View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13513_low_6 (Length: 256)

Name: NF13513_low_6
Description: NF13513
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13513_low_6
NF13513_low_6
[»] chr4 (104 HSPs)
chr4 (50-224)||(28570666-28570840)
chr4 (12-191)||(21218054-21218233)
chr4 (12-188)||(45911582-45911758)
chr4 (12-191)||(54136091-54136270)
chr4 (12-193)||(33626071-33626252)
chr4 (15-191)||(9010505-9010681)
chr4 (12-191)||(29864176-29864355)
chr4 (12-193)||(25218082-25218263)
chr4 (12-193)||(34958830-34959010)
chr4 (12-193)||(45683115-45683296)
chr4 (12-191)||(43316880-43317058)
chr4 (12-187)||(44432831-44433006)
chr4 (38-187)||(33625868-33626017)
chr4 (12-191)||(46200484-46200664)
chr4 (12-188)||(46621134-46621310)
chr4 (38-189)||(29864408-29864559)
chr4 (12-191)||(44710403-44710582)
chr4 (12-193)||(10014463-10014643)
chr4 (12-193)||(10021604-10021784)
chr4 (12-169)||(27347804-27347961)
chr4 (38-187)||(33882182-33882331)
chr4 (38-187)||(46620931-46621080)
chr4 (38-191)||(52914952-52915105)
chr4 (12-191)||(40067348-40067527)
chr4 (38-193)||(40067581-40067736)
chr4 (13-195)||(8246765-8246945)
chr4 (45-191)||(43317119-43317265)
chr4 (19-169)||(53645473-53645623)
chr4 (38-191)||(21217847-21218000)
chr4 (50-191)||(48209948-48210089)
chr4 (12-192)||(1205584-1205764)
chr4 (12-191)||(12381261-12381440)
chr4 (12-193)||(1157201-1157385)
chr4 (38-188)||(25058836-25058986)
chr4 (37-191)||(32384653-32384807)
chr4 (38-188)||(34959064-34959214)
chr4 (38-191)||(45911807-45911960)
chr4 (44-168)||(4965894-4966018)
chr4 (38-193)||(2738878-2739033)
chr4 (38-169)||(25218317-25218448)
chr4 (38-188)||(1157439-1157589)
chr4 (38-191)||(25593324-25593477)
chr4 (38-191)||(38866398-38866551)
chr4 (12-193)||(24503937-24504119)
chr4 (12-169)||(4966075-4966232)
chr4 (38-191)||(9010738-9010891)
chr4 (38-191)||(45683350-45683503)
chr4 (44-188)||(4793838-4793981)
chr4 (38-190)||(21051360-21051512)
chr4 (49-169)||(37515697-37515817)
chr4 (38-188)||(1205381-1205530)
chr4 (38-188)||(24504173-24504323)
chr4 (38-192)||(27347596-27347750)
chr4 (38-188)||(29970196-29970345)
chr4 (12-190)||(46535729-46535907)
chr4 (38-193)||(18862673-18862829)
chr4 (38-146)||(44428616-44428724)
chr4 (31-146)||(21051573-21051688)
chr4 (38-188)||(22831030-22831181)
chr4 (38-193)||(44710636-44710791)
chr4 (38-193)||(46535521-46535675)
chr4 (38-188)||(8246979-8247129)
chr4 (38-188)||(32385045-32385194)
chr4 (44-191)||(52915182-52915331)
chr4 (12-188)||(38866606-38866783)
chr4 (7-191)||(44169979-44170163)
chr4 (38-191)||(46200718-46200871)
chr4 (37-189)||(8751289-8751441)
chr4 (12-168)||(43969734-43969890)
chr4 (44-191)||(10014703-10014849)
chr4 (44-191)||(10021844-10021990)
chr4 (37-190)||(11242701-11242849)
chr4 (12-191)||(22830796-22830976)
chr4 (12-141)||(54191638-54191764)
chr4 (46-191)||(9657667-9657812)
chr4 (48-188)||(15985469-15985610)
chr4 (47-179)||(25977781-25977913)
chr4 (54-153)||(21885073-21885172)
chr4 (49-188)||(11102218-11102358)
chr4 (49-189)||(44170223-44170365)
chr4 (37-191)||(9657879-9658033)
chr4 (12-108)||(29970399-29970495)
chr4 (38-191)||(54136324-54136473)
chr4 (38-190)||(54191818-54191969)
chr4 (31-138)||(42779573-42779680)
chr4 (110-191)||(44428513-44428594)
chr4 (12-67)||(4793723-4793778)
chr4 (38-191)||(15985695-15985849)
chr4 (74-188)||(37515532-37515645)
chr4 (38-117)||(43969599-43969679)
chr4 (105-167)||(53994958-53995020)
chr4 (150-193)||(10017813-10017856)
chr4 (128-179)||(40680478-40680529)
chr4 (103-146)||(44428587-44428630)
chr4 (109-191)||(1433639-1433721)
chr4 (128-178)||(3503964-3504014)
chr4 (128-178)||(14525932-14525982)
chr4 (109-167)||(16037818-16037876)
chr4 (128-178)||(24045842-24045892)
chr4 (109-191)||(31214162-31214244)
chr4 (128-178)||(43291956-43292006)
chr4 (42-167)||(47603661-47603787)
chr4 (134-178)||(5904889-5904933)
chr4 (109-193)||(8592337-8592421)
[»] chr2 (117 HSPs)
chr2 (12-191)||(28203067-28203246)
chr2 (12-200)||(36211341-36211529)
chr2 (12-193)||(41377561-41377742)
chr2 (12-188)||(32933594-32933770)
chr2 (12-188)||(43183790-43183966)
chr2 (12-191)||(5961669-5961848)
chr2 (12-193)||(20908718-20908899)
chr2 (38-191)||(25642501-25642654)
chr2 (12-191)||(13354177-13354356)
chr2 (12-191)||(16736101-16736280)
chr2 (11-190)||(38275661-38275842)
chr2 (12-193)||(27883466-27883647)
chr2 (12-192)||(27132717-27132897)
chr2 (12-191)||(12304361-12304540)
chr2 (44-191)||(39454451-39454598)
chr2 (12-193)||(4104157-4104338)
chr2 (12-193)||(31450873-31451054)
chr2 (7-188)||(34820481-34820662)
chr2 (38-187)||(16655610-16655759)
chr2 (38-191)||(31450666-31450819)
chr2 (38-187)||(34820283-34820432)
chr2 (38-191)||(41377355-41377507)
chr2 (12-184)||(12303992-12304164)
chr2 (12-188)||(16655813-16655989)
chr2 (37-193)||(28202858-28203014)
chr2 (12-168)||(39149867-39150023)
chr2 (44-191)||(18565066-18565213)
chr2 (13-188)||(28631482-28631657)
chr2 (12-190)||(16260872-16261049)
chr2 (38-188)||(37744621-37744771)
chr2 (43-191)||(39912864-39913014)
chr2 (38-191)||(15137037-15137190)
chr2 (38-191)||(21470295-21470448)
chr2 (12-188)||(39912630-39912807)
chr2 (44-192)||(37412817-37412965)
chr2 (38-193)||(32933824-32933979)
chr2 (12-193)||(10833241-10833423)
chr2 (12-186)||(25642273-25642447)
chr2 (38-188)||(27132514-27132664)
chr2 (15-189)||(34127775-34127948)
chr2 (38-191)||(17856199-17856352)
chr2 (38-195)||(28631270-28631427)
chr2 (38-190)||(12303786-12303938)
chr2 (12-191)||(17856395-17856575)
chr2 (38-191)||(27883690-27883847)
chr2 (12-191)||(4120764-4120942)
chr2 (12-191)||(5921593-5921772)
chr2 (12-199)||(32503538-32503725)
chr2 (38-192)||(16736331-16736485)
chr2 (12-190)||(36442341-36442519)
chr2 (38-191)||(27476600-27476753)
chr2 (38-199)||(41659737-41659898)
chr2 (44-188)||(38275480-38275624)
chr2 (12-188)||(44915743-44915918)
chr2 (23-178)||(15829733-15829888)
chr2 (38-192)||(4104392-4104546)
chr2 (16-186)||(21470506-21470675)
chr2 (38-168)||(40694408-40694538)
chr2 (38-191)||(13354410-13354563)
chr2 (38-191)||(16261103-16261256)
chr2 (12-188)||(27476369-27476546)
chr2 (38-191)||(44612716-44612870)
chr2 (38-193)||(4120996-4121151)
chr2 (50-189)||(43183585-43183724)
chr2 (38-191)||(20908511-20908664)
chr2 (38-191)||(33819629-33819780)
chr2 (38-191)||(45389131-45389284)
chr2 (44-188)||(32503776-32503920)
chr2 (12-188)||(33819400-33819575)
chr2 (38-189)||(37412595-37412746)
chr2 (49-187)||(34127570-34127708)
chr2 (52-191)||(14877483-14877620)
chr2 (12-191)||(27246190-27246369)
chr2 (12-191)||(27914100-27914279)
chr2 (44-168)||(35408760-35408884)
chr2 (70-189)||(37744451-37744570)
chr2 (44-191)||(39150064-39150211)
chr2 (37-191)||(40694195-40694349)
chr2 (12-189)||(39454649-39454817)
chr2 (44-146)||(36211580-36211682)
chr2 (12-166)||(11943699-11943849)
chr2 (26-188)||(16350080-16350242)
chr2 (38-191)||(36442133-36442287)
chr2 (38-146)||(44915972-44916080)
chr2 (62-169)||(34484303-34484410)
chr2 (44-188)||(41659975-41660119)
chr2 (80-193)||(18565278-18565391)
chr2 (12-188)||(5720145-5720318)
chr2 (44-146)||(16350310-16350412)
chr2 (103-192)||(36211697-36211786)
chr2 (12-134)||(44612548-44612662)
chr2 (103-193)||(20297408-20297498)
chr2 (44-169)||(27913916-27914041)
chr2 (121-188)||(34484238-34484305)
chr2 (38-108)||(27246066-27246136)
chr2 (64-199)||(23992164-23992300)
chr2 (43-169)||(3603526-3603653)
chr2 (12-74)||(14877684-14877746)
chr2 (112-169)||(1580148-1580205)
chr2 (48-98)||(29078010-29078060)
chr2 (69-139)||(1580057-1580128)
chr2 (103-146)||(36211668-36211711)
chr2 (128-179)||(40469092-40469143)
chr2 (126-188)||(44610865-44610926)
chr2 (109-193)||(15744815-15744899)
chr2 (66-155)||(35738399-35738489)
chr2 (128-179)||(8030004-8030055)
chr2 (128-179)||(28189459-28189510)
chr2 (114-193)||(38073790-38073869)
chr2 (128-178)||(5484936-5484986)
chr2 (21-71)||(15136934-15136984)
chr2 (128-178)||(19299826-19299876)
chr2 (128-178)||(25334604-25334654)
chr2 (128-178)||(26424819-26424869)
chr2 (128-169)||(13479105-13479146)
chr2 (124-189)||(29076552-29076617)
chr2 (128-192)||(33200520-33200584)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (12-188)||(33544825-33545001)
chr6 (12-193)||(14336900-14337081)
chr6 (12-191)||(35132601-35132780)
chr6 (12-193)||(9173899-9174080)
chr6 (38-190)||(6220289-6220441)
chr6 (38-188)||(24604878-24605027)
chr6 (12-193)||(24605081-24605261)
chr6 (12-191)||(2949296-2949470)
chr6 (19-193)||(7537819-7537994)
chr6 (38-188)||(31029527-31029677)
chr6 (38-191)||(3338477-3338630)
chr6 (38-191)||(14337135-14337287)
chr6 (38-191)||(33329206-33329359)
chr6 (37-193)||(3289142-3289298)
chr6 (12-191)||(3338684-3338861)
chr6 (12-192)||(31029731-31029911)
chr6 (31-191)||(33346478-33346638)
chr6 (38-192)||(1860719-1860872)
chr6 (26-192)||(12903220-12903386)
chr6 (38-168)||(33545055-33545185)
chr6 (38-191)||(25551347-25551500)
chr6 (12-188)||(6220059-6220235)
chr6 (12-188)||(13156046-13156217)
chr6 (12-188)||(13160902-13161073)
chr6 (31-191)||(35119037-35119197)
chr6 (12-191)||(1158798-1158975)
chr6 (38-189)||(29009956-29010107)
chr6 (38-191)||(3288930-3289083)
chr6 (12-191)||(29010161-29010340)
chr6 (44-188)||(25551575-25551719)
chr6 (12-178)||(11524778-11524945)
chr6 (38-193)||(1158586-1158743)
chr6 (38-191)||(11524999-11525151)
chr6 (44-179)||(24548480-24548615)
chr6 (51-146)||(33972452-33972547)
chr6 (38-180)||(13155850-13155992)
chr6 (38-180)||(13160706-13160848)
chr6 (38-146)||(2949524-2949632)
chr6 (44-191)||(19135685-19135832)
chr6 (13-191)||(24548241-24548419)
chr6 (11-163)||(12903417-12903569)
chr6 (55-193)||(29999653-29999791)
chr6 (54-179)||(2814560-2814685)
chr6 (76-193)||(32283024-32283141)
chr6 (38-188)||(17544686-17544835)
chr6 (37-169)||(2315601-2315733)
chr6 (12-113)||(33329413-33329514)
chr6 (12-146)||(31754249-31754383)
chr6 (38-191)||(35132834-35132976)
chr6 (12-193)||(17544452-17544632)
chr6 (12-103)||(33972292-33972385)
chr6 (14-94)||(29999510-29999590)
chr6 (103-190)||(11524706-11524793)
chr6 (64-191)||(17245582-17245710)
chr6 (50-180)||(34181908-34182039)
chr6 (121-191)||(33548173-33548243)
chr6 (64-192)||(6229645-6229773)
chr6 (76-153)||(7162401-7162479)
chr6 (55-169)||(17971768-17971883)
chr6 (128-179)||(12261485-12261536)
chr6 (128-178)||(27128857-27128907)
chr6 (48-98)||(29467199-29467249)
chr6 (126-188)||(33971931-33971993)
chr6 (102-166)||(27829326-27829390)
[»] chr1 (139 HSPs)
chr1 (12-191)||(52412805-52412984)
chr1 (12-188)||(19986329-19986505)
chr1 (12-188)||(37199128-37199304)
chr1 (12-191)||(34028721-34028900)
chr1 (12-190)||(16267716-16267894)
chr1 (12-184)||(10654236-10654408)
chr1 (15-191)||(10923573-10923749)
chr1 (12-189)||(11787742-11787919)
chr1 (12-193)||(24590432-24590613)
chr1 (12-192)||(14775942-14776122)
chr1 (24-191)||(23281229-23281396)
chr1 (12-191)||(32564157-32564335)
chr1 (12-189)||(35986234-35986411)
chr1 (12-191)||(34279447-34279627)
chr1 (38-202)||(51691864-51692027)
chr1 (12-191)||(5463325-5463504)
chr1 (44-191)||(32563959-32564106)
chr1 (12-191)||(45305617-45305795)
chr1 (12-189)||(18793693-18793871)
chr1 (12-186)||(29257030-29257204)
chr1 (12-189)||(21035987-21036164)
chr1 (38-191)||(34028954-34029107)
chr1 (38-191)||(37198932-37199085)
chr1 (12-191)||(4045306-4045485)
chr1 (38-193)||(22584349-22584504)
chr1 (24-191)||(33753225-33753392)
chr1 (12-193)||(22584558-22584740)
chr1 (12-190)||(50921061-50921239)
chr1 (12-191)||(14118530-14118706)
chr1 (38-191)||(16267923-16268075)
chr1 (12-188)||(30611223-30611399)
chr1 (37-185)||(50574749-50574897)
chr1 (37-188)||(42607525-42607676)
chr1 (38-188)||(6181619-6181769)
chr1 (37-198)||(9881545-9881705)
chr1 (38-191)||(25088016-25088169)
chr1 (15-188)||(30293016-30293189)
chr1 (38-187)||(51810141-51810290)
chr1 (12-188)||(24655589-24655765)
chr1 (12-188)||(49291190-49291366)
chr1 (16-191)||(6181827-6182002)
chr1 (12-189)||(51692081-51692254)
chr1 (37-191)||(28970419-28970573)
chr1 (12-188)||(13944514-13944690)
chr1 (12-143)||(13831229-13831360)
chr1 (38-190)||(30611453-30611606)
chr1 (38-191)||(46738957-46739109)
chr1 (12-191)||(4550807-4550986)
chr1 (44-180)||(29256843-29256979)
chr1 (38-193)||(13944744-13944899)
chr1 (44-191)||(21385175-21385322)
chr1 (44-191)||(52412598-52412745)
chr1 (37-191)||(46949756-46949910)
chr1 (38-188)||(50118350-50118500)
chr1 (46-191)||(10654030-10654174)
chr1 (44-188)||(32517752-32517894)
chr1 (38-167)||(33753449-33753578)
chr1 (38-187)||(36657734-36657883)
chr1 (12-168)||(21384960-21385115)
chr1 (12-180)||(51810345-51810513)
chr1 (38-189)||(11394893-11395044)
chr1 (38-188)||(30293246-30293395)
chr1 (38-168)||(49291016-49291146)
chr1 (15-180)||(9119303-9119468)
chr1 (38-190)||(42607735-42607887)
chr1 (23-191)||(1831664-1831828)
chr1 (44-191)||(24655825-24655972)
chr1 (21-191)||(11787957-11788126)
chr1 (38-179)||(27209181-27209322)
chr1 (37-146)||(28112795-28112904)
chr1 (38-191)||(34279240-34279393)
chr1 (12-190)||(36657501-36657680)
chr1 (44-169)||(50574536-50574661)
chr1 (38-146)||(5118096-5118204)
chr1 (12-180)||(25088223-25088390)
chr1 (12-124)||(30792647-30792759)
chr1 (12-188)||(40533928-40534104)
chr1 (12-187)||(40703072-40703247)
chr1 (49-188)||(45305412-45305552)
chr1 (38-180)||(10923373-10923516)
chr1 (38-153)||(46949969-46950084)
chr1 (38-191)||(14775745-14775898)
chr1 (38-191)||(30792440-30792593)
chr1 (12-187)||(2125416-2125584)
chr1 (38-191)||(18793925-18794079)
chr1 (38-169)||(4045121-4045252)
chr1 (12-188)||(36884725-36884894)
chr1 (38-188)||(44222195-44222345)
chr1 (50-179)||(34621880-34622009)
chr1 (80-191)||(50921366-50921477)
chr1 (17-146)||(19886099-19886226)
chr1 (38-172)||(24590245-24590379)
chr1 (15-179)||(3569388-3569553)
chr1 (13-191)||(20260587-20260765)
chr1 (48-191)||(21036225-21036367)
chr1 (38-188)||(1831897-1832047)
chr1 (61-167)||(32517629-32517735)
chr1 (38-131)||(9119525-9119618)
chr1 (45-146)||(11797220-11797321)
chr1 (81-191)||(36077271-36077381)
chr1 (38-189)||(31125938-31126082)
chr1 (43-191)||(48702119-48702266)
chr1 (38-119)||(50921293-50921374)
chr1 (38-152)||(5463156-5463271)
chr1 (85-188)||(19885985-19886088)
chr1 (12-147)||(31126136-31126271)
chr1 (24-188)||(34621624-34621788)
chr1 (45-138)||(36884944-36885037)
chr1 (44-179)||(40702880-40703012)
chr1 (83-179)||(20260440-20260536)
chr1 (37-191)||(27209381-27209535)
chr1 (38-179)||(40534158-40534299)
chr1 (105-193)||(19886214-19886302)
chr1 (105-189)||(5117995-5118079)
chr1 (52-137)||(4054602-4054688)
chr1 (105-191)||(28112721-28112807)
chr1 (105-190)||(11797147-11797232)
chr1 (102-191)||(19269360-19269449)
chr1 (107-187)||(11394697-11394776)
chr1 (49-121)||(38961145-38961218)
chr1 (12-87)||(11394765-11394839)
chr1 (105-167)||(25995808-25995870)
chr1 (42-127)||(43727368-43727454)
chr1 (105-146)||(5118067-5118108)
chr1 (102-146)||(38961089-38961133)
chr1 (102-190)||(43727274-43727362)
chr1 (12-59)||(48702023-48702070)
chr1 (128-178)||(6137246-6137296)
chr1 (128-178)||(6714698-6714748)
chr1 (128-178)||(9478612-9478662)
chr1 (128-178)||(15073428-15073478)
chr1 (128-178)||(32193530-32193580)
chr1 (128-178)||(33171835-33171885)
chr1 (128-178)||(45678385-45678435)
chr1 (134-179)||(1524017-1524062)
chr1 (128-169)||(29022544-29022585)
chr1 (128-169)||(49652420-49652461)
chr1 (125-169)||(6241275-6241319)
chr1 (43-87)||(6241326-6241370)
[»] chr8 (102 HSPs)
chr8 (12-189)||(119119-119295)
chr8 (12-191)||(31230613-31230792)
chr8 (12-191)||(35223974-35224153)
chr8 (12-190)||(39240031-39240209)
chr8 (38-191)||(24456885-24457038)
chr8 (15-191)||(18621957-18622133)
chr8 (12-185)||(23244722-23244895)
chr8 (12-188)||(8654143-8654319)
chr8 (12-188)||(9495230-9495406)
chr8 (12-191)||(3869156-3869335)
chr8 (38-189)||(37393710-37393861)
chr8 (12-193)||(21515407-21515588)
chr8 (38-186)||(14920644-14920792)
chr8 (12-191)||(30872783-30872966)
chr8 (38-192)||(40040161-40040315)
chr8 (44-193)||(1826030-1826179)
chr8 (44-193)||(1860475-1860624)
chr8 (38-188)||(6843498-6843650)
chr8 (12-188)||(37393480-37393656)
chr8 (44-188)||(39912158-39912302)
chr8 (12-191)||(7041836-7042010)
chr8 (44-191)||(18017790-18017937)
chr8 (38-193)||(26736123-26736278)
chr8 (38-193)||(31230846-31231001)
chr8 (38-191)||(11198438-11198591)
chr8 (12-188)||(16645752-16645931)
chr8 (12-189)||(26736332-26736509)
chr8 (12-189)||(30568483-30568660)
chr8 (38-191)||(30650190-30650343)
chr8 (38-191)||(35223774-35223927)
chr8 (12-193)||(39911915-39912096)
chr8 (37-193)||(119348-119504)
chr8 (12-191)||(758551-758730)
chr8 (12-191)||(14920411-14920590)
chr8 (38-188)||(23244518-23244668)
chr8 (12-191)||(29027179-29027354)
chr8 (44-193)||(40032424-40032574)
chr8 (44-189)||(44254867-44255012)
chr8 (18-191)||(5416812-5416985)
chr8 (38-189)||(5417046-5417197)
chr8 (44-192)||(18914490-18914638)
chr8 (37-188)||(18018018-18018169)
chr8 (12-191)||(36343962-36344140)
chr8 (38-193)||(39240252-39240407)
chr8 (38-191)||(8653936-8654089)
chr8 (38-188)||(29026971-29027125)
chr8 (38-169)||(40094497-40094628)
chr8 (38-188)||(758347-758497)
chr8 (14-153)||(18914297-18914437)
chr8 (12-191)||(1825810-1825988)
chr8 (12-191)||(1860255-1860433)
chr8 (44-191)||(30873017-30873164)
chr8 (12-187)||(40094682-40094857)
chr8 (44-189)||(3868946-3869094)
chr8 (12-191)||(44255072-44255248)
chr8 (12-191)||(33542384-33542563)
chr8 (12-191)||(12873255-12873432)
chr8 (38-167)||(7041653-7041782)
chr8 (38-191)||(11639052-11639204)
chr8 (48-191)||(28206996-28207139)
chr8 (38-169)||(5525893-5526022)
chr8 (47-146)||(44678426-44678525)
chr8 (44-178)||(12873070-12873204)
chr8 (12-146)||(26217276-26217410)
chr8 (38-179)||(410595-410736)
chr8 (52-136)||(30568331-30568415)
chr8 (38-162)||(32733740-32733864)
chr8 (12-120)||(40040369-40040477)
chr8 (54-188)||(36344210-36344344)
chr8 (44-192)||(28206765-28206913)
chr8 (39-179)||(35485883-35486023)
chr8 (109-191)||(24456734-24456816)
chr8 (60-193)||(6844695-6844828)
chr8 (38-179)||(26217082-26217222)
chr8 (70-193)||(40032693-40032817)
chr8 (14-145)||(410415-410543)
chr8 (43-191)||(45436398-45436548)
chr8 (38-152)||(33542617-33542731)
chr8 (12-109)||(11639258-11639354)
chr8 (80-191)||(21512413-21512523)
chr8 (112-191)||(44678317-44678396)
chr8 (14-169)||(19302207-19302362)
chr8 (49-188)||(29769366-29769505)
chr8 (12-185)||(35486069-35486243)
chr8 (56-141)||(19302427-19302513)
chr8 (109-189)||(44678517-44678596)
chr8 (38-88)||(16645648-16645698)
chr8 (44-117)||(9495106-9495179)
chr8 (43-193)||(15740611-15740761)
chr8 (12-59)||(30650397-30650444)
chr8 (16-68)||(6843697-6843749)
chr8 (42-127)||(15741501-15741587)
chr8 (111-189)||(26217404-26217485)
chr8 (42-127)||(29770268-29770354)
chr8 (102-191)||(29770360-29770449)
chr8 (128-179)||(13462118-13462169)
chr8 (127-178)||(15271136-15271187)
chr8 (102-193)||(15741593-15741684)
chr8 (84-135)||(18623668-18623719)
chr8 (128-179)||(43633135-43633186)
chr8 (128-183)||(43633584-43633639)
chr8 (109-167)||(34470912-34470970)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (11-191)||(2357067-2357247)
chr7 (12-191)||(43726449-43726628)
chr7 (12-191)||(31715829-31716007)
chr7 (12-191)||(35085739-35085918)
chr7 (12-193)||(11678910-11679090)
chr7 (12-190)||(26920124-26920302)
chr7 (15-191)||(5238451-5238627)
chr7 (12-188)||(21522425-21522599)
chr7 (12-191)||(9230884-9231063)
chr7 (44-191)||(47250785-47250932)
chr7 (38-191)||(23437152-23437305)
chr7 (36-193)||(23472787-23472944)
chr7 (12-188)||(8769285-8769461)
chr7 (12-192)||(18731018-18731198)
chr7 (12-188)||(43140701-43140876)
chr7 (50-189)||(8769527-8769666)
chr7 (38-191)||(10625317-10625470)
chr7 (12-189)||(38842229-38842405)
chr7 (12-163)||(34568790-34568942)
chr7 (12-150)||(23437359-23437497)
chr7 (38-191)||(31715633-31715786)
chr7 (12-191)||(32706939-32707117)
chr7 (38-191)||(35085973-35086126)
chr7 (15-184)||(47250565-47250733)
chr7 (12-168)||(44448120-44448275)
chr7 (12-191)||(47305127-47305306)
chr7 (44-191)||(24119714-24119861)
chr7 (44-191)||(47251136-47251282)
chr7 (38-191)||(9034548-9034701)
chr7 (38-191)||(11678703-11678856)
chr7 (12-191)||(473192-473368)
chr7 (38-147)||(9230720-9230829)
chr7 (38-191)||(23472593-23472746)
chr7 (44-188)||(473419-473563)
chr7 (38-189)||(34568585-34568736)
chr7 (38-188)||(39118013-39118163)
chr7 (38-192)||(44486165-44486319)
chr7 (49-193)||(22338270-22338415)
chr7 (38-191)||(32706732-32706885)
chr7 (38-179)||(36507042-36507183)
chr7 (44-169)||(41758701-41758826)
chr7 (38-185)||(21522226-21522371)
chr7 (12-188)||(37143970-37144146)
chr7 (12-180)||(48704016-48704183)
chr7 (49-189)||(44447916-44448055)
chr7 (12-146)||(47250942-47251076)
chr7 (44-192)||(44485571-44485719)
chr7 (50-189)||(2357300-2357439)
chr7 (25-192)||(31623644-31623811)
chr7 (44-142)||(38842081-38842178)
chr7 (38-188)||(43726247-43726395)
chr7 (12-94)||(10625180-10625262)
chr7 (54-192)||(37143763-37143900)
chr7 (38-168)||(47305360-47305490)
chr7 (38-179)||(28349614-28349754)
chr7 (14-191)||(22338482-22338662)
chr7 (38-138)||(48703862-48703962)
chr7 (43-180)||(38676069-38676206)
chr7 (43-191)||(40263550-40263697)
chr7 (65-191)||(15326872-15326998)
chr7 (116-191)||(10625106-10625181)
chr7 (112-191)||(28263496-28263575)
chr7 (12-94)||(28349480-28349560)
chr7 (12-138)||(36506865-36506991)
chr7 (102-191)||(38677039-38677128)
chr7 (66-146)||(43050429-43050510)
chr7 (128-183)||(30474284-30474339)
chr7 (91-188)||(4156538-4156636)
chr7 (139-193)||(28349418-28349472)
chr7 (48-167)||(8417242-8417362)
chr7 (128-179)||(17278411-17278462)
chr7 (105-168)||(28264652-28264715)
chr7 (128-179)||(30765680-30765731)
chr7 (128-179)||(43704957-43705008)
chr7 (128-178)||(5905141-5905191)
chr7 (39-121)||(15327096-15327178)
chr7 (128-178)||(16955944-16955994)
chr7 (128-178)||(23140247-23140297)
chr7 (155-193)||(23439515-23439553)
chr7 (109-167)||(28286141-28286199)
chr7 (128-178)||(43705386-43705436)
chr7 (128-178)||(45457099-45457149)
chr7 (50-87)||(17279358-17279395)
chr7 (42-121)||(40262715-40262796)
chr7 (105-193)||(36282784-36282872)
chr7 (130-178)||(42287324-42287372)
chr7 (114-146)||(48703825-48703857)
[»] chr5 (89 HSPs)
chr5 (12-192)||(10656301-10656481)
chr5 (12-193)||(334294-334475)
chr5 (12-191)||(35263494-35263673)
chr5 (15-193)||(40589655-40589833)
chr5 (38-190)||(7210678-7210830)
chr5 (12-192)||(31656565-31656745)
chr5 (12-191)||(12593456-12593635)
chr5 (12-188)||(41859884-41860062)
chr5 (15-193)||(40589052-40589230)
chr5 (12-191)||(3878481-3878660)
chr5 (12-191)||(9692919-9693097)
chr5 (12-191)||(38416341-38416520)
chr5 (38-191)||(7399077-7399230)
chr5 (38-191)||(10656094-10656247)
chr5 (38-187)||(12694919-12695068)
chr5 (12-188)||(15476466-15476641)
chr5 (12-199)||(19204935-19205122)
chr5 (12-187)||(39706258-39706433)
chr5 (12-186)||(7210461-7210635)
chr5 (12-169)||(7399285-7399442)
chr5 (44-193)||(15267479-15267628)
chr5 (38-193)||(31656355-31656511)
chr5 (44-192)||(42710589-42710737)
chr5 (12-191)||(16353361-16353540)
chr5 (44-191)||(35263733-35263880)
chr5 (38-188)||(19205176-19205326)
chr5 (48-193)||(28392012-28392158)
chr5 (12-188)||(25923121-25923297)
chr5 (12-192)||(31908927-31909109)
chr5 (38-189)||(36751904-36752055)
chr5 (12-191)||(40774544-40774723)
chr5 (38-180)||(26289031-26289173)
chr5 (12-188)||(5624382-5624558)
chr5 (44-188)||(9693157-9693301)
chr5 (12-199)||(8418393-8418578)
chr5 (38-192)||(16353150-16353307)
chr5 (38-168)||(12593689-12593819)
chr5 (38-188)||(31909163-31909313)
chr5 (49-191)||(33699275-33699417)
chr5 (38-187)||(5087811-5087960)
chr5 (38-191)||(40589287-40589440)
chr5 (38-191)||(40589890-40590043)
chr5 (38-191)||(29023937-29024087)
chr5 (49-191)||(18514288-18514430)
chr5 (12-193)||(28391766-28391948)
chr5 (38-179)||(5152848-5152989)
chr5 (12-188)||(15267245-15267418)
chr5 (12-193)||(17861037-17861217)
chr5 (12-169)||(33762924-33763084)
chr5 (47-189)||(32272082-32272224)
chr5 (12-190)||(42710351-42710529)
chr5 (38-179)||(41372391-41372532)
chr5 (63-191)||(5088386-5088514)
chr5 (55-191)||(38416143-38416279)
chr5 (38-190)||(40774339-40774490)
chr5 (44-191)||(39706055-39706198)
chr5 (50-191)||(33763153-33763293)
chr5 (12-191)||(5152616-5152795)
chr5 (55-186)||(8418206-8418336)
chr5 (12-191)||(36752109-36752287)
chr5 (38-189)||(43570004-43570155)
chr5 (38-191)||(25923352-25923504)
chr5 (55-191)||(14143755-14143891)
chr5 (15-191)||(14143512-14143681)
chr5 (38-191)||(17861271-17861416)
chr5 (44-188)||(15670390-15670534)
chr5 (80-180)||(15476277-15476377)
chr5 (100-191)||(21750810-21750901)
chr5 (15-191)||(26289230-26289406)
chr5 (48-188)||(14051892-14052032)
chr5 (79-178)||(17736521-17736620)
chr5 (43-179)||(2597322-2597458)
chr5 (100-191)||(3879307-3879398)
chr5 (115-191)||(5460188-5460264)
chr5 (12-72)||(43569889-43569949)
chr5 (12-71)||(5088014-5088073)
chr5 (44-98)||(5624617-5624671)
chr5 (64-191)||(19185506-19185634)
chr5 (128-179)||(38384880-38384931)
chr5 (38-89)||(41859779-41859830)
chr5 (44-94)||(3878720-3878770)
chr5 (131-188)||(5460272-5460329)
chr5 (45-78)||(21750901-21750934)
chr5 (128-200)||(42766808-42766880)
chr5 (105-167)||(19184621-19184683)
chr5 (122-191)||(2596388-2596457)
chr5 (43-127)||(2596473-2596558)
chr5 (128-193)||(6794774-6794839)
chr5 (12-56)||(12694821-12694865)
[»] chr3 (145 HSPs)
chr3 (12-191)||(34521266-34521445)
chr3 (12-188)||(41208404-41208580)
chr3 (38-192)||(54107668-54107822)
chr3 (12-192)||(31513862-31514042)
chr3 (12-191)||(12123090-12123269)
chr3 (12-191)||(15862382-15862561)
chr3 (12-191)||(28688197-28688376)
chr3 (12-193)||(8846074-8846255)
chr3 (12-192)||(7937770-7937950)
chr3 (12-191)||(44069330-44069509)
chr3 (38-188)||(12123312-12123462)
chr3 (38-188)||(40410715-40410865)
chr3 (14-191)||(45171068-45171245)
chr3 (12-188)||(14353255-14353430)
chr3 (12-179)||(7742972-7743139)
chr3 (38-191)||(4846829-4846982)
chr3 (12-191)||(26332525-26332708)
chr3 (12-188)||(40926014-40926190)
chr3 (12-191)||(54081490-54081670)
chr3 (12-187)||(7274850-7275024)
chr3 (38-197)||(27940266-27940425)
chr3 (38-191)||(26332319-26332472)
chr3 (38-191)||(45871697-45871850)
chr3 (38-190)||(45171300-45171452)
chr3 (38-193)||(8846309-8846464)
chr3 (12-193)||(40969253-40969434)
chr3 (45-191)||(41997819-41997965)
chr3 (38-191)||(54108353-54108506)
chr3 (12-188)||(28691321-28691496)
chr3 (15-191)||(43899284-43899460)
chr3 (38-189)||(10756720-10756871)
chr3 (46-189)||(40926252-40926394)
chr3 (38-193)||(44069121-44069276)
chr3 (44-191)||(52606129-52606275)
chr3 (15-191)||(50819220-50819393)
chr3 (15-191)||(50856471-50856644)
chr3 (28-186)||(53841249-53841407)
chr3 (38-191)||(7950275-7950428)
chr3 (14-190)||(29248320-29248494)
chr3 (54-191)||(41208649-41208786)
chr3 (12-188)||(21169669-21169845)
chr3 (12-188)||(35753638-35753814)
chr3 (45-188)||(14353049-14353192)
chr3 (38-164)||(28688017-28688143)
chr3 (38-180)||(34629993-34630135)
chr3 (66-188)||(35580210-35580332)
chr3 (12-188)||(2829410-2829587)
chr3 (38-191)||(15862182-15862335)
chr3 (38-191)||(50819450-50819603)
chr3 (38-191)||(50856261-50856414)
chr3 (44-188)||(34521496-34521640)
chr3 (12-191)||(17102384-17102563)
chr3 (44-190)||(19124411-19124556)
chr3 (38-168)||(27254007-27254137)
chr3 (38-191)||(2829641-2829793)
chr3 (38-191)||(9028191-9028344)
chr3 (15-192)||(9028401-9028578)
chr3 (38-191)||(31514096-31514248)
chr3 (39-188)||(29248542-29248691)
chr3 (38-191)||(52268337-52268489)
chr3 (38-188)||(46766625-46766776)
chr3 (12-191)||(54247272-54247441)
chr3 (37-191)||(19124189-19124343)
chr3 (38-168)||(40639350-40639480)
chr3 (12-193)||(53678640-53678820)
chr3 (38-188)||(54081287-54081436)
chr3 (12-168)||(10756914-10757071)
chr3 (38-163)||(17102610-17102735)
chr3 (12-191)||(41998026-41998200)
chr3 (12-188)||(47891720-47891896)
chr3 (69-193)||(43899109-43899233)
chr3 (38-153)||(47891551-47891666)
chr3 (43-189)||(51170618-51170765)
chr3 (38-193)||(53678431-53678586)
chr3 (38-188)||(17273780-17273930)
chr3 (70-188)||(33812727-33812845)
chr3 (38-179)||(37133289-37133430)
chr3 (12-191)||(46766819-46767000)
chr3 (37-188)||(5348582-5348733)
chr3 (12-180)||(45871897-45872064)
chr3 (56-187)||(22354946-22355077)
chr3 (38-168)||(5348801-5348931)
chr3 (39-185)||(7742781-7742927)
chr3 (15-168)||(40639140-40639293)
chr3 (12-188)||(17273983-17274159)
chr3 (49-146)||(35753477-35753574)
chr3 (38-155)||(53841063-53841180)
chr3 (82-193)||(52609639-52609750)
chr3 (12-146)||(22444393-22444527)
chr3 (12-188)||(2078679-2078855)
chr3 (12-169)||(49222234-49222389)
chr3 (50-189)||(53309973-53310106)
chr3 (39-193)||(588384-588539)
chr3 (38-180)||(40969487-40969629)
chr3 (12-118)||(52268176-52268283)
chr3 (12-188)||(21918500-21918676)
chr3 (12-189)||(33772997-33773175)
chr3 (38-191)||(28691114-28691267)
chr3 (12-120)||(4846667-4846774)
chr3 (43-189)||(50259109-50259256)
chr3 (39-191)||(7274653-7274795)
chr3 (38-187)||(49222040-49222180)
chr3 (112-193)||(51883857-51883938)
chr3 (114-193)||(33812852-33812931)
chr3 (55-191)||(33771991-33772127)
chr3 (105-186)||(35753408-35753489)
chr3 (44-117)||(43527068-43527141)
chr3 (43-191)||(50393317-50393465)
chr3 (38-153)||(2078521-2078636)
chr3 (105-193)||(13866964-13867052)
chr3 (66-168)||(43844359-43844462)
chr3 (112-191)||(51311825-51311904)
chr3 (115-189)||(7937645-7937719)
chr3 (64-189)||(49529078-49529204)
chr3 (12-88)||(52606325-52606401)
chr3 (134-193)||(43527021-43527080)
chr3 (105-179)||(8327739-8327813)
chr3 (81-191)||(38911494-38911604)
chr3 (38-179)||(51885597-51885738)
chr3 (55-191)||(12992262-12992399)
chr3 (55-146)||(12991386-12991478)
chr3 (64-191)||(20963547-20963675)
chr3 (64-191)||(44316627-44316754)
chr3 (49-96)||(51311685-51311732)
chr3 (44-98)||(21169904-21169958)
chr3 (53-146)||(37133463-37133556)
chr3 (38-96)||(43527218-43527276)
chr3 (38-78)||(22444299-22444339)
chr3 (128-179)||(42541195-42541246)
chr3 (12-67)||(51885488-51885543)
chr3 (70-146)||(37174894-37174971)
chr3 (43-127)||(50394230-50394315)
chr3 (102-161)||(22444237-22444296)
chr3 (128-179)||(32305265-32305316)
chr3 (109-191)||(5900423-5900505)
chr3 (105-167)||(13866044-13866106)
chr3 (128-178)||(36174521-36174571)
chr3 (128-178)||(48946681-48946731)
chr3 (42-127)||(50260032-50260118)
chr3 (102-188)||(50394321-50394407)
chr3 (128-169)||(13355197-13355238)
chr3 (128-193)||(29587316-29587381)
chr3 (128-193)||(40503727-40503792)
chr3 (102-187)||(50260123-50260208)
chr3 (105-178)||(52705472-52705545)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (12-198)||(40559-40745)
scaffold0051 (38-191)||(40352-40505)
[»] scaffold0236 (2 HSPs)
scaffold0236 (12-191)||(11420-11600)
scaffold0236 (38-169)||(11235-11366)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (15-193)||(11697-11875)
scaffold0168 (44-191)||(11488-11635)
[»] scaffold0128 (2 HSPs)
scaffold0128 (12-191)||(45043-45222)
scaffold0128 (55-131)||(44895-44971)
[»] scaffold0809 (2 HSPs)
scaffold0809 (38-191)||(4551-4704)
scaffold0809 (37-188)||(4341-4492)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (12-191)||(13542-13720)
scaffold0188 (38-193)||(13774-13929)
[»] scaffold0045 (4 HSPs)
scaffold0045 (12-188)||(65742-65918)
scaffold0045 (12-188)||(73074-73250)
scaffold0045 (38-189)||(65972-66123)
scaffold0045 (38-189)||(73304-73455)
[»] scaffold1436 (2 HSPs)
scaffold1436 (44-191)||(1476-1622)
scaffold1436 (12-146)||(1682-1815)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (16-191)||(177276-177451)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (12-193)||(93186-93369)
scaffold0022 (48-95)||(93432-93479)
scaffold0022 (115-178)||(93524-93587)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (38-193)||(90803-90958)
scaffold0016 (38-142)||(91741-91845)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (38-146)||(11713-11821)
scaffold0444 (110-191)||(11639-11720)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (48-191)||(9782-9926)
scaffold0225 (48-179)||(10862-10994)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (107-188)||(25970-26051)
scaffold0193 (44-88)||(26039-26083)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (128-178)||(242156-242206)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (48-97)||(90254-90303)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (128-168)||(59762-59802)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 104)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 28570666 - 28570840
Alignment:
Q  50 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 149  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28570666 taacttttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 28570765  T
Q  150 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagataaataagaaatcaaagaaatattttacg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28570766 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagctaagataaataagaaattaaagaaataatttacg 28570840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 21218054 - 21218233
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21218054 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaaaaatatctaacgtttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 21218153  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21218154 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 21218233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 45911758 - 45911582
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  45911758 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 45911659  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45911658 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaatgaaccaaaaatgcaattta 45911582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 54136270 - 54136091
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  54136270 atgaagatgaaaaagaggagaagaaggtgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaagg 54136171  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  54136170 atcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 54136091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 33626071 - 33626252
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33626071 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 33626170  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  33626171 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagccaa 33626252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9010681 - 9010505
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9010681 aagatgaaaaataggagaagaagatgaagcaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaggacc 9010582  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  9010581 aaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 9010505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29864355 - 29864176
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||||| ||    
T  29864355 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacctttttgaattaaaactaacagaaaggaccaacatgtgtaacagagaaaagttaaggg 29864256  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29864255 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggataaaaaatgcaatttagcc 29864176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25218263 - 25218082
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25218263 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 25218164  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  25218163 actaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttaaccaa 25218082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34959010 - 34958830
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  34959010 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaatgaaaaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaattgtgtaacagagataagtt-aagg 34958912  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  34958911 aacaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaa 34958830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45683296 - 45683115
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  45683296 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 45683197  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  45683196 atcaaaataaatcaaattttacttaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagagatcaaaaatgtaatttagccaa 45683115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43317058 - 43316880
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||    
T  43317058 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttaaggg 43316959  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  43316958 accaaaataaataaaattttaattaagggaccaaagcgatactaccttaatagttaag-gaccaaaaatacaatttagcc 43316880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 44432831 - 44433006
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  44432831 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctgacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggg 44432930  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44432931 accaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagtgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 44433006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33626017 - 33625868
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33626017 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 33625918  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33625917 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33625868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 46200664 - 46200484
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaa-ctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  46200664 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaaaaaaatataacgtttttaaataaaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagg 46200565  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  46200564 gaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 46200484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 46621134 - 46621310
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  46621134 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaagg 46621233  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46621234 accaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 46621310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 29864408 - 29864559
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29864408 atgaataaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaa 29864507  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29864508 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 29864559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44710582 - 44710403
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  44710582 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 44710483  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44710482 atcaaaataaatcaaatttttgttaagagaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44710403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10014643 - 10014463
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10014643 atgaagatgagaaagaggagaattagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatgg 10014544  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10014543 atcaaaataaatc-gattttaattaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 10014463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10021784 - 10021604
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10021784 atgaagatgagaaagaggagaattagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatgg 10021685  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10021684 atcaaaataaatc-gattttaattaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 10021604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Original strand, 27347804 - 27347961
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  27347804 atgaagatgaaaaagaggtgaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 27347903  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  27347904 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaag 27347961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Original strand, 33882182 - 33882331
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33882182 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaagactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 33882281  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33882282 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33882331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 46621080 - 46620931
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46621080 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 46620981  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    |||||||||   |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46620980 gggaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 46620931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52915105 - 52914952
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52915105 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 52915006  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  52915005 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 52914952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40067527 - 40067348
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40067527 atgaaaatgaaaaagaggaaaagaagatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaagg 40067428  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  40067427 accaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcc 40067348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 40067581 - 40067736
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  40067581 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttagttaa 40067680  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40067681 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagccaa 40067736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8246945 - 8246765
Alignment:
Q  13 tgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagga 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  8246945 tgaagataaaaaagaggagaagaagatgaaaaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaaggga 8246847  T
Q  113 ccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaaga 195  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  8246846 tcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaatgatattatctaaataattaag-gaccaaaaatacaatttagccaaga 8246765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 191
Target Start/End: Original strand, 43317119 - 43317265
Alignment:
Q  45 aaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacca 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43317119 aaacctaacgtttttcaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacca 43317218  T
Q  145 aagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  43317219 aagcgatactacctaaatagttaggagactaaaaatgcaatttagcc 43317265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 53645623 - 53645473
Alignment:
Q  19 tgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaa 118  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  53645623 tgaaaaagaggagaagaagataaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaa 53645524  T
Q  119 taaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  53645523 taaaccgaattttaattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaag 53645473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21218000 - 21217847
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21218000 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 21217901  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21217900 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 21217847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48210089 - 48209948
Alignment:
Q  50 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 149  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48210089 taacctttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagggagagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 48209990  T
Q  150 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  48209989 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 48209948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 1205584 - 1205764
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||    
T  1205584 atgaagatgaaaaagaggagaagaagataaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaaggtaaggg 1205683  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1205684 acaaaaataaatcgaattttaattaagggagaaaagcgatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 1205764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 12381261 - 12381440
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  12381261 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaaaaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggg 12381360  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||    
T  12381361 accaaaataaatcgaattttaattaagggatgaaagcgatattgcctaaatagtttagggaccaaaaatacaattaagcc 12381440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1157385 - 1157201
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaag---ttaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||    
T  1157385 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagtacttaa 1157286  T
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  1157285 gggaccaaaataaattaaattttaattaaggaaccaaagcgatattacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccaa 1157201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25058986 - 25058836
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25058986 atgaagaaaagctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggagcaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaa 25058887  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  25058886 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagagacaaaaaatgcaattta 25058836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32384807 - 32384653
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32384807 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaggttaaagaaccaaaataaatcgaattttaatta 32384708  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  32384707 gaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 32384653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 34959064 - 34959214
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34959064 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaaattaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaa 34959163  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    || ||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  34959164 ggaaccaaagcgataatacctaaatagttaagggaccaaaattgcaattta 34959214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 45911807 - 45911960
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45911807 atgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagataagagaccaaaataaatcgaattttaattaa 45911906  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  45911907 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcc 45911960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4966018 - 4965894
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4966018 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggagc 4965919  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  4965918 aaagcgatactacctaaatagttaa 4965894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2739033 - 2738878
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2739033 atgaagaaaacctaatatttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 2738934  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2738933 aggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttaaccaa 2738878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 169
Target Start/End: Original strand, 25218317 - 25218448
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25218317 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaa 25218416  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
     ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  25218417 aggaccaaaacgatactacctaaatagttaag 25218448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 1157439 - 1157589
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1157439 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 1157538  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||    
T  1157539 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 1157589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 25593324 - 25593477
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25593324 atgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 25593423  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||   ||||  |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  25593424 gggaccaaaacaatactccctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcc 25593477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38866551 - 38866398
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38866551 atgaagaaaacctgaggtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaa 38866452  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  38866451 tggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 38866398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24504119 - 24503937
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatg-accaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||      
T  24504119 atgaagatgaaaaaaaggagaagaggataaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaaggaccaagatgtgtaacagagagaagttaaga 24504020  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||   |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24504019 gaccaaaataaatcgaattttaattaaagaaccaaaacaatactacctaaataattaagggattaaaaatgcaatttagccaa 24503937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Original strand, 4966075 - 4966232
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||  |    
T  4966075 atgaagattaaaaagagaagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataatggagagaagttaagag 4966174  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  4966175 acaaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaaacgataccacctaaatagttaag 4966232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 9010738 - 9010891
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9010738 atgaagaaaaccttatgtttttgaattaaaactaacggaagtaaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 9010837  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  9010838 gggaccaaagagatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcc 9010891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 45683350 - 45683503
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45683350 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttaa 45683449  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || |||||||  |||  |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  45683450 ggaaccaaagcaatattacctaaatagttaaggaaccaaaaatacaatttagcc 45683503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 4793838 - 4793981
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4793838 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggacc 4793937  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||  ||||| |||||||||  |||| | |||||||| |||||||    
T  4793938 aaaacgatactacctaaata-ataaggggtcaaaaatacaattta 4793981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21051512 - 21051360
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21051512 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaatttaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcaaattttagttaa 21051413  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    | || ||||| ||| | ||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  21051412 gagatcaaagcgatgctacctaaataattaagggacaaaaaatgtaatttagc 21051360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 169
Target Start/End: Original strand, 37515697 - 37515817
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagt 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  37515697 ctaacgttttttaattaaaactaatggaattgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 37515796  T
Q  149 gataccacctaaatagttaag 169  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  37515797 gatactacctaaatagttaag 37515817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1205530 - 1205381
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1205530 atgaagaaaacccaatgttttttaattaaaactaacggcaatgatcgaaatgtgtaacagaga-aagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 1205432  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  1205431 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaagtgcaattta 1205381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 24504173 - 24504323
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24504173 atgaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 24504272  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     |||| |||  ||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  24504273 aggactaaaacgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 24504323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27347750 - 27347596
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347750 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 27347651  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
     ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||    
T  27347650 aggaccaaagcgatactatctaaatagtcaagggaccaaaaatataatttagcca 27347596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29970345 - 29970196
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29970345 atgaagaaagcctaacgtttttgaattaaaactaacggataagaccaaaatgtgtaacggagataagttaatg-accaaaataaatcaaattttaattaa 29970247  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  29970246 gggatcaaagcgatactacctaaatagttatgggaccaaaaatgcaattta 29970196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 46535729 - 46535907
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  46535729 atgaaaatgaaaaagagaaaaaaaagatgaagaaaacctaatgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataccagaaagaagttaaagg 46535828  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  46535829 accaagataaatagaattttaattagaggaccaaaacaatactacctaaatagttaagtgaccaaaaatacaatttagc 46535907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 18862673 - 18862829
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18862673 atgaagaaatcctaacgttttttaattaaaactaacggaatggacaaaaaggtgtaacagagagcaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 18862772  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18862773 aaggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 18862829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44428724 - 44428616
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44428724 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaa 44428625  T
Q  138 gggaccaaa 146  Q
    |||||||||    
T  44428624 gggaccaaa 44428616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 21051573 - 21051688
Alignment:
Q  31 gaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattt 130  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21051573 gaaaaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatctaattt 21051672  T
Q  131 taattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||||||||||||    
T  21051673 taattaagggaccaaa 21051688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 22831030 - 22831181
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22831030 atgaagaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatta 22831129  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||| ||||| | | ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  22831130 agggaccaaagcgatactagcaaaatagttaagggaccaaaaatccaattta 22831181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 44710636 - 44710791
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44710636 atgaagaaaatctaacttttttgaattaaaaccaacgaaaaggactaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 44710735  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    || ||||||  ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44710736 ggaaccaaaacgatactacataaatacttaagggatcaaaaatgcaattttgccaa 44710791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46535675 - 46535521
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||  ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  46535675 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgaacgaga-agaaactaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaa 46535577  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  46535576 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaa 46535521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 8246979 - 8247129
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8246979 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataacagaaatgacgaaaatgtttaagggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 8247078  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  8247079 gggaccaaagaaatattacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 8247129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 32385045 - 32385194
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32385045 atgaagaaaacctaacattttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaa 32385144  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||  |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32385145 ggga-taaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 32385194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 52915182 - 52915331
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  52915182 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggacc 52915281  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtg--atcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||    
T  52915282 aaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaaaatgcaatttagcc 52915331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 38866606 - 38866783
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||||| |||| |||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38866606 atgaaaatgaaaaagaggaaaagaagatgaagaaaagctaatgttttttatttaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaagg 38866705  T
Q  112 a-ccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | | |||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  38866706 atcaaaaataaatcgaattttaattagagtaccaaagcgatactacctaaatagttaaggaatcaaaaatacaattta 38866783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44170163 - 44169979
Alignment:
Q  7 gtgagatgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagt 105  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| | |||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44170163 gtgatatgaagatgaagaagaggggaagaagatgag-aaaccataacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagt 44170065  T
Q  106 taaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  44170064 taagatactaaaataaatcaaattttaatcaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 44169979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 46200718 - 46200871
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||  | |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  46200718 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaa 46200817  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  46200818 gggaccaaagcgttactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 46200871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8751441 - 8751289
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  8751441 gatgaagaaaatctaacgttttttaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttagtta 8751342  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  8751341 agggaccaaaattatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttag 8751289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 43969734 - 43969890
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||    
T  43969734 atgaagatgaaaaagaggagaagaagataaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtataacaaaaagaagttaaggg 43969833  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||| || |||||||||||    
T  43969834 accaaagtaaatcgaattttaatcaagggatcaaaacgatactacataaatagttaa 43969890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 10014703 - 10014849
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10014703 aaaagctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaagggacc 10014801  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||   ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  10014802 aatacgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagcc 10014849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 10021844 - 10021990
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10021844 aaaagctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaagggacc 10021942  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||   ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  10021943 aatacgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagcc 10021990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 190
Target Start/End: Original strand, 11242701 - 11242849
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||| | |||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11242701 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaa-----ggaaataaccaaaatatataacggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaatca 11242795  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11242796 agggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagc 11242849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22830976 - 22830796
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaag 110  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||| |||||      
T  22830976 atgaagatgaagaagaggggaagaagatgaagaaaccctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaaga 22830877  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  22830876 taccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagctatactagcaaaatagttaagggaccaaaaatccaattcagcc 22830796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 54191764 - 54191638
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||| || ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  54191764 atgaagatgaaaaaaagaagaa---gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 54191668  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54191667 accaaaataaatcgaattttaattaaggga 54191638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9657812 - 9657667
Alignment:
Q  46 aacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacca 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9657812 aacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatatcaaaataaatcaaattttaattaagggacca 9657714  T
Q  145 aagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||  ||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  9657713 aaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 9657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15985610 - 15985469
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| | || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15985610 cctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtattagagaaaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 15985511  T
Q  147 gtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
      ||||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15985510 acgatactagcaaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 15985469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25977913 - 25977781
Alignment:
Q  47 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||    
T  25977913 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattgagagaccaaa 25977814  T
Q  147 gtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    | ||||  ||||| ||||||||| || ||||||    
T  25977813 gcgatagtacctagatagttaagggaccaaaaa 25977781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 153
Target Start/End: Original strand, 21885073 - 21885172
Alignment:
Q  54 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21885073 gtttttgaattaaaagtaacggaaaggaccaaaatgtttaacggatagaaattaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagtgaccaaagcgatac 21885172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Original strand, 11102218 - 11102358
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaag 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11102218 ctaacatttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaac 11102317  T
Q  148 tgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
      |||| |  |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  11102318 caatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 11102358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 189
Target Start/End: Original strand, 44170223 - 44170365
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaa--tgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44170223 ctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaaaatatgta-cggatagaaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaa 44170321  T
Q  146 agtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||  |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44170322 agcaatactaattaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttag 44170365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Original strand, 9657879 - 9658033
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatt 135  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  9657879 gatgaagataacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaattaaattttaatt 9657977  T
Q  136 aagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | |||||||||  ||||| |  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  9657978 aggggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggatcaaaaatataatttagcc 9658033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Original strand, 29970399 - 29970495
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29970399 atgaagatgaaaaagaggagaacaagatgaagaaaacttaacgattttgaattaaaactaacggaaagctccaaaatgtgtaacagagagaagttaa 29970495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 54136324 - 54136473
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  54136324 atgaaaaaaccctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgcaac----agaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaa 54136419  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||| ||||   || | ||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||    
T  54136420 aggatcaaaacaattctacctaaatagttaaaggacaaaaattgcaatttagcc 54136473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 54191818 - 54191969
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  54191818 atgaagaaaatctaacattttttaattgaaactaa-ggaaaggaccaaaatgtgtaatggggagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaa 54191916  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    |||||||||  ||| | | ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  54191917 gggaccaaaacgatgctatctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagc 54191969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 42779680 - 42779573
Alignment:
Q  31 gaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattt 130  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | || |||| |||  |||||||||| |||||    
T  42779680 gaaaaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaagataaattaacggattaaaataaatcgaattt 42779581  T
Q  131 taattaag 138  Q
    ||||||||    
T  42779580 taattaag 42779573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44428594 - 44428513
Alignment:
Q  110 ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44428594 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaatttagcc 44428513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 4793778 - 4793723
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaa 67  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4793778 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaa 4793723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 15985695 - 15985849
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||| |||||    
T  15985695 atgaagaaaccctaacgttttttaattaaaactaacaaaaataatc-aaatgtgtaacagatagaaagttaagataccaagataaatcaaatttcaatta 15985793  T
Q  137 a-gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | |||||||||  ||||| | | ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  15985794 aggggaccaaaacgatactagcaaaatagttaagagactaaaaatgctatttagcc 15985849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37515645 - 37515532
Alignment:
Q  74 ggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgat 173  Q
    |||||||| | |||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||  |     
T  37515645 ggaaatgatccaaatgtgtaacgaagagaagttaagggacaaaaataaattaaattttaattaaaggatcaacgggatactacctaaatagttaag-aaa 37515547  T
Q  174 caaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||    
T  37515546 caaaaatgcaattta 37515532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 43969679 - 43969599
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatg-accaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaa 117  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43969679 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaaccaatggaaaaggaccaaaatatgtaacagatagaagttaagggaccaaa 43969599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53995020 - 53994958
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagtta 167  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  53995020 ttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctgataccaactaaatagtta 53994958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10017856 - 10017813
Alignment:
Q  150 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10017856 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 10017813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40680529 - 40680478
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  40680529 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggagcaaaaa 40680478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44428630 - 44428587
Alignment:
Q  103 agttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44428630 agttaagggaccaaaataaatcaaattttagtcaagggaccaaa 44428587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Original strand, 1433639 - 1433721
Alignment:
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||  ||||||||  ||||||||||   || |||||||| |||||||||    
T  1433639 aggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 1433721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 3503964 - 3504014
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  3503964 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggatcaaaa 3504014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 14525932 - 14525982
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  14525932 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggatcaaaa 14525982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16037876 - 16037818
Alignment:
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagtta 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  16037876 aggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 16037818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 24045842 - 24045892
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  24045842 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggatcaaaa 24045892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31214244 - 31214162
Alignment:
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||  |||||||  ||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31214244 aggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagatgatcaaaaatgtaatttagcc 31214162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 43291956 - 43292006
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  43291956 ttttagttaagggaccaaagtgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 43292006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 167
Target Start/End: Original strand, 47603661 - 47603787
Alignment:
Q  42 ataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggg 140  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |  || || |||| ||||| |||||||| || ||||| |||  ||    
T  47603661 ataaaccctaacggtttttaattaaatttaacgaaaatgaccaaaatatgtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaattaatttttagttagagg 47603760  T
Q  141 accaaagtgataccacctaaatagtta 167  Q
    |||||  ||||||||  ||||||||||    
T  47603761 accaatctgataccaattaaatagtta 47603787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Original strand, 5904889 - 5904933
Alignment:
Q  134 ttaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  5904889 ttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggatcaaaa 5904933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Original strand, 8592337 - 8592421
Alignment:
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||   ||||||| |||||||||||   || |||||||| |||| ||||||    
T  8592337 aggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccaa 8592421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 117)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 28203067 - 28203246
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28203067 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaagg 28203166  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28203167 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatacgacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 28203246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36211529 - 36211341
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  36211529 atgaagatgaaaaaaaggagaagatgatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacgaacagaagttaaagg 36211430  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagataaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36211429 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacaatacaacctaaacagttaagtgaccaaaaatgcaatttagccaagttaaat 36211341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 41377561 - 41377742
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||| || || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  41377561 atgaagatgaaaaggatgataagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggg 41377660  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41377661 accaaaataaatcaaattttaattacgggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 41377742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32933770 - 32933594
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  32933770 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctgacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaag 32933671  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32933670 accaaaataaatggaattttagttaagggatcaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 32933594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 43183790 - 43183966
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  43183790 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaataaagaaaacctaacgtttttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 43183889  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  43183890 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaattta 43183966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5961848 - 5961669
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5961848 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 5961749  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  5961748 accaaaataaatcaatttttaattatgggatcaaagcgatactacctaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttagcc 5961669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 20908718 - 20908899
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20908718 atgaaaatgaaaaagaggaaaagaagatgaagaaaacctaaagtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaagg 20908817  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  20908818 accaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaa 20908899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 25642501 - 25642654
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25642501 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 25642600  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  25642601 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaacaaaaatacaatttagcc 25642654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13354356 - 13354177
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||    
T  13354356 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaggg 13354257  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  13354256 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccgaaaattcaatttagcc 13354177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16736280 - 16736101
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  16736280 atgaagatgaaaaagaggagaataagatgaagaaaacctaacgttttcaaattaaaactactggaaaggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaaggg 16736181  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16736180 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 16736101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Original strand, 38275661 - 38275842
Alignment:
Q  11 gatgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagataga--agttaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  38275661 gatggagatgaaaaagaggagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagagttac 38275760  T
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  38275761 gggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagtgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 38275842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27883647 - 27883466
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  27883647 atgaagatgaaaaaaaggagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 27883548  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  27883547 accaaaataaatcgaattttacttaagggaccaaagcgatattacttaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 27883466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 27132717 - 27132897
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  27132717 atgaagatgaaatagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatatgtaacggatagaagttaatgg 27132816  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27132817 accaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaatcgacactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 27132897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 12304361 - 12304540
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||  |    
T  12304361 atgaagatgaaaaagaggagaataagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagag 12304460  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12304461 accaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaattgttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 12304540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39454598 - 39454451
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39454598 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggacc 39454499  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39454498 aaagtgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 39454451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4104338 - 4104157
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||       
T  4104338 atgaagatgaaaaagaggagaaggagatgaaggaaacccaacatttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacagagagaagttaagat 4104239  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4104238 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 4104157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 31450873 - 31451054
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  31450873 atgaaaatggaaaagtggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaaagg 31450972  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31450973 atcaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccaa 31451054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Original strand, 34820481 - 34820662
Alignment:
Q  7 gtgagatgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagtt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  34820481 gtgatatgaagatgaaaaagaggagaggaagatgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagtt 34820580  T
Q  107 aaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  34820581 aagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgagactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 34820662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16655759 - 16655610
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16655759 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 16655660  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  16655659 aggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattt 16655610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31450819 - 31450666
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31450819 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 31450720  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31450719 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 31450666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34820432 - 34820283
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34820432 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatctaattttaattaa 34820333  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    || ||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34820332 ggaaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34820283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41377507 - 41377355
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41377507 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 41377408  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  41377407 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaag-gaccaaaaatacaatttagcc 41377355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Original strand, 12303992 - 12304164
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||  |    
T  12303992 atgaagatgaaaaagaggagaataagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagag 12304091  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaa 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12304092 accaaaataaatcgaattttaattaaaggacgaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaa 12304164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 16655813 - 16655989
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  16655813 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactagtggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 16655912  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  16655913 accaaaataaatcaaattttagttaaaggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 16655989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28203014 - 28202858
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28203014 gatgaagaaaacctaacgttattgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggatagaagttaaaggaccaatataaatcgaattttaatta 28202915  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28202914 agggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 28202858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39150023 - 39149867
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  39150023 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaaggg 39149924  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39149923 atcaaaataaatcgaattttagttaaaggactaaagtgatactatttaaatagttaa 39149867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18565213 - 18565066
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  18565213 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggact 18565114  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18565113 aaagcgatactgcctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 18565066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 28631482 - 28631657
Alignment:
Q  13 tgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagga 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28631482 tgaagatgaaaaagaggagaagaagatggcgaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaacagagagaagttaaggga 28631581  T
Q  113 ccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  28631582 ctaaaataaatcgaattttaattaagagagcaaagcgatactacccaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 28631657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16261049 - 16260872
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  16261049 atgaagatgaaaaggaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtttaacggagagaagttaaagg 16260950  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  16260949 accaaaa-aaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgctatttagc 16260872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 37744621 - 37744771
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37744621 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctataagagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 37744720  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37744721 gggaccaaagcgatactatctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaattta 37744771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Original strand, 39912864 - 39913014
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39912864 taaaccctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaggtgtaacagagagaaagttaagggaccaaaataaatctaattttaattaaggga 39912963  T
Q  142 ccaaagtgataccacct-aaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39912964 ccaaagtgatactacctaaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 39913014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 15137037 - 15137190
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15137037 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtgcaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 15137136  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  15137137 gggaccaaatcggtactacctaaatagttatgtgaccaaaaatgtaatttagcc 15137190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21470448 - 21470295
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21470448 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttgagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 21470349  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  21470348 gggaccaaagtgatactgcctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 21470295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39912807 - 39912630
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  39912807 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaaaaaaccctaatatttttgaattaaaactaacgtaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaaagttaacg 39912708  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  39912707 gaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 39912630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 37412817 - 37412965
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37412817 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaattgaattttaattaagggacc 37412916  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    || | ||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  37412917 aatgcgatactacttaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttagcca 37412965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 32933824 - 32933979
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32933824 atgaacaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttatttaa 32933923  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
     ||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32933924 aggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 32933979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 10833241 - 10833423
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttg-aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  10833241 atgatgatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttttaattaaaactaatcgaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaatg 10833340  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  10833341 gaccaaaataaatcgaattttaattgagggactaaagcgatactacctaaatagctaagggaccaaaaatgcaattcagccaa 10833423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25642447 - 25642273
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||  |    
T  25642447 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacagataaaagttaagag 25642348  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatt 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  25642347 accaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatactacttaaatagttaagggactaaaaatacaatt 25642273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27132664 - 27132514
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27132664 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactatcggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 27132565  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  27132564 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 27132514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Original strand, 34127775 - 34127948
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  34127775 aagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggacc-aaatgtgtaacagagagaagttaagggatc 34127873  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  34127874 aaaataaatcgaactttagttaagggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggtccaaaaatacaatttag 34127948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17856352 - 17856199
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17856352 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 17856253  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||    
T  17856252 gggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccgaaaatgaaatttagcc 17856199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28631427 - 28631270
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28631427 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactatcggaaatgaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaa 28631328  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaaga 195  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  28631327 gggaccaaagcgatgctacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattttgccaaga 28631270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12303938 - 12303786
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12303938 atgaagaaaacctaatgtttttgaaataaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagatgagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 12303839  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12303838 gtgaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 12303786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 17856395 - 17856575
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgt-ttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||      
T  17856395 atgaaaatgaaaaataagagaagaagatgaagaaaacctaacgtatttttaattaaaactaacggaaataactaaaatgtataacagagagaagttaaga 17856494  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17856495 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaccaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 17856575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 27883690 - 27883847
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  27883690 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagtcaccaaaataaatcaaattttaattaa 27883789  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaa----atagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27883790 gggaccaaagcgatactacctaaatatatagttaagggatcgaaaatgcaatttagcc 27883847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4120942 - 4120764
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  4120942 atgaatatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaa-cctaagatttttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatatgtaacggagagaaattaaagg 4120844  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  4120843 accaaaataaatcgaattttgattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 4120764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 5921593 - 5921772
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |     
T  5921593 atgaagatgaaaaagaggagaggacgatgaagaaaatccaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagga 5921692  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  5921693 acaaaaaaaaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatactatataaatagttaagggatcaaaaacacaatttagcc 5921772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32503725 - 32503538
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  32503725 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaaatctaacgtttttgacttaaaattaaaggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagga 32503626  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagataaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  32503625 accaaaataaatcgaattttagttaaggaagcaaaacgatactacctaaataattaatcgatcaaaaatacaatttaaccaatataaa 32503538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Original strand, 16736331 - 16736485
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16736331 atgaagaaaacctaacgtttctgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaa 16736430  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    ||||| | || ||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16736431 gggactacagcgatacaacctaaacagttaagggaccaaaagtgcaatttagcca 16736485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 36442341 - 36442519
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36442341 atgaaaatgaaaaagaggaaaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgactaaaatgtgtaacagaaagaagttaaagg 36442440  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  |||| | ||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  36442441 atcaaaataaattaaattttaattaaaggatcaaagcaatactatctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagc 36442519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 27476600 - 27476753
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27476600 atgaagaaaatctaacgttcttgatttaaaactaacggaaaggaccataatatgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 27476699  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27476700 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 27476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 41659898 - 41659737
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  41659898 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggcccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 41659799  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagataaa 199  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||| |||||    
T  41659798 gggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggacaaaaaatataatttagccaaaataaa 41659737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38275624 - 38275480
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38275624 aaaatctaacgtctttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagggaagttaaagaaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 38275525  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||  |||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  38275524 aaagcaatactacataaatagttaagggatcaaaaatacaattta 38275480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44915918 - 44915743
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||       
T  44915918 atgaagatgaagaagaggagaagaagatgaagaaaatttaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-ggagataagttaagat 44915820  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  44915819 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 44915743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15829888 - 15829733
Alignment:
Q  23 aaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaa 122  Q
    ||||||| ||| | |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15829888 aaagaggggaagaagatgaagaaaatttaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaagatgtgtaacggatagaagttaagggaccaaaataaa 15829789  T
Q  123 tcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  15829788 ttgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagctaagagaccaaaa 15829733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Original strand, 4104392 - 4104546
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4104392 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaa 4104491  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  4104492 gggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcca 4104546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 21470506 - 21470675
Alignment:
Q  16 agatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacca 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||    
T  21470506 agatgaaaatgaggagaagaagatggagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaagggacca 21470605  T
Q  116 aaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatt 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  21470606 aaataaatcgaattttaattaagggacc-aagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatggaatt 21470675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 40694408 - 40694538
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40694408 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatctaattttaattaa 40694507  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  40694508 aggaccaaagcgatactacctaaataattaa 40694538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 13354410 - 13354563
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13354410 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaatatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 13354509  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||    
T  13354510 gggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaattacaatttagcc 13354563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 16261103 - 16261256
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16261103 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaaccaaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagctaagggacaaaaataaatcaaattttagttaa 16261202  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  16261203 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 16261256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27476546 - 27476369
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgacc-aaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||| |||| |    
T  27476546 atgaagatgaaaaagaggagaaaaatatgaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggataggaccaaaaatgtgtaaaggagagaatttaagg 27476447  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  || || ||||||| |||||||    
T  27476446 gaccaaaataaatcgaattttaattaagggaacaaagcgatactacctaaatagtctagggaccaaaaatacaattta 27476369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 44612716 - 44612870
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44612716 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaa 44612815  T
Q  138 gggaccaaagtgatac--cacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| |||||   || |||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  44612816 gggaccaaagcgatactatacgtaaatagttaag-gaccaaacatgcaatttagcc 44612870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 4120996 - 4121151
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4120996 atgaagaaaacctgacgtttttgacttaaaactaacgaaaatgaacaaagtgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 4121095  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
     ||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  4121096 aggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccaa 4121151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43183724 - 43183585
Alignment:
Q  50 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  43183724 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttatgggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaagcg 43183625  T
Q  150 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  43183624 atactacctaaatagttaagggactaaaaatgtaatttag 43183585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20908664 - 20908511
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||    
T  20908664 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaactaaaataaatcgaattttagttaa 20908565  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  20908564 aggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcc 20908511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 33819629 - 33819780
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33819629 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatagccaaaatatgtaacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaa 33819727  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  33819728 aggaccaaagtgatactacctaaacagttatgaga-caaaaatacaatttagcc 33819780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45389284 - 45389131
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45389284 atgaagaaaacctaatatttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagaaaagttaatggaccaaaataaatcaaattttaattaa 45389185  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||  || || |||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  45389184 gggaccaaaacgacactacctaaatagttcagggaccaaaaatgcaatttagcc 45389131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 32503776 - 32503920
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32503776 aaaatctaacgttttcgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaaggacc 32503875  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||   |||| ||||||||||||||  ||  || |||||||||||    
T  32503876 aaatcaatactacctaaatagttaaaggactaagaatgcaattta 32503920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33819575 - 33819400
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||    
T  33819575 atgaagatgaataagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatctgtaacgaagaaaagttaaggg 33819476  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  33819475 acc-aaataaatcaaattttaattaagagaccaaaacggtactacctaaatagttaatggaccaaaagtgcaattta 33819400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37412746 - 37412595
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37412746 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtaacggaaagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 37412647  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37412646 gagaccaaagcgatactaactaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 37412595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34127708 - 34127570
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  34127708 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggatagaagttaagcgacaaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaac 34127609  T
Q  149 gataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34127608 gatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34127570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14877620 - 14877483
Alignment:
Q  52 acgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgat 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||    
T  14877620 acgtttttgaattaaaactaacggaaattaccaaaatgtgtaagaga--gaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaatcgat 14877523  T
Q  152 accacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  14877522 actacctaaatagttttgggaccaaaaatgcaatttagcc 14877483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 27246190 - 27246369
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  || ||||  | |||     
T  27246190 atgaaaatgaagaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataaccgaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaaattaaga 27246288  T
Q  112 -accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27246289 taccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatcctaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 27246369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 27914100 - 27914279
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaag 110  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||      
T  27914100 atgaagatgaagaagatgagaagaagatgaacaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaa-agagagaaagttaaga 27914198  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27914199 tgccaaaataaatcaaattttaactaaggaaccaaaacgatactaattaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagcc 27914279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 168
Target Start/End: Original strand, 35408760 - 35408884
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35408760 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggaacc 35408859  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||| ||||| |  |||||||||||    
T  35408860 aaagcgatactaattaaatagttaa 35408884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37744570 - 37744451
Alignment:
Q  70 taacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37744570 taacggaattgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaag 37744471  T
Q  170 tgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
     || |||||||| |||||||    
T  37744470 ggaccaaaaatgtaatttag 37744451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 39150064 - 39150211
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| |||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  39150064 aaaacctaacgtttttgaattaaaattaacaggaaggactaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggtaca 39150163  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  39150164 aaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 39150211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40694349 - 40694195
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  40694349 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaagtaatggaaatggccaaaatgtgcaactgagagaagttaagggactaaaataaatcgaatgttaatta 40694250  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  40694249 agggactaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcc 40694195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 39454649 - 39454817
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  39454649 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacg---------aaaatgtgtaacagagagaaattaaggg 39454739  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39454740 acaaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaagcgatactacctgaatagtcaagggaccaaaaatgcaatttag 39454817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Original strand, 36211580 - 36211682
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36211580 aaaacctaacatttttgaattaaagctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggacc 36211679  T
Q  144 aaa 146  Q
    |||    
T  36211680 aaa 36211682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Original strand, 11943699 - 11943849
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||    |||||||||||||| || ||||||||| |     
T  11943699 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacttttatgaattaaaactgacggaa----ccaaaatgtgtaacggagagaagttaatga 11943794  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagtt 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11943795 accaaaataaatcgaattttaattaaagtaccaaagcgatactacctaaatagtt 11943849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16350242 - 16350080
Alignment:
Q  26 gaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaaggaccaaaataaatc 124  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||   |||||||||||||    
T  16350242 gaggagaaaaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaacaaatggaaatgaccaaaatgtgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatc 16350144  T
Q  125 aaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16350143 aaattttaattaagggaccaatacgatactaattaaatagtcaagagaccaaaaatgcaattta 16350080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36442287 - 36442133
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttg-aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  36442287 atgaagaaaatctaacgtttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaatgaaccaaaataaatcaaatttttatta 36442188  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |  |||||||  ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  36442187 atagaccaaaacgatactacctaaatagtgaagggaacaaaaatacaatttagcc 36442133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 44915972 - 44916080
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  44915972 atgaagaaaacctcacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatgaaattttaattaa 44916071  T
Q  138 gggaccaaa 146  Q
    |||||||||    
T  44916072 gggaccaaa 44916080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 34484303 - 34484410
Alignment:
Q  62 attaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  34484303 attaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagataccaaagcgatactacctaaa 34484402  T
Q  162 tagttaag 169  Q
    || |||||    
T  34484403 taattaag 34484410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 41659975 - 41660119
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggac 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | |||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41659975 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaagcagaga-aagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagagac 41660073  T
Q  143 caaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  41660074 caaagtgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 41660119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Original strand, 18565278 - 18565391
Alignment:
Q  80 gaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  18565278 gaccaaaatatgtaacagggaaaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggacccaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 18565377  T
Q  180 tgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||| ||||    
T  18565378 tgcaatttatccaa 18565391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5720318 - 5720145
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||   || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| | |||||||      
T  5720318 atgaagatgaagaagaggagaa---gaagaagaagacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgaaaggagaga-aagttaaga 5720223  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||   |||  |  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5720222 taccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaaacaatattaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 5720145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Original strand, 16350310 - 16350412
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16350310 aaaacctaacgttttttaattaaaactaacatgaatgactaaaatgtgcaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttagttaagggacc 16350409  T
Q  144 aaa 146  Q
    |||    
T  16350410 aaa 16350412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Original strand, 36211697 - 36211786
Alignment:
Q  103 agttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  36211697 agttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacgaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttagcca 36211786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44612662 - 44612548
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| ||||||||||||||        || |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  44612662 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaatgaagaaaatctaacatttttgaattaaaa--------aaggaccaaaatgtgtaacggatagaagttaaggg 44612571  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44612570 accaaaataaatcaaattttaat 44612548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20297498 - 20297408
Alignment:
Q  103 agttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  20297498 agttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctgaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagccaa 20297408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27914041 - 27913916
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || |||||||||   | |||||||||| |||||||||| |||||||     
T  27914041 aaaacctaatgtttttgaattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagatagcaaaataaattaaattttaataaagggact 27913942  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||| ||||| |  ||||||||||||    
T  27913941 aaagcgatactaattaaatagttaag 27913916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34484305 - 34484238
Alignment:
Q  121 aatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  34484305 aatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 34484238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27246136 - 27246066
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaa 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27246136 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaatagaaatgacaaaaatgtgtaacagagagaagttaa 27246066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 199
Target Start/End: Original strand, 23992164 - 23992300
Alignment:
Q  64 taaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg-accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaat 162  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||  |||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |  |||||    
T  23992164 taaaattaacggaaatgtctaaaattagtaacaaagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaat 23992263  T
Q  163 agttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagataaa 199  Q
    |||| || || ||||||  ||||||||||||||||||    
T  23992264 agttcagggaccaaaaagacaatttagccaagataaa 23992300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3603653 - 3603526
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagata-gaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |  || |||||  ||||||| | | ||||||||||| ||||||    
T  3603653 taaaccctaacgtttttgaattaaatttaacggaaaggactaaaatatgtaacagagataaacttaaaataccaaaacataacaaattttaatcaaggga 3603554  T
Q  142 ccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  3603553 ccaaagcgatactaaataaatagttaag 3603526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 14877684 - 14877746
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacg 74  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14877684 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaaaaaaatctaacgtttttcaattaaaactaacg 14877746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Original strand, 1580148 - 1580205
Alignment:
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  1580148 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactatttaaatagttaag 1580205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 98
Target Start/End: Original strand, 29078010 - 29078060
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaga 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29078010 cctaacatttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtgtaacaga 29078060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1580128 - 1580057
Alignment:
Q  69 ctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 139  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1580128 ctaacgtaaaagaccaaaatgtgcaacagagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagg 1580057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 146
Target Start/End: Original strand, 36211668 - 36211711
Alignment:
Q  103 agttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36211668 agttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaa 36211711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Original strand, 40469092 - 40469143
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  40469092 ttttaattaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaaa 40469143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44610926 - 44610865
Alignment:
Q  126 aattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44610926 aattttaattaagggac-aaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 44610865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Original strand, 15744815 - 15744899
Alignment:
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||||| |||||||||||   || |||||||| |||| ||||||    
T  15744815 aggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccaa 15744899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35738489 - 35738399
Alignment:
Q  66 aaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac--agatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatacca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||  || || ||||||| |||||||    
T  35738489 aaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacaaagata-aagttaaaataccaaaatggatcaaattttagatatggaaccaaagcgatacca 35738399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Original strand, 8030004 - 8030055
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  8030004 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaaggcatcaaaaa 8030055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28189510 - 28189459
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  28189510 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaaa 28189459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Original strand, 38073790 - 38073869
Alignment:
Q  114 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |  |||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  38073790 caaaataaatcgaattttaattaaagaattaaaacgatactatctaaatagttaaatgatcaaaaatataatttagccaa 38073869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 5484936 - 5484986
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  5484936 ttttagttaagggaccaaagtgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 5484986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15136984 - 15136934
Alignment:
Q  21 aaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaacta 71  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15136984 aaaaagaggagaagatgatgaagaaaatctaacattttttaattaaaacta 15136934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 19299826 - 19299876
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  19299826 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaa 19299876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 25334604 - 25334654
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||    
T  25334604 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagagaccaaaa 25334654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 26424819 - 26424869
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||    
T  26424819 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 26424869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13479146 - 13479105
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  13479146 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaag 13479105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29076617 - 29076552
Alignment:
Q  124 caaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  29076617 caaatttaaattatgggaccaaaatgatactaattaaatagttaagagatcaaaatagcaatttag 29076552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 192
Target Start/End: Original strand, 33200520 - 33200584
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||| ||| || |||||    
T  33200520 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaagcatttaagcca 33200584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33545001 - 33544825
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33545001 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacctttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 33544902  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33544901 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33544825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14337081 - 14336900
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  14337081 atgaagatgaaaaagaggataagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtataacaaagagaagttaaagg 14336982  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14336981 accaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactagctaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagccaa 14336900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35132780 - 35132601
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35132780 atgaagatgaaaaagaggagacgaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaagg 35132681  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  35132680 accaaaataaatctaattttaattatgggaccaaagcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcc 35132601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9174080 - 9173899
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9174080 atgaaaatgaaaaagaggaaaagaagatgatgaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaagg 9173981  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  9173980 accaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaa 9173899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 6220289 - 6220441
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6220289 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattga 6220388  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6220389 tggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggattaaaaatgcaatttagc 6220441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24605027 - 24604878
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24605027 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaagt-aagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 24604929  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24604928 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 24604878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 24605081 - 24605261
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  24605081 atgaagttgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacgaaaatgac-aaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 24605179  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  24605180 atcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattaagccaa 24605261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2949470 - 2949296
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     ||||||| ||    
T  2949470 atgaagatgaaaaagaggaaaaaaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactactggaaaggaccaaaatgtgtaaca-----aagttaatgg 2949376  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  2949375 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactacttaaatagttaacggacaaaaaatgcaatttagcc 2949296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Original strand, 7537819 - 7537994
Alignment:
Q  19 tgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaa 118  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  7537819 tgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaaccgagagaagttatgggaccaaaa 7537918  T
Q  119 taaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtga-tcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  7537919 taaatcaaattttaattaagggacaaaagcgataccacttaaatagttaagggacaaaaaaatgcaatttagccaa 7537994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31029677 - 31029527
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31029677 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacgcagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaa 31029578  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31029577 gggaccaaagcgatactacctaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 31029527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3338630 - 3338477
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3338630 atgaagaaaacgtaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgagcaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 3338531  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  3338530 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 3338477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 14337135 - 14337287
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14337135 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaatttaagggaccaaaataaatcaaattttaactaa 14337234  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14337235 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggat-aaaaatgcaatttagcc 14337287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33329359 - 33329206
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33329359 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 33329260  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33329259 gggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 33329206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 193
Target Start/End: Original strand, 3289142 - 3289298
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3289142 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaacaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatta 3289241  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||| ||||||| ||||  |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  3289242 aggcaccaaagcgatattacctaaatagtttagggaccaaaaatgcaatttagccaa 3289298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 3338684 - 3338861
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3338684 atgaaggtgaaaaagaggagaaaaatatgaagaaaacctaaccttttcgaattaaaactaacgaaa--gaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaga 3338781  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  3338782 accaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaaacgatactacttaaatagttaagggaccaaaaataaaatttagcc 3338861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 31029731 - 31029911
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  31029731 atgaggatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgatcaaaatgtgtaacagagaaaagataaagg 31029830  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||   |||| |  ||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  31029831 accaaaataaatcgaattttagttaagggactaaaacaatactatttaaatggttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 31029911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33346638 - 33346478
Alignment:
Q  31 gaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattt 130  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33346638 gaaaaagatgaagagaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattt 33346539  T
Q  131 taattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  33346538 taattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggatccaaaatgaaatttagcc 33346478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Original strand, 1860719 - 1860872
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1860719 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaagactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaacccaaataaatcgaattttaattaa 1860818  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1860819 gggaccaaagagata-cacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 1860872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12903386 - 12903220
Alignment:
Q  26 gaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatca 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||||||      
T  12903386 gaggagaagatgatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaattg 12903287  T
Q  126 aattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||   | ||||||| |||||||||||    
T  12903286 aattttaattaagggaccaaagcgatactatctaaataattaaagaaccaaaaatacaatttagcca 12903220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 33545055 - 33545185
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33545055 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 33545154  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33545155 gggatcaaagtgatactacctaaatagttaa 33545185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25551500 - 25551347
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25551500 atgaagaaaacataatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggactaaaataaatcaaatttcaattaa 25551401  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  25551400 gggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 25551347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6220235 - 6220059
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  6220235 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaggaaaatttaacgtttttgaatgaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagggagaagttaaggg 6220136  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |  |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  6220135 accaaaataaatcaaattttaattaagagacgaaagcgatattaattaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 6220059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 13156046 - 13156217
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | | || |||| ||    
T  13156046 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaaggg 13156145  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  13156146 atcaaaataaatcgaattttaattaagggacca-----atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaattta 13156217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 13160902 - 13161073
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | | || |||| ||    
T  13160902 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaaggg 13161001  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  13161002 atcaaaataaatcgaattttaattaagggacca-----atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaattta 13161073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Original strand, 35119037 - 35119197
Alignment:
Q  31 gaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattt 130  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  35119037 gaaaaagatgaagataacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaattaatggaccaaaataaatcgaattt 35119136  T
Q  131 taattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  35119137 taattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggatccaaaatgaaatttagcc 35119197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 1158798 - 1158975
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | || |||| ||    
T  1158798 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacgaaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtataacggagataa-ttaaggg 1158896  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  1158897 accaaaataaatcaaa-tttaattaagggaccaaagcgatactacttaaatagttaaggtaccaaaaatgcaagttagcc 1158975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29010107 - 29009956
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  29010107 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaagggaccgaaataattcgaattttaattaa 29010008  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29010007 gggaccaaagcgatactacgtaaatagttaagggaccaaaaattcaatttag 29009956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3289083 - 3288930
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3289083 atgaaaaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaatggagagaagttaggggaccaaaataaatcgaattttagttaa 3288984  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  3288983 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagcc 3288930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 29010161 - 29010340
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  29010161 atgaagatgaaaaagaggagaaaaatatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaattaacagaatggaccaaaatgtgtaatggatggaagttaaggg 29010260  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  29010261 gccaaaataaatcgaattttagttaagggaccacagcgatactacataaatagtcaaggaaccaaaaatgcaatttagcc 29010340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 25551575 - 25551719
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25551575 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggacctaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaggggacc 25551674  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  25551675 aaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 25551719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11524945 - 11524778
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgttttt-gaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| || ||| ||||| |    
T  11524945 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacattttttgaattaaaaccaacagaaaggactaaaatgtgtaacggagagaggttaagg 11524846  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  11524845 gaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 11524778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1158743 - 1158586
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaac--ggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatt 135  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1158743 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacacggaaaggaccaacatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 1158644  T
Q  136 aagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||    
T  1158643 aaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgtaattaagccaa 1158586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 11524999 - 11525151
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||||||  |||||||| |||    
T  11524999 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaca-aggaaagttaagagaccaaaataaattgaattttaaataa 11525097  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  11525098 gggaccaaaccgatactacctaaattgttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 11525151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Original strand, 24548480 - 24548615
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24548480 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaaggacc 24548579  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  24548580 aaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 24548615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 146
Target Start/End: Original strand, 33972452 - 33972547
Alignment:
Q  51 aacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33972452 aacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 33972547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13155992 - 13155850
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13155992 atgaagaaaacctaacgaatttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaa 13155893  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  13155892 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaat 13155850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13160848 - 13160706
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13160848 atgaagaaaacctaacgaatttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaa 13160749  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  13160748 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaat 13160706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 2949524 - 2949632
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2949524 atgaagaaaacctaacgttgttgaattaaaactaaccataaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaa 2949623  T
Q  138 gggaccaaa 146  Q
    |||||||||    
T  2949624 gggaccaaa 2949632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 19135685 - 19135832
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  19135685 aaaaccgaacgttttttaattaaaactaatggaaaggaccaacatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagagatc 19135784  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||  ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  19135785 aaaacgatactacctaaatacttaatggaccaaaaatgcaatttagcc 19135832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24548419 - 24548241
Alignment:
Q  13 tgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||| | |||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| | |||||||       
T  24548419 tgaagatgaagaggaggagaagaggatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaaggagaga-aagttaagat 24548321  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24548320 accaaaataaatcaaattttaactaaggctcaaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 24548241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 163
Target Start/End: Original strand, 12903417 - 12903569
Alignment:
Q  11 gatgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || || ||||||||| |    
T  12903417 gatgaagatgaaaaaaaggagaagaaaatgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtattacggagagaagttaagg 12903516  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaata 163  Q
     | |||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  12903517 aatcaaaataattcgaattttaattaaaggaccaaagggatactacctaaata 12903569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 193
Target Start/End: Original strand, 29999653 - 29999791
Alignment:
Q  55 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatacc 154  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||     
T  29999653 tttttgaattaaaagtaacagaaaggactaaaatgtgtaacagatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattacgggactaaagcgatact 29999752  T
Q  155 acctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |  |||||||||||| |||||| ||   |||||||||||    
T  29999753 aattaaatagttaagagatcaataacataatttagccaa 29999791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 2814560 - 2814685
Alignment:
Q  54 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  2814560 gtttttgaattaaaactaacggaaagaatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagaaaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcgatac 2814659  T
Q  154 cacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
     |  |||||||||||| || ||||||    
T  2814660 taattaaatagttaagagaccaaaaa 2814685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32283141 - 32283024
Alignment:
Q  76 aaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatca 175  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||    
T  32283141 aaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactaattaaatagttaagggacca 32283042  T
Q  176 aaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||  |||||||||||    
T  32283041 aaaatataatttagccaa 32283024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 17544686 - 17544835
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg-accaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17544686 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatatgtaac-gatagaaaatcaagataccaaaataaatcaaattttaatta 17544784  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  17544785 agggaccaaagtgatattagcaaaatagttacggga-caaaaatgcaattta 17544835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2315733 - 2315601
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatt 135  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  2315733 gatgaagaaaaccaaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaatt 2315635  T
Q  136 aagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    ||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  2315634 aagcgaccaaagcgatactaattaaatagttaag 2315601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 113
Target Start/End: Original strand, 33329413 - 33329514
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33329413 atgaagatgaaaaagaggagacgaagattaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaagg 33329512  T
Q  112 ac 113  Q
    ||    
T  33329513 ac 33329514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31754383 - 31754249
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||| || |||||||||  |    
T  31754383 atgaagatgaaaaagatgagaaaaaaatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaatggaaaggtccaaaataagtaacggagagaagttaagag 31754284  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |  |||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  31754283 attaaaataaatagaattttaattaagagaccaaa 31754249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 35132834 - 35132976
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||           ||||||    
T  35132834 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaata-----------aattaa 35132922  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  35132923 gggaccaaagcggtactacctaaatagttaagggaccgaaaatacaatttagcc 35132976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17544632 - 17544452
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| |||  ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||  | |||     
T  17544632 atgaagatgaagaagaggagaagaagatgaagaaactctaacattcttgaatcaaaactaacgtaaaggattaaaatgtgtaac-gatagaaaattaaga 17544534  T
Q  112 -accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  17544533 tactaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagcgatattagcaaaatagttaaggga-caaaaatgcaatttaaccaa 17544452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 33972385 - 33972292
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaa--cgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  33972385 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaagacctaaaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagagaa 33972292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 29999590 - 29999510
Alignment:
Q  14 gaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa 94  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29999590 gaagatgaagaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatatgtaa 29999510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11524793 - 11524706
Alignment:
Q  103 agttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||    
T  11524793 agttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagc 11524706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Original strand, 17245582 - 17245710
Alignment:
Q  64 taaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg-accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaat 162  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||   |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |  |||||    
T  17245582 taaaattaacggaaaagactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaat 17245681  T
Q  163 agttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  17245682 aattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 17245710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34182039 - 34181908
Alignment:
Q  50 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagt 148  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| | | || |||      
T  34182039 taacgttcttgaattaaaattattgtaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattgaagaactaaaac 34181940  T
Q  149 gataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    || || | | ||||||||||| ||||||||||    
T  34181939 gaaactagcaaaatagttaagggatcaaaaat 34181908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 33548173 - 33548243
Alignment:
Q  121 aatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  33548173 aatcaaattttaattaaggggccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaattcaatttagcc 33548243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 192
Target Start/End: Original strand, 6229645 - 6229773
Alignment:
Q  64 taaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg-accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaat 162  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||   |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |  |||||    
T  6229645 taaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagtt-agggaccaaaccgatactaattaaat 6229743  T
Q  163 agttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  6229744 agttaagggaccaaaaaggcaatttagcca 6229773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7162479 - 7162401
Alignment:
Q  76 aaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 153  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7162479 aaatgaccaaaatgtgcaacggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcgatac 7162401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Original strand, 17971768 - 17971883
Alignment:
Q  55 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac--agatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgata 152  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17971768 tttttggaataaaattaacggaaaggaccaaaatgtgcaacggagata-aacttaaaataccaaaatggaacaaatttgaattaagggaccaaagcgata 17971866  T
Q  153 ccacctaaatagttaag 169  Q
    | ||  |||||||||||    
T  17971867 ctactaaaatagttaag 17971883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Original strand, 12261485 - 12261536
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  12261485 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaaa 12261536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27128907 - 27128857
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  27128907 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaa 27128857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 98
Target Start/End: Original strand, 29467199 - 29467249
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaga 98  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29467199 cctaatgtttttgaattaaatttaacggaaatgactaaaatatgtaacaga 29467249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33971993 - 33971931
Alignment:
Q  126 aattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||||||  |||   |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33971993 aattttaattaagggataaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33971931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 166
Target Start/End: Original strand, 27829326 - 27829390
Alignment:
Q  102 aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagtt 166  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| || |||||  |||||||||    
T  27829326 aagttagaggaccaaaataaatcattttttaattagaggaccaaactgttaccaattaaatagtt 27829390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 139)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 52412805 - 52412984
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||  |||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  52412805 atgaagatgaaaaagaaaagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 52412904  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  52412905 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 52412984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 19986329 - 19986505
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19986329 atgaagatgaaaaagaggaggagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaaagg 19986428  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19986429 accaaaataaatcaaattttatttaagagaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 19986505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 37199128 - 37199304
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  37199128 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 37199227  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  37199228 accagaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaattta 37199304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34028900 - 34028721
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  34028900 atgaagatgaaaaagatgagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaaggg 34028801  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34028800 accaaaataaattgaattttagttaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 34028721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16267894 - 16267716
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  16267894 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaccaacggtaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 16267795  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16267794 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 16267716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Original strand, 10654236 - 10654408
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10654236 atgaagatgaaaaagaggaaaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 10654335  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaa 184  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10654336 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaa 10654408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 10923573 - 10923749
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  10923573 aagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggacc 10923672  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10923673 aaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgataccacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10923749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11787919 - 11787742
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  11787919 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaaggg 11787820  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11787819 accaaaataattcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaattcaatttag 11787742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 24590432 - 24590613
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24590432 atgaagatgaaaaagaggagaagaaggtgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagag 24590531  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  24590532 accaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagccaa 24590613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 14775942 - 14776122
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |    
T  14775942 atgaagatgaaaaggaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagggagaatttaagag 14776041  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14776042 accaaaataaatcgaattttaattaagggaacaaaacgatactacctaaatagttaagtgaccaaaaatgcaatttagcca 14776122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 23281229 - 23281396
Alignment:
Q  24 aagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaat 123  Q
    |||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  23281229 aagaggagaagaagatgaaaaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaat 23281328  T
Q  124 caaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23281329 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 23281396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 32564157 - 32564335
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  32564157 atgaaaatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaatatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gatagaagttaaggg 32564255  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  32564256 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagcc 32564335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35986411 - 35986234
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |  |||||||||  |    
T  35986411 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtatcggcgagaagttaagag 35986312  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35986311 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaacaaaaatgcaatttag 35986234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 34279447 - 34279627
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaa-ctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34279447 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaaaaaaatataacgtttttaaataaaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagg 34279546  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34279547 gaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 34279627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 51692027 - 51691864
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  51692027 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaatggaccaaaatagatcgaattttaattaa 51691928  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagataaataa 202  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51691927 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa-ataaataa 51691864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 5463325 - 5463504
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5463325 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacagagaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 5463424  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  5463425 accaaaataaatcaaattttaattaacggaccaaagcgatactagctaaatagttaagggactaaaaatgcattttagcc 5463504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32564106 - 32563959
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32564106 aaaacataatgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 32564007  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32564006 aaagtgatacagcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 32563959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 45305617 - 45305795
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  45305617 atgaagatgaaaaacaggagaagaaaatgaaaaaactctaacgttttttaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagaga-gttaaggg 45305715  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  45305716 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 45305795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18793871 - 18793693
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaac-ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  18793871 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaaaaaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagg 18793772  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  18793771 gaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgaaatttag 18793693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Original strand, 29257030 - 29257204
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  29257030 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatgg 29257129  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatt 186  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29257130 accaaaataaattgaattttaattaggggacaaaattaatactagctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatt 29257204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21036164 - 21035987
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21036164 atgaagatgaaaaagaggaaaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacttaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 21036065  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21036064 accaaaataaattgaattttaattaatggaccaaagtgatactatctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttag 21035987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 34028954 - 34029107
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34028954 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 34029053  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34029054 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 34029107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37199085 - 37198932
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37199085 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 37198986  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  37198985 gggaccaaagcgatattgcctaaatagttaagaaaccaaaaatacaatttagcc 37198932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 4045306 - 4045485
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  4045306 atgaagatgaataagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggactaaaatgtgtagcagagaaaagttaaagg 4045405  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  4045406 actaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagtgatactacttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagcc 4045485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22584504 - 22584349
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22584504 atgaagaaaacctaacgtttttgatttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 22584405  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  22584404 gggaccaatgtgatactacctaaatagttaagagacaaaaaatgcaatatagccaa 22584349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33753392 - 33753225
Alignment:
Q  24 aagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaat 123  Q
    |||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  33753392 aagatgagaagaagatgaagaaaagctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagacaaaaatgtgtaactgggagaagttaaaggaccaaaataaat 33753293  T
Q  124 caaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  33753292 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 33753225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 22584558 - 22584740
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttg-aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22584558 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaaaaaaatctaacatttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagg 22584657  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  22584658 gaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaattagttaagggaccaaaaatataatttagccaa 22584740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 50921239 - 50921061
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||| | || ||    
T  50921239 atgaagatgaaaaagaagagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaaaactaaaatgtgtaacagagagaaatcaaggg 50921140  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  50921139 accaaaataaatcggattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 50921061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14118706 - 14118530
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||     
T  14118706 atgaatatgaaaaagagaagaa---gataaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagaaaagttaaagt 14118610  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14118609 accaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 14118530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 16267923 - 16268075
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16267923 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaa 16268021  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16268022 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 16268075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30611399 - 30611223
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||    
T  30611399 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaatagaaatgaccaaattatgtaacagagagaagttaaggg 30611300  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30611299 actaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagtgataatatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 30611223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 50574749 - 50574897
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50574749 gatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatta 50574848  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaat 185  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  50574849 agggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaat 50574897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42607676 - 42607525
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42607676 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttaaatta 42607577  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||  ||||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  42607576 agggaccaaaacgatattatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 42607525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6181769 - 6181619
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6181769 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 6181670  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    || ||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6181669 ggaaccaaagcgatactaactaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 6181619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9881705 - 9881545
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  9881705 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaatggaaaagaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattt 9881607  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagataa 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  9881606 agggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctagataa 9881545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25088169 - 25088016
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25088169 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 25088070  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25088069 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 25088016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30293189 - 30293016
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||    
T  30293189 aagatgaaaaagagaagaataagataaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacatagagaagttaagagacc 30293090  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  30293089 aaaataaatcgaattttaataaagagaccaaagcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaattta 30293016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51810290 - 51810141
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51810290 atgaaaaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 51810191  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  51810190 aggaccaaagtgatactacctaaatagttaagagactaaaaatgcaattt 51810141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24655765 - 24655589
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||  |    
T  24655765 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggcccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagag 24655666  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  24655665 accaaaatgaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatactacctaaatacttaagggaccaaatatgcaattta 24655589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 49291190 - 49291366
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||    
T  49291190 atgaagatgaaaaagatgagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaatcaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacatagagaaattaaggg 49291289  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  49291290 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactatctaaatagttaagggacgaaaaatgcaattta 49291366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 6181827 - 6182002
Alignment:
Q  16 agatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacca 115  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6181827 agatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaaccttacgtttttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggacca 6181926  T
Q  116 aaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  6181927 aaataaatcgaattttaattaaaggactaaagcgatactacataaatagttatgagaccaaaaatacaatttagcc 6182002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 51692081 - 51692254
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  51692081 atgaagatgagaaagaggagaa---gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaaggg 51692176  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51692177 accaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaaacgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 51692254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28970573 - 28970419
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28970573 gatgaagaaaacctaatgttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttcatggaccaaaataaatcgaattttaatta 28970474  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  28970473 aaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 28970419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13944690 - 13944514
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||    
T  13944690 atgaagatgaaaaagaagataagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtttaatggagagaagttaaggg 13944591  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  13944590 accaatataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactagctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 13944514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 143
Target Start/End: Original strand, 13831229 - 13831360
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  13831229 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 13831328  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13831329 accaaaataaatcgaattttaattaagggacc 13831360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 30611453 - 30611606
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc-aaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||     
T  30611453 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagaaaagataagggaccaaaaataaatcgaattttaattt 30611552  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30611553 agggaccaaagcgatacaacctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagc 30611606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 46738957 - 46739109
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46738957 atgaagaaaatctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaacagagagaagttaagcgaccaaagtaaatcgaattttaattaa 46739056  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  46739057 gggaccaaagtgatactacctaaatagttagggga-caaaaatacaatttagcc 46739109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 4550807 - 4550986
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||||      
T  4550807 atgaagatgaagaagaggagaaaaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaatttaacctaacggaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaaga 4550905  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4550906 taccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 4550986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 29256979 - 29256843
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29256979 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggacc 29256880  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  29256879 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 29256843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 13944744 - 13944899
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13944744 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattctaattaa 13944843  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  13944844 gggatcaaaacgatactacctaaatgattaagggaccaaaaatacaatttagccaa 13944899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 21385175 - 21385322
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21385175 aaaacctaacgtttttgaattaaaatcaacggaaatgaccaaaatgtgttacatagagaagttaagggatcaaaataaattaaattttaattaagggacc 21385274  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  21385275 aaagcgatactacttaaatagttaagggattaaaagtgcaatttagcc 21385322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52412745 - 52412598
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  52412745 aaaacctaacgttttggaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggacc 52412646  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  52412645 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtattttagcc 52412598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 46949910 - 46949756
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  46949910 gatgaagaaaacttgacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacgaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 46949811  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  46949810 agggaccaaaacgatactacctaaatagttaatgaattaaaaatgcaatttagcc 46949756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 50118500 - 50118350
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||||    
T  50118500 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaaattaagagaccaaaataaatcgaattgtaattaa 50118401  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  50118400 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 50118350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10654174 - 10654030
Alignment:
Q  46 aacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10654174 aacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggacagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaa 10654075  T
Q  146 agtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || | ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  10654074 agcg-tactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10654030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 32517752 - 32517894
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  32517752 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaatgagagaagttgagggatcaaaataaatcaaattttaattaa--aacc 32517849  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32517850 aaagtgatactacctaaatagataagggatcaaaaatgcaattta 32517894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Original strand, 33753449 - 33753578
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33753449 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 33753548  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagtta 167  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  33753549 gggaccaaaacgatactacctaaatagtta 33753578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Original strand, 36657734 - 36657883
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36657734 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatagacagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaa 36657833  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  36657834 gggaccaaagcgatactgcataaatagttaagggaccaaaaatacaattt 36657883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21385115 - 21384960
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||| |    
T  21385115 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctatcgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaa-g 21385017  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  21385016 accaaaataaatcgaattttaattaagggataaaagcgatactacataaatagttaa 21384960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 51810345 - 51810513
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  51810345 atgaagatgaaaaagaggagaagaggatgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacaagaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaggg 51810444  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  51810445 accaaaataaatcaatttttaattcaggaacaaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 51810513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 11394893 - 11395044
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11394893 atgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaataaccataatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 11394992  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||| ||||   | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11394993 gggatcaaaacaaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 11395044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 30293246 - 30293395
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30293246 atgaaaaaaacctaacatttttgaattaaaactaatggaaaataccaaaatgtgtaacatagagaagttaa-ggaccaaaataaatcgaattttaattaa 30293344  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30293345 aggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 30293395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 49291146 - 49291016
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  49291146 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaatgaagagaagttaaggaacaaaaataaatcaaattttaattaa 49291047  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49291046 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaa 49291016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9119468 - 9119303
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||   ||||||||||| ||| |    
T  9119468 aagatgaaaaagaggagaagaacacgaagaaaatctaacgtttttgaattgaaactaacggaaataaacaaaatgtataatgtatagaagttaagggatc 9119369  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||    
T  9119368 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaagtagttaagggataaaaaat 9119303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 42607735 - 42607887
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42607735 atgaagaaaatctaacctttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttgtaacagagagtaattaaaggaccgaaataaatcaaattttaattaa 42607834  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    | |||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  42607835 gagaccaaaacgatactatctaaataattaagggatcaaaaatacaatttagc 42607887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1831828 - 1831664
Alignment:
Q  23 aaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaa 122  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||    
T  1831828 aaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttt----taaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaagaagagaagttaagggaccaaaataaa 1831733  T
Q  123 tcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  1831732 tcgaattttaattaaaagaccaaagtgatactacctaaatagttaagagaccgaaaattcaatttagcc 1831664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 24655825 - 24655972
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  24655825 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaaccggaaggaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggctcaaaataaatcgaattttaattacgagacc 24655924  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  24655925 aaagcgatactacttaaatagttaagagactaaaaatgcaatttagcc 24655972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 11787957 - 11788126
Alignment:
Q  21 aaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaata 120  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  || | ||||||| |||||||||||    
T  11787957 aaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaa-gagcaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaata 11788055  T
Q  121 aatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  11788056 aatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgcttaaataattaaaagaccaaaaatgcaatttagcc 11788126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27209322 - 27209181
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  27209322 atgaagaaaacctaacggttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 27209223  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||| || ||||||    
T  27209222 gggaccaaagtgatattaattaaatagttaagggaccaaaaa 27209181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28112904 - 28112795
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28112904 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 28112805  T
Q  137 agggaccaaa 146  Q
    ||||| ||||    
T  28112804 agggatcaaa 28112795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34279393 - 34279240
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||  | |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  34279393 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaa 34279294  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34279293 gggaccaaagcgttactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 34279240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36657680 - 36657501
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac--agatagaagttaaa 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||| || ||||||     
T  36657680 atgaagatgaaaaagatgagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagga-caaaatatgtaacggagagaggagttaag 36657582  T
Q  110 ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  36657581 ggatcaaaataaatcaaattttaattaagggacccaagagatgcaaactaaatagttaggggacgaaaaatgcaatttagc 36657501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 50574661 - 50574536
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  50574661 aaaaccgaaagttattgagttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatagacc 50574562  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  50574561 aaagcgatactacctaaatagttaag 50574536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5118204 - 5118096
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5118204 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 5118105  T
Q  138 gggaccaaa 146  Q
    |||||||||    
T  5118104 gggaccaaa 5118096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 25088223 - 25088390
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  25088223 atgaaaatgaaaaagtggagaagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatggagaagttaaggg 25088322  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    ||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  25088323 accgaactaaatcgaattttagttaa-ggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 25088390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Original strand, 30792647 - 30792759
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||    
T  30792647 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaaggg 30792746  T
Q  112 accaaaataaatc 124  Q
    |||||||||||||    
T  30792747 accaaaataaatc 30792759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40534104 - 40533928
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||| || |||||||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||       
T  40534104 atgaagataaagaagaggagaagaagataaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagaaaagttaagat 40534005  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  40534004 agcgaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcgatactaattaaatagttaagagactaaaaatgcaattta 40533928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 40703072 - 40703247
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| | |||||||      
T  40703072 atgaagatgaagaagaggagaacatgatgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaaggagaga-aagttaaga 40703170  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40703171 tgccaaaataaatcaaattttaactaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 40703247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 45305552 - 45305412
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaag 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  45305552 ctaacgtttttgaattaaaagtaacggaaaagaccaaaaggtataacagagagaaagttaaaggaccaaaataaatcgaatcttaattaaaggaccaaag 45305453  T
Q  148 tgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
      |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  45305452 caatactacctaaatagttaactgaccaaaaatgcaattta 45305412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10923516 - 10923373
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaa-actaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  10923516 atgaagaaaacataacgtttttgaattaaatactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggatcaaaataaatcaaattttactta 10923417  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||||    
T  10923416 agggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaat 10923373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 46949969 - 46950084
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  46949969 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaa 46950068  T
Q  138 gggaccaaagtgatac 153  Q
     ||| ||| |||||||    
T  46950069 aggagcaatgtgatac 46950084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14775898 - 14775745
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14775898 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggagcaaaataaatcgaattttaattaa 14775799  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     | | ||||   |||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  14775798 agaagcaaaacaatactacctaaataattaagggaacaaaaatacaatttagcc 14775745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30792593 - 30792440
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30792593 atgaagaaaacttgacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagagaaaagataagggaccaaaataaatcgaattttatttaa 30792494  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| ||||| || |  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  30792493 gggatcaaagcgacagtacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcc 30792440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 2125416 - 2125584
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||    
T  2125416 atgaagatgaaaaagaagagaaacatatgaataaaacctaacgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgt-taacgaagagaagttaaggg 2125514  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  2125515 accaaaataaatcaaattt------agggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgtaattt 2125584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 18793925 - 18794079
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18793925 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaa-tgtgtaacgaaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 18794023  T
Q  138 gggaccaaagtg--ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| |  |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18794024 gggaccaaagcgatatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 18794079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4045252 - 4045121
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  4045252 atgaagaacacctaacgtttttgaattaaaatcaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaattgaattttaattaa 4045153  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  4045152 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaag 4045121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36884894 - 36884725
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||  |    
T  36884894 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaat-------aacggaaaggaccaaaatatgtaatggagggaagttaagag 36884802  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  36884801 accaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaacaaaaatacaattta 36884725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44222345 - 44222195
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44222345 atgaataaaatctaatgtttttgaattaaaactaacagaaagaatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaa 44222246  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||  || |||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  44222245 gggaccaaagcgatattacataaataattaaaggaccaaaaatgcaattta 44222195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 34621880 - 34622009
Alignment:
Q  50 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  34621880 taacgtttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaaacg 34621979  T
Q  150 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  34621980 atactaattaaatagttaagggaccaaaaa 34622009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 191
Target Start/End: Original strand, 50921366 - 50921477
Alignment:
Q  80 gaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  50921366 gaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttacttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 50921465  T
Q  180 tgcaatttagcc 191  Q
    || |||||||||    
T  50921466 tgtaatttagcc 50921477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Original strand, 19886099 - 19886226
Alignment:
Q  17 gatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  19886099 gatgaaaaagaggagaagaaaaggaagaaaacataacgtttttaaattaaaactaacggaaatgacaaaaatgtgt--gagagagaagttaaaggaccaa 19886196  T
Q  117 aataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19886197 aataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 19886226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24590379 - 24590245
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| | | || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24590379 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggactaaaatgtgtaacatagacaaattaatagaccaaaataaatcgaattttaattaa 24590280  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtga 172  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  24590279 gggaccaaagcgatactacttaaatagttaagtga 24590245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3569553 - 3569388
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggac 113  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||   ||    
T  3569553 aagatgaagaagaggagaagaagatggagaaatcctaacgtttttgaattaaaactaacggaaattaccaaaatgtgtaacagagagaaaattaagatac 3569454  T
Q  114 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |  |||||| ||||| || ||||||    
T  3569453 caaaatatatcaaattttaattaaggaaccaaaacgatactaattaaataattaagggaccaaaaa 3569388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 20260587 - 20260765
Alignment:
Q  13 tgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||       
T  20260587 tgaagatgaagaagaggagaagaagatgaagaaaacataacgtttttaaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatatgtaaggagagag-agttaagat 20260685  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  20260686 accaaaataaatcagattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaataattaagggactaaaaatgcaatttagcc 20260765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 191
Target Start/End: Original strand, 21036225 - 21036367
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaag 147  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21036225 cctaaagttcttgaattaaaactaacggaaatgatcaaacaatgtaacagagaaaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaag 21036324  T
Q  148 tgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||   ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  21036325 tgatggtacctaaatagttaa-agataaaaaatgcaatttagcc 21036367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 1831897 - 1832047
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || | |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1831897 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccataatatataacggagaaaagttaagagacgaaaataaatcgaattttaattaa 1831996  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     |||| |||  ||||| || || ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  1831997 aggactaaaacgatactacatatatagttaagggaccaaaaatacaattta 1832047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32517735 - 32517629
Alignment:
Q  61 aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaa 160  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32517735 aattaaaactaacaaaaataaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaa 32517636  T
Q  161 atagtta 167  Q
    |||||||    
T  32517635 atagtta 32517629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Original strand, 9119525 - 9119618
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaatttt 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9119525 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaactgaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttt 9119618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11797321 - 11797220
Alignment:
Q  45 aaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacca 144  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11797321 aaacctaacattcttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaggttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacca 11797222  T
Q  145 aa 146  Q
    ||    
T  11797221 aa 11797220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36077381 - 36077271
Alignment:
Q  81 accaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    |||||||| ||||||  | |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||    
T  36077381 accaaaatttgtaacgaagagaacttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaataattaagggaccaaaaat 36077282  T
Q  181 gcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||    
T  36077281 gcaatttagcc 36077271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31126082 - 31125938
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||     
T  31126082 atgaagaaaatctaacattttttaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaatta- 31125984  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
          |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31125983 ------aaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttag 31125938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Original strand, 48702119 - 48702266
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  48702119 taaaatctaatgtttttgaattaaaaccaacg-aaatgaccaaaatgtgtaac-gatagaaagttaaaataccaaaataaatccaattttaattaaagga 48702216  T
Q  142 ccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||  ||||| | | ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48702217 ccaaaacgatactaacaaaataattaagggactaaaaatgcaatttagcc 48702266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 50921293 - 50921374
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  50921293 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaattgaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaat 50921374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5463271 - 5463156
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttg-aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5463271 atgaagaaaacctaacgtttttttaattaaaactgacggaaaggaccaaaatatgtacctgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 5463172  T
Q  137 agggaccaaagtgata 152  Q
    || |||||||| ||||    
T  5463171 agagaccaaagcgata 5463156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19886088 - 19885985
Alignment:
Q  85 aaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaa 184  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  19886088 aaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatactacaaaaatagttaagggaccaaaaatgcaa 19885989  T
Q  185 ttta 188  Q
    ||||    
T  19885988 ttta 19885985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Original strand, 31126136 - 31126271
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||| | | ||||||| ||    
T  31126136 atgaagatgaaaaatagaaaaaaaagataaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtgacatagaaaagttaaggg 31126235  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaag 147  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31126236 actaaaataaatcaaattttaattaatgtaccaaag 31126271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34621788 - 34621624
Alignment:
Q  24 aagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaaggaccaaaataaa 122  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| | |||||||   |  ||||||||    
T  34621788 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaaaatgtgtaaggaga-aaaagttaagatattaaaataaa 34621690  T
Q  123 tcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | |||||||||||||| |||||||  ||||| |  |||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  34621689 taaaattttaattaagagaccaaaacgatactaattaaataattaaaggatcaaaaatgcaattta 34621624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 138
Target Start/End: Original strand, 36884944 - 36885037
Alignment:
Q  45 aaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaag 138  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36884944 aaacctaacattttttaattaaaattaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagataagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaag 36885037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40703012 - 40702880
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40703012 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaaagatcaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatttagggacc 40702913  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
       ||||||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  40702912 ---gtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 40702880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20260536 - 20260440
Alignment:
Q  83 caaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  20260536 caaaatgtgtaacggagagaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaatgatactaattaaatagttaagagaccaaaaa 20260440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Original strand, 27209381 - 27209535
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatt 135  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  || |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  27209381 gatgaagaagacctaacgttttttaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgcaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatt 27209479  T
Q  136 aagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || ||||||||  ||||| |  ||||| || ||| || ||||||||||||||||||    
T  27209480 aaaggaccaaaacgatactaattaaattgtcaagggaccaaaaatgcaatttagcc 27209535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 40534158 - 40534299
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||  || | |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40534158 atgaagaaaacttaacattttttaattaaaactaacagaaagggtcaaaatgtgtaatggagaaaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaa 40534257  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    | |||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  40534258 gagaccaaagcgatactaattaaatagttaagggatcaaaaa 40534299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Original strand, 19886214 - 19886302
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||||    
T  19886214 ttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagtgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatacaatttaaccaa 19886302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5118079 - 5117995
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5118079 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 5117995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4054688 - 4054602
Alignment:
Q  52 acgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag-gaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4054688 acgtttttgaattaaaactaacgtaaaagactaaaatgtgtaacggagagaaagtaaagagaccaaaataaatcgaattttaattaa 4054602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28112807 - 28112721
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28112807 ttaagggatcaaaataaattgaattttaattaaggaaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 28112721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11797232 - 11797147
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  11797232 ttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggacaaaagcgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatgcaatttagc 11797147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19269449 - 19269360
Alignment:
Q  102 aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19269449 aagttcaaggaccaaaataaaccgaattttaactaagagaccaaagtgatactggataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 19269360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11394776 - 11394697
Alignment:
Q  107 aaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11394776 aaaggatcaaaagaaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagaga-caaaaatgcaattt 11394697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 38961218 - 38961145
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataa 121  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  38961218 ctaacgttttttaattaaatttaacggaaatgaccaaaatgtataacggagagaaagttaagggaccaaaataa 38961145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 11394839 - 11394765
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaa 87  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||    
T  11394839 atgaagatgaacaagaggagaataa-atgaagaaaacctaacgtttcttaattaaaactaacggaaaggatcaaaa 11394765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25995870 - 25995808
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagtta 167  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  25995870 ttaaaggaccgaaataaatcaatttttaattaaaggaccaatctgataccaattaaatagtta 25995808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 43727454 - 43727368
Alignment:
Q  42 ataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaa 127  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || ||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  43727454 ataaaccctaacgttttttaattaaatttaacgggaaggaccaaaatgtataacggagagaaagttaagggaccaaaataattcaaa 43727368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5118108 - 5118067
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5118108 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 5118067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38961133 - 38961089
Alignment:
Q  102 aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  38961133 aagttaaaggaccaaaataaatcaaaatttagttaaggggccaaa 38961089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43727362 - 43727274
Alignment:
Q  102 aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||  || ||||  |||||||||||| ||  ||||| | ||||||||    
T  43727362 aagttaaaggatcaaaataaatcaaaatttagttaagggatcaaaccgaaaccaattaaatagttaagggactaaaaaggtaatttagc 43727274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 48702070 - 48702023
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgttttt 59  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  48702070 atgaagatgaagaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttt 48702023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6137296 - 6137246
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  6137296 ttttagttaagggaccaaagtgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 6137246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 6714698 - 6714748
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||    
T  6714698 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 6714748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 9478612 - 9478662
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  9478612 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggatcaaaa 9478662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15073478 - 15073428
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15073478 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggatcaaaa 15073428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32193580 - 32193530
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  32193580 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggattaaaa 32193530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 33171835 - 33171885
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  33171835 ttttagttaagggaccaaagtgataccaattaaatacttaagtgaccaaaa 33171885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45678435 - 45678385
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  45678435 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggatcaaaa 45678385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1524062 - 1524017
Alignment:
Q  134 ttaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  1524062 ttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaaa 1524017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 29022544 - 29022585
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29022544 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaag 29022585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 49652461 - 49652420
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49652461 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaag 49652420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6241319 - 6241275
Alignment:
Q  125 aaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  6241319 aaattttaattaagggaccaaagcgatactaaataaatagttaag 6241275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 6241370 - 6241326
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaa 87  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  6241370 taaaccctaacgtttttgaattaaatttaacggaaaggaccaaaa 6241326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 102)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 119295 - 119119
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  119295 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagtt-aagg 119197  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  119196 accaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaagtaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 119119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31230792 - 31230613
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  31230792 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 31230693  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  31230692 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtagtttagcc 31230613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 35223974 - 35224153
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  35223974 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggg 35224073  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35224074 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaacgatactaactaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 35224153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39240209 - 39240031
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |     
T  39240209 atgaagatgaaaaagaggagaataagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagga 39240110  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39240109 atcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 39240031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 24456885 - 24457038
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24456885 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 24456984  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24456985 gggaccaaggcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 24457038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 18621957 - 18622133
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18621957 aagatgaaaaagatgagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaagagcaaaatgtgtaacagatagaagttaagggacc 18622056  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  18622057 aaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagagaccaaaagtgcaatttagcc 18622133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Original strand, 23244722 - 23244895
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  23244722 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacatagagaagttaaggg 23244821  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaat 185  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23244822 atcaaaataaatcgaattttaactaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaat 23244895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 8654143 - 8654319
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  8654143 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaagtaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 8654242  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8654243 agcaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacaatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 8654319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 9495230 - 9495406
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  9495230 atgaagatgaaaaggacgagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgagtaacggagagaagttaaggg 9495329  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9495330 accaaaataaatcaaactttaattaacggaccaaagcaatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 9495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 3869156 - 3869335
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  3869156 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaaagtgtaacggagagaagttaaggg 3869255  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  3869256 acaaaaaaaaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 3869335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 37393710 - 37393861
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37393710 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacttacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 37393809  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37393810 gggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 37393861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 21515407 - 21515588
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  21515407 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagacaacgtaacgtttttgaattaaagctaacggaaatgaccaaaatatgtaacaaagagaagttaaggg 21515506  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||    
T  21515507 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacgtaaatagttaaaagactaaaaatgtaatttagccaa 21515588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Original strand, 14920644 - 14920792
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14920644 atgaagaaaacctaacgttttcgaattaaaagtaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 14920743  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatt 186  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||    
T  14920744 gggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 14920792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30872966 - 30872783
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttg----aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagtta 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  30872966 atgaagatgaaaaagaggagaagaacatgaagaaaacctaacgttttttttttaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgttacaaagagaagtta 30872867  T
Q  108 aaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30872866 agggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 30872783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40040315 - 40040161
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40040315 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaacaaaataaatcgaattttaattaa 40040216  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40040215 ggtaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 40040161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Original strand, 1826030 - 1826179
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1826030 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 1826129  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  1826130 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttatccaa 1826179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Original strand, 1860475 - 1860624
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1860475 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 1860574  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  1860575 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttatccaa 1860624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6843650 - 6843498
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaa--ggaccaaaataaatcaaattttaatt 135  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6843650 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttataagggaccaaaataaatcaaattttaatt 6843551  T
Q  136 aagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6843550 aagggatcatagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 6843498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37393656 - 37393480
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||||||| ||    
T  37393656 atgaaaatgaaaaagaggagaaaaatatgaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaattgagagaagttaaggg 37393557  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  37393556 accaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 37393480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 39912158 - 39912302
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39912158 aaaatctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 39912257  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  39912258 aaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 39912302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 7041836 - 7042010
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  7041836 atgaagatgaaaaagtggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggg 7041935  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7041936 accaaaataaatcaaat-----ttaagggaccaaagcgatactatataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 7042010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18017937 - 18017790
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  18017937 aaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaagtgacc 18017838  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  18017837 aaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaatatgcaatttagcc 18017790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26736278 - 26736123
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  ||    
T  26736278 atgaagaaagcctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaggtaagggaccaaaataaattaaattttaaaaaa 26736179  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  26736178 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttaaccaa 26736123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 31230846 - 31231001
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  31230846 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaattgaattttaattaa 31230945  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  31230946 gggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagccaa 31231001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 11198438 - 11198591
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11198438 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaa 11198537  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11198538 gggaccaaagcgatactgtctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 11198591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 16645752 - 16645931
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagat---agaagttaa 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||   |||||||||    
T  16645752 atgaagatgaaaaaaaggagaagaagatgaagaaaacctaatctttttgaattaaaactaatggaaaggaacaaaatgtgtaactgatgagagaagttaa 16645851  T
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16645852 aggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 16645931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 26736332 - 26736509
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  26736332 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaactcaaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtatcgaagagaagttaaagg 26736431  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||   |||| | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  26736432 accacaataaatcgaattttaattaaaggaccaaatcaatactatctaaatagttaagggatcgaaaatgtaatttag 26736509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 30568483 - 30568660
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||| ||    
T  30568483 atgaagatgaaaaagatgagaagaaggtgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagaaaaattaaggg 30568582  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30568583 accaaaataaatcaaattttaaataagggaccaaatcgatactaactaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 30568660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30650343 - 30650190
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30650343 atgaagaaaacctaaggttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaa 30650244  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   ||  |||||||||||||||||    
T  30650243 gggaccaaagtgatactacctaaatagttagaggactaaaaatgcaatttagcc 30650190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35223927 - 35223774
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  35223927 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagtcaa 35223828  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  35223827 gggaccaaagcgatactacctaaatagtaaagggaccaaaaatgcaatttagcc 35223774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39912096 - 39911915
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  39912096 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatataacggagagaagttaaagg 39911997  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  39911996 accaaaataaaccgaattttaattaagcgaccaaagagataatatctaaataattaagggacaaaaaatgcaaattagccaa 39911915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 193
Target Start/End: Original strand, 119348 - 119504
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  119348 gatgaagaaaacctattatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccggtgagaagttaagggaccaaaataaagcaaattttaatta 119447  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  119448 agggactaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaacaatgcaatttagccaa 119504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 758551 - 758730
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||| || || ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  758551 atgaagataaataaaaggagaagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgactaaaatgtgtagcagagaaaagttaaggg 758650  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  758651 accaaaataaatcgaattttaatttaaggaccaaagtgatactacttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagcc 758730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14920590 - 14920411
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  14920590 atgaagatgaaaaagagaagaagaggatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacagggagaagttaaggg 14920491  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||   |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  14920490 accaaaataaatcgaattttaattaaatgaccaaaacaatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaattaagcc 14920411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23244668 - 23244518
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23244668 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaacgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 23244569  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     | ||||||| ||||| || ||||| ||||   || |||||||||||||||    
T  23244568 agaaccaaagcgatactacataaatggttagtggaccaaaaatgcaattta 23244518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 29027179 - 29027354
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  29027179 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgacgaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaa----ccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 29027274  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  29027275 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatataatttagcc 29027354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40032574 - 40032424
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaa-ttaagggac 142  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  40032574 aaaacctaatgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagacagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttaagagac 40032475  T
Q  143 caaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40032474 caaagcgatactacctaaataattaagtgaccaaaaatgcaatttagccaa 40032424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44255012 - 44254867
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44255012 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaacactaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 44254913  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgat-caaaaatgcaatttag 189  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44254912 aaagcgatactacttaaatagttaag-gatccaaaaatgcaatttag 44254867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5416985 - 5416812
Alignment:
Q  18 atgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaa 117  Q
    ||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5416985 atgaaaaagaggaaaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaagaccaaa 5416886  T
Q  118 ataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  5416885 atcaatcgaattttaattagaggaccaaaacgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcc 5416812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 5417046 - 5417197
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-agatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  5417046 atgaagaaaacctaacgtttttgaaataaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaacgaga-agaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagtta 5417144  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  5417145 agggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcagtttag 5417197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 18914490 - 18914638
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  18914490 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaca 18914589  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    | || ||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  18914590 agagcgatgctacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcca 18914638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 188
Target Start/End: Original strand, 18018018 - 18018169
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18018018 gatgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaatta 18018117  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||| |||||  ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18018118 agggagcaaagcaatacttcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 18018169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36344140 - 36343962
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  36344140 atgaagatgaaaaaaagaagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatgtgtaacatagaaaagttaaagg 36344041  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||    
T  36344040 accaaaattaatcgaattttaattaagggaccaaaataatactacctaaataattaag-aaccaaaaatacaatttagcc 36343962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 39240252 - 39240407
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39240252 atgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaattaa 39240351  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  39240352 gagaccaaaacgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttaaccaa 39240407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8654089 - 8653936
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8654089 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacaaatgaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaa 8653990  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  8653989 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcc 8653936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29027125 - 29026971
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29027125 atgaagaaaacctaacgttttagaattaaaactaacagaaatgaccaaattgtgtaacgggtagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 29027026  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaa----tagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    |||||||| || |||||||||||||||    
T  29027025 gggaccaaaatgatactacctaaatagctagttaagggaccaaaaatgcaattta 29026971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40094628 - 40094497
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  40094628 atgaagaaaatctaacgttcttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttaattaa 40094529  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40094528 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaag 40094497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 758497 - 758347
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  758497 atgaagaacacctaacgtttttgaattaaaatcaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaatttaattttaattaa 758398  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  758397 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggggccaaaaatgcaattta 758347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18914437 - 18914297
Alignment:
Q  14 gaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggac 113  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  18914437 gaagatgaaaaagaggagaagaagatgaaaaaaacctaacatttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggac 18914338  T
Q  114 caaaataaatc-aaattttaattaagggaccaaagtgatac 153  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | ||||||| |||||    
T  18914337 caaaataaatcgaatttttaattaaagaaccaaagcgatac 18914297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1825988 - 1825810
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1825988 atgaagatgaaaaggaggagaagaagatgaaggaaatctaatatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 1825889  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| || ||||  ||| |  | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  1825888 actaaaat-aatcaaattttaattaagagatcaaaacgatgctccttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 1825810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1860433 - 1860255
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1860433 atgaagatgaaaaggaggagaagaagatgaaggaaatctaatatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 1860334  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| || ||||  ||| |  | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  1860333 actaaaat-aatcaaattttaattaagagatcaaaacgatgctccttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 1860255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 30873017 - 30873164
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  30873017 aaaacctaacgtttttgaactaaaactaacgaaaatgactaaaatgtgtaacggatagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaaggaatc 30873116  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||| | |||| ||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  30873117 aaactaatactaccaaaataattaagggacaaaaaatgcaatttagcc 30873164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 40094682 - 40094857
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  40094682 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaggaaaatttaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaagtgtaacggagagaagttaaggg 40094781  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    ||| |  |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  40094782 acaaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacagtactaattaaatagttaagggaccaaaaatgtaattt 40094857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3869094 - 3868946
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgt---gtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggg 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||| || |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3869094 aaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtactgtaacggagagaagttaagagactaaaataaatcgaattttaattaaggg 3868995  T
Q  141 accaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3868994 accaaagtgatactacataaatagttaagggatcaaaagtgcaatttag 3868946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 44255072 - 44255248
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||| |||| |||   |||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  44255072 atgaagatgaaaacgaggggaa---gatgaagaaaatgtaacatttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagag 44255168  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||    
T  44255169 accaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacaatcccacctaaatagttaaaggatcaaaaatacattttagcc 44255248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33542563 - 33542384
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| || |||||||     
T  33542563 atgaagatgaagaagaggagaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaaggagagag-agttaaaa 33542465  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  33542464 taccaaaataaatcagattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagcc 33542384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 12873255 - 12873432
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  || || ||||||       
T  12873255 atgaagatgaagaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaaaaaaatgaccaaaatgtgtaa-ggagag-agttaagat 12873352  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  12873353 accaaaataaatcagattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 12873432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7041782 - 7041653
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7041782 atgaagaaaacctaatgtttttcaattaaaactttcgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 7041683  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagtta 167  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7041682 gggaccaaagcgatactacctaaatagtta 7041653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11639204 - 11639052
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11639204 atgaacaaaacctaacgtttt-gaattaaaacttacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagacgaaaataaatcgaattttaattaa 11639106  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  11639105 gggaccaaagcgacgctacctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcc 11639052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 191
Target Start/End: Original strand, 28206996 - 28207139
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28206996 cctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatttgtaac-gatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggggtcaaa 28207094  T
Q  147 gtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | ||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28207095 gcgatactagcaaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagcc 28207139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5526022 - 5525893
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5526022 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaaggaaatggccaaaatgtataagagat--aagtaaagggactaaaataaatcaaattttaattaa 5525925  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
     ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  5525924 aggaccaaatcgatactacctaaatagttaag 5525893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 146
Target Start/End: Original strand, 44678426 - 44678525
Alignment:
Q  47 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  44678426 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaacgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaa 44678525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12873204 - 12873070
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12873204 aaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagaaaccaaaataaattaaattttaattaaaggacc 12873105  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||    
T  12873104 aaagtgatactaattaaatagttaagggattaaaa 12873070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 26217276 - 26217410
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||| ||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||    
T  26217276 atgaaaatgaaaatgaggaaaagaagatgaagaaaaccgaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgacgaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggg 26217375  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26217376 tacaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaa 26217410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 410595 - 410736
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  410595 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacaaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaggtaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 410694  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    || ||||||  ||||| |   ||||||||||| |||||||||    
T  410695 ggaaccaaaacgatactaataaaatagttaagggatcaaaaa 410736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30568415 - 30568331
Alignment:
Q  52 acgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30568415 acgtttttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 30568331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32733864 - 32733740
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32733864 atgaagaaaacataacatttttgaattaaaattaacggaaaggagcaaaatgtgtaacgtatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 32733765  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaat 162  Q
       |||||||| |||  ||||||||    
T  32733764 aaaaccaaagtaatattacctaaat 32733740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Original strand, 40040369 - 40040477
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  40040369 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaatgaagaacacctaacatttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 40040468  T
Q  112 accaaaata 120  Q
    |||||||||    
T  40040469 accaaaata 40040477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Original strand, 36344210 - 36344344
Alignment:
Q  54 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 153  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  36344210 gtttttgaatcaaaattaaaggaattgaccaaaatgtgtgacggaaataagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaaaagaccaaagcaatac 36344309  T
Q  154 cacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  36344310 tacctaaatagttaaaggataaaaaatgcaattta 36344344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28206913 - 28206765
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg-accaaaataaatcaaattttaattaagggac 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||  | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28206913 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggatcaaaatgtgtaac-gatagaaaattaagataccaaaatacatcaaattttaattaagggac 28206815  T
Q  143 caaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    ||||| ||||| | | ||||||||| | || ||||||| |||||||||||    
T  28206814 caaagcgatactagcaaaatagttatgggaccaaaaattcaatttagcca 28206765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35486023 - 35485883
Alignment:
Q  39 tgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaag 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| | |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35486023 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtttgacaaagagaagttaatataccaaaataaaacaaattttaattaag 35485924  T
Q  139 ggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||| |||| ||||  |  | |||||||||| |||||||||    
T  35485923 ggactaaagcgatattaattgaatagttaagggatcaaaaa 35485883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24456816 - 24456734
Alignment:
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24456816 aggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 24456734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 6844695 - 6844828
Alignment:
Q  60 gaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccaccta 159  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||| | |||||    
T  6844695 gaattaaaactaatgggaaagaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaagataaatcgatttttaattaagagatcaaagcgatgctaccta 6844794  T
Q  160 aatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  6844795 aatagttaagagaccaaaaatgcaatttacccaa 6844828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26217222 - 26217082
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26217222 atgaagaaaatccaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggacgaaa-tgtgtaacaaagaggagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaa 26217124  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
     || ||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  26217123 agggccaaaatgatactacttaaatagttaagggaccaaaaa 26217082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 193
Target Start/End: Original strand, 40032693 - 40032817
Alignment:
Q  70 taacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||| ||||    
T  40032693 taacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaaatgatactacataaatagctaag 40032792  T
Q  170 tga-tcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
     ||   |||||| ||||||||||||    
T  40032793 ggacaaaaaaatacaatttagccaa 40032817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 410543 - 410415
Alignment:
Q  14 gaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaagga 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||   |    
T  410543 gaagatgaagaagagcagaa---gatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaaggagaga-aagttaagata 410448  T
Q  113 ccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  410447 ccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaa 410415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Original strand, 45436398 - 45436548
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggacc--aaaataaatcaaattttaattaagg 139  Q
    |||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  45436398 taaaccctaacgttatt-aattaaatttaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaaagttaagggacccaaaaataaatcaaaatttagttaagg 45436496  T
Q  140 gaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||  || ||||  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  45436497 gaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggacaaaaaatgtaatttagcc 45436548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Original strand, 33542617 - 33542731
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || |||||||||   | ||||||||||||||||||||||||    
T  33542617 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagaaatcaaaataaatcaaattttaattaa 33542716  T
Q  138 gggaccaaagtgata 152  Q
      |||||||| ||||    
T  33542717 atgaccaaagcgata 33542731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Original strand, 11639258 - 11639354
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaa 109  Q
    ||||||||||||||||| | || | |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  11639258 atgaagatgaaaaagag-ataagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaaa 11639354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21512523 - 21512413
Alignment:
Q  80 gaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| ||  |||||    
T  21512523 gaccaaaatgtgtagcggagagaagttaaggggccaaaataaatcaaattttaattaatggactaaagcgata-ctcctaaatagttaagggacgaaaaa 21512425  T
Q  180 tgcaatttagcc 191  Q
    | ||||||||||    
T  21512424 tacaatttagcc 21512413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44678396 - 44678317
Alignment:
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44678396 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44678317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19302362 - 19302207
Alignment:
Q  14 gaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagataga-agttaaagga 112  Q
    ||||||||| |||||| ||| | |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||   ||||   |    
T  19302362 gaagatgaagaagaggggaagaagatgaagaaacccaaacgtttttgaattaaaactaacgcaaaagaccacaatgtgtaacagagagaccattaagata 19302263  T
Q  113 ccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  19302262 ctaaaataaatcaatatttaattaaggg-ccaaaacgatactaccaaaatagttaag 19302207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29769505 - 29769366
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaag 147  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||     
T  29769505 ctaacgttttt-aattaaatttaacggaaatgaccaaaacttgtaacaaagagaaagttaagggaccaaaataaatcaaaatttagttaaggaaccaaac 29769407  T
Q  148 tgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     || ||||  |||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  29769406 cgaaaccaattaaatagttaagagaccaaaaaggtaattta 29769366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Original strand, 35486069 - 35486243
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaac-ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaa 109  Q
    ||||||||||| || ||||||| | || ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || || || ||||||  || |||| |||||     
T  35486069 atgaagatgaagaataggagaagaagaagaaaaaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggagcacaaggtgtaag-gagagaaagttaag 35486167  T
Q  110 ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaat 185  Q
      || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| | || ||||||||||||    
T  35486168 atactaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaggggaccaaaaatgcaat 35486243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Original strand, 19302427 - 19302513
Alignment:
Q  56 ttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19302427 ttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatgtgtaaccgatagaaagttaagataccaaaataaatcaatatttaattaaggga 19302513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 189
Target Start/End: Original strand, 44678517 - 44678596
Alignment:
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  44678517 aggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaag-gaacaaaaatacaatttag 44678596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 16645698 - 16645648
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaat 88  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16645698 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaat 16645648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9495179 - 9495106
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaa 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||  |||||||    
T  9495179 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttataagagagagaagttaagagaccaaa 9495106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15740761 - 15740611
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaag-ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||   ||||| || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15740761 taaaccctaacgttttt-aattaaatttaacggaaaggactaaaagtggtaacggaaagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttagggga 15740663  T
Q  142 ccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||  ||||| |  |||||||||||  || |||||| |||||| ||||||    
T  15740662 ccaaaccgatactaattaaatagttaatggaccaaaaaggcaattaagccaa 15740611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 59
Target Start/End: Original strand, 30650397 - 30650444
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgttttt 59  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30650397 atgaagatgaaaaagaggagaatatgatgaagaaaacctaacgttttt 30650444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Original strand, 6843697 - 6843749
Alignment:
Q  16 agatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaa 68  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6843697 agatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaa 6843749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Original strand, 15741501 - 15741587
Alignment:
Q  42 ataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaa 127  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  15741501 ataaaccctaacgttttttaattaaatttaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaaagttaagggatcaaaataattcaaa 15741587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 189
Target Start/End: Original strand, 26217404 - 26217485
Alignment:
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa--gtgatacc-acctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |  |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  26217404 gaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaacgatactacctacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 26217485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Original strand, 29770268 - 29770354
Alignment:
Q  42 ataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaa 127  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  29770268 ataaaccctaacattttttaattaaatttaacgggaatgaccaaaatgtataacggagagaaagttaagggaccaaaataattcaaa 29770354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Original strand, 29770360 - 29770449
Alignment:
Q  102 aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||  |||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  29770360 aagttaagggatcaagataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttagcc 29770449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13462169 - 13462118
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  13462169 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaaa 13462118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15271187 - 15271136
Alignment:
Q  127 attttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  15271187 attttagttaagggaccaaagtgataccaattaaatacttaagtgaccaaaa 15271136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 193
Target Start/End: Original strand, 15741593 - 15741684
Alignment:
Q  102 aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||  |||||||  |||||||||||| || |||||| | |||| ||||||    
T  15741593 aagttaaggaaccaaaataaatcaaaatttagttagaggaccaaaccgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaattaagccaa 15741684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 135
Target Start/End: Original strand, 18623668 - 18623719
Alignment:
Q  84 aaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatt 135  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  18623668 aaaatgtgtaacagagagaaattaaagaagcaaaataaatcgaattttaatt 18623719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43633186 - 43633135
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  43633186 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 43633135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 183
Target Start/End: Original strand, 43633584 - 43633639
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgca 183  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  43633584 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggatcaaaagtgca 43633639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 167
Target Start/End: Original strand, 34470912 - 34470970
Alignment:
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagtta 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  34470912 aggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 34470970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2357247 - 2357067
Alignment:
Q  11 gatgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||| |    
T  2357247 gatgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagg 2357148  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2357147 gatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactatttaaatagttaagagatcaaaaatgcaatttagcc 2357067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 43726449 - 43726628
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  43726449 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaactctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaaggg 43726548  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43726549 accaaaataaatcaaattttaattaaggaactaaaacaataccacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 43726628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 31715829 - 31716007
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||| || || |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  31715829 atgaagatgaaaaggacgataaaaagaggaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacg-aaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttatagg 31715927  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31715928 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 31716007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35085918 - 35085739
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  35085918 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggg 35085819  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35085818 accaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 35085739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 11678910 - 11679090
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11678910 atgaagatgaaaaagatgagaagaaaatgaagaaaaactaacctttttgaat-aaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 11679008  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  11679009 atcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaa 11679090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 26920124 - 26920302
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  26920124 atgaaaataaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggg 26920223  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  26920224 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatacaaccgaaatagataagggattaaaaatgcaatttagc 26920302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5238627 - 5238451
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  5238627 aagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaagtaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagagaacttaagggacc 5238528  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5238527 aaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaacagttaatggatcaaaaatgcaatttagcc 5238451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 21522425 - 21522599
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||    
T  21522425 atgaagatgaaaaaaaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgt-taacggagagaagtt-aagg 21522522  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  21522523 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatgctacctaaatagttaagggaccaaaaacacaattta 21522599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 9230884 - 9231063
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  9230884 atgaagatgaataagaggagaagaagatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagtg 9230983  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  9230984 accaaaataaatcaaatcttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatcgttaagggaccaaaaatacaacttagcc 9231063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 47250785 - 47250932
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  47250785 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggacc 47250884  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47250885 aaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 47250932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23437305 - 23437152
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23437305 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatatgtaaccgagagaggttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 23437206  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23437205 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttagcc 23437152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Original strand, 23472787 - 23472944
Alignment:
Q  36 tgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatt 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23472787 tgatgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 23472886  T
Q  136 aagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23472887 aagggaccaaagcgaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 23472944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8769461 - 8769285
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  8769461 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaataaagaaaacctaacgtttttgaattaaatctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 8769362  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8769361 atcaaaataaatcaaattttaattcagggaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 8769285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18731198 - 18731018
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| ||    
T  18731198 atgatgattaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagataagttaaggg 18731099  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18731098 accaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 18731018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43140876 - 43140701
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |    
T  43140876 atgaagatgaaaaagaggagaataagatgaagaaaacgtaacgtttt-gaattaaaactaacagaaatgaccaaaatatgtaacagagaggagttaagag 43140778  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  43140777 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 43140701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 189
Target Start/End: Original strand, 8769527 - 8769666
Alignment:
Q  50 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8769527 taacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcg 8769626  T
Q  150 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  8769627 atactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttag 8769666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 10625317 - 10625470
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10625317 atgaagaaaacgtaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 10625416  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10625417 aggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 38842229 - 38842405
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |    
T  38842229 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaatatgtgtaacgggtagaagttaga-g 38842327  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  38842328 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatgctacctaaatagttaaggaatcaaaaatacaatttag 38842405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 34568790 - 34568942
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaa-cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  34568790 atgaaaatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagg 34568889  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaata 163  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  34568890 gacaaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagtgatactacataaata 34568942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 150
Target Start/End: Original strand, 23437359 - 23437497
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||   |    
T  23437359 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgggaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttacgag 23437458  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtga 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437459 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtga 23437497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31715786 - 31715633
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31715786 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 31715687  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  31715686 ggggtcaaagcgatactacctaaatagttaagagacaaaaaatacaatttagcc 31715633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 32706939 - 32707117
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  32706939 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaac-aacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaatgg 32707037  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  32707038 accaaaagaaatcgagttttaattaagggaccaaagcgatactatctaaataattaagggactaaaaatacaatttagcc 32707117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 35085973 - 35086126
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  35085973 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggtccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaatcaaattttagttaa 35086072  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  35086073 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 35086126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 47250733 - 47250565
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||    
T  47250733 aagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaatggggagaagttaagggacc 47250634  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaa 184  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  47250633 aaaataaattgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaataattaaggga-caaaaatgcaa 47250565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 44448120 - 44448275
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  44448120 atgaagatgaaaaagaggagagaa-gatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaaggg 44448218  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  44448219 accaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatactacttaaataattaa 44448275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47305306 - 47305127
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||      
T  47305306 atgaagatgaagaagagtagaagaagatgaagaaaacctaacgtctttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaaggagata-aagttaaga 47305208  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  47305207 taccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 47305127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24119861 - 24119714
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24119861 aaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagagaagttaagggatcaaaagaaatcaaattttaattaagagacc 24119762  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  | |||||||| |||||||||    
T  24119761 aaagtgatactatctaaatagttaagaaaccaaaaatgtaatttagcc 24119714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 47251136 - 47251282
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47251136 aaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gagaaaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagagacc 47251234  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47251235 aaagcaatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 47251282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 9034548 - 9034701
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9034548 atgaagaaaatctaacgtttttgatttaaaactaacgaaaaggaccaaaatctgtaacagagggaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 9034647  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  9034648 gagaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagcc 9034701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11678856 - 11678703
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11678856 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 11678757  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  11678756 gggaccaaagtgatattatctaaatatttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 11678703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 473368 - 473192
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||  || ||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||   ||||||||||||| | ||||||| |     
T  473368 atgaagatgaaacggatgagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgacttaaaactaaaggaaaggac---aatgtgtaacagagaaaagttaagga 473272  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  473271 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactgcctaaatagttaagcgatcaaaaatgcaatttagcc 473192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9230829 - 9230720
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9230829 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 9230730  T
Q  138 gggaccaaag 147  Q
    ||||||||||    
T  9230729 gggaccaaag 9230720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23472746 - 23472593
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  23472746 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaaagaaccaaaatgaatcgaattttaattaa 23472647  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
      |||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  23472646 aagaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 23472593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 473419 - 473563
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  473419 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaattgagagaagttaagggacgaaaataaatcaaattttaattaaaagacc 473518  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   || || |||||||||||    
T  473519 aaagcgatactacctaaatagttaaagaattaacaatgcaattta 473563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34568736 - 34568585
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34568736 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaa 34568637  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||    
T  34568636 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggacaaaaaatacaatttag 34568585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39118163 - 39118013
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || |||||||||    
T  39118163 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttagggaatcaaaataaatcgaaatttaattaa 39118064  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  39118063 gggatcaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 39118013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Original strand, 44486165 - 44486319
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44486165 atgaagaaaatctaacgttttggaatttaaactaacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaattaaatattaattaa 44486264  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  44486265 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcca 44486319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22338415 - 22338270
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22338415 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggtaccaaag 22338316  T
Q  148 tgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
      |||| |  |||||||||||| || ||||||   |||||||||||    
T  22338315 caatactaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagccaa 22338270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32706885 - 32706732
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32706885 atgaagaaaacctaacgtttttgaattagaactaacggaaaggactaaaatgtgtaattgagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaa 32706786  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||| | |||   |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32706785 gggtcaaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 32706732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 36507042 - 36507183
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36507042 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaa 36507141  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||  ||||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  36507142 gggaccaaatcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaa 36507183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41758826 - 41758701
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41758826 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 41758727  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||  ||||| |  ||||||||||||    
T  41758726 aaaacgatactatttaaatagttaag 41758701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21522371 - 21522226
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||    
T  21522371 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaa--gaattttaattaa 21522274  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaat 185  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21522273 gggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaat 21522226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 37143970 - 37144146
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||| || | ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | || ||||      
T  37143970 atgaagatgaagaaaatgagaaaaagatgaagaaaacctaacgtatttaaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaaggagaga-aaattaaga 37144068  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37144069 taccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 37144146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 48704016 - 48704183
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| | || |||| |||||||    
T  48704016 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaaaaaactctaacgtgtttgaattaaa-ctaacataaaggaccaaa-tgtgtatcggacagaaagttaaag 48704113  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  48704114 gaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 48704183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44448055 - 44447916
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  44448055 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatggccaaaatgtgtaaaagagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa-ggaccaaaac 44447957  T
Q  149 gataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
     |||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  44447956 aatactatctaaatagttaacggaccaaaaatgcaatttag 44447916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 47251076 - 47250942
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagat-agaagttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||| |    
T  47251076 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatttaacgtttttga-ttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggggagaagttaagg 47250978  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47250977 gaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 47250942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 44485571 - 44485719
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  44485571 aaaacctaatgttttggaatttaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaattgaatattaattaaaggacc 44485670  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||| ||||  || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  44485671 aaagcgataatacttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcca 44485719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 189
Target Start/End: Original strand, 2357300 - 2357439
Alignment:
Q  50 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 149  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||  |    
T  2357300 taacatttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttagttaagggcccaaaacg 2357399  T
Q  150 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||| ||||||||||||||| || || |||| ||||||||    
T  2357400 atactacctaaatagttaagggaccagaaatacaatttag 2357439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 31623644 - 31623811
Alignment:
Q  25 agaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatc 124  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||    
T  31623644 agaggagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttatgggaccaaaataaatc 31623743  T
Q  125 aaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||||||| || |||| |||||  ||||| |||| |||| |||||  |  ||||||||||||||||||    
T  31623744 aaattttacttgagggtccaaaacgatactacctgaataattaaggtactaaaaatgcaatttagcca 31623811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 38842178 - 38842081
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggac 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38842178 aaaacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagtt-aaggatcaaaataaatcgaattttaattaagggac 38842081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43726395 - 43726247
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  43726395 atgaagaaaacttaacatttttgaattaaaactaatgaaaa-gatcaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaa-taaatcaaattttaattaa 43726298  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| || || || |||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  43726297 gggaccaaagcgagactacttaaataattaagggaccaaaaatacaattta 43726247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10625262 - 10625180
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa 94  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10625262 atgaaaatgaaaaagtggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa 10625180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37143900 - 37143763
Alignment:
Q  54 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37143900 gtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagaaaagttaagatacc-aaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatac 37143802  T
Q  154 cacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
     |  |||||||||||| || ||||||   ||||||||||    
T  37143801 taattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcca 37143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 47305360 - 47305490
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  47305360 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatggagtgaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaa 47305459  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||| ||||  ||||| |  |||||||||||    
T  47305460 gggagcaaaacgatactaattaaatagttaa 47305490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 28349614 - 28349754
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  28349614 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaa-agagaaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaa 28349712  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||   |||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  28349713 gggaccaaaacaatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 28349754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 22338482 - 22338662
Alignment:
Q  14 gaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gtta--aag 110  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||  || ||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  |      
T  22338482 gaagatgaagaagaggagaagaagacaaagaaaccctaacatttttgaattaaaattaatgtaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaagttacgaca 22338581  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22338582 taccaaaataaatgaaattttaattaagggacgaaagcgatactaattaattagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 22338662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 48703962 - 48703862
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||  | ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48703962 atgaataaaccctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaagttgtaacagagagaaaattaaaaaccaaaataaatcgaattttaattaa 48703863  T
Q  138 g 138  Q
    |    
T  48703862 g 48703862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38676206 - 38676069
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38676206 taaaccctaacgttttt-aattaaatttaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaaagttaagagaccaaaataaatcaaaatttagttaaggga 38676108  T
Q  142 ccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    |||||  || | ||  |||||||||||| || |||||||    
T  38676107 ccaaaccgaaatcaattaaatagttaagggaccaaaaat 38676069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Original strand, 40263550 - 40263697
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggac 142  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40263550 taaaccctaacgttttt-aattaaatttaatggaaatgaccaaaacgtgtaacaaaagaaagttaagggaccaaaataaatcaaaatttagttaagggac 40263648  T
Q  143 caaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||  || ||||  |||||| ||||| || |||||| | |||||||||    
T  40263649 caaaccgaaaccaattaaatatttaagggaccaaaaaggtaatttagcc 40263697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15326998 - 15326872
Alignment:
Q  65 aaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaata 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||    
T  15326998 aaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaata 15326900  T
Q  164 gttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||   |  |||||||||||||||||    
T  15326899 gttaaaaaactaaaaatgcaatttagcc 15326872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10625181 - 10625106
Alignment:
Q  116 aaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  10625181 aaataaatcgaattttagttaagggaccaacacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 10625106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28263575 - 28263496
Alignment:
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  28263575 accaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggatcaaaaaagtaatttagcc 28263496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 28349560 - 28349480
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa 94  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  28349560 atgaagatgaaaaagagaataaaatgaacaa--aaacctaacgtttttgaattaaaattaatggaaagaaccaaaatgtgtaa 28349480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 36506991 - 36506865
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaag 110  Q
    ||||||||||| |||| || || | |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  ||| | |||||||      
T  36506991 atgaagatgaagaagatgataagaagatgaagaaaacccaacatttttaaattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaa-ggatggaaagttaaga 36506893  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaag 138  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  36506892 taccaaaataaatcaaattttaattaag 36506865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Original strand, 38677039 - 38677128
Alignment:
Q  102 aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||  |||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  38677039 aagttaagggatcaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttagcc 38677128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43050510 - 43050429
Alignment:
Q  66 aaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg-accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  43050510 aaactaacggaaagcaccaaaatatgtaacaaagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttaattaggggaccaaa 43050429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30474339 - 30474284
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgca 183  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  30474339 ttttagttaagggaccaaagcgataccagataaatagttaagggatcaaaaatgca 30474284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 4156538 - 4156636
Alignment:
Q  91 gtaacagatagaagttaaag-gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||| |  |||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  4156538 gtaacagagagaaatttaagagaccaaaataaatcaaattttagttagggtaccaaacagatactaattaaatagttaagggaccaaaaaggcaattta 4156636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28349472 - 28349418
Alignment:
Q  139 ggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28349472 ggaccaaagtgatactaattaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttagccaa 28349418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 167
Target Start/End: Original strand, 8417242 - 8417362
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaag-ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||| |  ||||  |||| |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||     
T  8417242 cctaacggtttttaattaaatttaacgaaaaggaccaaaatatgtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaattaatttttagttaaaggaccaat 8417341  T
Q  147 gtgataccacctaaatagtta 167  Q
     ||||||||  ||||||||||    
T  8417342 ctgataccaattaaatagtta 8417362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17278462 - 17278411
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  17278462 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaaa 17278411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 168
Target Start/End: Original strand, 28264652 - 28264715
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| |  |||||||||||    
T  28264652 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaaaagaccaaattgatactaattaaatagttaa 28264715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30765731 - 30765680
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  30765731 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaaa 30765680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43705008 - 43704957
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  43705008 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 43704957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5905191 - 5905141
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  5905191 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggatcaaaa 5905141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 121
Target Start/End: Original strand, 15327096 - 15327178
Alignment:
Q  39 tgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataa 121  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||   ||||||||||    
T  15327096 tgaagaaaacctaacgttttagaattaaaatacacggaaatgaccaaaatatataacggagagatgttaagataccaaaataa 15327178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16955994 - 16955944
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  16955994 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaa 16955944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 23140247 - 23140297
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  23140247 ttttagttaagggaccaaagtgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 23140297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 23439515 - 23439553
Alignment:
Q  155 acctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23439515 acctaagtagttaagggatcaaaaatgcaatttagccaa 23439553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28286199 - 28286141
Alignment:
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagtta 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  28286199 aggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 28286141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 43705386 - 43705436
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  43705386 ttttagttaagggaccaaagtgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 43705436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 45457099 - 45457149
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||    
T  45457099 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 45457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 87
Target Start/End: Original strand, 17279358 - 17279395
Alignment:
Q  50 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaa 87  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17279358 taacgttttttgattaaaactaacggaaatgaccaaaa 17279395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 40262796 - 40262715
Alignment:
Q  42 ataaaacctaacgtttttg-aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataa 121  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  40262796 ataaaccctaacgtttttttaattaaatttaacggaaatgaccaagatgtataacagagagaaagttaagggatcaaaataa 40262715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36282872 - 36282784
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||    
T  36282872 ttaagggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggactaaaaatgtaatttagccaa 36282784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42287372 - 42287324
Alignment:
Q  130 ttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||    
T  42287372 ttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 42287324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48703857 - 48703825
Alignment:
Q  114 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48703857 caaaataaatcaaattataattaagggaccaaa 48703825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 89)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 10656301 - 10656481
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10656301 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 10656400  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10656401 actaaaataaatcaaattttacttaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcca 10656481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 334475 - 334294
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  334475 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgggaaggaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaaggg 334376  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  334375 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagccaa 334294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35263673 - 35263494
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  35263673 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgttttttaattaaaattaacggaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaaagg 35263574  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35263573 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 35263494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40589833 - 40589655
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  40589833 aagatgaaaaagaggagaagatgatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggacc 40589734  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40589733 aaaataaatcgaattttaatttggagaccaaagtgaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 40589655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 7210678 - 7210830
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7210678 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacataaagaagttaaaagaccaaaataaatcgaattttaattaa 7210777  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7210778 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagtgaccaagaatgcaatttagc 7210830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 31656565 - 31656745
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  31656565 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagagaagttatggg 31656664  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  31656665 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgcctaataagttaagggaccaaaaatgtaatttagcca 31656745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12593635 - 12593456
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  12593635 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgacttaaaactaaaggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagga 12593536  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12593535 accaatataaatcgaattttagttaagggactgaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 12593456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 41859884 - 41860062
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41859884 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacctttttgaattaatactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaggg 41859983  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac--cacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  41859984 atcaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatactatacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 41860062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40589230 - 40589052
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  40589230 aagatgaaaaagaggagaagataatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggacc 40589131  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40589130 aaaataaatcgaattttaatttggagaccaaagtgaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 40589052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3878660 - 3878481
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  3878660 atgaagataaaaaagaagagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgcaatagagagaagttaaagg 3878561  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  3878560 accaaaataaatcgaattttaattaaacgaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcc 3878481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9693097 - 9692919
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||    
T  9693097 atgaagatgaaaaagaggaaaagaagaggaagaaaacctaacgttattgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtcaaggg 9692998  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || || ||||||| ||||||||||    
T  9692997 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagtt-agggaccaaaaatacaatttagcc 9692919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 38416341 - 38416520
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| |     
T  38416341 atgaagatgaaaaagaggagaacaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagga 38416440  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  38416441 accaaaataaatcgaattttaattaagtgagcaaagcgatactacctaaataattaagagaccaaaaatacaatttagcc 38416520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7399230 - 7399077
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7399230 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 7399131  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7399130 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 7399077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10656247 - 10656094
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10656247 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggagcaaaataaatcaaattttagttaa 10656148  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  10656147 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 10656094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Original strand, 12694919 - 12695068
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12694919 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaataaccaaaatgtgtaatggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 12695018  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  12695019 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaattt 12695068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 15476466 - 15476641
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||  |    
T  15476466 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaaggaaaactaacatttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagag 15476565  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
T  15476566 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaaggga-ctaaaatgcaattta 15476641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19205122 - 19204935
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  19205122 atgaagatcaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccagagagaagtt-aagg 19205024  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc-aagataaa 199  Q
         ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19205023 tatttaagccatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaagataaa 19204935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 39706258 - 39706433
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  39706258 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatccaacgtttttgaattgaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggg 39706357  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39706358 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaagaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 39706433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7210635 - 7210461
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  7210635 atgaagatgaaaaagagaagaagaagatgatgaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 7210536  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatt 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  7210535 accaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaaacgatagtacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatt 7210461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Original strand, 7399285 - 7399442
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  7399285 atgaagatgaaaaagaagagaagaagatgaagaaatcctaacttgtttgaataaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 7399384  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  7399385 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaag 7399442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Original strand, 15267479 - 15267628
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15267479 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggacc 15267578  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  15267579 aaagcgatactacctaaatagttaaaggatcaaaaatgcaatttcgccaa 15267628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31656511 - 31656355
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31656511 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtatcagagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaa 31656412  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatc-aaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  31656411 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaaatgcaatttggccaa 31656355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 42710589 - 42710737
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42710589 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttataacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggacc 42710688  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  42710689 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcca 42710737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 16353361 - 16353540
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| |  || | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||    
T  16353361 atgaagatgaaaaagaagcaaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggg 16353460  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16353461 accaaaataaatcgaattttaattaggggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 16353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 35263733 - 35263880
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35263733 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaatttaatggaccaaaataaatcgaattttagttaagggacc 35263832  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  35263833 aaagtcatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 35263880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 19205176 - 19205326
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  19205176 atgaagaaaacctaaagtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggggtcaaaataaatcgaattttagttaa 19205275  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19205276 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 19205326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 193
Target Start/End: Original strand, 28392012 - 28392158
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaag-ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28392012 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaggttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 28392111  T
Q  147 gtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | ||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  28392112 gcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatagaatttagccaa 28392158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25923297 - 25923121
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||| || |||||||||  |    
T  25923297 atgaagatggaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatggtaaaaatgtataacggagagaagttaagag 25923198  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25923197 accaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaccgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatacaattta 25923121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31909109 - 31908927
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||    
T  31909109 atgaagatgaaaaatagaagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattgaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaatagagagaagttaaggg 31909010  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaa--atagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  31909009 accaaaataaattgaattttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatatagttaaggcaccaaaaatacaatttagcca 31908927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36752055 - 36751904
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36752055 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtttaacagagagaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaa 36751956  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  36751955 gggaccaaatcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttag 36751904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 40774544 - 40774723
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||| | || ||    
T  40774544 atgaagatgaaaaataggagaagaagatggagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtgacgtagagaaataaaggg 40774643  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  40774644 accaaaataaatcgaattttaattaagggactaaagcgatactagctaaataattaaggaatcaaaaatgcaatttagcc 40774723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26289173 - 26289031
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26289173 atgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggacgaaaatgtgtgacatatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 26289074  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  26289073 gggacgaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 26289031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5624558 - 5624382
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| |||||||| ||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||| || ||||||||| ||    
T  5624558 atgaatatgaaaaataggagacgaaggtgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaaggg 5624459  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  5624458 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 5624382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 9693157 - 9693301
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  9693157 aaaaccaaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaatataaatcgatttttaattaagggacc 9693256  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||  ||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  9693257 aaatcgatactacctaaatcgttaagggaccaaaaatgcaattta 9693301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 8418393 - 8418578
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||    
T  8418393 atgaagatgaaaaagaggagaagaagataaagaaaaccta-cgttttt-aattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtataacagagaaaagttaaggg 8418490  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagataaa 199  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  8418491 atcaaaataaatcgaattttaattaacggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagctaaaataaa 8418578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16353307 - 16353150
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353307 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccgaaatgagtaacatagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 16353208  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaa---tagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||||||||  ||||| |||||||   |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  16353207 gggaccaaatcgatactacctaaatagtagttaagggaccaaaaatgtaatttagcca 16353150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 12593689 - 12593819
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12593689 atgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 12593788  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
     |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  12593789 aggaccaaagcaatactacctaaatagttaa 12593819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 31909163 - 31909313
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31909163 atgaagaaaacctaacattttttaattaaaattaacgaaaatgaccaaaatatgtaaaagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 31909262  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||| |||  ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  31909263 gggacgaaaacgatactacctaaacagttaagggaccaaaaatgcaattta 31909313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33699417 - 33699275
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||      
T  33699417 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaaccgaattttagttaaaggaccaaaac 33699318  T
Q  149 gataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  33699317 gatactacctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagcc 33699275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5087960 - 5087811
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  5087960 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttagttaa 5087861  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  5087860 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaattcaattt 5087811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 40589287 - 40589440
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40589287 atgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 40589386  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  40589387 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcc 40589440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 40589890 - 40590043
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40589890 atgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 40589989  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  40589990 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcc 40590043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29024087 - 29023937
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||   ||||| ||||||||||||    
T  29024087 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaa---aaatcgaattttaattaa 29023991  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29023990 ggaaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 29023937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18514430 - 18514288
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||     
T  18514430 ctaacgtttttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaactaagcgaccaaagg 18514331  T
Q  149 gataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18514330 gatacttcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 18514288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28391948 - 28391766
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaag 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  || |||| ||||| |    
T  28391948 atgaatatgaaaaagagaagaaaaagatgaaaaaaccctaacatttttgaattaaaactaactaaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaaagttaagg 28391849  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  28391848 gatcaaaataaatcgaactttaattaagggaccaaagtaatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattgagccaa 28391766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 5152848 - 5152989
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  5152848 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaaattaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 5152947  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  5152948 gggaccaaagcgatactaaataaatagttaagggaccaaaaa 5152989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15267418 - 15267245
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  15267418 atgaagatgaaaaagatgagaaaatgatgaagaaaatctaacattt--gaattaaaactaatagaaatgagcaaaatgtgtaattgagagaagttaaggg 15267321  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  15267320 gccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacgatactacct-aatagttaagggaccaaaaatgcaattta 15267245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17861217 - 17861037
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  | ||||||| ||||    
T  17861217 atgaagatgaaaaagaggataagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaatggaccaaaatgtgtaccgaagagaagtt-aagg 17861119  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||  || |||||||  |||||||||||    
T  17861118 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaacattacctaaatagttaaaggaccaaaaatataatttagccaa 17861037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33763084 - 33762924
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagt--taaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||     
T  33763084 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaataaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttataag 33762985  T
Q  110 ggaccaaaataaatcaaattttaa-ttaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  33762984 ggatcaaaataaatcgaattttaatttaagggaccaaagcgatactacctaaataattaag 33762924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 32272082 - 32272224
Alignment:
Q  47 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32272082 acctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaatgaacaaaatatataacatagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 32272181  T
Q  147 gtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    | ||||  | ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32272182 gcgatattatctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttag 32272224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42710529 - 42710351
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  42710529 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaatgaaaaaaatcaaatatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaatgg 42710430  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||| ||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  42710429 accaaaataaatcgaattttaattaaagaactaaagcgatactaccgaaatagttaaatgactaaaaatgcaatttagc 42710351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 41372391 - 41372532
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  41372391 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 41372490  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||  ||||  |  |||||||||||| || ||||||    
T  41372491 gggaccaaaacgatattaattaaatagttaagggaccaaaaa 41372532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 191
Target Start/End: Original strand, 5088386 - 5088514
Alignment:
Q  63 ttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaat 162  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  5088386 ttaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacaaaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaat 5088485  T
Q  163 agttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  5088486 agttaagagaccaaaaatacaatttagcc 5088514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38416279 - 38416143
Alignment:
Q  55 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatacc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||   | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||     
T  38416279 tttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaaccgagagaagttaagaaaacaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatact 38416180  T
Q  155 acctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38416179 acctaaataattaagagattaaaaatgcaatttagcc 38416143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40774490 - 40774339
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  40774490 atgaagaaaatctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagagagaagttaagggaccaaaataaatc-gattttaattaa 40774392  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    ||||| |||   |||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  40774391 gggactaaaacaatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgaaatttagc 40774339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39706198 - 39706055
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39706198 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatatctaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggacc 39706099  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| |     || |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39706098 aaagcg----tacataaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 39706055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 191
Target Start/End: Original strand, 33763153 - 33763293
Alignment:
Q  50 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 149  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  33763153 taacgtttttgaattaaaaccaaaggaaatgtacaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcg 33763252  T
Q  150 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  33763253 atacta-ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 33763293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5152795 - 5152616
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaca-gatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||      
T  5152795 atgaagatgaagaagaagagaagaagatcaagaaaacctaaagtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaagaagataga-gttaaga 5152697  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  || ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5152696 taccaaaataaatcaaattttaattaaggggccaaagtcatactaattacatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 5152616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8418336 - 8418206
Alignment:
Q  55 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatacc 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||     
T  8418336 tttttgaattaaaactaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagagaagtt-aagaaccaaaataaatcgaattttaattaagtgaccaaaacgatact 8418238  T
Q  155 acctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatt 186  Q
    ||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  8418237 acctaaataattaatggaccaaaaatgcaatt 8418206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 36752109 - 36752287
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || | ||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||    
T  36752109 atgaagataaaaaaaaggagaagaagatgaagaaaacctaacttttttaaattaaaaccaatgaaaaggaccaaaatgtgcaacaaagagaagttaatgg 36752208  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||   ||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36752209 accaaaataaatcgaattttaattaa-ggattgaagcgatactacataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 36752287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 43570004 - 43570155
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43570004 atgaagaaaacttaacgtttttgaatcaaaactaatcgaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaatgggacaaaataaatcaaattttaattaa 43570103  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||| ||||| ||| | | ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  43570104 gggaacaaagcgatgctatctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttag 43570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 25923352 - 25923504
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  25923352 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaattgaattttaattaa 25923451  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||   |||| || |||||||||  |  | ||||||||||||||||||    
T  25923452 gggaccaaaacaatactacataaatagttttg-aaccaaaaatgcaatttagcc 25923504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Original strand, 14143755 - 14143891
Alignment:
Q  55 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatacc 154  Q
    ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  14143755 ttttttaattaaaattaacaaaagtgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaatgaagagaccaaagtaatact 14143854  T
Q  155 acctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  14143855 acttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 14143891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14143681 - 14143512
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||     
T  14143681 aagatgaaaaagagaagaa---gatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggagagaagtt-aaggact 14143586  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||||||  ||||| | ||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  14143585 aaaataaatc-aattttaattaa-aaaccaaaacgatactatctaaatagttaaggga-caaaaatataatttagcc 14143512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 17861271 - 17861416
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||      |||||||||    
T  17861271 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaccaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttacaggaccaaaataaa------tttaattaa 17861364  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||| ||||||||||    
T  17861365 -ggaccaaagtgatactacctaaataatt-agggaccaaaaatacaatttagcc 17861416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 15670390 - 15670534
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  15670390 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaacatgtgtaatgcagagaagttaagggaccaaaataaataaaattttaattaaataacc 15670489  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  15670490 aaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 15670534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15476377 - 15476277
Alignment:
Q  80 gaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  15476377 gaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaataaaattttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 15476278  T
Q  180 t 180  Q
    |    
T  15476277 t 15476277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21750901 - 21750810
Alignment:
Q  100 agaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  21750901 agaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaaggcaatttagcc 21750810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 26289230 - 26289406
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaa-ctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggac 113  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||| ||  || ||||||||| |||     
T  26289230 aagatgaaaaagacgagaagaaaatgtagaaaacctaacgtttttgaattaaaaaccaacgaaaaggacaaaaatgtgcaatggagagaagttaa-ggat 26289328  T
Q  114 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  26289329 caaaatgaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactatttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatctagcc 26289406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14052032 - 14051892
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || | ||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||     
T  14052032 cctaacgtttttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttcaggaaccaaaataaatcgaattttaattaaaaaaccaaaa 14051933  T
Q  148 tgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
      |||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  14051932 caatattacctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 14051892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 178
Target Start/End: Original strand, 17736521 - 17736620
Alignment:
Q  79 tgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  17736521 tgaccaacatgtgtaacagagagaatttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 17736620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Original strand, 2597322 - 2597458
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  2597322 taaaccctaacgttttt-aattaaatttaacggaaatgaccaaaacgtgtaacaaagagaaagttaaaggaccaaaataaatcaaaatttagttaagaga 2597420  T
Q  142 ccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||   | ||||  |||||||||||| || ||||||    
T  2597421 ccaaaccaaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaa 2597458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 191
Target Start/End: Original strand, 3879307 - 3879398
Alignment:
Q  100 agaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3879307 agaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaaataatgaaccaaagtcatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 3879398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5460264 - 5460188
Alignment:
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  5460264 aaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgtctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 5460188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 43569949 - 43569889
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43569949 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttaaattaaaactaa 43569889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 5088014 - 5088073
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaacta 71  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5088014 atgaaaatgaaaaagaggaaaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacta 5088073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 98
Target Start/End: Original strand, 5624617 - 5624671
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaga 98  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5624617 aaaatctaacttttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacaga 5624671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Original strand, 19185506 - 19185634
Alignment:
Q  64 taaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg-accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaat 162  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||   |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||| |  |||||    
T  19185506 taaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccaatactaattaaat 19185605  T
Q  163 agttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||    
T  19185606 agttaagggaccaaaaaggtaatttagcc 19185634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38384931 - 38384880
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  38384931 ttttaattaagggaccaaagcgataccaaataaatagttaagggatcaaaaa 38384880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 41859830 - 41859779
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatg 89  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41859830 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatg 41859779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 94
Target Start/End: Original strand, 3878720 - 3878770
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa 94  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3878720 aaaacctaaggttttttaattaaaattaacagaaatgaccaaaatgtgtaa 3878770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 188
Target Start/End: Original strand, 5460272 - 5460329
Alignment:
Q  131 taattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  5460272 taattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 5460329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21750934 - 21750901
Alignment:
Q  45 aaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21750934 aaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaa 21750901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42766880 - 42766808
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagataaat 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||  || || |||||| ||||||    
T  42766880 ttttagttaagggaccaaagcgataccaaataaatagttaagggatcaaaaacacatttaagccaatataaat 42766808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19184683 - 19184621
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagtta 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  19184683 ttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaatagtta 19184621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2596457 - 2596388
Alignment:
Q  122 atcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  2596457 atcaaaatttaattaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttagcc 2596388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 2596558 - 2596473
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaa 127  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||| || ||||||||||| ||||  | || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  2596558 taaaccctaacgttttttaattaaatttaacgggaaggaccaaaatgtataacgaagagaaagttaagggaccaaaataattcaaa 2596473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 6794774 - 6794839
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||| ||| || ||||||    
T  6794774 ttttagttaagggaccaaagtgataacaaataaatagttaagggaccaaaaacgcatttaagccaa 6794839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 12694865 - 12694821
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtt 56  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  12694865 atgaggatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtt 12694821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 145)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34521445 - 34521266
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  34521445 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaaaaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 34521346  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  34521345 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 34521266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41208580 - 41208404
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  41208580 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgcaacggagagaagttaaggg 41208481  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  41208480 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 41208404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 54107822 - 54107668
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54107822 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 54107723  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  54107722 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 54107668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31514042 - 31513862
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31514042 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaactggaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaaagg 31513943  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  31513942 accaaaataaatcaaattttaattaaagaatcaaagcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcca 31513862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12123269 - 12123090
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||| |     
T  12123269 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagga 12123170  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12123169 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 12123090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 15862382 - 15862561
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  15862382 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggg 15862481  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  15862482 accaaaataaattgaattttaataaagggacaaaagagatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 15862561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 28688197 - 28688376
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  28688197 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaacgtgtaacaaagagaagttaaggg 28688296  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  28688297 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaatttagcc 28688376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8846255 - 8846074
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  8846255 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggg 8846156  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||   |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8846155 accaaaattaatcgaattttagttaagagaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 8846074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 7937770 - 7937950
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||  |    
T  7937770 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagag 7937869  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||    
T  7937870 accaaaataattcgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgaaatttagcca 7937950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 44069330 - 44069509
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44069330 atgaaaatgaaaaagaggaaaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaagg 44069429  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  44069430 accaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 44069509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 12123312 - 12123462
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12123312 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 12123411  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12123412 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaattta 12123462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40410865 - 40410715
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40410865 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 40410766  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  40410765 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 40410715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45171245 - 45171068
Alignment:
Q  14 gaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggac 113  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  45171245 gaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacttagagaagttaagggac 45171146  T
Q  114 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  45171145 caaaataaatcgaattttaattaaggggccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccagaaatacaatttagcc 45171068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 14353255 - 14353430
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  14353255 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacggagagaagttaaagg 14353353  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  14353354 accaagataaatcgaattttatttaagggaccaatgcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 14353430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 7742972 - 7743139
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||   |    
T  7742972 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttatgag 7743071  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  7743072 accaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 7743139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 4846829 - 4846982
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4846829 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacagagagaagttatgagaccaaaataaatcgaattttaattaa 4846928  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4846929 gggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 4846982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 26332525 - 26332708
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-----aagtt 106  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     |||||    
T  26332525 atgaagatgaaaaagatgagaagaagatgatgaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagtt 26332624  T
Q  107 aaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26332625 aagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaag-gaccaaaaatgcaatttagcc 26332708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40926190 - 40926014
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  40926190 atgaagatgaaaaagaggagaagaaagtgaagaaaacctaacgtttttcaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatgg 40926091  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  40926090 atcaaaataaatcaaattttaattaagagatcaaagcgatactacataaatagttaaaagaccaaaaatgcaattta 40926014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 54081490 - 54081670
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaa-tgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  54081490 atgaagatgaaaaagaggagaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaaataacgaaaatgaccaaaaatgtgtaacagagagaagttaagg 54081589  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  54081590 aaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 54081670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 7274850 - 7275024
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||   |||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  7274850 atgaagataaaaaagaggagaaaaatctgaagaaaacacaacgtttttgaattaaaactaaaagaaatgaccaaaatgtgtaaca-agagaagttaaggg 7274948  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  7274949 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaacggaccaaaaatgcaattt 7275024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27940425 - 27940266
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27940425 atgaagaaaacctaatgtttttgaattgaacctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtttagggaccaaaataaatcaaatttaaattaa 27940326  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagata 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  27940325 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagccatgata 27940266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26332472 - 26332319
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  26332472 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaaatttaattaa 26332373  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  26332372 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcc 26332319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45871850 - 45871697
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45871850 atgaagaaaacctaacgatttttaattaaaactaacggaaatgacccaaatgtataacagagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 45871751  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  45871750 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 45871697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 45171300 - 45171452
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45171300 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 45171399  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  45171400 tggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagc 45171452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 8846309 - 8846464
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||    
T  8846309 atgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaatggaattttagttaa 8846408  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8846409 gtgaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 8846464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40969434 - 40969253
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||      
T  40969434 atgaagatgaagaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactgacggaaatgaccaaaatgtgtaagaagaga-aagttaaga 40969336  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  40969335 taccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagccaa 40969253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41997965 - 41997819
Alignment:
Q  45 aaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacca 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41997965 aaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagggacca 41997866  T
Q  145 aagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  41997865 aaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 41997819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 54108353 - 54108506
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54108353 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 54108452  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  54108453 gggaccaaagcgatactagctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 54108506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 28691321 - 28691496
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  28691321 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaaacttaacatttt-gaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaatg 28691419  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||    
T  28691420 atcaaaataaatcaaattttaatttagggacaaaagcgatactacctaaataattaagggacaaaaaatacaattta 28691496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 43899284 - 43899460
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| || ||||||||| |||||    
T  43899284 aagatgaaaaaaaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttgtttaattaaaactaacggtaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggacc 43899383  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  43899384 aaaataaatcgaattttaattaggggaccaaagcgatattacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcc 43899460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10756871 - 10756720
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10756871 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagcaacaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 10756772  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  10756771 gggaccaaagcgatactacctaaatagctaagggaccaaaaatacaatttag 10756720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 189
Target Start/End: Original strand, 40926252 - 40926394
Alignment:
Q  46 aacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 145  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40926252 aacctaacgtttttcaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagtgaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaatggaccaa 40926350  T
Q  146 agtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  40926351 agtgatactacctaaatagttaggggactaaaaatgcaatttag 40926394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44069276 - 44069121
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44069276 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaa 44069177  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44069176 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 44069121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52606275 - 52606129
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52606275 aaaacctaacgttttttatttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 52606176  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||  ||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  52606175 aaaacgatactacataaatagttaaggga-ccaaaatgcaatttagcc 52606129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50819393 - 50819220
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  50819393 aagatgaaaaagatgagaaaatgaagaa---aacttaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggacc 50819297  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| | || |||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  50819296 aaaataaatcgaattttaattaagcgacgaaagcgatgctacgtaaatagttaagggaccaaaaatgcaattaagcc 50819220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 50856471 - 50856644
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  50856471 aagatgaaaaagatgagaaaatgaagaa---aacttaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggacc 50856567  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| | || |||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  50856568 aaaataaatcgaattttaattaagcgacgaaagcgatgctacgtaaatagttaagggaccaaaaatgcaattaagcc 50856644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 53841249 - 53841407
Alignment:
Q  28 ggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaa 127  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  53841249 ggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatcgaa 53841348  T
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatt 186  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53841349 ttttaattacgagaccaaagcaatactagctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 53841407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7950428 - 7950275
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7950428 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 7950329  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    | |||||||   |||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  7950328 gagaccaaaacaatactacataaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 7950275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29248494 - 29248320
Alignment:
Q  14 gaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggac 113  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  29248494 gaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaa--taacgtttttgaattaaaactaatgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaac 29248397  T
Q  114 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||    
T  29248396 caaaataaattaaattttaattaagggactaaaacgataccacctaaatagttaaataactaaaaatgcactttagc 29248320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 191
Target Start/End: Original strand, 41208649 - 41208786
Alignment:
Q  54 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41208649 gtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 41208748  T
Q  154 cacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  41208749 tacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 41208786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21169845 - 21169669
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| |||||||| ||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||| || ||||||||| ||    
T  21169845 atgaatatgaaaaataggagacgaaggtgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaaggg 21169746  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  21169745 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 21169669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 35753638 - 35753814
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  || ||||||||| ||    
T  35753638 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatggagagaagttaaggg 35753737  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  35753738 atcaaaataaatcgaatttaaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 35753814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14353192 - 14353049
Alignment:
Q  45 aaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacca 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14353192 aaacctaacatttttgaattaaaactgacggaaatggccaaaatgtgtcacagaggaaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggacca 14353093  T
Q  145 aagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14353092 aagcgatactacctaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 14353049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28688143 - 28688017
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28688143 atgaagaatacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaccggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 28688044  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatag 164  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28688043 gggatcaaagtgatactacctaaatag 28688017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34630135 - 34629993
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34630135 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaa 34630036  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  34630035 gggaccaaaacgatactacttaaatagttaagggaccaaaaat 34629993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 188
Target Start/End: Original strand, 35580210 - 35580332
Alignment:
Q  66 aaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagt 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  35580210 aaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagt 35580309  T
Q  166 taagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  35580310 taagggaccaaaaatgcaattta 35580332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2829587 - 2829410
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaa-ag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |     
T  2829587 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactagcagaaaagaccaaaatgtttaacagagagaagttaagaa 2829488  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  2829487 aaccaaaataaatcaaatgttaattaagagaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 2829410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15862335 - 15862182
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15862335 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaatagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 15862236  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||    
T  15862235 aggaccaaagcgatactacctaaataattaagggacctaaaatggaatttagcc 15862182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 50819450 - 50819603
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50819450 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 50819549  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50819550 gggaccaaagcgatactaccttaacagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 50819603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50856414 - 50856261
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50856414 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 50856315  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50856314 gggaccaaagcgatactaccttaacagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 50856261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 34521496 - 34521640
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34521496 aaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaaattaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 34521595  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34521596 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 34521640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17102563 - 17102384
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  17102563 atgaagatgaaaaagaggtgaagaatatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgcccaaaatatgtaacagggagaagttaaggg 17102464  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||   |||  ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  17102463 accaaaataaatcgaattttaattaagggaagaaaacaatattacctaaataattaagaaaccaaaaatgcaatttagcc 17102384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 190
Target Start/End: Original strand, 19124411 - 19124556
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19124411 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacagagaaaagtcaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 19124510  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 190  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  19124511 aaaacgatactacctaaatagttaag-gaccaaaaatataatttagc 19124556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27254137 - 27254007
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27254137 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaataatcaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaa 27254038  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  27254037 gggaccaaagcgatactgcctaaatagttaa 27254007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 2829641 - 2829793
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2829641 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 2829740  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
      |||||||   |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2829741 aagaccaaatcaataatacataaatagttaag-gatcaaaaatgcaatttagcc 2829793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9028344 - 9028191
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||  || ||||||  || |||||||||||||||||||| | |    
T  9028344 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaataccaaaatgtgtagcaggaaggagttaagagaacaaaataaatcaaattttaactta 9028245  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  9028244 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 9028191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 9028401 - 9028578
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  9028401 aagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaaaactaaaatgtataacgaagagaagttaaaggacc 9028500  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcca 192  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||   |||| | || |||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  9028501 aaaataaattgaattttaattaaaggaccaaaacaatactagcttaatagttaatgaaccaaaaatgcaatttagcca 9028578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 31514096 - 31514248
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31514096 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaagctaacggaaa-gaccaaactgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaa 31514194  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31514195 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 31514248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Original strand, 29248542 - 29248691
Alignment:
Q  39 tgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaag 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  29248542 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaattgaccaaattgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaatagatcaaattttaattaaa 29248641  T
Q  139 ggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||| ||||| |||| | ||||||||||||| || || |||| |||||||    
T  29248642 ggactaaagtaatactatctaaatagttaagggagcataaatacaattta 29248691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 52268337 - 52268489
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  52268337 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaa-gaccaaaataaattgaattttaattaa 52268435  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||  ||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  52268436 aggaccaaaacgatactaactaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcc 52268489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 46766776 - 46766625
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  46766776 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatta 46766677  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||  ||||  | | ||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  46766676 agggaccaaaacgatattagcaaaatagtaaaaggaccaaaaatgcaattta 46766625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 54247441 - 54247272
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||  || ||||||||| ||    
T  54247441 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaca---------aaaatgtgtaatggaaagaagttaaggg 54247351  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  54247350 accaaaataaatcaaattttaatcaatggaccaaagcgatactatttaaatagttaagggat-aaaaatgcaatttagcc 54247272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19124343 - 19124189
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||||  || ||||||| ||| |||||||||||    
T  19124343 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagatcaaaatagatcgaattttaatta 19124244  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||||||||  |||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19124243 ggggaccaaagcaatattacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 19124189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 40639350 - 40639480
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40639350 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacacacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttaagataccaatataaatcaaattttaattaa 40639449  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  40639450 gggaccaaagcgatactaattaaatagttaa 40639480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 53678640 - 53678820
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaag 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||  || |||| |||||      
T  53678640 atgaagatgaagaagagaagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaactaaaaccaacggaaagaaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaaga 53678738  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  53678739 taccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggat-aaaaacgcaatttagccaa 53678820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 54081436 - 54081287
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  54081436 atgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaa 54081337  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     ||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  54081336 -ggaccaaagcgatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 54081287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 10756914 - 10757071
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaac-ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||      
T  10756914 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagatcaaaatgtgtaacggagagaaattaaga 10757013  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  10757014 gaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatactgcctaaatagttaa 10757071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Original strand, 17102610 - 17102735
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17102610 atgaaaaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctataagagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttatttaa 17102709  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaata 163  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||    
T  17102710 tggaccaaagcgatactacctaaata 17102735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 41998026 - 41998200
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacg-----gaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  41998026 atgaagatgaaaaagaggagaagaagacgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgtaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagtt 41998125  T
Q  107 aaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |  |||          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  41998126 agggga----------tcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 41998200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 47891720 - 47891896
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||      
T  47891720 atgaagatgaagaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaggagaga-aagttaaga 47891818  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  47891819 tgccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcaatactaattaaatagttaaaggaacaaaaatggaattta 47891896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43899233 - 43899109
Alignment:
Q  69 ctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||    
T  43899233 ctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatgttacctaaatagttaa 43899134  T
Q  169 gtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
      || ||||||||||||||||||||    
T  43899133 aggaccaaaaatgcaatttagccaa 43899109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 47891666 - 47891551
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  47891666 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 47891567  T
Q  138 gggaccaaagtgatac 153  Q
    |||||||||| |||||    
T  47891566 gggaccaaagcgatac 47891551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Original strand, 51170618 - 51170765
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttg-aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  51170618 taaaacttaacgtttttttaattaaaactaattgaaaagactaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaatga 51170717  T
Q  142 ccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
     ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51170718 tcaaaacgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttag 51170765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53678586 - 53678431
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  53678586 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaa 53678487  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
     ||||||||| ||||| |  |||||| ||||| || |||||| | |||||| ||||    
T  53678486 aggaccaaagcgatactatttaaataattaagggaccaaaaacgtaatttaaccaa 53678431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17273930 - 17273780
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17273930 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgtaatgaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 17273831  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    || | ||||  |||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  17273830 ggaatcaaaacgatacggcctaaatagttaagggaccaaaaatgcatttta 17273780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33812845 - 33812727
Alignment:
Q  70 taacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  33812845 taacggaaatgacgaaaatgtgtaacggatagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcaatactacctaaatagttaag 33812746  T
Q  170 tgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     || |||||||| ||||||    
T  33812745 ggaccaaaaatgaaattta 33812727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37133430 - 37133289
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  37133430 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacttacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 37133331  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||| |||| || ||||||    
T  37133330 gggaccaaagcgatactaattaaatagctaagggaccaaaaa 37133289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 46766819 - 46767000
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttg-aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaa 109  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | |||||| ||| ||| || |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||     
T  46766819 atgaagatgaagaagaggggaagaagatgaaaaaacccttacatttttttaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaag 46766918  T
Q  110 ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  46766919 atacaaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactagcaaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 46767000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5348733 - 5348582
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatt 135  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  5348733 gatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaatt 5348635  T
Q  136 aagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     ||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5348634 gagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 5348582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 45871897 - 45872064
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||| | |||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||| |||| |     
T  45871897 atgaagatgaaaaagagg-gaagaagatgaaggaaatccaacgctttttaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaatttaagga 45871995  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  45871996 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 45872064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22355077 - 22354946
Alignment:
Q  56 ttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatacca 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |    
T  22355077 ttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacacagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaaacgatacta 22354978  T
Q  156 cctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  22354977 cctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 22354946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 5348801 - 5348931
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  5348801 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacacacggaaaggaccaaaatatgtaacggagaaaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattac 5348900  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  5348901 gggaccaaagcgatactaattaaatagttaa 5348931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7742927 - 7742781
Alignment:
Q  39 tgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaag 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  7742927 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagaccaaaatgtgcaacagagagaagataagagaacaaaataaatcaaattttaattaag 7742828  T
Q  139 ggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaat 185  Q
      |||||| | ||   ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  7742827 taaccaaaataatgttacctaaatagttaagggactaaaaatgcaat 7742781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40639293 - 40639140
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaaggac 113  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||   ||    
T  40639293 aagatgaagaagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatttgtaaggagaga-aagttaagatac 40639195  T
Q  114 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||    
T  40639194 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaa 40639140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 17273983 - 17274159
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagat-agaagttaaag 110  Q
    ||||||||||| |||||||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||| |||| ||||      
T  17273983 atgaagatgaagaagaggaggagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaaataacggaatgaaccaaaatgtgtaac-gatgagaaattaaga 17274081  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  17274082 gaccaaaataattcgaattttaattaaaagaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaattta 17274159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 35753574 - 35753477
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35753574 ctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtcacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 35753477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 53841180 - 53841063
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  53841180 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgcaacagagataagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaa 53841081  T
Q  138 gggaccaaagtgatacca 155  Q
    | |||||||| |||||||    
T  53841080 gcgaccaaagcgatacca 53841063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 193
Target Start/End: Original strand, 52609639 - 52609750
Alignment:
Q  82 ccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatg 181  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  52609639 ccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatagtacctaaatagttaagggaccaaaaatg 52609738  T
Q  182 caatttagccaa 193  Q
     |||||||||||    
T  52609739 gaatttagccaa 52609750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 22444393 - 22444527
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |     
T  22444393 atgaagatgaaaaataggagaagaagatgaagaaaatctaatgttttcgaattaaaactaaacaaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaagga 22444492  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22444493 accgaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 22444527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 2078679 - 2078855
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||| | |||||||      
T  2078679 atgaagatgaagaagaggagaagaagatgaagaaaatttaacgtgtttgaattaaaactaacagaaaagactaaaatgtgtaagaagaga-aagttaaga 2078777  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||| ||  |||||| |||||||    
T  2078778 taccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatattaattaaatagttaagggactaaaaatacaattta 2078855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Original strand, 49222234 - 49222389
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||    
T  49222234 atgaagatgaaaatgaggagaagaagacgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatatgtgacatatagaaggtaaggg 49222333  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  49222334 acc-aaatagatcaaa-tttaactaagggaccaaaacgatactatctaaatagttaag 49222389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 189
Target Start/End: Original strand, 53309973 - 53310106
Alignment:
Q  50 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 149  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||      ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53309973 taacgtttttgaattaaaattaacggcaa------aaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagtg 53310066  T
Q  150 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||  |||||||||||||||    
T  53310067 atactacctaaataattaggagactaaaaatgcaatttag 53310106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 588384 - 588539
Alignment:
Q  39 tgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg-accaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  | |||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  588384 tgaagaaaccctaacattttttaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaaattaagataccaaaacaaatcaaattttaattaa 588483  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    || ||| ||| ||||  |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  588484 ggaaccgaagcgatattaattaaatagttaagatatcaaaaatgcaatttagccaa 588539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Original strand, 40969487 - 40969629
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  40969487 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactgacggaaaggaccaaaatgtgtaagaagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaatta 40969585  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    || ||| |||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||    
T  40969586 agagactaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaat 40969629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 52268283 - 52268176
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttt-tgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| |    
T  52268283 atgaagatgaaaaagaggagaaaaagatgaagaaaaactaacgttttataaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaagtgagagaagttaagg 52268184  T
Q  111 gaccaaaa 118  Q
    ||||||||    
T  52268183 gaccaaaa 52268176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21918676 - 21918500
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacct-aacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-agatagaagttaaa 109  Q
    ||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  ||||| |||||||     
T  21918676 atgaagatgaagaaggggagaaacaaatgaaaaaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacg-aaaggatcaaaatgtgtaaggagata-aagttaag 21918579  T
Q  110 ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
      || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21918578 atacaaaaaaaaatcaaattttaatttagggaccaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 21918500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 33772997 - 33773175
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||| |||||  ||| || ||||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||||  | |||     
T  33772997 atgaagatgaagaagagtggaagataatgaagaaactctaacgtttttaaattaaaaccaacggaaacgaccaaaatatggaacagagagaaaattaaga 33773096  T
Q  112 -accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  33773097 taccaaaataaatcaaattttaatcaagggatcaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaacacaatttag 33773175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28691267 - 28691114
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||| || ||||||||||||   | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28691267 atgaaaaaaatctaacgtttttaaattaaaattaacataaaggatcaaaatgtgtaatgcagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 28691168  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| |||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  28691167 gggaacaaagcaataccacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcc 28691114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4846774 - 4846667
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  4846774 atgaagatgaaaaagaggagaagaagatgaagaaaattcaacgtttttgaattaaa-ctaatggaaaggaccaaaatgtgtaagagagagaagttaaggg 4846676  T
Q  112 accaaaata 120  Q
    |||||||||    
T  4846675 accaaaata 4846667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 50259256 - 50259109
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||| | |||||| |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  50259256 taaaccctaacgttttttaattaaatttaaagaaaatgatcaaaatgtgtaacaaagagaaagttaagggaccaaaataattcaaaatttagttaaggga 50259157  T
Q  142 ccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    |||||  || ||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  50259156 ccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttag 50259109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7274795 - 7274653
Alignment:
Q  39 tgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaag 138  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||||| |||          ||||||||||||||||    
T  7274795 tgaagaaaatctaatgtttttgaattaaagctaatggaaatgaacaaaatctgtaacggagagaagttaaggga----------tcaaattttaattaag 7274706  T
Q  139 ggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  7274705 agaccaaagcgatactacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 7274653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49222180 - 49222040
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  49222180 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaact---------gaccaaaatgtgtaacagagagaagttgaagaaccgaaataaatcgaattttaattaa 49222090  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
      |||| |||  |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  49222089 aagaccgaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattt 49222040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 51883938 - 51883857
Alignment:
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  51883938 accaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggattaaaaatgcaatttagccaa 51883857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Original strand, 33812852 - 33812931
Alignment:
Q  114 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  33812852 caaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcgatactacctaaatatttaagagaccaaaaatgaaatttagccaa 33812931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33772127 - 33771991
Alignment:
Q  55 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagata-gaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||  |  ||||  ||||    
T  33772127 ttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaataaagttaaaataccagaataaataaaattttaattaagaaagaaaagcaatac 33772028  T
Q  154 cacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33772027 taattaaatagttaag-gatcaaaaatgcaatttagcc 33771991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35753489 - 35753408
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatt 186  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35753489 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagaaaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 35753408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 43527141 - 43527068
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaa 117  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  43527141 aaaatctaatgtttttgaatcaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccagagagaagttaagggaccaaa 43527068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50393465 - 50393317
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 141  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50393465 taaaccctaatgttttt-aattaaatttaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaaagttaagggaccaaaataaatcaaaatttagttaaggga 50393367  T
Q  142 ccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
     ||||  || || |  |||||| ||||| | ||||||| | |||||||||    
T  50393366 tcaaaccgaaactaattaaataattaaggggtcaaaaaggtaatttagcc 50393317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2078636 - 2078521
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||   | ||||||||||||||||||| |||    
T  2078636 atgaagaaaacctaacgtttttgaatcaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaagaagaga-aagttaagatatcaaaataaatcaaattttattta 2078538  T
Q  137 agggaccaaagtgatac 153  Q
    |||||||| || |||||    
T  2078537 agggaccagagcgatac 2078521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Original strand, 13866964 - 13867052
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13866964 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 13867052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 168
Target Start/End: Original strand, 43844359 - 43844462
Alignment:
Q  66 aaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| |  |||||||    
T  43844359 aaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaatttaaaggacaaaaataaatcaatttttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatag 43844458  T
Q  165 ttaa 168  Q
    ||||    
T  43844459 ttaa 43844462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 51311825 - 51311904
Alignment:
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  51311825 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaacagaccaaaaatgtaatttagcc 51311904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7937719 - 7937645
Alignment:
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  7937719 aaaatgaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagcaaccaaaaatgcaatttag 7937645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Original strand, 49529078 - 49529204
Alignment:
Q  64 taaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg-accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaat 162  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||   |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |  |||||    
T  49529078 taaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaat 49529177  T
Q  163 agttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||    
T  49529178 agttaagggaccaaaaatgcaatttag 49529204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Original strand, 52606325 - 52606401
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaat 88  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  52606325 atgaatatgaaaaagaggagataaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaat 52606401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43527080 - 43527021
Alignment:
Q  134 ttaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43527080 ttaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccaa 43527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Original strand, 8327739 - 8327813
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  8327739 ttaaaggaccaaaataaatcaaaatatagttaagggaccaaaccgataccaaataaatagttaagggatcaaaaa 8327813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 38911494 - 38911604
Alignment:
Q  81 accaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaat 180  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||| ||||  ||  ||||||    
T  38911494 accaaaatgtgtaacagagaaaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacaatattacctaaataattaaaggacaaaaaat 38911593  T
Q  181 gcaatttagcc 191  Q
     ||||||||||    
T  38911594 acaatttagcc 38911604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 51885597 - 51885738
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa-cagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| |||||  ||| | ||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  51885597 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactgacggaaagggtcaaaatatgtaagaagaga-aagctaagataccaaaataaatcaaattttaatta 51885695  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    | ||||||||  ||||  |  |||||||||||| || ||||||    
T  51885696 aaggaccaaaacgatattaattaaatagttaagggaccaaaaa 51885738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Original strand, 12992262 - 12992399
Alignment:
Q  55 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaa-gttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 153  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||  ||||| || |||| ||||| |||||||||||| | ||| | || |||||||||||||  || ||    
T  12992262 tttttaaattaaatttaacggaaataaccaaaataagtaacggagagaaagttaagggaccaaaataatttaaaatatagttaagggaccaaaccgaaac 12992361  T
Q  154 cacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  12992362 caattaaatagttaagggatcaaaaaggtaatttagcc 12992399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12991478 - 12991386
Alignment:
Q  55 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  12991478 ttttttaattaaatttaacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaaagttaagagaccaaaatcaatcaaaatttagttaaggaaccaaa 12991386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Original strand, 20963547 - 20963675
Alignment:
Q  64 taaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaag-ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaat 162  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||  ||||| |  |||||    
T  20963547 taaaactaacggaaaggactaaaagaagtaacagagagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggatcaaaccgatactaattaaat 20963646  T
Q  163 agttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  20963647 agttaagggaccaaaaaggcaattaagcc 20963675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44316754 - 44316627
Alignment:
Q  64 taaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaata 163  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||   |||||||| |||| || ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||| |  ||||||    
T  44316754 taaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaataaatcaaattttagttaggggactaaaccgatactaattaaata 44316655  T
Q  164 gttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  44316654 gttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44316627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 51311732 - 51311685
Alignment:
Q  49 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaca 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51311732 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgcgtaaca 51311685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 98
Target Start/End: Original strand, 21169904 - 21169958
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaga 98  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21169904 aaaatctaacttttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacaga 21169958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 146
Target Start/End: Original strand, 37133463 - 37133556
Alignment:
Q  53 cgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-agatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37133463 cgtttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatgtgtaaggagataga-gttaagataccaaaataaatcatattttaagtaagggaccaaa 37133556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 96
Target Start/End: Original strand, 43527218 - 43527276
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaca 96  Q
    ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43527218 atgaagaaaacataatgttcttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaca 43527276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22444339 - 22444299
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaa 78  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22444339 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaa 22444299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Original strand, 42541195 - 42541246
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  42541195 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggatcaaaaa 42541246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 51885543 - 51885488
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaa 67  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51885543 atgaagatgaagaagaagagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaa 51885488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 37174894 - 37174971
Alignment:
Q  70 taacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || || || |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  37174894 taacggaaatgacgaaaatgtgtaacggagagaaaattaatggaccaaaataattcaaaatttagttaagggaacaaa 37174971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 127
Target Start/End: Original strand, 50394230 - 50394315
Alignment:
Q  43 taaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaa 127  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||| || ||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  50394230 taaaccctaacgttttttaattaaatttaacgggaaggaccaaaatgtataacggagagaaagttaagggaccaaaataattcaaa 50394315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22444296 - 22444237
Alignment:
Q  102 aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaa 161  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  22444296 aagttaagggagcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaatcgatactacctaaa 22444237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Original strand, 32305265 - 32305316
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  32305265 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaaa 32305316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5900505 - 5900423
Alignment:
Q  109 aggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||   ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||    
T  5900505 aggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagatgaccaaaaatgtaattaagcc 5900423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13866106 - 13866044
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagtta 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  13866106 ttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaatagtta 13866044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36174571 - 36174521
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  36174571 ttttagttaagggaccaaagtgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 36174521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 48946681 - 48946731
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  48946681 ttttagttaagggaccaaagtgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 48946731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Original strand, 50260032 - 50260118
Alignment:
Q  42 ataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatag-aagttaaaggaccaaaataaatcaaa 127  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||  | ||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  50260032 ataaaccctaacattttttaattaaacttaacggaaaaaatcaaaatgtgtaacggagagaaagttaagggaccaaaataattcaaa 50260118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 188
Target Start/End: Original strand, 50394321 - 50394407
Alignment:
Q  102 aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||   | ||||  |||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  50394321 aagttaagggatcaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccaaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaattta 50394407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13355238 - 13355197
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  13355238 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaag 13355197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29587381 - 29587316
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| || |||||||||| || ||||||    
T  29587381 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatacttaagggagcaaaaatgcatttaagccaa 29587316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 40503727 - 40503792
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||  |||||| ||||||    
T  40503727 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaagagcaattaagccaa 40503792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 187
Target Start/End: Original strand, 50260123 - 50260208
Alignment:
Q  102 aagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattt 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||  || ||||  ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  50260123 aagttaaaggaccaaaataattcaaaatttagttaagaaaccaaaccgaaaccaattaattagttaagggaccaaaaatgtaattt 50260208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 52705545 - 52705472
Alignment:
Q  105 ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||| |  |||||||||||| ||||||||    
T  52705545 ttaagggatcaaaataaatcaaattttagttaagggatcaaaccaatactaattaaatagttaagggatcaaaa 52705472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Original strand, 40559 - 40745
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |     
T  40559 atgaagatgaaaaagaagagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatga 40658  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaagataa 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40659 accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaagataa 40745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40505 - 40352
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  | || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40505 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatctgtaacgtagagtaattaagggaccgaaataaatcaaattttaattaa 40406  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  40405 gggactaaagcgatactatctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcc 40352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 11420 - 11600
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaa-agaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaag 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11420 atgaagatgaaaaaagaggagaataagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagg 11519  T
Q  111 gaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11520 gaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggataaaaaatgcaatttagcc 11600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11366 - 11235
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11366 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 11267  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaag 169  Q
    ||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  11266 gggacgaaagcaatactacctaaatagttaag 11235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Original strand, 11697 - 11875
Alignment:
Q  15 aagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacc 114  Q
    |||||| |||||| |||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||    
T  11697 aagatgcaaaagatgagaaaaatataaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatataacagagagaagttaagggacc 11796  T
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11797 aaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 11875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11635 - 11488
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11635 aaaatctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgcaacggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggacc 11536  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| |||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11535 aaagcgatactttctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 11488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 45043 - 45222
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  45043 atgaaaattaaaaagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggg 45142  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  45143 accacaataaatcaatttttaattaagggagcaaagcgataatacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 45222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44971 - 44895
Alignment:
Q  55 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaatttt 131  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||| |||| |||  ||||||||||| |||||    
T  44971 ttttttaattaaaactaacagaaaagatcaaaatgtgtaacatagagaaattaagggaagaaaataaatcagatttt 44895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 4551 - 4704
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4551 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtgacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaa 4650  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4651 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 4704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4492 - 4341
Alignment:
Q  37 gatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  4492 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagtgaagttaagagaccaaaataaatcaaatttcaatta 4393  T
Q  137 agggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4392 aggaaccaaagtgatagtacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 4341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13720 - 13542
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13720 atgaagatgaaaaagatgagaagaagatggagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 13621  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  || | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13620 accaaaataaatcggattttaactaagggaccaaagcaattctaactaaatagttaag-gaccaaaaatgcaatttagcc 13542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 13774 - 13929
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13774 atgaagaaaacccaacgtttttgaattaaaatcaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 13873  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||||| ||||    
T  13874 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttaaccaa 13929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 65918 - 65742
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  65918 atgaaaatgaaaaagaggagaagaagacgaagaaaacctaacgttttggaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaaggg 65819  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  65818 atcaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcaatattacctaaatagttaagagaccaaaaatgcagttta 65742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 73250 - 73074
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  73250 atgaaaatgaaaaagaggagaagaagacgaagaaaacctaacgttttggaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaaggg 73151  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  73150 atcaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcaatattacctaaatagttaagagaccaaaaatgcagttta 73074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 65972 - 66123
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  65972 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaattttaattaa 66071  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    || || |||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  66072 ggaactaaaacgatactacctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaatttag 66123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 73304 - 73455
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  73304 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaattttaattaa 73403  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttag 189  Q
    || || |||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  73404 ggaactaaaacgatactacctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaatttag 73455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold1436
Description:

Target: scaffold1436; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1622 - 1476
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 143  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1622 aaaagctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggacc 1524  T
Q  144 aaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  1523 aatgcgatactacctaaatagttaagtgacaaaaaatgcaacttagcc 1476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 1682 - 1815
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1682 atgaagatgaaaaagaggagaattagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatgg 1781  T
Q  112 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1782 atcaaaataaatc-gattttaattaagggaccaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 177276 - 177451
Alignment:
Q  16 agatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggacca 115  Q
    |||||||||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||    
T  177276 agatgaaaaaaagaagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaacaaaatgtgtaacatagagaagttaagggatca 177375  T
Q  116 aaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  177376 aaataaatcgaattttaattaagggatcgatctgataatacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 177451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 93369 - 93186
Alignment:
Q  12 atgaagatgaaaaagaggagaaaatgatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgt-aacagatag-aagttaaa 109  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||     
T  93369 atgaagatgaagaagaggagaagaagatgaaaaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaaacagagagaaagttaag 93270  T
Q  110 ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  93269 ataccaaaataaatcaaattttaattaagtgactaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaa 93186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Original strand, 93432 - 93479
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  93432 cctaccgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaac 93479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 178
Target Start/End: Original strand, 93524 - 93587
Alignment:
Q  115 aaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||| || |||||    
T  93524 aaaataaatcaaattttagttaagagaccaaagcgatactaattaaatagttaagagaacaaaa 93587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 90958 - 90803
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  90958 atgaagaaaacctaataattttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaatttcaattaa 90859  T
Q  138 gggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagccaa 193  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  90858 gggacaaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatgtagccaa 90803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Original strand, 91741 - 91845
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  91741 atgaagaaaacctaatgattttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaattttaattaa 91840  T
Q  138 gggac 142  Q
    |||||    
T  91841 gggac 91845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11821 - 11713
Alignment:
Q  38 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11821 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagtcaa 11722  T
Q  138 gggaccaaa 146  Q
    |||||||||    
T  11721 gggaccaaa 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11720 - 11639
Alignment:
Q  110 ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11720 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaatttagcc 11639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9926 - 9782
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaag-ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||   ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  9926 cctaacgtttttttaataaaactaacggaaaggactaaaagtagtaacggatagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggagcaaa 9827  T
Q  147 gtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagcc 191  Q
      |||||||  |||||||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  9826 ccgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaggcaattaagcc 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 179
Target Start/End: Original strand, 10862 - 10994
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaag-ttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 146  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||||  || ||||   |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10862 cctaacgtttttttaataaaattaacggaaagaactaaaagtggtaacagaaagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaa 10961  T
Q  147 gtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaa 179  Q
      ||||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  10962 ccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 10994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26051 - 25970
Alignment:
Q  107 aaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 188  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | || ||||| |||||||||    
T  26051 aaaggaccaaaataaatcgagttttaattaagggatcaaagtgataccaactacatagttaggagaccaaaagtgcaattta 25970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26083 - 26039
Alignment:
Q  44 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaat 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26083 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaaaggaaaggaccaaaat 26039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Original strand, 242156 - 242206
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagtgatcaaaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  242156 ttttagttaagggaccaaagtgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 242206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 90303 - 90254
Alignment:
Q  48 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacag 97  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  90303 cctaaagtttttgaattaaaactagcggaaaagaataaaatgtgtaacag 90254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 59802 - 59762
Alignment:
Q  128 ttttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaa 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  59802 ttttagttaagggaccaaagtgataccaactaaatacttaa 59762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University