View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13510_high_1 (Length: 675)

Name: NF13510_high_1
Description: NF13510
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13510_high_1
NF13510_high_1
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (17-668)||(8575987-8576638)
chr7 (17-658)||(8569982-8570623)
chr7 (17-658)||(8545304-8545944)
chr7 (17-658)||(8581371-8582012)
chr7 (52-668)||(8609578-8610194)
chr7 (19-658)||(8382734-8383373)
chr7 (25-668)||(8537697-8538340)
chr7 (17-560)||(8559097-8559645)
chr7 (28-658)||(29581708-29582338)
chr7 (19-579)||(8601724-8602284)
chr7 (25-658)||(29577533-29578169)
chr7 (25-658)||(17267610-17268243)
chr7 (121-658)||(17259912-17260449)
chr7 (130-658)||(8590309-8590837)
chr7 (19-358)||(10494232-10494571)
chr7 (436-658)||(6789183-6789405)
chr7 (121-658)||(27830835-27831372)
chr7 (25-358)||(8667390-8667723)
chr7 (322-658)||(7877894-7878230)
chr7 (533-656)||(8636715-8636838)
chr7 (19-362)||(8659330-8659673)
chr7 (19-358)||(13333314-13333653)
chr7 (19-358)||(8654421-8654760)
chr7 (19-257)||(8636201-8636439)
chr7 (19-362)||(1301427-1301774)
chr7 (25-265)||(8646941-8647181)
chr7 (442-579)||(8616431-8616568)
chr7 (19-578)||(8585564-8586123)
chr7 (19-357)||(6789484-6789822)
chr7 (507-656)||(8646550-8646699)
chr7 (121-346)||(3147247-3147472)
chr7 (19-252)||(8628609-8628842)
chr7 (19-99)||(7877591-7877671)
chr7 (599-658)||(10494812-10494871)
chr7 (536-658)||(3146935-3147057)
chr7 (508-658)||(8102338-8102488)
chr7 (600-658)||(8667090-8667148)
chr7 (25-99)||(8671494-8671568)
chr7 (622-652)||(27846567-27846597)
chr7 (55-164)||(6786816-6786925)
chr7 (622-658)||(8659034-8659070)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (25-658)||(12528175-12528808)
chr8 (442-651)||(43744494-43744703)
chr8 (19-165)||(43745013-43745159)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (23-656)||(12245268-12245901)
chr2 (19-656)||(7541899-7542536)
chr2 (121-656)||(14703081-14703616)
chr2 (19-656)||(11999081-11999704)
chr2 (409-658)||(43625083-43625332)
chr2 (481-652)||(12258901-12259072)
chr2 (48-362)||(16661879-16662193)
chr2 (19-362)||(16657375-16657718)
chr2 (437-655)||(12234364-12234581)
chr2 (50-243)||(43625498-43625691)
chr2 (37-255)||(12258457-12258675)
chr2 (601-656)||(16662432-16662487)
chr2 (508-561)||(17706060-17706113)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (118-658)||(15594705-15595245)
chr1 (25-655)||(34466657-34467282)
chr1 (119-658)||(4678516-4679054)
chr1 (437-485)||(52549288-52549336)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (19-656)||(35132129-35132758)
chr4 (508-656)||(23596932-23597080)
chr4 (412-579)||(30775002-30775169)
chr4 (25-254)||(9335755-9335984)
chr4 (19-362)||(30775219-30775562)
chr4 (535-658)||(9336265-9336388)
chr4 (508-656)||(23588080-23588228)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (607-658)||(28219589-28219640)
chr5 (119-165)||(28220115-28220161)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (202-255)||(11133068-11133121)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 616; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 616; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8576638 - 8575987
Alignment:
17 caggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8576638 caggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataa 8576539  T
117 gagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagac 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8576538 aagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagac 8576439  T
217 actcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaag 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8576438 actcacctaggaggccaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaag 8576339  T
317 ccttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattga 416  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8576338 ccttaaggaggttgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatatgacactgatgccacaattgaactagatgctatatataaaggtattga 8576239  T
417 cttctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaag 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8576238 cttctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaag 8576139  T
517 atggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaat 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
8576138 atggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggaggttttcaaggggaaggaat 8576039  T
617 tatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtgatgatgtcca 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
8576038 tatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtgctgttgtcca 8575987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 8570623 - 8569982
Alignment:
17 caggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataa 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
8570623 caggtgaaattgctggtctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattttgttgataa 8570524  T
117 gagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||||||||||||| ||||||    
8570523 gagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaaggataacaactatgaagtcaaggccactgctggagac 8570424  T
217 actcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaag 316  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||  |||  ||||||    
8570423 actcacctgggaggtgaagattttgataacagaatgttgactcactttgtgaagaagttcaagaagaagaacaacgaggatattagtaggaacccaaaag 8570324  T
317 ccttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattga 416  Q
    |||| |||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
8570323 ccttgaggaggttaagaacagcttgtgagagggcaaaaaggacactttcatatgatactgaggccacaattgagctagatgctatatataagggaattga 8570224  T
417 cttctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaag 516  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
8570223 cttcagttcatcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatggaaactgttaatagttgtcttgctgatgctaag 8570124  T
517 atggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaat 616  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
8570123 atggaaaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgaggcagctattacaagagtttttccaggggaaggaat 8570024  T
617 tatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
8570023 tatgcaacagcattaaccctgatgaggctgttgcttacggtg 8569982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 8545944 - 8545304
Alignment:
17 caggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataa 116  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
8545944 caggtgaaattgccggtctaaatgtcatgcggataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattg-gttgataa 8545846  T
117 gagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||    
8545845 gagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattcttacaattaaaaataaggtctttgatgtcaaggccactgctggagac 8545746  T
217 actcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaag 316  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||  |||  || |||    
8545745 acttacctaggcggtgaagactttgataacagaatggtgaattactttgtgaaggagttcaagaggaagaacaatgaggatattagtcggaacccagaag 8545646  T
317 ccttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattga 416  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
8545645 ccttgaggaggttgagaactgcctgtgagaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgacctagatgctttatatcaaggtattga 8545546  T
417 cttctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaag 516  Q
    ||| ||||| |  || || ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||||    
8545545 cttttgttcatgcatcactcgggccaagtttgagcaattgaatatggacctctttgaaaagtgtatggacactgttaattgttgtcttgttgatgctaag 8545446  T
517 atggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaat 616  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
8545445 atggacaagggtagtgtagatgatgttgtccttgttggcggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagttttttaaggggaaggaat 8545346  T
617 tatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
8545345 tatgcaagagcattaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 8545304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 8582012 - 8581371
Alignment:
17 caggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataa 116  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8582012 caggtgaaattgcaggtctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataa 8581913  T
117 gagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| ||||||    
8581912 gagaaatatttttatctttgaccttggaggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaataacgactatgaagtcaaggccactgctggagac 8581813  T
217 actcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaag 316  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||| ||  ||  | |||||||| |||| ||  ||| ||||||    
8581812 actcacctgggaggggaagattttgataacagaatggtgaatcactttgtgtcggagttcaagagaaaacataaagaggagattattggaaatccaaaag 8581713  T
317 ccttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattga 416  Q
    || | || ||| |||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
8581712 ccattagaaggttgaggactgcttgtgagagagcgaaaaggacactttcatatgacactgaggccacaattgacctagattctatacatcaaggtattga 8581613  T
417 cttctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaag 516  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||    
8581612 cttctattcgtcaataactcgggccaagtttgagcaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatggacactgttaatagttgtcttgccgatgctaag 8581513  T
517 atggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaat 616  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
8581512 atggacaggggtagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagtttttccaggggaaggaat 8581413  T
617 tatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8581412 tatgcaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 8581371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 52 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8610194 - 8609578
Alignment:
52 atcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaa 151  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
8610194 atcaatgaaccaacggctgcggctcttgcatatggtcttcagaagagagctaattgtgtggaaaatagaaatatttttatctttgatcttggtggtggga 8610095  T
152 cttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacctaggaggtcaagactttgataacataat 251  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||||||| ||| |||    
8610094 ctttcgatgtgtctgttctcacaattaaaaacaatgctttcgatgtcaaggctactgctggagatactcaccttggaggagaggactttgatcacagaat 8609995  T
252 ggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggca 351  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||  |  ||| |   | | ||||| |||| ||| || |  ||  | |||||| |||| ||||||||||| | ||||    
8609994 ggttaatcactttgtgaaggagttcaaaaggaagcattcaaaagatatcagtgggaactcgagggctcttaggaggttgaggactgcttgtgagagggca 8609895  T
352 aaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttctgttcctcaataacccgggccaagtttgagg 451  Q
    || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| | | |||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||     
8609894 aagaggacactttcatttgacacggaggccacaattgatattgatgctatatctgagggtattgatttttgttcatcaatcactcgtgcgaagtttgagc 8609795  T
452 aaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgt 551  Q
    || | || ||| |||||||||||||||||||| | || ||| | |  |||||| |||||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||    
8609794 aacttaacatggacctctttgaaaagtgtatggagacggttgaaagatgtcttactgatgctgaaatggataagaaaaccgtagatgatgttgttcttgt 8609695  T
552 tggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgct 651  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | || ||  ||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
8609694 tggaggttcttctaggattccgaaagtgaagcagctactgcaagactttttcaatggaaaggatttgtgtatgagcatcaaccctgatgaggcggttgct 8609595  T
652 tatggtgatgatgtcca 668  Q
    ||||||| || ||||||    
8609594 tatggtgctgctgtcca 8609578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 658
Target Start/End: Original strand, 8382734 - 8383373
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||    
8382734 ggtgcgattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgagccaactgccgctgctcttgcatatggccttcagaagagagctaattgtcttgaagaga 8382833  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||    
8382834 gaaatattttcatctttgatcttggtggtggaacttttgatgtgtctctcctcacaattaagaataatgtctttgttgtgaaggccactgccggagacac 8382933  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |  |||||||| | ||||||| ||  ||| | ||  |||| ||||||| |||  |||| ||     
8382934 tcatctaggaggtgaagacttagataacagaatcgtgaagtactttgttgacgagttcaagaggaagcataataaggacattagtgggaacccaaaggct 8383033  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgact 418  Q
     | || ||| | ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||  || | ||||||| | |||||  |||||||| | ||| | |||||||| |    
8383034 cttagaaggttaagaacggcttgcgagagggcaaaaaggacactttcatttgatattgaggccgcgattgacatagatgctctgtatgagggtattgatt 8383133  T
419 tctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagat 518  Q
    |   ||| ||| | || |||||||| |||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| | |  |||||| |||||||||||||    
8383134 ttaattcttcagtcactcgggccaaatttgagcaactcaatatggacctatttgaaaagtgtatggagactgttgagagctgtcttactgatgctaagat 8383233  T
519 ggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaatta 618  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||| ||  |  |||||||  |||||||  |     
8383234 gaacaagagtagtgtagatgatgttgttctcatcggtggttcttcgaggattcccaaagtgcaagagctattgcaacactttttcaattggaaggacctt 8383333  T
619 tgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    |||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
8383334 tgtgtgagcataaatcctgacgaggctgttgcttatggtg 8383373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8538340 - 8537697
Alignment:
25 attgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaata 124  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||      
8538340 attgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaacctacagctgctgctcttgcatacggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaaag 8538241  T
125 tttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacct 224  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| | ||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||    
8538240 ttttcatctttgatcttggtggtggaacttttgatgtatctctccttacattgaagaataatgcctttacagtcaaggccactgccggagatactcacct 8538141  T
225 aggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaagg 324  Q
     |||||  | |||||||||||     ||||| |||| ||||| || || || | ||  ||  ||||||  || |||||||  |||||||||||  | |||    
8538140 tggaggagaggactttgataatcggttggtgaatcattttgtgaatgaattgaagaggaaaaacaaagttgacattagtggaaattcaaaagctctgagg 8538041  T
325 aggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttctgtt 424  Q
    | | |||||||||| || || | |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| | | ||| |||| |||||||    
8538040 aagttgagaactgcatgcgagagggcaaaaaggtcgctttcttacgacactgaagccacaattgatatagatgctatatgtcagggtgttgatttctgtt 8537941  T
425 cctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaa 524  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| || | || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||     
8537940 catcaatcactcgggccaagtttgagcaactcaacatggacctctttgaaaagtgtatgaaaactgttaagagttgttttaatgatgctaagatggacag 8537841  T
525 gaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtg-agacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaa 623  Q
     | |||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| |||   ||  | ||  |  |||||| |||||||||  | | |||    
8537840 tagtagtatggatgatgttgtactagttggtggctcttctaggattcccaaagtgcaga-gtctgctgcaaaactttttcagggggaaggatatttttaa 8537742  T
624 gagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtgatgatgtcca 668  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
8537741 aagcatcaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgtcca 8537697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 8559645 - 8559097
Alignment:
17 caggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataa 116  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |    
8559645 caggtgaaattgctggtcttaatgtaatgcagataatcaatgaaccaactgcagctgctcttgcatatggacttcaaaagagatctaattgtgttaaaga 8559546  T
117 gagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagac 216  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
8559545 gagaaatattttcatctttgatctcggtggtggaacttttgatgtttctcttctcacaattaagaataatctctttgaagtcaaggccacttccggagac 8559446  T
217 actcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtac-----aaagaggatattagtgagaattc 311  Q
    || ||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||||   ||  ||| ||     ||||  || |||||||   |  |    
8559445 acacacctcggaggagaggactttgataacagaatggtgaaacactttgtaaaagagtttgagaggaagaacaaattaaagttgacattagtggtgaccc 8559346  T
312 aaaagccttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggt 411  Q
    |||| || | || ||| || | | | |||| |||| |||||||||   |||||| |||  |||| |||||||||||||  |||||||||||| | | ||     
8559345 aaaatccctgagaaggttgcggaattcttgcgaaagggcaaaaagagaactttcttacatcactaaggccacaattgacatagatgctatatgtcagggc 8559246  T
412 attgacttctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatg 511  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| | | ||  || | ||| ||||| ||||    
8559245 attgacttgtgttcatcaatcacacgggctaagtttgagcaactgaatatggatctctttgaaaagtgtatggagattgccaagagttgccttgcagatg 8559146  T
512 ctaagatggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttc 560  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
8559145 ctaagatggacaagaatagtgtcgatgatgtattccttgttggtggttc 8559097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 658
Target Start/End: Original strand, 29581708 - 29582338
Alignment:
28 gctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaatattt 127  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||  |||||||| ||| ||||| |||||  ||  ||||||| |    
29581708 gctggcctcaatgtaatgaggataatcaacgaaccaactgctgctgcacttgcatatggtattcaaaagggaggtaattttgttggaaaacgaaatatat 29581807  T
128 ttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacctagg 227  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| |  ||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
29581808 tcatctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtctcttctcacactcaaggatgataagtttgaagtgaaggccactgctggcgatactcacctagg 29581907  T
228 aggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaaggagg 327  Q
    |||  | ||||||||||||  ||||||| || ||||||  || ||||| | ||  ||| ||||   ||| ||||||| |||  ||||||| ||||||| |    
29581908 aggagaggactttgataaccgaatggtgaattactttgcgaatgagttgaagaggaagaacaatttggacattagtgggaacccaaaagctttaaggaag 29582007  T
328 ctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttctgttcct 427  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  ||||||| || | | |||||||||| ||||| ||      
29582008 ctgagaacagcttgtgagagggcaaagaggacactttcatttgacattgagaccacaattgacgtagatgccatttgtcaaggtattgatttctgctcac 29582107  T
428 caataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaagaa 527  Q
    || | || ||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||| | | ||||   | ||||||   ||||||||| |||| |||||     
29582108 cagttactcgggccaagtttgagcaaatcaacatcgacctctttgaaaaatgtatggagattgttgggagttgtctacgtgatgctaacatggtcaagag 29582207  T
528 tagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaagagc 627  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||   |||||||| || ||  |||||||||||||||| || || | ||||    
29582208 tagtgtagatgatatcgtccttattggtggctcttctagaattcccaaagtgcatcagctattgcaagaatttttcaaggggaaggatttgtgcatgagc 29582307  T
628 atcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
29582308 atcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 29582338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 8602284 - 8601724
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
8602284 ggtgccattgctggtctcaatgtaatgcggataatcaatgagccaactgcagctgctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagaga 8602185  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
8602184 gaaatattttcatatttgatcttggtggtggaacttttgatgtttctcttctcacaattaagaataatctctttgaagtcaaggccacttccggagacac 8602085  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
     ||||| |||||  | ||||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||  |  ||||| |   |||| ||||||| ||   | |  |      
8602084 acaccttggaggagaggactttgataaccgaatggtgaaccactttgttatggagttcaacaggaagtatatgaaggacattagtgggagcccgagggtg 8601985  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgact 418  Q
     | || ||| | ||||| || || || | | ||||||||||||||||||  || ||  | || ||||||||  ||||| |  ||| | | |||||||| |    
8601984 cttagaaggttaagaacggcctgcgagaggacaaaaaggacactttcatttgataccaatgcgacaattgacatagattccttatttgagggtattgatt 8601885  T
419 tctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagat 518  Q
    ||  ||| ||||| || ||||||||||||||| || | ||| || |||||||| | ||||||||  | |||||| | | |||||||  ||||||| ||||    
8601884 tccattcatcaatcactcgggccaagtttgagcaactcaatgtggacctctttaagaagtgtatagagactgttgaaagttgtcttagtgatgctcagat 8601785  T
519 ggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtg 579  Q
     || |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
8601784 cgaaaagagtagtgtggatgatgctgtccttgttggcggttcttctaggattcccaaagtg 8601724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 658
Target Start/End: Original strand, 29577533 - 29578169
Alignment:
25 attgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgat---aagagaa 121  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||| |   ||| |||    
29577533 attgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccaactgctgctgcacttgcatatggaattcaaaagagaggtaattttgttgttggaaagcgaa 29577632  T
122 atatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactca 221  Q
    || | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |  ||   || ||||| ||||||||||| || || |||||    
29577633 atgtattcatctttgatcttggtggtggcacctttgatgtgtctcttctcacacttaaggatgatagttttgaagtaaaggccactgctggtgatactca 29577732  T
222 cctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcctta 321  Q
    |||||||||  | ||||| ||||| | |||||||   |||||||| || ||||| | ||  ||| |||| | ||| ||||||  |||  ||||||| |||    
29577733 cctaggaggagaggacttcgataataaaatggtgagccactttgtgaatgagttgaagaggaagaacaatgtggacattagtttgaacccaaaagcttta 29577832  T
322 aggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttct 421  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||||    
29577833 aggaagctgagaactgcttgtgagagggcaaagagggcactttcatatgacattgaggccacaattgacatagatgctatatgtcagggtattgacttct 29577932  T
422 gttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatgga 521  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||||  | | || ||| ||||||||||||| |||||| | | ||||   | ||||||   ||||||| | |||||    
29577933 gctcatcaattactcgggcgaaatttgagcgactcaacatggacctctttgaaaaatgtatggagattgttcggagttgtctacgtgatgcttacatgga 29578032  T
522 caagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgt 621  Q
    | ||| ||  ||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |  | ||||| || ||  |||||||||| | ||| || ||     
29578033 ccagagtatggtacatgaaattgtccttgttggaggttcatctagaattcccaaagtgcggaaactattgcaagactttttcaagggtagggatttgtgc 29578132  T
622 aagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
29578133 atgagcataaaccctgacgaggctgttgcttatggtg 29578169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 17268243 - 17267610
Alignment:
25 attgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaata 124  Q
    |||||||| || |||||  || || ||||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||   |||||| |||| ||||||||  |  | ||||    
17268243 attgctggccttaatgtattgaaggtaatcaatgaaccaactgctgcagctattgcatatggccttggcaagagaactaactgtgttgaagaacggaata 17268144  T
125 tttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacct 224  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  | ||| ||||| | || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||    
17268143 tttttgtctttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctctcgttacaattaaggataaggtcttcgaagttaaggccaccggtggagacactcatct 17268044  T
225 aggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaagg 324  Q
     || ||| | ||||||||||| | ||||||  |  | |||||| ||||  |||  |  ||  | |||  | | |||  || |||  |||||||| | |||    
17268043 tgggggtgaggactttgataatagaatggtatactattttgttgaggaaatcaaaaggaaaaaaaaattgaaaattgttgggaacccaaaagccatgagg 17267944  T
325 aggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttctgtt 424  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || | ||| | |||   ||||  |||| ||| ||| ||| ||| |||| || | ||    
17267943 aggttgagaactgcatgtgaaaaagcaaaaaggacactttctttcgcctctgtgaccaatgttgaggtagacgctttatttaagggtgttgatttttctt 17267844  T
425 cctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaa 524  Q
    | ||||| || || ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||| ||| | | |||| | |  ||||||  |||||||||||| |||||    
17267843 cgtcaatcactcgtgccaagtttgaggaaatcaatatggacctttttgatgagtgcatggagattgttgagaagtgtcttagtgatgctaagattgacaa 17267744  T
525 gaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaag 624  Q
    ||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   || ||||| ||| |  | |||||||||||||||||||| ||     
17267743 gagcagagttgatgatgttgtccttgttggtgggtcttctaggattccgaaagtgcagcaactattgcagaacttcttcaaggggaaggaattatgcaaa 17267644  T
625 agcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
17267643 agtatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 17267610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 17260449 - 17259912
Alignment:
121 aatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactc 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||| |  | ||| ||||| | || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||    
17260449 aatatttttgtctttgaccttggtggggggacttttgatgtgtctctcgttacaattaaggataaggtcttcgaagttaaggccaccggtggagacactc 17260350  T
221 acctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcctt 320  Q
    | || || ||| | ||||||||||| | ||||||| |  | |||||  ||||| |||  |  | | | |||  ||| |||| || |||  ||||||||||    
17260349 atcttgggggtgaggactttgataatagaatggtgtactattttgtagaggagatcaaaagaacgaaaaaattggacattattgggaacccaaaagcctt 17260250  T
321 aaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttc 420  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | | ||| | |||   ||||  |||| ||| ||| ||| ||| || | ||     
17260249 aaggaggttgagaactgcatgtgaaaaagcaaaaaggacactttcttttgcctctgtgaccaatgttgaggtagacgctttatttaagggtgttaatttt 17260150  T
421 tgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatgg 520  Q
    | ||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |  |||| ||| | | |||| | |  ||||||  ||||| |||||| |    
17260149 tcttcgtcaatcactcgtgccaagtttgaagaaatcaatatggaccttttttatgagtgcatggagattgttgagaagtgtcttagtgatggtaagattg 17260050  T
521 acaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatg 620  Q
    ||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   || ||||| |||||  | |||||||| |||||||||||    
17260049 acaagagcagaattgatgatgttgtccttgttggtggatcttctaggattccgaaagtgcagcaactattgcaggatttcttcaagggtaaggaattatg 17259950  T
621 taagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17259949 caagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 17259912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 8590837 - 8590309
Alignment:
130 atctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacctaggag 229  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||     ||  ||| || || || |||||| ||||||| || ||||||||||    
8590837 atctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtctcttctcacactcaaaggtgatagctttgatgtaaaagccacttccggagatacccacctaggag 8590738  T
230 gtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaaggaggct 329  Q
    |  | ||||||||||||| ||||||  | || || || |||||||| ||||  ||| | |||| |||| | |||| |||  |||  ||  | |||||| |    
8590737 gagaggactttgataacagaatggttcaccatttggtgaaggagtttaggaggaagaataaagtggatttaagtgggaacgcaagggctcttaggaggtt 8590638  T
330 gagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttctgttcctca 429  Q
    || ||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |   |||||||||||||| | ||  ||||||||  ||  | |    
8590637 gaaaacagcttgtgagagggctaaaaggacactgtcatatgatactgaggcaacaatcggcatagatgctatatatgagggagttgacttccatttatta 8590538  T
430 ataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaagaata 529  Q
     | || ||||||||||||||  || | || | | | ||||||||||||||| || | | ||| || | |||| | ||| ||||||||||||||||||| |    
8590537 gtcactcgggccaagtttgaacaacttaacagggatctctttgaaaagtgtttggagattgtcaagaattgtttggctaatgctaagatggacaagaaca 8590438  T
530 gtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaagagcat 629  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| || ||  |||| | |||||||||  | |  || |||||    
8590437 ttgtagatgatgttgtacttgttggtggttcttctaggattcccaaagtgcagcagctattgcaagacttttttatggggaaggatctttacaatagcat 8590338  T
630 caaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||    
8590337 caatccagatgaggctgttgcttatggtg 8590309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Original strand, 10494232 - 10494571
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | ||||||  | ||||||  | |||      
10494232 ggtgctattgctggccttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagaagtgattgtgagggtaacc 10494331  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    ||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||    
10494332 gaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtacttttgatgtgtctatcctcacaattaagggtgatgtctttgaagtaaaagccactgcaggtaacac 10494431  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    |||||| || ||  | ||||| ||||||| ||||||| || | |||||| |||||||||  || ||| | || | ||| || |||| |||| ||||| ||    
10494432 tcaccttgggggagaggacttcgataacagaatggtgaattattttgttgaggagttcaaaaagaagaataacgtggacatcagtgggaatccaaaatcc 10494531  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaagga 358  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||    
10494532 ttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaagga 10494571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 436 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 6789405 - 6789183
Alignment:
436 cgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaagaatagtgtag 535  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||| |  |||||||||| || ||| | | |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||     
6789405 cgggccaagtttgaggaaatcaatatggatatttttaatgagtgtatgaagaccgttgagagttgtcttgttgacgctaagatggacaagagtattgtaa 6789306  T
536 atgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaaccc 635  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || ||  |||||| ||| ||||| || || | ||||||||||||    
6789305 atgatgttgtccttgttggtgggtcttctagaattcccaaagtgcaacaactattgcaagaagttttcatgggaaaggatttgtgcatgagcatcaaccc 6789206  T
636 tgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
6789205 tgatgaggctgttgcttacggtg 6789183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 658
Target Start/End: Original strand, 27830835 - 27831372
Alignment:
121 aatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactc 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||| | || |||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||    
27830835 aatatttttgtgtttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactc 27830934  T
221 acctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcctt 320  Q
    |||| || ||  | ||||||||||| |  |||||| |  | |||||  ||| ||||| ||| ||| | | || ||| ||||||| |||  ||| ||||||    
27830935 accttggtggagaggactttgataataggatggtgaactattttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagcctt 27831034  T
321 aaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttc 420  Q
     ||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| || |       |||  | || |||||  |||||||  ||| | | || |||||||||    
27831035 gaggaggctgagaacctaatgtgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcattgacttc 27831134  T
421 tgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatgg 520  Q
    | |||    || || || || |||||||||||||| |||||| |||| ||  |  | |||||| | |||||| | | ||||||  ||||  |||||||||    
27831135 ttttcaatgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatgg 27831234  T
521 acaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatg 620  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||||||   |||  |||||||||| ||||| || ||    
27831235 acaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttcaaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaaggatttgtg 27831334  T
621 taagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
27831335 caagagcatcaatcctgatgaggctgttgcttttggtg 27831372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8667723 - 8667390
Alignment:
25 attgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaata 124  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||  | | |||| || ||   ||||||    
8667723 attgctggacttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgcggcagctattgcatatggccttgacaagagaaatgactgtgatggtagccgaaata 8667624  T
125 tttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacct 224  Q
    ||||| ||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||| |||||    ||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||    
8667623 tttttgtctttgatctgggtggcgggacttttgatgtgtctatcctcacaattaagggtgatgtctttgaagtgaaagccactgcaggaaacactcacct 8667524  T
225 aggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaagg 324  Q
     || ||  | ||||| ||||||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |  || ||| | |||| ||| || ||| ||||  ||||| ||||||||    
8667523 tgggggcgaggacttcgataacagaatggtgaactattttgttgaggagttaaaaaagaagaataaagtggacatcagtcagaacccaaaatccttaagg 8667424  T
325 aggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaagga 358  Q
    ||| |||||||||| ||||| | |||||||||||    
8667423 aggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaagga 8667390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 322 - 658
Target Start/End: Original strand, 7877894 - 7878230
Alignment:
322 aggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttct 421  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||  || |||||| | ||||||||  ||||||||||| |  | || |||||||||     
7877894 aggaggttgagaactgcatgtgagagggctaaaaggacactgtcatttgatactgagactacaattgacatagatgctatacacgacggaattgacttca 7877993  T
422 gttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatgga 521  Q
     |   | | |||  ||||||||||||||| || | |||||| | || |||||||| ||| ||   | ||| || | ||||||| ||||||||| ||||||    
7877994 atatgttattaagtcgggccaagtttgagcaactcaatatggatctttttgaaaattgtttggcgattgtcaagagttgtcttactgatgctatgatgga 7878093  T
522 caagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgt 621  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||   |||||||| |||||  |||| |||||||||||  | ||     
7878094 caagaacaatgtagatgatgttgtacttgttggtggatcatctaggattctcaaagtgcagcagctattgcaggacttttttaaggggaaggatatttgc 7878193  T
622 aagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
7878194 agtagcatcaacccggatgaagctgttgcttatggtg 7878230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 533 - 656
Target Start/End: Original strand, 8636715 - 8636838
Alignment:
533 tagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||   || ||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
8636715 tagatgatgttgtccttgttggtggctcctctaggattccaaaggtgcagcaactattacaggacatttttaaggcgaaggaactgtgtaagagcatcaa 8636814  T
633 ccctgatgaggctgttgcttatgg 656  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
8636815 cgctgatgaggctgttgcttatgg 8636838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8659673 - 8659330
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||| |||||  || | ||||||| | | |||| || |||      
8659673 ggtgccattgctggccttaatgtcattcagataattaatgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaggtgactgtgatggtaaac 8659574  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
     |||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||    ||||||| ||||| || |||||| | ||| ||||    
8659573 aaaatattttggtctttgatcttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttacaatgaagggtgatgtctttgaagtaaaagccacttctggaaacac 8659474  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    |||||| |||||  | |||||||||| || ||||||| |  |||||||  |||||||||  || ||| | |||| ||| |||||||  ||  ||||| ||    
8659473 tcaccttggaggagaggactttgatagcagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataaagtggacattagtggtaacccaaaatcc 8659374  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacact 362  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
8659373 ttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaagaggacact 8659330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Original strand, 13333314 - 13333653
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| |  |||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | ||||||  | |||||| || ||||     
13333314 ggtgctattgctggccttaatatcattcgaataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagacgtgattgtgatggtaagc 13333413  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||| |    ||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||    
13333414 gaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtacttttgatgtgtctatccttacaattatgggtgatgtctttgaagtaaaagccaccgcaggaaacac 13333513  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||||||| ||||||| |  | |||||| |||||||||  || ||| | || |  ||||| |||| |||  ||||| ||    
13333514 tcaccttgggggagaagacttcgataacagaatggtgaactattttgttgaggagttcaaaaagaagaataacgtcgatatcagtgggaacccaaaatcc 13333613  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaagga 358  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||    
13333614 ttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggaaaaaagga 13333653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8654760 - 8654421
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| | |||| |||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | ||| ||  ||| | || || |||      
8654760 ggtgccattgctggacttaacgtcattcggatactcaatgaacctactgccgcagctattgcatatggccttgacaagcgaagtaactatgatggtaaac 8654661  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    | ||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    ||||||| || || || |||||||| ||| ||||    
8654660 ggaatattttggtatttgatcttggtggtggtacttttgatgtgtctatactcacaattaagggtgatgtctttgacgtaaaagccactgctggaaacac 8654561  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
     |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||  |||||||||  || ||| | |||| ||| ||||| |  ||  ||||| ||    
8654560 gcacctagggggagaagactttgataacagaatggtgtactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataaagtggaaattagcggtaacccaaaatcc 8654461  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaagga 358  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||    
8654460 ttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaagga 8654421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Original strand, 8636201 - 8636439
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || | ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |  |||    
8636201 ggtgccattgccggccttaatgtaattcggataatcaatgaaccaactgctgcagcttttgcgtatggacttcaaaagagaggtaactgtgttaaagaga 8636300  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    |||| |||||  | ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| |||| | ||||     | ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
8636301 gaaacattttcgtatttgatcttggtggtggtacattcgacgtgtctatactcaaaattaaaggtgaagtctttgaagttaaagccactgccggagacac 8636400  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtgga 257  Q
     ||||| |||||  | ||||||||||||| |||||||||    
8636401 acaccttggaggagaggactttgataacagaatggtgga 8636439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1301774 - 1301427
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccga----ctgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgat 114  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |    |||| || ||| ||||||||||  || | ||||||  | | |||| || |    
1301774 ggtgcaattgctggccttaatgtcattcagataattaatgaacctagctactgctgcagctattgcgtatggttttgacaagagaagtgactgtgatggt 1301675  T
115 aagagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggag 214  Q
    ||  | ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  | |||  | ||||||| ||||| || |||||||  |||     
1301674 aaacggaatattttggtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatccttaccatcaagggcgatgtctttgaagtaaaagccactggtggaa 1301575  T
215 acactcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaa 314  Q
    | |||||||| |||||  | ||||||||||| | |||||||    |||||||  |||||||||| || ||| | |||| ||| |||||||  ||    ||    
1301574 atactcaccttggaggagaggactttgataatagaatggtgagctactttgtagaggagttcagaaagaagaataaagtggacattagtggtaaccagaa 1301475  T
315 agccttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacact 362  Q
    | ||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
1301474 atccttaaggaggttgagaattgcgtgtgagagggcaaaaaggacact 1301427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8647181 - 8646941
Alignment:
25 attgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaata 124  Q
    |||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||| | |||||| | ||||||| |||  |  ||||||    
8647181 attgctggccttaatatcatccggataatcaatgaaccaacagctgctgctctcgcatatggccttgacaagagaacaaattgtgctgaagaacgaaata 8647082  T
125 tttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacct 224  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| | || |||||  | || || ||||| || ||| ||||||||||    
8647081 tattcatcttcgaccttggtggtggaacttttgatgtgtctctccttacaattaaggataaggtctttcatgttaaagccaccgctggaaacactcacct 8646982  T
225 aggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttg 265  Q
     |||||  | ||||||||||  | ||||||||| |||||||    
8646981 cggaggagaggactttgatagtagaatggtggaccactttg 8646941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 8616568 - 8616431
Alignment:
442 aagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaagaatagtgtagatgatg 541  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||||| || |||||| | | |||| ||  |||| ||||||| || |||| |||||||||||||     
8616568 aagtttgaggaaatcaatatggacctttttaacgagtgtataaagactgttgagagttgttttaatgattctaagatagagaagagtagtgtagatgata 8616469  T
542 ttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtg 579  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
8616468 ttgttcttgtcggtggctcgtctaggattcctaaagtg 8616431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 578
Target Start/End: Original strand, 8585564 - 8586123
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | || | || ||| |||| || | |      
8585564 ggtgccattgctggccttaatgttatgaggataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaactgtgatggtgaac 8585663  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||     ||||||| ||||| || || || || ||| | ||    
8585664 gaaatatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagcaaccgctggaaatac 8585763  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    |||||| || ||    ||||||||||||| |||| || |  |||||||| |||| || | ||  ||| |||| | |||||||| | ||||  ||| |||     
8585764 tcaccttgggggaggggactttgataacagaatgttgaactactttgttgaggaatttaagagaaagaacaatgtggatattactaagaacccaagagct 8585863  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgact 418  Q
    || ||| || | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |    |   | || |||||| | |||  | ||| | | ||  | || |    
8585864 ttgaggcggttaagaacggcatgtgaaaaggcaaaaaggacactttctttcaaattggtcactactattgaaattgattatttatgtgagggcgtcgatt 8585963  T
419 tctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagat 518  Q
    ||| ||| ||||| || || | ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||||| ||||||||| | | ||||||| | ||| |||||||    
8585964 tctcttcatcaatcacgcgtgtcaagtttgaggaaatcaatatggacctttttaatgagtgtataaatactgttgagagttgtcttaccgattctaagat 8586063  T
519 ggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagt 578  Q
     || |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| || || || ||||| |||||    
8586064 agagaagaatggtgtagacgatattgtccttgtcggtggctcgtccagaattcccaaagt 8586123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6789822 - 6789484
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||  | ||   | |    
6789822 ggtgccattgctggtcttaatgttatacgaataatcaatgaaccaacagctgctgctcttgcatatggccttgataagagaactaattacggtggagaaa 6789723  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
     |||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||| | ||  | || |||||| |||| |||||||| |  ||| ||||    
6789722 aaaatattttcgtcttcgaccttggtggtggcactttcgatgtgtctatcttaacaatcaaagataaggtcttccaagttaaggccaccggtggaaacac 6789623  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    |||||| |||||  | ||||||||||||  | ||||  |  ||||||   ||||||| | ||  ||| |||||| |||||||| ||  || ||||  |||    
6789622 tcacctcggaggagaggactttgataaccgattggtaaactactttgcagaggagtttaagaggaagaacaaagtggatattactggaaactcaagggcc 6789523  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaagg 357  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
6789522 ttaagaaggttgagaactgcgtgtgaaagggccaaaagg 6789484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 8646699 - 8646550
Alignment:
507 tgatgctaagatggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaag 606  Q
    |||||| ||||||||||||| |  | |  |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||| |  |  ||||| |||||||     
8646699 tgatgccaagatggacaagagttctatccatgatgttgttcttgttggtggctcctctagaattccaaaagtacaacagatgctgaaggagtttttcaat 8646600  T
607 gggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 656  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
8646599 gagaaggaattatgcgagagcatcaaccctgatgtggccgttgcttatgg 8646550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3147472 - 3147247
Alignment:
121 aatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactc 220  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| | || |||||  |||| |||||||  || ||| |||| |    
3147472 aatatttttatctttgacttgggtggtgggacttttgatgtgtctcttcttacaattaaggataaggtctttcaagttaaggccatcgcaggaaacaccc 3147373  T
221 acctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcctt 320  Q
    |||| || ||  | ||||||||||| |  |||||| |  ||||||    |||||| | ||| ||| |||| |  || ||||||||||| |||| ||||||    
3147372 accttgggggagaggactttgataataggatggtgaactactttgcacgggagtttaagaagaagaacaaggtagacattagtgagaactcaagagcctt 3147273  T
321 aaggaggctgagaactgcttgtgaaa 346  Q
    ||||||| ||| ||| || |||||||    
3147272 aaggaggttgaaaacggcgtgtgaaa 3147247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8628842 - 8628609
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||  |||||||||||| || ||||| || ||| |||| ||||||||| | || | || ||  |||| || | |      
8628842 ggtgccattgctggccttaatgttatgaggataatcaatgaccccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaggtgtgatggtgaac 8628743  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||     ||||||| ||||| || |||||||| ||| | ||    
8628742 gaaatatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccactgctggaaatac 8628643  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatg 252  Q
    |||||| || ||  | ||||||||||||| ||||    
8628642 tcaccttggtggagaggactttgataacagaatg 8628609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 7877591 - 7877671
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagaga 99  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
7877591 ggtgcagttgccggcctcaatgttatgcggataattaatgaaccaactgctgctgcccttgcatatggccttcaaaagaga 7877671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 599 - 658
Target Start/End: Original strand, 10494812 - 10494871
Alignment:
599 ttttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    |||||||||||||||||||||  | | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
10494812 ttttcaaggggaaggaattattcatgcgtatcaacccagatgaggctgttgcttatggtg 10494871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 3147057 - 3146935
Alignment:
536 atgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaaccc 635  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| |||||  ||||    |||||| |  | ||||| |||||||||||    
3147057 atgatgtcgtccttgtcggtggctcgtctagaattccaaaagtgcaacaactattgcaggaattttttgcagggaagcatctgtgtaacagcatcaaccc 3146958  T
636 tgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
3146957 tgatgaggccgttgcttatggtg 3146935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 8102488 - 8102338
Alignment:
508 gatgctaagatggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaagg 607  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||    || || || || ||  | ||||| |    
8102488 gatgctaagatggacaagagcacagttcatgatgttgttcttgttggtggttcaactaggattcccaaagttcagcaactgttgcaagacttcttcaatg 8102389  T
608 ggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    | |||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
8102388 gtaaggagctatgcaaaagcatcaaccccgacgaggctgttgcttatggtg 8102338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 600 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 8667148 - 8667090
Alignment:
600 tttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    ||||||||||||||||||||  | | | |||||||| || |||||||||||||||||||    
8667148 tttcaaggggaaggaattattcatgggtatcaacccagacgaggctgttgcttatggtg 8667090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 8671494 - 8671568
Alignment:
25 attgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagaga 99  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | ||||||    
8671494 attgctggacttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagaga 8671568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 622 - 652
Target Start/End: Original strand, 27846567 - 27846597
Alignment:
622 aagagcatcaaccctgatgaggctgttgctt 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
27846567 aagagcatcaaccctgatgaggctgttgctt 27846597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6786925 - 6786816
Alignment:
55 aatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaactt 154  Q
    |||||||| ||||  || |||||||| ||||  ||| | |||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  || ||||||    
6786925 aatgaacctactgttgctgctcttgcatatgatctttataagagagcaaattttgttgaaaataggaatatatttatctttgatcttggttgtagaactt 6786826  T
155 ttgatgtgtc 164  Q
    ||||| ||||    
6786825 ttgatatgtc 6786816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 622 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 8659070 - 8659034
Alignment:
622 aagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
8659070 aagagtatcaacccagatgaggctgttgcttatggtg 8659034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 25 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 12528808 - 12528175
Alignment:
25 attgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaata 124  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |    
12528808 attgctggcctcaatgtaatacggataatcaacgaaccaactgcagctgctcttgcatatggcattcaaaagagagctaattgtcttgaagagagaagga 12528709  T
125 tttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacct 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12528708 tttttatttttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctcttcttacagtaaagaataatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacct 12528609  T
225 aggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaagg 324  Q
     |||||  | |||||||||||   ||||||| |||||||||| || ||||| | ||  ||| ||||||  || |||| || ||| ||||||||| |||||    
12528608 tggaggagaggactttgataatcgaatggtgaatcactttgtgaaagagtttaagaggaagaacaaagttgacattattgggaactcaaaagccctaagg 12528509  T
325 aggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttctgtt 424  Q
    ||  ||||||||   || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||| | | || ||||||||||| |    
12528508 agattgagaactaactgcgagaaggcgaaaaggacactttcatacgatacagaggctacaattgacatagatgctatatgtgagggcattgacttctgct 12528409  T
425 cctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaa 524  Q
    | ||||| || || |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| | | |||| |  | |||||||||||||||||    
12528408 catcaatcactcgagccaagttcgagcaactgaatatggacctctttgaaaagtgtatggagaccgttgaaagttgtttgaccgatgctaagatggacaa 12528309  T
525 gaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaag 624  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||  |||    
12528308 gagtagtgtagatgatattgtacttgttggtggctcgtctaggattcccaaagtgaagcagctattgcaggagtttttcaagggcaaggagttatacaag 12528209  T
625 agcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12528208 agcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 12528175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 43744703 - 43744494
Alignment:
442 aagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaagaatagtgtagatgatg 541  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||  |  ||||| |||| | |||| | | ||||||| ||||||| |||||||||||||    | || ||||||    
43744703 aagtttgaggaaatcaatatggatctcttcaacgagtgtttgaaaattgttgagagttgtcttactgatgccaagatggacaagagcgctatacatgatg 43744604  T
542 ttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatga 641  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||   ||| ||||| |||||  ||||    |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||    
43744603 ttgttcttgttggtggctcctctaggattccaaaagtacaacaactattgcaggaattttttgcagggaaggatttgtgtaagaacattaaccctgatga 43744504  T
642 ggctgttgct 651  Q
    ||| ||||||    
43744503 ggcagttgct 43744494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43745159 - 43745013
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgtt-gataag 117  Q
    ||||| |||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||  |||||||| |||| | |||  ||  |     
43745159 ggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgagga- 43745061  T
118 agaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtct 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
43745060 agaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 43745013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 656
Target Start/End: Original strand, 12245268 - 12245901
Alignment:
23 caattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaa 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||| |||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||   | |||||    
12245268 caattgctggtctcaatgttatgagggtaatgaatgaacccactgctgcagctgttgcatatggccttgaaaagagagctgattgtgttggagaaagaaa 12245367  T
123 tatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcac 222  Q
     |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  ||||| | ||  ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||    
12245368 catttttgtgtttgatcttggtggtggcacttttgacgtttctatcctaactattaaggataacatcttccaagttaaggccactgctggaaacactcac 12245467  T
223 ctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaa 322  Q
    || |||||  | || |||||||| | ||||||  |  ||||||   ||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||  | |||||||||||| |    
12245468 cttggaggagaggattttgataatagaatggtaaactactttgcacaggagttcaagagaaagaacaaattggatattagtgcaagttcaaaagccttga 12245567  T
323 ggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttctg 422  Q
    ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| |       ||  || || |||||  ||||| || ||| | |||| ||||| || |     
12245568 ggagattgagaactgcttgtgagagggcaaaaagaatactttcgtttcttgttgttgcaactattgaggtagattctttatttcaaggcattgatttttc 12245667  T
423 ttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggac 522  Q
    ||| || || |  ||||| |||||||||||| ||||| |  | ||  || |  | ||||| || |||||| | | |||| ||   ||||| |||||||||    
12245668 ttcatccatcaatcgggcaaagtttgaggaattgaatttagatcttcttaatgattgtataaagactgttgagagttgtattatggatgcaaagatggac 12245767  T
523 aagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgta 622  Q
    |||| || | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |    
12245768 aagagtactatagatgattttgtacttgttggtggatcttctaggattcccaaagtccaacagctattacaggactttttcaacgggaaggaattgtgca 12245867  T
623 agagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 656  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
12245868 agagcattaaccctgacgaggctgttgcttatgg 12245901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 7542536 - 7541899
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||  |  ||| |||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | |||||| || ||| || ||   ||     
7542536 ggtgccattgctggcctcaatgttatgagggcaatgaatgaacctactgccgcagctgttgcatatggccttgacaagagaactgattatgatggagagc 7542437  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  |||||  |||   |||| |||| ||||||||||| ||  ||||    
7542436 gaaatatttttgtttttgatcttggcggtggcacttttgatgtgtctttactaacgattaagggcaacaacttccaagttaaggccactgctggcaacac 7542337  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||| | ||||| | |  |||||||  | ||||||| ||  ||| |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||    
7542336 tcaccttggtggagaagactttgataatagaatggcgaactactttgtacaagagttcaagagaaagaacaaagtggacattagtgggaatccaaaagcc 7542237  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgact 418  Q
    || |||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| | |     ||  ||||| |||||  ||||| || ||| | |||| |||||||    
7542236 ttgaggaggttgagaactgcttgtgagagggcaaaaagatcactttctttccttgttgttgccactattgaggtagattctttatttcaaggcattgact 7542137  T
419 tctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagat 518  Q
    | | ||| || || |   |||||||||||||||| ||||||||| | || ||| |  |||||||||  | ||||   |  ||||||  ||||||||| ||    
7542136 tttcttcatcgatcaatagggccaagtttgaggagatgaatatggatctttttaacgagtgtatgacgattgttggaagctgtcttattgatgctaatat 7542037  T
519 ggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaatta 618  Q
    ||||||||  |   ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| | |||    ||||||||| ||||  ||||||| || ||||| ||     
7542036 ggacaagagcatgatagatgatgttgtccttgtcggcgggtcttcgaggattcccatagtacatcagctattaaaggactttttcaatggaaaggacttg 7541937  T
619 tgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 656  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
7541936 tgcaagagcattaatcctgatgaggctgttgcttatgg 7541899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 14703616 - 14703081
Alignment:
121 aatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactc 220  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | || ||| |||||  ||  |||||| || | ||||| ||||| ||| ||||||    
14703616 aatatatttgtctttgatcttggtggtggtacttttgacgtgtctctcctaacaattaagggcaccgtcttccaaattaaggctactgctggaaacactc 14703517  T
221 acctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcctt 320  Q
    |||| || ||  | ||||| ||||||| ||||||| |  |||||||| | ||||||| ||  ||  ||| |  ||| |||||||  ||| ||||||||||    
14703516 acctcgggggagaggacttcgataacagaatggtgaactactttgttcaagagttcaagagaaaaaacagattggacattagtggaaatccaaaagcctt 14703417  T
321 aaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttc 420  Q
    ||||||  ||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||| | | |   ||  ||||| |||||  |||||||| ||| | || | ||||||||     
14703416 aaggagcttgagaaccgcttgcgagagggcaaaaagaacactttctttccaagttgtcgccactattgaggtagatgctttatttcaatgcattgacttt 14703317  T
421 tgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatgg 520  Q
    | ||| || || |   ||||||||||||| |||||||||||| || | ||| |  ||||| |||| | |||| | | |||||||  ||||||||||||||    
14703316 tcttcatcgatcaatagggccaagtttgaagaaatgaatatggacttttttaatgagtgtgtgaagattgttgagagttgtcttattgatgctaagatgg 14703217  T
521 acaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatg 620  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||    ||  ||||||||||  ||||| |||||||||| || ||    
14703216 acaagagtagagtagatgatgttgttcttgtcggtgggtcttctcggattcccaaagtacagcaattattacaggactttttccaggggaaggagttgtg 14703117  T
621 taagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 656  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
14703116 caacagcattaaccctgatgaagctgtagcttatgg 14703081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 11999704 - 11999081
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||   | |||| |||||||| ||||| ||  || |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||   | |    
11999704 ggtgcaattgctggcatcaatgttataagggtaatgaatgaacccactgctgcaactgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttggagaaa 11999605  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    |||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||    
11999604 gaaacattttagtctttgatcttggcggtggcacttttgatttgtctatactaacaattaaggacaatgtcttccaagttaaggccacagctggaaacac 11999505  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    |||| | |||||  | || |||||||| |             ||||||  | ||||||| ||  ||| || ||| |||||||||||  | ||||||||||    
11999504 tcacttcggaggagaggattttgataata-------------ctttgtacaagagttcaagataaagaacgaagtggatattagtggaagttcaaaagcc 11999418  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgact 418  Q
    || |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||       ||  || || |||||  ||||| || ||| | |||| ||||| |    
11999417 ttgaggaggttgagaactgcttgtgagagggcaaaaagaatactatcatttcttgttgttgcaactattgaggtagattctttatttcaaggcattgatt 11999318  T
419 tctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagat 518  Q
    | | ||| || || |  ||||| |||||||||||| ||||| |  | ||  || |  | ||||| || |||||| | | |||| ||   ||||| |||||    
11999317 tttcttcatccatcaatcgggcaaagtttgaggaattgaatttagatcttcttaatgattgtataaagactgttgagagttgtattatggatgcaaagat 11999218  T
519 ggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaatta 618  Q
    |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||   |||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||     
11999217 ggacaagagtactatagatgatgttgtacttgttggtggatcttctagga-tcccaaagtccaacagctattacatgactttttcaacgggaaggagttg 11999119  T
619 tgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 656  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
11999118 tgcaagagcattaaccctgatgaggctgtagcttatgg 11999081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 43625332 - 43625083
Alignment:
409 ggtattgacttctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctg 508  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| | || ||  |  ||||| |||| |||||||| | |||||||  ||    
43625332 ggtattgacttcttttcatcaatcactcgtgccaaatttgatgaaataaatatggatcttttcaacgagtgtttgaaaactgttaagagttgtcttattg 43625233  T
509 atgctaagatggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggg 608  Q
    |||| ||| ||||||||| |  | |  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||||||||    
43625232 atgccaagttggacaagagtgctatccacgatgttgtccttgttggcggctcctctagaattccaaaagtaaaacagctgttgcaggagtttttcaaggg 43625133  T
609 gaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    |||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
43625132 gaaggaatcatgcgaaagcataaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 43625083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 652
Target Start/End: Original strand, 12258901 - 12259072
Alignment:
481 atgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtga 580  Q
    ||||| |||||| | | ||||||| | |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||     
12258901 atgaagactgttgagagttgtcttacggatgctaacacggacaagagtaatgtagatgatgttgtccttgtaggtgggtcttctaggattctcaaagtgc 12259000  T
581 gacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgctt 652  Q
      ||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |||||||| || |||||||||||||| ||||    
12259001 agcagctattacaggattttttcaaggggaaagagttgtgcaagagcattaatcctgatgaggctgtagctt 12259072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 362
Target Start/End: Original strand, 16661879 - 16662193
Alignment:
48 gataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggt 147  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | || |||  |||||||| || | | |||||||||||| ||||||| ||||| |||    
16661879 gataatcaatgaacccactgcagcagctattgcatatggccttgacaaaagaagtaattgtgatggtgaaagaaatatttttgtctttgatcttggtggt 16661978  T
148 ggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacctaggaggtcaagactttgataaca 247  Q
    || ||||||||||||||| | |||||| ||||     ||||||| ||||| || |||||| | ||| |||||||||| || ||  | |||||||||||||    
16661979 gggacttttgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccacttctggaaacactcacctcgggggagaggactttgataaca 16662078  T
248 taatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaa 347  Q
     |||| || |  ||||||| || || || |  |  ||| |||||| |||||| | |  |||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
16662079 gaatgttgaactactttgtgaaagaatttaataggaagaacaaagtggatatcactaggaatccaagagccttgaggaggttgagaacttcttgtgaaaa 16662178  T
348 ggcaaaaaggacact 362  Q
    ||| |||||||||||    
16662179 ggcgaaaaggacact 16662193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 16657375 - 16657718
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| |  || ||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||| | ||||||  | |||||| || |||      
16657375 ggtgccatcgctggccttaatgtcattcgaattatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtcttgacaagagaagtgattgtgatggtaaac 16657474  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||    |||| || || || || |||||||||||| ||||    
16657475 ggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacac 16657574  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    |||||| || ||  | ||||||||||||| || |||| |  |||||||  |||||||    || ||| | || | ||| || |||| ||| |||| ||||    
16657575 tcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaactcaagagcc 16657674  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacact 362  Q
    || |||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
16657675 ttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacact 16657718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 437 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 12234581 - 12234364
Alignment:
437 gggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaagaatagtgtaga 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||    |||||||||| | |||| | | |||||||  |||||||||||||||||| | ||| || ||    
12234581 gggccaagtttgaggaaatgaatatggatcttcttattgagtgtatgaagattgttgagagttgtcttagtgatgctaagatggacaaaagtagggtgga 12234482  T
537 tgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaaccct 636  Q
    ||| ||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||||||  | || ||||| || ||||||    
12234481 tgaagttgtccttattggcgggtcctctaggattcccaaagtgcagcaactattgcaggattttttcaaggggaaggagctgtgcaagagtattaaccct 12234382  T
637 gatgaggctgttgcttatg 655  Q
    || ||||| ||||||||||    
12234381 ga-gaggcggttgcttatg 12234364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43625691 - 43625498
Alignment:
50 taatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggtgg 149  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| || || |||||| | ||||||  |||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||| |||||    
43625691 taatcaatgaaccaacagctgctgctctagcatacggccttaacaagagaattaattgtgttggagaacgaaatattttcatctttgaccttggtggtgg 43625592  T
150 aacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacctaggaggtcaagactttgat 243  Q
     ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||   || || |||||||| ||| |||||||||| |||||  | |||||||||    
43625591 tacttttgatgtgtctatacttacaattaaggacaaggtcttccgtgttaaagccactgctggaaacactcaccttggaggagaggactttgat 43625498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 12258457 - 12258675
Alignment:
37 aatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaatatttttatctttg 136  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | || |||  ||||||||| || ||  | ||||||||| ||||||    
12258457 aatgttatgaagatattaaatgaacctactgctgcagcttttgcatatggccttgacaaaagaattaattgtgtcgaaaaacggaatatttttgtctttg 12258556  T
137 accttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacctaggaggtcaaga 236  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||  ||||| | ||||||||  |||| ||||| || || ||| |||| ||||| |||||  | ||    
12258557 atcttggtggtggcacttttgatgtgtctctactaaccattaaggataatgtctttcaagttaaggctacagctggaaacacgcaccttggaggagagga 12258656  T
237 ctttgataacataatggtg 255  Q
    ||||||||| | |||||||    
12258657 ctttgataatagaatggtg 12258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 656
Target Start/End: Original strand, 16662432 - 16662487
Alignment:
601 ttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 656  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16662432 ttcaatgggaaggagttgtgcaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 16662487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 561
Target Start/End: Original strand, 17706060 - 17706113
Alignment:
508 gatgctaagatggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttct 561  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| || ||||||    
17706060 gatgctaagatggacaaaaaaagtgtccatgatgttgtccttgtaggaggttct 17706113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 15595245 - 15594705
Alignment:
118 agaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagaca 217  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||| |||| |||||||| | |||| |||    
15595245 agaaatatttttgtctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtctatcctaacaattaaggacaaggtcttccaagttaaggccacaggcggaaaca 15595146  T
218 ctcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagc 317  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||  |  ||||||   |||| |||| ||  ||| |||||| |||||||| || |||  |||  ||    
15595145 ctcaccttggaggagaggactttgataacagaatggtcaactactttgcgcaggaattcaagacgaagaacaaagtggatattactgggaacccaagggc 15595046  T
318 cttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgac 417  Q
    ||| |||||  |||||||||| || |||| ||||||||||  ||| || |     ||||   | || |||||  |||||  | ||| ||| |||||||||    
15595045 cttgaggagattgagaactgcgtgcgaaagggcaaaaagggtactctcttttactactgtcactaccattgaggtagattgtttatttaacggtattgac 15594946  T
418 ttctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaaga 517  Q
    |||| ||| ||  | || ||  |||||||||| ||||| || ||| || | ||| |  | |||||||| |  ||| | | |||||||| |||||||||||    
15594945 ttcttttcatcggttactcgttccaagtttgaagaaatcaacatggacttttttaaggattgtatgaagatagttgagagttgtcttgatgatgctaaga 15594846  T
518 tggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaatt 617  Q
    || | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||  ||||| |||| ||||||||    
15594845 tgaataagagtagtgtaaatgatattgtcattgttggtgggtcttctaggattcccaaagtgcaacaactattgaaggattttttcgagggaaaggaatt 15594746  T
618 atgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15594745 gtgcatgagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 15594705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 655
Target Start/End: Original strand, 34466657 - 34467282
Alignment:
25 attgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaata 124  Q
    |||||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||| | ||||||||| | | ||| ||  |  ||||||    
34466657 attgctggccttaatgttttgcaaataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggacttgacaagagagctgactttgtggaagaaggaaata 34466756  T
125 tttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacct 224  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||| | ||  ||||||||||    
34466757 ttttcgtctttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctctccttacaattaaggataatgtctttgaagttaaggccacttctggtaacactcacct 34466856  T
225 aggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaagg 324  Q
     ||| |  | ||||||||||| | ||||| | | |||||||  |||||||||| ||  ||| | ||  ||||||||||||  ||  | | ||| || |||    
34466857 cggacgagaggactttgataatagaatggcgaaccactttgcaaaggagttcaagaggaagcataataaggatattagtggaaaccctagagctttgagg 34466956  T
325 aggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgacttctgtt 424  Q
    ||| |||||||||| || || || ||||| |||||||| |  |        |  || ||  ||||| ||||| || ||||| | |  |||||||||  ||    
34466957 aggttgagaactgcgtgcgagaatgcaaagaggacactctttt--------gtcgctactgttgaaatagattctttatatgaggtaattgacttccatt 34467048  T
425 cctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagt---gtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatgga 521  Q
    | ||||| || || ||||||||||||||||| |||||| || ||||| || | |   | ||||  | ||||   | |||||||| |||||||||||||||    
34467049 cgtcaatcactcgtgccaagtttgaggaaatcaatatggacttctttaaagattaatgcatgaggattgttgtgagttgtcttgttgatgctaagatgga 34467148  T
522 caagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgt 621  Q
    || || ||||||  |||||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||   |||||||| | |||  ||||||| || |||||  ||||     
34467149 cacgagtagtgtgcatgatgctgtccttgtcgggggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattgcgggactttttcaatggtaaggatctatgc 34467248  T
622 aagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatg 655  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
34467249 aatagcatcaaccctgatgaggctgtcgcttatg 34467282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 658
Target Start/End: Original strand, 4678516 - 4679054
Alignment:
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | | | |||     |||||| ||||| || |||||||| ||| ||||    
4678516 gaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacac 4678615  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    ||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |  |||||||  |||||||||  || ||| | || | ||| |||||| ||||  ||||| ||    
4678616 tcacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaaccc 4678715  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattgact 418  Q
    ||||||||| |||||||||| || || | |||||| |||||||| || | || |  ||   ||||  ||| | ||||| || ||| | | || || ||||    
4678716 ttaaggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttg-agtagattctttatttcagggaatagact 4678814  T
419 tctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagat 518  Q
    | | ||| || || || || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||  |||| | |||||    
4678815 tttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagat 4678914  T
519 ggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaatta 618  Q
    |  |  || || | | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||    | ||||| || ||  |||| ||| ||||||| ||     
4678915 gcgcgggagtaatattgatgatgttgttcttgtgggtggttcatcgaggattcccaaagtgcaggatctattgcaagacttttttaagcggaaggatttg 4679014  T
619 tgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
4679015 tgcaagagtatcaacccagatgaggctgttgcttatggtg 4679054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 437 - 485
Target Start/End: Original strand, 52549288 - 52549336
Alignment:
437 gggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||    
52549288 gggccaagtttgaggaaatgaatatggacctttttaaggagtgtatgaa 52549336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 35132758 - 35132129
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcaga-taatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttg-ataa 116  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||  |||| ||||||||| | |||||| || |||||| || | ||    
35132758 ggtgctattgctggtcccaatgttatg-agagtaatgaatgaacctactgccgcagcggttgcatatggccttgacaagagatctgattgtgctggagaa 35132660  T
117 gagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagac 216  Q
     | |||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||  ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
35132659 ca-aaatatttttgtcttcgatcttggtggtggcacttttgatgtttcaatacttactattaaggataatgtcttccaagttaaggccactgccggaaac 35132561  T
217 actcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaag 316  Q
    ||||| || || ||  | ||||||||||||| ||||||| |  |||||||  | ||||||| ||  ||| ||||||  || ||||||| |||||||||||    
35132560 actcatctcggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtacaagagttcaagagaaagaacaaagtagacattagtgggaattcaaaag 35132461  T
317 ccttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgaactagatgctatatataaaggtattga 416  Q
    ||||         ||||||||| ||  | | |||||| ||  ||||||| | |     ||  ||||  |||||| ||||| || ||| | |||| |||||    
35132460 cctt---------gagaactgcctgctagagggcaaagagatcactttctttccttgttgttgccaatattgaagtagattctttatttcaaggcattga 35132370  T
417 cttctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaag 516  Q
     || | ||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||    |||| ||| |  ||||||||||||| ||  | | ||||||   ||||||||||    
35132369 tttttcttcatcaatcaatcgcgccaagtttgaggaaatgaatgcagacctttttaatgagtgtatgaataccgtagagagttgtctcattgatgctaag 35132270  T
517 atggacaagaata-gtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaa 615  Q
    ||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||||||| ||  |  ||||||| ||||||||     
35132269 atggacaagagcaagggtagatgatgttgttcttgttggagggtcttctaggattcccaaagtgcagcagctattgcaaaactttttcaaagggaaggag 35132170  T
616 ttatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 656  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
35132169 ttgtgcaagagcattaaccccgatgaggctgtagcttatgg 35132129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 508 - 656
Target Start/End: Original strand, 23596932 - 23597080
Alignment:
508 gatgctaagatggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaagg 607  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||| || ||   ||| || || || ||  | ||||| |    
23596932 gatgctaagatggataagaacagtgttgatgatgttgttcttgttggcggatcgactaggattcccaaggttcaacaacttttgcaagatttcttcaatg 23597031  T
608 ggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 656  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23597032 ggaaggaactttgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 23597080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 30775169 - 30775002
Alignment:
412 attgacttctgttcctcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatg 511  Q
    |||||||| | ||| ||||| || || | ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||  | |||||| | | ||||||| |||||     
30775169 attgacttttcttcatcaatcactcgtgtcaagtttgaggaaatcaatatggacctttttaatgagtgtatacagactgttgagagttgtcttactgatt 30775070  T
512 ctaagatggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtg 579  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
30775069 caaaggtagacaagagtagtgtagatgatattgttcttgtcggtggttcttctaggattcccaaagtg 30775002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Original strand, 9335755 - 9335984
Alignment:
25 attgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaata 124  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | ||||||  | | |||| || |||  ||||||    
9335755 attgctggccttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgataagagaaatgactgtgatggtaaccgaaata 9335854  T
125 tttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacct 224  Q
    ||||| ||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||| |||||    || | || ||||| || ||||| || ||| |||| |||||    
9335855 tttttgtctttgatctgggtggcggtacttttgatgtgtctatcctcacaattaagggtgatctatttgaagtaaaagccaccgcaggaaacacgcacct 9335954  T
225 aggaggtcaagactttgataacataatggt 254  Q
     |||||  | ||||||||||||| ||||||    
9335955 tggaggcgaggactttgataacagaatggt 9335984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30775562 - 30775219
Alignment:
19 ggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaga 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || ||||| || ||| |||| ||||| ||| | ||||||| ||  |||| || | |||    
30775562 ggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgaga 30775463  T
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacac 218  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||   |  |||| || ||||| || || ||||| ||| ||||    
30775462 ggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaactgctggaaacac 30775363  T
219 tcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagcc 318  Q
    |||| | || ||  | ||||||||||||| |||| || || |||||||  |||| || | ||  ||| |||| | ||| ||||  | |||| ||| |||     
30775362 tcacatcgggggagaggactttgataacagaatgttgaattactttgtagaggaatttaagacgaagaacaacgtggacattaccgggaatccaagagct 30775263  T
319 ttaaggaggctgagaactgcttgtgaaaaggcaaaaaggacact 362  Q
    || ||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
30775262 ttgagacagttgagaactgcatgtgaaaaggcaaaaaggacact 30775219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 535 - 658
Target Start/End: Original strand, 9336265 - 9336388
Alignment:
535 gatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaacc 634  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||  | | ||||| |  ||  |||||||||||||||||||||  | | | |||||||    
9336265 gatgatattgttcttgtgggtggctcgtctaggattccgaaagtgcaagaactattgctagaatttttcaaggggaaggaattattcatgggtatcaacc 9336364  T
635 ctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
9336365 cagatgaggctgttgcttatggtg 9336388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 656
Target Start/End: Original strand, 23588080 - 23588228
Alignment:
508 gatgctaagatggacaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagattttcaagg 607  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| || ||   ||| || || || ||  | ||||| |    
23588080 gatgctaagatggataagaacagtgtccatgatgttgttcttgttggtggatccactaggattcccaaggttcaacaacttttgcaagatttcttcaatg 23588179  T
608 ggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatgg 656  Q
    | |||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
23588180 gaaaggagctttgtaagagcatcaaccccgatgaagctgttgcatatgg 23588228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 28219640 - 28219589
Alignment:
607 gggaaggaattatgtaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 658  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
28219640 gggaaggaattgtgtaagagcattaaccctgatgaggctgttgcttatggtg 28219589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28220161 - 28220115
Alignment:
119 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtct 165  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
28220161 gaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtct 28220115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11133121 - 11133068
Alignment:
202 gccactgccggagacactcacctaggaggtcaagactttgataacataatggtg 255  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| |||||||    
11133121 gccactgctggagatactcacctcgggggacaagactttgataacacaatggtg 11133068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University