View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13516_low_1 (Length: 884)

Name: NF13516_low_1
Description: NF13516
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13516_low_1
NF13516_low_1
[»] chr1 (97 HSPs)
chr1 (13-846)||(8458647-8459466)
chr1 (13-572)||(51666230-51666774)
chr1 (13-475)||(50113368-50113830)
chr1 (14-492)||(4517959-4518444)
chr1 (30-483)||(19495093-19495544)
chr1 (13-475)||(9710639-9711086)
chr1 (13-441)||(46978798-46979235)
chr1 (13-475)||(1655644-1656101)
chr1 (13-475)||(7966044-7966497)
chr1 (13-475)||(44469575-44470023)
chr1 (13-475)||(13177690-13178144)
chr1 (13-513)||(30909593-30910080)
chr1 (13-512)||(29352256-29352742)
chr1 (14-454)||(20353500-20353925)
chr1 (13-386)||(37018960-37019318)
chr1 (13-454)||(13633436-13633863)
chr1 (13-475)||(25039645-25040088)
chr1 (15-475)||(36072430-36072879)
chr1 (13-454)||(3944057-3944484)
chr1 (13-475)||(38689992-38690417)
chr1 (13-454)||(38771712-38772140)
chr1 (13-454)||(3993406-3993833)
chr1 (232-503)||(22345818-22346083)
chr1 (13-376)||(12643369-12643714)
chr1 (13-377)||(6558047-6558410)
chr1 (14-476)||(5141435-5141873)
chr1 (228-577)||(52805325-52805674)
chr1 (13-381)||(5081928-5082283)
chr1 (212-475)||(46886137-46886400)
chr1 (13-357)||(33168082-33168422)
chr1 (207-454)||(15051092-15051338)
chr1 (228-577)||(21144396-21144745)
chr1 (228-454)||(94480-94705)
chr1 (228-436)||(22527460-22527667)
chr1 (228-454)||(470835-471060)
chr1 (228-450)||(31780054-31780275)
chr1 (228-483)||(16281751-16282004)
chr1 (232-422)||(19521711-19521900)
chr1 (236-427)||(50617312-50617503)
chr1 (331-471)||(23359217-23359357)
chr1 (253-474)||(47714877-47715089)
chr1 (456-572)||(38689869-38689985)
chr1 (462-550)||(6562186-6562275)
chr1 (455-576)||(46141715-46141837)
chr1 (462-572)||(36908515-36908626)
chr1 (458-576)||(22345194-22345312)
chr1 (456-576)||(49927532-49927653)
chr1 (395-495)||(12643270-12643372)
chr1 (457-539)||(27485029-27485112)
chr1 (462-550)||(30905730-30905819)
chr1 (462-577)||(49924788-49924904)
chr1 (456-523)||(52802116-52802184)
chr1 (463-577)||(46320482-46320594)
chr1 (495-577)||(6437598-6437680)
chr1 (465-575)||(8460125-8460235)
chr1 (457-550)||(44465555-44465649)
chr1 (456-513)||(44470030-44470088)
chr1 (456-577)||(51271610-51271732)
chr1 (462-550)||(5077900-5077989)
chr1 (468-572)||(19053996-19054101)
chr1 (466-550)||(23913816-23913901)
chr1 (456-576)||(29765548-29765669)
chr1 (457-513)||(41453834-41453891)
chr1 (456-576)||(46886406-46886527)
chr1 (456-572)||(46973141-46973258)
chr1 (530-575)||(49874942-49874987)
chr1 (404-475)||(6557976-6558046)
chr1 (462-513)||(15047278-15047330)
chr1 (456-539)||(23276127-23276211)
chr1 (415-475)||(29261475-29261535)
chr1 (456-575)||(13971998-13972116)
chr1 (457-519)||(20349447-20349510)
chr1 (456-572)||(26633467-26633581)
chr1 (530-576)||(9618655-9618701)
chr1 (456-577)||(9711670-9711792)
chr1 (467-564)||(35527043-35527141)
chr1 (207-272)||(1179877-1179942)
chr1 (457-513)||(6557911-6557968)
chr1 (456-572)||(41804052-41804169)
chr1 (530-577)||(640985-641032)
chr1 (466-576)||(2425714-2425824)
chr1 (154-189)||(15051053-15051088)
chr1 (299-362)||(29261538-29261601)
chr1 (470-572)||(35521551-35521654)
chr1 (518-576)||(15354640-15354698)
chr1 (456-513)||(23359368-23359426)
chr1 (463-540)||(29434942-29435020)
chr1 (456-577)||(36076577-36076698)
chr1 (466-575)||(44596795-44596905)
chr1 (456-577)||(48751429-48751551)
chr1 (456-576)||(94343-94463)
chr1 (526-575)||(1872042-1872091)
chr1 (230-327)||(10165606-10165703)
chr1 (456-576)||(18975139-18975260)
chr1 (456-512)||(19161889-19161946)
chr1 (236-325)||(25234017-25234106)
chr1 (463-575)||(32161321-32161431)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (19-475)||(44050650-44051104)
chr4 (14-550)||(37394768-37395306)
chr4 (25-475)||(10422984-10423418)
chr4 (13-540)||(18578618-18579141)
chr4 (13-473)||(38460489-38460934)
chr4 (13-454)||(3407803-3408230)
chr4 (13-481)||(4774168-4774631)
chr4 (13-475)||(19069248-19069709)
chr4 (13-454)||(49563923-49564351)
chr4 (13-335)||(10374240-10374548)
chr4 (105-482)||(50904819-50905179)
chr4 (115-458)||(51642096-51642423)
chr4 (228-575)||(50278588-50278937)
chr4 (13-302)||(24415392-24415679)
chr4 (233-575)||(44674099-44674440)
chr4 (233-475)||(51492132-51492374)
chr4 (231-475)||(15995783-15996026)
chr4 (228-475)||(37015959-37016206)
chr4 (40-477)||(6186714-6187140)
chr4 (13-186)||(11506658-11506831)
chr4 (298-460)||(24414911-24415072)
chr4 (49-477)||(30043023-30043436)
chr4 (470-576)||(6280790-6280897)
chr4 (456-550)||(9889953-9890048)
chr4 (456-577)||(16984180-16984302)
chr4 (455-572)||(37959738-37959856)
chr4 (456-575)||(16983456-16983576)
chr4 (456-572)||(955729-955846)
chr4 (457-572)||(21472504-21472620)
chr4 (462-576)||(39588025-39588140)
chr4 (466-577)||(4979946-4980058)
chr4 (462-545)||(50274724-50274808)
chr4 (456-539)||(11494514-11494597)
chr4 (530-577)||(28320491-28320538)
chr4 (462-548)||(37394209-37394296)
chr4 (467-577)||(38464796-38464906)
chr4 (456-572)||(29700321-29700438)
chr4 (456-564)||(33383750-33383859)
chr4 (457-512)||(3403844-3403900)
chr4 (456-575)||(49572919-49573039)
chr4 (456-575)||(51492006-51492125)
chr4 (466-532)||(41023363-41023430)
chr4 (378-512)||(44795056-44795189)
chr4 (456-513)||(15995718-15995776)
chr4 (456-513)||(19069183-19069241)
chr4 (462-575)||(44051117-44051231)
chr4 (457-512)||(1041932-1041988)
chr4 (456-513)||(18884523-18884581)
chr4 (58-198)||(31598814-31598954)
chr4 (457-572)||(44561350-44561466)
chr4 (459-572)||(4768615-4768729)
chr4 (456-513)||(14201549-14201604)
chr4 (456-513)||(15999818-15999876)
chr4 (499-561)||(21470851-21470913)
chr4 (456-577)||(39590587-39590709)
chr4 (510-560)||(51642012-51642062)
chr4 (456-572)||(958613-958729)
chr4 (457-486)||(17139648-17139677)
chr4 (456-512)||(23221689-23221743)
chr4 (456-512)||(38368228-38368282)
chr4 (456-512)||(46253483-46253537)
chr4 (456-512)||(55587355-55587409)
chr4 (456-512)||(55588306-55588360)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (13-483)||(43376843-43377312)
chr8 (13-466)||(2124248-2124703)
chr8 (13-454)||(31959611-31960051)
chr8 (13-493)||(39499-39966)
chr8 (13-475)||(35962368-35962816)
chr8 (13-470)||(23924032-23924474)
chr8 (13-475)||(43679458-43679905)
chr8 (109-575)||(39751008-39751473)
chr8 (50-465)||(4867394-4867804)
chr8 (13-454)||(7344120-7344547)
chr8 (13-337)||(22588006-22588316)
chr8 (13-439)||(30301231-30301644)
chr8 (13-454)||(32375734-32376161)
chr8 (13-454)||(8419487-8419914)
chr8 (128-572)||(20548938-20549368)
chr8 (13-315)||(7171881-7172179)
chr8 (238-577)||(41743822-41744162)
chr8 (13-414)||(22661138-22661523)
chr8 (265-477)||(23578494-23578705)
chr8 (233-454)||(34366994-34367214)
chr8 (234-453)||(41238932-41239150)
chr8 (13-185)||(41744160-41744332)
chr8 (317-507)||(7172465-7172658)
chr8 (18-117)||(39751659-39751758)
chr8 (361-512)||(1116112-1116264)
chr8 (207-360)||(30972618-30972771)
chr8 (230-405)||(31280942-31281118)
chr8 (456-577)||(39601636-39601758)
chr8 (462-577)||(41858146-41858262)
chr8 (456-575)||(2146976-2147095)
chr8 (50-155)||(31281179-31281282)
chr8 (462-550)||(1114702-1114791)
chr8 (376-457)||(22588311-22588392)
chr8 (456-539)||(18205756-18205840)
chr8 (462-545)||(45454370-45454454)
chr8 (456-575)||(18441460-18441580)
chr8 (456-535)||(41855342-41855422)
chr8 (456-575)||(44052245-44052365)
chr8 (456-534)||(35962282-35962361)
chr8 (456-572)||(7168025-7168142)
chr8 (470-550)||(35966782-35966863)
chr8 (470-575)||(39753031-39753136)
chr8 (456-575)||(18438568-18438688)
chr8 (456-575)||(35389442-35389562)
chr8 (94-201)||(30972519-30972626)
chr8 (530-576)||(34503152-34503198)
chr8 (463-575)||(7577617-7577727)
chr8 (485-550)||(20546812-20546877)
chr8 (462-550)||(31957793-31957882)
chr8 (457-577)||(34235143-34235263)
chr8 (278-394)||(29807053-29807168)
chr8 (495-575)||(34234517-34234597)
chr8 (456-575)||(34366846-34366965)
chr8 (456-575)||(34823035-34823155)
chr8 (456-575)||(41250091-41250210)
chr8 (456-539)||(42602430-42602514)
chr8 (497-539)||(5304205-5304247)
chr8 (489-539)||(26455734-26455784)
chr8 (427-477)||(29807193-29807243)
chr8 (456-513)||(32585012-32585067)
chr8 (456-534)||(43690053-43690131)
chr8 (530-575)||(6268920-6268965)
chr8 (456-512)||(22550884-22550941)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (29-575)||(29286163-29286695)
chr6 (13-472)||(7537250-7537709)
chr6 (13-560)||(18609797-18610329)
chr6 (18-475)||(2051089-2051545)
chr6 (25-575)||(25140681-25141218)
chr6 (13-540)||(31150629-31151142)
chr6 (13-454)||(28362281-28362720)
chr6 (13-475)||(23958951-23959399)
chr6 (13-458)||(29667387-29667827)
chr6 (13-475)||(13382690-13383150)
chr6 (13-487)||(1608341-1608803)
chr6 (207-460)||(26702456-26702698)
chr6 (235-475)||(11840022-11840262)
chr6 (207-454)||(18351387-18351633)
chr6 (228-577)||(3502429-3502778)
chr6 (281-486)||(2258336-2258540)
chr6 (49-477)||(34230548-34230953)
chr6 (228-475)||(31771505-31771753)
chr6 (13-207)||(2259400-2259593)
chr6 (258-477)||(8304506-8304715)
chr6 (207-462)||(20448531-20448776)
chr6 (211-394)||(20439753-20439935)
chr6 (456-576)||(18605978-18606098)
chr6 (456-575)||(2050963-2051082)
chr6 (229-394)||(19129120-19129281)
chr6 (211-477)||(20436045-20436301)
chr6 (49-207)||(20448388-20448545)
chr6 (462-576)||(7361124-7361239)
chr6 (466-576)||(13401419-13401530)
chr6 (518-572)||(26702741-26702795)
chr6 (456-560)||(28362750-28362858)
chr6 (47-129)||(19129562-19129644)
chr6 (462-575)||(29061230-29061344)
chr6 (456-577)||(31768685-31768807)
chr6 (468-577)||(2052615-2052723)
chr6 (457-513)||(18347037-18347094)
chr6 (455-507)||(31146375-31146428)
chr6 (223-283)||(2259338-2259398)
chr6 (468-575)||(29065674-29065782)
chr6 (468-575)||(29074687-29074795)
chr6 (468-575)||(29079451-29079559)
chr6 (468-575)||(29107260-29107368)
chr6 (456-539)||(35021282-35021366)
chr6 (458-576)||(11687392-11687508)
chr6 (455-577)||(14012393-14012515)
chr6 (463-577)||(18001146-18001260)
chr6 (460-572)||(13479663-13479776)
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (13-575)||(41181371-41181919)
chr2 (13-475)||(24601700-24602160)
chr2 (13-475)||(24611954-24612414)
chr2 (13-475)||(9659604-9660067)
chr2 (13-550)||(1096554-1097092)
chr2 (13-477)||(41052681-41053142)
chr2 (25-475)||(28342584-28343020)
chr2 (13-434)||(439374-439792)
chr2 (14-572)||(12905486-12906037)
chr2 (13-475)||(81814-82274)
chr2 (13-475)||(43943750-43944210)
chr2 (13-572)||(45479385-45479930)
chr2 (13-475)||(7267008-7267456)
chr2 (13-475)||(41004589-41005045)
chr2 (13-475)||(3795398-3795859)
chr2 (13-471)||(24753588-24754032)
chr2 (13-477)||(39798004-39798453)
chr2 (13-454)||(41564054-41564482)
chr2 (13-487)||(10620022-10620483)
chr2 (13-454)||(5351295-5351722)
chr2 (13-487)||(209033-209494)
chr2 (238-475)||(25184606-25184842)
chr2 (228-477)||(10825277-10825526)
chr2 (115-487)||(38950232-38950577)
chr2 (228-436)||(39950936-39951143)
chr2 (228-427)||(32952840-32953038)
chr2 (148-454)||(18000315-18000607)
chr2 (228-427)||(29398019-29398213)
chr2 (13-201)||(1150595-1150783)
chr2 (207-327)||(3206956-3207076)
chr2 (13-118)||(38949750-38949855)
chr2 (456-576)||(25184849-25184969)
chr2 (456-571)||(82281-82396)
chr2 (328-450)||(7189818-7189939)
chr2 (457-575)||(35493361-35493480)
chr2 (456-575)||(7189970-7190089)
chr2 (456-540)||(41008947-41009031)
chr2 (456-550)||(27276393-27276488)
chr2 (456-578)||(41500253-41500376)
chr2 (456-566)||(41004472-41004582)
chr2 (27-198)||(25613526-25613697)
chr2 (466-564)||(35490625-35490724)
chr2 (230-360)||(25613379-25613508)
chr2 (456-577)||(41497404-41497526)
chr2 (456-505)||(41183243-41183292)
chr2 (456-576)||(43870140-43870261)
chr2 (456-572)||(45475377-45475494)
chr2 (456-572)||(2917620-2917737)
chr2 (462-575)||(24607593-24607707)
chr2 (456-540)||(3943211-3943295)
chr2 (457-513)||(38945758-38945815)
chr2 (456-540)||(435312-435396)
chr2 (456-575)||(1149406-1149526)
chr2 (425-473)||(3206842-3206890)
chr2 (456-575)||(9660074-9660194)
chr2 (456-575)||(23346715-23346834)
chr2 (456-575)||(23347347-23347466)
chr2 (58-118)||(43668500-43668560)
chr2 (462-512)||(3803568-3803619)
chr2 (510-577)||(16580477-16580544)
chr2 (462-512)||(20951071-20951122)
chr2 (456-513)||(3795333-3795391)
chr2 (457-513)||(1101072-1101129)
chr2 (462-550)||(24749645-24749734)
chr2 (452-531)||(2648776-2648856)
chr2 (537-577)||(15488243-15488283)
chr2 (456-488)||(39033540-39033572)
chr2 (530-577)||(4014200-4014247)
chr2 (462-577)||(43950267-43950382)
chr2 (456-513)||(30802039-30802094)
chr2 (463-540)||(39378343-39378418)
chr2 (456-540)||(23409520-23409605)
chr2 (463-539)||(45137459-45137536)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (13-475)||(6489390-6489852)
chr3 (13-575)||(46989481-46990035)
chr3 (13-475)||(4002055-4002517)
chr3 (16-486)||(21951850-21952305)
chr3 (13-566)||(66844-67392)
chr3 (13-437)||(36812937-36813360)
chr3 (13-513)||(13743289-13743775)
chr3 (13-575)||(14402569-14403109)
chr3 (13-507)||(50957243-50957737)
chr3 (13-487)||(9426654-9427114)
chr3 (13-454)||(6744890-6745316)
chr3 (13-475)||(48246473-48246920)
chr3 (13-486)||(2857546-2858005)
chr3 (13-454)||(30943272-30943700)
chr3 (13-454)||(3952778-3953205)
chr3 (13-454)||(8156591-8157018)
chr3 (143-550)||(7841080-7841474)
chr3 (228-475)||(600309-600556)
chr3 (228-468)||(50213525-50213765)
chr3 (228-576)||(16646939-16647287)
chr3 (13-299)||(2743678-2743964)
chr3 (228-475)||(47070529-47070776)
chr3 (228-436)||(36134048-36134255)
chr3 (228-450)||(42166177-42166398)
chr3 (238-436)||(52387900-52388097)
chr3 (228-428)||(2271463-2271663)
chr3 (235-436)||(9473721-9473921)
chr3 (322-475)||(2743459-2743611)
chr3 (322-450)||(4004931-4005058)
chr3 (456-576)||(52567696-52567817)
chr3 (456-537)||(41802970-41803052)
chr3 (456-575)||(43476125-43476246)
chr3 (461-576)||(23443130-23443246)
chr3 (456-578)||(55385068-55385191)
chr3 (462-575)||(19454350-19454464)
chr3 (456-565)||(52570585-52570694)
chr3 (456-576)||(7247879-7248000)
chr3 (456-572)||(19440193-19440310)
chr3 (456-575)||(41805694-41805814)
chr3 (456-578)||(2432962-2433085)
chr3 (456-550)||(49219810-49219905)
chr3 (462-575)||(14398469-14398583)
chr3 (454-575)||(41137652-41137774)
chr3 (462-550)||(2745230-2745319)
chr3 (462-578)||(6489264-6489377)
chr3 (456-575)||(46344871-46344991)
chr3 (456-513)||(2743394-2743452)
chr3 (462-575)||(6505976-6506090)
chr3 (456-577)||(41579743-41579865)
chr3 (456-576)||(48250888-48251009)
chr3 (458-578)||(50216875-50216996)
chr3 (463-575)||(55267375-55267488)
chr3 (456-575)||(43478849-43478969)
chr3 (465-575)||(55207691-55207802)
chr3 (229-327)||(7314585-7314683)
chr3 (456-513)||(13747737-13747795)
chr3 (456-540)||(13896895-13896980)
chr3 (456-540)||(19341613-19341698)
chr3 (456-572)||(29918360-29918477)
chr3 (456-572)||(29967513-29967630)
chr3 (462-572)||(45101873-45101984)
chr3 (456-577)||(600563-600685)
chr3 (456-513)||(4002524-4002582)
chr3 (456-513)||(26245331-26245386)
chr3 (456-513)||(34694453-34694511)
chr3 (494-540)||(44490374-44490420)
chr3 (463-517)||(48892151-48892205)
chr3 (495-564)||(7245096-7245165)
chr3 (435-475)||(7839472-7839513)
chr3 (519-576)||(51402481-51402538)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (13-475)||(19044354-19044815)
chr7 (13-475)||(20709821-20710282)
chr7 (18-475)||(34622560-34623002)
chr7 (13-526)||(47742553-47743053)
chr7 (14-475)||(10705309-10705765)
chr7 (13-477)||(15069914-15070365)
chr7 (13-451)||(18109357-18109781)
chr7 (13-477)||(42503402-42503853)
chr7 (13-454)||(603862-604288)
chr7 (16-470)||(12111267-12111729)
chr7 (13-487)||(43619728-43620189)
chr7 (13-454)||(45767424-45767851)
chr7 (13-454)||(30790570-30790998)
chr7 (13-303)||(47064858-47065148)
chr7 (229-485)||(40928719-40928975)
chr7 (228-514)||(5537867-5538152)
chr7 (228-450)||(17838400-17838621)
chr7 (235-475)||(34742168-34742407)
chr7 (238-454)||(29592626-29592841)
chr7 (13-185)||(29592839-29593011)
chr7 (228-475)||(13323480-13323727)
chr7 (380-572)||(36186416-36186608)
chr7 (228-314)||(10522280-10522366)
chr7 (456-577)||(46738734-46738856)
chr7 (456-577)||(19044226-19044347)
chr7 (456-577)||(20710289-20710410)
chr7 (463-577)||(21185551-21185666)
chr7 (463-576)||(28980199-28980313)
chr7 (462-575)||(34623405-34623519)
chr7 (456-550)||(42499368-42499463)
chr7 (462-575)||(29593353-29593467)
chr7 (462-550)||(34139856-34139945)
chr7 (463-575)||(48314608-48314720)
chr7 (466-575)||(46863373-46863483)
chr7 (457-513)||(618745-618802)
chr7 (456-572)||(9494825-9494942)
chr7 (530-578)||(35839321-35839369)
chr7 (456-575)||(47060861-47060980)
chr7 (494-572)||(28112779-28112857)
chr7 (489-575)||(48269615-48269700)
chr7 (530-575)||(30471633-30471678)
chr7 (466-582)||(39460480-39460597)
chr7 (519-576)||(41623898-41623955)
chr7 (456-539)||(30355258-30355342)
chr7 (456-575)||(41047712-41047831)
chr7 (462-576)||(34622432-34622547)
chr7 (457-535)||(45361623-45361702)
chr7 (456-575)||(41049208-41049327)
chr7 (495-577)||(43686907-43686989)
chr7 (456-513)||(49140652-49140707)
chr7 (456-540)||(10705217-10705302)
chr7 (462-534)||(27453619-27453692)
chr7 (456-512)||(46907536-46907590)
chr7 (456-576)||(47776265-47776386)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (63-475)||(25877682-25878089)
chr5 (13-475)||(34122585-34123047)
chr5 (13-419)||(7796695-7797086)
chr5 (13-486)||(24053204-24053672)
chr5 (13-513)||(13563663-13564150)
chr5 (13-477)||(1039356-1039819)
chr5 (13-475)||(33994713-33995160)
chr5 (13-498)||(27863440-27863912)
chr5 (13-477)||(38855774-38856224)
chr5 (13-475)||(24050088-24050547)
chr5 (13-451)||(37814668-37815091)
chr5 (13-471)||(25890059-25890503)
chr5 (13-477)||(11029067-11029516)
chr5 (71-477)||(34079753-34080145)
chr5 (13-472)||(28882058-28882497)
chr5 (92-475)||(7017573-7017941)
chr5 (13-461)||(30352503-30352939)
chr5 (301-577)||(4196515-4196790)
chr5 (228-475)||(38407208-38407454)
chr5 (13-208)||(14280542-14280737)
chr5 (228-475)||(7762008-7762256)
chr5 (251-475)||(28388307-28388531)
chr5 (13-208)||(4196830-4197023)
chr5 (228-427)||(41799534-41799731)
chr5 (14-173)||(28387821-28387979)
chr5 (207-477)||(43179644-43179904)
chr5 (62-399)||(6267612-6267933)
chr5 (13-143)||(43179429-43179559)
chr5 (456-576)||(25877555-25877675)
chr5 (421-575)||(31094497-31094651)
chr5 (361-455)||(14280797-14280891)
chr5 (457-577)||(13568095-13568216)
chr5 (463-580)||(35777044-35777159)
chr5 (207-260)||(4196792-4196845)
chr5 (463-575)||(18310047-18310160)
chr5 (456-564)||(33993225-33993334)
chr5 (456-577)||(3603167-3603289)
chr5 (457-550)||(27867840-27867934)
chr5 (457-550)||(34122483-34122577)
chr5 (456-550)||(34123954-34124049)
chr5 (457-575)||(43094596-43094715)
chr5 (456-575)||(3600270-3600391)
chr5 (207-249)||(14280722-14280764)
chr5 (456-577)||(20192285-20192407)
chr5 (463-540)||(41798787-41798865)
chr5 (463-550)||(1397376-1397464)
chr5 (530-577)||(8680336-8680383)
chr5 (239-362)||(16440192-16440315)
chr5 (462-540)||(28387238-28387317)
chr5 (456-540)||(7757294-7757379)
chr5 (456-572)||(18538354-18538471)
chr5 (13-77)||(7017943-7018007)
chr5 (456-575)||(28388538-28388658)
chr5 (456-575)||(39743167-39743287)
chr5 (456-513)||(3892459-3892514)
chr5 (465-550)||(25897107-25897193)
chr5 (462-547)||(30887385-30887471)
chr5 (457-502)||(37820874-37820920)
chr5 (485-550)||(1035143-1035208)
chr5 (463-575)||(2532530-2532640)
chr5 (456-577)||(4204230-4204350)
chr5 (457-513)||(7021878-7021935)
chr5 (457-513)||(8539536-8539593)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (13-475)||(22464-22923)
scaffold0201 (457-575)||(22337-22456)
[»] scaffold0219 (2 HSPs)
scaffold0219 (95-475)||(19743-20124)
scaffold0219 (13-97)||(19498-19582)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (13-477)||(4890-5341)
scaffold0494 (456-550)||(790-885)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (13-475)||(15519-15967)
scaffold0116 (462-575)||(11235-11349)
scaffold0116 (456-513)||(15974-16032)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (120-475)||(8260-8601)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (16-424)||(21762-22144)
[»] scaffold0169 (3 HSPs)
scaffold0169 (296-486)||(1517-1706)
scaffold0169 (13-163)||(10828-10978)
scaffold0169 (519-575)||(1728-1784)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (233-443)||(12497-12706)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (228-450)||(236001-236222)
[»] scaffold0794 (2 HSPs)
scaffold0794 (13-186)||(1315-1488)
scaffold0794 (456-505)||(5276-5325)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (462-550)||(17376-17465)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (456-577)||(1200-1321)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (462-575)||(17965-18079)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (462-575)||(54765-54879)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (462-550)||(781-870)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (470-550)||(4433-4514)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (457-519)||(11770-11833)
[»] scaffold1379 (1 HSPs)
scaffold1379 (456-577)||(453-575)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 630; Significance: 0; HSPs: 97)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 630; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 8459466 - 8458647
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8459466 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcaaaatatggtagaagataatat 8459367  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  8459366 attatacatgtatgttcgttctatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt---- 8459271  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8459270 ----------tttaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 8459181  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8459180 ttttcttgtttatgaccaagtttcaatgttgtatgatttatattgccttt-ggaaatgctatggtttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaatggctt 8459082  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  8459081 agaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaactgcagtcggtttcaaattccacggcagttaacttctga 8458982  T
Q  513 gaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaaggaaagacaacgtataagcgacaaaattattaaat 612  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458981 ggggataaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttaagcaatgtgtcaacatcaattctcaaggaaagacaacgtataagcgacaaaattattaaat 8458882  T
Q  613 tttaagattgtgactgacaagcaataaannnnnnnatgcacatacaaattcttggtatcatatgtaactacttctctctggactggaaagcattattatt 712  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458881 tttaagattttgactgacaagcaataaaattttttatgcacatacaaattcttggtatcatatgtaactacttctctctggactggaaagcattattatt 8458782  T
Q  713 tnnnnnnncactaatggcc-aaaaatatgtacctccataacatgatcagaggggaagggccagtgagcctgcacagagagtgaatcaagagcatgagttt 811  Q
    |       |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458781 taaaaaaacactaacggccaaaaaatatgtacctccataacatgatcagaggggaagggccagtgagcctgcacagagagtgaatcaagagcatgagttt 8458682  T
Q  812 aggattttaatcggaaaatgcaatgtgttattgcc 846  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458681 aggattttaatcggaaaatgcaatgtgttattgcc 8458647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 572
Target Start/End: Original strand, 51666230 - 51666774
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51666230 gagatgaatacacatggaacacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 51666329  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||              ||    
T  51666330 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgtttaa--------------tt 51666415  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51666416 atggacactttgtaactttttgatgaatttcaaacttttatgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaatatattgtat 51666515  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  51666516 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctttggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaatggctt 51666614  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||| ||||    
T  51666615 gagaatgctttagaattatgcagaacccactgtgtgcataattgttttcctcagcagttaactgcagccgatttcgaattactcggcatttaactgccga 51666714  T
Q  513 gaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |  || |||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  51666715 gggggcaaaagcgtattttactcgtgtgacacagctttatgcaatgtgtcaacatcaatt 51666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 50113830 - 50113368
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50113830 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 50113731  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  50113730 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaataatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgtt 50113631  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113630 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 50113531  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |    
T  50113530 ttatcttgtttatgtctgagtttcaacgttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactagccgaaaaaatggat 50113432  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  50113431 tgaaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagtttttctcggcagttaact 50113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 4517959 - 4518444
Alignment:
Q  14 agatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatata 113  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  4517959 agatgaatacgcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttattaaagactatagcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 4518058  T
Q  114 ttatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttg----------tttaattatgga 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||          ||||||||||||    
T  4518059 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatt--atataatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatgga 4518156  T
Q  204 cacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4518157 cacttaattatggacattttgtaacgttctgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 4518256  T
Q  304 atattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4518257 atattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctttggtttaattacaggtaaaaactggccgaa 4518355  T
Q  404 aaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaatt 492  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4518356 aaatggcttgaaaatgctttagaattatgcagaacctactgtctccataattgttttcctcggcagttaactgcagccggtttcgaatt 4518444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 30 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 19495544 - 19495093
Alignment:
Q  30 aaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttc 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19495544 aaaacggcaagctatatgccttggcttattcgagacgatagcgacgttggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttc 19495445  T
Q  130 gttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaattatggacactttgtaac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | | |    ||||||||||||||| ||||||    
T  19495444 gttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgacttgt--aatgtgttgt---ttaattatggacactatgtaac 19495350  T
Q  229 gt---tttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttat 325  Q
         ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19495349 acgcgtttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttatttat 19495250  T
Q  326 gaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttag 425  Q
    ||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  19495249 gactgagtttaaatgttgtatgaattatattaccttt-ggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatagcttggaaatgcttaac 19495151  T
Q  426 aattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccgg 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19495150 aattatgcagaacccactgtctgcataatagtttttctcggcagttaactgcagccgg 19495093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9711086 - 9710639
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9711086 gagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaagataatat 9710987  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  9710986 attatatatgtatgttctttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt---- 9710891  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9710890 ----------tgtaacattttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcagtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 9710801  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    || ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9710800 ttatcttgtttatgtcctagtttcaatgttgtatgaattattttacc-tttggaaatactcttgtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggctt 9710702  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataatt-gtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9710701 ggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataattcgttttcctcggcagttaact 9710639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 441
Target Start/End: Original strand, 46978798 - 46979235
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  46978798 gagatgaatacacatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcgaaatatggtggaaaataatat 46978897  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||          |||||||||||||||    
T  46978898 attatatatgtatgttcgttcctaatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgaattgtaatgtgttgtttaattatgg 46978997  T
Q  203 acacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46978998 acacttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtctgtttgatttaattatggacaattgtaaaa 46979097  T
Q  303 gatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccga 402  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  46979098 gatattctatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctgatttaattacaagtaaaaactgaccga 46979196  T
Q  403 aaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaaccca 441  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46979197 aaaatagcttgaaaatgttttagaattatgcagaaccca 46979235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 1655644 - 1656101
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1655644 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 1655743  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaat 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | | |    |||      
T  1655744 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaatgatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt--aatgtgttgt---ttatg 1655838  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
     ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1655839 catggatactatgtaacgatttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtccgtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 1655938  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggct 411  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1655939 ttttacttgtttatgactaaatttaaatgttgtataagttatattgcc-tttggaaatgctctgattaaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggct 1656037  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    || || || || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1656038 tgaaagtgcttaacaattatgcagaacccactgtctgcataaatgttttcctcggcagttaact 1656101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7966497 - 7966044
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7966497 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttg-cttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7966399  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaa-tgagttgtttaattatggacacttaat 211  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||| |  ||         ||||    
T  7966398 attacatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaaatgtaatgtgttgtt---------taat 7966308  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgt-aaaagatattgt 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7966307 tatggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaaagatattgt 7966208  T
Q  311 atttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggc 410  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7966207 attttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcc-tttggaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggc 7966109  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  7966108 ttggaagtgctttagaattatgcagaactcactgtctgcataatcaattttctcagcagttaact 7966044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 44469575 - 44470023
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44469575 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 44469674  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              ||||||    
T  44469675 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt--------------ttaatt 44469760  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  44469761 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 44469860  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  44469861 ttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttgaaaatgctctggttcaattacaggtaaaaactgaccgaaaaaatggct 44469959  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44469960 tggaaatg-tttagaattatgcagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 44470023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 13177690 - 13178144
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13177690 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatggcttggcttaatcgcaacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13177789  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaat 211  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | | |    ||||     
T  13177790 attatatatgtatgttcattccatatgcaattgcattgaaagtaagtagggatttaatttaataatgtgtaatgagttg--taatgtgttg---tttaac 13177884  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13177885 tatggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattata 13177984  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggct 411  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |   |  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  13177985 ttttacttgtttatgactgagtttaa--ataatataagttatattgcc-tttggaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactggtcaaaaaatggct 13178081  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13178082 tggaagtgctttataattatgcagaacccactgt-tgcataaatgtttttctcggcagttaact 13178144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 513
Target Start/End: Original strand, 30909593 - 30910080
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30909593 gagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 30909692  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||              ||    
T  30909693 attatatatgtatgttcgtttcatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtactttaa--------------tt 30909778  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  30909779 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaacgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 30909878  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || | ||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30909879 ttatgttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 30909977  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttc 509  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  30909978 tggaattg-ttcagaattatgcagaaccctctgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcgacagttaactgc 30910076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29352742 - 29352256
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29352742 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 29352643  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  29352642 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt---- 29352547  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29352546 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 29352457  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  29352456 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttgcaaatgctctggtttaattacaagtaaaaattggccgaaaaaatggtt 29352358  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttc 509  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||| |    
T  29352357 tggaaatg-tttagaattatgtagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactggagccggatttcaaattcctcgacaattaactgc 29352259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 454
Target Start/End: Original strand, 20353500 - 20353925
Alignment:
Q  14 agatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatata 113  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20353500 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 20353599  T
Q  114 ttatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatta 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||              |||    
T  20353600 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtataatgagtagtttaa--------------tta 20353685  T
Q  214 tggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20353686 tggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatt 20353785  T
Q  314 tttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggctt 412  Q
    | ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20353786 tgtcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggctt 20353884  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20353885 ggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 20353925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 386
Target Start/End: Original strand, 37018960 - 37019318
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37018960 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacataggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 37019059  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||              ||||||    
T  37019060 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt--------------ttaatt 37019145  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37019146 atggacactttgtaacattttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 37019245  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattaca 386  Q
    || ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| || || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  37019246 ttatcttgtttatatccgagtttcaatgttgtatgaattattttacc-tttgaaaatactctggtttaattaca 37019318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 13633436 - 13633863
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13633436 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgatgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13633535  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  13633536 attatatatgtatgtttgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttattgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt---- 13633631  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaa-tgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13633632 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggttaaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 13633721  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggcc-gaaaaatggc 410  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13633722 tttatcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattatttagcc-tttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactggccggaaaaatggc 13633820  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13633821 ttggaaatg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataat 13633863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 25039645 - 25040088
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25039645 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatacgccttggcttattcgcgtcgataacgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 25039744  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    || |             
T  25039745 attatatgtgtatgttcgttccatatacaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgttta----tgca--------- 25039831  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25039832 -tggacactatgtaacgatttgatgaattttaaacttttgtgtattttgaaccaaatatcagtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 25039930  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||  | |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||        
T  25039931 tttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtacaagttatattgtc-tttggaaatgttctggttaaattacaggtaaaaactggccgaaaaatg---- 25040025  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  25040026 ggaaatgcttaacaattatgcagaacccactgtctgcataaatgttttcctcaacagttaact 25040088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 36072879 - 36072430
Alignment:
Q  15 gatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatat 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36072879 gatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttggctaattgaagatgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatat 36072780  T
Q  115 tatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattat 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||  ||     ||||| ||    
T  36072779 tatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatatgttg----tttaatcat 36072684  T
Q  215 ggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt 314  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36072683 ggacactatctaatgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattt 36072584  T
Q  315 ttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttgg 414  Q
    | |||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||      |||| |||||||     |||||||||  |||     
T  36072583 tacttgtttatgactgagtttaactgttgtataagttatattgcc-tttggaaatgttctgg------tacaggtaaaaaaatttcgaaaaatgatttga 36072491  T
Q  415 aaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  36072490 aaatgctttagaattatgcagaatccactgtctgcataatcagttttttcggcagttaact 36072430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3944484 - 3944057
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3944484 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 3944385  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  3944384 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 3944293  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3944292 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 3944199  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3944198 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 3944101  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3944100 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 3944057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 38690417 - 38689992
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  38690417 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcaaaatatggtggaaaataatat 38690318  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||              ||||||    
T  38690317 attatatatgtatgtttgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagta-ggatttaatataatgatgtgtaatgtgttgt--------------ttaatt 38690233  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38690232 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaactatggacaattgtaaaagatattgtat 38690133  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||| ||||||||                     | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38690132 ttttcttatttatgac---------------------tgatattgcc-tttggaaatcctctggtttaattacagataaaaactggccgaaaaatggctt 38690055  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38690054 ggaaatgctttagaattatgtagaaaccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaact 38689992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 38772140 - 38771712
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  38772140 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttatccgcgacgacggtgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 38772041  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  38772040 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 38771949  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38771948 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaggatattgtat 38771855  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38771854 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 38771756  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38771755 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 38771712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 3993406 - 3993833
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3993406 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 3993505  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              ||||||    
T  3993506 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaatt 3993591  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3993592 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 3993691  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3993692 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 3993789  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3993790 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 3993833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 232 - 503
Target Start/End: Original strand, 22345818 - 22346083
Alignment:
Q  232 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccga 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||||    
T  22345818 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttacttatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttggt-----ccga 22345912  T
Q  332 gtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattat 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22345913 gtttcaatgttgtatgatttatattgccttt-ggaaatgctctggcttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaatggcttggaaatgcattagaattat 22346011  T
Q  432 gcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22346012 gcagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcctcggcagtt 22346083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12643714 - 12643369
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  12643714 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaataatat 12643615  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643614 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 12643515  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    || |||||||               ||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643514 atagacactt---------------aatt--aaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 12643432  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctgg 376  Q
    || ||||||||||| | |||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12643431 ttatcttgtttatgtctgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctgg 12643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6558410 - 6558047
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6558410 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 6558311  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |     
T  6558310 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgta 6558211  T
Q  213 atggacactttgtaacgt----tttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatatt 308  Q
    |||     ||||    ||    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6558210 atg----ttttgagtggtttaatttgatgaatttcaaacatttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatatt 6558115  T
Q  309 gtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggt 377  Q
    ||| || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6558114 gtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggt 6558047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 476
Target Start/End: Original strand, 5141435 - 5141873
Alignment:
Q  14 agatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatata 113  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5141435 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcgttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatgtatgtttcggaatatgatggaagataatata 5141534  T
Q  114 ttatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatta 213  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||| ||||||  |||     
T  5141535 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaacgatatataatgtgttgtttaattattgacact--att- 5141631  T
Q  214 tggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 313  Q
               ||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  5141632 -----------taacgttttaatgaatttcaaacattcgagtaattcgaaccccttgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagata-tgtaat 5141719  T
Q  314 tttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttg 413  Q
    ||||||||||||| | |||| | | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  5141720 tttcttgtttatgcctgagtataaatgttgtatgagttatattgcc-tttggaaatgttctgctttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggctag 5141818  T
Q  414 gaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactg 476  Q
    |        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  5141819 g--------ttgaattatgcagaacccactgtctgcataattgatttcctcgacagttaactg 5141873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 228 - 577
Target Start/End: Original strand, 52805325 - 52805674
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  52805325 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttatttatgt 52805424  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52805425 cagagtttcaatgttatatgaattattttgcc-tttggaaatactctggtttaattacaggtaaaagctgaccgaaaaatggcttggaaatg-tttagaa 52805522  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacg 525  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||||      
T  52805523 tcatgcagagcccactgtctgcataatttgttttcctcggcaattaactacagccggatttcaaattcgtcggcagttaactgccgagggggcaaaaaaa 52805622  T
Q  526 tattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||    
T  52805623 taaattacttgtgtgccacaaccttatcaaatgtgggaacatcaattctcaa 52805674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 381
Target Start/End: Original strand, 5081928 - 5082283
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5081928 gagatgaatacgcatggaaaacgacaaggtatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 5082027  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  |              ||||||    
T  5082028 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaaatatggatttaatttaatgatgtgtaaggagtact--------------ttaatt 5082113  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  5082114 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 5082213  T
Q  313 ttttcttgtttatgac--cgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaa 381  Q
    || ||||  ||||| |   |||||||| | |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5082214 ttatctttattatgtctgagagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttgaaaatgctctggtttaa 5082283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 212 - 475
Target Start/End: Original strand, 46886137 - 46886400
Alignment:
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46886137 tatggacactttgtaatgtttcgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 46886236  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggc 410  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  46886237 tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttggaaaggctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaaatggc 46886335  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  46886336 ttggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 46886400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33168422 - 33168082
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33168422 gagatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttgacttattttagacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 33168323  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaat 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| | | |    |||||    
T  33168322 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgagtgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttg--taatgtgttg---tttaat 33168228  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  33168227 tatggacactatgtaacgttttgatgattttcaaactttcgtgtactttgaactaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagataatata 33168128  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcag-tgttgtatgatttatattg 357  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||    
T  33168127 ttttccttgtttatgactgag-tacagatgttgtatgaattatattg 33168082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 207 - 454
Target Start/End: Original strand, 15051092 - 15051338
Alignment:
Q  207 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagata 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15051092 ttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagata 15051191  T
Q  307 ttgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaa 405  Q
    ||||| || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15051192 ttgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaa 15051290  T
Q  406 atggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15051291 atggcttggaaatg-tttagaattatgcagaactcactgtctgcataat 15051338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 228 - 577
Target Start/End: Original strand, 21144396 - 21144745
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21144396 cgttatgacgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatagacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgt 21144495  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
     ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21144496 tcgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttcgaaattctctgctttacttacagataaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 21144594  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacg 525  Q
    | || |||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| ||||| |  |||||||||| ||||||| | |||||||    
T  21144595 tcatacagagctcactgtcttcataatttgttttcctcggcacttaactgccgccggaattctaattccttcgcagttaactgccgagaa-gcaaaaacg 21144693  T
Q  526 tattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||  ||| ||||||| || |||||| |  ||||||  |||| ||||||||||    
T  21144694 taaattagtcgtgtgccagaaccttatcaaatgtgggaacaacaattctcaa 21144745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 228 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 94705 - 94480
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  94705 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 94606  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  94605 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactggtcaaaaaaagccttggaaatgttttagaa 94507  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    | ||||||| | || || |||||||||    
T  94506 tgatgcagagctcaatgcctgcataat 94480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 228 - 436
Target Start/End: Original strand, 22527460 - 22527667
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  22527460 cgttatgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaacatattgtatttatcttgtttatgt 22527559  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22527560 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaaaggcttggaaatgttttggaa 22527658  T
Q  428 ttatgcaga 436  Q
    | |||||||    
T  22527659 tgatgcaga 22527667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 228 - 454
Target Start/End: Original strand, 470835 - 471060
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||     
T  470835 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtataatttgaaccaaatgtcggtttgattaaattatgaacaatggtaaaagatattgtacttatcttgtttatgt 470934  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  470935 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaagacctggaaatgttttagaa 471033  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    | ||||||| | ||||| |||||||||    
T  471034 tgatgcagagctcactgcctgcataat 471060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 228 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 31780275 - 31780054
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  31780275 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 31780176  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| || | |||||  || |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  31780175 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-attcgaaatgctctggcttaattacaggtaaaaattggccgaaaaaatgcttggaaatattttagaa 31780077  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgca 450  Q
    | ||||||| | ||||| |||||    
T  31780076 tgatgcagagctcactgcctgca 31780054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 228 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 16282004 - 16281751
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16282004 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccagatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgtttatgt 16281905  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgtttt---- 423  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||        
T  16281904 ccgagttttaatgttgtatgaattattttgcc-tttcgaaatgctctgctttaattac-agtaaaaactgaccgaaaaatagtttggaaatgttttagaa 16281807  T
Q  424 agaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccgg 483  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16281806 agaatcatgcagagctcattgtctg----tttgttttcctcggcagttaactgcagccgg 16281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 232 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19521900 - 19521711
Alignment:
Q  232 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccga 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19521900 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatagacaattgtaaaagatatagtatttttcttgtttatgtccga 19521801  T
Q  332 gtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttt 422  Q
    |||||| || ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  19521800 gtttcaatgctgtatgaattattttgcc-tttcgaaatgctctgctttaattgcaggtaaaaagtgaccaaaaaatggcttggaaatgttt 19521711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 50617503 - 50617312
Alignment:
Q  236 tgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgt-atttttcttgtttatgaccgagtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| | |||||    
T  50617503 tgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaaatatggacaattgtaaaaaatattgtgtttttttttgtttatgtcagagtt 50617404  T
Q  335 tcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||| |||  ||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  50617403 tcaatgttgtatgaattattttgcc-tttcaaaatgttgtgctttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttgaaaatgttgtagaa 50617312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 331 - 471
Target Start/End: Original strand, 23359217 - 23359357
Alignment:
Q  331 agtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaatt 429  Q
    ||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23359217 agtttcaatcttgtatgaattattttgccttt-ggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttagaatt 23359314  T
Q  430 atgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagtt 471  Q
    |||||||||   ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  23359315 atgcagaacttgctgtctgtataatcagttttcctcggcagtt 23359357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 474
Target Start/End: Original strand, 47714877 - 47715089
Alignment:
Q  253 tgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgattta 352  Q
    |||||||| ||  |||||| || |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||| || | |    
T  47714877 tgtaattttaatgaaatgtcggattgattcaattatggacagctataaaagataatgtatttttgttgtttatgactgagtataaatgttgtacgactaa 47714976  T
Q  353 tattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcata 452  Q
    |||||  || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||        |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  47714977 tattgt-ttctggaaatgctctggttgaattataggtaaaaactagccgaaaaatggcttgg--------ttcaactatgcagaacccactgtctgcata 47715067  T
Q  453 attgtttttctcggcagttaac 474  Q
    |||| ||| ||| |||||||||    
T  47715068 attgctttcctcagcagttaac 47715089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 38689985 - 38689869
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||    
T  38689985 gttttccttggcagttaactgcagccggtttcgaattcctcgacatttaactaccgagggggtaaaagcgtattttactcatgtgacacagctttatgca 38689886  T
Q  556 atgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||||||||||| |||||    
T  38689885 atgtgtcaacaacaatt 38689869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 462 - 550
Target Start/End: Original strand, 6562186 - 6562275
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6562186 ctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactagtgtggcacaacctt 6562275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 455 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 46141837 - 46141715
Alignment:
Q  455 tgtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctg 553  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | || |||| ||    
T  46141837 tgttttcctcggcagttaactgcagccggttattgaattcctcggcagttaactgccgagagggcaaaatcgtattttacttgtgtacctcagccttatg 46141738  T
Q  554 caatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |||| |||||||| |||||||||    
T  46141737 caatatgtcaacaacaattctca 46141715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 36908626 - 36908515
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| | || |||| |  ||||||    
T  36908626 ctcggcagttaactgcagccggtttttgaattcttcgacagttaactgccgaggaggcaaaaatgtattttacttgtgtgcctcatccttataaaatgtg 36908527  T
Q  561 tcaacatcaatt 572  Q
    ||||||||||||    
T  36908526 tcaacatcaatt 36908515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 458 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 22345312 - 22345194
Alignment:
Q  458 ttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaat 557  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     ||||||||||  ||||||||||| | | ||||| |  |||    
T  22345312 ttttttcggcagttaactgcagccggtttcaaattcctcggcagttaactgccgatggaataaaaacgtaaattactcgtgtgccccgaccttatagaat 22345213  T
Q  558 gtgtcaacatcaattctca 576  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  22345212 gtgtcaatagcaattctca 22345194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Original strand, 49927532 - 49927653
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttc-aaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||  | |  || | ||     
T  49927532 gtttttctcggcagttaactatagccggtttttaaattcttcggcagttaactgccgaggggacaaaaacgtattttactcgtgtttctcggccatatga 49927631  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  49927632 aatgtgtcaacaacaattctca 49927653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 12643372 - 12643270
Alignment:
Q  395 ctggccgaaaaa-tggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccg-gtttcaaat 491  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12643372 ctggccgaaaaaatggcttgaaaatgttt-agaattatgcagaacaaactgtctgcataatcagttttcctcagcagttaactgcagccgaatttcaaat 12643274  T
Q  492 tctt 495  Q
    ||||    
T  12643273 tctt 12643270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27485112 - 27485029
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  27485112 tttttctcggcagttaactgcagccggatttttaattcctaggcagttaactgccgagggggcaaaaacgtattttactcgtgt 27485029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30905819 - 30905730
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  30905819 ctcggcagttaactgcagccggatttcaaatttctcggcagttaactgccgaggggataaaatcgtattttactggtgtggcacagcctt 30905730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 462 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 49924904 - 49924788
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||| | ||||   || |||||||||  ||||||||||| | || |||| |||||||||    
T  49924904 ctcggcagttaactgtagccggtttttgaatttttcggcagttaattgccgaaggggcaaaaacgtaaattactcgtgtgcctcagccttatgcaatgtg 49924805  T
Q  561 tcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||| ||||||||||    
T  49924804 tcaacaacaattctcaa 49924788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 52802184 - 52802116
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaa 523  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  52802184 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgagagggcaaaaa 52802116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 577
Target Start/End: Original strand, 46320482 - 46320594
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtc 562  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||    || ||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||      
T  46320482 tcggtagttaactgcagccggtttcaaa--cttcggtagttaactaccgcaggggcaaaaacgtcatttactcgtgtggcacaaccttatgtaatgtggg 46320579  T
Q  563 aacatcaattctcaa 577  Q
    |||| ||||||||||    
T  46320580 aacagcaattctcaa 46320594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 495 - 577
Target Start/End: Original strand, 6437598 - 6437680
Alignment:
Q  495 tcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||| | || | || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6437598 tcggcagttaactgccgagagggcaaaagcgtattttacttgtgtgcctcagctttatgcaatgtgtcaacaacaattctcaa 6437680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 575
Target Start/End: Original strand, 8460125 - 8460235
Alignment:
Q  465 ggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaa 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||  |  |||||||||| |||||| |||| | || |||| |  ||||||||||    
T  8460125 ggcagttaactgcagccgatttcaaattcctcggttgttaactaccgaggggacaaaaacgtatattactcatgtgcctcagccttatagaatgtgtcaa 8460224  T
Q  565 catcaattctc 575  Q
    || ||||||||    
T  8460225 cagcaattctc 8460235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 44465649 - 44465555
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  44465649 ttttcctcggcagtaaactgcagccggaattcaaattcctcggtagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactagtatggcacaacctt 44465555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 44470030 - 44470088
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  44470030 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgag 44470088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 51271610 - 51271732
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||  || ||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||     
T  51271610 gttttcctcggcaattaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgagggggcaaaaacgtcatttacccgtgtggcacaaccttatgt 51271709  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||    
T  51271710 aatttgggaacaacaattctcaa 51271732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 5077989 - 5077900
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  5077989 ctcggcagttaactgcagtcggatttcaaatttctcagcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactggtgtggcacagcctt 5077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 19054101 - 19053996
Alignment:
Q  468 agttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaaca 566  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||  | || |||| || ||||||||||||    
T  19054101 agttaactgcagccggtttttgaattcctcggcagttaactgtcgagggggcaaaaacgtattttactcgtgtttctcagccttatgaaatgtgtcaaca 19054002  T
Q  567 tcaatt 572  Q
     |||||    
T  19054001 acaatt 19053996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 466 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 23913901 - 23913816
Alignment:
Q  466 gcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | |||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23913901 gcagttaactgcagccggaattcaaattcctcggtagttaactgctgagggggtaaaatcgtattttactagtgtggcacaacctt 23913816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Original strand, 29765548 - 29765669
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||  |  ||||||||  |||| |||||||  |||||||| |||    
T  29765548 gttttcctcggcagttaactgcaaccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgaggggacaaaaacgtcatttattcgtgtggtacaaccttatgc 29765647  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    ||||||  |||| |||||||||    
T  29765648 aatgtgggaacaacaattctca 29765669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 457 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 41453891 - 41453834
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41453891 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactaccgag 41453834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Original strand, 46886406 - 46886527
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||  || ||||||||  |||||||||||  ||||||||| |      
T  46886406 gttttcctcggcacttaactacagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgagggggcaaaaacgtcatttactcgtgtagcacaaccttatca 46886505  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    ||||||| |||| |||||||||    
T  46886506 aatgtgtaaacaacaattctca 46886527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 46973258 - 46973141
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| || ||  || |||| ||||||||||| ||||| | || |||  ||     
T  46973258 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttttgaattcctcggcagttaactgccaagggggcaaaatcgtattttacttgtgtgtctcagcctaatga 46973159  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||||||||||| |||||    
T  46973158 aatgtgtcaacaacaatt 46973141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 49874987 - 49874942
Alignment:
Q  530 ttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  49874987 ttactcgtgtgacacaaccttatgcaatgtgtcaacaacaattctc 49874942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6558046 - 6557976
Alignment:
Q  404 aaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataatt-gtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6558046 aaatggcttgaaaatgttt-agaattatgcaga-cccattgtctgcataatcagtttttctcggcagttaact 6557976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15047330 - 15047278
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15047330 ctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgag 15047278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 539
Target Start/End: Original strand, 23276127 - 23276211
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||| || |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  23276127 gttttcctcggcagttaactgtagccggatttttaattcctcagcagttaactgccgagggggcaaaaacgtattttactcgtgt 23276211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 29261535 - 29261475
Alignment:
Q  415 aaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||||    
T  29261535 aaatgctttagaattatgcagaacccgctgtctccataattagttttctcgacagttaact 29261475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13972116 - 13971998
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||| ||||   || |||||||||||||||| ||||  | || |||| || |    
T  13972116 gttttcctcggctgttaactgcagccagtttttaattcctcggcagt-aactgccgaaggggcaaaaacgtattttacttgtgtttctcagccttatgaa 13972018  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  13972017 atgtgtcaacaacaattctc 13971998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 20349510 - 20349447
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggta 519  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  20349510 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggtagttaactgccgagagggta 20349447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 26633581 - 26633467
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||   ||||  || |||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||     
T  26633581 gttttcctcggcagttaactgcaaccggtttttgaattcttcggtagttaac---cgagggggcaaaagcgtattttacttgtgtgcctcaaccttatga 26633485  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||||||||||| |||||    
T  26633484 aatgtgtcaacaacaatt 26633467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 9618701 - 9618655
Alignment:
Q  530 ttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9618701 ttactcgtgtgacacagccttatgcaatgtgtcaacaacaattctca 9618655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 9711670 - 9711792
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||| | ||   || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |      
T  9711670 gttttcctcggcagttaactgcgaccggatttctaattcctcggcagttaactgctgatggggcaaaatcgtattttactagtgtgccacaaccttatca 9711769  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||  |||| ||||||||||    
T  9711770 aatgtgggaacaacaattctcaa 9711792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 467 - 564
Target Start/End: Original strand, 35527043 - 35527141
Alignment:
Q  467 cagttaactgcagccggtttcaaatt-cttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaa 564  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||| |||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||| || ||||||||||    
T  35527043 cagttaactgcagcctgtttttgatttcttcggcaattaactgccaagaaggcaaaaacgtattttacttgtgtgcctcagccttatgaaatgtgtcaa 35527141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1179942 - 1179877
Alignment:
Q  207 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtt 272  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||    
T  1179942 ttaattgtggacactctttaatgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgtt 1179877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 6557968 - 6557911
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6557968 ttttcctcggcagttaactgcagccgaatttcaaattcctcggcagttaactgccgag 6557911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Original strand, 41804052 - 41804169
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||||| | || |||| |      
T  41804052 gttttcctcggcagttaactgcagtcggtttttgaattcctcggcagttaactgccgaaggggcaaaagcgtattttacttgtgtgcctcagccttataa 41804151  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||||||||||| |||||    
T  41804152 aatgtgtcaacaacaatt 41804169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 641032 - 640985
Alignment:
Q  530 ttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  641032 ttactagtgtgacacagccttatgcaatgtgtcaacaacaattctcaa 640985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 576
Target Start/End: Original strand, 2425714 - 2425824
Alignment:
Q  466 gcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaa 564  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||  |||||||  ||  |||||||||||| |||  ||||| ||||||||  ||    
T  2425714 gcagttaactgcagccggatttccaaaacttcggcagttaactgccgagg-ggtaaaagggttatttactcgtgtgtcacggccttccgcaatgtgggaa 2425812  T
Q  565 catcaattctca 576  Q
    || |||||||||    
T  2425813 caacaattctca 2425824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 15051053 - 15051088
Alignment:
Q  154 gtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagt 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15051053 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagt 15051088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29261601 - 29261538
Alignment:
Q  299 aaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttt 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||| | ||||||| |||||    
T  29261601 aaaagatattgtattttacttgtttatgactgaatttaaatgttgtataagttatattaccttt 29261538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 35521654 - 35521551
Alignment:
Q  470 ttaactgcagccggtttcaaatt-cttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatc 568  Q
    |||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||| | || |||| |  |||||||||||| |    
T  35521654 ttaactgcagccggttttttatttcctcggcagttaactgccgagagggcaaaatcgtattttacttgtgtgcctcagccttataaaatgtgtcaacaac 35521555  T
Q  569 aatt 572  Q
    ||||    
T  35521554 aatt 35521551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 518 - 576
Target Start/End: Original strand, 15354640 - 15354698
Alignment:
Q  518 taaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||    
T  15354640 taaaaacgtcatttactcgtgtgacacaaccttatgtaatgtgggaacagcaattctca 15354698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 23359368 - 23359426
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  23359368 gttttcctcggtagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcaattaactgccgag 23359426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 29435020 - 29434942
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||  |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29435020 tcggaagttaactgcagtcggttattgaattcttcgaaagttaactgccaagagggtaaaaacgtattttattcgtgtg 29434942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 36076577 - 36076698
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||  ||||||| |||| | ||  ||||||||||||||| ||||  | || |||| ||     
T  36076577 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttttgaattcctcggtggttaactaccga-aggggtaaaacgtattttacttgtgtttctcagccttatga 36076675  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  36076676 aatgtgtcaacagcaattttcaa 36076698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 466 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44596905 - 44596795
Alignment:
Q  466 gcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaa 564  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||  || ||||||||  |||||||||||| ||||  ||| || ||||||  ||    
T  44596905 gcagttaactgcaaccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgagcgggcaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagtcttatgtaatgtgggaa 44596806  T
Q  565 catcaattctc 575  Q
    || ||||||||    
T  44596805 caacaattctc 44596795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 48751429 - 48751551
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| | | |||||  ||||||| ||||||||||| ||||  | || |||| |      
T  48751429 gttttcctcggcaattaactgcagccggatttttaattcctcggcagttcagtgccgagggggtaaaatcgtattttactagtgtttctcagccttatca 48751528  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  48751529 aatgtgggaacatcaattctcaa 48751551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 94463 - 94343
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||| |||| | || ||||||||  ||||||| |||| |||| |||| |      
T  94463 gttttcctcggtagttaactgcagctggatttctaaaacttcggcagttaactgccga-agggcaaaaacgtcatttactcatgtggcacagccttatca 94365  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    ||||||| |||| |||||||||    
T  94364 aatgtgtaaacaacaattctca 94343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1872091 - 1872042
Alignment:
Q  526 tattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1872091 tattttactcgtgtgcctcagccttatgcaatgtgtcaacaacaattctc 1872042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 327
Target Start/End: Original strand, 10165606 - 10165703
Alignment:
Q  230 ttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| | | |||| || ||||||  || ||| |||||| ||||||    
T  10165606 ttttgttgaatttcaaacattcgtgtaattttaacaaaatgttgaattgatttaatttttgtcaatggtgaaagattatgcattgttcttgcttatga 10165703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Original strand, 18975139 - 18975260
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || ||| | |||||| ||| ||||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||  | || | || | |    
T  18975139 gttttcctctgcagttaactgcaaccagttattaaattcctcgacagttaaccgccgagggggcaaaaacgtattttacttgtgtacctcagctttatac 18975238  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18975239 aatgtgtcaacaacaattctca 18975260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19161946 - 19161889
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  19161946 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccga 19161889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 325
Target Start/End: Original strand, 25234017 - 25234106
Alignment:
Q  236 tgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttat 325  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||  || |||||||| ||  ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  25234017 tgaatttcaaacattcgtgttattttaacgaaatgttgaattaatttaattttgatcaattgtgaaagattatgtattgttcttgtttat 25234106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 575
Target Start/End: Original strand, 32161321 - 32161431
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtc 562  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||    || ||||||||  |||||||||||| |||| |||| || ||||||      
T  32161321 tcggtagttaactgcagccggttccaaa--cttcggtagttaactgccgcaggggcaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagccttatgtaatgtggg 32161418  T
Q  563 aacatcaattctc 575  Q
    |||| ||||||||    
T  32161419 aacaacaattctc 32161431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Original strand, 44050650 - 44051104
Alignment:
Q  19 aatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattata 118  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44050650 aatacgcatggaaaacaacaagctatatgt-ttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatattata 44050748  T
Q  119 catgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggac 218  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44050749 tatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgcaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggac 44050848  T
Q  219 actttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44050849 actttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttct 44050948  T
Q  319 tgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaat 418  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44050949 tgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaat 44051047  T
Q  419 gttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44051048 gctttagaattatgcagaacccactgtttgcataattgttttcctcggcagttaact 44051104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 550
Target Start/End: Original strand, 37394768 - 37395306
Alignment:
Q  14 agatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatata 113  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37394768 agatgaatacgcatggaaaacggcaagttgtatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 37394867  T
Q  114 ttatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatta 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394868 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatta 37394967  T
Q  214 tggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394968 tggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 37395067  T
Q  314 tttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggctt 412  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37395068 tatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattatttttcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggctt 37395166  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttcc 510  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | |     
T  37395167 gaaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcaattaactgcagccggatttcaaattcctcgacagttaagtgct 37395265  T
Q  511 gagaaggtaaaaa-cgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37395266 gagggggcaaaaatcgtattttactagtgtggcacaacctt 37395306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Original strand, 10422984 - 10423418
Alignment:
Q  25 catggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10422984 catggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcggcgattgcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgta 10423083  T
Q  125 tgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |              ||    
T  10423084 tgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatctaatgatatgtaatgagttgtttaattatggacacat--------------tg 10423169  T
Q  225 taacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgttta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10423170 taacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatat-gtatttttcttgttta 10423268  T
Q  325 tgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgtttta 424  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  10423269 tgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgccttt-gaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttggaattgcttta 10423367  T
Q  425 gaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10423368 gatttatgcaaaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaact 10423418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 18579141 - 18578618
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18579141 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggctaattgaagacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 18579042  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaat 211  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | | |    |||||    
T  18579041 attatatatgtatgttagttctatatgcaattgcgttgaatgtaagaagtgatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt--aatgtgttgt---ttaat 18578947  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18578946 tatggacactatgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 18578847  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggct 411  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18578846 ttttacttgtttatgagtgagtttaaatgttgtataagttatattgcc-tttggaaatactctggttgaattacaagtaaaaactagccgaaaaatggct 18578748  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccg-gtttcaaattcttcggcagttaacttcc 510  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||| ||| ||||||||| ||    
T  18578747 tggaaatgcttaacaattatgcagaatccactgtctgcataaatgtttttctcggcagataactgcagccgttttttgaattcctcgacagttaactgcc 18578648  T
Q  511 gagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
     || ||| ||||| |||||||||| |||||    
T  18578647 aaggaggcaaaaatgtattttacttgtgtg 18578618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 38460934 - 38460489
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  38460934 gagatgaatgcgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgttggatttatgtttcagaatatggtggaaaataatat 38460835  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||||||||| |||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  38460834 attatatatgtatgtttgttgcatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt---- 38460739  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38460738 ----------tgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattatat 38460649  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38460648 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggctt 38460550  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaa 473  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38460549 ggaaatgctttagaattatgcagaacccactgactgcataattgttttcctcggcagttaa 38460489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 3407803 - 3408230
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3407803 gagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 3407902  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  3407903 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt---- 3407998  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaa-tgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3407999 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 3408088  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggc 410  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3408089 tttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaaatggc 3408187  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3408188 ttggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctacataat 3408230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 481
Target Start/End: Original strand, 4774168 - 4774631
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4774168 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatggcttggcttatttgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 4774267  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaat 211  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | | |    |||      
T  4774268 gttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgcatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt--aatgtgttgt---ttatg 4774362  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
     ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4774363 catggacactatgtaacgatttaatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaatgatattgta 4774462  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggct 411  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| | |||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  4774463 ttttacttgcttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattggc-tttggaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactagtcgaaaaatggct 4774561  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagcc 481  Q
    |||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4774562 tggaaatgcttaacaattatgcagaaaccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaactacagcc 4774631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19069709 - 19069248
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19069709 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcgggtttatgtttcggaatatggtggaagataatat 19069610  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |     
T  19069609 attatacatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagtagtttaattatggacactttgta 19069510  T
Q  213 atggacactttgtaacgt----tttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatatt 308  Q
    |||     ||||    ||    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19069509 atg----ttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatatt 19069414  T
Q  309 gtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaat 407  Q
     || || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19069413 ttacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggtcgaaaaaat 19069315  T
Q  408 ggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19069314 ggcttggaaatg-tttacaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 19069248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 49564351 - 49563923
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  49564351 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 49564252  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  49564251 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 49564160  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  49564159 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaatatattgtat 49564066  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  49564065 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 49563967  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  49563966 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 49563923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10374548 - 10374240
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10374548 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacatcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataatat 10374449  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||              
T  10374448 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatgg---------- 10374359  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
        |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10374358 ----acaccttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttcatttaattatggacaactgtaaaaggtattgtat 10374263  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagttt 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  10374262 ttttcttggttatgaccgagttt 10374240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 105 - 482
Target Start/End: Original strand, 50904819 - 50905179
Alignment:
Q  105 gataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggac 204  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  50904819 gataatatattatatttgtatgtttgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgaaatgaattgtttaattatgaac 50904918  T
Q  205 acttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaaga 304  Q
    ||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50904919 actt--------------tgtatcgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaaga 50905004  T
Q  305 tattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaa 404  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50905005 tttcatatttttcttgtttatgttcgagtttcaatgttgtatgatttatattg-catttagaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaa 50905103  T
Q  405 aatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccg 482  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  50905104 aatggcttggaaatgcattagaattatgcagaactcactgtctg--taattgttttcctcggcagttaactgccgccg 50905179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 51642423 - 51642096
Alignment:
Q  115 tatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaatta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||| | | |    |||||||    
T  51642423 tatatatgtatgttcgttctatatgtaattgtgatgaatgtaagttgggatttaacttaatgatatgtaatgagttgt--aatgtgttgt---ttaatta 51642329  T
Q  214 tggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51642328 tggacaatttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 51642229  T
Q  314 tttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttg 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| |||    
T  51642228 tttcttgtttatgatcgagtttcaatattgtatgatttatattgcc-tttgaaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttg 51642141  T
Q  414 gaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtt 458  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51642140 aaaatgctttaaaattatgcagaacccactatctgcataattgtt 51642096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 228 - 575
Target Start/End: Original strand, 50278588 - 50278937
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50278588 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttcaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaataattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgt 50278687  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttaga 426  Q
    |||||||||| ||||||||   |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||    
T  50278688 ccgagtttcaatgttgtatagattattttgcc-tttcgaaatgctctgttttaattacaggtaaaaactgatcgaaaaaatggcttgaaaatattttaga 50278786  T
Q  427 attatgcagaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaac 524  Q
    || ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||  ||||  |  ||||||    
T  50278787 atcatgcagagctcactgtctgcataatttgttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaattcatcgacagttaactgtcgaggggacaaaaac 50278886  T
Q  525 gtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||| |  ||||||  |||| ||||||||    
T  50278887 gtaaattactcgtgtgccacaaccttatcaaatgtgggaacaacaattctc 50278937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24415679 - 24415392
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgt--cttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataat 110  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  24415679 gagatgaatacacatggaaaacgacaagctatatatgccttgacttattgaagacgatagcgacgttgcatttatgtttcggaatatgatggaaaataat 24415580  T
Q  111 atattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacactta 209  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| | | |    |||    
T  24415579 atattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttg--taatgtgttg---ttta 24415485  T
Q  210 attatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415484 attatggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 24415392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44674440 - 44674099
Alignment:
Q  233 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgag 332  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  44674440 tgatgaattttaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtacttatcttgtttatgtccgag 44674341  T
Q  333 tttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatg 432  Q
    ||||| |||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44674340 tttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctgatttaattac-agggaaaactggccaaaaaaaggcttggaaatgttttagaatgatg 44674243  T
Q  433 cagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagcc-ggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattt 530  Q
    |||| | ||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||| || ||  || ||||||||  ||    
T  44674242 cagagctcactgcctgcataatcagatttcctcggcagttaactgcagccgggtttcttaaacttcggcagttaactgccaag-gggcaaaaacgtcatt 44674144  T
Q  531 tactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||  |||| ||||||||    
T  44674143 tactcgtgtggcacaaccttatgtaatgtgggaacaacaattctc 44674099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 233 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 51492374 - 51492132
Alignment:
Q  233 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||    
T  51492374 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtacttatcttgtttatgttcgag 51492275  T
Q  333 tttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatg 432  Q
    ||| | |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  51492274 ttttaatgttgtatgaattattttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaatctggctgaaaaaaggcttggaaatgttttagaatgatg 51492176  T
Q  433 cagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||| | ||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  51492175 cagagctcactgcctgcataatcagatttcctcggcagttaact 51492132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 231 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 15996026 - 15995783
Alignment:
Q  231 tttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||    
T  15996026 tttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccg 15995927  T
Q  331 agtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaatt 429  Q
    | ||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15995926 actttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttagaatt 15995829  T
Q  430 atgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15995828 atgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 15995783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 228 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 37016206 - 37015959
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  37016206 cgttatgatgaatttcaaacgtttctgtaatttgaatcaaacgtcagtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 37016107  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| || ||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  37016106 ccgagtttcaatgatgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggctgaaaaaagacttgaaaatgttttagaa 37016008  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataatt-gtttttctcggcagttaact 475  Q
    | ||||||| | ||||| || ||||||| | ||| || |||||||||||    
T  37016007 tgatgcagagctcactgcctccataattagatttcctgggcagttaact 37015959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6187140 - 6186714
Alignment:
Q  40 gctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatg 139  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6187140 gctatgtgtcttggcttattcacgacgatagcgacattggatttatgtttagcaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatg 6187041  T
Q  140 caattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatga 238  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||  |||| | | |    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  6187040 caaatgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaatgatatgtaatatgttg--taatgtgttg---tttaattatggacaccctttaatgttttgatga 6186946  T
Q  239 atttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtt--tatgaccgagtttc 336  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||| |     
T  6186945 atttcaaacatacgtgtaattttaacgaaatgtcggattgatttaattattgactactataaaagataatgtatttttcttgtttatatgactgagtata 6186846  T
Q  337 agtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcaga 436  Q
    | ||||||| || |  ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||        |  ||||||| |||    
T  6186845 aatgttgtacgactagtattgcc-ttcggaaatgctttggttgaattacaggtaaaaactgattgaaaaatggtttgg--------ttcaattatgtaga 6186755  T
Q  437 acccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  6186754 acccattgtctgcataattactttcctcggcagttaactgc 6186714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 11506658 - 11506831
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  11506658 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttgacttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaaaataatat 11506757  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatg 186  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  11506758 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatggatttaatataatgatgtgtaatg 11506831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 298 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 24415072 - 24414911
Alignment:
Q  298 taaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactg 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||| | ||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24415072 taaaaaatattgtatttttcttgcttatgattgagtttaaatgttttctgagttatattatcttt-ggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactg 24414974  T
Q  398 gccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttt 460  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24414973 tccgataaatggcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttt 24414911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 477
Target Start/End: Original strand, 30043023 - 30043436
Alignment:
Q  49 cttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgt 148  Q
    ||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||| | | |    
T  30043023 cttggcttattcagggcgataatgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatttgtattttcgttccatttgcaacttcat 30043122  T
Q  149 tgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacg 248  Q
     |||||| |  || ||||| ||||||  || ||||||| |||||    |  ||     |||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||     
T  30043123 agaatgtcaccagagatttcatttaacgatatgtaatgtgttgtagtgtgttgt----ttaattatgg-cactctttaatgttttgataaatttcaaaca 30043217  T
Q  249 tttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatga 348  Q
    |  ||||||||| |||   | || || |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||| | | ||||||| ||    
T  30043218 tccgtgtaattttaactctacgtcggattgatttaattatggataattgtaaaagataatacatttttcttgtttatgacttagtataaatgttgtacga 30043317  T
Q  349 tttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctg 448  Q
     |  |||||||| || |||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||||||        |  ||||||||| |||| | ||||||    
T  30043318 atagtattgcctctt-gaaatgctctggttgaatttcatgtaaaaactggtcg-aaaatggcttgg--------ttcaattatgcaaaacctattgtctg 30043407  T
Q  449 cataattgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30043408 cataattgttttcctcagcagttaactgc 30043436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 470 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 6280897 - 6280790
Alignment:
Q  470 ttaactgcagccggtttc-aaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatc 568  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |    
T  6280897 ttaactgcagccggtttttaaattctttgacagttaactgccgagagggcaaaaacgtaaattactcgtgtgccccaaccttatgcaatgtgtcaacaac 6280798  T
Q  569 aattctca 576  Q
    ||||||||    
T  6280797 aattctca 6280790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 9890048 - 9889953
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  9890048 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactggtgtggcacagcctt 9889953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 16984180 - 16984302
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||| |||| |||| |      
T  16984180 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgagggggtaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagccttatca 16984279  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||| |||| ||||||||||    
T  16984280 aatgtgtaaacagcaattctcaa 16984302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 455 - 572
Target Start/End: Original strand, 37959738 - 37959856
Alignment:
Q  455 tgtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctg 553  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||    
T  37959738 tgttttcctcggcagttaactgcagctggttattaaattcctcaacagttaactgccgagggggtaaaaacgtattttactcgtgtgcctcagccttatg 37959837  T
Q  554 caatgtgtcaacatcaatt 572  Q
     |||||||||||| |||||    
T  37959838 taatgtgtcaacaacaatt 37959856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16983576 - 16983456
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||| |||| |||| |      
T  16983576 gtttttctcggcagttaactgtagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgagggggtaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagccttatca 16983477  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  16983476 aatgtgtaaacaacaattctc 16983456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 955846 - 955729
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| || |||||||||| || |  ||| |||||||||||||||| ||||| | |||| || ||     
T  955846 gtttttctcggcagttaactgcagccgatttttgaattcctcagcagttaactgccaaagaggcaaaaacgtattttacttgtgtgcctcaactttatga 955747  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||||||||||||||||||    
T  955746 aatgtgtcaacatcaatt 955729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 457 - 572
Target Start/End: Original strand, 21472504 - 21472620
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||  | || |||| || |    
T  21472504 ttttcctcggcagttaactgcagccgatttttgaattcctcggcagttaactgccgaggcggcaaaaacgtattttactcgtgtttctcagccttatgaa 21472603  T
Q  556 atgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21472604 atgtgtcaacaacaatt 21472620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 39588140 - 39588025
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  39588140 ctcggcagttaactgcagtcgaatttctaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaaacgtcatttactcgtgtgacacatccttatgcaatatg 39588041  T
Q  561 tcaacatcaattctca 576  Q
      |||| |||||||||    
T  39588040 agaacaacaattctca 39588025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 577
Target Start/End: Original strand, 4979946 - 4980058
Alignment:
Q  466 gcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaa 564  Q
    |||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||||| |||||   | |||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  4979946 gcagttaactgcagccggtttttgaaatcgtcgacagttaactgccgagggaggaaaaacgtaaattactcgtgtgcctcaaccttatgcaatgtgtcaa 4980045  T
Q  565 catcaattctcaa 577  Q
    || ||||||||||    
T  4980046 caacaattctcaa 4980058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 462 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 50274808 - 50274724
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacaca 545  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  50274808 ctcggcagttaactgcagccggatttctaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaaacgtaaattactcgtgtgccaca 50274724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 11494597 - 11494514
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| | |||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  11494597 gttttcctcggcagttaactgcagccggttttgaattcctcgacagttaattgccgaggggacaaaaacgtattttactcgtgt 11494514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 28320538 - 28320491
Alignment:
Q  530 ttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28320538 ttactcgtgtgacacaaccttatgcaatgtgtcaacaacaattctcaa 28320491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 37394296 - 37394209
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacc 548  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  37394296 ctcggcagttaactgcatccggatttcaaattcctcgacagttaactgccgaagaggcaaaatcgtattttactagtgtggcacaacc 37394209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 577
Target Start/End: Original strand, 38464796 - 38464906
Alignment:
Q  467 cagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaaca 566  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||  |||| | | |||| | |||||||||| |||  | ||||||| || ||||||||||||    
T  38464796 cagttaactgcagccggtttcgaattcctcgtcatttaactgtcgaggaagcaaaatcatattttactcatgtacctcaaccttatgaaatgtgtcaaca 38464895  T
Q  567 tcaattctcaa 577  Q
     ||||||||||    
T  38464896 acaattctcaa 38464906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Original strand, 29700321 - 29700438
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||| ||||| | || |||| ||     
T  29700321 gttttcctcggcagttaactgcagccggttattgaattcctcagcagttaactgtcgaggagacaaaagcgtattttacttgtgtgcctcagccttatga 29700420  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||||||||||| |||||    
T  29700421 aatgtgtcaacaacaatt 29700438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 33383859 - 33383750
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| || ||| || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |  |||||| ||     
T  33383859 gttttcctcggcagttaactgcagtcggtttttaaaatcctcgacaattaactaccgagaaggcaaaaatgtattttacttgtgtgcctaaaccttatga 33383760  T
Q  555 aatgtgtcaa 564  Q
    ||||||||||    
T  33383759 aatgtgtcaa 33383750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3403900 - 3403844
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3403900 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccga 3403844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 49572919 - 49573039
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||| |||||||||  |||   || |||||||||||||||| ||||| | || |||| |||    
T  49572919 gttttcctcggcagttaactgcagccgattattgaattcctcgacagttaactgtcgatggggcaaaaacgtattttacttgtgtgcctcagccttatgc 49573018  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  49573019 aatgtgtcaacaacgattctc 49573039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 51492125 - 51492006
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||     
T  51492125 gttttcctaggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcgacagttaattgccgagaagc-aaaaacgtcatttactcgtgtggcacaaccttatgt 51492027  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||  |||| ||||||||    
T  51492026 aatgtgggaacaacaattctc 51492006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 466 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 41023430 - 41023363
Alignment:
Q  466 gcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtatttta 532  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  41023430 gcagttaactgcagccggatttcaaatttctcggcagttaactgccaaggaggtaaaatcgtatttta 41023363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 378 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 44795189 - 44795056
Alignment:
Q  378 ttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||   ||||| ||||| |   | |||||||||||||| |||||    
T  44795189 ttaattacaggtaaaa-ctggccgaaaaaaggcttgaaaatgttttagaatgatgcagagttcactgcctgca-atcagattttctcggcagtttactgc 44795092  T
Q  478 agccggttt-caaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
     ||| |||| | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  44795091 cgccagtttactaaaacttcggcagttaactgccga 44795056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15995776 - 15995718
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  15995776 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcatttaactgccgag 15995718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19069241 - 19069183
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  19069241 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcatttaactgccgag 19069183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Original strand, 44051117 - 44051231
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttcaaatt-cttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||  ||||   || |||||||||  ||||| ||||| | || |||| |||||||||    
T  44051117 ctcgggagttaactgcagccggtttcttatttcctcggcagttaaccgccgatggggcaaaaacgtaaattactggtgtgcctcagccttatgcaatgtg 44051216  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
    |||||| ||||||||    
T  44051217 tcaacaacaattctc 44051231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 457 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1041988 - 1041932
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  1041988 tttttctcggcagttaactgcagtcggatttctaattcctcggcagttaactgccga 1041932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 18884523 - 18884581
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg--tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  18884523 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttttcaaaat-ttcggcagttaactgccgag 18884581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31598954 - 31598814
Alignment:
Q  58 ttcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaa 157  Q
    |||| ||||| |||||| |  ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||| || | || ||||||||  ||||  ||||| |||||| |    
T  31598954 ttcgtgacgacagcgacataagatttatgtttagacatatggttgaaaataatatattatatatttgtggtcgttctaactgcatgtgcgtagaatgtca 31598855  T
Q  158 gtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaatt 198  Q
    |||| ||||| || ||||  | |||||||||||| ||||||    
T  31598854 gtagagatttcatataatgttatgtaatgagttgcttaatt 31598814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 457 - 572
Target Start/End: Original strand, 44561350 - 44561466
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattct-tcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||   |||   ||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||||||||||  | || |||| || |    
T  44561350 ttttcctcggtagttaactgcagccggttttttatttactcggcagttaacaaccgagagggcaaaatcgtattttactcgtgtttctcagccttatgaa 44561449  T
Q  556 atgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||||||||||| |||||    
T  44561450 atgtgtcaacaacaatt 44561466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 459 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 4768729 - 4768615
Alignment:
Q  459 tttctcggcagttaactgcagcc-ggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaat 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||   ||||||||| |||||   || |||| || |||    
T  4768729 tttctcggcagttaactgcagccagattttgaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaattatattttacttgtgtgcatcagccttatgaaat 4768630  T
Q  558 gtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||||||||| |||||    
T  4768629 gtgtcaacaacaatt 4768615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 14201549 - 14201604
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||    
T  14201549 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccgag 14201604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 15999818 - 15999876
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  15999818 gttttcctcggcagttaattgcagccggatttcaaatttctcggcagttaactgccgag 15999876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 499 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 21470913 - 21470851
Alignment:
Q  499 cagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgt 561  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||    
T  21470913 cagttaactgccgagaagacaaaaacgtattttacttgtgtgcctcaaccttatccaatgtgt 21470851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 39590587 - 39590709
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||  ||||||||||||||| |||||  || |||||| |  |||||||||||| |||| |||| |      
T  39590587 gttttcctcggcagttaactgcagctgtatttctaaaacttcggcagttaactgccgagggggcaaaaacatcatttactcgtgtggcacagccttatat 39590686  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||  |||| ||||||||||    
T  39590687 aatgtggaaacagcaattctcaa 39590709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 51642062 - 51642012
Alignment:
Q  510 cgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  51642062 cgagaaagcaaaaacgtattttactcgtgtgatacatccttatgcaatgtg 51642012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Original strand, 958613 - 958729
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || ||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||  |||| | || |||| |      
T  958613 gttttcctcggcagttaactgcaaccggtttttgaattcatc-gcagttaactgtcgagaggacaaaaacgtattttacttatgtgcctcagccttataa 958711  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||||||||||||||||||    
T  958712 aatgtgtcaacatcaatt 958729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 17139677 - 17139648
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccggttt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17139677 tttttctcggcagttaactgcagccggttt 17139648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 512
Target Start/End: Original strand, 23221689 - 23221743
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||    
T  23221689 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccga 23221743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38368282 - 38368228
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||    
T  38368282 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccga 38368228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 46253537 - 46253483
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||    
T  46253537 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccga 46253483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 55587409 - 55587355
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||    
T  55587409 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccga 55587355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 512
Target Start/End: Original strand, 55588306 - 55588360
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||    
T  55588306 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccga 55588360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 483
Target Start/End: Original strand, 43376843 - 43377312
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43376843 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggtttattcgcgacgatagtgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 43376942  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43376943 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 43377042  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43377043 aaggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaacttgaaccaaatttcggtttcatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 43377142  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43377143 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggctt 43377241  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccgg 483  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43377242 ggaaatgctttagaattatgtagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaattgcagccgg 43377312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2124703 - 2124248
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2124703 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacaatagcgactttggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 2124604  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2124603 attatatatgtattttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggacttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 2124504  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  2124503 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaactatggacaactgtaaaagatattatat 2124404  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggttta---attacaagtaaaaactggccgaaaaatgg 409  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  2124403 ttttcttggttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaaatattccaggtaaaaagtggccgaaaaatgg 2124305  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcgg 466  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2124304 cttggaaatgcattagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcgg 2124248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 31959611 - 31960051
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  31959611 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaaaataatat 31959710  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31959711 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtatggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacaattaatt 31959810  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31959811 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtgggtttaatttaatcatgaacaattgtaaaagatattgtat 31959910  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| |||||||||| | || ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31959911 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttatatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 31960009  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  31960010 tgcaaatg-tttagaattatgcagaacttgctgtctgcataat 31960051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 39966 - 39499
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39966 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgtctttgcttattcgcaacgacggcgatgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 39867  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  39866 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt---- 39771  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39770 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaatgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 39681  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| | ||| |||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  39680 ttatcttgtttatgtctgaggttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaaatggct 39582  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattc 493  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39581 tggaaatg-tttagaattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattc 39499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 35962816 - 35962368
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35962816 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 35962717  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||        
T  35962716 attatatacgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgcaatgagttgtttaattatgcacactt---- 35962621  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35962620 ----------tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatttcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 35962531  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||  |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  35962530 ttatcttgtttatatccgagttttaatgttgtatgaattattttgcctttt-gtaatactctggtataattacacgtaaaaattggccgaaaaaatggct 35962432  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  35962431 tgaaaatg-tttagaattatgcagaacccactgcctgcataatcagttttcctcggcagttaact 35962368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23924474 - 23924032
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23924474 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 23924375  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  23924374 attatatatgtatgttcgttccatatgcagttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt---- 23924279  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  23924278 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 23924189  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    || |||| |||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23924188 ttatcttttttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctagtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggctt 23924090  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagt 470  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  23924089 gaaaatg-tttagaattatgcataatccattgtctgcataatcagttttcctcggcagt 23924032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 43679905 - 43679458
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43679905 gagatgaacacgcatggaaaacgacaagttatatgccttgacttattaaagacgatagagacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 43679806  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||        
T  43679805 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagcagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgtttaattatgaacactt---- 43679710  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43679709 ----------tgtaacgttttgatgaattttaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 43679620  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||  ||    
T  43679619 ttttcttgtttatgaccgagtttcaattttgtatgatttatattgcc-tttggaaatattttggtttaattacatgtaaaaattagccaaaaaatgattt 43679521  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||    
T  43679520 ggaaatgctttagaattatgcaaaacccactgtctgtataattattttcttcggcagttaact 43679458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 109 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 39751473 - 39751008
Alignment:
Q  109 atatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751473 atatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattacgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt 39751374  T
Q  209 aattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatatt 308  Q
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39751373 --------------tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcagtttgatttaattacggacaactgtaaaagatatt 39751288  T
Q  309 gtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatg 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||     
T  39751287 gtatttttcttggttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgtc-tttggaaatgctctggtttaattatagttaaaaactggccaaaaaata 39751189  T
Q  409 gcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataatt--------------gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattct 494  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39751188 gcttggaaatgcattataaatatgcagaatccactgtctgcataactgttttcctgccgaggttttcctcggcagttaactgcagccggtttcaaattca 39751089  T
Q  495 tcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  39751088 tcggcagttaattgccaagggggcaaaaacgtattttactcgtgtgcctcaacattatgcaatgtgtcaacagcaattctc 39751008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 50 - 465
Target Start/End: Original strand, 4867394 - 4867804
Alignment:
Q  50 ttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgtt 149  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4867394 ttggcttattcgagatgataacgacgtcggatttatgtttcggattatggtggaaaataatatattatatacgtatgttcgttccatatccaattgcgtt 4867493  T
Q  150 gaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||| | | |    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  4867494 gaatgtaagtagggatttaatttaatgataagtaatgagttgt--aatctgttgt---ttaattatggagactatgtaatgttttgatgaatttcaaact 4867588  T
Q  249 tttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatga 348  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  4867589 tttgtgtattttaaatcaaatgttggtttgatttaattatggacaatggtgaaagatattgtatttttcttgtttatgactgagtttaaatgttgtatga 4867688  T
Q  349 tttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctg 448  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4867689 gttatattgcc-tttggaaatgctctagtttaattacaagtaaaaactggccaaaaaatggcttggaaatgctttagaattatgcaaaacccactgtctg 4867787  T
Q  449 cataattgtttttctcg 465  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  4867788 catagttgttttcctcg 4867804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 7344120 - 7344547
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7344120 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 7344219  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              ||||||    
T  7344220 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaatt 7344305  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7344306 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctatttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtat 7344405  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggc 410  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7344406 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggc 7344504  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7344505 ttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 7344547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Original strand, 22588006 - 22588316
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22588006 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtcttggctaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaagataatat 22588105  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              ||||||    
T  22588106 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt--------------ttaatt 22588191  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22588192 atggacactttgtaacgttttgatcaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttgatttaattatggataattgtaaaagatattgtat 22588291  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttca 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  22588292 ttttcttgtttatgatcgagtttca 22588316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 30301644 - 30301231
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30301644 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 30301545  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  30301544 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 30301453  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30301452 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtat 30301359  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30301358 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 30301260  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacc 439  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30301259 cttggaaat-acttagaattatgcagaacc 30301231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 32376161 - 32375734
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32376161 gagatgaatacgcatgggaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 32376062  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  32376061 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 32375970  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32375969 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcgatttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 32375876  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  |||||  ||||||||| |  |   ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32375875 ttatcttcattatgttcgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 32375778  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32375777 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 32375734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8419914 - 8419487
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8419914 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 8419815  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  8419814 attatatatgtacgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 8419723  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8419722 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 8419629  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  8419628 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacagataaaaactggccgaaaaaatgg 8419531  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  8419530 cttggaaat-acttagaattatgcagaacttattgtctgcataat 8419487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 128 - 572
Target Start/End: Original strand, 20548938 - 20549368
Alignment:
Q  128 tcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||    
T  20548938 tcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaaggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaa--------------ttatggacactttgtaa 20549023  T
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  20549024 tgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatttcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatat 20549123  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| | |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  20549124 ccgagtttcaatcttgtatgaattattttgtc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaatgatggcttggaaatg-tttagaa 20549221  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccg-gtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacg 525  Q
    |||||||||||   |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||  |    
T  20549222 ttatgcagaacttgctgtctgcataatcagttttcctcggtagttaactgcagccgaatttcaaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaagag 20549321  T
Q  526 tattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||   |||||||||| ||||||||| || || |||| |||| |||||    
T  20549322 taaaatactcgtgtggcacaaccttatgtaaagtgtaaacaacaatt 20549368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Original strand, 7171881 - 7172179
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  7171881 gagatgaatacgcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 7171980  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaat 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| | | |    |||||    
T  7171981 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtactgagttg--taatgtgttg---tttaat 7172075  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7172076 tatggacactatgtaacgttttcatgaatttcaaacttttgtgtattttgaacaaaatgtgggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 7172175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 238 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 41744162 - 41743822
Alignment:
Q  238 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  41744162 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaatcatggacaattgtaaaaaatattgtatttatcttgtttatgttcgagtttca 41744063  T
Q  338 gtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcaga 436  Q
     | |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41744062 atcttgtataaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttaaaattatgcaga 41743965  T
Q  437 acccactgtctgcataatt-gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttact 534  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||  || ||||  |||   ||||    
T  41743964 acccactgtctgcataattagttttcttcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactatcgagggggcaaaagagtaaaatact 41743865  T
Q  535 cgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||  |||||||| || || |||| |||| ||||||||||    
T  41743864 cgtgtggtacaaccttatgtaaagtgtaaacaacaattctcaa 41743822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 414
Target Start/End: Original strand, 22661138 - 22661523
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22661138 gagatgaatatgcatggaaaacggcaagccatatgccttggcttattcacgacgatagcgacgtcgggtctatgtttcggaatatggtggaagatgatat 22661237  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||         
T  22661238 attatatatgtatgttcgttccatatgcaactgcgcagaatgtcagtagagatttaatttaacgatatgtaatgtgttgtttaattatggacact----- 22661332  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
           |||  ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  22661333 -------ctt--taatgttttgatgaatctcaaacattcgtgtaattttaacgaaatatcggtttgatttaattatggacaaccgtaaaagataatgtat 22661423  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    |||||||||||||||| |||| | | |||||||  | | ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  22661424 ttttcttgtttatgactgagtataaatgttgtacaactaataatgcc-tttggaaatgctctagttgaattacaggtaaaaacttgcc-aaaattggctt 22661521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 265 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23578705 - 23578494
Alignment:
Q  265 caaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttg 364  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  23578705 caaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgacagagtttcaatgttgtataatttatattgccttt-g 23578607  T
Q  365 gaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctc 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23578606 gaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggctgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataatttttttcctc 23578507  T
Q  465 ggcagttaactgc 477  Q
    || ||||||||||    
T  23578506 ggtagttaactgc 23578494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 233 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 34367214 - 34366994
Alignment:
Q  233 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgag 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34367214 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 34367115  T
Q  333 tttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatg 432  Q
    ||||| || ||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  34367114 tttcaatgctgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaaggcttggaaatgttttagaatgatg 34367016  T
Q  433 cagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||| | ||||| |||||||||    
T  34367015 cagagctcactgcctgcataat 34366994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41239150 - 41238932
Alignment:
Q  234 gatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  41239150 gatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttgtcttgtttatgtccgaga 41239051  T
Q  334 ttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgc 433  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41239050 ttcaatgttgtatgaattattttg-catttcgaaatgctctgctttaattacaggttaaaactgactgaaaaatggcttggacatgttttagaatcatgc 41238952  T
Q  434 agaacccactgtctgcataa 453  Q
    ||| |  ||||| |||||||    
T  41238951 agagcttactgtttgcataa 41238932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41744332 - 41744160
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41744332 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagttatatgccttggcttattcatgacgatagcgacgtcggatttatatttcggaatatggtggaagataatat 41744233  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaat 185  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41744232 attatatatgtatattcgctccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggacttaatttaatgatgtgtaat 41744160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 317 - 507
Target Start/End: Original strand, 7172465 - 7172658
Alignment:
Q  317 cttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaa--ctggccgaaaaatggcttgg 414  Q
    ||||||||||||  ||||| | |||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||| |||||||    
T  7172465 cttgtttatgactaagtttaaatgttgtataagttatattgccttt-gaaaatgctctggtttaattacaagtaaaaaaacaggttgaaaaacggcttgg 7172563  T
Q  415 aaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaact 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  7172564 aaatgctttagaattatgcagaagccactgtctgcataatcagtttttctcggcagttaattgcagccggttttaaaatttctcggcagttaact 7172658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 39751758 - 39751659
Alignment:
Q  18 gaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattat 117  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751758 gaatacgcatggaaaacggcaaactatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattat 39751659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 512
Target Start/End: Original strand, 1116112 - 1116264
Alignment:
Q  361 tttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaa-tggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtt 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  1116112 tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaa-ctggccgaaaaaatggcttggaattgttt-agaattatgcagaaccctctgtctgcataatcagtt 1116209  T
Q  459 tttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  1116210 tttctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcgacagttaactgccga 1116264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 360
Target Start/End: Original strand, 30972618 - 30972771
Alignment:
Q  207 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagata 306  Q
    ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30972618 ttaattatgtatactctgtaatgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgttgaattgatttaattatcgacaaccgtaaaagata 30972717  T
Q  307 ttgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgcct 360  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||| || ||||||||    
T  30972718 atgtatttttcttgtttatgactgagtataaatgatgtatgagttgtattgcct 30972771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 31281118 - 31280942
Alignment:
Q  230 ttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaa--tttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||| ||||||  | ||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  31281118 ttttgatgaatttcaaacattcgtgtaaaattttaacgaaatgtcagattgatttaattacagtcaattgtaaaagattatgtattgttcttgtttatga 31281019  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaa 405  Q
    |||| | | | || ||||||| || ||||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||    
T  31281018 ccgattataaatggtgtatgagttgtattgtc-tctggaaatgctctggttgaattacaggtaaaaataggccgaaaa 31280942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 39601758 - 39601636
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||     
T  39601758 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgtcgagaaggtaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagccttatgt 39601659  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||  || | ||||||||||    
T  39601658 aatgtgggaatagcaattctcaa 39601636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 577
Target Start/End: Original strand, 41858146 - 41858262
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||  | || || | || ||||||    
T  41858146 ctcggcagttaactgcagccggtttttgaattcttcgccagttaactgccgagggggcaaaaacgtattttactcgtgtttctcagccatatgaaatgtg 41858245  T
Q  561 tcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||| ||||||||||    
T  41858246 tcaacaacaattctcaa 41858262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 2146976 - 2147095
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||  |  ||||||| |  ||||||||||| | ||||||| | ||    
T  2146976 gttttcctcggcagtttactgcagccggtttcaaattccccggcagttaactgctgaggggaaaaaaacgaaaattactcgtgtgcctcaaccttataca 2147075  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  2147076 atgtgtcaacaacaattctc 2147095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31281282 - 31281179
Alignment:
Q  50 ttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgtt 149  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||  |||||     
T  31281282 ttggcttattcgtgacgatag--acgtaggatttatgtttcagaatatggttgaagataatatattatatctttatgttcgttccatctgcacgtgcgta 31281185  T
Q  150 gaatgt 155  Q
    ||||||    
T  31281184 gaatgt 31281179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 462 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 1114791 - 1114702
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  1114791 ctcggcagttaactgcagccggatttcaaatttctcggcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactggtgtggcacagcctt 1114702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 457
Target Start/End: Original strand, 22588311 - 22588392
Alignment:
Q  376 gtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgt 457  Q
    |||| ||||||  ||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22588311 gtttcattacagataaaaactgaccgaaaaattgattgaaaatgctttagaattatacagaacccactgtctgcataattgt 22588392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 456 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 18205840 - 18205756
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18205840 gttttccttggcagttaactgcagccggtttttgaattcttcggcagttaaccgccgaggtggtaaaaacgtattttactcgtgt 18205756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 45454454 - 45454370
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacaca 545  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  45454454 ctcggcagttaactgcatccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgaggaggcaaaatcgtattttactagtgtgccaca 45454370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 18441460 - 18441580
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||  ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||     
T  18441460 gtttttctcggcagttaactacaatcggttattgaatttctcggcagttaactgccgagggggcaaaaacgtattttacttgtgtgtctcagccttatga 18441559  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  18441560 aatgtgtcaacaacaattctc 18441580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 41855422 - 41855342
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactc 535  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41855422 gttttcctcggcagttaactgcagccgatttttgaattcttcgacagttaactgccgaggaggcaaaaacgtattttactc 41855342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 44052245 - 44052365
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggttt-caaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||     
T  44052245 gttttcctcggtaggtaactgcagccggattgcaaattcctcggcaattaactaccgagggggcaaaaacgtcatttactcgtgtgccacaaccttatgt 44052344  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||  |||| ||||||||    
T  44052345 aatgtgggaacaacaattctc 44052365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 35962361 - 35962282
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttact 534  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  35962361 gttttcctcggcagttaactgtagccggatttcaaattcctcgacagttaactgccgagagggcaaaatcgtattttact 35962282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 7168142 - 7168025
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||   ||||  || |||| ||||||||||| ||||| | || |||| ||     
T  7168142 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttttgaattcttcggcagctaacagtcgagggggcaaaatcgtattttacttgtgtgcctcagccttatga 7168043  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||||||||||| |||||    
T  7168042 aatgtgtcaacaacaatt 7168025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 550
Target Start/End: Original strand, 35966782 - 35966863
Alignment:
Q  470 ttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  35966782 ttaactgcagtcggatttcaaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaattgtattttactagtgtgacacaacctt 35966863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 575
Target Start/End: Original strand, 39753031 - 39753136
Alignment:
Q  470 ttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatca 569  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |  ||||| |||  ||||||||||| |  | |||| | ||||||||||||| ||    
T  39753031 ttaactgcagccggtttcaaattcctcggcagttaactgccgatgggacaaaaatgtaaattactcgtgtgcctgagccttatacaatgtgtcaacaaca 39753130  T
Q  570 attctc 575  Q
    ||||||    
T  39753131 attctc 39753136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18438688 - 18438568
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||  ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| |||||   || |||| |||    
T  18438688 gttttcctcggcagttaactgcagccggttattgaattcctcaacagttaactgccgaaggggcaaaagcgtattttacttgtgtgcatcagccttatgc 18438589  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  18438588 aatgtgtcaacaacaattctc 18438568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 35389562 - 35389442
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||  |||||||||||||  |||  ||| |||||||||  |||||||| || | || |||| |||    
T  35389562 gttttcctcggcagttaactgcagctggtttttgaatttctcggcagttaactgtcgaagaggcaaaaacgtaaattactcgtatgtctcagccttatgc 35389463  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  35389462 aatgtgtcaacaacaattctc 35389442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Original strand, 30972519 - 30972626
Alignment:
Q  94 atatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtt 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||  ||||| ||||||   |||  |||| || |||| |||||||||| ||||||    
T  30972519 atatggttgaagataatatattatatatgtgtgtttgttccatttgcacatgcgtagaatgtcgatagatattttatgtaatgatgtgtaatgtgttgtt 30972618  T
Q  194 taattatg 201  Q
    ||||||||    
T  30972619 taattatg 30972626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 576
Target Start/End: Original strand, 34503152 - 34503198
Alignment:
Q  530 ttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34503152 ttactcgtgtgacacacccttatgcaatgtgtcaacaacaattctca 34503198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 575
Target Start/End: Original strand, 7577617 - 7577727
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtc 562  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||    |||||||||||  |||||||||||| |||| |||| || ||||||      
T  7577617 tcggtagttaactgcagccggtttcaaa--cttcggtagttaattgccgcaggggtaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagccttatgtaatgtggg 7577714  T
Q  563 aacatcaattctc 575  Q
    |||| ||||||||    
T  7577715 aacagcaattctc 7577727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 20546877 - 20546812
Alignment:
Q  485 ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20546877 ttcaaattcctcggtagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactagtgtggcacaacctt 20546812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 31957882 - 31957793
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||  ||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31957882 ctcggtagttaactgcagccggaattcaaattcctcggtagttagctgtcgagggggtaaaatcgtattttactagtgtggcacaacctt 31957793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 577
Target Start/End: Original strand, 34235143 - 34235263
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||  |||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||| |||| |  |    
T  34235143 ttttcctcagcagttaactgtagccgaatttctaaaacttcggcagttaactgccgagtaggtaaaaacgtcatttactcgtatg-cacagccttatcaa 34235241  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||| |||| ||||||||||    
T  34235242 atgtgtaaacagcaattctcaa 34235263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 394
Target Start/End: Original strand, 29807053 - 29807168
Alignment:
Q  278 gatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||  | | | | |  ||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||    
T  29807053 gatttaattatgaacaattgtaaaagatcatgtaatgttcttgtttatgacttattataaatagtgtatgagttgtattgcc-tctggaaatgctatggt 29807151  T
Q  378 ttaattacaagtaaaaa 394  Q
    | ||||||| |||||||    
T  29807152 tgaattacaggtaaaaa 29807168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 495 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34234597 - 34234517
Alignment:
Q  495 tcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||| |||| |||| |  ||||||| |||| ||||||||    
T  34234597 tcggcagttaactaccgagggggtaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagccttatcaaatgtgtaaacaacaattctc 34234517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34366965 - 34366846
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||  ||||  || ||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||     
T  34366965 gttttcctcggaagttaactgcagccggatttataaaacttcggcagttaactgacgagg-ggcaaaaaggtcttttactcgtgtggcacagccttatgt 34366867  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  34366866 aatgtgggaacatcaattctc 34366846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 34823035 - 34823155
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||  |||  ||||| ||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||  ||||| | ||||||| | |    
T  34823035 gttttcctcgacaattaactgcagccgtatttttaattcctcgacagttaactgccgagaggacaaaaacgtatattacgtgtgtgcctcaaccttatac 34823134  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  34823135 aatgtgtcaacaacaattctc 34823155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 41250091 - 41250210
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| ||  ||||| ||||||||| |||||  || ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||    
T  41250091 gttttcctcggcagtaaactgcagtcggatttctaaaacttcgacagttaactaccgagg-ggcaaaaacgtcaattactcgtgtgccacaaccttatgc 41250189  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||  |||| ||||||||    
T  41250190 aatgtgggaacaacaattctc 41250210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 42602514 - 42602430
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |    ||||| |||||||||||||||    
T  42602514 gttttcctcggcagttaactgcatccggtttttgaattcttcggcagttaactgccgatagaacaaaaatgtattttactcgtgt 42602430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 497 - 539
Target Start/End: Original strand, 5304205 - 5304247
Alignment:
Q  497 ggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5304205 ggcagttaactgccgagggggtaaaaacgtattttactcgtgt 5304247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 489 - 539
Target Start/End: Original strand, 26455734 - 26455784
Alignment:
Q  489 aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26455734 aattcctccgcagttaactgccgagagggtaaaaccgtattttactcgtgt 26455784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 477
Target Start/End: Original strand, 29807193 - 29807243
Alignment:
Q  427 attatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29807193 attatgtagaagccactgtctgtataattgatttcctcggcagttaactgc 29807243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 32585012 - 32585067
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||    
T  32585012 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactaccgag 32585067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 534
Target Start/End: Original strand, 43690053 - 43690131
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttact 534  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  43690053 gttttcctcgacatttaactgcagccgattttaaattcatcagtagttaactaccgagagagcaaaaacgtattttact 43690131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6268965 - 6268920
Alignment:
Q  530 ttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||    
T  6268965 ttactcgtgtgacacaaccttatgcaatgtatcatcagcaattctc 6268920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 512
Target Start/End: Original strand, 22550884 - 22550941
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  22550884 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccga 22550941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29286695 - 29286163
Alignment:
Q  29 gaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgtt 128  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29286695 gaaaacggcaaactatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgtt 29286596  T
Q  129 cgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaac 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||    
T  29286595 cgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagaggtttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt--------------tgtaac 29286510  T
Q  229 gttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29286509 gttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttaagac 29286410  T
Q  329 cgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaat 428  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29286409 cgagtttcaacgttgtatgatttatattgcc-tttgaaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgctttagaat 29286311  T
Q  429 tatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggtttc-aaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgta 527  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  29286310 tatgcagaacctactgtctgcataattgttttcctcggcagttaactgcaaccggtttcttatttcctcggcagttaactaccgagggggcaaaaacgta 29286211  T
Q  528 ttttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
      ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29286210 aattacttgtgtgcctcaaccttatgcaatgtgtcaacaacaattctc 29286163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 7537709 - 7537250
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7537709 gagacgaatacgcatggaaaacagcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7537610  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7537609 attatatatgtatgttcgttccatatgcatttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgatttgtttaattatggacacttaatt 7537510  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7537509 atggacactttgtaatgtttagatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 7537410  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7537409 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggctt 7537311  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagtta 472  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  7537310 ggaaatgctttagaattatgcagaattcactgtctgcataatcagttttcctcggcagtta 7537250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 560
Target Start/End: Original strand, 18609797 - 18610329
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  18609797 gagataaatatgcatggaaaacgacaagttatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaattatat 18609896  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||              ||    
T  18609897 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaa--------------tt 18609982  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18609983 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattcgaaccagatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 18610082  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18610083 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttgaaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactgaccgaaaaatggctt 18610181  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  18610182 ggaaatgctttagaattatgcagaacccactatctgcatagttgttttcctcggcagttaaatgcagccggtttcaaattcctcggcatttaactaccga 18610281  T
Q  513 gaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  18610282 aggggcaaaaacgtattttactcgtgtgacacagccttatacaatgtg 18610329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 2051545 - 2051089
Alignment:
Q  18 gaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattat 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2051545 gaatacgcatggaaaacggcaagttatatgtcttggcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcgaaatatggtggaagataatatattat 2051446  T
Q  118 acatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatgga 217  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  2051445 atatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatgaacacttaattattaa 2051346  T
Q  218 cactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttc 317  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2051345 cactttttatcgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtatttttc 2051246  T
Q  318 ttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaa 417  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  2051245 ttggttatgatcgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctgttttaattacagataaaaactggccgaaaaattgcttgaaaa 2051147  T
Q  418 tgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  2051146 tgcattagaattatgcataacccactgtctgcataattgttttcctctgcagataact 2051089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 25 - 575
Target Start/End: Original strand, 25140681 - 25141218
Alignment:
Q  25 catggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattataca-tgt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||    
T  25140681 catggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcgcatttatgtttcggaatatggtgaaagataatatattatataatgt 25140780  T
Q  124 atgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacacttt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||              |||||||||||||    
T  25140781 atgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaa--------------ttatggacacttt 25140866  T
Q  224 gtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgttt 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25140867 gtaacgtgttgatgaatttcaaacgtttgtttaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaatgatattgtatttttcttgttt 25140966  T
Q  324 atgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgtttt 423  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25140967 atggccgagtttcaatattgtatgatttatattgcc-tttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaacttggccgaaaaatggcttgaaaatgcttt 25141065  T
Q  424 agaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaa 522  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||| ||| ||||||||| ||||   |  ||||    
T  25141066 agaattatgcagaacccactgtctccataattgttttcctcggcagttaactgtagctggtatttgaattcctcgacagttaactgccgaatggacaaaa 25141165  T
Q  523 acgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |  ||  ||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25141166 atataaattattcgtgtgcctcagccttatgcaatgtgtcaacaacaattctc 25141218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 540
Target Start/End: Original strand, 31150629 - 31151142
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  31150629 gagatgaatacgcttggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgttttagaatatggtggaagataatat 31150728  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||              ||    
T  31150729 attatatatgtatgtttgatcgatatgcaattgcgttgaatgtatgtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaa--------------tt 31150814  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150815 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattggaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 31150914  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  31150915 ttaccttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggattaattataggtaaaaactgggcgaaaaatggctt 31151013  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttcc 510  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||| ||    
T  31151014 ggaaat-atttagaattatgcagaacccacagtctgcataatttgttttccttggcagttaactgcagccggatttcaaaaatttcgacagttaactgcc 31151112  T
Q  511 gagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    ||| ||| |||||||||   ||||||||||    
T  31151113 gaggaggcaaaaacgtaaaatactcgtgtg 31151142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 28362281 - 28362720
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28362281 gagatgaataagcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttatttgcgatgatagcgacgtcgaatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 28362380  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28362381 attatatatgtatgttcgatcgatatgcaattgtgtagaatgtatgtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaatgatggacatttaatt 28362480  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28362481 atgaacactttgtaacgttttgttgaatttcaatcggttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattttagacaactgtaaaagatattgtat 28362580  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28362581 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttatatgatttatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggctt 28362679  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28362680 ggaaatg-tttagaattatgcagaacacactgcctgcataat 28362720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 23959399 - 23958951
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23959399 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcacgacgatagcgacgttggatttatgtttcggaatatggtgtaagataatat 23959300  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  23959299 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgtttaattatggacacta---- 23959204  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23959203 ----------tgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaaaatattgtat 23959114  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  23959113 tttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaatctggtcgaaaaatggctt 23959015  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23959014 ggaaatgctttagaattatgcagaatccactgtctgcataaccagtttttctcggcagttaact 23958951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 458
Target Start/End: Original strand, 29667387 - 29667827
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29667387 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgatgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagttaatat 29667486  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaat 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | | |    |||||    
T  29667487 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt--aatgtgttgt---ttaat 29667581  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29667582 tatggacactgtgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 29667681  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggct 411  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |  ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29667682 ttttacttgtttatgactgagtttaaaagttgtataagttatattgcc-tttgaaaatgctctggttaaattacagataaaaactggccgaaaaatggct 29667780  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtt 458  Q
    ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29667781 tggaagtgctttggaattatgcaaaacccactgtctgcataaatgtt 29667827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13383150 - 13382690
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13383150 gagatgaatacgcatggaaaacgtcaagttatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13383051  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |     
T  13383050 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagtagtttaattatggacactttgta 13382951  T
Q  213 atggacactttgtaacgt----tttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatatt 308  Q
    |||     ||||    ||    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13382950 atg----ttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatatt 13382855  T
Q  309 gtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatg 408  Q
    ||| || ||||  ||||| ||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13382854 gtagttatctttattatgtccgagtttcaaacttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaatg 13382756  T
Q  409 gcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13382755 gcttggaaatg-tttacaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 13382690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1608803 - 1608341
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1608803 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 1608704  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  1608703 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 1608612  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1608611 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtat 1608518  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1608517 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatatt-acttttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 1608419  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccggtttc 487  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1608418 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactgccgccggtttc 1608341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Original strand, 26702456 - 26702698
Alignment:
Q  207 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagata 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26702456 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggttt-atttaattatggacaattgtaaaagata 26702554  T
Q  307 ttgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  26702555 ttgtatttttcttgtttatgaccgaatttctatgttgtatgatttatactgcc-tttggaaatgctctgatttaattacatgtaaaaattggtcgaaaaa 26702653  T
Q  407 tggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttt 460  Q
    |||         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26702654 tgg---------gctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttt 26702698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 235 - 475
Target Start/End: Original strand, 11840022 - 11840262
Alignment:
Q  235 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  11840022 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgttcgagtt 11840121  T
Q  335 tcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgca 434  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840122 tcaatgttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgca 11840220  T
Q  435 gaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    || | ||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  11840221 gagctcactgcctgcataatcagatttcctcggcagttaact 11840262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 207 - 454
Target Start/End: Original strand, 18351387 - 18351633
Alignment:
Q  207 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagata 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18351387 ttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagata 18351486  T
Q  307 ttgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaa 405  Q
    ||||| || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18351487 ttgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaa 18351585  T
Q  406 atggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18351586 atggctcggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 18351633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 228 - 577
Target Start/End: Original strand, 3502429 - 3502778
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3502429 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgg 3502528  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    || ||||||| |||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  3502529 ccaagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttt-gaaatgctctggtgtaattacaggtaaaaactagccgaaaaaagacttgtaaatgttttagaa 3502627  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg--tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaac 524  Q
    | ||||||| | || || |||||||||  | ||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||  ||||||| ||||| | | || |  | ||||||    
T  3502628 tgatgcagagctcattgcctgcataatcagatttcctcagcagttaactgcagtcggattttcaaa-acttcggccgttaattgctga-agagcaaaaac 3502725  T
Q  525 gtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||    
T  3502726 gtcatttactcgtgtgacacaaccttatgaaatgtgtaaatagcaattctcaa 3502778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 281 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 2258540 - 2258336
Alignment:
Q  281 ttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggttta 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2258540 ttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgactgagtttaaatgttgtatgagttatattgccttt-gaaaatgctctggttta 2258442  T
Q  381 attacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagc 480  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2258441 attacaagtaaaatctgactgaaaaatgacttgaaaattctttagaattatgcagaattcactgtctgcataattgtttttctcgatagttaactgcagc 2258342  T
Q  481 cggttt 486  Q
    | ||||    
T  2258341 cagttt 2258336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 34230953 - 34230548
Alignment:
Q  49 cttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgt 148  Q
    ||||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  34230953 cttggcttattcaagaggatagtgacgtccgatttatgttttagaatatggtagaagataatatattatatatgtatgttcgttccatctgcaactgtgt 34230854  T
Q  149 tgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaa-c 247  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||            |||  ||| |||||||||||||||||| |    
T  34230853 agaatgttagtagagatttaatttaacgatgtgtaatgtgttgtttaattatggacact------------ctt--taatgttttgatgaatttcaaagc 34230768  T
Q  248 gtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatg 347  Q
     ||  |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||| |    
T  34230767 attcatgtaattttaacgaaatgtcggtttgatttaattatagacaattgtaaaagataatgtatttttattctttatgactgagtataaatgttgtacg 34230668  T
Q  348 atttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtct 447  Q
    | |   |||||| |||| ||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||     ||||    |||||||||||| |||||||||    
T  34230667 actataattgcc-tttgcaaataatctggttgaattataggtaaaaactggccg-aaaatggctt-----tgtt---caattatgcagaatccactgtct 34230578  T
Q  448 gcataattgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  34230577 gcataattggttttttcgacagttaactgc 34230548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 228 - 475
Target Start/End: Original strand, 31771505 - 31771753
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31771505 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgtttatgt 31771604  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttaga 426  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||  |||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31771605 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttcgaaatgatctactttaattaaaggtaaaaaatggctgaaaaaatggcttggaaatgttttaga 31771703  T
Q  427 attatgcagaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggcagttaact 475  Q
    || ||| |||   || ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||    
T  31771704 atcatgaagagttcattgtctgcataatttattttcctcggcaattaact 31771753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2259593 - 2259400
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  2259593 gagatgaatacgcatagaaaacgacaagctatatgcattggcttattaaagacgaaagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaaaataatat 2259494  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacact 207  Q
    |||||| ||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2259493 attatatatgcatgtttgttccatatgcaa-tacgttgaatgtaagtaaggatttaatttaataagttgtaatgtgttgtttaattatggacact 2259400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 258 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 8304715 - 8304506
Alignment:
Q  258 tttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattg 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||  |||||||    
T  8304715 tttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagataatgtatttttcttgtttatgactgagtgcaaatgttgtatgaggtatattg 8304616  T
Q  358 ccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgt 457  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||        | ||||||| || ||||||| |||||||||||||     
T  8304615 gc-tttggaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactggccg-aaattgacttgg--------ttgaattattcataacccacagtctgcataattga 8304526  T
Q  458 ttttctcggcagttaactgc 477  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  8304525 tttcctcggcagttaactgc 8304506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 462
Target Start/End: Original strand, 20448531 - 20448776
Alignment:
Q  207 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagata 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||  | |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20448531 ttaattatggacactctttaatgtttttatgaatttcaaacattcctctaattttaacgaaatgtcggattgatttaattatggacaactgtaaaagata 20448630  T
Q  307 ttgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaa 406  Q
     |||||| ||||||||||||||  ||| | | || ||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| ||||    
T  20448631 atgtattcttcttgtttatgactaagtataaatggtgtatgagttatattgcc-tctgtaaatgctctggttgaattacagataaaaataggccg-aaaa 20448728  T
Q  407 tggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttc 462  Q
    ||||||||        | |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  20448729 tggcttgg--------ttgaattatgcagaagtcactgtctgcataattttttttc 20448776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 211 - 394
Target Start/End: Original strand, 20439753 - 20439935
Alignment:
Q  211 ttatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgt 310  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20439753 ttatggacactctttaatgttttcatgaatttcaaacattcctgtaattttaacaaaatgtcggattgatttaattatggacaactgtaaaagataatgt 20439852  T
Q  311 atttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaa 394  Q
    |||  |||||||||||||  ||| | | || ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  20439853 attcctcttgtttatgactaagtataaatggtgtatgagttgtattgcc-tctggaaatgctctggttgaataacaggtaaaaa 20439935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 18606098 - 18605978
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| | || |||  | ||    
T  18606098 gttttcctcggcagttaactgcagccggtgtcaaattcctaggcagttaactaccgagggggcaaaaacgtattttactcgtgtgcctcagcctcataca 18605999  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  18605998 atgtgtcaacaacaattctca 18605978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2051082 - 2050963
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    | ||||||||||||||||||||||   || |||| ||||    
T  2051082 gttttcctcggcagttaactgcaaccggtttcaaattcatcggcagttaactgccgaaggagcaaaaacgtattttactcgtgtgcatcagccttatgca 2050983  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  2050982 atgtgtcaatagcaattctc 2050963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19129281 - 19129120
Alignment:
Q  229 gttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgac 328  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |   ||||||||||||||    
T  19129281 gttttgatgaatttcaaacattcgtgtaatttcaacgaaatgtcagattgatttaattatggacaactgtaaaagataatgca---ttcttgtttatgac 19129185  T
Q  329 cgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaa 394  Q
     |||| | | || ||| ||| || ||||| | | |||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  19129184 tgagtataaatggtgtgtgagttttattg-catctggaaatgttgtggtttaattacaggtaaaaa 19129120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 477
Target Start/End: Original strand, 20436045 - 20436301
Alignment:
Q  211 ttatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgt 310  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||  |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  20436045 ttatgaacactctttaatgttttcatgaatttcaaacattcatgtaattttaataaaatgtcggattgatttaatcatggacaactgtaaaagataatgt 20436144  T
Q  311 atttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagt-aaaaactggccgaaaaatgg 409  Q
    |||  |||||||||||||  ||| | | || ||||||| || ||||  | | |||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||    
T  20436145 attcctcttgtttatgactaagtataaatggtgtatgaattgtattttc-tctggaaatgctctggttgaataacaggtaaaaaacaggccg-aaaatgg 20436242  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    |||||        | ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  20436243 cttgg--------ttgaattatgcagaagccactgtgt-cattattgttttcctcggcaggtaactgc 20436301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Original strand, 20448388 - 20448545
Alignment:
Q  49 cttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgt 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||| |||| |||  || ||||| || ||    
T  20448388 cttggcttattcgtgacgatagcgacgtttcatttatgtttaggtatat-gttgaagataatatattatatatgtgtgtttgttacatttgcaaatgtgt 20448486  T
Q  149 tgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacact 207  Q
     ||||||   |||  |||| || |||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  20448487 agaatgtcgatagatattttatgtaatgatatgaaatgtgttgtttaattatggacact 20448545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 7361239 - 7361124
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttc-aaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| || || |||||||| | ||||   |  |||||||||  ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  7361239 ctcggcagttaactgcagccggtttttaaaatcctcagcagttaattgccgacgggacaaaaacgtaaattactcgtgtgccacagccttatgcaatgtg 7361140  T
Q  561 tcaacatcaattctca 576  Q
    |||||| |||||||||    
T  7361139 tcaacagcaattctca 7361124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 13401530 - 13401419
Alignment:
Q  466 gcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaa 564  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||| |||||  || |||| | ||||| |||||||| || ||||||| |  ||||||||||    
T  13401530 gcagttaactgcagccgattttttaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaagcatatttaactcgtgttactcaaccttataaaatgtgtcaa 13401431  T
Q  565 catcaattctca 576  Q
    ||||||||||||    
T  13401430 catcaattctca 13401419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 572
Target Start/End: Original strand, 26702741 - 26702795
Alignment:
Q  518 taaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  26702741 taaaagcgtattttactcgtgtgacacagccttatgcaatgtgtcaacaacaatt 26702795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 560
Target Start/End: Original strand, 28362750 - 28362858
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaa---cttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttc 551  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   || ||||   |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||     
T  28362750 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgctgccgacggggtaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagcctta 28362849  T
Q  552 tgcaatgtg 560  Q
    || ||||||    
T  28362850 tgtaatgtg 28362858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19129644 - 19129562
Alignment:
Q  47 gtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttc 129  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  19129644 gtcttggcttattcgtgacgattgcgacgtttcatttatgtttaggcatatgattgaatataatatattatatatgtgtgttc 19129562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29061344 - 29061230
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  29061344 ctcggaagttaactgcagccgaatttctaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaaaagtaaattactcgtgtgccacagccttatgtaatgtg 29061245  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
      |||| ||||||||    
T  29061244 ggaacaccaattctc 29061230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 31768807 - 31768685
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| |||  |||||||||| ||||| |||| |      
T  31768807 gttttcctcggcaattaactgcagccggatttttaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaaaagtaaattactcgtgttacacagccttatca 31768708  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||  |||| ||||||||||    
T  31768707 aatgtgggaacaacaattctcaa 31768685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 577
Target Start/End: Original strand, 2052615 - 2052723
Alignment:
Q  468 agttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacat 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||  |  |||||||||  ||||||||||| | | | ||| | ||||||| |||||     
T  2052615 agttaactgcagccgatttcaaattcctcgacagttaactgccgaggggacaaaaacgtaaattactcgtgtgcctc-agcttatacaatgtgccaacaa 2052713  T
Q  568 caattctcaa 577  Q
    ||||||||||    
T  2052714 caattctcaa 2052723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18347094 - 18347037
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  18347094 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcagattcctcggcagttaactgccgag 18347037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31146428 - 31146375
Alignment:
Q  455 tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaact 507  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31146428 tgttttcctcgacagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaact 31146375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2259398 - 2259338
Alignment:
Q  223 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgattta 283  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  2259398 tgtaacgttttgatgaatttcaacattttgtgcattttgaaccaaatgtcggtttcattta 2259338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29065782 - 29065674
Alignment:
Q  468 agttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaaca 566  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||  ||||    
T  29065782 agttaactgcagccggatttctaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaaaagtaaattactcgtgtgccacagccttatttaatgtgggaaca 29065683  T
Q  567 tcaattctc 575  Q
     ||||||||    
T  29065682 acaattctc 29065674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29074795 - 29074687
Alignment:
Q  468 agttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaaca 566  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||  ||||    
T  29074795 agttaactgcagccggatttctaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaaaagtaaattactcgtgtgccacagccttatttaatgtgggaaca 29074696  T
Q  567 tcaattctc 575  Q
     ||||||||    
T  29074695 acaattctc 29074687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29079559 - 29079451
Alignment:
Q  468 agttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaaca 566  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||  ||||    
T  29079559 agttaactgcagccggatttctaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaaaagtaaattactcgtgtgccacagccttatttaatgtgggaaca 29079460  T
Q  567 tcaattctc 575  Q
     ||||||||    
T  29079459 acaattctc 29079451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29107368 - 29107260
Alignment:
Q  468 agttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaaca 566  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||  ||||    
T  29107368 agttaactgcagccggatttctaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaaaagtaaattactcgtgtgccacagccttatttaatgtgggaaca 29107269  T
Q  567 tcaattctc 575  Q
     ||||||||    
T  29107268 acaattctc 29107260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 539
Target Start/End: Original strand, 35021282 - 35021366
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||| |||||  || ||||  |||||||||||||||    
T  35021282 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttttgaattcttccgcatttaactgccgagggggcaaaagtgtattttactcgtgt 35021366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 11687508 - 11687392
Alignment:
Q  458 ttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaat 557  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||    |||||||||||  |||||||||||| |||||| || |  |||    
T  11687508 ttttttcgggagttaactgcagccggttttaaa--cttcggtagttaactgccgcaggggtaaaaacgtcatttactcgtgtggcacaactttatataat 11687411  T
Q  558 gtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |||  |||| |||||||||    
T  11687410 gtgggaacagcaattctca 11687392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 577
Target Start/End: Original strand, 14012393 - 14012515
Alignment:
Q  455 tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctg 553  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||| | || | || ||||||||  |||||||||||| |||| |||| |     
T  14012393 tgttttcctcggcagttaactgaagccggatttctaaaacttcggcagttaactgctga-agggcaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagccttatt 14012491  T
Q  554 caatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
     ||||||  |||| ||||||||||    
T  14012492 aaatgtgggaacaacaattctcaa 14012515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 18001260 - 18001146
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtc 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||| |||| | || |   || ||||||||| ||||  | ||||||| || ||||||||    
T  18001260 tcggcagttaactgcagccggtttttaattcctcaacagttaactgccgatagggcatttacatattttacttgtgtacctcaaccttatgaaatgtgtc 18001161  T
Q  563 aacatcaattctcaa 577  Q
    |||| ||||| ||||    
T  18001160 aacaacaattttcaa 18001146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 460 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 13479776 - 13479663
Alignment:
Q  460 ttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatg 558  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||   |||||  || ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| ||||| | || |||| || ||||    
T  13479776 ttctcagcagttaactgcagctggtttttgaattccccgacagttaactaccgagggggcaaaagcgtattttacttgtgtgcctcagccttatgaaatg 13479677  T
Q  559 tgtcaacatcaatt 572  Q
    |||||||| |||||    
T  13479676 tgtcaacaacaatt 13479663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41181919 - 41181371
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41181919 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggcttatacgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 41181820  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  41181819 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt---- 41181724  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41181723 ----------tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtat 41181634  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  41181633 ttttcttagttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgcccaaaaaatggctt 41181535  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccg 511  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||    
T  41181534 ggaaatgcattagaattatgcataacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaaatgtagccggttattgaattcctcggcagttaactgccg 41181435  T
Q  512 agaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41181434 agggggcaaaaacgtattttactcgtgtgcctcagccttatgcaatgtgtcaacatcaattctc 41181371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24602160 - 24601700
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24602160 gagacgaatacggatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcaacgtcggatttatttttcggaatatggtggaagataatat 24602061  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24602060 attatatat--atgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 24601963  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24601962 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtctgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 24601863  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24601862 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactgaccgaaaaatggctt 24601764  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24601763 ggaaatgcttttgaattatgtagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 24601700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 24611954 - 24612414
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24611954 gagacgaatacggatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcaacgtcggatttatttttcggaatatggtggaagataatat 24612053  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24612054 attatatat--atgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 24612151  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24612152 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtctgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 24612251  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24612252 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactgaccgaaaaatggctt 24612350  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24612351 ggaaatgcttttgaattatgtagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 24612414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 9659604 - 9660067
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9659604 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcgagtttatgtttcggaatatggtggaagataatat 9659703  T
Q  113 attatacat--gtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaa 210  Q
    ||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9659704 attttatatttgtatgttcgttcaatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggtatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaa 9659803  T
Q  211 ttatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgt 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9659804 ttatggacactgtgtaacgttttgatgaatttcaagcgtttgtgtaattttaaccaaatgtcgttttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgt 9659903  T
Q  311 atttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9659904 atttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattaaaggtaaaaactggccgaaaaatggc 9660002  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9660003 ttggaaatgttttagaattatgcataacccactgtctgcataattgttttcctcggcaattaact 9660067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 1097092 - 1096554
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1097092 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgcttgggcttatttgcgacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 1096993  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1096992 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgtttaattatgaacacttaatt 1096893  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1096892 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtagtttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatactgtat 1096793  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1096792 ttatcttgtttatgtccgagttttaatgttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 1096694  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttc 509  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  1096693 tggaaatg-tttagaattatgcataacccactgtcttcataatcagttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaacagc 1096595  T
Q  510 cgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||  || |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1096594 cgagggggcaaaatcgtattttactagtgtgccacaacctt 1096554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 41053142 - 41052681
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41053142 gagacgaatacgcattgaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 41053043  T
Q  113 att-atacatgtatgttcgttc--tatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacactta 209  Q
    ||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41053042 atttatatatgtgtgttcgttccatatatgcaattgcattgaatgtaagtagg-----aatttaatgatgtgtaatgaattgtttaattatggacactta 41052948  T
Q  210 attatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41052947 attatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattg 41052848  T
Q  310 tatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatgg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41052847 tatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatactctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatgg 41052749  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  41052748 cttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattattttcctcggcaattaactgc 41052681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 28343020 - 28342584
Alignment:
Q  25 catggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgttt-cggaatatggtagaagataatatattatacatgt 123  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28343020 catgtaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgttttcggaatatggtggaagataatatattatatatgt 28342921  T
Q  124 atgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacacttt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||              |    
T  28342920 atgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgaattgtttaattatgaacactt--------------t 28342835  T
Q  224 gtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgttt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342834 gtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgttt 28342735  T
Q  324 atgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgtttt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  28342734 atgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgttctggtttaattacagataaaaactggccgaaaaatagtttggaaattcttt 28342636  T
Q  424 agaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28342635 agaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaact 28342584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Original strand, 439374 - 439792
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  439374 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccctggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaagtaatat 439473  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  439474 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaaggagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatgaacacttaatt 439573  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  439574 atggatactttgtaacgctttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta- 439672  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  439673 -tttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgcgctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggctt 439770  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgca 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  439771 ggaaatgctttagaattatgca 439792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 12906037 - 12905486
Alignment:
Q  14 agatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatata 113  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12906037 agatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 12905938  T
Q  114 ttatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaatt 212  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | | |    ||||||    
T  12905937 ttatatatgtatgtttgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtacggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt--aatgtgttgt---ttaatt 12905843  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12905842 attgacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaatatattgtat 12905743  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  12905742 tttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtatgagttatattgcc-tttggaaatgctctggttaaatt---agtaaaaactggtcgaaaaatggctt 12905647  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccg--gtttcaaattcttcggcagttaacttcc 510  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  12905646 ggaaatgctttagaattatgcagaactcactgtctgcataaccagttttctcggcagttaactgcagccgatttttcaatttc-tcggcagttaactgcc 12905548  T
Q  511 gagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||  |  |||| |||||||||||| |||  | || |||| || ||||||||||||| ||||    
T  12905547 gaggggaaaaaagcgtattttactcttgtttctcagccttatgaaatgtgtcaacataaatt 12905486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 81814 - 82274
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  81814 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatcccttgacttattaaagacgataacgacgtcggatttatgtttcggaatatggttgaaaataatat 81913  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  81914 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatgcatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatgcacacttaatt 82013  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  82014 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaa-tatggacaattgtaaaagatattgtat 82112  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  82113 ttttcttgtttatgaccaagttttgatgttggatgatttatactgcc-tttagaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggttt 82211  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  82212 gaaaatgctttagaattatgcagaactcattgtctgcataattgttttcctcagcagttaact 82274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 43944210 - 43943750
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43944210 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggcttattcgcgatgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 43944111  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaat 211  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | | |    |||      
T  43944110 aatatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgaattgt--aatgtgttgt---ttatg 43944016  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43944015 catggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttttgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 43943916  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttata--ttgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatgg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43943915 tttttcttgtttatgaccgagttttaatgttgtatgatttatattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatgg 43943817  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttt-ctcggcagttaact 475  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43943816 cttggaaatgctttagaattatgcataacccattctctgcataattgtttttcctcggcagttaact 43943750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 572
Target Start/End: Original strand, 45479385 - 45479930
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45479385 gagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatatcggcgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 45479484  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||              ||    
T  45479485 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgtttaa--------------tt 45479570  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45479571 atggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttttgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtat 45479670  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45479671 tttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtattagttatattgcc-tttggaaatgctctggttaaattacaagtaaaaactggccgaaaaatagctt 45479769  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccg-gtttcaaattcttcggcagttaacttccg 511  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||  |||  ||||  ||||||||||||| |||    
T  45479770 gaaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcaattttctcggcaattaactacagtcgattttttaatttctcggcagttaactgccg 45479869  T
Q  512 agaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||  | |||| |||||||||||| |||  |  | |||| || |||||||||||| |||||    
T  45479870 agagagcaaaatcgtattttactcatgtttctgagccttatgaaatgtgtcaacaacaatt 45479930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 7267008 - 7267456
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7267008 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatacctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7267107  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||              ||    
T  7267108 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaa--------------tt 7267193  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7267194 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtaggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 7267293  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| | |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7267294 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtataaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 7267392  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  7267393 tggaaatgctttacaattatgcag-acccactgtctgcataatcagatttcctcggcagttaact 7267456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 41005045 - 41004589
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| |  || || ||||    
T  41005045 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctacatgccctggcttattaaagacgattgggacgtcagatttatgtttcagaatatgttgaaaaattatat 41004946  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaat 211  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| | | |    |||||    
T  41004945 attatatatgtatgttcattccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagtgatttaatataatgatgtgtaatgagttgt--aatgtgttgt---ttaat 41004851  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  41004850 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttaaaccaaatgttggtttgatttaattatagacaattgtaaaagatattata 41004751  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggct 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  41004750 tttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgtc-tttggaaatgcttcggtttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaatggct 41004653  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  41004652 ttgaaatgctttagaattatgcagaatccactgtctgcataatatttttcctcggcagttaact 41004589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 3795859 - 3795398
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3795859 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgtgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 3795760  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |     
T  3795759 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgta 3795660  T
Q  213 atggacactttgtaacgt----tttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatatt 308  Q
    |||     ||||    ||    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3795659 atg----ttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatatt 3795564  T
Q  309 gtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggcc-gaaaaat 407  Q
    ||| || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  3795563 gtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccaaaaaaat 3795465  T
Q  408 ggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3795464 ggcttggaaatg-tttagaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 3795398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 471
Target Start/End: Original strand, 24753588 - 24754032
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24753588 gagatgaatacgtatggaaaacggcaagctatatgcttttgcttattcgcgacgacggcgacatcgtatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 24753687  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||              ||    
T  24753688 attatatatgtatgtttgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaa--------------tt 24753773  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24753774 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaaaaattgtaaaagatattgtat 24753873  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24753874 ttatcttgtttatgtcccagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 24753972  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagtt 471  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  24753973 tggaaatg-tttagaattatgcagaacttgctgtctgcataatcagttttcctcggcagtt 24754032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Original strand, 39798004 - 39798453
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39798004 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 39798103  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||              
T  39798104 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatgg---------- 39798193  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacc-aaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39798194 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgca 39798287  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggc 410  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||  | |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39798288 tttatcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattat-ttaacctttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggc 39798386  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  39798387 ttggaaatg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgc 39798453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 41564054 - 41564482
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41564054 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 41564153  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              ||||||    
T  41564154 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaatt 41564239  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41564240 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtat 41564339  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41564340 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 41564438  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41564439 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 41564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10620483 - 10620022
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10620483 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 10620384  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  10620383 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 10620292  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10620291 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 10620198  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10620197 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 10620100  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccggtttc 487  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  10620099 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactgccgccgatttc 10620022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 5351295 - 5351722
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5351295 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 5351394  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              ||||||    
T  5351395 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaatt 5351480  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5351481 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 5351580  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5351581 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 5351678  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5351679 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 5351722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 209494 - 209033
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  209494 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 209395  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  209394 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtatggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 209303  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  209302 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 209209  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  209208 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 209111  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccggtttc 487  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  209110 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgccggtttc 209033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 238 - 475
Target Start/End: Original strand, 25184606 - 25184842
Alignment:
Q  238 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184606 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatatcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttca 25184705  T
Q  338 gtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaa 437  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25184706 atgttgtatgatttatattgcc-tttgaaaatactctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatacagaa 25184804  T
Q  438 cccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25184805 cccactgtttacataattgttttcctcggcagttaact 25184842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 228 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 10825526 - 10825277
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  10825526 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtctgtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 10825427  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    | |||||||| |||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10825426 ctgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgcttggaaatgttttagaa 10825328  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    | ||||||| | ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  10825327 tgatgcagagctcactgcctgcataatcagattttctcggcagttaactgc 10825277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 115 - 487
Target Start/End: Original strand, 38950232 - 38950577
Alignment:
Q  115 tatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattat 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||              ||||    
T  38950232 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaa--------------ttat 38950317  T
Q  215 ggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38950318 ggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattt 38950417  T
Q  315 ttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttgg 414  Q
     ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||            |||||||||| ||    
T  38950418 atcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggt------------aaaaatggctcgg 38950504  T
Q  415 aaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccggtttc 487  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  38950505 aaat-acttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagatttcctcggcagttaactgtcgccggtttc 38950577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 228 - 436
Target Start/End: Original strand, 39950936 - 39951143
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  39950936 cgttatgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 39951035  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39951036 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacagataaaaactggtcgaaaaaaggcttggaaatgttttagaa 39951134  T
Q  428 ttatgcaga 436  Q
    | |||||||    
T  39951135 tgatgcaga 39951143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 228 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 32953038 - 32952840
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  32953038 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgttgatgt 32952939  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32952938 ctgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttgaaaatgatttagaa 32952840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 148 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 18000607 - 18000315
Alignment:
Q  148 ttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaac 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||              ||||| |||||||||||||||||||    
T  18000607 ttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt--------------tgtaatgttttgatgaatttcaaac 18000522  T
Q  248 gtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gta 345  Q
    || ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||    
T  18000521 gtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacata 18000422  T
Q  346 tgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactg 444  Q
    ||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||    
T  18000421 tgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctg 18000325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 228 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 29398213 - 29398019
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||     
T  29398213 cgttatgatgaatttcaaacatttgtgtaatttgaactaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttc----ttatgt 29398118  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  29398117 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatgatttgaaaatgttttagaa 29398019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 1150595 - 1150783
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||    
T  1150595 gagataaatacgcatggaaaacggcaaactatacgccttggtttatttgtgacgatagcgacgtcggatttatgttttggaatatgatggaagatactat 1150694  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatg 201  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1150695 attatatatgtatgttcgttccatatgcaatttcattgaatgtaagtagtgatttaatttaatgatgtgtaatgaattgtttaattatg 1150783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3207076 - 3206956
Alignment:
Q  207 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagata 306  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3207076 ttaattatggacaccatgcaacgttttgatgaatttcaaacttttgtatactttgaactaaatgtcggtttgatttaattatagacaattgtaaaagata 3206977  T
Q  307 ttgtatttttcttgtttatga 327  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  3206976 atgtatctttcttgtttatga 3206956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 38949750 - 38949855
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38949750 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 38949849  T
Q  113 attata 118  Q
    ||||||    
T  38949850 attata 38949855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Original strand, 25184849 - 25184969
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  25184849 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcctcgacagttaactgctgagggggcaaaaacgtattttactcgtgtgcctcaaccttatgca 25184948  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  25184949 atctgtcaacaacaattctca 25184969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 456 - 571
Target Start/End: Original strand, 82281 - 82396
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  82281 gttttcctcgacagttaactgcagccggtttcaaattactcgacagttaactaccgaggaaacaaaaacgtattttactcgtgtgacataaccttatgca 82380  T
Q  556 atgtgtcaacatcaat 571  Q
    ||||||||||| ||||    
T  82381 atgtgtcaacaacaat 82396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 328 - 450
Target Start/End: Original strand, 7189818 - 7189939
Alignment:
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| || |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7189818 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttctgcctttcg-aaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaaaggcttggaaatgttttagaa 7189916  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgca 450  Q
    | ||||||| | ||||| |||||    
T  7189917 tgatgcagagctcactgcctgca 7189939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 457 - 575
Target Start/End: Original strand, 35493361 - 35493480
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  35493361 ttttcctcggcagttaactgcagctggtttttgaattcctcggcagttaactaccgagggggcaaaagcgtattttactcgtgtgtctcaaccttatgca 35493460  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  35493461 atgtgtcaacaacaattctc 35493480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 7189970 - 7190089
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||     
T  7189970 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgagg-ggcaaaaacgtaatttactcgtgtggcacaaccttatgt 7190068  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  7190069 aatgtgggaacatcaattctc 7190089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 540
Target Start/End: Original strand, 41008947 - 41009031
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||||||||||    
T  41008947 gttttcctcggcagttaaatgcagccggttacaaattcctcggcagttaactgccgaggaggcaaaaacgtaaattactcgtgtg 41009031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 550
Target Start/End: Original strand, 27276393 - 27276488
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  27276393 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcagcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactagtgtggcacagcctt 27276488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 578
Target Start/End: Original strand, 41500253 - 41500376
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |  |||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||  | || || | ||     
T  41500253 gtttttctcggcagttaactgcagccggattttgaattctttgatagttaactgccgagggggcaaaagcgtattttactcgtgtttctcagccatatga 41500352  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaag 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41500353 aatgtgtcaacatcaattctcaag 41500376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 41004582 - 41004472
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||  |||||||| ||   || |||| | ||    
T  41004582 gtttttttcggcagttaactgcagccggttacaaattcctcggcagttaactgccgaggaagcaaaaacgtaaattactcgtatgcatcagccttataca 41004483  T
Q  556 atgtgtcaaca 566  Q
    |||||||||||    
T  41004482 atgtgtcaaca 41004472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25613697 - 25613526
Alignment:
Q  27 tggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatg 126  Q
    ||||||||| | |||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||||||||  | | ||    
T  25613697 tggaaaacggcgagctatgtgccttgacttattcgtgacgatagcgacgtaggatttatgtttatgaatataattaaagataatatattatatctttgtg 25613598  T
Q  127 ttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaatt 198  Q
    ||||||| || ||||  ||| | |||||| | ||| ||||| || |||| || ||||||| |||| ||||||    
T  25613597 ttcgttccatctgcatgtgcatagaatgtcaatagagattttatgtaatgatatgtaatgtgttgattaatt 25613526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 35490724 - 35490625
Alignment:
Q  466 gcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaa 564  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||| |||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||    
T  35490724 gcagttaactgcagccggtttttgaattcttcggcagttaaccgtcgaggaggcaaaaatgtattttactcgtgtgtctcagccttatgcaatgtgtcaa 35490625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25613508 - 25613379
Alignment:
Q  230 ttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgacc 329  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||     
T  25613508 ttttgatgaatttcaaacattcttgtaatttaaacaaaatgcctgattgatttaattttggtcaattgtaaaagattatgta-ttttcttgtttatgact 25613410  T
Q  330 gagtttcagtgttgtatgatttatattgcct 360  Q
    || ||| | || ||||||| || ||||||||    
T  25613409 gattttaaatgatgtatgagttgtattgcct 25613379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 41497526 - 41497404
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |  ||||  || |||||||||  ||||||||||| | || |||| |||    
T  41497526 gttttcctcggcaattaactgcagccggtttttgaattcttcggcagttaagtgtcgaggtggcaaaaacgtaaattactcgtgtgcctcagccttatgc 41497427  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||||||| | ||||||||||    
T  41497426 aatgtgtcaagagcaattctcaa 41497404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 505
Target Start/End: Original strand, 41183243 - 41183292
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaa 505  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41183243 gttttcctcggtagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaa 41183292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Original strand, 43870140 - 43870261
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||   || ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||     
T  43870140 gttttcctcggcagctaactgcagtcggatttctaaaacttcggcagttaactgccgatggggcaaaaacgtcatttactcgtgtggcacaaccttatgt 43870239  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  43870240 aatgtgggaacatcaattctca 43870261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 45475494 - 45475377
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||  ||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| ||||| | || |||| ||     
T  45475494 gttttcctcggcagttaactgtagccggtttttgaatttctcggcagttaactgccgagggggcaaaatcgtattttacttgtgtgtctcagccttatga 45475395  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45475394 aatgtgtcaacatcaatt 45475377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 2917737 - 2917620
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggttt--caaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctg 553  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||| | || |||| ||    
T  2917737 gttttcctcggcagttaactgtagccggtttttcaatttct-cggcagttaactgccgagggggcaaaaacgtattttacttttgtgcctcagccttatg 2917639  T
Q  554 caatgtgtcaacatcaatt 572  Q
     |||||||||||| |||||    
T  2917638 aaatgtgtcaacaacaatt 2917620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Original strand, 24607593 - 24607707
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| | |||  || |||||||||  ||||  ||||| | || |||| |||||||||    
T  24607593 ctcggcagttaactgcagccggttttttaaatcttcggcagttaactgctgagggggaaaaaacgtaaattacctgtgtgcctcagccttatgcaatgtg 24607692  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
    |||||| ||||||||    
T  24607693 tcaacaacaattctc 24607707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 540
Target Start/End: Original strand, 3943211 - 3943295
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  3943211 gtttttctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgagga-gcaaaaacgtcatttactcgtgtg 3943295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 457 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 38945815 - 38945758
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38945815 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgag 38945758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 435396 - 435312
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||  || |||||||||  |||||||||||    
T  435396 gttttcctcggtagtttactgcagccgatttcaaattcatcggcagttaactgccaagggggcaaaaacgtaaattactcgtgtg 435312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1149526 - 1149406
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||   | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |      
T  1149526 gttttcctcgacagttaactgcaatcggatttcaaattcctcggcagttaactgccgagggagcaaaatcgtattttactagtgtggcacaaccttatca 1149427  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||  |||| ||||||||    
T  1149426 aatgtgggaacaacaattctc 1149406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3206890 - 3206842
Alignment:
Q  425 gaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaa 473  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3206890 gaattatgcagaacccacagtctgcataattgatttcctcggcagttaa 3206842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 9660074 - 9660194
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||  ||||||||||  | || | || |||    
T  9660074 gttttcctcggcagtcaactgcagccggttattgtattcctcggcagttaactgccgagagggcaaaaaagtaaattactcgtgtacctcagctttatgc 9660173  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  9660174 aatgtgtcaacagcaattctc 9660194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23346834 - 23346715
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||||||| |      
T  23346834 gttttccttggcagttaactgcagccggatttataaaacttcggcagttaactgccga-agggcaaaaacgtcatttactcgtgtggcacaaccttatca 23346736  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  23346735 aatgtgtaaacaacaattctc 23346715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 23347347 - 23347466
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||| | || ||||||||  |||||||||||| |||| |||| |      
T  23347347 gttttcctcggtagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccga-agggcaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagccttatca 23347445  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  23347446 aatgtgtaaacagcaattctc 23347466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43668560 - 43668500
Alignment:
Q  58 ttcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattata 118  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  43668560 ttcgtgacgatagtgacgtaggatttatgtttaggcatatggttgaagataatatattata 43668500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 512
Target Start/End: Original strand, 3803568 - 3803619
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3803568 ctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccga 3803619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 510 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 16580544 - 16580477
Alignment:
Q  510 cgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16580544 cgaggaggcaaaaatgtattttactcgtgtgtctcagccttatgcaatgtgtcaacaacaattctcaa 16580477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 512
Target Start/End: Original strand, 20951071 - 20951122
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20951071 ctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccga 20951122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3795391 - 3795333
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  3795391 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcgacagttaactgccgag 3795333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 513
Target Start/End: Original strand, 1101072 - 1101129
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1101072 ttttcctcggcagttaactacagccggatttcaaattcatcggcagttaactgccgag 1101129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 24749734 - 24749645
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  24749734 ctcggcagttaactacagtcggaattcaaattcctcggtagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactagtgtggcacagcctt 24749645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 2648856 - 2648776
Alignment:
Q  452 aattgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtatttt 531  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  2648856 aattgttttcctcggtagttaactgcagccggtttttgaattccttggcagttaactgccgagagggcaaaagcgtatttt 2648776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 537 - 577
Target Start/End: Original strand, 15488243 - 15488283
Alignment:
Q  537 tgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15488243 tgtgacacaaccttatgcaatgtgtcaacaacaattctcaa 15488283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 488
Target Start/End: Original strand, 39033540 - 39033572
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39033540 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca 39033572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 4014247 - 4014200
Alignment:
Q  530 ttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  4014247 ttactagtgtgacacaaccttatacaatgtgtcaacaacaattctcaa 4014200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 577
Target Start/End: Original strand, 43950267 - 43950382
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgt 561  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  |||||  | |||||||||| |||||  || ||||| |||||||||||||||  | || |||| |  |||||||    
T  43950267 ctcggcagttaattgcagtcggttttgaattccacagcagttaactgccgagggggcaaaaatgtattttactcgtgtttctcagccttatcaaatgtgt 43950366  T
Q  562 caacatcaattctcaa 577  Q
    ||||| || |||||||    
T  43950367 caacaacagttctcaa 43950382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 30802094 - 30802039
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||    
T  30802094 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccgag 30802039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 540
Target Start/End: Original strand, 39378343 - 39378418
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||| |||  |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  39378343 tcggcagttaactgcagccgattccaaa--cttcggtagttaactaccgcaaaggcaaaaacgtcatttactcgtgtg 39378418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 540
Target Start/End: Original strand, 23409520 - 23409605
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagcc-ggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||| |||||| |||||| || |||  ||||||||||| |||||    
T  23409520 gttttcctcggcagttaactgcagccagtttttgaattcctcggcaattaactgccgagagggcaaacgcgtattttactagtgtg 23409605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 539
Target Start/End: Original strand, 45137459 - 45137536
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||| |||||| || || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  45137459 tcggcagttaactgcagccgaatttttaattcctcggcaattaactgccaaggaggcaaaatcgtattttactcgtgt 45137536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6489852 - 6489390
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6489852 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgtcgtcggatttatatttcggaatatggtggaagataatat 6489753  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6489752 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaagt 6489653  T
Q  213 atggacac-tttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6489652 atggacacttttgtaacgtttcaatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagataatgta 6489553  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggct 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  6489552 tttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattagcggtaaaaactggccgaaaaatggct 6489454  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6489453 tggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaact 6489390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 46990035 - 46989481
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46990035 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatgacgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaagataatat 46989936  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46989935 attatatatgtatgttcgttccacatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 46989836  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46989835 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 46989736  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  46989735 ttatcttgtttatgtccgagtttcacatttgtatgaattattttgcc-tttgaaaatactttggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 46989637  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttcc 510  Q
    |||||||| |||||||||||||||       |  || |  |   ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| ||    
T  46989636 tggaaatg-tttagaattatgcag------ttaactaccga--ggttttcctcggcagttaactgcagccggaattcaaatttctcggtagttaactgcc 46989546  T
Q  511 gagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||| || ||||||||  ||||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||    
T  46989545 gagagggcaaaaacgtcatttactcgtatgacacaaccttattaaatgtgtaaacaacaattctc 46989481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 4002055 - 4002517
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  4002055 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaaaatggtggaaaataatat 4002154  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  4002155 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttatttaattatggacacttagtt 4002254  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4002255 atagacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 4002354  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  4002355 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaacttgccgaaaaaatggct 4002453  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4002454 tggaaatg-tttagaattatgcagaacttgctgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 4002517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21952305 - 21951850
Alignment:
Q  16 atgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatatt 115  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21952305 atgaatacgcatggaaaacggcaagctatgtgccttggcttattcgcgatgatagcgacgtcggatttaggtttcggaatatggtggaagatgatatatt 21952206  T
Q  116 atacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatg 215  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |           
T  21952205 atatttgtatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaactagggatttaatttaatgacgtgtaatgagttgtttaatcatggacacat------- 21952113  T
Q  216 gacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttt 315  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21952112 -------tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttt 21952020  T
Q  316 tcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttgga 415  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21952019 tcttgtttatgttcgagtttcaatgttgtatgatttatattg-catttggaaatgctctggtttaattacaagtcaaaactggccgaaaaatggcttgga 21951921  T
Q  416 aatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggttt 486  Q
    | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  21951920 attgttttagaattctgcagaacctgctgtctgcataattgttttcctcggcagtatactgccgccggttt 21951850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 67392 - 66844
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  67392 gagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgtcttggcttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatac 67293  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaat 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| | | |    |||||    
T  67292 attatatatgtatgttcgttccatatgtgattgcgttgaatgtaagtagggatttcatttaatgatgtgtaatgagttgt--aatgtgttgt---ttaat 67198  T
Q  212 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67197 tatggacactatgtaccgttttgatgaatttcaaacttttgtgtagtttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 67098  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggct 411  Q
    |||| ||||||||| |  |||||| | |||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  67097 ttttacttgtttataagtgagtttaaatgttgtatgaattatattg-catttgggattgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggct 66999  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccg 511  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||    
T  66998 tggaaatgcttaacaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttctcggtagttaactgcagccggttttgaatacctcggcagttaactgccg 66899  T
Q  512 agaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaaca 566  Q
    ||  || |||| ||||||||||||||||| | || |||| |  ||||||||||||    
T  66898 agggggcaaaagcgtattttactcgtgtgtctcagccttatcaaatgtgtcaaca 66844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 36813360 - 36812937
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36813360 gagatgaatacgtgtggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaatataatat 36813261  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36813260 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatataatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacaattaatt 36813161  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36813160 atggaaactttgtaatgttttaatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtataagatattgtat 36813061  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| |||||||||| | |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36813060 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatggattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaactacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 36812962  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaa 437  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  36812961 tggaaatg-tttagaattatgcagaa 36812937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13743775 - 13743289
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13743775 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 13743676  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  13743675 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt---- 13743580  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  13743579 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattt-aaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 13743491  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13743490 ttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctagtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 13743392  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttc 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  13743391 tggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctacataatcagttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgc 13743293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 575
Target Start/End: Original strand, 14402569 - 14403109
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14402569 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 14402668  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14402669 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgacgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 14402768  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14402769 atagacactttgtaatgttttcatgaatttcaaacgtttgtttaatt----------------------taattatggacaattgtaaaagatattgtat 14402846  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  14402847 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggtt 14402945  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttc 509  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  14402946 tggaaatg-tttagaattatgcagaactcactgt-tgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgccggatttcaaattcctcggcagttaactgc 14403043  T
Q  510 cgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||  || ||||  |||   |||||||||| |||| |||| || || |||| |||| ||||||||    
T  14403044 cgagggggcaaaagagtaaaatactcgtgtggcacagccttatgtaaagtgtaaacaacaattctc 14403109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 507
Target Start/End: Original strand, 50957243 - 50957737
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  50957243 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttttgtttcggaatatggtggaagataatat 50957342  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt---a 209  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |    
T  50957343 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgga 50957442  T
Q  210 at-tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatatt 308  Q
    || | | ||    || |||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50957443 atgttttgagtagtt-taa---tttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtctgtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatatt 50957538  T
Q  309 gtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaat 407  Q
    ||| || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50957539 gtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctgatttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaat 50957637  T
Q  408 ggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaa 505  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  50957638 ggcttggaaatg-tttaaaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagctaa 50957735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 9427114 - 9426654
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9427114 gagatgaatacgcatggaaaacggcaaactatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 9427015  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  9427014 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt---- 9426919  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  9426918 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 9426829  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9426828 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 9426730  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccggtttc 487  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  9426729 tggaaatgctttataattatgcag-acccactatctgcataatcagatttcctcggcatttaactgccgccggtttc 9426654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 6744890 - 6745316
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6744890 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 6744989  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||              ||    
T  6744990 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaa--------------tt 6745075  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6745076 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtat 6745175  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6745176 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 6745274  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6745275 tggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 6745316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 48246920 - 48246473
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48246920 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgctttggcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 48246821  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||            
T  48246820 attatatatgtatgtttgttccatatgcaactgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggac-------- 48246729  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48246728 ------actttgtaattttttgatgaatttcaaaagtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 48246635  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggcc-gaaaaatggct 411  Q
    || | ||| ||||| | |||||||| |||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  48246634 ttatattgcttatgtctgagtttcaatgttttatgaattattttgcc-tttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccggaaaaatggct 48246536  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcat-aattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    || ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  48246535 tgaaaatg-tttagaattatgca-cacacactgtctgcataaacagttttcctcggcagttaact 48246473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 486
Target Start/End: Original strand, 2857546 - 2858005
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  2857546 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaaaatggtggaaaataatat 2857645  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||              ||    
T  2857646 attatatatgtatgttcattccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaa--------------tt 2857731  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  2857732 atggacactttgtaatgttaagatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 2857831  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||  ||||| || ||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2857832 ttatcttcattatgtccaagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 2857930  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccggttt 486  Q
    |||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||  | | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  2857931 tggaaatgctttacaattatgcag-actcactgtctgcataatcagatatcctcggcagttaactgccgccggttt 2858005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 30943700 - 30943272
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30943700 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 30943601  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  30943600 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 30943509  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30943508 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtat 30943415  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30943414 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatatt-acttttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 30943316  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30943315 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 30943272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 3952778 - 3953205
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3952778 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 3952877  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              ||||||    
T  3952878 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaatt 3952963  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3952964 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctatttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtat 3953063  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggc 410  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3953064 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggc 3953162  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3953163 ttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 3953205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8157018 - 8156591
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8157018 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 8156919  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  8156918 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 8156827  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8156826 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 8156733  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8156732 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 8156635  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8156634 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 8156591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 143 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 7841474 - 7841080
Alignment:
Q  143 ttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaattt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||    
T  7841474 ttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagttgtttaattatggacactt--------------tgtaacgttttgatgaattt 7841389  T
Q  243 caaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt 342  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  7841388 taaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttacttatggacaattgtaaaagatactgtatttatcttgtttatgtctgagtttcaatgtt 7841289  T
Q  343 gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaaccca 441  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7841288 gtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaaatggcttggaaatg-tttagaattatgcataaccca 7841191  T
Q  442 ctgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagcc-ggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| |||||| | |||||  || ||||  |||||||||| ||||    
T  7841190 ctgtttgcataatcagttttcctcggcagttaaatgcagccagatttcaaattcctcggtagttaattgccgagggggcaaaattgtattttactagtgt 7841091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 228 - 475
Target Start/End: Original strand, 600309 - 600556
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  600309 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgt 600408  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  600409 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttaaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 600507  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    | ||||||| | ||||| |||||| ||  | ||| ||||||||||||||    
T  600508 tcatgcagagctcactgcctgcatgatcagatttcctcggcagttaact 600556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 228 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 50213765 - 50213525
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  50213765 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgcatttttcttgtttatgt 50213666  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  50213665 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatagcttagaaatgttttagaa 50213567  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggca 468  Q
    | ||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  50213566 tcatgcagagctcactgtctccataatttgttttcctcggca 50213525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 228 - 576
Target Start/End: Original strand, 16646939 - 16647287
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||     
T  16646939 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttaaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaatcgtaaaagatattatatttatctt-tttatgt 16647037  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    | |||||||| |||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16647038 ctgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacagataaaaattggccggaaaatggcttggaaatgttttagaa 16647136  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataatt-gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacg 525  Q
    | ||||||| | ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||| |||||  || |||||||    
T  16647137 tcatgcagagctcactgcctgcataattagatttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacatcggcagttaactgccgagggggcaaaaacg 16647236  T
Q  526 tattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |    |||||||||| || |||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  16647237 tcaagtactcgtgtgccagaaccttatgcaatgtgggaacaacaattctca 16647287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2743964 - 2743678
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2743964 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 2743865  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |     
T  2743864 attatatacgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatgaacactttgta 2743765  T
Q  213 atggacactttgtaacgt----tttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgta 299  Q
    |||     ||||    ||    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2743764 atg----ttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgta 2743678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 47070776 - 47070529
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  47070776 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaacgtcggtttgatttaattatggacaattggaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 47070677  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
     ||||||||| |||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47070676 tcgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 47070578  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    | ||| ||| | ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  47070577 tcatgtagagctcactgactgcataatcagattttctcggcagttaact 47070529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 228 - 436
Target Start/End: Original strand, 36134048 - 36134255
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  36134048 cgttatgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 36134147  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36134148 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttcgaaatgctctgatttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaaagcttggaaatgttttagaa 36134246  T
Q  428 ttatgcaga 436  Q
    | |||||||    
T  36134247 tgatgcaga 36134255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 228 - 450
Target Start/End: Original strand, 42166177 - 42166398
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  42166177 cgttatgataaatttcaaacattagtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 42166276  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| || | ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42166277 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaaggcttggaaatgttttagaa 42166375  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgca 450  Q
    | ||||||| | ||||| |||||    
T  42166376 tgatgcagagctcactgcctgca 42166398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 238 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 52388097 - 52387900
Alignment:
Q  238 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  52388097 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggtcaattgtaaaagatattgtatttatattgtttatgtccgagtttca 52387998  T
Q  338 gtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcaga 436  Q
     |||||||||| ||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52387997 atgttgtatgaattggtttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaaggcttggaaatgttttagaatgatgcaga 52387900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2271663 - 2271463
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttt-tcttgtttatg 326  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2271663 cgttatgatgaattttaaacgtttgtctaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttatcttgtttatg 2271564  T
Q  327 accgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttaga 426  Q
     || ||||||| |||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2271563 tccaagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaaggcttgaaaatgttttaga 2271465  T
Q  427 at 428  Q
    ||    
T  2271464 at 2271463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 436
Target Start/End: Original strand, 9473721 - 9473921
Alignment:
Q  235 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  9473721 atgaatttcaaacgtttgtgtaacttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggataattgtaatagatattgtatttatattgtttatgtccgagtt 9473820  T
Q  335 tcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgca 434  Q
    ||| |||||||||| || | ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9473821 tcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgatctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaaggcttggaaatgttttagaatgatgca 9473919  T
Q  435 ga 436  Q
    ||    
T  9473920 ga 9473921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 322 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 2743611 - 2743459
Alignment:
Q  322 ttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccga-aaaatggcttggaaatgt 420  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  2743611 ttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgccttt-ggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaaatggcttcgaaatg- 2743514  T
Q  421 tttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2743513 tttacatttatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 2743459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 322 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 4005058 - 4004931
Alignment:
Q  322 ttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgtt 421  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4005058 ttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcg-aaatgctctggtttaattacatgtaaaaactggccgaaaaaatgcttggaaatgtt 4004960  T
Q  422 ttagaattatgcagaacccactgtctgca 450  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  4004959 ttagaatgatgcagagctcactgcctgca 4004931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 52567817 - 52567696
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||   |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  52567817 gtttttctcggcagttaagtgcagccgatttttgaattattcggcagttaactgccgagaaggcaaaatcgtattttactcgtgtgcctcagccttatgc 52567718  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    || || |||||| |||||||||    
T  52567717 aacgtatcaacaacaattctca 52567696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 41803052 - 41802970
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttc-aaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgt 537  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  41803052 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttttaaattcttcggcagttaactgccgagtgggcaaaaacgtattttactcgt 41802970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 43476246 - 43476125
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg--tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctg 553  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||    
T  43476246 gttttcctcggcagttaactgcagccggattttctaaaacttcggcagttaacttccgagggggcaaaaacgtcatttactcgtgtggcacaaccttatg 43476147  T
Q  554 caatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
     ||||||  |||| ||||||||    
T  43476146 taatgtgagaacaacaattctc 43476125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 461 - 576
Target Start/End: Original strand, 23443130 - 23443246
Alignment:
Q  461 tctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |  |||||    
T  23443130 tctcggcagttaactgcagccggaattcaaattcctcggcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactagtgtgtcacagccttatcaaatgt 23443229  T
Q  560 gtcaacatcaattctca 576  Q
    |  |||| |||||||||    
T  23443230 gggaacaacaattctca 23443246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 55385191 - 55385068
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||  || ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||    
T  55385191 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgagggggcaaaaacgtcaattactcgtgtgccacaaccttatgc 55385092  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaag 578  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||    
T  55385091 aatgtgggaacaacaattttcaag 55385068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Original strand, 19454350 - 19454464
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||   ||||| || |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||     
T  19454350 ctcggcagttaactgcaaccgatttttgaattcctcagcagttaactgccgagagggcaaaagcgtattttactcgtgtgtctcaaccttatgcaatgta 19454449  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
    |||||| ||||||||    
T  19454450 tcaacaacaattctc 19454464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 565
Target Start/End: Original strand, 52570585 - 52570694
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | || |||| |||    
T  52570585 gtttttctcggtagttaactgcagtcggtttttgaattcttcggcagttaactgccgagg-ggaaaaaacgtattttaatcgtgtgcctcagccttatgc 52570683  T
Q  555 aatgtgtcaac 565  Q
    |||||||||||    
T  52570684 aatgtgtcaac 52570694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Original strand, 7247879 - 7248000
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||| | || |||| | |    
T  7247879 gttttcctcgtcagttaactgcagccggttattgaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaagcgtattttattcgtgtgcctcagccttatcc 7247978  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  7247979 aatgtgtcaacaacaattctca 7248000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 19440310 - 19440193
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||   ||||||||||||||| | || | || |||    
T  19440310 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttatgaattcttcggcagttaactgccgaggaggcaaaagtttattttactcgtgtgcctcagctttatgc 19440211  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  19440210 aatgtatcaacagcaatt 19440193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 41805694 - 41805814
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||  ||||| ||||| | || |||| |||    
T  41805694 gttttcctcggcagttaattgcagccggtctttaaattcttcgacagttaactgccgaggaagcaaaaacgtaaattacttgtgtgcctcagccttatgc 41805793  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  41805794 aatgtgtcatcaacaattctc 41805814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 578
Target Start/End: Original strand, 2432962 - 2433085
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||| |  ||||| ||| ||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  2432962 gttttcctcgacagttaactgtatccggttattgaattcctcgacagttaactgccgaggggataaaagcgtattttactcgtgtgcctcagccttatgc 2433061  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaag 578  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  2433062 aatgtgtcaacaacaattctcaag 2433085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 550
Target Start/End: Original strand, 49219810 - 49219905
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  49219810 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaattcctcggcagttaactaccgaggaggcaaaattgtattttactagtgtggcacagcctt 49219905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14398583 - 14398469
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||   ||||||||||||||| |||| || || |||    
T  14398583 ctcggcagttaactgcagccggaattcaaattcctcggcagttaaccgccgaggagataaaatcgtaaaatactcgtgtgacacagccttatgtaaagtg 14398484  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
    | |||| ||||||||    
T  14398483 taaacaacaattctc 14398469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41137774 - 41137652
Alignment:
Q  454 ttgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttct 552  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||    | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  41137774 ttgttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgctgatggagcaaaaacatattttactagtgtggcacaaccttat 41137675  T
Q  553 gcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
      ||||||  |||| ||||||||    
T  41137674 caaatgtgggaacaacaattctc 41137652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 550
Target Start/End: Original strand, 2745230 - 2745319
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  2745230 ctcgacagttaactgcagccgaatttcaaattcctcagcagttaactaccgagggggtaaaatcgtattttattggtgtgacacaacctt 2745319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 462 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6489377 - 6489264
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    ||| |||||  || |||||||||  ||||| ||||| | ||||||| |||||||||    
T  6489377 ctcggcagttaactgcagccggtttcttaattcctcggca----actgccgagggggcaaaaacgtaaattacttgtgtgcctcaaccttatgcaatgtg 6489282  T
Q  561 tcaacatcaattctcaag 578  Q
    |||||| |||||||||||    
T  6489281 tcaacagcaattctcaag 6489264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 46344991 - 46344871
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||| ||||||||| |||||  || |||||  ||||||||| ||||| | ||||||| | |    
T  46344991 gttttcctcggcagttaactgcagccgatttttgaattcctcgacagttaactgccgagggggcaaaaaaatattttacttgtgtgcctcaaccttatcc 46344892  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  46344891 aatttgtcaacatcaattctc 46344871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 2743452 - 2743394
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2743452 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgag 2743394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Original strand, 6505976 - 6506090
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttc-aaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||  |  |||||||||  ||||||||||| | || |||| | |||||||    
T  6505976 ctcggcagttaactgcagccggtttcttaattccttggcagttaacttctgaggggacaaaaacgtaaattactcgtgtgcctcagccttatacaatgtg 6506075  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||  |||||||    
T  6506076 tcaacagtaattctc 6506090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 41579743 - 41579865
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||| |||||| |||||  || |||| |||||||||||  |||| | || |||| |||    
T  41579743 gttttcctcggcagttaactgcagccggttattgaattcctcagcaattaactgccgagggggaaaaatcgtattttacttatgtgcctcagccttatgc 41579842  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  41579843 aacgtgtcaacaacaattctcaa 41579865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Original strand, 48250888 - 48251009
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||| |||||  || ||||||||  |||| |  |||| ||||||||| ||     
T  48250888 gttttcctcggcagttaactgcagccggaattcaaattcctcagcagttaactgccgagggggcaaaaacgtcatttatttatgtggcacaaccttatgt 48250987  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    ||||||  |||| |||||||||    
T  48250988 aatgtgggaacaacaattctca 48251009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 458 - 578
Target Start/End: Original strand, 50216875 - 50216996
Alignment:
Q  458 ttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaa 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| || |   || ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |  ||    
T  50216875 ttttctcggcagttaactgcagccggatttttaattcctcggcagttaactgccaatggggcaaaaacgtcaattactcgtgtgccacaaccttatcaaa 50216974  T
Q  557 tgtgtcaacatcaattctcaag 578  Q
    ||||  |||| |||||||||||    
T  50216975 tgtgggaacaacaattctcaag 50216996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 55267488 - 55267375
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgt 561  Q
    |||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||  ||||||||||| | || |||| ||||| ||||    
T  55267488 tcggcaattaactgcagccgatttttgaattcttcggcagttaactgtcgagggggcaaaaacgtaaattactcgtgtgtctcagccttatgcaacgtgt 55267389  T
Q  562 caacatcaattctc 575  Q
    ||||| ||||||||    
T  55267388 caacaacaattctc 55267375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 43478849 - 43478969
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||| |||||  |  |||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||     
T  43478849 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcagcagttaactgccgaggggacaaaaacatcatttactcgtgtggcacaaccttatgt 43478948  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||  |||| ||||||||    
T  43478949 aatgtgggaacaacaattctc 43478969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 465 - 575
Target Start/End: Original strand, 55207691 - 55207802
Alignment:
Q  465 ggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtca 563  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||   || ||||  |||||||||||||||  | || || | || |||||||||    
T  55207691 ggcagttaactgcaaccggtttttgaattcttcggcagttaactgccgatggggcaaaagagtattttactcgtgtttctcagccatatgaaatgtgtca 55207790  T
Q  564 acatcaattctc 575  Q
    ||||||||||||    
T  55207791 acatcaattctc 55207802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7314683 - 7314585
Alignment:
Q  229 gttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||||| |||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  7314683 gttttgttgaatttcaaacattcgtataattttaacaaaatgtcgaattgatttaattttggtcaattgtgaaagattatgtattgttcttatttatga 7314585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 13747737 - 13747795
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13747737 gttttcctcagcagttaactgcagccggatttcaaattcatcggcagttaactgccgag 13747795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 540
Target Start/End: Original strand, 13896895 - 13896980
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  13896895 gttttcctcgacagttaactgcagccagttattaaattcttcagcaattaactgccgaggagtcaaaaacatattttactcgtgtg 13896980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 540
Target Start/End: Original strand, 19341613 - 19341698
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||  |  |||||||||  |||||||||||    
T  19341613 gttttcctcggtagttaactgcagccggatttctaattcctcggcagttaactgccgaggggacaaaaacgtaacttactcgtgtg 19341698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Original strand, 29918360 - 29918477
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | |||||  |  |||| |||||||||||  |||| | || |||| ||     
T  29918360 gttttcctcggcagttaactgcagccggttttcgaattattcggcagttaattgccgaggggccaaaatcgtattttacttatgtgcctcagccttatga 29918459  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  29918460 aatatgtcaacaacaatt 29918477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Original strand, 29967513 - 29967630
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | |||||  |  |||| |||||||||||  |||| | || |||| ||     
T  29967513 gttttcctcggcagttaactgcagccggttttcgaattattcggcagttaattgccgaggggccaaaatcgtattttacttatgtgcctcagccttatga 29967612  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  29967613 aatatgtcaacaacaatt 29967630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 572
Target Start/End: Original strand, 45101873 - 45101984
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  || |||||| |||||  | |||||||||||||||||  |||| | ||||||| || ||||||    
T  45101873 ctcggcagttaactgcagccggtttttgaattcctcaacaattaactgccgaggggataaaaacgtattttacttatgtgcctcaaccttatgaaatgtg 45101972  T
Q  561 tcaacatcaatt 572  Q
    || ||| |||||    
T  45101973 tcgacaacaatt 45101984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 600563 - 600685
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||  ||||   | ||||||||  |||||||||||| | || |||||| |    
T  600563 gttttcctcgacagttaactgcggccggatttccaaaacttcggcagttaactgtcgagggcgcaaaaacgtcatttactcgtgtgccgcagccttctac 600662  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||  |||| ||||||||||    
T  600663 aatgtgggaacaacaattctcaa 600685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 4002524 - 4002582
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||    
T  4002524 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcagtagttaactgccgag 4002582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26245386 - 26245331
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||    
T  26245386 gtttttctcggaagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccgag 26245331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 34694453 - 34694511
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  34694453 gtttttctcggcagtttactgcagccggatttctaattcctcgacagttaactgccgag 34694511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 494 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 44490420 - 44490374
Alignment:
Q  494 ttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  44490420 ttcggcagttaactaccgaggaggcaaaaacgtattttattcgtgtg 44490374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 517
Target Start/End: Original strand, 48892151 - 48892205
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||||    
T  48892151 tcggcagttaactgcagccggtttttaattcctcgacagttaactgtcgagaagg 48892205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 495 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 7245165 - 7245096
Alignment:
Q  495 tcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaa 564  Q
    ||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  7245165 tcggcagttaattgtctagagggtaaaaacgtattttacttgtgtgcctcaaccttatgaaatgtgtcaa 7245096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 475
Target Start/End: Original strand, 7839472 - 7839513
Alignment:
Q  435 gaacccactgtctgcataatt-gtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7839472 gaacccactgtctgcataattagttttcctcggcagttaact 7839513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 51402481 - 51402538
Alignment:
Q  519 aaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |||||||||||||||||||||  | || || | || ||||||||||||||||||||||    
T  51402481 aaaaacgtattttactcgtgtttctcagccatatgaaatgtgtcaacatcaattctca 51402538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19044815 - 19044354
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19044815 gagaagaatatgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataatat 19044716  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19044715 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgatttgtttaattatggacacttaatt 19044616  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19044615 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtat 19044516  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19044515 ttttcttggttatgacccaatttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaattctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaatggctt 19044417  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19044416 ggaaatgcattagaattatgcaaaacccactatctgcataattgttttcctcggcagttaact 19044354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 20709821 - 20710282
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20709821 gagaagaatatgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataatat 20709920  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20709921 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgatttgtttaattatggacacttaatt 20710020  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20710021 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtat 20710120  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20710121 ttttcttggttatgacccaatttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaattctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaatggctt 20710219  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20710220 ggaaatgcattagaattatgcaaaacccactatctgcataattgttttcctcggcagttaact 20710282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 34623002 - 34622560
Alignment:
Q  18 gaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattat 117  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34623002 gaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatgatggaagataatatattat 34622903  T
Q  118 acatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatgga 217  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  34622902 atatgtatgttcgtttcatatgcaattgcgttgaatgtaagtagaagtttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt--------- 34622812  T
Q  218 cactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttc 317  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34622811 -----tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaatatattgtatttttc 34622717  T
Q  318 ttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaa 417  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34622716 ttatttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactgaccgaaaaatggcttggaaa 34622618  T
Q  418 tgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  34622617 tgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttccttggctgttaact 34622560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 526
Target Start/End: Original strand, 47742553 - 47743053
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47742553 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 47742652  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||              ||    
T  47742653 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaa--------------tt 47742738  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47742739 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgcat 47742838  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggcc-gaaaaatggct 411  Q
    || |||||||| || ||  |||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  47742839 ttatcttgtttttgtccatgtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccaaaaaaatggct 47742937  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccg-gtttcaaattcttcggcagttaacttc 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||| || |||||| |    
T  47742938 tggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcgacagttaactgcagccgaatctcaaattcctcgacaattaactgc 47743036  T
Q  510 cgagaaggtaaaaacgt 526  Q
     |||| || ||||||||    
T  47743037 tgagaggggaaaaacgt 47743053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 10705765 - 10705309
Alignment:
Q  14 agatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatata 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  10705765 agatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggctaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagatgatata 10705666  T
Q  114 ttatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaatt 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||| |    ||||||    
T  10705665 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttattgatgtgtaatgagttgt--aatgtattgt---ttaatt 10705571  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705570 atggacactatgtaacattttgatgaattttaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 10705471  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| |||    
T  10705470 tttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcc-tttagaaatgctttggttaaattacatgtaaaaattgaccgaaaaatgactt 10705372  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10705371 ggaagtgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttctcggcagttaact 10705309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Original strand, 15069914 - 15070365
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15069914 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 15070013  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  15070014 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt---- 15070109  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaa-tgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15070110 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 15070199  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggc 410  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15070200 tttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattatttagcc-tttggaaatgctctggtttatttacaggtaaaaactggccgaaaaaatggc 15070298  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  15070299 ttggaaatg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcngcagttaactgc 15070365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 451
Target Start/End: Original strand, 18109357 - 18109781
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18109357 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 18109456  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  18109457 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt---- 18109552  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaa-tgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18109553 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 18109642  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggc 410  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||     
T  18109643 tttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacagataaaaactggccgaaaaaatggt 18109741  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcat 451  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18109742 ttggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcat 18109781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Original strand, 42503402 - 42503853
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42503402 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctacatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 42503501  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              ||||||    
T  42503502 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaatt 42503587  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacc-aaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  42503588 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgttggtttaatttaatcatgaacaattataaaagatattgta 42503687  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggc 410  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  42503688 tttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgcatgaattatttagcc-tttggagatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatagc 42503786  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  42503787 ttggaaatg-tctagaattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcgacagttaactgc 42503853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 604288 - 603862
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  604288 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 604189  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  604188 attatatatgtatgtttgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 604097  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  604096 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcgatttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtat 604003  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||  |||||  ||||||||| | |||||||| |||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  604002 ttatcttcattatgttcgagtttcaatcttgtatgaattattttacc-tttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 603904  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603903 tggaaat-acttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 603862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12111729 - 12111267
Alignment:
Q  16 atgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatatt 115  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    
T  12111729 atgaatacacatggaaaacgacaagctatatgccttggtttattaaagatgatagcgacgtcggatttatatttcggaatatggtggaaaataatat--t 12111632  T
Q  116 atacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaattat 214  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| ||| |    ||||||||    
T  12111631 atatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgt--aatgtattgt---ttaattat 12111537  T
Q  215 ggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt 314  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12111536 ggacaatttataacgttttgatgaattttaaactttggtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattataaaagatattgtattt 12111437  T
Q  315 ttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattg-------------ccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||              | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  12111436 ttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactgactg 12111337  T
Q  402 aaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaaccca-ctgtctgcataattgtttttctcggcagt 470  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  12111336 aaaaataacttgaaaatgctttagaattatgcataacccacctatctgcataattgttttgttcggcagt 12111267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 43620189 - 43619728
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43620189 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 43620090  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  43620089 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 43619998  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43619997 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 43619904  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| | |||||||| |  |   ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43619903 ttatcttcattatgtctgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 43619806  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccggtttc 487  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43619805 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactgccgccggtttc 43619728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 45767424 - 45767851
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45767424 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 45767523  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              ||||||    
T  45767524 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaatt 45767609  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45767610 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtat 45767709  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45767710 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt--ggaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 45767807  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45767808 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 45767851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 454
Target Start/End: Original strand, 30790570 - 30790998
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30790570 gagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 30790669  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              ||||||    
T  30790670 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaatt 30790755  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  30790756 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattctat 30790855  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgtt--gtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatgg 409  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| |  |   ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  30790856 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaaatggccgaaaaaatgg 30790954  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 454  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30790955 cttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 30790998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 303
Target Start/End: Original strand, 47064858 - 47065148
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||   || ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  47064858 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggtttattaaagatgatagcgacgtcaaatttatgtttcgaaatatggtggaaaataatat 47064957  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47064958 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacatttaatt 47065057  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 303  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47065058 atggatactttgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttaaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 47065148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 229 - 485
Target Start/End: Original strand, 40928719 - 40928975
Alignment:
Q  229 gttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40928719 gttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgattatgac 40928818  T
Q  329 cgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40928819 cgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttagaa 40928916  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccggtt 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40928917 ttatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgctgccggtt 40928975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 228 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 5538152 - 5537867
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  5538152 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtataatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtataagatattttatttttcttgtttatgt 5538053  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5538052 ccgagtttcaatgttgtatgaattat-tttccctttcgaaatgctctgctttaattac--gtaaaaactgaccgaaaaatggcttgaaaatgttttagaa 5537956  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggcagttaactgcagccg-gtttcaaattcttcggcagttaacttccgaga 514  Q
    | ||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  5537955 tcatgcagagctcactgtctacataatttgttttcctcggcagttaactgcagccgaatttctaattcctcggcagctaactgccgaga 5537867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 228 - 450
Target Start/End: Original strand, 17838400 - 17838621
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17838400 cgttatgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 17838499  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17838500 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaagtaaatactggccgaaaaaaggcttggaaatgttttagaa 17838598  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgca 450  Q
    | ||||||| | ||||| |||||    
T  17838599 tgatgcagagctcactgcctgca 17838621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 235 - 475
Target Start/End: Original strand, 34742168 - 34742407
Alignment:
Q  235 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34742168 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgtccgagtt 34742267  T
Q  335 tcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgca 434  Q
    ||| |||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34742268 tcaatgttgtatgaatt-ttttgcc-tttcgaaatgctctactttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttggaaatgttttagaatcatgca 34742365  T
Q  435 gaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||   |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  34742366 gagttcactgtctgcataatttgttttcctcgacagttaact 34742407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 238 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 29592841 - 29592626
Alignment:
Q  238 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttca 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29592841 aatttcaaaagtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttatcttgtttatgtccgagtttca 29592742  T
Q  338 gtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcaga 436  Q
     | |||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  29592741 atcttgtatgaattatttttcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggtttggaaatg-tttaaaattatgcaga 29592644  T
Q  437 acccactgtctgcataat 454  Q
    | ||||||||||||||||    
T  29592643 atccactgtctgcataat 29592626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29593011 - 29592839
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29593011 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcaacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatac 29592912  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaat 185  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29592911 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaat 29592839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 228 - 475
Target Start/End: Original strand, 13323480 - 13323727
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  13323480 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacgaaatgccggtttaatttaattatggaaaattgtaaaaaatattgtatttttcttgttaatgt 13323579  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    |  |||||||  ||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13323580 ctcagtttcaacgttgtatgaattattttacc-tttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactgcccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 13323678  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||| ||| | || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  13323679 ttatgaagagctcattatctgcataatttgttttgctcagcagttaact 13323727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 380 - 572
Target Start/End: Original strand, 36186416 - 36186608
Alignment:
Q  380 aattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcag 479  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  36186416 aattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttgaaaatgctttagaattatgcagaactcactgtatgtataattgttttcctcggcagttaactgcaa 36186515  T
Q  480 ccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  36186516 ccggtttcgaattcctcggcatttaactgccgagggggcaaaagcgtattttactcgtgtgacacagccttatgcaatgtgtcaacaacaatt 36186608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 314
Target Start/End: Original strand, 10522280 - 10522366
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt 314  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10522280 cgttatgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt 10522366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 46738856 - 46738734
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||     
T  46738856 gtttttctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgagagggcaaaaacgtcatttgctcgtgtggcacaaccttatgt 46738757  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||  |||| ||||||||||    
T  46738756 aatgtgggaacaacaattctcaa 46738734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 19044347 - 19044226
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||     ||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||    
T  19044347 gttttcctcggcaattaactgcagtcggtttcaaattcctcggcaattaactgccgagtgaacaaaaacgtattttactcatgtgcctcagccttatgca 19044248  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  19044247 atgtgtcaacaataattctcaa 19044226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 20710289 - 20710410
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||     ||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||    
T  20710289 gttttcctcggcaattaactgcagtcggtttcaaattcctcggcaattaactgccgagtgaacaaaaacgtattttactcatgtgcctcagccttatgca 20710388  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  20710389 atgtgtcaacaataattctcaa 20710410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 463 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 21185666 - 21185551
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgt 561  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||  |||| | || | || ||||||||||    
T  21185666 tcggcagttaactacagccggttattgaattcttcggcagttaactgccgaggaggcaaaatcgtattttacttatgtgtctcatcattatgcaatgtgt 21185567  T
Q  562 caacatcaattctcaa 577  Q
    ||||| ||||||||||    
T  21185566 caacaacaattctcaa 21185551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 463 - 576
Target Start/End: Original strand, 28980199 - 28980313
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgt 561  Q
    |||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||| ||||| | |||  || |||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  28980199 tcggcagttaactgcatccggatattgaattcttcggcagctaactgctgagggggcaaaaacgtattttactcgtgtgtctcagccttatgcaatgtgt 28980298  T
Q  562 caacatcaattctca 576  Q
    ||||| |||||||||    
T  28980299 caacaacaattctca 28980313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Original strand, 34623405 - 34623519
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||||| ||    
T  34623405 ctcggcagttaactgcagccgatctcttaattcctcggcagttaactgccgatgaggcaaaaacgtaaattactcgtgtgtctcaaccttatgcaatatg 34623504  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
    |||||| ||||||||    
T  34623505 tcaacagcaattctc 34623519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 42499463 - 42499368
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||  |||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42499463 gttttcctcggcagttaactgcagtcggatttcaaattcctcggcaattaactgtcgaaggggtaaaatcgtattttactggtgtgacacaacctt 42499368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Original strand, 29593353 - 29593467
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||    
T  29593353 ctcggcagttaactgcagccggaattcaaattcctcggcagttaactgtcgagggggtaaaattgtattttactagtgtggcacaaccttatcaaatgtg 29593452  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
      |||| ||||||||    
T  29593453 ggaacaacaattctc 29593467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 34139945 - 34139856
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||   || |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  34139945 ctcggcagttaactgcagccggatttctaattcttcggcagttaattaccgaaggggcaaaaacgtaaattactcgtgtgccacaacctt 34139856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 48314720 - 48314608
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgt 561  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||    
T  48314720 tcggtagttaactgcagccggttattgaattcctcggcagttaactgccgagg-ggcaaaaatgtattttacttgtgtacctcaaccttatgcaatgtgt 48314622  T
Q  562 caacatcaattctc 575  Q
    ||||| ||||||||    
T  48314621 caacaacaattctc 48314608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 575
Target Start/End: Original strand, 46863373 - 46863483
Alignment:
Q  466 gcagttaactgcagccggttt--caaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtca 563  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||| ||||    
T  46863373 gcagttaactgcagccggtttttcaatttct-cggcagttaactgccgatggggcaaaaacgtattttacttgtgtgtctcagccttatgcaatgcgtca 46863471  T
Q  564 acatcaattctc 575  Q
    ||| ||||||||    
T  46863472 acaacaattctc 46863483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 457 - 513
Target Start/End: Original strand, 618745 - 618802
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  618745 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgag 618802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Original strand, 9494825 - 9494942
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||  || | | || ||||||||| ||||| | || |||| ||     
T  9494825 gttttcctcggcagttaactgcagccggttttttaattcctcggcagttaactgccgagggggcatatacctattttacttgtgtgcctcagccttatga 9494924  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||||||||||| |||||    
T  9494925 aatgtgtcaacaacaatt 9494942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 35839369 - 35839321
Alignment:
Q  530 ttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaag 578  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35839369 ttactagtgtgacacaaccttatgcaatgtgtcaacaacaattctcaag 35839321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 47060980 - 47060861
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||||| || || | || |||| || |    
T  47060980 gttttcctcggcagttaactacagccgattttgaattcctcgacagttaactgccgagggggcaaaaacgtattttacttgtatgcctcagccttatgaa 47060881  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    || ||||||||  |||||||    
T  47060880 atatgtcaacaataattctc 47060861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 28112857 - 28112779
Alignment:
Q  494 ttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  28112857 ttcgacagttaactgccgagagggcaaaagcgtattttacttgtgtgtctcaaccttatgaaatgtgtcaacaacaatt 28112779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 48269700 - 48269615
Alignment:
Q  489 aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| | || |||| |  |||||||||||| ||||||||    
T  48269700 aattcttcggcagttaactgccgag-agggaaaaacatattttacttgtgtgcctcagccttataaaatgtgtcaacaacaattctc 48269615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Original strand, 30471633 - 30471678
Alignment:
Q  530 ttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30471633 ttactcgtgtgacacagccttttgcaatgtgtcaacaacaattctc 30471678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 39460597 - 39460480
Alignment:
Q  466 gcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaa 564  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| | |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |  ||||| | ||    
T  39460597 gcagttaactgcagccggatttttaattcctcggcaatcaactgccgagaggataaaatcgtattttactcgtgtttctcaaccttatcaaatgtataaa 39460498  T
Q  565 catcaattctcaaggaaa 582  Q
    || |||||||||| ||||    
T  39460497 caacaattctcaaagaaa 39460480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 41623898 - 41623955
Alignment:
Q  519 aaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  41623898 aaaaacgtattttacttgtgtgcctcaaccttatgtaatgtgtcaacagcaattctca 41623955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 539
Target Start/End: Original strand, 30355258 - 30355342
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccg-gtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgt 539  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||| |||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  30355258 gttttcctcggcagttaactgcagccgatttttgaattcttcagcaattaactgccgagggggcaaaagcgtattttactcgtgt 30355342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41047831 - 41047712
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |  |||| | ||  ||| |||    
T  41047831 gttttcctcggcagttaactacacccgattattaaattcttctgcagttaactaccgagaagc-aaaaatgtattttatttatgtgccgcagtcttatgc 41047733  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  41047732 aatgtgtcaacaacaattctc 41047712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 34622547 - 34622432
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||  | ||  || |||||||||  ||||| ||||| | || |||| |||||||||    
T  34622547 ctcgacagttaactgcagtcggtttcttaattcctctgcagttaactgtcaagggggcaaaaacgtaaattacttgtgtgcctcagccttatgcaatgtg 34622448  T
Q  561 tcaacatcaattctca 576  Q
    |||||| |||||||||    
T  34622447 tcaacaacaattctca 34622432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 45361702 - 45361623
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| |||||   | |||||| ||||||||||    
T  45361702 tttttctcggcagttaactgcagccggatttttaattcctcgtcagttaactgccgagggagcaaaaacatattttactc 45361623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 41049208 - 41049327
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccga-gaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctg 553  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||| |||| |||   |||| |||||||||||  ||||   || |||| ||    
T  41049208 gttttcctcggcagttaactgcagccgattattgaattcttcgacagttaactaccgaagaac--aaaagcgtattttacttatgtgcatcagccttatg 41049305  T
Q  554 caatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  41049306 caatgtgtcaacaacaattctc 41049327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 495 - 577
Target Start/End: Original strand, 43686907 - 43686989
Alignment:
Q  495 tcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||  |||| ||||||||||    
T  43686907 tcggcagttaactactgagagggcaaaatcgtattttactagtgtggcacaaccttatcaaatgtgggaacagcaattctcaa 43686989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 49140707 - 49140652
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||    
T  49140707 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccgag 49140652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10705302 - 10705217
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccg-gtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||||||||| || ||  || ||||| |||||||||| |||||    
T  10705302 gtttttctcggcagttaactgcagccgattttttaatttctcggcagttaactgccaaggggggaaaaatgtattttacttgtgtg 10705217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 534
Target Start/End: Original strand, 27453619 - 27453692
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttact 534  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||  || |||  |||||||||||    
T  27453619 ctcggcagttaactgcagccggatttttaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaagtcgtattttact 27453692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 46907590 - 46907536
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccga 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||    
T  46907590 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccga 46907536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 47776386 - 47776265
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagcc-ggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||||  |||||||||||||  ||||  || |||| ||||||||||||||||  | || |||| |      
T  47776386 gttttcctcggcagttaactgcagccagatttttaatttctcggcagttaactgtcgagggggcaaaatcgtattttactcgtgtttctcagccttatca 47776287  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  47776286 aatgtgggaacatcaattctca 47776265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 63 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25878089 - 25877682
Alignment:
Q  63 gacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  25878089 gacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgtttgttccatatgcaattgtgatg--tgtaagtagg 25877992  T
Q  163 gatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttga 262  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25877991 gatttaatataatcacgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttga 25877892  T
Q  263 accaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttt 362  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25877891 accaaatgtcggtt--atttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccaagtttcaatgttgtatgatttatattg-cttt 25877795  T
Q  363 tggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttc 462  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25877794 tgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataaatgttttcc 25877695  T
Q  463 tcggcagttaact 475  Q
    |||||||||||||    
T  25877694 tcggcagttaact 25877682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 34123047 - 34122585
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34123047 gagatgaatacgcatggaaaacggtaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 34122948  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34122947 attatatatatatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaagtatgaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 34122848  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34122847 atgaacaccttgtaaccttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 34122748  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34122747 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 34122649  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34122648 tgaaaat-atttagaattatgcagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 34122585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7797086 - 7796695
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7797086 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgctttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7796987  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  7796986 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt---- 7796891  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7796890 ----------tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattataaaagatattgtat 7796801  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7796800 ttttcttgtttataaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatagctt 7796702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24053672 - 24053204
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24053672 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcgaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 24053573  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||  ||     ||||||    
T  24053572 attatatatgtatgttctttctatatgcaattgcgttgaatgtaattagggatataatttaatgatgtgtaatgagttgtaatatgttgt----ttaatt 24053477  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24053476 atggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatgtaattatggacaattgtaaaagatattgtat 24053377  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24053376 tttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcc-tttgaaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggctt 24053278  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggttt 486  Q
    | ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24053277 gaaaatgcttgacaattatgcagaactcactgtctgcataagtgtttttctcggcagttaactgcagacggttt 24053204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13564150 - 13563663
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13564150 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttatttgcgatgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13564051  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  13564050 attatatatgtatgttcgatccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt---- 13563955  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  13563954 ----------tgtaatgttttaatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 13563865  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  13563864 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaaatggct 13563766  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttc 509  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |    
T  13563765 tggaaatg-tttataattatgcagaacccactgtctgcataatcagttctcctcggcagttaactgcagccggattacatattcttcggcagttaactgc 13563667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Original strand, 1039356 - 1039819
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  1039356 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacatcggatttatgttt-ggaatatggtggaaaataatat 1039454  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
     ||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  1039455 gttatatatgtatgttcgtaccatatgcagttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgttaaattattgacacttaatt 1039554  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1039555 atagacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 1039654  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactg-gccgaaaaatggct 411  Q
    || || |||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  1039655 ttatcgtgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgacccaaaaaatggct 1039753  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  1039754 tggaaat-atttaggattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgc 1039819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 33994713 - 33995160
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  33994713 gagatgaatacgcatggacaacggcaaactatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcttaatatggtggaagataatat 33994812  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    || |             
T  33994813 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgttta----tgca--------- 33994899  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
     |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33994900 -tggacactatgtaacgatttgaagaatttcaaacttttttgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 33994998  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33994999 tttacttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcc-tttggaaatgttctggttaaattacatgtaaaaactggccgaaaaatggctt 33995097  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33995098 ggaaatgcttaacaattatgcataacccactgtctgcataaatgttttcctcggcagttaact 33995160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27863912 - 27863440
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27863912 gagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacagcgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaagataatat 27863813  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  27863812 attatatatgtatgttcgttccatttgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt---- 27863717  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  27863716 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 27863627  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||| ||||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27863626 ttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtgtgaattattttgcc-tttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 27863528  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcgg 498  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  27863527 tgaaaatg-tttagaattatgcagaacccactatctgcataatcagttttcctcggcagttaactgcaaccggatttcaaattcctcgg 27863440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 38856224 - 38855774
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38856224 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 38856125  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  38856124 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggattgaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt---- 38856029  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaa-tgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38856028 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattacgaacaattgtaaaagatattgta 38855939  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggct 411  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38855938 tttatcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattatttagcc-tttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggct 38855840  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  38855839 tggaaatg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgc 38855774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24050547 - 24050088
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24050547 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcgaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 24050448  T
Q  113 at--tatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacactta 209  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| | | |    |||    
T  24050447 atattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatataatttaatgatgtgtaatgagttgt--aatgtgttgt---tta 24050353  T
Q  210 attatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattg 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24050352 attatggatactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattg 24050253  T
Q  310 tatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatgg 409  Q
    |||||| |||||||||||| || ||| | |||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24050252 tattttacttgtttatgactgaatttaaatgttgtataagttatatttcc-tttggtaatgctctggttaaattacatgtgaaaactggccgaaaaatgg 24050154  T
Q  410 cttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  24050153 cttggaaatgcttaacaattatgcagaactcactatctgcataaatgtttttgtcgatagttaact 24050088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 13 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 37815091 - 37814668
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37815091 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcacgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 37814992  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  37814991 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaaagtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt---- 37814896  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  37814895 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtac 37814806  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggcc-gaaaaatggct 411  Q
    || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37814805 ttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccggaaaaatggct 37814707  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcat 451  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37814706 tggaaatg-tttagaactatgcagaacccactgtctgcat 37814668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 25890503 - 25890059
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| || ||||||||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  25890503 gagatgaatacgcgtggaaaacagcaagcgatatgcctttgcttattcgcgacgacgtcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaataatat 25890404  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||        
T  25890403 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatgaacactt---- 25890308  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25890307 ----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtataagatattgtat 25890218  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25890217 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 25890119  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagtt 471  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  25890118 tggaaatg-tttagaattatgcagaacttgttgtctgcataatcagttttcctcggcagtt 25890059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 11029516 - 11029067
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11029516 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 11029417  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||              
T  11029416 attatatatgtatgttcgtttcatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtgatgagtagtttaattatgg---------- 11029327  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacc-aaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11029326 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgca 11029233  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggc 410  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  11029232 tttatcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattatttagcc-tttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaaatggc 11029134  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11029133 ttggaaatg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgc 11029067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 71 - 477
Target Start/End: Original strand, 34079753 - 34080145
Alignment:
Q  71 cgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaat 170  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34079753 cgacggcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaaggatttaat 34079852  T
Q  171 ttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatg 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34079853 ttaatgatgtgtaatgagttgtttaa--------------ttatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatg 34079938  T
Q  271 ttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatg 370  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  34079939 tcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatg 34080037  T
Q  371 ctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggca 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||    
T  34080038 ctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctctgca 34080136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 28882497 - 28882058
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28882497 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcatttgcttatttgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 28882398  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            
T  28882397 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtggggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac-------- 28882306  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28882305 ------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaacgaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtat 28882212  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||| |||||||||||||||| | |||||||       ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28882211 ttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatg------tttgcc-tttgtaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 28882119  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataatt-gtttttctcggcagtta 472  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28882118 tggaaatg-cttagaattatgtagaacctactggctgcataattagttttcctcggcagtta 28882058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 92 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7017941 - 7017573
Alignment:
Q  92 gaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  7017941 gaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtag 7017842  T
Q  192 tttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatgga 291  Q
    |||||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  7017841 tttaattatggacactt--------------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaa 7017756  T
Q  292 caattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaa 391  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7017755 caattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacagataa 7017657  T
Q  392 aaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  7017656 aaactggccgaaaaaatggcttgaaaatg-tttagaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 7017573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 30352939 - 30352503
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  30352939 gagatgaatatgcatgaaaaacggcaagttatatgccttggcttgttaaagacgatagcgacgtcgtatttatgtttcggaatattgtggaaaataatat 30352840  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||    |  ||     ||||||    
T  30352839 attatatatgtatgttttttccatatgcaattgcattgaatgtaagtaaagatttaatttattgatatgtaatgagttgtaatgtgctgt----ttaatt 30352744  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  30352743 atggacactgtgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgctggtttgatttaattatggaca-----aaaagatattgtat 30352649  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggctt 412  Q
    ||||||  |||||||| |||||| | |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  30352648 ttttct--tttatgactgagtttaaatgttgtatggcttatattg-catttggaaatgctctgatttatttacagataaaaactgatcgaaaaatggctt 30352552  T
Q  413 ggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttt 461  Q
    | ||||| || | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  30352551 gaaaatgcttaacaattatgcaaaattcactgtctgcataattgttttt 30352503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 301 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 4196790 - 4196515
Alignment:
Q  301 aagatattgtattttt-cttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggc 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  4196790 aagatattgtattttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgccttt-ggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattgac 4196692  T
Q  400 cgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggc 499  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  4196691 cgaaaaatagcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaattgcagccgattttaaattcctcggc 4196592  T
Q  500 agttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    | |||||| ||||    | |||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4196591 acttaactaccgaatgagcaaaaacttatttgactcgtgtgacac-agcttatgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 4196515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 38407454 - 38407208
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  38407454 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgccggtttgatttaattatggacaattctaaaagatattgtatttttcttgtttatgt 38407355  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38407354 ctgagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttcgaaatgttctgctttaattacaggtaaaaactggccg-aaaatggcttggaaatgttttagaa 38407257  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgcataa-ttgtttttctcggcagttaact 475  Q
    | ||||||| | |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  38407256 tcatgcagagctcactgtctacataatttgttttcttcggcagttaact 38407208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 14280542 - 14280737
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14280542 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 14280641  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt 208  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14280642 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt 14280737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 228 - 475
Target Start/End: Original strand, 7762008 - 7762256
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  7762008 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatctatcttgtttatgt 7762107  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttaga 426  Q
     ||||||||| |||||||||| || | ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  7762108 tcgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcc-tttcaaaatgctttggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaaaggcttgaaaatgttttaga 7762206  T
Q  427 attatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    || ||||||| | ||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  7762207 atgatgcagagctcactgcctgcataatcaattttcctcggcagttaact 7762256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 251 - 475
Target Start/End: Original strand, 28388307 - 28388531
Alignment:
Q  251 tgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatt 350  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| | |||||||| |    
T  28388307 tgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttattttgtttatgtccgaatttcaatcttgtatgaat 28388406  T
Q  351 tatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgc 449  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28388407 tattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttaaaattatgcagaacccactgtctgc 28388504  T
Q  450 ataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||  |||||  |||||||||||||    
T  28388505 ataatcagttttcttcggcagttaact 28388531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4197023 - 4196830
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4197023 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctacatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtcgaaaataatat 4196924  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt 208  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4196923 attatatatgta--ttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatatgtaatgagttgtttaattatggacactt 4196830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 228 - 427
Target Start/End: Original strand, 41799534 - 41799731
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  41799534 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaa-aaattgtatttttcttgtttatgt 41799632  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    || ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41799633 ccaagtttcaatgttgtatgaattattttgcc-tttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttgaaaatgttttagaa 41799731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 173
Target Start/End: Original strand, 28387821 - 28387979
Alignment:
Q  14 agatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatata 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28387821 agatgaatacacatggaaaacgacaagttatatgcctttg-ttattcacgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 28387919  T
Q  114 ttatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaattta 173  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28387920 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgattgtaagtagggatttaattta 28387979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 207 - 477
Target Start/End: Original strand, 43179644 - 43179904
Alignment:
Q  207 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagata 306  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  43179644 ttaattatggacactctttaacgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgttggattgtattaattatggacaagtgtaaaagata 43179743  T
Q  307 ttgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaa 406  Q
     | |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  43179744 atatatttttcttgtttttgaccgagtataaatgttgtacgactagtattgcc-tttgaaaatgctctggttgaattacaggtaaaaactgaccg-aaaa 43179841  T
Q  407 tggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    ||||||||        |  |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  43179842 tggcttgg--------ttcaattatgcagaacccactgtctgcataatatctttcctcggcagttaactgc 43179904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6267933 - 6267612
Alignment:
Q  62 cgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtag 161  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||| ||||| |||||| |||||    
T  6267933 cgacgatggcgacgtcgaatttatgtt-cggaatatgatggaagataatatattatatatgtatttttgttccatctgcaactgcgtagaatgtcagtag 6267835  T
Q  162 ggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttg 261  Q
     ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||            |||  ||| ||| ||||||||||||||| ||  || |||||     
T  6267834 agatttaatttaatgatatgtaatgtgttgtttaattatggacact------------ctt--taatgttatgatgaatttcaaacattcttgcaatttt 6267749  T
Q  262 aaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgcctt 361  Q
    ||  |||||| || |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||| || |  ||||||| |    
T  6267748 aatgaaatgtcggattgatttaattatggataacggtaaaagataatgtatttttcttgtttatgactgaggataaatgttgtacgactagtattgcc-t 6267650  T
Q  362 ttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggc 399  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||    
T  6267649 ttggaaatgctctggctgaattataggtaaaaaatggc 6267612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 43179429 - 43179559
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43179429 gagatgaacacgcatggaaaacggtaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtttgatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 43179528  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaat 143  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  43179529 attatatatgtatgttcgttccatctgcaat 43179559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 456 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 25877675 - 25877555
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25877675 gttttcctcggcagttaattgcagccggtttcgaattcctcggcatttaattgccgaagtggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttatgca 25877576  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctca 576  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  25877575 atgtgtcaacaacaattctca 25877555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31094651 - 31094497
Alignment:
Q  421 tttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaa 520  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||| |||||  || ||    
T  31094651 tttagaattatgcagaatccactgtctgcataattgttttcttcggcagttaactgcagccggtttcaatttccccgacagttaactaccgagggggcaa 31094552  T
Q  521 aaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||| |||  ||||||||||| |  | |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  31094551 aaatgtaaattactcgtgtgcctaagccttatgcaatgtatcaacaacaattctc 31094497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 361 - 455
Target Start/End: Original strand, 14280797 - 14280891
Alignment:
Q  361 tttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataatt 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14280797 tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatt 14280891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 457 - 577
Target Start/End: Original strand, 13568095 - 13568216
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||  ||||||||| || |||| |||| || |    
T  13568095 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactaccgatggggtaaaaacgtcatttactcgtatggcacagccttatgta 13568194  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||  |||| ||||||||||    
T  13568195 atgtgggaacaacaattctcaa 13568216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 463 - 580
Target Start/End: Original strand, 35777044 - 35777159
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtc 562  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||   ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || |||      
T  35777044 tcggcagttaactgcagccggttccaaa--cttcggtagttaactgccgcagaggcaaaaacgtcatttactcgtgtggcacaaccttatgtaacgtggg 35777141  T
Q  563 aacatcaattctcaagga 580  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35777142 aacatcaattctcaagga 35777159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4196845 - 4196792
Alignment:
Q  207 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4196845 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaataccaaacgtttgtgtaattt 4196792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 463 - 575
Target Start/End: Original strand, 18310047 - 18310160
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgt 561  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||    
T  18310047 tcggcagttaactgcagtcggttattgaattcctcgacagttaactgctgaggaggcaaaaacgtattttacttgtgtgcctcagccttatgcaatgtgt 18310146  T
Q  562 caacatcaattctc 575  Q
    ||||| ||||||||    
T  18310147 caacaacaattctc 18310160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 33993334 - 33993225
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||     
T  33993334 gtttttcacggcagttaactacagccggtttttgaatttttcggcagttaacttccgagggggcaaaaacgtattttactcgtatttctcaaccttatga 33993235  T
Q  555 aatgtgtcaa 564  Q
    ||||||||||    
T  33993234 aatgtgtcaa 33993225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 3603167 - 3603289
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||   | ||||||||||||||||  |||| | || |||| |||    
T  3603167 gttttcctcggaagttaactgcagccagttattgaattcttcggcagttaactgtcgagggagcaaaaacgtattttacttatgtgcctcagccttatgc 3603266  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  3603267 aatgtgtcaacaacaattctcaa 3603289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 457 - 550
Target Start/End: Original strand, 27867840 - 27867934
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  27867840 ttttcctcggcagtaaactgcagccggaattcaaattcctcggcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactagtgtggcacagcctt 27867934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 457 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 34122577 - 34122483
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||   || |||| |||||||||||  |||| |||||||||    
T  34122577 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgaaggggcaaaatcgtattttactaatgtggcacaacctt 34122483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 550
Target Start/End: Original strand, 34123954 - 34124049
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34123954 gttttccttggcagttaactgcagccggatttcaaatttctcgacagttaactgccgagggggcaaaatcgtattttactggtgtggcacaacctt 34124049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 575
Target Start/End: Original strand, 43094596 - 43094715
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||  |||   |||||||||||  |||||||||||| || |||||| |  |    
T  43094596 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgtcgatggggtaaaaacgtcatttactcgtgtggcataaccttatcaa 43094695  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  43094696 atgtgtaaacagcaattctc 43094715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3600391 - 3600270
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt--tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctg 553  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||  |  |||| |||||||||||||| |||||  || |||||| ||||||||| ||||| | |||| || ||    
T  3600391 gttttccttggcagttaactgcagctggttattataattattcggcagttaactgccgagggggcaaaaacatattttacttgtgtggctcaactttatg 3600292  T
Q  554 caatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  3600291 aaatgtgtcaacaacaattctc 3600270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 249
Target Start/End: Original strand, 14280722 - 14280764
Alignment:
Q  207 ttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgt 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14280722 ttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgt 14280764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 20192407 - 20192285
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtt-tcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||  |||   || |||| ||||||||||| ||||| | || |||| ||     
T  20192407 gttttcctcggcagttaactgcagccgattattgaattcttcagcagttaactgacgaaggggcaaaatcgtattttacttgtgtgcctcagccttatga 20192308  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  20192307 aatgtgtcaacaacaattctcaa 20192285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 41798865 - 41798787
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||| | ||||||||| |||||    
T  41798865 tcggcagttaactgcagccggatttcaaattcttcagcagttaactgccgagggggcaaaatcatattttactagtgtg 41798787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 550
Target Start/End: Original strand, 1397376 - 1397464
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||||||||| |||||||||    
T  1397376 tcggcagttaactgcagccggatttctaattcctcagcagttaactgccgagggggcaaaaatgtaaattactcgtgtgccacaacctt 1397464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 530 - 577
Target Start/End: Original strand, 8680336 - 8680383
Alignment:
Q  530 ttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8680336 ttactcgtgtgacacagccttatgcaatgtgtcaacaacaattctcaa 8680383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 362
Target Start/End: Original strand, 16440192 - 16440315
Alignment:
Q  239 atttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcag 338  Q
    |||| |||| || ||||||||| ||| |||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||| || | | |     
T  16440192 attttaaacattcgtgtaattttaacgaaatatcggattgatttaattatggtcaattctaaaatattatgtattgttcttgtttatgactgattataaa 16440291  T
Q  339 tgttgtatgatttatattgccttt 362  Q
    || ||||||| || ||||||||||    
T  16440292 tggtgtatgagttgtattgccttt 16440315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 28387317 - 28387238
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  28387317 ctcggcaattaactgcagccggaattcaaattcctcggcagttaactgtcgagggggtaaaatcgtattttactagtgtg 28387238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 7757379 - 7757294
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtg 540  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||  ||||  || ||||||||  ||||||||||||    
T  7757379 gttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgtcgagggggcaaaaacgtcatttactcgtgtg 7757294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Original strand, 18538354 - 18538471
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| || |||||| |||||  || |||| ||||||||||| ||||| | || |||  ||     
T  18538354 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttttgaattcctcgacaattaactgccgagggggcaaaatcgtattttacttgtgtgcctcagcctaatga 18538453  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaatt 572  Q
    |||||||||||| |||||    
T  18538454 aatgtgtcaacaacaatt 18538471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 7018007 - 7017943
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtc 77  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  7018007 gagatgaatacacatggaaaatggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtc 7017943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 28388538 - 28388658
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| |||||  || ||||  |||   |||||||||| |||| |||| ||     
T  28388538 gttttcctcggcagttaactgcagctggatttcaaattcctcggcagctaactgccgagggggcaaaagagtaaaatactcgtgtggcacagccttatgt 28388637  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    || |||| |||| ||||||||    
T  28388638 aaagtgtaaacaacaattctc 28388658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 575
Target Start/End: Original strand, 39743167 - 39743287
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||| | ||||||||| ||||| |||| |||| |      
T  39743167 gttttcctcggcagttaactgcagtcgaatttcaaattcctcggcagttaactgtcgagggggcaaaatcatattttactagtgtggcacagccttatca 39743266  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    ||||||  |||| ||||||||    
T  39743267 aatgtgggaacaacaattctc 39743287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 3892459 - 3892514
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||    
T  3892459 gttttcctcggcagttaactgcagccggtttc--ataattcggcagttaactgccgag 3892514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 465 - 550
Target Start/End: Original strand, 25897107 - 25897193
Alignment:
Q  465 ggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||   |||||||   ||||||||| ||||| |||||||||    
T  25897107 ggcagttaactgcagccggagttcaaattcctcggtagttaactgccgaaggggtaaaataatattttactagtgtggcacaacctt 25897193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 547
Target Start/End: Original strand, 30887385 - 30887471
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaac 547  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| || || | | |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  30887385 ctcggcagttaactgcagccggatttctaattccttagcagttaactgcctaggaagcaaaaacgtaaattactcgtgtgccacaac 30887471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 502
Target Start/End: Original strand, 37820874 - 37820920
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagt 502  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37820874 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagt 37820920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 1035208 - 1035143
Alignment:
Q  485 ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  1035208 ttcaaattcctcggcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttattagtgtggcacagcctt 1035143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 575
Target Start/End: Original strand, 2532530 - 2532640
Alignment:
Q  463 tcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtc 562  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| | |||    |||||||||||  |||||||||||| |||| |||| || ||||||      
T  2532530 tcgggagttaactgcagccggttccaaa--cttcggtagttaattaccgcaggggtaaaaacgtcatttactcgtgtggcacagccttatgtaatgtggg 2532627  T
Q  563 aacatcaattctc 575  Q
    |||| ||||||||    
T  2532628 aacagcaattctc 2532640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 4204230 - 4204350
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||  ||||| || |||||||||  |||||| ||||   ||||| | | ||    
T  4204230 gttttcctcgacagttaactgcagc-ggtttcaaatttctcgacagttaactgtcgagagggcaaaaacgtaaattactcatgtgcttcaaccatataca 4204328  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    || |||||| | ||||||||||    
T  4204329 atatgtcaatagcaattctcaa 4204350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 513
Target Start/End: Original strand, 7021878 - 7021935
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| || |||||    
T  7021878 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcagcagttatctaccgag 7021935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 513
Target Start/End: Original strand, 8539536 - 8539593
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||    
T  8539536 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgag 8539593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22923 - 22464
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||    
T  22923 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttatttgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaatattat 22824  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22823 attatatatgtatgttcgttccatttgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 22724  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22723 atgaacactttgtaatgttttgatgaatttc-aacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 22625  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggct 411  Q
    || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22624 ttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaaatggct 22526  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22525 tggaaatg-tttagaattatgcagaactcactg--tgcataatcagttttcctcggcagttaact 22464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22456 - 22337
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||  |||   |||||||||||||||||||| || |    
T  22456 ttttcctcagcagttaactgcagccgaatttcaaattcctcggcagttaactgccgagggggcaaaagagtaaaatactcgtgtgacacaaccttatgta 22357  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    | |||| || | ||||||||    
T  22356 aagtgtaaatagcaattctc 22337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 95 - 475
Target Start/End: Original strand, 19743 - 20124
Alignment:
Q  95 tatggtagaagataatatattatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgttt 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19743 tatggtggaagataatatattatatatgtatgctcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagttgttt 19842  T
Q  195 aattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19843 aattatgaacacttaattacggccactttgtaacgttttgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 19942  T
Q  295 ttgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19943 ttgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaa 20041  T
Q  395 ctggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  20042 ctgaccgaaaaaaaagcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagtaaact 20124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 19498 - 19582
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatat 97  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19498 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgctttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatat 19582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Original strand, 4890 - 5341
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4890 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 4989  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  4990 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt---- 5085  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaa-tgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 311  Q
              ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5086 ----------tgtaatgttttcatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 5175  T
Q  312 tttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggc 410  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5176 tttatcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattatttagcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggc 5274  T
Q  411 ttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaactgc 477  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5275 ttggaaatg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgc 5341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 885 - 790
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  885 gttttcctcggcagttaactacagccgaatttcaaattcctaggcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactggtgtggcacagcctt 790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 15519 - 15967
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15519 gagatgaatacgtatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggggacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 15618  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||              ||    
T  15619 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaa--------------tt 15704  T
Q  213 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15705 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaactaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 15804  T
Q  313 ttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaa-aaatggct 411  Q
    || ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15805 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaacaaatggct 15903  T
Q  412 tggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  15904 tagaaatg-tttagaattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggaagttaact 15967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11349 - 11235
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |  ||||||    
T  11349 ctcggaagttaactgcagccggaattcaaattcctcggcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactagtgtggcacagccttatcaaatgtg 11250  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
      |||| ||||||||    
T  11249 ggaacagcaattctc 11235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 513
Target Start/End: Original strand, 15974 - 16032
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgag 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15974 gttttcctcggcagttaactgcagctggatttcaaattcctcggcagttaactgccgag 16032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 120 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8601 - 8260
Alignment:
Q  120 atgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggaca 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  8601 atgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt----------- 8513  T
Q  220 ctttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttctt 319  Q
       ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8512 ---tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgttggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatctt 8416  T
Q  320 gtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaat 418  Q
    | ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8415 gattatgcccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcc-tttggaaatgctttggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 8317  T
Q  419 gttttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgtttttctcggcagttaact 475  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  8316 g-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttccttggcagttaact 8260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 22144 - 21762
Alignment:
Q  16 atgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatatt 115  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |             
T  22144 atgaatacgcatggaaaatgacaagttatatgtcttggcttattaaagacaatagcgacgtcgaatttatgttttggaatatggtggaaaa--------- 22054  T
Q  116 atacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaat-tatggacacttaattat 214  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| | | |    ||||||||    
T  22053 atatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgt--aatgtgttgt---ttaattat 21959  T
Q  215 ggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21958 ggacactttttaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt 21859  T
Q  315 ttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttgg 414  Q
    ||            ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21858 tt------------cgagtttcaatattgtatgatttatattg-cttttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttag 21772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 155; Significance: 8e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 296 - 486
Target Start/End: Original strand, 1517 - 1706
Alignment:
Q  296 tgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaac 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1517 tgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgccttt-ggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaac 1615  T
Q  396 tggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgtttttctcggcagttaactgcagccggttt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  1616 tggccgaaaaatggcttggaaatgctatagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcagcagttaactgcagtcggttt 1706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 10828 - 10978
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10828 gagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcagatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 10927  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggg 163  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10928 attatatttgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggg 10978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 519 - 575
Target Start/End: Original strand, 1728 - 1784
Alignment:
Q  519 aaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtgtcaacatcaattctc 575  Q
    |||||||||  ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1728 aaaaacgtaaattactcgtgtgcctcagccttatgcaatgtgtcaacatcaattctc 1784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12706 - 12497
Alignment:
Q  233 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgag 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12706 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttaaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 12607  T
Q  333 tttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatg 432  Q
    ||||| |||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  12606 tttcaatgttgtatgaattgttttg-cttttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaaggcttggaaatgttttagaatgatg 12508  T
Q  433 cagaacccact 443  Q
    || ||| ||||    
T  12507 caaaactcact 12497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 228 - 450
Target Start/End: Original strand, 236001 - 236222
Alignment:
Q  228 cgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  236001 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 236100  T
Q  328 ccgagtttcagtgttgtatgatttatattgccttttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaa 427  Q
    | |||||||| | |||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  236101 ctgagtttcaatattgtatgaattgttttgcc-tttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaaaggtttggaaatgttttagaa 236199  T
Q  428 ttatgcagaacccactgtctgca 450  Q
    | ||||||| | |||||||||||    
T  236200 tgatgcagagctcactgtctgca 236222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0794 (Bit Score: 98; Significance: 8e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 1315 - 1488
Alignment:
Q  13 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  1315 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttgacttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaaaataatat 1414  T
Q  113 attatacatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatg 186  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  1415 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatggatttaatataatgatgtgtaatg 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0794; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 5325 - 5276
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaa 505  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5325 gttttcctcggtagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaa 5276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 462 - 550
Target Start/End: Original strand, 17376 - 17465
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17376 ctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggcagttaactgccgagggggtaaaatcgtattttactagtgtggcacaacctt 17465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 1200 - 1321
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgca 555  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  |||||||||  ||||||||||| | || |||| ||||    
T  1200 gttttcctcggcagttaattgctgccggtttcaaattcctcggcagttaactgccgaggggacaaaaacgtaaattactcgtgtgcctcagccttatgca 1299  T
Q  556 atgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  1300 atgtgtcagcagcaattctcaa 1321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18079 - 17965
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||||  ||||||||||| |||||| || |  ||||||    
T  18079 ctcggcagttaactgcagccgggtttctaattcctcggcagttaactgtcgagggggcaaaaacgtaaattactcgtgtgccacaactttatcaaatgtg 17980  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
      |||||||||||||    
T  17979 ggaacatcaattctc 17965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 575
Target Start/End: Original strand, 54765 - 54879
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgcaatgtg 560  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||||  ||||||||||| |||||| || |  ||||||    
T  54765 ctcggcagttaactgcagccgggtttctaattcctcggcagttaactgtcgagggggcaaaaacgtaaattactcgtgtgccacaactttatcaaatgtg 54864  T
Q  561 tcaacatcaattctc 575  Q
      |||||||||||||    
T  54865 ggaacatcaattctc 54879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 870 - 781
Alignment:
Q  462 ctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||   || |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  870 ctcggcagttaactgcagccggatttctaattcttcggcagttaattaccgaaggggcaaaaacgtaaattactcgtgtgccacaacctt 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 550
Target Start/End: Original strand, 4433 - 4514
Alignment:
Q  470 ttaactgcagccggt-ttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaacctt 550  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4433 ttaactgcagccggagttcaaattcctcggcagttaactgccgagggagtaaaatcgtattttactagtgtggcacaacctt 4514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 11833 - 11770
Alignment:
Q  457 tttttctcggcagttaactgcagccgg-tttcaaattcttcggcagttaacttccgagaaggta 519  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  11833 ttttcctcggcagttaactgcagccggatttcaaattcctcggtagttaactgccgagagggta 11770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1379 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1379
Description:

Target: scaffold1379; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 453 - 575
Alignment:
Q  456 gtttttctcggcagttaactgcagccggtttca-aattcttcggcagttaacttccgagaaggtaaaaacgtattttactcgtgtgacacaaccttctgc 554  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||   | |||| ||||||||||||||||  | ||  ||| |      
T  453 gttttcctcgacagttaactgcagccggattattaattcttcggcagttaactgccgagggagcaaaatcgtattttactcgtgtttctcagtcttatca 552  T
Q  555 aatgtgtcaacatcaattctcaa 577  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  553 aatgtgtaaacatcaattctcaa 575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University