View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13519_low_1 (Length: 703)

Name: NF13519_low_1
Description: NF13519
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13519_low_1
NF13519_low_1
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (138-542)||(41096293-41096687)
chr2 (164-542)||(7993548-7993919)
chr2 (138-502)||(26151501-26151857)
chr2 (138-502)||(45618931-45619286)
chr2 (140-542)||(18676065-18676460)
chr2 (164-542)||(13020337-13020709)
chr2 (140-500)||(4855948-4856301)
chr2 (244-542)||(42411412-42411706)
chr2 (292-542)||(19367320-19367568)
chr2 (147-508)||(6530607-6530963)
chr2 (168-507)||(2063754-2064088)
chr2 (244-507)||(36481353-36481605)
chr2 (244-507)||(12269374-12269635)
chr2 (292-542)||(25222238-25222486)
chr2 (164-508)||(45042337-45042678)
chr2 (138-507)||(42759509-42759863)
chr2 (324-507)||(34061793-34061971)
chr2 (315-470)||(18172865-18173018)
chr2 (392-508)||(1418858-1418973)
chr2 (392-508)||(39081346-39081462)
chr2 (325-484)||(38985644-38985801)
chr2 (324-470)||(15457486-15457631)
chr2 (302-469)||(31273078-31273242)
chr2 (390-508)||(36059903-36060021)
chr2 (313-470)||(21747153-21747308)
chr2 (313-438)||(17117568-17117691)
chr2 (390-470)||(18916052-18916132)
chr2 (390-480)||(27302526-27302616)
chr2 (392-484)||(13997286-13997378)
chr2 (392-454)||(38599404-38599466)
chr2 (392-484)||(29480637-29480729)
chr2 (599-666)||(19367625-19367692)
chr2 (599-658)||(36481204-36481263)
chr2 (319-504)||(13001597-13001772)
chr2 (392-484)||(18482506-18482599)
chr2 (599-664)||(26151953-26152018)
chr2 (599-660)||(45618773-45618834)
chr2 (599-659)||(4855787-4855847)
chr2 (133-232)||(19367173-19367269)
chr2 (599-664)||(13020214-13020279)
chr2 (599-664)||(41096746-41096811)
chr2 (390-489)||(1226264-1226364)
chr2 (599-659)||(18676518-18676578)
chr2 (599-659)||(25222120-25222180)
chr2 (147-207)||(34061628-34061685)
chr2 (599-657)||(42411764-42411822)
chr2 (166-207)||(25222569-25222610)
chr2 (611-659)||(42759966-42760014)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (133-542)||(19661295-19661696)
chr4 (246-508)||(23426022-23426282)
chr4 (138-542)||(53011628-53012025)
chr4 (138-542)||(11681495-11681892)
chr4 (138-542)||(11689774-11690171)
chr4 (147-508)||(27632346-27632700)
chr4 (138-508)||(41038197-41038562)
chr4 (139-508)||(32130544-32130906)
chr4 (147-507)||(23256543-23256898)
chr4 (292-502)||(44477993-44478203)
chr4 (244-508)||(28463442-28463704)
chr4 (244-508)||(29221475-29221737)
chr4 (292-508)||(29579828-29580043)
chr4 (292-503)||(16072547-16072761)
chr4 (246-484)||(5545301-5545538)
chr4 (390-508)||(21791545-21791663)
chr4 (298-508)||(35653889-35654096)
chr4 (313-470)||(45172568-45172722)
chr4 (332-484)||(10575465-10575615)
chr4 (392-508)||(43154788-43154904)
chr4 (425-508)||(21169005-21169088)
chr4 (390-507)||(55134157-55134274)
chr4 (298-508)||(22423632-22423841)
chr4 (292-355)||(16887884-16887947)
chr4 (392-466)||(34982214-34982288)
chr4 (138-206)||(29221377-29221442)
chr4 (392-508)||(24449072-24449190)
chr4 (599-657)||(11681950-11682008)
chr4 (599-657)||(11690229-11690287)
chr4 (610-664)||(27632194-27632248)
chr4 (292-417)||(51066326-51066449)
chr4 (599-664)||(41038041-41038105)
chr4 (610-658)||(39372879-39372927)
chr4 (599-659)||(53011513-53011572)
chr4 (615-657)||(23256394-23256436)
chr4 (599-664)||(21168849-21168914)
chr4 (599-659)||(19661178-19661237)
chr4 (168-207)||(16887764-16887803)
chr4 (599-657)||(28463795-28463853)
chr4 (610-664)||(32131007-32131061)
chr4 (395-432)||(51066667-51066704)
chr4 (417-489)||(26329057-26329129)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (141-542)||(30899570-30899972)
chr1 (138-508)||(48722119-48722486)
chr1 (244-508)||(10109668-10109934)
chr1 (140-508)||(17487034-17487399)
chr1 (138-508)||(14084451-14084817)
chr1 (138-508)||(6150669-6151033)
chr1 (167-507)||(50552444-50552782)
chr1 (138-542)||(51109852-51110250)
chr1 (148-504)||(28885434-28885785)
chr1 (140-542)||(20905041-20905437)
chr1 (292-508)||(25930552-25930766)
chr1 (292-542)||(18127838-18128086)
chr1 (296-508)||(29208003-29208214)
chr1 (164-508)||(30004684-30005017)
chr1 (244-507)||(52055501-52055762)
chr1 (298-544)||(27703438-27703679)
chr1 (147-462)||(1-311)
chr1 (342-542)||(12884089-12884286)
chr1 (324-500)||(33124563-33124738)
chr1 (298-508)||(50371082-50371290)
chr1 (313-508)||(12971354-12971547)
chr1 (316-507)||(5560432-5560622)
chr1 (298-508)||(15441238-15441445)
chr1 (244-381)||(52240390-52240526)
chr1 (397-508)||(44836726-44836837)
chr1 (292-354)||(20470713-20470775)
chr1 (390-507)||(6333514-6333630)
chr1 (392-508)||(37873762-37873878)
chr1 (298-465)||(13120775-13120939)
chr1 (392-482)||(17674354-17674444)
chr1 (392-508)||(42740058-42740174)
chr1 (392-484)||(22386837-22386929)
chr1 (292-484)||(24556778-24556967)
chr1 (599-664)||(51110309-51110374)
chr1 (599-664)||(6150498-6150563)
chr1 (599-659)||(20470525-20470585)
chr1 (612-664)||(52055342-52055394)
chr1 (399-469)||(3907459-3907528)
chr1 (610-664)||(18128157-18128211)
chr1 (599-657)||(48722579-48722637)
chr1 (390-466)||(9777403-9777480)
chr1 (138-207)||(20470857-20470924)
chr1 (164-279)||(33124417-33124530)
chr1 (396-508)||(38263812-38263924)
chr1 (390-433)||(1269574-1269617)
chr1 (610-659)||(14084918-14084967)
chr1 (450-507)||(28189346-28189403)
chr1 (411-456)||(32810370-32810415)
chr1 (599-659)||(33124839-33124899)
chr1 (599-658)||(17487492-17487551)
chr1 (138-202)||(18127692-18127753)
chr1 (147-207)||(29207855-29207912)
chr1 (599-659)||(10109515-10109575)
chr1 (618-666)||(12971212-12971260)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (164-542)||(2618271-2618640)
chr6 (168-542)||(3514629-3514999)
chr6 (292-508)||(6754154-6754369)
chr6 (246-507)||(12614574-12614831)
chr6 (292-504)||(57640-57851)
chr6 (293-508)||(29149351-29149565)
chr6 (164-542)||(6360676-6361050)
chr6 (292-508)||(7525068-7525282)
chr6 (301-508)||(628006-628211)
chr6 (292-505)||(29401091-29401301)
chr6 (148-475)||(22503727-22504044)
chr6 (392-507)||(3748568-3748683)
chr6 (390-508)||(30915364-30915482)
chr6 (292-362)||(31258473-31258543)
chr6 (390-469)||(31860989-31861067)
chr6 (313-508)||(1092964-1093156)
chr6 (390-500)||(1690631-1690741)
chr6 (392-454)||(21946109-21946171)
chr6 (390-484)||(29308465-29308559)
chr6 (298-431)||(6294279-6294409)
chr6 (390-489)||(350381-350481)
chr6 (390-454)||(14893415-14893479)
chr6 (610-659)||(12622178-12622227)
chr6 (599-659)||(31258665-31258725)
chr6 (599-666)||(6360552-6360619)
chr6 (138-207)||(29401383-29401449)
chr6 (599-664)||(3515058-3515123)
chr6 (610-659)||(24455017-24455066)
chr6 (455-508)||(24455167-24455220)
chr6 (411-507)||(31234862-31234956)
chr6 (390-454)||(19231615-19231678)
chr6 (138-207)||(31258325-31258392)
chr6 (411-454)||(1327595-1327638)
chr6 (164-207)||(29149635-29149678)
chr6 (599-660)||(7525374-7525435)
chr6 (390-438)||(11088564-11088613)
chr6 (411-507)||(31243999-31244092)
chr6 (630-666)||(2618146-2618182)
chr6 (321-373)||(31861067-31861119)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (292-508)||(21784684-21784900)
chr3 (168-508)||(52654903-52655239)
chr3 (135-542)||(8364087-8364486)
chr3 (138-542)||(28132488-28132884)
chr3 (292-507)||(29387655-29387869)
chr3 (138-508)||(51939308-51939672)
chr3 (245-542)||(46791552-46791846)
chr3 (246-542)||(18408107-18408399)
chr3 (292-508)||(23164473-23164688)
chr3 (164-507)||(25598859-25599201)
chr3 (292-544)||(41706953-41707206)
chr3 (246-544)||(24252532-24252829)
chr3 (248-507)||(27729627-27729884)
chr3 (292-542)||(23067625-23067875)
chr3 (138-504)||(13401411-13401768)
chr3 (248-508)||(54430500-54430760)
chr3 (133-508)||(6715397-6715754)
chr3 (244-453)||(20762052-20762260)
chr3 (244-381)||(27110726-27110862)
chr3 (390-508)||(21596283-21596401)
chr3 (392-508)||(7767011-7767127)
chr3 (392-507)||(42009262-42009377)
chr3 (390-508)||(48627027-48627145)
chr3 (392-508)||(27303135-27303251)
chr3 (392-484)||(36538186-36538278)
chr3 (392-484)||(46904714-46904806)
chr3 (316-449)||(15987207-15987338)
chr3 (392-469)||(50677314-50677391)
chr3 (396-504)||(19965884-19965992)
chr3 (296-500)||(1254962-1255158)
chr3 (298-507)||(40152038-40152245)
chr3 (390-502)||(1649829-1649941)
chr3 (313-508)||(51146886-51147077)
chr3 (391-505)||(4207357-4207465)
chr3 (599-664)||(8363964-8364029)
chr3 (599-659)||(6715248-6715308)
chr3 (599-659)||(41707262-41707322)
chr3 (599-657)||(21784990-21785048)
chr3 (610-664)||(23067943-23067997)
chr3 (600-666)||(24252409-24252475)
chr3 (411-507)||(43905862-43905958)
chr3 (616-664)||(51939779-51939827)
chr3 (139-207)||(46791451-46791514)
chr3 (599-664)||(27111014-27111078)
chr3 (610-659)||(29387972-29388021)
chr3 (627-664)||(52655358-52655395)
chr3 (467-544)||(27110882-27110958)
chr3 (168-207)||(27110651-27110690)
chr3 (411-454)||(35202737-35202780)
chr3 (248-277)||(19965735-19965764)
chr3 (167-203)||(23164351-23164387)
chr3 (612-664)||(48627232-48627284)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (140-508)||(16658-17019)
scaffold0126 (599-659)||(16502-16562)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (133-542)||(13585214-13585621)
chr8 (140-506)||(18420361-18420723)
chr8 (168-542)||(43967848-43968219)
chr8 (164-508)||(43926102-43926439)
chr8 (138-542)||(7858000-7858395)
chr8 (292-508)||(18112064-18112280)
chr8 (292-507)||(44664947-44665161)
chr8 (148-508)||(3471548-3471899)
chr8 (138-458)||(1004056-1004368)
chr8 (292-508)||(32098078-32098294)
chr8 (337-504)||(27074526-27074692)
chr8 (351-508)||(42951725-42951885)
chr8 (314-508)||(34523875-34524067)
chr8 (390-507)||(5869320-5869435)
chr8 (313-508)||(23567197-23567390)
chr8 (298-508)||(3628656-3628863)
chr8 (313-470)||(12531545-12531700)
chr8 (392-483)||(39697938-39698029)
chr8 (302-470)||(29372343-29372508)
chr8 (390-507)||(30915285-30915403)
chr8 (139-279)||(3445710-3445842)
chr8 (298-438)||(42777763-42777901)
chr8 (392-508)||(35874872-35874990)
chr8 (599-664)||(44665248-44665313)
chr8 (392-508)||(2545921-2546036)
chr8 (141-207)||(44664360-44664423)
chr8 (399-454)||(42076110-42076165)
chr8 (602-664)||(18111607-18111669)
chr8 (610-659)||(7857884-7857933)
chr8 (164-232)||(18112344-18112411)
chr8 (164-207)||(27074718-27074761)
chr8 (298-438)||(36515064-36515202)
chr8 (147-279)||(42951557-42951684)
chr8 (627-664)||(1003906-1003943)
chr8 (599-664)||(13585093-13585158)
chr8 (390-469)||(33452778-33452858)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (138-508)||(33910012-33910375)
chr7 (138-469)||(12251037-12251365)
chr7 (167-542)||(42160902-42161271)
chr7 (292-502)||(36796272-36796482)
chr7 (140-542)||(6379840-6380234)
chr7 (166-508)||(18015359-18015698)
chr7 (244-508)||(33418970-33419234)
chr7 (244-508)||(46221556-46221819)
chr7 (292-542)||(11672499-11672749)
chr7 (168-508)||(7636104-7636442)
chr7 (292-508)||(44893930-44894145)
chr7 (324-542)||(4099883-4100100)
chr7 (300-507)||(32956724-32956929)
chr7 (390-508)||(8358292-8358410)
chr7 (298-508)||(26633311-26633518)
chr7 (390-508)||(26282540-26282658)
chr7 (292-470)||(773783-773962)
chr7 (390-470)||(40001694-40001774)
chr7 (298-497)||(30739082-30739279)
chr7 (296-505)||(41908128-41908335)
chr7 (392-508)||(36438351-36438467)
chr7 (395-504)||(40737994-40738103)
chr7 (392-504)||(9479079-9479191)
chr7 (345-508)||(1365957-1366118)
chr7 (599-664)||(42161329-42161394)
chr7 (319-487)||(44876087-44876248)
chr7 (392-484)||(18895397-18895489)
chr7 (292-448)||(41852200-41852356)
chr7 (298-508)||(42311958-42312164)
chr7 (298-467)||(3799670-3799835)
chr7 (402-507)||(25061852-25061957)
chr7 (324-508)||(40841179-40841362)
chr7 (610-666)||(38524975-38525031)
chr7 (298-372)||(28590052-28590126)
chr7 (610-660)||(46221920-46221970)
chr7 (600-657)||(8358501-8358558)
chr7 (599-664)||(27432385-27432450)
chr7 (610-659)||(33909864-33909913)
chr7 (392-484)||(7366659-7366751)
chr7 (244-279)||(4100133-4100168)
chr7 (610-664)||(36796588-36796641)
chr7 (610-659)||(12251605-12251654)
chr7 (164-207)||(11672835-11672878)
chr7 (470-542)||(12251466-12251536)
chr7 (138-207)||(44893781-44893847)
chr7 (601-664)||(44894241-44894304)
chr7 (614-664)||(4099745-4099795)
chr7 (630-664)||(11672393-11672427)
chr7 (313-431)||(25610091-25610207)
chr7 (244-273)||(3799616-3799645)
chr7 (616-665)||(25061696-25061745)
chr7 (599-651)||(18015787-18015839)
chr7 (148-202)||(29730853-29730904)
chr7 (148-202)||(29742043-29742094)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (133-504)||(13474582-13474946)
chr5 (138-507)||(13423813-13424175)
chr5 (142-543)||(26377533-26377925)
chr5 (138-492)||(12661273-12661618)
chr5 (244-507)||(19099168-19099429)
chr5 (296-542)||(13656123-13656369)
chr5 (352-508)||(36718527-36718683)
chr5 (313-508)||(43511566-43511759)
chr5 (138-508)||(26311954-26312297)
chr5 (313-470)||(29156176-29156331)
chr5 (392-508)||(138092-138208)
chr5 (313-508)||(20975933-20976126)
chr5 (324-466)||(17513870-17514010)
chr5 (298-508)||(40956261-40956469)
chr5 (401-508)||(27351297-27351404)
chr5 (390-508)||(10591271-10591389)
chr5 (325-484)||(42291816-42291973)
chr5 (313-508)||(4734505-4734698)
chr5 (313-470)||(5829371-5829524)
chr5 (335-508)||(931328-931494)
chr5 (313-468)||(3349652-3349805)
chr5 (138-361)||(37046875-37047093)
chr5 (448-507)||(8398930-8398989)
chr5 (298-508)||(10033494-10033701)
chr5 (392-455)||(18873458-18873521)
chr5 (298-508)||(40779140-40779346)
chr5 (399-504)||(23069172-23069277)
chr5 (300-507)||(17325793-17325998)
chr5 (298-452)||(7390310-7390460)
chr5 (298-453)||(33281677-33281830)
chr5 (409-508)||(8379538-8379637)
chr5 (599-659)||(13423658-13423718)
chr5 (392-484)||(16515496-16515588)
chr5 (610-657)||(8398778-8398825)
chr5 (599-658)||(26377983-26378042)
chr5 (298-380)||(8379351-8379432)
chr5 (599-657)||(36718774-36718832)
chr5 (610-658)||(12661102-12661150)
chr5 (411-454)||(37029051-37029094)
chr5 (247-277)||(27351527-27351557)
chr5 (610-666)||(19099533-19099589)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (147-508)||(16896-17248)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (133-508)||(1021-1377)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (292-508)||(46076-46289)
scaffold0100 (146-207)||(45937-45995)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (244-431)||(22659-22844)
scaffold0035 (599-659)||(22971-23031)
scaffold0035 (170-207)||(22588-22625)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (396-470)||(8399-8473)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (244-273)||(99098-99127)
scaffold0034 (169-202)||(99167-99200)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 138 - 542
Target Start/End: Original strand, 41096293 - 41096687
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||         
T  41096293 gccgtccctgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaatagacccctagtaaaataaaacgtaattttt--gtgtagttaaatttcattaaaaa 41096387  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
           || ||| ||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41096388 aaa----cataataagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaataagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtca 41096483  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41096484 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgatt 41096583  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaa 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  41096584 aagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaaactcaaatgtgtactaaagaaa 41096682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 164 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 7993919 - 7993548
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||    
T  7993919 tcggctctctttttaaaataggcacctagtaaaataaaacataatttttttgtgtagttaaatttcattaaaaaaaa---tcagaatcagaagaacttct 7993823  T
Q  264 aaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaa 363  Q
    ||||||||||||||||          | ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7993822 aaacatgaaaggaattaaaaaaaa--taagtgaaagatgtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaa 7993725  T
Q  364 cgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggt 463  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7993724 cgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaagattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattggctgattaagtgattatacaaattaggggtggt 7993625  T
Q  464 ttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  7993624 ttgataggatccggtttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaactcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 7993548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 138 - 502
Target Start/End: Original strand, 26151501 - 26151857
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||         
T  26151501 gccgtccccgtgaaataggaggcttg---gctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaa 26151597  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26151598 aaa---tcagaatcagaagaagttctaaacatgaaagtaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtca 26151693  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26151694 ctcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 26151792  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactaga 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26151793 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactaga 26151857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 138 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 45619286 - 45618931
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| || |||||||||||         
T  45619286 gccgtccccgtgaaatacgaggctcgac---tctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaatttgtttgtgaagctaaatttcattaaaaa 45619190  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45619189 aaa---tcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtca 45619094  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45619093 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctt-ccaaattgactgatt 45618996  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactaga 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45618995 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactaga 45618931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 140 - 542
Target Start/End: Original strand, 18676065 - 18676460
Alignment:
Q  140 cgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnn 239  Q
    |||||| |||||||| |||||||    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||           
T  18676065 cgtccctgtgaaataagaggctca---gctctctttataaaataggcccctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaa 18676161  T
Q  240 nnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcact 339  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18676162 aa--tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaactttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcact 18676258  T
Q  340 cctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaa 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676259 cctcttttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaa 18676358  T
Q  440 gtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaaga 539  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||    
T  18676359 gttattatacaaattaggggtagtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaaga 18676457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 164 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13020709 - 13020337
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||| | |||||||||||           ||||||| ||||||| ||||    
T  13020709 tcggctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgttgctaaatttcattaaaaaaaa---tcagaattagaagaagttct 13020613  T
Q  264 aaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaa 363  Q
    |||||||||||||||           | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13020612 aaacatgaaaggaat--aaaaaagattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcatttgaatttttcactcctctgttgtgaaaaaaggtaaaa 13020515  T
Q  364 cgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggt 463  Q
    ||||||||||||||||||        | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13020514 cgaatggtttatgcgaagaaaaaaatt-attgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggt 13020416  T
Q  464 ttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  13020415 ttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 13020337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 140 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4856301 - 4855948
Alignment:
Q  140 cgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnn 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||           
T  4856301 cgtccccgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaa 4856205  T
Q  240 nnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcact 339  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  4856204 a---tcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacaatgtcgtttggatttgtcact 4856109  T
Q  340 cctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaa 439  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4856108 cctctgttgtggaaaaggttaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattcactgattaa 4856010  T
Q  440 gtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatg-tacaaaaaagagaacta 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  4856009 gtgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgttacaaaaaggagaacta 4855948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 244 - 542
Target Start/End: Original strand, 42411412 - 42411706
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||          | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42411412 tcagaatcagaagaacttttaaacatgaaagaaattaaaaataat-taagtgaaagaggttaaatttatctaacggtgtcgtttggatttttcactcctc 42411510  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtga 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42411511 tgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagtaaaaaa-tgattgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactaattaagtga 42411609  T
Q  444 ttatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  42411610 ttatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 42411706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 292 - 542
Target Start/End: Original strand, 19367320 - 19367568
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||    
T  19367320 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactccactgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttattcgaagaaaaaaa-tg 19367418  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19367419 attgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatagaatccgatttatgtacaaaaa 19367518  T
Q  492 agagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
     ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  19367519 ggagaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 19367568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 6530963 - 6530607
Alignment:
Q  147 gtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntca 246  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||       |||||| |||||||||||           |||    
T  6530963 gtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggctcctattaaaataaaacgtaatttctttgtgtagctaaatttcattaaaaaaaaaaatca 6530867  T
Q  247 gaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgt 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||    
T  6530866 gaatcaaaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagagatgaaatttatctaacagtgacgtttgaatctgtcactcctctgt 6530768  T
Q  347 tgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatta 446  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6530767 tgtggaataggataaaacgaatggtttatgcgaagaaaataa-tgattgttgtgattctttcaatgaaataccttttcaaattgactgattaagtgatta 6530669  T
Q  447 tacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6530668 tacaaattaggggtggtttgatagtatccgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctag 6530607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 168 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 2064088 - 2063754
Alignment:
Q  168 ctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaac 267  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||       |||||| |||| ||||||           |||||||||||||| ||||||||     
T  2064088 ctctctttttaaaataggtccgtagtaaaataaaacgtaatatctttgtgtagctaaacttcattaaaaaaa----tcagaatcagaagaccttctaaat 2063993  T
Q  268 atgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaa 367  Q
    ||| ||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2063992 atggaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaa 2063893  T
Q  368 tggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttga 467  Q
    |||||| ||||  |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2063892 tggtttttgcgg-gaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttga 2063794  T
Q  468 taggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2063793 taggattatatttatgtacaaaaaggaaaactagagtcta 2063754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 244 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 36481605 - 36481353
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36481605 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaccggtgtcgtttggatttgtcactcctc 36481506  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtga 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||    
T  36481505 tgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatgcgaag-aaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttcc----------attaagtga 36481417  T
Q  444 ttatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36481416 ttatacaaattaggggtggtttgaaaggatccaatttatgtacaaaaaggagaattagagtcta 36481353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 244 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12269635 - 12269374
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  12269635 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcattcctc 12269536  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtga 443  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||        ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12269535 tgctgtggaaaaagataaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaa-tgattgtggtgatttttttaatgaaatagctttccaaatc-actgattaagtga 12269438  T
Q  444 ttatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12269437 ttatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtgcaaaaaagagaactagagtcta 12269374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 292 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 25222486 - 25222238
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  25222486 agtgaaagatgtgaaatttatataacggtgttgtttgaatttgtcactcctctgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tg 25222388  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25222387 attgttgtgattctttcaatgaaataactttctaaattgactaattaagtgattatacaaattaggaatgatttgataggatccgatttatgtacaaaaa 25222288  T
Q  492 agagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
     |||||||| |||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  25222287 ggagaactaaagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 25222238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 45042678 - 45042337
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttct 263  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||       |||||| |||| ||||||           |||||||| |||||||||||    
T  45042678 tcggctcactttttaaaatagacccatagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaacttcattaaaaaaaaa--tcagaatcggaagaacttct 45042581  T
Q  264 aaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaa 363  Q
    ||| ||||||||||||          | ||||||| |||||||||| ||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  45042580 aaatatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaataggtgaaatttatccaacaatgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaa-- 45042484  T
Q  364 cgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatag-ctttc--caaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 460  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45042483 cgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagactttcaccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 45042385  T
Q  461 ggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45042384 ggtttgataggatcaaatttatgtacgaaaagaagaactagagtctag 45042337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 507
Target Start/End: Original strand, 42759509 - 42759863
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnn-gtgtagttaaatttcattnnnn 236  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||        
T  42759509 gccgtctccgtgaaataggaggctca---gccctctttttaaaataggtccatagtaaaataaaacgtaattttttttgtgtagttaaatttcattaaaa 42759605  T
Q  237 nnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtc 336  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  42759606 aaaa---tcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagagatggaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtc 42759701  T
Q  337 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 436  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        
T  42759702 acccctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaag-aaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgac---- 42759796  T
Q  437 taagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
        |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42759797 ----tgattataaaaattatgggtggtttgatatgatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtcta 42759863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 324 - 507
Target Start/End: Original strand, 34061793 - 34061971
Alignment:
Q  324 gtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttc 423  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34061793 gtttggatttgtcactcatc----gtggaaaagggtaaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttc 34061887  T
Q  424 caaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  34061888 caaattgactgattaagtaatcatacaaattatgggtggtttgataggaccagatttatgtacaaaaagaagaactatagtcta 34061971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 315 - 470
Target Start/End: Original strand, 18172865 - 18173018
Alignment:
Q  315 aacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaa 414  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||| |||||    
T  18172865 aacggcgtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaa 18172962  T
Q  415 atagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18172963 atagcttttcaaattgagtgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 18173018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 1418973 - 1418858
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| ||||||  |||||    
T  1418973 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttacaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcat-caaattatgtctaaaaa 1418875  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
      |||||||||||||||    
T  1418874 gtagaactagagtctag 1418858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 39081462 - 39081346
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||    
T  39081462 attgttgtaattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaa 39081363  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
      | |||||||||||||    
T  39081362 gtaaaactagagtctag 39081346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 325 - 484
Target Start/End: Original strand, 38985644 - 38985801
Alignment:
Q  325 tttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttcc 424  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38985644 tttggatttgtcacttatccgttgtggaaaaggggaaaacaaatgttttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttc 38985741  T
Q  425 aaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||    
T  38985742 aaattgattgattaaatgattatacaaattggaggtggtttgatagtaccaaatttatgt 38985801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 324 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15457631 - 15457486
Alignment:
Q  324 gtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttc 423  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||         | |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15457631 gtttggatttgtcacttgtccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttgtgtgaaaaaaaaaatt-attgttgtgattctttcaataaaatagctttt 15457533  T
Q  424 caaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15457532 caaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtagtttgatag 15457486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 469
Target Start/End: Original strand, 31273078 - 31273242
Alignment:
Q  302 gtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtga 401  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||         ||| |||| |||    
T  31273078 gtgaaatttacctaactgtgtcgtttggatttgtcacttttctgttgtgggaaagagaaaaacaaatggtttatgcgaa--aaagaaatgaatgttatga 31273175  T
Q  402 ttctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgata 469  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31273176 ttcttttaatgaaatagtattccaaattgactgattaaatgattatacaaatt-ggggtggtttgata 31273242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 508
Target Start/End: Original strand, 36059903 - 36060021
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| |||  |||    
T  36059903 tgattgttgtggttctttcaatgaaatagctttttaaattaactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttttgtctaaa 36060002  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  36060003 aagtagaactagagtctag 36060021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 313 - 470
Target Start/End: Original strand, 21747153 - 21747308
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||         | |||||||||||||||||||||    
T  21747153 ctaacggcgtcgtttgaatttctcacttatctgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatg 21747250  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    | ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21747251 acatagtattttaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatag 21747308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 438
Target Start/End: Original strand, 17117568 - 17117691
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||||    
T  17117568 ctaacggtgtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcaatg 17117665  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgatta 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  17117666 aaatagcttttcaaattgactgatta 17117691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 470
Target Start/End: Original strand, 18916052 - 18916132
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18916052 tgattgctgtgattctttcagtgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattggggatggtttgatag 18916132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 480
Target Start/End: Original strand, 27302526 - 27302616
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaattt 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||    
T  27302526 tgattgttgtgattcttttaatgatatagcttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgagggtgatttggtagcatcgaattt 27302616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 392 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 13997378 - 13997286
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||  |||| ||| |||||||||    
T  13997378 attgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactcattaagtgattattcaaattgacggtggttcaatagcatcaaatttatgt 13997286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 38599466 - 38599404
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38599466 attgttttgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgattgattaagtgattatacaaatt 38599404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 392 - 484
Target Start/End: Original strand, 29480637 - 29480729
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  29480637 attgttgtgattctttcaatgaaataatttttcaaattgactgaataagtgtttattcaaattgatggtggtttaatagcatcaaatttatgt 29480729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 666
Target Start/End: Original strand, 19367625 - 19367692
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcgggtc 666  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19367625 cgttagagacccgtagcatttggaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccctcaaagccgggtc 19367692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 36481263 - 36481204
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaag 658  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36481263 cgttagaggcccgtagcatttggaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaag 36481204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 13001772 - 13001597
Alignment:
Q  319 gtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatag 418  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| || ||| |   |        ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13001772 gtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtgggaaaggagaaaacgaattgtatatac--tgaaaaaaaatgattattgtgattcttttaatgaaatag 13001675  T
Q  419 ctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagt 504  Q
    ||||  ||||||||        | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  13001674 ctttataaattgac--------taattatacaaattgggggtggtttgatagcatcaaatttatgtataaaaaggagaattagagt 13001597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 484
Target Start/End: Original strand, 18482506 - 18482599
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttcc-aaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||    
T  18482506 attgttgttattctttcaatgaaataactgtgttaaattgactgattaagcgattatacaaattgggggtagtttgttagcatcaaatttatgt 18482599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Original strand, 26151953 - 26152018
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26151953 cgttagagacccgtagcatttggaggcccgacctggttgagcatcttgcacaccctcaaggccggg 26152018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 45618834 - 45618773
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggt 660  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45618834 cgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggctgagcaccttgcacaccctcaaggt 45618773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 4855847 - 4855787
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4855847 cgttagaggcccgtagaatttggaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 4855787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 232
Target Start/End: Original strand, 19367173 - 19367269
Alignment:
Q  133 tcagtgccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcatt 232  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  19367173 tcagggccgtccctgtgaaataggaggcttgac---tctctttttaaaataggctcctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagttaaatttcatt 19367269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 13020279 - 13020214
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13020279 cgttagaggcccgtagcaattggaggcccgccctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccggg 13020214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Original strand, 41096746 - 41096811
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41096746 cgttagagacccgtagcatttagaggtccggcctgattgagtaccttgcacaccttcaaggtcggg 41096811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 489
Target Start/End: Original strand, 1226264 - 1226364
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattc-tttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaa 488  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||  |||||||| |||    
T  1226264 tgattgttgtgattctttttattgaaataacttttcaaattgtctgattgagtgattatataaattgagggtggtttggtagcatcagatttatgtccaa 1226363  T
Q  489 a 489  Q
    |    
T  1226364 a 1226364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Original strand, 18676518 - 18676578
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18676518 cgttagaaacccgtagcatttggatgcccggcctggttgagcaccttgcacactctcaagg 18676578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 25222180 - 25222120
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25222180 cgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcacctttcataccctcaagg 25222120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 207
Target Start/End: Original strand, 34061628 - 34061685
Alignment:
Q  147 gtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34061628 gtgaaataggaggctca---gctctctttttaaaataagcccctagtaaaataaaacgtaa 34061685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 599 - 657
Target Start/End: Original strand, 42411764 - 42411822
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 657  Q
    |||||||| | | ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42411764 cgttagaggctcttagcaattggaggcccggcctgattgagcaccttgcacaccctcaa 42411822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25222610 - 25222569
Alignment:
Q  166 ggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25222610 ggctctttttttaaagtaggcccctagtaaaataaaacgtaa 25222569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 659
Target Start/End: Original strand, 42759966 - 42760014
Alignment:
Q  611 gtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42759966 gtagcatttggaggcccgacctagttgagcaccttgtacaccctcaagg 42760014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 133 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 19661696 - 19661295
Alignment:
Q  133 tcagtgccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcatt 232  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||    
T  19661696 tcagggccgtcctagtgaaataggaggctct---gctctctttttaaaataggctcctagtaaaataaaacataatttttttgtgtagttaaatttcatt 19661600  T
Q  233 nnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatt 332  Q
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19661599 aaaaaaaaaaa-cagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatt 19661502  T
Q  333 tgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgac 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661501 tgtcactcctttgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaag-gattgttgtgtttctttcaatgaaatagctttccaaattgac 19661403  T
Q  433 tgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaa 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| |||||||||    
T  19661402 tgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctag--aaaaaactcaaacgtgtactaa 19661305  T
Q  533 agaaagaaaa 542  Q
    ||||||||||    
T  19661304 agaaagaaaa 19661295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 246 - 508
Target Start/End: Original strand, 23426022 - 23426282
Alignment:
Q  246 agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23426022 agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggcgttgtttggatttgtcactcctctg 23426120  T
Q  346 ttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23426121 ttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatt 23426219  T
Q  446 atacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23426220 atacaaattagaggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag 23426282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 138 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 53012025 - 53011628
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||         
T  53012025 gccgttcctgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggctcatagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaa 53011929  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnntt--agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgt 335  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  53011928 aaa---tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgt 53011832  T
Q  336 cactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactga 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53011831 cactcctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttccaaattgactga 53011733  T
Q  436 ttaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||        |||||| ||||||||||||    
T  53011732 ttaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaattagagtttag--aaaaaactcaaacgtgtactaaaga 53011635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 138 - 542
Target Start/End: Original strand, 11681495 - 11681892
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||| |||||||||||         
T  11681495 gccgtccccgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacataacttttttgtgtagctaaatttcattaaaaa 11681591  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11681592 aaa---tcagaatcagaaaaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtca 11681688  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11681689 ctcatctgttgtggaaaagggtaaaacggatggtttattcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgatt 11681787  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaa-gagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaa 536  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||    
T  11681788 aagtgattataaaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaa 11681886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 138 - 542
Target Start/End: Original strand, 11689774 - 11690171
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||| |||||||||||         
T  11689774 gccgtccccgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacataacttttttgtgtagctaaatttcattaaaaa 11689870  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11689871 aaa---tcagaatcagaaaaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtca 11689967  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11689968 ctcatctgttgtggaaaagggtaaaacggatggtttattcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgatt 11690066  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaa-gagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaa 536  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||    
T  11690067 aagtgattataaaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaa 11690165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 147 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 27632700 - 27632346
Alignment:
Q  147 gtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntca 246  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||           |||    
T  27632700 gtgaaataggaggctcg---gctctcattttaaaataggcccctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagttaaacttcattaaaaaaaaa--tca 27632606  T
Q  247 gaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27632605 gaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtcactactctgt 27632507  T
Q  347 tgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatta 446  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||        |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27632506 tgtggaaaagggtaaagcgaatgatttatgcgaagaaaaaaa-tgattgatgtgattctttcaatgaagtagcttttcaaattgactaattaagtgatta 27632408  T
Q  447 tacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27632407 tacaaattaggggtggtttgataggatcaaatttatgtacaaaaaggagaactagaatctag 27632346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 138 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 41038562 - 41038197
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnn-gtgtagttaaatttcattnnnn 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||        |||||| |||||| ||||        
T  41038562 gccgtcccggtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaatgtaattttttttgtgtagctaaatt-cattaaaa 41038467  T
Q  237 nnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtc 336  Q
           ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  41038466 aaaaaaatcaaaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaat--taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtc 41038369  T
Q  337 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41038368 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgat 41038270  T
Q  437 taagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaa-aaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  41038269 taagtgattatacaaattaggggtgatttgataggattcgatttatgtacaaaaaaaaaaaactagagtctag 41038197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 139 - 508
Target Start/End: Original strand, 32130544 - 32130906
Alignment:
Q  139 ccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnn 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||| ||||||| |||          
T  32130544 ccgtccctgtgaaataggaggctcg---gctcttcttttaaaataggtccttagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaattttattaaaaaa 32130640  T
Q  239 nnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcac 338  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  32130641 aaa--tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagagatgaaatttatctaattgtgtcgtttgaatttgtcac 32130737  T
Q  339 tcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatta 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32130738 tcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgatta 32130836  T
Q  439 agtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  32130837 agtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaagaagaactagtgtctag 32130906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23256898 - 23256543
Alignment:
Q  147 gtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnn-tc 245  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||            ||    
T  23256898 gtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggccct-agtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagttaaatttcattaaaaaaaaaaaatc 23256803  T
Q  246 agaatcagaagaa-cttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctct 344  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||          | ||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23256802 agaatcagaagaaacttccaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtaaaataggtgaaatttatctaccggtgtcgtttgaatttgtcactcctct 23256704  T
Q  345 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgat 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23256703 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgggaagaaaaaa--tgattgttgtgattctttcattgaaatagctttctaaattgactgattaagtggt 23256606  T
Q  445 tatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23256605 tatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactggagtcta 23256543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 292 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 44478203 - 44477993
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||    
T  44478203 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaaatg 44478104  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44478103 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatttagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaa 44478004  T
Q  492 agagaactaga 502  Q
     || |||||||    
T  44478003 tgataactaga 44477993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 244 - 508
Target Start/End: Original strand, 28463442 - 28463704
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28463442 tcagaatcagaagaagttctaaacatcaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctc 28463540  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtga 443  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  28463541 tattgtggaaaagggcaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaacttgattgattaagtga 28463639  T
Q  444 ttatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28463640 ttatacaaattaggggtggtttgataagatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag 28463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 244 - 508
Target Start/End: Original strand, 29221475 - 29221737
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  29221475 tcagaatcagaagaacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaattaatccaacggtgtcgtttaaatttgtcactcctc 29221573  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  29221574 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattccttcaatgaaatagacttccaaattgaccgtttaagtga 29221672  T
Q  444 ttatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29221673 ttatacaaattaagagtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaacgagaattagagtctag 29221737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 29580043 - 29579828
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||        ||    
T  29580043 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtatcatttggatttgtcactactctgttgtggaaaatggtaaaacgaattgtttatgcgaagaaaaaaa-tg 29579945  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29579944 attgttgtgattctttcattgaaatagcttttcaatttgactgattaattaattatacaaattatgggtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaa 29579845  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
    | |||||||||||||||    
T  29579844 atagaactagagtctag 29579828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 292 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16072761 - 16072547
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||    
T  16072761 agtgaaagaggtgaaatttatctaacgatgtcatttgggtttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatagtttatgcgaagaaaaaaa-tg 16072663  T
Q  392 attgttgtgattctttc----aatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtaca 487  Q
    |||||||||||||||||    | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16072662 attgttgtgattctttctttcattgaaatagtttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattagggatggtttgataggatcaaatttatgtaca 16072563  T
Q  488 aaaaagagaactagag 503  Q
    |||| |||| ||||||    
T  16072562 aaaaggagatctagag 16072547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 246 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5545538 - 5545301
Alignment:
Q  246 agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnntta-gtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |          ||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  5545538 agaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagacgtgaaatttacctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctcc 5545439  T
Q  345 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgat 444  Q
    ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5545438 gttgtgagaagggggaaaacgaatggtttatgcgaa--aaataaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttccaaattgaccgattaagtgat 5545341  T
Q  445 tatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    |||||||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||    
T  5545340 tatacaaattggtggtggtttgatggcatcaaatttatgt 5545301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 508
Target Start/End: Original strand, 21791545 - 21791663
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| | ||| ||||||||| || |    
T  21791545 tgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacacattgaaggtggtttgatggcatcaaatttatgttcaga 21791644  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21791645 aaggagaactagagtctag 21791663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Original strand, 35653889 - 35654096
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||| | | |||||||||  || || | |||||| ||||||||| |||||||||||         | ||||||    
T  35653889 agaggtgaaatttatctaacggtgtcatttgaaat-gtcactcctacgtcgtaggaaagggaaaaacgaatagtttatgcgaa--aaagaaataattgtt 35653985  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaa 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||| || |||  ||||    
T  35653986 gtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcatatttatgtccagaaagtagaa 35654085  T
Q  498 ctagagtctag 508  Q
    |||||||||||    
T  35654086 ctagagtctag 35654096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 313 - 470
Target Start/End: Original strand, 45172568 - 45172722
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||         ||||||||||||||||||| |||    
T  45172568 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtctatatgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttccatg 45172665  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45172666 aaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatta-gggtggtttgatag 45172722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 332 - 484
Target Start/End: Original strand, 10575465 - 10575615
Alignment:
Q  332 ttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattga 431  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10575465 ttgtcactcctccgtcgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa--aaagaaatgattgttgtgattatttcaatgaaataactttctaaattga 10575562  T
Q  432 ctgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  10575563 ctgattaagtgattatacaagttgagggtggtttgatagcataaaatttatgt 10575615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Original strand, 43154788 - 43154904
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  43154788 attgttgtgattcttttaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccaaaaa 43154887  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
      ||||||||| |||||    
T  43154888 gtagaactagaatctag 43154904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 425 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21169088 - 21169005
Alignment:
Q  425 aaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21169088 aaattgactcattaattgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag 21169005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 390 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 55134274 - 55134157
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| | | ||||||||| || |    
T  55134274 tgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccaga 55134175  T
Q  490 aaagagaactagagtcta 507  Q
     |||||||||| ||||||    
T  55134174 taagagaactaaagtcta 55134157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22423841 - 22423632
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||   ||| || |||||||||| |||||| | |         | ||||||    
T  22423841 agaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctatgtcgtatgaaatggaaaaacgaatgatttatgtggaaaaaataaataattgtt 22423743  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaa 497  Q
     ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||  ||||    
T  22423742 ttgattctttcaataaaatagtttttcaaattgattgattaagtgatcatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaa 22423643  T
Q  498 ctagagtctag 508  Q
    |||||||||||    
T  22423642 ctagagtctag 22423632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 355
Target Start/End: Original strand, 16887884 - 16887947
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16887884 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaa 16887947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 34982288 - 34982214
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttg 466  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  34982288 attgttgtgattctttcaacgaaatagtttttccaattgactgattaagtgattatacaaattggggatggtttg 34982214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Original strand, 29221377 - 29221442
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgta 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29221377 gccgtccctgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggcctctagtaaaataaaacgta 29221442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 24449190 - 24449072
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt--aggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||| ||||||| | || |    
T  24449190 attgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgatatagtggtttgatagcatcaaatttatatccaga 24449091  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  24449090 aagtagaactagagtctag 24449072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 657
Target Start/End: Original strand, 11681950 - 11682008
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 657  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11681950 cgttagaggctcgtagcatttgaaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 11682008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 657
Target Start/End: Original strand, 11690229 - 11690287
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 657  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690229 cgttagaggctcgtagcatttgaaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 11690287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27632248 - 27632194
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27632248 cgtagcatttggaggcccggcctagttgagcaccttgcactccctcaaggtcggg 27632194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 417
Target Start/End: Original strand, 51066326 - 51066449
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||| |         ||    
T  51066326 agtgaaagaggtgaaatttacctaacagtgtcatttggatttgtcactccttcgttttgggaa--gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaaaatg 51066423  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaata 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  51066424 attgttgtgattctttcaatgaaata 51066449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 41038105 - 41038041
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41038105 cgttagagac-cgtatcatttggaggcccggcctggttgagcatcttgcacaccctcaaggccggg 41038041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 658
Target Start/End: Original strand, 39372879 - 39372927
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaag 658  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39372879 cgtagaatttggaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaag 39372927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 53011572 - 53011513
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53011572 cgttagaggcccgtagcatttggaggc-cggtctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 53011513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 615 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 23256436 - 23256394
Alignment:
Q  615 catttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 657  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23256436 catttggaggttcggcctgattgagcaccttgcacaccctcaa 23256394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21168914 - 21168849
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | |||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21168914 cgttagaggcccgtatcatttggagatccggcctggttgagcaccttgcataccctcaaggccggg 21168849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 19661237 - 19661178
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661237 cgttagagacccatagcatttgaaggcccg-cctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 19661178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 16887764 - 16887803
Alignment:
Q  168 ctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16887764 ctctccttttaaaataggcccttaataaaataaaacgtaa 16887803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 599 - 657
Target Start/End: Original strand, 28463795 - 28463853
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 657  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  28463795 cgttagaggcccgtagcatttggaggtccggcctgattgaacaccttgcacaccttcaa 28463853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 32131007 - 32131061
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  32131007 cgtagcatttggaggcccagcctggttgaacaccttacacaccctcaaggccggg 32131061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 432
Target Start/End: Original strand, 51066667 - 51066704
Alignment:
Q  395 gttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  51066667 gttgtgattctttcaatgaaattgctttctaaattgac 51066704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 489
Target Start/End: Original strand, 26329057 - 26329129
Alignment:
Q  417 agctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  26329057 agctttctaaattgactgattgaatgattatataaattggaggtggtttggtagcatcagatttatgtccaaa 26329129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 141 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 30899972 - 30899570
Alignment:
Q  141 gtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggccctta----gtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnn 236  Q
    ||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||       || |||||||||||||||        
T  30899972 gtccctgtgaaataggaggttcg---gctctctttttaaaatagacccttaattagtaaaataaaacgtaatttttttgtctagttaaatttcattaaaa 30899876  T
Q  237 nnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnntta-gtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgt 335  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30899875 aaaaa--tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgt 30899778  T
Q  336 cactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnn-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactg 434  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30899777 cattcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgacta 30899678  T
Q  435 attaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaag 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||    
T  30899677 attaagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaag 30899578  T
Q  535 aaagaaaa 542  Q
    ||||||||    
T  30899577 aaagaaaa 30899570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 138 - 508
Target Start/End: Original strand, 48722119 - 48722486
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||         
T  48722119 gccgtccgtgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggtccatagtaaaataaaacgtaattttgttgtgtagttaaatttcattaaaaa 48722215  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnntt---agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttg 334  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          |    ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  48722216 aaaa--tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaagaaattaaaaaaaaaatattaagtaaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttg 48722313  T
Q  335 tcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactg 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48722314 tcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattatttcaatgaaatagctttccaaattgactg 48722412  T
Q  435 attaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48722413 attaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaaatagagtctag 48722486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 244 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10109934 - 10109668
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnn---ttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||             | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10109934 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggcgtcgtttggatttgtcactc 10109835  T
Q  341 ctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaag 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10109834 ctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaattgctttccaaattgactgattaag 10109736  T
Q  441 tgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10109735 tgattatacaaattagtggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag 10109668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 140 - 508
Target Start/End: Original strand, 17487034 - 17487399
Alignment:
Q  140 cgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnn 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||           
T  17487034 cgtccccgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattgaaaaaa 17487130  T
Q  240 nnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnn---ttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtc 336  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||             | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17487131 ac--tcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggcgttgtttggatttgtc 17487228  T
Q  337 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 436  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  17487229 actcctctgttgtggaaaaggataaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgatttat 17487327  T
Q  437 taagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17487328 taagtgattatataaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaggagaactagagtctag 17487399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 138 - 508
Target Start/End: Original strand, 14084451 - 14084817
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngt-gtagttaaatttcattnnnn 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||       || |||| |||||||||||        
T  14084451 gccgtcccagtaaaataggaggctcg---gctctctttttaaaatagacctataataaaataaaacgtaatttttttgttgtagctaaatttcattaaaa 14084547  T
Q  237 nnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtc 336  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | | |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  14084548 aaaaa--tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaaatgaaagaggtgaaatttatctaatggtgtcgtttggatttgtc 14084645  T
Q  337 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 436  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14084646 actcctctgttgtggagaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattgattattgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgactgat 14084745  T
Q  437 taagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14084746 taagtgattatacattttaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag 14084817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 138 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 6151033 - 6150669
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||       |||||| |||||||||||         
T  6151033 gccgtccctgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataagcccttagtaaaataaaacataatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaa 6150937  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6150936 aaaaat--agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaataggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtca 6150840  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaag-ggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 436  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6150839 ctcctctgttgtggaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaat-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgat 6150741  T
Q  437 taagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6150740 taaatgattatataaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag 6150669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 167 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 50552782 - 50552444
Alignment:
Q  167 gctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaa 266  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||       |||||| |||||||||||           ||||||||| |||||||||||||    
T  50552782 gctctctttttaaaataaacccttagtaaaataaaacttaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaaaaaatcagaatcaaaagaacttctaaa 50552683  T
Q  267 catgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacga 366  Q
    |||||||||||||          | |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  50552682 catgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagagatgaaatttatctaatggtgtcgtttggatttgtcactcctatgttgtggaaaaaggtaaaatga 50552584  T
Q  367 atggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttg 466  Q
    ||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50552583 atggtttatacgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattaggggtggtttg 50552485  T
Q  467 ataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50552484 ataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtcta 50552444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 138 - 542
Target Start/End: Original strand, 51109852 - 51110250
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngt-gtagttaaatttcattnnnn 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        | |||| |||||||||||        
T  51109852 gccgtccctgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacgtaattttttttttgtagctaaatttcattaaaa 51109948  T
Q  237 nnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtc 336  Q
           ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||    
T  51109949 aaaaaa-tcagaattagaagaatttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcatttgaatttgtc 51110046  T
Q  337 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 436  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51110047 actcctttgttgtggaaaaggataaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaactt-attgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgactgat 51110145  T
Q  437 taagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaa 536  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||        |||||| |||||||||||||    
T  51110146 taagtgattatagaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggataactatagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaa 51110244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 148 - 504
Target Start/End: Original strand, 28885434 - 28885785
Alignment:
Q  148 tgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcag 247  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||           ||||    
T  28885434 tgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaatagatacctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagttaaatttcattaaaaaaaaa--tcag 28885528  T
Q  248 aatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgtt 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28885529 aattagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgtt 28885627  T
Q  348 gtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattat 447  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28885628 gtggaaaaagataaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattcttacaatgaaatagctttcaaaattgattgattaagtgattat 28885726  T
Q  448 acaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtac--aaaaaagagaactagagt 504  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  28885727 acaaattatgggtggtttgataggatccgatttatgcacaaaaaaaagagaactagagt 28885785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 140 - 542
Target Start/End: Original strand, 20905041 - 20905437
Alignment:
Q  140 cgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnn 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||       |||||| |||| ||||||           
T  20905041 cgtccctgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggtccctagtaagataaaacgtaatttttttgtgtagctaaacttcattaaaaaaa 20905137  T
Q  240 nnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcact 339  Q
         |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||          | |||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20905138 ac---cagaataagaagaacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaacttaagtgaaagtggtgaaatttatccaacggtgtcgtttggatttgtcact 20905234  T
Q  340 cctctgttgtggaaaa-gggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatta 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||        | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  20905235 cctctgttgtggaaaaagggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaatt-attgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgactgaata 20905333  T
Q  439 agtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaag 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||    
T  20905334 agtgattatacaaattagggctggtttgataggattagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaataaaactcaaacgtgtactaaagaaag 20905433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 25930766 - 25930552
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||        ||    
T  25930766 agtgaaagagatgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatccaaagaaaaaa--tg 25930669  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25930668 attgttgtgatcctttcaatgaaatagcttttcaagttgactgattaagtgattatacaaattaggggtagtttgataggatcagatttatgtacaaaaa 25930569  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
     ||||||||||||||||    
T  25930568 tgagaactagagtctag 25930552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 292 - 542
Target Start/End: Original strand, 18127838 - 18128086
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |     
T  18127838 agtgaaagaggtaaaatttacctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaa-ta 18127936  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  18127937 attgttgtgattcttgcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatccgatttacgtac-aaaa 18128035  T
Q  492 agagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
     |||||||||| |||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  18128036 ggagaactagaatctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 18128086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 296 - 508
Target Start/End: Original strand, 29208003 - 29208214
Alignment:
Q  296 aaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattg 395  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  29208003 aaagagatgaaatttatccaacggtgtcatttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattg 29208101  T
Q  396 ttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagag 495  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  29208102 ttgtgattctttcaatgaaatagacttccagattgactgattaaatgattatacaaattaggggtggtttgatatgattagatttatgtacaaaaaagag 29208201  T
Q  496 aactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||    
T  29208202 aactagagtctag 29208214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 164 - 508
Target Start/End: Original strand, 30004684 - 30005017
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| |||| ||||||           ||||||||||||||||||||    
T  30004684 tcggctctctttttaaaataggcccatagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaacttcattgaattaaa---tcagaatcagaagaacttct 30004780  T
Q  264 aaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaa 363  Q
    ||||||||||||||||          | ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30004781 aaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaaaaggtgaaatttatctaacggtatcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaa 30004880  T
Q  364 cgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggt 463  Q
    ||||||||||||| ||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||      ||||    
T  30004881 cgaatggtttatgggaag--aacaaatgattgttgcgattctttcaatgaaatagcttttcaaattaattgattaagtgattatacaaat------tggt 30004972  T
Q  464 ttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30004973 ttgataggatcggatttatgtacaaaaaggagaagtagagtctag 30005017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 244 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 52055762 - 52055501
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||          | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  52055762 tcagaatcagaaaaacttctaagcatgaaaggaattaaaaaataaataagtgaaagaggtaaaatttatctaacggtgtcgtttagatttgtcactcctc 52055663  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtga 443  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52055662 t-ttgtgtaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaac-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtga 52055565  T
Q  444 ttatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    ||||| |||||| || | |||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52055564 ttatataaattatggatagtttgatatgattagatttatgtacaaaaaggagaactagagtcta 52055501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 298 - 544
Target Start/End: Original strand, 27703438 - 27703679
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||||    
T  27703438 agaggtgaaatttacctaacagtgtcgtttggatt-gtcactcttccgtggtggaaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaa--aatgaaatgattgtt 27703534  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaa 497  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27703535 gtgattctttcgatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagcatcaaatttatgttcaaaaaagagaa 27703634  T
Q  498 ctagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaaag 544  Q
    |||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27703635 ctagagtctag--aaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaag 27703679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 147 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 311 - 1
Alignment:
Q  147 gtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntca 246  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||       |||||| |||| ||||||           |||    
T  311 gtgaaataggaggctcg---gttctctttttaaaataggctcccagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaacttcatt-aaaaaaaaaatca 216  T
Q  247 gaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgt 346  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  215 aaatcaaaagaacttccaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgt 116  T
Q  347 tgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatta 446  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  115 tgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaag-aaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatcactttccaaattgactgattaagtgatta 17  T
Q  447 tacaaattaggggtgg 462  Q
    ||||||||| ||||||    
T  16 tacaaattaagggtgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 342 - 542
Target Start/End: Original strand, 12884089 - 12884286
Alignment:
Q  342 tctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagt 441  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12884089 tctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaa--tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgattaagt 12884186  T
Q  442 gattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaa 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||    
T  12884187 gattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggaaaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaa 12884285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 324 - 500
Target Start/End: Original strand, 33124563 - 33124738
Alignment:
Q  324 gtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33124563 gtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaatggtataacgaatggtttatgtgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttt 33124661  T
Q  424 caaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaacta 500  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  33124662 caaattgacttattaagtgattatacaaattagaggtggtttaataggatccgatttatgtagaaaaaggagaacta 33124738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 50371290 - 50371082
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||         ||||||||    
T  50371290 agaggtgaaatttacctaacgatgttgtttggatttgtcactcctccgttgtgggtaagggaaaaactaatgatttatgcgaa--aaagaaatgattgtt 50371193  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaa 497  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| | ||||| | || ||| |||||    
T  50371192 gtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgagggtgatttgatagcatcaactttatatccagaaaggagaa 50371093  T
Q  498 ctagagtctag 508  Q
    |||||||||||    
T  50371092 ctagagtctag 50371082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 313 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 12971547 - 12971354
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||| |||    
T  12971547 ctaacggagtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcgatg 12971450  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||| || | | |||||||| |||||||    
T  12971449 aaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgataatatcagatttatgtccagataggagaactaaagtctag 12971354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 5560622 - 5560432
Alignment:
Q  316 acggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaa 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||| |||| ||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||||    
T  5560622 acggtgttatttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaagagaaaatgaatagtttatgcgga-aaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaa 5560524  T
Q  416 tagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |  |||||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  5560523 taactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttggtagcaccagatttatgtccagaaatgagaactatagtcta 5560432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15441445 - 15441238
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||         | ||||||    
T  15441445 agaggtgaaatttacctaacggcgtcgtttggatttgtcactcttctgttgtggaaaaggg-aaaatgaatgatttatgcaaa---aaagaattattgtt 15441350  T
Q  398 gtgattctttc-aatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagaga 496  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||| ||||    
T  15441349 gtgattctttttaatgaaatagctttataaattgagtgattaagtgattatacaaattgtaggtggtttgatagcattatatttatgtctagaaaggaga 15441250  T
Q  497 actagagtctag 508  Q
    ||||||||||||    
T  15441249 actagagtctag 15441238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 381
Target Start/End: Original strand, 52240390 - 52240526
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||    
T  52240390 tcagaatcagaagaacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacagtgtcgtttgaatttgtcgctcctc 52240488  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaag 381  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  52240489 tgttgtggaaaagggcaaaatgaatgatttatgcgaag 52240526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 397 - 508
Target Start/End: Original strand, 44836726 - 44836837
Alignment:
Q  397 tgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagaga 496  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||  |||    
T  44836726 tgtgattctttcagtgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgttcagaaagtaga 44836825  T
Q  497 actagagtctag 508  Q
    |||||| |||||    
T  44836826 actagaatctag 44836837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20470775 - 20470713
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaa 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20470775 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaa 20470713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 507
Target Start/End: Original strand, 6333514 - 6333630
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| |||  |||||||||||      
T  6333514 tgattgttgtgattcttttaataaaataactttccaatttgactgattaagtgattttacagatta-ggatggtttgatagtatcagatttatgtacagg 6333612  T
Q  490 aaagagaactagagtcta 507  Q
    || |||||||||||||||    
T  6333613 aatgagaactagagtcta 6333630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Original strand, 37873762 - 37873878
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||  | |||    
T  37873762 attgttgtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattaactgattaagtgactatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtctagaaa 37873861  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
      |||||||||||||||    
T  37873862 gtagaactagagtctag 37873878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 465
Target Start/End: Original strand, 13120775 - 13120939
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||  || || | |||||| |||| ||||||||||||||||         | |||||     
T  13120775 agaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaa--aaagaaataattgtg 13120871  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  13120872 gtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattattcaaattaatggtggttt 13120939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 392 - 482
Target Start/End: Original strand, 17674354 - 17674444
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| |||||||    
T  17674354 attgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattattcaaattgatggtggtttaatagcatcaaatttat 17674444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 42740174 - 42740058
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||| ||| || |||||| || |||    
T  42740174 attgttgcgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactaattaagttattatacaaattgatggttgtttgatagcatcaaacttatgtccagaaa 42740075  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
      |||||||||||||||    
T  42740074 gtagaactagagtctag 42740058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 392 - 484
Target Start/End: Original strand, 22386837 - 22386929
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||   |||||||  |||| ||| |||||||||    
T  22386837 attgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattgttcaaattgatggtggttaaatagcatcaaatttatgt 22386929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 24556967 - 24556778
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||  ||  | | |||  | |||||||||||||||||||||         |     
T  24556967 agtgaaagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtgataggaaaaagaaaaacgaatggtttatgcgaa--aaagaaata 24556871  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||| | | |||||||||    
T  24556870 attgttgtgattctttaaatgaaatagtttttcaaattgacttattaagtgattattcaaattgatggtggtttaatagcaccaaatttatgt 24556778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Original strand, 51110309 - 51110374
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51110309 cgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttacacaccctcaaggtcggg 51110374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6150563 - 6150498
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150563 cgttagaggcccgtagcatttggaagcccggcctgattgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 6150498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 20470585 - 20470525
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20470585 cgttagaggcccgtagcatttgtaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 20470525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 612 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 52055394 - 52055342
Alignment:
Q  612 tagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52055394 tagcatttggaggctcggcctggttgagcaccttgcactcccccaaggtcggg 52055342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 3907528 - 3907459
Alignment:
Q  399 tgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgata 469  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  3907528 tgattctttcaatgaaataatttttcaaattgattgattaaatgattatacaaatt-ggagtggtttgata 3907459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 18128157 - 18128211
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18128157 cgtagcatttagaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccggg 18128211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 657
Target Start/End: Original strand, 48722579 - 48722637
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 657  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48722579 cgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcactttgcacaccctcaa 48722637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 9777480 - 9777403
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaat-gaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttg 466  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9777480 tgattgttgtgattctttttattgaaatagttattcaaattgactgattgagtgattatataaattgggggtggtttg 9777403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20470924 - 20470857
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaat-aggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  20470924 gccgtccccgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaaacaggcccctagtaaaataaaacgtaa 20470857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 279
Target Start/End: Original strand, 33124417 - 33124530
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||       || |||||||||||||||           |||||||||||||||||| |    
T  33124417 tcggctctctttttaaaataggctcctagtaaaataaaacgtaatttttttgtatagttaaatttcatt--aaaaaaaattcagaatcagaagaactttt 33124514  T
Q  264 aaacatgaaaggaatt 279  Q
    |||||||||| |||||    
T  33124515 aaacatgaaacgaatt 33124530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 38263924 - 38263812
Alignment:
Q  396 ttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagag 495  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || || |||||     ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||   |    
T  38263924 ttgtgattctatcaatgaaatagttttttaaattgactgattaagtaataattcaaatcgatagtggtttaatagcatcaaatttatgtccaaaaagtgg 38263825  T
Q  496 aactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||    
T  38263824 aactagagtctag 38263812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1269617 - 1269574
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgact 433  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1269617 tgattgttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaaattgact 1269574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Original strand, 14084918 - 14084967
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14084918 cgtaacatttggaggtccggtctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 14084967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 28189403 - 28189346
Alignment:
Q  450 aaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28189403 aaattagaggtagtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactaaagtcta 28189346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 456
Target Start/End: Original strand, 32810370 - 32810415
Alignment:
Q  411 tgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattag 456  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32810370 tgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattattcaaattag 32810415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Original strand, 33124839 - 33124899
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33124839 cgttagaggcccgtagcgtttggaggcccagcctgattgagcaccttgcacaccctcaagg 33124899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 658
Target Start/End: Original strand, 17487492 - 17487551
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaag 658  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17487492 cgttagaggcccgtatcatttggaggcccggcttggttgaggaccttgcacaccctcaag 17487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 18127692 - 18127753
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaa 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||   | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18127692 gccgtccctgtgaaataggaggttcg---gttctcttttcaaaataggtccttagtaaaataaaa 18127753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 207
Target Start/End: Original strand, 29207855 - 29207912
Alignment:
Q  147 gtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29207855 gtgaaataggaggctcgac---tctctttctaaaataggtccatagtaaaataaaacgtaa 29207912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 10109575 - 10109515
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10109575 cgtttgagacccgtagtatttaaaggctcggcttagttgagcaccttgcacaccctcaagg 10109515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 12971260 - 12971212
Alignment:
Q  618 ttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcgggtc 666  Q
    |||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12971260 ttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggtcgggtc 12971212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 164 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 2618640 - 2618271
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||| |    
T  2618640 tcggctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagttaaatttcattaaaaaaa----tcagaataagaagaactttt 2618545  T
Q  264 aaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaa 363  Q
    ||||||||||| ||||          | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2618544 aaacatgaaagcaattaaaaaaat--taagtgaaagaggtgaaatttatccaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaa 2618447  T
Q  364 cgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggt 463  Q
    ||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2618446 cgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-taattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggt 2618348  T
Q  464 ttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  2618347 ttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactaaagtctag--aaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 2618271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 168 - 542
Target Start/End: Original strand, 3514629 - 3514999
Alignment:
Q  168 ctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaac 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||           |||||||||||||||||| |||||    
T  3514629 ctctctttttaaaatagacccttagtaaaataaaacgtaatttttttttgtagttaaatttcattataaaaaaaa-tcagaatcagaagaacttttaaac 3514727  T
Q  268 atgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaa 367  Q
    ||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3514728 atgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaatggtgtcgtttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaa 3514826  T
Q  368 tggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttga 467  Q
    ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3514827 tggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgatatagctttccaaattgaatgattacgtgattatacaaattaggggtggtttga 3514925  T
Q  468 taggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  3514926 taggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtttag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 3514999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 6754369 - 6754154
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  6754369 agtgaaagaggtgaaatttattcaacggtgtcatttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tg 6754271  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6754270 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgactatacaaattagggatggtttgataggatccgatttatgtacaaaaa 6754171  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||| |||||    
T  6754170 agagaactagaatctag 6754154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 246 - 507
Target Start/End: Original strand, 12614574 - 12614831
Alignment:
Q  246 agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||| |||||||||    
T  12614574 agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtc--gtttgaatttgttactcctctg 12614670  T
Q  346 ttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatt 445  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12614671 ttgtggaaaagggtaaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgatt 12614769  T
Q  446 atacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12614770 atacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtcta 12614831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 292 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 57851 - 57640
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  57851 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tg 57753  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  57752 attgttgtgattctttgaatgaaatagctttctaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaa 57653  T
Q  492 agagaactagagt 504  Q
     ||||||||||||    
T  57652 ggagaactagagt 57640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 293 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 29149565 - 29149351
Alignment:
Q  293 gtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntga 392  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||    
T  29149565 gtgaaagaggtgaaatttacgtaacggtatcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tga 29149467  T
Q  393 ttgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  29149466 ttgttgtgattctttcaatgaactaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggtgtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaag 29149367  T
Q  493 gagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||||||||    
T  29149366 gagaactagagtctag 29149351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 164 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6361050 - 6360676
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnn-tcagaatcagaagaacttc 262  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||       |||||| |||||||||||            ||| ||||| |||||||||    
T  6361050 tcggctctctttttaaaataggtccctagtaaaataaaacataacttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaaaaaaatcaaaatcaaaagaacttc 6360951  T
Q  263 taaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaa 362  Q
    |||||||||||||||||          | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360950 taaacatgaaaggaattaaaaaaaaa-taagtgaaagagatgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaa 6360852  T
Q  363 acgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgg 462  Q
    ||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6360851 acgaatggtttatacgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaa-taacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaagggtgg 6360754  T
Q  463 tttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  6360753 tttgataggatccgatttatgtgcaaaaaagagaactagagtctag--aaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 6360676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Original strand, 7525068 - 7525282
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||        ||    
T  7525068 agtgaaataggtgaaatttatctaacggtgtc-tttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaataaattgtttatgcgaagaaaaaaa-tg 7525165  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7525166 attgttgtgattctttcaataaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaat 7525265  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
     ||||||||||||||||    
T  7525266 ggagaactagagtctag 7525282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 301 - 508
Target Start/End: Original strand, 628006 - 628211
Alignment:
Q  301 ggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtg 400  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  628006 ggtgaaatttatctaacgatgtcgtttggatttatcacttctctgttgtggaaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtg 628103  T
Q  401 attctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaacta 500  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| | ||||||    
T  628104 attctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataagatctgatttgtgtacaaaaaggtgaacta 628203  T
Q  501 gagtctag 508  Q
    ||||||||    
T  628204 gagtctag 628211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 292 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 29401301 - 29401091
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||    
T  29401301 agtgaaagaggtgaaatttatcta--ggtgtcatttggatttgtcactcctctgtcgtggaaaagggtaagacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tg 29401205  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29401204 attgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatactaattaggggtagtttgataggattcgatttatgtacaaaaa 29401105  T
Q  492 agagaactagagtc 505  Q
     || ||||||||||    
T  29401104 tgaaaactagagtc 29401091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22504044 - 22503727
Alignment:
Q  148 tgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcag 247  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||       |||||| |||||||||||            |||    
T  22504044 tgaaataggaggctcg---gttctctttttaaaatagaccctcagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaaaaa--cag 22503950  T
Q  248 aatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgtt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||          | |||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||    
T  22503949 aatcagaagaagttctaaacataaaaggaatttaaaaaaaattaagtgaa-gaggtgaaatttatctaacggtgtcatttgaatttgtcacttctctgtt 22503851  T
Q  348 gtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattat 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||        |||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22503850 gtggaaaagggtaaaatgaatggtttatacgaag-aaaaaaatgattgttttaattctttcaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattat 22503752  T
Q  448 acaaattaggggtggtttgataggatcc 475  Q
       ||||| | |||||||||||||||||    
T  22503751 ---aattatgagtggtttgataggatcc 22503727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 3748568 - 3748683
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  3748568 attgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgatggcggtttgatagcatcaaatttatgtccaaaaa 3748667  T
Q  492 agagaactagagtcta 507  Q
      ||||||||| ||||    
T  3748668 gtagaactagaatcta 3748683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 508
Target Start/End: Original strand, 30915364 - 30915482
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||||||| || |    
T  30915364 tgattgttgtgattctttcaattaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattgatgggggtttgatagcatcaaatttatgtccaga 30915463  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  30915464 aagtagaactagagtctag 30915482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 292 - 362
Target Start/End: Original strand, 31258473 - 31258543
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaa 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31258473 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaa 31258543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 31861067 - 31860989
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgata 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31861067 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt-ggggtggtttgata 31860989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 313 - 508
Target Start/End: Original strand, 1092964 - 1093156
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||| ||    
T  1092964 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgttttgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttca-tg 1093060  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |  |||||||||||| | | ||||||||| || | | |||||||| |||||||    
T  1093061 aaatagctttttaaattgactgatttagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctag 1093156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 500
Target Start/End: Original strand, 1690631 - 1690741
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |  |||||||| ||||    
T  1690631 tgattgttgtgattctttcaatgaaataaattttcaaattgattgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtccaaa 1690730  T
Q  490 aaagagaacta 500  Q
     | ||||||||    
T  1690731 taggagaacta 1690741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21946171 - 21946109
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 454  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21946171 attgttatggttctttcaatgaaatagcttttcaaatagactgattaagtgattatacaaatt 21946109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 484
Target Start/End: Original strand, 29308465 - 29308559
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| | | |||||||||    
T  29308465 tgattgttgtgattacttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgt 29308559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6294409 - 6294279
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||  || |||| |||||| ||||||||| |||||||||||         ||||||||    
T  6294409 agaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatagtttatgcgaa--aaagaaatgattgtt 6294313  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattga 431  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6294312 gtgattctttcaatgaaattgcttttcaaattga 6294279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 350481 - 350381
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaat-gaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaa 488  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||| |||  |||||||| |||    
T  350481 tgattgttgtgattctttttattgaaatagctttcgaaattgactgattgagtgattatataaattgatggtggtttgatagcatcatatttatgtccaa 350382  T
Q  489 a 489  Q
    |    
T  350381 a 350381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 454
Target Start/End: Original strand, 14893415 - 14893479
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 454  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14893415 tgattgttgtgattcttttaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt 14893479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Original strand, 12622178 - 12622227
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12622178 cgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 12622227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Original strand, 31258665 - 31258725
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31258665 cgttagaggcccgtagcatttgtaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 31258725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 599 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 6360619 - 6360552
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcgggtc 666  Q
    |||||||| | |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6360619 cgttagaggcccgtagcatttggaggcctggcctgattgagcaccttgcacaccctcaaggccgggtc 6360552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29401449 - 29401383
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29401449 gccgtccccgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacataa 29401383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Original strand, 3515058 - 3515123
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3515058 cgttagaggcccgtagcatttgtaggcccggcttggttgagcaccttgcacaccctcaaggccggg 3515123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 24455066 - 24455017
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24455066 cgtagcatttggaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 24455017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 24455220 - 24455167
Alignment:
Q  455 aggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  24455220 aggggtggtttgataggatccgatttatatataaaaaggagaactagagtctag 24455167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 411 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31234956 - 31234862
Alignment:
Q  411 tgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||||  |||  |||||  ||||||||||||||    
T  31234956 tgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaatt--ggatggtttgatagcattgaattcttgtctaaaaagtagaactagagtcta 31234862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19231678 - 19231615
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 454  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19231678 tgattgttgtgattttttcaatgtcatagcttttcaaattgattgattaagtga-tatacaaatt 19231615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 207
Target Start/End: Original strand, 31258325 - 31258392
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaat-aggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  31258325 gccgtccccgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaaacaggcccctagtaaaataaaacgtaa 31258392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1327638 - 1327595
Alignment:
Q  411 tgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 454  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1327638 tgaaatagttttctaaattgattgattaagtgattatacaaatt 1327595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29149678 - 29149635
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  29149678 tcggctctctttttaaaataggtctctagtaaaataaaacgtaa 29149635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 599 - 660
Target Start/End: Original strand, 7525374 - 7525435
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggt 660  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  7525374 cgttagagacccgtagcatttggaggccccgtctggttgagcatcttatacaccctcaaggt 7525435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11088613 - 11088564
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaat-gaaatagctttccaaattgactgatta 438  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11088613 tgattgttgtgattctttttattgaaatagcttttcaaattgactgatta 11088564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31244092 - 31243999
Alignment:
Q  411 tgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||||  |||  |||||  ||||||||||||||    
T  31244092 tgaaatagcttttcaa-ttgattgattaagtgattatacaaatt--ggatggtttgatagcattgaattcttgtctaaaaagtagaactagagtcta 31243999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 630 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 2618182 - 2618146
Alignment:
Q  630 cctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcgggtc 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2618182 cctggttgagcaccttgcacactctcaaagtcgggtc 2618146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31861119 - 31861067
Alignment:
Q  321 gttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggttt 373  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31861119 gttgtttgaatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggttt 31861067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Original strand, 21784684 - 21784900
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  21784684 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggcgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatg 21784783  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21784784 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattaactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaa 21784883  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
     ||||||||||||||||    
T  21784884 ggagaactagagtctag 21784900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 168 - 508
Target Start/End: Original strand, 52654903 - 52655239
Alignment:
Q  168 ctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaac 267  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||    
T  52654903 ctctctttttaaaataggtccctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagttaaatttcattaaaaaaaa---ttagaatcagaagaacttctaaac 52654999  T
Q  268 atgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaa 367  Q
    ||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52655000 atgaaaggaattaaaaaaaaaataagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtatcgtttgaatttgtcactcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaa 52655099  T
Q  368 tggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttga 467  Q
    |||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52655100 tggtttatgcga-ggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagtggtggtttga 52655198  T
Q  468 taggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  52655199 taggatccgatttatatacaaaaaggagaactagagtctag 52655239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 135 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 8364486 - 8364087
Alignment:
Q  135 agtgccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnn 234  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||| | |||||||||||      
T  8364486 agtgccatccctgtggaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccatagtaaaataaaacgtaatttttttgtgttgctaaatttcattaa 8364390  T
Q  235 nnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttg 334  Q
             | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8364389 aaaaaa---ttagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaacat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttg 8364294  T
Q  335 tcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactg 434  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8364293 tctctcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttgtgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactg 8364194  T
Q  435 attaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaag 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||        |||||| |||||||||||    
T  8364193 attaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaacaagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaag 8364095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 138 - 542
Target Start/End: Original strand, 28132488 - 28132884
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnn--gtgtagttaaatttcattnnn 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||         |||||| |||||||||||       
T  28132488 gccgtccctgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaatataatttttttttgtgtagctaaatttcattaaa 28132584  T
Q  236 nnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgt 335  Q
            ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||    
T  28132585 agaaa---tcaaaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggcgtcgtttgaacttgt 28132680  T
Q  336 cactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactga 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28132681 cactcctctgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaa--tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactga 28132778  T
Q  436 ttaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaaga 535  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  28132779 ttaagtgattatacaaattaagggtgatttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaatctcaaatgtgtactaaaga 28132877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 292 - 507
Target Start/End: Original strand, 29387655 - 29387869
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  29387655 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctattgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tg 29387753  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29387754 attgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaa 29387853  T
Q  492 agagaactagagtcta 507  Q
     |||||||||||||||    
T  29387854 ggagaactagagtcta 29387869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 138 - 508
Target Start/End: Original strand, 51939308 - 51939672
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||       |||||| |||||||||||         
T  51939308 gccgtccctgtgaaatagtaggctcgac---tctctttttaaaataggctcctattaaaatataacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaa 51939404  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||    
T  51939405 aaaa--tcagaatgagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttaaccaactgtgtcgtttggatttgtca 51939501  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51939502 cttctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatt 51939601  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51939602 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 51939672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 245 - 542
Target Start/End: Original strand, 46791552 - 46791846
Alignment:
Q  245 cagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctct 344  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46791552 cagaatctgaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctct 46791650  T
Q  345 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgat 444  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46791651 gttgtggaaaagggtcaagtgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattcttgcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgat 46791749  T
Q  445 tatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  46791750 tatacaaattagaggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 46791846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 246 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18408399 - 18408107
Alignment:
Q  246 agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18408399 agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatcaaacggtgtcgtttggatttgtcactgctctg 18408301  T
Q  346 ttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18408300 ttgtggaaaagggtaaaacgaattgtttatgcgaa-aaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatggattagcttttcaaattgactgattaagtgatt 18408202  T
Q  446 atacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  18408201 atacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaactaaagtctag--aaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 18408107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Original strand, 23164473 - 23164688
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |     
T  23164473 agtgaaagaggtgaaatttatccaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatt- 23164571  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23164572 attgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaa 23164671  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
     ||||||||||||||||    
T  23164672 ggagaactagagtctag 23164688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 164 - 507
Target Start/End: Original strand, 25598859 - 25599201
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttct 263  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||       |||||| |||| ||||||           ||||||||||||||||||||    
T  25598859 tcggctctctttttaaaataggtctttagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaacttcattaaaaaaaa---tcagaatcagaagaacttct 25598955  T
Q  264 aaacatgaaaggaattnnnnnnnnnn----ttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggt 359  Q
    ||||||||||| ||||              | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25598956 aaacatgaaagaaattaaaaaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggt 25599055  T
Q  360 aaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25599056 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaca--tgattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatataaattagagg 25599153  T
Q  460 tggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25599154 tggtttgatagaatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtcta 25599201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 292 - 544
Target Start/End: Original strand, 41706953 - 41707206
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnn-- 389  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||              
T  41706953 agtgaaaggggtgaaatttatctaacgttgtcgtttggatttgtcactcctctggtgtgaaaaagggtaaagcgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaaa 41707052  T
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41707053 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatgcaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaa 41707152  T
Q  490 aaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaaag 544  Q
    || ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41707153 aaggagaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaag 41707206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 246 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24252829 - 24252532
Alignment:
Q  246 agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctg 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  24252829 agaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggggtcgtttggatttgtcactcatctg 24252730  T
Q  346 ttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24252729 ttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattcttgcactgaaataactttccaaattgactgattaagtgatt 24252631  T
Q  446 atacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag-nnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaaag 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||         |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24252630 atacaaattaagggtggtttgataggatctga-ttatgtacaaaaagaagaactagagtctagaaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaag 24252532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 248 - 507
Target Start/End: Original strand, 27729627 - 27729884
Alignment:
Q  248 aatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||    
T  27729627 aatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacagtgtcgtttggatttgtcacttctatgtt 27729725  T
Q  348 gtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattat 447  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27729726 gtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaataa-tgattgttgtgattctttcgatcaaattgctttccaaattgattgattatgtgattat 27729824  T
Q  448 acaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27729825 acaaattaggggtggtttgataagatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtcta 27729884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 292 - 542
Target Start/End: Original strand, 23067625 - 23067875
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||    
T  23067625 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcatttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaa-ttaaaaaatg 23067723  T
Q  392 attgt-tgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaa 490  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23067724 attgtgtgtgattctttaaatgaaataacttttcaaattgactggtgaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaa 23067823  T
Q  491 aagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    | |||||||| |||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  23067824 aggagaactaaagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 23067875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 13401768 - 13401411
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||       ||||||||||| ||||||         
T  13401768 gccgtccctgtaaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggtccttagtaaaataaaatgtaacttttttgtgtagttaaacttcattaaaaa 13401672  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||          | | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||    
T  13401671 aatga-----aatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taattgaaagaggtgaaatttatcttacggtgtcgtttgaatttggca 13401578  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13401577 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgggaaaaaaaaatgattgttgtgattcttccaatgaaatagcttttcaaattgactgatt 13401478  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagt 504  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13401477 aagtgattatacaaattaagagtggtttgataggatcgaatgtatgtacaaaaaggagaactagagt 13401411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 248 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 54430760 - 54430500
Alignment:
Q  248 aatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgtt-gtttggatttgtcactcctctgt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||    
T  54430760 aatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaaaaggtgaaatttatctaacggtatccgtttggatttgtcactcgtttgt 54430661  T
Q  347 tgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatta 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  54430660 tgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgcaattcttttaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgatta 54430562  T
Q  447 tacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  54430561 tacaaattaggggtggtttgataacatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagcctag 54430500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 133 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 6715754 - 6715397
Alignment:
Q  133 tcagtgccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcatt 232  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||    
T  6715754 tcagggccgtccccgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaatagatccttagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcatt 6715658  T
Q  233 nnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatt 332  Q
               |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||          | |||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||    
T  6715657 aaaaaaaa---tcagaagcagaagaagatctaaacatggaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatataatggtgtcgtttggatt 6715562  T
Q  333 tgtcactcctctgttgtgg-aaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattga 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6715561 tgtcactcctctgttgtggaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaa--aaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaataactttcaaaattga 6715464  T
Q  432 ctgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||          |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6715463 ctgat----------tacaaattataggtggtttgataggatccgatttatatacaaaaaggagaactagagtctag 6715397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20762260 - 20762052
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||          | |||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  20762260 tcagaatcggaagaacttctaaatatgaaatgaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttattcaacggtatcgtttgtatttgtcactcctc 20762161  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtga 443  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  20762160 tattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgacg-aaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaatagacttccaaattaactgatcaagtga 20762062  T
Q  444 ttatacaaat 453  Q
    ||||||||||    
T  20762061 ttatacaaat 20762052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 244 - 381
Target Start/End: Original strand, 27110726 - 27110862
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27110726 tcagaatcataagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctc 27110824  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaag 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27110825 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaag 27110862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21596401 - 21596283
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||| || |    
T  21596401 tgattgttgtgattcttgtaatgaaatagctttccaaatcgactgattaagtgattatacaaattgggagtggtttgatagcatctgatttatgtccaga 21596302  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  21596301 aaggagaattagagtctag 21596283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 7767127 - 7767011
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||    
T  7767127 attgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggttgtttgatagcatcaaatttatgtccagaaa 7767028  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
      |||||| ||||||||    
T  7767027 gtagaactggagtctag 7767011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 42009262 - 42009377
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||    
T  42009262 attgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaa 42009361  T
Q  492 agagaactagagtcta 507  Q
      ||||||| ||||||    
T  42009362 gtagaactaaagtcta 42009377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 508
Target Start/End: Original strand, 48627027 - 48627145
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||  |||||||| || |    
T  48627027 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggcggtggtctgatagtatcagatttatgtccaga 48627126  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
     | |||||||| |||||||    
T  48627127 tatgagaactaaagtctag 48627145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 27303251 - 27303135
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| || | ||| ||||||||| || |||    
T  27303251 attgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgatggtggtttcatggcatcaaatttatgtccataaa 27303152  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
      |||| ||||||||||    
T  27303151 gtagaagtagagtctag 27303135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 392 - 484
Target Start/End: Original strand, 36538186 - 36538278
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  36538186 attgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaagtttatgt 36538278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 392 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 46904806 - 46904714
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  46904806 attgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatctatgt 46904714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15987338 - 15987207
Alignment:
Q  316 acggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaa 415  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||         |||| ||||| ||||||| |||||||    
T  15987338 acggtgtcatttgaatttgtcactcctccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaa--aaataaatgatagttgtaattcttttaatgaaa 15987241  T
Q  416 tagctttccaaattgactgattaagtgattatac 449  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15987240 taactttcgaaattgaatgattaagtgattatac 15987207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 50677314 - 50677391
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgata 469  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  50677314 attgttgtgattgtttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgata 50677391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 396 - 504
Target Start/End: Original strand, 19965884 - 19965992
Alignment:
Q  396 ttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagag 495  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||    
T  19965884 ttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaatttaactaattaagtgattatacaaattggcagtggtttgatagcatcagatttatgtccaaaaaggag 19965983  T
Q  496 aactagagt 504  Q
    || ||||||    
T  19965984 aattagagt 19965992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 500
Target Start/End: Original strand, 1254962 - 1255158
Alignment:
Q  296 aaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattg 395  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||| |||||   ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||         | ||||    
T  1254962 aaagaggtgaaatctacctaacggtgttgtctagatttg-cactc---tgttgcgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaattattg 1255055  T
Q  396 ttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagag 495  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||  ||    
T  1255056 ttg--attctttcaatgaaataactttctaaattgaccgattaagtcattatacaaattaaaggtcgtttgatagcatcagatttatgtccaaaaagaag 1255153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 507
Target Start/End: Original strand, 40152038 - 40152245
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |         ||||||||    
T  40152038 agaggtgaaatttacctaaaggtgttgtttggatgtatcattcctccgttgtgggaaaggggaaa-caaatggtttatgcgca--aaagaaatgattgtt 40152134  T
Q  398 gtgattc-tttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagaga 496  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||  || |||||  |||||  |||    
T  40152135 gtgattcgttttaatgaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattggggatgatttggtagcatcagatctatgtctaaaaagaaga 40152234  T
Q  497 actagagtcta 507  Q
    | |||||||||    
T  40152235 attagagtcta 40152245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 502
Target Start/End: Original strand, 1649829 - 1649941
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||||| ||  |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |  ||||||||  | |    
T  1649829 tgattgttgcgaagctttcagtgaaatagattttcaaattgaatgattaagtgattatacaaattgggggtgatttgatagcaccagatttatgtctaga 1649928  T
Q  490 aaagagaactaga 502  Q
    |||||||||||||    
T  1649929 aaagagaactaga 1649941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 313 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 51147077 - 51146886
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |        | ||||||||||||||||||||     
T  51147077 ctaacggtgtcgtttggaat-gtcacttctatgtcgtagaaaaggg-aaaacgaatggtttatgcga-gagaaaaaataattgttgtgattctttcaata 51146981  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||   |||||||| |||||    
T  51146980 aaatagttttttaaattgactgattaagtga-tattcaaattgatggtggtttaatagcatcaaatttatgtccaaaaagtggaactagaatctag 51146886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 505
Target Start/End: Original strand, 4207357 - 4207465
Alignment:
Q  391 gattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaa 490  Q
    |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||||  ||| |||||    
T  4207357 gattgttgtgattcttt----gaaatatctttccaaattgaatgattaagtgattatacaaatt--ggatggtttgatagcattgaattcttgtccaaaa 4207450  T
Q  491 aagagaactagagtc 505  Q
    | |||||||||||||    
T  4207451 aggagaactagagtc 4207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 8364029 - 8363964
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8364029 cgttagaggcccgtagcaattggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccggg 8363964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 6715308 - 6715248
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6715308 cgttagaggcccgtaacatttagaggctcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 6715248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Original strand, 41707262 - 41707322
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41707262 cgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgaacaccttgcacaccctcaagg 41707322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 657
Target Start/End: Original strand, 21784990 - 21785048
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 657  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21784990 cgttagagacccgtagcattgggaggcccggcctggttaagcaccttgcacaccctcaa 21785048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 23067943 - 23067997
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23067943 cgtagcaattggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccggg 23067997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 600 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 24252475 - 24252409
Alignment:
Q  600 gttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcgggtc 666  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24252475 gttagaggcccgtaacatttggaggcccggtctggttgagcaccttacacaccctcaaggtcgggtc 24252409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 507
Target Start/End: Original strand, 43905862 - 43905958
Alignment:
Q  411 tgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||    
T  43905862 tgaaataacttttcaaattgactgattgagtgattatacaaattgagggtagtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtcta 43905958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 664
Target Start/End: Original strand, 51939779 - 51939827
Alignment:
Q  616 atttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51939779 atttggaggccccgcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 51939827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Original strand, 46791451 - 46791514
Alignment:
Q  139 ccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46791451 ccgtccctgtgaaataggaggctcg---gctctcttt--aaaataggcccctagtaaaataaaacgtaa 46791514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Original strand, 27111014 - 27111078
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27111014 cgttagaggcccgtagcatttggaggccccgcctggttgagcacctt-cacaccctcaaggccggg 27111078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Original strand, 29387972 - 29388021
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29387972 cgtagcatttgaaggtccggcctggttgagcaccttgcacacactcaagg 29388021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 664
Target Start/End: Original strand, 52655358 - 52655395
Alignment:
Q  627 cggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52655358 cggcctggttaagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 52655395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 544
Target Start/End: Original strand, 27110882 - 27110958
Alignment:
Q  467 ataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaaag 544  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27110882 ataggatacgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaag 27110958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 27110651 - 27110690
Alignment:
Q  168 ctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27110651 ctctctttttaaaatagacccgtagtaaaataaaacgtaa 27110690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 454
Target Start/End: Original strand, 35202737 - 35202780
Alignment:
Q  411 tgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 454  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35202737 tgaaattgctttcaaaattgactgattaagtaattatacaaatt 35202780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 277
Target Start/End: Original strand, 19965735 - 19965764
Alignment:
Q  248 aatcagaagaacttctaaacatgaaaggaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19965735 aatcagaagaacttctaaacatgaaaggaa 19965764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Original strand, 23164351 - 23164387
Alignment:
Q  167 gctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23164351 gctctctttttaaaataggcctctagtaaaataaaac 23164387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 612 - 664
Target Start/End: Original strand, 48627232 - 48627284
Alignment:
Q  612 tagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48627232 tagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcaccccctcaaggtcggg 48627284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 140 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 17019 - 16658
Alignment:
Q  140 cgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnn 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||       |||||| |||||||||||           
T  17019 cgtccccgtgaaataggaggctcaac---tctctttttaaaataggcccctagtaaaatataacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaa 16923  T
Q  240 nnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcact 339  Q
        | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16922 aa--ttagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgttact 16826  T
Q  340 cctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaa 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16825 cctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaata-tgatcgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 16727  T
Q  440 gtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16726 gtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag 16658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 16562 - 16502
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16562 cgttagaggcccgtagcatttggaggcccggtctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 16502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 133 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13585621 - 13585214
Alignment:
Q  133 tcagtgccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnn----gtgtagttaaattt 228  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||           |||||| |||||||    
T  13585621 tcagggccgtccctgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaatgtaatttttttttttgtgtagctaaattt 13585525  T
Q  229 cattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttg 328  Q
    ||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||    
T  13585524 cattaaaaaaaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaaaaggtgaaatttatctaacggcgtcgtttg 13585426  T
Q  329 gatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaat 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13585425 gacttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaat 13585327  T
Q  429 tgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgta 528  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||| |||||    
T  13585326 tgactgattaattgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaagaaaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgta 13585228  T
Q  529 ctaaagaaagaaaa 542  Q
    ||||||||||||||    
T  13585227 ctaaagaaagaaaa 13585214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 140 - 506
Target Start/End: Original strand, 18420361 - 18420723
Alignment:
Q  140 cgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnn 239  Q
    |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||           
T  18420361 cgtccctgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaatagtctcctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaa 18420457  T
Q  240 nnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcact 339  Q
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||          | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18420458 aaaatcagaatcagaataacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaaaaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcact 18420557  T
Q  340 cctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaa 439  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18420558 cctctgttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaacagcttttcaaattgactgattaa 18420656  T
Q  440 gtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtct 506  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18420657 gtgattatacaaattaagtgtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtct 18420723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 168 - 542
Target Start/End: Original strand, 43967848 - 43968219
Alignment:
Q  168 ctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaac 267  Q
    |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||       |||||| |||||||||||           |||||||||||||||||||||||     
T  43967848 ctctctttttaaaatagatccctattaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcatttaaaaaaaaaatcagaatcagaagaacttctaaat 43967947  T
Q  268 atgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaa 367  Q
    ||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43967948 atgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaaggatgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagagtaaaacgaa 43968046  T
Q  368 tggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttga 467  Q
    ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43968047 tggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggagtggtttga 43968145  T
Q  468 taggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  43968146 taggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 43968219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 164 - 508
Target Start/End: Original strand, 43926102 - 43926439
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||| ||||||||| |           ||||||||||||||| ||||    
T  43926102 tcggctctctttttaaaataggcctttagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcactaaaaaa-----tcagaatcagaagaagttct 43926196  T
Q  264 aaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaa 363  Q
    ||||||||||||||||          | || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  43926197 aaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagagaaagaggtgaaatttatgtaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaag 43926295  T
Q  364 cgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggt 463  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43926296 cgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattatgggtggt 43926394  T
Q  464 ttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  43926395 ttgataggatccgatttatatacaaaaagtagaactagagtctag 43926439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 138 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 7858395 - 7858000
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||  | |||||||||||         
T  7858395 gccgtccccgtggaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgctgctaaatttcattaaaaa 7858299  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||             |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  7858298 aaaa--tcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaataaaaaagataa--agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcatttggatttttca 7858203  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  7858202 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttaaatgaattaactttccaaattgactgatt 7858104  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaa 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||    
T  7858103 aagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatgttcaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaa 7858005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 18112280 - 18112064
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  18112280 agtgaaagaggttaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatg 18112181  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  18112180 attgttgtgattctttcaataaaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggagtggtttgatatgatccgatttatgtacataaa 18112081  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18112080 agagaactagattctag 18112064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 292 - 507
Target Start/End: Original strand, 44664947 - 44665161
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  44664947 agtgaaaaaggtgaaatttatctaatggtatcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tg 44665045  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44665046 attgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaatagactgattaagtgatgatacaaattagaggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaa 44665145  T
Q  492 agagaactagagtcta 507  Q
     |||||||||||||||    
T  44665146 ggagaactagagtcta 44665161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 148 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 3471899 - 3471548
Alignment:
Q  148 tgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcag 247  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||       |||||| |||| ||||||           ||||    
T  3471899 tgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataagctcttagtaaagtaaaacgtaatttttttgtgtagctaaacttcattaaaaaaaa---tcag 3471806  T
Q  248 aatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgtt 347  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||          | ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  3471805 aatcataagaacttctaaacattaaaggaattaaaaaaat--taagtgaaataggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatctatcactcctctgtt 3471708  T
Q  348 gtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattat 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3471707 gtggaaaagggtaaaatgaatggttcatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattat 3471609  T
Q  448 acaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3471608 acaaattaggggtggtttgatagaatcacatttatgtacaaaaatgagaactagattctag 3471548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 1004368 - 1004056
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||         
T  1004368 gccgtccccgtgaaataggaggctcgac---tctttttttaaaatagatccatagtaaaataaaacgtaatttttttatgtagttaaatttcattaaaaa 1004272  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          ||||||||||||||| || |||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||    
T  1004271 aaaaa-tcagaatcagaagaagttttaaacatgaaaggaattaaaaaaat--taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttg---ttgtca 1004178  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaat-agctttccaaattgactgat 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  1004177 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgatgaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataattttttcaaattgactgat 1004078  T
Q  437 taagtgattatacaaattaggg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1004077 taagtgattatacaaattaggg 1004056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Original strand, 32098078 - 32098294
Alignment:
Q  292 agtgaaagag--gtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnn 389  Q
    ||||||||||  |||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||             
T  32098078 agtgaaagagaagtgaaatttacgtaacggtgtcgtttggattcgtcactcctctgttgtgggaatggggaaaacgaatggtttatgcaaa--aaagaaa 32098175  T
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  32098176 taattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgatcatacaaattaagagtggtttgatagcatcaaatttatgtccaaa 32098275  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
    || || |||||||||||||    
T  32098276 aaggataactagagtctag 32098294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 337 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 27074692 - 27074526
Alignment:
Q  337 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 436  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  27074692 actcctctgttgtggaaaaaggtaaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattttttcaatgaaatagacttttaaattgactgat 27074594  T
Q  437 taagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagt 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27074593 taagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagtactagagt 27074526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 351 - 508
Target Start/End: Original strand, 42951725 - 42951885
Alignment:
Q  351 gaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtg----attctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatta 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42951725 gaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgtgtgattctttcaataaaataacttttcaaattgactgattaagtgatta 42951823  T
Q  447 tacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42951824 tacaaattaggagtggtttgataggattcgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctag 42951885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 314 - 508
Target Start/End: Original strand, 34523875 - 34524067
Alignment:
Q  314 taacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatga 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||||    
T  34523875 taacggtgtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcaatga 34523972  T
Q  414 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||    
T  34523973 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctag 34524067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 390 - 507
Target Start/End: Original strand, 5869320 - 5869435
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  5869320 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattttaaaaatt-gtggtggtttgatagtat-caatttatgtacaga 5869417  T
Q  490 aaagagaactagagtcta 507  Q
    || |||||||| ||||||    
T  5869418 aaggagaactaaagtcta 5869435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 313 - 508
Target Start/End: Original strand, 23567197 - 23567390
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||         | ||||||||||| |||||||||    
T  23567197 ctaacggcgtcgtttggatttgtcatttatccgttgtgggaaaaggaaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatcattgttgtgatactttcaatg 23567294  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  23567295 aaatagtatttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtagcagatttatgttcagataagagaactaaagtctag 23567390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Original strand, 3628656 - 3628863
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| ||||||| | |||||||||  || || | ||| || |||||||||||||||||||||         | ||||||    
T  3628656 agaggtgaaatttacctaactgtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaacggaaaaacgaatggtttatgcgaa--aaagaaataattgtt 3628752  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaa 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||  || ||   ||||    
T  3628753 gtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattatgtgattatacaaattaatggtggtttgatagcatcaaatttatgaccagaatgtagaa 3628852  T
Q  498 ctagagtctag 508  Q
    |||||||||||    
T  3628853 ctagagtctag 3628863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12531700 - 12531545
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||         |||||||||||||||||||||||    
T  12531700 ctaacggcgtcgtttgaatttgtcatttatccgttgtgggaaaggggaaaacaaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcaatg 12531603  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  12531602 aaatagatttttaaattgactgattaagtgattatacaaattggaggtagtttgatag 12531545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 392 - 483
Target Start/End: Original strand, 39697938 - 39698029
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatg 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||    
T  39697938 attgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactaattaaatgatcatacaaattggtggtggtttgatagtaccaaatttatg 39698029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 302 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29372508 - 29372343
Alignment:
Q  302 gtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtga 401  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||   | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||         |||||||||| |    
T  29372508 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactccttcatcgtggcaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaa--aaataaatgattgttgtca 29372412  T
Q  402 ttctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  29372411 ttctttcaattgaataactttccaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgatag 29372343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 507
Target Start/End: Original strand, 30915285 - 30915403
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttc-aatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaa 488  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||| ||| |||  || ||||| ||     
T  30915285 tgattgttgtgattctttttaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattggaggaggtttggtagcatcagatctatgtccag 30915384  T
Q  489 aaaagagaactagagtcta 507  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  30915385 aaaggagaattagagtcta 30915403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3445842 - 3445710
Alignment:
Q  139 ccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnn 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||          
T  3445842 ccgtccctgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacgtaa--tttttgtgtagttaaatttcatt---aaa 3445751  T
Q  239 nnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaatt 279  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3445750 aaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaagaatt 3445710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 42777901 - 42777763
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| |   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||  |        ||||||||    
T  42777901 agaggtgaaatttactgaacggtgtggtttggttttgtcactcctccgttgtgggaaatgagaaaacgaatggtatatgcg--gaaaaaaaatgattgtt 42777804  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatta 438  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42777803 gtgattcttttaattaaatagctttctaaattgactaatta 42777763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 35874990 - 35874872
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt--aggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||| ||||||| | || |    
T  35874990 attgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgatatagtggtttgatagcatcaaatttatatccaga 35874891  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  35874890 aagtagaactagagtctag 35874872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Original strand, 44665248 - 44665313
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44665248 cgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcttgattgagcaccttacacaccctcaaggtcggg 44665313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Original strand, 2545921 - 2546036
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| || | | ||||||  || ||    
T  2545921 attgttttgatagtttcaatgaaataacttcccaatttgattgattaagtgattata-taatttggggtgatttgatagcatgcgaattatgtcaaataa 2546019  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
     ||||||||||||||||    
T  2546020 ggagaactagagtctag 2546036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 44664360 - 44664423
Alignment:
Q  141 gtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    ||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44664360 gtccctgtgaaataggtggctcg---gctctctttttaaaataggtccctagtaaaataaaacgtaa 44664423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 399 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 42076165 - 42076110
Alignment:
Q  399 tgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 454  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42076165 tgattctttcaatgttatagcttttcaaattgattgattaagttattatacaaatt 42076110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18111669 - 18111607
Alignment:
Q  602 tagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    ||||||| | |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18111669 tagagacccatagcatttggaggtccgacctgattgagcaccttgcacaccctcaaggccggg 18111607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 7857933 - 7857884
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7857933 cgtagcaattggaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 7857884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18112411 - 18112344
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||    
T  18112411 tcggctctctttttaaaataggtcc-tagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcatt 18112344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27074761 - 27074718
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27074761 tcggctatctttttaaaataggtccatagtaaaataaaacgtaa 27074718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 438
Target Start/End: Original strand, 36515064 - 36515202
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||  || || | ||| || ||||| |||| |||||||||||        | ||||||    
T  36515064 agagctgaaatttatctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaatgggaaaacaaatgatttatgcgaagaaaaaaa-taattgtt 36515161  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatta 438  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  36515162 gtgattctttcaatgaaatagttttttaaattaactgatta 36515202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 279
Target Start/End: Original strand, 42951557 - 42951684
Alignment:
Q  147 gtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntca 246  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||           |||    
T  42951557 gtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggttactagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcatt--taaaaaaaatca 42951651  T
Q  247 gaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaatt 279  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42951652 gaatcataagaacttccaaacatgaaaggaatt 42951684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 627 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1003943 - 1003906
Alignment:
Q  627 cggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1003943 cggcctggttgagcactttgcacaccctcaaggccggg 1003906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 13585158 - 13585093
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13585158 cgttagaggcccgttgcatttgaaggcccggtctgattgagcaccttgcacacccttaaggtcggg 13585093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33452858 - 33452778
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaa-tagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgata 469  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| || |||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  33452858 tgattgttgtgattctttttattaaaataacttttcaaattgattaattgagtgattatataaattggaggtggtttgata 33452778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 138 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 33910375 - 33910012
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| |||| ||||||         
T  33910375 gccgtccctgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaacgtaatatttttgtgtagctaaacttcattaaaaa 33910279  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  33910278 aaaa--tcagaataagaataacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtaa 33910182  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33910181 ttcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatt 33910083  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33910082 aagcgattatacaaattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag 33910012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 138 - 469
Target Start/End: Original strand, 12251037 - 12251365
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||         
T  12251037 gccgtccctgtgaaataggaggctcgacta-tct-tttttaaaataggcctctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaa 12251134  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  12251135 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgacgtttggatttgtca 12251234  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12251235 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaag-aaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 12251333  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgata 469  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12251334 aaatgattatagaaattaggggtggtttgata 12251365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 167 - 542
Target Start/End: Original strand, 42160902 - 42161271
Alignment:
Q  167 gctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaa 266  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||    
T  42160902 gctctctttttaaaatagatccttagtaaaataaaacgtaatatctttatgtagttaaatttcattaaaaaaaa---tcagaatcagaataacttctaaa 42160998  T
Q  267 catgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacga 366  Q
    |||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42160999 catgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacga 42161097  T
Q  367 atggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttg 466  Q
    |||||||||||||||        || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42161098 atggtttatgcgaagaaaaat--tg-ttgctgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattaactgatcaagtgattatacaaattaggggtggtttg 42161194  T
Q  467 --ataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  42161195 atataggatccaatttatgtacaaaaatgagaattagagtctag-aaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 42161271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 292 - 502
Target Start/End: Original strand, 36796272 - 36796482
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  36796272 agtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgttttgatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatg 36796371  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36796372 attgttgtgattctttcaatgaaataattttccaaattgactgattaagttattatacaaattaagggtagtttgataggatccgatttatgtacaaaaa 36796471  T
Q  492 agagaactaga 502  Q
     ||||||||||    
T  36796472 ggagaactaga 36796482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 140 - 542
Target Start/End: Original strand, 6379840 - 6380234
Alignment:
Q  140 cgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnn 239  Q
    |||||| |||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||           
T  6379840 cgtccctgtgaaatatgaggctcg---gctcactttttaaaataggcccatagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagttaaacttcattaaaaaaa 6379936  T
Q  240 nnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcact 339  Q
        ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  6379937 a---tcagaatcgaaagaacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatccaacaatgtcgtttggatttgtcact 6380032  T
Q  340 cctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaa 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  6380033 cctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaata-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgattgattaa 6380131  T
Q  440 gtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaaga 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||        |||||| |||||||||||||| |    
T  6380132 gtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcagattcatgtacaaaaagaagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaata 6380231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 166 - 508
Target Start/End: Original strand, 18015359 - 18015698
Alignment:
Q  166 ggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||| |||||||||||           ||||||| ||||||||||||||    
T  18015359 ggctctctttttaaaataggcccctaataaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaaa---tcagaattagaagaacttctaa 18015455  T
Q  266 acatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacg 365  Q
    ||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  18015456 acatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatcaaacggtgtcgtttgaatttgtcacttttctgttgtgtaaaagggtaaaacg 18015554  T
Q  366 aatggtttatgcgaagnnnnnnnn-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtt 464  Q
    ||||||| ||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18015555 aatggttaatgcgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtt 18015654  T
Q  465 tgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18015655 tgataggatccgatttatgtacaaaaaggaaaactagagtctag 18015698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 244 - 508
Target Start/End: Original strand, 33418970 - 33419234
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33418970 tcagaatcagaagaagttctaaacatgaatggaattaaaaaaaaaataagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctc 33419069  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactga-ttaagtg 442  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  33419070 tgttgtagaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattattgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgacttaattaagtg 33419168  T
Q  443 attatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33419169 attatacaaattaggggtagtttgataggatccgatttatgtacaaaaacaagaactagagtctag 33419234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 244 - 508
Target Start/End: Original strand, 46221556 - 46221819
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||          | |||||||||||| ||||| |||||||| | |  ||||||||||||| || ||    
T  46221556 tcagaattagaagaacttctaaacatgaaagaaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtaaaatttatctaacgatatcatttggatttgtcattcttc 46221655  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtga 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46221656 tgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaa-taaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtga 46221754  T
Q  444 ttatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46221755 ttctacaaattaggggtagtttgataggattcgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 46221819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 292 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 11672749 - 11672499
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||        ||    
T  11672749 agtgaaagaggtgaaatttatcaaacgatgtcgtttagatttgtcactcctctgttgtggaaaagagtaaaacgaatgatttatgcgaagaaaaaaa-tg 11672651  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatt--tatgtacaaa 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  11672650 attgttgtgattctttcattgaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggagtggtttgataggatccgatttatatgtacaaa 11672551  T
Q  490 aaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    || ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  11672550 aaggagaactagagtctag-aaaaaaactcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 11672499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 168 - 508
Target Start/End: Original strand, 7636104 - 7636442
Alignment:
Q  168 ctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaac 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||       |||||| |||| ||||||           |||||||||||| |||||||||||    
T  7636104 ctctctttttaaaataggcccctagtagaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaacttcattgaaaaaaa---tcagaatcagaacaacttctaaac 7636200  T
Q  268 atgaaaggaattnnnnnnnnnntta-gtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacga 366  Q
    ||||||||||||          ||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7636201 atgaaaggaattaaaaaaaaaattaagtgaaaaaggtgaaatttatctaacggtatcgtttgaatttgtcactcttctgttgtggaaaagggtaaaacga 7636300  T
Q  367 atggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttg 466  Q
    |||| ||||| ||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7636301 atggcttatgggaagaaaaaaaatgattgttgcgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattaggggtggtttg 7636400  T
Q  467 ataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  7636401 ataggatcagagttatgtacaaaagggagaagtagagtctag 7636442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Original strand, 44893930 - 44894145
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||    
T  44893930 agtgaaagaggtgaaatttatgtaacggtgtcgtttgaatttgtaactcctttgctgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaa-tg 44894028  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  44894029 attgttgtgattctttcaataaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttaataggatccgatttatgtacaaaaa 44894128  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
      ||||||| |||||||    
T  44894129 gaagaactatagtctag 44894145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 324 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 4100100 - 4099883
Alignment:
Q  324 gtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaa-cgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4100100 gtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaaacgaatggtttttgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtaattctttcaatgaaatagcttt 4100002  T
Q  423 ccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaa 522  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||        ||||||    
T  4100001 tcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgata-gatccgatttatgtacaaaaaggagaattagcgtctagaaaaaaaactcaaa 4099903  T
Q  523 tgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4099902 cgtgtactaaagaaagaaaa 4099883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 300 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 32956929 - 32956724
Alignment:
Q  300 aggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgt 399  Q
    |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  32956929 aggtgaaatttacctaacagtgtcgtttggatttgtcactcatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa--aaagaaatcattgttgt 32956832  T
Q  400 gattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaact 499  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| || ||| |||||||    
T  32956831 gattctttcaatgaaataactttataaattgactgattaaatgattataaaaattgggggtggtttgatagcatcagatttatgtccagaaaggagaact 32956732  T
Q  500 agagtcta 507  Q
    ||||||||    
T  32956731 agagtcta 32956724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 390 - 508
Target Start/End: Original strand, 8358292 - 8358410
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8358292 tgattgttgtgattctttcaatgagataactttttaaattgactgattaagtgattatataaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaa 8358391  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
    || |||||||| |||||||    
T  8358392 aaggagaactaaagtctag 8358410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 26633518 - 26633311
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||| | ||||||| |  || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||         ||||||||    
T  26633518 agaggtgaaatttacttaacggtgtcgtttggaat-gtcactcatacgtcgtgggaaagggaaaaatgaatggtttatgcgaa--aaagaaatgattgtt 26633422  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaa 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||| ||||||||| || |||  ||||    
T  26633421 gtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggttttatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaa 26633322  T
Q  498 ctagagtctag 508  Q
    |||||||||||    
T  26633321 ctagagtctag 26633311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 390 - 508
Target Start/End: Original strand, 26282540 - 26282658
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||| || |    
T  26282540 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtgcaga 26282639  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
     | |||||||| |||||||    
T  26282640 taggagaactaaagtctag 26282658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Original strand, 773783 - 773962
Alignment:
Q  292 agtgaaagag--gtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnn 389  Q
    ||||||||||  |||||||| | ||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |             
T  773783 agtgaaagagatgtgaaatttacctaacggcgtcgtttgaatttgtgactcctccgttgttggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcacaaaaaaaaaa 773881  T
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  773882 tgattgttgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactgataaagtaattatacaaattaggggtgatttgatag 773962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 470
Target Start/End: Original strand, 40001694 - 40001774
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  40001694 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattggaggtggtttgatag 40001774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 298 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 30739279 - 30739082
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||         |||| |||    
T  30739279 agaggtgaaatttaccaaacggtgtcatttggatttgtcactccgccgttgtgaaaaaggggaaaactaattgtttatgcgaa--aaggaaatgatcgtt 30739182  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaa 497  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||    
T  30739181 gtgattcttttaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattataaaaattgaagatggtttgatagcatccgatttatgtccagaaaggagaa 30739082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 41908335 - 41908128
Alignment:
Q  296 aaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattg 395  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||  || |||| || ||||||||||         ||||||    
T  41908335 aaagaggtgaaatttatctaacgatatcgtttggatctgtcactcctccgtagtgaaaaaggagaatacgagtg-tttatgcgaa--aaagaaatgattg 41908239  T
Q  396 ttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaa-ga 494  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||  |||||||| ||||||| ||    
T  41908238 ttgtgattctttcaatgaaacagcttttctaattgactgattaagtgattgtacaaattggaggtggtttgaaagcatcagatttatgtccaaaaaatga 41908139  T
Q  495 gaactagagtc 505  Q
    |||| ||||||    
T  41908138 gaaccagagtc 41908128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Original strand, 36438351 - 36438467
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||||||| || |||    
T  36438351 attgttgtgattctttcaatgaaatggtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatagtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaa 36438450  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
      |||||||||| ||||    
T  36438451 gtagaactagagcctag 36438467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 395 - 504
Target Start/End: Original strand, 40737994 - 40738103
Alignment:
Q  395 gttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaag- 493  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||     
T  40737994 gttgtgattctttcaataaaatagctttttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgt-caaaaaagt 40738092  T
Q  494 agaactagagt 504  Q
    |||||||||||    
T  40738093 agaactagagt 40738103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 392 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 9479191 - 9479079
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||    
T  9479191 attgttgtgattctttcaacgaaatagttttttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaa 9479092  T
Q  492 agagaactagagt 504  Q
      |||||||||||    
T  9479091 gtagaactagagt 9479079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 1366118 - 1365957
Alignment:
Q  345 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgat 444  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  1366118 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaataacttttcaaattgactgattaagtcat 1366021  T
Q  445 tatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||| |||| |  |||||||||||| | | ||||||||| || | | |||||||| |||||||    
T  1366020 tataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctag 1365957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Original strand, 42161329 - 42161394
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42161329 cgttagaggcccgtagcatttggaggctcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 42161394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 487
Target Start/End: Original strand, 44876087 - 44876248
Alignment:
Q  319 gtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44876087 gtgtcgtttggatttgtcactccttcattgtggaaaggg--aaaacgaatggtttatgcgga---aaaaaatgattgttgtgattcttttaatgaaatag 44876181  T
Q  419 ctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtaca 487  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || | |||||||||| || |||||||||||||    
T  44876182 ctttctaaattgactgattaaatgattttaaaaatt-ggtgcggtttgatagtat-caatttatgtaca 44876248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 392 - 484
Target Start/End: Original strand, 18895397 - 18895489
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||  ||| |||||||||    
T  18895397 attgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaattgattatacaaattaatagtggtttgataacatcaaatttatgt 18895489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 448
Target Start/End: Original strand, 41852200 - 41852356
Alignment:
Q  292 agtgaaagag--gtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnn 389  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||             
T  41852200 agtgaaagagatgtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctccgttgtggaaaaggggaaaatgaattatttatgcaaa--aaagaaa 41852297  T
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattata 448  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  41852298 tgagtgttgcgattctttcaatgaaataactctttaaattgactgagtaagtgattata 41852356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 42312164 - 42311958
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||         ||| ||||    
T  42312164 agaggtgaaatttacttaacggtgtcgtttagatttgtcgctcatccgttgtggaaagggg-aaaacgaattatttaagcgaa--aaataaatgactgtt 42312068  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaa 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||   |||| ||||| ||  |||  |||||||| || |||||||||    
T  42312067 gtgattcttttaatgaaatagcttttcaaattgactaatcaagtgattatacaaatcgagggtagtttg-taacatcagatttatgtccagaaaagagaa 42311969  T
Q  498 ctagagtctag 508  Q
     ||||||||||    
T  42311968 ttagagtctag 42311958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 467
Target Start/End: Original strand, 3799670 - 3799835
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||| ||    |||||||||||||||||||| |         ||||||||    
T  3799670 agaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggatttg-cgctcctccattgtgggaatttctaaaacgaatggtttatgcgga---aaaaaatgattgtt 3799765  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttga 467  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  3799766 gtgattctttcaatgaaatagcttccaaaattggcttattaaatgattatacaatttggaggtggtttga 3799835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 402 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 25061957 - 25061852
Alignment:
Q  402 ttctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactag 501  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  |  | ||||||||| |||  |||||||| ||||||  ||||||||    
T  25061957 ttctttcaatgaaatagcttttcaaattaactgataaagtgattgtacaaattgagaatagtttgatagcatcagatttatgtccaaaaagaagaactag 25061858  T
Q  502 agtcta 507  Q
    ||||||    
T  25061857 agtcta 25061852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 508
Target Start/End: Original strand, 40841179 - 40841362
Alignment:
Q  324 gtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttc 423  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||         ||| |||||| ||||||| |||  |||| ||||     
T  40841179 gtttggatttgtcacttctccgttgtaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa--aaagaaatgagtgttgtaattcttttaatagaataacttta 40841276  T
Q  424 caaattgactgattaagtgattatacaaattagg-ggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
     ||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||| ||||||  | || ||||||||||    
T  40841277 taaattgattagttaagtaattatacaaattaggaggtggtttgataacatcatatttatgtccaaaaagaataattagagtctag 40841362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 38525031 - 38524975
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcgggtc 666  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38525031 cgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaagccgggtc 38524975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Original strand, 28590052 - 28590126
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtt 372  Q
    ||||||||| || | |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28590052 agaggtgaattttacctaacaatgtcgtttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtt 28590126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 660
Target Start/End: Original strand, 46221920 - 46221970
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggt 660  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46221920 cgtagcatttggaggcccggcctagttgagcaccttgcacaccctcaaggt 46221970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 600 - 657
Target Start/End: Original strand, 8358501 - 8358558
Alignment:
Q  600 gttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 657  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8358501 gttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggatgagcaccttgcacaccctcaa 8358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27432450 - 27432385
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27432450 cgttagaggcccgtagcatttgaaggccgggcctggttgagcaccttacacaccctcaaggtcggg 27432385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 33909913 - 33909864
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33909913 cgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttgcacacccccaagg 33909864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 7366751 - 7366659
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||   |||||||| |||  ||| |||||||||    
T  7366751 attgttgtgattctttcaataaaatagtttttcaaattgacaaattaagtaattattcaaattgatggtggtttaatatcatcaaatttatgt 7366659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4100168 - 4100133
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaatt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4100168 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaatt 4100133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 36796588 - 36796641
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36796588 cgtagtatttggaggc-cggcctggttgagcaccttgcacagcctcaaggtcggg 36796641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Original strand, 12251605 - 12251654
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12251605 cgtagcatttggaggtccggcctgattgagtaccttgcacaccctcaagg 12251654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11672878 - 11672835
Alignment:
Q  164 tcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11672878 tcggttctctttttaaaatagacccctagtaaaataaaacgtaa 11672835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 542
Target Start/End: Original strand, 12251466 - 12251536
Alignment:
Q  470 ggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  12251466 ggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 12251536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 207
Target Start/End: Original strand, 44893781 - 44893847
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  44893781 gccgtctccgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaatagatccttaataaaataaaacgtaa 44893847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 601 - 664
Target Start/End: Original strand, 44894241 - 44894304
Alignment:
Q  601 ttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  44894241 ttagagatccgtagcatttggaggcccgacctggttgagcatcttgtacatcctcaaggtcggg 44894304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 614 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 4099795 - 4099745
Alignment:
Q  614 gcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4099795 gcatttggaggcccagtctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccggg 4099745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 630 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11672427 - 11672393
Alignment:
Q  630 cctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcggg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11672427 cctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccggg 11672393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25610207 - 25610091
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   ||  |||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||         |||||||||||||||||||||||    
T  25610207 ctaacggtgtcgtttggatttgtcacctatccattgtgggaaaggggaaaactattggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcaatg 25610110  T
Q  413 aaatagctttccaaattga 431  Q
    ||||  |||| ||||||||    
T  25610109 aaatgacttttcaaattga 25610091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 273
Target Start/End: Original strand, 3799616 - 3799645
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3799616 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaa 3799645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 616 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 25061745 - 25061696
Alignment:
Q  616 atttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcgggt 665  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25061745 atttggaggtccggcttggttgagcaccttgcactcccccaaggtcgggt 25061696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 651
Target Start/End: Original strand, 18015787 - 18015839
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacac 651  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  18015787 cgttagaggcccgtaacatttggaggcccggcctggttgagcatcttgcacac 18015839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 202
Target Start/End: Original strand, 29730853 - 29730904
Alignment:
Q  148 tgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaa 202  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29730853 tgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccccagtaaaataaaa 29730904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29742094 - 29742043
Alignment:
Q  148 tgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaa 202  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29742094 tgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccccagtaaaataaaa 29742043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 133 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 13474946 - 13474582
Alignment:
Q  133 tcagtgccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcatt 232  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||       |||||| ||||||| |||    
T  13474946 tcagggccgtccccgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcctctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaattttatt 13474850  T
Q  233 nnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatt 332  Q
               ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||          | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13474849 aaaaaaaaa--tcagaataagaagaagttctaaaaatgaaaggaattacaaaaaat-taagtgaaagaggtaaaatttatctaacggtgtcgtttggatt 13474753  T
Q  333 tgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  13474752 tgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaacaacttttcaaattgac 13474654  T
Q  433 tgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagt 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13474653 tgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagt 13474582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 138 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13424175 - 13423813
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||  |||       ||||||||||||||||||         
T  13424175 gccgtccctgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggtctctagtaagataaaaactaatttttttgtgtagttaaatttcattaaaaa 13424079  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13424078 aaa---tcagaatcagaagaacttttaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagaggtgaaatttatcgaacggtgtcgtttagatttgtca 13423982  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13423981 ctcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgattgatt 13423883  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13423882 aagtgattatacaaattaggaatggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 13423813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 142 - 543
Target Start/End: Original strand, 26377533 - 26377925
Alignment:
Q  142 tcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnn 241  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||       |||||| | |||||||||             
T  26377533 tccccgtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataggcccctagtaaaatagaacataatttttttgtgtagctcaatttcattaaaaaaa-- 26377627  T
Q  242 nntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcc 341  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26377628 --tcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaatat--taagtgaaagagatgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcc 26377723  T
Q  342 tctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagt 441  Q
    || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  26377724 tcagttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttctcacattgactgaataagt 26377823  T
Q  442 gattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaa 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||    
T  26377824 gattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaa 26377923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 138 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12661618 - 12661273
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||       |||||| ||||||| |||         
T  12661618 gccgtccctgtgaaatgggaggctcg---gctctctttttaaaataggtctttagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaattttattaaaaa 12661522  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12661521 aaa---tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaat--taagtgaaagatgtgaaatttatctaacagtgtcgtttggatttgtca 12661427  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12661426 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaat-attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactggtt 12661328  T
Q  438 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaa 492  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  12661327 aagtgattatacaaattagaggtggtttgatagaatccgatttatatacaaaaaa 12661273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 244 - 507
Target Start/End: Original strand, 19099168 - 19099429
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19099168 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaagaattaagaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcacttctc 19099266  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtga 443  Q
     ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19099267 ggttgtggaaagtgataaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgattaagtga 19099365  T
Q  444 ttatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19099366 ttatacaaattagggatggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactatagtcta 19099429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 296 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13656369 - 13656123
Alignment:
Q  296 aaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattg 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  13656369 aaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgacactcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaa-tgattg 13656271  T
Q  396 ttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgat---aggatccaatttatgtacaaaaaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||||| |||||||||||||||     
T  13656270 ttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggatggtttttttttaggatccgatttatgtacaaaaag 13656171  T
Q  493 gagaactagagtctagnnnnnnnnctcaaatgtgtactaaagaaagaaaa 542  Q
    ||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  13656170 gagaactagagtctag--aaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaa 13656123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 352 - 508
Target Start/End: Original strand, 36718527 - 36718683
Alignment:
Q  352 aaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaa 451  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||        | || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36718527 aaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaattatggttgtgattctttcaataaaataactttacaaattgactgattaaatgattatacaa 36718626  T
Q  452 attaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36718627 attaggggtggtttgataggatccgattcatgtacaaaaaggagaactagagtctag 36718683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 313 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 43511759 - 43511566
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||| |||    
T  43511759 ctaacggtgtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatatgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttccatg 43511662  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||    
T  43511661 aaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctag 43511566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 26312297 - 26311954
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||         
T  26312297 gccgtccccgtgaaataggaggctcgac---tctcattttaaaataggctaatagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaa 26312201  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26312200 aa----tcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtca 26312106  T
Q  338 ctcc---tctgttgtggaaaa-gggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgact 433  Q
    ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||                         
T  26312105 ctcctgatctgttgtggaaaaggggtaaaacgaatggtttatacgaag-aaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg--------------------- 26312028  T
Q  434 gattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  26312027 -attaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaagaagaactagaatctag 26311954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 313 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29156331 - 29156176
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||||    
T  29156331 ctaacggtatcgtttgaatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcaatg 29156234  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29156233 aaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 29156176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 392 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 138208 - 138092
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  138208 attgttgtgattatttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccgaaaa 138109  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
      |||||||||||||||    
T  138108 gtagaactagagtctag 138092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 313 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 20976126 - 20975933
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||    
T  20976126 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaagacgaaaacgaatagtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcaatg 20976029  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| |||||||    
T  20976028 aaatagcttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccaaatttatgtcaagataagagaactaaagtctag 20975933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 324 - 466
Target Start/End: Original strand, 17513870 - 17514010
Alignment:
Q  324 gtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttc 423  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  17513870 gtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcagtgaaataactttt 17513967  T
Q  424 caaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttg 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17513968 caaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttg 17514010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 40956469 - 40956261
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||         ||||||||    
T  40956469 agaggtgaaatttatctaacggcgtcgtttggatttgtcactcttccattgtgggaaaggggaaaacgaatggtgtatgcaaa--aaagaaatgattgtt 40956372  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaa 497  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| | |   ||||||| | |||  |||||||| || ||| |||||    
T  40956371 gtgattcttttaatgaaatagtttttcaaattaaatgattaagtgattatacaaattggagaatgtttgattgcatcagatttatgtccacaaaggagaa 40956272  T
Q  498 ctagagtctag 508  Q
    |||||||||||    
T  40956271 ctagagtctag 40956261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 401 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 27351404 - 27351297
Alignment:
Q  401 attctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaacta 500  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||| || ||| ||||||||    
T  27351404 attctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtggttatacaaattggaggtggtttgatagcaccaaatttatgttcagaaaggagaacta 27351305  T
Q  501 gagtctag 508  Q
    ||||||||    
T  27351304 gagtctag 27351297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 508
Target Start/End: Original strand, 10591271 - 10591389
Alignment:
Q  390 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaa 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||| || |    
T  10591271 tgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattaactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccatatttatgttcaga 10591370  T
Q  490 aaagagaactagagtctag 508  Q
     | |||||||| |||||||    
T  10591371 taggagaactaaagtctag 10591389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 325 - 484
Target Start/End: Original strand, 42291816 - 42291973
Alignment:
Q  325 tttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttcc 424  Q
    |||||||||||||||  || |  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  42291816 tttggatttgtcacttatccgcggtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttc 42291913  T
Q  425 aaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | | |||||||||    
T  42291914 aaattgactgattaagtgattatacaaattggtggtgatttgatagtaccaaatttatgt 42291973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 313 - 508
Target Start/End: Original strand, 4734505 - 4734698
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||||||    
T  4734505 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggaaatgggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttcaatg 4734602  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||    
T  4734603 aaatagattttcaaattgagtgatcaagggattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctag 4734698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5829524 - 5829371
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   || ||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||| ||||    
T  5829524 ctaacagtgtcgtttggatttgtcacctatccgttgtaggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattcttttaatg 5829427  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5829426 aaatagcttt--aaattgactgattaagtgattatacaaattgaggttggtttgatag 5829371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 335 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 931494 - 931328
Alignment:
Q  335 tcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactg 434  Q
    |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||     |||||||||| ||||||||||    
T  931494 tcactcgtctgttgtgggaaaggagaaaacgaatggtttatgcgaa--aaagaaatgattattgtgattctttc-----aatagctttctaaattgactg 931402  T
Q  435 attaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| ||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||    
T  931401 attaagtgattatacaaattgggtgtgatttaatagcatcaaatttatatatagaaaagagaactatagtctag 931328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 313 - 468
Target Start/End: Original strand, 3349652 - 3349805
Alignment:
Q  313 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatg 412  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||         ||||||||||||||||||| |||    
T  3349652 ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaacggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatg 3349749  T
Q  413 aaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgat 468  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||||||||    
T  3349750 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattattccaattggtagtggtttgat 3349805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37047093 - 37046875
Alignment:
Q  138 gccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnn 237  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||| |||         
T  37047093 gccgtccccgtgaaataggaggttcg---gctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaattttatt-aaaa 37046998  T
Q  238 nnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtca 337  Q
          ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||          | | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37046997 aaaaaatcagaattagaagaagttctaaacatgaaagaaatt-aaaaaaaattaaatgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtca 37046899  T
Q  338 ctcctctgttgtggaaaagggtaa 361  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||    
T  37046898 ctcctcgattgtagaaaatggtaa 37046875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 8398989 - 8398930
Alignment:
Q  448 acaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtcta 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8398989 acaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaactagagtcta 8398930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10033701 - 10033494
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | |||||||| | ||||||| | |||||||||  || || | |||||| |||||||||||||||||||||         | ||| ||    
T  10033701 agaggtgaaatttacctaacggtttcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaa--aaagaaataattatt 10033606  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactg-attaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagaga 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||| |||  |||    
T  10033605 gtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactttaatcagtgattatacaaattgatgggggtttgatagcatcaaatttatgtacagaaagtaga 10033506  T
Q  497 actagagtctag 508  Q
    ||||||||||||    
T  10033505 actagagtctag 10033494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 18873521 - 18873458
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatta 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18873521 attgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattggctgattaagtggttatacaaatta 18873458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 40779346 - 40779140
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| | |||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||         ||||||||    
T  40779346 agaggtgaaatttacctaatgatgtcgtttcgatttgtcactcctccattgtgggaaagg--aaaacgaatggtttatacgaa-aaaagaaatgattgtt 40779250  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaa 497  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| ||||||||| || ||| |||||    
T  40779249 gtgattcct-caatggaatagtttttcaaattgacttattaaacgattatacaaattggggatagtttgataacatcaaatttatgttcagaaaggagaa 40779151  T
Q  498 ctagagtctag 508  Q
    ||||| |||||    
T  40779150 ctagactctag 40779140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 399 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 23069277 - 23069172
Alignment:
Q  399 tgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaac 498  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||| || ||| |||||     
T  23069277 tgattcttgtaatgaaatagctttccaaatcgaatgattaagggattatacaaattgggggtggtttgctagcatcatatttatgttcagaaaggagaat 23069178  T
Q  499 tagagt 504  Q
    ||||||    
T  23069177 tagagt 23069172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 300 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17325998 - 17325793
Alignment:
Q  300 aggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgt 399  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||  || || | |||||| ||| |||||||||||||||||         | ||||||||    
T  17325998 aggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaagcgaatggtttatgcgaa--aaagaaataattgttgt 17325902  T
Q  400 gattctttcaatgaaatag-ctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaac 498  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    ||| |||| |||| ||| ||||||||| || |||   ||||    
T  17325901 gattctttcaatgaaatagttttttcaaattgactgattaagtgattattcaaatcgatggtagtttaatagcatcaaatttatgtccagaaagtggaac 17325802  T
Q  499 tagagtcta 507  Q
    |||||||||    
T  17325801 tagagtcta 17325793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 452
Target Start/End: Original strand, 7390310 - 7390460
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||| || ||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||         | |||||     
T  7390310 agaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaat--gtcacttctatgtcgcaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa--aaagaaataattgtc 7390405  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaa 452  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7390406 gtgattctttcgatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaa 7390460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 33281830 - 33281677
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgtt 397  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||         ||||| ||    
T  33281830 agaggtgaaatttacttaacgatgtcgtttgaatttgtcactcatccgttgtgggaaaaggaaaagcaaatggtttatgcgaa--aaagaaatgattatt 33281733  T
Q  398 gtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaat 453  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33281732 gggattctttcaatgaaataactttttaaattgactaattaagtgattatacaaat 33281677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 508
Target Start/End: Original strand, 8379538 - 8379637
Alignment:
Q  409 aatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||||| || ||| |||||  |||||||||    
T  8379538 aatgaaataactttcgaaattaattgattaagtaattatacaaattaggggtgatttgataacatcatatttatgtccataaatgagaatgagagtctag 8379637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 13423718 - 13423658
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13423718 cgttagaggcccgtaacatttggaggccccgcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 13423658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16515588 - 16515496
Alignment:
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgt 484  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  16515588 attgttgtgattctttcaataaaataatttttcaaattgattgattaagtgattattaaaattgatggtgttttaatagcatcaaatttatgt 16515496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 8398825 - 8398778
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 657  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8398825 cgtagcatttggaggtccggcctgattgagcaccttgcacaccctcaa 8398778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 599 - 658
Target Start/End: Original strand, 26377983 - 26378042
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaag 658  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377983 cgttagagacccgtagaatttgaaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccctcaag 26378042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 380
Target Start/End: Original strand, 8379351 - 8379432
Alignment:
Q  298 agaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaa 380  Q
    |||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8379351 agaggtgaaatttacgcaacggtgtcgtttggatttgtcactcatccgttgtgg-gaaggggaaaacgaatggattatgcgaa 8379432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 599 - 657
Target Start/End: Original strand, 36718774 - 36718832
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 657  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36718774 cgttagagacccgtagcattcggaggcccggcctagttgagcaccttgcacatcctcaa 36718832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 610 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 12661150 - 12661102
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaag 658  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661150 cgtagcatttggaggcccgatctggttgagcaccttgcacaccctcaag 12661102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 454
Target Start/End: Original strand, 37029051 - 37029094
Alignment:
Q  411 tgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 454  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37029051 tgaaatagctttttaaattgattgattaagtgattatacaaatt 37029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27351557 - 27351527
Alignment:
Q  247 gaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaa 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27351557 gaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaa 27351527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 666
Target Start/End: Original strand, 19099533 - 19099589
Alignment:
Q  610 cgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggtcgggtc 666  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  19099533 cgtagtatttggaggcccgacctggttgagcaccttgcactcccacaagggcgggtc 19099589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 147 - 508
Target Start/End: Original strand, 16896 - 17248
Alignment:
Q  147 gtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcattnnnnnnnnnnntca 246  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||| |||||||||||           |||    
T  16896 gtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataggcccctaataaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaataaaa---tca 16989  T
Q  247 gaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgt 346  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  16990 gaatctgaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaat--taagtgaaagaggtgaaatttatccaacggtgtcgtttgaatttgtcacttctttgt 17087  T
Q  347 tgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatta 446  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17088 tgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaagaaaa-tgattgttgtgattctttcaacgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatta 17186  T
Q  447 tacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17187 tacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatatacaaaaatgagaactagagtctag 17248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 133 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 1377 - 1021
Alignment:
Q  133 tcagtgccgtcccagtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaannnnnnngtgtagttaaatttcatt 232  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||    
T  1377 tcagggccgtccccgtgaaataggaggctcg---gctctctttttaaaataagttcctagtaaaataaaacgtaatttttttgtgtagctaaatttcatt 1281  T
Q  233 nnnnnnnnnnntcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatt 332  Q
               ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1280 aaaaaaaa---tcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaaatgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatt 1184  T
Q  333 tgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgac 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  1183 tgtcactcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaag-aaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaat---- 1089  T
Q  433 tgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaagagaactagagtctag 508  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1088 --------tgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgcacaaaaaggagaactagagtctag 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Original strand, 46076 - 46289
Alignment:
Q  292 agtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntg 391  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||        ||    
T  46076 agtgaaacaggtgaaatttagccaacggtgtcgtttggatttgtcactcctct-ttgtgaaaaagagtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaa--tg 46172  T
Q  392 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaa 491  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  46173 attgttgtgattatttcaatgaaatagacttccaaattgactgattaagtgattatccaaattatgggtggtttgataggatcagatatatgtataaaaa 46272  T
Q  492 agagaactagagtctag 508  Q
     ||||||||||||||||    
T  46273 tgagaactagagtctag 46289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 207
Target Start/End: Original strand, 45937 - 45995
Alignment:
Q  146 agtgaaataggaggctcgtcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  45937 agtgaaataggaggctcgac---tctctttttaaaataagcccctagtaaaataaaatgtaa 45995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 431
Target Start/End: Original strand, 22659 - 22844
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattnnnnnnnnnnttagtgaaagaggtgaaattgatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  22659 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaat-taagtgaaagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactccta 22757  T
Q  344 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagnnnnnnnntgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattga 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  22758 tgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaag-aaaaaaataattattgtgattctttcaatgaaatagtttttcatattga 22844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 659
Target Start/End: Original strand, 22971 - 23031
Alignment:
Q  599 cgttagagacacgtagcatttggaggatcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 659  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22971 cgttagagacccgtatcatttggaggtccggcctggttgagcaccttacacaccctgaagg 23031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 207
Target Start/End: Original strand, 22588 - 22625
Alignment:
Q  170 ctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaacgtaa 207  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22588 ctctttttaaaataagcccatagtaaaataaaacgtaa 22625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 396 - 470
Target Start/End: Original strand, 8399 - 8473
Alignment:
Q  396 ttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatag 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8399 ttgtgattctttcaatgaaatagttttcgaaattgactgattaattgattatacaaattatgggtggtttgatag 8473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 99127 - 99098
Alignment:
Q  244 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  99127 tcagaatcagaagaacttctaaacatgaaa 99098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 99200 - 99167
Alignment:
Q  169 tctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  99200 tctctttttaaaataggccctcagtaaaataaaa 99167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University