View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1350R-Insertion-14 (Length: 827)

Name: NF1350R-Insertion-14
Description: NF1350R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1350R-Insertion-14
NF1350R-Insertion-14
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (312-813)||(17960131-17960631)
chr3 (314-813)||(38810833-38811325)
chr3 (342-816)||(12952921-12953397)
chr3 (364-813)||(39656506-39656953)
chr3 (392-813)||(16880131-16880552)
chr3 (312-813)||(11328784-11329280)
chr3 (93-311)||(18014924-18015142)
chr3 (316-812)||(14059035-14059528)
chr3 (312-813)||(17139436-17139936)
chr3 (525-813)||(47784580-47784872)
chr3 (362-807)||(17191519-17191965)
chr3 (455-780)||(30207287-30207613)
chr3 (364-698)||(12488659-12488993)
chr3 (364-807)||(3576261-3576705)
chr3 (533-813)||(11882038-11882316)
chr3 (350-769)||(9590617-9591035)
chr3 (9-125)||(19350439-19350555)
chr3 (312-776)||(12560092-12560555)
chr3 (214-311)||(19350020-19350117)
chr3 (533-807)||(13301294-13301567)
chr3 (533-807)||(13311950-13312223)
chr3 (525-807)||(17204822-17205105)
chr3 (364-759)||(14080489-14080884)
chr3 (339-607)||(34559854-34560122)
chr3 (362-813)||(15876046-15876490)
chr3 (649-780)||(48421843-48421972)
chr3 (676-813)||(15520341-15520475)
chr3 (136-216)||(19350329-19350410)
chr3 (342-467)||(47784911-47785036)
chr3 (312-745)||(14295366-14295797)
chr3 (312-495)||(14528148-14528331)
chr3 (342-592)||(1990760-1991010)
chr3 (23-124)||(16676229-16676328)
chr3 (312-592)||(6228664-6228954)
chr3 (312-468)||(17204629-17204784)
chr3 (361-469)||(55441011-55441119)
chr3 (700-813)||(12487596-12487709)
chr3 (312-679)||(4162157-4162531)
chr3 (9-66)||(18015139-18015196)
chr3 (364-468)||(11061169-11061273)
chr3 (312-745)||(14300993-14301424)
chr3 (640-780)||(14527932-14528071)
chr3 (8-124)||(17728552-17728666)
chr3 (8-124)||(19029781-19029895)
chr3 (364-626)||(31412338-31412600)
chr3 (640-745)||(3578344-3578447)
chr3 (643-780)||(11060859-11060994)
chr3 (646-748)||(34560130-34560231)
chr3 (364-584)||(41661545-41661765)
chr3 (364-743)||(14814653-14815032)
chr3 (342-463)||(19946657-19946777)
chr3 (709-813)||(15550924-15551028)
chr3 (14-78)||(16653359-16653423)
chr3 (14-78)||(19012254-19012318)
chr3 (342-426)||(33341840-33341923)
chr3 (556-670)||(15517803-15517917)
chr3 (312-469)||(35123625-35123781)
chr3 (640-780)||(35123951-35124090)
chr3 (342-592)||(50313145-50313395)
chr3 (342-426)||(7853941-7854024)
chr3 (660-739)||(51961030-51961107)
chr3 (640-743)||(14298677-14298778)
chr3 (640-743)||(14304304-14304405)
chr3 (703-806)||(12031826-12031932)
chr3 (640-813)||(50111871-50112042)
chr3 (640-780)||(6146621-6146760)
chr3 (382-471)||(47984650-47984738)
chr3 (382-471)||(48003224-48003312)
chr3 (709-780)||(6154183-6154255)
chr3 (709-780)||(12349391-12349463)
chr3 (709-780)||(17100975-17101047)
chr3 (709-780)||(17101660-17101732)
chr3 (709-780)||(17522742-17522814)
chr3 (14-113)||(19392187-19392284)
chr3 (640-740)||(22144165-22144263)
chr3 (709-780)||(40939449-40939521)
chr3 (709-745)||(55440746-55440782)
chr3 (361-436)||(13817492-13817567)
chr3 (342-607)||(33368951-33369198)
chr3 (640-743)||(54424268-54424369)
chr3 (342-592)||(43427555-43427804)
chr3 (640-780)||(16181800-16181937)
chr3 (382-471)||(47993937-47994025)
chr3 (382-471)||(48012510-48012598)
chr3 (364-469)||(54423993-54424097)
chr3 (640-740)||(317403-317500)
chr3 (709-780)||(38528050-38528121)
chr3 (342-426)||(54685514-54685597)
chr3 (709-740)||(13817833-13817864)
chr3 (361-436)||(14298399-14298473)
chr3 (361-436)||(14304026-14304100)
chr3 (709-740)||(16995954-16995985)
chr3 (361-471)||(13838873-13838982)
chr3 (367-469)||(17100636-17100738)
chr3 (367-469)||(17101321-17101423)
chr3 (361-414)||(17956209-17956262)
chr3 (364-469)||(38167894-38167999)
chr3 (365-470)||(51961298-51961403)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (315-807)||(37956849-37957341)
chr4 (312-780)||(19821628-19822095)
chr4 (364-813)||(15044808-15045256)
chr4 (364-813)||(15109168-15109616)
chr4 (339-807)||(7964536-7965003)
chr4 (339-807)||(18276389-18276856)
chr4 (364-807)||(7185669-7186111)
chr4 (361-813)||(41165774-41166216)
chr4 (312-813)||(13809330-13809829)
chr4 (349-827)||(14901197-14901673)
chr4 (610-780)||(27961197-27961366)
chr4 (364-780)||(52265360-52265775)
chr4 (364-780)||(15013136-15013549)
chr4 (312-742)||(41256259-41256698)
chr4 (542-780)||(18494181-18494416)
chr4 (649-780)||(34177501-34177629)
chr4 (364-743)||(30232386-30232763)
chr4 (312-807)||(47534904-47535364)
chr4 (364-626)||(13442681-13442946)
chr4 (364-626)||(18238162-18238424)
chr4 (364-592)||(50219979-50220207)
chr4 (312-469)||(16732097-16732254)
chr4 (312-472)||(27960900-27961059)
chr4 (364-607)||(38764689-38764932)
chr4 (542-739)||(40885458-40885658)
chr4 (350-501)||(40905064-40905214)
chr4 (392-592)||(54398391-54398591)
chr4 (312-495)||(18494464-18494647)
chr4 (361-469)||(34395234-34395342)
chr4 (350-438)||(47468522-47468610)
chr4 (361-468)||(23270097-23270204)
chr4 (452-592)||(47468387-47468527)
chr4 (362-495)||(12837336-12837468)
chr4 (709-813)||(23269753-23269858)
chr4 (342-591)||(41916766-41917016)
chr4 (709-780)||(20813399-20813471)
chr4 (361-469)||(53704895-53705003)
chr4 (361-469)||(55376759-55376867)
chr4 (364-592)||(13590113-13590341)
chr4 (704-743)||(21959354-21959393)
chr4 (361-436)||(44055892-44055967)
chr4 (640-743)||(44056170-44056271)
chr4 (361-436)||(53907891-53907966)
chr4 (709-743)||(819821-819855)
chr4 (707-740)||(30458224-30458257)
chr4 (640-740)||(53704627-53704725)
chr4 (709-740)||(12837094-12837125)
chr4 (712-743)||(34395583-34395614)
chr4 (709-740)||(53907602-53907633)
chr4 (762-827)||(15674920-15674985)
chr4 (342-379)||(16522776-16522813)
chr4 (531-592)||(40904973-40905034)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (312-813)||(3065-3559)
chr2 (312-827)||(722323-722831)
chr2 (314-813)||(24294341-24294839)
chr2 (364-806)||(67972-68413)
chr2 (359-812)||(31145999-31146452)
chr2 (343-807)||(43645853-43646318)
chr2 (525-802)||(22775044-22775311)
chr2 (525-802)||(22780422-22780689)
chr2 (577-805)||(23821467-23821693)
chr2 (577-805)||(23830546-23830772)
chr2 (351-807)||(19666495-19666950)
chr2 (364-780)||(19668961-19669376)
chr2 (313-780)||(22579715-22580177)
chr2 (362-812)||(25305423-25305860)
chr2 (342-607)||(24884644-24884909)
chr2 (342-468)||(19433495-19433621)
chr2 (533-805)||(19660029-19660299)
chr2 (312-780)||(24571145-24571610)
chr2 (364-501)||(23821735-23821872)
chr2 (364-501)||(23830814-23830951)
chr2 (639-813)||(27262058-27262232)
chr2 (639-745)||(25602279-25602384)
chr2 (362-626)||(24277739-24278003)
chr2 (342-592)||(9636702-9636953)
chr2 (361-469)||(28974026-28974134)
chr2 (556-725)||(24087295-24087462)
chr2 (709-813)||(7321843-7321947)
chr2 (312-469)||(27261734-27261891)
chr2 (640-780)||(271426-271564)
chr2 (312-498)||(271099-271284)
chr2 (640-745)||(4448021-4448124)
chr2 (342-563)||(6094673-6094895)
chr2 (361-426)||(23836910-23836975)
chr2 (640-745)||(28974305-28974407)
chr2 (361-469)||(32465835-32465943)
chr2 (364-495)||(36890821-36890952)
chr2 (312-493)||(4448271-4448450)
chr2 (361-469)||(25602001-25602109)
chr2 (364-467)||(22138140-22138243)
chr2 (709-743)||(36890576-36890610)
chr2 (709-740)||(23836599-23836630)
chr2 (688-807)||(24884943-24885062)
chr2 (361-495)||(25265541-25265675)
chr2 (709-740)||(25875814-25875845)
chr2 (398-500)||(24560862-24560964)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (312-813)||(38033491-38033992)
chr1 (312-813)||(19603025-19603521)
chr1 (312-827)||(20955245-20955758)
chr1 (314-813)||(36356111-36356606)
chr1 (312-807)||(27674725-27675219)
chr1 (312-813)||(22829245-22829743)
chr1 (452-817)||(16645980-16646345)
chr1 (455-807)||(16656709-16657061)
chr1 (339-807)||(17608883-17609351)
chr1 (339-807)||(37233685-37234152)
chr1 (326-807)||(20177118-20177599)
chr1 (312-811)||(51627486-51627983)
chr1 (312-780)||(21194932-21195409)
chr1 (376-807)||(22143186-22143616)
chr1 (542-781)||(13376709-13376948)
chr1 (364-780)||(8537762-8538177)
chr1 (364-780)||(8603001-8603416)
chr1 (316-468)||(41229102-41229253)
chr1 (316-498)||(13376973-13377154)
chr1 (364-780)||(49997133-49997548)
chr1 (339-780)||(52400585-52401026)
chr1 (364-592)||(5768208-5768436)
chr1 (535-743)||(27329656-27329851)
chr1 (342-626)||(40436274-40436559)
chr1 (640-743)||(22403000-22403101)
chr1 (640-813)||(35522172-35522343)
chr1 (312-469)||(35522481-35522637)
chr1 (361-436)||(41212046-41212121)
chr1 (709-780)||(35055079-35055151)
chr1 (709-744)||(9783953-9783988)
chr1 (709-740)||(20346347-20346378)
chr1 (361-414)||(15861649-15861702)
chr1 (361-414)||(22366996-22367049)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (312-827)||(32965953-32966466)
chr5 (312-813)||(7728348-7728849)
chr5 (362-813)||(16595486-16595935)
chr5 (455-807)||(28902262-28902614)
chr5 (455-807)||(28938657-28939009)
chr5 (364-813)||(5450660-5451110)
chr5 (364-813)||(3673842-3674290)
chr5 (339-807)||(21616971-21617439)
chr5 (525-817)||(21296990-21297281)
chr5 (339-807)||(21222433-21222900)
chr5 (339-807)||(37983322-37983787)
chr5 (365-780)||(432444-432857)
chr5 (312-738)||(19862140-19862563)
chr5 (610-813)||(23494145-23494350)
chr5 (525-784)||(21310557-21310815)
chr5 (542-780)||(23466595-23466830)
chr5 (388-776)||(29917969-29918356)
chr5 (642-807)||(24225171-24225335)
chr5 (640-780)||(19405794-19405934)
chr5 (364-495)||(23493899-23494030)
chr5 (640-780)||(11337038-11337177)
chr5 (365-695)||(23981451-23981781)
chr5 (339-592)||(21109704-21109958)
chr5 (364-570)||(6456604-6456810)
chr5 (416-670)||(22885674-22885928)
chr5 (361-469)||(1168366-1168474)
chr5 (365-615)||(26559831-26560081)
chr5 (342-592)||(16835338-16835589)
chr5 (312-469)||(23466385-23466542)
chr5 (640-780)||(24182984-24183123)
chr5 (640-780)||(20712331-20712471)
chr5 (660-745)||(22662570-22662652)
chr5 (649-809)||(25005082-25005240)
chr5 (361-469)||(19405514-19405622)
chr5 (364-474)||(19873824-19873934)
chr5 (342-592)||(24084035-24084285)
chr5 (364-467)||(20712056-20712159)
chr5 (640-743)||(21397348-21397449)
chr5 (361-436)||(24475560-24475635)
chr5 (361-426)||(2031787-2031852)
chr5 (361-498)||(11337319-11337455)
chr5 (342-426)||(11584009-11584093)
chr5 (361-426)||(28261498-28261563)
chr5 (640-740)||(4865518-4865615)
chr5 (342-413)||(11342641-11342713)
chr5 (640-740)||(28261772-28261869)
chr5 (711-780)||(1168058-1168127)
chr5 (361-469)||(21906697-21906802)
chr5 (342-379)||(109093-109130)
chr5 (709-738)||(11584376-11584405)
chr5 (342-379)||(16105601-16105638)
chr5 (762-827)||(18530899-18530964)
chr5 (361-442)||(21397066-21397147)
chr5 (382-471)||(22054008-22054096)
chr5 (527-592)||(23234524-23234589)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (312-780)||(25919541-25920009)
chr6 (362-807)||(15740207-15740643)
chr6 (316-813)||(25367055-25367552)
chr6 (312-807)||(21623097-21623591)
chr6 (382-812)||(21410870-21411298)
chr6 (342-745)||(18398896-18399297)
chr6 (544-813)||(16887610-16887879)
chr6 (364-803)||(33538198-33538636)
chr6 (339-789)||(22361609-22362057)
chr6 (350-806)||(18629433-18629892)
chr6 (452-827)||(17083003-17083376)
chr6 (364-813)||(35135831-35136279)
chr6 (364-780)||(33324673-33325088)
chr6 (364-607)||(25651217-25651460)
chr6 (312-493)||(18381821-18382001)
chr6 (525-785)||(17556867-17557123)
chr6 (641-807)||(25654381-25654546)
chr6 (364-626)||(19854135-19854397)
chr6 (640-780)||(15079563-15079702)
chr6 (342-592)||(34966824-34967075)
chr6 (709-807)||(14152634-14152733)
chr6 (312-462)||(28195263-28195412)
chr6 (342-435)||(18583292-18583384)
chr6 (342-679)||(29605407-29605744)
chr6 (364-498)||(16887925-16888059)
chr6 (640-743)||(18432899-18432999)
chr6 (342-438)||(17083371-17083468)
chr6 (361-469)||(31628245-31628353)
chr6 (640-740)||(22441190-22441287)
chr6 (389-493)||(16086022-16086126)
chr6 (704-779)||(16086335-16086411)
chr6 (709-780)||(18777452-18777524)
chr6 (640-743)||(32899046-32899147)
chr6 (709-743)||(16106839-16106873)
chr6 (341-463)||(18839419-18839540)
chr6 (527-617)||(22848158-22848248)
chr6 (364-592)||(23221894-23222124)
chr6 (342-463)||(18823564-18823684)
chr6 (364-433)||(19672275-19672344)
chr6 (382-495)||(35009590-35009702)
chr6 (640-740)||(18570535-18570632)
chr6 (709-741)||(25640453-25640485)
chr6 (361-436)||(25744408-25744483)
chr6 (364-442)||(15742420-15742498)
chr6 (527-625)||(19672429-19672527)
chr6 (342-379)||(4991030-4991067)
chr6 (527-592)||(17013678-17013743)
chr6 (361-469)||(22440911-22441019)
chr6 (527-592)||(23222894-23222959)
chr6 (527-592)||(32352190-32352255)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (318-779)||(31194176-31194636)
chr8 (360-761)||(15969795-15970196)
chr8 (312-789)||(22735690-22736157)
chr8 (336-807)||(5854566-5855036)
chr8 (339-807)||(15933253-15933721)
chr8 (312-780)||(38533577-38534045)
chr8 (342-807)||(33528384-33528848)
chr8 (361-813)||(21197971-21198422)
chr8 (339-807)||(26011449-26011913)
chr8 (312-813)||(39446585-39447084)
chr8 (525-807)||(17285345-17285628)
chr8 (525-807)||(25296299-25296582)
chr8 (525-807)||(25758319-25758602)
chr8 (316-807)||(23837131-23837622)
chr8 (417-817)||(29306450-29306852)
chr8 (312-807)||(33610877-33611381)
chr8 (342-807)||(23149737-23150201)
chr8 (342-807)||(23225903-23226367)
chr8 (525-780)||(22981414-22981664)
chr8 (536-807)||(23151660-23151928)
chr8 (342-807)||(23158119-23158580)
chr8 (364-626)||(45465131-45465393)
chr8 (342-592)||(18261510-18261761)
chr8 (342-743)||(22742718-22743123)
chr8 (709-813)||(21259316-21259420)
chr8 (364-772)||(38635507-38635915)
chr8 (342-594)||(18041569-18041822)
chr8 (342-592)||(45558976-45559227)
chr8 (350-501)||(27233197-27233348)
chr8 (342-592)||(33172185-33172436)
chr8 (312-440)||(17285196-17285323)
chr8 (640-745)||(21681259-21681363)
chr8 (350-605)||(37653642-37653895)
chr8 (640-780)||(20561483-20561622)
chr8 (640-780)||(20573044-20573183)
chr8 (366-592)||(24552609-24552835)
chr8 (313-469)||(21680931-21681087)
chr8 (639-740)||(20481860-20481957)
chr8 (342-592)||(22497248-22497499)
chr8 (361-469)||(41246635-41246743)
chr8 (364-495)||(23151969-23152100)
chr8 (312-436)||(20567353-20567476)
chr8 (312-436)||(20573546-20573669)
chr8 (361-493)||(20573330-20573461)
chr8 (640-740)||(22234698-22234795)
chr8 (364-467)||(20481585-20481688)
chr8 (452-780)||(19331168-19331493)
chr8 (640-740)||(25122698-25122795)
chr8 (361-426)||(41507022-41507087)
chr8 (709-780)||(20529705-20529777)
chr8 (385-469)||(20654067-20654151)
chr8 (361-436)||(20567194-20567268)
chr8 (709-740)||(37611991-37612022)
chr8 (674-779)||(16404859-16404965)
chr8 (720-780)||(20653885-20653946)
chr8 (362-463)||(21494625-21494725)
chr8 (361-438)||(24928999-24929075)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (312-813)||(102743-103241)
scaffold0022 (312-807)||(109518-110005)
scaffold0022 (640-813)||(112366-112536)
scaffold0022 (361-432)||(112741-112812)
scaffold0022 (527-592)||(131958-132023)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (342-813)||(28494-28965)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (339-807)||(48356599-48357066)
chr7 (364-813)||(13377509-13377959)
chr7 (339-807)||(16914752-16915220)
chr7 (339-807)||(9838835-9839302)
chr7 (339-807)||(9611263-9611731)
chr7 (312-810)||(17223757-17224256)
chr7 (312-813)||(49047494-49047993)
chr7 (312-807)||(34241031-34241508)
chr7 (312-813)||(13274715-13275204)
chr7 (342-807)||(14271723-14272175)
chr7 (364-592)||(20583593-20583821)
chr7 (745-827)||(9080965-9081047)
chr7 (312-780)||(16569858-16570325)
chr7 (312-780)||(16595337-16595804)
chr7 (364-626)||(28390292-28390554)
chr7 (364-743)||(26070156-26070531)
chr7 (364-743)||(26093943-26094318)
chr7 (361-779)||(12247973-12248391)
chr7 (364-592)||(13448866-13449094)
chr7 (342-607)||(14935320-14935583)
chr7 (342-607)||(15362913-15363176)
chr7 (312-469)||(11287345-11287502)
chr7 (364-780)||(15358777-15359191)
chr7 (366-679)||(4484709-4485021)
chr7 (342-592)||(4446169-4446420)
chr7 (364-591)||(38424199-38424426)
chr7 (640-813)||(11287673-11287843)
chr7 (665-787)||(16919811-16919934)
chr7 (392-626)||(17947597-17947831)
chr7 (364-592)||(31501153-31501381)
chr7 (336-607)||(14940704-14940975)
chr7 (336-607)||(15368297-15368568)
chr7 (527-742)||(28722253-28722468)
chr7 (722-807)||(13389693-13389778)
chr7 (527-616)||(9319578-9319667)
chr7 (660-739)||(25124406-25124483)
chr7 (342-469)||(7284222-7284348)
chr7 (640-743)||(45452058-45452159)
chr7 (342-474)||(45149560-45149692)
chr7 (364-501)||(46473981-46474118)
chr7 (361-469)||(39046785-39046893)
chr7 (364-592)||(9723846-9724074)
chr7 (364-495)||(13863066-13863197)
chr7 (452-592)||(33559715-33559855)
chr7 (361-436)||(35094794-35094869)
chr7 (361-442)||(143622-143703)
chr7 (709-743)||(12759311-12759345)
chr7 (709-743)||(13862823-13862857)
chr7 (527-592)||(8267767-8267832)
chr7 (342-438)||(8267905-8268002)
chr7 (640-780)||(35095071-35095208)
chr7 (640-780)||(39046481-39046619)
chr7 (640-740)||(3895281-3895378)
chr7 (640-740)||(15822325-15822423)
chr7 (361-469)||(15822593-15822701)
chr7 (709-740)||(143962-143993)
chr7 (709-743)||(47290105-47290139)
chr7 (527-592)||(4438926-4438991)
chr7 (402-471)||(13321033-13321102)
chr7 (762-827)||(15709525-15709590)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (364-723)||(2435-2795)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (339-807)||(43622-44090)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (317-807)||(69389-69880)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (339-807)||(2480-2948)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (364-813)||(2136-2583)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (339-780)||(30975-31415)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (312-807)||(35408-35902)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (316-781)||(76697-77161)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (312-807)||(6848-7344)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (345-812)||(6622-7090)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (312-813)||(33547-34046)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (339-807)||(197078-197548)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (339-807)||(97023-97490)
scaffold0031 (661-780)||(70891-71007)
scaffold0031 (361-469)||(31021-31129)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (315-813)||(3250-3747)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (364-807)||(104448-104889)
scaffold0032 (319-487)||(93916-94084)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (526-780)||(1200-1453)
scaffold0409 (526-780)||(9455-9708)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (577-807)||(116382-116612)
scaffold0016 (312-445)||(116699-116831)
scaffold0016 (709-740)||(164536-164567)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (560-780)||(1398-1617)
scaffold0456 (560-780)||(8543-8762)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (364-780)||(11074-11488)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (339-738)||(53302-53699)
scaffold0025 (342-686)||(85490-85834)
[»] scaffold1272 (2 HSPs)
scaffold1272 (542-810)||(452-721)
scaffold1272 (312-468)||(238-393)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (544-780)||(22281-22516)
scaffold0138 (368-455)||(22594-22681)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (600-780)||(8021-8200)
scaffold0589 (362-462)||(7812-7912)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (368-739)||(7994-8364)
scaffold0123 (661-739)||(11153-11230)
[»] scaffold0480 (3 HSPs)
scaffold0480 (316-813)||(8701-9197)
scaffold0480 (361-469)||(5408-5516)
scaffold0480 (709-780)||(5101-5172)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (580-780)||(89717-89915)
scaffold0026 (364-438)||(90037-90111)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (546-807)||(22246-22507)
scaffold0151 (342-501)||(22552-22712)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (544-780)||(70158-70393)
scaffold0058 (368-498)||(70439-70569)
[»] scaffold0389 (2 HSPs)
scaffold0389 (542-780)||(10820-11056)
scaffold0389 (364-482)||(10642-10760)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (364-739)||(79519-79892)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (640-813)||(11944-12117)
scaffold0021 (646-780)||(16162-16296)
scaffold0021 (646-780)||(25693-25827)
scaffold0021 (312-469)||(11615-11772)
scaffold0021 (361-469)||(132412-132520)
scaffold0021 (709-743)||(132139-132173)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (364-615)||(21979-22230)
scaffold0165 (364-635)||(29944-30215)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (342-780)||(31169-31604)
scaffold0120 (342-458)||(21470-21586)
scaffold0120 (640-780)||(47402-47540)
scaffold0120 (640-743)||(21767-21867)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (342-592)||(7714-7965)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (342-592)||(86314-86565)
scaffold0004 (364-625)||(27477-27738)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (364-780)||(4585-4999)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (342-590)||(6501-6750)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (649-780)||(372-500)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (649-780)||(1362-1490)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (527-776)||(818-1066)
scaffold0387 (364-468)||(1109-1213)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (364-780)||(3232-3647)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (640-743)||(5567-5669)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (364-592)||(37538-37766)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (361-745)||(464-846)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (362-780)||(33640-34057)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (342-469)||(3258-3384)
[»] scaffold0447 (4 HSPs)
scaffold0447 (364-495)||(4543-4674)
scaffold0447 (364-495)||(9157-9288)
scaffold0447 (709-740)||(4884-4915)
scaffold0447 (709-740)||(9498-9529)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (312-458)||(8915-9061)
scaffold0338 (640-813)||(9243-9415)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (312-777)||(159230-159691)
scaffold0014 (361-469)||(85309-85417)
scaffold0014 (643-810)||(85591-85755)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (364-470)||(5920-6026)
scaffold0342 (709-811)||(12592-12695)
[»] scaffold0554 (2 HSPs)
scaffold0554 (640-780)||(2172-2310)
scaffold0554 (314-472)||(1846-2004)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (364-460)||(5937-6033)
scaffold0327 (747-780)||(6030-6063)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (361-469)||(4918-5026)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (361-469)||(109624-109732)
scaffold0035 (361-469)||(118125-118233)
scaffold0035 (709-745)||(109349-109385)
scaffold0035 (709-745)||(117850-117886)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (342-469)||(103-229)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (342-617)||(7359-7635)
scaffold0253 (342-617)||(16784-17060)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (364-495)||(46145-46276)
scaffold0034 (640-743)||(40915-41015)
scaffold0034 (388-469)||(40662-40743)
scaffold0034 (364-426)||(79844-79906)
[»] scaffold0195 (3 HSPs)
scaffold0195 (312-469)||(680-837)
scaffold0195 (382-471)||(19206-19294)
scaffold0195 (382-471)||(21290-21378)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (364-495)||(7151-7283)
scaffold0383 (709-740)||(7493-7524)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (342-462)||(283-402)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (361-754)||(9914-10305)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (640-779)||(61062-61201)
scaffold0001 (361-436)||(70817-70892)
scaffold0001 (361-469)||(60784-60891)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (342-436)||(24918-25010)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (362-443)||(147531-147612)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (361-469)||(38275-38383)
scaffold0044 (709-780)||(38621-38693)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (364-626)||(107991-108251)
[»] scaffold0673 (3 HSPs)
scaffold0673 (360-469)||(984-1093)
scaffold0673 (640-740)||(715-813)
scaffold0673 (361-436)||(7043-7118)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (361-466)||(24362-24467)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (527-592)||(67936-68001)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (361-445)||(1358-1442)
[»] scaffold0240 (2 HSPs)
scaffold0240 (640-740)||(7826-7924)
scaffold0240 (396-493)||(7581-7678)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (361-469)||(11730-11837)
scaffold0117 (709-780)||(11421-11493)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (709-780)||(24580-24652)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (361-469)||(254976-255084)
scaffold0011 (361-469)||(261582-261690)
[»] scaffold0390 (3 HSPs)
scaffold0390 (364-467)||(16005-16108)
scaffold0390 (364-467)||(3021-3124)
scaffold0390 (364-445)||(5162-5243)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (400-495)||(13523-13618)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (361-495)||(41626-41760)
[»] scaffold0359 (3 HSPs)
scaffold0359 (367-469)||(1300-1402)
scaffold0359 (709-780)||(1638-1710)
scaffold0359 (640-740)||(11546-11644)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (367-437)||(3317-3387)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (709-743)||(23014-23048)
scaffold0008 (361-469)||(22668-22776)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (364-445)||(1574-1655)
scaffold0786 (364-467)||(4488-4591)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (640-745)||(11596-11699)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (527-592)||(8633-8698)
scaffold0153 (364-474)||(1815-1924)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (361-426)||(30068-30133)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (361-442)||(253178-253259)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (640-740)||(2959-3056)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (709-780)||(4606-4677)
scaffold0740 (361-435)||(4284-4358)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (527-635)||(14179-14287)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (361-469)||(32180-32288)
scaffold0091 (361-469)||(42015-42123)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (640-740)||(15129-15226)
scaffold0083 (361-436)||(14194-14269)
scaffold0083 (361-436)||(14854-14929)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (709-740)||(8670-8701)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (738-780)||(1974-2016)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (364-413)||(1655-1704)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (361-414)||(6308-6361)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (364-469)||(10136-10241)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (364-469)||(1-106)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (527-592)||(25489-25554)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 17960631 - 17960131
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17960631 aacatgaaaacaat-gatatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 17960533  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
17960532 agtcatgaattattaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaatatgaatctcagcataattcaacatcaacataacacaaattgtcattt 17960433  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17960432 agagcataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcacccacaaaaaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 17960333  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
17960332 cataataggagcacgaattctaaccatcatgaacaattaattaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatt 17960233  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcc 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17960232 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaagtttcactttagctcctaggttctctcctcttcttcaatcttcaagttcc 17960133  T
812 tc 813  Q
    ||    
17960132 tc 17960131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 314 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 38811325 - 38810833
Alignment:
314 catgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaag 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
38811325 catgaaaacaattaacatttgaaccaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaag 38811226  T
414 ttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttag 513  Q
      |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||    
38811225 ccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttag 38811126  T
514 agsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatca 613  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||    
38811125 agcataatatgacatatatcattttcatgtattttgatcattcaatttcaccaacaacaaattaattatcatcaattccttacatacaaaaagaacatca 38811026  T
614 taataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattat 713  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
38811025 taattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatca--------attaagcacttattcatgcaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat 38810934  T
714 gatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctc-tcctcttcttgaatcttcaagttcct 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||    
38810933 gatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccagttcttgaatcttcaagctcct 38810834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 342 - 816
Target Start/End: Original strand, 12952921 - 12953397
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||    
12952921 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctct 12953020  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttca 540  Q
    ||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| |||||   ||||||| || |||||    
12953021 tagcaacaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttca 12953120  T
541 tatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaacca-tc 639  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  || |||| |||||||| | |     
12953121 tatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaattctaacaacta 12953220  T
640 atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctta 738  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
12953221 atgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacagtaattgaaaaattacact-aaattgattatgattgaattctaatccccttacctta 12953319  T
739 gttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctcctt 816  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
12953320 gttagatcaattccctagcccaaacttcaatttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagcttctcctt 12953397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 364 - 813
Target Start/End: Original strand, 39656506 - 39656953
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || || ||   |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
39656506 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacccctaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaaccacatcaattgaa 39656605  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||||||| |  | |||| |||| ||||||| || || |   || || ||| ||| |   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||    
39656606 catgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 39656705  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    | ||||| || | |||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||    
39656706 ctaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaattaatcatttactcaa 39656805  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagc 763  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39656806 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgcact--aaatgattatgatcaattctaactcccttaccttagttagatcaattccctagctcaagc 39656903  T
764 ttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
39656904 ttcattttaactcctaggttctatcatcttcttgaatcttcaagctcctc 39656953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 392 - 813
Target Start/End: Original strand, 16880131 - 16880552
Alignment:
392 tcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaa 491  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | || |||| |||| |||    
16880131 tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaa 16880230  T
492 cataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaattt 591  Q
    |||| || || ||  ||  | ||| ||| | | ||||||| || ||||  ||||||||| |||  ||||| || ||||| || | |||||||| ||| ||    
16880231 catagcataatttcacaaattgagcatattctaacatataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaactt 16880330  T
592 cttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaa 691  Q
    ||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
16880331 cttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaaacacttgttcatacaacaattgaa 16880430  T
692 aatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctc 791  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||      
16880431 aatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaagcttcactttagcttctaggtcctctccaa 16880530  T
792 ttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
     ||||||||||||||| |||||    
16880531 ctcttgaatcttcaagctcctc 16880552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 11329280 - 11328784
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttta--caaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacc 409  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||||   |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
11329280 aacatgaaaacaattgatatttggaccaatt-aaccaatttttagcaaact-accaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacc 11329183  T
410 caagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcat 509  Q
    ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   ||     
11329182 caagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 11329083  T
510 ttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaa 609  Q
    || ||| ||| |   ||||||| || ||||  ||||||||| |||  |||||||| ||||| || | |||||| | ||| ||  | ||     ||||       
11329082 tttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattattaacaactttatgca-----acatgtc 11328988  T
610 atcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataa 709  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
11328987 atcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaaatga 11328888  T
710 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagtt 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |    
11328887 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagatcaagcttcactttagctcctaggtcctctccaactcttgaatcttcaagct 11328788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 93 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18015142 - 18014924
Alignment:
93 attatataagatatttgctaatgggaaagcattnnnnnnntaatagatttgtgacagctccaaacaacaagactttagaaaaagcaaagaagactttggg 192  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
18015142 attatataagatattatctaatgggaaaggattaaaaaaataatagatttgtgacagctccaaacaacaagactttagaaaaagcaaagaagactttgga 18015043  T
193 catatcaccattgatatttcatatttgatacaaagagtacaattgaaacttattaggagttttcaagcatctattaacgtttcttgtattaattatcaat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18015042 catatcaccattgatatttcatatttgatacaaagagtacaattgaaacttattaggagttttcaagcatctattaacgtttcttgtattaattatcaat 18014943  T
293 atgtgatacccggataatt 311  Q
    |||||||||||||||||||    
18014942 atgtgatacccggataatt 18014924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 316 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 14059528 - 14059035
Alignment:
316 tgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttta-caaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagt 414  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |   ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||     
14059528 tgaaaacaactgacatttggacaaattcaccaatttttatcaaagt-accaacaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagc 14059430  T
415 tatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttaga 514  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| | | || |||| |||| ||||||| || || |  |||  | ||    
14059429 catgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattga 14059330  T
515 gsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcat 614  Q
    | ||| |   |||||| ||||||||  ||||||||| |||  |||||| | || || || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||    
14059329 gcatatttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatgaaatttctctaaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcat 14059230  T
615 aataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatg 714  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||    
14059229 aattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattagtcaattagtcaattaagcacttattcatacaataattgaaaa-ttgcact-aaaatgattatg 14059132  T
715 atgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcct 812  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||| ||||    
14059131 atgaattataaccccctta-cttagttagattaattccctagcttagacttcactttagctcctaggttcttctctccacttgaatcttcaagctcct 14059035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Original strand, 17139436 - 17139936
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||| | |   |||||| ||   |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
17139436 aacatgaaaacaattgacatttggatcaatttaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcataccca 17139535  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||| ||  | |   |   |    
17139536 agccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaat 17139635  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| ||| |   ||||||| |||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | ||| |||||||   ||    
17139636 tgagcatatttcaacatataccattttctcatagtttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcat 17139735  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
17139736 cataattggagcacgaattctaacaattatgaacacttaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattg-aaatttacactaagaatgatt 17139834  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||| |||  | |||||||||||||||||    
17139835 atgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagcccaagcttcaatttacctcctagctctct-tccaatccttgaatcttcaagttc 17139933  T
811 ctc 813  Q
    |||    
17139934 ctc 17139936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 525 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 47784872 - 47784580
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||  |||||    
47784872 acatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagca 47784773  T
625 cggattctaacca--tcat--gaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaat 720  Q
    || ||| |||| |  || |  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
47784772 cgaattataacaacttcctttgaacaataaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaat 47784673  T
721 tctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
47784672 tctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatattcaggttcctc 47784580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 362 - 807
Target Start/End: Original strand, 17191519 - 17191965
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattg 461  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||     
17191519 accaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaatta 17191618  T
462 aacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaattt 561  Q
    ||||||| ||| | || |||| | || |||||||||| || |  ||| || ||| |||||   ||||| |||| ||||  ||||||||| |||  |||||    
17191619 aacatgattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcataattcaacataaatcactttctcatactttgaacatgaaattt 17191718  T
562 caccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattact 660  Q
    ||||||||| || |  ||||||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||| |||||    
17191719 caccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatc-atctatgaacaattaatcatttact 17191817  T
661 caattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctc 759  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | |||||||| |    
17191818 caattaagcaattgttcatacaacaattgaaaaattacact-aaaatgattgtgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagccc 17191916  T
760 aagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
17191917 aaacttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaag 17191965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 455 - 780
Target Start/End: Original strand, 30207287 - 30207613
Alignment:
455 tcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcat 554  Q
    |||||||||| ||||||| | || |||| |||| ||||||| ||||| |  ||| ||  || |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||    
30207287 tcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacat 30207386  T
555 tcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatca 654  Q
      | |||||||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
30207387 gaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaataattaatca 30207486  T
655 attactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcc 753  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
30207487 attactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttaccttagttagattaatctccc 30207586  T
754 tagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||| | |||||| ||| ||||||||    
30207587 tagcttaggcttcaattttgctcctag 30207613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 364 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12488993 - 12488659
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||     
12488993 caacaacaacttatttcccatcattaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 12488894  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |  ||| || ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||    
12488893 catgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 12488794  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
     |||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| |||||| || ||||||||  ||||| | |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||    
12488793 tcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaattctaacaattatgaacaattaattaatgactcaa 12488694  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac 698  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
12488693 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac 12488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 364 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576261
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||  |||| || |||||||| |||  ||||||||  ||    
3576705 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaa 3576606  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||| ||| | || |||| |||| ||||||| || ||    ||| || ||| |||||   | |||||||| ||||  |||| |||| |||  |||||||    
3576605 catgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataattcaatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttca 3576506  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    ||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||| ||| ||| |||| |   |||||||||||||| ||||||||    
3576505 ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 3576406  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaag 762  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||| ||||    
3576405 ttaagcacttattcgtacaacaattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacaaattcctagcccaag 3576307  T
763 cttcactttagctcctaggttctc-tcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||    
3576306 cttcactttacctcctaggatctcttccaattcttgaatattcaag 3576261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 533 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 11882316 - 11882038
Alignment:
533 cattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattct 632  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||||||  ||||| | | |      
11882316 cattttcacatactatgaacattcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcatgaaattc 11882217  T
633 aaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaaccccct 731  Q
    ||| ||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
11882216 aac-atctaagaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttacactaaa--tgattatgatgaattctaaccccct 11882120  T
732 taccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||    
11882119 taccttagttagatcaattccctaggtcaagcttcactttagctcctaggatctctccaactcttgaatcttcaagctcctc 11882038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 350 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 9591035 - 9590617
Alignment:
350 ttttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaa 449  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||    
9591035 ttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa 9590936  T
450 acacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacat-atatcattttcatatacttt 548  Q
      ||||||||||||||||  ||||| || || | |||| ||||||| || || |   ||  | ||| ||||| | | || ||| || ||||| |||||||    
9590935 caacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcataat-tcatatcataccactttcacatacttt 9590837  T
549 gatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaat 648  Q
    || |||  | |||||||||||| || | |||||||||||||||  | ||| ||||||||  |||||| |  ||||||||||| |||| |  |||||||||    
9590836 gaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaacaat 9590737  T
649 taatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaa-ttgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatca 747  Q
    ||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
9590736 taaccacttattcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattctaatccccttaccttagttag--ca 9590641  T
748 att--tcctagctcaagcttcact 769  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
9590640 attaatcctagctcaagcttcact 9590617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19350555 - 19350439
Alignment:
9 atagctataattcgaataggtatgtgattgcttgaaagagttgttggtagcttaattacatatgttaggagatgatctagtgttattatataagatattt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19350555 atagctataattcgaataggtatgtgattgcttgaaagagttgttattagcttaatgacatatgttaggagatgatctagtgtgattatataagatattt 19350456  T
109 gctaatgggaaagcatt 125  Q
    |||||||||||||||||    
19350455 gctaatgggaaagcatt 19350439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 312 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 12560555 - 12560092
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttta-caaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||| |   ||||| |||| | |||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||    
12560555 aacatgaaaacaattgacctttggaccaattcaccaatttttatcaaact-accaacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcataccc 12560457  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatt 510  Q
    |||  | |||||| ||   |||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||  | || |||| |||| ||||||| || || |   |       
12560456 aagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccag 12560357  T
511 tagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaa 610  Q
    | | | ||| | | ||||||| || ||||  ||||||||| |||  |||||| | |||||||| | || |||||  || |||   ||| ||| ||||| |    
12560356 ttgggcatattttcacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataaca 12560257  T
611 tcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataat 710  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||  | |||| ||    
12560256 tcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgat 12560159  T
711 tatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctc 776  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || |||||||| ||||||||    
12560158 tatgatgaattttaacccccttaccttagttagattaatctccctaacttaagcttcaatttagctc 12560092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19350117 - 19350020
Alignment:
214 tatttgatacaaagagtacaattgaaacttattaggagttttcaagcatctattaacgtttcttgtattaattatcaatatgtgatacccggataatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
19350117 tatttgatacaaagagtacaattgaaacttattaggagttttcaagcatctattaacgtttcttgtattaattatcaatatgtgatactcggataatt 19350020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 533 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 13301567 - 13301294
Alignment:
533 cattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattct 632  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||||||  ||||||| | |      
13301567 cattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattc 13301468  T
633 aaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaaccccct 731  Q
    ||| ||| | |||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
13301467 aac-atctaagaaccaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaa--tgattatgatgaattctaaccccct 13301371  T
732 taccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctagg-ttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||    
13301370 taccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcctcacatcttcttgaatcttcaag 13301294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 533 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 13312223 - 13311950
Alignment:
533 cattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattct 632  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||||||  ||||||| | |      
13312223 cattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattc 13312124  T
633 aaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaaccccct 731  Q
    ||| ||| | |||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
13312123 aac-atctaagaaccaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaa--tgattatgatgaattctaaccccct 13312027  T
732 taccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctagg-ttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||    
13312026 taccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcctcacatcttcttgaatcttcaag 13311950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 525 - 807
Target Start/End: Original strand, 17204822 - 17205105
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||||||||| || |  ||||||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  |||||    
17204822 acatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagca 17204921  T
625 cggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgat-gaattc 722  Q
    || ||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
17204922 cgaattttatc-atctatgaacaattaatcatttactcaattaagcacttgttcgtaccacaattgaaaaattacact-aaaatgattatgatggaattc 17205019  T
723 taacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||||||||||||||| |||   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
17205020 taacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatttctaccaattcttgaatcttcaag 17205105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 364 - 759
Target Start/End: Original strand, 14080489 - 14080884
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||   | ||| ||||| |||||||| |||| |||  ||  ||||||||||||    
14080489 caacaacaactcatttctcatcaccaaatcatgaattatgaatacccaagccgtaaatcatcaacaacaacattacttcgcaataacaacatcaattgaa 14080588  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||| |   |   | ||| |||||     |  || || ||  | ||||||||| ||| ||| ||||    
14080589 catggttctcatcataattcaacaacaatatagcacaattcacccaattgagcataattcataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattca 14080688  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactca 662  Q
    | ||| | || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||  ||    
14080689 ctaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaac-atctatgcacaattaatcatttatcca 14080787  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctc 759  Q
    ||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
14080788 attaaacacttattcataccatagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttacattaattccctagctc 14080884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 339 - 607
Target Start/End: Original strand, 34559854 - 34560122
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||    
34559854 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatca 34559953  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| || |    |||||||| |||||   |||| || ||  ||    
34559954 cttagcaacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaacaactacataacataattcaaaatttagagcataattcaacatgtaacacatt 34560053  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacata 607  Q
    || ||| ||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
34560054 cacatattttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata 34560122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 362 - 813
Target Start/End: Original strand, 15876046 - 15876490
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattg 461  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
15876046 accaacaccaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattg 15876145  T
462 aacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaattt 561  Q
    ||||||||||| | || |||| |||| |||| ||  | ||     || || ||| || ||   | |||||||| ||||  |||||| || |||  |||||    
15876146 aacatgaatcttatcacaattcaacaacaacttatgataatccaacaatttgagtatcattcaagatatatcactttctcatacttggaacataaaattt 15876245  T
562 caccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattact 660  Q
    || |||||| || | | |||||| |||  || | |||  |||||||  ||||||||  ||||||| ||| | | |||| ||||||||||||        |    
15876246 catcaacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatt-tcatcatctatgaacaattaa--------t 15876336  T
661 caattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaa-cccccttaccttagtta-gatcaatttcctagct 758  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||| ||||||||     
15876337 caattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccccttaccttaattatcgtcaa-ttcctagcc 15876435  T
759 caagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||   ||||||||||||||| |||||    
15876436 caagcttcactttaactcctaagatctctccaactcttgaatcttcaagctcctc 15876490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 649 - 780
Target Start/End: Original strand, 48421843 - 48421972
Alignment:
649 taatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaa 748  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
48421843 taatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaa--tgattatgatgaattctaactctcttaccttagttagatcaa 48421940  T
749 tttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||    
48421941 ttccctagctctagcttcactttaactcctag 48421972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 676 - 813
Target Start/End: Original strand, 15520341 - 15520475
Alignment:
676 tcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagct 775  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || ||||    
15520341 tcatacaacaat-gaaaaattacactaaaa-tgattatgatgaattataacccc-ttatcttagttaggtcaattccctagcccaagcttcaattaagct 15520437  T
776 cctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
15520438 cctaggttctctcctcttcttaaatcttcaagctcctc 15520475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19350410 - 19350329
Alignment:
136 tagatttgtgacagctccaaacaacaagactttagaaaaa-gcaaagaagactttgggcatatcaccattgatatttcatat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
19350410 tagatttgtgacagctccaaacaacaagattttagaaaaaagcaaagaagactttggacatatcaccattgatatttcatat 19350329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 47785036 - 47784911
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || || |||||||||||||    
47785036 tcaacccattttacagaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 47784937  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatg 467  Q
    | || |||  ||||||| ||||||||    
47784936 aacaacaacaacatcaactgaacatg 47784911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 745
Target Start/End: Original strand, 14295366 - 14295797
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||| |||||||| | || |||||| |   ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
14295366 aacatgaaaacacttgacattaggaccaattcatcaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaaccca 14295465  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   |   |    
14295466 agccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaat 14295565  T
512 agagsataatat-gacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttc-accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaa 609  Q
     ||| ||| | |  ||||||| |||||||  ||||||||| || | |||||| || ||||| || | |||||||   || ||| ||||| ||||||| |     
14295566 tgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaaca-tgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgac 14295664  T
610 atcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaata 708  Q
    ||||||||  ||||||| |||  | |  | |||||||||||||||||| || || || |||| || ||||||||| ||||||||| || |   || |||     
14295665 atcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccattttagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatg 14295760  T
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14295761 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 14295797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 312 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14528331 - 14528148
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |   |||||  ||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || || |||||    
14528331 aacatgaaaacaattgacatttggaccaattcaccaatttttatcaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcataccca 14528232  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    ||  |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| |||||||    
14528231 agccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacata 14528148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Original strand, 1990760 - 1991010
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcac-acccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || | |||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||    
1990760 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatctct 1990859  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||  |||||| || ||||||| ||||| || | || |||| ||||||||||| ||||  || || ||| ||||| | || |||||||||||||    
1990860 taacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacataacac-aattcacaatttgagcataat-tcacaatatatcattttc 1990957  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||    
1990958 atctactatgaacatgcaatttcacaaacaataattcaattattaccaatttc 1991010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16676328 - 16676229
Alignment:
23 aataggtatgtgattgcttgaaagagttgttggtagcttaattacatatgttaggagatgatctagtgttattatataagatatttgctaatgggaaagc 122  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
16676328 aataggtatgtgattgctagaaacaattgttggtagcttaatgacatttgttaggaga--atctagtgtgattatataagatatttcctaatgggaaagc 16676231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 6228954 - 6228664
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaaca---------aattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaatta 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         || |||||||||||| |||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||    
6228954 aacatgaaaacaattgacatttgaacataattcaataaatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgattta 6228855  T
402 tgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaa 501  Q
    || |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |||  ||||||||| |||||||  | || |||||||  ||| ||||||| |||||    
6228854 tgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatttcttagcaacaacaacatcaattaaacatgatccacatcataattcgacaacaacatagcacaa 6228755  T
502 attgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
     |   ||||||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
6228754 ttcaacatttagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 6228664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 468
Target Start/End: Original strand, 17204629 - 17204784
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||| || | ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
17204629 aacatgaaaaccattgacatttggaccaattca-ccaactttacaaaaccactaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattataaacaccca 17204727  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatga 468  Q
    ||  |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||  ||||| ||| |||||||    
17204728 agccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaacaacatccattaaacatga 17204784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 55441119 - 55441011
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||    
55441119 caccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatcaacaacatcaatt 55441020  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
55441019 gatcatgaa 55441011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 700 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 12487709 - 12487596
Alignment:
700 ctaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttga 798  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||  | |||||    
12487709 ctaaaaacgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcattttagctcttagctctct-tccaatccttga 12487611  T
799 atcttcaagttcctc 813  Q
    |||||||||||||||    
12487610 atcttcaagttcctc 12487596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 4162531 - 4162157
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaaca---------aattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaatta 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         || |||||||||||| |||||   ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||    
4162531 aacatgaaaacaattgacatttgaacataatttaacaaatcaacccatttttacaaa---accaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgattta 4162435  T
402 tgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaa 501  Q
    || |||||||||  |||||| ||||| ||||| |   ||||||| |||  ||||||||| ||||||| || |  ||| ||| |||| |||||||||||||    
4162434 tgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatagttcttagcaacaacaacatcaattaaacatgattcacgtcatcattcaacaacaacataacacaa 4162335  T
502 attgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatac 600  Q
     |   ||||||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| | |  |||||||||||||  || | |||||||||||||||  |  || |    
4162334 ttcaacatttagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacttgtaatttcaccaacagcaattcaattatcaccaattttatgtattc 4162236  T
601 aaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcat 679  Q
    |||||||  | |||||| |||| ||| |||  ||| |  |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
4162235 aaacatatcaccataattggagtacgaatttcaacaactatgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcat 4162157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18015196 - 18015139
Alignment:
9 atagctataattcgaataggtatgtgattgcttgaaagagttgttggtagcttaatta 66  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18015196 atagttataattcgaataggtatgtgattgcttgaaagagttgttggtagcttaatta 18015139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11061273 - 11061169
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
11061273 caacaataacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaa 11061174  T
464 catga 468  Q
    |||||    
11061173 catga 11061169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 745
Target Start/End: Original strand, 14300993 - 14301424
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||| |||||||| | || |||||| |   ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||| |    
14300993 aacatgaaaacacttgacattaggaccaattcatcaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaa 14301092  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||| ||||  ||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   |   |    
14301093 agacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaat 14301192  T
512 agagsataatat-gacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttc-accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaa 609  Q
     ||| ||| | |  ||||||| |||||||  ||||||||| || | |||||| || ||||| || | |||||||   || ||| ||||| ||||||| |     
14301193 tgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaaca-tgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgac 14301291  T
610 atcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaata 708  Q
    ||||||||  ||||||| |||  | |  | |||||||||||||||||| || || || |||| || ||||||||| ||||||||| || |   || |||     
14301292 atcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccattttagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatg 14301387  T
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14301388 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 14301424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 14528071 - 14527932
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||| || || ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
14528071 atgaacaattaatcaattcacctaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataaa--tgattatgatgaattctaacccccttacctta 14527975  T
739 gttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
14527974 gttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 14527932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 17728552 - 17728666
Alignment:
8 aatagctataattcgaataggtatgtgattgcttgaaagagttgttggtagcttaattacatatgttaggagatgatctagtgttattatataagatatt 107  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||  |||||||| |||||||| ||||||    
17728552 aatagttataattcaatcaggtatgtgattgctagaagtagttgttggtagtttaatgacatatgataggggat--tctagtgtgattatatatgatatt 17728649  T
108 tgctaatgggaaagcat 124  Q
    |||| ||||||||||||    
17728650 tgcttatgggaaagcat 17728666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 19029781 - 19029895
Alignment:
8 aatagctataattcgaataggtatgtgattgcttgaaagagttgttggtagcttaattacatatgttaggagatgatctagtgttattatataagatatt 107  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||  |||||||| |||||||| ||||||    
19029781 aatagttataattcaatcaggtatgtgattgctagaagtagttgttggtagtttaatgacatatgataggggat--tctagtgtgattatatatgatatt 19029878  T
108 tgctaatgggaaagcat 124  Q
    |||| ||||||||||||    
19029879 tgcttatgggaaagcat 19029895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 31412600 - 31412338
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  || |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
31412600 caacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 31412501  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    | | | ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || ||| || | ||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
31412500 cctaattctcatcacaattcaacaacaacatatcacaattcaacaattaaagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 31412402  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||||| | |||||||    
31412401 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacg 31412338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 640 - 745
Target Start/End: Original strand, 3578344 - 3578447
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
3578344 atgaacaattaatcaatttacccaattaagcacttattcctacaataattgaaaattg---caataaatgattatgatgaattctaacccgcttacctta 3578440  T
739 gttagat 745  Q
    |||||||    
3578441 gttagat 3578447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 643 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 11060994 - 11060859
Alignment:
643 aacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 742  Q
    ||||| |||| |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || | |   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
11060994 aacaaataattaattatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaatta---tgattatgatgaattccaacccccttaccttagtta 11060898  T
743 gatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||| ||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||    
11060897 gattaatctccctagcttaagcttcagttttgctcctag 11060859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 646 - 748
Target Start/End: Original strand, 34560130 - 34560231
Alignment:
646 aattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaga 744  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
34560130 aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgatcatgattgaattctaacccccttaccttaattagc 34560227  T
745 tcaa 748  Q
    ||||    
34560228 tcaa 34560231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 584
Target Start/End: Original strand, 41661545 - 41661765
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||| || | || |||  ||||||||| ||    
41661545 caacaacaacttatttatcatcatcaattcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctctcaacaacaacaacatcaattaaa 41661644  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||  |||||| ||||| |   ||||||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
41661645 catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 41661743  T
563 accaacaaaaaattaattatca 584  Q
    |||||||| || | ||||||||    
41661744 accaacaacaattcaattatca 41661765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 14815032 - 14814653
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| | ||| |||| || |  |||||  ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
14815032 caacaacaacttatttctcatcatcaaattatgattcatgaacacgcaggccatgaaacatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 14814933  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||| | || |||| |||| ||||||| ||||| |   || || ||| | ||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
14814932 catgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 14814834  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  | ||||||   |||||| |||  ||| |  |||| ||| |||||| ||| |||    
14814833 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgagcaaataatcacttattca 14814734  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaataattat-gatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||| ||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
14814733 attaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttag 14814653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 463
Target Start/End: Original strand, 19946657 - 19946777
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||  |||||||| || |    
19946657 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 19946755  T
442 agcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    | || |||  ||||||||||||    
19946756 atcaacaacaacatcaattgaa 19946777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 709 - 813
Target Start/End: Original strand, 15550924 - 15551028
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagt 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||   | | |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||   |||||||||||||||     
15550924 attatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactcgtaggatctctccaactcttgaatcttcaagc 15551023  T
809 tcctc 813  Q
    |||||    
15551024 tcctc 15551028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 16653359 - 16653423
Alignment:
14 tataattcgaataggtatgtgattgcttgaaagagttgttggtagcttaattacatatgttagga 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
16653359 tataattcaaataggtatgtgattgatagaaagagttgttggtagcttaatgacatacgttagga 16653423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 19012254 - 19012318
Alignment:
14 tataattcgaataggtatgtgattgcttgaaagagttgttggtagcttaattacatatgttagga 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
19012254 tataattcaaataggtatgtgattgatagaaagagttgttggtagcttaatgacatacgttagga 19012318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 33341840 - 33341923
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatca 426  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
33341840 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 33341923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 670
Target Start/End: Original strand, 15517803 - 15517917
Alignment:
556 caatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaa 655  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |  |  ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||     
15517803 caatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcac 15517902  T
656 ttactcaattaagca 670  Q
    |||||||||||||||    
15517903 ttactcaattaagca 15517917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 469
Target Start/End: Original strand, 35123625 - 35123781
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| || ||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||    
35123625 aacatgaaaacaattgacattaggacaaattca-ccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaaccc 35123722  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    ||   |||||||||||  |||||||| || || || |||  ||||||||||| ||||||    
35123723 aaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaa 35123781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Original strand, 35123951 - 35124090
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  ||||||||| || || |||   | ||||||||||||||||||||| |||||||    
35123951 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccctttacctt 35124046  T
738 agttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
35124047 agttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 35124090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Original strand, 50313145 - 50313395
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||| ||||||||||  || | || |||||| ||||| ||||  |||||||| | ||||| | || |||  ||||||| ||||| ||||| ||| |||    
50313145 tcaacctattttacaaaaccaaccacgacaacttatttctcatcgtcaaatcataatttatgaatactcaaactatgaatcatcaacaacaatatctctt 50313244  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttca 540  Q
    | || |||  ||||||||| ||||||| || || || |||| |||| ||||||| |||||     ||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||    
50313245 aacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacatatcacaatccaacatttagagcacaat-tcacaatatatcattttca 50313343  T
541 tatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
     ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
50313344 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttc 50313395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 7853941 - 7854024
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatca 426  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||    
7853941 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgattcatgcaaacccaagccatgaattatca 7854024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 660 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 51961107 - 51961030
Alignment:
660 tcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttag 739  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
51961107 tcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 51961030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Original strand, 14298677 - 14298778
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  ||||||||| || || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
14298677 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctt 14298772  T
738 agttag 743  Q
    ||||||    
14298773 agttag 14298778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Original strand, 14304304 - 14304405
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  ||||||||| || || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
14304304 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctt 14304399  T
738 agttag 743  Q
    ||||||    
14304400 agttag 14304405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 703 - 806
Target Start/End: Original strand, 12031826 - 12031932
Alignment:
703 aaaataattatgat-gaattctaa-cccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaa 799  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||    
12031826 aaaatgattatgattgaattctaaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaa 12031925  T
800 tcttcaa 806  Q
    |||||||    
12031926 tcttcaa 12031932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 50112042 - 50111871
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||   || | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
50112042 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 50111947  T
738 agttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||| | ||||| | |  ||||| ||||||||||||||    
50111946 agttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctccta-gctctcttcacaccttgattcttcaagttcctc 50111871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 6146760 - 6146621
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||   || | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
6146760 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 6146665  T
738 agttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
6146664 agttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctag 6146621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 471
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984738
Alignment:
382 catcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatc 471  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||    
47984650 catcatcaattcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatc 47984738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 471
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003312
Alignment:
382 catcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatc 471  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||    
48003224 catcatcaattcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatc 48003312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 6154255 - 6154183
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
6154255 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatatctctagcttaggcttcaattttgctcctag 6154183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 12349463 - 12349391
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| | | ||||||||    
12349463 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaagcttcaatattgctcctag 12349391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Original strand, 17100975 - 17101047
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |  ||||| ||| ||||||||    
17100975 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttagacttcaattttgctcctag 17101047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Original strand, 17101660 - 17101732
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |  ||||| ||| ||||||||    
17101660 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttagacttcaattttgctcctag 17101732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 17522814 - 17522742
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
17522814 attatgatgaattctaacccccttaccttagttatattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 17522742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19392284 - 19392187
Alignment:
14 tataattcgaataggtatgtgattgcttgaaagagttgttggtagcttaattacatatgttaggagatgatctagtgttattatataagatatttgctaa 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||  | |||||| |||||||| ||| ||||||||    
19392284 tataattgaaataggtatgtgattgctagaagcagtttttggtagtttaatgacatatgttaggggat--tttagtgtgattatatacgatgtttgctaa 19392187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 22144263 - 22144165
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||| || |||||||||  |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
22144263 atgaacagttaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 22144168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Original strand, 40939449 - 40939521
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
40939449 attatgatgaattctaacccccttaccttagttatattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 40939521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 55440782 - 55440746
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55440782 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 55440746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Original strand, 13817492 - 13817567
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
13817492 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 13817567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 33369198 - 33368951
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||| ||  ||    
33369198 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcgtcaacaacaatattcct 33369099  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttca 540  Q
    || || |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||       || | || ||||            ||||||||    
33369098 taacaacaaaaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaa-------ttcacagtataa------------cattttca 33369018  T
541 tatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacata 607  Q
     ||||| ||| ||| ||||||||||||| | || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
33369017 catactatgaacatgcaatttcaccaaccacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata 33368951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Original strand, 54424268 - 54424369
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  ||||||||||| | |    || | |||||||||||||||||||||||||||||    
54424268 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaattgaaat---aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 54424363  T
738 agttag 743  Q
    ||||||    
54424364 agttag 54424369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 43427804 - 43427555
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || || |||||||| |||||  ||||  || |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||| |     
43427804 tcaacccattttcacaaaaccaacatcaacaacttatttcatatcacaaactcatgatttatgaacaccaaagctatgaatcatcaacaacaatatctc- 43427706  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttca 540  Q
     | || |||  ||||||||| | ||||| ||||| || || | |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||| |   ||||||||||||||    
43427705 -aacaacaacaacatcaattaatcatgattctcatcacaactcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatcattttca 43427607  T
541 tatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
     ||||| ||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||    
43427606 catactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttc 43427555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 16181937 - 16181800
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
16181937 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 16181843  T
738 agttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    || ||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
16181842 ag-tagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 16181800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 471
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994025
Alignment:
382 catcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatc 471  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||    
47993937 catcatcaattcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatc 47994025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 471
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012598
Alignment:
382 catcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatc 471  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||    
48012510 catcatcaattcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatc 48012598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 469
Target Start/End: Original strand, 54423993 - 54424097
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||  |||||||||||     
54423993 caacaacaacttatttctcat-aacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagcaataacaacatcaattgat 54424091  T
464 catgaa 469  Q
    ||||||    
54424092 catgaa 54424097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 317500 - 317403
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
317500 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 317406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Original strand, 38528050 - 38528121
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||    
38528050 attatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaagcttcaattttgctcctag 38528121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 54685597 - 54685514
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatca 426  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||    
54685597 tcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaatccaagccatgaattatca 54685514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Original strand, 13817833 - 13817864
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
13817833 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 13817864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Original strand, 14298399 - 14298473
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
14298399 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 14298473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Original strand, 14304026 - 14304100
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
14304026 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 14304100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 16995985 - 16995954
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
16995985 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 16995954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 471
Target Start/End: Original strand, 13838873 - 13838982
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||   |||| | |||||  ||||||||| ||| |||| |  |||||||||    
13838873 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaa-tatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaatt 13838971  T
461 gaacatgaatc 471  Q
    ||||| |||||    
13838972 gaacaagaatc 13838982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 17100636 - 17100738
Alignment:
367 caacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacat 466  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||   | ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||    
17100636 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcat 17100735  T
467 gaa 469  Q
    |||    
17100736 gaa 17100738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 17101321 - 17101423
Alignment:
367 caacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacat 466  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||   | ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||    
17101321 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcat 17101420  T
467 gaa 469  Q
    |||    
17101421 gaa 17101423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 17956262 - 17956209
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagt 414  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
17956262 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagt 17956209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 469
Target Start/End: Original strand, 38167894 - 38167999
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||   | ||||||||||| || |||  ||||| |||||     
38167894 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 38167993  T
464 catgaa 469  Q
    ||||||    
38167994 catgaa 38167999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 51961403 - 51961298
Alignment:
365 aacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaac 464  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||| || || ||||||||   |||||| ||||| ||||||||| | || || |||  ||||||||| | |    
51961403 aacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttgtgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaattaagc 51961304  T
465 atgaat 470  Q
    ||||||    
51961303 atgaat 51961298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 37957341 - 37956849
Alignment:
315 atgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
37957341 atgaaaacaattgacatttgaaccaagtcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagc 37957242  T
415 tatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttaga 514  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||    
37957241 cgtgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaccacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatattccaaattgacatttaga 37957142  T
515 gsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcat 614  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
37957141 gcataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaactaatcaattaccaccaatttcttacatacaaacataacatcat 37957042  T
615 aataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatg 714  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
37957041 aataggagcacgaattccaacaatcatgaacaattaatcaattactcaattaaacaaataatcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatg 37956942  T
715 atgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
37956941 atgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttggatcttcaag 37956849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 312 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 19822095 - 19821628
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
19822095 aacatgaaaaccattgacatttgaaccaattcaactcattttacaaagtcaccaaaaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaataccca 19821996  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||  |||||| ||||| || ||||||    
19821995 agccatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaataacatatcacaa-ttatcattt 19821897  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
19821896 agagcataatatgacatatatcattttcatacactttgatcactcaatttctccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacatacaaacataacat 19821797  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
19821796 cataataggagcacgaactctaataatcatgatcaattaatcaattactcaattaagcacttattcataaaacaattgaaaattgacactaaaaatgatt 19821697  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
19821696 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattctctagttctagcttcactttagctcctag 19821628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 364 - 813
Target Start/End: Original strand, 15044808 - 15045256
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
15044808 caacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 15044907  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |  ||| || ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||    
15044908 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 15045007  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    ||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
15045008 ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa 15045107  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagc 763  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
15045108 ttaagcacttattcatacaacaattgagaatttaaact-aaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagc 15045206  T
764 ttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||||    
15045207 ttcaccttagctcctagctctct-tccaatccttgaatcttcaagttcctc 15045256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 364 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 15109616 - 15109168
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||  |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||    
15109616 caacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaacaacaacatcaattgaa 15109517  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || || ||| || ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||    
15109516 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 15109417  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    ||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
15109416 ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaactattatgaataattaatcaattactcaa 15109317  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagc 763  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
15109316 ttaagcacttattcatacaacaattgagaatttaaact-aaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagc 15109218  T
764 ttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||||    
15109217 ttcaccttagctcctagctctct-tccaatccttgaatcttcaagttcctc 15109168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 7965003 - 7964536
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||    
7965003 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatca 7964904  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  | ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| |||||   ||||||| || |||    
7964903 cttagcaacaacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacacttt 7964804  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    || |||| |||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||| |     
7964803 cacatac-ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaac 7964705  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
7964704 tatgaacaattactcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 7964607  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
7964606 agttagcacaaattccttgcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 7964536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Original strand, 18276389 - 18276856
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||| |||||||||  || ||| ||||| ||||| ||||    
18276389 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatactcatcgtcaaatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatca 18276488  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| ||| ||||| |   ||||||||| |||||   ||||||| || |||    
18276489 ctttgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacacttt 18276588  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    || || |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||| |  ||||||| ||| |||| |     
18276589 cacatgctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaac 18276688  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |  ||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
18276689 tatgaacaattaatcacatactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaatcgcact--aaatgattatgattgaattctaaccccgttacctt 18276786  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
18276787 aattagtacaa-ttcctagctcaagcttcactttagctcctaggatctgtaccacttcttgaatcttcaag 18276856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 364 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 7186111 - 7185669
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||  |||||||||  |||||| ||||| || || ||| ||||||| |||  ||||||||| ||    
7186111 caacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaa 7186012  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |  |||||||| | | |||   |||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||    
7186011 catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcatcatttagtgcacaattcaacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttca 7185912  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||  ||| |||| |  ||||||||||||||| ||| ||||    
7185911 ccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttattcaa 7185812  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagc 763  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||| ||| |    
7185811 ttaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattctaacctccttaccttaattagcacaaattcctagcccaaac 7185714  T
764 ttcactttagctcctagg-ttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||    
7185713 ttcactttagctcataggatcctcaccacttcttgaatcttcaag 7185669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 361 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 41166216 - 41165774
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||    
41166216 cacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 41166117  T
461 gaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatt 560  Q
    |||||||| |||   || |||| |||| ||||||| || || |   || || ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||    
41166116 gaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 41166017  T
561 tcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattact 660  Q
    |||| ||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| |||| |||  |||||||| |||||||  ||||||||          |||||||||||||||    
41166016 tcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaatatattatcataattggagcacaaattctaac----------aattaatcaattact 41165927  T
661 caattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctca 760  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||   | | |||||||| ||    
41165926 caattaagcacttattcataccacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagccca 41165827  T
761 agcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||    
41165826 agcttcactttagctcctaggaactctccaattcttgaatcttcaagctcctc 41165774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 13809829 - 13809330
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| |   |||||| ||   || ||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||| | |||    
13809829 aacatgaacacaattgacatttggaccaattcaccaatttttaccaaactactaacaacatctcatttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatcca 13809730  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||||||  |||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   |   |    
13809729 agccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaat 13809630  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| ||| |   ||||||| |||||||  ||||||||| |||  ||| |||||||||| || | ||||| || ||| ||| | ||| ||||||||  ||    
13809629 tgagcatatttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaaatctcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcat 13809530  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  ||  | |||| |||    
13809529 cataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaatggca--ataaatgatt 13809432  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||  | |||||||||||||||||    
13809431 atgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcaatttagcccctagctctctc-ccaatccttgaatcttcaagttc 13809333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 349 - 827
Target Start/End: Original strand, 14901197 - 14901673
Alignment:
349 attttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagca 448  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||    
14901197 attttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaaca 14901296  T
449 aacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatacttt 548  Q
    |  |||||||||||| |||| ||| | || |||| || |  |||||| || || |   ||||| ||| ||| |   |||||||||| ||||  ||||||     
14901297 acaacatcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcatatttaaacatatatcactttctcatacttc 14901396  T
549 gatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaat 648  Q
     | |||  |||||||||||||| || | |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||   |||||||  ||||||| ||| |||| |  |||||||||    
14901397 aaacatgaaatttcaccaacaacaa-tcaattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaat 14901495  T
649 taatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaa 748  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
14901496 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaaa-tgattatgatgaaatttaacccccttaccttagttagatcaa 14901594  T
749 tttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctccttcgataaccctt 827  Q
    |  || |||| ||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||| | |||||||  ||||||||    
14901595 tccccaagcttaagcttcactttaactcctaggttcccccttcctcttgaatattcaagcttctccttctctaaccctt 14901673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 610 - 780
Target Start/End: Original strand, 27961197 - 27961366
Alignment:
610 atcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataa 709  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
27961197 atcataattggagcacggattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaa-tttacactaacaatga 27961295  T
710 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
27961296 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcacttttgctcctag 27961366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 52265775 - 52265360
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
52265775 caacatcaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 52265676  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||||||| | || |||| |||| ||||||  || || |   || || ||| ||| |   ||||||| || ||||  ||||||||| |||  ||||||     
52265675 catgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacataaaatttct 52265576  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactca 662  Q
    | ||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||    
52265575 ctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatt-tcatcatctatgaacaattaatcaattaccca 52265477  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaa 761  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| |     
52265476 attaaacacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtcagattaatctccctagcttag 52265379  T
762 gcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||| ||||||||||||    
52265378 gcttcaatttagctcctag 52265360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 15013549 - 15013136
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  | ||||||| ||    
15013549 caacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaattaaa 15013450  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| |||| |||| || ||||| |   || || ||| ||||| | ||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
15013449 catgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataat-tcacaatatgtcattttcacatactatgaacatgcaatttc 15013351  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||||| | ||| ||| ||||  ||||||||  ||||||| |||  ||| |  ||||||||||||||| ||| |||    
15013350 accaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaa-catatcatcataattagagcacgaatttaaacaactatgaacaattaatcacttattca 15013252  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaa 761  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||||||||   |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||    
15013251 attaagcacttaaacatacaacaaatgaaaattacaact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaa-atcctagctcaa 15013155  T
762 gcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||||||||||    
15013154 gcttcactttagctcctag 15013136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 312 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 41256698 - 41256259
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaaca---------aattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaatta 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         || |||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
41256698 aacatgaaaacaattgacatttgaacataattcaccaaatcaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgattta 41256599  T
402 tgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaa 501  Q
    || ||||||||   |||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||||||  ||||| || |||| |||| |||| || |||||    
41256598 tgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaa 41256499  T
502 attgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatac 600  Q
     |   || || ||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| |    
41256498 ttcaacaatttgagcataat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattc 41256400  T
601 aaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-a 699  Q
    || |||   ||||||||  ||||||| |||  ||| |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| |    
41256399 aa-catttcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaa 41256301  T
700 ctaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagtta 742  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
41256300 ct--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagtta 41256259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 542 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 18494416 - 18494181
Alignment:
542 atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcat 641  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| || | ||||||||  || ||| ||||||| |||||   |||||||| |||||||| |||||||| || ||    
18494416 atactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcat-aacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattat 18494318  T
642 gaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 741  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
18494317 gaacaattgatcaattacacaattaagcacctattcataccataattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 18494221  T
742 agatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||| ||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||    
18494220 agattaatctccctagcttaagcctcaatttagctcctag 18494181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 649 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 34177629 - 34177501
Alignment:
649 taatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaa 748  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
34177629 taatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaa--tgattatgatgaattctaacccc-ttaccttagttagatcaa 34177533  T
749 tttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
34177532 ttccctagctctagcttcactttagctcctag 34177501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 364 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 30232763 - 30232386
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||   | ||||||||||| || |||  ||||| |||||     
30232763 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaataatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat 30232664  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatca-ttttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    |||||| || | || ||||||||| ||||||| || || |   || || ||| ||| | | |||||   || |||||| |||||||||||||  | ||||    
30232663 catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttc 30232565  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    |||||||| || | ||||||||  || ||| || ||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
30232564 accaacaacaattcaattatcat-aacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattacaca 30232466  T
663 attaagcaattattcatacaacaattg-aaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||  | || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
30232465 attaagcacttattcataccataattgaaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaaccctcttaccttagttag 30232386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 47535364 - 47534904
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||    
47535364 aacatgaaaaccattgacatttgaaccaattca-ccaattttacaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactca 47535266  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||| ||||| ||||                   || |||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||| || || |  ||| ||    
47535265 agccatgaatcatcaacaaca-------------------acgtcaattgaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 47535185  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| ||| |   |||||||||| ||||  ||||||||| | |  |||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||    
47535184 tgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcat 47535085  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    ||||||  ||||||| ||| || |  | |||||||||||||                || ||| |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||    
47535084 cataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaat----------------catttaatcatacaataatggaaaaattacact-aaaatgatt 47535002  T
712 atga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
47535001 atgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctcgcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaag 47534904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 364 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 13442946 - 13442681
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagca--aac-acatcaatt 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||  ||| |||||||||    
13442946 caacaacaactcatttctcatcatcaattcataatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaaaatctcttaacaacaacaacaacatcaatt 13442847  T
461 gaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaat 559  Q
     ||||||| ||||| || |||| ||||  |||||||||||| |   ||||||||| ||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||    
13442846 aaacatgattctcatcacaattcaacaataacataacacaattcaacatttagagcataat-tcacaatataacattttcacatactatgaacatgcaat 13442748  T
560 ttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||| | |||||||    
13442747 ttcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacg 13442681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 364 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 18238424 - 18238162
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  || |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
18238424 caacaacaacttatttcacatcactaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 18238325  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
18238324 catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 18238226  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    |||||||| || | ||||||||||||| || |  || ||||||||  ||||||| | |||||||    
18238225 accaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacg 18238162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 364 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 50220207 - 50219979
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  || |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
50220207 caacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 50220108  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||| ||||| || || | |||| ||||| ||||||| |   ||||||||| | |||   | |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||    
50220107 catgattctcatcacaaatcaacaacaacacaacacaattcaacatttagagcacaattcaaaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 50220008  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||||||    
50220007 ccaacaacaattcaattatcactaatttc 50219979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 469
Target Start/End: Original strand, 16732097 - 16732254
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||| |   ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
16732097 aacatgaaaacaattgacattatgaccaattcaccaagtttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaaccca 16732196  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    ||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
16732197 agccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaattgatcatgaa 16732254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 472
Target Start/End: Original strand, 27960900 - 27961059
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||   |||||||| | |||||||| || ||| ||||||| ||| ||||| |||||    
27960900 aacatgaaaacaattgacatttgaaccaattcaccaatttttaccaaactaccaacaatatctcatttctcaacaataaatcat-aatcatgcataccca 27960998  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatct 472  Q
    |   |||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||||    
27960999 aaccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatct 27961059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 607
Target Start/End: Original strand, 38764689 - 38764932
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||  |||| || |||  ||||||||| ||    
38764689 caacaacaacttatttctcatcttcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaa 38764788  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||  || || |   || || ||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||||    
38764789 catgattctcatcataattgaacaacaacatcgcataattcaacaatttgagcacaat-tcacaatataacattttcacatactatgaacatgtaatttc 38764887  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacata 607  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
38764888 accaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacata 38764932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 542 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 40885658 - 40885458
Alignment:
542 atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcat 641  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||  | || | | |||| ||| ||| || | | |||    
40885658 atactttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaatt-catgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattttagcaaacat 40885560  T
642 gaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaa----taattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| || |||||||||||| || |  ||| |||| ||||| |    | |||||||||||||||||||||||||||||    
40885559 gaacaattatccaattattcaattaatcacttattcatacaagaaatagaaaattactctaaataatcatgattatgatgaattctaacccccttacctt 40885460  T
738 ag 739  Q
    ||    
40885459 ag 40885458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 40905214 - 40905064
Alignment:
350 ttttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaa 449  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  | || | ||||| ||||| ||| ||||||| |||    
40905214 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccacgagtcatcaacaacaatatctcttagcaacaa 40905115  T
450 acacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaa 501  Q
      ||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||    
40905114 caacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaa 40905064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 592
Target Start/End: Original strand, 54398391 - 54398591
Alignment:
392 tcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaa 491  Q
    |||||| ||||  |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || || | |||| |||    
54398391 tcatgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaa 54398490  T
492 cataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatt 590  Q
    |||||||||| |   || |||||| | ||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||    
54398491 cataacacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatattattttcatatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatt 54398589  T
591 tc 592  Q
    ||    
54398590 tc 54398591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 18494647 - 18494464
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |||||| || ||||| || ||  ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||| ||||    
18494647 aacatgaacacaattgacaattggaccaattca-ccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcataccc 18494549  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    |||  |||| ||| ||  |||||||||||||| || |||   || ||||||| ||||||||| | || |||| |||| |||||||    
18494548 aagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaacaacagcaacaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacata 18494464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 34395234 - 34395342
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||  |||||||| || ||||| |||  |||||||||    
34395234 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaacatcaatt 34395333  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
34395334 gatcatgaa 34395342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 47468610 - 47468522
Alignment:
350 ttttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
47468610 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaacatca 47468522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23270204 - 23270097
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||| || |||  |||||||||    
23270204 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 23270105  T
461 gaacatga 468  Q
    || |||||    
23270104 gatcatga 23270097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 47468527 - 47468387
Alignment:
452 acatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttga 550  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||| |   || |||||| | ||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||    
47468527 acatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaat-tcacactatatcattttcacatactatga 47468429  T
551 tcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
     ||| ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
47468428 acatacaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttc 47468387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 12837468 - 12837336
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||   | ||||||||||| || |||  ||||| ||||    
12837468 accaacaacaacttatttctca-caacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattg 12837370  T
462 aacatgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    | |||||| || | || ||||||||| |||||||    
12837369 accatgaaacttatcacaatttaacaacaacata 12837336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 23269858 - 23269753
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| |||||||| |   ||||  | ||||| ||||||||    
23269858 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcaactccaatccttgattcttcaag 23269759  T
808 ttcctc 813  Q
    ||||||    
23269758 ttcctc 23269753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 41917016 - 41916766
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||  || |||||| || || |||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||    
41917016 tcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttttgaacactcaagcaatgaatcatcaacaacaatatctct 41916917  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||  |||||| || ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||  | || ||||||||| |||    
41916916 taacaacaacaacatcagttaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaa-ctcacaatatatcatcttc 41916818  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaattt 591  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
41916817 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattatattatcaccaattt 41916766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 20813471 - 20813399
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
20813471 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttcgctcctag 20813399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 53705003 - 53704895
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||| | || |||  ||| |||||    
53705003 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 53704904  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
53704903 gatcatgaa 53704895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 55376867 - 55376759
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| | ||| || |||  ||| |||||    
55376867 caccaacatcatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataatttaacaacaacaacaacaatt 55376768  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
55376767 gatcatgaa 55376759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 13590341 - 13590113
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| | ||| |||||   | |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || || ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
13590341 caacaacaacttaattcacatcatagactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 13590242  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||||||||| || || | |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||| ||| | ||| ||| || ||||    
13590241 catgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcagtttc 13590143  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | |||||  || | ||||||||||||||||    
13590142 atcaacatcaattgaattatcaccaatttc 13590113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 704 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 21959393 - 21959354
Alignment:
704 aaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21959393 aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 21959354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Original strand, 44055892 - 44055967
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
44055892 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 44055967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Original strand, 44056170 - 44056271
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||   || | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
44056170 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 44056265  T
738 agttag 743  Q
    ||||||    
44056266 agttag 44056271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 53907966 - 53907891
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
53907966 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 53907891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 709 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 819855 - 819821
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
819855 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 819821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 707 - 740
Target Start/End: Original strand, 30458224 - 30458257
Alignment:
707 taattatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30458224 taattatgatgaattctaacccccttaccttagt 30458257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 53704725 - 53704627
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| | |||   ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
53704725 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaaataaca---aaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 53704630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 12837125 - 12837094
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
12837125 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 12837094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 712 - 743
Target Start/End: Original strand, 34395583 - 34395614
Alignment:
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
34395583 atgatgaattctaacccccttaccttagttag 34395614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 53907633 - 53907602
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
53907633 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 53907602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 15674985 - 15674920
Alignment:
762 gcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctccttcgataaccctt 827  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||  ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
15674985 gcttcactttagctcctaagctcactccaattcttgattcttcaagtttctccttctctaaccctt 15674920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 379
Target Start/End: Original strand, 16522776 - 16522813
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt 379  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
16522776 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt 16522813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 40905034 - 40904973
Alignment:
531 atcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
40905034 atcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttc 40904973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 3559 - 3065
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||    
3559 aacatgaaaacaattaacatttgaaccaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatctacaa-tcatgaattatgaacaccca 3461  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||      ||||||| ||||||||| |||||    
3460 agccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaacctaagcataatt------caacatatcacaaattgacattt 3367  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
3366 agagaataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacat 3267  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
3266 cataataggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcacataatcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatt 3167  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcc 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
3166 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctcttctcttcttgaatcttcaagttcc 3067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 312 - 827
Target Start/End: Original strand, 722323 - 722831
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
722323 aacatgaaaacaattgacatttgaaccaattcaaccaattttacaaagtcaccaacaacaactcatatctcatcaataaatcatgaattatgcacaccca 722422  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||    
722423 agccatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaactacttcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacattt 722522  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
722523 agagcataa----acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataatat 722618  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||  |||| |||    
722619 cataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgcaaa-ttgcact--aaatgatt 722715  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcc 811  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
722716 atgatgaattctaacccctttaccttagttagttcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctctcatcttcttgaatcttcaagtttt 722815  T
812 tccttcgataaccctt 827  Q
    ||||||  ||||||||    
722816 tccttctctaaccctt 722831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 314 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 24294839 - 24294341
Alignment:
314 catgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaag 413  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| || || |||| ||   ||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||    
24294839 catgaaaacaattgacatatgcaccaattca-ccaatattaccaaactaccaacaattacttatttctcatccacaaatcatgaattatgaatactcaag 24294741  T
414 ttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttag 513  Q
      |||||| ||||  |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| |    
24294740 ccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttgg 24294641  T
514 agsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatca 613  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||    
24294640 agcataatataacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcatcaatttctcacatacaattataacatca 24294541  T
614 taataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattat 713  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24294540 taattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactcaattaagaatttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat 24294441  T
714 gatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
24294440 gatgaactttaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaaacttcaatttagctcctaggttctctcctcctcttgaatcttcaagctcctc 24294341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 364 - 806
Target Start/End: Original strand, 67972 - 68413
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
67972 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 68071  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   || || ||| ||| |   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||    
68072 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 68171  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    ||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
68172 ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatctattactcaa 68271  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagc 763  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
68272 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatattaattccctagctcaagc 68371  T
764 ttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaa 806  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    
68372 ttcactttagcttctagg-tctctccaactcttgaatcttcaa 68413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 359 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 31146452 - 31145999
Alignment:
359 gtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaa 458  Q
    ||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| | |  |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||    
31146452 gtcaccaacaataactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacctaggccatgatttatcatcaacaacatcacttagcaacagtaacatcaa 31146353  T
459 ttgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaa 558  Q
    ||||||| |||||| |  | |||| |||| || |||| || || |   || || ||| ||| |   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||    
31146352 ttgaacaggaatcttattacaattcaacaaca-catagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacataaaa 31146254  T
559 tttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaatta 658  Q
    |||| | ||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||    
31146253 tttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaattaatcaatta 31146154  T
659 ctcaattaagcaattattcatacaacaatt-gaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagc 757  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
31146153 ctcagttaagcacttattcatacaacaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattctctagc 31146054  T
758 tcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcct 812  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
31146053 ccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagctcct 31145999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 343 - 807
Target Start/End: Original strand, 43645853 - 43646318
Alignment:
343 caacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactta 442  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
43645853 caacccattttacaaaaccaccaccaacaactcaaatgacatca-caaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcgacaacaacatcactta 43645951  T
443 gcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcata 542  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||| ||| | || | || |||| ||||||| || || |   || || ||| |||||   |||||||||| ||||  |    
43645952 gcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctca 43646051  T
543 tactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatg 642  Q
    |||||| | |||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||  | ||||||  ||||||| ||| |||| |   ||    
43646052 tactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaattataacaactttg 43646151  T
643 aacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagtt 741  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
43646152 aacaattaatcatttactcaattaaacacttattcatacaacaattggaaatttacactaaaaatgattatgactgaattctaacccccttaccttaatt 43646251  T
742 agatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
43646252 atcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaag 43646318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 525 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 22775311 - 22775044
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||| |||  | |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||    
22775311 acatatataactttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagca 22775212  T
625 cggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattcta 724  Q
    || ||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
22775211 cgaattctaac----------aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctt 22775122  T
725 acccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatct 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
22775121 acccccttaccttagttagatcaattccctacctcaagattcactttagctcctaggtcctctccaactcttgaatct 22775044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 525 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 22780689 - 22780422
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||| |||  | |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||    
22780689 acatatataactttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagca 22780590  T
625 cggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattcta 724  Q
    || ||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
22780589 cgaattctaac----------aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctt 22780500  T
725 acccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatct 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
22780499 acccccttaccttagttagatcaattccctacctcaagattcactttagctcctaggtcctctccaactcttgaatct 22780422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 577 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 23821693 - 23821467
Alignment:
577 aattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattatt 676  Q
    |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||      
23821693 aattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaag 23821594  T
677 catacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctc 776  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
23821593 catgcaataattgaaaaattacactaaa--tgattataatgaaatctaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaagcttcactttagctc 23821496  T
777 ctaggttctctcctcttcttgaatcttca 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
23821495 ctaggttctctcctcttcttgaatcttca 23821467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 577 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 23830772 - 23830546
Alignment:
577 aattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattatt 676  Q
    |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||      
23830772 aattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaag 23830673  T
677 catacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctc 776  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
23830672 catgcaataattgaaaaattacactaaa--tgattataatgaaatctaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaagcttcactttagctc 23830575  T
777 ctaggttctctcctcttcttgaatcttca 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
23830574 ctaggttctctcctcttcttgaatcttca 23830546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 351 - 807
Target Start/End: Original strand, 19666495 - 19666950
Alignment:
351 tttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaa 450  Q
    ||||||||  || |||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||| | |||||||  |||||| |||||  |||| ||||||||||| |||     
19666495 tttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaac 19666594  T
451 cacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttga 550  Q
     ||||||||||||||||  ||||| ||||||| || | ||||||| || || |   |  || ||| |||||     |  || || ||  | |||||||||    
19666595 aacatcaattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataattcataagttaacacttatacatactttga 19666694  T
551 tcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaatta 650  Q
     ||| ||| |||||||| || || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  || ||| |  ||||| | ||| |||| |  |||||||||||    
19666695 acatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaactatgaacaatta 19666794  T
651 atcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatt 750  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
19666795 atcacttattcaattaagcatttattcatacaataattgaaaaattacactaaa--tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaat 19666892  T
751 tcctagctcaagcttcactttagctcctagg-ttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
19666893 tcctagcccaaacttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaag 19666950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 19669376 - 19668961
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||||    
19669376 caacaacaactcatttttcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 19669277  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtc-atttagagsataatatgacatat-atcattttcatatactttgatcattcaattt 561  Q
    ||||  || || ||||||| |||| ||||||| || || |   | | ||| || || || | |||  | | || || || |||||| || ||| ||||||    
19669276 catggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaatta-agcatgat-tcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaattt 19669179  T
562 caccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattact 660  Q
    ||||||||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  | |||| |  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||      
19669178 caccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaac-atctatgaacaattaatcatttatc 19669080  T
661 caattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctca 760  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
19669079 caattaatcacttattcatacaataattgaaaaattacactaaaa-tgattatgatgaattctaaccccgttaccttagttagattaattccctagctca 19668981  T
761 agcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||    
19668980 agcttcactttagctcctag 19668961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 22580177 - 22579715
Alignment:
313 acatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaa 412  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| |   |||||| ||  ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||    
22580177 acatgaaaacaattgacattaggaccaattcaccaatttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaa 22580078  T
413 gttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaa--cataacacaaattgtcatt 510  Q
    |  |||||||||||  ||||||||||| || |||||   ||||||||||| |||||| || | || |||| |||| |||  |||||  |||     || |    
22580077 gccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcagcaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaagcataattcaac----caat 22579982  T
511 tagagsataatatgacatatatcattttcat-atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaa 609  Q
    | ||| ||| |   ||||||| ||||||  | |||| ||||||||  | |||||||||||| || | ||||||||  || ||| |||||||||||||       
22579981 t-gagcatatttcaacatataacatttttctcataccttgatcataaagtttcaccaacaacaattcaattatcat-aacttcatacatacaaacatgtc 22579884  T
610 atcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataa 709  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |   || | | |    
22579883 atcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattacacaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgc---aatagtga 22579787  T
710 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||    
22579786 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttaaattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctag 22579715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 362 - 812
Target Start/End: Original strand, 25305423 - 25305860
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattg 461  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||    
25305423 accaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaattg 25305522  T
462 aacatgaatctcagcataatttaaca-tcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatt 560  Q
    ||||||| ||| | || |||| |||| |||||||| || || |   || || ||| |||||   ||| |||||| ||||  ||||||||| |||  ||||    
25305523 aacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacacatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 25305622  T
561 tcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattact 660  Q
    ||| ||||||               ||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||| |   |||||||||||||| |||||    
25305623 tcatcaacaa---------------caacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttact 25305707  T
661 caattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctc 759  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | ||| |||| |    
25305708 caattaagcacttattcatacaacaattgtaaaattatact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcatagccc 25305806  T
760 aagcttcactttagctcctaggttctc-tcctcttcttgaatcttcaagttcct 812  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||    
25305807 aagcttcactttaactcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcct 25305860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 342 - 607
Target Start/End: Original strand, 24884644 - 24884909
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||  ||    
24884644 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcctcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctatt 24884743  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttca 540  Q
    |||| |||  ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||  |||||| ||||| |   ||||||||| ||||  | || |||||||| |||||    
24884744 agcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcataa-ctcacaatatatcactttca 24884842  T
541 tatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacata 607  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| | | ||| ||||||||    
24884843 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacata 24884909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 342 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19433621 - 19433495
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| |||    
19433621 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctctt 19433522  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatga 468  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||    
19433521 agcaacaacaacatcaattgaacatga 19433495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 533 - 805
Target Start/End: Original strand, 19660029 - 19660299
Alignment:
533 cattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattct 632  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||||||  ||||||| | |      
19660029 cattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaaattc 19660128  T
633 aaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaaccccct 731  Q
    ||| ||| | |||||| |||||| ||| || ||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |    
19660129 aac-atctaagaacaaataatcacttattccattaaacacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaag-tgattatgatgaattctaacccc-t 19660225  T
732 taccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttca 805  Q
    ||||||| |||   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||    
19660226 taccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctccaactcttgaatcttca 19660299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 312 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 24571610 - 24571145
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||||| ||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || || | |||    
24571610 aacatgaacacaattgacatttggacaaattcaccaatttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagcca 24571511  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||| ||||||  |||||||||||||| || |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||  |||||| || || |   |   |    
24571510 ag-catgagttatcatcaacaacatcacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaat 24571412  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| ||| |   |||||||||||||||  |||| |||| |||  |||||| | ||||| || | || ||||  ||| ||| | ||| ||||| |   ||    
24571411 tgagcatatttcaacatatatcattttctcataccttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcat 24571312  T
612 cataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataat 710  Q
    || |||  ||||||| ||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |   || ||| ||    
24571311 caaaattagagcacgaatt-tcatcatctatgaacaattaatcaattacccaattaagcatttattcatacaataattgaaacattgc---aataatgat 24571216  T
711 tatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| || || ||||| ||||||||||||    
24571215 tatgatgaattctaaccccctaaccttagttagattaatctccctatcttaaacttcaatttagctcctag 24571145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23821872 - 23821735
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
23821872 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 23821773  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaa 501  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||||    
23821772 catgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaa 23821735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23830951 - 23830814
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
23830951 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 23830852  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaa 501  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||||    
23830851 catgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaa 23830814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 639 - 813
Target Start/End: Original strand, 27262058 - 27262232
Alignment:
639 catgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||    
27262058 catgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaa--tgattatgatgaattctaactcccttacctt 27262155  T
738 agttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||||| ||| | ||||||| | |||||| |||||||||||| ||  | ||  | ||||| ||||||||||||||    
27262156 agttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctttcccccaatccttgattcttcaagttcctc 27262232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 639 - 745
Target Start/End: Original strand, 25602279 - 25602384
Alignment:
639 catgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
25602279 catgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaa--tgattatgatgaattctaacccccttacctt 25602376  T
738 agttagat 745  Q
    ||||||||    
25602377 agttagat 25602384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 362 - 626
Target Start/End: Original strand, 24277739 - 24278003
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  |||||| ||     
24277739 accaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcattta 24277838  T
462 aacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatt 560  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
24277839 aacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatt 24277937  T
561 tcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    |||||||||| || | |||| |||||||| || |  || ||||||||  ||||||| | |||||||    
24277938 tcaccaacaacaattcaattgtcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacg 24278003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Original strand, 9636702 - 9636953
Alignment:
342 tcaacccatttta-caaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| |||||  || |||||| ||||| | ||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| ||    
9636702 tcaacccattttaacaaaaccaacaacaacaagttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctct 9636801  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttc 539  Q
    || || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || |||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
9636802 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcataat-tcacaatatatcattttc 9636900  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
9636901 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 9636953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 28974026 - 28974134
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  |||||||||    
28974026 caccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 28974125  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
28974126 gatcatgaa 28974134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 556 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 24087462 - 24087295
Alignment:
556 caatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaa 655  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |     ||||||||  ||||||||  |||| || ||| ||||  | ||||| |||||||||     
24087462 caatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtgctcaaacatatcatcataattagagcccgaattttaacatttatgaataattaatcac 24087363  T
656 ttactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaa 725  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
24087362 ttactcaattaagcacttaatcatacaacaa-tgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattctaa 24087295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 709 - 813
Target Start/End: Original strand, 7321843 - 7321947
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||  | ||||||||||||||    
7321843 attataatgaattctaacccccttaccttagttagattaattcccaagctcaaacttcaatttagctcctagatctct-tccaatccttgaatcttcaag 7321941  T
808 ttcctc 813  Q
    ||||||    
7321942 ttcctc 7321947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 469
Target Start/End: Original strand, 27261734 - 27261891
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| |   ||| || ||  ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||| |||||    
27261734 aacatgaaaacaattgacattaggaccaattcaccaagtttcaccaaaacaccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaaccca 27261833  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    ||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  | ||||||||| ||||||    
27261834 agccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaatatcaattgatcatgaa 27261891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Original strand, 271426 - 271564
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||||||| || || |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
271426 atgaataattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctta 271521  T
739 gttagatcaatttcc-tagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| | |||||| ||| ||||||||    
271522 gttaggttaatctccttagcttaggcttcaattttgctcctag 271564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 498
Target Start/End: Original strand, 271099 - 271284
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| || ||  ||||||||||| |||||| | || || |||||||||||| ||||| ||||    
271099 aacatgaaaacaattgacattaggaccaattca-ccaattttcaccaaagcaccaacaacatctcattcctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaaccc 271196  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataaca 498  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||| || || || |||  ||||||||||| |||||| || | || |||| |||| ||||| ||||    
271197 aagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaaca 271284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 4448124 - 4448021
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||| || || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
4448124 atgaacaattaatcaattcactcaattaagcactt-ttcatataaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctt 4448029  T
738 agttagat 745  Q
    ||||||||    
4448028 agttagat 4448021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 563
Target Start/End: Original strand, 6094673 - 6094895
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||| | |||||  || |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||    
6094673 tcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattccacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctct 6094772  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || || | |||| ||||||||||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||    
6094773 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttc 6094871  T
540 atatactttgatcattcaatttca 563  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||    
6094872 acatactatgaacatgcaatttca 6094895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23836975 - 23836910
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatca 426  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
23836975 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatca 23836910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 640 - 745
Target Start/End: Original strand, 28974305 - 28974407
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||  | |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
28974305 atgaacaattaatcaattcaccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgaaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctta 28974400  T
739 gttagat 745  Q
    |||||||    
28974401 gttagat 28974407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 32465835 - 32465943
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||| | || |||  |||||||||    
32465835 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaatt 32465934  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
32465935 gatcatgaa 32465943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 36890952 - 36890821
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||| ||||   |||||||||||||||| |||  ||| |||||||     
36890952 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacaacaattgat 36890853  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    |||||| || | || |||||| || |||||||    
36890852 catgaaacttatcacaatttatcaacaacata 36890821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4448450 - 4448271
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||| |   |||||| ||  ||||||||||| |||||||  || || |||||||||||| ||||| |||||    
4448450 aacatgaaaacaattgacattatgaccaattcaccaatttttaccaaa-caccaacaacatctcatttttcaaca-caaatcatgaatcatgcaaaccca 4448353  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaaca 493  Q
    ||  |||||||||||  |||||||| || || || |||  ||||||||||| |||||| || | ||||||| |||| |||||    
4448352 agccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataattcaacaacaaca 4448271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 25602001 - 25602109
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||| ||||||  |||||||| || ||||| |||  |||||||||    
25602001 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacatagcaacaacaacatcaatt 25602100  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
25602101 gatcatgaa 25602109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 467
Target Start/End: Original strand, 22138140 - 22138243
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||| | |||||||| || ||| | ||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||    
22138140 caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa 22138239  T
464 catg 467  Q
    ||||    
22138240 catg 22138243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 709 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 36890610 - 36890576
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36890610 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 36890576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 23836630 - 23836599
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
23836630 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 23836599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 688 - 807
Target Start/End: Original strand, 24884943 - 24885062
Alignment:
688 tgaaaatttacactaaaaataattatgat-gaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctag-ctcaagcttcactttagctcctaggttct 785  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||    
24884943 tgaaaaattacactaaa--tgattatgattgaattataacccccttaccttagtaagcacaa-ttcctagccccaaacttcaatttagctcctaggatct 24885039  T
786 ct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    || ||  ||||||||||||||||    
24885040 ctaccagttcttgaatcttcaag 24885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 25265675 - 25265541
Alignment:
361 caccaacaacaactcat-ttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaat 459  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||  |||| | || || |||||||||| ||| || |||  ||||||||    
25265675 caccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaat 25265577  T
460 tgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||    
25265576 tgaacatggttctcatcataattcaacaacaacata 25265541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 25875845 - 25875814
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
25875845 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 25875814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24560964 - 24560862
Alignment:
398 attatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataac 497  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| | || || |||  ||||||||| ||||||||||||| || | || |||| ||||||| |    
24560964 attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacatacc 24560865  T
498 aca 500  Q
    |||    
24560864 aca 24560862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 38033992 - 38033491
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||    
38033992 aacatgaaaacaattgataattgaaccaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaacttatttctcatcaacaa-tcgtgaactatgcacaccca 38033894  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||    
38033893 agccatgaattaacaacagcaacatcacttagcagcaatcacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaatatatcacaacttgacattt 38033794  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
38033793 agagcataatataacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacat 38033694  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
38033693 cataataggagcacgaattctaataatcattaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatt 38033594  T
712 atgatgaattctaaccccc-ttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttc 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38033593 atgatgaattctaaccccctttaccttagttatatcaattccctagttcgagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttc 38033494  T
811 ctc 813  Q
    |||    
38033493 ctc 38033491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Original strand, 19603025 - 19603521
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
19603025 aacatgaaaacaattaacatttggaccaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattattcacaccca 19603124  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||    
19603125 agtcatgaattatcaataaccacatcacttagcagcaactacatcaattgaacatgaatttcagcataattcaacatcaacatatcacaagatgacattt 19603224  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
19603225 agagcataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacat 19603324  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| |||    
19603325 cataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaatttgcact--aaatgatt 19603422  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcc 811  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
19603423 atgatgaattctagcccccttaccttagttagatcaatt---cagcccaagcttcactttagctcctaggttttctcctcttcttgaatcttcaagctcc 19603519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 312 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 20955758 - 20955245
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||| |    
20955758 aacatgaaaacaattaacatttgaaccaattcaaccccttttacaaagtcacccacaacaactcatttcacaccaacaattcacgaattattcacaccga 20955659  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||    
20955658 agccatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaactacatcaattgaacatgaatttcagcataattcaacatcaacatatcacaagatgacattt 20955559  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
20955558 agagcataatatgacatatatcattctcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacagatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacat 20955459  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||    
20955458 cataattggagcacaaattctaacaattatgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttgcact--aaatgatt 20955361  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcc 811  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
20955360 atgatgaattataacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctccttttcttgaatcttcaagcttc 20955261  T
812 tccttcgataaccctt 827  Q
    ||||||  ||||||||    
20955260 tccttctctaaccctt 20955245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 314 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 36356606 - 36356111
Alignment:
314 catgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaag 413  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||| || ||||||| ||   || | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
36356606 catgaaaacaattaacatttgcaccaattca-ccaattttaccaa---actaccaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaag 36356511  T
414 ttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttag 513  Q
      || ||| ||||  ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| |||||||    
36356510 ccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataaatcaacatcaacatatcacaatttgacatttag 36356411  T
514 agsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatca 613  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
36356410 agcataatatgacatatatcattttcatatactttgatccttcaatttcaccaacaacatttcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatca 36356311  T
614 taataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattat 713  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
36356310 taataggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat 36356211  T
714 gatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36356210 gatgaattctaacccccttactttagttagatcaattccctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 36356111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 312 - 807
Target Start/End: Original strand, 27674725 - 27675219
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
27674725 aacatgaaaacaaataacatttgaaccaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaa-aaatcatgaattatgcacaccca 27674823  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
27674824 agccatgaattatcaataacaacatcacttaacaacaactacaccaattgaacatgaatctcagcataattcaacctcaacatatcacaaattgacattt 27674923  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
27674924 agagcatgatatgacatatatcatttccatatactttgatcattcaatttcaccaataacaaatcaattatcaccaatttcttacattcaaacataacat 27675023  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
27675024 cataattggagcacgaattctaacagtcatgaacaaataatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaacgatt 27675123  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||    
27675124 atgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaatcttgaatcttcaag 27675219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 22829743 - 22829245
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22829743 aacatggaaataattgacatttgaaccaatccaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 22829644  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  ||||||||||||||  || |||||||| || |||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||    
22829643 agccatgaattatcaatagaaaaatcacttaacaacaattacatcaatggaacatgaaactcaacataattcaacctcaacatatcacaa-ttgacattt 22829545  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||    
22829544 agagcataatatgacatatatcattttcatatgctttgaccattcaatttcactaacaacaaatcaattatcaccagtttcatacattcaaacataacat 22829445  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||    
22829444 cataattggagcacgaattctaacaattatgaataattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgcact--aaatgatt 22829347  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcc 811  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||    
22829346 atgatgaattctaacccccttactttagttagatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggatccttcctcttcttgaatcttcaagctcc 22829247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 452 - 817
Target Start/End: Original strand, 16645980 - 16646345
Alignment:
452 acatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgat 551  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |  ||| || ||| |||||   |||||||||| ||||  |||||||||     
16645980 acatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaataattcaacatatatcactttctcatactttgaa 16646079  T
552 cattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaa 651  Q
    |||  ||||| |||||||  || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||    
16646080 catgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaa 16646179  T
652 tcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattt 751  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
16646180 tcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattc 16646279  T
752 cctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctccttc 817  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
16646280 cctagctcaagcttcactttagttcctaggttctctcattctcttgaatcttcaagttcctccttc 16646345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 455 - 807
Target Start/End: Original strand, 16656709 - 16657061
Alignment:
455 tcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcat 554  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |  ||| || ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| ||     
16656709 tcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacac 16656808  T
555 tcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatca 654  Q
      | |||||||||||| || | |||||||| ||| ||  | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
16656809 gaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatca 16656908  T
655 attactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcct 754  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
16656909 attactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccct 16657008  T
755 agctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16657009 agcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 16657061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Original strand, 17608883 - 17609351
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||    
17608883 aattcaacccattttccaaaaccaacaacaacaactcaattctcataatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatca 17608982  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    |||| || |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| |||||   ||||||| || |||    
17608983 cttaacaacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacacttt 17609082  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| | ||| |||| |||  ||||||||  ||||||| |||||||| |     
17609083 catatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaac 17609182  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
17609183 tatgatcaactaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 17609280  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
17609281 agttagcacaaattcctaacccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 17609351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 37234152 - 37233685
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||| |||||| ||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
37234152 aattcaacccattttacaaaaccaaccacaaaaactcaattttcatcatcaaatcatgatttatggacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatca 37234053  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||| || || |   ||||||||| |||||   |||||||||| |||    
37234052 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatatatcacttt 37233953  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||    |||||| |||||||| |     
37233952 catatactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaacaac 37233853  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     || |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
37233852 tattaacaattactcacttactcaattaagcacttaataatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 37233755  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
37233754 aattagcacaa-ttcctagcccaagcttcactttacctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 37233685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 326 - 807
Target Start/End: Original strand, 20177118 - 20177599
Alignment:
326 tgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatc 425  Q
    ||||||||| || |||||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | |||||  |||||| |||    
20177118 tgacatttgcaccaattca-ccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatc 20177216  T
426 aataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatga 525  Q
    |  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| | | | || |||| |||| ||||||| || || |   || || ||| |||||   |    
20177217 atcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaa 20177316  T
526 catatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcac 625  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||| ||| ||| | |||  |||||||  |||||||| |||||||    
20177317 catatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcac 20177416  T
626 ggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattcta 724  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
20177417 gaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttaaacatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattcta 20177515  T
725 acccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctc-tcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||| |||||||| |||   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||    
20177516 accccattaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaag 20177599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 312 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 51627983 - 51627486
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| |   |||||| ||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| |||||    
51627983 aacatgaaaacaattgacatttggatcaattcaccaatttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcataccca 51627884  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||||||  |||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| || |||| || || |   |   |    
51627883 agccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaat 51627784  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||  ||| |   ||||||| |||||||  ||||||||| |||  | |||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||| | ||| ||| ||||  ||    
51627783 tgaacatatttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcat 51627684  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
51627683 cataattggagcacaaattctaacgattatgaacaaataatcaattactcaattaagcacttattcatgcaacaattgaaa-tttacactaaaaatgatt 51627585  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcc 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||  | ||||||||||||||||||    
51627584 atgatgaattctaacccccttaccttagttagattaactccctagcttaagcttcaatttagctccta-gctccctccaatccttgaatcttcaagttcc 51627486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 312 - 780
Target Start/End: Original strand, 21194932 - 21195409
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaaca-aattcaac--------ccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaatta 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||| | |||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
21194932 aacatgaaaacaattgacatttgaacacaattcaacaaaacaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgattta 21195031  T
402 tgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaa 501  Q
    || |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  |||| |||| ||||||| ||||| || |||| |||| |||| || |||||    
21195032 tgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaa 21195131  T
502 attgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatac 600  Q
     |   || || ||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| |    
21195132 ttcaacaatttgagcataat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattc 21195230  T
601 aaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-a 699  Q
    |||||||  | ||||||  ||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| |    
21195231 aaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaa 21195330  T
700 ctaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
21195331 ct--aaatgattatgattgaattctaaaccccttaccttagttagcacaa-atcctagcccaagcttcactttagctcctag 21195409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 376 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 22143616 - 22143186
Alignment:
376 atttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcag 475  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||     
22143616 atttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgagcatggttctcat 22143517  T
476 cataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaat 575  Q
    ||||||| |||| ||||||| || || |   |  || ||| |||||     |  || |||||  | ||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |    
22143516 cataattcaacaacaacatagcataattcaaccatttgagcataattcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaatt 22143417  T
576 taattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaatta 674  Q
     ||||||||| |||||| | |||||||||| |  |||||| |  ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||    
22143416 caattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaac-atctatgaacaattaatcatttatccaattaagcactta 22143318  T
675 ttcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatt--tcctagctcaagcttcacttta 772  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||    
22143317 ttcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttag--caattaatcctagcccaagcttcacttta 22143222  T
773 gctcctagg-ttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
22143221 gctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaag 22143186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 542 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 13376948 - 13376709
Alignment:
542 atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-a 640  Q
    ||||||||| |||  ||||||| | |||| || |||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| | |||| |    
13376948 atactttgaacatgaaatttcaacgacaacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacg-attctcatcatcta 13376850  T
641 tgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttag 739  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
13376849 tgaacaattaatcaattactaaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaa 13376751  T
740 ttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctagg 781  Q
    |||   | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
13376750 ttatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctcctagg 13376709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 8538177 - 8537762
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||  |||| || |||  ||||||||| ||    
8538177 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaa 8538078  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| |||  |   || ||  || | ||| | || ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
8538077 catgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaat-tcacaatataacattttcacatactatgaacatgcaatttc 8537979  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||| | ||| ||||||||  ||||||||   |||||| |||  ||| | ||||||| | |||||||||| |||    
8537978 accaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaaccatgaacgaataatcaattattca 8537879  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctca 760  Q
    | |||||| ||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||| ||    
8537878 actaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaactcccttaccttagttagcacaa-atcctagccca 8537782  T
761 agcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||| |||||||    
8537781 agcttcactttaactcctag 8537762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 8603416 - 8603001
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||  |||| || |||  ||||||||| ||    
8603416 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaa 8603317  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| |||  |   || ||  || | ||| | || ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
8603316 catgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaat-tcacaatataacattttcacatactatgaacatgcaatttc 8603218  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||| | ||| ||||||||  ||||||||   |||||| |||  ||| | ||||||| | |||||||||| |||    
8603217 accaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaaccatgaacgaataatcaattattca 8603118  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctca 760  Q
    | |||||| ||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||| ||    
8603117 actaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaactcccttaccttagttagcacaa-atcctagccca 8603021  T
761 agcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||| |||||||    
8603020 agcttcactttaactcctag 8603001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41229253 - 41229102
Alignment:
316 tgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtt 415  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||| || ||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||      
41229253 tgaaaacaaatgacatttgcactaattca-ccaattttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagcc 41229155  T
416 atgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatga 468  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
41229154 atgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatga 41229102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 316 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13377154 - 13376973
Alignment:
316 tgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtt 415  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||| || |||| |||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||      
13377154 tgaaaacaaatgacatttgcaccaattca-ccaatttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagcc 13377056  T
416 atgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataaca 498  Q
    |||||| | ||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||    
13377055 atgaatcaacatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaacataaca 13376973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 49997548 - 49997133
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactta-gcagcaaacacatcaattga 462  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||| ||   |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||| |||  |||||| || |    
49997548 caacaacaacttatttctcatcaacaac-catgatttatgaacaccaaatccatgaatgatcaacaacaatatctcttaagcaacaacaacatcagttaa 49997450  T
463 acatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaattt 561  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||| ||||||| ||||| |    |||||||| | ||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||    
49997449 acatgattctcaccttaattcaacaacaacatagcacaattcaaaatttagagtacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaattt 49997351  T
562 caccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataa-taggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattact 660  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||| || || ||||||||  | ||||| |||| ||||  |||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |    
49997350 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcaccataactagg-gcacaaatttcaacaatcatgaacaaataatcacttatt 49997252  T
661 caattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaataattatg-atgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagct 758  Q
    |||||||||| ||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||    
49997251 caattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgtttgaattctaacccccttaccttagttag-caaaaatcctagct 49997155  T
759 caagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
49997154 caaacttcaatttagctcctag 49997133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 339 - 780
Target Start/End: Original strand, 52400585 - 52401026
Alignment:
339 aattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatc 437  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||   | | ||||||| ||||| |||||||||    
52400585 aattccacccattttcacaaaatcaaccacaacaacttatttcacatcaccaactcatgatttatgaacatttacgctatgaatcatcaacaacaacatc 52400684  T
438 acttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcatt 536  Q
     || |||| |||  || |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   |||||| || | ||| | ||| |||||||||    
52400685 tctcagcaacaacaacgtcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttatagcacaat-tcacaatatatcatt 52400783  T
537 ttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaacc 636  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | || ||||||||||||| |  || ||||||||  | ||||||  ||||||| |    |||     
52400784 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaactatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaaagtcaaca 52400883  T
637 atcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaataattat-gatgaattctaacccccttac 734  Q
    |  |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || | ||||| | ||||||||||||| |||||    
52400884 actatgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaaccctcttac 52400981  T
735 cttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||   ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
52400982 cttagttag-caaaaatcctagcccaagcttcaatttagctcctag 52401026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 364 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 5768436 - 5768208
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  || |||| | ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
5768436 caacaacaacttatttcacatcacaaactcataatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 5768337  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
5768336 catgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatacaatttc 5768238  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||    
5768237 accaacaacaattcaattatcaccaatttc 5768208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 535 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 27329851 - 27329656
Alignment:
535 ttttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaa 634  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||| || | ||||||||  || ||| || ||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
27329851 ttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcat-aacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaa 27329753  T
635 ccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttac 734  Q
    |          |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||| || || |||   | ||||||||||||||||||||||||||    
27329752 c----------aattaatcaattacacaattaaacacttattcataccataattgaaaaattgcaataag--tgattatgatgaattctaacccccttac 27329665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 40436559 - 40436274
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||  || |||||| || || ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||    
40436559 tcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcataaactcatgatttgtgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctct 40436460  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttc 539  Q
    ||  | |||  ||||||||| ||||| | ||||| || || | |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||| | ||| ||||||||||||    
40436459 taaaaacaacaacatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttc 40436361  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    | ||| | ||| ||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| | |||||||    
40436360 acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcatcataacaagagcacg 40436274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 22403101 - 22403000
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  |||||||||||   || | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
22403101 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 22403006  T
738 agttag 743  Q
    ||||||    
22403005 agttag 22403000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 35522343 - 35522172
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||  || |||||||||  ||||||||| || || |||   | |||||||||||||||||| ||||||||||    
35522343 atgaacaattaatcaattcacccaattaagccctt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaactcccttacctt 35522248  T
738 agttagatcaatttcc-tagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| | |||||| ||| ||||||| | ||||| | |  ||||| ||||||||||||||    
35522247 agttagattaatctccttagcttaggcttcaattttgctccta-gctctcttcaccccttgattcttcaagttcctc 35522172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 35522637 - 35522481
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||||| || ||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||    
35522637 aacatgaaaacaactgacattaggaccaattca-ccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaaccc 35522540  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    |||  |||||||||||  |||||||| || || || |||  ||||||||||| ||||||    
35522539 aagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaacaacaacatcaattgatcatgaa 35522481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Original strand, 41212046 - 41212121
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
41212046 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 41212121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Original strand, 35055079 - 35055151
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
35055079 attatgatgaattttaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctag 35055151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 9783988 - 9783953
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaga 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
9783988 attatgatgaattctaacccccttaccttagataga 9783953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Original strand, 20346347 - 20346378
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
20346347 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 20346378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15861702 - 15861649
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagt 414  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
15861702 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagt 15861649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 414
Target Start/End: Original strand, 22366996 - 22367049
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagt 414  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
22366996 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagt 22367049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 312 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 32966466 - 32965953
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||    
32966466 aacataaaaaccattaacatttgaaccaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaccaattatgaattatgcacgctca 32966367  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||    
32966366 agccatgaattatcaataacaacaccacttagaagcaattacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaacatatcacaagatgtcattt 32966267  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
32966266 agagcataatat--catatattattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcttacattccaacataacat 32966169  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
32966168 cataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttactcaattaagcacttatttatacaacaattgaaaattcacactaaaaatgatt 32966069  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcc 811  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32966068 atgatgaattctaaccctcttaccttagttagatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcc 32965969  T
812 tccttcgataaccctt 827  Q
    ||||||  ||||||||    
32965968 tccttctctaaccctt 32965953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Original strand, 7728348 - 7728849
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||    
7728348 aacatgaaaacatttgacatttgaaccaattcaacccatttttcaaagtcaccaacaacacctcatctctcaccaacaattcatgaattatgcacaccca 7728447  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  || ||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   || ||    
7728448 agcgataaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 7728547  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| ||| |   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||  |    
7728548 tgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatccattcaaatataactt 7728647  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
7728648 cataattggagtacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaatttacaccaaaaatgatt 7728747  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttc-ttgaatcttcaagttc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||  || ||||||||||||||||    
7728748 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctggctctagcttcactttagctccta-gctctcttctaatctttgaatcttcaagttc 7728846  T
811 ctc 813  Q
    |||    
7728847 ctc 7728849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 362 - 813
Target Start/End: Original strand, 16595486 - 16595935
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattg 461  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||   ||||||||||    
16595486 accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatcaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattg 16595585  T
462 aacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaattt 561  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||  || || ||| ||| |   ||||||| || ||||  ||||||||| |||  |||||    
16595586 aacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataa-ttcacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaattt 16595684  T
562 caccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactc 661  Q
    | | | ||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
16595685 ctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaattactc 16595784  T
662 aattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaa 761  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||    
16595785 aattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaagattaattccatagctcaa 16595883  T
762 gcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||||    
16595884 gtttcactttagctcctaggtcctctccaactcttgaatcttcaagctcctc 16595935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 455 - 807
Target Start/End: Original strand, 28902262 - 28902614
Alignment:
455 tcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcat 554  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |  ||| || ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| ||     
28902262 tcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacac 28902361  T
555 tcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatca 654  Q
      | |||||||||||| || | |||||||| ||| ||  | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
28902362 gaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatca 28902461  T
655 attactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcct 754  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
28902462 attactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccct 28902561  T
755 agctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28902562 agcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 28902614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 455 - 807
Target Start/End: Original strand, 28938657 - 28939009
Alignment:
455 tcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcat 554  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |  ||| || ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| ||     
28938657 tcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacac 28938756  T
555 tcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatca 654  Q
      | |||||||||||| || | |||||||| ||| ||  | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
28938757 gaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatca 28938856  T
655 attactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcct 754  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
28938857 attactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccct 28938956  T
755 agctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28938957 agcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 28939009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 364 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 5451110 - 5450660
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||  | |||| ||||  ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
5451110 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgatcatccaagccaagaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcagttgaa 5451011  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||||| | | || |||| |||| ||||||| || || |  ||| || ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||    
5451010 catgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 5450911  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    ||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
5450910 ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa 5450811  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagtta-gatcaatttcctagctcaag 762  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||    
5450810 ttaagcatttatttatgcaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattattatcaa-ttcctagcccaag 5450712  T
763 cttcactttagctcctaggttctc-tcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||    
5450711 cttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcctc 5450660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 364 - 813
Target Start/End: Original strand, 3673842 - 3674290
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||  |||||| ||||  ||| || || ||||||| |||  |||||||||||     
3673842 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcgtgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcgcttagcaacaacaacatcaattgat 3673941  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    |||||| || | || |||| |||| ||||||| || || |   || || ||| ||| |   ||||||| || ||||  |||||||||||||  ||||||     
3673942 catgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgatcatgaaatttcc 3674041  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    | ||||| || | |||||||| ||| ||  |  || ||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
3674042 ctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa 3674141  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagc 763  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
3674142 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatt-acactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagc 3674240  T
764 ttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
3674241 ttcactttagctcctagatcctctcctcttcttgaatcttcaagctcctc 3674290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Original strand, 21616971 - 21617439
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||| ||||| ||||    
21616971 aattcaacccattttacaaaaccaaccacaacagctcacttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatca 21617070  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||  |||| |   ||||||||| ||| |   ||||||| || |||    
21617071 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagaacaattcaacatttagagcatagttcaacatataacacttt 21617170  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaacca- 637  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |     
21617171 catatacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaac 21617270  T
638 tcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacct 736  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
21617271 taatgaacaattaatcccttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacct 21617368  T
737 tagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    || ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
21617369 taattagcacaa-ttcctagcccaaccttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 21617439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 525 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 21297281 - 21296990
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | | | ||||||||  |||||| |  ||| |    
21297281 acatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagagga 21297182  T
625 cggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattcta 724  Q
    || ||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
21297181 cgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaa-taattatgatgaattcta 21297083  T
725 acccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctccttc 817  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
21297082 acccccttaccttagttagatcaattccctatcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagcttctccttc 21296990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 21222900 - 21222433
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    |||||||||| ||| |||||  ||  |||||||||| | ||| ||||| ||| |||||| ||||| |||| |||   |||||| ||||| ||||| ||||    
21222900 aattcaacccttttcacaaaaccaataacaacaactgaattctcatcatcaagtcatgatttatgaacactcaatccatgaatcatcaacaacaatatca 21222801  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||||||||||| | || |||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| |||||   ||||||| || |||    
21222800 cttagcaacaacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcataattcaacatataacacttt 21222701  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |     
21222700 catatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaac 21222601  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
21222600 tatgaacaattaatcaa-tactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaataattatgattgaactctaacccccatacctt 21222504  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | |||   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
21222503 aattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaag 21222433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Original strand, 37983322 - 37983787
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
37983322 aattcaacccattttacaaa---accaacaacaactcatttttcatcatcaaatcctgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatca 37983418  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattt 537  Q
    |||| || |||  ||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||  |||||| ||||| |   ||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||    
37983419 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcattacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcataat-tcacaatatatcactt 37983517  T
538 tcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcata-ataggagcacggattctaacc 636  Q
    ||| |||||||||  || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| |||| |||  | |||| |||| |||||  ||| ||||     
37983518 tcacatactttgaatatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagatag-agcacaaattttaaca 37983616  T
637 atcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgat-gaattctaacccccttacc 735  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||    
37983617 actatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaa--tgattatgattgaattctaacccccttacc 37983714  T
736 ttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
37983715 ttagttagcacaaatttctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 37983787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 365 - 780
Target Start/End: Original strand, 432444 - 432857
Alignment:
365 aacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaac 464  Q
    |||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||| | |||||||  | |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
432444 aacaacaacttatttctcatgatcaaatcataaattatgaatacccaagccaggaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaac 432543  T
465 atgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcac 564  Q
    |||||||| | || |||  |||| |||||||  | || |  ||| || ||| |||||   |||||||||||||||  ||||||||| |||  | ||||||    
432544 atgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaagtttcac 432643  T
565 caacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaat 664  Q
    |||||| || | |||||||| ||| | | | ||| ||||||||  |||||||| ||||| || ||| |||| || |||| |||||||||| |||||||||    
432644 caacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaattatgatcaattaatcatttactcaat 432743  T
665 taagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagct 764  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
432744 taagcacttattcatgcaacaattgaaaaattgcagtaaa--tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagctctagct 432841  T
765 tcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||    
432842 tcactttagctcctag 432857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 312 - 738
Target Start/End: Original strand, 19862140 - 19862563
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
19862140 aacatgaaaacaaatgacatttgaaccaattcatca-attttgcaac--caccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacaccca 19862236  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||| |||||| ||||| || || ||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||| | || |||| |||| ||||||| || || |   || ||    
19862237 agtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 19862336  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||  ||    
19862337 tgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcat 19862436  T
612 cataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataat 710  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||    
19862437 cataattagagcacgaattttaac-atctatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacact-aaaatgat 19862534  T
711 tatga-tgaattctaacccccttacctta 738  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
19862535 tatgattgaattctaacccccttacctta 19862563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 610 - 813
Target Start/End: Original strand, 23494145 - 23494350
Alignment:
610 atcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataa 709  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
23494145 atcatagttggagcacgaattctaacaattatgaacaattaattgattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaa-tttacactaaaaatga 23494243  T
710 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctc---ttcttgaatcttcaa 806  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||    
23494244 ttatgatgatttctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcttccaatccttgaatcttcaa 23494343  T
807 gttcctc 813  Q
    |||||||    
23494344 gttcctc 23494350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 525 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 21310815 - 21310557
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||| |  |||||    
21310815 acatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagca 21310716  T
625 cggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattcta 724  Q
    || ||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
21310715 cgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaatttta 21310617  T
725 acccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttc 784  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
21310616 acccccttaccttagttggatcaattccctagcccaagcttcactttatctcctaggttc 21310557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 542 - 780
Target Start/End: Original strand, 23466595 - 23466830
Alignment:
542 atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcat 641  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| || | ||||||||  || |||||||||||||||||     |||||| |||||||| |||||||  || ||    
23466595 atactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcat-aacttcttacatacaaacatgttgccataattggagcacgaattctaataattat 23466693  T
642 gaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 741  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||    | | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
23466694 gaacaattaatcaattacacaattaatcacttattcatacaataattgaaaatt---gcaataattgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 23466790  T
742 agatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
23466791 agattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 23466830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 388 - 776
Target Start/End: Original strand, 29917969 - 29918356
Alignment:
388 caaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaaca 487  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||    
29917969 caaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcagttaaacatgattctcatcataattcaaca 29918068  T
488 tcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcacc 586  Q
     ||||||||||||| |   ||||||||| ||||| | || ||||||| | |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| |    
29918069 acaacataacacaattcaacatttagagcataat-tcacaatatatcctgttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatc 29918167  T
587 aatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaa 686  Q
    |||||| |  || ||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |  ||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||  |    
29918168 aatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaatttcaacaactatgaacaaaaaatcacttattcaattaagcatttaatcatgcaatta 29918267  T
687 ttgaaaatttac-actaaaaataattat-gatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctc 776  Q
     |||||| |||| |||  || | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||| ||||| ||||||||    
29918268 atgaaaagttacaact--aattgattatggttgaaatctaacccccttaccttagttag-tgaacatcctagcccaaacttcaatttagctc 29918356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 642 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 24225335 - 24225171
Alignment:
642 gaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||| | |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
24225335 gaacaattaatcacttaatcaattaagcacttaaccatacaactagtgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaactcccttaccttagt 24225238  T
741 tagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
24225237 tagcacaa-ttcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 24225171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Original strand, 19405794 - 19405934
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
19405794 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaa--tgattatgatgaattctaacccccttacctta 19405891  T
739 gttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||    
19405892 gttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctag 19405934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 364 - 495
Target Start/End: Original strand, 23493899 - 23494030
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
23493899 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 23493998  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    ||||||||| | || |||| |||| |||||||    
23493999 catgaatcttatcacaattcaacaacaacata 23494030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 11337177 - 11337038
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
11337177 atgaacaattaaccaattcatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaattg---caataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 11337081  T
739 gttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||    
11337080 gttagattaatctccctagctcaagcttcaattttgctcctag 11337038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 365 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 23981781 - 23981451
Alignment:
365 aacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaac 464  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
23981781 aacaacaacttatttcacatca-caaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaac 23981683  T
465 atgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcac 564  Q
    |||  ||||| ||||||| |||| ||||||| || || |   |  || ||| |||||     |  || |||||  | ||||||||| ||| ||| |||||    
23981682 atggttctcatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccatttgagcataattcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcac 23981583  T
565 caacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaat-tactcaa 663  Q
    |||||| || | |||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||  | |  | |||||||||||||||||  ||| ||    
23981582 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatgcactaaa 23981483  T
664 ttaagcaattattcatac-aacaattgaaaatt 695  Q
    ||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
23981482 ttaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt 23981451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 339 - 592
Target Start/End: Original strand, 21109704 - 21109958
Alignment:
339 aattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatc 437  Q
    ||||||||||||||| |||||  || ||| | ||||| ||||| ||| |  || |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
21109704 aattcaacccattttcacaaaaccaacaatagcaacttatttcacatgacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaataacaatatc 21109803  T
438 acttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcatt 536  Q
     |||| || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || || | |||| ||||||||||||| |   || |||||| | ||| | || ||||||||||    
21109804 tcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcatt 21109902  T
537 ttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
21109903 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattattaccaatttc 21109958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 364 - 570
Target Start/End: Original strand, 6456604 - 6456810
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||  |||||| ||||| ||| | ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
6456604 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 6456703  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||| |   || || ||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
6456704 catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcataat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 6456802  T
563 accaacaa 570  Q
    ||||||||    
6456803 accaacaa 6456810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 416 - 670
Target Start/End: Original strand, 22885674 - 22885928
Alignment:
416 atgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagag 515  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |    | || |||    
22885674 atgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcaacataattcaacaacaacataacacaattcaataatttgag 22885773  T
516 sataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcat 614  Q
     | ||| | ||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||    
22885774 cacaat-tcacaatataacattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcat 22885872  T
615 aataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagca 670  Q
    |||   |||||| |||  ||| | ||||||||| | |||||||| |||||||||||    
22885873 aattaaagcacgaatttcaacaaccatgaacaaattatcaattattcaattaagca 22885928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1168474 - 1168366
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  |||||||||    
1168474 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 1168375  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
1168374 gatcatgaa 1168366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 365 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 26560081 - 26559831
Alignment:
365 aacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaac 464  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||| || ||||| |||||||||  | |||| ||||  ||||| ||| ||||||| |||  ||||||||| |||    
26560081 aacaacaacttatttcacatcacaaattcacgatttatgaacacccaagccaagaatcatcaccaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattaaac 26559982  T
465 atgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    || | ||||| || || | |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||    
26559981 ataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 26559883  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcata 615  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||    
26559882 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcata 26559831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 16835589 - 16835338
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || |||||||| || | ||| |||||  || |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||    
16835589 tcaacccattttcacaaaaccaacaacaacagcttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacatccaagctatgaatcatcaacaacaacatctct 16835490  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||  |||| |||| ||||||||||||| || || | |||| ||||||| ||||| | | || |||||| | ||| | || |||||  ||||||    
16835489 taacaacaacaacattaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcgacaattagagcacaat-tcacaatatactattttc 16835391  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||| | ||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
16835390 acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaaatcaattatcaccaatttc 16835338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 469
Target Start/End: Original strand, 23466385 - 23466542
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| |   |||||  ||  |||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||    
23466385 aacatgaaaacaattgacattaggaccaattcaccaatttttatcaaaacaccaacaacatatcattcctcaacaacaaatcatgaatcatgcataccca 23466484  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    ||  ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
23466485 agccatgaactatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaa 23466542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 24183123 - 24182984
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  ||||||||| || || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
24183123 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctt 24183028  T
738 agttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
24183027 agttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 24182984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Original strand, 20712331 - 20712471
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||   | |||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
20712331 atgaacaattaatcaattcactcaattaagcactt-ttcatacaagtaattgaaaattgcaaataag--tgattatgatgaattctaacccccttacctt 20712427  T
738 agttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||| | |||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||    
20712428 agttaggttaatttctctagcttaggcttcaattttgctcctag 20712471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 660 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 22662652 - 22662570
Alignment:
660 tcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 745  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||| | ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
22662652 tcaattaaacacttattcatacaacaaatgaaaact-acactaaa--tgattatgatgaattctatcccccttaccttagttagat 22662570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 809
Target Start/End: Original strand, 25005082 - 25005240
Alignment:
649 taatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagtta--gatc 746  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || |||  |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||  |||     
25005082 taatcacttattcaattgagcacttattcatacaacaattgaaaaactaaact--aaatgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgatt 25005179  T
747 aatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagtt 809  Q
    ||  ||| | || | ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||    
25005180 aa--tccaaacttaggcttcactttagctcctagattcactccaattcttgattcttcaagtt 25005240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 19405514 - 19405622
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||  | |||||||    
19405514 caccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaatatcaatt 19405613  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
19405614 gatcatgaa 19405622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 474
Target Start/End: Original strand, 19873824 - 19873934
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  || |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
19873824 caacaacaacttaattcacatcacaaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 19873923  T
464 catgaatctca 474  Q
    |||||||||||    
19873924 catgaatctca 19873934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Original strand, 24084035 - 24084285
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || | ||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||   |||||||||  ||||||  |||| ||||| ||  ||    
24084035 tcaacccatttttacaaaaccaaccacaacaacttattttc-atcatcaaatcatgatttactaacacccaagccatgaatcttcaacaacaatatttct 24084133  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttc 539  Q
    ||||| |||  ||||||||| ||||||| || || || |||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||    
24084134 tagcaacaacaacatcaattaaacatgattcacatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatatatcattttc 24084232  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||||| ||| |||  ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||    
24084233 acatactatgaacatgtaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 24084285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 467
Target Start/End: Original strand, 20712056 - 20712159
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||| || |||  |||||||||||     
20712056 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgat 20712155  T
464 catg 467  Q
    ||||    
20712156 catg 20712159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Original strand, 21397348 - 21397449
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||   || | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
21397348 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 21397443  T
738 agttag 743  Q
    ||||||    
21397444 agttag 21397449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Original strand, 24475560 - 24475635
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
24475560 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 24475635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 426
Target Start/End: Original strand, 2031787 - 2031852
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatca 426  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
2031787 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 2031852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11337455 - 11337319
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| ||| | || ||||  |||||||||||  ||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
11337455 caccaacaacatctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaatt 11337357  T
461 gaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataaca 498  Q
    || |||||| || | || |||| | || ||||||||||    
11337356 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataaca 11337319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 11584009 - 11584093
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgc-acacccaagttatgaattatca 426  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||    
11584009 tcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaaacccaagccatgaattatca 11584093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 426
Target Start/End: Original strand, 28261498 - 28261563
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatca 426  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||    
28261498 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatca 28261563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Original strand, 4865518 - 4865615
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
4865518 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 4865612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 11342641 - 11342713
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaag 413  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||    
11342641 tcaacccattttcaccaagacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaag 11342713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Original strand, 28261772 - 28261869
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
28261772 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 28261866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 711 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 1168127 - 1168058
Alignment:
711 tatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
1168127 tatgatgaattctaacccccttaccttag-tagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 1168058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 21906697 - 21906802
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    |||||||||||  ||||||| || | ||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||| || ||   |||||||||    
21906697 caccaacaacatttcatttctcagccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaaca---acatcaatt 21906793  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
21906794 gatcatgaa 21906802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 109130 - 109093
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt 379  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
109130 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt 109093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 709 - 738
Target Start/End: Original strand, 11584376 - 11584405
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
11584376 attatgatgaattctaacccccttacctta 11584405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 379
Target Start/End: Original strand, 16105601 - 16105638
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt 379  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
16105601 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt 16105638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 18530964 - 18530899
Alignment:
762 gcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctccttcgataaccctt 827  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||  ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
18530964 gcttcactttagctcctaagctcactccaattcttgattcttcaagtttctccttctctaaccctt 18530899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 21397066 - 21397147
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactta 442  Q
    |||||| |||| |||||||| ||  |||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| |||||    
21397066 caccaagaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactta 21397147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22054008
Alignment:
382 catcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatc 471  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| | |||||||  |||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
22054096 catcatcaattcatgaat-atgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatc 22054008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 23234589 - 23234524
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||||||| ||||| | | ||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
23234589 atatatcattttcacatactataaacatgcaattacaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 23234524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 312 - 780
Target Start/End: Original strand, 25919541 - 25920009
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
25919541 aacatgaaaaccaatgacatttgaaccaattcaactcattttacaaagtcaccaacaataactcatttttcatcaacaaatcatgaattatgaataccca 25919640  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||    
25919641 agccatgaatcatcaacaacaacatcatatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcacaaattatcattt 25919740  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
25919741 agagtataatatgacatatatcattttcatacacttggatcactcaatttctccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacgtacaaatataacat 25919840  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||    
25919841 cataataggagcacgaattctaataatcatgaccaattaatcaattactcaattaagcacttattcattcaacaaatgaaaattgacactaaaaatgatt 25919940  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
25919941 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagttctaacttcactttagctcctag 25920009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 362 - 807
Target Start/End: Original strand, 15740207 - 15740643
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattg 461  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||   ||||||||||    
15740207 accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaaaccatgaattattaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattg 15740306  T
462 aacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaattt 561  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
15740307 aacatgaatctcagtataattcaacatcaacatatcacaaattgacatatagagcataatatgacatatatcatttttatatactttgatcattcaattt 15740406  T
562 caccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactc 661  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
15740407 caccaacaaccaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacatagcatcataattggagcacgaaatctaacaatcatgaacaattaatcaattactc 15740506  T
662 aattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaa 761  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||         | ||||||||| ||||  ||||    
15740507 aattaagtacttattcatacaaaaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaactccc---------taagatcaattccctaattcaa 15740597  T
762 gcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||   |||||||||||||||    
15740598 gcttcactttcgctcctaagtcctctccaactcttgaatcttcaag 15740643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 316 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 25367552 - 25367055
Alignment:
316 tgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttta-caaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagt 414  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |  |||||| |||| | || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||     
25367552 tgaaaacaaatgacatttgaaccaattcaccaaattttatcaaact-actaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagc 25367454  T
415 tatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttaga 514  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | || |||| |||| ||||||||||||| |   || || ||    
25367453 catgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttga 25367354  T
515 gsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaat-ttcttacatacaaacataaaatca 613  Q
    | ||| |   ||||| | || ||||  ||||||||| |||  |||||| | ||||| || |  |||||||  ||  ||| ||||| ||||||||| ||||    
25367353 gcatatttcaacataaaccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatca 25367254  T
614 taataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattat 713  Q
    |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
25367253 taattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattgctcaattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacact-aaaatgattat 25367155  T
714 gatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
25367154 gatgaattctaacccccttaccttagctagatcaattctctagccaaagattcactttagcttataggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctc 25367055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 312 - 807
Target Start/End: Original strand, 21623097 - 21623591
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||| ||   ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||    
21623097 aacatgaaaaccaatgacatttgaaccaattca-ccaattttaccaaactaccaacaacaactcatttttcatccacaaatcatgaattatgaataccca 21623195  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||| | || || | ||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||| | || |||| |||| ||||||| || || |   || ||    
21623196 agccatgactcattaacatcaacatcacttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 21623295  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||| |||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||  ||    
21623296 tgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccat 21623395  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||    
21623396 cataattggagcacgaattctaacatttatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgagaaattacact-aaaatgatt 21623494  T
712 atga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
21623495 atgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttcaattcttgaatcttcaag 21623591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 382 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 21411298 - 21410870
Alignment:
382 catcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataat 481  Q
    ||||||||| || | ||| |||||| | ||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||   |||||||||| |||||||||||||||||||    
21411298 catcaacaattcgttaatcatgcacgctcaagccatgaattataaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattgcacatgaatctcagcataat 21411199  T
482 ttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaatta 581  Q
      |||||||||||| || || ||  || || ||| ||| |   ||||||| || ||||  ||||||||| |||  |||||    |||||  | | |||||    
21411198 ccaacatcaacatagcataa-ttcacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaatta 21411100  T
582 tcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatac 681  Q
    ||| ||| ||| | ||| || |||||| |||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
21411099 tcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattcctcaattaagcacttattcatac 21411000  T
682 aacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctagg 781  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
21410999 aataattgaaaatttacactaaaa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcactttagctcctaga 21410901  T
782 ttctctcctcttcttgaatcttcaagttcct 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
21410900 ttctctcctcttcttgaatcttcaagttcct 21410870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 342 - 745
Target Start/End: Original strand, 18398896 - 18399297
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
18398896 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatca-caattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcact 18398994  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttca 540  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| || || |   || || ||| ||| |   |||||||  ||||||     
18398995 tagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatactattttct 18399094  T
541 tatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatca 640  Q
     ||||||||| |||  |||||| | ||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |    
18399095 catactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta 18399194  T
641 tgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
18399195 tgaacaattagtcaattactcaattaagcacttattcatacaataattg-aaatttacact-aaaatgattatgaagaattctaacccccttaccttagt 18399292  T
741 tagat 745  Q
    |||||    
18399293 tagat 18399297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 544 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 16887879 - 16887610
Alignment:
544 actttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atg 642  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| |  | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||| |  ||||||| ||| |||| ||| |||    
16887879 actttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaac-atctatg 16887781  T
643 aacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 742  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16887780 aacaattaatcatttattcaattaatcacttattcatacaataattgaaaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 16887681  T
743 gatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
16887680 gatcaattccctagttcaagcttcactttagctcctatgttctctcctcttcttgattcttcaagttcctc 16887610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 364 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 33538636 - 33538198
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||  ||||||||| ||    
33538636 caacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataacaacatcaattaaa 33538537  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacat-atatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||  |||||| ||||| |   | ||||||| ||||| | |||  |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||    
33538536 catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacctttagagcataat-tcacaacatatcactttcacatactttgaacatgcaatttc 33538438  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    |||||||| || | |||| ||||||||||| | ||| |||| |||  | |||| |  ||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||    
33538437 accaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttactca 33538339  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgat-gaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaa 761  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| |||    
33538338 attaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaa--tgattatgattgaattctaacccccttaccttagttcgcacaaattcctagcccaa 33538241  T
762 gcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatctt 803  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
33538240 gcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatctt 33538198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 339 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 22362057 - 22361609
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||    
22362057 aattcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatca 22361958  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||| || || |  ||| || ||| |||||   || ||| ||| |||    
22361957 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacttatgtcacttt 22361858  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    |  ||||||||| |||  ||||||| |||||| || | |||||||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||  ||| || | ||    
22361857 ctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatc-at 22361759  T
639 c-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacct 736  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
22361758 ctatgaacaattaatcatttgctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattac---taaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 22361662  T
737 tagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcc 789  Q
    || |||   | | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
22361661 taattatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctcctaggatctctcc 22361609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 350 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 18629892 - 18629433
Alignment:
350 ttttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagca- 448  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||     
18629892 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa 18629793  T
449 -aac-acatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatac 545  Q
     ||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||  |||||| ||||| |   |||| |||| ||||| | || ||||| || ||||| ||||    
18629792 caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacattcagagcataat-tcacaatataccactttcacatac 18629694  T
546 tttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaac 645  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||| |  ||||||    
18629693 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac 18629594  T
646 aattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaga 744  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||| | |||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
18629593 aattaatcacttattcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagc 18629496  T
745 tcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaa 806  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
18629495 acaaattcctagcccaagcttcactttacctcctaggatctataccacttcttgaatcttcaa 18629433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 452 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 17083376 - 17083003
Alignment:
452 acatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgat 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| | |||   |||||||||||||||| ||||| |||     
17083376 acatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcaacatatatcattttcacatactatgaa 17083277  T
552 cattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaa 651  Q
    ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||  |||| |  ||||||||||||    
17083276 catacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaactatgaacaattaa 17083178  T
652 tcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatt- 750  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
17083177 tcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattaaaatgaattctaacccccttaccttagttag--caatta 17083082  T
751 -tcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaagttcctccttcgataaccctt 827  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||    
17083081 atcctagccgaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttaaatcttcaagcttcttcttcgctaaccctt 17083003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 364 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 35136279 - 35135831
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
35136279 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa 35136180  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatat-atcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||  ||| ||| || || |  ||   | ||| ||||| | |||  | | || ||  | | ||||||| ||| ||| |||    
35136179 catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataat-tcacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattc 35136081  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactc 661  Q
    || ||||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||| || |  ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||       
35136080 ac-aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaac-atctatgaacaattaatcaattatct 35135983  T
662 aattaagcaattattcatacaacaattgaaaat-ttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctca 760  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
35135982 aattaatcacttattcatacaataattgaaaaaattacactaaaa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctca 35135884  T
761 agcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||||    
35135883 agcttcactttagctcctagctctct-tccaatccttgaatcttcaagttcctc 35135831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Original strand, 33324673 - 33325088
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
33324673 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa 33324772  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||  ||| ||| || || |  ||   | ||| |||||     |  || || ||  | | ||||||| ||| ||| ||||    
33324773 catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataattcataagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattca 33324872  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactca 662  Q
    | ||||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||| || |  ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
33324873 c-aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaac-atctatgaacaattaatcaattatcca 33324970  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaa-atttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaa 761  Q
    ||||| || |||||||||||  |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
33324971 attaatcacttattcatacattaattgaaataattacactaaaa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatgaattccctagctcaa 33325069  T
762 gcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||||||||||    
33325070 gcttcactttagctcctag 33325088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 607
Target Start/End: Original strand, 25651217 - 25651460
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| | |||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
25651217 caacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 25651316  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| |||||   ||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||    
25651317 catgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttca 25651416  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacata 607  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
25651417 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata 25651460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 312 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18382001 - 18381821
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
18382001 aacatgaaaacaaatgacatttgcaccaattca-ccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaataccca 18381903  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaaca 493  Q
    ||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| | || |||| |||| |||||    
18381902 agccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 525 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 17557123 - 17556867
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  |||||    
17557123 acatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-caaacatatcatcataattagagca 17557025  T
625 cggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattct 723  Q
    || ||| |||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | || |||  | |||||| |||||||  | || ||||||| ||||||||    
17557024 cgaatt-taacaactatgaacaaataatcaattattcaattaagcacttaataatgcaattaatgaaaaattacact--agatgattatgattgaattct 17556928  T
724 aacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttct 785  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||    
17556927 aacccccttaccttaattagctcaa-atcctagcctaagcttcactttatctcctagattct 17556867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 641 - 807
Target Start/End: Original strand, 25654381 - 25654546
Alignment:
641 tgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||  |  ||||||||||||||||||||| |    
25654381 tgaacaattaatcacctactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaa--tgattagcacaaattctaacccccttaccttaat 25654478  T
741 tagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||  ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
25654479 tagcacagattcctagcgcaagtttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 25654546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 626
Target Start/End: Original strand, 19854135 - 19854397
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||  ||||||||| ||    
19854135 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattaaa 19854234  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||  |||||| ||||| |  | |||||||| | ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
19854235 catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcattatttagagcacaa-ctcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttc 19854333  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||||| |  |  ||||||||| ||||||| | |||||||    
19854334 accaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacg 19854397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 15079702 - 15079563
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttag 739  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| |  ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
15079702 atgaataattaatcaattatccaattaatcccttattcataaaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttag 15079605  T
740 ttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||| |||  | |||||| |||||||||||| ||||||||    
15079604 ttagattaatccctctagcttaagcttcacttttgctcctag 15079563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Original strand, 34966824 - 34967075
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||  || |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||    
34966824 tcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctct 34966923  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || || | |||| ||||||| || || |   || |||||| | ||| | || ||||||| |||||    
34966924 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaattagagtacaat-tcacaatatatctttttc 34967022  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||    
34967023 acatactatgaacatgcaatttcacgaacaacaattcaattatcaccaatttc 34967075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 709 - 807
Target Start/End: Original strand, 14152634 - 14152733
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttc-tctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
14152634 attatgatgaagaataacccccttgccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcatctcctcttcttgattcttcaag 14152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 28195412 - 28195263
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttta-caaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |   ||||| |||| | |||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||| || |    
28195412 aacatgaaaacaattgacatttggaccaattcaccaatttttatcaaact-accaacaacatctcatttctcaacaataaatcat-aattatgcaaactc 28195315  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattga 462  Q
    |||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
28195314 aagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattga 28195263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Original strand, 18583292 - 18583384
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaaca 435  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||    
18583292 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaca 18583384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 679
Target Start/End: Original strand, 29605407 - 29605744
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||| ||||||| ||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| ||||| ||  ||    
29605407 tcaacccatttttacaaaaccaacaagaacaacttatttctcattatcaattcatgatttatgcacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatttct 29605506  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    ||||| |||  ||||||||| | ||||| || || ||||||| |||| ||||||| ||||| |   ||||| ||| | ||| | || |||| ||||||||    
29605507 tagcaacaacaacatcaattaagcatgattcacatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacattttgagcacaat-tcacaatatttcattttc 29605605  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc 639  Q
    | ||||| ||| |||  |||||||||||||| || | ||||||||| || ||| | ||| ||||||||  | ||||||  ||||||| |||  ||| |      
29605606 acatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaa-ttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaact 29605704  T
640 atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcat 679  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
29605705 atgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcat 29605744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16888059 - 16887925
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||  |||||| || || || |||||||| |||   |||  | ||||||||||    
16888059 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgtatacccaagccatgaatcattaacaataacatcacatagtgacaacaaaatcaattgaa 16887960  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataaca 498  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
16887959 catggttctcatcataattcaacaacaacataaca 16887925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Original strand, 18432899 - 18432999
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||  || ||||||||| |||||||||||| || |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
18432899 atgaacaaataatcaattcacccaattaagctctt-ttcatacaataattgaaaatttgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctta 18432994  T
739 gttag 743  Q
    |||||    
18432995 gttag 18432999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17083468 - 17083371
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    |||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
17083468 tcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactcatttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 17083371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 31628245 - 31628353
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| || || || |||  |||||||||    
31628245 caccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 31628344  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
31628345 gatcatgaa 31628353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Original strand, 22441190 - 22441287
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||      |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
22441190 atgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattgc----aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 22441284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 493
Target Start/End: Original strand, 16086022 - 16086126
Alignment:
389 aaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacat 488  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || || || |||  ||||||| ||| |||||| || | ||||||| ||||     
16086022 aaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaa 16086121  T
489 caaca 493  Q
    |||||    
16086122 caaca 16086126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 704 - 779
Target Start/End: Original strand, 16086335 - 16086411
Alignment:
704 aaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctccta 779  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| |||||||    
16086335 aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctccta 16086411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Original strand, 18777452 - 18777524
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
18777452 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctag 18777524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Original strand, 32899046 - 32899147
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||||| || |||||||||||   || | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
32899046 atgaacaattaatcaattcaccaaattaagcactt-ttcataccaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 32899141  T
738 agttag 743  Q
    ||||||    
32899142 agttag 32899147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 709 - 743
Target Start/End: Original strand, 16106839 - 16106873
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16106839 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 16106873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18839540 - 18839419
Alignment:
341 ttcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||  |||||||| ||     
18839540 ttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgaca 18839442  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    || || |||  ||||||||||||    
18839441 tatcaacaacaacatcaattgaa 18839419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 617
Target Start/End: Original strand, 22848158 - 22848248
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataat 617  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||    
22848158 atataacattttcacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataat 22848248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 592
Target Start/End: Original strand, 23221894 - 23222124
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttag--cagcaaacacatcaattg 461  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  || |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| ||||   || |||  | |||||||     
23221894 caacaacaacttagttcacatcagaaactcatgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctcttataacaacaacaatatcaatta 23221993  T
462 aacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatt 560  Q
    ||||||||||||| || || | |||| |||||||| |||| |   || |||||| ||||| | || ||||| |||||||| ||| | ||| ||| |||||    
23221994 aacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataatacaattcaacaattagagcataat-tcacaatataccattttcacatattatgaacatgcaatt 23222092  T
561 tcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||||||||    
23222093 tcatcaacaacaattcaattatcaccaatttc 23222124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18823684 - 18823564
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||  |||||||| || |    
18823684 tcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 18823586  T
442 agcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    | || |||  ||||||||||||    
18823585 atcaacaacaacatcaattgaa 18823564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Original strand, 19672275 - 19672344
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaa 433  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
19672275 caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgatttatgaacaccgaagttatgaatcatcaacaacaa 19672344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009590
Alignment:
382 catcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataat 481  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||  |||| | ||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
35009702 catcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataat 35009604  T
482 ttaacatcaacata 495  Q
    | |||| |||||||    
35009603 tcaacaacaacata 35009590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Original strand, 18570535 - 18570632
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
18570535 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaattgattatgatgaattctaacccccttacctt 18570629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 25640485 - 25640453
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
25640485 attatgatgaattctaacccccttaccttagtt 25640453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25744483 - 25744408
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
25744483 caccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 25744408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15742498 - 15742420
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactta 442  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| || | | |||||||||||    
15742498 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcactta 15742420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 527 - 625
Target Start/End: Original strand, 19672429 - 19672527
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcac 625  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||  ||||| || | |||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| ||||||    
19672429 atatatcattttcacatattatgaacatgcaatttcattaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataataagagcac 19672527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 379
Target Start/End: Original strand, 4991030 - 4991067
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt 379  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
4991030 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt 4991067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 17013743 - 17013678
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||    
17013743 atatatcattttcacatactatgaacaggcaatttcaccaacaacaattcaattttcaccaatttc 17013678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 22440911 - 22441019
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttc-ccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaat 459  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||| || |||  ||| ||||    
22440911 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaat 22441009  T
460 tgaacatgaa 469  Q
    ||| ||||||    
22441010 tgatcatgaa 22441019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 592
Target Start/End: Original strand, 23222894 - 23222959
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||    
23222894 atatatcattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttc 23222959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 592
Target Start/End: Original strand, 32352190 - 32352255
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||  || || | ||||||||||||||||    
32352190 atatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccataaacaattcaattatcaccaatttc 32352255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 318 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 31194636 - 31194176
Alignment:
318 aaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttat 417  Q
    ||||||| | ||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||| |||    
31194636 aaaacaaataacatttggaccaattca-ccaattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcaccaacaaatcatgaatcatgtgcacccaagctat 31194538  T
418 gaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsa 517  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||  || ||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||| |    
31194537 gaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaacatggataacaacataattcaacaacaacataacacccattgacatttagagca 31194438  T
518 taatatgacatatatcattttcatatactttgat-cattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataa 616  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
31194437 taatatgacatatatcatcttcatacactttgatgcattcaattttacccacaacaacc-aattatcaccaatttcttacatacaaacagaacatcgtaa 31194339  T
617 taggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgat 716  Q
    |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
31194338 ttagagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttgcactaaaaatgattatgat 31194239  T
717 gaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctccta 779  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
31194238 gaaaactaacccccttaccttagttagattaattcactagcttaagcttcacttttgctccta 31194176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 360 - 761
Target Start/End: Original strand, 15969795 - 15970196
Alignment:
360 tcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaat 459  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||    
15969795 tcaccaacaacaactcatttctcctctacaa-tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagcaacatcacttaacaacaactacaccaat 15969893  T
460 tgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataa---tatgacatatatcattttcatatactttgatcattc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15969894 tgaacatgaatctcagcataattcaacctcatcatatcacaaattgacatttagagcataataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattc 15969993  T
557 aatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaat 656  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| |    
15969994 aatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttctttcgtacaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatt 15970093  T
657 tactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctag 756  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
15970094 tactcaattaagcatttattcatacaataattgaaaaattgcact--aaatgattatgatgaattccaacccccttaccttagttatatcaattccctat 15970191  T
757 ctcaa 761  Q
    |||||    
15970192 ctcaa 15970196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 312 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 22736157 - 22735690
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
22736157 aacatgaaaacaattgacatttgaaccaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacaccca 22736058  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||||| | || |||  |||| |||||||  | || |  ||| ||    
22736057 agccatgaattaacaacaacaacatcagttagcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatt 22735958  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcat-atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaa 610  Q
     ||  |||||   ||||||||||||||  | ||||||||| |||  | ||| |||||||| || | |||||||| | | ||| | ||| ||| ||||  |    
22735957 tgatcataattcaacatatatcattttttttatactttgaacatgaagttttaccaacaacaactcaattatcaaccacttcatgcattcaa-catatta 22735859  T
611 tcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataat 710  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
22735858 tcataattggagcacgaattctaac----------aattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacattaaaaatgat 22735769  T
711 tatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcc 789  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22735768 tatgatgaattttaacccccttaccttagttagataaattccctagctcaagcttcactttagctcctaggtcctctcc 22735690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 336 - 807
Target Start/End: Original strand, 5854566 - 5855036
Alignment:
336 acaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaaca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| |    
5854566 acaaattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaata 5854665  T
436 tcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcat 535  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| |||||   ||||||| ||     
5854666 tcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacatttagagcataattcaacatataacac 5854765  T
536 tttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaac 635  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || | ||||||| |||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||    
5854766 tttcatatactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac 5854865  T
636 catcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttac 734  Q
     |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
5854866 aactatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacctccttac 5854963  T
735 cttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
5854964 cttaattagcacaa-ttcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 5855036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Original strand, 15933253 - 15933721
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||   |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||    
15933253 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcttcaaatcatgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatca 15933352  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |   ||||||||| |||||   |||| || || |||    
15933353 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcaacatttaacacttt 15933452  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||  ||| |||| |     
15933453 cacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaac 15933552  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
15933553 tatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgatttaattctaacccccttacctt 15933650  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | ||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
15933651 aattagcacaatttcctagcccaggcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 15933721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 312 - 780
Target Start/End: Original strand, 38533577 - 38534045
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
38533577 aacatggaaacaattgacatttgaaccaattcaacccattttacaaagtctccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 38533676  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| || || |    | ||    
38533677 agccatgaattatcatcaacaacatcacctagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaataatt 38533776  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| ||| |   ||||||| |||||||  ||||||||| |||   ||||| | ||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| ||    
38533777 tgagcatatttcaacatataccattttctcatactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacat 38533876  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |    |    | |||| |||    
38533877 cataattggagtacgaattctaacaattatgaacaattagtcaattacttaattaagcacttattcatacaataattcatacaacaattcataaatgatt 38533976  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
38533977 atgatgaattctaacccccttaccttagtcaaatcaatttcctagctctagcttcactttagctcctag 38534045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 342 - 807
Target Start/End: Original strand, 33528384 - 33528848
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| || || ||| |||    
33528384 tcaacccattttacaaaatcaacaacaacaacccatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaa-aatatctctt 33528482  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcat 541  Q
    |||| |||  ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| | |||   |||||||||||||||||    
33528483 agcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcaacatatatcattttcat 33528582  T
542 atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-a 640  Q
    |||||  ||  || |||||||| |||||| || | |||||||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| | | | |||| |    
33528583 atactaagaagatacaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaat-tcaacatcta 33528681  T
641 tgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttag 739  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
33528682 agaacaattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag 33528779  T
740 ttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcct-cttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
33528780 ttagcacaaattcctagctcaaacttcactttagctcctaggatctctactacttcttgaatcttcaag 33528848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 361 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 21198422 - 21197971
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || || | ||||||||||||||| |||  |||||||||    
21198422 caccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 21198323  T
461 gaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatt 560  Q
    |||||||| ||| | || |||| |||| |||||||||| || |   || || ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||    
21198322 gaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 21198223  T
561 tcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattac 659  Q
    |||||||||| || | |||||||  ||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| | | |||| ||||||||||||||||||||    
21198222 tcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt-tcatcatctatgaacaattaatcaattac 21198124  T
660 tcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctc 759  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||   | | |||||||| |    
21198123 tcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattataatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagccc 21198025  T
760 aagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
21198024 aagcttcactttagctcctaggttctctccaactcttgaatcttcaagctcctc 21197971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Original strand, 26011449 - 26011913
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||    
26011449 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatca 26011548  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| |||||   ||||||| || |||    
26011549 cttagcaacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacacttt 26011648  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    || ||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||| |     
26011649 cacatactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaac 26011748  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgat-gaattctaacccccttacctt 737  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||   ||||||||||||||    
26011749 tatgaacaattaatcacttactcaattaaacacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaa--tgattatgattgaat---aacccccttacctt 26011843  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | ||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||||    
26011844 aattagcacaatt-cctagcccaagcttcactttacctcctatgatctctaccacttcttgaatcttcaag 26011913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 39447084 - 39446585
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |   |||||| ||   |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||    
39447084 aacatgaaaacaattgacatttggaccaattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcataccca 39446986  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   |   |    
39446985 agccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaat 39446886  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
      || ||| |   ||||||| || ||    ||||||| | |||  |||| ||| ||||| || | |||||||  ||| |||   ||| |||||||   ||    
39446885 ttagcatatttcaacatataacacttcttcatactttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcat 39446786  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
39446785 cataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcatttattcatacaacaattgaaa-tttacactaaaaatgatt 39446687  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||  | |||||||||||||||||    
39446686 atgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcaatttagctcatagctctct-tccaatccttgaatcttcaagttc 39446588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 525 - 807
Target Start/End: Original strand, 17285345 - 17285628
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||| ||| ||| | |||  |||||||  |||||||| ||||||    
17285345 acatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattggagca 17285444  T
625 cggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattct 723  Q
    || |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
17285445 cgaattctaacaattatgaacaattattcaattattcaattaagcacttaatcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattgaattct 17285544  T
724 aacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||||||||||| |||   | | |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
17285545 aacccccttaccttaattatcaccaattcctaacccaagcttcactttagctcctaggatctctccaattcttgaatcttcaag 17285628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 525 - 807
Target Start/End: Original strand, 25296299 - 25296582
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || | ||||||||  |||||| | ||| ||||||||  |||||| |  | |||    
25296299 acatatatcattttcacaagctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggca 25296398  T
625 cggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgat-gaattct 723  Q
    || ||| ||||    ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
25296399 cgaattttaacatgtatgaacaattaattacttactcaattaaacacttattcatacaacaatcaaaaatttacactaaaaatgattatgattgaattct 25296498  T
724 aacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
25296499 aacccccttaccttagttagatcaattccctagcccaagcttcactttagctcttaggttctctcttcttcttgaatcttcaag 25296582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 525 - 807
Target Start/End: Original strand, 25758319 - 25758602
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || | ||||||||  |||||| | ||| ||||||||  |||||| |  | |||    
25758319 acatatatcattttcaaaagctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggca 25758418  T
625 cggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgat-gaattct 723  Q
    || ||| ||||    ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
25758419 cgaattttaacatgtatgaacaattaattacttactcaattaaacacttattcatacaacaatcaaaaatttacactaaaaatgattatgattgaattct 25758518  T
724 aacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
25758519 aacccccttaccttagttagatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcttctttttgaatcttcaag 25758602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 316 - 807
Target Start/End: Original strand, 23837131 - 23837622
Alignment:
316 tgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtt 415  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||| || |||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||      
23837131 tgaaaacaaatgacatttgcactaattca-ccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagcc 23837229  T
416 atgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagag 515  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| | || |||| |||| ||||||| || || |   || || |||    
23837230 atgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgag 23837329  T
516 sataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcata 615  Q
     ||| |   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||| ||| | |||  |||||||  ||||||    
23837330 catagttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcata 23837429  T
616 ataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatg 714  Q
    ||  ||||||| ||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||| ||||||    
23837430 attagagcacgaatt-ttatcatctatgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatctata-ttaaaatgattatg 23837527  T
715 a-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctc-tcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||   |   |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||   ||||||||||||||||    
23837528 attgaattctaacccccttaccttaattatcaccgattcctagcccaaggttcactttatctcctaggatctcttcaaattcttgaatcttcaag 23837622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 417 - 817
Target Start/End: Original strand, 29306450 - 29306852
Alignment:
417 tgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagags 516  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || || |||     
29306450 tgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagc 29306549  T
517 ataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataa 616  Q
    |||||   |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||| | |||   ||||||  ||||||     
29306550 ataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatag 29306649  T
617 taggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga 715  Q
    |  ||||||| ||  |||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||    
29306650 ttagagcacgaatattaac-atctatgaacaatcaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact-aaaatgattatga 29306747  T
716 -tgaattctaacccc-cttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaagttcct 812  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||| | ||    
29306748 ttgaattctaacccctcttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcagtttagctcctaagatctctacgacttcttgaatcttcaagcttct 29306847  T
813 ccttc 817  Q
    |||||    
29306848 ccttc 29306852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 312 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 33611381 - 33610877
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaaca-aattca-------acccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattat 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||       ||||||||| |||||  || ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||    
33611381 aacatgaaaacaattgtcatttgaacataattcaccaattcacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatatctcatcatcaaatcatgatttat 33611282  T
403 gcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaa 502  Q
    | |||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||  ||||| || |||| |||| ||||||| || ||     
33611281 gaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatggttctcaacacaattcaacaacaacatagcataat 33611182  T
503 ttgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaa 602  Q
    |    ||||| || |||||     |||||||| ||||| ||||||||| |||  | |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| | ||| |||    
33611181 tcaatatttatagcataattctcaatatatcactttcacatactttgaacatgaattttcaccaacaacaatctaatgatcaccaatttcatgcattcaa 33611082  T
603 acataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacacta 702  Q
    | |||  |||||| |  ||||||  ||| |||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||||| |||||| |||||||     
33611081 atatatcatcatagttagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttattcaattaatcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacact- 33610983  T
703 aaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatt--tcctagctcaagcttcactttagctccta-ggttctctcctcttcttga 798  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||  ||||||| |||| || ||||||||||||| | | ||| || ||||||||    
33610982 -aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagctag--caattaatcctagcccaagtttaactttagctcctatgatcctcaccacttcttga 33610886  T
799 atcttcaag 807  Q
    |||||||||    
33610885 atcttcaag 33610877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 342 - 807
Target Start/End: Original strand, 23149737 - 23150201
Alignment:
342 tcaacccattt--tacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcac 439  Q
    |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||| ||||| |||||||||||    
23149737 tcaacccatttcttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatcac 23149836  T
440 ttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatc--aacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacat-atatcatt 536  Q
    |||||| |||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  | |||||  |||     || || ||| ||||| | | |  ||| || |    
23149837 ttagcaacaaaaacaactattgaacatgattctcatcataattcaacaacttagcataattcaac----caatt-gagcataat-tcataccataccact 23149930  T
537 ttcatatactttga-tcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaac 635  Q
    |||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| || | | ||||||| | |||| | ||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||    
23149931 ttcacatattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattttaac 23150030  T
636 catcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaa-cccccttac 734  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
23150031 aattatgaacaattaatcatttactcaattaagcacttactcatacaacaa-tgaaaa-ttaaact--aaatgattatgatgaattataaccccccttac 23150126  T
735 cttagttagatcaatt--tcctagctc-aagcttcactttagctcctagg-ttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||||||||  |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
23150127 cttagttag--caattaatcctagcccaaagcttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaag 23150201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 342 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 23226367 - 23225903
Alignment:
342 tcaacccattt--tacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcac 439  Q
    |||||||||||  ||||||  || |||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||| ||||| |||||    
23226367 tcaacccatttcttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcataatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcac 23226268  T
440 ttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattg-tcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||| || |||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||| || |   |||||| ||| |||||     |  || || ||     
23226267 ttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaatcattt-gagcataattcataagttaacactta 23226169  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
     | |||||||   ||| ||| ||||||||||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||| |  ||||||  ||| |||| ||    
23226168 tacatacttttgacatgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaac-at 23226070  T
639 c-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    | ||||||||||||||| |    ||||||| || || ||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
23226069 ctatgaacaattaatcattc---caattaaacactttttcatacaataattgaaaaattgcactaaaa-tgattatgatgaattctaacccctttacctt 23225974  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctagg-ttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | | ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
23225973 aatgagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaag 23225903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 525 - 780
Target Start/End: Original strand, 22981414 - 22981664
Alignment:
525 acatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagca 624  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||| |||  |||||| | ||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||  |||||    
22981414 acatataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagca 22981513  T
625 cggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattcta 724  Q
    |  ||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || || |  | ||||||||||||||||    
22981514 caaatt-tcatcatc-tgaacaattaatcaattacccaattaagcacttattcatacaa-aattgaaaaattgcaatata--tgattatgatgaattcta 22981608  T
725 acccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
22981609 acccccttaccttagttagattaattccccagctcaagcttcaatttagctcctag 22981664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 536 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 23151928 - 23151660
Alignment:
536 tttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaac 635  Q
    ||||||| | ||||| |||  |||||||||||||| || | ||||||||| | |||| | ||| |||| |||  |||||||| ||| |||| ||| ||||    
23151928 tttcatacaatttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaac 23151829  T
636 catcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaa-cccccttac 734  Q
     |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
23151828 aaatatgaacaattaatcatttactgaattaagcacttattcacacaacaa-tgaaaa--tacact--aaatgattatgatgaattctaaccccccttac 23151734  T
735 cttagttag--atcaatttcctagctcaagcttcactttagctccta-ggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||    
23151733 cttagttagtaatcaa--tcctagcccaagcttcactttagctcctacgatcctcacctcttcttgaatcttcaag 23151660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 342 - 807
Target Start/End: Original strand, 23158119 - 23158580
Alignment:
342 tcaacccattt--tacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcac 439  Q
    |||||||||||  ||||||  || ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||   |||||||||    
23158119 tcaacccatttcgtacaaaaccaacaagaacaactcatttttcattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaa---caacatcac 23158215  T
440 ttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacat-atatcatttt 538  Q
    |||| | |||  ||| | ||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||| || |   |   | ||| ||||| | | || ||| || |||    
23158216 ttaggaacaacaacaactattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcataat-tcatatcataccacttt 23158314  T
539 catatactttga-tcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaacca 637  Q
    ||  || ||||| ||||  |||||||||||||| || | | ||||||| | |||| | ||| ||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||| |    
23158315 cacgtattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcatgaattttaacaa 23158414  T
638 tcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||    
23158415 ttatgaacaattaatcatttactcaaataagcacttattcatacaacaa--gaaaa-ttacact--aaatgattataatgaattataactcccttatctt 23158509  T
738 agttagatcaatt--tcctagctcaagcttcactttagctcctagg-ttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
23158510 agtt--atcaattaatcctagcccaagcttcactttaactcctaggatcctcacctcttctggaatcttcaag 23158580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 364 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 45465393 - 45465131
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
45465393 caacaacaactcatttcccatcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 45465294  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||  |||||| | ||| |   ||| ||||| ||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
45465293 catgattctcatcacaattcaacaataacatagctcaattcaacatctagagcataat-tcacaatataacattttcacatactatgaacatgcaatttc 45465195  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||| |||||||||    
45465194 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaggagcacg 45465131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 18261761 - 18261510
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||    
18261761 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctct 18261662  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||    
18261661 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttc 18261563  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||||| |||  || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
18261562 acatactatgaagatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 18261510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 342 - 743
Target Start/End: Original strand, 22742718 - 22743123
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||| |||||||||  | |||| ||||| ||||| ||  ||    
22742718 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaacaaaccaagatttatgaacacccaagccacgaatcatcaacaacaatattcct 22742817  T
441 tagcagcaa--aca-catcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcatt 536  Q
     | || |||  ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| | ||| | ||| |||||||||    
22742818 caacaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatatatcatt 22742916  T
537 ttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaacc 636  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||  ||||||||  | ||||||   |||||| |||  |||     
22742917 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcaccataatcaaagcacgaatttcaaca 22743016  T
637 atcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaataattat-gatgaattctaacccccttac 734  Q
    |  |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || | ||||| | |||||||||||||||||||    
22743017 actatgaacaaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttac 22743114  T
735 cttagttag 743  Q
    |||| ||||    
22743115 cttaattag 22743123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 709 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 21259420 - 21259316
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||  | ||||||||||||||    
21259420 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagcttaagcttcaatttagctcctagctctct-tccaatccttgaatcttcaag 21259322  T
808 ttcctc 813  Q
    ||||||    
21259321 ttcctc 21259316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 364 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 38635915 - 38635507
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
38635915 caacaacaacttgtttctcatcaacaaattatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 38635816  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |   || || ||| ||||| | || |||||||||||||  ||| | ||| ||| |||||||    
38635815 catgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagtataat-tcacaatatatcattttcgcatattatgaacatgcaatttc 38635717  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||| |  || ||||||||  || ||||   ||||||| |||  ||| |  ||||||||  | ||| ||| |||    
38635716 accaacaacaattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatgataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaaagattcacttattca 38635617  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaataattat-gatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctca 760  Q
    |||||||| ||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||  |    
38635616 attaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaaatcctagccaa 38635519  T
761 agcttcacttta 772  Q
    ||||||||||||    
38635518 agcttcacttta 38635507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 18041822 - 18041569
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||  || |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||  ||    
18041822 tcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcataaactcatgatttatgaacacctaagctatgaatcatcaacaacaatatatct 18041723  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || || | |||| ||||||||||||| |   || || ||| | ||| | || |||||||||||||    
18041722 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagtacaat-tcacaatatatcattttc 18041624  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttctt 594  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
18041623 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttctt 18041569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 45559227 - 45558976
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| | ||| |||||  || |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||    
45559227 tcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaccacccaagctatgaatcatcaacaacaatatccct 45559128  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||    
45559127 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttc 45559029  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
45559028 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttc 45558976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 350 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 27233348 - 27233197
Alignment:
350 ttttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaa 449  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||    
27233348 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa 27233249  T
450 acacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaa 501  Q
      ||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||    
27233248 caacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaa 27233197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Original strand, 33172185 - 33172436
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||  || |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||| | ||| ||    
33172185 tcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacgcaagctatgaatcatcaacaaccatatctct 33172284  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttc 539  Q
    |   | |||  ||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||| | ||| ||||||||||||    
33172285 ttataacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttc 33172383  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
33172384 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 33172436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 17285196 - 17285323
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| | |||||    
17285196 aacatgaaaaccaatgacatttgaaccaattca-ccaattttgcaaaactaccaacaacaactcatttctcatcctcaagtcatgaattatgaataccca 17285294  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    ||  |||||| ||||| ||||||||||||    
17285295 agccatgaatcatcaacaacaacatcact 17285323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 640 - 745
Target Start/End: Original strand, 21681259 - 21681363
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactcaa-ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
21681259 atgaacaattaatcaattcaacaaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaa--tgattatgatgaattctaacccccttacctta 21681356  T
739 gttagat 745  Q
     ||||||    
21681357 tttagat 21681363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 350 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 37653895 - 37653642
Alignment:
350 ttttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaa 449  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  |||| |||||||||  || ||| ||||| ||||| ||  |||| || |||    
37653895 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatcaaatcatga--tatgaacacccaagccataaatcatcaacaacaatattccttaacaacaa 37653798  T
450 acacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatacttt 548  Q
      ||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| ||| |||| |||| |   ||||||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| |    
37653797 caacatcaattaaacatgattctcaacagaattcaacaacaatataaaacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactat 37653699  T
549 gatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaaca 605  Q
    || ||| |||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||||||    
37653698 gaacatgcaatttcagcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgcatacaaaca 37653642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 20561622 - 20561483
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  ||||||||| || || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
20561622 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctt 20561527  T
738 agttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
20561526 agttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 20561483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 20573183 - 20573044
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||  ||||||||| || || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
20573183 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctt 20573088  T
738 agttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
20573087 agttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 20573044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 366 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 24552835 - 24552609
Alignment:
366 acaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaaca 465  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| | ||  |||| |||| | | ||| ||||| ||| | ||| |||| || |||  ||||||||| ||||    
24552835 acaacaacttatttcacatcaccaactcatgattcattaacactcaagctctaaatcatcaacaaccatatctcttaacaacaacaacatcaattaaaca 24552736  T
466 tgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttcac 564  Q
    ||| ||||| || || |||||| ||||||||||||| |   || |||||| | ||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||    
24552735 tgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcac 24552637  T
565 caacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||    
24552636 caacaacaattcaattatcaccaatttc 24552609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 469
Target Start/End: Original strand, 21680931 - 21681087
Alignment:
313 acatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaa 412  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| |   |||||| ||   |||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||    
21680931 acatgaaaacaattgacattaggaccaattcaccaatttttaccaaaataccaacaacatcttatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaa 21681030  T
413 gttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    |  |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||  ||||||||||| ||||||    
21681031 gccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattgatcatgaa 21681087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 740
Target Start/End: Original strand, 20481860 - 20481957
Alignment:
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||||   || |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
20481860 catgaacaaataatcaattatccaattaagcacttattcatacattaattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattttaacccccttacctta 20481955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 22497499 - 22497248
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| | ||| |||||  || |||||| ||||| ||||||||  ||||||| || || ||||| | | ||    
22497499 tcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaaactatgaatcattaacaacaatacctct 22497400  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||  ||||||||| ||||||||||||| || || | |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||    
22497399 tatcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttc 22497301  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||| | ||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||    
22497300 acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttc 22497248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 41246635 - 41246743
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||| || |||  |||||||||    
41246635 caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 41246734  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
41246735 gatcatgaa 41246743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 23152100 - 23151969
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    |||||||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||   |||||||||||    
23152100 caacaacttctcatttatcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacatagcaacaacagcatcaattgaa 23152001  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    || |  ||||| ||||||| |||| |||||||    
23152000 cacggttctcatcataattcaacaacaacata 23151969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20567476 - 20567353
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| || ||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||    
20567476 aacatgaaaacaattgacattaggaccaattca-ccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaaccc 20567379  T
411 aagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    |||  |||||||||||  ||||||||    
20567378 aagccatgaattatcatcaacaacat 20567353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20573669 - 20573546
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| || ||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||    
20573669 aacatgaaaacaattgacattaggaccaattca-ccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaaccc 20573572  T
411 aagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    |||  |||||||||||  ||||||||    
20573571 aagccatgaattatcatcaacaacat 20573546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20573461 - 20573330
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| || || || |||  |||||||||    
20573461 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 20573363  T
461 gaacatgaatctcagcataatttaacatcaaca 493  Q
    || |||||| || | || |||| |||| |||||    
20573362 gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca 20573330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 22234795 - 22234698
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
22234795 atgaacaattaatcaattcattcaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 22234701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 467
Target Start/End: Original strand, 20481585 - 20481688
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||| || |||  |||||||||||     
20481585 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgat 20481684  T
464 catg 467  Q
    ||||    
20481685 catg 20481688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 19331493 - 19331168
Alignment:
452 acatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttga 550  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || || ||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||    
19331493 acatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacaatttgagcataat-tcacaatatatcattttcacatactatga 19331395  T
551 tcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatga-acaatt 649  Q
     ||| |||||||||||||||    | |||||||||||||||| |  || |||||||| | |||||| | ||||||| |||  ||| | || || | || |    
19331394 acatgcaatttcaccaacaat---tcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatagtcataacaagagcacgaatttcaacaaccaagagaaaaat 19331298  T
650 aatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatca 747  Q
    ||||| ||| |||| |||||| |||  ||| |||  | |||||| |||| |||  || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |    
19331297 aatcacttattcaaataagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaact--aagtgattatgattgaaatctaacccccttacattagttaga-aa 19331201  T
748 atttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
19331200 aaatcctagctcaagcttcaatttacctcctag 19331168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Original strand, 25122698 - 25122795
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
25122698 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatta----taataatgattatgatgaattctaacccccttacctt 25122792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 41507087 - 41507022
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatca 426  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
41507087 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 41507022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 20529777 - 20529705
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
20529777 attatgatgaattataacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctag 20529705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20654151 - 20654067
Alignment:
385 caacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||  |||||||| || ||||| |||  ||||||||||| ||||||    
20654151 caacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaa 20654067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20567268 - 20567194
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
20567268 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 20567194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Original strand, 37611991 - 37612022
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
37611991 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 37612022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 674 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 16404965 - 16404859
Alignment:
674 attcatacaacaattgaaaatttacac-taaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcacttta 772  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||  || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  || |  |  |||||| |||||||||||     
16404965 attcatacaacatttgaaaatttacaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttt 16404866  T
773 gctccta 779  Q
    |||||||    
16404865 gctccta 16404859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 720 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 20653946 - 20653885
Alignment:
720 ttctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
20653946 ttctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 20653885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21494725 - 21494625
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattg 461  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||  || |||| |||  ||||||||||    
21494725 accaacaacatctcaattctcaccaacaa-tcatgatatatgcacacccaagttataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 21494627  T
462 aa 463  Q
    ||    
21494626 aa 21494625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24929075 - 24928999
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||  |||| | |||||| |||||||||    
24929075 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaa-tatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatca 24928999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 103241 - 102743
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
103241 aacatgaaaacatttgacatttgaactaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacaccca 103142  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    |   |||||||||||  ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| | | || |||| |||| ||||||| || || |   ||  |    
103141 aaccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaat 103042  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
      || ||| |    |||||| || ||||  ||||||||| |||  |||||||| ||||| || | ||||||||  || ||| | ||| ||||||||  ||    
103041 ttagcatattccaccatataccactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcat 102942  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
102941 cataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacacaaaaaatgatt 102842  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcc 811  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |||    
102841 atgatgaattataaaccccttaccttagttagatcaatcccctagctcaagcttcactttagcttctaggttct---ctcttcttgaatcttcaagctcc 102745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 312 - 807
Target Start/End: Original strand, 109518 - 110005
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||    
109518 aacatgaaaacaattgacatttgaaccaattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcataccca 109617  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   || ||    
109618 agccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatt 109717  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| ||| |   ||||||| || ||||  ||||||| | |||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||| ||| |  || ||||||||  ||    
109718 tgagcatatttcaacatataccactttctcatactttaaacatgaaatttcattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcat 109817  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||| | ||| |||| |||||||| || || | |||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||    
109818 catacttggatcacgaattctaacaattatcatcaattaatcaa--------ttaagcatttattcatacaacaattgataatttacacaaaagatgatt 109909  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||   |||  ||||||||||||||    
109910 atgatgaattctaaccaccttaccttagttagattaattccctagcttaggcttcactttagctcctaagttcttctctccacttgaatcttcaag 110005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 640 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 112536 - 112366
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| | || ||||||||| ||||||||| || || |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
112536 atgaacaattaatcaattcacccaaataagtactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctta 112441  T
739 gttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||| | ||||| | |  ||||| ||||||||||||||    
112440 gttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctccta-gctctcttcaccccttgattcttcaagttcctc 112366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 112812 - 112741
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataaca 432  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
112812 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcaacaaca 112741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 592
Target Start/End: Original strand, 131958 - 132023
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||||||| |||||  || ||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||    
131958 atatatcattttcacatactacgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 132023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 342 - 813
Target Start/End: Original strand, 28494 - 28965
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| || || |||||||||||||    
28494 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 28593  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcat 541  Q
    |||| |||  ||||||||||||||| | ||| |  | |||| |||| ||||||| || || |   || || ||| |||||   |||||||||| ||||      
28594 agcaacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 28693  T
542 atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcat 641  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||| || | | |||||| ||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||  |||| |   |    
28694 atactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatgataacaacttt 28793  T
642 gaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 741  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
28794 ggacaattaatcatttactcaattaagaacttattcatacaacaattgaaaatttaaactaaaaatgattatgatgaattctaaccccgttaccttagtt 28893  T
742 agatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28894 agatcaaatccctagcccaagcttcactttagttcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 28965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Original strand, 48356599 - 48357066
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||    
48356599 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatca 48356698  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |   ||||||||| |||||   ||||||| || |||    
48356699 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcaacatataacacttt 48356798  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||  ||| |||| |     
48356799 cacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaac 48356898  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
48356899 tatgaacaattaatcacttactcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 48356996  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
48356997 aattagcacaa-ttcctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 48357066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 364 - 813
Target Start/End: Original strand, 13377509 - 13377959
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||  |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||    
13377509 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaacaacaacatcaattgaa 13377608  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |  ||| || ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||    
13377609 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 13377708  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    ||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
13377709 ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcgattactcaa 13377808  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagc 763  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   | | |||||||| |||||    
13377809 tgaatcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagc 13377908  T
764 ttcactttagctcctaggttctc-tcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||  ||||| |||||||||| |||||    
13377909 ttcactttagctcctaagatctcttccaattcttaaatcttcaagctcctc 13377959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 16915220 - 16914752
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| || |    
16915220 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatga 16915121  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   | ||||||| |||||   ||||||| || |||    
16915120 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcataattcaacatataacacttt 16915021  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||| |     
16915020 cacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaac 16914921  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||    
16914920 tatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaagttacact--aaatgattgtgattgaattctaacccctttacctt 16914823  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||    
16914822 aattaggacaaattcctagcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttcaatcttcaag 16914752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Original strand, 9838835 - 9839302
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||    
9838835 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaactttcatcatcaaatcatgatttatgaacacc-aagtcatgaatcatcaacaacaatatca 9838933  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   ||||||||| |||||   ||||||| || |||    
9838934 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacacttt 9839033  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||| |     
9839034 cacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaac 9839133  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
9839134 tatgaacaattaatcacgtactcaattaagcacttaatgatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaaccctcttacctt 9839231  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | ||||   || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
9839232 aattagcaaaaattcctcgccgaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 9839302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Original strand, 9611263 - 9611731
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||    
9611263 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaactttcatcatcaaatcatgatttatgaacacc-aagtcatgaatcatcaacaacaatatca 9611361  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttaga-gsataatatgacatatatcattt 537  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   |||||||| | |||||   ||||||| || ||    
9611362 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataattcaacatataacactt 9611461  T
538 tcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaacca 637  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||| |    
9611462 tcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaa 9611561  T
638 tcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacct 736  Q
      |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
9611562 ctatgaacaattaatcacgtactcaattaagcacttaatgatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaaccctcttacct 9611659  T
737 tagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    || ||||   || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
9611660 taattagcaaaaattcctcgccgaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 9611731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 312 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 17224256 - 17223757
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
17224256 aacatgaaaacaattgacatttgcaccaattca-ccaattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaataccca 17224158  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| |  | |||| |||| ||||||| || || |   || ||    
17224157 agccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 17224058  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||| ||||| || | |||||||  ||| ||| | ||| ||||||||  ||    
17224057 tgagtataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcat 17223958  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |   |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||    
17223957 cataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaattatttactcaattaagcacttaatcataaaataattgaaaaattacactaaaaatgatt 17223858  T
712 atga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctc-tcctcttcttgaatcttcaagtt 809  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | ||| |||| |||||||||||||| ||| |||| |||| |||  ||||||||| ||||||||    
17223857 atgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcttagcccaagcttcactttacctcgtaggatctcttccaattcttgaattttcaagtt 17223758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 49047993 - 49047494
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |   |||||| ||   |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
49047993 aacatgaaaacaattgacatttggaccaattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcgtttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataccca 49047894  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |   |   |    
49047893 agccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaat 49047794  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| ||| |   ||||||| || | ||  ||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| |||||||   ||    
49047793 tgagcatatttcaacatataccactctctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcat 49047694  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
     ||||| |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||  | |||| |||    
49047693 tataattggagcacaaattctaacaattctgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatataacaattgaaaaatggca--ataaatgatt 49047596  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| |||  | |||||||||||||||||    
49047595 atgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagttcaagcttcaatttagctcctagctctct-tccaatccttgaatcttcaagttc 49047497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 312 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 34241508 - 34241031
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaaca-aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||| |    
34241508 aacatgaaaacaactgacatttgaacataattcaaccctttttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgatttatgaacactc 34241409  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatt 510  Q
    |||  |||||| ||||| |||||  ||||||| || |||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |   ||      
34241408 aagccatgaatcatcaacaacaatgtcacttatcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaatt---ca-- 34241314  T
511 tagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaa 610  Q
                  |||||||| | ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |    
34241313 --------------acatatattactttcacatacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataaca 34241228  T
611 tcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataat 710  Q
    |||||||   | |||| ||| || | |  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||    
34241227 tcataattataacacgaattttatcaactatgaacaattaatcacttactcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgat 34241130  T
711 tatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||    
34241129 tatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaattcttaacccaagcttcactttagctcataggatctctaccacttcttgaatcttcaag 34241031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Original strand, 13274715 - 13275204
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |   |||||| ||   |||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||| |    
13274715 aacatgaaaacaattgacatttggaccaattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaa 13274814  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   |   |    
13274815 agccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaat 13274914  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     |||          |||||| || ||||  ||||||||| |||  ||||| || ||||| || | ||||| || ||| ||||| ||| ||||||||  ||    
13274915 tgag----------catataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcat 13275004  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||  | |||| |||    
13275005 cataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaatggca--ataaatgatt 13275102  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| |||  | |||||||||||||||||    
13275103 atgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctaactcaagattcactttagctcctagctctct-tccaatccttgaatcttcaagttc 13275201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 342 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 14272175 - 14271723
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||| |||| ||    
14272175 tcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcattt 14272076  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcat 541  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||| |||     ||||        |||||| ||  |||   || || ||| ||| |   ||||||||||||||||     
14272075 agcaacaacaacatcaattgaacatgattct-----taat--------aacatagcatgaatcaacaattggagcatagttcaacatatatcattttcac 14271989  T
542 atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcat 641  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| | ||| ||||||||  | ||||||  ||||||| ||| | || |  ||    
14271988 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatt-tgacaactat 14271890  T
642 gaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |    
14271889 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaattcccttaccttaat 14271791  T
741 tagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctc-tcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||   | | |||||| |  ||||||||||||| ||| |||| | || |||  ||||||||||||||||    
14271790 tatcaccaattcctaacctaagcttcactttaactcataggatatcttccaattcttgaatcttcaag 14271723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 364 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 20583821 - 20583593
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
20583821 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaa 20583722  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   || || ||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
20583721 catgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 20583623  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | |||||| || | ||||||||||||||||    
20583622 atcaacaataattcaattatcaccaatttc 20583593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 745 - 827
Target Start/End: Original strand, 9080965 - 9081047
Alignment:
745 tcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctccttcgataaccctt 827  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
9080965 tcaattccctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagtttctccttctctaaccctt 9081047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 312 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 16570325 - 16569858
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| |   |||||| ||  |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
16570325 aacatgaaaacaattgacattaggaccaattcaccaatttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataccca 16570226  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||||||   || ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || | |  |||| |||| ||||||| || || |   |   |    
16570225 agccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaat 16570126  T
512 agagsataatat-gacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaa 610  Q
     ||| ||| | |  | ||||| |||||||  ||||||||| |||  ||||  || ||||| |||| |||||||   || ||| ||||| |||||||   |    
16570125 tgagcatattttccagatataccattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtca 16570026  T
611 tcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataat 710  Q
    |||||||  ||||||| |||  | |  | |||| ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |   || ||| ||    
16570025 tcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaataatcaattatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgc---aataatgat 16569929  T
711 tatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||    
16569928 tatgatgaattttaacccccttacctttgttagattaatctccctagcttatgcttcaatttagctcctag 16569858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 312 - 780
Target Start/End: Original strand, 16595337 - 16595804
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| |   |||||| ||  |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
16595337 aacatgaaaacaattgacattaggaccaattcaccaatttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataccca 16595436  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||||||||   || ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || | |  |||| |||| ||||||| || || |   |   |    
16595437 agccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaat 16595536  T
512 agagsataatat-gacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaa 610  Q
     ||| ||| | |  | ||||| |||||||  ||||||||| |||  ||||  || ||||| |||| |||||||   || ||| ||||| |||||||   |    
16595537 tgagcatattttccagatataccattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtca 16595636  T
611 tcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataat 710  Q
    |||||||  ||||||| |||  | |  | |||| ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |   || ||| ||    
16595637 tcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaataatcaattatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgc---aataatgat 16595733  T
711 tatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||    
16595734 tatgatgaattttaacccccttacctttgttagattaatctccctagcttatgcttcaatttagctcctag 16595804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 626
Target Start/End: Original strand, 28390292 - 28390554
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
28390292 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 28390391  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| | ||| || |||| ||||  |||||| ||||| |   ||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
28390392 catgattatcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttc 28390490  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||| | |||||||    
28390491 accaacaacaatttaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacg 28390554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 364 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 26070531 - 26070156
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||   |||||||||||||||| |||  |||||||||||     
26070531 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 26070432  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatga-catatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    |||||| || | || |||| | || |||||||||| || |   || ||| || ||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||  ||||      
26070431 catgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaatta-agcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattca 26070333  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    || ||||| || | |||||||   || ||| ||||| |||||||   ||||||||  ||||||| |||  | |  | |||||||||||||||||||| ||    
26070332 actaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattacaca 26070233  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||| || |   || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
26070232 attaagcacttattcataccataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttag 26070156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 364 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 26094318 - 26093943
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||   |||||||||||||||| |||  |||||||||||     
26094318 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 26094219  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatga-catatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    |||||| || | || |||| | || |||||||||| || |   || ||| || ||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||  ||||      
26094218 catgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaatta-agcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattca 26094120  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    || ||||| || | |||||||   || ||| ||||| |||||||   ||||||||  ||||||| |||  | |  | |||||||||||||||||||| ||    
26094119 actaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattacaca 26094020  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||| || |   || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
26094019 attaagcacttattcataccataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttag 26093943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 12248391 - 12247973
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||| |||  ||||| |||    
12248391 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatccatt 12248292  T
461 gaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatat-gacatatatcattttcatatactttgatcattcaat 559  Q
    || ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   |   | ||| ||| | |  |||||||  ||||||  ||||||| | |||  |||    
12248291 gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatactattttctcatactttaaacatgaaat 12248192  T
560 ttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattac 659  Q
    |  || || || || | |||||||   || ||| ||||| |||||||   ||||||||  ||||||| |||  | |  | |||||||| ||||||||||     
12248191 tcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaagtaatcaattat 12248092  T
660 tcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagct 758  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||  | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
12248091 ccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--atatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagct 12247994  T
759 caagcttcactttagctccta 779  Q
     | |||||| ||| |||||||    
12247993 taggcttcaattttgctccta 12247973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 364 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 13449094 - 13448866
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
13449094 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatcaacacccaagctacgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 13448995  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||  |||||| ||||| |   ||||||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
13448994 catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 13448896  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||    
13448895 accaacaataattcaattatcaccaatttc 13448866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 607
Target Start/End: Original strand, 14935320 - 14935583
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||  |||| ||||| ||| ||    
14935320 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctct 14935419  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttc 539  Q
    || || |||   ||||| || || |||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   || || ||| ||||| | ||| ||||||||||||    
14935420 taacaacaa---catcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataat-tcacaatatatcattttc 14935515  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacata 607  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
14935516 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata 14935583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 607
Target Start/End: Original strand, 15362913 - 15363176
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||  |||| ||||| ||| ||    
15362913 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctct 15363012  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttc 539  Q
    || || |||   ||||| || || |||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   || || ||| ||||| | ||| ||||||||||||    
15363013 taacaacaa---catcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataat-tcacaatatatcattttc 15363108  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacata 607  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
15363109 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata 15363176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 469
Target Start/End: Original strand, 11287345 - 11287502
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| || ||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
11287345 aacatgaaaacaattgacatttggaccaattca-ccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaaccc 11287443  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    |||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||||||| ||| ||||||    
11287444 aagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaactgatcatgaa 11287502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Original strand, 15358777 - 15359191
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||| |||  |||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| |   |||| || |||  ||||||||| ||    
15358777 caacaacaacttatttttcatcatcaaatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaa 15358876  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| || || || |||| |||| ||||||||||||| |   ||||||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
15358877 catgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 15358975  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  | ||||||   | |||| |||  ||| |  |||||||| |||||| ||| |||    
15358976 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcagttattca 15359074  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaattta-cactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctca 760  Q
    | |||| | ||| |||| |||  | |||||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||| ||    
15359075 actaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaa-atcctagccca 15359171  T
761 agcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
15359172 agcttcaatttagatcctag 15359191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 366 - 679
Target Start/End: Original strand, 4484709 - 4485021
Alignment:
366 acaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaaca 465  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||||    
4484709 acaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaaca 4484808  T
466 tgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttcac 564  Q
    ||| ||||| || |||| |||| ||| ||| ||||| |   || || ||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||| ||||||| |    
4484809 tgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacaatttgagcataat-tcacaatatatcattttcacatacaatgaacatgcaatttctc 4484907  T
565 caacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaat 664  Q
    |||||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  |||||| ||||| |||| |||  ||| |  |||||||| |||||| ||| |||||    
4484908 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatattagga-cacgaatttcaacaactatgaacaaataatcacttattcaat 4485006  T
665 taagcaattattcat 679  Q
    |||||| ||| ||||    
4485007 taagcacttaatcat 4485021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Original strand, 4446169 - 4446420
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaatta-tcaataacaacatcac 439  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||  |||||| | |||| | || |||| |    
4446169 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatctc 4446268  T
440 ttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttc 539  Q
    ||| || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || || ||| | ||||    |||||||||||||    
4446269 ttatcaacaacaacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagcacaatacataatatatcattttc 4446367  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
4446368 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 4446420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 364 - 591
Target Start/End: Original strand, 38424199 - 38424426
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  |||||| || ||    
38424199 caacaacaacttatttttcaccatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcacttaaa 38424298  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||| | ||||| ||||||| |||| |||||||  |||| |   || || ||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
38424299 cataattctcatcataattcaacaacaacatagaacaattcaacaatttgagcataat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 38424397  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaattt 591  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||    
38424398 accaacaacaattcaattatcaccaattt 38424426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 640 - 813
Target Start/End: Original strand, 11287673 - 11287843
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| || || ||||||||| ||||||||| || || |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
11287673 atgaacaattaatcaattcacccaattaaacactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctta 11287768  T
739 gttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||| ||| | ||||||| |  ||||| ||| ||||||| | ||||||| || ||||| ||||||||||||||    
11287769 gttagattaatctccctagcttagacttcaattttgctccta-gctctctccactccttgattcttcaagttcctc 11287843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 665 - 787
Target Start/End: Original strand, 16919811 - 16919934
Alignment:
665 taagcaattattcatacaacaattgaaaat-ttacactaaaaataattatgat-gaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaag 762  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||   | | |||||||| ||||    
16919811 taagcacttattcatacaacaattgaaaaaattacactaaaa-tgattatgattgaattttaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaag 16919909  T
763 cttcactttagctcctaggttctct 787  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
16919910 cttcactttagctcctaggatctct 16919934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 392 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 17947831 - 17947597
Alignment:
392 tcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaa 491  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || || | |||| |||    
17947831 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaa 17947732  T
492 cataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaattt 591  Q
    |||| ||||| |   || |||||| | ||| |   |||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |||||||| || | |||||||||||||||    
17947731 catagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatcattttcacatactatgcacattcagtttaaccaacaacaattcaattatcaccaattt 17947632  T
592 cttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    | | ||  ||||||||  ||||||| | |||||||    
17947631 catgcactcaaacatatcatcataacaagagcacg 17947597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 592
Target Start/End: Original strand, 31501153 - 31501381
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| | || || |||  ||||||||| ||    
31501153 caacaataacttatttctcatcatcaaatcatgactcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaa 31501252  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || || ||| || || | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
31501253 catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcattat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 31501351  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    ||||| || || | ||||||||||||||||    
31501352 accaataacaattcaattatcaccaatttc 31501381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 607
Target Start/End: Original strand, 14940704 - 14940975
Alignment:
336 acaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaa---taac 431  Q
    ||||| |||||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| |||||   |||     
14940704 acaaaatcaacccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaattctaaa 14940803  T
432 aacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atat 530  Q
    ||| || |||| || |||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   || || ||| ||||| | || ||||    
14940804 aac-tctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataat-tcacaatat 14940901  T
531 atcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacata 607  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||   || ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
14940902 atcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaac---aatttaattatcacaaatttcatgcattcaaacata 14940975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 607
Target Start/End: Original strand, 15368297 - 15368568
Alignment:
336 acaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaa---taac 431  Q
    ||||| |||||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| |||||   |||     
15368297 acaaaatcaacccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaattctaaa 15368396  T
432 aacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atat 530  Q
    ||| || |||| || |||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |  | | || ||| ||||| | || ||||    
15368397 aac-tctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcattaatttgagcataat-tcacaatat 15368494  T
531 atcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacata 607  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||   || ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
15368495 atcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaac---aatttaattatcacaaatttcatgcattcaaacata 15368568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 527 - 742
Target Start/End: Original strand, 28722253 - 28722468
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||   |||||||    
28722253 atatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacg 28722352  T
627 gattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaataattat-gatgaattcta 724  Q
     |||  ||| |  ||||||||  | ||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || | ||||| | |||||||||    
28722353 aatttcaacaactatgaacaaagattcacttattcaattaagcatttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattcta 28722450  T
725 acccccttaccttagtta 742  Q
    ||||||||||||||||||    
28722451 acccccttaccttagtta 28722468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 722 - 807
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389778
Alignment:
722 ctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||||||||||||| |||   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
13389693 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctccaattcttgaatcttcaag 13389778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 9319667 - 9319578
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataa 616  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||    
9319667 atatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgtattcaaacatatcatcataa 9319578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 660 - 739
Target Start/End: Original strand, 25124406 - 25124483
Alignment:
660 tcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttag 739  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
25124406 tcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 25124483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7284348 - 7284222
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| || ||||  ||||||||| |  |||||||| || |    
7284348 tcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattattatcaacaacatgacat 7284250  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    | || |||  ||||||||||| ||||||    
7284249 atcaacaacaacatcaattgatcatgaa 7284222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 45452159 - 45452058
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  |||||||||||    | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
45452159 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaattg---caataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt 45452064  T
738 agttag 743  Q
    ||||||    
45452063 agttag 45452058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 474
Target Start/End: Original strand, 45149560 - 45149692
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||  || |||||  ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||    
45149560 tcaacccattttcacaaaatcaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgg-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctct 45149658  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctca 474  Q
    || || |||  ||||||||| |||||||||||||    
45149659 taacaacaacaacatcaattaaacatgaatctca 45149692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 501
Target Start/End: Original strand, 46473981 - 46474118
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  || |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
46473981 caacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 46474080  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaa 501  Q
    ||||||||||| || || | |||| ||||||| |||||    
46474081 catgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaa 46474118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 39046893 - 39046785
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||| | || |||  ||| |||||    
39046893 caccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 39046794  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
39046793 gatcatgaa 39046785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 9724074 - 9723846
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| | ||| |||||   | |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || || ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
9724074 caacaacaacttaattcacatcatagactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 9723975  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||||||||| || || | |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||| ||| | ||| ||| || ||||    
9723974 catgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcagtttc 9723876  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | |||||  || | ||||||||||||||||    
9723875 atcaacatcaattgaattatcaccaatttc 9723846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 13863197 - 13863066
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  |||||| |||||||||  ||| || || || ||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||    
13863197 caacaacaacttatttcacattatcaaatcattgattatgaacacccaagccatgcatcattaacaacaatatcacttagcaacaacaacaacaattgaa 13863098  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    ||||||| | | || |||| |||| |||||||    
13863097 catgaatattatcacaattcaacaacaacata 13863066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 452 - 592
Target Start/End: Original strand, 33559715 - 33559855
Alignment:
452 acatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttga 550  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || || | |||| ||||||||||||| |   |||||||||   ||| | ||| ||||||||||||  ||||| |||    
33559715 acatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcccaat-tcacaatatatcattttctcatactatga 33559813  T
551 tcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
     ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
33559814 acatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 33559855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Original strand, 35094794 - 35094869
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||    
35094794 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacat 35094869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 143622 - 143703
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttc-ccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactta 442  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||    
143622 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcattaacaacatgactta 143703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 709 - 743
Target Start/End: Original strand, 12759311 - 12759345
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12759311 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 12759345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 709 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 13862857 - 13862823
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13862857 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 13862823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 527 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 8267832 - 8267767
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||    
8267832 atatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttc 8267767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8268002 - 8267905
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||    
8268002 tcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaaatcatgatttatgaacatccaagctatgaatcctcaacaacaacatca 8267905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Original strand, 35095071 - 35095208
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
35095071 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 35095165  T
738 agttagatcaatttcct-agctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    || ||| | ||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||    
35095166 ag-taggttaatctcctaagcttaagcttcaattttgctcctag 35095208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 39046619 - 39046481
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| | |||   ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
39046619 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaaataaca---aaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 39046524  T
738 agttagatcaatttcct-agctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    || ||| | ||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||    
39046523 ag-taggttaatctcctaagcttaagcttcaattttgctcctag 39046481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Original strand, 3895281 - 3895378
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
3895281 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 3895375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 15822423 - 15822325
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  || ||||||||   || | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
15822423 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataactgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 15822328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15822701 - 15822593
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||  |||||||| || || || |||  |||||||||    
15822701 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 15822602  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
15822601 gatcatgaa 15822593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Original strand, 143962 - 143993
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
143962 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 143993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 709 - 743
Target Start/End: Original strand, 47290105 - 47290139
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
47290105 attatgatgaattctaacccccttaccttaattag 47290139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 592
Target Start/End: Original strand, 4438926 - 4438991
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||| || || | ||||||||||||||||    
4438926 atatatcattttaacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatttc 4438991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 471
Target Start/End: Original strand, 13321033 - 13321102
Alignment:
402 tgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatc 471  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||||||    
13321033 tgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatc 13321102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 827
Target Start/End: Original strand, 15709525 - 15709590
Alignment:
762 gcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctccttcgataaccctt 827  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||  ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
15709525 gcttcactttagctcctaagctcactccaattcttgattcttcaagtttctccttctctaaccctt 15709590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 364 - 723
Target Start/End: Original strand, 2435 - 2795
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| | |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
2435 caacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 2534  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
2535 catggttctcatcataattcaacaacaacatatcataaattatcatttagagcataatataacatatatcattttcatacactttgatcattcaatttct 2634  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
2635 ccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacatacaaacataccatcataataggagcacgaattctaataatcatgaccaattaatcaattactcaa 2734  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattg-aaaatttacactaaaaataattatgatgaattct 723  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
2735 taaagcacttactcatacaacaattgaaaaattgacactaaaaatgattatgatgaattct 2795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 44090 - 43622
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||    
44090 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatca 43991  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||    |||   |||||||||| |||    
43990 cttagcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaatttgacatttagaacccaattcaacatatatcacttt 43891  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  |||||   ||| |||| |     
43890 catatcctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaac 43791  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
43790 tatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 43693  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    | ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||    
43692 aattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttaaatcttcaag 43622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 317 - 807
Target Start/End: Original strand, 69389 - 69880
Alignment:
317 gaaaacaattgacatttgaaca-aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||      
69389 gaaaacaattgacatttgaacataattcaacccattttacaaaaccaacaacaacacctcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagcc 69488  T
416 atgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagag 515  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   |||||||||    
69489 atgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagag 69588  T
516 sataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcata 615  Q
     |||||   ||||||| || ||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||| || | |||||| ||||||||| | |||  |||||||  ||||||    
69589 cataattcaacatataacactttcacatactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcata 69688  T
616 ataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga 715  Q
    ||  ||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||    
69689 attagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactttctcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatga 69786  T
716 -tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
69787 ttgaattctaacccccttatcttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 69880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Original strand, 2480 - 2948
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    |||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||||| ||||| ||||    
2480 aattcaacccattttagaaaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatca 2579  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || || |   ||||||||| |||||   ||||||| || |||    
2580 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatataacacttt 2679  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||| |     
2680 catatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaac 2779  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||| ||  || || |||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
2780 tatgaacaattaatcacttactgaattaatcatctaatcttacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccgcttacctt 2877  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
2878 agttagcaaaaattcctagctcaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 2948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 364 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 2583 - 2136
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
2583 caacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttaggaacaacaacatcaattgaa 2484  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||| ||| | ||||||| |||| ||||||| || || |  ||| || ||| |||||   |||||| ||| ||||  ||||||||| |||  |||||||    
2483 catgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatgtcactttctcatactttgaacatgaaatttca 2384  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    ||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  || ||||  ||||||||||||||||||    
2383 ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataattatgattaattaatcaattactcaa 2284  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagc 763  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
2283 ttaagcacttattcatacaacaatt-aaaaattgcact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattctcttgctcaagc 2186  T
764 ttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||||    
2185 ttcactttagctcctagctctct-tccaatccttgaatcttcaagttcctc 2136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 339 - 780
Target Start/End: Original strand, 30975 - 31415
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||  ||||    
30975 aattcaacccattttacaaaagcaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcttgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacagtatca 31074  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||  |||||| ||||| |   |||||| || |||||   ||||||| || |||    
31075 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcataattcaacatataacacttt 31174  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    || ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| | ||| |||| |||  ||||||||  ||||||| |||||||| |     
31175 cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaac 31274  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
31275 tatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 31372  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    | ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
31373 aattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctag 31415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 312 - 807
Target Start/End: Original strand, 35408 - 35902
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
35408 aacatgaaaacaactgacatttgcaccaattca-ccaattttacaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaataccca 35505  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | || | || |||| ||||||| || ||||   || ||    
35506 agccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatt 35605  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
     ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||| ||||| || | ||||||||  || ||| | ||| ||||||||  ||    
35606 tgagtataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcat 35705  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    ||| || |||||||| ||| |||  |   |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
35706 catgattggagcacgaattataagaactttgaacaattaatcttttactcaattaagcacctattcatacaacaattgaaaaattacact-aaaatgatt 35804  T
712 atga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctc-tcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||    
35805 atgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaag 35902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 316 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 77161 - 76697
Alignment:
316 tgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtt 415  Q
    ||||||||  ||||||||| || |||||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||      
77161 tgaaaacacatgacatttgcaccaattca-ccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagcc 77063  T
416 atgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagag 515  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| || || |   || || ||     
77062 atgaatcatcaataacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaa 76963  T
516 sataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcata 615  Q
     |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||    
76962 cataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcata 76863  T
616 ataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatg 714  Q
    ||  ||||| | ||| | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
76862 attagagcatgaatt-tcatcatctatgaacaattactcaattactcaattaagtacttaatcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatg 76765  T
715 a-tgaattctaacccccttaccttagtta-gatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctagg 781  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
76764 attgaattctaacccccttaccttaattatcagcaa-ttcctagcccaagcttcactttagctcctagg 76697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 312 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 7344 - 6848
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaaca-aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  || ||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |    
7344 aacatgaaaacaattgacatttgaacataattca-ccaattttacaaaaccatcattcacaactcatttctcatcaacaattcatgaattatgaacactc 7246  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatt 510  Q
    |||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | || |||  || | |||||||||| || |   || |    
7245 aagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgaacatgattcttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaat 7146  T
511 tagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaa 610  Q
    | ||| |||||   |||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||  |    
7145 ttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatca 7046  T
611 tcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataat 710  Q
    |||||||  ||||||| ||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||    
7045 tcataattagagcacgaattttgacaattatgaacaacaaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacgattgaaaaattaca-ttaaaatgat 6947  T
711 tatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||   | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
6946 tataattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaag 6848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 345 - 812
Target Start/End: Original strand, 6622 - 7090
Alignment:
345 acccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagc 444  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||     
6622 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttagg 6721  T
445 agcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatata 544  Q
    || ||  ||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||  | |||| || || |   || || ||| | |||   |||||||||| ||||  |||    
6722 agtaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaattcaacatatatcactttctcata 6821  T
545 ctttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaa 644  Q
    |||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||   |||||| ||| |||| | | ||||    
6822 ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaattataacaa-cttgaa 6920  T
645 caattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || |||     
6921 caattaatcatttacacatttaagcatttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattcaattctaacccccttaccataattat 7020  T
744 atcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaagttcct 812  Q
      | | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
7021 caccaattcctagcccaaccttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctcct 7090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 312 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 34046 - 33547
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |   |||||| ||   |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||    
34046 aacatgaaaacaattgacatttggaccaattcaccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcataccca 33948  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattt 511  Q
    ||  ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |   |   |    
33947 agccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaat 33848  T
512 agagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaat 611  Q
      || ||| |   ||||||| || ||    ||||||| | |||  |||| ||| ||||| || | |||||||  ||| |||   ||| |||||||   ||    
33847 ttagcatatttcaacatataacacttcttcatactttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcat 33748  T
612 cataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatt 711  Q
    |||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
33747 cataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcatttattcatacaacaattgaaa-tttacactaaaaatgatt 33649  T
712 atgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||  | |||||||||||||||||    
33648 atgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcaatttagctcatagctctct-tccaatccttgaatcttcaagttc 33550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 197548 - 197078
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagt---caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaaca 435  Q
    ||||||||||||||||||||     || ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||| | ||||||   |||||| ||||| ||||| |    
197548 aattcaacccattttacaaaactaacaacaacaacaactcaattctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaata 197449  T
436 tcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcat 535  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||  |||| |   ||||||||| |||||   || |||| ||     
197448 tcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaacatttagagcataattcaacttataacac 197349  T
536 tttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaac 635  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||  |||| || | |  |||    
197348 tttcacatactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaac 197249  T
636 catc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaaccccctta 733  Q
     ||| | ||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
197248 -atctaagaacaattaatcacttatccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaaccccctta 197152  T
734 ccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
197151 ccttaattagcacaa-ttcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 197078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 339 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 97490 - 97023
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| | |||||||  |||||| ||||| || || ||||    
97490 aattcaacccattttacaaaaccaataacaacaactcaattcttatcatcaaatcatgatttatgaaaacccaaggcatgaatcatcaacaataatatca 97391  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
     |||| | |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || || |   ||||||||| |||||   ||||||| || |||    
97390 attagtaacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatataacacttt 97291  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    || ||||||||| ||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||  | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||  |||| |     
97290 cacatactttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaac 97191  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
97190 tatgaacaattaatcactcactcaattaaacactaaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 97093  T
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
      ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||    
97092 cattagcacaa-ttcctagcccaagcttcactttacctcctacgatctctaccatttcttgaatcttcaag 97023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 661 - 780
Target Start/End: Original strand, 70891 - 71007
Alignment:
661 caattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctc 759  Q
    |||||||||| || ||||||||| || ||||||||   || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||     
70891 caattaagcactt-ttcatacaataactgaaaatt---acaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagctt 70986  T
760 aagcttcactttagctcctag 780  Q
    | |||||| ||| ||||||||    
70987 aggcttcaattttgctcctag 71007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 31021 - 31129
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||||  || ||||||||  || ||| |||| || ||||||  |||||||||    
31021 caccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaacaacatcaatt 31120  T
461 gaacatgaa 469  Q
     | ||||||    
31121 aatcatgaa 31129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 315 - 813
Target Start/End: Original strand, 3250 - 3747
Alignment:
315 atgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatt-tta-caaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaa 412  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| || ||| ||| |||| | |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
3250 atgaaaacaattgacatttggaccaattca-ccaattcttatcaaact-accaactacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaa 3347  T
413 gttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcattta 512  Q
    |  |||||||| ||   |||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||  ||||||| || || | | |   |     
3348 gccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattggaccaatt 3447  T
513 gagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatc 612  Q
    ||| ||| | | ||||||| || ||||  ||||||||| |||| |||||| | ||||| || | |||||| |  || ||| | ||| ||||||||| |||    
3448 gagcatattttcacatataccactttctcatactttgaacattaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatc 3547  T
613 ataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataatta 712  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||  | |||| ||||    
3548 ataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgtaaaattgca--ataaatgatta 3645  T
713 tgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaagttc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| || |||||||| |||||||||||| | ||| |||  | |||||||||||||||||    
3646 tgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctatcttaagcttcaatttagctcctagctctct-tccaatccttgaatcttcaagttc 3744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 364 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 104889 - 104448
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||    
104889 caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt-aa 104791  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||  | ||| ||||||| |||| |||||||||| || |   |  || ||| |||||     |  || |||||  | ||||||||| | | ||| ||||    
104790 catggttatcatcataattcaacaacaacataacataattcaaccatttgagcataattcataagttagcatttatacatactttgaacctgcaaattca 104691  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactca 662  Q
    ||||||| || | |||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||||| |  ||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
104690 ccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattttaac-atctatgaacaattaatcacttactca 104592  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaag 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||| |||| ||||    
104591 attaagcaattattcatacaacaattgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattctaacccacttaccttaattagcacaaattcttagcccaag 104494  T
763 cttcactttagctcctag-gttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||    
104493 cttcactttagctcctagtatcctcacctcttcttgaatcttcaag 104448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 319 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 94084 - 93916
Alignment:
319 aaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatg 418  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||| | |||    
94084 aaacaattgacatttgaaccaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatg 93985  T
419 aattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaaca 487  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  |  ||  ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
93984 aattatcatcaacaacatcacttattaataacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaatttaaca 93916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 526 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 1453 - 1200
Alignment:
526 catatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcac 625  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||| |  ||||||    
1453 catatatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcac 1354  T
626 ggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattcta 724  Q
    | ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||    
1353 gaattttaac-atctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattacactaata-tgattatgatgaattcta 1256  T
725 acccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
1255 acccccttaccttagatagattaattccctagatcaagcttcactttagctcctag 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 526 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 9708 - 9455
Alignment:
526 catatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcac 625  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||| |  ||||||    
9708 catatatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcac 9609  T
626 ggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattcta 724  Q
    | ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||    
9608 gaattttaac-atctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattacactaata-tgattatgatgaattcta 9511  T
725 acccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
9510 acccccttaccttagatagattaattccctagatcaagcttcactttagctcctag 9455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 577 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 116612 - 116382
Alignment:
577 aattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattatt 676  Q
    |||||||| ||||||| | | | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||    
116612 aattatcaacaatttcatgccttcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgagcaattaataatttactcaattaagcacttatt 116513  T
677 catacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctc 776  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||   | | |||||||| ||||||||||||||||||    
116512 catacaaccattcaaaatttacactaaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctc 116413  T
777 ctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 807  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||||    
116412 ctaggatctctccaattattgaatcttcaag 116382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 116831 - 116699
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   |||||| || ||||||||||  ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
116831 aacatgaaaaccaatgacatttgagtcaattca-ccaattttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacaccca 116733  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagca 445  Q
    ||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
116732 agccatgaatcatcaacaacaatatcacttagca 116699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Original strand, 164536 - 164567
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
164536 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 164567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 560 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 1617 - 1398
Alignment:
560 ttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaatta 658  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||| |  ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||    
1617 ttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaac-atctatgaacaattaatcattta 1519  T
659 ctcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagct 758  Q
      |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
1518 tccaattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaa-taattatgatgaattctaaaccccttaccttagatagattaattccctagct 1420  T
759 caagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||    
1419 caagcttcactttagctcctag 1398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 560 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 8762 - 8543
Alignment:
560 ttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaatta 658  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||| |  ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||    
8762 ttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaac-atctatgaacaattaatcattta 8664  T
659 ctcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagct 758  Q
      |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
8663 tccaattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaa-taattatgatgaattctaaaccccttaccttagatagattaattccctagct 8565  T
759 caagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||    
8564 caagcttcactttagctcctag 8543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Original strand, 11074 - 11488
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||| |||  |||||| || || ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
11074 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaa 11173  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||| ||| ||| || |  |   |  || ||| |||||   |||||||||| ||||| | ||||||| |||  |||||||    
11174 catggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttcaactatttgagcataattcaacatatatcactttcacacactttgaacatgaaatttca 11273  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattct-aaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    | ||||| || | ||||||||| | |||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| || | ||| | ||| || |||||||||||||||  ||||||    
11274 caaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggaacatgaatttttaacaattatgaacaattaatcatctactca 11373  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaag 762  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
11374 attaagcacttattcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattataa-ccccttaccttagttagattaattccctagctctag 11470  T
763 cttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||| |||||||    
11471 cttcactttacctcctag 11488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 339 - 738
Target Start/End: Original strand, 53302 - 53699
Alignment:
339 aattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||| | ||| || ||||||  |||||| || || |||||  |||    
53302 aattcaacccattttacaaaaccaacaacaacacgtcaattctcatcatcaaatcatgattaatg-actcccaagccatgaatcattaacaacaatgtca 53400  T
439 cttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcatttt 538  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| || |||| | || ||| ||| || || |   ||||||||| |||||   ||||||| ||  ||    
53401 cttagcaacaacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcataattcaacatataacacctt 53500  T
539 catatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccat 638  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||| || | ||| ||||||||  ||||| ||  ||||| | |||||||| |     
53501 cacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaac 53600  T
639 catgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttacctt 737  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
53601 tatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 53698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 342 - 686
Target Start/End: Original strand, 85490 - 85834
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||  ||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||    
85490 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacctatttttcatcaacaaaccatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctct 85589  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    ||||| |||  | |||| || ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |  | | || ||| ||||| | || |||||||||||||    
85590 tagcaacaacaatatcacttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcattaatttgagcataat-tcacaatatatcattttc 85688  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc 639  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||  ||||||| |||  ||| |      
85689 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaact 85787  T
640 atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaa 686  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
85788 atgaacaattaatcacttattcaattaagcatttaaacatacaacaa 85834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 542 - 810
Target Start/End: Original strand, 452 - 721
Alignment:
542 atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcat 641  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||   || ||| ||| |||| | | |    
452 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattataggacgaattataacaa-ctt 550  T
642 gaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || |    
551 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattcaattctaacccccttaccataat 650  T
741 tagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaagttc 810  Q
    ||   | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||    
651 tatcactaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttctagttc 721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 312 - 468
Target Start/End: Original strand, 238 - 393
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    |||||| |||| | ||||||||| || |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
238 aacatggaaaccaatgacatttgcaccaattca-cccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcaccca 336  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatga 468  Q
    ||  |||||| ||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
337 aggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatga 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 544 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 22516 - 22281
Alignment:
544 actttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atg 642  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||| || |  ||||||| ||| |||| ||| |||    
22516 actttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaac-atctatg 22418  T
643 aacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 742  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||| || |||||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22417 aacaatcaatcaatcatccaattaatcacttattcatacaataattaaaaaataacactaaaa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 22319  T
743 gatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
22318 gattaattccctacctcaagcttcactttagctcctag 22281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22681 - 22594
Alignment:
368 aacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacat 455  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
22681 aacaactcatttttcatcgccaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaacatcacttagcaacaaaaacat 22594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 600 - 780
Target Start/End: Original strand, 8021 - 8200
Alignment:
600 caaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttaca 699  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||    
8021 caaacataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgtaaaattgca 8120  T
700 ctaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
      | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
8121 --ataaatgattacgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctagcttaagcttcaatttagctcctag 8200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 462
Target Start/End: Original strand, 7812 - 7912
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattg 461  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
7812 accaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 7911  T
462 a 462  Q
    |    
7912 a 7912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 368 - 739
Target Start/End: Original strand, 7994 - 8364
Alignment:
368 aacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatg 467  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
7994 aacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatg 8093  T
468 aatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacata---tatcattttcatatactttgatcattcaatttcac 564  Q
      ||||| |||||||  ||| ||||||| || || |   |   | ||| |||| ||  ||||   || || ||  | ||||||||| ||| ||| |||||    
8094 gttctcatcataattccacaacaacatagcataattcacccaattgagcataa-at--cataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattcac 8190  T
565 caacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaa 663  Q
    |||||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||| |  ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||  |||    
8191 caacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaac-atctatgaacaattaatcatttatccaa 8289  T
664 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttag 739  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
8290 ttaatcacttattcatacaataattgaaaaattaca-ttaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 8364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 661 - 739
Target Start/End: Original strand, 11153 - 11230
Alignment:
661 caattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttag 739  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
11153 caattaatcacttattcatacaataattgaaaaattacattaaaa-tgattatgatgacttctaacccccttaccttag 11230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 316 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 9197 - 8701
Alignment:
316 tgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtt 415  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |   |||||  ||  |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| |||      
9197 tgaaaacaattgacattgggaccaattcaccaatttttatcaaaccaccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagcc 9098  T
416 atgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagag 515  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || | || ||||||||| ||||||| || || |   |   | |||    
9097 atgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 8998  T
516 sataatatga-catatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcat 614  Q
     ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||  || ||||| || | |||||||   || ||| ||||| |||||||   |||||    
8997 cata-tatcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcat 8899  T
615 aataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaatta-ctcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattat 713  Q
    |||  ||||||| |||  | |  | ||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||| |||||| |||||    
8898 aattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattttcccaattaagcacttattcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattat 8801  T
714 gatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcct 812  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| |||  |||||| | ||||| |   |||||| |||||||||||||    
8800 gatgaactctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcattttttctccta-gctctcttccaatcttgattcttcaagttcct 8702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 5516 - 5408
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  |||||||||    
5516 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 5417  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
5416 gatcatgaa 5408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 5172 - 5101
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
5172 attatgatgaattctaacccccttaccttag-tagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 5101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 580 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 89915 - 89717
Alignment:
580 tatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattca 678  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
89915 tatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt-taac-atctatgaacaattaatcaattatccaattaatcacttattca 89818  T
679 tacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcc 777  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| |||||||||    
89817 tacaataattgaaaatt-acactaaaaaga-ttatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcc 89720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 90111 - 90037
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatca 438  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
90111 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaacatca 90037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 546 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 22507 - 22246
Alignment:
546 tttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaac 645  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||| |  ||||||| ||| |||| |  ||||||    
22507 tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaac 22408  T
646 aattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaga 744  Q
    ||||| ||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
22407 aattattcacttattctattaagcatttattaatacaacaaatgagaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttag- 22311  T
745 tcaatt--tcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctct-cctcttcttgaatcttcaag 807  Q
     || ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
22310 -cagttaatcctagcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaag 22246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22712 - 22552
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | | ||| ||||||||  |||||||  |||| ||||| |||| |    
22712 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcataattcatgaacacccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaat 22613  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaa 501  Q
    || || |||  ||||||||| ||||||| || || |  |||| |||| ||||||| |||||    
22612 taacaacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaa 22552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 544 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 70393 - 70158
Alignment:
544 actttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atg 642  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| ||||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||| | |||| ||| ||| | | |||| |||    
70393 actttgaacatgcaaattcac-aacaataattgaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaatttttaacatctatg 70295  T
643 aacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 742  Q
    ||||||||||||||||  || |||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
70294 aacaattaatcaattatacatttaatcacttattcatacaataattgaaaattt-cac-aaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 70197  T
743 gatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||| |||   ||||||| |||||||| ||| ||||||||    
70196 gattaatccccctagcttaagcttcatttttgctcctag 70158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 70569 - 70439
Alignment:
368 aacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatg 467  Q
    |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
70569 aacaacccatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatg 70470  T
468 aatctcagcataatttaacatcaacataaca 498  Q
       |||| ||||||| |||| ||| ||||||    
70469 gtcctcatcataattcaacaacaatataaca 70439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 542 - 780
Target Start/End: Original strand, 10820 - 11056
Alignment:
542 atactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcata-ataggagcacggattctaaccatc- 639  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| || |||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||| |||| |||     
10820 atactttgaacatgcaaattctccgacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatag-agcacgaattataac-atct 10917  T
640 atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttag 739  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
10918 atgaacaattaattatttatccaattaatcacttattcatacaataattgaaaatt-atactaaaa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttag 11015  T
740 ttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||| |||   ||||||| ||||||||||| ||||||||    
11016 ttagattaatcctctagctctagcttcacttttgctcctag 11056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 482
Target Start/End: Original strand, 10642 - 10760
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
10642 caacaacaattcatttttcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattgaa 10741  T
464 catgaatctcagcataatt 482  Q
    ||||  ||||| |||||||    
10742 catggttctcatcataatt 10760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 739
Target Start/End: Original strand, 79519 - 79892
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||| || || ||||||||||| |||  ||||||||||||    
79519 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 79618  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtc-atttagagsataatatgacatat-atcattttcatatactttgatcattcaattt 561  Q
    ||||  || || ||||||| |||| ||||||| || || |   | | ||| || ||||| | |||  | | || || || |||||| || ||| ||||||    
79619 catggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaatta-agcataat-tcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaattt 79716  T
562 caccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatc-atgaacaattaatcaattact 660  Q
    ||||| ||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||| |  | ||||| ||| || | ||| ||||||||||||||| |||      
79717 caccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagc-atctatgaacaattaatcatttatc 79815  T
661 caattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttag 739  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
79816 caattaatcacttattcatacaataattgaaaaattacact-aaaataattatgatgaattctaa-ccccttaccttag 79892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 640 - 813
Target Start/End: Original strand, 11944 - 12117
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
11944 atgaacaattaatcaattgacccaattaagcacttattcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttacctta 12041  T
739 gttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    ||||||| ||| | ||||||| | |||||| |||| ||||||| |  |||||  | ||||| ||||||||||||||    
12042 gttagattaatctccctagcttaggcttcaatttaactcctagctcttctccaatccttgattcttcaagttcctc 12117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 646 - 780
Target Start/End: Original strand, 16162 - 16296
Alignment:
646 aattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttaga 744  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16162 aattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaga 16259  T
745 tcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    | ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||    
16260 ttaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctag 16296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 646 - 780
Target Start/End: Original strand, 25693 - 25827
Alignment:
646 aattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttaga 744  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25693 aattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaga 25790  T
745 tcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    | ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||    
25791 ttaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctag 25827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 469
Target Start/End: Original strand, 11615 - 11772
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |   |||||  ||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| | |||    
11615 aacatgaaaacaattgacatttggaccaattcaccaatttttatcaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataacca 11714  T
412 agttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    ||  |||||||||||  |||||| |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
11715 agccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaa 11772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 132520 - 132412
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||| || |||  |||||||||    
132520 caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 132421  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
132420 gatcatgaa 132412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 709 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 132173 - 132139
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
132173 attatgatgaattccaacccccttaccttagttag 132139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 615
Target Start/End: Original strand, 21979 - 22230
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| || ||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
21979 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacatacccaagctgtgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 22078  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||||| | ||| |   ||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
22079 catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcccaattcaacatttagagcacaat-tcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttc 22177  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcata 615  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||    
22178 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatatactcaaacataacatcata 22230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 364 - 635
Target Start/End: Original strand, 29944 - 30215
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |  ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
29944 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacgtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcgcttaacaacaacaacatcaattaaa 30043  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||  |||||| ||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
30044 catgattctcatcacaattcaacaaaaacatagcacaattcaacaattagagcaaaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 30142  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaac 635  Q
    ||| |||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  |||||| || ||||||| ||| ||||    
30143 acctacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagtaagagcacgaattttaac 30215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 780
Target Start/End: Original strand, 31169 - 31604
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||    
31169 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactt 31268  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatat-gacatatatcattttca 540  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||| || | || |||| | || |||||||  | || ||  || || ||| ||| | |  ||||||| |||||||     
31269 agcaacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaatt-gagcatattttcaacatataccattttct 31367  T
541 tatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatca 640  Q
     ||||||||| |||| ||||  || ||||| ||   ||||||||  || ||| ||||| |||||||   ||||||||  || || | |||  | |  | |    
31368 catactttgaacatttaattcaactaacaacaatccaattatca-taacttcatacatccaaacatgtcatcataattagatcatgaatttcatcattta 31466  T
641 tgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttag 739  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| || ||||||||| ||||||||| || |   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
31467 tgaacaattaatcaattcgcccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 31562  T
740 ttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
31563 ttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctag 31604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 342 - 458
Target Start/End: Original strand, 21470 - 21586
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||    
21470 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactt 21569  T
442 agcagcaaacacatcaa 458  Q
    |||| |||  |||||||    
21570 agcaacaacaacatcaa 21586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 47540 - 47402
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatta-ctcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||| || ||||||||| ||||||||| || || |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
47540 atgaacaattaatcaattcgcccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacctta 47445  T
739 gttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
47444 gttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctag 47402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Original strand, 21767 - 21867
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatta-ctcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||  || ||||||||| ||||||||| || || |||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
21767 atgaacaattaatcaattcgcccaattaagccttt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattataacccccttacctta 21862  T
739 gttag 743  Q
    |||||    
21863 gttag 21867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 7965 - 7714
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||  || |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||    
7965 tcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctct 7866  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||  ||||||||| ||||||| ||||| || || | |||| ||||||| ||||| |   || |||||| | ||| | || |||||||||||||    
7865 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaat-tcacaatatatcattttc 7767  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
7766 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 7714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 592
Target Start/End: Original strand, 86314 - 86565
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||    
86314 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttacttcacatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctct 86413  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    || || |||| ||||||||| ||||||| | ||| || |||| |||   |||||| ||||| |   ||||||||| | ||| | || ||||| |||||||    
86414 taacaacaaaaacatcaattaaacatgattatcatcacaattgaactataacatagcacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatataacattttc 86512  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
86513 acatactatgaacatccaatttcaccaacaaaaattcaattatcacaaatttc 86565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 364 - 625
Target Start/End: Original strand, 27477 - 27738
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||   |||||||| ||    
27477 caacaacaactcatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacatcatcaattaaa 27576  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||| || |||| |||| ||| ||| ||||| |   ||||||| | | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||    
27577 catgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagggcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgaaatttc 27675  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcac 625  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||||| | ||||||    
27676 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcac 27738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Original strand, 4585 - 4999
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||| |||  |||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| |   |||| || |||  ||||||||| ||    
4585 caacaacaacttatttttcatcatcaaatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaa 4684  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| || || || |||| |||| ||||||||||||| |   ||||||||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
4685 catgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 4783  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaattactca 662  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  | ||||||   | |||| |||  ||| |  |||||||| |||||| ||| |||    
4784 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcagttattca 4882  T
663 attaagcaattattcatacaacaattgaaaattta-cactaaaaataattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctca 760  Q
    | |||| | ||| |||| |||  | |||||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||| ||    
4883 actaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaa-atcctagccca 4979  T
761 agcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
4980 agcttcaatttagatcctag 4999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 590
Target Start/End: Original strand, 6501 - 6750
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||||| ||||| ||| ||    
6501 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacctaagccatgaatcatcaacaacaatatctct 6600  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    ||||| |||   |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |   || || ||| ||||  | || |||||||||||||    
6601 tagcaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagtataa-ctcacaatatatcattttc 6699  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatt 590  Q
    | ||||| ||| ||| |||||||||||| || || | ||||||||||||||    
6700 acatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatt 6750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 649 - 780
Target Start/End: Original strand, 372 - 500
Alignment:
649 taatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaa 748  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||   | |    
372 taatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaact-acactaaa--tgattacaatgaattctaacccccttacctcagttatcacca 468  T
749 tttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
469 attcctagctcaagcttcactttagctcctag 500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 649 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 1490 - 1362
Alignment:
649 taatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaa 748  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| | |||   | |    
1490 taatcatttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaact-acactaaa--tgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcacca 1394  T
749 tttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||    
1393 attcctagctcaagcttcactttagttcctag 1362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 527 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 1066 - 818
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||||||  || ||||    
1066 atatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacg 967  T
627 gattctaaccatcatgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaataattatga-tgaattcta 724  Q
     ||| |||| |  |||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || | ||||||| |||| ||||    
966 aattttaacaactatgaacaaataatcacttatttaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaaatcta 869  T
725 acccccttaccttagttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctc 776  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
868 acccccttaccttagttaga-aaaaatcctagcccaagcttcaatttagctc 818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1213 - 1109
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |||  ||||||||| ||    
1213 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttagcaacaacaacatcaattaaa 1114  T
464 catga 468  Q
    |||||    
1113 catga 1109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 364 - 780
Target Start/End: Original strand, 3232 - 3647
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
3232 caacaacaacttatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 3331  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgaca-tatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| | ||| || |||| |||| ||||||| ||||| |   || ||||||   ||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
3332 catgatt-tcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcccaat-tcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 3429  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaat-taatcaattactc 661  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||||| | | ||||| |||  ||| |  |||| |||  |||||| ||| ||    
3430 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagcgcacgaatttcaacaactatgagcaaaataatcacttattc 3529  T
662 aattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttaca-ctaaaaataattatgat-gaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagctc 759  Q
    ||||||||| |||  |||  ||  |  ||||| ||||| ||||   | |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||| |    
3530 aattaagcacttaagcatgaaattagggaaaaattacaactaat--tgattatgattgaattctaacccccttgccttaattagctcaaat-cctagccc 3626  T
760 aagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||| |||||||    
3627 aagcttcactttaactcctag 3647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 5669 - 5567
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttag 739  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
5669 atgaacaattaatcacttattcaattaagcacttattcatataataattgaaaaattacact-aaaatgattatcatgaattataacccccttatcttag 5571  T
740 ttag 743  Q
    ||||    
5570 ttag 5567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 364 - 592
Target Start/End: Original strand, 37538 - 37766
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||  ||||||||| ||    
37538 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 37637  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttcatatactttgatcattcaatttc 562  Q
    ||||| ||||  |  |||| ||||  |||||| ||||| |   ||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
37638 catgattctcgtctcaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaat-tcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttc 37736  T
563 accaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||| || | |||| |||||||||||    
37737 accaacaacaattcaattttcaccaatttc 37766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 846 - 464
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  |||||||||    
846 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 747  T
461 gaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatat-gacatatatcattttcatatactttgatcattcaat 559  Q
    || |||||| || | || |||| | || ||||||| || || |   ||  | ||| ||| | |  ||||||| |||||||  ||||||||| |||  |||    
746 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaat-gagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaat 648  T
560 ttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaatt-a 658  Q
    |  |  ||||| || |  ||||||   |||||| ||||| |||||||   ||||||||  ||||||| |||  | |  | |||||||||||||||||| |    
647 tcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 548  T
659 ctcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 745  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  ||  | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
547 cccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaatagca--ataaatga-tatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 362 - 780
Target Start/End: Original strand, 33640 - 34057
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||| ||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
33640 accaacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg 33739  T
462 aacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatat-gacatatatcattttcatatactttgatcattcaatt 560  Q
    | |||||| || | || |||| | || ||||||| || || |   || ||| |  ||||| |  ||||||| || ||||  ||||||||| |||  ||||    
33740 atcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattcaccaatta-aacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaatt 33838  T
561 tcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaatt-ac 659  Q
      || ||||| || | |||||||   || ||| ||||| |||||||   ||||||||  ||||||| |||  | |  | | |||||||||||||||| |     
33839 caactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaattaatcaattcat 33938  T
660 tcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagct 758  Q
     |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
33939 ccaattaagcacttaatcatacagtaattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaatccccttaccttagttagattaatctccctagct 34035  T
759 caagcttcactttagctcctag 780  Q
     | |||||| ||||||||||||    
34036 taggcttcaatttagctcctag 34057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 469
Target Start/End: Original strand, 3258 - 3384
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| || |    
3258 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat 3356  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    | || |||  ||||||||||| ||||||    
3357 atcaacaacaacatcaattgatcatgaa 3384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 495
Target Start/End: Original strand, 4543 - 4674
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
4543 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 4642  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
     |||||| | | || |||| |||| |||||||    
4643 aatgaatattatcacaattaaacaacaacata 4674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 495
Target Start/End: Original strand, 9157 - 9288
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
9157 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 9256  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
     |||||| | | || |||| |||| |||||||    
9257 aatgaatattatcacaattaaacaacaacata 9288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Original strand, 4884 - 4915
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
4884 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 4915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Original strand, 9498 - 9529
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9498 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 9529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 458
Target Start/End: Original strand, 8915 - 9061
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| || ||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||    
8915 aacatgaaaacaattgacatttggaccaattca-ccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaaccc 9013  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaa 458  Q
    |||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  |||||||    
9014 aagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaa 9061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 813
Target Start/End: Original strand, 9243 - 9415
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaat-ttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  || || |||   | |||||||| ||||||||||||||||||||    
9243 atgaaaaattaatcaattcactcaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaaattgcaataa---tgattatgataaattctaacccccttacctt 9338  T
738 agttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 813  Q
    |||||||| ||| | ||||||| |  ||||| ||| |||||||| |   | ||  ||||||| ||||||||||||||    
9339 agttagattaatctccctagcttagacttcaattttgctcctagctcaaccccaattcttgattcttcaagttcctc 9415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 777
Target Start/End: Original strand, 159230 - 159691
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| || ||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
159230 aacatgaaaacaattgacattaggaccaattca-ccaattttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataccc 159328  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatt 510  Q
    |||  |  ||||||||    ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || | || |||| |||||||||||| || || |   |       
159329 aagccaaaaattatcat---caacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaa 159425  T
511 tagagsataatatgacat-atatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaa 609  Q
    | ||| ||||| | |  | |||||||||||  ||||||||| |||  ||||  || ||||| ||    ||||||   || ||| ||||| |||||||       
159426 ttgagcataatttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtc 159525  T
610 atcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaata 708  Q
    ||||||||  ||||||| |||  | |  | |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| || || |||   |     
159526 atcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcgtacaataattgaaaaattgcaataa---tg 159621  T
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcc 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| |||||    
159622 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcc 159691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 85309 - 85417
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  |||||||||    
85309 caccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 85408  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
85409 gatcatgaa 85417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 643 - 810
Target Start/End: Original strand, 85591 - 85755
Alignment:
643 aacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 741  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||||||| || || |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
85591 aacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagta 85686  T
742 agatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttc 810  Q
    |||| ||| | ||||||| |  ||||| ||| |||||| | || ||||| || ||||| |||||||||||    
85687 agattaatctccctagcttagacttcaattttgctccttgctt-tctccactccttgattcttcaagttc 85755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 470
Target Start/End: Original strand, 5920 - 6026
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
5920 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 6019  T
464 catgaat 470  Q
    |||||||    
6020 catgaat 6026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 709 - 811
Target Start/End: Original strand, 12592 - 12695
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctaggt-tctctcctcttcttgaatcttcaa 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| |||  ||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||    
12592 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttctcctaggtctct-tccactccttgattcttcaa 12690  T
807 gttcc 811  Q
    |||||    
12691 gttcc 12695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 640 - 780
Target Start/End: Original strand, 2172 - 2310
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||||||| || || |||   | |||||||||||||||||||||||||| |||    
2172 atgagcaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttacttta 2267  T
739 gttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||    
2268 gttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctag 2310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 472
Target Start/End: Original strand, 1846 - 2004
Alignment:
314 catgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaa 412  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| || ||  ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||    
1846 catgaaaacaattgacattaggaccaattca-ccaattttcaccaaaccactaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaa 1944  T
413 gttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatct 472  Q
    |  | |||||||||  | |||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||    
1945 gccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatct 2004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 460
Target Start/End: Original strand, 5937 - 6033
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
5937 caacaacaactcatttttcatcgccaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaacatcacttagcaacaaaaacattaatt 6033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 747 - 780
Target Start/End: Original strand, 6030 - 6063
Alignment:
747 aatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
6030 aattccctagctcaagcttcactttagctcctag 6063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 4918 - 5026
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  |||||||||    
4918 caccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 5017  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
5018 gatcatgaa 5026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 109732 - 109624
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  |||||||||    
109732 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 109633  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
109632 gatcatgaa 109624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 118233 - 118125
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||||||| |    
118233 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaact 118134  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
118133 gatcatgaa 118125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 109385 - 109349
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
109385 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 109349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 117886 - 117850
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
117886 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagat 117850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 469
Target Start/End: Original strand, 103 - 229
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| || |    
103 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat 201  T
442 agcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    | || |||  ||||||||||| ||||||    
202 atcaacaacaacatcaattgatcatgaa 229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 617
Target Start/End: Original strand, 7359 - 7635
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||   |||||||  |||||| || |  ||||| ||| ||    
7359 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctct 7458  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    ||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| || |||| ||||| |   |||||| || | ||| | || |||||||||||||    
7459 tagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagcatagcacaattcaacatttatagcacaat-tcacaatatatcattttc 7557  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataat 617  Q
    | ||||| |||  || ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||| |  || ||||||||  ||||||||    
7558 acatactatgagaatgcaatttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataat 7635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 617
Target Start/End: Original strand, 16784 - 17060
Alignment:
342 tcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcact 440  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||   |||||||  |||||| || |  ||||| ||| ||    
16784 tcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctct 16883  T
441 tagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgac-atatatcattttc 539  Q
    ||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| || |||| ||||| |   |||||| || | ||| | || |||||||||||||    
16884 tagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagcatagcacaattcaacatttatagcacaat-tcacaatatatcattttc 16982  T
540 atatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataat 617  Q
    | ||||| |||  || ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||| |  || ||||||||  ||||||||    
16983 acatactatgagaatgcaatttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataat 17060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 495
Target Start/End: Original strand, 46145 - 46276
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||  ||||| |||||     
46145 caacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgat 46244  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    |||||| || | || ||||||||| |||||||    
46245 catgaaacttatcacaatttaacaacaacata 46276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 743
Target Start/End: Original strand, 40915 - 41015
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 738  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||    | | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
40915 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcact-attcatacaataattaaaaattg---caataaatgattatgatgaattataacccccttacctta 41010  T
739 gttag 743  Q
    |||||    
41011 gttag 41015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 469
Target Start/End: Original strand, 40662 - 40743
Alignment:
388 caaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||    
40662 caaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaa 40743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Original strand, 79844 - 79906
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatca 426  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
79844 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatca 79906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 837 - 680
Alignment:
312 aacatgaaaacaattgacatttgaacaaattcaacccatttt-acaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacaccc 410  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||| | || ||||| || ||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||    
837 aacatgaaaacacttgacattagaaccaattta-ccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaaccc 739  T
411 aagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaa 469  Q
    |||  |||||||||||  |||||||| |||||| | |||  ||||||||||| ||||||    
738 aagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaacaacaacatcaattgatcatgaa 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 471
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19294
Alignment:
382 catcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatc 471  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||  |||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
19206 catcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatc 19294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 471
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21378
Alignment:
382 catcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatc 471  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||  |||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
21290 catcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatc 21378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 495
Target Start/End: Original strand, 7151 - 7283
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacat-caattga 462  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||    
7151 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccaattga 7250  T
463 acatgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    | |||||| | | || |||| |||| |||||||    
7251 aaatgaatattatcacaattaaacaacaacata 7283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Original strand, 7493 - 7524
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
7493 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 7524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 402 - 283
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactt 441  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| || |    
402 tcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacat 304  T
442 agcagcaaacacatcaattga 462  Q
    | || |||  |||||||||||    
303 atcaacaacaacatcaattga 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 361 - 754
Target Start/End: Original strand, 9914 - 10305
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||  |||||||| || || || |||  |||||||||    
9914 caccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 10013  T
461 gaacatgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatga-catatatcattttcatatactttgatcattcaat 559  Q
    || |||||| || | || |||| |||| ||||| | || || |   || || ||| ||| | | | |||||| | ||||||||  |||||| |||  |||    
10014 gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatacccttttcatactctttgaacatgtaat 10112  T
560 ttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacggattctaaccatcatgaacaattaatcaatt-a 658  Q
    |  || ||||| || | |||||||   || ||| ||||| |||||||   ||||||||  ||||||| ||| || |  | |||||||||||||||||| |    
10113 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattca 10212  T
659 ctcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcct 754  Q
    | |||||||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
10213 cccaattaagcactt-ttcatacaaagaattgaaaatttgcaataa---tgattattatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctcct 10305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 779
Target Start/End: Original strand, 61062 - 61201
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  ||||||||| || || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
61062 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataag--tgattatgatgaattctaacccccttacctt 61158  T
738 agttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctccta 779  Q
    |||||  | |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
61159 agttaagttaatttctctagcttaagcttcaattttgctccta 61201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 70892 - 70817
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||    
70892 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacat 70817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 60784 - 60891
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| || || || |||  |||||||||    
60784 caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 60882  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
60883 gatcatgaa 60891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 436
Target Start/End: Original strand, 24918 - 25010
Alignment:
342 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
24918 tcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacat 25010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 147531 - 147612
Alignment:
362 accaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttag 443  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||    
147531 accaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 147612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 38275 - 38383
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | || |||  || ||||||    
38275 caccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacgtcaatt 38374  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
38375 gatcatgaa 38383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Original strand, 38621 - 38693
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
38621 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctag 38693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 626
Target Start/End: Original strand, 107991 - 108251
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||| || |||  ||||||||| ||    
107991 caacaacaacttatttctcatcaa-aattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatcttaacaacaacaacatcaattaaa 108089  T
464 catgaatctcagcataatttaacatcaacataacacaaattgtcatttagagsataatatgacatatatcattttcatatactttgatcattcaatttca 563  Q
    |||||   ||| || |||| ||||  |||| | || || |   ||||||||| |||||     ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||    
108090 catgatcttcatcacaattcaacaataaca-agcataattcaacatttagagcataattcataatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca 108188  T
564 ccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||| | |||||||    
108189 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacg 108251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 360 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 984
Alignment:
360 tcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaat 459  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| || || || |||  ||| ||||    
1093 tcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacaacaat 994  T
460 tgaacatgaa 469  Q
    ||| ||||||    
993 tgatcatgaa 984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 813 - 715
Alignment:
640 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
813 atgaacaatcaatcaattcactcaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 7118 - 7043
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
7118 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 7043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24467 - 24362
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| || ||||| |||  ||| |||||    
24467 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaacaacaatt 24368  T
461 gaacat 466  Q
     |||||    
24367 caacat 24362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 527 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 68001 - 67936
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
68001 atatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc 67936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 445
Target Start/End: Original strand, 1358 - 1442
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagca 445  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||  |||||||| || |||||    
1358 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgacatagca 1442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Original strand, 7826 - 7924
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
7826 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctt 7921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 493
Target Start/End: Original strand, 7581 - 7678
Alignment:
396 gaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaaca 493  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||| || |||  ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || |||||    
7581 gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaaca 7678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11730
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| || || || |||  |||| ||||    
11837 caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaatt 11739  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
11738 gatcatgaa 11730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 11493 - 11421
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
11493 attatgatgaattctaacccccataccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctag 11421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 24652 - 24580
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
24652 attatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttatgcttcaattttgctcctag 24580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 255084 - 254976
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||  |||||||| || || || |||  |||||||||    
255084 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 254985  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
254984 gatcatgaa 254976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 261690 - 261582
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||  |||||||| || || || |||  |||||||||    
261690 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 261591  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
261590 gatcatgaa 261582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16108 - 16005
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||| | |||||||| || ||| | ||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||    
16108 caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa 16009  T
464 catg 467  Q
    ||||    
16008 catg 16005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 3124 - 3021
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||| | ||||| || || ||| | ||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||    
3124 caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccatgtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa 3025  T
464 catg 467  Q
    ||||    
3024 catg 3021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 445
Target Start/End: Original strand, 5162 - 5243
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagca 445  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| | |||||||  |||||| | ||| ||||| ||||| |||||    
5162 caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacatagca 5243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 495
Target Start/End: Original strand, 13523 - 13618
Alignment:
400 tatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    |||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||    
13523 tatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacata 13618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 495
Target Start/End: Original strand, 41626 - 41760
Alignment:
361 caccaacaacaactcat-ttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaat 459  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||  |||| | ||||| |||||||||| ||| || |||  ||||||||    
41626 caccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaat 41724  T
460 tgaacatgaatctcagcataatttaacatcaacata 495  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||    
41725 tgaacatggttctcatcataattcaacaacaacata 41760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 1300 - 1402
Alignment:
367 caacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaacat 466  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||  |||||||| || || || |||  ||||||||||| |||    
1300 caacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcat 1399  T
467 gaa 469  Q
    |||    
1400 gaa 1402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Original strand, 1638 - 1710
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttc-ctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||    
1638 attatgatgaattctaacccccttgccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctag 1710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 11644 - 11546
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||   || | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
11644 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 11549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3387 - 3317
Alignment:
367 caacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatc 437  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
3387 caacaactcatttcacaataaaaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 709 - 743
Target Start/End: Original strand, 23014 - 23048
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23014 attatgatgaattctaacccccttaccttagttag 23048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 22668 - 22776
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  |||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||  | || |||  |||||||||    
22668 caccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaacaacatcaatt 22767  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
22768 gatcatgaa 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 445
Target Start/End: Original strand, 1574 - 1655
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagca 445  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| | |||||||  |||||| | ||| ||||| |||||||||||    
1574 caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 4591 - 4488
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||| | |||||| | || ||| | ||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||    
4591 caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaaatcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa 4492  T
464 catg 467  Q
    ||||    
4491 catg 4488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 11699 - 11596
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || | || | ||||||||||||||||||||||||| |||    
11699 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttagctt 11604  T
738 agttagat 745  Q
    ||||||||    
11603 agttagat 11596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 527 - 592
Target Start/End: Original strand, 8633 - 8698
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||    
8633 atatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttc 8698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 474
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1924
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||   ||||||||| ||    
1815 caacaacaacttatttcacatcatcaattcatgatttatg-acacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacatcaacatcaattaaa 1913  T
464 catgaatctca 474  Q
    ||||| |||||    
1914 catgattctca 1924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 426
Target Start/End: Original strand, 30068 - 30133
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatca 426  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
30068 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 30133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 253259 - 253178
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcactta 442  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||  |||||||| |||||    
253259 caccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgactta 253178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 3056 - 2959
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
3056 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 2962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Original strand, 4606 - 4677
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-ttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
4606 attatgatgaattctaacccccttaccttag-tagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctag 4677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 435
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4358
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaaca 435  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
4284 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaaca 4358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 527 - 635
Target Start/End: Original strand, 14179 - 14287
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacg 626  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||| | |||||||    
14179 atataccattttcacatactatgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacg 14278  T
627 gattctaac 635  Q
     ||| ||||    
14279 aattttaac 14287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 32180 - 32288
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| || | |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||| | || |||  ||| |||||    
32180 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 32279  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
32280 gatcatgaa 32288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 42123 - 42015
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaatt 460  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| || | |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||| | || |||  ||| |||||    
42123 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 42024  T
461 gaacatgaa 469  Q
    || ||||||    
42023 gatcatgaa 42015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 740
Target Start/End: Original strand, 15129 - 15226
Alignment:
640 atgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcataca-acaattgaaaatttacactaaaaataattatgatgaattctaacccccttacctt 737  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||   || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
15129 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacatataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 15223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Original strand, 14194 - 14269
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| |  |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
14194 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 14269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Original strand, 14854 - 14929
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| |  |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
14854 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 14929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 740
Target Start/End: Original strand, 8670 - 8701
Alignment:
709 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
8670 attatgatgaattctaacccccttaccttagt 8701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 738 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 2016 - 1974
Alignment:
738 agttagatcaatttcctagctcaagcttcactttagctcctag 780  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
2016 agttagattaattccctagctcaagcttcaatttagctcctag 1974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 413
Target Start/End: Original strand, 1655 - 1704
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaag 413  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
1655 caacaacatctcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaag 1704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6361 - 6308
Alignment:
361 caccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagt 414  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
6361 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagt 6308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10241 - 10136
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||   | ||||||||||| || |||  ||||| |||||     
10241 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat 10142  T
464 catgaa 469  Q
    ||||||    
10141 catgaa 10136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 469
Target Start/End: Original strand, 1 - 106
Alignment:
364 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagttatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 463  Q
    |||||||||  |||||| || |||||||| |||||  ||||| |||||||  |||||||||||  ||||| || || ||||| |||  |||||||||||     
1 caacaacaatccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgat 100  T
464 catgaa 469  Q
    ||||||    
101 catgaa 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 592
Target Start/End: Original strand, 25489 - 25554
Alignment:
527 atatatcattttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaaaaaattaattatcaccaatttc 592  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||    
25489 atatatcattttcacatactatgaacaggcaatttcaccaacaacaattcaattttcaccaatttc 25554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University