View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13540_low_6 (Length: 388)

Name: NF13540_low_6
Description: NF13540
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13540_low_6
NF13540_low_6
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (20-386)||(28991105-28991471)
chr1 (21-386)||(3431401-3431766)
chr1 (20-386)||(13452070-13452438)
chr1 (20-386)||(21496881-21497247)
chr1 (16-386)||(32135103-32135474)
chr1 (21-385)||(13477078-13477442)
chr1 (20-386)||(31541197-31541564)
chr1 (21-386)||(31549766-31550132)
chr1 (21-386)||(41744502-41744868)
chr1 (21-386)||(13803853-13804221)
chr1 (20-386)||(2385210-2385572)
chr1 (21-386)||(28459816-28460189)
chr1 (21-322)||(23952221-23952522)
chr1 (16-386)||(43456082-43456454)
chr1 (20-329)||(32608685-32608997)
chr1 (21-386)||(23355413-23355780)
chr1 (20-386)||(31553397-31553764)
chr1 (20-329)||(22479724-22480035)
chr1 (21-386)||(31562531-31562897)
chr1 (21-385)||(20502155-20502516)
chr1 (30-385)||(8240873-8241229)
chr1 (20-385)||(21054919-21055281)
chr1 (27-385)||(22472595-22472955)
chr1 (27-329)||(34336617-34336924)
chr1 (27-329)||(16135213-16135517)
chr1 (21-386)||(51055115-51055477)
chr1 (27-385)||(3350531-3350889)
chr1 (27-329)||(12464050-12464354)
chr1 (21-257)||(35097378-35097615)
chr1 (21-329)||(38123427-38123734)
chr1 (20-329)||(52101236-52101543)
chr1 (21-215)||(13461138-13461332)
chr1 (21-230)||(21244871-21245080)
chr1 (14-214)||(46776794-46776994)
chr1 (15-215)||(27311778-27311980)
chr1 (27-181)||(8513942-8514097)
chr1 (30-153)||(22495867-22495990)
chr1 (31-148)||(18780115-18780232)
chr1 (30-333)||(36848508-36848813)
chr1 (20-190)||(25337129-25337295)
chr1 (34-384)||(4282520-4282866)
chr1 (34-169)||(2248397-2248532)
chr1 (175-329)||(18702551-18702704)
chr1 (353-386)||(11950359-11950392)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (21-386)||(36248747-36249112)
chr8 (21-386)||(26871212-26871577)
chr8 (20-386)||(17529071-17529436)
chr8 (20-386)||(25584850-25585216)
chr8 (20-386)||(17662266-17662633)
chr8 (20-386)||(30939526-30939893)
chr8 (21-386)||(4837362-4837728)
chr8 (18-386)||(17975677-17976046)
chr8 (20-386)||(17681395-17681762)
chr8 (20-386)||(22103423-22103791)
chr8 (20-386)||(39844051-39844419)
chr8 (21-386)||(39836010-39836377)
chr8 (21-386)||(16775275-16775641)
chr8 (20-386)||(16760838-16761205)
chr8 (20-329)||(15832007-15832316)
chr8 (21-334)||(4842807-4843121)
chr8 (30-386)||(36252305-36252660)
chr8 (21-386)||(19850817-19851186)
chr8 (21-386)||(19856853-19857222)
chr8 (21-386)||(4583605-4583972)
chr8 (21-385)||(36576543-36576905)
chr8 (21-386)||(23922855-23923219)
chr8 (21-385)||(25719058-25719418)
chr8 (21-264)||(25796693-25796937)
chr8 (20-329)||(14204590-14204902)
chr8 (21-329)||(14219231-14219542)
chr8 (27-329)||(16190395-16190700)
chr8 (27-329)||(22418206-22418512)
chr8 (21-373)||(6582673-6583028)
chr8 (30-375)||(26912535-26912875)
chr8 (19-329)||(31000603-31000916)
chr8 (27-385)||(23092747-23093105)
chr8 (20-329)||(31207494-31207807)
chr8 (21-254)||(1388092-1388326)
chr8 (21-314)||(17129388-17129686)
chr8 (21-329)||(22366723-22367038)
chr8 (21-230)||(14335743-14335948)
chr8 (21-230)||(23600859-23601065)
chr8 (299-386)||(22023032-22023115)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (21-386)||(10640385-10640750)
chr4 (20-386)||(8101540-8101906)
chr4 (21-386)||(8092736-8093101)
chr4 (21-386)||(773188-773553)
chr4 (21-386)||(12425216-12425582)
chr4 (20-383)||(20865658-20866021)
chr4 (20-386)||(27341511-27341877)
chr4 (21-386)||(52297728-52298094)
chr4 (21-386)||(12998570-12998935)
chr4 (20-386)||(1889458-1889825)
chr4 (21-352)||(4522214-4522545)
chr4 (21-386)||(1875344-1875710)
chr4 (20-386)||(21530104-21530472)
chr4 (19-329)||(26210378-26210688)
chr4 (27-329)||(26219147-26219448)
chr4 (21-386)||(4747401-4747766)
chr4 (21-330)||(26033961-26034271)
chr4 (21-385)||(18010081-18010442)
chr4 (21-386)||(55584160-55584522)
chr4 (27-385)||(19644868-19645227)
chr4 (20-385)||(10786659-10787025)
chr4 (27-329)||(14718502-14718807)
chr4 (21-385)||(21398818-21399184)
chr4 (21-326)||(25652449-25652753)
chr4 (27-385)||(34842697-34843057)
chr4 (27-329)||(19759880-19760186)
chr4 (27-329)||(19774636-19774942)
chr4 (21-320)||(21810865-21811167)
chr4 (27-329)||(25247160-25247466)
chr4 (27-301)||(14736787-14737064)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (21-386)||(30822981-30823346)
chr6 (21-386)||(19826377-19826746)
chr6 (21-386)||(15389214-15389581)
chr6 (21-386)||(20530498-20530865)
chr6 (21-386)||(5486923-5487288)
chr6 (20-386)||(27537410-27537777)
chr6 (21-386)||(27551619-27551985)
chr6 (21-386)||(5996654-5997019)
chr6 (21-386)||(25993578-25993943)
chr6 (21-386)||(14475583-14475951)
chr6 (30-386)||(25713743-25714103)
chr6 (30-386)||(35090147-35090504)
chr6 (30-386)||(25552411-25552768)
chr6 (19-386)||(33300120-33300487)
chr6 (19-386)||(23927585-23927954)
chr6 (21-385)||(16589015-16589377)
chr6 (21-385)||(16606003-16606365)
chr6 (20-385)||(16635413-16635776)
chr6 (21-385)||(16645370-16645732)
chr6 (21-386)||(16302770-16303133)
chr6 (20-386)||(27057290-27057658)
chr6 (21-386)||(27047047-27047414)
chr6 (21-386)||(21708370-21708732)
chr6 (27-385)||(24485249-24485608)
chr6 (20-329)||(18219937-18220247)
chr6 (21-329)||(18204939-18205248)
chr6 (16-385)||(27960273-27960642)
chr6 (21-385)||(12451321-12451684)
chr6 (20-385)||(24920475-24920836)
chr6 (21-386)||(13492028-13492392)
chr6 (21-329)||(30995327-30995636)
chr6 (27-385)||(25653983-25654342)
chr6 (20-385)||(28304227-28304592)
chr6 (20-329)||(18111981-18112290)
chr6 (21-329)||(18126526-18126834)
chr6 (27-329)||(21358419-21358725)
chr6 (27-329)||(23962401-23962707)
chr6 (27-329)||(23982511-23982817)
chr6 (21-254)||(13827922-13828156)
chr6 (20-230)||(28267592-28267802)
chr6 (20-230)||(28346341-28346551)
chr6 (20-209)||(25699770-25699959)
chr6 (21-215)||(8719657-8719848)
chr6 (21-238)||(16097689-16097908)
chr6 (21-199)||(5008126-5008304)
chr6 (21-230)||(11063829-11064034)
chr6 (218-386)||(13827755-13827924)
chr6 (27-153)||(18587362-18587488)
chr6 (140-327)||(28266570-28266758)
chr6 (140-327)||(28345319-28345507)
chr6 (104-209)||(25693129-25693234)
chr6 (266-386)||(25693008-25693131)
chr6 (266-386)||(25699649-25699772)
chr6 (20-122)||(335285-335388)
chr6 (20-93)||(15141656-15141729)
chr6 (21-91)||(18842945-18843016)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (20-386)||(1726618-1726986)
chr5 (19-386)||(31423760-31424127)
chr5 (21-386)||(31412855-31413219)
chr5 (20-386)||(28845185-28845553)
chr5 (21-386)||(28853795-28854162)
chr5 (21-386)||(43596506-43596873)
chr5 (21-386)||(43629300-43629667)
chr5 (21-386)||(41093548-41093917)
chr5 (21-386)||(19225864-19226226)
chr5 (20-386)||(24963753-24964119)
chr5 (21-386)||(24955294-24955659)
chr5 (18-386)||(33835127-33835494)
chr5 (20-386)||(20396265-20396614)
chr5 (20-386)||(33843828-33844193)
chr5 (33-329)||(23348554-23348851)
chr5 (20-386)||(20377746-20378112)
chr5 (21-386)||(20386535-20386900)
chr5 (20-385)||(26088335-26088700)
chr5 (20-385)||(26078356-26078721)
chr5 (20-329)||(3491533-3491844)
chr5 (21-329)||(3476764-3477074)
chr5 (20-329)||(11812422-11812731)
chr5 (30-329)||(21856806-21857108)
chr5 (21-329)||(11802347-11802655)
chr5 (20-329)||(36458672-36458982)
chr5 (20-329)||(12170128-12170437)
chr5 (20-329)||(12179557-12179866)
chr5 (20-385)||(17642458-17642825)
chr5 (20-386)||(20370577-20370911)
chr5 (21-385)||(23039088-23039454)
chr5 (21-243)||(21931544-21931765)
chr5 (21-329)||(27064117-27064428)
chr5 (27-329)||(23827751-23828057)
chr5 (35-385)||(21850650-21851001)
chr5 (27-329)||(23637375-23637681)
chr5 (27-329)||(23835209-23835515)
chr5 (27-326)||(31548049-31548352)
chr5 (21-329)||(21986165-21986477)
chr5 (27-329)||(23984788-23985096)
chr5 (20-329)||(21994812-21995125)
chr5 (27-385)||(26177063-26177422)
chr5 (35-329)||(21858564-21858861)
chr5 (20-329)||(27220140-27220451)
chr5 (20-329)||(27223147-27223458)
chr5 (20-329)||(27232618-27232929)
chr5 (21-230)||(29190273-29190478)
chr5 (21-230)||(344880-345085)
chr5 (20-230)||(359518-359724)
chr5 (27-355)||(23762285-23762615)
chr5 (306-386)||(21931466-21931546)
chr5 (140-188)||(19071785-19071833)
chr5 (146-210)||(27586827-27586891)
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (21-386)||(27338859-27339224)
chr3 (21-386)||(50826548-50826913)
chr3 (20-386)||(4435618-4435985)
chr3 (21-386)||(4456409-4456775)
chr3 (21-386)||(30062629-30062994)
chr3 (21-386)||(3711786-3712152)
chr3 (21-386)||(41016584-41016950)
chr3 (19-386)||(18949439-18949807)
chr3 (21-386)||(50848940-50849307)
chr3 (21-386)||(27550643-27551010)
chr3 (21-382)||(17360272-17360633)
chr3 (21-382)||(17364914-17365275)
chr3 (18-386)||(15711212-15711581)
chr3 (20-386)||(8204027-8204395)
chr3 (21-386)||(14425821-14426188)
chr3 (19-386)||(39707036-39707405)
chr3 (20-386)||(2256617-2256985)
chr3 (20-386)||(15694609-15694976)
chr3 (30-386)||(13507248-13507606)
chr3 (21-386)||(51922060-51922426)
chr3 (21-386)||(8153128-8153495)
chr3 (21-386)||(8196217-8196584)
chr3 (21-386)||(17935267-17935628)
chr3 (20-386)||(10720699-10721066)
chr3 (73-386)||(15696922-15697236)
chr3 (27-386)||(6293521-6293879)
chr3 (21-386)||(2214919-2215282)
chr3 (21-385)||(27978778-27979139)
chr3 (20-386)||(6563794-6564159)
chr3 (21-386)||(6577463-6577827)
chr3 (21-386)||(18351223-18351585)
chr3 (21-326)||(17630358-17630664)
chr3 (31-386)||(43468083-43468434)
chr3 (21-386)||(1004109-1004475)
chr3 (19-329)||(13847667-13847977)
chr3 (20-329)||(5144264-5144573)
chr3 (21-386)||(16290884-16291251)
chr3 (20-329)||(11918196-11918508)
chr3 (20-329)||(11932766-11933078)
chr3 (20-329)||(22951943-22952253)
chr3 (21-385)||(17562687-17563053)
chr3 (21-329)||(22965917-22966226)
chr3 (20-329)||(25264847-25265156)
chr3 (21-329)||(25274341-25274649)
chr3 (27-329)||(1480127-1480432)
chr3 (27-329)||(13274947-13275253)
chr3 (152-386)||(18900462-18900697)
chr3 (30-385)||(15675079-15675432)
chr3 (21-329)||(31278725-31279037)
chr3 (27-329)||(7063626-7063931)
chr3 (27-329)||(7096473-7096778)
chr3 (30-385)||(15683621-15683974)
chr3 (27-329)||(4503361-4503666)
chr3 (27-329)||(17616479-17616783)
chr3 (20-230)||(10713425-10713635)
chr3 (106-386)||(18041097-18041373)
chr3 (20-303)||(24215983-24216267)
chr3 (34-385)||(21185428-21185777)
chr3 (21-230)||(29730411-29730622)
chr3 (30-303)||(27957186-27957455)
chr3 (27-265)||(12468968-12469210)
chr3 (20-190)||(18881927-18882097)
chr3 (213-386)||(18890340-18890514)
chr3 (20-330)||(27880426-27880734)
chr3 (21-230)||(13555545-13555750)
chr3 (197-386)||(16814558-16814746)
chr3 (21-168)||(14520712-14520859)
chr3 (48-330)||(27884821-27885101)
chr3 (272-386)||(41007805-41007919)
chr3 (67-330)||(9567318-9567581)
chr3 (21-124)||(18900359-18900462)
chr3 (208-329)||(30102160-30102286)
chr3 (21-110)||(22094837-22094926)
chr3 (310-386)||(27957882-27957958)
chr3 (261-386)||(27958025-27958144)
chr3 (331-382)||(9183894-9183945)
chr3 (20-63)||(15697231-15697274)
chr3 (21-80)||(18041374-18041433)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (21-386)||(4393-4759)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (21-386)||(18302861-18303227)
chr7 (20-386)||(13832749-13833114)
chr7 (21-386)||(13840779-13841143)
chr7 (21-386)||(4661689-4662049)
chr7 (16-386)||(24185922-24186294)
chr7 (20-386)||(1900832-1901197)
chr7 (21-386)||(1886732-1887096)
chr7 (19-386)||(10449329-10449695)
chr7 (20-386)||(5208096-5208460)
chr7 (21-330)||(4940091-4940401)
chr7 (21-386)||(5198980-5199343)
chr7 (16-386)||(17739178-17739547)
chr7 (21-385)||(16545452-16545813)
chr7 (21-385)||(16619849-16620210)
chr7 (27-385)||(16909643-16909997)
chr7 (21-329)||(29096783-29097091)
chr7 (20-329)||(29082024-29082333)
chr7 (21-385)||(40679961-40680327)
chr7 (21-386)||(17211285-17211648)
chr7 (21-329)||(17514148-17514456)
chr7 (21-329)||(17538758-17539066)
chr7 (20-329)||(27975209-27975518)
chr7 (21-329)||(27965757-27966065)
chr7 (21-329)||(16889549-16889858)
chr7 (27-332)||(29023465-29023773)
chr7 (20-329)||(15185593-15185904)
chr7 (20-329)||(16120491-16120805)
chr7 (20-329)||(16147231-16147545)
chr7 (27-329)||(16227804-16228111)
chr7 (27-329)||(16244682-16244989)
chr7 (20-329)||(15200213-15200524)
chr7 (20-329)||(44075013-44075322)
chr7 (20-329)||(568163-568473)
chr7 (21-329)||(558254-558563)
chr7 (27-329)||(27435300-27435608)
chr7 (21-298)||(19383910-19384187)
chr7 (27-329)||(27444330-27444638)
chr7 (20-329)||(2549000-2549311)
chr7 (21-329)||(2562886-2563196)
chr7 (20-230)||(13491879-13492086)
chr7 (31-375)||(43600597-43600939)
chr7 (21-212)||(13478068-13478255)
chr7 (248-386)||(10442212-10442350)
chr7 (21-329)||(36476574-36476884)
chr7 (105-332)||(29031903-29032133)
chr7 (27-212)||(38255594-38255780)
chr7 (29-215)||(48498519-48498706)
chr7 (27-181)||(38263200-38263355)
chr7 (21-224)||(43139053-43139255)
chr7 (100-321)||(4323863-4324083)
chr7 (319-385)||(33533462-33533527)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (20-386)||(15951497-15951867)
chr2 (20-386)||(34541819-34542186)
chr2 (21-386)||(34527846-34528212)
chr2 (21-386)||(35039948-35040313)
chr2 (21-386)||(15942988-15943356)
chr2 (20-386)||(35139865-35140232)
chr2 (20-386)||(35148206-35148573)
chr2 (20-386)||(26731632-26732000)
chr2 (20-386)||(42572999-42573367)
chr2 (21-386)||(42564376-42564743)
chr2 (21-386)||(17684935-17685301)
chr2 (21-386)||(41232315-41232681)
chr2 (21-386)||(6855957-6856323)
chr2 (21-386)||(25495842-25496207)
chr2 (21-386)||(44375045-44375413)
chr2 (21-386)||(44390626-44390994)
chr2 (24-386)||(42247477-42247841)
chr2 (21-386)||(20364529-20364895)
chr2 (20-386)||(26717499-26717867)
chr2 (20-386)||(24293436-24293803)
chr2 (16-386)||(26896523-26896895)
chr2 (30-386)||(24286868-24287224)
chr2 (21-329)||(30524517-30524827)
chr2 (21-385)||(20920728-20921089)
chr2 (20-386)||(16274668-16275033)
chr2 (21-386)||(16283844-16284208)
chr2 (21-385)||(28481239-28481600)
chr2 (21-329)||(15600680-15600991)
chr2 (21-373)||(21151341-21151689)
chr2 (27-385)||(33306561-33306919)
chr2 (21-329)||(35304648-35304954)
chr2 (21-329)||(3754885-3755193)
chr2 (21-329)||(34437039-34437347)
chr2 (21-329)||(29855291-29855600)
chr2 (16-329)||(2652981-2653294)
chr2 (20-329)||(3764935-3765244)
chr2 (21-386)||(34068674-34069030)
chr2 (21-329)||(10681324-10681635)
chr2 (27-329)||(22187281-22187588)
chr2 (20-329)||(21858556-21858869)
chr2 (21-329)||(21850122-21850434)
chr2 (21-329)||(42245497-42245808)
chr2 (27-329)||(27680929-27681237)
chr2 (21-385)||(31354710-31355077)
chr2 (20-385)||(34685593-34685960)
chr2 (20-329)||(34708069-34708381)
chr2 (20-329)||(42386068-42386378)
chr2 (20-329)||(42400952-42401262)
chr2 (30-329)||(11622050-11622352)
chr2 (21-211)||(38153999-38154189)
chr2 (20-188)||(25493307-25493475)
chr2 (21-230)||(30683105-30683313)
chr2 (21-230)||(19655563-19655769)
chr2 (20-322)||(21111315-21111614)
chr2 (21-230)||(21320618-21320825)
chr2 (21-230)||(14630457-14630662)
chr2 (21-154)||(38611415-38611545)
chr2 (290-386)||(20623596-20623692)
chr2 (88-187)||(39842078-39842174)
chr2 (237-385)||(17095634-17095777)
chr2 (32-94)||(23283970-23284032)
chr2 (301-385)||(17069151-17069234)
chr2 (301-385)||(17075144-17075227)
[»] scaffold1804 (1 HSPs)
scaffold1804 (21-378)||(1-359)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (30-386)||(109390-109746)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (21-386)||(10178-10545)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (20-379)||(29929-30287)
scaffold0056 (20-124)||(11481-11585)
[»] scaffold0015 (3 HSPs)
scaffold0015 (21-386)||(188564-188931)
scaffold0015 (20-329)||(194811-195119)
scaffold0015 (21-329)||(159154-159462)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (21-353)||(4297-4628)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (21-386)||(9802-10165)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (20-329)||(80337-80648)
scaffold0044 (21-329)||(63938-64246)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (20-329)||(21450-21760)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (21-329)||(4588-4899)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (21-385)||(63227-63590)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (20-329)||(14925-15237)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (21-382)||(10424-10782)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (21-329)||(145283-145591)
scaffold0023 (20-317)||(136320-136617)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (82-385)||(1-302)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (27-329)||(83481-83786)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (30-329)||(46461-46759)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (20-255)||(29568-29803)
[»] scaffold0455 (1 HSPs)
scaffold0455 (21-385)||(3570-3936)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (21-230)||(21929-22139)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (21-291)||(22707-22980)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (163-386)||(19804-20028)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (27-204)||(15379-15557)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (21-185)||(172567-172731)
[»] scaffold1199 (1 HSPs)
scaffold1199 (20-251)||(2209-2439)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (21-194)||(9796-9966)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (21-181)||(16395-16555)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (21-194)||(29775-29945)
scaffold0077 (20-154)||(32641-32772)
scaffold0077 (201-386)||(32437-32622)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (149-329)||(421-603)
scaffold0031 (12-98)||(337-423)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (21-167)||(13635-13781)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (47-230)||(63307-63488)
scaffold0007 (341-385)||(19404-19448)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (27-238)||(7741-7954)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (30-212)||(55726-55909)
[»] scaffold0945 (1 HSPs)
scaffold0945 (27-206)||(2-183)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (27-226)||(1-202)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (261-386)||(38672-38797)
[»] scaffold1481 (1 HSPs)
scaffold1481 (131-329)||(1550-1751)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (21-130)||(8423-8533)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (21-94)||(1-74)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (21-94)||(1-74)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (20-83)||(9947-10010)
[»] scaffold0545 (1 HSPs)
scaffold0545 (340-386)||(8011-8057)
[»] scaffold2020 (1 HSPs)
scaffold2020 (140-210)||(701-771)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (140-210)||(164724-164794)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 28991105 - 28991471
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28991105 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtaaatctttgaactctcgatctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 28991204  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28991205 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 28991304  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28991305 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 28991404  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28991405 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 28991471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 3431401 - 3431766
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431401 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 3431500  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3431501 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 3431600  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3431601 tcttgtgctaaattcattggttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 3431700  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431701 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 3431766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13452438 - 13452070
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13452438 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 13452339  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13452338 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 13452239  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13452238 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagcatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 13452139  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13452138 gttttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 13452070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 21496881 - 21497247
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21496881 ctgtgctcctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtca-tctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaa 21496979  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21496980 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaatcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 21497079  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21497080 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 21497179  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21497180 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 21497247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Original strand, 32135103 - 32135474
Alignment:
Q  16 aatactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 115  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135103 aatattgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 32135202  T
Q  116 aaaaa-ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacct 214  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135203 aaaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacct 32135302  T
Q  215 aacttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttta 314  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32135303 aatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatatttttggttattttta 32135402  T
Q  315 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135403 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 32135474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13477442 - 13477078
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13477442 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgattagaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaa 13477343  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13477342 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgtagggaaggtgttagcaccctaagcatctacggtatcccgtaggaacctcttacctaaatta 13477243  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13477242 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 13477143  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13477142 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 13477078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31541564 - 31541197
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31541564 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 31541465  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31541464 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 31541365  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31541364 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 31541265  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31541264 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 31541197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31550132 - 31549766
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31550132 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 31550033  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31550032 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 31549933  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31549932 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 31549833  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31549832 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 31549766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 41744502 - 41744868
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744502 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 41744601  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41744602 tccttgtcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaaacgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 41744701  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41744702 tcctgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 41744801  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744802 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 41744868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 13803853 - 13804221
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13803853 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13803952  T
Q  121 --ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13803953 aaccctcatcgagactttggatccgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaat 13804052  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13804053 tatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattactacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaaatatgttttttgttatttttattt 13804152  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13804153 gatttggaaggataaaaatcctatgcttacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 13804221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 2385572 - 2385210
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2385572 ctgtgctcatgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 2385473  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  2385472 accctta---agactttggattcgggggttggttacacgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttatctaaatt 2385376  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2385375 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 2385276  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2385275 atttggaaggattaaa--cctttgcctacatacccttaaaggaaagggatcaaaaccaatgtagttca 2385210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28460189 - 28459816
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28460189 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattgattgaattgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 28460090  T
Q  121 ccctcatcgagactttggatt------cgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacct 214  Q
    |||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28460089 cccttatcgagactttggatttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaaacgtctacggtattccgcaggaacctcttacct 28459990  T
Q  215 aacttatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttt 312  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28459989 aaattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattgttacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttt 28459890  T
Q  313 tatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28459889 tatttgatttggaaggataaaaatcctatgtctacatacccttaaagaaaagggatcaaaatcaatgtagttca 28459816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23952522 - 23952221
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23952522 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaatcgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggatgggaaaaaatgagtaaaaa 23952423  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23952422 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 23952323  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23952322 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 23952223  T
Q  321 tt 322  Q
    ||    
T  23952222 tt 23952221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 43456454 - 43456082
Alignment:
Q  16 aatactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 115  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43456454 aatagtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 43456355  T
Q  116 aaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttaccta 215  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  43456354 aaaaacccttatcaagactttggatttgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaggcgtctatggtatttcataggaacctcttaccta 43456255  T
Q  216 acttatcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacct--aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttt 312  Q
    | ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43456254 aattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatatttttggttatttt 43456155  T
Q  313 tatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43456154 tatttgattttgaaggat-taactcctttgcctatatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 43456082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32608997 - 32608685
Alignment:
Q  20 ctgtgctcc-cgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggga-aaaaatgagtaa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32608997 ctgtgctcctcgattttcggatatcaaatcattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggacaaaaatgagtaa 32608898  T
Q  118 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32608897 aaacccttattgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaat 32608798  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttg-ttatttttatt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32608797 ttatcttgtgctacattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttatttttatt 32608698  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  32608697 tgatttggaagga 32608685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 23355413 - 23355780
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23355413 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgataatctttgaactctcgatttttattcgtggaaagggaaaaaatgagtaaaaa 23355512  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  23355513 ccctta---agactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatgatatttcatatgaacctcttacctaattta 23355609  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacct-aaaaatcta-aat--gaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttat 315  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23355610 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctactatgcgaaagaatgggcggagaagaagtatgtttttggttatttttat 23355709  T
Q  316 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23355710 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 23355780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31553764 - 31553397
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagta-aa 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31553764 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 31553665  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||      
T  31553664 aacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctaga 31553565  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31553564 ttatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 31553466  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31553465 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 31553397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22480035 - 22479724
Alignment:
Q  20 ctgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22480035 ctgtgctccctgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctttatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 22479936  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22479935 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtactagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaa-t 22479837  T
Q  219 tatcttgtgct-acattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22479836 tatcttgtgctaaaattatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 22479737  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  22479736 tgatttggaagga 22479724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31562897 - 31562531
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagta-aaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31562897 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 31562798  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  31562797 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagat 31562698  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31562697 tatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 31562599  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31562598 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 31562531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20502516 - 20502155
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20502516 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 20502417  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  20502416 ccctta---agactctgaattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctagattg 20502320  T
Q  221 tcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20502319 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtggaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 20502220  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||| ||   |||| | ||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  20502219 atttggaaggacaag--tcctctacctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 20502155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 385
Target Start/End: Original strand, 8240873 - 8241229
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatc 128  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |      
T  8240873 gattttcgagtatcaagccattgattggttttgaaccttcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaaaccctta-- 8240970  T
Q  129 gagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgc 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  8240971 gagactttggattcaggggttgattacgcgaagggaaggtgatagcaccctaagcatctacggtactccgtaggaatctcttgcctaatttatcttgtgc 8241070  T
Q  229 tacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttg-ttatttttatttgatttggaa 326  Q
    || ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8241071 taaattaatttgcttatttgaaaattattgcctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtaagttttttggttatttttatttgatttggaa 8241170  T
Q  327 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8241171 ggataaaaatcctttgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 8241229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21055281 - 21054919
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  21055281 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagtgaaaaagttagtaaaa 21055182  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||    
T  21055181 accctt---gagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcactctaagcgtctacggtactctgtaggaacctcttgcctaattt 21055085  T
Q  220 atcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21055084 atcctgtgctaaattaattcgcttatttgaaaattattgcctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 21054985  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||| |||  ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054984 atttggaatgat-taacgccttttcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 21054919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22472955 - 22472595
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22472955 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 22472856  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  22472855 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 22472756  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22472755 tgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgattt 22472656  T
Q  323 ggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  22472655 ggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 22472595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 34336617 - 34336924
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34336617 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 34336716  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  34336717 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 34336816  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    ||||| |||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34336817 tgctaaattcgtttggcttacttgaaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 34336916  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  34336917 tggaagga 34336924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16135517 - 16135213
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16135517 cccgattctcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaaggaaaaaatgagtaaaaaccctta 16135418  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  16135417 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 16135318  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16135317 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 16135219  T
Q  324 gaagga 329  Q
    ||||||    
T  16135218 gaagga 16135213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 51055115 - 51055477
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  51055115 tgtgctcgtgattttcgaatatcaaaccattaattgattcgaatcgtcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagggaaaacgtgagtaaaaa 51055214  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||    |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||    
T  51055215 ccctt---gagactttggattttggggttaattacgcgaagggaagatgctagcaccctaaacgtctacggtactccataggaacctcttgcctaattta 51055311  T
Q  221 tcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51055312 tcttgtgctaaattaatttgcttatttaaaaattattgcctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 51055411  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||  || | || || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  51055412 tttggaaggat-taacttctttggctacatacccttaaaagaaagggatcaaaaccaatgtagttca 51055477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Original strand, 3350531 - 3350889
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3350531 cccgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 3350630  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| | ||||| ||||| ||  ||||||||    
T  3350631 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaagaaccgcttacttagattatcttg 3350730  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3350731 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttgtttttatttgatttg 3350830  T
Q  324 gaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  |||||||||||||||| |||||||    
T  3350831 gaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaagggatcaaaaccaacgtagttc 3350889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 12464050 - 12464354
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12464050 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 12464149  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  12464150 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 12464249  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12464250 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaataagtatg-ttttggttatttttatttgatttg 12464348  T
Q  324 gaagga 329  Q
    ||||||    
T  12464349 gaagga 12464354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Original strand, 35097378 - 35097615
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35097378 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtatgaagggaaaaaatgagtaaaaa 35097477  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35097478 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 35097577  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattatta 257  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  35097578 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattatta 35097615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 38123427 - 38123734
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38123427 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 38123526  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  38123527 ccctta-aaaaaaattggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 38123625  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38123626 tcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 38123724  T
Q  320 tttggaagga 329  Q
    ||||||||||    
T  38123725 tttggaagga 38123734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 52101543 - 52101236
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52101543 ctgtgctcgtgattttcgggtatcaagccattgattggttttgaaccttcaatctttgaactctcgatttttattcgtggga-gggaaaaaatgagtaaa 52101445  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||| | |   |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |    
T  52101444 aaccttta---agacct-ggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatgatattccataggaacctcttacctagat 52101349  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52101348 tatcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatgtttttggttatttttatt 52101249  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  52101248 tgatttggaagga 52101236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13461332 - 13461138
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461332 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13461233  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttaccta 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461232 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttaccta 13461138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 21244871 - 21245080
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21244871 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 21244970  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21244971 cccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 21245070  T
Q  221 tcttgtgcta 230  Q
    ||||||||||    
T  21245071 tcttgtgcta 21245080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 46776794 - 46776994
Alignment:
Q  14 tgaatactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatga 113  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46776794 tgaatattgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaacctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatga 46776893  T
Q  114 gtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacc 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46776894 gtaaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacc 46776993  T
Q  214 t 214  Q
    |    
T  46776994 t 46776994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Original strand, 27311778 - 27311980
Alignment:
Q  15 gaatactgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatga 113  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27311778 gaatagtgtgctccccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggcagggaaaaaatga 27311877  T
Q  114 gtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttac 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| |||||    
T  27311878 gtaaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttac 27311977  T
Q  213 cta 215  Q
    |||    
T  27311978 cta 27311980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8514097 - 8513942
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8514097 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 8513998  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||||||||||    
T  8513997 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaa 8513942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22495990 - 22495867
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22495990 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 22495891  T
Q  130 agactttggattcgggggttggtt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22495890 agactttggattcgggggttggtt 22495867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18780232 - 18780115
Alignment:
Q  31 attttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcga 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18780232 attttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcga 18780133  T
Q  131 gactttggattcgggggt 148  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18780132 gactttggattcgggggt 18780115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 333
Target Start/End: Original strand, 36848508 - 36848813
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa-ccctcatc 128  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |      
T  36848508 gattttcgaatatcaaaccattaattgatttaaatcttcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaaatccctta-a 36848606  T
Q  129 gagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||   | || |||||   | ||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||| |||||    
T  36848607 gagactttggattcgggggttggttttgaatagggaaggtttgacgccccctacatgactatggtactccgtagaaaccttttgcctaacttattttgtg 36848706  T
Q  228 ct-acattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaa 326  Q
    || | ||   ||  |||  ||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36848707 ctaaaatattttatttatatgaaaattattgcctaagagtctaggtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttgtttttatttgatttggaa 36848806  T
Q  327 ggataaa 333  Q
     ||||||    
T  36848807 tgataaa 36848813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25337295 - 25337129
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    ||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25337295 ctgtgctcgtgagtttcggatgtcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaa 25337198  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacg 190  Q
    |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25337197 aaccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacg 25337129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Original strand, 4282520 - 4282866
Alignment:
Q  34 ttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgaga 132  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||  | |    
T  4282520 ttcgggtatcaaaccattaattggttttgaaccttcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagagaaaaagtgagtaaaa-cccttataaa-a 4282617  T
Q  133 ctttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt-atcttgtgcta 230  Q
    |||||||| |||||||||||| ||    | ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||    
T  4282618 ctttggatccgggggttggttccgaatcgtgaaggtgttaagcaccctaaacgactacggtattccgtaggaacctcctacctaactttaatttgtgcta 4282717  T
Q  231 cattcattgcttactt--gaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagg 328  Q
     ||| ||||| || ||  |||||| |||   || |||  ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4282718 aattaattgcctattttcgaaaataattgtttacaaaattaagtgaa-gaatggagggagaagaaacatgttttttgttgtttttatttgatttggaagg 4282816  T
Q  329 ataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagtt 384  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||    
T  4282817 at--aaatcatttgcctacataccct----aaaaagggatcaaaaccattgtagtt 4282866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2248532 - 2248397
Alignment:
Q  34 ttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgaga 132  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  2248532 ttcgggtatcaaaccattaattggttttgaaccttcaatctttgaactcccaacttttattcgtgagaagggaaaaagtgagtaaaaacccttat-gaga 2248434  T
Q  133 ctttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  2248433 ctttggattcgggggttggtttcgaaaagggaaggtg 2248397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18702704 - 18702551
Alignment:
Q  175 accctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatg 273  Q
    ||||||| || || ||||| |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||  ||  ||| | | ||||||| ||||| |||||   ||||| ||    
T  18702704 accctaaacgacttcggtactccgaagtaaccgcttacctaaattatcttgtgctaagttacttgttcatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtg 18702606  T
Q  274 aaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  18702605 aaagaatggagggagaaaaagtatgt-ttttggtattttttattgatttggaagga 18702551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11950392 - 11950359
Alignment:
Q  353 cttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11950392 cttaaagaaaaggtatcaaaaccaatgtagttca 11950359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 36249112 - 36248747
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36249112 tgtgctcgtgattttcgaatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 36249013  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36249012 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 36248913  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36248912 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 36248813  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36248812 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttgaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 36248747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 26871212 - 26871577
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871212 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 26871311  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26871312 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 26871411  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26871412 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 26871511  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871512 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 26871577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17529436 - 17529071
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529436 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 17529337  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17529336 cccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 17529237  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17529236 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgg-gggagaagaagtatatttttggttatttttatttga 17529138  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529137 tttggaaggataaaaatcctatgcctgcatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 17529071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 25584850 - 25585216
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25584850 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 25584949  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25584950 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccataagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 25585049  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25585050 accttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagagtggagggagaagaagtatatttttggttatttttatttga 25585149  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25585150 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 25585216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 17662266 - 17662633
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662266 ctgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaactgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 17662365  T
Q  120 a-ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17662366 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaatt 17662465  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17662466 tatcttgtgctaaattcattggttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 17662565  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662566 atttggaaggataaaaaacctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 17662633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 30939893 - 30939526
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30939893 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 30939794  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30939793 actcttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 30939694  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30939693 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 30939594  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30939593 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 30939526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 4837362 - 4837728
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837362 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 4837461  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  4837462 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 4837561  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4837562 tcttgtgctaatttcattgcttatttgaaaattatcacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 4837661  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837662 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttacagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 4837728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17976046 - 17975677
Alignment:
Q  18 tactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagta 116  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17976046 tactgtgctcgtgattttcggataacaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagta 17975947  T
Q  117 aaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaa 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17975946 aaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaa 17975847  T
Q  217 cttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17975846 tttatcttgtgctaaattcattgcttatctgaaagttattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 17975747  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17975746 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaatagggatcaaaaccaatgtagttca 17975677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 17681395 - 17681762
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17681395 ctgtgctcgtgattttcgaatatcaagccattaactgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 17681494  T
Q  120 a-ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17681495 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaatt 17681594  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17681595 tatcttgtgctaaattcattggttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 17681694  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17681695 atttggaatgataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 17681762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 22103423 - 22103791
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22103423 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaa 22103522  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||    
T  22103523 acccttatcgagaccttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacatagatt 22103622  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22103623 atcttgtgctagattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttagttttattt 22103722  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22103723 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 22103791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 39844051 - 39844419
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39844051 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 39844150  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39844151 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattctgtaggaacctcttacctaattt 39844250  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    | ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39844251 accttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 39844350  T
Q  319 atttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39844351 atttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 39844419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 39836010 - 39836377
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39836010 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 39836109  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39836110 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaaacatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 39836209  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39836210 ccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 39836309  T
Q  320 tttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39836310 tttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 39836377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16775641 - 16775275
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775641 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16775542  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16775541 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 16775442  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatt-attacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16775441 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttga 16775342  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16775341 tttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttca 16775275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16761205 - 16760838
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16761205 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 16761106  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16761105 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 16761006  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatt-attacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16761005 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 16760906  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16760905 atttggaaggatacaaatcccatgcctatatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttca 16760838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15832316 - 15832007
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15832316 ctgtgctcgcgattttcggttatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 15832217  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15832216 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 15832117  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15832116 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatgtttttggttttttttatttga 15832017  T
Q  320 tttggaagga 329  Q
    ||||||||||    
T  15832016 tttggaagga 15832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 334
Target Start/End: Original strand, 4842807 - 4843121
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4842807 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 4842906  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  4842907 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccttaggaacctcttacctaattta 4843006  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4843007 tcttgtgctaatttcattgcttatttgaaaattatcacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 4843106  T
Q  320 tttggaaggataaaa 334  Q
    |||||||||||||||    
T  4843107 tttggaaggataaaa 4843121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 36252305 - 36252660
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  36252305 gattttcggatattaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcatgagaagggaaaaaatgagtaaaaaccct--tc- 36252401  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36252402 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgct 36252501  T
Q  230 acattca-ttgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaa 326  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36252502 aaattcatttgcttacttgaaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagtagtatgcttttggttatttttatttgatttggaa 36252601  T
Q  327 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||   | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252602 ggat-tgactcccttgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 36252660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19851186 - 19850817
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19851186 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaacactcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 19851087  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||| ||| || || ||||| |||  ||||||| ||||||||  |    
T  19851086 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccttaaacgacttcggtactccaaaggaaccgcttacctagat 19850987  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19850986 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagagagaagaagtatgtttttggttatttttatt 19850887  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19850886 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 19850817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19857222 - 19856853
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857222 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaacactcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 19857123  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||| ||| || || ||||| |||  ||||||| ||||||||  |    
T  19857122 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccttaaacgacttcggtactccaaaggaaccgcttacctagat 19857023  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19857022 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagagagaagaagtatgtttttggttatttttatt 19856923  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19856922 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 19856853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4583972 - 4583605
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtca---atctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 117  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583972 tgtgctcgtgatttccggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcatcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 4583873  T
Q  118 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4583872 aaacccttatcgagactttggattcgggg-ttggttacacgaagagaaggtgctagcaccctaagtgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaa 4583774  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4583773 ttatcctgtgctaaattgatttgcttacatgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatt 4583674  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583673 tgatttggaaggat-tgactcccctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 4583605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Original strand, 36576543 - 36576905
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36576543 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 36576642  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  36576643 cccttatcgagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttgcctaattta 36576742  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaa-attattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36576743 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaagattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 36576841  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||    
T  36576842 tttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccaacgtagttc 36576905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 23922855 - 23923219
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23922855 tgtgctcatgattttcagatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagagaaaaaatgagtaaaaa 23922954  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    | || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23922955 ctctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtactagcatcctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttgcctaattta 23923051  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaa-atctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23923052 tcttgtgctaaattaatttgcttatttgaaaattattgcctaaaaggtctaagtgaaagaatggagggaggagaaatatgtttttggttatttttatttg 23923151  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23923152 atttggaaggataaaaattctttgcctacataccgttaaaagaaagggatcaaaaccaatgtagttca 23923219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25719418 - 25719058
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25719418 tgtgctcgtgattttcgaatatcaaaccattaattgatttgaatcatcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 25719319  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25719318 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccttaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 25719222  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25719221 tcttgtgctaaattcatttgcttactcgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 25719123  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||| | |||||||    
T  25719122 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaaggaatcaaaaccgacgtagttc 25719058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25796937 - 25796693
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25796937 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 25796838  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  25796837 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtaatccgtaggaacctcttacctaattt 25796738  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaa 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25796737 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa 25796693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14204902 - 14204590
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14204902 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttgttcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 14204803  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  14204802 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 14204703  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14204702 tattttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 14204603  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  14204602 tgatttggaagga 14204590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14219542 - 14219231
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14219542 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttgttcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 14219443  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||    
T  14219442 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 14219343  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14219342 attttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 14219243  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  14219242 gatttggaagga 14219231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 16190395 - 16190700
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16190395 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatcttcgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 16190494  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16190495 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatcttg 16190594  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16190595 tgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgattt 16190693  T
Q  323 ggaagga 329  Q
    |||||||    
T  16190694 ggaagga 16190700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22418512 - 22418206
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22418512 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaggggaaaaatgagtaaaaaccctta 22418413  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  22418412 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 22418313  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22418312 tgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgattt 22418213  T
Q  323 ggaagga 329  Q
    |||||||    
T  22418212 ggaagga 22418206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 373
Target Start/End: Original strand, 6582673 - 6583028
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6582673 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 6582772  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||| | ||||| ||||||||  |    
T  6582773 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactttggtactccgaatgaaccgcttacctagat 6582872  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttat 315  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6582873 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 6582972  T
Q  316 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaa 373  Q
    |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | |||||||||||||    
T  6582973 ttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaa 6583028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 26912535 - 26912875
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  26912535 gattttcggatatcaactcattaattgatttgaatattcaatctttgaactctctacttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaaacccttat-g 26912633  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26912634 agattttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctatcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttgcctaa-ttatcttgtgct 26912732  T
Q  230 acatt-cattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagg 328  Q
    | |||   ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26912733 aaattattttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctaggtgaaagaatgg-gggagaagaagtatg-tttttgttgtttttatttgatttggaagg 26912830  T
Q  329 ataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaacc 375  Q
    ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26912831 at--aaatcctttgcctacatactcttaaagaaaagggatcaaaacc 26912875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 329
Target Start/End: Original strand, 31000603 - 31000916
Alignment:
Q  19 actgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31000603 actgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaa 31000702  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| |||||||||     
T  31000703 aacccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaa 31000802  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttta 314  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31000803 ttatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 31000901  T
Q  315 tttgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||||    
T  31000902 tttgatttggaagga 31000916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23093105 - 23092747
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  23093105 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatttttgaactctcaatttttattcgtgggaaaggaaaaaatgagt-aaaaccctta 23093007  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  23093006 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttaggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 23092907  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23092906 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 23092807  T
Q  324 gaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  23092806 gaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 23092747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 31207494 - 31207807
Alignment:
Q  20 ctgtgctcc-cgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31207494 ctgtgctcctcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaa 31207593  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||      
T  31207594 aacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaga 31207693  T
Q  218 ttatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttat 315  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31207694 ttatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggggaagaagtatgtttttggttatttttat 31207793  T
Q  316 ttgatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||||    
T  31207794 ttgatttggaagga 31207807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 1388092 - 1388326
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1388092 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 1388191  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1388192 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 1388291  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaatta 254  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  1388292 ccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaatta 1388326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17129686 - 17129388
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17129686 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgagggaagggaaaaaatgagtaaaa 17129587  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||   | |||||||| | |||||||||| |  || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  17129586 acccttatcgagactttggattcggggcttggtttcgaatatggaaggtgttaagcaccctaaacaacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 17129487  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttta 314  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17129486 tatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 17129388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 22366723 - 22367038
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt-aaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22366723 tgtgctccctgattttcggatgtcaacccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaa 22366822  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||      
T  22366823 aacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaga 22366922  T
Q  218 ttatcttgtgctacattca--ttgcttacttg-aaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttt 313  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22366923 ttatcttgtgctaaattcattttgcttactcgaaaaattattacctaaaaaatctaagtaaaagaatggagagagaagaattatgtttttggttattttt 22367022  T
Q  314 atttgatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||||||    
T  22367023 atttgatttggaagga 22367038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 14335743 - 14335948
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14335743 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 14335840  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  14335841 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaactt 14335937  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||    
T  14335938 atcttgtgcta 14335948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 23600859 - 23601065
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  23600859 tgtgctcgtgattttcggatgtcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttttttgtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 23600957  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||    
T  23600958 accctta---agactttggtttcgtgggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaattt 23601054  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||    
T  23601055 atcttgtgcta 23601065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 386
Target Start/End: Original strand, 22023032 - 22023115
Alignment:
Q  299 ttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || | |||||||||| ||  || ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22023032 ttttttgttgtttttatt-gatttggaaggatagaattctt-tgcctacatatcc--aaggaaaatggatcaaaatcaatgtagttca 22023115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10640750 - 10640385
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10640750 tgtgctcgtgattttcggatatccaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 10640651  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10640650 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 10640551  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10640550 tcttgtgctacattcattgcttatttgaaaattattacttaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 10640451  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10640450 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 10640385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 8101540 - 8101906
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8101540 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 8101639  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8101640 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 8101739  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8101740 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 8101839  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8101840 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 8101906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 8092736 - 8093101
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8092736 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 8092835  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8092836 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 8092935  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8092936 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 8093035  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8093036 ttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 8093101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 773553 - 773188
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  773553 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 773454  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  773453 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccataggaacctcttacctaaatta 773354  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  773353 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 773254  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  773253 ttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 773188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 12425216 - 12425582
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12425216 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcatgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 12425315  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12425316 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 12425415  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12425416 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaaaagtatgtttttggttatttttatttga 12425515  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12425516 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 12425582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 383
Target Start/End: Original strand, 20865658 - 20866021
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20865658 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 20865757  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20865758 acccttatcgaaactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 20865857  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20865858 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaaaagtatgtttttggttatttttatttga 20865957  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagt 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20865958 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaatcaatgtagt 20866021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 27341511 - 27341877
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341511 ctgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtccatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 27341610  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  27341611 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 27341710  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27341711 atcttgtgctaaattcatttgcttac-tgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 27341809  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341810 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 27341877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 52298094 - 52297728
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52298094 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaaa 52297995  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  52297994 cccttatcgtgactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 52297895  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52297894 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 52297795  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52297794 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccttttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 52297728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12998935 - 12998570
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12998935 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgcactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 12998836  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12998835 ccctcatcaagactttggaatcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctactgtattccgtaggaacctcttacctaattta 12998736  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12998735 tcttgtgctaaattcattgcttatttaaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggataagaagtatgtttttggttatttttatttgat 12998636  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12998635 ttggaaggataaaattcttttgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 12998570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 1889458 - 1889825
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1889458 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 1889557  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1889558 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 1889657  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatt-attacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1889658 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 1889757  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1889758 atttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttca 1889825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Original strand, 4522214 - 4522545
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522214 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 4522313  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4522314 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 4522413  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4522414 tcttgtgctacattcattggttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 4522513  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacc 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522514 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacc 4522545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 1875344 - 1875710
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1875344 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 1875443  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1875444 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 1875543  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatt-attacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1875544 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttga 1875643  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1875644 tttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttca 1875710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 21530104 - 21530472
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21530104 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaa 21530203  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctctta-cctaact 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21530204 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttaccctaaat 21530303  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatt-attacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21530304 tatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttattt 21530403  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21530404 gatttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttca 21530472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 329
Target Start/End: Original strand, 26210378 - 26210688
Alignment:
Q  19 actgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26210378 actgtgctccccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaa 26210477  T
Q  118 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||      
T  26210478 aaaccc-cttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctaga 26210576  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26210577 ttatcttgtgctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 26210676  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  26210677 gatttggaagga 26210688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 26219147 - 26219448
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26219147 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccc-ct 26219245  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  26219246 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagattatcttgt 26219345  T
Q  227 gctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaa 326  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26219346 gctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 26219445  T
Q  327 gga 329  Q
    |||    
T  26219446 gga 26219448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 4747401 - 4747766
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4747401 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagagaaaaaatgagtaaaaa 4747500  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  4747501 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtactagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttgcctaaatta 4747600  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||  ||  ||| ||| |||  ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4747601 tcttgtgctaagttacttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggaggagaagtatgtttttggttatttttatttg 4747699  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4747700 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 4747766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 330
Target Start/End: Original strand, 26033961 - 26034271
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26033961 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaaggaaaaaatgagtaaaaa 26034060  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  26034061 cccttgtcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatta 26034160  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26034161 tcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagaatgtttttggttatttttatttga 26034260  T
Q  320 tttggaaggat 330  Q
    |||||||||||    
T  26034261 tttggaaggat 26034271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18010442 - 18010081
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18010442 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18010343  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  18010342 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 18010246  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18010245 tcttgtgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatataaatgaaagaatgaagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 18010146  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  18010145 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 18010081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 55584160 - 55584522
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55584160 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaaatatcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 55584259  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  55584260 ccctta---agactctggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 55584356  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttactt-gaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55584357 tcttgtgctaaattcatttgcttacttggaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaggaagtatgtttttggttatttttatttg 55584456  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||| |||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55584457 atttcgaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 55584522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Original strand, 19644868 - 19645227
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19644868 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 19644967  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  19644968 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 19645067  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19645068 tgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgattt 19645166  T
Q  323 ggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  19645167 ggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 19645227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 10787025 - 10786659
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10787025 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcttgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 10786926  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| |    
T  10786925 acccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgagtagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaat 10786826  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttat 315  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10786825 tatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 10786727  T
Q  316 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  10786726 ttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 10786659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 14718502 - 14718807
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  14718502 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaacactta 14718601  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  14718602 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 14718701  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14718702 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 14718801  T
Q  324 gaagga 329  Q
    ||||||    
T  14718802 gaagga 14718807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Original strand, 21398818 - 21399184
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21398818 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaa 21398917  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  21398918 acccttatcgagactttggattcgggggttgatttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactttggtactccgaaggaaccgcttacctagat 21399017  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21399018 tatcttgtgctagattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatgtttttggttatttttatt 21399117  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  21399118 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 21399184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 326
Target Start/End: Original strand, 25652449 - 25652753
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25652449 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttaatcgttaatctttgaactttcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 25652548  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  25652549 ccctca---agactttggattcgggagctggttacgcgaagggaaagtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtagaaacctcttacctagatta 25652645  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25652646 tcttgtgctaaattcatttgggtacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagagaaaagaaatatgtttttgattatttttatttg 25652745  T
Q  319 atttggaa 326  Q
    ||||||||    
T  25652746 atttggaa 25652753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34843057 - 34842697
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34843057 cccgattttcggatattaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctaaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 34842958  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||| ||  ||||||||    
T  34842957 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacatagattatcttg 34842858  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34842857 tgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaaggagtatgtttttggttatttttatttgattt 34842758  T
Q  323 ggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  34842757 ggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 34842697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19760186 - 19759880
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19760186 cccgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 19760087  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  19760086 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatctt 19759987  T
Q  225 gtgctacattca--ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19759986 gtgctaaattcaattggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 19759888  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  19759887 tggaagga 19759880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19774942 - 19774636
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19774942 cccgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 19774843  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  19774842 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatctt 19774743  T
Q  225 gtgctacattca--ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19774742 gtgctaaattcaattggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 19774644  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  19774643 tggaagga 19774636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 320
Target Start/End: Original strand, 21810865 - 21811167
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21810865 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 21810964  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||    
T  21810965 cccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaatt 21811064  T
Q  220 atcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21811065 atcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 21811163  T
Q  317 tgat 320  Q
    ||||    
T  21811164 tgat 21811167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 25247160 - 25247466
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt-aaaaaccctc 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  25247160 cccgattttcggatattaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaggg-aaaaatgagtaaaaaaccctt 25247258  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  25247259 attgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 25247358  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25247359 gtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatt 25247458  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  25247459 tggaagga 25247466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 301
Target Start/End: Original strand, 14736787 - 14737064
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14736787 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 14736886  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  14736887 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 14736986  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttt 301  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736987 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaagaagtatgttt 14737064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 30822981 - 30823346
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30822981 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 30823080  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30823081 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 30823180  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30823181 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 30823280  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30823281 ttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 30823346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 19826377 - 19826746
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19826377 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 19826476  T
Q  121 c----cctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaa 216  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19826477 aaaaacctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaa 19826576  T
Q  217 cttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  19826577 cttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggaaaagaagtatgtttttggtcatttttatt 19826676  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19826677 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 19826746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 15389214 - 15389581
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatg-agtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15389214 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatggagtaaaa 15389313  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15389314 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 15389413  T
Q  220 atcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15389414 atcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 15389513  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15389514 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtaattca 15389581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 20530498 - 20530865
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa- 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20530498 tgtgctcttgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 20530597  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20530598 accctcatcgagactttggattcgggggttggtcacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 20530697  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaa-atctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20530698 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 20530797  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20530798 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 20530865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 5486923 - 5487288
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5486923 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaataagtaaaaa 5487022  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5487023 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaaacgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 5487122  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5487123 tcttgtgctaaaatcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaaatgaaagaatggagggggaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 5487222  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5487223 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccactgtagttca 5487288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27537777 - 27537410
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27537777 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 27537678  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27537677 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 27537578  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27537577 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 27537478  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27537477 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 27537410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27551985 - 27551619
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551985 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27551886  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27551885 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 27551786  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27551785 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 27551686  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551685 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 27551619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5997019 - 5996654
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5997019 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 5996920  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5996919 cccttgtcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 5996820  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5996819 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaaattttacctaaaaatctaagtgaaagaatgaggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 5996720  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5996719 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 5996654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25993943 - 25993578
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25993943 tgtgctcttgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgagaagggaaaaa-tgagtaaaaa 25993845  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25993844 cccttgtcgagactttggattcgggggttgtttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 25993745  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttg-ttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25993744 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaattgggggagaagaagtatgttttttgattatttttatttga 25993645  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25993644 tttggaaggataaaaatcctctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 25993578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14475951 - 14475583
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475951 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatctgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 14475852  T
Q  121 -ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14475851 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 14475752  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatt-attacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14475751 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 14475652  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14475651 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaataaaatggatcaaaaccaatgtagttca 14475583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25714103 - 25713743
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714103 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaagtctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 25714004  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25714003 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctttggtattccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgct 25713904  T
Q  230 acattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttt----tttgttatttttatttgatttgga 325  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || |||||||||||||||||    
T  25713903 aaattcattgcttatctgaaagttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttttttttttttatttgatttgga 25713804  T
Q  326 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25713803 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaatcaatgtagttca 25713743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 35090147 - 35090504
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35090147 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 35090246  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35090247 agactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgct 35090346  T
Q  230 acattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagg 328  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35090347 aaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg 35090446  T
Q  329 ataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35090447 ataaaaattttatgcctacatatctttaaaaaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 35090504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25552768 - 25552411
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25552768 gattttcggatatcaaactattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 25552669  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25552668 agactttggattcgggggttgtttacgtgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccttaggaacctcttacctaatttatcttgtgct 25552569  T
Q  230 acattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttg-ttatttttatttgatttggaagg 328  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25552568 aaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaattgggggagaagaagtatgttttttgattatttttatttgatttggaagg 25552469  T
Q  329 ataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25552468 ataaaaatgctctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 25552411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 33300487 - 33300120
Alignment:
Q  19 actgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33300487 actgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 33300388  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |    
T  33300387 aacccttgtcgagactttggattcgggggttagttacgcgaagggaaggtactagcaccctaagcgtctatggtattccatatgaacctcttacctaatt 33300288  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33300287 tatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgg-gggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 33300189  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33300188 gatttggaaggataaaaatctcatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 33300120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23927954 - 23927585
Alignment:
Q  19 actgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927954 actgtgctcgtgattttcggatatcaaatcattaattgatttgaatcgttaatttttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 23927855  T
Q  119 aa-ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  23927854 aaacccttatcgggactttggattcgggggttggttacgcgaagagaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaat 23927755  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatta-ttacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23927754 ttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 23927655  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927654 tgatttggaaggatacaaatcccatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 23927585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16589377 - 16589015
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16589377 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16589278  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  16589277 cccttttcgagactttgaattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtatcccgtaggaacctcttacctagatta 16589178  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16589177 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 16589078  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  16589077 ttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 16589015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Original strand, 16606003 - 16606365
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16606003 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16606102  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  16606103 cccttttcgagactttgaattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtatcccgtaggaacctcttacctagatta 16606202  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16606203 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 16606302  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  16606303 ttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 16606365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16635776 - 16635413
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635776 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 16635677  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16635676 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 16635577  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  16635576 attttgtgctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttttattga 16635477  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  16635476 tttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 16635413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16645732 - 16645370
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16645732 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16645633  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16645632 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 16645533  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  16645532 ttttgtgctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttttattgat 16645433  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  16645432 ttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 16645370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 16302770 - 16303133
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16302770 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgagaagggaaaaaatgagtaaaaa 16302869  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||  |||    
T  16302870 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccttaagcgtctttggtattccataggaacctcttatctagatta 16302966  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16302967 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 16303066  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||   | |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16303067 atttggaaggatttgactcccctacctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 16303133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 27057290 - 27057658
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaa 118  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27057290 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaaatgagtaaa 27057389  T
Q  119 aa-ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||      
T  27057390 aaacccttttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttaga 27057489  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||||  ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27057490 ttatcttgtgctaagttacttgtttacttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 27057588  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27057589 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 27057658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 27047047 - 27047414
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27047047 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 27047146  T
Q  120 a-ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |    
T  27047147 aacccttttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttagat 27047246  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||||  ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27047247 tatcttgtgctaagttacttgtttacttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 27047345  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047346 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 27047414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 21708370 - 21708732
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21708370 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgagaagggaaaaaatgagtaaaaa 21708469  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||    
T  21708470 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgcagggaaggtgctagaaccctaagcgtctatggtattccatagaaacctcttacctagatta 21708566  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21708567 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaacaagtatgtttttggttacttttatttg 21708666  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21708667 atttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 21708732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Original strand, 24485249 - 24485608
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24485249 cccgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 24485348  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24485349 tcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagattatcttgt 24485448  T
Q  227 gctacattcatt--gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    |||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24485449 gctaaaatcattttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 24485548  T
Q  324 gaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||  ||  |||| ||||||| | |||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  24485549 gaaggacgaa--tcctctgcctacgtgcccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 24485608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 18219937 - 18220247
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18219937 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 18220036  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  18220037 accct-ttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 18220135  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18220136 attttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaagctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 18220235  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  18220236 gatttggaagga 18220247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 18204939 - 18205248
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18204939 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18205038  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  18205039 ccct-ttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 18205137  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18205138 ttttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaagctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 18205237  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  18205238 atttggaagga 18205248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27960642 - 27960273
Alignment:
Q  16 aatactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 115  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27960642 aataatgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagt 27960543  T
Q  116 aaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttaccta 215  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27960542 aaaa-cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 27960444  T
Q  216 acttatcttgtgctacattca--ttgcttactt--gaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattt 311  Q
    | ||||||| ||||| |||||  | ||||||||   ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27960443 aattatcttatgctaaattcacttggcttactttgaaaaattatttcct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattt 27960345  T
Q  312 ttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  27960344 ttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 27960273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Original strand, 12451321 - 12451684
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12451321 tgtgctcgtgattttcagatatcaaatcattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctaaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 12451420  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12451421 ccctta---agactctgaattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 12451517  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacct--aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    | |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||  ||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12451518 ttttgtgctaaatcaatttgcttatttgaaaattattacctagaaatatttaagtgagagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 12451617  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12451618 gatttggaaggat-tgactcctttgcctacatacccttaaagaaaatggatcaaaaccaatgtagttc 12451684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24920836 - 24920475
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24920836 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 24920737  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||    
T  24920736 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagatt 24920640  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24920639 atcttgtgttaaatttatttgcttacttgaaaaattattacttaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtcatttttattt 24920540  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  24920539 gatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 24920475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13492392 - 13492028
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13492392 tgtgctcgtgatttttgaatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcacgatttttattcatgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 13492293  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  13492292 accctta---agactttggattcgggggttggttacgggaagggaatgtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttgcctaattt 13492196  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgtta-tttttattt 317  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  13492195 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtgtttggttattttttattt 13492096  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13492095 gatttggaaggat-tgactcctttgcctacatacccttaaatgaaagggatcaaaaccaatgtagttca 13492028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 30995327 - 30995636
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30995327 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 30995426  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  30995427 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 30995526  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaa--ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||   |  ||| ||| |||||||   |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30995527 tcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaatatattgcct-aaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 30995625  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  30995626 atttggaagga 30995636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25654342 - 25653983
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25654342 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcatcaatctttgaactttcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 25654243  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  25654242 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggtaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaacctcttacctagattatcttg 25654143  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25654142 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatttaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 25654043  T
Q  324 gaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  25654042 gaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 25653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28304592 - 28304227
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28304592 ctgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 28304493  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28304492 acccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagaatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 28304393  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt-ttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||| | |  ||| | | |||  ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28304392 atcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttcttgttatttttatt 28304294  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||   | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  28304293 tgatttggaag--aacaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 28304227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18112290 - 18111981
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18112290 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcatcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 18112191  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  18112190 accct-ttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 18112092  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    || |||||||| | |  ||| ||| |||  ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18112091 attttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 18111993  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  18111992 gatttggaagga 18111981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18126834 - 18126526
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126834 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcatcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18126735  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  18126734 ccct-ttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 18126636  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    | |||||||| | |  ||| ||| |||  ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18126635 ttttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 18126537  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  18126536 atttggaagga 18126526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 21358419 - 21358725
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatt-tttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21358419 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaattctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 21358518  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  21358519 atcgagactttggattcgggtgttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 21358618  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21358619 gtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 21358717  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  21358718 tggaagga 21358725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 23962401 - 23962707
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatt-tttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23962401 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaattctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 23962500  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  23962501 atcgagactttggattcgggtgttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 23962600  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23962601 gtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 23962699  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  23962700 tggaagga 23962707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 23982511 - 23982817
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatt-tttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23982511 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaattctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 23982610  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  23982611 atcgagactttggattcgggggttggtttcaaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 23982710  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23982711 gtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 23982809  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  23982810 tggaagga 23982817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13828156 - 13827922
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13828156 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13828057  T
Q  121 -ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  13828056 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 13827957  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatta 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13827956 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaatta 13827922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 28267592 - 28267802
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28267592 ctgtgctcgtgattttcggatgtcaaaccattaattgattcgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 28267691  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  28267692 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattt 28267791  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||    
T  28267792 atcttgtgcta 28267802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 28346341 - 28346551
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28346341 ctgtgctcgtgattttcggatgtcaaaccattaattgattcgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 28346440  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  28346441 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattt 28346540  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||    
T  28346541 atcttgtgcta 28346551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25699959 - 25699770
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  25699959 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatctttaatctttgaactctcgatttttatttttgggaagagaaaaaatgagtaaaa 25699860  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25699859 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaaactct 25699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 8719657 - 8719848
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8719657 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 8719756  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttaccta 215  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||    
T  8719757 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctatgttatcccataggaacctctttccta 8719848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16097908 - 16097689
Alignment:
Q  21 tgtgctcc-cgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097908 tgtgctcctcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 16097809  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  16097808 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 16097709  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt 238  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  16097708 tatcttgtgctaaattcatt 16097689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5008304 - 5008126
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5008304 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatatttattcataagaagggaaaaaatgagtaaaaa 5008205  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5008204 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgt 5008126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11064034 - 11063829
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11064034 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 11063937  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||    
T  11063936 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaattt 11063840  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||    
T  11063839 atcttgtgcta 11063829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13827924 - 13827755
Alignment:
Q  218 ttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatt-attacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13827924 ttancttgtgctaaattcattgcttatttgaacatttattacctaaaaatctaagtgaaagaatgacgggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 13827825  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13827824 tgatttggaagtataaaaatctcatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 13827755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18587488 - 18587362
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18587488 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 18587389  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggtt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18587388 tcgagactttggattcgggggttggtt 18587362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 140 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28266758 - 28266570
Alignment:
Q  140 ttcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcattg 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |  |||    
T  28266758 ttcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaatacttg 28266659  T
Q  240 cttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaag 327  Q
     | | |||  ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28266658 ttcatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttctgttatttttatttgatttggaag 28266570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 140 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28345507 - 28345319
Alignment:
Q  140 ttcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcattg 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |  |||    
T  28345507 ttcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaatacttg 28345408  T
Q  240 cttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaag 327  Q
     | | |||  ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28345407 ttcatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttctgttatttttatttgatttggaag 28345319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25693234 - 25693129
Alignment:
Q  104 gaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtagga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25693234 gaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtagga 25693135  T
Q  204 acctct 209  Q
    | ||||    
T  25693134 aactct 25693129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 266 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25693131 - 25693008
Alignment:
Q  266 tctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttt---atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25693131 tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttttttttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 25693032  T
Q  363 agggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  25693031 agggatcaaaatcaatgtagttca 25693008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 266 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25699772 - 25699649
Alignment:
Q  266 tctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttt---atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25699772 tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttttttttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 25699673  T
Q  363 agggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  25699672 agggatcaaaatcaatgtagttca 25699649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Original strand, 335285 - 335388
Alignment:
Q  20 ctgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  335285 ctgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtggaaagggaaaaaatgagtaaa 335384  T
Q  119 aacc 122  Q
    ||||    
T  335385 aacc 335388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15141729 - 15141656
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttatt 93  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15141729 ctgtgctcgcgattttcagatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttatt 15141656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18843016 - 18842945
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgattttta 91  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18843016 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattggtttaaatcgtcaatctttgaactctcaattttta 18842945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 1726618 - 1726986
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1726618 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaactgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 1726717  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1726718 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 1726817  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct--aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1726818 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 1726917  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1726918 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 1726986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31424127 - 31423760
Alignment:
Q  19 actgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424127 actgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 31424028  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31424027 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttatctaatt 31423928  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31423927 tatcttgtgtttaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaaatgaaagaatggagggagaaaaagtgtgtttttggttatttttatttg 31423828  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423827 atttggaaggataaaaatcctatgcctgcatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 31423760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31413219 - 31412855
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31413219 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 31413120  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31413119 cccttatcgagactttggattcgggggtcggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 31413020  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattaccta-aaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31413019 tcttgtgctaagttcattgcttatttgaaaattattacctagaaaatctaagtgaaagaatg--gggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 31412922  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31412921 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 31412855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28845553 - 28845185
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28845553 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 28845454  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28845453 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 28845354  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    | ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28845353 accttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 28845254  T
Q  319 atttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28845253 atttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 28845185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28854162 - 28853795
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28854162 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 28854063  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28854062 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 28853963  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28853962 ccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 28853863  T
Q  320 tttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853862 tttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 28853795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 43596506 - 43596873
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43596506 tgtgctcgtgattttcggatatcaaatcattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 43596605  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  43596606 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatta 43596705  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43596706 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttgtttatttttatttg 43596805  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43596806 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 43596873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 43629300 - 43629667
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43629300 tgtgctcgtgattttcggatatcaaatcattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 43629399  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  43629400 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatta 43629499  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43629500 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttgtttatttttatttg 43629599  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43629600 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 43629667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 41093548 - 41093917
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa--tgagtaaa 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41093548 tgtgctcctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaaatgagtaaa 41093647  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41093648 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaaggggaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaatt 41093747  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41093748 tatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaaattattacctaaaagtataattgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 41093847  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41093848 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 41093917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19226226 - 19225864
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19226226 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 19226127  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19226126 ccct----tagactttggattcgggggttggttacgcgaaggggaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 19226031  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19226030 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 19225931  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225930 tttgaaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 19225864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 24963753 - 24964119
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24963753 ctgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 24963852  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24963853 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 24963952  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    | ||||||||| | | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24963953 a-cttgtgctaaactgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 24964051  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24964052 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 24964119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 24955294 - 24955659
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24955294 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 24955393  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24955394 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 24955493  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
     ||||||||| | | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24955494 -cttgtgctaaactgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 24955592  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24955593 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 24955659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 33835127 - 33835494
Alignment:
Q  18 tactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33835127 tactgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaa 33835226  T
Q  118 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33835227 aaacccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaaaggaaggtgctagcatcctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaga 33835326  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||||   |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33835327 ttatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 33835425  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33835426 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 33835494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 20396265 - 20396614
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaa-aatgagtaaa 118  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20396265 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtgaa 20396364  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20396365 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttgcctaatt 20396464  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||||  |||                 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20396465 tatcttgtgct-tatt-----------------ttattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 20396546  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396547 atttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 20396614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 33843828 - 33844193
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33843828 ctgtgctcccgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 33843927  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  33843928 acccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 33844027  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||||   |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33844028 atcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttacttttatttg 33844126  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33844127 atttggaaggataaaaatcatatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 33844193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 23348554 - 23348851
Alignment:
Q  33 tttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgaga 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23348554 tttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactatcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgaga 23348653  T
Q  133 ctttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctaca 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  23348654 ctttggattcgagggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaa 23348753  T
Q  233 ttca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagga 329  Q
    || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23348754 ttgatttgcttatttgaaaattactacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 23348851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20378112 - 20377746
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20378112 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcaatttttattcttgggaagg-aaaaaatgagtaaaa 20378014  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20378013 acccttttcgagactttggattcgagggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 20377914  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||||   |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20377913 atcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttagttatttttatttg 20377815  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20377814 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 20377746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20386900 - 20386535
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20386900 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcaatttttattcttgggaagg-aaaaaatgagtaaaaa 20386802  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20386801 cccttttcgagactttggattcgagggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 20386702  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||   |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20386701 tcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttagttatttttatttga 20386603  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20386602 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 20386535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Original strand, 26088335 - 26088700
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26088335 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 26088434  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  26088435 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatt 26088534  T
Q  220 atcttgtgctaca-ttcattgcttac-ttgaaa-attattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    || |||||||| | | | | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26088535 attttgtgctaaactacttggcttactttgaaagattattacct-aaaatctaagtgaaaaaatggagggagaagaagtatgtttttggctatttttatt 26088633  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  26088634 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 26088700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Original strand, 26078356 - 26078721
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26078356 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtgaaa 26078455  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  26078456 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatt 26078555  T
Q  220 atcttgtgctaca-ttcattgcttac-ttgaaa-attattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    || |||||||| | | | | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26078556 attttgtgctaaactacttggcttactttgaaagattattacct-aaaatctaagtgaaaaaatggagggagaagaagtatgtttttggctatttttatt 26078654  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  26078655 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 26078721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 3491533 - 3491844
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3491533 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaa 3491632  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3491633 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagat 3491732  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||||   |  ||| ||| |||  ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3491733 tatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 3491831  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  3491832 tgatttggaagga 3491844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 3476764 - 3477074
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3476764 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 3476863  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3476864 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 3476963  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||   |  ||| ||| |||  ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3476964 atcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 3477062  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  3477063 gatttggaagga 3477074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 11812422 - 11812731
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11812422 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 11812521  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  11812522 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 11812621  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    || |||||||| | |  ||| ||| ||| |||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11812622 attttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaatattgcct-aacgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 11812720  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  11812721 atttggaagga 11812731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 329
Target Start/End: Original strand, 21856806 - 21857108
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21856806 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 21856905  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  21856906 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 21857005  T
Q  229 tacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaa 326  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21857006 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaaggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 21857105  T
Q  327 gga 329  Q
    |||    
T  21857106 gga 21857108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 11802347 - 11802655
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11802347 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 11802446  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  11802447 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 11802546  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    | |||||||| | |  ||| ||| ||| |||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11802547 ttttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaatattgcct-aacgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 11802645  T
Q  320 tttggaagga 329  Q
    ||||||||||    
T  11802646 tttggaagga 11802655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 36458982 - 36458672
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36458982 ctgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 36458883  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  36458882 acccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 36458783  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttg-ttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| | |  ||| | | ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36458782 atcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttatttttattt 36458684  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  36458683 gatttggaagga 36458672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 12170128 - 12170437
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12170128 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 12170227  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||    
T  12170228 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtatttcataggaacctcttacctagatt 12170327  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    || |||||||| | |  ||| ||| ||| |||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12170328 attttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaatattgcct-aacgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 12170426  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  12170427 atttggaagga 12170437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 12179557 - 12179866
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12179557 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 12179656  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||    
T  12179657 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtatttcataggaacctcttacctagatt 12179756  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    || |||||||| | |  ||| ||| ||| |||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12179757 attttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaatattgcct-aacgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 12179855  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  12179856 atttggaagga 12179866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17642825 - 17642458
Alignment:
Q  20 ctgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17642825 ctgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaatggaaaaaatgagtaaa 17642726  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||  | |||||||||| || || ||||| |||| |||||||  |||||||      
T  17642725 aacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtattaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgtttacctaga 17642626  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcatt-gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttat 315  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17642625 ttatcttgtgctaaattcattcgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaaggagaagaagtatgtttttggttatttttat 17642526  T
Q  316 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  17642525 ttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 17642458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 20370577 - 20370911
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaa 118  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  20370577 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcatgggaagggaaaaaaatgagtgaa 20370676  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20370677 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaaag---------------ctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaatt 20370761  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||            ||||||| ||      |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20370762 tatctt------------ttgcttattt------tattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 20370843  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20370844 atttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 20370911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23039454 - 23039088
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23039454 tgtgctccctgattttcggatatcaaactattaattgatttgaatcgtcaatttttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 23039355  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  23039354 acccttatcgagactttgaattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 23039255  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23039254 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 23039155  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||||| ||   |||| ||||||| |||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  23039154 tgatttggaaggacaag--tcctctgcctacgtaccattttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 23039088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21931765 - 21931544
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21931765 tgtgctcgtgattttcgga-atcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 21931667  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21931666 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 21931567  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgctta 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  21931566 tcttgtgctaaattcattgctta 21931544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27064428 - 27064117
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27064428 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27064329  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||    
T  27064328 cccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaatt 27064229  T
Q  220 atcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27064228 atcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 27064130  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  27064129 tgatttggaagga 27064117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 23827751 - 23828057
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23827751 cccgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 23827850  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  23827851 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatctt 23827950  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttactt-gaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23827951 gtgctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 23828049  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  23828050 tggaagga 23828057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 385
Target Start/End: Original strand, 21850650 - 21851001
Alignment:
Q  35 tcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagact 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21850650 tcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaaaaagtaaaaacccttatcgagact 21850749  T
Q  135 ttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacat 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21850750 ttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaat 21850849  T
Q  234 tca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggata 331  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  21850850 tcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaaggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--a 21850947  T
Q  332 aaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
     || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  21850948 caagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 21851001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23637681 - 23637375
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23637681 cccgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtagaaaccctt 23637582  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  23637581 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatctt 23637482  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttactt-gaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23637481 gtgctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 23637383  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  23637382 tggaagga 23637375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 23835209 - 23835515
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23835209 cccgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtagaaaccctt 23835308  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  23835309 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatctt 23835408  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttactt-gaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23835409 gtgctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 23835507  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  23835508 tggaagga 23835515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 326
Target Start/End: Original strand, 31548049 - 31548352
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt-aaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  31548049 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttatttgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaaaccctt 31548148  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  31548149 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 31548248  T
Q  225 gtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31548249 gtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttgtttttatttgattt 31548348  T
Q  323 ggaa 326  Q
    ||||    
T  31548349 ggaa 31548352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 21986165 - 21986477
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21986165 tgtgctcacgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 21986264  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| |    
T  21986265 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaat 21986364  T
Q  219 tatcttgtgctacattca--ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttat 315  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21986365 tatcttgtgctaaattcacttggcttacttgaaaaattatta-cttaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 21986463  T
Q  316 ttgatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||||    
T  21986464 ttgatttggaagga 21986477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23985096 - 23984788
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc- 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  23985096 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaaacttt 23984997  T
Q  126 -atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatct 223  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||    
T  23984996 tatcgagaccttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatct 23984897  T
Q  224 tgtgctacattcatt--gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23984896 tgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgat 23984797  T
Q  321 ttggaagga 329  Q
    |||||||||    
T  23984796 ttggaagga 23984788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 21994812 - 21995125
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21994812 ctgtgctcacgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatttttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 21994911  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| |||||||||     
T  21994912 aacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaa 21995011  T
Q  218 ttatcttgtgctacattca--ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttta 314  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21995012 ttatcttgtgctaaattcacttggcttacttgaaaaattatta-cttaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 21995110  T
Q  315 tttgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||||    
T  21995111 tttgatttggaagga 21995125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26177422 - 26177063
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagta-aaaaccctc 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26177422 cccgattttcggatatcaaacccttgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaaccctt 26177323  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  26177322 atcgagactttggattc-ggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 26177224  T
Q  225 gtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26177223 gtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaataagtatgttttgggttatttttatttgattt 26177124  T
Q  323 ggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  26177123 ggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 26177063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 329
Target Start/End: Original strand, 21858564 - 21858861
Alignment:
Q  35 tcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagact 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21858564 tcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaaaaagtaaaaacccttatcgagact 21858663  T
Q  135 ttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacat 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21858664 ttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaat 21858763  T
Q  234 tca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagga 329  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21858764 tcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatttaagtgaaagaatggaaggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 21858861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 27220140 - 27220451
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27220140 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 27220239  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  27220240 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagat 27220339  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaa--ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||||   |  ||| ||| |||||||   |||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27220340 tatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaatatattgcct-aatgtctaagtgaaagtatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 27220438  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  27220439 tgatttggaagga 27220451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 27223147 - 27223458
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27223147 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 27223246  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  27223247 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagat 27223346  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaa--ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||||   |  ||| ||| |||||||   |||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27223347 tatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaatatattgcct-aatgtctaagtgaaagtatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 27223445  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  27223446 tgatttggaagga 27223458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 27232618 - 27232929
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27232618 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 27232717  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  27232718 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagat 27232817  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaa--ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||||   |  ||| ||| |||||||   |||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27232818 tatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaatatattgcct-aatgtctaagtgaaagtatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 27232916  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  27232917 tgatttggaagga 27232929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29190478 - 29190273
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29190478 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaa-tgagtaaaaa 29190380  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  29190379 ccctca---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattta 29190283  T
Q  221 tcttgtgcta 230  Q
    ||||||||||    
T  29190282 tcttgtgcta 29190273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 344880 - 345085
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  344880 tgtgctcgtgattttcggatgtcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 344977  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||    
T  344978 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaattt 345074  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||    
T  345075 atcttgtgcta 345085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 359518 - 359724
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  359518 ctgtgctcgtgattttcggatgtcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaa 359615  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |    
T  359616 aaccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaagatgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaatt 359712  T
Q  219 tatcttgtgcta 230  Q
    ||||||||||||    
T  359713 tatcttgtgcta 359724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 355
Target Start/End: Original strand, 23762285 - 23762615
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||     
T  23762285 cccgattttcggatataaaaccatttaattgatttgaatcgacaatctttgaactctctatttttattcgtggaaagataaaaaatgagaaaaaaccctt 23762384  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |    ||| |||||| | |||||||||| |  || | ||| |||  | ||||| |||| |||| |||||||    
T  23762385 atcaagactttgtattcgggggttggtttctaataggaaaggtgttaagcaccctaaacaacttcagtactccaaaagaaccgcttatctaaattatctt 23762484  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttactt-gaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23762485 gtgctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatgtttttggttatttttatttgatt 23762583  T
Q  322 tggaaggataaaaatcctatgcctacataccctt 355  Q
    || |||   | || |||| |||||||||||||||    
T  23762584 tgaaag--aacaagtcctctgcctacataccctt 23762615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 306 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21931546 - 21931466
Alignment:
Q  306 ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21931546 ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgcagttca 21931466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19071833 - 19071785
Alignment:
Q  140 ttcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtcta 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  19071833 ttcgggggttggttacgcaaagggaaggtattagccccctaaacgtcta 19071785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27586891 - 27586827
Alignment:
Q  146 ggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctctt 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||  ||| ||  ||||||||||||    
T  27586891 ggttggttacgcaaagggaaggtgttagcaccctaaatgtctatagtactctataggaacctctt 27586827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 27338859 - 27339224
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338859 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgactcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27338958  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27338959 cccttattgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctatgcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 27339058  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27339059 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 27339158  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339159 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 27339224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 50826913 - 50826548
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50826913 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 50826814  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50826813 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 50826714  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  50826713 tcttgtgctaaattcgttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgac 50826614  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50826613 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 50826548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4435985 - 4435618
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt-aaa 118  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  4435985 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcttgatttttattcgtggaaagggaaaaaatgagtgaaa 4435886  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4435885 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaatt 4435786  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4435785 tatcttgtgctacattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 4435686  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4435685 atttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 4435618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4456775 - 4456409
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt-aaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4456775 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtgaaaa 4456676  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4456675 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacgctatttcgtaggaacctcttacctaattt 4456576  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4456575 atcttgtgctacattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatatttttggttatttttatttga 4456476  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456475 tttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 4456409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 30062629 - 30062994
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30062629 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaattgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagg-aaaaaatgagtaaaaa 30062727  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30062728 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 30062827  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30062828 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 30062927  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30062928 tttggaaggataaaaatcccatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 30062994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3712152 - 3711786
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3712152 tgtgctcgagattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 3712053  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  3712052 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtatggacctcttacctaattta 3711953  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3711952 tcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 3711853  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3711852 tttggaaggataaaaatcctgtgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 3711786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 41016950 - 41016584
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41016950 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 41016851  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41016850 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 41016751  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41016750 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 41016651  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41016650 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 41016584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 19 - 386
Target Start/End: Original strand, 18949439 - 18949807
Alignment:
Q  19 actgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18949439 actgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 18949538  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  18949539 aaccctcatcgagactttggattcgggaattggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccataggaacctcttacctaatc 18949638  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18949639 tatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatagggggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 18949738  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18949739 gacttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 18949807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 50848940 - 50849307
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50848940 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 50849039  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50849040 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctttggtattccgtaggaacctcttacctaattta 50849139  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50849140 tcttgtgctaaattcgttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 50849239  T
Q  321 ttggaaggat--aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50849240 ttggaaggattgaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 50849307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 27550643 - 27551010
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggg-aaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27550643 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtggggaggggaaaaaatgagtaaaa 27550742  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27550743 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 27550842  T
Q  220 atcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27550843 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatatctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttacttg 27550942  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27550943 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 27551010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17360633 - 17360272
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17360633 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17360534  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  17360533 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattta 17360434  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17360433 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaataatggagggagaagaagtatg-tttttgttttttttatttga 17360335  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtag 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17360334 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccattgtag 17360272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17365275 - 17364914
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17365275 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17365176  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  17365175 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattta 17365076  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17365075 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaataatggagggagaagaagtatg-tttttgttttttttatttga 17364977  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtag 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17364976 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccattgtag 17364914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15711581 - 15711212
Alignment:
Q  18 tactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15711581 tactgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 15711482  T
Q  118 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||     
T  15711481 aaacccttatcgagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccattggaacctcttgcctaat 15711382  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatta-ttacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15711381 ttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaagttatttacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatggttttggttatttttatt 15711282  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15711281 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 15711212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 8204027 - 8204395
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8204027 ctgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 8204126  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8204127 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 8204226  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8204227 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagagagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 8204326  T
Q  319 atttggaagga-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8204327 atttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 8204395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14426188 - 14425821
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14426188 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgttggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 14426089  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  14426088 tccttatcgagactttggatttgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacatagatta 14425989  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14425988 tcttgtgctagattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 14425889  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425888 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 14425821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 39707405 - 39707036
Alignment:
Q  19 actgtgctcccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39707405 actgtgctcgcgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcttcaatctgtgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 39707306  T
Q  118 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39707305 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaa 39707206  T
Q  218 ttatcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  39707205 ttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaggaagtatgtttttgattatttttatt 39707106  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39707105 tgatttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 39707036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 2256985 - 2256617
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattc-gtgggaagggaaaaaa-tgagtaa 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2256985 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgcatcgtcaatatttgaactctcaatttttattccgtgggaagggaaaaaaatgagtaa 2256886  T
Q  118 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2256885 aaacccttgtcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattctgtaggaacctcttacctaaa 2256786  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2256785 ttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatatttttggttatttttattt 2256686  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2256685 gatttggaaggataaaaatcctctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 2256617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15694976 - 15694609
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15694976 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 15694877  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||| ||    
T  15694876 acccttatcgagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattatataggaacctcttgcctaattt 15694777  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatta-ttacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15694776 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaagttatttacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatggttttggttatttttatttg 15694677  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15694676 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 15694609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 13507248 - 13507606
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa-ccctcatc 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13507248 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcttcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaacccttatc 13507347  T
Q  129 gagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13507348 gagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgc 13507447  T
Q  229 tacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagg 328  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13507448 taaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaggtatgtttttggttatttttattcgatttggaagg 13507547  T
Q  329 a-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13507548 attgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgcagttca 13507606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 51922060 - 51922426
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51922060 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 51922159  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  51922160 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaagaacctcttacctagatta 51922259  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51922260 tcttgtgctaaattgatttgtttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttctttga 51922359  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  51922360 tttggaaggataaaaatcctctgcctacatacctttaaagaaaggggatcaaaaccaacgtagttca 51922426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 8153128 - 8153495
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8153128 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 8153227  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8153228 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 8153327  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
     ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8153328 ccttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 8153427  T
Q  320 tttggaagga-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8153428 tttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaacaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 8153495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 8196217 - 8196584
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8196217 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattatttgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 8196316  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8196317 cccttctcgagactttggattcgggggttggttatgcgaaggtaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 8196416  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8196417 tcttgtgctaaattgattttcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagagagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 8196516  T
Q  320 tttggaagga-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8196517 tttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 8196584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17935628 - 17935267
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17935628 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtaaatctttgaactctcaatttttatttgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17935529  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  17935528 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattta 17935432  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17935431 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 17935332  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17935331 tttggaaggat-taactcctttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 17935267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 10720699 - 10721066
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10720699 ctgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 10720798  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10720799 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 10720898  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttg-ttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| | |  ||| | | ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10720899 atcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttatttttattt 10720997  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10720998 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 10721066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 73 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15697236 - 15696922
Alignment:
Q  73 tttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta 172  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15697236 tttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgcta 15697137  T
Q  173 gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatta-ttacctaaaaatctaaa 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  15697136 gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaagttatttacctaaaaatctaag 15697037  T
Q  272 tgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaa 371  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15697036 tgaaagaatgggggaagaagaagtatggttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaa 15696937  T
Q  372 aaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||    
T  15696936 aaccaatgtagttca 15696922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 27 - 386
Target Start/End: Original strand, 6293521 - 6293879
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6293521 cccgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 6293620  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  6293621 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttagattattttgt 6293720  T
Q  227 gctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttgga 325  Q
    ||||  ||  | | ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6293721 gctaagttactcgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 6293819  T
Q  326 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6293820 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 6293879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 2214919 - 2215282
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2214919 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaatggaaaaaaatgagtaaaa 2215018  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    | ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  2215019 atcctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 2215115  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2215116 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaataagtatgtttttggttatttttattt 2215215  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2215216 gatttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 2215282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27979139 - 27978778
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27979139 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27979040  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  27979039 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 27978943  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27978942 tcttgtgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatataaatgaaagaatgaagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 27978843  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  27978842 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 27978778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6564159 - 6563794
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6564159 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 6564060  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  6564059 accctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 6563961  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttt-gttatttttattt 317  Q
    |||||||||||   |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6563960 atcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtttaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttggttatttttattt 6563862  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6563861 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 6563794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6577827 - 6577463
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6577827 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 6577728  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  6577727 ccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 6577629  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttt-gttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||   |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6577628 tcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtttaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttggttatttttatttg 6577530  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6577529 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 6577463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18351585 - 18351223
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18351585 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaattgtcaatctctgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18351486  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||    
T  18351485 ccctta---agactttggatttgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagatta 18351389  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18351388 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattta 18351289  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    | ||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18351288 aattggaaggat-tgactcccctgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 18351223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17630664 - 17630358
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17630664 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtttatctttgttctctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17630565  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17630564 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 17630465  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17630464 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 17630365  T
Q  320 tttggaa 326  Q
    |||||||    
T  17630364 tttggaa 17630358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 31 - 386
Target Start/End: Original strand, 43468083 - 43468434
Alignment:
Q  31 attttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcga 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |    
T  43468083 attttcgaatatcaaaccattaattgattcgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta---a 43468179  T
Q  131 gactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  43468180 gactttggattcaggggttggttacgcgaagggaatgtgctagcaccctaagcgtctatggtattccatatgaacctcttacctaaattatcttgtgtta 43468279  T
Q  231 cattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagga 329  Q
     ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43468280 aattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaaaggggggagaaaaagtatg-ttttggttatttttatttgatttggaagga 43468378  T
Q  330 taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |  || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43468379 t-taactcctttgcctacatacccttaaaagaaagggatcaaaaccaatgtagttca 43468434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 1004109 - 1004475
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1004109 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 1004208  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | | |||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||    
T  1004209 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaaacaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 1004308  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1004309 atcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttatttg 1004407  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1004408 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 1004475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 329
Target Start/End: Original strand, 13847667 - 13847977
Alignment:
Q  19 actgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 117  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13847667 actgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 13847766  T
Q  118 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  13847767 aaaccctta---agactttggattcgggggttggttatgcaaaggaaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaga 13847863  T
Q  218 ttatcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttg-ttatttttat 315  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13847864 ttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacttaagaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgattatttttat 13847963  T
Q  316 ttgatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||||    
T  13847964 ttgatttggaagga 13847977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 5144264 - 5144573
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5144264 ctgtgctcacgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 5144363  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  5144364 accct-ttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 5144462  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||  ||  ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5144463 atcttgtgctaactttgttgcttatttgaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 5144561  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  5144562 gatttggaagga 5144573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16291251 - 16290884
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16291251 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 16291152  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||  ||||||||  |    
T  16291151 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaactgcttacctagat 16291052  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16291051 tatcttgtgctaaattcatttgtttacttgaaaaattataacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 16290952  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16290951 tgatttggaaggat-tgactcccctgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 16290884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 11918196 - 11918508
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11918196 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 11918295  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  11918296 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 11918395  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11918396 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 11918495  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  11918496 tgatttggaagga 11918508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 11932766 - 11933078
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11932766 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 11932865  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  11932866 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 11932965  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11932966 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 11933065  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  11933066 tgatttggaagga 11933078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22952253 - 22951943
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22952253 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 22952154  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||    
T  22952153 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttagatt 22952054  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||  ||  ||| |||||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22952053 atcttgtgctaagttacttgtttacttgaaaaaattattgcct-aatgtctaaatgagagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 22951955  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  22951954 gatttggaagga 22951943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Original strand, 17562687 - 17563053
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17562687 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17562786  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  17562787 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtattccgaaggaaccgcttacctaaatt 17562886  T
Q  220 atcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgtta-tttttat 315  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17562887 atcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttttat 17562985  T
Q  316 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||| | |||||||    
T  17562986 ttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttggaaaagggatcaaaaccgacgtagttc 17563053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22966226 - 22965917
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22966226 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 22966127  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  22966126 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttagatta 22966027  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||  ||  ||| |||||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22966026 tcttgtgctaagttacttgtttacttgaaaaaattattgcct-aatgtctaaatgagagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 22965928  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  22965927 atttggaagga 22965917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25265156 - 25264847
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25265156 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 25265057  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  25265056 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttatctagatt 25264957  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||| | |  ||| | | ||||||| |  |  || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25264956 atcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaatcattgcttaatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttagttatttttatttga 25264857  T
Q  320 tttggaagga 329  Q
    ||||||||||    
T  25264856 tttggaagga 25264847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25274649 - 25274341
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25274649 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 25274550  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  25274549 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttatctagatta 25274450  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| | |  ||| | | ||||||| |  |  || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25274449 tcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaatcattgcttaatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttagttatttttatttgat 25274350  T
Q  321 ttggaagga 329  Q
    |||||||||    
T  25274349 ttggaagga 25274341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1480432 - 1480127
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1480432 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 1480333  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1480332 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatcttg 1480233  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1480232 tgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgattt 1480134  T
Q  323 ggaagga 329  Q
    |||||||    
T  1480133 ggaagga 1480127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13275253 - 13274947
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13275253 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 13275154  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  13275153 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 13275054  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13275053 tgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgattt 13274954  T
Q  323 ggaagga 329  Q
    |||||||    
T  13274953 ggaagga 13274947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 152 - 386
Target Start/End: Original strand, 18900462 - 18900697
Alignment:
Q  152 ttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18900462 ttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaa 18900561  T
Q  252 ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttt-gttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacata 350  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900562 ttattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaaggagtatgttttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacata 18900661  T
Q  351 cccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900662 cccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 18900697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 30 - 385
Target Start/End: Original strand, 15675079 - 15675432
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15675079 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgattcttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttttcg 15675178  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15675179 aaactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgct 15675278  T
Q  230 acattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagg 328  Q
    | | |  ||| | | ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15675279 aaactacttgttcatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag- 15675376  T
Q  329 ataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
      | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  15675377 -aacaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 15675432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31279037 - 31278725
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31279037 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 31278938  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  31278937 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 31278838  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31278837 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattatttcctaaaaatctaagtgaaagaatgaagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 31278738  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  31278737 tgatttggaagga 31278725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 7063626 - 7063931
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  7063626 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 7063725  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| | || ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  7063726 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtacttcgaaggaaccgcttacctagattatcttg 7063825  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7063826 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatataaaagaatggagggagaataagtatgtttttggttatttttatttgatttg 7063925  T
Q  324 gaagga 329  Q
    ||||||    
T  7063926 gaagga 7063931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 7096473 - 7096778
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  7096473 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 7096572  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  7096573 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 7096672  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7096673 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatataaaagaatggacggagaataagtatgtttttggttaattttatttgatttg 7096772  T
Q  324 gaagga 329  Q
    ||||||    
T  7096773 gaagga 7096778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 385
Target Start/End: Original strand, 15683621 - 15683974
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15683621 gattttcggatatcaaacctttaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgattcttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttttcg 15683720  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15683721 aaactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacgatattccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgct 15683820  T
Q  230 acattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagg 328  Q
    | | |  ||| | | ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15683821 aaactacttgttcatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag- 15683918  T
Q  329 ataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
      | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  15683919 -aacaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 15683974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 4503361 - 4503666
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4503361 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 4503460  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  4503461 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 4503560  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4503561 tgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattatct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatgtttttggttttttttatttgattt 4503659  T
Q  323 ggaagga 329  Q
    |||||||    
T  4503660 ggaagga 4503666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 17616479 - 17616783
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17616479 cccgattttcggatatcaaaccattggttgatttgaatcttcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 17616578  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  17616579 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 17616678  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17616679 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaataagtatg-ttttggttatttttatttgatttg 17616777  T
Q  324 gaagga 329  Q
    ||||||    
T  17616778 gaagga 17616783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 10713425 - 10713635
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10713425 ctgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 10713524  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10713525 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 10713624  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||    
T  10713625 atcttgtgcta 10713635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 106 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18041373 - 18041097
Alignment:
Q  106 aaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaac 205  Q
    ||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18041373 aaaaatgagtaaaaaccccta---agactttggattcgggggttggttacacgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaac 18041277  T
Q  206 ctcttacctaacttatcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttt 304  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  18041276 ctcttaactaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaatattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagcatgttcttg 18041177  T
Q  305 gttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18041176 gttatttatatttgatttggaaggat-taactcccttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 18041097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 303
Target Start/End: Original strand, 24215983 - 24216267
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24215983 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 24216082  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  24216083 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagat 24216182  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttt 303  Q
    |||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24216183 tatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatattttt 24216267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 385
Target Start/End: Original strand, 21185428 - 21185777
Alignment:
Q  34 ttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaaaaccctcatcgag 131  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||    
T  21185428 ttcgggtatcaaaccattaattgattttgaaccttcaatatttgaactctcaacttttattcgtgggaagggaaaaaagtgagtaaaaaccctta---ag 21185524  T
Q  132 actttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctac 231  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||     
T  21185525 actttggattcaggggttgattacgcgaagggaaggtgctggcatcctaagcgtctacggtacttcgtaggaacctcttgcctaatttatcttgtgttaa 21185624  T
Q  232 attca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggat 330  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21185625 attaatttgcttatttgaaaattattgcctaaaggtctaagtgaaagaatgaagggagaagaagtatgttttttgttgtttttatttgatttggaaggat 21185724  T
Q  331 aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
      || |||| |||||||||| ||  |||||   |||||||||||||||| |||||    
T  21185725 -taactcctttgcctacatatcc-aaaagatttgggatcaaaaccaatgcagttc 21185777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 29730411 - 29730622
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt--aaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  29730411 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 29730510  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  29730511 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagat 29730610  T
Q  219 tatcttgtgcta 230  Q
    ||| ||||||||    
T  29730611 tattttgtgcta 29730622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 303
Target Start/End: Original strand, 27957186 - 27957455
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  27957186 gatttacggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatttttgaactca--atttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta--- 27957280  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27957281 aaactttagattcgggtgttggttacgcgaaggaaaggtgctagcattctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgct 27957380  T
Q  230 acattca-ttgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttt 303  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27957381 aaattgatttgcttatttgaaaattattgcctaaaaaatataagtgaaagaatgg-gggagaagaagtatgttttt 27957455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12469210 - 12468968
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  12469210 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaggaaaaaaataagtaaaaaccctta 12469111  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  12469110 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 12469011  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaa 265  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12469010 tgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaa 12468968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 18881927 - 18882097
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18881927 ctgtgctcatgattttcagataccaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 18882026  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacg 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18882027 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacg 18882097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 213 - 386
Target Start/End: Original strand, 18890340 - 18890514
Alignment:
Q  213 ctaacttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttg-ttattt 311  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18890340 ctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatgggaggagaaggagtatgttttttggttattt 18890439  T
Q  312 ttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18890440 ttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 18890514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27880734 - 27880426
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27880734 ctgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcttcaatctttgaactctctacttttattcgtgggaagggaaaaagtgag-aaaa 27880636  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||   |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  27880635 acccttat-gagactttggatccgagggttggtttcgattagggaaggtgttaagcacccgaatcgactacggtattccgtaggaacctcttgcctactt 27880537  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgctta-cttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||| |||  |||||||  ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27880536 tatcttgtgcta-attatttgcttattttgaaaatgcttacttaaaagtctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatg-tttttgttgtttttattt 27880439  T
Q  318 gatttggaaggat 330  Q
    |||||||||||||    
T  27880438 gatttggaaggat 27880426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13555750 - 13555545
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13555750 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attagtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 13555653  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||    
T  13555652 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgcaggaaccttttacttaattt 13555556  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||    
T  13555555 atcttgtgcta 13555545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 197 - 386
Target Start/End: Original strand, 16814558 - 16814746
Alignment:
Q  197 cgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagt 295  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16814558 cgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgaagggagaaaaagt 16814657  T
Q  296 atgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16814658 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-taacttctttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 16814746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 14520712 - 14520859
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520712 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcttaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 14520811  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggt 168  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520812 cccttgtcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggt 14520859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27885101 - 27884821
Alignment:
Q  48 cattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcggggg 147  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||||| ||||||    
T  27885101 cattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctctacttttatttgtgggaagggaaaaaatgag-aaaaaccattat-gagattttggatccggggg 27885004  T
Q  148 ttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcattgctta-ct 245  Q
    |||||| ||   |||||||||| | ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||  |    
T  27885003 ttggtttcgattagggaaggtgttaagcacccgaatcgactactgtattccgtaggaacctcttgcctactttatcttgtgcta-attatttgcttattt 27884905  T
Q  246 tgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggat 330  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27884904 tgaaaatgcttacttaaaagtctaagtgaaagaatggatggagaagaagtatg-tttttgttgtttttatttgatttggaaggat 27884821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 272 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 41007919 - 41007805
Alignment:
Q  272 tgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaa 371  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007919 tgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaa 41007820  T
Q  372 aaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||    
T  41007819 aaccaatgtagttca 41007805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 330
Target Start/End: Original strand, 9567318 - 9567581
Alignment:
Q  67 tcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaag 166  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  9567318 tcaatctttggactctcaacttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaaaccctta-cgagactttggattcgggggttggtttcgattagggaag 9567416  T
Q  167 gtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaa 264  Q
    ||| | |||||||  | || ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||| || ||| | ||||||| ||||||| || |  |||| |    
T  9567417 gtgttaagcacccacatcgactacggtatcccataggaacctcttgcctactttatcttgtgttaaattaatttgcttatttgaaaa-taatgtctaaga 9567515  T
Q  265 atctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatg-ttttttgttatttttatttgatttggaaggat 330  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  9567516 gtctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttttgtttctttta-ttgatttggaaggat 9567581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 18900359 - 18900462
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900359 tgtgctcgtgatttttggataccaaaccattaattgatttgaatcgtcaatcattgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18900458  T
Q  121 ccct 124  Q
    ||||    
T  18900459 ccct 18900462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 208 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30102286 - 30102160
Alignment:
Q  208 cttacctaacttatcttgtgctacattcatt--gcttacttgaaaa--ttattacctaaaaa-tctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30102286 cttacctagattatcttgtgctaaattcgtttggcttacttgaaaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt 30102187  T
Q  303 ttgttatttttatttgatttggaagga 329  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  30102186 tggttatttttatttgatttggaagga 30102160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 22094926 - 22094837
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa 110  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22094926 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa 22094837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 386
Target Start/End: Original strand, 27957882 - 27957958
Alignment:
Q  310 ttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27957882 ttttatttgatttggaatgataaaaatcctttgcctacatacccttaaatgaaagggatcaaaaccaatgtagttca 27957958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 386
Target Start/End: Original strand, 27958025 - 27958144
Alignment:
Q  261 aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 360  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||  |||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||      
T  27958025 aaaaatctaagtgaaagaatgg--ggagaagaaacatgtttttggtt----ttatttgatttggaatgataaaaatcctttgcctacatacctttaaatg 27958118  T
Q  361 aaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||    
T  27958119 aaagggatcaaaatcaatgtcgttca 27958144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Original strand, 9183894 - 9183945
Alignment:
Q  331 aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtag 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9183894 aaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtag 9183945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15697274 - 15697231
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaa 63  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15697274 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaa 15697231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18041433 - 18041374
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaact 80  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18041433 tgtgctcgtgattttcggatatcaaatcattaattgatttgaatcgttaatctttgaact 18041374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4759 - 4393
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4759 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcatgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 4660  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4659 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 4560  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattaccta-aaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4559 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaaaagtatgtttttggttatttttatttga 4460  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4459 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 4393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 18302861 - 18303227
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18302861 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18302960  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18302961 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgtgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattcagtaggaacctcttacctaattta 18303060  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18303061 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 18303160  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18303161 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 18303227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13833114 - 13832749
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13833114 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 13833015  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13833014 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 13832915  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13832914 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtta-ttttatttga 13832816  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13832815 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 13832749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13841143 - 13840779
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841143 tgtgctcgtgattttcagatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13841044  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13841043 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 13840944  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13840943 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtta-ttttatttgat 13840845  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13840844 ttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 13840779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 4661689 - 4662049
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4661689 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtc----tgtgaactctcgatttt-attcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 4661783  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4661784 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 4661883  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4661884 tcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 4661983  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4661984 ttggaaggataaaaattctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 4662049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Original strand, 24185922 - 24186294
Alignment:
Q  16 aatactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 115  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185922 aatattgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 24186021  T
Q  116 aaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttaccta 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24186022 aaaaaccctcatcaagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttaccta 24186121  T
Q  216 acttatc-ttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttt 313  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24186122 atttatctttgtgctaaattcattgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttattttt 24186221  T
Q  314 atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24186222 acttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 24186294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 1900832 - 1901197
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900832 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 1900931  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1900932 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaattt 1901031  T
Q  220 atc-ttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  1901032 atctttgtgctaaattcattgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaat---gggggaagaagtatgtttttggttatttttactt 1901128  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1901129 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 1901197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 1886732 - 1887096
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1886732 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 1886831  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1886832 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaattta 1886931  T
Q  221 tc-ttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1886932 tctttgtgctaaattcattgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaat---gggggaagaagtatgtttttggttatttttacttg 1887028  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1887029 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 1887096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10449695 - 10449329
Alignment:
Q  19 actgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10449695 actgtgctcgcgattttcgaatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgaatgaa 10449596  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||  |    
T  10449595 aaccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaagatgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaatctcttacctagat 10449499  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10449498 tatcttgtgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 10449399  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10449398 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 10449329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 5208096 - 5208460
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5208096 ctgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 5208195  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  5208196 accct-ttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagagaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 5208294  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5208295 atcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 5208393  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5208394 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 5208460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 330
Target Start/End: Original strand, 4940091 - 4940401
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaa-aatgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4940091 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 4940190  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4940191 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcttctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 4940290  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4940291 atcttgtgctaagttcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 4940390  T
Q  320 tttggaaggat 330  Q
    |||||||||||    
T  4940391 tttggaaggat 4940401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 5198980 - 5199343
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5198980 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgagaagggaaaaaatgagtaaaaa 5199079  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  5199080 ccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 5199178  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5199179 tcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 5199277  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5199278 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 5199343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Original strand, 17739178 - 17739547
Alignment:
Q  16 aatactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgag 114  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17739178 aatattgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgagaagggaaaaaaatgag 17739277  T
Q  115 taaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacct 214  Q
    |||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17739278 taaaaaccctta---agattttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttgcct 17739374  T
Q  215 aacttatcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttt 312  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17739375 aatttatcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaattattgcctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttt 17739474  T
Q  313 tatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739475 tatttgatttggaaggat-taactccttttcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 17739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16545813 - 16545452
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16545813 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16545714  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  16545713 ccctta---agactctgaattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctatatta 16545617  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  16545616 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttctgattatttttatttg 16545517  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  16545516 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 16545452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Original strand, 16619849 - 16620210
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16619849 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16619948  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  16619949 ccctta---agactctgaattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctatatta 16620045  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  16620046 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttctgattatttttatttg 16620145  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  16620146 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 16620210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Original strand, 16909643 - 16909997
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16909643 cccgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 16909742  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgt 226  Q
       ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16909743 ---agactctgacttcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaacttatcttgt 16909839  T
Q  227 gctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttgga 325  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16909840 gctaaaatcatttgcttacttgaaaattgttagctaaaaatctaagtgaaagagtggagggggaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 16909939  T
Q  326 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  16909940 agg--acaagtcctttgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 16909997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29097091 - 29096783
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29097091 tgtgctcacgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 29096992  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  29096991 ccc-cttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 29096893  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||  ||  ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29096892 tcttgtgctaactttgttgcttatttgaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 29096794  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  29096793 atttggaagga 29096783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29082333 - 29082024
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29082333 ctgtgctcacgattttcagatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 29082234  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  29082233 accc-cttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 29082135  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||  ||  ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29082134 atcttgtgctaactttgttgcttatttgaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 29082036  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  29082035 gatttggaagga 29082024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40680327 - 40679961
Alignment:
Q  21 tgtgctcc-cgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680327 tgtgctcctcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 40680228  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  40680227 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 40680128  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40680127 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 40680028  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  40680027 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 40679961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17211648 - 17211285
Alignment:
Q  21 tgtgctcc-cgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17211648 tgtgctcctcgattttcggatatcaaaccattaattggtttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 17211549  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||  ||    
T  17211548 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaatgtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataaaaccctcttacctagatt 17211452  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17211451 atcctgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 17211352  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17211351 gatttggaagga-atgattcccctgcctacatacccttgaag-aaacggatcaaaacccatgtagttca 17211285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 17514148 - 17514456
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17514148 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17514247  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  17514248 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaaacgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 17514347  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    | |||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17514348 ttttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatggttttggttatttttatttga 17514446  T
Q  320 tttggaagga 329  Q
    ||||||||||    
T  17514447 tttggaagga 17514456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17539066 - 17538758
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17539066 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17538967  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  17538966 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaaacgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 17538867  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    | |||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17538866 ttttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatggttttggttatttttatttga 17538768  T
Q  320 tttggaagga 329  Q
    ||||||||||    
T  17538767 tttggaagga 17538758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 27975209 - 27975518
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27975209 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaacctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 27975308  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  27975309 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 27975408  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    || |||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27975409 attttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 27975507  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  27975508 atttggaagga 27975518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 27965757 - 27966065
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27965757 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaacctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27965856  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  27965857 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 27965956  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    | |||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27965957 ttttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 27966055  T
Q  320 tttggaagga 329  Q
    ||||||||||    
T  27966056 tttggaagga 27966065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 16889549 - 16889858
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16889549 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16889648  T
Q  121 -ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  16889649 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 16889748  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    || ||||||||   |  ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16889749 attttgtgctaagctacttgtttacttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 16889847  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  16889848 atttggaagga 16889858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29023773 - 29023465
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29023773 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttg 29023674  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  29023673 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 29023574  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgattt 322  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29023573 tgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgattt 29023475  T
Q  323 ggaaggataa 332  Q
    ||||||||||    
T  29023474 ggaaggataa 29023465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15185904 - 15185593
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15185904 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaa 15185805  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15185804 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtccatggtattccataggaacctcttacctaaat 15185705  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||| |||||||| | |  ||| ||| |||  |||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15185704 tattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaaatattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 15185606  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  15185605 tgatttggaagga 15185593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 16120491 - 16120805
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattg--attgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120491 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 16120590  T
Q  118 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaa 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  16120591 aaacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaa 16120690  T
Q  217 cttatcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttt 313  Q
     ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16120691 attatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttt 16120789  T
Q  314 atttgatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||||||    
T  16120790 atttgatttggaagga 16120805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 16147231 - 16147545
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattg--attgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16147231 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 16147330  T
Q  118 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaa 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  16147331 aaacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaa 16147430  T
Q  217 cttatcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttt 313  Q
     ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16147431 attatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttt 16147529  T
Q  314 atttgatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||||||    
T  16147530 atttgatttggaagga 16147545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16228111 - 16227804
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgattttt-attcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16228111 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtaaatctttgaactctcaattttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 16228012  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  16228011 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 16227912  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16227911 gtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatt 16227812  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  16227811 tggaagga 16227804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16244989 - 16244682
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgattttt-attcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16244989 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttaaactctcaattttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 16244890  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  16244889 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 16244790  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16244789 gtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatt 16244690  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  16244689 tggaagga 16244682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15200524 - 15200213
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15200524 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaa 15200425  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15200424 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtccatggtattccataggaacctcttacctaaat 15200325  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||| |||||||| | |  ||  ||| |||  |||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15200324 tattttgtgctaaactacttctttatttgaaaaaaatattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 15200226  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  15200225 tgatttggaagga 15200213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 44075013 - 44075322
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44075013 ctgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 44075112  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  44075113 acccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagtgaaagtgctagcatcctaagcatctacggtatttcgtaggaacctcttacctagatt 44075212  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||||   |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44075213 atcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctgagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 44075311  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||| ||||    
T  44075312 atttgggagga 44075322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 568163 - 568473
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  568163 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 568262  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  568263 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 568362  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  568363 tatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttattt 568461  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  568462 gatttggaagga 568473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 558254 - 558563
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  558254 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 558353  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||    
T  558354 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 558453  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  558454 atcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttatttg 558552  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  558553 atttggaagga 558563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27435608 - 27435300
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27435608 cccgattttcggatatcaaaccatttacttgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 27435509  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  27435508 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 27435409  T
Q  225 gtgctacattca--ttgcttacttg-aaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27435408 gtgctaaattcattttgcttactcgaaaaattattacctaaaaaatctaagtaaaagaatggagagagaagaattatgtttttggttatttttatttgat 27435309  T
Q  321 ttggaagga 329  Q
    |||||||||    
T  27435308 ttggaagga 27435300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 19383910 - 19384187
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgatt-gatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19383910 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattgatttgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 19384009  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  19384010 acccttatcgagactt-ggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 19384108  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatg 298  Q
    ||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19384109 atcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 19384187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27444638 - 27444330
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  27444638 cccgattttcggatatcaaaccatttacttgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagagaaaaaatgagtaaaaaccctt 27444539  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  27444538 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 27444439  T
Q  225 gtgctacattca--ttgcttacttg-aaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27444438 gtgctaaattcattttgcttactcgaaaaattattacctaaaaaatctaagtaaaagaatggagagagaagaattatgtttttggttatttttatttgat 27444339  T
Q  321 ttggaagga 329  Q
    |||||||||    
T  27444338 ttggaagga 27444330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2549311 - 2549000
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaa-aaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2549311 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaa 2549212  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||      
T  2549211 aacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaga 2549112  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2549111 ttatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttatt 2549013  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  2549012 tgatttggaagga 2549000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2563196 - 2562886
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaa-aaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2563196 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 2563097  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  2563096 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 2562997  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2562996 tatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttattt 2562898  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  2562897 gatttggaagga 2562886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 13491879 - 13492086
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13491879 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaacaattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 13491978  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |     
T  13491979 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacctaattc 13492075  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||    
T  13492076 atcttgtgcta 13492086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43600939 - 43600597
Alignment:
Q  31 attttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcga 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  43600939 attttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcttcaatcttcgaactctcaacttttatccgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccttaa--ga 43600842  T
Q  131 gactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||   | ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43600841 gactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtttgacgcaccctacacgactacggtattccgtaggaacctattgcctaacttatcttgtgct 43600742  T
Q  230 acattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgtt-ttttgttatttttatttgatttggaag 327  Q
    | |||  || ||||| |||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43600741 aaattattttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctaggtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttttgttgtttttatttgatttggaag 43600642  T
Q  328 gataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaacc 375  Q
    |||  ||||||| || |||| ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  43600641 gat--aaatcctttgactacgtaccc-taaagggaagggatcaaaacc 43600597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 13478068 - 13478255
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13478068 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttatttgtggga-gggaaaaaatgagtaaaaa 13478166  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttac 212  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13478167 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttac 13478255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 248 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10442350 - 10442212
Alignment:
Q  248 aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10442350 aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctac 10442251  T
Q  348 atacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10442250 atacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 10442212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 36476574 - 36476884
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36476574 tgtgctcgtgattttcagatatcaaaccattaattgatttgaatcttcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 36476673  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||||  | |||||||||| || || ||||| |||| | ||||| ||||||||| ||    
T  36476674 cccttat-gagactttagatccgggggttggtttcgcatagggaaggtattaagcaccctaaacgacttcggtactccgaatgaaccgcttacctaaatt 36476772  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt-ttgtta-tttttatt 316  Q
    ||| | ||||| |||  ||| | | ||| ||||||||| ||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  36476773 atcatttgctaaattacttgttcatttgaaaaattattgcc-caatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttgttgttattttttatt 36476871  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  36476872 tgatttggaagga 36476884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29032133 - 29031903
Alignment:
Q  105 aaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtagga 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || || ||||| |||| | ||    
T  29032133 aaaaaatgagtaaaaacccttgtcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaacga 29032034  T
Q  204 acctcttacctaacttatcttgtgctacattcatt--gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgtt 300  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29032033 accgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtt 29031935  T
Q  301 ttttgttatttttatttgatttggaaggataa 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29031934 tttggttatttttatttgatttggaaggataa 29031903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38255780 - 38255594
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38255780 cccgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 38255681  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| |||||    
T  38255680 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttac 38255594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Original strand, 48498519 - 48498706
Alignment:
Q  29 cgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatc 128  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48498519 cgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 48498618  T
Q  129 gagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttaccta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  48498619 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttaccta 48498706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 38263355 - 38263200
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38263355 cccgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 38263256  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||||||||||    
T  38263255 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaa 38263200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43139255 - 43139053
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgat-ttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| | ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43139255 tgtgctccctgattttcgggtatcaaaccatcaattggtattgaaccttcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaaaggaaaaagtgagtaaa 43139156  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  43139155 aaccctta--gagactt-ggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctacggtatttcgtaggaacctcttgcctaatt 43139059  T
Q  219 tatctt 224  Q
    ||||||    
T  43139058 tatctt 43139053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4324083 - 4323863
Alignment:
Q  100 aagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccg 198  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |   ||||||||||| || |||||| || || ||||| ||||| |    
T  4324083 aagggaaaaaat-agtaaaaatccttat-gagactttggatccaggggttggtttcaataagggaaggtgttaagcacccgaatcgactacgatattctg 4323986  T
Q  199 taggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtat 297  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||| ||||| |||  || ||||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  4323985 taggaacctcttgcctactttaacttttgctaaattattttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctagatgaaagaaaggggggagaagaagtat 4323886  T
Q  298 gttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    || ||||||| |||||||||||||    
T  4323885 gt-ttttgttgtttttatttgatt 4323863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 385
Target Start/End: Original strand, 33533462 - 33533527
Alignment:
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33533462 atttggaaggattaac-tcctttgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 33533527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 15951497 - 15951867
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951497 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 15951596  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15951597 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 15951696  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15951697 atcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 15951796  T
Q  319 atttggaaggat---aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951797 atttggaaggataaaaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 15951867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 34541819 - 34542186
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34541819 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 34541918  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34541919 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 34542018  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34542019 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 34542118  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34542119 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 34542186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 34527846 - 34528212
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34527846 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 34527945  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34527946 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 34528045  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34528046 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 34528145  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34528146 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 34528212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 35040313 - 35039948
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35040313 tgtgctcgtgattttcggatatcaaacaattaattgatttgaaccgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 35040214  T
Q  121 -ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35040213 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 35040114  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  35040113 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagcat-tttttggttatttttatttga 35040015  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35040014 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 35039948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 15942988 - 15943356
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15942988 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 15943087  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15943088 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 15943187  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15943188 tcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 15943287  T
Q  320 tttggaaggat--aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15943288 cttggaaggataaaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 15943356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 35140232 - 35139865
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35140232 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 35140133  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35140132 acccttattgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 35140033  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35140032 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 35139933  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35139932 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 35139865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 35148573 - 35148206
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148573 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 35148474  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35148473 acccttattgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 35148374  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35148373 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 35148274  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148273 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 35148206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 26731632 - 26732000
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26731632 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 26731731  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26731732 accctcatcaagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaattt 26731831  T
Q  220 atc-ttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26731832 atctttgtgctaaattcattgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttactt 26731931  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26731932 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 26732000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 42572999 - 42573367
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42572999 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 42573098  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42573099 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 42573198  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    | ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42573199 accttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 42573298  T
Q  319 atttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42573299 atttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 42573367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 42564376 - 42564743
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42564376 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 42564475  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42564476 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 42564575  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42564576 ccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 42564675  T
Q  320 tttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42564676 tttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 42564743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 17684935 - 17685301
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684935 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17685034  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17685035 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacatgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 17685134  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
     ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17685135 ccttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 17685234  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17685235 attggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 17685301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 41232315 - 41232681
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41232315 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtaaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 41232414  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41232415 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 41232514  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41232515 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 41232614  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41232615 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 41232681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 6855957 - 6856323
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6855957 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcttgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 6856056  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  6856057 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 6856156  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6856157 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 6856256  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856257 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 6856323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25496207 - 25495842
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25496207 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 25496108  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||    
T  25496107 ccttcatcgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattacataggaacctcttacctagatta 25496008  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25496007 tcttgtgctaaattcatttgcttac-tgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 25495909  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25495908 tttggaaagataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 25495842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 44375413 - 44375045
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaaa 119  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44375413 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 44375314  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44375313 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 44375214  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattaccta--aaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44375213 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaactgttacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttattt 44375114  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44375113 gatttggaaggataaaaatcatatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 44375045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 44390994 - 44390626
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaaa 119  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44390994 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 44390895  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44390894 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 44390795  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattaccta--aaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44390794 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaactgttacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttattt 44390695  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44390694 gatttggaaggataaaaatcatatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 44390626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 24 - 386
Target Start/End: Original strand, 42247477 - 42247841
Alignment:
Q  24 gctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaaaacc 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42247477 gctcctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcttcaatctttgaattctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaaacc 42247576  T
Q  123 ctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatc 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42247577 cttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccataggaacctcttacctaatttatc 42247676  T
Q  223 ttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42247677 ttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 42247776  T
Q  322 tggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42247777 tggaaggataaaaatcctatgcatacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 42247841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 20364529 - 20364895
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20364529 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatctgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 20364628  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  20364629 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaaggaaatgtgctagcaccctaagcgtctacggtattccataggaacctcttacctaattta 20364728  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20364729 tcttgtgctaaattcattggttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggaggagaagaagtatgtttttggtcatttttatttga 20364828  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20364829 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 20364895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 26717499 - 26717867
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26717499 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctttatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 26717598  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26717599 accctcatcaagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaattt 26717698  T
Q  220 atc-ttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26717699 atctttgtgctaaattcattgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttactt 26717798  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26717799 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 26717867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24293803 - 24293436
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293803 ctgtgctcgtgattttcggatctcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 24293704  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24293703 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgcagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaagaacctcttacctaaatt 24293604  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24293603 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaacggagagagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 24293504  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293503 atttgaaaggataacaatcctctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 24293436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Original strand, 26896523 - 26896895
Alignment:
Q  16 aatactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 115  Q
    |||| |||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26896523 aatattgtgctcgtgatttttggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttatttgtgggaagggaaaaaatgagt 26896622  T
Q  116 aaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttaccta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  26896623 aaaaacccttatcgagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctatggtatcccataggaacctcttaccta 26896722  T
Q  216 acttatcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttt 313  Q
      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26896723 gattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaatttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttt 26896822  T
Q  314 atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896823 atttgatttggaaggataaaagtcctctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 26896895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24287224 - 24286868
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24287224 gattttcggatctcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgagaagggaaaaa-tgagtaaaaacccttatcg 24287126  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24287125 agactttggattcgggggttggttacgcgcagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaagaacctcttacctaaattatcttgtgct 24287026  T
Q  230 acattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagg 328  Q
    | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24287025 aaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaacggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgaaagg 24286926  T
Q  329 ataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24286925 ataacaatcctctgcctacatacctttaaagaaaagggatcaaaaccaatatagttca 24286868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 30524517 - 30524827
Alignment:
Q  21 tgtgctcc-cgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30524517 tgtgctcctcgattttcggatatcagaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggacaaaatgagtaaaa 30524616  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30524617 acccttattgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 30524716  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttg-ttatttttatttg 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30524717 atcttgtgctacattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttatttttatttg 30524816  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  30524817 atttggaagga 30524827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20921089 - 20920728
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20921089 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaggaaaacaatgagtaaaaa 20920990  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  20920989 ccctta---agattttggatttgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttgcctaattta 20920893  T
Q  221 tcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20920892 tcttgtgctaaatcaatttgcttatttgaaaattattgcctaaacatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 20920793  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20920792 tttggaaggacaaaaatcctttccctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttc 20920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16275033 - 16274668
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275033 ctgtgctcacgattttcggatgtcaaatcattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 16274934  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  16274933 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 16274834  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16274833 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaat----ggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 16274738  T
Q  317 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274737 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 16274668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16284208 - 16283844
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16284208 tgtgctcacgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16284109  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||    
T  16284108 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 16284009  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16284008 atcttgtgcaaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaat----ggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 16283913  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283912 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 16283844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28481600 - 28481239
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28481600 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggggaaaaatgagttaaaa 28481501  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||    
T  28481500 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagatta 28481404  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28481403 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 28481304  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  28481303 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 28481239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15600991 - 15600680
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15600991 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 15600892  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  15600891 cctttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcatctacggtattccgtaggaaccgcttacctagatta 15600792  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgtta-tttttattt 317  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15600791 tcttgtgctaaatttatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttttattt 15600692  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  15600691 gatttggaagga 15600680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21151689 - 21151341
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151689 tgtgctcgcgattttcggatatcacaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 21151590  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  21151589 ccctta---agactctgaattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 21151493  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21151492 tattgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 21151394  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaa 373  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | |||||||||||||    
T  21151393 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaa 21151341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 27 - 385
Target Start/End: Original strand, 33306561 - 33306919
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33306561 cccgatttttggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 33306660  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33306661 tcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagattatcttgt 33306760  T
Q  227 gct-acattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttgg 324  Q
    ||| | |   |||||||| ||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33306761 gctaaaaaaaattgcttatttgaaaaattattacct-gaactctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttagttatttttatttgatttgg 33306859  T
Q  325 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| | |||||||    
T  33306860 aagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttaggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 33306919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35304954 - 35304648
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35304954 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactc--gatttttatttgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 35304857  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||  |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  35304856 accccta---agtctttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 35304760  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35304759 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaatttattacctaaaaatttaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 35304660  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  35304659 gatttggaagga 35304648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 3754885 - 3755193
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3754885 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 3754984  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3754985 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 3755084  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||  ||  ||| ||| ||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3755085 tcttgtgctaagttacttgtttatttgaaaaattatcgcct-aatgtctaaatgaaagaatggagggagaagaagcatgtttttggttatttttatttga 3755183  T
Q  320 tttggaagga 329  Q
    ||||||||||    
T  3755184 tttggaagga 3755193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34437347 - 34437039
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34437347 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 34437248  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  34437247 cccttatcgagactttggattcgggggttgattatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 34437148  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||   |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34437147 tcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 34437049  T
Q  320 tttggaagga 329  Q
    ||||||||||    
T  34437048 tttggaagga 34437039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29855600 - 29855291
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29855600 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaaggtaaaaaatgagtaaaaa 29855501  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  29855500 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtccatggtattccataggaacctcttacctaaatta 29855401  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttg--aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    | |||||||| | |  ||| ||| |||  ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29855400 ttttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 29855302  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  29855301 atttggaagga 29855291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2653294 - 2652981
Alignment:
Q  16 aatactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 115  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2653294 aatattgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagt 2653195  T
Q  116 aaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttaccta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653194 aaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttaccta 2653095  T
Q  216 acttatcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttta 314  Q
      |||||||||||||  ||  ||| ||| ||| ||||||||  ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2653094 gattatcttgtgctaagttacttgtttatttgaaaaattatcgcct-aatgtctaaatgaaaggatggagggagaagaagcatgtttttggttattttta 2652996  T
Q  315 tttgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||||    
T  2652995 tttgatttggaagga 2652981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 3764935 - 3765244
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3764935 ctgtgctcgcgattttcggatgttaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 3765034  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3765035 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 3765134  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||||  ||  ||| ||| ||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3765135 atcttgtgctaagttacttgtttatttgaaaaattatcgcct-aatgtctaaatgaaagaatggagggagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 3765233  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  3765234 atttggaagga 3765244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 34068674 - 34069030
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  34068674 tgtgctcgtgattttcgaatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttatccgtgggaatggaaaaaatgagtaaaaa 34068773  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  34068774 ccctta---agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtactagcgtcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 34068870  T
Q  221 tcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    |||||||||| ||||||   || |   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34068871 tcttgtgctaaattcat---ttgcaaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 34068966  T
Q  321 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||   | |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34068967 ttggaaggat-tgactcccctgcctatatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 34069030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 10681324 - 10681635
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10681324 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 10681423  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||    
T  10681424 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 10681523  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10681524 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattatcacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 10681623  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  10681624 gatttggaagga 10681635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22187588 - 22187281
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagta-aaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22187588 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaaccctt 22187489  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  22187488 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatctt 22187389  T
Q  225 gtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatt 321  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22187388 gtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagcaggagtatgtttttggttatttttatttgatt 22187289  T
Q  322 tggaagga 329  Q
    ||||||||    
T  22187288 tggaagga 22187281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 21858556 - 21858869
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858556 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattatttgatttgaatcgtcgatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 21858655  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |    
T  21858656 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacttaaat 21858755  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttat 315  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21858756 tatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 21858855  T
Q  316 ttgatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||||    
T  21858856 ttgatttggaagga 21858869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 21850122 - 21850434
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850122 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattatttgatttgaatcgtcgatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 21850221  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||    
T  21850222 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacttaaatt 21850321  T
Q  220 atcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21850322 atcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 21850421  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  21850422 tgatttggaagga 21850434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42245808 - 42245497
Alignment:
Q  21 tgtgctcc-cgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42245808 tgtgctcctcgattttcggatatcaaaccatcgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatctttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 42245709  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||  |    
T  42245708 acccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtattccgaaggaaccgcttacctagat 42245609  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42245608 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 42245510  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||||||||    
T  42245509 tgatttggaagga 42245497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 27680929 - 27681237
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27680929 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 27681028  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  27681029 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 27681128  T
Q  226 tgctacattcatt--gcttacttg--aaaattattacc-taaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgat 320  Q
    ||||| |||| ||  |||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27681129 tgctaaattcgtttggcttacttgaaaaaattattaccaaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 27681228  T
Q  321 ttggaagga 329  Q
    |||||||||    
T  27681229 ttggaagga 27681237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Original strand, 31354710 - 31355077
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31354710 tgtgctccctgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaa 31354809  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||      
T  31354810 aacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaga 31354909  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttat 315  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31354910 ttatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 31355009  T
Q  316 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  31355010 ttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 31355077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34685960 - 34685593
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34685960 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaa 34685861  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaac 217  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| |||||||||     
T  34685860 aacccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaa 34685761  T
Q  218 ttatcttgtgctacattcatt--gcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttattttta 314  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34685760 ttatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 34685662  T
Q  315 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  34685661 tttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 34685593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34708381 - 34708069
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34708381 ctgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 34708282  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| |    
T  34708281 acccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaat 34708182  T
Q  219 tatcttgtgctacattca--ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttat 315  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34708181 tatcttgtgctaaattcacttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 34708083  T
Q  316 ttgatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||||    
T  34708082 ttgatttggaagga 34708069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42386378 - 42386068
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42386378 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 42386279  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  42386278 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagat 42386179  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42386178 tatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 42386080  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  42386079 gatttggaagga 42386068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42401262 - 42400952
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42401262 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 42401163  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  42401162 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagat 42401063  T
Q  219 tatcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42401062 tatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 42400964  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  42400963 gatttggaagga 42400952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 329
Target Start/End: Original strand, 11622050 - 11622352
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11622050 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 11622149  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| || | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  11622150 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaagatgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacttagattatcttgtgc 11622249  T
Q  229 tacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaa 326  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  11622250 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttgtttttatttgatttggga 11622349  T
Q  327 gga 329  Q
    |||    
T  11622350 gga 11622352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Original strand, 38153999 - 38154189
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38153999 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 38154098  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctctta 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38154099 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctctta 38154189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25493475 - 25493307
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25493475 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 25493376  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtcta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25493375 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtcta 25493307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 30683105 - 30683313
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30683105 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 30683204  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  30683205 ccct-ttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttagatta 30683303  T
Q  221 tcttgtgcta 230  Q
    ||||||||||    
T  30683304 tcttgtgcta 30683313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 19655563 - 19655769
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19655563 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggagggaaaaaaatgagtaaaaa 19655662  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||    
T  19655663 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacataattta 19655759  T
Q  221 tcttgtgcta 230  Q
    ||||||||||    
T  19655760 tcttgtgcta 19655769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21111614 - 21111315
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21111614 ctgtgctcttgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaa 21111515  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    |||||     |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21111514 accct-----agactttgaattcagaggttggttacgcgaagggaaggtgctagaaccctaagcgtctatggtattccgtaggaacctcttgcctaaatt 21111420  T
Q  220 atcttgtgctacatt-cattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatg--ttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||  |||| | ||||  || |||||||| || ||||||| ||||  ||||||||| || |||||    
T  21111419 atcttgtgctaaattattttgcttatttgaaaattatt-gctaagagtctaggtggaagaatgggggtagaagaaatatgttttttttgttgttgttatt 21111321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 21320618 - 21320825
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattga-ttgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21320618 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccatttaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtggga-gggaaaaaatgagtaaa 21320716  T
Q  119 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||| |   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  21320717 aaccctta---agactttggattcaggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacctaatt 21320813  T
Q  219 tatcttgtgcta 230  Q
    ||||||||||||    
T  21320814 tatcttgtgcta 21320825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14630662 - 14630457
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgattt-gaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14630662 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 14630565  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||    
T  14630564 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaattt 14630468  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||    
T  14630467 atcttgtgcta 14630457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 38611415 - 38611545
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38611415 tgtgctcgtgattttcggatatcaaatcattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 38611514  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggtta 154  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  38611515 ccctta---agactttggattcgggggttggtta 38611545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 290 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20623692 - 20623596
Alignment:
Q  290 agaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623692 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcccatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 20623596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 187
Target Start/End: Original strand, 39842078 - 39842174
Alignment:
Q  88 tttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtct 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39842078 tttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta---agaatttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtct 39842174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 385
Target Start/End: Original strand, 17095634 - 17095777
Alignment:
Q  237 ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaat 336  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |    
T  17095634 ttgcttatttgaaaattattgc-taagagtctaagtgaaagaatggggg---aagaagtatgtcttttgttgtttttatttgatttggaaggattaac-t 17095728  T
Q  337 cctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17095729 cttttgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 17095777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Original strand, 23283970 - 23284032
Alignment:
Q  32 ttttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23283970 ttttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattc 23284032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 301 - 385
Target Start/End: Original strand, 17069151 - 17069234
Alignment:
Q  301 ttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17069151 ttttgttgtttttatttgatttggaaggattaac-tcttttccctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 17069234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 385
Target Start/End: Original strand, 17075144 - 17075227
Alignment:
Q  301 ttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17075144 ttttgttgtttttatttgatttggaaggattaac-tcttttccctacatacccttcaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 17075227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1804 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold1804
Description:

Target: scaffold1804; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 359 - 1
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaaa 119  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  359 tgtgctcgtgattttcggatattaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcttgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 260  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  259 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattctgtaggaacctcttacctaattt 160  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  159 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaatgaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 60  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaat 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 109746 - 109390
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  109746 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt-tcg 109648  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  109647 agactttggattcgtgggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgct 109548  T
Q  230 acattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagga 329  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  109547 aaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctgagtgaaagaatggagggagaagaagcattttttttgttatttttatttggttttgaagga 109448  T
Q  330 ta-aaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109447 taaaaaatcatatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 109390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10545 - 10178
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10545 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 10446  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctctta-cctaactt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10445 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttaccctaaatt 10346  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaatt-attacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10345 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 10246  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10245 atttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttca 10178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30287 - 29929
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30287 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactc--gatttttattcgtgggaagagaaaaaatgagtaaaa 30190  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30189 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaagttgctagcaccctaagtgtctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 30090  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattaccta--aaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30089 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttattt 29990  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatg 379  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29989 gatttggaaggataaaaatcctctgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatg 29929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11585 - 11481
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11585 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctctgaacactcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 11486  T
Q  120 accct 124  Q
    |||||    
T  11485 accct 11481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 3)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 188931 - 188564
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  188931 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccgttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 188832  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||    
T  188831 cccttgttgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccatatgatcctcttacctaaatta 188732  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  188731 tcttgtgctaaattcatttgctaacttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 188632  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  188631 ttttggaaagataaaaatcccttgcctacatacccttaaagaaaatggatcaaaaccaatgtagttca 188564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 195119 - 194811
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195119 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 195020  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  195019 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagagaaggtgctagcaccctaagcatctatggtattccataggaacctcttacctagatt 194923  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  194922 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 194823  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  194822 gatttggaagga 194811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 159462 - 159154
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgatt-gatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  159462 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgatttgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 159363  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  159362 acccttatcgagactt-ggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 159264  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| | |  ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  159263 atcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttatttg 159165  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||||||||    
T  159164 atttggaagga 159154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4628 - 4297
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4628 tgtgctcgtgatattcggatatcaaaccattaattgatttgagtcgtcaatctttgaactc--gatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 4531  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  4530 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacacgaagggaaggtgctagcactctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatta 4431  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttga 319  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4430 tcttgtgctaaattcatttgcttacttaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 4331  T
Q  320 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4330 tttggaaggataaaaatcctttgcctacgtaccc 4297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Original strand, 9802 - 10165
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9802 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 9901  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||    
T  9902 ccctta---agactttggattcgggcgttggttacgcgaagggaatgtgttagcaccctaagcgtctatggtattccatagaaacctcttacctagatta 9998  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9999 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggctatttttatttg 10098  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10099 atttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaagaaaaaggatcaaaaccaatgtagttca 10165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 80337 - 80648
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80337 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 80436  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||    
T  80437 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaacgtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagatt 80536  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  80537 atcttgttctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 80636  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  80637 gatttggaagga 80648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 63938 - 64246
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa-tgagtaaaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  63938 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 64037  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||    
T  64038 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaaaggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagatt 64134  T
Q  220 atcttgtgctacatt-cattgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  64135 atcttgtgctaaattcctttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaactgaaagaatggaggaagaagaagtatatttttggttatttttattt 64234  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||| ||||    
T  64235 gatttggtagga 64246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 21450 - 21760
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21450 ctgtgctcttgattttcagatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaa 21549  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21550 aaccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacaatattccgtaggaacctcttacctaaatt 21649  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21650 atcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggaggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 21749  T
Q  319 atttggaagga 329  Q
    |||||| ||||    
T  21750 atttgggagga 21760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4899 - 4588
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  4899 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaat 4800  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4799 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 4700  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatgga-gggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4699 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 4600  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  4599 gatttggaagga 4588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 63590 - 63227
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  63590 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaatatgagtaaaa 63491  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||    
T  63490 acccttatc--gactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagatt 63393  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  63392 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 63293  T
Q  318 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  63292 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 63227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15237 - 14925
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15237 ctgtgctcacgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 15138  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15137 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacttagatt 15038  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgtt-atttttatt 316  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  15037 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttgttttttatt 14938  T
Q  317 tgatttggaagga 329  Q
    |||||||| ||||    
T  14937 tgatttgggagga 14925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10782 - 10424
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  10782 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtggaaagggagaaaatgaataaaaa 10683  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  10682 ccctta---agcctttatattcgggggttcgttacgcgaagggaaggtgctagcaccttaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 10586  T
Q  221 tcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 318  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10585 tcttgtgctaaattcatttgcatacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 10486  T
Q  319 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtag 382  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10485 atttggaaggat-taactcctttgcctacataccctt-aaggaaagggatcaaaaccaatgtag 10424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 145283 - 145591
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145283 tgtgctcatgattttcggatatcaaaccattaattgatttgagtcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 145382  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 220  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  145383 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcggagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccaaaggaacctcttacctagatta 145479  T
Q  221 tcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttattt 317  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  145480 tcttgtgctaaattcatttgcttacatgaaaaattattacctaaaaaagctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 145579  T
Q  318 gatttggaagga 329  Q
    ||||||||||||    
T  145580 gatttggaagga 145591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 317
Target Start/End: Original strand, 136320 - 136617
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136320 ctgtgctcgtgattttcagatatcaaaccattaattgatttgagtcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 136419  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  136420 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcacgctaagtgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 136516  T
Q  220 atcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacct-aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 316  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  136517 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatatttatt 136616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 82 - 385
Target Start/End: Original strand, 1 - 302
Alignment:
Q  82 tcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaa 100  T
Q  182 gcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatg 281  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  101 gcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagattattttgtgctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatg 200  T
Q  282 gagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgta 381  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||    
T  201 gagggagaagaagtatgtttttggttattttttattgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgta 298  T
Q  382 gttc 385  Q
    ||||    
T  299 gttc 302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 83786 - 83481
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  83786 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaattttcattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta 83687  T
Q  127 tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  83686 tcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttg 83587  T
Q  226 tgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  83586 tgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaaaaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 83487  T
Q  324 gaagga 329  Q
    ||||||    
T  83486 gaagga 83481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 329
Target Start/End: Original strand, 46461 - 46759
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |       
T  46461 gattttcggatattaaaccattatttgatttaaatcgtcaatatttgaactatcgatttttattcgtgggaagcgaaaaaatgagtaaaaatcctta--- 46557  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46558 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtataccataggaacctcttacctagattatcttgtgct 46657  T
Q  230 acattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaag 327  Q
    | ||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46658 aaattcatttaattgcttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag 46757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 255
Target Start/End: Original strand, 29568 - 29803
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29568 ctgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 29667  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29668 acccttatcaagactttggatttgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtcgacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 29767  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29768 atcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat 29803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0455 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0455
Description:

Target: scaffold0455; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Original strand, 3570 - 3936
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3570 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 3669  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||| || ||||||||| || || ||||| |||| ||||||| |||||||   |    
T  3670 acccttatcgagactttggattcgggg-ttggtttcaaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctggat 3768  T
Q  219 tatcttgtgctacattcatt--gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttat 315  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3769 tatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttat 3868  T
Q  316 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||||| ||   |||| ||||||| |||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||    
T  3869 ttgatttggaaggacaag--tcctctgcctacgtacctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 21929 - 22139
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21929 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 22028  T
Q  121 -ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  22029 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 22128  T
Q  220 atcttgtgcta 230  Q
    || ||||||||    
T  22129 attttgtgcta 22139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Original strand, 22707 - 22980
Alignment:
Q  21 tgtgctcc-cgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22707 tgtgctcctcgattttcggatatcaaaccatcgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatctttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 22806  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaact 218  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  22807 acccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 22906  T
Q  219 tatcttgtgctacattca-ttgcttacttg-aaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaag 291  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22907 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 22980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 163 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20028 - 19804
Alignment:
Q  163 gaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacct 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20028 gaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacct 19929  T
Q  261 aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 360  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||||    
T  19928 aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaaga 19830  T
Q  361 aaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19829 aaagggatcaacaccaatgtagttca 19804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15557
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaa-aatgagtaaaaaccctc 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15379 cccgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaaaccctt 15478  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15479 atcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaa 15557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 172731 - 172567
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  172731 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 172632  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgt 185  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  172631 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgt 172567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1199 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1199
Description:

Target: scaffold1199; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 2209 - 2439
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2209 ctgtgctcacgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 2308  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactt 219  Q
    ||||| |   | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  2309 accctta-aaaaaaattggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 2407  T
Q  220 atcttgtgctacattcattgcttacttgaaaa 251  Q
    |||||||||||  ||  ||||||| |||||||    
T  2408 atcttgtgctaactttgttgcttatttgaaaa 2439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9966 - 9796
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9966 tgtgctcctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 9867  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtat 194  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9866 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtat 9796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 16395 - 16555
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16395 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16494  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaa 181  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16495 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaa 16555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 29775 - 29945
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29775 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctctatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 29874  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtat 194  Q
     ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29875 tcctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtat 29945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 32641 - 32772
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32641 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccatttattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgttggaagggaaaaaatgagtaaaa 32740  T
Q  120 accctcatcgagactttggattcgggggttggtta 154  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  32741 accctta---agactttggattcgggggttggtta 32772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 201 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 32622 - 32437
Alignment:
Q  201 ggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatg 298  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  32622 ggaacctcttacttagattatcttatgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaataagtatg 32523  T
Q  299 ttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32522 tttttggttatttttatttgatttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttca 32437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 149 - 329
Target Start/End: Original strand, 421 - 603
Alignment:
Q  149 tggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcatt-gcttacttg 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  421 tggttacccgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttg 520  T
Q  248 aaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaagga 329  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  521 aaaaattattacctaaaaatctaagtgaatgaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Original strand, 337 - 423
Alignment:
Q  12 gttgaatactgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgg 98  Q
    |||| ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  337 gttggataatgtgctcgtgattttcgaatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgg 423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 13635 - 13781
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13734  T
Q  121 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaagg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13735 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaagg 13781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 63488 - 63307
Alignment:
Q  47 ccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa-ccctcatcgagactttggattcggg 145  Q
    ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||    
T  63488 ccattaatcgatttggatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaaccctta---agactttggattcggg 63392  T
Q  146 ggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgcta 230  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  63391 ggttggttacgcgaagggaaggtattagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgcta 63307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 385
Target Start/End: Original strand, 19404 - 19448
Alignment:
Q  341 tgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19404 tgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 19448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 7741 - 7954
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggg-aaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  7741 cccgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaaaagagtaaaaaccctt 7840  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  7841 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 7940  T
Q  225 gtgctacattcatt 238  Q
    |||||| |||||||    
T  7941 gtgctaaattcatt 7954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55909 - 55726
Alignment:
Q  30 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctcatcg 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55909 gattttcggatatcaaacaattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 55810  T
Q  130 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttac 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| |||||    
T  55809 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttac 55726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0945 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0945
Description:

Target: scaffold0945; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 183 - 2
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatt-tttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  183 cccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaattctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 84  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| |||||||    
T  83 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaacc 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 202 - 1
Alignment:
Q  27 cccgattttcggatatcaaaccattga-ttgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctc 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  202 cccgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 103  T
Q  126 atcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  102 atcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatctt 3  T
Q  225 gt 226  Q
    ||    
T  2 gt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 386
Target Start/End: Original strand, 38672 - 38797
Alignment:
Q  261 aaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 360  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38672 aaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 38771  T
Q  361 aaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38772 aaagggatcaaaaccaatgtagttca 38797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1481 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1481
Description:

Target: scaffold1481; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1751 - 1550
Alignment:
Q  131 gactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1751 gactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaagttatcttgtgct 1652  T
Q  230 acattcatt-gcttacttgaaaa-ttattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttgatttggaag 327  Q
    | ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1651 aaattcatttggttacttgaaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag 1552  T
Q  328 ga 329  Q
    ||    
T  1551 ga 1550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 8423 - 8533
Alignment:
Q  21 tgtgctccc-gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8423 tgtgctccctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 8522  T
Q  120 accctcatcga 130  Q
    ||||| |||||    
T  8523 acccttatcga 8533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 74 - 1
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattc 94  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 74 - 1
Alignment:
Q  21 tgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattc 94  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74 tgtgctcgcgattttcggatatccaaccatttattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Original strand, 9947 - 10010
Alignment:
Q  20 ctgtgctcccgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctc 83  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9947 ctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctc 10010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0545 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0545
Description:

Target: scaffold0545; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 386
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8057
Alignment:
Q  340 atgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8011 atgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttca 8057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2020 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2020
Description:

Target: scaffold2020; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 210
Target Start/End: Original strand, 701 - 771
Alignment:
Q  140 ttcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctctt 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||  ||||||||||||    
T  701 ttcggaggttggttacgtgaagggaaggtgttagcaccctaaacgtctatattattctataggaacctctt 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 164794 - 164724
Alignment:
Q  140 ttcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctctt 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||  ||||||||||||    
T  164794 ttcggaggttggttacgtgaagggaaggtgttagcaccctaaacgtctatattattctataggaacctctt 164724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University