630422  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |    
T  8630421 ggcatcgaaggtgacgacctggaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattaa 8630322  T
Q  216 tgattgt 222  Q
    |||||||    
T  8630321 tgattgt 8630315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 19572430 - 19572693
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  19572430 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgagtggtgattgtgaa 19572529  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 323  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  19572530 tgaatatttgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 19572624  T
Q  324 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19572625 attattgatcaaacacatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 19572693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 22145882 - 22146145
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  22145882 gtgacgaccttgaggtaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatgtgatgacacgagtcttattgatatatgtgattggtgattgcata 22145981  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||   |||| |||   |||    
T  22145982 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgttagatattgggg-tggatgtatgtattgatatgtgaa---tat 22146077  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  22146078 tattgatcaagtgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 22146145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38166407 - 38166213
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  38166407 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggagttttg 38166308  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38166307 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 38166213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18738167 - 18737974
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18738167 tgatatatgtaattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattgaagattattgatgtgagatattggggtttga 18738068  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18738067 tgtaagtatatgtatgagaatagtactattgatcaagtgcatgatgtttatattggaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18737974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 14060726 - 14060980
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14060726 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagatgggggtgaactcttacattcgatatttttg 14060825  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtga 211  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |    
T  14060826 ttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtaaaatgtaa 14060925  T
Q  212 ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 268  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14060926 ttgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattg 14060980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19944998 - 19944805
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19944998 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttga 19944899  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19944898 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 19944805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7851877 - 7851683
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 298  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  7851877 tgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttgtc 7851778  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7851777 atataagtatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatactaactgttatttggattatgatgatgt 7851683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30141177 - 30140984
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  30141177 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 30141078  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  30141077 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 30140984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12796908 - 12796728
Alignment:
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12796908 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 12796809  T
Q  309 --atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgat 387  Q
      ||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12796808 tgatgtggga-aattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgat 12796728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17936649 - 17936455
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17936649 tgatatatatgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatttgagattattgatgtgagatattggggtttga 17936550  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttat-attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17936549 tataagtatatgtatgggaatattataattgatcaagtgcatgatgtttatgatgaaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 17936455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 38812481 - 38812671
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  38812481 catcatagtcatgttgagtctagtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacggg-gtgaaatattacatacgatgtttttg 38812579  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttattg 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  38812580 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatggtgacatgagtcttattg 38812671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 169
Target Start/End: Original strand, 18008645 - 18008776
Alignment:
Q  38 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18008645 tagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttg 18008744  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 169  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18008745 aggtgattcagtaccacatgcatttatgcgtc 18008776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19230734 - 19230535
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| ||||     
T  19230734 catcatagttatgttgaaattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttga 19230635  T
Q  116 tgcatcgaaa-gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    | |||||||| |||||||| ||  || |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19230634 ttcatcgaaaggtgacgacgttttggagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgataaatgtgattg 19230535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15874820 - 15874690
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15874820 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 15874721  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15874720 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 15874690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16819234 - 16819043
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16819234 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttga 16819135  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16819134 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 16819043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48420327 - 48420197
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48420327 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgacc 48420228  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48420227 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 48420197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 55442252 - 55442404
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55442252 catcatagtcatgttgagtttgtagttgtaaaatggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 55442351  T
Q  116 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55442352 tgcattgaaggtgacgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatg 55442404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Original strand, 12490249 - 12490372
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  12490249 tgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgagat 12490348  T
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||| |||||||||||||| ||||    
T  12490349 gattcggtaccacatgcatttatg 12490372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14287596 - 14287323
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 223  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||    
T  14287596 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattttg 14287497  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggt-ttgatgtaag--tatatgtatgagaa 319  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||  |  || | ||||  ||||| |||| |||    
T  14287496 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgttgattaattgatgtgaggtattggaatcatggtataagtatatatatatgtgaa 14287397  T
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14287396 cgttattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 14287323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2048723 - 2048535
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||    
T  2048723 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgacc 2048624  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2048623 ttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 2048535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 11330493 - 11330643
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11330493 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 11330592  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  11330593 ttgcatcaaaggtgacaaccttgaggtgactcggtaccacatgcatttatg 11330643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 11199144 - 11199415
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| | ||   || ||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||    
T  11199144 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtggcgggctaggtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattggtgattgt 11199242  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | |||||| | ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  |  || | || |||||| |||| ||||    
T  11199243 gcatgaatgaatgtgatttgatgactgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaatattggaatgatggtatatgtatatatatgtgaat 11199342  T
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11199343 attattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattgttcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 11199415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Original strand, 5229607 - 5229721
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229607 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 5229706  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5229707 tgcatatatgtgtcg 5229721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33340506 - 33340317
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  33340506 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 33340407  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33340406 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 33340317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23491169 - 23490980
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  23491169 tgtagttgtaaaaaggttgtgctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 23491070  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  23491069 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 23490980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35122189 - 35121921
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 223  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| || |||||||||||||| ||   |   ||||||| ||||||||    
T  35122189 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacattatgacatgagtcttgttttgaatcgtgattggtgattgtg 35122090  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaata 321  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||  |||||| ||||||| | ||||  ||      
T  35122089 tatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaatttgggattttgatataagtatttatatgtaaa-- 35121992  T
Q  322 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35121991 -tattattgatcaagtacacgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35121921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19945289 - 19945098
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | ||||||||||    
T  19945289 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggtggttttgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgacct 19945191  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatga 228  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||    
T  19945190 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtttatga 19945098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8630232 - 8630101
Alignment:
Q  204 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgta 303  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  8630232 atatgtgattggtaattgtgcatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggagattatgaatgtgagatattggggtttgatgta 8630133  T
Q  304 agtatatgtatgagaatattattattgatcaa 335  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  8630132 agtatatgtatgtggatattgttattgatcaa 8630101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10737219 - 10737033
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||| ||||||    
T  10737219 tgtagttgtaaaagggttgagctcttctacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtggcgacct 10737121  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |  || |||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  10737120 tttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctgatttgatatatgtgattggtgattgt 10737033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14297000 - 14296730
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  14297000 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtggattgtgattggtgattgt 14296902  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | || ||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  || | ||||||||| |||| ||||    
T  14296901 gcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtatatatatgtgaat 14296802  T
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14296801 attattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 14296730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14302627 - 14302357
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  14302627 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtggattgtgattggtgattgt 14302529  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | || ||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  || | ||||||||| |||| ||||    
T  14302528 gcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtatatatatgtgaat 14302429  T
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14302428 attattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 14302357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Original strand, 14846160 - 14846339
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  14846160 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggggggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 14846258  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  14846259 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtaatatatgtgattggtgat 14846339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 293
Target Start/End: Original strand, 11062691 - 11062861
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 223  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  11062691 gtgacgaccttgaagtgaaacggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcaggacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 11062790  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 293  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11062791 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattggg 11062861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47983531 - 47983418
Alignment:
Q  58 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47983531 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 47983432  T
Q  157 gcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||| |||| ||||    
T  47983431 gcatatatgtgtcg 47983418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47992818 - 47992705
Alignment:
Q  58 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47992818 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 47992719  T
Q  157 gcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||| |||| ||||    
T  47992718 gcatatatgtgtcg 47992705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48002105 - 48001992
Alignment:
Q  58 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48002105 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 48002006  T
Q  157 gcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||| |||| ||||    
T  48002005 gcatatatgtgtcg 48001992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48011391 - 48011278
Alignment:
Q  58 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48011391 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 48011292  T
Q  157 gcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||| |||| ||||    
T  48011291 gcatatatgtgtcg 48011278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 284 - 392
Target Start/End: Original strand, 54045594 - 54045703
Alignment:
Q  284 agatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggatt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  54045594 agatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactattatttggatt 54045693  T
Q  383 atgatgatgt 392  Q
    ||||||||||    
T  54045694 atgatgatgt 54045703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11813403 - 11813307
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11813403 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgctgattgt 11813307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 9592239 - 9592394
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  9592239 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacacatgatgtgtttg 9592338  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    || ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9592339 ttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 9592394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13816070 - 13815973
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt 297  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13816070 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgacgtgagatattggagttt 13815973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 14523006 - 14523278
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  || |||||| ||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  14523006 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggaacacatcatg-cataagtcttattggtgaaatgtaattgatgattgt 14523104  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtttgatg---taagtatatgtatgaga 318  Q
    | ||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | || || | |  |||||   || |||| | || | ||    
T  14523105 gcatgcataagtgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgaataattgagctga-atctttgagaatgatggtatatgtatttatacgtga 14523203  T
Q  319 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14523204 atattattattgatcaagtacatgatggttaaattggaatattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 14523278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 392
Target Start/End: Original strand, 17958169 - 17958303
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17958169 catgtgattggtgattattgatgtgagatattgggggatatgatgtaagtattaatatgggagtattattattgatcaagtacatgatgtttactttgaa 17958268  T
Q  357 ttattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 392  Q
     ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  17958269 atatccatgttaactgttatt-gattatgttgatgt 17958303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49230869 - 49230655
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| ||||||| |||      
T  49230869 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgacgttgtt 49230772  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 239  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |    
T  49230771 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaa 49230672  T
Q  240 ttgatatttgttcatga 256  Q
    |||||| ||||||||||    
T  49230671 ttgataattgttcatga 49230655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5227378 - 5227201
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc- 134  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||| ||| |  ||||||| |||||||||     
T  5227378 tgtagttgtaaaagggttgg-ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgttt-tatcatcgaatgtgacgacct 5227281  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgatt 213  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  5227280 ttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacataacatgagtcttgtttgatatatgtgatt 5227201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Original strand, 15939959 - 15940140
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| |  |||| | |||||||||||     
T  15939959 gttgtaaaagggctgaacttttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttg-tctatcggaggtgacgaccttt 15940057  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  15940058 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgatttatgtgattggtgat 15940140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Original strand, 17913751 - 17913933
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||| | ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  17913751 tgtaaaagggttaagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacgtacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 17913849  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17913850 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgatgtatgtgattgatgattgt 17913933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 41660249 - 41660135
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41660249 actcttttatttcggtgataatgtaagacaggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccaca 41660150  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  41660149 tgcatatatgtgtcg 41660135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 54686707 - 54686551
Alignment:
Q  204 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt--gatg 301  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  54686707 atatgtgatcggtaattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattggggtttttgatg 54686615  T
Q  302 taagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 365  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  54686614 taagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatg 54686551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 317 - 392
Target Start/End: Original strand, 11062944 - 11063020
Alignment:
Q  317 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11062944 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 11063020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 17957996 - 17958093
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17957996 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatctcatgacatgagtcttatatgatatatgtgattgatgattgt 17958093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44228083 - 44227903
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  44228083 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 44227985  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  44227984 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 44227903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 204 - 365
Target Start/End: Original strand, 9304664 - 9304819
Alignment:
Q  204 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 302  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  9304664 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 9304756  T
Q  303 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 365  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  9304757 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 9304819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16819565 - 16819386
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||| ||||| |||||||||||      
T  16819565 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgcaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgtt 16819467  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16819466 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 16819386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16259683 - 16259487
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  16259683 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 16259589  T
Q  155 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 254  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  16259588 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgggtcttatttggaaatgtgattagagattgtgaatgaatatttgtcaattgataattgttcat 16259489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25057166 - 25057035
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25057166 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaa 25057072  T
Q  357 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  25057071 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 25057035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15516197 - 15516035
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    |||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15516197 gtgacgaccttgaagtgatttcgtaccacatgcatatat----cgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 15516102  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt 290  Q
      ||| |||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  15516101 tcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgatacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatatt 15516035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 222
Target Start/End: Original strand, 19262602 - 19262698
Alignment:
Q  127 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19262602 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19262698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13815943 - 13815856
Alignment:
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13815943 tatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 13815856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19230499 - 19230318
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19230499 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgtt-------catatgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 19230407  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||| ||      |||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19230406 tgtaagtattaatgtgtg-----gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgt 19230318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11813253 - 11813179
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11813253 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacccatgtgattggtgatt 11813179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 12563136 - 12563281
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12563136 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatggcatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 12563235  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 268  Q
    | |||| ||| ||||  |||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  12563236 gcatgattaaatgtgatttgatgatttctcatgacacatgtgattg 12563281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25057344 - 25057247
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  25057344 gtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 25057247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 165
Target Start/End: Original strand, 33370914 - 33371002
Alignment:
Q  76 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33370914 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgat-tttttgttgcaccatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 33371002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 392
Target Start/End: Original strand, 17536847 - 17536923
Alignment:
Q  317 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17536847 gaatattattattgatcaagtgcatgaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgt 17536923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18908854 - 18908679
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 307  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  18908854 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 18908762  T
Q  308 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18908761 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18908679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22273209 - 22273034
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 307  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  22273209 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 22273117  T
Q  308 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22273116 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 22273034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27839362 - 27839184
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  27839362 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 27839265  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  27839264 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattgatgat 27839184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45581382 - 45581310
Alignment:
Q  150 accacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45581382 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 45581310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7852035 - 7851968
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 267  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852035 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 7851968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Original strand, 15860824 - 15860902
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15860824 gatttggtacaacatgcacatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 15860902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Original strand, 18905356 - 18905434
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18905356 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18905434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18908966 - 18908892
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18908966 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 18908892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49230429 - 49230262
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||||||||| |||    
T  49230429 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatattggggtgtga 49230337  T
Q  300 tgtaagta-tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    |||||||| ||   ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  49230336 tgtaagtacta---atgtgta-attattattgatcaagtccatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatt 49230262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15613720 - 15613564
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  15613720 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 15613626  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15613625 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15613564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11813120 - 11813048
Alignment:
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11813120 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgaaacatgtaattggtgatt 11813048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17137969 - 17137827
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgat-atgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgtg 223  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||  || | ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||||    
T  17137969 gtgacaaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtgaattaggtgcacatcatgacatgagtgttattggtgtaatgtggttgatgattgtg 17137870  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 268  Q
     || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17137869 cat-aataaatgtg-attgatgtttgttcatgacacatgtgattg 17137827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 199
Target Start/End: Original strand, 23081682 - 23081821
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  23081682 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 23081776  T
Q  155 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23081777 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 23081821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23490898 - 23490768
Alignment:
Q  260 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaat 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  23490898 atgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttactattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaa 23490804  T
Q  358 tattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    || ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  23490803 tactcatgttatctgttatttggattatgataatgt 23490768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16819355 - 16819292
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16819355 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 16819292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30141456 - 30141361
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 221  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  30141456 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 30141361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 2450910 - 2451004
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2450910 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 2451004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 122
Target Start/End: Original strand, 11517010 - 11517056
Alignment:
Q  76 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcg 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517010 atgtaaaacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcg 11517056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18909263 - 18909169
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18909263 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18909169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22273618 - 22273524
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22273618 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 22273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40938236 - 40938085
Alignment:
Q  124 aagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgatt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| | | || ||| |||| |||    
T  40938236 aagtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgagctaggtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatatgaatgataatt 40938138  T
Q  221 gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40938137 gtgtgtgaataaatgtg-attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgatt 40938085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 219
Target Start/End: Original strand, 12266007 - 12266167
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  12266007 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 12266101  T
Q  155 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  12266102 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 12266167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15574618 - 15574545
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15574618 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15574545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 16745670 - 16745848
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||| ||||| |||||||||||      
T  16745670 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgtt 16745767  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16745768 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 16745848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 392
Target Start/End: Original strand, 53900388 - 53900463
Alignment:
Q  317 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  53900388 gaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattatttatg-taactgttgtttggattatgatgatgt 53900463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 1469236 - 1469330
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1469236 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 1469330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7851931 - 7851857
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||    
T  7851931 tgatatatgtggttgatggttgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtggttgatgatt 7851857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 17536606 - 17536774
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | |  |||||||| |  | ||    
T  17536606 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtattggt 17536704  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 291  Q
    |  ||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  17536705 gcgtgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacagatgtgatcggtgattaattgatgtgagttattg 17536774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33340155 - 33340038
Alignment:
Q  270 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgtt 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||     ||||||| ||||||| | |||| ||||   ||||||||||||||| |    
T  33340155 tgattattgatgttagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattagtgatcaaatgcatgttgtt--aattgaattattcatgat 33340063  T
Q  368 aattgttattggattatgatgatgt 392  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  33340062 aactgttattggattatgataatgt 33340038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 219
Target Start/End: Original strand, 15470048 - 15470141
Alignment:
Q  127 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  15470048 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacataagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 15470141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 392
Target Start/End: Original strand, 19262733 - 19262907
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 306  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  19262733 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 19262825  T
Q  307 at--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattg-ttattggattatgatgatgt 392  Q
    ||  |||| ||      |||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||    
T  19262826 attaatgtgtg-----gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgctaattggattatgataatgt 19262907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30151991 - 30151813
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  30151991 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 30151894  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  30151893 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 30151813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 392
Target Start/End: Original strand, 12563334 - 12563397
Alignment:
Q  330 gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  12563334 gattaagtacatgatatttaaattgaattattcatgttaagtgttatgtgaattatgatgatgt 12563397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12951555 - 12951476
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12951555 gtgacgaccttgaagtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 12951476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39654237 - 39654163
Alignment:
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39654237 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 39654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 8269976 - 8270080
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8269976 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8270075  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  8270076 gtgat 8270080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 8277087 - 8277191
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8277087 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8277186  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  8277187 gtgat 8277191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 8305896 - 8306000
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8305896 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8305995  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  8305996 gtgat 8306000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 392
Target Start/End: Original strand, 14061039 - 14061110
Alignment:
Q  322 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14061039 ttatcattgattaagtacatgatgttga-attgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 14061110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 53769241 - 53769137
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  53769241 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 53769142  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  53769141 gtgat 53769137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Original strand, 13956378 - 13956457
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  13956378 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 13956457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Original strand, 13977211 - 13977290
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  13977211 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 13977290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 87
Target Start/End: Original strand, 18905296 - 18905343
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggg 87  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18905296 gttgtaaaagggttgggctcttttactttggagattatgtaaggcggg 18905343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41268822 - 41268743
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  41268822 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 41268743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45859600 - 45859521
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  45859600 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 45859521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 273
Target Start/End: Original strand, 53900177 - 53900326
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | |  |||||||| | |||||    
T  53900177 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcggtctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtaattgt 53900275  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 273  Q
    | |||||||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53900276 gcatgaatatacgtgatttgatacttgtttatgacacatgtgattgatgat 53900326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 55314962 - 55314883
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  55314962 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 55314883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 2451155 - 2451229
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  2451155 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 2451229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22273321 - 22273247
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  22273321 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 22273247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49230583 - 49230509
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  49230583 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 49230509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 256
Target Start/End: Original strand, 2451035 - 2451084
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 256  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2451035 tgtgattgatgtttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2451084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10736953 - 10736904
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||    
T  10736953 catgtgattggtgattattaatgtgagatattggagtgtgacgtaagtat 10736904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 171
Target Start/End: Original strand, 11883923 - 11883968
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 171  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11883923 gtgacgactttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 11883968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14291955 - 14291910
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 171  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14291955 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcga 14291910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Original strand, 38377415 - 38377460
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38377415 gtgacgacctttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcg 38377460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45581230 - 45581181
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45581230 catgagattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 45581181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15989548 - 15989508
Alignment:
Q  126 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15989548 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 15989508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 96)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4863943 - 4863551
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4863943 catcataatcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 4863844  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-------g 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||       |    
T  4863843 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacattcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgg 4863744  T
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4863743 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgctttgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagta 4863644  T
Q  308 ------tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
          ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||    
T  4863643 tatatgtatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattaaattattcatgattaactgttgttttgattatgatgatgt 4863551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 27185318 - 27185699
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27185318 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27185417  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  27185418 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 27185517  T
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27185518 tgattgataattgtgtctgaataaatgtgaattgttgtttgtacatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 27185617  T
Q  309 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
       |||| |||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27185618 tgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcataatgtttatattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 27185699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 76 - 392
Target Start/End: Original strand, 21661268 - 21661593
Alignment:
Q  76 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatg 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  21661268 atgtaagactggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataag 21661367  T
Q  176 tgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatatg-----tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || || ||     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21661368 tgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 21661467  T
Q  269 gtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgtt 367  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  21661468 gtgattattgttgtgagatattggggtcttgatgtaagcatatgtatgagaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgtt 21661567  T
Q  368 aattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    || ||||| |||||||||||||||||    
T  21661568 aactgttatttggattatgatgatgt 21661593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21392698 - 21392432
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21392698 gtgacgaccttgagttgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgta 21392599  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    ||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21392598 tgaataattggaaactgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatatgtatgagaatatttt 21392500  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21392499 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 21392432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34937764 - 34937571
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34937764 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgttagatattggggtttga 34937665  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34937664 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 34937571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10500 - 10307
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10500 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10401  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10400 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 10780112 - 10780305
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10780112 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10780211  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10780212 tgtaagtattgatgtgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 10780305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 32967661 - 32967815
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32967661 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 32967760  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32967761 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 32967815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 43445708 - 43445901
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43445708 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 43445807  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  43445808 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 43445901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23492662 - 23492532
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23492662 ttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23492563  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23492562 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23492532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28257970 - 28257781
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28257970 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 28257871  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28257870 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcattttaactgttattttgattatgatgatgt 28257781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 22885041 - 22885234
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22885041 tgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggcgatcattgatgtgagatattggggtttga 22885140  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||    
T  22885141 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgatgactgttatttggattatgataatgt 22885234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Original strand, 24226976 - 24227146
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24226976 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 24227075  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24227076 ttgaggtgattcggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 24227146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 25211796 - 25211982
Alignment:
Q  206 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttgatgtaa 304  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25211796 atgtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaa 25211895  T
Q  305 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25211896 gtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25211982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 25275948 - 25276134
Alignment:
Q  206 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttgatgtaa 304  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25275948 atgtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaa 25276047  T
Q  305 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25276048 gtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25276134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21615671 - 21615535
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21615671 ttgtagctgtaaaagagttgaactcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 21615572  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21615571 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 21615535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 203 - 392
Target Start/End: Original strand, 17473704 - 17473892
Alignment:
Q  203 tatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgt 302  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17473704 tatatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacatatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttgatgt 17473803  T
Q  303 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| || ||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17473804 aagtat-tg-atgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17473892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7727257 - 7727112
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7727257 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaggggttgagctattttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 7727158  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7727157 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 7727112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19498120 - 19497952
Alignment:
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498120 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 19498021  T
Q  309 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
       | || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  19498020 tgatgtgtgaatattattaatgatcatgtacgtaatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatt 19497952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19860912 - 19860756
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19860912 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagagttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 19860813  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 171  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19860812 ttgtatcgaaggtgacgaccttggggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 19860756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28888598 - 28888441
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28888598 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 28888499  T
Q  115 ttgcatcgaa---agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 169  Q
    ||||||||||     ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28888498 ttgcatcgaagatgatgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 28888441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11582414 - 11582266
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  11582414 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgtgta 11582315  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11582314 tgaataactgtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgatt 11582266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11580113 - 11579922
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||    
T  11580113 tgatgtatatgattggtgactgcgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattactgatgtgagatattggagttttg 11580014  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  11580013 atgtaagtata--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 11579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Original strand, 1170321 - 1170467
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1170321 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtatcaataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaa 1170420  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga 272  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1170421 tgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatgtgatttgtga 1170467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13793809 - 13793659
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  13793809 catcatagtcatgttgagtcttgtggttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgagatcttatatacgatgtttttg 13793710  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13793709 ttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 13793659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Original strand, 37189637 - 37189767
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37189637 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 37189736  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37189737 ttgaggtgattcggtaccacttgcatttatg 37189767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23453454 - 23453184
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23453454 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23453355  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23453354 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23453258  T
Q  321 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23453257 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23453184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23460698 - 23460428
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23460698 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23460599  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23460598 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23460502  T
Q  321 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23460501 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23460428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23464959 - 23464689
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23464959 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23464860  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23464859 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23464763  T
Q  321 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23464762 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23464689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 274
Target Start/End: Original strand, 1221351 - 1221584
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||| ||||      
T  1221351 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaacttgtt 1221449  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 239  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |    
T  1221450 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaa 1221549  T
Q  240 ttgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1221550 ttgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 1221584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 23986165 - 23986359
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatatt-ggggtttg 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||| ||    
T  23986165 gatatatgtgaatgatgattgtgtatgaataactgtgaattaatatttgttcctgacacatatgattggtgattacttgatgtgaaacattgggggtatg 23986264  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23986265 atgtaagtattgatatgagagtattattatttatcaagtgcatgatgtttatatagaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 23986359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 250 - 392
Target Start/End: Original strand, 1171320 - 1171464
Alignment:
Q  250 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 348  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1171320 ttcatgataaatgtgattgatgtttattaatgtgagatattggggctttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttt 1171419  T
Q  349 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  1171420 atattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgatgatgt 1171464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 9732592 - 9732782
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  9732592 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatctttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgcgagatattgggatgtga 9732691  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  9732692 tgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtttatcttgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 9732782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 1221638 - 1221826
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1221638 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttga 1221737  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  1221738 tgtaagtat-tg-atgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgt 1221826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11964586 - 11964472
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11964586 actcttttacttcggtgataatgtaatacgggtttgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttgaggtggtttggtaccaca 11964487  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||||||||| ||||    
T  11964486 tgcatgtatgtgtcg 11964472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 24184869 - 24185137
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 223  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  24184869 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaagtgtgattggtgattgtg 24184968  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 321  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||| | || |||| |  |||| | |||| |||      
T  24184969 tatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatggaattggtgattaattgatgtgagaaattgagattatgatatttgtatttatatgtgaa-- 24185066  T
Q  322 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24185067 -tattattgatcaattacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 24185137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24470804 - 24470555
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||            
T  24470804 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgggtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttactgatatatgtgattgctg-------- 24470713  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
          |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||   | || |   |||||    
T  24470712 ------attgtgaattgataattgttcgtgacatatgtgattgattattattgttgtgagatattggggtgtgatgtaaatattattgtgtg---attat 24470622  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24470621 tattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaactattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 24470555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 21653052 - 21653148
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21653052 gtgacgaccttgaggacatttggtaccacatgcatatatgcgtcgataagtgcatatcatgacacgagtcttattgataaatgtgattggtgattgt 21653148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Original strand, 11213222 - 11213404
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  11213222 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 11213320  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  11213321 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctcatatgatataagtgattgatgattgt 11213404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Original strand, 110604 - 110785
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  110604 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 110701  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  110702 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattgt 110785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Original strand, 20455627 - 20455741
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20455627 actcttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtaacgatcttgaggtgatttggtaccaca 20455726  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20455727 tgcatatatgtgtcg 20455741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 256
Target Start/End: Original strand, 22884887 - 22885017
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| |    
T  22884887 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaa 22884986  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 256  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22884987 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22885017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 17473568 - 17473648
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17473568 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 17473648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23510473 - 23510313
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtat 240  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  23510473 gatttggtacaacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaat 23510374  T
Q  241 tgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    ||||| ||||||   |||    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23510373 tgataattgttc---aca----tgattgatgactattgatgtgagatattggggtatgatgcaagtat 23510313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 29192671 - 29192857
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  29192671 tgataaatgtgattggtgattgtgattgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgcgagatatcggggtttga 29192763  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  29192764 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 29192857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17908030 - 17907853
Alignment:
Q  204 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 302  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  17908030 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattggggttttggtgt 17907938  T
Q  303 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgtta-ttggattatg 385  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  17907937 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatgattaactgttatttggattatg 17907853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 256
Target Start/End: Original strand, 35792767 - 35792964
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtacca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || ||||||||||||    
T  35792767 actcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtacca 35792861  T
Q  154 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttca 253  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  35792862 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattagagatcgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttca 35792961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16534881 - 16534750
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgtgt 224  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||  |||||||     
T  16534881 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaactatgtgattggagattgtga 16534782  T
Q  225 atgaataattgtgtattgatatttgttcatga 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16534781 atgaataattgtgaattgataattgttcatga 16534750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 35793162 - 35793345
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| |||    
T  35793162 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtga 35793254  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  35793255 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 35793345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10628 - 10554
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10628 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Original strand, 18779790 - 18779904
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtatt 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||| | ||||| |||    
T  18779790 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattagagattgtgaatgaacatttgtgaatt 18779889  T
Q  242 gatatttgttcatga 256  Q
    |||| ||||||||||    
T  18779890 gataattgttcatga 18779904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 22368188 - 22368285
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22368188 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattgt 22368285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19498458 - 19498280
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  19498458 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 19498361  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19498360 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19498280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28258093 - 28257998
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  28258093 gtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttatcgataaatgtggttggtgattgt 28257998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 9732495 - 9732562
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9732495 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 9732562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Original strand, 10779799 - 10779980
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  10779799 tgtaaaagggttgagctcttttactttg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 10779896  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  10779897 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 10779980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 392
Target Start/End: Original strand, 11338584 - 11338802
Alignment:
Q  188 catgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaaga 286  Q
    |||||||||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  11338584 catgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtg-attgataattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagt 11338682  T
Q  287 tattggggt-------------ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgt 373  Q
    ||||||| |             |  || ||  ||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11338683 tattgggatcatgatatatatatatatatatatatatatatatgaatgttgttattgatcaagtacatgatcttttaattgaaatattcatgttaattgt 11338782  T
Q  374 tat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  11338783 tatgtggattatgatgatgt 11338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 25944566 - 25944750
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtaagatattggggtttg 298  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| | ||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  25944566 tgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattaatgtgagatattagggtgtg 25944658  T
Q  299 atgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25944659 atgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 25944750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11340782 - 11340599
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||        |||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| |||    
T  11340782 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataatcgttcata-------tgattgatgaatatttatgtgagatatcggggtgtga 11340690  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11340689 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 11340599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11341294 - 11341116
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  11341294 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 11341197  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11341196 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11341116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 18780052 - 18780235
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| |||    
T  18780052 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtga 18780144  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18780145 tgtaagtatta--atgtgta-attattattaatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18780235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25425206 - 25425102
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25425206 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 25425107  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  25425106 gtgat 25425102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11341085 - 11341018
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  11341085 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgaatggtgatt 11341018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10925 - 10831
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10925 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Original strand, 110990 - 111157
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  110990 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 111082  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  111083 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 111157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 200
Target Start/End: Original strand, 5452432 - 5452511
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5452432 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 5452511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19498248 - 19498182
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19498248 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 19498182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 43445390 - 43445555
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 153  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  43445390 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 43445488  T
Q  154 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  43445489 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgaatcttatgtgaaatatatgattggtgat 43445555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 4201586 - 4201764
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    ||  ||||||||| |||||||||||      
T  4201586 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgacatcgaaaggtgacgaccttgtt 4201683  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4201684 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 4201764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 9732360 - 9732464
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  9732360 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatctatgtgttaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatctgattg 9732459  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  9732460 gtgat 9732464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16534574 - 16534391
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||  | ||||| |||    
T  16534574 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagacttcggggtgtga 16534482  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||    ||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  16534481 tgtaagtatta--atgtgta-attattgttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaattattatctggattatgataatgt 16534391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 249
Target Start/End: Original strand, 25211623 - 25211719
Alignment:
Q  153 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 249  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25211623 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 25211719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 249
Target Start/End: Original strand, 25275775 - 25275871
Alignment:
Q  153 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 249  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25275775 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 25275871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25424736 - 25424680
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  25424736 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatt 25424680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Original strand, 25944472 - 25944536
Alignment:
Q  210 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25944472 gattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 25944536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 43445582 - 43445654
Alignment:
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  43445582 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggcgatt 43445654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 21075192 - 21075286
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21075192 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21075286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 21933863 - 21933957
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21933863 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21933957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 21940033 - 21940127
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21940033 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21940127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 22368337 - 22368411
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22368337 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcaggatacatgtaattggtgatt 22368411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 29192321 - 29192415
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  29192321 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaagtatgtgattggtgat 29192415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35580829 - 35580735
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  35580829 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 35580735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 37010867 - 37010961
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37010867 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37010961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3672497 - 3672421
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  3672497 gtgacgaccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactagatgcatatcaagacatgagtcttatt 3672421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 10780011 - 10780082
Alignment:
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10780011 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatt-gttcctgatacatgtgattggtgatt 10780082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Original strand, 22368602 - 22368674
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22368602 attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgataatgt 22368674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24595159 - 24594981
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  24595159 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 24595062  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24595061 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 24594981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23327598 - 23327458
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 153  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  23327598 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 23327500  T
Q  154 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  23327499 catgcatttatgggtccataagtgcatatcatagcatgagtc 23327458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27008596 - 27008492
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  27008596 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacctcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 27008497  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  27008496 gtgat 27008492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 270
Target Start/End: Original strand, 110888 - 110957
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 270  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  110888 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgata-ttgttcatgatacatgtaattggt 110957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7726993 - 7726919
Alignment:
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7726993 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttagctgttatctggattatgatgatgt 7726919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Original strand, 25902021 - 25902123
Alignment:
Q  118 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgat 216  Q
    ||||||| |||||||||||   | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| |    
T  25902021 catcgaaggtgacgaccttatagagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggt 25902120  T
Q  217 gat 219  Q
    |||    
T  25902121 gat 25902123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 29192583 - 29192641
Alignment:
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  29192583 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 29192641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37051559 - 37051465
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  37051559 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 37051465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 297
Target Start/End: Original strand, 21653228 - 21653265
Alignment:
Q  260 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21653228 atgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggttt 21653265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 21649495 - 21649463
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttc 68  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21649495 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttc 21649463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 9)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 256560 - 256827
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  256560 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 256659  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256660 tgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 256759  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  256760 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaaatattcatattaactgttatttggattatgatgatgt 256827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 125009 - 125089
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  125009 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 125089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Original strand, 72028 - 72106
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  72028 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 72106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Original strand, 76409 - 76487
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  76409 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 76487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 193057 - 192985
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193057 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 192985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Original strand, 72191 - 72317
Alignment:
Q  262 gtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 359  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||    
T  72191 gtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaata 72283  T
Q  360 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  72284 ttcatgataactgttatttggattatgatgatgt 72317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Original strand, 76572 - 76698
Alignment:
Q  262 gtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 359  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||    
T  76572 gtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaata 76664  T
Q  360 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||| || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  76665 ttcttgataactgttatttggattatgatgatgt 76698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 392
Target Start/End: Original strand, 125173 - 125298
Alignment:
Q  263 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattat 360  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||    
T  125173 tgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 125265  T
Q  361 tcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  125266 tcatgataactgttatttagattatgatgatgt 125298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 192897 - 192768
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 356  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  192897 catgtaattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 192805  T
Q  357 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  192804 atattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 192768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 21961053 - 21961440
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21961053 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 21961152  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   || || |         
T  21961153 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgttta 21961252  T
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaag 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||| ||||    
T  21961253 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgatatatgtgattggtgattaattgatgtgagctattgggagtatgatttaag 21961352  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21961353 tattgatatatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 21961440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 104 - 392
Target Start/End: Original strand, 12837900 - 12838192
Alignment:
Q  104 cgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattg 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12837900 cgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgatataggtgcatatcatgacatgagtctttttg 12837999  T
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgat 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12838000 atatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggttttgat 12838099  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12838100 ataagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12838192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 392
Target Start/End: Original strand, 12901269 - 12901631
Alignment:
Q  28 gttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagt 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12901269 gttgaaattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggt 12901368  T
Q  128 gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatat-----gtgattgatgattg 221  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||| || |     ||||||| ||||||    
T  12901369 gacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgacatgagtcttctttgaaatgtgattggtgattggtgattg 12901468  T
Q  222 tgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaa 319  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||          |    
T  12901469 tgtacgaataactgtgaattgattattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtat----------a 12901558  T
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12901559 tatttatattgatcaagtacatgatgtttgaatt-aattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12901631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44345333 - 44345057
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||     
T  44345333 gtgacgaccttgaggtgatttgttaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatatgtttggtgattgtgtg 44345234  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaa--------gtatatgtatga 316  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||    
T  44345233 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatatga 44345134  T
Q  317 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  44345133 gaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttgttttgattatgatgatgt 44345057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 125 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33738732 - 33738477
Alignment:
Q  125 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33738732 agtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatacatgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgt 33738633  T
Q  225 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatt 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||                
T  33738632 atgaataattgtgaattgatatttgctcatggcacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatg------------ 33738545  T
Q  324 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
      |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33738544 --tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 33738477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18167067 - 18166874
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18167067 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 18166968  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18166967 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 18166874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 8873978 - 8874162
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  8873978 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaatgggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgt 8874077  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8874078 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 8874162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34393580 - 34393385
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 297  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  34393580 tgatatatgtgattggcgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacagatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttt 34393481  T
Q  298 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34393480 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 34393385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 53909555 - 53909750
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg--gttt 297  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  53909555 tgataaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtgttt 53909654  T
Q  298 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  53909655 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgatgatgt 53909750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 16366361 - 16366624
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  16366361 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattagtgattgtgaa 16366460  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 323  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  16366461 tgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatttgattgatgattattgatgtgagatattagggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 16366555  T
Q  324 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  16366556 attattgatcaaacgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactattatttggattatgatgatgt 16366624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14900136 - 14899948
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14900136 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggtgattttgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcggaggtgacgacc 14900037  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgatt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  14900036 ttgaggtgatttggtatcacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 14899948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 19699414 - 19699606
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19699414 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19699513  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19699514 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19699606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 19709999 - 19710191
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19709999 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19710098  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19710099 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19710191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 34197658 - 34197812
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34197658 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 34197757  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34197758 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 34197812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 7134310 - 7134503
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7134310 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgggatattggggtttga 7134409  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7134410 tgtaattattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 7134503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8372800 - 8372607
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8372800 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 8372701  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8372700 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcttgttaactgttatttggattatgataatgt 8372607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 37958550 - 37958704
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37958550 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 37958649  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 169  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37958650 ttgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 37958704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 15274470 - 15274663
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15274470 tgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 15274569  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15274570 tgtaagtattgatgtgggaattttattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 15274663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27959708 - 27959563
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27959708 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttg 27959609  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27959608 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 27959563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 110143 - 109957
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  110143 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 110045  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  110044 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 109957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 12245745 - 12245895
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12245745 catcatagtcatgttgagtcttgtatttgtaaaagggtttagctcttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 12245844  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12245845 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 12245895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26678370 - 26678179
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  26678370 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgataggtgaatattgatgtgacatattggggtttga 26678271  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  26678270 tgtaagtattgatatgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 26678179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44054427 - 44054168
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  44054427 gtgacggccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 44054328  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatatt 323  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||          |||||    
T  44054327 tgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgactggtgatttattgatatgagatattgggattatgatgtaagtat----------atatt 44054238  T
Q  324 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
      ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44054237 tatatcgatcaagtacatgatgtttgaattaaattaattatgttaactgttatttggattatgatgatgt 44054168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 45460611 - 45460894
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttat--tgatatatgtgattgatgatt- 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||||  || ||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||| |||||     
T  45460611 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccgcatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaactgtgattggtgattt 45460710  T
Q  221 -------gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatg 311  Q
           |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||     
T  45460711 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatgaattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatata 45460810  T
Q  312 --tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  45460811 catatgtgaatattatcattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattattatgatgt 45460894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Original strand, 15852829 - 15852959
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15852829 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactttggtgaaatcttacatacgatgttttttttgcatcgaaggtgacgacc 15852928  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15852929 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 15852959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 41167447 - 41167569
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41167447 ttgtggttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatctcacatacgatgtttttgttacatcgaaggtgacgacc 41167546  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatg 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  41167547 ttgaggtgattcggtaccacatg 41167569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15212004 - 15211762
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | |||||| |    
T  15212004 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgtc 15211905  T
Q  134 cttga-ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt-gatatatgtgattgatgattgtgtatgaata 231  Q
    |||   ||  |||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||    
T  15211904 ctttttggatatttggtaccacatgcatttatgtctcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgagta 15211805  T
Q  232 attgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
     || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15211804 tttttgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 15211762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13244861 - 13244606
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13244861 gtgacgaccctgaaatgatttggtcccacatgcatatatgtgtcaataggtggatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaa 13244762  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 323  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  13244761 tgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 13244674  T
Q  324 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13244673 attattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 13244606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 198 - 392
Target Start/End: Original strand, 53706635 - 53706828
Alignment:
Q  198 attgatatatgtgatt-gatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt 296  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  53706635 attgatatatgtgatttggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtg 53706734  T
Q  297 tgatgtaagta--tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||   || ||||      ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53706735 tgatgtaagtactaatttatg-----tttactattgatcaaatgcatgatgtttatactgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 53706828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 13811287 - 13811558
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || || |||||||    
T  13811287 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgcgaatgttgattgt 13811386  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||  ||| | || | |||  | ||    
T  13811387 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcattacacgtgtgattggtgattaatggatgtaagatattgggattatg--gtatgaatttatatttggat 13811484  T
Q  321 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13811485 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 13811558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 30236147 - 30236411
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttat--tgatatatgtgattgatgattg 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |  || ||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||| ||| ||    
T  30236147 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatccatatatgtgtcaaattaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaattgtgattggtgactg 30236246  T
Q  222 tgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaa 319  Q
    ||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||| ||          
T  30236247 tgtatgaataactgtgaattattgattgttcatgacacatgtaattggtgatttattgatgtgagatattgcagttatgatataagtatatata------ 30236340  T
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
       |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30236341 ---tattattgatcaggtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 30236411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 22356424 - 22356616
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttg 298  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22356424 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttg 22356523  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||| ||||||   |||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22356524 atgcaagtattgttatgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattattgttaactgttatttggattatgataatgt 22356616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 392
Target Start/End: Original strand, 20813715 - 20813890
Alignment:
Q  219 ttgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatga 316  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||  |||     
T  20813715 ttgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattaatgaattattgatgtgaaatattgggattatgatataagtatatacatgt 20813814  T
Q  317 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20813815 gtgaat-attattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 20813890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47355688 - 47355509
Alignment:
Q  211 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtata 309  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  47355688 attgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtatt 47355589  T
Q  310 tgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 392  Q
      |||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||    |||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47355588 gttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatcatgt---aattgaaatgttcgtgataactgttattggattatgataatgt 47355509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 214
Target Start/End: Original strand, 53909431 - 53909519
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909431 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 53909519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 41257842 - 41258031
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaag-ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttttt 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||  ||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  41257842 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagggtg--ctcttctacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatattttt 41257939  T
Q  114 gttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41257940 gttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 41258031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Original strand, 5372228 - 5372342
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5372228 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaagtcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccaca 5372327  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5372328 tgcatatatgtgtcg 5372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Original strand, 10238967 - 10239081
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238967 actcttttactttggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttgttgcatcatgtgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 10239066  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10239067 tgcatatatgtgtcg 10239081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 392
Target Start/End: Original strand, 18294600 - 18294746
Alignment:
Q  247 ttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgt 346  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18294600 ttgttcatgatttatgtgatcggtgattattgatgtgagatattgggatttaatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtagatgatat 18294699  T
Q  347 ttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18294700 ttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 18294746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 165
Target Start/End: Original strand, 47469867 - 47469976
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47469867 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttggggttatttggtaccaca 47469966  T
Q  156 tgcatgtatg 165  Q
    ||||| ||||    
T  47469967 tgcatatatg 47469976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16521447 - 16521294
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| | ||||| | |||||||||||     
T  16521447 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttggcttg-tccatcggaggtgacgaccttt 16521349  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatga 192  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16521348 tgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 16521294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Original strand, 5684404 - 5684586
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  5684404 tgtaaaagagttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagtccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 5684502  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  5684503 gagatttggtatcacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattgt 5684586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 170
Target Start/End: Original strand, 50223696 - 50223806
Alignment:
Q  60 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 159  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50223696 ttttacttcggtgataatgtaagacgggtatgaaatctaacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgaccttgaggtgatttggtatcacatgca 50223795  T
Q  160 tgtatgcgtcg 170  Q
    | |||| ||||    
T  50223796 tatatgtgtcg 50223806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 218
Target Start/End: Original strand, 43283043 - 43283138
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatga 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  43283043 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatga 43283138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15211698 - 15211515
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||    
T  15211698 tgataaatgtgattggtgattgttaatgaatatttgcgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattgaggtgtga 15211606  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  ||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15211605 tgtaagtatgaatgtatga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 15211515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 392
Target Start/End: Original strand, 8874265 - 8874346
Alignment:
Q  312 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8874265 tatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 8874346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10642683 - 10642586
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  10642683 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 10642586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19999183 - 19999005
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  19999183 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 19999086  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19999085 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19999005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34393666 - 34393610
Alignment:
Q  218 attgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393666 attgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 34393610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 52267125 - 52267196
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  52267125 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtc 52267196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 232
Target Start/End: Original strand, 53706515 - 53706591
Alignment:
Q  156 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 232  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  53706515 tgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttggtgattgtgtgtgaataa 53706591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 310
Target Start/End: Original strand, 55378542 - 55378646
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaag 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  55378542 gtgattgatgattgtgtatgaatatttgtgatttgatgattgttcatgacacataagattggtgattaattgatgtgagatattggaattatgatgtaag 55378641  T
Q  306 tatat 310  Q
    |||||    
T  55378642 tatat 55378646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8372921 - 8372854
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8372921 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 8372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18167164 - 18167097
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18167164 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 18167097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 18496065 - 18496334
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga-tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 223  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||| || | | || ||| |||||| ||||    
T  18496065 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaactaggtgcacatcatgacatgagttttaatggtgaaatatgagtgatgactgtg 18496164  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 321  Q
     || ||||| ||||  |||||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || || | | | ||||| | ||   |||    
T  18496165 cataaataaatgtgatttgatgattattcatgaaacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatggtatgaatatatttgtg---ata 18496261  T
Q  322 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||  ||| || | |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18496262 ttattatcggattaaatgcatgatatttaaattgaactattcatgttatttgttatatggattatgatgatgt 18496334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 212
Target Start/End: Original strand, 54119906 - 54119976
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat 212  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54119906 gatttggtaccagatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgat 54119976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 274
Target Start/End: Original strand, 7134088 - 7134208
Alignment:
Q  153 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttc 252  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| || ||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  7134088 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtg-ttgcgaatgaatatttgtgaattgatatttattc 7134186  T
Q  253 atgacacatgtgattggtgatt 274  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  7134187 ctgatacatgtgattggtgatt 7134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9293843 - 9293712
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  9293843 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa 9293749  T
Q  357 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     ||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  9293748 atatccatgttatctgttatttggattatgataatgt 9293712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9294021 - 9293924
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||    
T  9294021 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttcataaatgtgattggtgattgt 9293924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10642505 - 10642374
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  10642505 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaa 10642411  T
Q  357 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  10642410 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 10642374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 22356065 - 22356244
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22356065 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22356162  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 221  Q
    | ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  22356163 gagatttggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 22356244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 15138134 - 15138238
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15138134 gcatcgaaaggtgatgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 15138233  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  15138234 gtgat 15138238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19998700 - 19998517
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  19998700 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtgtga 19998608  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||| |||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  19998607 tgtgagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttgactgttatttggattatgataatgt 19998517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26678626 - 26678522
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  26678626 gcatcgaaagatgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacacgagtcttatgtgaaatatgtgattg 26678527  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  26678526 gtgat 26678522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47355907 - 47355803
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  47355907 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 47355808  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  47355807 gtgat 47355803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26678491 - 26678428
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26678491 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 26678428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8373029 - 8372951
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  8373029 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 8372951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14994772 - 14994678
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  14994772 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 14994678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18167273 - 18167195
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18167273 gatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcaaatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 18167195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18246762 - 18246668
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18246762 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18246668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19998973 - 19998907
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19998973 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 19998907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 25120617 - 25120663
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaag 82  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25120617 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaag 25120663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 15274361 - 15274442
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  15274361 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 15274442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19998845 - 19998780
Alignment:
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  19998845 tgattggtgattgtgtatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtaattggtgatt 19998780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 275
Target Start/End: Original strand, 13751910 - 13751978
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 275  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13751910 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacatatgtgattggtgatta 13751978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18246250 - 18246178
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  18246250 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 18246178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47355769 - 47355705
Alignment:
Q  210 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  47355769 gattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatatgattggtgatt 47355705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7848902 - 7848776
Alignment:
Q  146 tggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgat 244  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||| |||||  ||| |    
T  7848902 tggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatctcatttgaaat-tgtgagtggtgattgtgtgcgaatagttgtggtttggt 7848804  T
Q  245 atttgttcatgacacatgtgattggtga 272  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  7848803 atttgtttaggacccatgtgattggtga 7848776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16520985 - 16520801
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||    
T  16520985 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatatagatgtaagatatcggggtgtga 16520893  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatg-tttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  16520892 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgttttaaattgaaatatccatgttaactattatttagattatgatgatgt 16520801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 392
Target Start/End: Original strand, 54120066 - 54120195
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||| | | |||||||||   ||||||    
T  54120066 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcgaatgcatgatgtt--aattgaa 54120158  T
Q  357 ttattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  54120159 atatccatgttaattgttaattggattatgttgatgt 54120195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 385
Target Start/End: Original strand, 55378691 - 55378757
Alignment:
Q  319 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatg 385  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  55378691 atattattattgattaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaacagttattggattatg 55378757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 34393727 - 34393690
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggtt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393727 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggtt 34393690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14950602 - 14950498
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  14950602 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgggtcaataagtgcatatcatatcatgagtcctatgtgaaatacgtgattg 14950503  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  14950502 gtgat 14950498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 109922 - 109828
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 306  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  109922 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 109830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15043443 - 15043381
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 186  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  15043443 gtgacgaccttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15043381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 186
Target Start/End: Original strand, 15110981 - 15111043
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 186  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  15110981 gtgacgaccttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16521080 - 16521015
Alignment:
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  16521080 tgattggtgattgtgtatgaataattgttaattgatgattattcatgatacatgtaattggtgatt 16521015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 182
Target Start/End: Original strand, 53706465 - 53706521
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatat 182  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  53706465 gtgacgaccctgaggtgatctagtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatat 53706521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16521263 - 16521168
Alignment:
Q  162 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatga-gtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 256  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  16521263 tatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgatggcttattttgaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 16521168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10487243 - 10487149
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  10487243 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 10487149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 16329508 - 16329602
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  16329508 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 16329602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 99
Target Start/End: Original strand, 17213378 - 17213420
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatctta 99  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17213378 ctcttttacttcggcgaaaatgtaagacgggtgtgaaatctta 17213420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18246465 - 18246391
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  18246465 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtggattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 18246391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24237525 - 24237479
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 102  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  24237525 actcttttacttcggcgataatgtaagacgtgcgtgaaatcttacat 24237479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Original strand, 43283140 - 43283185
Alignment:
Q  248 tgttcatgacacatgtgattggtgattattg-atgtaagatattgg 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43283140 tgttcatgacatatgtgattggtgattgttgaatgtaagatattgg 43283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 387
Target Start/End: Original strand, 5684742 - 5684802
Alignment:
Q  328 ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgat 387  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5684742 ttgatcaagtgcatgatgtttaatttgtaatattcatgttaactgttatttggattatgat 5684802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 13049739 - 13049843
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  13049739 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatatgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 13049838  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  13049839 gtgat 13049843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Original strand, 17377040 - 17377084
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  17377040 gtgatgaccttgaggtgatttggtaccacattcatatatgtgtcg 17377084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 60250 - 59865
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60250 catcatattcgtgttgatattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 60151  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  60150 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 60051  T
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat-tattgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagt 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||| |||||    
T  60050 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatgtattgatgtgagatattgggaatatgatataagt 59951  T
Q  307 atatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    || | | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  59950 at-tatttgtggatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 59865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35053515 - 35053141
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35053515 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtagaagggttgaactcttttacttatgagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 35053416  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga---- 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||        
T  35053415 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatgg 35053316  T
Q  212 ---ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
       ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||              
T  35053315 tgtttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattgtggtttg---------- 35053226  T
Q  309 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  35053225 atgtatgagaatgttattattgatcaagtacatggtgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 35053141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 22407894 - 22408162
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22407894 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacataagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtg 22407993  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 324  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22407994 tgaataattgtgaattgatatttgctcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatgagaatatta 22408093  T
Q  325 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22408094 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 22408162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 2422733 - 2422997
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  2422733 gtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 2422832  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  2422833 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaa---tat 2422929  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2422930 tattgatcaagtgtatgatgtttatattgaaatatccatgttaattgttatttggattatgttgatgt 2422997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Original strand, 5676091 - 5676355
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5676091 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactctcttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 5676190  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg----- 210  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||         
T  5676191 tgcattgaaggtgacgaccttgaggtgatacggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 5676290  T
Q  211 --attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
      |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5676291 taattggtgattgtgtatgaataattatgtattgatatttg-tcatgacacatgtgattggtgatt 5676355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41217739 - 41217544
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41217739 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttt 41217640  T
Q  298 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41217639 gatgtaagtatatttatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 41217544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 208 - 392
Target Start/End: Original strand, 5676350 - 5676535
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5676350 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagta 5676449  T
Q  308 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  5676450 tatgcatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttataatgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 5676535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41218126 - 41217945
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41218126 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactattttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 41218027  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41218026 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgtatatatctatcgataggtgcatatcatgacatgagtctt 41217945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20444420 - 20444214
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||     
T  20444420 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttga 20444321  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    | ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20444320 ttcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattgg 20444221  T
Q  216 tgattgt 222  Q
    |||||||    
T  20444220 tgattgt 20444214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20252534 - 20252342
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20252534 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatattcgttcatgatacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgat 20252435  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20252434 gtaagtattgatatgataatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 20252342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 37845956 - 37846162
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||     
T  37845956 catcatagtcatgttgaaattgtagttgtaaaagggctgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttga 37846055  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    | ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  37846056 ttcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattgg 37846155  T
Q  216 tgattgt 222  Q
    |||||||    
T  37846156 tgattgt 37846162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20530185 - 20529978
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||     
T  20530185 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttga 20530086  T
Q  116 tgcatcgaa-agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    | |||||||  | |||||| ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20530085 ttcatcgaagggggacgacgttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 20529986  T
Q  215 atgattgt 222  Q
     |||||||    
T  20529985 gtgattgt 20529978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 49966151 - 49966013
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49966151 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 49966052  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtg 264  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  49966051 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtg 49966013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Original strand, 38035130 - 38035260
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38035130 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatgtgacgacc 38035229  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38035230 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 38035260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Original strand, 13378250 - 13378395
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13378250 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttaagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 13378349  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13378350 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 13378395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 9786123 - 9786315
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  9786123 tgatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacaaatgtgattggagattattgatgtgagacattgggg-ttga 9786221  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9786222 tgtaagtacatgtatgaggatattattattgatcaagtgtatgatgtttatgatgaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 9786315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 35524082 - 35524350
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 223  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||| |||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  35524082 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcacgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtg 35524181  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 321  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||||| | |||| |||||    
T  35524182 tatgaataactgtgatttggtgattgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatgtaagtatttatatgtgaata 35524281  T
Q  322 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  35524282 tt---attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttctttggattatgatgatgt 35524350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19601836 - 19601713
Alignment:
Q  37 gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacctt 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19601836 gtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgttgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctt 19601737  T
Q  137 gaggtgatttggtaccacatgcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19601736 gaggtgattcggtaccacatgcat 19601713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 36357826 - 36357976
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  36357826 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcagagattatgtaagactggagtgaaatcttacatacgatgtttttg 36357925  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36357926 ttgcatcgaagatgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 36357976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Original strand, 37235470 - 37235600
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37235470 ttgtagctataaaatggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttaaatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 37235569  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37235570 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 37235600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20930131 - 20929955
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  20930131 gttgtaaaatggttgagctcttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttacatcggaggtgacgaccttt 20930032  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20930031 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 20929955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21193844 - 21193694
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |  |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21193844 catcatagtcatgttgagttttgtagctgtaaaagaggggtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21193745  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21193744 ttgcatcgaaggtgacaaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 21193694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22226638 - 22226459
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  22226638 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 22226540  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22226539 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 22226459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 292
Target Start/End: Original strand, 22836911 - 22837078
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22836911 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgatgattgtt 22837010  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattgg 292  Q
     ||| |||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22837011 catg-ataaatgtg-attgaagattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattgg 22837078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 329
Target Start/End: Original strand, 22250776 - 22250905
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22250776 tgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtttga 22250875  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattatt 329  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22250876 tgtaagtattgatatgagaatattattatt 22250905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 151
Target Start/End: Original strand, 8539490 - 8539584
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtac 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8539490 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8539584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 151
Target Start/End: Original strand, 8604729 - 8604823
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtac 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8604729 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8604823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22352785 - 22352601
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  22352785 gttgtaaaagggttgagctctcttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 22352687  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22352686 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22352601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Original strand, 44036401 - 44036582
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  44036401 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcaggggtggacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 44036500  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44036501 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcagtaagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 44036582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 51657986 - 51658255
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||    
T  51657986 gtgacgaccttggagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtggaatgtgaatgatgattgt 51658085  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tg--atgtaagtatatgtatgaga 318  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||  ||| | |||||||||         
T  51658086 gtatgaataaatgtgatttgataattgttcatgccacatgcgattggtgattaattgatgtaagatattggaattatggtatgaatgtatatgta----g 51658181  T
Q  319 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51658182 atattatt-gtgattaagtatatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 51658255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 165
Target Start/End: Original strand, 5769744 - 5769853
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5769744 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 5769843  T
Q  156 tgcatgtatg 165  Q
    ||||| ||||    
T  5769844 tgcatatatg 5769853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 20895390 - 20895486
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20895390 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20895486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Original strand, 20956627 - 20956776
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20956627 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 20956726  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
      ||| || |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20956727 tcatg-attattgtg-attgatgattgttcatgatacatgtgattggtgatt 20956776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 15862938 - 15863149
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  15862938 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 15863032  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 239  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |    
T  15863033 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaa 15863132  T
Q  240 ttgatatttgttcatga 256  Q
    |||||| ||||||||||    
T  15863133 ttgataattgttcatga 15863149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20821590 - 20821476
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20821590 actcttttacttcggcgataatgtaagacgggcgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgataccaca 20821491  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20821490 tgcatatatgtgtcg 20821476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18505817 - 18505646
Alignment:
Q  220 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaa 319  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   |||| |      
T  18505817 tgtgaatgaatatttgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatatttgggtgtgatgtaagtattaatatgtg-t 18505719  T
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18505718 gattattattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 18505646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 5471872 - 5472028
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||| | |  | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5471872 catcatagtcatgttgagtcttgaagttgtaaatgaggggtactcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttg 5471971  T
Q  115 ttgcatc-gaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5471972 ttgcatcatggggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 5472028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 9785899 - 9785995
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  9785899 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 9785995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21716707 - 21716430
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||  ||| |  || ||||||| | |||||    
T  21716707 gtgacgaccttgagataatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtctatttggtgaattgtgattggtaattgt 21716609  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt------tga-tgtaagtatatgtat 314  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||      ||  |||  |||||| |||    
T  21716608 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagattatggtatgtgtgtgtgtatatatat 21716509  T
Q  315 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  21716508 atgaatattattattgatcaagtacatgatgtttataatgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 21716430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20526791 - 20526725
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20526791 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaatggttgagctcttttacttcggagattatgtaag 20526725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Original strand, 41213197 - 41213311
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41213197 actcttttacttcgatgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttattgtatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 41213296  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  41213297 tgcatatatgtgtcg 41213311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 366
Target Start/End: Original strand, 20895514 - 20895660
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                        
T  20895514 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgtttatgacacatgtgattggtgattattga-------------------- 20895593  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgt 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20895594 tgtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgt 20895660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 22144923 - 22145036
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 156  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144923 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaattttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 22145022  T
Q  157 gcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||| |||| ||||    
T  22145023 gcatatatgtgtcg 22145036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41217867 - 41217793
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41217867 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 41217793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 15863325 - 15863508
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  15863325 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 15863417  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15863418 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatggttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 15863508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21857934 - 21857753
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||     ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21857934 tgataaatgtgattggtgattatgaatgaatatttgtgcattgataattgttca-----catg--attgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 21857842  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21857841 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatacatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 21857753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 256
Target Start/End: Original strand, 22250622 - 22250752
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||   | |||||||||  || |||| |    
T  22250622 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgtgtcatatttggaaatgtgattggagactgtgaa 22250721  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 256  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22250722 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22250752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17147003 - 17146820
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| | |||| ||||| |||    
T  17147003 tgatatacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgaaatatcggggtgtga 17146911  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17146910 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17146820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27673355 - 27673257
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27673355 gtgacgcccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcatatcatgacatgagtctatttgataaatgtgattgatgattgt 27673257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22365252 - 22365155
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  22365252 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 22365155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17147362 - 17147258
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17147362 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 17147263  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  17147262 gtgat 17147258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22352570 - 22352498
Alignment:
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22352570 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 22352498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 15863221 - 15863295
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15863221 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatacatgtaattggtgatt 15863295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22352468 - 22352285
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||        |||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22352468 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgaaaattgttcata-------tgattgatgaatattgatatgagatattggggtgtga 22352376  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||  |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  22352375 tgtaagtattaatgcgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgataatgt 22352285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21858035 - 21857966
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga 211  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21858035 gatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgacatatgtga 21857966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 35935166 - 35935239
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35935166 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 35935239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 7642105 - 7642270
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 153  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  7642105 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagtccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 7642203  T
Q  154 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  7642204 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaattatgtgattggtgat 7642270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17003396 - 17003302
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17003396 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17003302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22365074 - 22364943
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 356  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  22365074 catgtgatggatgattattgacgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaa 22364980  T
Q  357 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  22364979 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 22364943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22034503 - 22034325
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22034503 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22034406  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  22034405 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 22034325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45050324 - 45050185
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||| ||||||  || |||||||||||||    
T  45050324 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgatgaccttttggagatttggtaccac 45050230  T
Q  155 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
    |||||| |||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||    
T  45050229 atgcatttatgtgtcaacaagtgcatatcataacatgagtcttat 45050185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 360
Target Start/End: Original strand, 20589963 - 20590078
Alignment:
Q  247 ttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgat 344  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||| || || ||||     
T  20589963 ttgttcatgatacatgcgattggtgatttattgatgtgagatattgtgattatgatataagtatatacatgtggatattattattgattaaatatatgag 20590062  T
Q  345 gtttatattgaattat 360  Q
     |||| ||||||||||    
T  20590063 atttaaattgaattat 20590078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22080240 - 22080190
Alignment:
Q  343 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22080240 atgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 22080190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41393023 - 41392929
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||   ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41393023 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagtatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 41392929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51451184 - 51451090
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  51451184 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 51451090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 20826805 - 20826909
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  20826805 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 20826904  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  20826905 gtgat 20826909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Original strand, 5073884 - 5073963
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  5073884 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 5073963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18505855 - 18505816
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18505855 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatg 18505816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Original strand, 18602627 - 18602706
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  18602627 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 18602706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20444123 - 20444085
Alignment:
Q  270 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20444123 tgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 20444085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20529863 - 20529825
Alignment:
Q  270 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20529863 tgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 20529825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Original strand, 77632 - 77677
Alignment:
Q  126 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  77632 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 77677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 308
Target Start/End: Original strand, 37846241 - 37846286
Alignment:
Q  263 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37846241 tgattgatgatcattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 37846286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27673260 - 27673216
Alignment:
Q  247 ttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  27673260 ttgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatatt 27673216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12874 - 12488
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12874 catcatagtcgtgttgagattgtagtcataaaaggcttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 12775  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  12774 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcctatttggaaatgtgattgg 12675  T
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg---tttgatgtaag------ 305  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||   |||||||||||          
T  12674 tgattgtgtatgaataattttgaattaat-gttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggggttttgatgtaagtatata 12576  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12575 tatatatatgagaatattattattcatcaagtgcatgatgtctatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 94)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6878117 - 6877821
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6878117 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 6878018  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  6878017 tgcatcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccaaatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 6877918  T
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagata-ttggggtttgatgtaagtatat 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6877917 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgaatggtgatttattaatgtcagatatttgggttttgatgtaagtatat 6877821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 36892360 - 36892628
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36892360 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 36892459  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892460 tgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtaagctattggggttttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 36892559  T
Q  325 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36892560 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 36892628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 25877618 - 25877882
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25877618 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgatatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 25877717  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||   |||| |||   |||    
T  25877718 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgcgagatattggggattgatgtaagtattgttatgtgaa---tat 25877814  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25877815 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 25877882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8886814 - 8886450
Alignment:
Q  17 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8886814 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgtt 8886715  T
Q  117 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgat 216  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8886714 gcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatgtgtgattggt 8886615  T
Q  217 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtat 314  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||  |||| |    
T  8886614 gattgtgagtgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgcgagatattggagtgtgatgtaggtattgatgtgt 8886522  T
Q  315 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8886521 g-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgt 8886450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22862158 - 22861923
Alignment:
Q  20 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22862158 atagttgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgca 22862059  T
Q  120 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||   |  |||||||| ||||    
T  22862058 tcgaaggtgacgaccttgaggtgatctcgtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgattcttatttggaagtgtgattggtgat 22861959  T
Q  220 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 255  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  22861958 tgtgaatgaatatttgtgaattgataatcgttcatg 22861923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25600635 - 25600431
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25600635 catcatagtctcgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 25600536  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  25600535 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtaatatggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttgg 25600436  T
Q  216 tgatt 220  Q
    |||||    
T  25600435 tgatt 25600431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 24088880 - 24089120
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24088880 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacgtcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgacgacc 24088979  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  24088980 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatg-ata 24089078  T
Q  232 attgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    | |||| ||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24089079 aatgtg-attgatgattgttcatgataaatgtgattgatgatt 24089120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 19434958 - 19435144
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19434958 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgaaaaagggttgagctcttt-acttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacgtacgatgtttttg 19435056  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19435057 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttgataccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttatt 19435144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Original strand, 42180210 - 42180402
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  42180210 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 42180309  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  42180310 gtaagtattgatatgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 42180402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 253
Target Start/End: Original strand, 43644471 - 43644688
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||  ||| | || |||| ||||||| ||    
T  43644471 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgaagattatgtgaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgcttgattcaacgaaggtgacgatct 43644570  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattg 235  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  43644571 tttggagatttggtaccacatgcatatatgcgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttg 43644670  T
Q  236 tgtattgatatttgttca 253  Q
    || ||||||| |||||||    
T  43644671 tgaattgataattgttca 43644688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19658625 - 19658470
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19658625 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 19658526  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19658525 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 19658470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 21276342 - 21276535
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21276342 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatcgatgtgagatattggggtttga 21276441  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   | || |||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21276442 tgtaagtattgatgtgggaatatgattattgatcaaatgcatgatgcttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 21276535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15632071 - 15631864
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |     
T  15632071 catcatagtcgtgttgtatttgtagttgtaaaagggttaagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgttcaaga 15631972  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
     ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15631971 ggcatcaaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgcatttttgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgataaatgtgattg 15631872  T
Q  215 atgattgt 222  Q
     |||||||    
T  15631871 gtgattgt 15631864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24966609 - 24966425
Alignment:
Q  206 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24966609 atgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaag 24966510  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  24966509 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaacttttatttggattatgatgatgt 24966425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Original strand, 4795 - 4925
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4795 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 4894  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4895 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 4925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25304244 - 25304094
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25304244 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttaagctattttacttcggagattatgtaagaagggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 25304145  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25304144 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 25304094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 377
Target Start/End: Original strand, 12638003 - 12638171
Alignment:
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12638003 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattagtgattattgatgtgagacattggggtttgatgtaagtat 12638102  T
Q  309 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
       | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  12638103 tgatgtgggaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 12638171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27260257 - 27260130
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27260257 catcatagtcatgttgtgtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27260158  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtga 143  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27260157 tgcatcaaaggtgacgaccttgaggtga 27260130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 207 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21140325 - 21140139
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 306  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21140325 tgtgattgatgattgtaaatgaatacttgtgaattgatatttgttccttatacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 21140226  T
Q  307 atatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||   | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  21140225 attgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 21140139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Original strand, 23823027 - 23823157
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23823027 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23823126  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23823127 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23823157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Original strand, 23824971 - 23825101
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23824971 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23825070  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23825071 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23825101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Original strand, 23832106 - 23832236
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23832106 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23832205  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23832206 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23832236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 43641502 - 43641346
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  43641502 catcatagtcatgttgagtcttgtagccgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgttttta 43641403  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 171  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  43641402 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcga 43641346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7319989 - 7319718
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  7319989 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 7319890  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    |||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  ||| | |||| || | | ||    
T  7319889 gtatgaatgaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggattatg--gtatgaatatatacgtggat 7319792  T
Q  321 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7319791 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 7319718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 19670629 - 19670778
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  19670629 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tcttg 19670727  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  19670728 atgcatcgaaggtgacgaccttgaggagattcggcaccacatgcatttatg 19670778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22282782 - 22282601
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  22282782 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 22282683  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22282682 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 22282601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 24296071 - 24296221
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| |    
T  24296071 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcggagattatgtaagacttgggtgaaatcttacatacgatgttttag 24296170  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24296171 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 24296221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28972543 - 28972272
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  28972543 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 28972445  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggttt--gatgtaagtatatgtatgagaa 319  Q
    | |||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||  ||  | | || |||||| | || |||    
T  28972444 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcaggacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaattttgggaattatggtatatgtatatatgtgtgaa 28972345  T
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28972344 tattattattgatcaagtacatgatgttta-attgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 28972272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 31832 - 32102
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31832 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 31931  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaata 321  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||   ||  | ||| | |||| |||| | |||    
T  31932 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacatatgtgactggtgattatttgatgtgagatattgaaattata-gtatgaatatatatgtg-ata 32029  T
Q  322 ttattattg-atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32030 ttattatcgaattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22273547 - 22273368
Alignment:
Q  38 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||||    
T  22273547 tagttgtaaaagagttgagctcttttacttaagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgacct 22273448  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22273447 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 22273368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 274
Target Start/End: Original strand, 12643600 - 12643758
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  12643600 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattgg 12643699  T
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12643700 tgattgtgtatgaatatttctgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12643758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 12643812 - 12644000
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12643812 tgatgtatatgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagacattggggtttga 12643911  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  12643912 tgtaagtat-tg-atgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgt 12644000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 269693 - 269422
Alignment:
Q  124 aagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgatt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| | |||    
T  269693 aagtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtaatt 269595  T
Q  221 gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgaga 318  Q
    ||| || ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | |  || | || ||||||  ||| ||    
T  269594 gtgcataaatatatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagatcatggtatatgtatat--atgtga 269497  T
Q  319 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  269496 atattgttattgatcaaattcatgatgtttatatttaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 269422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25600401 - 25600309
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25600401 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgg 25600309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 392
Target Start/End: Original strand, 24573051 - 24573320
Alignment:
Q  127 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 223  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  24573051 tgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgggtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgaagattgtg 24573150  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 321  Q
     || ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |  ||| | ||||| | ||   ||     
T  24573151 cataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatagtgtgaatatatttgtg---att 24573247  T
Q  322 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||  ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24573248 ttattatcggattaaatacatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 24573320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15631812 - 15631702
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15631812 tgatatatatgattgataatggtgtatgaataattgtaagttgatattcgttcatgacacatgtgattggagattattgatgtgagatattggagtttga 15631713  T
Q  300 tgtaagtatat 310  Q
    |||||||||||    
T  15631712 tgtaagtatat 15631702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22692949 - 22692768
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  22692949 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgacctta 22692851  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgat 219  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22692850 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22692768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22697596 - 22697415
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  22697596 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgacctta 22697498  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgat 219  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22697497 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22697415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 22581588 - 22581858
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22581588 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatttatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 22581687  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | || ||| | | ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | || |  ||| | ||||| | ||   ||    
T  22581688 gcataaatgaatatgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgacgtgagatattgagattatagtgtgaatatatttgtg---at 22581784  T
Q  321 attattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||  ||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22581785 attattatcggattaaataaatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 22581858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Original strand, 4450084 - 4450171
Alignment:
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4450084 tatatatatgagaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 4450171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18534464 - 18534350
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18534464 actcttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgcaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacgttgaggtgatttggtaccaca 18534365  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18534364 tgcatatatgtgtcg 18534350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24272689 - 24272579
Alignment:
Q  60 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 159  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24272689 ttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgca 24272590  T
Q  160 tgtatgcgtcg 170  Q
    | |||| ||||    
T  24272589 tatatgtgtcg 24272579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Original strand, 22137341 - 22137469
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 141  Q
    |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  22137341 tgtaaaagggatgtgctcttttatttcggtgataatgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggt 22137440  T
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22137441 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 22137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 461219 - 461139
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  461219 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 461139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 3801123 - 3801306
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3801123 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 3801215  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3801216 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 3801306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 38706810 - 38706993
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||    
T  38706810 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggtgtgtga 38706902  T
Q  300 tgtaagta-tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||| ||   ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  38706903 tgtaagtacta---atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 38706993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Original strand, 9654507 - 9654579
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9654507 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgccatgagtcttattgatatatgtgattg 9654579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 12637665 - 12637843
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  12637665 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 12637762  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  12637763 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 12637843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 20629034 - 20629114
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629034 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcaagagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20629114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21140533 - 21140355
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  21140533 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 21140436  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21140435 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 21140355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34822498 - 34822315
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  34822498 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 34822406  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  34822405 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 34822315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24966770 - 24966692
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24966770 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgaatcttattgatatatgtgattggtgatt 24966692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 275
Target Start/End: Original strand, 22691607 - 22691758
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 222  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||| |||||||||    || ||||||| |||||||    
T  22691607 gtgaagaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgtgtcttattggcgaattgtgattggtgattgt 22691705  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 275  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22691706 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgatta 22691758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 275
Target Start/End: Original strand, 22696254 - 22696405
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 222  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||| |||||||||    || ||||||| |||||||    
T  22696254 gtgaagaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgtgtcttattggcgaattgtgattggtgattgt 22696352  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 275  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22696353 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgatta 22696405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 21276027 - 21276205
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  21276027 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 21276124  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  21276125 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 21276205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 12637873 - 12637940
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12637873 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12637940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Original strand, 22691823 - 22691910
Alignment:
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22691823 tatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgt 22691910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Original strand, 22696470 - 22696557
Alignment:
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22696470 tatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgt 22696557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25600260 - 25600173
Alignment:
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25600260 tatatgtgtgtgaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 25600173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 195
Target Start/End: Original strand, 24687161 - 24687322
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagt-gacga 132  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || ||||||||||| |||||    
T  24687161 ttgttgttgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaagttgacga 24687259  T
Q  133 ccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  24687260 ccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 24687322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 3800613 - 3800791
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  3800613 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 3800710  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  3800711 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3800791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8941784 - 8941712
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8941784 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 8941712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Original strand, 19888848 - 19888920
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19888848 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 19888920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25211076 - 25210909
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| || |||||| |||||| ||||| |||    
T  25211076 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatactgatgtgagatatcggggtgtga 25210984  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  25210983 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 25210909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34822854 - 34822676
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  34822854 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 34822757  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  34822756 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 34822676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34822645 - 34822578
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  34822645 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcatgatacatgtaattggtgatt 34822578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6877791 - 6877721
Alignment:
Q  323 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6877791 tattattgttcaagtgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 6877721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 19888362 - 19888456
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19888362 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19888456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Original strand, 20629142 - 20629243
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  20629142 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgtt-------catgtgattgataattattgatgtgagataatggggtgtga 20629234  T
Q  300 tgtaagtat 308  Q
    |||||||||    
T  20629235 tgtaagtat 20629243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Original strand, 43644713 - 43644814
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43644713 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgcgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 43644805  T
Q  300 tgtaagtat 308  Q
    |||||||||    
T  43644806 tgtaagtat 43644814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12726709 - 12726531
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  12726709 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 12726612  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  12726611 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 12726531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25211180 - 25211108
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga 272  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||    
T  25211180 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacaagtaattggtga 25211108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 3800822 - 3800889
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3800822 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcctgatacatgtgaatggtgatt 3800889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 5889880 - 5889974
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5889880 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5889974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 9654615 - 9654792
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  9654615 tgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtga 9654707  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||| |   ||||||||||||||| | ||||      |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  9654708 tgtaagtattaatatgtg---attattattgatcaaatgcatg------atattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 9654792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 11232835 - 11232929
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11232835 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11232929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 14908022 - 14908116
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  14908022 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 14908116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 22514682 - 22514776
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22514682 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22514776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 28777283 - 28777377
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  28777283 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 28777377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22654412 - 22654339
Alignment:
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22654412 tattattattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 22654339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 199
Target Start/End: Original strand, 24828161 - 24828218
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24828161 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24828218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 199
Target Start/End: Original strand, 24832613 - 24832670
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24832613 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24832670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 720918 - 720835
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  720918 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgtcacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 720835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8942228 - 8942124
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8942228 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaagtgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 8942129  T
Q  215 atgat 219  Q
     ||||    
T  8942128 gtgat 8942124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23773193 - 23773015
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  23773193 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23773096  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23773095 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23773015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Original strand, 17398170 - 17398249
Alignment:
Q  117 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  17398170 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 17398249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 3800969 - 3801043
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3800969 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3801043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20013695 - 20013601
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  20013695 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 20013601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22273233 - 22273164
Alignment:
Q  323 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  22273233 tattattgatcaaatacatgatgatta-attgaaatattcatgttaactgctatttggattatgataatgt 22273164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23818752 - 23818658
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23818752 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23818658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 24089074 - 24089146
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24089074 tgataaatgtgattgatgattgttcatga-taaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattgatgatt 24089146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25211429 - 25211379
Alignment:
Q  149 taccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25211429 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 25211379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 461060 - 461007
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 254  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  461060 gataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgacttgataattgttcat 461007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 308
Target Start/End: Original strand, 23806359 - 23806404
Alignment:
Q  263 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  23806359 tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtgatgtaagtat 23806404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4425
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4805 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgt 4706  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||   ||||| |         
T  4705 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtattgttttggatatgtgattg 4606  T
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaag 305  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | || ||| ||  |||||       |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  4605 gtgattggtgaatgtgtatgaataactatgaattaatgattgtt-------catgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggagtatgatgtaag 4513  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4512 tattgatatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttatattgacttattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14354 - 13964
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14354 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaattcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtcaaatcttacatacgatgtttttgt 14255  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt---------attgatata 206  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||  ||     
T  14254 tgcatcgaagatgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgatt 14155  T
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaa 304  Q
     |||||||| ||||||||||||||   ||||  |||||  |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||    
T  14154 ggtgattgacgattgtgtatgaatgtctgtgatttgatgattgttcatgacacatacgattgatgacttattaatgtgagatattggggttatgatataa 14055  T
Q  305 gtatat--gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14054 gtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 13964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31304 - 31038
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31304 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 31205  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31204 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatttttatgagaatattat 31106  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31105 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 31038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21128 - 20860
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  21128 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgtgta 21029  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatatta 324  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21028 tgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttatgattggtgattattgatgtgagatattgggattatgatgtaagtatatgtatgagaatatta 20929  T
Q  325 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    || || ||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20928 ttgttaatcaaatgcatgatgcttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 20860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 125 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28719 - 28450
Alignment:
Q  125 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  28719 agtgacgaccttgaggagatttggcaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgagt 28620  T
Q  225 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatatt 323  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28619 atgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttgtgattggtgattattgatgtgagatattcagatcatgatgtaagtctatgtatgagaatatt 28520  T
Q  324 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28519 attgttgatcaaatgcatgatgtttcaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 28450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 129700 - 129877
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||   ||||| ||||| | |||| ||| ||     
T  129700 gttgtaaaagagttgagctcttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacaatgttgagttgttccatcggaggtgaagacgttt 129799  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  129800 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 129877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 249025 - 249313
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  249025 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttaggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgt 249124  T
Q  116 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat 212  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||    
T  249125 tgcatcgaaggtgacgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgat 249224  T
Q  213 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    || |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  249225 tggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 249313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 6)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3301 - 3095
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3301 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgt 3202  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||     
T  3201 tgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattgg 3102  T
Q  216 tgattgt 222  Q
    |||||||    
T  3101 tgattgt 3095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2811 - 2737
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2811 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2939 - 2865
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2939 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2683 - 2616
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2683 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3067 - 2993
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3067 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2475
Alignment:
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2561 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 2475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 7)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5909 - 5703
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5909 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgt 5810  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||     
T  5809 tgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattgg 5710  T
Q  216 tgattgt 222  Q
    |||||||    
T  5709 tgattgt 5703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 943 - 813
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| |    
T  943 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgaagattgtgaa 844  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 256  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  843 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5547 - 5480
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5547 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5675 - 5601
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5675 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 5601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 511 - 328
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  511 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 419  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  418 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatggtaactgttatttggattatgataatgt 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5425 - 5339
Alignment:
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5425 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 5339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 641
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  715 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgatacatgtaattggtgatt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8108 - 7842
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8108 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 8009  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    | || |         
T  8008 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgagtg 7909  T
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7908 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgattggtgatt 7842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 200 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7631 - 7453
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  7631 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtgattattgatgggagatattggggttttt 7532  T
Q  298 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7531 gatgtaagtatatgtatgagaatattattcttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttat 7453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7682
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatt 277  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7759 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatt 7682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 125 - 392
Target Start/End: Original strand, 7012 - 7287
Alignment:
Q  125 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7012 agtgacgaccttgaggttatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgt 7111  T
Q  225 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgag 317  Q
     ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||      ||| ||||||    
T  7112 gtgaataattgaaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatgag 7211  T
Q  318 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  7212 aatatcattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaattattcatgttaacttttattttgattatgatgatgt 7287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 13680 - 13884
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13680 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 13779  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  13780 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgtatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttgg 13879  T
Q  216 tgatt 220  Q
    |||||    
T  13880 tgatt 13884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16103 - 15922
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  16103 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 16005  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
     || |||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16004 tggagatttgataccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 293
Target Start/End: Original strand, 13914 - 14007
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13914 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatgttggg 14007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 392
Target Start/End: Original strand, 14078 - 14154
Alignment:
Q  317 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  14078 gaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 14154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 802 - 535
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  802 gtgacgacctttaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataccatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtaattacgta 703  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  702 tgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattat 603  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  602 tattgatcaagtgcatgatgcttaaattgaaatattcatgctaactgttatttgtattatgatgatgt 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3335 - 3129
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3335 catcatagtcttgttgagtttgtagttgaaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 3236  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||     
T  3235 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcaataggtgcatatcatgccacgagtcttattgataaatgtggttgg 3136  T
Q  216 tgattgt 222  Q
    |||||||    
T  3135 tgattgt 3129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3101 - 2907
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 298  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||  ||  |    
T  3101 tgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattagtgactattgctgtgagatattggaattggg 3002  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    || || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  3001 atataggtatatttatgtgaatactattattgttcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Original strand, 3784 - 4044
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3784 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatataagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 3883  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtga 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||    
T  3884 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtattattggtgaaatgtga 3983  T
Q  212 ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984 ttgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 4044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 1046 - 1307
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1046 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgggta 1145  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   || | |||          
T  1146 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattgatacgtgaa------ 1239  T
Q  326 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||    
T  1240 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgataactattattttgattatgatgatgt 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 8)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20067 - 19799
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20067 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagtgttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 19968  T
Q  116 tgcatcgaa--agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat---- 207  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  || || |        
T  19967 tgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgatt 19868  T
Q  208 -gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 275  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  19867 ggtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattgctgatta 19799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17983 - 17776
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17983 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagtgttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 17884  T
Q  116 tgcatcgaa--agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 213  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||    
T  17883 tgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgatt 17784  T
Q  214 gatgattg 221  Q
    | ||||||    
T  17783 ggtgattg 17776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 8140 - 8293
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8140 catcatagtcatgtagagtttgttgttgtaaataggttgaactcttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 8239  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8240 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 8293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 13529 - 13682
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13529 catcatagtcatgtagagtttgttgttgtaaataggttgaactcttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 13628  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13629 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 13682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17716 - 17526
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17716 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 17617  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17616 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 17526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19746 - 19556
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19746 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 19647  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  19646 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 19556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Original strand, 8466 - 8539
Alignment:
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8466 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 8539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Original strand, 13855 - 13928
Alignment:
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13855 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 13928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27250 - 27067
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27250 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27151  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27150 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtactacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttat 27067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26954 - 26889
Alignment:
Q  312 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26954 tatgtgaatattatttttgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatt 26889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 208 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 236597 - 236412
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  236597 gtgattggtgattgtgtatgaataatggtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtcagatattggggttcgatgtaagta 236498  T
Q  308 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  236497 tatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaattgttatttgaattatgatgatgt 236412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 236857 - 236652
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  236857 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagaaaggtgtgaaatcttacatacgatgttaaagt 236758  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 215  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  236757 agcatcgaaggtgacgacctagaggtgataaggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 236658  T
Q  216 tgattg 221  Q
    ||||||    
T  236657 tgattg 236652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 270785 - 270545
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||     
T  270785 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgat 270686  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 232  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||     
T  270685 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatat 270586  T
Q  233 ttgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  270585 ttgtgaattgata-ttattcatgatacatgtaattggtgatt 270545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 270515 - 270329
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  270515 tgataaatgtgattggttattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtttga 270423  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270422 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 270329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 120
Target Start/End: Original strand, 255963 - 256007
Alignment:
Q  76 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcat 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  255963 atgtaagacgggtatgaaatcttacatttgatgtttttgttgcat 256007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28145 - 27950
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg--gttt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  28145 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtgttt 28046  T
Q  298 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28045 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 27950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28327 - 28179
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  28327 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttgatgattgagta 28228  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  28227 tgaataactgtgaattgatatttgttaatgatatatgtggttgatgatt 28179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28199 - 28125
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  28199 tgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgatt 28125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 56615 - 56369
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  56615 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtttgaattcttacatacgatgtttttgt 56516  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat--- 212  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||       
T  56515 tgcatcgaatgtgacgaccttttggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgt 56416  T
Q  213 ----tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 255  Q
        |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  56415 tgaatgatgattgtgtatgagtaactgtgaattgatgtttgttcatg 56369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 56370 - 56206
Alignment:
Q  220 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgag 317  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||             
T  56370 tgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgac-catgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtat--------- 56281  T
Q  318 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  56280 -atatttatattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 56206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3248 - 3055
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  3248 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttga 3149  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3148 tgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatttttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 477 - 281
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  477 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattgttgaggtaagatattggggttttg 378  T
Q  299 atgtaag--tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  377 atgtaagtatatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgataatgt 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 577
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  739 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 640  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 200  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  639 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3518 - 3430
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3518 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 3430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30843 - 30650
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-ga 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  30843 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggttttga 30744  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30743 tgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 30650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31090 - 31002
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31090 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 31002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8754 - 8493
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8754 catcatagtcttgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 8655  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 213  Q
    || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  || ||||    
T  8654 tgaatcggaggtgacggccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgagatt 8555  T
Q  214 gatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 275  Q
    | ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  8554 ggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacgtgtgagtggtgatta 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8387
Alignment:
Q  337 tacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8443 tacatgacgtttatagtgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 8387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 13548 - 13740
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13548 tgatatttgtgattggtgattgtgtataaataattgtgaattgatatt-gttcatgacacatgtgattagtgaatattgatgtgagatattggggtttga 13646  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13647 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 13740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 250
Target Start/End: Original strand, 13434 - 13557
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  13434 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggttcatatcatgacatgagtctt-ttgatatatgtgtttagtgattgtgta 13532  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgt 250  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||    
T  13533 tgagtaattgttaaatgatatttgt 13557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 15006 - 15271
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatga-ttgtgt 224  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||     
T  15006 gtgacgaccctgagatgattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatacatgtgactggtgatttgtga 15105  T
Q  225 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatat 322  Q
    ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||     ||    
T  15106 atgaatattagtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgattattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtatg-----at 15200  T
Q  323 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15201 tattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 15271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26642 - 26451
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  26642 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattatgaatgtgagatattgggg-ttgat 26544  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26543 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 109
Target Start/End: Original strand, 23915 - 24009
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt 109  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23915 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgt 24009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 126 - 310
Target Start/End: Original strand, 3707 - 3893
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||     
T  3707 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttgttgatatatgtgattgatgatggtgtg 3806  T
Q  226 tgaataattgtgtattgata-tttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatat 310  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3807 tgaataattgtgaattgatattttgttcatgacacatgtgattagtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatat 3893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Original strand, 3927 - 4014
Alignment:
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  3927 tatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattataatgatgt 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 4638 - 4831
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4638 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 4737  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4738 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 222
Target Start/End: Original strand, 4250 - 4435
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  4250 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 4349  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4350 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 4435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 49478 - 49671
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49478 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 49577  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49578 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 49671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 222
Target Start/End: Original strand, 49090 - 49275
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  49090 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 49189  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49190 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 49275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 126 - 285
Target Start/End: Original strand, 26416 - 26575
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26416 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 26515  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaag 285  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26516 tgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtaag 26575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Original strand, 70883 - 71003
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  70883 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagataggtgtgaaatcttccatacgatgtttttgt 70982  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgacctt 136  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  70983 tgcatcgaaggtgacgacctt 71003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 392
Target Start/End: Original strand, 66322 - 66592
Alignment:
Q  132 accttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg-------tgt 224  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||       |||    
T  66322 accttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattttgaagtgtgattggtgattgggaattgtgt 66421  T
Q  225 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatat 322  Q
    |||| ||| | || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||||||||||||   |||| ||||||    
T  66422 atgagtaactatggattgatgattgttcatgattcatgtgattggtgattaattgatatgagatattgagattatgatgtaagtattgatatgtgaatat 66521  T
Q  323 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  66522 tattattgagcaagtacatgatgattatattgaattattcatgttaaatgtcatttggattatgatgatgt 66592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 392
Target Start/End: Original strand, 26590 - 26660
Alignment:
Q  323 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  26590 tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttctttggattatgatgatgt 26660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 21633 - 21827
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21633 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacattttttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 21732  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21733 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatttatgctaactgttatttggattatgatgatgt 21827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 156183 - 156376
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  156183 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggagtttga 156282  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  156283 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 156376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 85966 - 86149
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  85966 tgataaatgtgattgttgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtga 86058  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||| |||     || ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  86059 tgtaagtattaatgtgtga-----ttgttattgatcaaatgcatgatgtttatagtgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 86149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34989 - 34811
Alignment:
Q  44 taaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggt 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  |     
T  34989 taaaaggattgaactcttttacttcg-atattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttga 34891  T
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  34890 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 34811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 156062 - 156129
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  156062 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 156129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 155937 - 156031
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  155937 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcagatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 156031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 71768 - 71922
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  71768 catcatagtcatgttgagttttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttg 71867  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  71868 ttgcatcgaatgtgacgaccttgaggtgatttggtaccacaggcatttatgcgtc 71922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Original strand, 72093 - 72166
Alignment:
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  72093 tattatcattgattaagtatatgatatttgaaatgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 72166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 209 - 392
Target Start/End: Original strand, 2474 - 2658
Alignment:
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2474 tgattggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 2573  T
Q  309 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  2574 tgatttgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgt 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4346 - 4078
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 223  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  4346 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgtatatatgtgtcgggctaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtg 4247  T
Q  224 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 321  Q
    ||||||||| ||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | |||| |||||    
T  4246 tatgaataactgtgatttggtgagtgttcatgacacatgtgattggttattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatgtatatgtgaata 4147  T
Q  322 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4146 ctatt---gatcaagcacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 4078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 200 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 77793 - 77600
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||  |||    
T  77793 tgatatatgtgattggtgattgtgcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtggttatggatgtgagatattagggttttt 77694  T
Q  298 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgat 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  77693 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaaatgttatttggattatgatgat 77600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 77977 - 77919
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  77977 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgatatgagtcttatt 77919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36047 - 35999
Alignment:
Q  247 ttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36047 ttgttcatgatacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggg 35999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 2112 - 2262
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 115  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2112 catcatagtcatgtagagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 2211  T
Q  116 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgc 166  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  2212 tgaatcgaaggtgacgatcttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgc 2262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Original strand, 2438 - 2511
Alignment:
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2438 tattatcattgattaagtatatgaaatttggattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 2511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15032 - 14849
Alignment:
Q  209 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta 307  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15032 tgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagta 14933  T
Q  308 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  14932 tatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 14849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 106409 - 106559
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  106409 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttg 106508  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  106509 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 106559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 113902 - 114150
Alignment:
Q  146 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattga 243  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||| |||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||||| ||||| | ||  |||     
T  113902 tggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcaagacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtgtataaataactatgatttgg 114001  T
Q  244 tatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacat 341  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | |||| |||||||   |||||||||||||||    
T  114002 tgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatttatatgtgaatatt---attgatcaagtacat 114098  T
Q  342 gatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  114099 gatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 114150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Original strand, 6649 - 6830
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  6649 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 6747  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6748 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 6830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 130522 - 130409
Alignment:
Q  57 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 156  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130522 ctcttttacttcggtgataacgtaagaccggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 130423  T
Q  157 gcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||| |||| ||||    
T  130422 gcatatatgtgtcg 130409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59117
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  58936 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacataagatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 59034  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
         |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  59035 ttaaaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 59117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 108156 - 108058
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  108156 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaacttggtgcacatcatgacatgagtcttattgggaaatgtgattgatggttgt 108058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 201 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17928 - 17735
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttga 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |  |||    
T  17928 gatatatgtgattggtgattgtgtattaataactgttaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaggtattgggataatga 17829  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  17828 tataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatggtgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattttgatgatgt 17735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18055
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  18151 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 18055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 499 - 683
Alignment:
Q  206 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 305  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  499 atgtgattggtgatggtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattggggtttgatgtaag 598  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  599 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29830 - 29653
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29830 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataacggtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 29731  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 377  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  29730 tgtaagtattgatttgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 29653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 68964 - 68785
Alignment:
Q  55 aactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  68964 aactcttttacttgggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatggtaccac 68865  T
Q  155 atgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 232  Q
    |||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  68864 atgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtgtatgaataa 68785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 68773 - 68597
Alignment:
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattat-tgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgta 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | ||    
T  68773 tgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacatgtgattggtgattaactgatgtgagaaattgggattatgatataagtatttata 68674  T
Q  314 tgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatga 389  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  68673 tgcgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 68597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 69441 - 69394
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactctttt 63  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  69441 catcatagtcatgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactctttt 69394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30531 - 30314
Alignment:
Q  175 gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 273  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||| |||||||    
T  30531 gtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatatgattgataattgtgtgtgaataaatgtg-attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgat 30434  T
Q  274 t-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaatt 371  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||   ||| | |||| |||| | ||||||||||  ||| || | |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  30433 tgattgatgtgagata-tggggattatagtatgaatatatatgtg-atattattatcggattaaatgcatgatatttgaattgaattattcatgttaatt 30336  T
Q  372 gttat-tggattatgatgatgt 392  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  30335 attatatagattatgatgatgt 30314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33580 - 33395
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  33580 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 33481  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  33480 tgtaagtat--------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 33395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Original strand, 32688 - 32869
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  32688 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 32787  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32788 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 32869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33848 - 33725
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||| | |||     
T  33848 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgagtatgtg 33749  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttg 249  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  33748 tgaataattgtgaattgatgtttg 33725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 39264 - 39449
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  39264 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 39363  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  39364 tgtaagtat--------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 39449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40156 - 39975
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  40156 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 40057  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40056 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 39975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 249
Target Start/End: Original strand, 38996 - 39119
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||| | |||     
T  38996 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgagtatgtg 39095  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttg 249  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  39096 tgaataattgtgaattgatgtttg 39119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7175 - 6984
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  7175 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacgtgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 7076  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatga 389  Q
    |  ||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7075 agataagtatacatgtatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 6984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7298 - 7214
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7298 gtgacgaccttgaggtgatttagtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 7214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 4842 - 4991
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4842 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcggagattatgtatgacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 4941  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4942 ttgcatc-aaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 4991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 243 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23190 - 23040
Alignment:
Q  243 atatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatg 342  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23190 atatttgttcagaacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatg 23091  T
Q  343 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23090 atgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 23040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16445 - 16376
Alignment:
Q  324 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16445 attattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Original strand, 2627 - 2869
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  2627 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 2726  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtg--catatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaat 230  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  2727 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcacatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaat 2826  T
Q  231 aattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    | ||||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  2827 atttgtg-attaatgattattcatgatacatgtaattggtgatt 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 2899 - 3083
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtaagatattggggtttg 298  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  2899 tgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattgatgtgagatatcggggtgtg 2991  T
Q  299 atgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt-ggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||  |||| |||     |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2992 atgtaagtattaatgtgtga-----ttattaatgatcaagtgcattatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 19248 - 19489
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtatt 241  Q
    |||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||    
T  19248 gatttgataccacatgcatatatgtggcgataggtgcatatcatgacatgagtctttttgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaatt 19347  T
Q  242 gatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtac 339  Q
    |||| |||||       ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |    
T  19348 gataattgtt-------catatgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgc 19435  T
Q  340 atgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19436 atgatgtttatattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgt 19489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 94495 - 94335
Alignment:
Q  202 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgat 300  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| || ||||    
T  94495 atatatgtgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattgggattatgat 94396  T
Q  301 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattatt 361  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  94395 ataattatatatatgagaatattattattgatccagtacatgatgtttgaattgaattatt 94335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 94742 - 94695
Alignment:
Q  175 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  94742 gtgcatatcatgacatgagtcttatatataaatgtgattggtgattgt 94695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Original strand, 90600 - 90748
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  90600 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccaaatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgtgta 90699  T
Q  226 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90700 agaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 90748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 78337 - 78228
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  78337 ttgtagttgtaaaagggttcagctcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 78238  T
Q  135 ttgaggtgat 144  Q
    ||||||||||    
T  78237 ttgaggtgat 78228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 90802 - 91018
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-g 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  90802 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattggggttttg 90901  T
Q  299 atgtaag----------------------tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta- 375  Q
    |||||||                      ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  90902 atgtaagtatatacatatatatatatatatatatatatatgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttat 91001  T
Q  376 ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||    
T  91002 ttggattatgatgatgt 91018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 129026 - 128867
Alignment:
Q  58 tcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  129026 tcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 128932  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  128931 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgttataggtgattgatgat 128867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 128804 - 128730
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  128804 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 128730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 145195 - 145016
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||    
T  145195 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgacc 145096  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  145095 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattg 145016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 147454 - 147275
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||| ||||    
T  147454 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgatgacc 147355  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  147354 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattg 147275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 144980 - 144926
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 254  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  144980 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 144926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 147239 - 147185
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 254  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  147239 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 147185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 7153 - 7303
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgagattg-tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7153 catcatagtcatgttgagtctggtagtcgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttg 7252  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7253 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 7303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Original strand, 7416 - 7489
Alignment:
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7416 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 7489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Original strand, 78342 - 78472
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  78342 ttgtaggtgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacaacc 78441  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  78442 ttgaggtgattcagtaccacatgcatttatg 78472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 118094 - 118244
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  118094 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagatggctgtgaaatcttacatacgatgtttttg 118193  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 165  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  118194 ttgaatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcagtaccacatgcatatatg 118244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 163901 - 163817
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163901 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 163817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 54300 - 54118
Alignment:
Q  38 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||||     
T  54300 tagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcagagattatgtaagctgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaagtgacgaccttt 54202  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 220  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  54201 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgatt 54118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109799
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  109582 gttgtaaaatggttgatctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 109680  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtg 237  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||||| |||||    
T  109681 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgatttgagattgtgaatgaatatttgtg 109780  T
Q  238 tattgatatttgttcatga 256  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  109781 aattgataattgttcatga 109799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 109897 - 109971
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109897 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 109971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54112 - 54011
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  54112 tgataaatgtgattggtgatagtgaattaataattgtgaattgataattgttcatg-------tgattggtgattattgatgtgagatattggagtgtga 54020  T
Q  300 tgtaagtat 308  Q
     ||||||||    
T  54019 cgtaagtat 54011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Original strand, 110002 - 110055
Alignment:
Q  201 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 254  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  110002 gatatatgtgattagtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 110055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Original strand, 197600 - 197778
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  197600 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtcttt-tatcatcgaaggtgacgacct 197698  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
    |  || |||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  197699 tttggagatttggtaccacatgtatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 197778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 85056 - 84942
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85056 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 84957  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  84956 tgcatatatgtgtcg 84942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26194 - 26080
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26194 actcttttacttcggtgataatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacctttaggtgatttggtaccaca 26095  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcg 170  Q
    ||||| |||| ||||    
T  26094 tgcatatatgtgtcg 26080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1925 - 1652
Alignment:
Q  123 aaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgat 219  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  1925 aaagagacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgat 1826  T
Q  220 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgaga 318  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||| | |||| |||| |     
T  1825 tgtgcatgaataaatgtgatttgaagattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagatattgggattata-gtatgaatatatatgtg- 1728  T
Q  319 atattattattg-atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1727 atattattatcgaattaagtacatgatgtttaaattaaattactcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16961 - 16826
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16961 tgatgtatatgattggtgattgtgtgtgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtttga 16862  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 335  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  16861 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaa 16826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17128 - 17070
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17128 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 17070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 25101 - 25274
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25101 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagaggtgtgctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttg 25200  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 186  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  25201 ttgcatttaaggtgacgaccttgaggtgattttgtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 25274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34128 - 34006
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  34128 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacaggtgtgaaatgttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgact 34029  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatg 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  34028 ttgaggtgattcggtaccacatg 34006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Original strand, 217246 - 217426
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  217246 tgtaattgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggg-gtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 217344  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  217345 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 217426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5396 - 5221
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 307  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5396 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 5304  T
Q  308 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  5303 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 5221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5755 - 5661
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  5755 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 5661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3393 - 3244
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3393 actcttatacttcggtgattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctagaggtgatttggtaccaca 3294  T
Q  156 tgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg---acatgagtcttatt 200  Q
    ||||| |||| |||||  || ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3293 tgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttcacatgagtcttatt 3244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 9930 - 10122
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9930 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttattcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10029  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| |   | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||  || |||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  10030 tgtaagtgttgatttgagaataatattatcgataaagtgcatgatg-ttaaattgaaaaatacatgttaactgtcatttggattatgataatgt 10122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Original strand, 11532 - 11716
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 135  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  11532 tgtagttgtaaaagggtggt--tcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 11628  T
Q  136 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  11629 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatgacatgagtcttatttgatgtatgtgattggtgattgt 11716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 308
Target Start/End: Original strand, 11796 - 11845
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  11796 catgtgattgatgattattgatgagaaatattggggtgtgatgtaagtat 11845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4501 - 4320
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  4501 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 4403  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4402 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6123
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6386 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 6287  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaata 321  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  | ||| | |||| | || | |||    
T  6286 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcataacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattata-gtatgaatatatgtgtg-ata 6189  T
Q  322 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatg 385  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  6188 ttattatcggattaagtacatgatatttaaattgaattactcatgttaatttttatgtggattatg 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 5102 - 5274
Alignment:
Q  43 gtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgagg 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||  ||||||| ||||||||  ||||  ||||| | |||||||||||  ||    
T  5102 gtaaaagggttgagctcttttactttggagattatgtaaggcggcagtgaacccttacatacgatgtttacttgtc-catcggaggtgacgaccttttgg 5200  T
Q  141 tgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5201 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattg 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 214
Target Start/End: Original strand, 12788 - 12876
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12788 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 164
Target Start/End: Original strand, 14101 - 14250
Alignment:
Q  16 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  14101 catcatagtcatgttgagtcttgaagttgtaaaagaggggtactcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttg 14200  T
Q  115 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 164  Q
    |||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14201 ttgcatcatgggtaacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 14250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 276
Target Start/End: Original strand, 15935 - 16011
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattat 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15935 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaacaactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattat 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Original strand, 15833 - 15907
Alignment:
Q  148 gtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||    
T  15833 gtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacgtgagtcttattcataaatgtggttggtgattgt 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51690 - 51511
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||| ||||||  |    
T  51690 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtcaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgatgaccttttg 51592  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51591 gagatttggtaccacgtgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 51511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 21158 - 21288
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-- 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  21158 tgatatatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggttttt 21250  T
Q  298 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 21288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 20906 - 21002
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20906 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttaatgatatatgtgattggtgattgt 21002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 21030 - 21104
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 21104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 3125 - 3395
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||| |||||  || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||| | |||||||     
T  3125 gtgacgaccttgaagtgaaatggtatcacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaattatgattgc 3223  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 320  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||  ||| | |||| |||| | ||    
T  3224 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgagattatg--gtatgaatatatatgtggat 3321  T
Q  321 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  3322 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 6410 - 6583
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
T  6410 tgataaatgtggttggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgat------------------- 6490  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6491 -gtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 6583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6406
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6310 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattaatgattgt 6406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 392
Target Start/End: Original strand, 22 - 119
Alignment:
Q  296 ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  22 ttgatgtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14958 - 14779
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  14958 gttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggtgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 14860  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14859 gagatttggttccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28479 - 28300
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  28479 gttgtaaaagggttgagctcttttaattcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 28381  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| ||| |||  || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28380 gagatttggtgccacatgcatttatgtgtcaataaatgaatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 28300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 211
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  346 ttgtggttgtaaaagggacgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 247  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  246 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5401 - 5266
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  5401 ttgtggttgtaaaagggacgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 5302  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5301 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 5266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3934 - 3799
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  3934 ttgtggttgtaaaagggatgtgctcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 3835  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3834 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 3799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4686 - 4568
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  4686 ttgtagttgtaaaagggttgggctcttttacttcagagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacc 4588  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccac 154  Q
    | |||||||||  |||||||    
T  4587 tggaggtgattcagtaccac 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 208 - 392
Target Start/End: Original strand, 75550 - 75727
Alignment:
Q  208 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaag 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  75550 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatatgagatattggggttatgatgtaag 75649  T
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |         |||| |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  75650 tatatat---------ttatga-cgatcaagtacatgatgtttgaattaaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 75727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 197
Target Start/End: Original strand, 72106 - 72177
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt 197  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  72106 gtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 72177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 1
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| |    
T  126 tgtagttgtaaaagggttgagcttttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgagc 27  T
Q  135 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 160  Q
    ||  || |||||||||||||||||||    
T  26 ttttggagatttggtaccacatgcat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25718 - 25594
Alignment:
Q  211 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtata 309  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  25718 attgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtatt 25619  T
Q  310 tgtatgagaatattattattgatca 334  Q
      |||| ||||||| ||||||||||    
T  25618 gttatgtgaatatttttattgatca 25594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25799 - 25735
Alignment:
Q  210 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  25799 gattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatatgattggtgatt 25735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 106660 - 106479
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  106660 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgatcccttacatatgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 106562  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  106561 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgacttatgtgattggtgat 106479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27352 - 27169
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||        |||| | ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  27352 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgctcata-------tgatcgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 27260  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  27259 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 27169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32093 - 31925
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 222  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| |||||    
T  32093 gtgacgaccttgaggtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattgataattgt 31995  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 291  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31994 gtatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattg 31925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31850 - 31776
Alignment:
Q  317 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  31850 gaatattattattgatcaagtgcatgaag-ttaaattgaaatattcatg-taaatgttatgtgggttatgatgatgt 31776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1469
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 139  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  1292 gttgtaaaagagttgagctcttttactttggagattatgtaag----gagtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 1386  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattg 221  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  1387 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattg 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 35
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc-ttga 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | ||||||||| ||      
T  215 gttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttt 117  T
Q  139 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    || || |||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  116 ggagaattggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtggttggtgat 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40098 - 40010
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40098 gtgacaaccctgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 40010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37697 - 37627
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  37697 attattattgatcaaatgcatgatgttaat--tgaattattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 37627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 56026 - 55922
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  56026 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggggattttgtaccaca 55927  T
Q  156 tgcat 160  Q
    |||||    
T  55926 tgcat 55922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44443 - 44288
Alignment:
Q  204 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 302  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | || |||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  44443 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgtttattgatgtgagatattggggttttggtgt 44351  T
Q  303 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 365  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  44350 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatg 44288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 52597 - 52457
Alignment:
Q  219 ttgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |    
T  52597 ttgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgattgatgactattgatctgagatattggggttttgatttaagtatatgcatgtg 52505  T
Q  318 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 365  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  52504 aatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatg 52457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41371 - 41190
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||  ||||||| |||||||    |||| ||||| | ||||||||    
T  41371 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgtagattatgtaaggcaggggtgaacccttacatacgatgttgagctgttccatcggaggtgacgac 41272  T
Q  134 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc-ttattgatatatgtgattg 214  Q
    |||  || |||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||  ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  41271 cttttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatccagacataagtctttttttatatatgtgattg 41190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Original strand, 9426 - 9607
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt-tgcatcgaaagtgacgaccttga 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||  ||| ||    | | ||||| | |||| ||||||      
T  9426 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggggttgaacccttacatatgatattgacatgtccatcggaggtgatgacctttt 9525  T
Q  139 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9526 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaaaaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 145413 - 145283
Alignment:
Q  146 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattga 243  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   | |||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  145413 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgagtagtgattgtgtatgaataactgtgaattga 145314  T
Q  244 tatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  145313 tgatttttcatgacacatgtgattggtgatt 145283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 145060 - 144987
Alignment:
Q  320 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  145060 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattaatcatgttaattgttatgtggattatgataatgt 144987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7641 - 7465
Alignment:
Q  40 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||  |||| || |||||||   ||| | ||||  | |||| ||||||     
T  7641 gttgtaaaagggttgaactcttttactttggagattatgtaaggctggggtgaacccttatatacgatgttgacttg-tccatcagaggtgatgaccttt 7543  T
Q  138 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 214  Q
     || |||||||||| |||||||| |||| ||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7542 tggagatttggtacgacatgcatttatgtgtcaacaagtacatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 365
Target Start/End: Original strand, 12989 - 13085
Alignment:
Q  270 tgattattgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  12989 tgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 13085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31192 - 31120
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  31192 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31391 - 31333
Alignment:
Q  216 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 274  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  31391 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 31333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1509
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1587 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1427 - 1298
Alignment:
Q  259 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  1427 catgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 1335  T
Q  357 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  1334 atattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Original strand, 52771 - 52837
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  52771 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacat 52837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Original strand, 56723 - 56789
Alignment:
Q  36 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  56723 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacat 56789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 804
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  987 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 895  T
Q  300 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  894 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgt 804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 219
Target Start/End: Original strand, 1 - 94
Alignment:
Q  127 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 264 - 448
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| |||| | ||    
T  264 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattggtcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcgggggtgtg 356  T
Q  299 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  357 atgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgt 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Original strand, 15167 - 15239
Alignment:
Q  321 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15167 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 15239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6898
Alignment:
Q  142 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6826 gatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatatgattg 6898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 392
Target Start/End: Original strand, 6934 - 7115
Alignment:
Q  200 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |       ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  6934 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattggt-------catatgattgatgactattgatgtgagatattgggatgtga 7026  T
Q  300 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 392  Q
     ||||||||  |||| ||     |||| |||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7027 agtaagtattaatgtgtg-----attactattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 7115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Original strand, 4639 - 4725
Alignment:
Q  306 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4639 tatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgaag-ttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgt 4725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 275
Target Start/End: Original strand, 4528 - 4596
Alignment:
Q  207 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 275  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4528 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgatta 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30009 - 29855
Alignment:
Q  42 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  30009 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 29911  T
Q  140 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 195  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  29910 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 29855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 219
Target Start/End: Original strand, 17586 - 17771
Alignment:
Q  35 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacga 132  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| ||||||    
T  17586 ttgttgttgtaaaagggatga-ctcttttactttg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacga 17683  T
Q  133 ccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    |||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17684 ccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37862 - 37768
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37862 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 4578 - 4532
Alignment:
Q  56 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  4578 actcttttacttcggagataatgtaagacggacgtgaaatcttacat 4532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 275
Target Start/End: Original strand, 2839 - 2989
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  2839 gtgacgaccttgaggtgaat-ggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 2936  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 275  Q
    |||||||||| ||||  |||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  2937 gtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 2989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 275
Target Start/End: Original strand, 26542 - 26692
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 222  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  26542 gtgacgaccttgaggtgaat-ggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 26639  T
Q  223 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 275  Q
    |||||||||| ||||  |||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  26640 gtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 26692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Original strand, 3160 - 3254
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  3160 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12329 - 12285
Alignment:
Q  76 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12329 atgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcat 12285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25476 - 25382
Alignment:
Q  126 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  25476 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 25382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7299
Alignment:
Q  351 attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7341 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7125 - 7049
Alignment:
Q  145 ttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatat-atgtgattgatga 218  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  7125 ttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcataacatgagtctatttgatgtaatgtgattgatga 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University