View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13512_high_2 (Length: 385)

Name: NF13512_high_2
Description: NF13512
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13512_high_2
NF13512_high_2
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (1-366)||(3415322-3415687)
chr6 (69-239)||(29518911-29519079)
chr6 (69-238)||(29518495-29518662)
chr6 (69-238)||(32741171-32741338)
chr6 (80-238)||(3409251-3409407)
chr6 (46-239)||(2378117-2378308)
chr6 (70-238)||(35210196-35210362)
chr6 (69-239)||(3409651-3409819)
chr6 (46-228)||(2578419-2578598)
chr6 (47-228)||(16454577-16454756)
chr6 (69-237)||(1846741-1846907)
chr6 (70-230)||(2579872-2580030)
chr6 (47-228)||(2377756-2377935)
chr6 (59-224)||(16454913-16455076)
chr6 (66-238)||(3058218-3058388)
chr6 (47-228)||(16107680-16107861)
chr6 (94-238)||(26544041-26544185)
chr6 (48-230)||(10074341-10074521)
chr6 (69-238)||(14748341-14748504)
chr6 (59-238)||(1127352-1127529)
chr6 (46-224)||(2843560-2843737)
chr6 (59-229)||(2578824-2578991)
chr6 (70-230)||(10073991-10074149)
chr6 (122-225)||(32460630-32460733)
chr6 (59-230)||(593696-593867)
chr6 (94-227)||(1950207-1950340)
chr6 (47-230)||(10073593-10073772)
chr6 (78-225)||(2579500-2579645)
chr6 (70-228)||(5832027-5832182)
chr6 (139-228)||(16108065-16108154)
chr6 (73-227)||(6999799-6999951)
chr6 (114-230)||(10911565-10911682)
chr6 (105-224)||(9062383-9062501)
chr6 (70-228)||(2579109-2579261)
chr6 (114-230)||(8481927-8482042)
chr6 (114-235)||(5958645-5958766)
chr6 (105-230)||(6071132-6071257)
chr6 (59-230)||(12071680-12071849)
chr6 (114-230)||(12092524-12092640)
chr6 (112-215)||(2975567-2975670)
chr6 (82-230)||(12085046-12085191)
chr6 (58-226)||(17135057-17135223)
chr6 (59-230)||(31714671-31714837)
chr6 (157-210)||(35210498-35210551)
chr6 (152-193)||(14789284-14789325)
chr6 (118-162)||(22605301-22605345)
chr6 (78-126)||(3409405-3409451)
chr6 (202-230)||(7588354-7588382)
chr6 (114-162)||(11637763-11637811)
chr6 (118-162)||(21130103-21130147)
chr6 (178-230)||(33605654-33605706)
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (48-239)||(3669678-3669867)
chr8 (78-238)||(3670052-3670210)
chr8 (69-238)||(1014244-1014411)
chr8 (78-239)||(30441072-30441235)
chr8 (78-239)||(1013879-1014038)
chr8 (72-228)||(3038292-3038446)
chr8 (69-228)||(34835211-34835368)
chr8 (94-238)||(20870595-20870741)
chr8 (78-228)||(34834878-34835026)
chr8 (59-230)||(45121899-45122068)
chr8 (80-230)||(45122067-45122215)
chr8 (94-227)||(147454-147587)
chr8 (78-201)||(9483195-9483316)
chr8 (47-228)||(40518584-40518763)
chr8 (59-223)||(9482593-9482755)
chr8 (70-228)||(25561815-25561972)
chr8 (69-216)||(45122638-45122783)
chr8 (78-228)||(37544498-37544646)
chr8 (78-236)||(40579514-40579670)
chr8 (94-228)||(30359611-30359745)
chr8 (94-228)||(33113389-33113523)
chr8 (78-230)||(9608745-9608895)
chr8 (69-228)||(34835476-34835634)
chr8 (69-228)||(34835742-34835900)
chr8 (60-230)||(6876852-6877021)
chr8 (47-230)||(9309355-9309535)
chr8 (104-228)||(30359273-30359397)
chr8 (60-228)||(40518071-40518239)
chr8 (46-230)||(8918742-8918922)
chr8 (94-223)||(70296-70425)
chr8 (68-228)||(1513913-1514071)
chr8 (47-220)||(18371970-18372142)
chr8 (78-239)||(6731895-6732045)
chr8 (78-230)||(5420651-5420801)
chr8 (70-230)||(5915872-5916025)
chr8 (60-239)||(6651496-6651662)
chr8 (95-230)||(41972158-41972296)
chr8 (49-230)||(9308977-9309160)
chr8 (69-230)||(45123006-45123165)
chr8 (94-230)||(147829-147956)
chr8 (152-238)||(41416251-41416335)
chr8 (78-226)||(18380027-18380171)
chr8 (45-236)||(32305478-32305660)
chr8 (117-227)||(43274824-43274934)
chr8 (94-207)||(9609108-9609221)
chr8 (80-227)||(32640542-32640682)
chr8 (78-228)||(45121664-45121811)
chr8 (69-223)||(18371660-18371807)
chr8 (158-227)||(18372785-18372854)
chr8 (114-230)||(4154708-4154824)
chr8 (50-155)||(40579249-40579352)
chr8 (158-227)||(18372342-18372411)
chr8 (114-193)||(9507819-9507898)
chr8 (114-228)||(8794113-8794227)
chr8 (126-226)||(18372988-18373085)
chr8 (68-148)||(8919142-8919220)
chr8 (48-230)||(9620656-9620834)
chr8 (122-228)||(18372656-18372758)
chr8 (157-220)||(25561729-25561792)
chr8 (140-227)||(3037776-3037865)
chr8 (114-230)||(4154323-4154438)
chr8 (98-226)||(43398094-43398225)
chr8 (94-230)||(12283873-12284008)
chr8 (186-227)||(18372485-18372526)
chr8 (178-230)||(20995507-20995559)
chr8 (59-145)||(41129073-41129157)
chr8 (242-306)||(14919017-14919081)
chr8 (138-194)||(18373236-18373292)
chr8 (104-230)||(5274775-5274901)
[»] chr1 (67 HSPs)
chr1 (45-239)||(44290433-44290625)
chr1 (60-239)||(44290814-44290992)
chr1 (69-230)||(41142372-41142532)
chr1 (70-238)||(3537599-3537765)
chr1 (78-238)||(3550712-3550867)
chr1 (47-228)||(26661499-26661678)
chr1 (66-239)||(48588484-48588655)
chr1 (103-236)||(32594747-32594880)
chr1 (70-238)||(41759475-41759641)
chr1 (79-230)||(41157375-41157524)
chr1 (47-228)||(17294579-17294759)
chr1 (46-230)||(41156991-41157176)
chr1 (47-230)||(22077472-22077653)
chr1 (47-230)||(34364507-34364688)
chr1 (95-228)||(26661921-26662054)
chr1 (78-230)||(34364925-34365075)
chr1 (46-228)||(11977282-11977463)
chr1 (63-222)||(14318875-14319032)
chr1 (63-230)||(29798199-29798364)
chr1 (47-230)||(31767138-31767319)
chr1 (78-229)||(40082408-40082556)
chr1 (68-239)||(45493972-45494146)
chr1 (47-238)||(50052001-50052189)
chr1 (79-228)||(37556113-37556260)
chr1 (47-226)||(9955911-9956090)
chr1 (45-238)||(32168672-32168853)
chr1 (47-230)||(45084382-45084557)
chr1 (94-233)||(38804377-38804516)
chr1 (46-230)||(5319942-5320123)
chr1 (151-239)||(3537226-3537314)
chr1 (69-228)||(34649440-34649597)
chr1 (59-230)||(3875320-3875489)
chr1 (136-230)||(41184489-41184583)
chr1 (79-227)||(37555733-37555878)
chr1 (70-230)||(37850600-37850758)
chr1 (47-230)||(66449-66630)
chr1 (47-230)||(39066178-39066358)
chr1 (78-230)||(24600322-24600472)
chr1 (114-240)||(44043814-44043945)
chr1 (47-230)||(22077806-22077986)
chr1 (47-224)||(5575110-5575284)
chr1 (121-230)||(66136-66247)
chr1 (94-229)||(22793279-22793415)
chr1 (78-220)||(5528762-5528902)
chr1 (51-193)||(22077092-22077231)
chr1 (81-230)||(24131999-24132143)
chr1 (49-230)||(19283434-19283613)
chr1 (124-230)||(30630690-30630796)
chr1 (151-230)||(21378120-21378199)
chr1 (136-230)||(44685456-44685551)
chr1 (94-228)||(45839629-45839767)
chr1 (69-148)||(11977026-11977103)
chr1 (183-230)||(35154150-35154197)
chr1 (178-230)||(50469187-50469239)
chr1 (46-160)||(50051665-50051776)
chr1 (114-230)||(1188630-1188746)
chr1 (115-175)||(35154046-35154106)
chr1 (198-238)||(50051777-50051817)
chr1 (114-208)||(10351182-10351276)
chr1 (114-148)||(12466365-12466399)
chr1 (165-238)||(4266875-4266948)
chr1 (179-230)||(4878803-4878854)
chr1 (122-193)||(4956228-4956299)
chr1 (136-175)||(41184152-41184191)
chr1 (154-215)||(44091909-44091970)
chr1 (198-230)||(22077248-22077280)
chr1 (178-230)||(47379891-47379943)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (47-234)||(37105920-37106105)
chr2 (60-239)||(5542615-5542792)
chr2 (72-239)||(37106179-37106344)
chr2 (69-239)||(36178604-36178772)
chr2 (78-239)||(5543006-5543165)
chr2 (47-228)||(6421387-6421566)
chr2 (47-238)||(14745643-14745833)
chr2 (59-238)||(41283464-41283641)
chr2 (47-230)||(42514649-42514830)
chr2 (78-228)||(15880265-15880413)
chr2 (60-230)||(962598-962766)
chr2 (69-214)||(6422126-6422269)
chr2 (59-228)||(6712978-6713146)
chr2 (47-239)||(14745269-14745461)
chr2 (60-230)||(35580714-35580881)
chr2 (46-212)||(36178147-36178311)
chr2 (95-239)||(7598600-7598736)
chr2 (78-228)||(36005888-36006035)
chr2 (71-230)||(38796619-38796778)
chr2 (78-223)||(15511503-15511646)
chr2 (46-225)||(33731653-33731832)
chr2 (69-228)||(40733519-40733676)
chr2 (123-238)||(36178320-36178435)
chr2 (94-226)||(28254261-28254391)
chr2 (73-230)||(40679632-40679787)
chr2 (94-230)||(12529050-12529186)
chr2 (46-217)||(23346250-23346418)
chr2 (114-230)||(28531356-28531472)
chr2 (80-238)||(1769884-1770040)
chr2 (47-230)||(7598228-7598409)
chr2 (78-230)||(37632605-37632755)
chr2 (123-230)||(16542449-16542556)
chr2 (122-230)||(31468800-31468904)
chr2 (94-228)||(5367457-5367591)
chr2 (94-219)||(40163394-40163520)
chr2 (71-230)||(29676903-29677065)
chr2 (142-227)||(31899496-31899581)
chr2 (122-230)||(33953821-33953929)
chr2 (152-230)||(38796298-38796376)
chr2 (48-168)||(6421793-6421911)
chr2 (116-228)||(29874067-29874179)
chr2 (122-230)||(33561501-33561609)
chr2 (69-228)||(40733885-40734041)
chr2 (78-230)||(16590888-16591033)
chr2 (114-227)||(31259658-31259774)
chr2 (112-222)||(37895101-37895211)
chr2 (114-230)||(30323464-30323580)
chr2 (47-222)||(29676543-29676709)
chr2 (177-230)||(36785668-36785721)
chr2 (46-175)||(3673123-3673250)
chr2 (114-230)||(30313178-30313293)
chr2 (125-214)||(28254165-28254254)
chr2 (99-188)||(31385779-31385868)
chr2 (68-168)||(6421688-6421786)
chr2 (122-230)||(29873587-29873695)
chr2 (99-175)||(36784287-36784363)
chr2 (118-230)||(37894738-37894850)
chr2 (69-158)||(3672773-3672860)
chr2 (123-230)||(41678419-41678527)
chr2 (114-227)||(9231252-9231365)
chr2 (182-228)||(6421306-6421352)
chr2 (198-230)||(33954387-33954419)
chr2 (114-163)||(28226404-28226453)
chr2 (114-159)||(28226726-28226770)
chr2 (194-230)||(3673085-3673121)
chr2 (123-227)||(12910231-12910335)
chr2 (126-166)||(35580494-35580534)
chr2 (198-230)||(43443108-43443140)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (59-238)||(6500443-6500619)
chr5 (68-230)||(40296313-40296473)
chr5 (46-238)||(27502012-27502202)
chr5 (67-238)||(32487386-32487554)
chr5 (45-238)||(18603095-18603286)
chr5 (59-239)||(6500814-6500991)
chr5 (49-240)||(9498634-9498822)
chr5 (69-237)||(41170627-41170793)
chr5 (94-230)||(13415782-13415918)
chr5 (60-230)||(15370099-15370267)
chr5 (71-233)||(36492218-36492378)
chr5 (47-239)||(624187-624378)
chr5 (59-227)||(3295334-3295498)
chr5 (59-228)||(6224198-6224365)
chr5 (60-228)||(42405588-42405752)
chr5 (47-228)||(1028493-1028673)
chr5 (68-230)||(41632782-41632942)
chr5 (69-230)||(3295014-3295172)
chr5 (47-227)||(25327938-25328117)
chr5 (69-229)||(299490-299648)
chr5 (59-230)||(36568558-36568725)
chr5 (46-228)||(24489182-24489360)
chr5 (69-223)||(11416976-11417128)
chr5 (114-228)||(26074614-26074728)
chr5 (95-233)||(29549278-29549416)
chr5 (60-220)||(34753015-34753173)
chr5 (114-230)||(26074188-26074304)
chr5 (69-230)||(12662651-12662810)
chr5 (78-228)||(26075169-26075318)
chr5 (94-238)||(5723813-5723957)
chr5 (109-228)||(26074818-26074938)
chr5 (114-230)||(35150007-35150122)
chr5 (69-238)||(623810-623977)
chr5 (78-218)||(33747783-33747921)
chr5 (59-193)||(15370439-15370571)
chr5 (47-228)||(300961-301132)
chr5 (62-228)||(35167830-35167994)
chr5 (122-229)||(36521946-36522053)
chr5 (151-228)||(26074320-26074397)
chr5 (78-225)||(38427553-38427697)
chr5 (155-238)||(7768842-7768925)
chr5 (132-228)||(42508614-42508710)
chr5 (54-227)||(2411010-2411181)
chr5 (105-227)||(41635224-41635346)
chr5 (69-230)||(26590909-26591068)
chr5 (60-144)||(26900007-26900089)
chr5 (114-230)||(31509623-31509740)
chr5 (94-146)||(795254-795306)
chr5 (101-227)||(36522266-36522392)
chr5 (107-227)||(35914852-35914972)
chr5 (98-216)||(31509745-31509864)
chr5 (170-227)||(6225047-6225104)
chr5 (114-163)||(13042606-13042655)
chr5 (151-228)||(39309686-39309762)
chr5 (190-244)||(5660284-5660338)
chr5 (181-238)||(22298956-22299014)
chr5 (94-143)||(38427306-38427355)
chr5 (132-228)||(42524719-42524814)
chr5 (116-163)||(13112604-13112651)
chr5 (184-222)||(26900082-26900120)
chr5 (114-172)||(32445943-32446001)
chr5 (188-230)||(35150747-35150789)
chr5 (188-230)||(35151038-35151080)
chr5 (198-228)||(36527209-36527239)
chr5 (118-162)||(41341523-41341567)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (47-228)||(35946524-35946704)
chr3 (69-239)||(22304560-22304728)
chr3 (46-230)||(29644557-29644739)
chr3 (72-228)||(43346793-43346947)
chr3 (50-230)||(29644882-29645060)
chr3 (61-230)||(33803243-33803410)
chr3 (54-230)||(12114546-12114720)
chr3 (47-230)||(42342364-42342546)
chr3 (69-228)||(37990638-37990795)
chr3 (94-238)||(39389062-39389206)
chr3 (69-230)||(32589704-32589862)
chr3 (67-230)||(25739422-25739583)
chr3 (71-228)||(37990978-37991133)
chr3 (78-240)||(39934963-39935125)
chr3 (48-228)||(3135432-3135617)
chr3 (72-230)||(15772854-15773010)
chr3 (50-228)||(25755396-25755572)
chr3 (47-228)||(52634678-52634856)
chr3 (94-239)||(4823646-4823791)
chr3 (58-228)||(32462888-32463057)
chr3 (47-230)||(54017793-54017974)
chr3 (69-230)||(54018197-54018356)
chr3 (67-228)||(22303952-22304104)
chr3 (47-230)||(42342067-42342248)
chr3 (98-223)||(3135099-3135224)
chr3 (69-230)||(41359764-41359919)
chr3 (47-230)||(53577364-53577546)
chr3 (46-230)||(15773192-15773376)
chr3 (69-230)||(21832344-21832501)
chr3 (81-230)||(39914252-39914399)
chr3 (66-230)||(45395649-45395811)
chr3 (78-230)||(31190017-31190159)
chr3 (95-238)||(50612470-50612618)
chr3 (109-238)||(51886553-51886676)
chr3 (114-230)||(8327904-8328020)
chr3 (70-228)||(45901715-45901872)
chr3 (94-228)||(49336708-49336843)
chr3 (45-228)||(32462534-32462715)
chr3 (114-230)||(1634356-1634473)
chr3 (122-228)||(33175711-33175820)
chr3 (114-229)||(53118017-53118131)
chr3 (177-239)||(22304237-22304299)
chr3 (60-238)||(37726496-37726664)
chr3 (66-230)||(44160543-44160702)
chr3 (47-146)||(41359467-41359565)
chr3 (81-172)||(22303670-22303759)
chr3 (114-230)||(47964560-47964676)
chr3 (113-220)||(42584863-42584970)
chr3 (114-227)||(11661954-11662068)
chr3 (78-230)||(9240149-9240299)
chr3 (123-239)||(3384317-3384433)
chr3 (106-201)||(33362327-33362422)
chr3 (138-227)||(7767380-7767469)
chr3 (163-228)||(11661537-11661602)
chr3 (177-230)||(43346650-43346703)
chr3 (47-160)||(54017524-54017636)
chr3 (114-163)||(53596027-53596076)
chr3 (114-163)||(53596342-53596391)
chr3 (114-230)||(47964957-47965073)
chr3 (135-230)||(39336292-39336387)
chr3 (46-148)||(7766758-7766857)
chr3 (118-227)||(25317161-25317270)
chr3 (122-227)||(46546375-46546480)
chr3 (120-180)||(52634990-52635050)
chr3 (121-188)||(12749211-12749278)
chr3 (118-176)||(17731950-17732008)
chr3 (118-176)||(19033181-19033239)
chr3 (114-228)||(25991405-25991519)
chr3 (69-121)||(22304302-22304352)
chr3 (104-149)||(39336002-39336047)
chr3 (114-163)||(53596542-53596591)
chr3 (59-126)||(8328374-8328439)
chr3 (114-147)||(11661603-11661636)
chr3 (198-230)||(12747878-12747910)
chr3 (118-162)||(16871005-16871049)
chr3 (45-89)||(25089720-25089764)
chr3 (198-230)||(33809134-33809166)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (47-238)||(37533341-37533530)
chr7 (47-239)||(37532988-37533177)
chr7 (47-230)||(1085593-1085774)
chr7 (49-228)||(30244272-30244449)
chr7 (59-230)||(22567028-22567196)
chr7 (69-230)||(23376-23535)
chr7 (70-230)||(7517580-7517738)
chr7 (47-223)||(11845198-11845372)
chr7 (114-239)||(14681501-14681626)
chr7 (47-228)||(30245079-30245254)
chr7 (108-236)||(29157559-29157687)
chr7 (68-230)||(24177435-24177595)
chr7 (104-230)||(7554025-7554151)
chr7 (78-230)||(36939741-36939891)
chr7 (69-230)||(40094773-40094932)
chr7 (69-228)||(6054562-6054719)
chr7 (69-228)||(45433243-45433400)
chr7 (121-230)||(22566711-22566820)
chr7 (95-228)||(45754718-45754850)
chr7 (114-230)||(16569196-16569312)
chr7 (114-230)||(16596350-16596466)
chr7 (94-222)||(19122740-19122867)
chr7 (80-228)||(45434638-45434784)
chr7 (72-224)||(34218036-34218186)
chr7 (70-230)||(118299-118459)
chr7 (60-225)||(30032572-30032735)
chr7 (114-228)||(47129097-47129211)
chr7 (47-227)||(9901648-9901824)
chr7 (95-227)||(24838724-24838857)
chr7 (94-230)||(8128463-8128599)
chr7 (94-230)||(36622960-36623096)
chr7 (109-230)||(40230328-40230449)
chr7 (46-230)||(41854635-41854815)
chr7 (104-230)||(1085280-1085407)
chr7 (49-188)||(30253534-30253667)
chr7 (72-209)||(37167808-37167937)
chr7 (157-230)||(30245494-30245567)
chr7 (114-230)||(36534826-36534942)
chr7 (132-227)||(41910654-41910749)
chr7 (109-230)||(43241495-43241616)
chr7 (142-230)||(28301613-28301701)
chr7 (96-227)||(20599317-20599450)
chr7 (157-230)||(30255339-30255412)
chr7 (70-149)||(47129450-47129527)
chr7 (45-184)||(28300227-28300366)
chr7 (160-230)||(30244701-30244771)
chr7 (162-230)||(36109007-36109075)
chr7 (180-230)||(40094502-40094552)
chr7 (72-142)||(37532753-37532821)
chr7 (114-163)||(21416183-21416232)
chr7 (193-236)||(14681281-14681324)
chr7 (114-161)||(23569044-23569091)
chr7 (78-147)||(28300576-28300644)
chr7 (112-163)||(21619085-21619136)
chr7 (47-129)||(30245256-30245336)
chr7 (178-228)||(36967335-36967385)
chr7 (114-175)||(4124130-4124191)
chr7 (118-162)||(27391815-27391859)
chr7 (46-129)||(30244453-30244534)
chr7 (46-129)||(30253671-30253752)
[»] chr4 (81 HSPs)
chr4 (61-238)||(55933113-55933288)
chr4 (79-239)||(50630762-50630920)
chr4 (47-238)||(41370349-41370538)
chr4 (47-230)||(25483336-25483517)
chr4 (60-230)||(54017583-54017751)
chr4 (47-230)||(3340807-3340988)
chr4 (71-228)||(36629239-36629394)
chr4 (69-233)||(50002423-50002585)
chr4 (71-230)||(1731646-1731803)
chr4 (47-230)||(36608636-36608817)
chr4 (80-230)||(52884695-52884844)
chr4 (71-228)||(39404400-39404555)
chr4 (47-230)||(10245920-10246101)
chr4 (72-228)||(39792860-39793014)
chr4 (94-215)||(54108928-54109048)
chr4 (59-230)||(44620660-44620828)
chr4 (114-238)||(49880152-49880276)
chr4 (98-230)||(4955341-4955473)
chr4 (61-230)||(22183253-22183420)
chr4 (114-230)||(52884887-52885004)
chr4 (47-211)||(54936215-54936376)
chr4 (70-228)||(36572021-36572177)
chr4 (59-228)||(39404020-39404187)
chr4 (66-227)||(50459724-50459883)
chr4 (69-220)||(54343005-54343147)
chr4 (121-230)||(2741071-2741180)
chr4 (78-227)||(49302907-49303056)
chr4 (47-230)||(22027936-22028117)
chr4 (70-221)||(44621011-44621160)
chr4 (46-228)||(45489306-45489485)
chr4 (61-230)||(4390090-4390257)
chr4 (114-228)||(34646689-34646803)
chr4 (114-228)||(41707505-41707618)
chr4 (59-230)||(2740700-2740867)
chr4 (68-224)||(20825842-20825996)
chr4 (78-230)||(32941129-32941279)
chr4 (78-230)||(49076837-49076986)
chr4 (69-239)||(18932746-18932925)
chr4 (66-230)||(22028363-22028527)
chr4 (70-221)||(44620362-44620511)
chr4 (78-224)||(20826223-20826367)
chr4 (104-215)||(45496820-45496931)
chr4 (94-229)||(16888836-16888971)
chr4 (46-229)||(16889510-16889691)
chr4 (47-231)||(54108537-54108718)
chr4 (107-238)||(6975489-6975620)
chr4 (46-230)||(34004559-34004739)
chr4 (46-230)||(3244425-3244607)
chr4 (68-175)||(23817677-23817782)
chr4 (122-217)||(54017750-54017845)
chr4 (136-230)||(49076510-49076604)
chr4 (46-230)||(3341128-3341310)
chr4 (114-230)||(54741218-54741334)
chr4 (114-228)||(43174508-43174623)
chr4 (178-238)||(50788087-50788147)
chr4 (47-230)||(51768035-51768216)
chr4 (82-228)||(19504707-19504842)
chr4 (47-184)||(18879852-18879987)
chr4 (69-190)||(43827480-43827598)
chr4 (78-175)||(31691207-31691304)
chr4 (46-230)||(3700365-3700539)
chr4 (114-230)||(28034229-28034345)
chr4 (164-222)||(44620304-44620362)
chr4 (141-230)||(10246347-10246436)
chr4 (114-225)||(760194-760304)
chr4 (94-228)||(40067045-40067180)
chr4 (114-201)||(48111738-48111825)
chr4 (164-230)||(44621426-44621492)
chr4 (122-208)||(3271806-3271895)
chr4 (46-224)||(45489688-45489864)
chr4 (156-230)||(11348410-11348484)
chr4 (114-216)||(15841408-15841510)
chr4 (114-163)||(11197293-11197342)
chr4 (164-228)||(44620946-44621011)
chr4 (182-230)||(45050601-45050649)
chr4 (114-188)||(34544148-34544223)
chr4 (114-176)||(10396185-10396247)
chr4 (200-238)||(18933096-18933134)
chr4 (114-224)||(15841025-15841134)
chr4 (114-163)||(10396483-10396532)
chr4 (98-230)||(23556890-23557022)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (47-228)||(491-670)
scaffold0702 (46-239)||(123-309)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (47-228)||(1083-1262)
scaffold0391 (114-183)||(1733-1802)
scaffold0391 (179-230)||(3092-3143)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (95-230)||(5777-5917)
scaffold0734 (79-230)||(5396-5546)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (110-230)||(17492-17614)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (69-230)||(47360-47519)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (114-230)||(5357-5473)
scaffold0078 (78-230)||(4982-5132)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (153-228)||(10192-10267)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3415687 - 3415322
Alignment:
Q  1 tgcataagagaatcacccaaaacaattacaaagtcaagttaccggttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3415687 tgcataagagaatcacccaaaacaattacaaagtcaagttaccggttgttgggtcacaaggggagcttgggggaccttccacatcgaggctagagaacaa 3415588  T
Q  101 ccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415587 ccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttat 3415488  T
Q  201 ctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacacaggtgccacaataaagatcaccgtgatatacaaactaaataatatgaagattacaccataa 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415487 gtgatgtgggacatataactcacactcgcaaaccaacacaggtgccacaataaagatcaccgtgatatacaaactaaataatatgaagattacaccataa 3415388  T
Q  301 cacccacacagaaaagatagcaatttgaccttgtctgatatgctctgttaatccaaattaaagcct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3415387 cacccacacagaaaagatagcaatttgaccttgtctgatatgctatgttaatccaaattaaagcct 3415322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29519079 - 29518911
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29519079 gggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctctt 29518982  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518981 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 29518911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29518662 - 29518495
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29518662 gggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctctt 29518565  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518564 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32741338 - 32741171
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32741338 gggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctctt 32741241  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741240 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32741171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409251
Alignment:
Q  80 cacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggt 179  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3409407 cacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 3409310  T
Q  180 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409309 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2378308 - 2378117
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||| || | || | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2378308 ttgttgggtcactagagaagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaag 2378211  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378210 gtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 2378117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35210362 - 35210196
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35210362 ggggaccgtccacatcgaggctagag--caaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctctta 35210265  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210264 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 35210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3409819 - 3409651
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3409819 gggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctctt 3409722  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409721 acttataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgcaaaccaacac 3409651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Original strand, 2578419 - 2578598
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||  ||||| | | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2578419 ttgttgggtcatgaggggggctagggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 2578516  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2578517 gctatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttg 2578598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16454756 - 16454577
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  16454756 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaagg 16454659  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454658 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttg 16454577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1846907 - 1846741
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  1846907 gggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctctt 1846810  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  1846809 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgcaacccaac 1846741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 2579872 - 2580030
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2579872 ggggaccttccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctctta 2579969  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579970 cttataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2580030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2377935 - 2377756
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2377935 tgttgggtcactggggaagctcgggggaccttccacatcgaggct--agaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 2377838  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2377837 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16455076 - 16454913
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  16455076 aggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttat 16454979  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 224  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454978 gggtcctattacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcaca 16454913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3058388 - 3058218
Alignment:
Q  66 tttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcct 165  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |  ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3058388 tttgggggacggtccacatcgaggtt--agaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcct 3058291  T
Q  166 cttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3058290 catacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttgcaaaccaaca 3058218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16107861 - 16107680
Alignment:
Q  47 tgttgggtcac--aaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaa 144  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16107861 tgttgggtcactgaaggggagttaggggtaccacccacatcgaggctagag--caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 16107764  T
Q  145 ggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  16107763 ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttg 16107680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26544185 - 26544041
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26544185 agaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaacctttact 26544086  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26544085 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 26544041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 10074341 - 10074521
Alignment:
Q  48 gttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggc 147  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10074341 gttgggtcacaaggggagcctgggggactatccacatcgaggct--agaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 10074438  T
Q  148 aacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  10074439 aatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgca 10074521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Original strand, 14748341 - 14748504
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||    ||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  14748341 gggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctctt 14748434  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14748435 atttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaatcaaca 14748504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1127529 - 1127352
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||| | |||  ||||| || ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  1127529 aggggagctttggggaccacccacatcgaggttagag--caaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttat 1127432  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1127431 gagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcacagttgcaaaccaaca 1127352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2843737 - 2843560
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2843737 ttgttggatcatgaggggagttagggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaag 2843640  T
Q  146 gcaacgggtttatggg-tcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 224  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  2843639 gcaatgagtttatggggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 229
Target Start/End: Original strand, 2578824 - 2578991
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||    
T  2578824 aggggagcctgggggaccgtccacatcgagg-tc-agaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttat 2578921  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgc 229  Q
    || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2578922 ggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgc 2578991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 10073991 - 10074149
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||  | |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10073991 ggggaccgtccacgtcgaggct--agaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 10074088  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10074089 cttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgca 10074149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  222 acac 225  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Original strand, 593696 - 593867
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagaca--ccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggttt 156  Q
    ||||||| | |||||||| || |||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||    
T  593696 aggggagctcgggggaccgtcaacatcgagcct--agaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggttt 593793  T
Q  157 atgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  593794 atgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Original strand, 1950207 - 1950340
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1950207 agaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 1950306  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1950307 cttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 10073593 - 10073772
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| |||||||  ||  ||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  10073593 tgttgggtcacgaggggagcctgaaggaccgtccacatcgatgct--agaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagc 10073690  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10073691 caatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttac--ttttctccgatgtgggacatataactaacacttgca 10073772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 225
Target Start/End: Original strand, 2579500 - 2579645
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |    
T  2579500 tccacatcgaggtt--agaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataag 2579597  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacac 225  Q
    || | | ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2579598 gtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 228
Target Start/End: Original strand, 5832027 - 5832182
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||    || ||||||||||||||||    
T  5832027 ggggaccgtctacatcgaggct--agaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaaggggt-ggctttatgggtcctctta 5832123  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  5832124 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttg 5832182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16108154 - 16108065
Alignment:
Q  139 ccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16108154 ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttg 16108065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 227
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999951
Alignment:
Q  73 gaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttactt 172  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |    
T  6999799 gaccgtccacatcgagact--agaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacat 6999896  T
Q  173 atatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6999897 ataaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10911682 - 10911565
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttac-tattttatctgatgtgggac 212  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  10911682 agagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggac 10911583  T
Q  213 atataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10911582 atataactcacacttgca 10911565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  105 acaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctga 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  205 tgtgggacatataactcaca 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 228
Target Start/End: Original strand, 2579109 - 2579261
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| |  | |||||||||| ||||||||    
T  2579109 ggggaccgtgcacatcgaggct--agaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagttatgggtttatggttcctctta 2579206  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
        || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2579207 ----taaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttg 2579261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8482042 - 8481927
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||| ||| | |||||  |||||||||||  ||| || |||||||||| |||||    
T  8482042 agagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-ggaca 8481944  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  8481943 tataactcacacttgca 8481927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Original strand, 5958645 - 5958766
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||| ||||| ||| | ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||    
T  5958645 agagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacaca 5958744  T
Q  214 tataactcacacttgcaaacca 235  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  5958745 tataactcacaattgcacacca 5958766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6071257 - 6071132
Alignment:
Q  105 acaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctga 204  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||| || ||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||   |    
T  6071257 acaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttctattcaa 6071158  T
Q  205 tgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6071157 tgtgggacatataactcacacttgca 6071132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Original strand, 12071680 - 12071849
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    ||||||| || ||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||    
T  12071680 aggggagcttaggggaccgttcacatcgaggct--agaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttat 12071777  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | ||||| |   |||||  |||||||| ||  | | || ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12071778 gagtcctttctattataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttgca 12071849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 12092524 - 12092640
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||    
T  12092524 agagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggaca 12092623  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    | |||| ||| ||||||    
T  12092624 tctaacacacccttgca 12092640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2975670 - 2975567
Alignment:
Q  112 aaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 211  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||| || |||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  2975670 aaagagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtggga 2975571  T
Q  212 cata 215  Q
    ||||    
T  2975570 cata 2975567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Original strand, 12085046 - 12085191
Alignment:
Q  82 catcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgt 181  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||| |   |||||  ||||    
T  12085046 catcgaggct--agaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttatgagtcctttctattataaagtgt 12085143  T
Q  182 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| ||  ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12085144 tcaaactccact-ttctatctgatgcaggacatataactcacacttgca 12085191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 17135057 - 17135223
Alignment:
Q  58 aaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggttta 157  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| | ||||| ||    ||| | |||||    
T  17135057 aaggggagtctgggggaccgtccacatcaaggc-cg-gaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagttta 17135154  T
Q  158 tgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacact 226  Q
    ||  ||||||| |||||| ||| || ||| ||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17135155 tgaatcctcttgcttataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31714837 - 31714671
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||    
T  31714837 aggggagtctgggagaccgtccacatcgaggctagag--caaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaat 31714741  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||| | ||||||   |||||||||  ||| || |||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  31714740 gggtcctctca-ttatataacgttcaacctccacttttctatccgatgtaggacatat-agtcacacttgca 31714671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210498
Alignment:
Q  157 atgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtggg 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg 35210498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 193
Target Start/End: Original strand, 14789284 - 14789325
Alignment:
Q  152 ggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14789284 ggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605345
Alignment:
Q  118 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggt 162  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22605345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3409451 - 3409405
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacac 126  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3409451 tccacatcgaggct--agaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 230
Target Start/End: Original strand, 7588354 - 7588382
Alignment:
Q  202 tgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7588354 tgatgtgggacatataactcacacttgca 7588382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 162
Target Start/End: Original strand, 11637763 - 11637811
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggt 162  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  11637763 agagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 11637811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Original strand, 21130103 - 21130147
Alignment:
Q  118 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggt 162  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  21130103 acaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggt 21130147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33605706 - 33605654
Alignment:
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33605706 gtgttcaacctccacttttctatctgatgtgagacatatagctcacacttgca 33605654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3669867 - 3669678
Alignment:
Q  48 gttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggc 147  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3669867 gttgggtcacgaggggagctagggggaccatccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 3669770  T
Q  148 aacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669769 aatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 3669678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3670210 - 3670052
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |    
T  3670210 tccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttataag 3670113  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670112 gtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3670052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Original strand, 1014244 - 1014411
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  1014244 ggggaaccatccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctctt 1014341  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014342 acttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30441235 - 30441072
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatat- 176  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  30441235 tccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataat 30441138  T
Q  177 ---ggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
       ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441137 taaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 30441072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 239
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014038
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  1013879 tccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagg 1013976  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013977 gtgttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgcaaaccaacac 1014038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 3038292 - 3038446
Alignment:
Q  72 ggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 171  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3038292 ggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttact 3038389  T
Q  172 tatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3038390 tataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3038446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34835368 - 34835211
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| || |||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34835368 gggggaccgtctacatcgaggct--agaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctctt 34835271  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34835270 acttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttg 34835211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Original strand, 20870595 - 20870741
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20870595 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttact 20870694  T
Q  194 attttatctgatgtgggac--atataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20870695 attttatctgatgtggaacatatataactcacacttgcaaaccaaca 20870741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834878
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  34835026 tccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataag 34834929  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34834928 gtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 34834878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Original strand, 45121899 - 45122068
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| | ||||||    
T  45121899 aggggagcctgggggaccttccacatcgaggcttga--ataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttat 45121996  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45121997 gagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122215
Alignment:
Q  80 cacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggt 179  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||| |||    
T  45122067 cacatcgaggct--agaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggt 45122164  T
Q  180 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122165 gttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 45122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 147587 - 147454
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  147587 agaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctttact 147488  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  147487 cttttatccgatgtgggacatataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 201
Target Start/End: Original strand, 9483195 - 9483316
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  9483195 tccacatcgaggct--agaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataag 9483292  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatc 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  9483293 gtgttcaacctttactcttttatc 9483316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40518763 - 40518584
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| | ||||| |  | ||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||||||     
T  40518763 tgttgggtcactacgggagctcagaggaccgtccacattgaggct--agaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagt 40518666  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40518665 cattgggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 223
Target Start/End: Original strand, 9482593 - 9482755
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||||    
T  9482593 aggggagttatgggaaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttat 9482690  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  9482691 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 228
Target Start/End: Original strand, 25561815 - 25561972
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacca-aaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  25561815 ggggaccttccacatcgaggctagag--caaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctt 25561912  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561913 acttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25561972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45122783 - 45122638
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  45122783 gggggaccttccacatcgaggcttga--acaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctt 45122686  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatat 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  45122685 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgcgggccatat 45122638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 37544498 - 37544646
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| | || || ||||||||||||||| ||||||      
T  37544498 tccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttcttataat 37544595  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  37544596 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 236
Target Start/End: Original strand, 40579514 - 40579670
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |    
T  40579514 tccacatcgaggat--agaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataag 40579611  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  40579612 gtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttggaaaccaa 40579670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30359745 - 30359611
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30359745 agaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttact 30359646  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359645 cttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 30359611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Original strand, 33113389 - 33113523
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  33113389 agaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagacgttcaacctttact 33113488  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  33113489 attttatccgatgtaggacatataactcaaacttg 33113523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9608895 - 9608745
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9608895 tccacatcgaggct--agaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataag 9608798  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9608797 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 9608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34835634 - 34835476
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| || |||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34835634 gggggaccgtctacatcgaggct--agaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctctt 34835537  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatc-tgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835536 acttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34835900 - 34835742
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| || |||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34835900 gggggaccgtctacatcgaggct--agaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctctt 34835803  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatc-tgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835802 acttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Original strand, 6876852 - 6877021
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| | || ||||    
T  6876852 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatg 6876949  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac-atataactcacacttgca 230  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6876950 ggtcatcttatttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgca 6877021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9309535 - 9309355
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |   | | |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  9309535 tgttgggtcactgggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacatactgaga-gagacaccacactcttacccgacaccttaagg 9309439  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309438 caatgagtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 9309355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30359397 - 30359273
Alignment:
Q  104 cacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctg 203  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |    
T  30359397 cacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccg 30359298  T
Q  204 atgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  30359297 atgtgagacatataactcacacttg 30359273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40518239 - 40518071
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  40518239 ggggagctcgggggaccgtccacatcaaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatg 40518142  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttac--tattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518141 ggtccatttacttataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 8918742 - 8918922
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  | ||||||| |||| |||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  8918742 ttgttgggtcacgaggggagct--ggggaccgtccacatcgaggtt--aaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaag 8918837  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8918838 tcaataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgca 8918922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 70296 - 70425
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  70296 agaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacatttact 70395  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcac 223  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  70396 cttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 1513913 - 1514071
Alignment:
Q  68 tgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctct 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  1513913 tgggggaccgtccacatcgaggct--agaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctct 1514010  T
Q  168 tacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  1514011 tacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttg 1514071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 18371970 - 18372142
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttggggga-ccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||| || | ||||| |||||| |||  ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  18371970 tgttgggtcatgaggggagctcgggggaaccgttcacattgaggctagag--caaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaa 18372067  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataact 220  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18372068 gcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6732045 - 6731895
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||         
T  6732045 tccacatcgaggtt--agaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttactt----- 6731953  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6731952 ----tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaacaacac 6731895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5420801 - 5420651
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||||||  |  |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5420801 tccacatcgaggcttga--acaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag 5420704  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5420703 atgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttgca 5420651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5916025 - 5915872
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||        
T  5916025 ggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcct---- 5915932  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||  ||||| || ||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5915931 cttataaagtgtt-aaactttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 5915872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6651662 - 6651496
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||    
T  6651662 ggggagttagggggaccatccacatcgaggtt--agaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatg 6651565  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||| ||||||         | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6651564 ggttctctta---------ttttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataact--cacttgcaaaacaacac 6651496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41972296 - 41972158
Alignment:
Q  95 gaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaa---aaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaaccttta 191  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||| ||   ||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  41972296 gaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttcaaccttta 41972197  T
Q  192 ctattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972196 cttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41972158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9309160 - 9308977
Alignment:
Q  49 ttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacact---cttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || | |  | ||||||||||||||   ||| || |||||||| ||    
T  9309160 ttgggtcactgggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttag 9309064  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtg--ggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9309063 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgca 9308977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45123165 - 45123006
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactct--taccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctc 166  Q
    |||||||| |||||||||||  |  ||||||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||  |||||||||||| ||    
T  45123165 gggggaccgtccacatcgagatt--agaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatc 45123068  T
Q  167 ttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45123067 ttacttaa--ggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 45123006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 147956 - 147829
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||         ||||||| |||||||| ||||||    
T  147956 agaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgttcaacatttact 147866  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  147865 tttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 147829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 238
Target Start/End: Original strand, 41416251 - 41416335
Alignment:
Q  152 ggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41416251 ggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact--cacttgcaaaccaaca 41416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 18380027 - 18380171
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||||| |||  |||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||| || || |||||||||| |    
T  18380027 tccacatcgaagct--agaagaatcgcacaagcaa--gaggcaccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttacttataag 18380122  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  18380123 gtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32305660 - 32305478
Alignment:
Q  45 gttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaa 144  Q
    |||||| ||| || ||||||||  |||||||| |||||||| ||| |  |||||||| ||| ||| || | |||| ||||||||||| | |||| |||||    
T  32305660 gttgtttggttacgaggggagtcagggggaccgtccacatcaaggtt--agaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaa 32305563  T
Q  145 ggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 236  Q
    || || |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  32305562 ggtaatgggtttataggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-------cgacatataactcacacttgcaaaccaa 32305478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  117 gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatat 216  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  217 aactcacactt 227  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9609221 - 9609108
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9609221 agaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttact 9609122  T
Q  194 attttatctgatgt 207  Q
     || ||||||||||    
T  9609121 tttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Original strand, 32640542 - 32640682
Alignment:
Q  80 cacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggt 179  Q
    ||||||||||||  ||||||| | || |||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||     |    
T  32640542 cacatcgaggct--agaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----t 32640634  T
Q  180 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  32640635 gttcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 45121664 - 45121811
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || ||| || ||||| | |||||||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| |    
T  45121664 tccacatcgaggct--agaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataag 45121761  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  45121762 gtgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttg 45121811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Original strand, 18371660 - 18371807
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  18371660 ggggaaccgtccacatcgaagctagag--caaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggc-atgggtttatgggtcttctt 18371756  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 223  Q
    |||||     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18371757 actta----atgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  158 tgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 4154708 - 4154824
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||| | |||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||||    
T  4154708 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 4154807  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  4154808 tataactcacacttgca 4154824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 155
Target Start/End: Original strand, 40579249 - 40579352
Alignment:
Q  50 tgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaa 149  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  40579249 tgggtcaccaggggagctcgggggacagtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaa 40579346  T
Q  150 cgggtt 155  Q
     |||||    
T  40579347 tgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372411
Alignment:
Q  158 tgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9507898 - 9507819
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  9507898 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttact 9507819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8794227 - 8794113
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||  |   |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||    
T  8794227 agagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgagaca 8794128  T
Q  214 tataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||    
T  8794127 tataactcacacttg 8794113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373085
Alignment:
Q  126 ctcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacac 225  Q
    |||||||| |||||||   ||||| | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 148
Target Start/End: Original strand, 8919142 - 8919220
Alignment:
Q  68 tgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 148  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  8919142 tgggggaccgtccacatcgaagct--agaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 9620656 - 9620834
Alignment:
Q  48 gttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggc 147  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||| |||||||| ||||  |||  ||||| ||||||  | ||||||| || |||||||   |||| ||||||||    
T  9620656 gttgggtcacgaggggagcccgggggaccgtccacatccaggcctgag--caaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggc 9620751  T
Q  148 aacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| | |||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9620752 aatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgca 9620834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372758
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 221  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  222 acacttg 228  Q
    |||||||    
T  18372752 acacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  157 atgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataact 220  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 227
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  140 cttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac--atataactcacactt 227  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 4154323 - 4154438
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||||||||| |||||    
T  4154323 agagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggtc-tctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggaca 4154421  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4154422 tataactcacatttgca 4154438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Original strand, 43398094 - 43398225
Alignment:
Q  98 caaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctc---ttacttatatggtgttcaacctttacta 194  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||     
T  43398094 caaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataaggtgttcaacctttactt 43398193  T
Q  195 ttttatctgatgtgggacatataactcacact 226  Q
    || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  43398194 ttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12284008 - 12283873
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |   | ||||||| ||| | |||||| || | | |||||| ||||||    
T  12284008 agaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagactt-gagtttatgtgtcattttacttttaagatattcaacatttact 12283910  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12283909 tttttatctgacgtgggacatataacttacacttgca 12283873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  186 cctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Original strand, 20995507 - 20995559
Alignment:
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20995507 gtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 20995559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41129157 - 41129073
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||  |||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41129157 aggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtttga--acaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaag 41129073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14919081 - 14919017
Alignment:
Q  242 gtgccacaataaagatcaccgtgatatacaaactaaataatatgaagattacaccataacaccca 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  14919081 gtgccacaacaaagatcaccgcgaaataaaaacaaaataataagaagattacactctaacaccca 14919017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373292
Alignment:
Q  138 accttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttacta 194  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5274901 - 5274775
Alignment:
Q  104 cacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctg 203  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| |  |||||||||| ||  | |||||  ||||||||||| | || ||||||       
T  5274901 cacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttttattca 5274802  T
Q  204 atgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||    
T  5274801 atgtagaacatataactcatacttgca 5274775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 67)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 239
Target Start/End: Original strand, 44290433 - 44290625
Alignment:
Q  45 gttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaa 144  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44290433 gttgttgggtcactgggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaa 44290530  T
Q  145 ggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290531 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 44290625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 239
Target Start/End: Original strand, 44290814 - 44290992
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactctt-accaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44290814 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 44290911  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290912 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 44290992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41142532 - 41142372
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactctt-accaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctct 167  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  41142532 gggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttt 41142435  T
Q  168 tacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142434 tacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 238
Target Start/End: Original strand, 3537599 - 3537765
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  3537599 ggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctctta 3537696  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3537697 ctcataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacgtacaaaccaaca 3537765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3550867 - 3550712
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3550867 tccacatcgaggct--agaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag 3550773  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3550772 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgccaaccaaca 3550712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Original strand, 26661499 - 26661678
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26661499 tgttgggtcacgaggagagttagggggaccgtccatatcgaggcttga--acaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 26661596  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26661597 caatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 26661678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 239
Target Start/End: Original strand, 48588484 - 48588655
Alignment:
Q  66 tttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcct 165  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||| |    
T  48588484 tttgggcgaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtctt 48588581  T
Q  166 cttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48588582 cttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgcaaaccaacac 48588655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 236
Target Start/End: Original strand, 32594747 - 32594880
Alignment:
Q  103 gcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatct 202  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32594747 gcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatct 32594846  T
Q  203 gatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594847 gatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaa 32594880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759475
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggct--agaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatctta 41759544  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41759543 cttataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaaaccaaca 41759475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41157524 - 41157375
Alignment:
Q  79 ccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatgg 178  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41157524 ccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 41157427  T
Q  179 tgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157426 tgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 41157375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17294759 - 17294579
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaacc-gcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||||| |||  ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17294759 tgttaggtcacgaggggagctcgggcgaccgtccacatcgaggctagag--caacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 17294662  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17294661 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 17294579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41157176 - 41156991
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcac--aaggggagt-ttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaacctt 142  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41157176 ttgttgggtcactgaaggggagccttgggggaccgcccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaacctt 41157079  T
Q  143 aaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  41157078 aaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgca 41156991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 22077472 - 22077653
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||| ||  ||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22077472 tgttgggtcacaaggggagcctgggggaccgtccatatcgatgcttga--acaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagg 22077569  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22077570 ctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 22077653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34364688 - 34364507
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  |||||| |  ||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34364688 tgttgggtcactgggggagctcagggaaccatccacatcgaggctagag--caaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagg 34364591  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364590 ctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 34364507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662054
Alignment:
Q  95 gaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttacta 194  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactc 26662020  T
Q  195 ttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26662021 ttttatctgatatgggatatataactcacacttg 26662054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34365075 - 34364925
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||||||| | |||  |||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  34365075 tccacatcgaggttagag--caactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataag 34364978  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364977 gtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 34364925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11977463 - 11977282
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaagggga-gtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaa 144  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11977463 ttgttaggtcacaaagggaagttcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaa 11977366  T
Q  145 ggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||   |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11977365 ggcattaggtttatgagtgctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 11977282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14319032 - 14318875
Alignment:
Q  63 gagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggt 162  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  14319032 gagttcgggggaccgtccacattgaggct--agaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggt 14318935  T
Q  163 cctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactca 222  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  14318934 cttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29798364 - 29798199
Alignment:
Q  63 gagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggt 162  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  29798364 gagtttgggggaccgtctatatcgaggtt--agaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagt 29798267  T
Q  163 cctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29798266 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 29798199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 31767138 - 31767319
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31767138 tgttgggtcatgagggaagcttgggggaccgtccacatcgagtct--agaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaagg 31767235  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31767236 cattaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgca 31767319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40082556 - 40082408
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||| |    
T  40082556 tccacatcgaggct--agaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataag 40082460  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40082459 gtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgc 40082408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 239
Target Start/End: Original strand, 45493972 - 45494146
Alignment:
Q  68 tgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctct 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| || ||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| || |||    
T  45493972 tgggggaccgtccacatcgaggcttga--acaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatct 45494069  T
Q  168 tacttata----tggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatat-aactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45494070 tacttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgcaaaccaacac 45494146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 50052001 - 50052189
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||||| |  ||||||||  || || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  50052001 tgttgggtcacgaggggagctcgggggactgtccacatcgaggtt--agaacaaca-cataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaga 50052097  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50052098 aaataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttaaaaaccaaca 50052189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556113
Alignment:
Q  79 ccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatgg 178  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |     
T  37556260 ccacatcgaggcttga--acaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataaga 37556164  T
Q  179 tgttcaacctttacta-ttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37556163 tgttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 37556113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9956090 - 9955911
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| ||| |||  | |||||||   |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9956090 tgttgggtcacgaggagagcctaggggaccgctcacatcgaggctagag--caaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagg 9955993  T
Q  147 caacgggttt-atgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttac-tattttatctgatgtgggacatataactcacact 226  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9955992 caattggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 32168672 - 32168853
Alignment:
Q  45 gttgttgggtcacaaggggagt-ttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaacctta 143  Q
    ||||||||||||| |||||||  || ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  32168672 gttgttgggtcactaggggagccttaggggactgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctca 32168769  T
Q  144 aggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168770 aggcaatgggtttatgggtcctct------taaggtgttcaacctttactattttatc-----cgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32168853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45084557 - 45084382
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||  |||| ||  ||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  45084557 tgttgggtcatgagggaagcctgggggaccgtccgcatcgaggtt--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaag- 45084461  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
      |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084460 --acg---ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgca 45084382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 38804377 - 38804516
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38804377 agaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaacctttact 38804476  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 233  Q
     ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38804477 cttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaac 38804516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 5319942 - 5320123
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| ||| || |||| ||||||  ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5319942 ttgttgggtcacgaagggagcttgggg-accgtctacattgaggct--agaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaag 5320038  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    || | | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5320039 gctatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 5320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 239
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537314
Alignment:
Q  151 gggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 3537314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34649597 - 34649440
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||       
T  34649597 gggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgc 34649500  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34649499 acttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Original strand, 3875320 - 3875489
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3875320 aggggagctcggaggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttat 3875417  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3875418 gagtcctcttacttataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgca 3875489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184583
Alignment:
Q  136 aaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 41184583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555733
Alignment:
Q  79 ccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatgg 178  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| || ||||||||||||||  |    
T  37555878 ccacatcgaggcttga--acaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggatttaagg-tcctcttacttataatg 37555782  T
Q  179 tgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37555781 tattcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 37850600 - 37850758
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||| |  |||||||||  ||   ||||||||||| ||||||    
T  37850600 ggggaccgtccacatcgaggctagag--caaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctctta 37850697  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850698 cttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 37850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 66449 - 66630
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||   ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| | |||||| | | ||||||||| ||||||||||||    
T  66449 tgttgggtcatgaggggagcttggataaccgtccacattgaggct--agaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaagg 66546  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | |   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66547 ccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 66630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 39066178 - 39066358
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  39066178 tgttggatcactgggggagtttgggggaccgtc-acatcaaggct--agaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaga 39066274  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||| |  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39066275 caatgattttatgggtcatcttagttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgca 39066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Original strand, 24600322 - 24600472
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  || ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||      
T  24600322 tccacatcgaggct--agaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataat 24600419  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24600420 atgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 24600472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Original strand, 44043814 - 44043945
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacct------ttactattttatctgatgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |      ||||||||||||  |||||    
T  44043814 agagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattactattttattcgatgt 44043913  T
Q  208 gggacatataactcacacttgcaaaccaacaca 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44043914 gggacatataact-acacttgcaaaccaacaca 44043945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 22077806 - 22077986
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||    
T  22077806 tgttgggtcacaaggggagcctggaggaccgtccacatcgatgcttga--acaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-gg 22077902  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || |||| ||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22077903 ctatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgca 22077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5575284 - 5575110
Alignment:
Q  47 tgttgggtcaca-aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||||| | ||||||||||     
T  5575284 tgttgggtcactgaggagagtctgggggacattccacatcgaggct--agaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaa 5575189  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 224  Q
    || | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||| |||||    
T  5575188 gctatggatttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 66136 - 66247
Alignment:
Q  121 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttc-aacctttactattttatctgatgtgggacat-ataa 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||| || |    
T  66136 ccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaacctttacttttctatccgatgtgagacatgatta 66235  T
Q  219 ctcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||    
T  66236 ctcacacttgca 66247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22793415 - 22793279
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaac-gggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttac 192  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||  || |||||||| |||    
T  22793415 agaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaacctctac 22793316  T
Q  193 tattttatctgatgtgggacatataactcacacttgc 229  Q
    | || |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22793315 ttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgc 22793279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 220
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5528902
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| ||  || |||||| ||||||  ||||| |||||||||||  || | ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  5528762 tccacatcgaggat--agaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataag 5528859  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataact 220  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  5528860 atgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 193
Target Start/End: Original strand, 22077092 - 22077231
Alignment:
Q  51 gggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaac 150  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||  |  |||||  |||||||||| | ||||||||| |||||     
T  22077092 gggtcacaaggg-agcctgggggaccgtccacatcgaggcttga--acaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaat 22077188  T
Q  151 gggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22077189 gagtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttact 22077231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 230
Target Start/End: Original strand, 24131999 - 24132143
Alignment:
Q  81 acatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtg 180  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  24131999 acatcgaggct--agaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtg 24132093  T
Q  181 ttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24132094 ttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgca 24132143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 19283434 - 19283613
Alignment:
Q  49 ttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 148  Q
    ||||||||  ||||||||   |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||  | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||     
T  19283434 ttgggtcatgaggggagtcaaggggacctcccacatccaggctagag--caaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcg 19283531  T
Q  149 acgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | | ||||||| ||||||| | ||| |  ||| |||||||  ||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19283532 atgagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgca 19283613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 230
Target Start/End: Original strand, 30630690 - 30630796
Alignment:
Q  124 cactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 223  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  30630690 cactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgtcaaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcac 30630789  T
Q  224 acttgca 230  Q
    |||||||    
T  30630790 acttgca 30630796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 230
Target Start/End: Original strand, 21378120 - 21378199
Alignment:
Q  151 gggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21378120 gggtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgca 21378199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44685551 - 44685456
Alignment:
Q  136 aaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaa-cctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44685551 aaacattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 44685456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45839767 - 45839629
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttc-----aacct 188  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     |||||||||| ||||||||||| |||||||     |||||    
T  45839767 agaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgttcgattcaacct 45839668  T
Q  189 ttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  45839667 ttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttg 45839629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11977103 - 11977026
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11977103 gggggaccgtccacatcgaggct--agaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 11977026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 230
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154197
Alignment:
Q  183 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 35154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Original strand, 50469187 - 50469239
Alignment:
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50469187 gtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgca 50469239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Original strand, 50051665 - 50051776
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||  ||||||||  || || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50051665 ttgttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacatcgatgct--agaacaaca-cataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaag 50051761  T
Q  146 gcaacgggtttatgg 160  Q
      || ||||||||||    
T  50051762 ataatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 1188630 - 1188746
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||| ||| |||||||   | ||||||||  ||| || |||| ||| ||| |||    
T  1188630 agagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaaca 1188729  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  1188730 tataactcacacttgca 1188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  115 gagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttata 175  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 238
Target Start/End: Original strand, 50051777 - 50051817
Alignment:
Q  198 tatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051777 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50051817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10351276 - 10351182
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||| | || | |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||| || | || |||||||||||    
T  10351276 agagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctctatttttctatctgatgtg 10351182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12466399 - 12466365
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12466399 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 12466365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 4266875 - 4266948
Alignment:
Q  165 tcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4266875 tcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgtaaaacaaca 4266948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4878854 - 4878803
Alignment:
Q  179 tgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4878854 tgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgca 4878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4956299 - 4956228
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    |||||| ||||| ||||| |||  |||| | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4956299 cacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttact 4956228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 175
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184191
Alignment:
Q  136 aaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttata 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttata 41184191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44091970 - 44091909
Alignment:
Q  154 tttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacata 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  44091970 tttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 230
Target Start/End: Original strand, 22077248 - 22077280
Alignment:
Q  198 tatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077248 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 22077280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Original strand, 47379891 - 47379943
Alignment:
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47379891 gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttgca 47379943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37106105 - 37105920
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37106105 tgttgggtcacaaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagg 37106008  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 234  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106007 caatgagtttatgggtccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 37105920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 239
Target Start/End: Original strand, 5542615 - 5542792
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5542615 ggggagctcgggggaccgtccacatcgagacttga--acaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatg 5542712  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542713 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 5542792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106179
Alignment:
Q  72 ggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 171  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggct--agaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttact 37106247  T
Q  172 tatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106246 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 37106179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 239
Target Start/End: Original strand, 36178604 - 36178772
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||| | ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36178604 gggggatcgtccacatagaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 36178701  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36178702 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaactaacac 36178772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 239
Target Start/End: Original strand, 5543006 - 5543165
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |    
T  5543006 tccacatcgaggcttga--acaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataag 5543103  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543104 gtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 5543165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6421566 - 6421387
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6421566 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgagact--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaagg 6421469  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6421468 caatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6421387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 14745643 - 14745833
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaagggg-agtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14745643 tgttgggtcacgagggggagctcgggggactgtccacatcgaggct--agaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 14745740  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745741 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 14745833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 59 - 238
Target Start/End: Original strand, 41283464 - 41283641
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  41283464 aggggagcatgggggaccgtccacatcaaggct--agaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttat 41283561  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283562 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41283641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42514830 - 42514649
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  42514830 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagg 42514733  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42514732 cgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgca 42514649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15880413 - 15880265
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  15880413 tccacatcgaggct--aaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 15880316  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15880315 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 15880265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 962766 - 962598
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  962766 ggggagttcgggagaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 962669  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  962668 ggtcctctcacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 962598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6422269 - 6422126
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6422269 gggggacagtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctctt 6422172  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacat 214  Q
    | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6422171 aattataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6713146 - 6712978
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcaacgggttta 157  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  6713146 agggaagttcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggttta 6713049  T
Q  158 tgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6713048 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 6712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 239
Target Start/End: Original strand, 14745269 - 14745461
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaagggg-agtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgc-acaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaa 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||  ||||||||| | ||   ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14745269 tgttgggtcacaagggggagtttgagggattgtccacatcgaggct--agaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaa 14745366  T
Q  145 ggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14745367 ggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaagatgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcacagttgcaaaccaacac 14745461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Original strand, 35580714 - 35580881
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35580714 ggggagtcagggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 35580811  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580812 g-tcctctcacttataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35580881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 36178147 - 36178311
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||| || |||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36178147 ttgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtctacatcgaggct--ataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaag 36178244  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 212  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36178245 gcaatgggtttatgggttcccttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7598736 - 7598600
Alignment:
Q  95 gaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttacta 194  Q
    |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7598736 gaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactt 7598645  T
Q  195 ttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7598644 ttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacaccaacac 7598600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 36005888 - 36006035
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  36005888 tccacatcgaggct--agaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataag 36005985  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36005986 gtgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttg 36006035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Original strand, 38796619 - 38796778
Alignment:
Q  71 gggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccaca--ctcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||| || ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  38796619 gggaccgtcgacatcgaggcttga--acaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctctt 38796716  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796717 acttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 38796778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 15511503 - 15511646
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||      
T  15511503 tccacatcgagact--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataac 15511600  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  15511601 gtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33731832 - 33731653
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcaca-aggggag-tttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaacctta 143  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33731832 ttgttgggtcaccgaggggagctttggaggaccgtttacatcgaggct--agaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaacctta 33731735  T
Q  144 aggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacac 225  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  33731734 aggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40733676 - 40733519
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||  || ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     |||||||||||||||||    
T  40733676 gggggaccatccacatcgagacttga--actaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctctt 40733579  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40733578 acttataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 40733519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 238
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178435
Alignment:
Q  123 acactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactca 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  223 cacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||||||||||||    
T  36178420 cacttgcaaaccaaca 36178435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Original strand, 28254261 - 28254391
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28254261 agaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttact 28254358  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacact 226  Q
     || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28254359 tttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 230
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679787
Alignment:
Q  73 gaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttactt 172  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagact--agaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttactt 40679729  T
Q  173 atatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40679730 ataaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgca 40679787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Original strand, 12529050 - 12529186
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12529050 agaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgttcaatctttact 12529149  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12529150 gttttatttgatgtaggacatataactcacacttgca 12529186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23346418 - 23346250
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23346418 ttgttgggtcatgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaag 23346321  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatata 217  Q
    || | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||  |||||| ||||||||    
T  23346320 gctatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 28531356 - 28531472
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||    
T  28531356 agagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttacttataaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggaca 28531455  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  28531456 tataactcacacttgca 28531472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1770040 - 1769884
Alignment:
Q  80 cacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggt 179  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| | | || || | | ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  1770040 cacatcgaggct--agaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggt 1769943  T
Q  180 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1769942 gttcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacaccaaca 1769884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7598409 - 7598228
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||  | |||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  7598409 tgttgggtcacgaggggagatcaggggaccgttcacatcgaggcttga--acaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaagg 7598312  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | | | ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||  ||||| | |||||||| |||||||||||    
T  7598311 ctatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgca 7598228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Original strand, 37632605 - 37632755
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||  | || ||| |||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||      
T  37632605 tccacatcgaggct--agaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataaa 37632702  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37632703 atgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 37632755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542449
Alignment:
Q  123 acactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactca 222  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  223 cacttgca 230  Q
    ||||||||    
T  16542456 cacttgca 16542449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468904
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  222 acacttgca 230  Q
    |||||||||    
T  31468896 acacttgca 31468904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5367591 - 5367457
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | | ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5367591 agaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaacctttgct 5367492  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
     ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||    
T  5367491 cttttatccgatctgggacatatatatcacacttg 5367457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 219
Target Start/End: Original strand, 40163394 - 40163520
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacg-ggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttac 192  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40163394 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttac 40163493  T
Q  193 tattttatctgatgtgggacatataac 219  Q
    | || |||| |||||||||||||||||    
T  40163494 ttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29677065 - 29676903
Alignment:
Q  71 gggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc-----ct 165  Q
    |||||| |||||||||||| | ||  |||||| |||||  || |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||     ||    
T  29677065 gggaccatccacatcgaggttgga--acaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcct 29676968  T
Q  166 cttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    || || |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29676967 ctcacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 29676903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  142 taaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953929
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 221  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  222 acacttgca 230  Q
    ||| |||||    
T  33953921 acatttgca 33953929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 230
Target Start/End: Original strand, 38796298 - 38796376
Alignment:
Q  152 ggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796298 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 38796376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6421911 - 6421793
Alignment:
Q  48 gttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggc 147  Q
    |||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6421911 gttgggtcatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggcc--agaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 6421814  T
Q  148 aacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  6421813 aataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Original strand, 29874067 - 29874179
Alignment:
Q  116 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacata 215  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  29874067 agacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacata 29874166  T
Q  216 taactcacacttg 228  Q
    |||| ||||||||    
T  29874167 taacacacacttg 29874179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 33561501 - 33561609
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  33561501 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaacatataactc 33561600  T
Q  222 acacttgca 230  Q
    |||||||||    
T  33561601 acacttgca 33561609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40734041 - 40733885
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||    |||| ||| | ||||||    
T  40734041 gggggaccgtccacatcgagacttga--acaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtaggtt-atgagccctctt 40733945  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40733944 acttataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 40733885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16591033 - 16590888
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| || |||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||         
T  16591033 tccacattgaggct--agaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt----- 16590941  T
Q  178 gtgttcaacctttactatttt-atctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590940 -tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgca 16590888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatc---tgatgtggg 210  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||   ||||||| |    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  211 acatataactcacactt 227  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Original strand, 37895101 - 37895211
Alignment:
Q  112 aaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 211  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| || ||| |||||| |||| | || |||| |||||||||    
T  37895101 aaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtggga 37895200  T
Q  212 catataactca 222  Q
    |||||||||||    
T  37895201 catataactca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30323580 - 30323464
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||  | | || |||||||| |||||||    
T  30323580 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggaca 30323481  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||| ||||||||||    
T  30323480 tataacacacacttgca 30323464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29676709 - 29676543
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      ||    
T  29676709 tgttgggtcact-ggggagttccggggaccgtccacatcgaggtttga--ataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa------gg 29676619  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactca 222  Q
    ||| | |||||||||| |||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  29676618 caatgagtttatgggttctctcacttataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Original strand, 36785668 - 36785721
Alignment:
Q  177 ggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785668 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36785721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3673250 - 3673123
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| || || ||||||| |||||||||| | |||| |||||     
T  3673250 ttgttgggtcactgggggagccagggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaa 3673153  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttata 175  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  3673152 gcaatgagtttatggatcctcttacttata 3673123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30313293 - 30313178
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||| ||||    
T  30313293 agagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttata-agtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagaca 30313195  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||| ||| ||||||    
T  30313194 tataacacacgcttgca 30313178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 214
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  125 actcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacat 214  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385779
Alignment:
Q  99 aaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacct 188  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacct 31385779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6421786 - 6421688
Alignment:
Q  68 tgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctct 167  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  6421786 tggggtaccgtccacatcgaggc-cg-gaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctct 6421689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 29873587 - 29873695
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 221  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||   ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||| |    
T  29873587 cacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacac 29873686  T
Q  222 acacttgca 230  Q
    || ||||||    
T  29873687 acccttgca 29873695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 175
Target Start/End: Original strand, 36784287 - 36784363
Alignment:
Q  99 aaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttata 175  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36784287 aaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttata 36784363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Original strand, 37894738 - 37894850
Alignment:
Q  118 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatata 217  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || |||   ||||||||||||||    
T  37894738 acaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtgggacatata 37894837  T
Q  218 actcacacttgca 230  Q
    ||||||| |||||    
T  37894838 actcacatttgca 37894850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3672860 - 3672773
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  3672860 ggggaaccgtccacatcgagact--agaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678527
Alignment:
Q  123 acactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac--atataact 220  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||   || || ||||||||||| |||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  221 cacacttgca 230  Q
    ||||||||||    
T  41678518 cacacttgca 41678527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9231365 - 9231252
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||||   ||||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  9231365 agagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatttataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagaca 9231266  T
Q  214 tataactcacactt 227  Q
    ||||||||| ||||    
T  9231265 tataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421306
Alignment:
Q  182 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 6421306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 230
Target Start/End: Original strand, 33954387 - 33954419
Alignment:
Q  198 tatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33954387 tatctgatgtgggacatataactcacacttgca 33954419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28226453 - 28226404
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  28226453 agagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgggtc 28226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28226770 - 28226726
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  28226770 agagacaccacactcttaccaaaaacc-taagacaatgggtttatg 28226726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3673121 - 3673085
Alignment:
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3673121 attttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3673085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  123 acactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactca 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||  ||| | | ||||||| || ||||||||| |||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  223 cactt 227  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 166
Target Start/End: Original strand, 35580494 - 35580534
Alignment:
Q  126 ctcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctc 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35580494 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 230
Target Start/End: Original strand, 43443108 - 43443140
Alignment:
Q  198 tatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43443108 tatctgatgtgggacatataacttacacttgca 43443140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6500619 - 6500443
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  6500619 aggggagcctgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaa 6500522  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500521 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 40296313 - 40296473
Alignment:
Q  68 tgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctct 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  40296313 tgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct 40296410  T
Q  168 tacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296411 tacttataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 40296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 27502012 - 27502202
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27502012 ttgttgggtcatgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggat--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaag 27502109  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502110 gcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 27502202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32487554 - 32487386
Alignment:
Q  67 ttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctc 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32487554 ttgggggaccatccacatcgaggct--agaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 32487457  T
Q  167 ttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487456 ttacttata-ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 18603095 - 18603286
Alignment:
Q  45 gttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaa 144  Q
    |||||||||| || |||||||   || | ||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  18603095 gttgttgggttacgaggggagccaggagaaccgtccacatcgaggct--agaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaa 18603192  T
Q  145 ggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18603193 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgaaaactaaca 18603286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6500991 - 6500814
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||    
T  6500991 aggggagcctgggggaccgtccacatcgaggct--agaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttat 6500894  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500893 gggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaacac 6500814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 240
Target Start/End: Original strand, 9498634 - 9498822
Alignment:
Q  49 ttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 148  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||   | | | || || ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9498634 ttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacattgaggctaga---ccagcacataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggca 9498730  T
Q  149 acgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaca 240  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9498731 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcacatttgcaaaccaacaca 9498822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41170793 - 41170627
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| || ||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41170793 gggggaccgtctacaccgaggct--agaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 41170696  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 237  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41170695 acttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattacaaaccaac 41170627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Original strand, 13415782 - 13415918
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13415782 agaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 13415881  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415882 aatttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 13415918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15370267 - 15370099
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||    
T  15370267 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatg 15370170  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370169 ggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15370099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492378
Alignment:
Q  71 gggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttac 170  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| || | |||||| |||||||||||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttac 36492315  T
Q  171 ttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492316 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 36492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 624378 - 624187
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaagggg-agtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  624378 tgttgggtcactagggggagctcggggaaccgtccacatcgaggct--agaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaag 624281  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  624280 gctatgggtttatgggtcatcttacttataacgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 624187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 227
Target Start/End: Original strand, 3295334 - 3295498
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  3295334 aggggagtgagggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttaccaaaa-ccttaaggcaattggtttat 3295430  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295431 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6224365 - 6224198
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || ||||||  ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  6224365 aggggagcctgggggaccgtccatattgaggct--agaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttat 6224268  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6224267 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttg 6224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 228
Target Start/End: Original strand, 42405588 - 42405752
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  42405588 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaa--gagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 42405683  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
     ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42405684 agtccttttacttgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttg 42405752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Original strand, 1028493 - 1028673
Alignment:
Q  47 tgttgggtcaca-aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1028493 tgttgggtcactgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaag 1028590  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1028591 gttataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41632942 - 41632782
Alignment:
Q  68 tgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctct 167  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||||||||    
T  41632942 tgggggaccgtccacatcgagact--aaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctct 41632845  T
Q  168 tacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41632844 tacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgca 41632782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 3295014 - 3295172
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||  ||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3295014 gggggactgtccacatcgaggct--acaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttctt 3295111  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3295112 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgca 3295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25328117 - 25327938
Alignment:
Q  47 tgttgggtcaca-aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25328117 tgttgggtcactgaggggagctcgggggaccgtccacattgaggct--agaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 25328020  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25328019 gcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 299648 - 299490
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||  |||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  299648 gggggactgtccacatcgatgct--agaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatctt 299551  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgc 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  299550 acttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 299490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Original strand, 36568558 - 36568725
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  36568558 aggggagctcgggggaccttccacatcgaggat--agaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttac 36568653  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36568654 gggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36568725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Original strand, 24489182 - 24489360
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  24489182 ttgttgggtcacgaggggagtctgagggaccgcccacatcgagact--agaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaag 24489279  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24489280 gcaatgggtttatgggt--tcttactaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Original strand, 11416976 - 11417128
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| |||||||||| |||  ||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11416976 gggggaccatccacatcgaagct--agaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctctt 11417073  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11417074 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26074728 - 26074614
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||    
T  26074728 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaaca 26074629  T
Q  214 tataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||    
T  26074628 tataactcacacttg 26074614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549416
Alignment:
Q  95 gaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttacta 194  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  195 ttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 233  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttgcaaac 29549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 220
Target Start/End: Original strand, 34753015 - 34753173
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||| |||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  34753015 ggggagcttgggaaaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatg 34753112  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataact 220  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  34753113 ggtcttcttacttataaggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 26074188 - 26074304
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  26074188 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtgaca 26074287  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  26074288 tataactcacacttgca 26074304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 12662651 - 12662810
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||  ||||    
T  12662651 gggggaccgaccacatcgaggct--agaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttctt 12662748  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12662749 acttataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12662810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 26075169 - 26075318
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactctt-accaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatat 176  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||  |||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  26075169 tccacatcgaggct--aaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 26075266  T
Q  177 ggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  26075267 ggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 26075318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Original strand, 5723813 - 5723957
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||| |||    || |||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| |    
T  5723813 agaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaacttttatt 5723912  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723913 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5723957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 26074818 - 26074938
Alignment:
Q  109 gcaaaagagacaccacactctt-accaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgt 207  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26074818 gcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactcttttatccgatgt 26074917  T
Q  208 gggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26074918 gggacatataactcacacttg 26074938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35150122 - 35150007
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  35150122 agagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttacttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggaca 35150024  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  35150023 tataactcacacttgca 35150007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 623977 - 623810
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| || |||| ||||||  ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |   |||||||| ||  |||    
T  623977 gggggaccgtctacattgaggct--agaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaactt 623880  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  623879 acttgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 623810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33747921 - 33747783
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||      
T  33747921 tccacatcaaggct--agaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttataaa 33747824  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataa 218  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33747823 gtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15370571 - 15370439
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  15370571 aggggagcatggaggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttat 15370474  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15370473 gggtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 15370439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 301132 - 300961
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||  ||||||||| || ||||| | ||| ||||| || ||  ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  301132 tgttgggtcattaggggagttcggaggaccgttcacgtcgagacttga--acagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaagg 301035  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| || ||        |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  301034 caatggatt--------ctcttacttataaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttg 300961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 35167830 - 35167994
Alignment:
Q  62 ggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatggg 161  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| |||  ||||||||| ||| ||    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||    
T  35167830 ggagttagggggacagtccacatcgatgct--agaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatggg 35167927  T
Q  162 tcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||    
T  35167928 tcatcctacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttg 35167994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 36521946 - 36522053
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36521946 cacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataactc 36522045  T
Q  222 acacttgc 229  Q
    ||||||||    
T  36522046 acacttgc 36522053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26074397 - 26074320
Alignment:
Q  151 gggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074397 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427553
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggtt--agaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctct-acttataag 38427601  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacac 225  Q
     ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38427600 atgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768842
Alignment:
Q  155 ttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttgaaaaccaaca 7768842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42508710 - 42508614
Alignment:
Q  132 ccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  42508710 ccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttg 42508614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2411181 - 2411010
Alignment:
Q  54 tcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacggg 153  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||| |   |||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||   |    
T  2411181 tcacaaggggagcttgggggaccgtccatatcgaggtt--agaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataag 2411084  T
Q  154 tttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    ||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  2411083 tttatgggttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 41635224 - 41635346
Alignment:
Q  105 acaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctga 204  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41635224 acaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttttatctga 41635323  T
Q  205 tgtgggacatataactcacactt 227  Q
    || |  |||||||||||| ||||    
T  41635324 tgggaaacatataactcatactt 41635346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 26590909 - 26591068
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||| ||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||| |||||||    
T  26590909 ggggaaccatccacatcgaggtt--agaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctctt 26591006  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  26591007 acttataaggtgttcaacctttacttttcgattcgatatggaacatttaaatcacacttgca 26591068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 144
Target Start/End: Original strand, 26900007 - 26900089
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaa 144  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26900007 ggggagcttgggggaccgtccacatcaaggct--agaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31509740 - 31509623
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaa-ccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 212  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  31509740 agagacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagac 31509641  T
Q  213 atataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31509640 atataactcacacttgca 31509623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 146
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 227
Target Start/End: Original strand, 36522266 - 36522392
Alignment:
Q  101 ccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttat 200  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |  | | || |||    
T  36522266 ccgcacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctat 36522365  T
Q  201 ctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  36522366 ccaatgtgagacatataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35914972 - 35914852
Alignment:
Q  107 aagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatg 206  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | || |  ||| ||||| || |||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35914972 aagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatg 35914873  T
Q  207 tgggacatataactcacactt 227  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  35914872 tgtgacatataactcatactt 35914852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31509864 - 31509745
Alignment:
Q  98 caaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacca-aaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactatt 196  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||  ||| ||    
T  31509864 caaccgtacaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccactttt 31509765  T
Q  197 ttatctgatgtgggacatat 216  Q
     |||| |||||| |||||||    
T  31509764 ctatccgatgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225047
Alignment:
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13042655 - 13042606
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc 163  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13042655 agagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39309762 - 39309686
Alignment:
Q  151 gggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39309762 gggtttatgg-tcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 39309686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5660338 - 5660284
Alignment:
Q  190 tactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacacaggtg 244  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5660338 tactattttattcgatgtggaacatataactcacatttgcaaaccaacataggtg 5660284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Original strand, 22298956 - 22299014
Alignment:
Q  181 ttcaacctttactatttt-atctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22298956 ttcaacctttattatttttatctgatgtgagacatataacccacacatgcaaaccaaca 22299014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38427355 - 38427306
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaacctta 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  38427355 agaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42524814 - 42524719
Alignment:
Q  132 ccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||||||| || ||| || |||||| ||||||||| | ||| | ||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  42524814 ccaaaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaa-ctttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13112651 - 13112604
Alignment:
Q  116 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc 163  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13112651 agacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 13112604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 222
Target Start/End: Original strand, 26900082 - 26900120
Alignment:
Q  184 aacctttactattttatctgatgtgggacatataactca 222  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26900082 aaccttaactcttttatctgatgtgggacatataactca 26900120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 32446001 - 32445943
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttactt 172  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  32446001 agagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150747
Alignment:
Q  188 tttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35150747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151038
Alignment:
Q  188 tttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35151038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 228
Target Start/End: Original strand, 36527209 - 36527239
Alignment:
Q  198 tatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36527209 tatctgatgtgggacatataactcacacttg 36527239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41341567 - 41341523
Alignment:
Q  118 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggt 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  41341567 acaccacattcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtgtatgggt 41341523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35946704 - 35946524
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggag-tttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35946704 tgttgggtcactgggggagctttgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaag 35946607  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35946606 gcaacgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35946524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22304728 - 22304560
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22304728 gggggactgtccacatcgagact--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctctt 22304631  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22304630 acttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgcaaaccaacac 22304560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 29644557 - 29644739
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29644557 ttgttgggtcacgaggggagtttgggggaccatccacatcgaagct--aaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 29644654  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29644655 acaatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29644739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 43346793 - 43346947
Alignment:
Q  72 ggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 171  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  43346793 ggaccgtccacatagaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttact 43346890  T
Q  172 tatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346891 tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 43346947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Original strand, 29644882 - 29645060
Alignment:
Q  50 tgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaa 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  29644882 tgggtcacgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggct--aaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaa 29644979  T
Q  150 cgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29644980 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 29645060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 230
Target Start/End: Original strand, 33803243 - 33803410
Alignment:
Q  61 gggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgg 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  33803243 gggagtttgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgg 33803340  T
Q  161 gtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33803341 gtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgca 33803410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 230
Target Start/End: Original strand, 12114546 - 12114720
Alignment:
Q  54 tcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacggg 153  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  12114546 tcacgaggggagtctgggggaccgaccacatcgtggct--agaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggg 12114643  T
Q  154 tttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114644 tttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgca 12114720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 42342364 - 42342546
Alignment:
Q  47 tgttgggtcac-aaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  42342364 tgttgggtcactaaggggagccagggggaccgtccacattgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaag 42342461  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342462 acaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 42342546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Original strand, 37990638 - 37990795
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  37990638 gggggaccgtccacatcgaggct--agaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctctt 37990735  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37990736 acttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttg 37990795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39389206 - 39389062
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  39389206 agaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtgttcaacctttact 39389107  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39389106 attttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 39389062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32589862 - 32589704
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32589862 gggggaccgtccacatcgagcct--agaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 32589765  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32589764 acttataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgca 32589704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 25739422 - 25739583
Alignment:
Q  67 ttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctc 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||| || |||| | ||||||||||||||    
T  25739422 ttgggggaccgtccacatcgaggct--agaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctc 25739519  T
Q  167 ttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739520 ttacttatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 25739583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 228
Target Start/End: Original strand, 37990978 - 37991133
Alignment:
Q  71 gggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttac 170  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  37990978 gggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttac 37991075  T
Q  171 ttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  37991076 ttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttg 37991133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 240
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935125
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  39934963 tccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataag 39935060  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacaca 240  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39935061 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactctcacacttgcaaaccaacaca 39935125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 3135432 - 3135617
Alignment:
Q  48 gttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggc 147  Q
    |||||||||  ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3135432 gttgggtcatgaggagagtcagggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggc 3135529  T
Q  148 aacgggtttat--gggtcctcttacttatat-----ggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| ||||     |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3135530 aatgggtttatgggggtcctcttactaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttg 3135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15773010 - 15772854
Alignment:
Q  72 ggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 171  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  15773010 ggaccgtccacatcgaggtt--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 15772913  T
Q  172 tatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15772912 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgca 15772854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25755572 - 25755396
Alignment:
Q  50 tgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaa 149  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||| ||| | |||    
T  25755572 tgggtcatgaggggagttcgggggaccatccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaa 25755475  T
Q  150 cgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
     || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25755474 tggatttatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 25755396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52634856 - 52634678
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||  || ||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  52634856 tgttgggtcactgggggagctcgggggacagtctacatcaaggct--agaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagg 52634759  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52634758 caatgggtttatgggtc-tcttacttataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52634678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4823791 - 4823646
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  4823791 agaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaacttttact 4823692  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4823691 attttatccgatgtgagacttataactcacacttgcaaaccaacac 4823646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 228
Target Start/End: Original strand, 32462888 - 32463057
Alignment:
Q  58 aaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggttta 157  Q
    |||||||| ||||  |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  32462888 aaggggagcttggaagaccgtacacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggttta 32462985  T
Q  158 tgggtcctcttacttatatggtgttcaacc-tttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    || ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32462986 tgagtcttcttacttataaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 32463057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 54017793 - 54017974
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  ||||||   ||||||||  ||||||||| |||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54017793 tgttgggtcactgggggagccagggggaccgcccacatcgaagct--agaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 54017890  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54017891 cgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 54017974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 54018197 - 54018356
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  54018197 gggggaccgcccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctctt 54018294  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54018295 acttataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgca 54018356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 228
Target Start/End: Original strand, 22303952 - 22304104
Alignment:
Q  67 ttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctc 166  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22303952 ttgggggacaatccacatcgaggct--agaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgc 22304049  T
Q  167 ttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304050 ttacttataag-------acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 22304104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 42342067 - 42342248
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42342067 tgttgggtcaccgagggagttcggaggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagg 42342164  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||  || ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  42342165 caatgagtttatgagtcctcttacttataaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgca 42342248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135224
Alignment:
Q  98 caaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattt 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  198 tatctgatgtgggacatataactcac 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 41359764 - 41359919
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41359764 gggggaccgcccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 41359861  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    ||||||||||||||||    
T  41359862 acttataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgca 41359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 53577546 - 53577364
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaagg-ggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  53577546 tgttgggtcacaaagaggagttcgggggaccatccacaccgaggct--agaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaag 53577449  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||   |||||||| ||| |||| || || | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  53577448 gcaatatgtttatggatccacttatttttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 53577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15773376 - 15773192
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaa--aagagacaccacactcttaccaaaaacctta 143  Q
    ||||||| |||  ||||||||| || ||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  15773376 ttgttggatcatgaggggagttaggaggatcgtccacatcgaggtt--agaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaacttta 15773279  T
Q  144 aggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||| | | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773278 aggcaatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15773192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 21832344 - 21832501
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  21832344 gggggactgtccacatcgaggct--agaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctctt 21832439  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21832440 acttataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgca 21832501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914252
Alignment:
Q  81 acatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtg 180  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39914399 acatcgaggct--agaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtg 39914302  T
Q  181 ttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39914301 ttcaacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 39914252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Original strand, 45395649 - 45395811
Alignment:
Q  66 tttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcct 165  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  45395649 tttgggagaccctccacatcgaggctagag--caaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcct 45395746  T
Q  166 cttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45395747 cttacttataacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgca 45395811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31190159 - 31190017
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||| |||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||| ||||||| |    
T  31190159 tccaaatcgaggct--agaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaacttataag 31190070  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31190069 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgca 31190017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 238
Target Start/End: Original strand, 50612470 - 50612618
Alignment:
Q  95 gaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtt-----tatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctt 189  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||   |||     |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  50612470 gaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctcttacttataaggtgttcaatctt 50612569  T
Q  190 tactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612570 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50612618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 51886676 - 51886553
Alignment:
Q  109 gcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||      |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  51886676 gcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtg 51886583  T
Q  209 ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51886582 agacatataactcacacttgcaaaccaaca 51886553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8328020 - 8327904
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8328020 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggaca 8327921  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  8327920 tataactcacacttgca 8327904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45901872 - 45901715
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| |||||||||| | |  |||||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  45901872 ggggaccgtccacatcgaagtt--agaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctctta 45901775  T
Q  170 cttatatggtgttcaacc-tttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45901774 cttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 45901715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Original strand, 49336708 - 49336843
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaa-agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttac 192  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  49336708 agaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataaggtggtcaacctttac 49336807  T
Q  193 tattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    | || |||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  49336808 ttttctatccgatgtgagacatgtaactcacacttg 49336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 32462534 - 32462715
Alignment:
Q  45 gttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaa 144  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  32462534 gttgttggatcatgaggggagtttggggg-ccgtctacatcgaggct--aaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaa 32462630  T
Q  145 ggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacc-tttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
     ||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32462631 agcaataggtttatggatcatcttacttataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttg 32462715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 1634356 - 1634473
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacc-tttactattttatctgatgtgggac 212  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||| | || |||| ||||||||||    
T  1634356 agagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggac 1634455  T
Q  213 atataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1634456 atataactcacacttgca 1634473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Original strand, 33175711 - 33175820
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggt---ttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataa 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | | ||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  33175711 cacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataa 33175810  T
Q  219 ctcacacttg 228  Q
    ||||||||||    
T  33175811 ctcacacttg 33175820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 53118017 - 53118131
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||    
T  53118017 agagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaaca 53118115  T
Q  214 tataactcacacttgc 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  53118116 tataactcacacttgc 53118131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22304299 - 22304237
Alignment:
Q  177 ggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304299 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 22304237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37726664 - 37726496
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||   ||||| || | | ||  |||||||||| | ||||||| |||||||        ||    
T  37726664 ggggagttcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaa--------tg 37726575  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726574 gatcctcttacttataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 37726496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Original strand, 44160543 - 44160702
Alignment:
Q  66 tttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcct 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||  || || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  44160543 tttgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttaccaaaa-ccttaagacaatgggtttatggatcct 44160637  T
Q  166 cttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||  || ||  |||||||||| |||||||||    
T  44160638 cttatttataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgca 44160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 146
Target Start/End: Original strand, 41359467 - 41359565
Alignment:
Q  47 tgttgggtca-caaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41359467 tgttgggtcagcgaggggagtctgggggaccgtccacattgaggct--agaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 41359564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 22303670 - 22303759
Alignment:
Q  81 acatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttactt 172  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22303670 acatcgaggct--agaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 47964560 - 47964676
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  ||  || |||| |||| ||||||    
T  47964560 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttctatccgatgcgggaca 47964659  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    || ||||||||||||||    
T  47964660 tacaactcacacttgca 47964676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Original strand, 42584863 - 42584970
Alignment:
Q  113 aagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 212  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  42584863 aagagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggac 42584962  T
Q  213 atataact 220  Q
    ||||||||    
T  42584963 atataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11662068 - 11661954
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 212  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  11662068 agagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcacttttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggc 11661969  T
Q  213 atataactcacactt 227  Q
    || ||||||||||||    
T  11661968 atttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9240299 - 9240149
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| |   | |||||||||||| ||||| |  ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  9240299 tccacatcgaggct--agaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataag 9240202  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| | ||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9240201 gtgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 9240149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384433
Alignment:
Q  123 acactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactca 222  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  223 cacttgcaaaccaacac 239  Q
    | |||||| ||||||||    
T  3384417 cgcttgcacaccaacac 3384433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 201
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362422
Alignment:
Q  106 caagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatc 201  Q
    ||||||| ||||| ||  ||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatc 33362422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  138 accttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11661602 - 11661537
Alignment:
Q  163 cctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11661602 cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 11661537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43346703 - 43346650
Alignment:
Q  177 ggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43346703 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 43346650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 54017524 - 54017636
Alignment:
Q  47 tgttgggtcaca-aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||   | ||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54017524 tgttgggtcatagaggggagttagggggaccgaccacatcgaggcc--aaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 54017621  T
Q  146 gcaacgggtttatgg 160  Q
    |||| ||||||||||    
T  54017622 gcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 53596076 - 53596027
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53596076 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 53596391 - 53596342
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53596391 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 47964957 - 47965073
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||  |||| |||||  ||| || |||| |||||   |||    
T  47964957 agagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaaca 47965056  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  47965057 tataactcacacttgca 47965073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 39336292 - 39336387
Alignment:
Q  135 aaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||  |   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336292 aaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 39336387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 148
Target Start/End: Original strand, 7766758 - 7766857
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagttt-gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||  |||||    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  7766758 ttgttgggtcacaaggggagtttagggggaccatctacatcgaggct--agaacaaccatacaag--tgagagacgccacaatcttacctaaaaccttaa 7766853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25317270 - 25317161
Alignment:
Q  118 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatata 217  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |  ||| |||||||  ||| ||  ||||| ||||||||| |||    
T  25317270 acactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttttccatctggtgtgggacacata 25317171  T
Q  218 actcacactt 227  Q
    ||||||||||    
T  25317170 actcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 227
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 221  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||  |||||||||||  ||  ||  |||  |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  222 acactt 227  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  120 accacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtg 180  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12749278 - 12749211
Alignment:
Q  121 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacct 188  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  12749278 ccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgttcaacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17732008
Alignment:
Q  118 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatat 176  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttatat 17732008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033239
Alignment:
Q  118 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatat 176  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttatat 19033239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25991519 - 25991405
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||| ||| |||| |||||||   |||| ||| || |||  ||||| ||||||||||||    
T  25991519 agagagaccacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtgggaca 25991420  T
Q  214 tataactcacacttg 228  Q
    ||| |||||||||||    
T  25991419 tattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22304352 - 22304302
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacac 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22304352 gggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 149
Target Start/End: Original strand, 39336002 - 39336047
Alignment:
Q  104 cacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaa 149  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39336002 cacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 39336047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 53596591 - 53596542
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  53596591 agagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 8328439 - 8328374
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacac 126  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8328439 aggggagttcgtgggaccgtccacatcgaggct--aaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11661636 - 11661603
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggc 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11661636 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 11661603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 230
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747910
Alignment:
Q  198 tatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12747910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871049
Alignment:
Q  118 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggt 162  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 16871049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25089764 - 25089720
Alignment:
Q  45 gttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgagg 89  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  25089764 gttgttgggtcacaaggggagctcgggggactgtccacatcgagg 25089720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 230
Target Start/End: Original strand, 33809134 - 33809166
Alignment:
Q  198 tatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33809134 tatctgatgtgggacatataacttacacttgca 33809166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 37533341 - 37533530
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37533341 tgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 37533438  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37533439 caatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacacttacaaatcaaca 37533530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 239
Target Start/End: Original strand, 37532988 - 37533177
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| | |||||   |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37532988 tgttgggtcacgatgggagcgcgggggaccgtccacatcgaggtt--agaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaagg 37533084  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533085 caatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 37533177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 1085593 - 1085774
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||  |||||||   |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1085593 tgttgggtcatgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagg 1085690  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085691 caatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1085774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30244449 - 30244272
Alignment:
Q  49 ttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 148  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30244449 ttgggtcacaaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttga--acaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 30244352  T
Q  149 acgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30244351 atgggtttatgagtcctcttacttataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 30244272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Original strand, 22567028 - 22567196
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22567028 aggggagctcgggggaccatccacatcgaggcccga--acaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttat 22567125  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22567126 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttgca 22567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 23376 - 23535
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23376 gggggaccgtccaaatcgaggct--agaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctt 23473  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23474 acttataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgca 23535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7517738 - 7517580
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7517738 ggggaccacccacatcgaggct--agaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 7517641  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517640 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 7517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11845372 - 11845198
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  ||||||   |||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11845372 tgttgggtcactgggggagcacgggggaccgtctacatcgaggct--agaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagg 11845275  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 223  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11845274 caatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14681626 - 14681501
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681626 agagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 14681527  T
Q  214 tataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14681526 tataacttacacttgcaaaccaacac 14681501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30245254 - 30245079
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30245254 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttga--acaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 30245161  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30245160 caatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 30245079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29157687 - 29157559
Alignment:
Q  108 agcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgt 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  29157687 agcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccggtgt 29157588  T
Q  208 gggacatataactcacacttgcaaaccaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157587 gggacatataactcacacttgcaaaccaa 29157559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24177595 - 24177435
Alignment:
Q  68 tgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctct 167  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24177595 tgggggaccgtccacgtcgaggct--aagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgct 24177498  T
Q  168 tacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24177497 tacttataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgca 24177435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7554151 - 7554025
Alignment:
Q  104 cacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctg 203  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  7554151 cacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 7554052  T
Q  204 atgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7554051 atgtgggacatataactcacacttgca 7554025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939891
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  36939741 tccacatcgaggct--agaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataag 36939838  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36939839 gtgttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgca 36939891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 40094773 - 40094932
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  40094773 gggggaccgaccacatcgaggct--agaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctctt 40094870  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40094871 acttataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 40094932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6054719 - 6054562
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6054719 gggggaccgtccacatcaaggct--agaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctctt 6054622  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  6054621 acttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45433400 - 45433243
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| || |||||    
T  45433400 gggggaccgaccacatcgaggct--agaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctctt 45433303  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  45433302 acttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttg 45433243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 22566711 - 22566820
Alignment:
Q  121 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataact 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  22566711 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattact 22566810  T
Q  221 cacacttgca 230  Q
    ||||||||||    
T  22566811 cacacttgca 22566820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45754850 - 45754718
Alignment:
Q  95 gaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttacta 194  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45754850 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgttcaacatttacta 45754751  T
Q  195 ttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45754750 ttttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 45754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16569312 - 16569196
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  16569312 agagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagaca 16569213  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  16569212 tataactcacacttgca 16569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 16596350 - 16596466
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  16596350 agagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagaca 16596449  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  16596450 tataactcacacttgca 16596466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19122867 - 19122740
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19122867 agaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 19122768  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactca 222  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19122767 attttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45434784 - 45434638
Alignment:
Q  80 cacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggt 179  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45434784 cacatcgaggct--agaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttacttataaggt 45434687  T
Q  180 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45434686 gttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 45434638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 224
Target Start/End: Original strand, 34218036 - 34218186
Alignment:
Q  72 ggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 171  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||    
T  34218036 ggaccgtccacatcgaggcttga--acaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcact 34218133  T
Q  172 tatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 224  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34218134 tataaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcaca 34218186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 118299 - 118459
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaaga--gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctct 167  Q
    ||||||| |||||||| | |||  ||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  118299 ggggaccgtccacatcaaagct--agaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctct 118396  T
Q  168 tacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  118397 tacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgca 118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30032735 - 30032572
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||    
T  30032735 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggat--agaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatg 30032638  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacac 225  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30032637 gatactcttacttataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47129211 - 47129097
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  47129211 agagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagaca 47129112  T
Q  214 tataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||    
T  47129111 tataactcacacttg 47129097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9901824 - 9901648
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| ||||  ||| || ||||  |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9901824 tgttgggtcacgagggacgttcggaggacagtccacaccgaggct--agaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga 9901727  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    ||| | |||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9901726 caatgagtttatggatcctc-tacgtataagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 227
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838857
Alignment:
Q  95 gaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcc-tcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
     ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Original strand, 8128463 - 8128599
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||| || |||| | || ||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  8128463 agaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgttcaacctttatt 8128562  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8128563 tttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 8128599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36623096 - 36622960
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||| | |||||| || |||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||   |||| ||||||||||    
T  36623096 agaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttact 36622997  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36622996 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36622960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 230
Target Start/End: Original strand, 40230328 - 40230449
Alignment:
Q  109 gcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtg 208  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  40230328 gcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtg 40230427  T
Q  209 ggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  40230428 ggacatataacttacacttgca 40230449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41854815 - 41854635
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||| || |||| ||||||  |||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  41854815 ttgttgggtcact-ggggagtcagggggaccgtctacattgaggct--agaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaag 41854719  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||     ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41854718 gcattatatttataggtcatcttgcttataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgca 41854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085407
Alignment:
Q  104 cacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctg 203  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  204 atgtgggacat-ataactcacacttgca 230  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacacttgca 1085407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30253667 - 30253534
Alignment:
Q  49 ttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 148  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30253667 ttgggtcacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttga--acaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 30253574  T
Q  149 acgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacct 188  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  30253573 atgagtttatgggttctcttacttataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37167937 - 37167808
Alignment:
Q  72 ggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 171  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  37167937 ggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact 37167840  T
Q  172 tatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgg 209  Q
           |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37167839 ------ctgttcaacatttactattttatctgatgtgg 37167808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245494
Alignment:
Q  157 atgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 30245494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 36534826 - 36534942
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  36534826 agagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatccgaggtgggaca 36534925  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    ||||| | |||||||||    
T  36534926 tataagttacacttgca 36534942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Original strand, 41910654 - 41910749
Alignment:
Q  132 ccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41910654 ccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctcagttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241495
Alignment:
Q  109 gcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtg 208  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||   ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  209 ggacatataactcacacttgca 230  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttgca 43241495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301701
Alignment:
Q  142 taaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 28301701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20599450 - 20599317
Alignment:
Q  96 aacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactct--taccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||  ||||| | ||||||||    
T  20599450 aacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtgtttatcctttact 20599351  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20599350 tttttatccgatatgggacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255339
Alignment:
Q  157 atgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgca 30255339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 47129527 - 47129450
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaa 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47129527 ggggaccgtccacatcgaggct--agatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Original strand, 28300227 - 28300366
Alignment:
Q  45 gttgttgggtcac-aaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaacctta 143  Q
    ||||||||||||  |||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||  |||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  28300227 gttgttgggtcaataaggggagtcaggaggaccgtccacatcgaggcccga--acaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 28300324  T
Q  144 aggcaacgggtttat-gggtcctcttacttatatggtgttca 184  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  28300325 aggcaatgggtttatggggttctcttacttataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244701
Alignment:
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 30244701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109075
Alignment:
Q  162 tcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgca 36109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094552
Alignment:
Q  180 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgca 40094552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 142
Target Start/End: Original strand, 37532753 - 37532821
Alignment:
Q  72 ggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaacctt 142  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37532753 ggaccgtccacatcgaggct--agaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 163
Target Start/End: Original strand, 21416183 - 21416232
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21416183 agagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14681324 - 14681281
Alignment:
Q  193 tattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 236  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681324 tattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 14681281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 161
Target Start/End: Original strand, 23569044 - 23569091
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatggg 161  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23569044 agagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 28300576 - 28300644
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactctta-ccaaaaaccttaaggc 147  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28300576 tccacatcgaggct--agaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 163
Target Start/End: Original strand, 21619085 - 21619136
Alignment:
Q  112 aaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc 163  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21619085 aaagatacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 21619136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30245336 - 30245256
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactct 129  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  30245336 tgttgggtcataaggggagcatgggggaccgtccacattgaggcttga--acaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967385
Alignment:
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 175
Target Start/End: Original strand, 4124130 - 4124191
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttata 175  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  4124130 agagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttata 4124191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Original strand, 27391815 - 27391859
Alignment:
Q  118 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggt 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  27391815 acaccacactcttacctaaaaccttaaggcagtggatttatgggt 27391859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30244534 - 30244453
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactct 129  Q
    |||||||||||  |||||||  || |||||| ||||||||||||||   |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  30244534 ttgttgggtcatgaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggct--tgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30253752 - 30253671
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactct 129  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||  ||||||||||||||   |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  30253752 ttgttgggtcatgaggggagcctgggggacagtccacatcgaggct--tgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 81)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 238
Target Start/End: Original strand, 55933113 - 55933288
Alignment:
Q  61 gggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgg 160  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  55933113 gggagcttgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgg 55933210  T
Q  161 gtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933211 gtcctcttacttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 55933288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Original strand, 50630762 - 50630920
Alignment:
Q  79 ccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatgg 178  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  50630762 ccacatcgaggct--aaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataatg 50630859  T
Q  179 tgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50630860 tgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttgcaaaccaacac 50630920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41370538 - 41370349
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  41370538 tgttgggtcactggggaagttcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaagg 41370441  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370440 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41370349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25483517 - 25483336
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  ||||||   ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25483517 tgttgggtcactgggggagccagggagaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 25483420  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25483419 caatgggtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 25483336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Original strand, 54017583 - 54017751
Alignment:
Q  60 ggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatg 159  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  54017583 ggggagctagggagaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatg 54017680  T
Q  160 ggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54017681 ggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgca 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3340988 - 3340807
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  |||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3340988 tgttgggtcactgggggagctcaggagaccgtccacatcgaggct--agaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 3340891  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3340890 cagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgca 3340807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 71 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36629394 - 36629239
Alignment:
Q  71 gggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttac 170  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36629394 gggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttac 36629297  T
Q  171 ttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36629296 ttataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50002585 - 50002423
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  50002585 gggggaccgcccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctctt 50002488  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 233  Q
    ||||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50002487 acttaaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaac 50002423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731803
Alignment:
Q  71 gggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttac 170  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  1731646 gggaccgtccacattgaggct--agaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttat 1731743  T
Q  171 ttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1731744 ttataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgca 1731803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 36608636 - 36608817
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  36608636 tgttgggtcacgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga 36608733  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36608734 caatggatttatggatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgca 36608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884695
Alignment:
Q  80 cacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacca-aaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatgg 178  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| ||    
T  52884844 cacatcgaggct--agatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataagg 52884747  T
Q  179 tgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884746 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404400
Alignment:
Q  71 gggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttac 170  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttac 39404458  T
Q  171 ttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404457 ttataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 39404400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10246101 - 10245920
Alignment:
Q  47 tgttgggtca-caaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10246101 tgttgggtcagcgaggggagcttgggggagcgtccacatcgaggct--agaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaag 10246004  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10246003 gctttgggtttatgg-tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgca 10245920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 39792860 - 39793014
Alignment:
Q  72 ggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 171  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||    
T  39792860 ggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttct 39792957  T
Q  172 tatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39792958 tataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 39793014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54109048 - 54108928
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54109048 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 54108950  T
Q  194 attttatctgatgtgggacata 215  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  54108949 attttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44620828 - 44620660
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||    
T  44620828 aggggagcttgggggaccgtccacatcgaggat--ataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatgg-tttat 44620732  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620731 gggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44620660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 49880276 - 49880152
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  49880276 agagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgggaca 49880177  T
Q  214 tataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  49880176 tataactcacacttgcaaaccaaca 49880152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 230
Target Start/End: Original strand, 4955341 - 4955473
Alignment:
Q  98 caaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattt 197  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4955341 caaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttaactattt 4955440  T
Q  198 tatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  4955441 tatccgatatgagacatataactcacacttgca 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 230
Target Start/End: Original strand, 22183253 - 22183420
Alignment:
Q  61 gggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgg 160  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22183253 gggagtctgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 22183350  T
Q  161 gtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||| |||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22183351 gtccttttacttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgca 22183420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52885004 - 52884887
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttacca-aaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 212  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52885004 agagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 52884905  T
Q  213 atataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52884904 atataactcacacttgca 52884887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 54936376 - 54936215
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| || | |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54936376 tgttgggtcactgggggagctcgggggactgtccacatcgaggct--agaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 54936280  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936279 caatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 54936215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572021
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttga--acaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttctta 36572080  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36572079 cttataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 36572021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39404187 - 39404020
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| || | | ||||||    
T  39404187 aggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttat 39404090  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  39404089 gagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttg 39404020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50459883 - 50459724
Alignment:
Q  66 tttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcct 165  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  50459883 tttgagggaccgtgcacatcgaggct--agaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcct 50459786  T
Q  166 cttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  50459785 cttacttataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 220
Target Start/End: Original strand, 54343005 - 54343147
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||       ||||||||    
T  54343005 gggggaccatccacatcgaggct--agaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggg-------gtcctctt 54343095  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataact 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54343096 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741071
Alignment:
Q  121 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataact 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  221 cacacttgca 230  Q
    ||||||||||    
T  2741080 cacacttgca 2741071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49303056 - 49302907
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttac--ttata 175  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  49303056 tccacatcgaggat--agaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttttata 49302959  T
Q  176 tggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 227  Q
     | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49302958 agatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 22027936 - 22028117
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||  |||||||  || |||||  ||||||||||| ||  | ||||||| || |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22027936 tgttgggtcatgaggggagcctgagggactgtccacatcgagact--aaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaagg 22028033  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22028034 caatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgca 22028117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44621160 - 44621011
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | |||||||    
T  44621160 ggggaccgtccacatcgaggct--agaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctctta 44621063  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  44621062 cttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Original strand, 45489306 - 45489485
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  45489306 ttgttgggtcacgcggggagttggagggaccatccacatcgaggct--agaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa 45489403  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
     ||   |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  45489404 -cagtaggtttaagagttctcttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttg 45489485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 230
Target Start/End: Original strand, 4390090 - 4390257
Alignment:
Q  61 gggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgg 160  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| | | | | ||    
T  4390090 gggagcttgggagaccgtccgcatcgaggct--agaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaagg 4390187  T
Q  161 gtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4390188 atcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgca 4390257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Original strand, 34646689 - 34646803
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  34646689 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggaca 34646788  T
Q  214 tataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||    
T  34646789 tataactcacacttg 34646803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Original strand, 41707505 - 41707618
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41707505 agagacaccacactcttaccaaaa-ccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggaca 41707603  T
Q  214 tataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||||||    
T  41707604 tataactcacacttg 41707618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2740867 - 2740700
Alignment:
Q  59 aggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttat 158  Q
    ||||||| | |||||||| |||| |||||||||  |||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||    
T  2740867 aggggagctcgggggaccatccatatcgaggct--agaacaacc--acaagtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttat 2740772  T
Q  159 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740771 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2740700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20825996 - 20825842
Alignment:
Q  68 tgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctct 167  Q
    ||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  20825996 tgggggactgtccacatcaaggct--agaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctct 20825899  T
Q  168 tacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 224  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20825898 tatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcaca 20825842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Original strand, 32941129 - 32941279
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||| |    
T  32941129 tccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataag 32941226  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||| || | || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  32941227 gtgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgca 32941279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Original strand, 49076837 - 49076986
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||| |    
T  49076837 tccacatcgaggct--agaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctcttac-tataag 49076933  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076934 gtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgca 49076986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 239
Target Start/End: Original strand, 18932746 - 18932925
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| | ||||||||||||  | ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18932746 gggggaccgtacacatcgaggct--ataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 18932843  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatg-----------tgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18932844 atttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtaggaccgatgtgggacatataactcagacttgcaaaccaacac 18932925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Original strand, 22028363 - 22028527
Alignment:
Q  66 tttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcct 165  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  22028363 tttgggggaccgtccacattgaggct--agaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcct 22028460  T
Q  166 cttacttatatggtgttcaaccttta--ctattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||   | ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22028461 cttactaataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgca 22028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44620511 - 44620362
Alignment:
Q  70 ggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  44620511 ggggaccgtccacatcaaggtt--agaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctctta 44620414  T
Q  170 cttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 221  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44620413 tttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20826367 - 20826223
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||      
T  20826367 tccacatcgaggct--agaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataac 20826270  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20826269 gtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45496931 - 45496820
Alignment:
Q  104 cacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctg 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  45496931 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttatccg 45496832  T
Q  204 atgtgggacata 215  Q
    ||||||||||||    
T  45496831 atgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Original strand, 16888836 - 16888971
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 193  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16888836 agaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttacttataaggtattcaacctttact 16888935  T
Q  194 attttatctgatgtgggacatataactcacacttgc 229  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16888936 tttctatccgatgtgggacatataactcacacttgc 16888971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Original strand, 16889510 - 16889691
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||||  |||||| | | |||||| |||||||||||| |  ||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  16889510 ttgttgggtcacgtggggagctcgagggaccgtccacatcgaggtt--agaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaag 16889607  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgc 229  Q
    |||   ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  16889608 gcagtaggtttatgaatcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54108718 - 54108537
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtt-tgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||||  |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  54108718 tgttgggtcactgggggagctatgggggaccg-ccacattgaggct--agaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaag 54108622  T
Q  146 gcaacgggttt-atgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaa 231  Q
    |||| |  ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||    
T  54108621 gcaatgaattttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttgcaa 54108537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 238
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975620
Alignment:
Q  107 aagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatg 206  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||  || || |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  207 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6975589 tgagacatataactcacatttgcaaactaaca 6975620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 34004559 - 34004739
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||  || |||| | ||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  34004559 ttgttgggtcatgagaggagctcgggagaccgttcacatcgaggct--agaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaag 34004656  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34004657 g-aatgagtttatgggtcctcttacttataagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgca 34004739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 3244425 - 3244607
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||| |||| |||   ||||||   ||||||||||||| ||  ||||||  |||||  | ||||||  |||| ||||||| ||||| |||||    
T  3244425 ttgttgggtcacgagggaagtcaaggggactgcccacatcgaggctgga--acaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaag 3244522  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3244523 acaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 3244607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 175
Target Start/End: Original strand, 23817677 - 23817782
Alignment:
Q  68 tgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctct 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||||    
T  23817677 tgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctct 23817774  T
Q  168 tacttata 175  Q
    ||||||||    
T  23817775 tacttata 23817782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 217
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatata 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 49076510 - 49076604
Alignment:
Q  136 aaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076510 aaactttaagacaatgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgca 49076604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3341310 - 3341128
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||||| |  | || |||| || ||  || | ||||| |||||||||||| |||| |||||     
T  3341310 ttgttgggtctggaggggagtttgggggaccgtctacatcgaggtt--aaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaa 3341213  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     ||| |   |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3341212 acaatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3341128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 54741218 - 54741334
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  54741218 agagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagaca 54741317  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    ||||| |||||||||||    
T  54741318 tataattcacacttgca 54741334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43174623 - 43174508
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact-attttatctgatgtgggac 212  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||||||  |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  43174623 agagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggc 43174524  T
Q  213 atataactcacacttg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  43174523 atataactcacacttg 43174508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788147
Alignment:
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaaca 50788147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 51768035 - 51768216
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||| | || ||| || ||||||| |  ||| ||||| |||||||||||     
T  51768035 tgttgggtcatgagggaagtttgggagaccgtccacatcgaggtt--agaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaaga 51768132  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||  ||| | |||||||||||||||| |||||    
T  51768133 caatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgca 51768216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504707
Alignment:
Q  82 catcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgt 181  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||         ||||    
T  19504842 catcgaggct--agaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgt 19504754  T
Q  182 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  19504753 tcaacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttg 19504707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18879987 - 18879852
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    ||||||||||   |||||| | || ||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  18879987 tgttgggtcattgggggagctcggaggaccgtccacatcgaagct--agaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagg 18879890  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttca 184  Q
     ||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  18879889 aaataggtttataggtcatcttacttataaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43827598 - 43827480
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  43827598 gggggaccgtccacatcgaggtt--agaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatc-caaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctctt 43827502  T
Q  169 acttatatggtgttcaaccttt 190  Q
    | ||||| || |||||| ||||    
T  43827501 atttataaggagttcaatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31691304 - 31691207
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaaga--gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttata 175  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31691304 tccacatcgaggct--agaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3700539 - 3700365
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||| |||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  | |||| |||||   | ||||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  3700539 ttgttaggtcactagaggagttcgggagaccgtccacatcgaggcttga--ataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaag 3700442  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||        || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3700441 gcaa--------tgagtccttttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 3700365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28034345 - 28034229
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||| ||||||    
T  28034345 agagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggaca 28034246  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    ||||| |||||||||||    
T  28034245 tataattcacacttgca 28034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620304
Alignment:
Q  164 ctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactca 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246347
Alignment:
Q  141 ttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||  |||||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgca 10246347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 760304 - 760194
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||| | | || |||  |||||||||||    
T  760304 agagacaccacacttttaccaaaatc-ttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtgggaca 760206  T
Q  214 tataactcacac 225  Q
    ||||||||||||    
T  760205 tataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40067180 - 40067045
Alignment:
Q  94 agaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaac-ctttac 192  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |  || | |||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||    
T  40067180 agaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaactttttac 40067081  T
Q  193 tattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
      ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  40067080 acttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 201
Target Start/End: Original strand, 48111738 - 48111825
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatc 201  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  48111738 agagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttacttataatgtgttcaacctttactcttttatc 48111825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621426
Alignment:
Q  164 ctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgca 44621426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3271895 - 3271806
Alignment:
Q  122 cacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttactt---atatggtgttcaacctttactattttatctgatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||   ||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  3271895 cacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctcttacttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtg 3271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Original strand, 45489688 - 45489864
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| |  |||||||||| ||  |||||||||   ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  45489688 ttgttgggtcactggaggagtttgggggatcggccacatcgagact--agaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaaa 45489785  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 224  Q
          |||||| || || ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  45489786 ctttaaggtttaaggatcatcttacttatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcaca 45489864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Original strand, 11348410 - 11348484
Alignment:
Q  156 tatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  11348410 tatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgca 11348484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Original strand, 15841408 - 15841510
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||| |  |||||||||||  ||| || ||| ||||||| ||||    
T  15841408 agagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacctccacttttctatttgatgtgagaca 15841507  T
Q  214 tat 216  Q
    |||    
T  15841508 tat 15841510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11197342 - 11197293
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11197342 agagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620946
Alignment:
Q  164 ctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatg-tgggacatataactcacacttg 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttg 44620946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050601
Alignment:
Q  182 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgca 45050601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34544223 - 34544148
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacct 188  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||    
T  34544223 agagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacct 34544148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10396247 - 10396185
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatat 176  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  10396247 agagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtcttctctcttatat 10396185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 18933096 - 18933134
Alignment:
Q  200 tctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933096 tctgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 18933134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Original strand, 15841025 - 15841134
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||||| |||||||   |||||| |||  ||| || |||||||| |||||||    
T  15841025 agagacaatacactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatgggaca 15841123  T
Q  214 tataactcaca 224  Q
    ||||| |||||    
T  15841124 tataattcaca 15841134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10396532 - 10396483
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtc 163  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396532 agagagaccacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 230
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557022
Alignment:
Q  98 caaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattt 197  Q
    ||||| |||||| || ||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||| |  ||||||| | |||||| |||||   ||||||||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  198 tatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||| |||||   |||| |||||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttgca 23557022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Original strand, 491 - 670
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  491 tgttgggtcactggggaagctcgggggaccttccacatcgaggct--agaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 588  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  589 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 239
Target Start/End: Original strand, 123 - 309
Alignment:
Q  46 ttgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 145  Q
    |||||||||||| || | || | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |  |||     
T  123 ttgttgggtcactagagaagctcgggggaccgtccacatcgaggct--agaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaacc--taaa 218  T
Q  146 gcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 239  Q
    | |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219 gtat--ggtttatgg-tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1262
Alignment:
Q  47 tgttgggtcacaaggggagtttgggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 146  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| || || ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1083 tgttgggtcactgggggagcttggggaaccgtccacatcgaggct--agaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaagg 1180  T
Q  147 caacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1181 caatgggtttatgagtcctttttcttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 183
Target Start/End: Original strand, 1733 - 1802
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttc 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1733 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 230
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3143
Alignment:
Q  179 tgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 3143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5917 - 5777
Alignment:
Q  95 gaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttac-caaaa----accttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctt 189  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5917 gaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 5818  T
Q  190 tactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5817 tactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgca 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5396
Alignment:
Q  79 ccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |    
T  5546 ccacatcgaggcttga--acaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataag 5449  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5448 gtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 230
Target Start/End: Original strand, 17492 - 17614
Alignment:
Q  110 caaaagagacaccacactcttacc--aaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgt 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17492 caaaagagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 17591  T
Q  208 gggacatataactcacacttgca 230  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  17592 gtgacatataactcacacttgca 17614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47519 - 47360
Alignment:
Q  69 gggggaccttccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctt 168  Q
    |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||    
T  47519 gggggaccgtccacatcgaggtt--agaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctctt 47422  T
Q  169 acttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  47421 acttataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgca 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5473 - 5357
Alignment:
Q  114 agagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggaca 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||    
T  5473 agagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtggaaca 5374  T
Q  214 tataactcacacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  5373 tataactcacacttgca 5357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5132 - 4982
Alignment:
Q  78 tccacatcgaggctcgagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttatatg 177  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |    
T  5132 tccacatcgaggctagag--caaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataag 5035  T
Q  178 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 230  Q
     | || |||||||||| || | || |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5034 atattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgca 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 228
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10267
Alignment:
Q  153 gtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University