View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13541_high_2 (Length: 664)

Name: NF13541_high_2
Description: NF13541
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13541_high_2
NF13541_high_2
[»] chr3 (122 HSPs)
chr3 (306-664)||(17489551-17489909)
chr3 (306-664)||(16492252-16492610)
chr3 (306-664)||(12497949-12498307)
chr3 (306-664)||(14876570-14876928)
chr3 (306-664)||(9522420-9522778)
chr3 (306-664)||(16371114-16371472)
chr3 (306-661)||(16691861-16692216)
chr3 (313-664)||(15348316-15348667)
chr3 (313-664)||(16635481-16635832)
chr3 (313-664)||(43162805-43163156)
chr3 (306-664)||(15208592-15208950)
chr3 (313-664)||(10005308-10005659)
chr3 (313-664)||(10905918-10906269)
chr3 (313-664)||(15589463-15589814)
chr3 (313-664)||(26792470-26792821)
chr3 (313-664)||(48425155-48425506)
chr3 (308-664)||(16806997-16807353)
chr3 (313-664)||(20062125-20062476)
chr3 (313-664)||(6600455-6600806)
chr3 (313-664)||(15402581-15402932)
chr3 (312-664)||(15247854-15248206)
chr3 (313-660)||(53385093-53385440)
chr3 (313-664)||(15338977-15339328)
chr3 (313-664)||(13252398-13252749)
chr3 (313-664)||(16412353-16412704)
chr3 (313-664)||(5425001-5425351)
chr3 (313-664)||(15725005-15725355)
chr3 (7-214)||(6110064-6110271)
chr3 (7-214)||(10572592-10572799)
chr3 (313-664)||(16756656-16757007)
chr3 (7-214)||(15600884-15601091)
chr3 (7-214)||(15607429-15607636)
chr3 (7-211)||(13211305-13211509)
chr3 (7-214)||(13248607-13248814)
chr3 (7-212)||(16482483-16482688)
chr3 (7-208)||(17781118-17781319)
chr3 (7-208)||(10579355-10579556)
chr3 (7-212)||(18522665-18522870)
chr3 (7-214)||(15357586-15357793)
chr3 (30-214)||(8490488-8490672)
chr3 (7-212)||(18519980-18520182)
chr3 (7-208)||(19089745-19089946)
chr3 (7-212)||(17200184-17200389)
chr3 (7-195)||(15342219-15342407)
chr3 (7-212)||(13516813-13517018)
chr3 (53-214)||(18640792-18640953)
chr3 (344-661)||(15015818-15016135)
chr3 (7-208)||(32056900-32057101)
chr3 (7-208)||(1647521-1647726)
chr3 (313-657)||(15227367-15227711)
chr3 (313-657)||(13972187-13972531)
chr3 (313-657)||(14086391-14086735)
chr3 (30-212)||(16200128-16200309)
chr3 (22-214)||(29924971-29925163)
chr3 (22-214)||(29974124-29974316)
chr3 (315-657)||(10420112-10420454)
chr3 (315-657)||(15953035-15953377)
chr3 (36-212)||(16200434-16200609)
chr3 (313-657)||(8759149-8759493)
chr3 (313-657)||(44776965-44777309)
chr3 (315-657)||(13322719-13323061)
chr3 (313-657)||(13941742-13942086)
chr3 (313-657)||(41177240-41177584)
chr3 (315-657)||(18134413-18134755)
chr3 (313-657)||(12850346-12850690)
chr3 (7-207)||(24253388-24253589)
chr3 (313-657)||(16836577-16836921)
chr3 (315-637)||(8274497-8274819)
chr3 (7-108)||(17136465-17136566)
chr3 (331-608)||(18748401-18748678)
chr3 (315-547)||(14571568-14571800)
chr3 (315-637)||(16742801-16743123)
chr3 (565-664)||(11564752-11564851)
chr3 (416-619)||(17192915-17193118)
chr3 (315-653)||(12360613-12360951)
chr3 (315-657)||(11303840-11304182)
chr3 (315-637)||(10383689-10384011)
chr3 (315-657)||(11961101-11961443)
chr3 (315-637)||(15576470-15576792)
chr3 (315-619)||(13975161-13975465)
chr3 (522-657)||(4678365-4678500)
chr3 (585-664)||(14126665-14126744)
chr3 (315-657)||(16329726-16330068)
chr3 (150-212)||(18534758-18534820)
chr3 (315-460)||(47123664-47123809)
chr3 (416-605)||(6712539-6712728)
chr3 (250-306)||(6109972-6110028)
chr3 (250-306)||(8490396-8490452)
chr3 (250-306)||(13248515-13248571)
chr3 (486-657)||(13001800-13001971)
chr3 (313-657)||(16380995-16381338)
chr3 (250-306)||(13211211-13211267)
chr3 (250-306)||(18640989-18641045)
chr3 (468-657)||(17492503-17492692)
chr3 (167-212)||(18510924-18510969)
chr3 (528-657)||(26009060-26009189)
chr3 (250-306)||(17136137-17136193)
chr3 (447-637)||(6152949-6153139)
chr3 (264-306)||(10579611-10579653)
chr3 (555-657)||(14573889-14573991)
chr3 (250-306)||(15607672-15607729)
chr3 (250-306)||(15351237-15351293)
chr3 (250-306)||(15357829-15357885)
chr3 (250-306)||(16482727-16482782)
chr3 (250-306)||(17200427-17200483)
chr3 (250-306)||(18519885-18519941)
chr3 (264-306)||(10572848-10572890)
chr3 (250-307)||(1647768-1647825)
chr3 (250-306)||(15601127-15601184)
chr3 (250-306)||(13516719-13516775)
chr3 (250-306)||(17781358-17781414)
chr3 (250-306)||(19089985-19090041)
chr3 (250-306)||(32057144-32057200)
chr3 (454-637)||(14183010-14183193)
chr3 (250-306)||(18510829-18510885)
chr3 (250-306)||(18522570-18522626)
chr3 (250-298)||(18534671-18534719)
chr3 (331-514)||(21686681-21686864)
chr3 (369-481)||(267512-267624)
chr3 (539-619)||(21189630-21189710)
chr3 (250-306)||(29924879-29924935)
chr3 (250-306)||(29974032-29974088)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (306-664)||(6485-6843)
scaffold0403 (555-657)||(3153-3255)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (306-664)||(14152-14510)
scaffold0106 (408-664)||(17657-17912)
scaffold0106 (315-657)||(31532-31874)
[»] chr8 (85 HSPs)
chr8 (306-664)||(21788634-21788991)
chr8 (306-664)||(21166812-21167170)
chr8 (306-664)||(21394140-21394498)
chr8 (306-664)||(19978115-19978473)
chr8 (306-664)||(21251090-21251447)
chr8 (306-664)||(23650189-23650547)
chr8 (310-664)||(21922010-21922364)
chr8 (306-664)||(15533528-15533886)
chr8 (306-664)||(16408320-16408678)
chr8 (313-664)||(19112845-19113196)
chr8 (306-664)||(32600292-32600650)
chr8 (306-664)||(30313419-30313777)
chr8 (313-664)||(17674298-17674649)
chr8 (306-664)||(22046521-22046879)
chr8 (306-664)||(22133316-22133674)
chr8 (306-664)||(22164466-22164824)
chr8 (313-664)||(20018025-20018376)
chr8 (318-664)||(19485145-19485491)
chr8 (306-664)||(22377729-22378086)
chr8 (306-664)||(22383904-22384261)
chr8 (318-664)||(22120449-22120795)
chr8 (316-664)||(22987359-22987707)
chr8 (7-214)||(21940665-21940872)
chr8 (13-212)||(28554885-28555084)
chr8 (7-212)||(22171491-22171694)
chr8 (7-208)||(6094129-6094330)
chr8 (306-658)||(20396406-20396758)
chr8 (7-208)||(24642655-24642856)
chr8 (434-664)||(18856853-18857083)
chr8 (408-664)||(23949170-23949425)
chr8 (318-657)||(20388259-20388598)
chr8 (461-660)||(22040162-22040361)
chr8 (306-465)||(22032180-22032339)
chr8 (313-657)||(19851566-19851910)
chr8 (313-657)||(19857602-19857946)
chr8 (313-657)||(20010182-20010526)
chr8 (81-208)||(24636860-24636987)
chr8 (315-655)||(23655084-23655424)
chr8 (313-657)||(21840572-21840916)
chr8 (313-657)||(22051018-22051362)
chr8 (313-657)||(31571124-31571468)
chr8 (315-657)||(1266396-1266737)
chr8 (315-544)||(20008007-20008236)
chr8 (312-431)||(23949043-23949162)
chr8 (315-541)||(21681868-21682094)
chr8 (315-637)||(16877397-16877719)
chr8 (315-637)||(21196804-21197126)
chr8 (315-637)||(20652635-20652957)
chr8 (315-657)||(22061715-22062057)
chr8 (331-637)||(22315364-22315670)
chr8 (315-637)||(21850639-21850961)
chr8 (306-394)||(15441329-15441417)
chr8 (315-637)||(6603815-6604137)
chr8 (315-541)||(21324807-21325033)
chr8 (315-657)||(29303708-29304050)
chr8 (315-657)||(31416756-31417098)
chr8 (315-637)||(6679268-6679590)
chr8 (315-657)||(14565299-14565641)
chr8 (315-460)||(804152-804297)
chr8 (416-637)||(23157313-23157534)
chr8 (324-640)||(19863223-19863539)
chr8 (324-640)||(19867860-19868176)
chr8 (315-481)||(22982593-22982759)
chr8 (250-308)||(22070106-22070164)
chr8 (315-460)||(12304915-12305060)
chr8 (250-306)||(21940573-21940629)
chr8 (528-657)||(20975933-20976062)
chr8 (250-306)||(6094031-6094087)
chr8 (250-306)||(22171396-22171452)
chr8 (254-306)||(24642556-24642608)
chr8 (10-202)||(38232380-38232570)
chr8 (250-306)||(28554791-28554847)
chr8 (315-430)||(16265127-16265242)
chr8 (135-193)||(2375027-2375085)
chr8 (334-484)||(25282307-25282457)
chr8 (315-433)||(28982514-28982632)
chr8 (315-433)||(28987734-28987852)
chr8 (23-184)||(32872857-32873019)
chr8 (315-368)||(27347383-27347436)
chr8 (113-176)||(10920234-10920297)
chr8 (318-481)||(24818074-24818237)
chr8 (589-657)||(22371371-22371439)
chr8 (269-306)||(24636605-24636642)
chr8 (585-657)||(12305185-12305257)
chr8 (525-637)||(22982801-22982913)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (306-664)||(7090514-7090872)
chr4 (306-664)||(16252017-16252375)
chr4 (313-664)||(12523765-12524116)
chr4 (313-664)||(18297294-18297645)
chr4 (313-664)||(27711425-27711776)
chr4 (306-664)||(16355017-16355375)
chr4 (313-664)||(12476689-12477040)
chr4 (313-664)||(19778365-19778716)
chr4 (313-664)||(29038976-29039327)
chr4 (306-664)||(14680649-14681007)
chr4 (306-664)||(18227018-18227376)
chr4 (313-664)||(23955836-23956187)
chr4 (313-664)||(8053195-8053546)
chr4 (313-664)||(8386501-8386852)
chr4 (318-664)||(14303550-14303896)
chr4 (313-664)||(14266471-14266822)
chr4 (313-664)||(40473129-40473480)
chr4 (306-664)||(14850938-14851296)
chr4 (306-661)||(14159574-14159929)
chr4 (306-660)||(14652390-14652744)
chr4 (7-214)||(19926760-19926967)
chr4 (7-214)||(26970463-26970670)
chr4 (7-214)||(55612683-55612890)
chr4 (7-214)||(868597-868804)
chr4 (7-214)||(5707320-5707527)
chr4 (7-214)||(26963640-26963847)
chr4 (7-212)||(18262214-18262419)
chr4 (7-214)||(5713948-5714155)
chr4 (7-214)||(10621333-10621540)
chr4 (7-214)||(10628412-10628619)
chr4 (368-664)||(1639997-1640293)
chr4 (7-212)||(18269070-18269280)
chr4 (7-212)||(28393134-28393339)
chr4 (7-212)||(4426604-4426808)
chr4 (7-202)||(8845215-8845410)
chr4 (7-202)||(8858179-8858374)
chr4 (306-502)||(15149740-15149936)
chr4 (324-656)||(15414866-15415198)
chr4 (497-664)||(15147456-15147623)
chr4 (315-657)||(15003203-15003545)
chr4 (317-657)||(15070506-15070846)
chr4 (99-214)||(12357136-12357251)
chr4 (359-522)||(16676417-16676580)
chr4 (317-637)||(55375217-55375537)
chr4 (414-657)||(15077825-15078068)
chr4 (7-206)||(20311299-20311499)
chr4 (315-657)||(15358929-15359271)
chr4 (315-656)||(15246015-15246356)
chr4 (374-658)||(8706068-8706352)
chr4 (313-657)||(51606020-51606364)
chr4 (315-637)||(13247736-13248058)
chr4 (315-637)||(15293016-15293338)
chr4 (315-657)||(27900477-27900819)
chr4 (317-657)||(1649116-1649456)
chr4 (315-657)||(20891073-20891415)
chr4 (331-613)||(12132293-12132574)
chr4 (315-657)||(16146003-16146345)
chr4 (313-421)||(15364475-15364583)
chr4 (315-657)||(3264633-3264975)
chr4 (7-208)||(10677555-10677753)
chr4 (7-208)||(10891195-10891393)
chr4 (315-637)||(14997407-14997729)
chr4 (7-208)||(5668125-5668327)
chr4 (315-613)||(9290926-9291224)
chr4 (315-657)||(11207070-11207412)
chr4 (315-481)||(16445227-16445393)
chr4 (8-212)||(5616215-5616421)
chr4 (7-208)||(35223576-35223767)
chr4 (313-508)||(16752682-16752877)
chr4 (318-657)||(33223012-33223351)
chr4 (250-308)||(19927003-19927061)
chr4 (315-657)||(29453376-29453718)
chr4 (250-306)||(5713856-5713912)
chr4 (250-306)||(26963548-26963604)
chr4 (250-306)||(26970371-26970427)
chr4 (318-501)||(9849473-9849656)
chr4 (331-637)||(12342722-12343028)
chr4 (250-306)||(5707228-5707284)
chr4 (250-306)||(10621576-10621632)
chr4 (250-306)||(12357044-12357100)
chr4 (250-310)||(17142372-17142432)
chr4 (250-304)||(868507-868561)
chr4 (250-306)||(10628655-10628711)
chr4 (250-306)||(55612594-55612650)
chr4 (324-640)||(18549916-18550234)
chr4 (252-306)||(28393380-28393434)
chr4 (250-307)||(4426847-4426904)
chr4 (315-460)||(44661902-44662047)
chr4 (250-306)||(18268976-18269032)
chr4 (98-165)||(39074278-39074346)
chr4 (7-188)||(21454137-21454319)
chr4 (250-299)||(55992680-55992729)
chr4 (331-483)||(16685361-16685513)
chr4 (105-164)||(11161913-11161972)
chr4 (250-291)||(5668371-5668412)
chr4 (250-298)||(8845118-8845166)
chr4 (250-298)||(8858082-8858130)
chr4 (250-290)||(18262136-18262176)
[»] chr5 (87 HSPs)
chr5 (306-664)||(25423203-25423561)
chr5 (306-664)||(21984319-21984677)
chr5 (306-664)||(23573756-23574114)
chr5 (306-664)||(23516555-23516913)
chr5 (306-664)||(20798774-20799132)
chr5 (313-664)||(19769981-19770332)
chr5 (313-664)||(40708801-40709152)
chr5 (313-664)||(16356523-16356874)
chr5 (306-661)||(23440239-23440594)
chr5 (313-664)||(34566515-34566866)
chr5 (313-664)||(14999753-15000104)
chr5 (313-664)||(27685414-27685765)
chr5 (313-664)||(37291510-37291861)
chr5 (306-664)||(21498050-21498408)
chr5 (313-664)||(27668504-27668855)
chr5 (313-664)||(27610375-27610726)
chr5 (313-661)||(27518428-27518776)
chr5 (313-664)||(22134689-22135040)
chr5 (313-664)||(22332901-22333252)
chr5 (313-664)||(41770863-41771214)
chr5 (306-639)||(18775791-18776124)
chr5 (313-664)||(22348446-22348795)
chr5 (318-664)||(29476087-29476433)
chr5 (306-664)||(26738719-26739077)
chr5 (317-661)||(23471254-23471598)
chr5 (368-664)||(21339300-21339596)
chr5 (306-664)||(20468110-20468468)
chr5 (7-214)||(24695466-24695673)
chr5 (7-214)||(18569863-18570070)
chr5 (7-212)||(19714498-19714703)
chr5 (7-208)||(19707218-19707419)
chr5 (313-657)||(24749575-24749919)
chr5 (315-657)||(21890780-21891122)
chr5 (313-657)||(17269354-17269698)
chr5 (315-657)||(21563994-21564329)
chr5 (313-632)||(24735657-24735976)
chr5 (315-657)||(20821458-20821800)
chr5 (315-657)||(28894963-28895305)
chr5 (315-657)||(28923789-28924131)
chr5 (408-664)||(21404936-21405194)
chr5 (315-637)||(11210735-11211057)
chr5 (315-657)||(22461957-22462299)
chr5 (423-658)||(21831763-21831998)
chr5 (315-657)||(20773765-20774107)
chr5 (315-544)||(23442427-23442656)
chr5 (30-209)||(27347501-27347679)
chr5 (315-657)||(22235941-22236283)
chr5 (315-637)||(21937229-21937551)
chr5 (315-637)||(27011089-27011411)
chr5 (7-208)||(22547016-22547217)
chr5 (315-657)||(23080110-23080452)
chr5 (315-637)||(24581216-24581538)
chr5 (105-214)||(39537962-39538071)
chr5 (313-452)||(24737011-24737150)
chr5 (315-657)||(22381204-22381546)
chr5 (315-657)||(22502684-22503026)
chr5 (30-210)||(17285755-17285935)
chr5 (315-657)||(37545517-37545860)
chr5 (315-657)||(14887012-14887354)
chr5 (315-460)||(24798615-24798760)
chr5 (315-460)||(25848080-25848225)
chr5 (315-657)||(20342287-20342629)
chr5 (306-370)||(21343666-21343730)
chr5 (331-490)||(23503464-23503623)
chr5 (105-208)||(31886537-31886640)
chr5 (317-394)||(20573546-20573623)
chr5 (30-210)||(17298908-17299088)
chr5 (250-306)||(24695709-24695765)
chr5 (7-148)||(18807034-18807175)
chr5 (250-306)||(19714742-19714798)
chr5 (9-101)||(39538701-39538793)
chr5 (250-306)||(19707462-19707518)
chr5 (306-418)||(21662300-21662412)
chr5 (306-418)||(21665761-21665873)
chr5 (250-306)||(27347722-27347778)
chr5 (585-657)||(28916434-28916506)
chr5 (251-306)||(39537870-39537925)
chr5 (585-655)||(21680429-21680499)
chr5 (98-188)||(33477389-33477479)
chr5 (556-653)||(1053-1150)
chr5 (335-484)||(25244546-25244695)
chr5 (335-484)||(25308698-25308847)
chr5 (334-493)||(16065877-16066034)
chr5 (314-390)||(21404858-21404934)
chr5 (250-298)||(18570108-18570156)
chr5 (96-164)||(11479420-11479489)
chr5 (250-298)||(17285948-17285996)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (306-664)||(23063790-23064148)
chr2 (306-664)||(24675202-24675560)
chr2 (306-664)||(21325638-21325996)
chr2 (308-664)||(24707854-24708210)
chr2 (313-664)||(16924980-16925331)
chr2 (313-664)||(16998720-16999071)
chr2 (313-664)||(16981872-16982223)
chr2 (313-664)||(17063437-17063788)
chr2 (313-664)||(17067095-17067446)
chr2 (313-664)||(24262090-24262441)
chr2 (313-664)||(24709753-24710104)
chr2 (313-664)||(9609856-9610207)
chr2 (306-664)||(23188721-23189078)
chr2 (313-664)||(27370989-27371340)
chr2 (313-664)||(24878367-24878718)
chr2 (313-664)||(10868570-10868921)
chr2 (313-664)||(21145402-21145753)
chr2 (306-664)||(22756837-22757193)
chr2 (313-664)||(27217736-27218087)
chr2 (313-664)||(44385941-44386292)
chr2 (313-664)||(22325228-22325579)
chr2 (306-661)||(24825657-24826012)
chr2 (7-214)||(21330248-21330455)
chr2 (306-661)||(30211292-30211647)
chr2 (7-214)||(18796506-18796713)
chr2 (306-657)||(23087163-23087514)
chr2 (306-664)||(45529230-45529582)
chr2 (488-664)||(41608757-41608933)
chr2 (306-467)||(23138750-23138911)
chr2 (306-467)||(23550540-23550701)
chr2 (315-657)||(27365458-27365800)
chr2 (330-657)||(23276513-23276840)
chr2 (7-212)||(18619807-18620011)
chr2 (313-657)||(12574073-12574417)
chr2 (313-657)||(27787461-27787805)
chr2 (315-657)||(23293680-23294022)
chr2 (306-405)||(27377102-27377201)
chr2 (315-637)||(22276001-22276323)
chr2 (69-208)||(19692598-19692737)
chr2 (315-637)||(12640318-12640640)
chr2 (331-637)||(24570067-24570373)
chr2 (315-640)||(24831583-24831908)
chr2 (331-637)||(22761968-22762274)
chr2 (333-637)||(25128387-25128691)
chr2 (22-149)||(20977957-20978084)
chr2 (417-640)||(23817449-23817672)
chr2 (315-657)||(11358253-11358595)
chr2 (416-477)||(27368391-27368452)
chr2 (315-460)||(31830380-31830525)
chr2 (250-309)||(21330493-21330552)
chr2 (315-637)||(1063473-1063795)
chr2 (315-657)||(20832707-20833049)
chr2 (7-180)||(36270199-36270373)
chr2 (7-180)||(18822115-18822290)
chr2 (407-501)||(14708901-14708995)
chr2 (315-433)||(24654067-24654185)
chr2 (585-657)||(24948581-24948653)
chr2 (528-657)||(19652431-19652557)
chr2 (331-382)||(23817747-23817798)
chr2 (315-382)||(24945089-24945156)
chr2 (331-382)||(28144701-28144752)
chr2 (250-306)||(19692773-19692829)
chr2 (565-637)||(23890754-23890826)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (306-664)||(6136-6494)
scaffold0120 (315-657)||(1366-1708)
scaffold0120 (315-548)||(22816-23049)
[»] chr6 (98 HSPs)
chr6 (306-664)||(25609838-25610196)
chr6 (306-664)||(18407919-18408278)
chr6 (306-659)||(16963349-16963702)
chr6 (306-664)||(19864633-19864991)
chr6 (306-661)||(16927620-16927975)
chr6 (306-664)||(22078667-22079023)
chr6 (313-664)||(24313145-24313496)
chr6 (313-664)||(29591897-29592248)
chr6 (313-664)||(16626694-16627045)
chr6 (306-660)||(12497972-12498326)
chr6 (306-660)||(12510575-12510929)
chr6 (306-664)||(23078415-23078773)
chr6 (306-664)||(22762432-22762790)
chr6 (306-660)||(12505301-12505655)
chr6 (306-664)||(27331410-27331768)
chr6 (306-664)||(27392150-27392508)
chr6 (313-664)||(28263174-28263525)
chr6 (313-664)||(28341923-28342274)
chr6 (313-664)||(1543061-1543412)
chr6 (313-664)||(25112505-25112856)
chr6 (313-664)||(28292349-28292700)
chr6 (313-664)||(2874780-2875131)
chr6 (317-664)||(5839196-5839543)
chr6 (313-664)||(27187389-27187740)
chr6 (313-664)||(27261500-27261851)
chr6 (306-616)||(25765315-25765624)
chr6 (7-214)||(27381252-27381459)
chr6 (7-214)||(27471635-27471842)
chr6 (7-212)||(17684469-17684674)
chr6 (7-214)||(29308890-29309097)
chr6 (7-214)||(29315850-29316057)
chr6 (7-212)||(16566320-16566525)
chr6 (418-663)||(22433927-22434172)
chr6 (7-214)||(17691440-17691647)
chr6 (7-212)||(188977-189182)
chr6 (7-212)||(25537159-25537364)
chr6 (7-212)||(11651725-11651930)
chr6 (317-657)||(25768148-25768488)
chr6 (315-657)||(15459291-15459633)
chr6 (313-657)||(21471554-21471898)
chr6 (306-581)||(18197607-18197882)
chr6 (315-657)||(19879253-19879595)
chr6 (306-657)||(1640718-1641069)
chr6 (306-450)||(21833172-21833316)
chr6 (315-637)||(34645590-34645912)
chr6 (7-212)||(13359269-13359474)
chr6 (313-657)||(18794643-18794987)
chr6 (313-657)||(27560601-27560945)
chr6 (315-657)||(11280489-11280831)
chr6 (315-656)||(22796617-22796958)
chr6 (313-657)||(28282797-28283141)
chr6 (313-657)||(21564116-21564460)
chr6 (315-657)||(17415441-17415783)
chr6 (315-619)||(25743110-25743413)
chr6 (317-657)||(18800899-18801239)
chr6 (315-559)||(11287680-11287924)
chr6 (315-637)||(16382377-16382699)
chr6 (313-451)||(25750762-25750900)
chr6 (315-657)||(10468833-10469175)
chr6 (317-459)||(14131361-14131503)
chr6 (315-661)||(14381447-14381793)
chr6 (315-637)||(15078368-15078690)
chr6 (315-637)||(16098005-16098327)
chr6 (366-466)||(11291818-11291918)
chr6 (331-637)||(1648788-1649094)
chr6 (315-637)||(23996203-23996525)
chr6 (315-640)||(18837909-18838234)
chr6 (331-619)||(18571622-18571910)
chr6 (314-438)||(25750900-25751024)
chr6 (331-613)||(21412966-21413248)
chr6 (566-664)||(17032589-17032687)
chr6 (451-657)||(19453511-19453717)
chr6 (7-175)||(20553587-20553755)
chr6 (315-657)||(8766132-8766474)
chr6 (318-619)||(16233167-16233468)
chr6 (313-379)||(17032515-17032581)
chr6 (250-304)||(17691683-17691737)
chr6 (315-460)||(24364367-24364512)
chr6 (333-478)||(25655456-25655601)
chr6 (250-306)||(27381495-27381551)
chr6 (250-306)||(27471878-27471934)
chr6 (250-306)||(29308798-29308854)
chr6 (250-306)||(29315758-29315814)
chr6 (7-176)||(17850495-17850663)
chr6 (250-306)||(17684712-17684768)
chr6 (7-191)||(27925772-27925961)
chr6 (22-195)||(8509941-8510115)
chr6 (252-306)||(11651630-11651684)
chr6 (250-306)||(25537405-25537461)
chr6 (585-657)||(27559972-27560044)
chr6 (152-207)||(31258065-31258120)
chr6 (318-500)||(26276888-26277071)
chr6 (585-655)||(5297191-5297261)
chr6 (250-298)||(13359512-13359560)
chr6 (250-298)||(16566563-16566611)
chr6 (250-307)||(189221-189281)
chr6 (133-198)||(22259925-22259990)
chr6 (565-637)||(1652278-1652350)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (306-660)||(65518-65872)
scaffold0042 (412-664)||(39654-39906)
scaffold0042 (306-364)||(39924-39982)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (306-664)||(20136875-20137233)
chr1 (306-661)||(20249947-20250302)
chr1 (306-660)||(17044923-17045277)
chr1 (313-664)||(16350503-16350854)
chr1 (313-664)||(33390933-33391284)
chr1 (313-664)||(51333397-51333748)
chr1 (313-664)||(19106471-19106822)
chr1 (306-664)||(50620148-50620506)
chr1 (313-664)||(21830407-21830758)
chr1 (313-664)||(21837054-21837405)
chr1 (318-664)||(41354373-41354719)
chr1 (306-664)||(19760770-19761128)
chr1 (306-664)||(16078556-16078895)
chr1 (306-664)||(16369394-16369752)
chr1 (306-616)||(21747632-21747941)
chr1 (7-214)||(18252030-18252237)
chr1 (7-214)||(18532514-18532721)
chr1 (7-214)||(27131409-27131616)
chr1 (7-212)||(21171233-21171438)
chr1 (7-212)||(27310577-27310782)
chr1 (7-212)||(16359035-16359240)
chr1 (7-208)||(36816633-36816834)
chr1 (7-214)||(3855919-3856126)
chr1 (7-214)||(22657221-22657429)
chr1 (315-657)||(20939974-20940316)
chr1 (315-657)||(19854420-19854761)
chr1 (323-657)||(20835799-20836133)
chr1 (315-657)||(41307931-41308273)
chr1 (315-544)||(19664900-19665129)
chr1 (315-653)||(20294518-20294856)
chr1 (315-637)||(20831323-20831645)
chr1 (315-657)||(20856672-20857014)
chr1 (315-460)||(11382700-11382845)
chr1 (7-208)||(27277557-27277756)
chr1 (315-657)||(22433027-22433369)
chr1 (7-180)||(12014284-12014457)
chr1 (315-608)||(20914316-20914609)
chr1 (315-492)||(46518827-46519004)
chr1 (306-376)||(50612608-50612678)
chr1 (315-657)||(37677185-37677528)
chr1 (31-180)||(12006563-12006712)
chr1 (250-308)||(18532757-18532815)
chr1 (250-307)||(18251935-18251992)
chr1 (416-619)||(22135507-22135710)
chr1 (331-484)||(21202371-21202524)
chr1 (315-460)||(31550289-31550434)
chr1 (315-460)||(20075167-20075312)
chr1 (31-202)||(9917942-9918106)
chr1 (250-306)||(27310821-27310877)
chr1 (618-664)||(21749350-21749396)
chr1 (250-306)||(16359280-16359336)
chr1 (315-377)||(22142232-22142294)
chr1 (139-208)||(30720625-30720694)
chr1 (250-306)||(21171479-21171535)
chr1 (107-184)||(3403248-3403325)
chr1 (107-184)||(3443494-3443571)
chr1 (253-298)||(36816881-36816926)
chr1 (250-306)||(3856164-3856220)
chr1 (585-657)||(19663047-19663119)
chr1 (254-306)||(22657469-22657521)
chr1 (372-475)||(20184345-20184448)
chr1 (594-657)||(24099514-24099577)
chr1 (250-306)||(27131652-27131704)
chr1 (465-501)||(15730887-15730923)
chr1 (250-306)||(27277800-27277856)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (306-664)||(1252-1610)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (306-662)||(531-886)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (306-664)||(6127-6485)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (306-664)||(658-1015)
scaffold0220 (7-214)||(18288-18495)
scaffold0220 (250-306)||(18196-18252)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (306-664)||(5334-5692)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (306-664)||(278665-279023)
scaffold0005 (306-660)||(164548-164902)
scaffold0005 (321-515)||(308787-308981)
scaffold0005 (313-657)||(260428-260772)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (306-662)||(789-1145)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (306-664)||(7903-8261)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (317-663)||(63867-64213)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (306-664)||(180330-180688)
scaffold0020 (587-657)||(101394-101464)
[»] chr7 (96 HSPs)
chr7 (313-664)||(8707683-8708034)
chr7 (313-664)||(15160898-15161249)
chr7 (313-664)||(18551599-18551950)
chr7 (313-664)||(13686142-13686493)
chr7 (313-664)||(8198706-8199057)
chr7 (313-664)||(11552943-11553294)
chr7 (306-664)||(17157-17515)
chr7 (313-664)||(44791192-44791543)
chr7 (306-664)||(15154498-15154851)
chr7 (312-664)||(10871072-10871424)
chr7 (313-664)||(12687579-12687930)
chr7 (313-664)||(14332475-14332826)
chr7 (313-664)||(18177820-18178171)
chr7 (318-664)||(14954703-14955049)
chr7 (313-664)||(11237054-11237405)
chr7 (313-664)||(23516610-23516961)
chr7 (7-214)||(29327784-29327991)
chr7 (306-664)||(15203950-15204308)
chr7 (7-214)||(11536062-11536269)
chr7 (7-214)||(11542980-11543187)
chr7 (7-212)||(15152445-15152650)
chr7 (414-664)||(9596236-9596486)
chr7 (7-212)||(15148144-15148349)
chr7 (306-664)||(15624623-15624981)
chr7 (7-212)||(18561009-18561214)
chr7 (339-664)||(35964691-35965016)
chr7 (7-212)||(12750828-12751033)
chr7 (373-664)||(11772082-11772373)
chr7 (313-657)||(12206626-12206970)
chr7 (11-208)||(12738542-12738739)
chr7 (306-520)||(14037878-14038092)
chr7 (306-520)||(14347908-14348122)
chr7 (313-657)||(19147290-19147634)
chr7 (313-657)||(20746689-20747033)
chr7 (7-212)||(18257842-18258047)
chr7 (342-657)||(21662071-21662383)
chr7 (315-657)||(14264070-14264412)
chr7 (315-657)||(15102429-15102769)
chr7 (313-657)||(11388254-11388597)
chr7 (315-637)||(16072140-16072462)
chr7 (313-657)||(18053779-18054123)
chr7 (525-664)||(14039986-14040125)
chr7 (525-664)||(14350016-14350155)
chr7 (331-637)||(14936443-14936749)
chr7 (313-657)||(23199569-23199913)
chr7 (313-657)||(23505696-23506040)
chr7 (313-657)||(14129952-14130296)
chr7 (313-657)||(14433770-14434114)
chr7 (315-637)||(7823980-7824302)
chr7 (315-657)||(14286202-14286544)
chr7 (315-637)||(27107642-27107964)
chr7 (315-657)||(49152382-49152724)
chr7 (315-548)||(4440008-4440241)
chr7 (315-499)||(13665629-13665813)
chr7 (315-651)||(16950303-16950639)
chr7 (315-619)||(21674419-21674723)
chr7 (315-657)||(1233-1575)
chr7 (315-657)||(11306089-11306431)
chr7 (30-208)||(13392157-13392334)
chr7 (331-637)||(15364036-15364342)
chr7 (315-460)||(8212151-8212296)
chr7 (414-637)||(13021537-13021760)
chr7 (315-657)||(6413592-6413934)
chr7 (7-192)||(2364917-2365101)
chr7 (324-640)||(41011-41327)
chr7 (333-577)||(12193654-12193898)
chr7 (315-637)||(26118451-26118773)
chr7 (331-637)||(45146652-45146957)
chr7 (315-608)||(12368473-12368766)
chr7 (250-309)||(12738440-12738499)
chr7 (414-657)||(15340611-15340854)
chr7 (121-208)||(39111819-39111905)
chr7 (331-481)||(13353247-13353397)
chr7 (250-307)||(2653275-2653332)
chr7 (250-306)||(11543223-11543279)
chr7 (319-460)||(12455787-12455928)
chr7 (22-181)||(7396221-7396381)
chr7 (250-306)||(11536305-11536361)
chr7 (250-306)||(12750733-12750789)
chr7 (250-306)||(15152350-15152406)
chr7 (330-481)||(20466877-20467028)
chr7 (251-306)||(29327690-29327745)
chr7 (333-490)||(13378796-13378953)
chr7 (250-306)||(15148049-15148105)
chr7 (97-140)||(3132748-3132791)
chr7 (330-505)||(5764588-5764763)
chr7 (335-481)||(17145282-17145428)
chr7 (99-164)||(10234179-10234244)
chr7 (561-657)||(13665864-13665960)
chr7 (315-478)||(17923760-17923924)
chr7 (414-661)||(12456959-12457206)
chr7 (251-306)||(13392030-13392085)
chr7 (414-460)||(26288060-26288106)
chr7 (182-214)||(2653207-2653239)
chr7 (250-306)||(18258087-18258143)
chr7 (250-306)||(18560913-18560969)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (306-664)||(4240-4598)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (306-664)||(8709-9067)
scaffold0109 (306-664)||(33408-33766)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (306-664)||(14473-14831)
scaffold0044 (313-664)||(740-1091)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (306-664)||(127034-127392)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (308-664)||(229158-229514)
scaffold0012 (306-664)||(219252-219610)
scaffold0012 (315-619)||(32877-33179)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (306-664)||(21980-22338)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (306-664)||(9456-9814)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (313-663)||(109647-109997)
scaffold0029 (315-657)||(112681-113023)
scaffold0029 (315-657)||(95844-96186)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (318-664)||(7522-7868)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (313-664)||(7058-7410)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (313-664)||(534-885)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (313-664)||(7497-7848)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (313-664)||(43274-43625)
scaffold0028 (313-664)||(8605-8956)
scaffold0028 (487-664)||(15241-15418)
scaffold0028 (315-657)||(50356-50698)
scaffold0028 (359-483)||(13832-13956)
scaffold0028 (315-637)||(106435-106757)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (306-664)||(9083-9441)
scaffold0507 (315-478)||(354-517)
scaffold0507 (522-640)||(213-331)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (306-661)||(115-470)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (306-664)||(32587-32945)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (306-664)||(49606-49964)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (313-651)||(628-966)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (316-664)||(14914-15262)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (306-664)||(14990-15348)
scaffold0040 (630-664)||(113322-113356)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (306-664)||(4145-4502)
[»] scaffold0234 (6 HSPs)
scaffold0234 (7-214)||(2321-2528)
scaffold0234 (7-214)||(11212-11419)
scaffold0234 (318-658)||(24912-25252)
scaffold0234 (250-306)||(2564-2620)
scaffold0234 (250-306)||(11455-11511)
scaffold0234 (315-459)||(16211-16355)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (306-664)||(1118-1470)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (306-664)||(26368-26726)
scaffold0011 (315-657)||(195545-195886)
scaffold0011 (315-637)||(121812-122134)
scaffold0011 (315-656)||(148692-149033)
scaffold0011 (416-637)||(180147-180368)
scaffold0011 (315-364)||(68575-68624)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (7-214)||(6934-7141)
scaffold0390 (7-214)||(13950-14157)
scaffold0390 (250-306)||(7177-7233)
scaffold0390 (250-306)||(14193-14249)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (306-664)||(12812-13170)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (306-661)||(1021-1376)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (306-656)||(17100-17450)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (370-664)||(15832-16126)
scaffold0333 (306-530)||(15605-15829)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (7-214)||(7107-7314)
scaffold0433 (250-306)||(7015-7071)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (306-664)||(16251-16609)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (7-214)||(993-1200)
scaffold0657 (250-307)||(900-957)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (306-664)||(3253-3611)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (306-664)||(116740-117098)
scaffold0037 (315-619)||(98137-98441)
scaffold0037 (315-382)||(23583-23650)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (306-664)||(112134-112492)
scaffold0004 (306-658)||(203309-203661)
scaffold0004 (315-657)||(322826-323168)
scaffold0004 (313-657)||(385939-386283)
scaffold0004 (315-657)||(117690-118032)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (328-661)||(25557-25890)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (7-214)||(25990-26197)
scaffold0186 (251-306)||(26231-26286)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (306-637)||(448172-448503)
scaffold0001 (317-657)||(90774-91114)
scaffold0001 (306-476)||(162226-162396)
scaffold0001 (315-490)||(78638-78813)
scaffold0001 (630-664)||(391035-391069)
scaffold0001 (555-657)||(114542-114644)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (307-589)||(16375-16657)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (7-212)||(5531-5736)
scaffold0063 (250-298)||(5444-5492)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (342-664)||(5426-5747)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (444-664)||(12738-12958)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (475-664)||(6331-6520)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (306-664)||(86339-86697)
scaffold0007 (496-664)||(46531-46699)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (396-664)||(4289-4557)
scaffold0023 (408-664)||(58969-59225)
scaffold0023 (577-660)||(130532-130615)
scaffold0023 (577-660)||(134626-134709)
scaffold0023 (306-357)||(4567-4618)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (306-553)||(206-453)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (480-664)||(1552-1736)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (31-212)||(230365-230545)
scaffold0008 (315-633)||(24002-24320)
scaffold0008 (250-306)||(230584-230640)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (516-664)||(8163-8311)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (313-657)||(9918-10257)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (313-657)||(3995-4339)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (306-637)||(10602-10932)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (315-657)||(28610-28953)
scaffold0064 (315-657)||(40601-40944)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (313-657)||(5756-6100)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (313-657)||(33519-33863)
scaffold0076 (315-637)||(40380-40702)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (315-657)||(4872-5214)
[»] scaffold0326 (3 HSPs)
scaffold0326 (315-657)||(18379-18721)
scaffold0326 (250-306)||(16523-16579)
scaffold0326 (181-214)||(16615-16648)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (315-657)||(48875-49217)
scaffold0053 (313-657)||(57659-58002)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (315-657)||(51705-52047)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (523-664)||(1-142)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (507-664)||(10-167)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (315-657)||(1916-2258)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (315-657)||(47246-47588)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (313-657)||(6878-7222)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (313-651)||(26262-26600)
scaffold0192 (534-652)||(26865-26983)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (315-657)||(27641-27983)
scaffold0139 (313-657)||(991-1335)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (306-455)||(26-175)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (315-657)||(9925-10267)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (315-656)||(6305-6647)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (324-657)||(1-333)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (313-657)||(18969-19313)
scaffold0090 (313-657)||(23131-23475)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (306-457)||(28080-28231)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (411-524)||(3694-3807)
scaffold0375 (621-664)||(3649-3692)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (313-657)||(37322-37666)
scaffold0026 (316-490)||(38183-38357)
scaffold0026 (316-460)||(27376-27520)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (315-657)||(20105-20447)
scaffold0298 (315-653)||(13207-13545)
scaffold0298 (315-653)||(16977-17315)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (315-657)||(49049-49391)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (315-657)||(13743-14085)
scaffold0034 (315-657)||(4795-5137)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (313-657)||(648-992)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (315-637)||(46276-46598)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (306-460)||(58445-58599)
scaffold0058 (315-657)||(19242-19584)
scaffold0058 (331-484)||(74038-74191)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (416-637)||(71442-71663)
scaffold0021 (417-490)||(13475-13548)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (315-657)||(14093-14435)
scaffold0203 (250-306)||(23769-23825)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (315-637)||(13030-13352)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (315-637)||(7672-7994)
scaffold0124 (315-657)||(241-583)
scaffold0124 (315-653)||(11010-11348)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (315-657)||(39861-40202)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (408-657)||(3197-3446)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (315-657)||(220-562)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (315-637)||(3281-3603)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (315-657)||(27348-27689)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (315-657)||(26383-26725)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (315-640)||(245-570)
scaffold0761 (633-664)||(4934-4965)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (315-636)||(14600-14921)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (313-657)||(5333-5677)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (313-657)||(21513-21857)
scaffold0235 (416-619)||(26029-26232)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (313-640)||(12640-12967)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (315-657)||(52021-52363)
scaffold0067 (315-657)||(61055-61397)
scaffold0067 (315-657)||(67443-67785)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (315-657)||(2873-3215)
scaffold0035 (330-502)||(13192-13364)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (315-657)||(42175-42517)
scaffold0010 (315-652)||(47246-47583)
scaffold0010 (609-664)||(2337-2392)
scaffold0010 (306-373)||(2263-2330)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (331-619)||(14661-14949)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (313-577)||(4924-5188)
scaffold0249 (584-657)||(1814-1887)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (315-547)||(1121-1353)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (315-490)||(4013-4188)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (315-657)||(7080-7422)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (313-499)||(14205-14391)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (315-657)||(25707-26049)
scaffold0113 (315-460)||(16798-16943)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (315-547)||(28218-28450)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (331-637)||(916-1222)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (408-657)||(104-353)
scaffold1710 (315-469)||(940-1094)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (315-464)||(313-462)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (348-657)||(1076-1385)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (317-637)||(23518-23838)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (416-640)||(1283-1507)
scaffold0117 (315-382)||(10426-10493)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (315-637)||(3737-4059)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (451-637)||(7426-7612)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (306-378)||(17070-17142)
scaffold0324 (618-664)||(19837-19883)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (331-642)||(8748-9059)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (573-664)||(197313-197404)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (416-637)||(26019-26240)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (150-214)||(8446-8510)
scaffold0176 (250-306)||(8546-8602)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (331-622)||(9125-9416)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (315-490)||(8217-8392)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (585-664)||(19040-19119)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (315-490)||(14779-14954)
scaffold0132 (416-640)||(43761-43985)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (315-657)||(20244-20586)
scaffold0114 (315-657)||(43627-43969)
scaffold0114 (315-657)||(44639-44981)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (315-657)||(42905-43247)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (414-657)||(5294-5537)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (315-657)||(248735-249077)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (331-640)||(3803-4112)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (315-460)||(38926-39071)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (331-463)||(10493-10625)
scaffold0447 (331-463)||(5879-6011)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (318-608)||(10781-11071)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (315-460)||(16752-16897)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (331-463)||(8488-8620)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (313-401)||(1297-1385)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (315-657)||(10891-11233)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (416-481)||(18332-18397)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (250-306)||(41-97)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (250-306)||(8944-9000)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (315-403)||(4235-4323)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (426-637)||(14370-14581)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (585-655)||(33952-34022)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (465-637)||(2828-3000)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (270-306)||(1-37)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (250-304)||(10202-10256)
scaffold0565 (164-195)||(10127-10158)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (587-657)||(5140-5210)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (585-657)||(136302-136374)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (315-372)||(13380-13437)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (113-185)||(92194-92267)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (254-306)||(5878-5930)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 122)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 17489551 - 17489909
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17489551 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 17489650  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17489651 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctc 17489750  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489751 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 17489850  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489851 tgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 17489909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16492610 - 16492252
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16492610 ataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 16492511  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16492510 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctc 16492411  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16492410 tggtcctaagaccactctttcacctgatacaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcacaaggtgtcattccaatactagaa 16492311  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16492310 tgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctcc 16492252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 12497949 - 12498307
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12497949 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 12498048  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  12498049 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 12498148  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12498149 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 12498248  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12498249 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 12498307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14876928 - 14876570
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  14876928 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggt 14876829  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14876828 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatctc 14876729  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14876728 gggtcctaagaccgctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 14876629  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14876628 tgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaatatgactatcccaagttcctcc 14876570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 9522420 - 9522778
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  9522420 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagat 9522519  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  9522520 cttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctc 9522619  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522620 tggtcctaagaccactctctcacctgactcaaaccaagacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 9522719  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9522720 tgataaatattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctcc 9522778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 16371114 - 16371472
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||    
T  16371114 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagat 16371213  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16371214 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 16371313  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16371314 tggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 16371413  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16371414 tgataactattattgtatgtgaactcaatcaatgaaagatgaatatcccaagttcctcc 16371472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 306 - 661
Target Start/End: Original strand, 16691861 - 16692216
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  16691861 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 16691960  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  16691961 ccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtctgctgaacaatctc 16692060  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16692061 gggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 16692160  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16692161 tgataactattgttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcc 16692216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15348667 - 15348316
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15348667 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 15348568  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  15348567 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcct 15348468  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15348467 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaac 15348368  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15348367 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 15348316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 16635481 - 16635832
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16635481 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 16635580  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16635581 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16635680  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635681 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 16635780  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16635781 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16635832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 43162805 - 43163156
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43162805 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 43162904  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43162905 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 43163004  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163005 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 43163104  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43163105 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 43163156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 15208592 - 15208950
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  15208592 ataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgt 15208691  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  15208692 ttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttc 15208791  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15208792 tggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgtccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 15208891  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15208892 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttcctcc 15208950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 10005308 - 10005659
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  10005308 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 10005407  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10005408 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10005507  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005508 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 10005607  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10005608 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 10005659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 10905918 - 10906269
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  10905918 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttct 10906017  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10906018 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10906117  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906118 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 10906217  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10906218 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 10906269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15589814 - 15589463
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  15589814 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 15589715  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15589714 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15589615  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589614 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 15589515  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15589514 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 15589463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 26792821 - 26792470
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26792821 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcct 26792722  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26792721 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 26792622  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26792621 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcataatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 26792522  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26792521 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 26792470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 48425155 - 48425506
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  48425155 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttct 48425254  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  48425255 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctagtcct 48425354  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425355 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttgaacggtgccattccaatactagaatgataac 48425454  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48425455 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 48425506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 308 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16807353 - 16806997
Alignment:
Q  308 aaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatat 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||      
T  16807353 aaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcc 16807254  T
Q  408 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctg 507  Q
    || || ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16807253 tttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 16807154  T
Q  508 gtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16807153 gtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatg 16807054  T
Q  608 ataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16807053 ataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16806997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 20062476 - 20062125
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  20062476 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 20062377  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20062376 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 20062277  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062276 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 20062177  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20062176 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 20062125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 6600455 - 6600806
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||    
T  6600455 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttct 6600554  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6600555 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 6600654  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6600655 aagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagc 6600754  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6600755 tattattataagtgaactcgatcaacgaaagatgactatcccaagttcctcc 6600806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15402932 - 15402581
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||| ||    
T  15402932 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttct 15402833  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15402832 acgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15402733  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15402732 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatgtaaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 15402633  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15402632 tattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctcc 15402581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 312 - 664
Target Start/End: Original strand, 15247854 - 15248206
Alignment:
Q  312 ctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||   | |||||    
T  15247854 ctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcattgtttttcc 15247953  T
Q  412 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcc 511  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15247954 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcc 15248053  T
Q  512 taagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataa 611  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15248054 taaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgactatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataa 15248153  T
Q  612 ctattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15248154 ctgttattgtacgtgaactatatcaatagaagatgactatcccaagttcctcc 15248206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 313 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 53385440 - 53385093
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  53385440 tcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 53385341  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53385340 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 53385241  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  53385240 aagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagc 53385141  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53385140 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 53385093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 15338977 - 15339328
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||| ||    
T  15338977 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttct 15339076  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  15339077 acgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgatgaacaatctctggtcct 15339176  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15339177 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 15339276  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15339277 tattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctcc 15339328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 13252398 - 13252749
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  13252398 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 13252497  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13252498 acgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 13252597  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13252598 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaac 13252697  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13252698 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctcc 13252749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16412704 - 16412353
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |  |||||    
T  16412704 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcct 16412605  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16412604 acgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16412505  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16412504 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 16412405  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16412404 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16412353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 5425351 - 5425001
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||    
T  5425351 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaag-cacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttct 5425253  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5425252 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 5425153  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425152 aagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 5425053  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5425052 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctcc 5425001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15725355 - 15725005
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  15725355 tcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 15725256  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15725255 acgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaat-ttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 15725157  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15725156 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 15725057  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15725056 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 15725005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6110271 - 6110064
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110271 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 6110172  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110171 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 6110072  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  6110071 tgccttgt 6110064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 10572592 - 10572799
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572592 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 10572691  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572692 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 10572791  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  10572792 tgccttgt 10572799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16757007 - 16756656
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  || ||||||| ||| ||    
T  16757007 tcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttct 16756908  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16756907 acgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16756808  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  | | |||||||||||||||||||||||| |    
T  16756807 aagaccactctttcatctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacgatgccattccaatactagaatgatagc 16756708  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16756707 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctcc 16756656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 15600884 - 15601091
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600884 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 15600983  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600984 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 15601083  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    || |||||    
T  15601084 tgtcttgt 15601091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 15607429 - 15607636
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607429 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 15607528  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607529 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 15607628  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    || |||||    
T  15607629 tgtcttgt 15607636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13211509 - 13211305
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211509 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 13211410  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211409 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 13211310  T
Q  207 tgcct 211  Q
    |||||    
T  13211309 tgcct 13211305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13248814 - 13248607
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248814 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaatagtttccttatgttt 13248715  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248714 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 13248615  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  13248614 tgccttgt 13248607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 16482483 - 16482688
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16482483 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgttt 16482582  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482583 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 16482682  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  16482683 tgcctt 16482688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 17781118 - 17781319
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781118 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 17781217  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781218 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 17781317  T
Q  207 tg 208  Q
    ||    
T  17781318 tg 17781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 10579355 - 10579556
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579355 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 10579454  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579455 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccatttaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 10579554  T
Q  207 tg 208  Q
    ||    
T  10579555 tg 10579556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18522870 - 18522665
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18522870 atcatcagtctacctacataatagtctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 18522771  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522770 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18522671  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  18522670 tgcctt 18522665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 15357586 - 15357793
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15357586 atcatcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgttt 15357685  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357686 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 15357785  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    || |||||    
T  15357786 tgtcttgt 15357793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8490672 - 8490488
Alignment:
Q  30 gtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtta 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490672 gtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtta 8490573  T
Q  130 tacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490572 tacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 8490488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18520182 - 18519980
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  18520182 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggat---ttaagaatagtttccttatgttt 18520086  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520085 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18519986  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  18519985 tgcctt 18519980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 19089745 - 19089946
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19089745 atcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttcattatgttt 19089844  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089845 aaaggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 19089944  T
Q  207 tg 208  Q
    ||    
T  19089945 tg 19089946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 17200184 - 17200389
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17200184 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaatagtttcattatgttt 17200283  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200284 aaaggggtatcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 17200383  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  17200384 tgcctt 17200389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Original strand, 15342219 - 15342407
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15342219 atcatcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgttt 15342318  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342319 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaacaaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 15342407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13517018 - 13516813
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13517018 atcatcagtctacccacataatagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatcgtttccttatgttt 13516919  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516918 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccatgaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 13516819  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  13516818 tgcctt 13516813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640953
Alignment:
Q  53 cacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga 152  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgga 18640891  T
Q  153 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640892 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18640953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 344 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 15016135 - 15015818
Alignment:
Q  344 tccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactc 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15016135 tccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactc 15016036  T
Q  444 tgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaac 543  Q
    || |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||  | ||||| |||||| ||||||    
T  15016035 tgagacgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgttgaacaatttctggtcctagtaccacattctcaccggattcataccaac 15015936  T
Q  544 acaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaag 643  Q
    ||||  |||||||||||||| || |||| || || ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  | |||||||| |||||||  ||    
T  15015935 acaatggagttctgcatctccgatcatacaatgcttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgcaagtgaactcgatcaatgagag 15015836  T
Q  644 atgactatcccaagttcc 661  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15015835 atgactatcccaagttcc 15015818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 32056900 - 32057101
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32056900 atcattagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaatagtttctttatgttt 32056999  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32057000 aacggggtcttacaataaagttatacttgatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 32057099  T
Q  207 tg 208  Q
    ||    
T  32057100 tg 32057101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 1647521 - 1647726
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1647521 atcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaatagtttccttatgttt 1647620  T
Q  107 aatggggtctcacaattaag----ttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 202  Q
    || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647621 aacggggtctcacaattaagttaattatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 1647720  T
Q  203 gaaatg 208  Q
    ||||||    
T  1647721 gaaatg 1647726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 15227367 - 15227711
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  15227367 tcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttct 15227466  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||  || ||||| |  ||||| |||||||| | |||||||||     
T  15227467 acgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctctcttatcaatttgaccttttttgtagtctgctgaactaaatctggtccc 15227566  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || |  || | |||||  || ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||| ||| | ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15227567 aacattacaccttcactcgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccaaccatacaaatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 15227666  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  15227667 tgttgttgtatgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaag 15227711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 13972531 - 13972187
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||    
T  13972531 tcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcct 13972432  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc--ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtc 510  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  13972431 acgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtc 13972334  T
Q  511 ctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgata 610  Q
    | || | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  13972333 ccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggta 13972234  T
Q  611 actattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  13972233 actattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 13972187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 14086391 - 14086735
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||    
T  14086391 tcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcct 14086490  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc--ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtc 510  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  14086491 acgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtc 14086588  T
Q  511 ctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgata 610  Q
    | || | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14086589 ccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggta 14086688  T
Q  611 actattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  14086689 actattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 14086735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16200309 - 16200128
Alignment:
Q  30 gtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtta 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200309 gtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaattaagtta 16200210  T
Q  130 tacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200209 tacataatgttccattaaacgaactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29925163 - 29924971
Alignment:
Q  22 acataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 121  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29925163 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29925064  T
Q  122 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 214  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29925063 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29924971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29974316 - 29974124
Alignment:
Q  22 acataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 121  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29974316 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29974217  T
Q  122 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 214  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29974216 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 10420454 - 10420112
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || ||||| || || ||||| | ||||||||    
T  10420454 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctac 10420355  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||| || || |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  10420354 gcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtggtctcatgaaccaaatccggtcccaa 10420255  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || ||||||||||| |   |||| || || ||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||     
T  10420254 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactg 10420155  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10420154 ttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaag 10420112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 15953377 - 15953035
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  15953377 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 15953278  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  15953277 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 15953178  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || |||||| |||| ||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||  ||||     
T  15953177 cacaacactttctcccgactcaaacaaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggcaactg 15953078  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  15953077 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 15953035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16200609 - 16200434
Alignment:
Q  36 atgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatactta 135  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16200609 atgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttattggagtctcacaattaagttatacata 16200510  T
Q  136 atgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200509 atgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 8759493 - 8759149
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  8759493 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 8759394  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  8759393 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccc 8759294  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8759293 aacacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataac 8759194  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8759193 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 8759149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 44776965 - 44777309
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||    |||||    
T  44776965 tcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcct 44777064  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || || || ||||| | |||||| | |||||||||     
T  44777065 cctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaactaaatctggtccc 44777164  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| ||||  || |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44777165 aacacaacactttctcctgtctcgaaccaacacaaaggagtcctgcaccttcgaccatataatgcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataac 44777264  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44777265 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaag 44777309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 13323061 - 13322719
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||    
T  13323061 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctac 13322962  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  13322961 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 13322862  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||  | || | |||||| |||||||| || ||  |||||||||| ||| |||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||| |     
T  13322861 cacagcactctgacctgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccgtacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaattg 13322762  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  13322761 ttgttgtaggtaaactctatcaaaggtaggtgactatcccaag 13322719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 13941742 - 13942086
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  13941742 tcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 13941841  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  13941842 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccc 13941941  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13941942 aacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataac 13942041  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13942042 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 13942086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 41177240 - 41177584
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  41177240 tcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 41177339  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  41177340 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccc 41177439  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41177440 agcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataac 41177539  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  41177540 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 41177584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 18134755 - 18134413
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| | || || || || ||||||||    |||||||    
T  18134755 ggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 18134656  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || || || || ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  18134655 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatcattttgactttatctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 18134556  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  || | ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  18134555 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 18134456  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  18134455 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 18134413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 12850690 - 12850346
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||    ||  |    
T  12850690 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttat 12850591  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||  || || || |  |||||||| ||||| | |||||||||     
T  12850590 tcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaatttgactttttatgtagtttgatgaactaaatctggtccc 12850491  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||| | |   | |||||||| |||||||| ||||| |||     
T  12850490 aacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaatctttgaacggtgccataccaatacttgaatggtaat 12850391  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  12850390 tgttgttgtacgtgaactctatcaacgatagatgactatcccaag 12850346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Original strand, 24253388 - 24253589
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||  ||| |||  ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24253388 atcattagtctaccgacataatagtctctatgctttaatgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaatagtgtccttatgttt 24253487  T
Q  107 aatgggg-tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaa 205  Q
     |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24253488 gatggggatctcacgattaagtcatacttaatgttccatcaaacgaacgagctattctaaggactttattattttgaagtaaaacaaaatcaataaagaa 24253587  T
Q  206 at 207  Q
    ||    
T  24253588 at 24253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 16836921 - 16836577
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||    |||||    
T  16836921 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcct 16836822  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| || || |  ||||| | |||||||||     
T  16836821 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctcatgaaccaaatctggtccc 16836722  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || || || ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  16836721 aacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaac 16836622  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  16836621 tgttgttgtaggtgaactctaccaatggtaggtgactatcccaag 16836577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274497
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 8274620  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  8274619 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 8274520  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  8274519 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 8274497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17136566 - 17136465
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17136566 atcatcagtctacccacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 17136467  T
Q  107 aa 108  Q
    ||    
T  17136466 aa 17136465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 331 - 608
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748678
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||| || ||  |||| |||||||  |  ||||| | |||||||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | |||||||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttcacct 18748600  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatga 608  Q
    ||||||||||||||||||   || || || ||| ||||||| ||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  18748601 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaaccctcaaacggtgccataccgatactagaatga 18748678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 547
Target Start/End: Original strand, 14571568 - 14571800
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  14571568 ggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 14571667  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| || || || ||||| | ||| ||||| ||    
T  14571668 gcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtggtctgatgaaccaaatccggtcccaa 14571767  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaa 547  Q
     || || ||||| || |||||||||||||||||    
T  14571768 cacaacactttctcccgattcaaaccaacacaa 14571800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742801
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  ||||  |||||| ||  || || |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 16742924  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  16742923 caaagcactctctccggactcaaaccaacaaaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 16742824  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  16742823 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 16742801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 565 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11564851 - 11564752
Alignment:
Q  565 gaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11564851 gaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 11564752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 416 - 619
Target Start/End: Original strand, 17192915 - 17193118
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |  || ||||  || |||| |||     
T  17192915 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtactctcttgcacaacttccggtcgtaac 17193014  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    || || ||||| ||| ||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| |||| |    
T  17193015 acaacactttctccttattcaaaccaacacaacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgt 17193114  T
Q  616 tgtt 619  Q
    ||||    
T  17193115 tgtt 17193118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 12360951 - 12360613
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||  |||| || ||| ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  12360951 ggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 12360852  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||| |||||  | ||||| |  |||||||| ||    
T  12360851 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtccgatgaaccaagtctggtcccaa 12360752  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||  | || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  12360751 tacagcactctctcctgactcaaaccagcataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 12360652  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcc 653  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  12360651 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcc 12360613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 11304182 - 11303840
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||    ||||||| ||| ||||| || || ||||| |||||||||   ||| |||    
T  11304182 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatac 11304083  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||  || ||||  | ||  ||||| ||    
T  11304082 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcctgatgaatcaaattcggtcccaa 11303983  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||| | |||||||| ||||| |||||     
T  11303982 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccttaccaatactcgaatggtaactg 11303883  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || || || ||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  11303882 ttattgtatgtgaactatatcaacggtaggtgactatcccaag 11303840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 10383689 - 10384011
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  10383689 ggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 10383788  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  10383789 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaa 10383888  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || |  |||||||| || |||||||| |||||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  10383889 cacaatactttcacccgactcaaaccagcacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 10383988  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  10383989 ttgttataagtgaactcaatcaa 10384011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 11961443 - 11961101
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||  |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || |||||||||   ||||| |    
T  11961443 ggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttc 11961344  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||    ||||| || ||||| || || || |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  11961343 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatcttttcccttatcattttgaccttttcagtcgtctcatgaaccacatccggtcccaa 11961244  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || |||||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||     
T  11961243 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatgatagctg 11961144  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  11961143 ttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaag 11961101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576792
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  | || ||||||| ||  || || |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |   | ||||  || ||||| ||    
T  15576570 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctcgcacaacttccggtccaaa 15576669  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||| | ||||| || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||  ||||     
T  15576670 caaagcactctctccagactcaaaccaacataacggtgttctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgcaaactg 15576769  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  15576770 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 15576792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 13975465 - 13975161
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  13975465 ggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 13975366  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |  ||||  || || |||||    
T  13975365 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttccacaacttccggccctaa 13975266  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |     || || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  13975265 caaaggactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 13975166  T
Q  615 ttgtt 619  Q
    |||||    
T  13975165 ttgtt 13975161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 522 - 657
Target Start/End: Original strand, 4678365 - 4678500
Alignment:
Q  522 ctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttat 621  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  4678365 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 4678464  T
Q  622 acgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4678465 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 4678500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 585 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14126744 - 14126665
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14126744 ggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 14126665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 16330068 - 16329726
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || |||||||||   || ||      
T  16330068 ggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttt 16329969  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| ||    
T  16329968 gcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaa 16329869  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || |||||||| ||||||||||| |   |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  16329868 cacaacactctcacctgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 16329769  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  16329768 ttgttataagtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaag 16329726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18534820 - 18534758
Alignment:
Q  150 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534820 ggactaactattctatggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18534758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Original strand, 47123664 - 47123809
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| || || || || || |||||||  || || |    
T  47123664 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttc 47123763  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  47123764 gcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatctt 47123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 416 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 6712728 - 6712539
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  6712728 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaaccttttatgtagtctcttgtacaacctccggtcctaac 6712629  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |   | ||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||| || ||   |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  6712628 aaagcactttcgcctgactcataccaacacaacggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaa 6712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6110028 - 6109972
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110028 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 6109972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8490452 - 8490396
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490452 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8490396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13248571 - 13248515
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248571 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13248515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 486 - 657
Target Start/End: Original strand, 13001800 - 13001971
Alignment:
Q  486 gtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataag 585  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||  ||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||  | |    
T  13001800 gtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacg 13001899  T
Q  586 gtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||||||||||||||    
T  13001900 gtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctattaacggtaaatgactatcccaag 13001971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 16381338 - 16380995
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||  | ||||||||    || ||    
T  16381338 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatcccgaaactcaagggcctttct 16381239  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| | ||| |||||     
T  16381238 ccgcttgtcatggtaactct---gtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgaccttttctgtagtctcatgaaccaaatccggtccc 16381142  T
Q  513 aagacca---ctctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgat 609  Q
     | ||||   | || || || || |||||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |    
T  16381141 ca-accataacactctctccggactcaaaccagcacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgcgatacctatactcgaatggt 16381043  T
Q  610 aactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  16381042 aactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgattatcccaag 16380995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13211267 - 13211211
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211267 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13211211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 18640989 - 18641045
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640989 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 468 - 657
Target Start/End: Original strand, 17492503 - 17492692
Alignment:
Q  468 atcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgac 567  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || || || || ||||| |||||||| |  ||  |||| ||||| ||| |||    
T  17492503 atcatctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcttaaaggagtcctgcacctccgac 17492602  T
Q  568 catataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||| ||||| ||    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  17492603 catacaaagcttcgatcggtgccataccaatattcgaatgataactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 17492692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18510969 - 18510924
Alignment:
Q  167 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510969 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 26009189 - 26009060
Alignment:
Q  528 cctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtga 627  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  26009189 cctgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaa 26009090  T
Q  628 actctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  26009089 actctctcaacggtaggtgactatcccaag 26009060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17136193 - 17136137
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136193 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 447 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 6153139 - 6152949
Alignment:
Q  447 gacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacaca 546  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || |  ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||    
T  6153139 gacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccgaccctaacacaacactttctccggattcaaaccaacaca 6153040  T
Q  547 acagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    || | || || || ||| ||||||| ||||||||| | || |||||  | |||||||||||| || | ||||| || || ||||| |||||    
T  6153039 acggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagccatctcgatactagaatgaaaattgttgttgtatgtaaactcaatcaa 6152949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 306
Target Start/End: Original strand, 10579611 - 10579653
Alignment:
Q  264 aaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579611 aaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10579653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 555 - 657
Target Start/End: Original strand, 14573889 - 14573991
Alignment:
Q  555 ctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatccc 654  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14573889 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgattggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccc 14573988  T
Q  655 aag 657  Q
    |||    
T  14573989 aag 14573991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 15607672 - 15607729
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607672 catgatacaaagccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15607729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 15351237 - 15351293
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351237 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15351293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 15357829 - 15357885
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357829 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15357885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 16482727 - 16482782
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16482727 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgg-tattagggcttattctaaca 16482782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 17200427 - 17200483
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17200427 catgctacaaagccaaacccaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 17200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18519941 - 18519885
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18519941 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 18519885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 306
Target Start/End: Original strand, 10572848 - 10572890
Alignment:
Q  264 aaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10572848 aaacccaatcaatataggttggctattagggcttattccaaca 10572890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 307
Target Start/End: Original strand, 1647768 - 1647825
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  1647768 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagaccagctattagggcttactccaacat 1647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 15601127 - 15601184
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601127 catgatacaaatccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15601184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13516775 - 13516719
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13516775 catgatacacagccaaactcaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 13516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 17781358 - 17781414
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17781358 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17781414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 19089985 - 19090041
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089985 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19090041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 32057144 - 32057200
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32057144 catgatacaaagtcaaacccaatcaacatagattggctattagagcttactccaaca 32057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 14183193 - 14183010
Alignment:
Q  454 tcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagt 553  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || | ||| || || || |||||||  || ||| ||||||||||  | ||    
T  14183193 tcatcttttcctgaatcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaatttccgatcccaacacaacactttcactcgactcataccaacacaaaggtgt 14183094  T
Q  554 tctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||| ||||||    |||| ||||| ||  |||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||| || || ||||| |||||    
T  14183093 tctacatctcctctcatacaaagcatcgaaaggagccataccaatacttaaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaa 14183010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18510885 - 18510829
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18510885 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18510829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18522626 - 18522570
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18522626 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18522570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18534719 - 18534671
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 298  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18534719 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattgactattagggctta 18534671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 514
Target Start/End: Original strand, 21686681 - 21686864
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| || | ||||| ||||| ||||| || ||  |||| |||| || || ||| || | ||||| |||||||||    
T  21686681 acttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaacttgaaactgaatatcttttctcctcttataatgataact 21686780  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    ||| |    ||| || ||| |||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| |  || ||||| |||||||||||    
T  21686781 cttcttcttactttgagactctttcatcttttcctgaaacatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaatttctggtcctaa 21686864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 369 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 267624 - 267512
Alignment:
Q  369 ctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| |||  || | || ||| ||| ||||||| || || | ||    
T  267624 ctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatctcctgcctaccctgagacactttcatgttttcctaaa 267525  T
Q  469 tcatcttaacctt 481  Q
    |||||||||||||    
T  267524 tcatcttaacctt 267512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 539 - 619
Target Start/End: Original strand, 21189630 - 21189710
Alignment:
Q  539 ccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgtt 619  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||||||||| ||| |  ||||| ||||| |||||||||||    
T  21189630 ccaacacaagagagttatgcatttcgtaccatataatgactcataaggtgtcatccatatactggaatggtaactattgtt 21189710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29924935 - 29924879
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29924935 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29974088 - 29974032
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29974088 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 6485 - 6843
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6485 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 6584  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6585 cttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagtttgctgaacaatctc 6684  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6685 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 6784  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785 tgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 6843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 657
Target Start/End: Original strand, 3153 - 3255
Alignment:
Q  555 ctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatccc 654  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  3153 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttcttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 3252  T
Q  655 aag 657  Q
    |||    
T  3253 aag 3255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 14152 - 14510
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  14152 ataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagat 14251  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  14252 ctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatcta 14351  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 14451  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14452 tgataactattattatacgtgaactatatcaatggaagatgactttcccaagttcctcc 14510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 408 - 664
Target Start/End: Original strand, 17657 - 17912
Alignment:
Q  408 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctg 507  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  17657 ttcctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctg 17756  T
Q  508 gtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17757 gtcctaagaccactctttcacctgactc-aaccaacacaacgaagttctacatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatg 17855  T
Q  608 ataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17856 ataactattattttatgtgaactcgatcagtggaagatgactatcccaagttcctcc 17912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 31532 - 31874
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  31532 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctac 31631  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||  |||||||| ||||| | ||| | ||| ||    
T  31632 gcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctatgtagtttgatgaaccaaatccgatcccaa 31731  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| ||| | |||||||| || ||  ||||  |||| ||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||  ||||||| ||||| |||||     
T  31732 cacaacgctttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatatcaatactcgaatggtaactg 31831  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  31832 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 31874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 85)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21788991 - 21788634
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21788991 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagat 21788892  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21788891 ctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctc 21788792  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788791 tggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccata-caagcctcataaggtgccattccaatactagaa 21788693  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21788692 tgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctcc 21788634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21167170 - 21166812
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21167170 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 21167071  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21167070 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctc 21166971  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21166970 tggtcctaagaccactcttccacctgattcaaaccaacacaattgagttctgcatcttcgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 21166871  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21166870 tgataactgttattgtacgtaaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 21166812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21394498 - 21394140
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21394498 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagat 21394399  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21394398 ctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctc 21394299  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctga-ccatataaagcctcataaggtgccattccaatactaga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394298 tggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacccata-caagcctcataaggtgccattccaatactaga 21394200  T
Q  605 atgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21394199 atgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctcc 21394140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 19978115 - 19978473
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19978115 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 19978214  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  19978215 cctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 19978314  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19978315 tggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatataaagcctccaaaggtgccattccaatactagaa 19978414  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19978415 tgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 19978473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 21251090 - 21251447
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  21251090 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagat 21251189  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21251190 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcatct-ctctttaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctc 21251288  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||| |||  |||||||||||    
T  21251289 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatacaaagcgtaataaggtgtcatctcaatactagaa 21251388  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251389 tgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 21251447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 23650189 - 23650547
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  23650189 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagat 23650288  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23650289 cttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctc 23650388  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23650389 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccattccaatactagaa 23650488  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23650489 tgataactattattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctcc 23650547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 310 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21922364 - 21922010
Alignment:
Q  310 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatattt 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21922364 atctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 21922265  T
Q  410 cctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggt 509  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  21922264 tctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggt 21922165  T
Q  510 cctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgat 609  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21922164 cctaagaccactcttccacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatagaaagcctcataaggtgccattccaatagtagaatgat 21922065  T
Q  610 aactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922064 aactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 21922010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 15533528 - 15533886
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  15533528 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagat 15533627  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15533628 ctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 15533727  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15533728 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 15533827  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15533828 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 15533886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16408678 - 16408320
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  16408678 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagat 16408579  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16408578 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 16408479  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16408478 cggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 16408379  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16408378 tgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16408320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 19112845 - 19113196
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19112845 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 19112944  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19112945 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaataatctctggtcct 19113044  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113045 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 19113144  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113145 tattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 19113196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 32600292 - 32600650
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  32600292 ataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 32600391  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||    
T  32600392 ccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctactgaacaatctc 32600491  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32600492 tggtcctaagaccactctttcacctgaccgaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 32600591  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32600592 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 32600650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 30313777 - 30313419
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  30313777 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 30313678  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  30313677 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 30313578  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
      | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30313577 gagccctaagaccactctttcacctgactcaaaccaccacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccgttccaatactagaa 30313478  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30313477 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 30313419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17674649 - 17674298
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17674649 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 17674550  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17674549 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17674450  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17674449 aagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaac 17674350  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17674349 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 17674298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 22046521 - 22046879
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  22046521 ataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagat 22046620  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  22046621 ccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 22046720  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22046721 tggtcctaggaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 22046820  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22046821 tgataaccattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 22046879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22133674 - 22133316
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  22133674 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagat 22133575  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22133574 ctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 22133475  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22133474 gggtcctaagaccactctttcacttgactcaaacccgcacaacggagttctgcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 22133375  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22133374 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 22133316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22164824 - 22164466
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  22164824 ataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagat 22164725  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22164724 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 22164625  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||| | |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22164624 gggtccgaagaccactctttcacttgactcaaacctgcacaacggagttctgcatcaccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 22164525  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22164524 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 22164466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 20018376 - 20018025
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| ||| ||    
T  20018376 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttct 20018277  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20018276 acgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 20018177  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018176 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 20018077  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20018076 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 20018025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 318 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 19485491 - 19485145
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| ||| |||||||    
T  19485491 gtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgct 19485392  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19485391 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagac 19485292  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19485291 cactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctatta 19485192  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19485191 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 19485145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22378086 - 22377729
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||| ||    
T  22378086 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatat 22377987  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||    
T  22377986 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttc 22377887  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||  |||||||||| ||    |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22377886 tggtcctaaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccata-caagcctcaaatggtgccattccaatactagaa 22377788  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377787 tgataactattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctcc 22377729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22384261 - 22383904
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||| ||    
T  22384261 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatat 22384162  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||    
T  22384161 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttc 22384062  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||  |||||||||| ||    |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22384061 tggtcctaaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccata-caagcctcaaatggtgccattccaatactagaa 22383963  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383962 tgataactattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctcc 22383904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 318 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22120795 - 22120449
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  22120795 gtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 22120696  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  22120695 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatcctaagac 22120596  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22120595 cactctttcacctcactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 22120496  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22120495 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 22120449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Original strand, 22987359 - 22987707
Alignment:
Q  316 gagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacg 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  22987359 gagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacg 22987458  T
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||| |||||||| | || ||||||     
T  22987459 cttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatattatctttctcaatagtttgttgaacaatttatgctcctaaa 22987558  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    ||||| || |||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  22987559 accacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataattgt 22987658  T
Q  616 tgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    | || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22987659 tattgtacatgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctcc 22987707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21940872 - 21940665
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940872 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 21940773  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940772 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 21940673  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||| ||||    
T  21940672 tgcattgt 21940665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28554885
Alignment:
Q  13 agtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatggg 28554985  T
Q  113 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554984 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttaggtattttattattttgaaactaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 28554885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22171694 - 22171491
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22171694 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttc--tatgttt 22171597  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22171596 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaataaaacaaaatcaataaggaaa 22171497  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  22171496 tgcctt 22171491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6094330 - 6094129
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6094330 atcatcactctacccatataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaatagtttccttatgttt 6094231  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094230 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 6094131  T
Q  207 tg 208  Q
    ||    
T  6094130 tg 6094129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 306 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 20396758 - 20396406
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  20396758 ataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggt 20396659  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20396658 cttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatc 20396559  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    | |||| || || || || || ||||| || |||||||||||| |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  20396558 tagtcccaaaactacactctcgcctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccattccaatactagaa 20396459  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagt 658  Q
    |||||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20396458 tgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagt 20396406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24642856 - 24642655
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24642856 atcatcagtctacccacataatagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgttt 24642757  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642756 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaacaattctagggactttatgattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 24642657  T
Q  207 tg 208  Q
    ||    
T  24642656 tg 24642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 434 - 664
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18857083
Alignment:
Q  434 ttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgat 533  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacgactctttcacctgac 18856952  T
Q  534 tcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactcta 633  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |    
T  18856953 tcaaaccagcacaacagagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatacctattattgtatgtgaactcga 18857052  T
Q  634 tcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18857053 tcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 18857083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 408 - 664
Target Start/End: Original strand, 23949170 - 23949425
Alignment:
Q  408 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctg 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||    
T  23949170 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct-aacgatttctg 23949268  T
Q  508 gtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatg 607  Q
    |||| || || || || |||||||| || |||||||||||| |||| || || ||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23949269 gtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatatagagcttcgaaaggtgccattccaatactagaatg 23949368  T
Q  608 ataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23949369 ataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 23949425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 318 - 657
Target Start/End: Original strand, 20388259 - 20388598
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||    
T  20388259 gtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgct 20388358  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||  || ||||| |  ||||| || ||||| |||||| |||| || ||    
T  20388359 tgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttttttgtagtctgatgaactatatctcgtcccaacac 20388458  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
     ||  ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  20388459 tacattttaacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatggtaactgttg 20388558  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20388559 ttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 20388598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 461 - 660
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040361
Alignment:
Q  461 ctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcat 560  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctcattcaaaccagcacaacggagttctgcat 22040261  T
Q  561 ctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22040262 ctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactaatattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 22040361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 306 - 465
Target Start/End: Original strand, 22032180 - 22032339
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  22032180 ataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagat 22032279  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctt 465  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22032280 ccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 19851566 - 19851910
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    || ||    
T  19851566 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttct 19851665  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||  ||||| |  ||||| | |||||||||     
T  19851666 acgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtccc 19851765  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  19851766 aacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactagaatggtaac 19851865  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  19851866 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaag 19851910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 19857602 - 19857946
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    || ||    
T  19857602 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttct 19857701  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||  ||||| |  ||||| | |||||||||     
T  19857702 acgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtccc 19857801  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  19857802 aacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactagaatggtaac 19857901  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  19857902 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaag 19857946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 20010526 - 20010182
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    ||| |    
T  20010526 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttctt 20010427  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  ||||||||  |||| || ||||| | |||||||||     
T  20010426 acgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctggaccttctctatagtctgatgaactaaatctggtccc 20010327  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||| || || ||| ||||||| ||||  ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  20010326 aacaacacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaagtttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaac 20010227  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20010226 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 20010182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24636987 - 24636860
Alignment:
Q  81 actttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24636987 actttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaaggactaactattctagggactttattatttt 24636888  T
Q  181 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24636887 gaaacaaaacaaaatcaagaaagaaatg 24636860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 315 - 655
Target Start/End: Original strand, 23655084 - 23655424
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    || || |    
T  23655084 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctcc 23655183  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  23655184 gcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 23655283  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || |||||||| || |||||||| || ||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| | |||||| |||||||||||     
T  23655284 cacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatgataactg 23655383  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatccca 655  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  23655384 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactgtccca 23655424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 21840572 - 21840916
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||    
T  21840572 tcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttcct 21840671  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||     
T  21840672 tcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccc 21840771  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || ||||| ||||| || || ||||||||||||||  | || ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  21840772 aacaccacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 21840871  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21840872 tgttgttgtacgtgaattctatcaacgatagatgactatcccaag 21840916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 22051018 - 22051362
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||| ||||||||    |||||    
T  22051018 tcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 22051117  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| || || || ||||| | |||||||||     
T  22051118 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctctgtcgtctgttgaaccaaatctggtccc 22051217  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || || || ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  22051218 aacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaac 22051317  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  22051318 tgttgttgtaggtgaactctataaatggtaggtgactatcccaag 22051362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 31571468 - 31571124
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  31571468 tcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 31571369  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  31571368 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccc 31571269  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |  || || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31571268 agcacaacactttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataac 31571169  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31571168 tattgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 31571124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 1266396 - 1266737
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  1266396 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 1266495  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||| || || || ||||| | ||| ||||| ||    
T  1266496 gcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatctta-ccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 1266594  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||| | |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  1266595 cacaacactctctcctgactcaaactagcacaaaggagtcctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 1266694  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1266695 ttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 1266737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 315 - 544
Target Start/End: Original strand, 20008007 - 20008236
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||    
T  20008007 ggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctac 20008106  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||    
T  20008107 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 20008206  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaaca 544  Q
     ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  20008207 caccacactttctcccgactcaaaccaaca 20008236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 312 - 431
Target Start/End: Original strand, 23949043 - 23949162
Alignment:
Q  312 ctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcc 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||    
T  23949043 ctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcc 23949142  T
Q  412 tacgcttatcatgataactc 431  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  23949143 tacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 21682094 - 21681868
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  21682094 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 21681995  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||    
T  21681994 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 21681895  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaacca 541  Q
     || || || || ||||| ||||||||    
T  21681894 cacaacactctctcctgactcaaacca 21681868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16877719 - 16877397
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||  | || ||||||| ||  ||||| |    
T  16877719 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 16877620  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  16877619 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 16877520  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  16877519 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 16877420  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  16877419 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 16877397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 21197126 - 21196804
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||| | || ||||||| ||  || || |    
T  21197126 ggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcc 21197027  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |   |||| |  || ||||  || ||||||||    
T  21197026 tcttatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttacatagtctcttgcacaacttccggtcctaa 21196927  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| || |||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  21196926 caaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactg 21196827  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  21196826 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 21196804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652635
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||| || ||  |||| ||||| | ||  || || |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  || || |  || ||||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtctcttgcaccacctccggtcctaa 20652758  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| || || | ||||||||||||| | || || || |||  |||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| |||||    
T  20652757 caaggcactttctccggacttaaaccaacacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaacta 20652658  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  20652657 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 20652635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 22062057 - 22061715
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||||||| || || || || |||||||||   || || |    
T  22062057 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctcc 22061958  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  22061957 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 22061858  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |   | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  22061857 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 22061758  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  22061757 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 22061715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 331 - 637
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315670
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || ||  | || |||||||  |  ||||| | |||||||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||  || |||||||        |||||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgaacaacttccggtcctacccaagaactttcacct 22315563  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
    || ||| ||||||||||  | ||||| || ||   |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||||    
T  22315564 gactcataccaacacaatggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaact 22315663  T
Q  631 ctatcaa 637  Q
    | |||||    
T  22315664 caatcaa 22315670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 21850961 - 21850639
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  ||| | |    
T  21850961 ggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcc 21850862  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || || |||||    
T  21850861 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggccctaa 21850762  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| ||||     
T  21850761 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtaccattccgatactagcatgaaaactg 21850662  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  21850661 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 21850639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 306 - 394
Target Start/End: Original strand, 15441329 - 15441417
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  15441329 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttg 15441417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 6603815 - 6604137
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  6603815 ggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 6603914  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  6603915 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 6604014  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || ||||||||||||||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  6604015 cacaacactctcacccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 6604114  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  6604115 ttgttatacgtaaactcaatcaa 6604137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 21325033 - 21324807
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    || ||||    
T  21325033 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctac 21324934  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  21324933 gcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 21324834  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaacca 541  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21324833 caccacactatctcctgactcaaacca 21324807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 29304050 - 29303708
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||| || || || || |||||||||   || || |    
T  29304050 ggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 29303951  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||  | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  29303950 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 29303851  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || |||||||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| || ||||| ||||||||  |     
T  29303850 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatacctatactcgaatgatagttg 29303751  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  29303750 ttgttataagtgaactctatcaacggtaggtggctatcccaag 29303708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 31417098 - 31416756
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||||    ||  | |    
T  31417098 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatcc 31416999  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    |||||||| || ||||| ||||| || || || | ||| ||||| ||    
T  31416998 gcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgcactaaatccggtcccaa 31416899  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  ||||  |||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  31416898 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaactg 31416799  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  31416798 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 31416756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 6679268 - 6679590
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  6679268 ggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 6679367  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  6679368 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 6679467  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  6679468 cacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 6679567  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  6679568 ttgttataagtaaactcaatcaa 6679590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 14565299 - 14565641
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||| ||||  || || |    
T  14565299 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttc 14565398  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  14565399 gcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaa 14565498  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || |  |||||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  14565499 cacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 14565598  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  |||||||||||||    
T  14565599 ttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaag 14565641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 804297 - 804152
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||| ||||  || || |    
T  804297 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttc 804198  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  804197 gcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 804152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 416 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 23157534 - 23157313
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    |||||||||||||||| | | || | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| |  || ||||  | |||||||||     
T  23157534 cttatcatgataactcctctatctattctgagatgctttcatattctcttgaatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttttggtcctaac 23157435  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    |   | ||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||| |||| |    
T  23157434 aaagcactttcacctgattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcataccgatactagaatgaaaactgt 23157335  T
Q  616 tgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    |||| || || ||||| |||||    
T  23157334 tgttgtaagtaaactcaatcaa 23157313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 640
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863539
Alignment:
Q  324 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcat 423  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |   ||||||| |  |||||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19863322  T
Q  424 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactct 523  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||  ||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||  |  |    
T  19863323 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19863422  T
Q  524 ttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatac 623  Q
     || || || ||  ||||||||||  | ||||  ||||||  |||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||     
T  19863423 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatggaaactgttgttataa 19863522  T
Q  624 gtgaactctatcaatgg 640  Q
    || ||||| || |||||    
T  19863523 gtaaactcaattaatgg 19863539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 640
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19868176
Alignment:
Q  324 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcat 423  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |   ||||||| |  |||||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19867959  T
Q  424 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactct 523  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||  ||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||  |  |    
T  19867960 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19868059  T
Q  524 ttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatac 623  Q
     || || || ||  ||||||||||  | ||||  ||||||  |||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||     
T  19868060 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatggaaactgttgttataa 19868159  T
Q  624 gtgaactctatcaatgg 640  Q
    || ||||| || |||||    
T  19868160 gtaaactcaattaatgg 19868176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 481
Target Start/End: Original strand, 22982593 - 22982759
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||| |||||| |||| || ||  | || ||||||| || ||| |  |    
T  22982593 ggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacc 22982692  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 481  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22982693 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaacctt 22982759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22070164 - 22070106
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 308  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070164 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 22070106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Original strand, 12304915 - 12305060
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||| ||||| || || || || |||||||||   || || |    
T  12304915 ggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 12305014  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12305015 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 12305060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21940629 - 21940573
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940629 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21940573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 20976062 - 20975933
Alignment:
Q  528 cctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtga 627  Q
    ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20976062 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtga 20975963  T
Q  628 actctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||    
T  20975962 actctatcaacggtaggtgactatcccaag 20975933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6094087 - 6094031
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094087 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 6094031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22171452 - 22171396
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171452 catgatacaaaatcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 22171396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24642608 - 24642556
Alignment:
Q  254 atacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642608 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 24642556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Original strand, 38232380 - 38232570
Alignment:
Q  10 atcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaat 109  Q
    ||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||   |||| |||||  ||| |||| ||||||||  ||||||| |||||| | |  ||| |||||||    
T  38232380 atcagtctacccacaaaatagtttttatgctttaagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaatactatt-ttacgtttaat 38232478  T
Q  110 ggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 202  Q
    || || |||  |||||||||||| |||   |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38232479 ggagtgtcatgattaagttatacctaaaaatttattaaacagactaactattctagaga-tttattattttgaaataaaacaaaatcaataaa 38232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28554847 - 28554791
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28554847 catgatacaaagccaaacccaatcaacaaagattggctattagggcttactccaaca 28554791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16265242 - 16265127
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  16265242 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 16265143  T
Q  415 gcttatcatgataact 430  Q
    |||| ||||| |||||    
T  16265142 gcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2375085 - 2375027
Alignment:
Q  135 aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaa 193  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2375085 aatgttccattaaattgactaattattatagggagtttattattttgaaacaaaacaaa 2375027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 484
Target Start/End: Original strand, 25282307 - 25282457
Alignment:
Q  334 tcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactctt 433  Q
    |||||| |||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| || ||  |||| ||||| |  |  ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  25282307 tcaaagtacgtccaacactggttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcgatgtccttcctcctcttattatgataactctt 25282406  T
Q  434 ttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 484  Q
     || | |||| | ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25282407 ctgcctactccgagacactctcatcttctcttgaatgatcttaaccttctc 25282457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 433
Target Start/End: Original strand, 28982514 - 28982632
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  28982514 ggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 28982613  T
Q  415 gcttatcatgataactctt 433  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  28982614 gcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 433
Target Start/End: Original strand, 28987734 - 28987852
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  28987734 ggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 28987833  T
Q  415 gcttatcatgataactctt 433  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  28987834 gcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 32872857 - 32873019
Alignment:
Q  23 cataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 122  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||| ||| | | || | ||  | | || |||| | |||||||||    
T  32872857 cataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactacaaatattttaatagtattgtcactcttttcaatgagatctcacaat 32872956  T
Q  123 taagttatacttaatgttccat-taaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 184  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32872957 taagtcatacttaatgttctatataaatggatgaactattataaggactttattattttgaaa 32873019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 368
Target Start/End: Original strand, 27347383 - 27347436
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 368  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27347383 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10920297 - 10920234
Alignment:
Q  113 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 176  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  10920297 gtctcacgattaactcatacttaatgttccattaaacagactaattattctaggaattttatta 10920234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 24818237 - 24818074
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| | ||||| |||||  |  | ||||| ||||||||||| ||| |  |||| ||||||  || |||||| | ||    
T  24818237 gtcaacttcctacacttcaaagcacgttcgacaccggtcacgaggttcactcttaaaaacacatgatcttcaacttgaaactcagtatctttccttctct 24818138  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 481  Q
     |||||| |||||||| |  | |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24818137 catcatggtaactcttcttcctactctgagacgatttcatcttttcctgaatcatcttaacctt 24818074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 657
Target Start/End: Original strand, 22371371 - 22371439
Alignment:
Q  589 ccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  22371371 ccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaaatctatcaacggtaggtgactatcccaag 22371439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24636642 - 24636605
Alignment:
Q  269 caatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24636642 caatcaatatagattggctattatggcttactccaaca 24636605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 585 - 657
Target Start/End: Original strand, 12305185 - 12305257
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  12305185 ggtgccataccaatgctcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcatgtgactatcccaag 12305257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 525 - 637
Target Start/End: Original strand, 22982801 - 22982913
Alignment:
Q  525 tcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacg 624  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || | |||||||||| || | ||||| || |    
T  22982801 tcacttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgacactagaatgaaaattgttgttgtaag 22982900  T
Q  625 tgaactctatcaa 637  Q
    | ||||| |||||    
T  22982901 taaactcaatcaa 22982913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 7090514 - 7090872
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  7090514 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagat 7090613  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  7090614 cttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctc 7090713  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7090714 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaactgagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggttccattctaatactagaa 7090813  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7090814 tgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 7090872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16252375 - 16252017
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16252375 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 16252276  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
T  16252275 ccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaagaatctc 16252176  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16252175 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaataatagaa 16252076  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16252075 tgataactattattgtacgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16252017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 12523765 - 12524116
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12523765 tcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcct 12523864  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12523865 acggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 12523964  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523965 aaaaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataac 12524064  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524065 tattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 12524116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 18297294 - 18297645
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18297294 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 18297393  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18297394 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18297493  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297494 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 18297593  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18297594 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 18297645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 27711425 - 27711776
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27711425 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 27711524  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27711525 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27711624  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711625 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 27711724  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27711725 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 27711776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16355375 - 16355017
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||    
T  16355375 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagat 16355276  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16355275 ctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 16355176  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16355175 tggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggaattctccatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcaaatactagaa 16355076  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16355075 tgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16355017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 12476689 - 12477040
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12476689 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcct 12476788  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12476789 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttcctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 12476888  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476889 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 12476988  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12476989 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 12477040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 19778716 - 19778365
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19778716 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 19778617  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19778616 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19778517  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19778516 aagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaac 19778417  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19778416 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 19778365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29039327 - 29038976
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  29039327 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 29039228  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29039227 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 29039128  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039127 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 29039028  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29039027 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 29038976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 14680649 - 14681007
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  14680649 ataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagat 14680748  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  14680749 ccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 14680848  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14680849 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 14680948  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14680949 tgataactattattgtatatgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 14681007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18227376 - 18227018
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  18227376 ataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagat 18227277  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| ||    
T  18227276 tcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtcttctgaacaatctc 18227177  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18227176 gggtcctaagaccactctttcacctgactaaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 18227077  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18227076 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 18227018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 23955836 - 23956187
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  23955836 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 23955935  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23955936 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 23956035  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23956036 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaac 23956135  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23956136 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacggtcctaagttcctcc 23956187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 8053546 - 8053195
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| | | ||    
T  8053546 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttct 8053447  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8053446 acgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 8053347  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053346 aagaccactctctctcctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 8053247  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8053246 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 8053195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 8386501 - 8386852
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  8386501 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 8386600  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8386601 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 8386700  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  8386701 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggcgccattccaatactagaatgataac 8386800  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8386801 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 8386852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 318 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14303896 - 14303550
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  14303896 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 14303797  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14303796 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 14303697  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14303696 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagcatgataactatta 14303597  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14303596 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 14303550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14266822 - 14266471
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  14266822 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 14266723  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14266722 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctcagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 14266623  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14266622 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactggaatgatagc 14266523  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14266522 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 14266471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 40473129 - 40473480
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  40473129 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 40473228  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  40473229 acgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatttgaactttctcagtagtttgctgaacaatctccggtcct 40473328  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40473329 aagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaataataac 40473428  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40473429 tattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 40473480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14851296 - 14850938
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  14851296 ataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggt 14851197  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  14851196 ttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttc 14851097  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14851096 tggtcctaaaaccacactctcacctgactcgagccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 14850997  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14850996 tgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 14850938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 306 - 661
Target Start/End: Original strand, 14159574 - 14159929
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||| |||||| |||| || |||||||    
T  14159574 ataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcatgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagat 14159673  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  14159674 cttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatctc 14159773  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     ||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14159774 cggtcccaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 14159873  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14159874 tgataactattattgtacgtgaactctattaatggaaggtgactatcccaagttcc 14159929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 306 - 660
Target Start/End: Original strand, 14652390 - 14652744
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  14652390 ataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagat 14652489  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  14652490 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttc 14652589  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || |  || || |||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  14652590 tggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaa 14652689  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14652690 tgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttc 14652744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 19926760 - 19926967
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926760 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 19926859  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926860 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 19926959  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  19926960 tgccttgt 19926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26970670 - 26970463
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970670 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 26970571  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970570 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 26970471  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  26970470 tgccttgt 26970463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 55612890 - 55612683
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55612890 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgttt 55612791  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612790 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 55612691  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  55612690 tgccttgt 55612683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 868804 - 868597
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868804 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 868705  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868704 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 868605  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    || |||||    
T  868604 tgtcttgt 868597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5707527 - 5707320
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707527 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 5707428  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707427 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 5707328  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  5707327 tgccttgt 5707320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26963847 - 26963640
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963847 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 26963748  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963747 aatggggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 26963648  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  26963647 tgccttgt 26963640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18262419 - 18262214
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262419 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 18262320  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18262319 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacgaaacaaaatcaataaagaaa 18262220  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  18262219 tgcctt 18262214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5714155 - 5713948
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714155 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 5714056  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714055 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgggctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 5713956  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  5713955 tgccttgt 5713948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 10621333 - 10621540
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621333 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgttt 10621432  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621433 aatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 10621532  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  10621533 tgccttgt 10621540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 10628412 - 10628619
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628412 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgttt 10628511  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628512 aatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 10628611  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  10628612 tgccttgt 10628619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 368 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1639997
Alignment:
Q  368 tctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 467  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttga 1640194  T
Q  468 atcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgac 567  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  1640193 atcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccaccctctcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatcttcgac 1640094  T
Q  568 catataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1640093 catacaaagcctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataaatattattgtaagtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctcc 1639997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18269280 - 18269070
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269280 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 18269181  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-----aaaatcaataa 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  18269180 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaacaaaatcaataa 18269081  T
Q  202 agaaatgcctt 212  Q
    |||||||||||    
T  18269080 agaaatgcctt 18269070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 28393134 - 28393339
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28393134 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgttt 28393233  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28393234 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaa 28393333  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  28393334 tgcctt 28393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 4426604 - 4426808
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4426604 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt-ccttatgttt 4426702  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426703 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 4426802  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  4426803 tgcctt 4426808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8845410 - 8845215
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8845410 atcatcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 8845311  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 202  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845310 aacgggatctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8845215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8858374 - 8858179
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8858374 atcatcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 8858275  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 202  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858274 aacgggatctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 306 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 15149936 - 15149740
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15149936 ataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 15149837  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaat 502  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  15149836 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 324 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15415198 - 15414866
Alignment:
Q  324 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcat 423  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||    
T  15415198 ttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcat 15415099  T
Q  424 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactct 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||  || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || |  || ||    
T  15415098 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcccttatcaatttgaccttttccgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacact 15414999  T
Q  524 ttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatac 623  Q
    |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  15414998 ttcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtac 15414899  T
Q  624 gtgaactctatcaatggaagatgactatcccaa 656  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15414898 gtgaactctatcaacggcagatgactatcccaa 15414866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 497 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15147623 - 15147456
Alignment:
Q  497 aacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattcca 596  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15147623 aacaatatctggtcctaagaacactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcca 15147524  T
Q  597 atactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15147523 atactagaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 15147456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 15003545 - 15003203
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||    
T  15003545 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctac 15003446  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||    
T  15003445 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaa 15003346  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||| ||  |||| || ||  || ||||||| ||||| |   | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  15003345 caccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctccacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 15003246  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  15003245 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 15003203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 317 - 657
Target Start/End: Original strand, 15070506 - 15070846
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    |||||||||| |  |||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    || || |||    
T  15070506 agtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgc 15070605  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || |    
T  15070606 ttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaaca 15070705  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
    | || ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  15070706 ctacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgtt 15070805  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15070806 gttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 15070846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12357251 - 12357136
Alignment:
Q  99 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357251 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 12357152  T
Q  199 taaagaaatgccttgt 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357151 taaagaaatgccttgt 12357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676417
Alignment:
Q  359 aggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 458  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  459 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactc 522  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 16676417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 317 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 55375537 - 55375217
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || | |    
T  55375537 agtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 55375438  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  ||||||||||| |    
T  55375437 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgtacaacttctggtcctaaca 55375338  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |||| ||    
T  55375337 aagcactttcacctgattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgtaaactgtt 55375238  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||| || || ||||| |||||    
T  55375237 gttgtaagtaaactcaatcaa 55375217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 414 - 657
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15078068
Alignment:
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 15077924  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | || || ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15077925 acactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 15078024  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15078025 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 15078068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20311499 - 20311299
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| | || ||| |||||||||||    
T  20311499 atcatcaatctacccacaaaatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaaaaacagtgtccttatgttt 20311400  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttata-cttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20311399 aatggggtctcacaattaagttataccttaatgctccattgaacatattaactattataagtactttattattttaaaacaaaacaaaatcaataaagaa 20311300  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  20311299 a 20311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 15359271 - 15358929
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    || ||||    
T  15359271 ggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 15359172  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  15359171 gcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 15359072  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||  ||||| |||||     
T  15359071 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacatgaatggtaactg 15358972  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  15358971 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 15358929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 315 - 656
Target Start/End: Original strand, 15246015 - 15246356
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||||     |||||||    
T  15246015 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctac 15246114  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||  ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  15246115 gtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttcttcgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 15246214  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| ||||| |||||| |  | ||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| | |||     
T  15246215 cacaacactttctcctgactcaaactagaataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtgactg 15246314  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaa 656  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  15246315 ttgttgtacgtcaactctatcaacggtagttgactatcccaa 15246356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 374 - 658
Target Start/End: Original strand, 8706068 - 8706352
Alignment:
Q  374 aaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 473  Q
    ||||||||  |||||||| |  || ||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||   || | |    
T  8706068 aaacacataatctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctcttattagc 8706167  T
Q  474 ttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatata 573  Q
    ||||| || ||  |||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||| |    
T  8706168 ttaactttttctatagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacataacgaagttctgcacctccgaccataca 8706267  T
Q  574 aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagt 658  Q
    |||| ||  | |||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8706268 aagcttcgaatggtgtcattcatatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagt 8706352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 51606364 - 51606020
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  51606364 tcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 51606265  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  51606264 ccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccc 51606165  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  51606164 agcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgagtgataac 51606065  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  51606064 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 51606020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 13247736 - 13248058
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||  ||||| || | || |||||||| ||||| || ||  |||| ||||||| || ||| || |    
T  13247736 ggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcc 13247835  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  13247836 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 13247935  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| || |||||||||||||||||| | ||||| || |||  |||||| ||||||||| | || ||||| | ||||||||||||| ||||     
T  13247936 caaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccatcctaatactagaatgaaaactg 13248035  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  13248036 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 13248058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 15293338 - 15293016
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| |||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  ||||| |    
T  15293338 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 15293239  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  15293238 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 15293139  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  15293138 caaagcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 15293039  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  15293038 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 15293016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 27900477 - 27900819
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||  |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || |||||||| | ||||||||    
T  27900477 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctac 27900576  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  27900577 gcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 27900676  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || |||||||| || ||   ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  27900677 cacaacactttctcccgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 27900776  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  27900777 ttgttgtatgtgaactctatgaacggtaggtgactatcccaag 27900819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 317 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 1649456 - 1649116
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||    
T  1649456 agtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgc 1649357  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| || ||||  ||||| |  ||||| | ||| ||||| || |    
T  1649356 ttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgattatcttgactttcttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaca 1649257  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
    |||| || || | ||| |||||||| || ||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  1649256 ccacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgacataccaatactcgaatggtaactgtt 1649157  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  1649156 gttgtaagtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 1649116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 20891073 - 20891415
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || |||||||||   || || |    
T  20891073 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 20891172  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | ||  ||||| ||    
T  20891173 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaattcggtcccaa 20891272  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || |||||||| |||||||| || ||  |||| || || ||| | ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  20891273 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatgatagcta 20891372  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  20891373 ttgttatatgtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaag 20891415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 331 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132293
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||| || ||  |||| |||||||  |  ||||| | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| || | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  ||||| ||||| |  || |||||||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttctggacctaacaaaacactttcacct 12132375  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    || ||| |||||||||||   ||||| |||| | || |||| ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||| ||||    
T  12132374 gactcataccaacacaacgacgttctacatc-ccgatcatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagaatgaaaact 12132293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 16146003 - 16146345
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||  | || || ||||||||    |||||||    
T  16146003 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctac 16146102  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||| ||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||    
T  16146103 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 16146202  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || |  ||||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||| | ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  16146203 cacaacactctgtcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 16146302  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || || || ||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  16146303 ttattgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaag 16146345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 313 - 421
Target Start/End: Original strand, 15364475 - 15364583
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  15364475 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 15364574  T
Q  413 acgcttatc 421  Q
    |||||||||    
T  15364575 acgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 3264975 - 3264633
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  3264975 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 3264876  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  3264875 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 3264776  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  3264775 cacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 3264676  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  |||||||||||||    
T  3264675 ttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaag 3264633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 10677555 - 10677753
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||    
T  10677555 atcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgttt 10677652  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  10677653 aatggg-tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaa 10677751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 10891195 - 10891393
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||    
T  10891195 atcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgttt 10891292  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  10891293 aatggg-tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaa 10891391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997729
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  |  ||||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaa 14997606  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || |  || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||     
T  14997607 caaagcactctctctggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactg 14997706  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  14997707 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 14997729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 5668125 - 5668327
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggata--ctttgagaatagtttccttatgt 104  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||| |||||||||||||  |||  |||| |||||| | |||||   |    
T  5668125 atcatcggtctatccacataatagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaataatgtcctttcat 5668224  T
Q  105 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 204  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5668225 ttaatggg-tctcacgattaaatcacacttaatgctccattaaatagactaattattctagagactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaaga 5668323  T
Q  205 aatg 208  Q
    ||||    
T  5668324 aatg 5668327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 613
Target Start/End: Original strand, 9290926 - 9291224
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||| | ||||||||| | || |||||||| || || || ||  | || ||||||| ||  || || |    
T  9290926 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 9291025  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  9291026 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 9291125  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
     |   | ||||| || || ||||||||||||||  | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||    
T  9291126 caaagcactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaact 9291224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 11207412 - 11207070
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  11207412 ggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 11207313  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| ||    
T  11207312 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaa 11207213  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  11207212 cacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 11207113  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| | ||| || |  |||||||||||||    
T  11207112 ttgttataagtgaactcaaccaaaggcaagtgactatcccaag 11207070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445227
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || |||||||||||| | || || ||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  ||||| |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 481  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 16445227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5616421 - 5616215
Alignment:
Q  8 tcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagc--ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtt 105  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||  || ||| |  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||   |||    
T  5616421 tcatcaatctacatacataatagtctcaatgctttattaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaataatgtcctctagtt 5616322  T
Q  106 taatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaa 205  Q
    ||| ||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||  |||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5616321 taacgggatctcatgatttagtcagacttaatgttccaagaaatagactaattattttaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatgaataaagaa 5616222  T
Q  206 atgcctt 212  Q
    |||||||    
T  5616221 atgcctt 5616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35223767 - 35223576
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||  ||||    
T  35223767 atcatccgtctacccacataatagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaataatgtcctttcgttt 35223668  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
     | |          ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35223667 tacg----------attaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattctagggactttattattttaaaacaaaacaaaatcaacaaagaaa 35223578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 313 - 508
Target Start/End: Original strand, 16752682 - 16752877
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||    || ||    
T  16752682 tcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttct 16752781  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctgg 508  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  16752782 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtttgatgaaccaaatctgg 16752877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 657
Target Start/End: Original strand, 33223012 - 33223351
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || |||||||| |  || || ||||    
T  33223012 gtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgct 33223111  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||| ||| || ||||| |||||||  ||||| |  |||||||| || ||    
T  33223112 tgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacttgactttctcagtagtttcatgaaccaagtctggtcccaacac 33223211  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
    ||| || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| || || |   | |||| ||| ||||||||  | || ||  | |||    
T  33223212 cacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaatgctttgaatggtgtcataccaatactctattgttattttttg 33223311  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  33223312 ttttatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 33223351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 308
Target Start/End: Original strand, 19927003 - 19927061
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 308  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927003 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 19927061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 29453718 - 29453376
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  29453718 ggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 29453619  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | |||  |||| ||    
T  29453618 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgaaccaaatcccgtcccaa 29453519  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  29453518 tacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 29453419  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  |||||||||||||    
T  29453418 ttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaag 29453376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5713912 - 5713856
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713912 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5713856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26963604 - 26963548
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963604 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26963548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26970427 - 26970371
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970427 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 9849656 - 9849473
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |    |||||||||||||  || |||||  |||| || |||| ||  |||||  | |    
T  9849656 gtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactaggtcaactctcaaaaacatttgatctccgacttgaaattcaatatccttcctctgtt 9849557  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaa 501  Q
    |||||||| ||||||| |  | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  9849556 tatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttctccatagtctgctgaacaa 9849473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 331 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 12343028 - 12342722
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||||| |||| | || ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||  | || ||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||    
T  12343028 acttcaaagcacgtctaacatcggttacaggatacactctaaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcaatattcttcctcctcttatcatgataact 12342929  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| || | |||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||| |  ||||| |  || ||||  || |||||||  |   | |||||||||    
T  12342928 cttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacctccggtcctagtaaagcactttcacct 12342829  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
    || ||| |||||||||||   ||||| || |||  |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || | ||||| || || ||||    
T  12342828 gactcataccaacacaacgacgttctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggtgccatcccaatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaact 12342729  T
Q  631 ctatcaa 637  Q
    | |||||    
T  12342728 caatcaa 12342722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5707284 - 5707228
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707284 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5707228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 10621576 - 10621632
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12357100 - 12357044
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357100 catgatacaaagccaaatccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 12357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Original strand, 17142372 - 17142432
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacataaa 310  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17142372 catgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggctttttccaacataaa 17142432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 868561 - 868507
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868561 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggtttattccaa 868507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 10628655 - 10628711
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628655 catgatacaaagtcaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 55612650 - 55612594
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55612650 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggttattagggcttattctaaca 55612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 18550234 - 18549916
Alignment:
Q  324 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcat 423  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |  | ||| || ||||| |   ||||||| ||||||||||    
T  18550234 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaacaaatgatacctttcctgaaactccaatgatttccttcgcttatcat 18550135  T
Q  424 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttca-tct-tctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccact 521  Q
    |||| |||||||||| | | || || ||||||| ||| ||||| ||||||| || || || || || || ||||||||||| |||||||| || ||  |     
T  18550134 gatagctcttttgtctattttgtgatgctttcattctctctctcgaatcattttgactttttctgtcgtctgctgaacaatctctggtcccaacactgca 18550035  T
Q  522 ctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttat 621  Q
     |||| || || ||  ||||||||||  | ||||  ||||||  |||||| ||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||  || | |||||||    
T  18550034 atttcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaatacctcaaatggtgccatcccaatactagaatggaaattgttgttat 18549935  T
Q  622 acgtgaactctatcaatgg 640  Q
    | || ||||| || |||||    
T  18549934 aagtaaactcaattaatgg 18549916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 306
Target Start/End: Original strand, 28393380 - 28393434
Alignment:
Q  252 tgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393380 tgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 28393434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 307
Target Start/End: Original strand, 4426847 - 4426904
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 307  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4426847 catgatacagagccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaacat 4426904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 44662047 - 44661902
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  44662047 ggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctcc 44661948  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44661947 gcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 44661902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18269032 - 18268976
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18269032 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 18268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Original strand, 39074278 - 39074346
Alignment:
Q  98 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctag 165  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  39074278 cttatgtttaatggggtctcatgattaagtcatacttaatgttcaatttaaacggactaattattctag 39074346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Original strand, 21454137 - 21454319
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    ||||||| |||||  |||||||  ||| ||||| ||| || |||| || ||| ||| |||| |||||||  |||| ||| | |||| | || ||||  ||    
T  21454137 atcatcaatctactcacataataatctttatgcattattgttatctcatttcacaataaagtttgactatagatattttaaaaataatgtcattataatt 21454236  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatactt-aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 188  Q
    ||||||||||||  ||||||| | | || ||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21454237 aatggggtctcaatattaagtcacattttaatgttccattaatcaaactaactattctaagaactttattactttgaaacaaa 21454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55992729 - 55992680
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttat 299  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55992729 catgatacaaagtcaaacccaatcaatacaaattggctattagggcttat 55992680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 483
Target Start/End: Original strand, 16685361 - 16685513
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||| || | |||||||||||| |||| || ||  |||| || | || ||  ||| | | ||||||||||||| |    
T  16685361 acttcaaagcacacccaacaccggttacatgattcactctcaaaaacccatgatcaccaacttgaaattaaatatccttcatcctcttatcatgataaat 16685460  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 483  Q
     || || | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16685461 tttctgcctactctgagacgctctcatcttctcctgaatcatcttaactttct 16685513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Original strand, 11161913 - 11161972
Alignment:
Q  105 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11161913 ttaatggagtctcacaattaagtcacactttgtgttccattaaactgattaactattcta 11161972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 291
Target Start/End: Original strand, 5668371 - 5668412
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctatta 291  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668371 catgatacaaaaccaaacacaatcaatatagattggctatta 5668412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8845166 - 8845118
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 298  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8845166 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8845118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8858130 - 8858082
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 298  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8858130 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18262176 - 18262136
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctatt 290  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18262176 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatt 18262136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 87)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 25423203 - 25423561
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25423203 ataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 25423302  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  25423303 ctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctt 25423402  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423403 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 25423502  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25423503 tgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatccctagttcctcc 25423561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21984677 - 21984319
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21984677 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagat 21984578  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21984577 ctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctc 21984478  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984477 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 21984378  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21984377 tgattactattattgtacgtgaactctatcaatgaaagatgactatcccaagttcctcc 21984319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 23573756 - 23574114
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23573756 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 23573855  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  23573856 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 23573955  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23573956 tggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 23574055  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23574056 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 23574114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 23516555 - 23516913
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  23516555 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggt 23516654  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  23516655 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctc 23516754  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23516755 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataccaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 23516854  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23516855 tgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctcc 23516913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 20798774 - 20799132
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20798774 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 20798873  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |     
T  20798874 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctt 20798973  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20798974 tggtcctaagacctctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 20799073  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20799074 tgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 20799132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 19769981 - 19770332
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19769981 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 19770080  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19770081 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19770180  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770181 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 19770280  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19770281 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 19770332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 40708801 - 40709152
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  40708801 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttct 40708900  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40708901 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 40709000  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709001 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 40709100  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40709101 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 40709152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 16356523 - 16356874
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16356523 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 16356622  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16356623 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16356722  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356723 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 16356822  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16356823 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16356874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 306 - 661
Target Start/End: Original strand, 23440239 - 23440594
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  23440239 ataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagat 23440338  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23440339 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 23440438  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23440439 tggttttaagaccactctttctcctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctgaaaaggtgccattccaatactagaa 23440538  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440539 tgataactattattgtatgtaaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcc 23440594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 34566515 - 34566866
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34566515 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 34566614  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34566615 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 34566714  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566715 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 34566814  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34566815 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 34566866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15000104 - 14999753
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15000104 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 15000005  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15000004 acacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 14999905  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14999904 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagtctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 14999805  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14999804 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaaattcctcc 14999753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27685765 - 27685414
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27685765 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcct 27685666  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27685665 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27685566  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27685565 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaggcctcgaaaggtgtcattccaatacttgaatgataac 27685466  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27685465 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 27685414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 37291861 - 37291510
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37291861 tcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcct 37291762  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37291761 acacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 37291662  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291661 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataac 37291562  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37291561 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 37291510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21498408 - 21498050
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| |  |    
T  21498408 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgt 21498309  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21498308 ctatcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctc 21498209  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498208 gggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 21498109  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498108 tgataacttttattttacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 21498050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27668855 - 27668504
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  27668855 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 27668756  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27668755 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27668656  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668655 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 27668556  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27668555 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctcc 27668504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 27610375 - 27610726
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  27610375 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 27610474  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27610475 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27610574  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610575 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 27610674  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27610675 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagtccctcc 27610726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 313 - 661
Target Start/End: Original strand, 27518428 - 27518776
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  27518428 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 27518527  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27518528 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27518627  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518628 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 27518727  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27518728 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcc 27518776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 22134689 - 22135040
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  22134689 tcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 22134788  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22134789 gcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22134888  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22134889 aagaccactctttcacctgactcaaactagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 22134988  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22134989 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 22135040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22333252 - 22332901
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  22333252 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttct 22333153  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||   || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22333152 acgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccggactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22333053  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22333052 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 22332953  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22332952 tattattgtctgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 22332901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 41770863 - 41771214
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  41770863 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 41770962  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41770963 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 41771062  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771063 aagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 41771162  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41771163 tattattataagtgagctcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctcc 41771214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 306 - 639
Target Start/End: Original strand, 18775791 - 18776124
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||    
T  18775791 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagat 18775890  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  18775891 ccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 18775990  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18775991 gggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaa 18776090  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatg 639  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  18776091 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaatg 18776124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 22348446 - 22348795
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||| ||  ||    
T  22348446 tcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcccgaaactcaagatttt--ct 22348543  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22348544 acgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 22348643  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22348644 aagactactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataac 22348743  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22348744 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 22348795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 318 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29476433 - 29476087
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  29476433 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 29476334  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  ||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  29476333 tatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttttcagtagtctgttgaacaatctctggtcctaagac 29476234  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  29476233 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 29476134  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29476133 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 29476087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 26739077 - 26738719
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||||| |||||||| |    
T  26739077 ataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggt 26738978  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  26738977 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgtacaatttc 26738878  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||| |||    
T  26738877 tggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagccttaaattgtgccattccattactggaa 26738778  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    | |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26738777 taataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 26738719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Original strand, 23471254 - 23471598
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | || |||||||    
T  23471254 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgc 23471353  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| || || |    
T  23471354 ttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttatggccccaaaa 23471453  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
    | || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23471454 ctacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctgtt 23471553  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
     || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23471554 attgtacgtgaactctattaatgggagatgactatcccaagttcc 23471598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 368 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339300
Alignment:
Q  368 tctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 467  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  468 atcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgac 567  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 21339397  T
Q  568 catataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21339396 catacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 21339300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 20468468 - 20468110
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  20468468 ataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggt 20468369  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |     
T  20468368 ctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttggatcaacttaacattctcagtagtttgctgaacgattta 20468269  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || || || || |||||||| || |||||||||||| |||| || || ||| ||||||  | ||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  20468268 tggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatgcagagcttcaaatggtgccattccaatactagaa 20468169  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20468168 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 20468110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 24695466 - 24695673
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24695466 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgttt 24695565  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695566 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 24695665  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  24695666 tgccttgt 24695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 18569863 - 18570070
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18569863 atcatcagtctaccaacataatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagagtagtttccttatgttt 18569962  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569963 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18570062  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    || |||||    
T  18570063 tgtcttgt 18570070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 19714498 - 19714703
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  19714498 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgttt 19714597  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19714598 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaa 19714697  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  19714698 tgcctt 19714703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 19707218 - 19707419
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  19707218 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgttt 19707317  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19707318 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaa 19707417  T
Q  207 tg 208  Q
    ||    
T  19707418 tg 19707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 24749919 - 24749575
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||    
T  24749919 tcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcct 24749820  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||| ||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  24749819 acgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtccc 24749720  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || | ||| ||||| || || |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24749719 aacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 24749620  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  24749619 tgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 24749575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 21891122 - 21890780
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  21891122 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 21891023  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||| ||| ||    
T  21891022 gcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctgttcccaa 21890923  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || ||||||||||| ||  ||||  || | ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  21890922 cactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagtcttgtacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 21890823  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  21890822 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgagtatcccaag 21890780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 17269698 - 17269354
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  17269698 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 17269599  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  17269598 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccc 17269499  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || || || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  17269498 aacacaacactctctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatggtaac 17269399  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17269398 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 17269354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 21564329 - 21563994
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  || || |    
T  21564329 ggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttcttc 21564230  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||   ||||  || ||||| || ||||| || ||||| |||||| |||| ||    
T  21564229 gcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctctcttatcaatttgaccttttctgtagtctgatgaactatatctagtcccaa 21564130  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || |||       | ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||| ||| |||||||| ||||| |||||     
T  21564129 cactacactt-------actcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactg 21564037  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21564036 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 21563994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 24735976 - 24735657
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||    
T  24735976 tcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcct 24735877  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||| ||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  24735876 acgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtccc 24735777  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || | ||| |||||  | || |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24735776 aacatcacactttcttccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 24735677  T
Q  613 tattgttatacgtgaactct 632  Q
    | ||||| || |||||||||    
T  24735676 tgttgttgtatgtgaactct 24735657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 20821458 - 20821800
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || ||||| || || ||||| | |||| |||    
T  20821458 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttac 20821557  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||| ||||| |  ||||| | ||| || || ||    
T  20821558 gcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctaactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggccccaa 20821657  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || ||||||||||| |   |||| || ||  || ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||     
T  20821658 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactg 20821757  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20821758 ttgttgtatgtgagttctatcaatggtagatgactatcccaag 20821800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 28895305 - 28894963
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||||||||    
T  28895305 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctac 28895206  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | || || || ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  28895205 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 28895106  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||  || ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  28895105 aacaacactttctcccgactcgaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 28895006  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28895005 ttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaag 28894963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 28924131 - 28923789
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||||||||    
T  28924131 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctac 28924032  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | || || || ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  28924031 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 28923932  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||  || ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  28923931 aacaacactttctcccgactcgaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 28923832  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28923831 ttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaag 28923789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 408 - 664
Target Start/End: Original strand, 21404936 - 21405194
Alignment:
Q  408 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctg 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||  ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  21404936 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaacaatgtctg 21405035  T
Q  508 gtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatata--aagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||| |  | |||  | ||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |  | || ||  | |||||||||||||||||||||    
T  21405036 gtcccagtatcacaatctcaccggactcataccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaacacgcttcgaacggtgccattccaatactagaa 21405135  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21405136 tggtaactgttattataagtgaactcgatcaatgaaagatgactatcccaagttcctcc 21405194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210735
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| || |||||| |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 11210858  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |  || || || || || |||||||||||||||   || || || |||  |||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11210857 caaaacactctctccggactcaaaccaacacaacgatgtcctacacctcctaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgaaaacta 11210758  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  11210757 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 11210735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 22461957 - 22462299
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||| |  |||||||    
T  22461957 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctac 22462056  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||  ||||| |  || || || ||    
T  22462057 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctctgtagtttcatgaaccaattccggccccaa 22462156  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || || ||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||| ||| ||||| |||||     
T  22462157 cacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaacactcgaatggtaactg 22462256  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || || || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  22462257 ttgttgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaag 22462299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 423 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 21831998 - 21831763
Alignment:
Q  423 tgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactc 522  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   || | ||||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |    
T  21831998 tgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacac 21831899  T
Q  523 tttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttata 622  Q
      ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | |||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||    
T  21831898 cctcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcaaatggtgtcattcctatactagaaaggtaactgttgttgta 21831799  T
Q  623 cgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagt 658  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21831798 cgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagt 21831763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 20773765 - 20774107
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| || || |||| |||||| || |||| ||| |||||| | ||||| || |||| ||| | ||||| ||    
T  20773765 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgac 20773864  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| ||    
T  20773865 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaattccggtcccaa 20773964  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || ||  |||| || || || |||||||| ||  ||||  | ||  || ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  20773965 aacaacattttctcccgactcgaaccaacataaaggagtcttacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 20774064  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20774065 ttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaag 20774107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 23442656 - 23442427
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||    
T  23442656 ggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagagccttcctac 23442557  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  23442556 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 23442457  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaaca 544  Q
     || || ||||| || |  |||||||||||    
T  23442456 cactacactttctcccgtctcaaaccaaca 23442427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 27347501 - 27347679
Alignment:
Q  30 gtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtta 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||| |||||| ||||||| |    
T  27347501 gtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataatgtcctttcgtttaatggg-tctcacgattaagtca 27347599  T
Q  130 tacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 209  Q
     |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27347600 cacttaatgctccattaaacagattaattattctaaggactttattattttgaatcaaaacaaaatcaacaaagaaatgc 27347679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 22236283 - 22235941
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  22236283 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 22236184  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| || ||||| ||||| || ||||| |  || ||||| ||    
T  22236183 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaactccggtcccaa 22236084  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| ||||||||  | ||  ||||  |||| ||| ||||||| ||||| ||  | | |||||| |||||||| ||||| |||||     
T  22236083 cacaacactctctcctgactcaaaccagaataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccataccaatactcgaatggtaactg 22235984  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  22235983 ttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaag 22235941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937229
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || || || ||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaa 21937352  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| || |||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| ||||     
T  21937351 caaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactg 21937252  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  21937251 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 21937229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011411
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  ||||| |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 27011288  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || ||  | ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||| ||||     
T  27011289 caaagcactctctccgaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcattccgatactagcatgaaaactg 27011388  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  27011389 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 27011411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 22547016 - 22547217
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||| || ||||||| | |||| | ||| ||| |||    
T  22547016 atcatcggtctatccacataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataatgtccatatattt 22547115  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||    
T  22547116 aatgagatctcacgattaagttatacttaatgttccattaaaccgactaactattatagcggttttattattttaaaataaaacaaaatgaataaataaa 22547215  T
Q  207 tg 208  Q
    ||    
T  22547216 tg 22547217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 23080452 - 23080110
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||  ||    || || |    
T  23080452 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctcc 23080353  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||| ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  23080352 gcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctcatgcaccaagtctggtcccaa 23080253  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||||| |||||||| || |   |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  23080252 caccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 23080153  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  23080152 ttgttatatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 23080110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581538
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || | |||||| || || ||  |||| ||||||| ||  ||||| |    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||  || ||||  || ||||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtggtttcttgcacaacttccggtcctaa 24581415  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  24581416 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 24581515  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  24581516 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 24581538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39538071 - 39537962
Alignment:
Q  105 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39538071 ttaatgaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaaccaactattctaaggacttaaccattttgaaacaaaacaaaatcattaaaga 39537972  T
Q  205 aatgccttgt 214  Q
    |||| |||||    
T  39537971 aatggcttgt 39537962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 313 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 24737150 - 24737011
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||    
T  24737150 tcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcct 24737051  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgct 452  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24737050 acgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgct 24737011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 22381204 - 22381546
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||| || || || || |||||||||   || || |    
T  22381204 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 22381303  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  22381304 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattttgaccttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 22381403  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || |||||||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  |  ||||||| || ||||| || ||||| ||     
T  22381404 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatagtgccatacctatactcgagtgatagctg 22381503  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  22381504 ttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaag 22381546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 22502684 - 22503026
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || |||||||||   || || |    
T  22502684 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 22502783  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||    |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| |  |||||||| ||    
T  22502784 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtctggtcccaa 22502883  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || |||||||| || ||  ||||  | || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  22502884 cacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatgccaatactcgagtgatagctg 22502983  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  22502984 ttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaag 22503026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Original strand, 17285755 - 17285935
Alignment:
Q  30 gtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtta 129  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||| ||| |||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| ||||||| |    
T  17285755 gtctatatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtca 17285854  T
Q  130 tacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 210  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17285855 cacttaatgttccattaaacagactaactattctctggagattattattttgaaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17285935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 37545860 - 37545517
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca-aaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttccta 413  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||| || || || || ||||||||||  || ||     
T  37545860 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 37545761  T
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  || || | ||| ||||| |    
T  37545760 cgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatccggtccca 37545661  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | || || |||||||| || |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| || || ||  |  ||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  37545660 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacagtgccataccaatactcgagtgatagct 37545561  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
     |||||||| || ||||| ||||| || |  |||||||||||||    
T  37545560 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaag 37545517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 14887354 - 14887012
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  14887354 ggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 14887255  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  || || | ||| ||||| ||    
T  14887254 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaa 14887155  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || |||||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| | ||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  14887154 cacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 14887055  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  |||||||||||||    
T  14887054 ttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaag 14887012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 24798760 - 24798615
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| || || ||  | ||||||||||  ||||| |    
T  24798760 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttc 24798661  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  24798660 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatctt 24798615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Original strand, 25848080 - 25848225
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||  ||  | |    
T  25848080 ggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttcc 25848179  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25848180 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 25848225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 20342287 - 20342629
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||| || |  || || ||||||||||  || || |    
T  20342287 ggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttc 20342386  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| ||    
T  20342387 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaa 20342486  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || |||||| | || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  20342487 cacaacactctcacccgactcaaactagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 20342586  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||||||||    
T  20342587 ttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaag 20342629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 306 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21343730 - 21343666
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21343730 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 331 - 490
Target Start/End: Original strand, 23503464 - 23503623
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| || | || || ||||||||||| || ||   ||| ||||||| ||  || || | |||||||||||||||    
T  23503464 acttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatgatcaccaatttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 23503563  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 490  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23503564 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 23503623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31886640 - 31886537
Alignment:
Q  105 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 204  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31886640 ttaatggagtctcacgattaagtcgtacttgatgttcaattaaatgaactaattattctaaggactttattaatttgaaacaaaacaaaatcactaaaga 31886541  T
Q  205 aatg 208  Q
    ||||    
T  31886540 aatg 31886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 317 - 394
Target Start/End: Original strand, 20573546 - 20573623
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttg 394  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20573546 agtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttg 20573623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Original strand, 17298908 - 17299088
Alignment:
Q  30 gtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtta 129  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||  ||| |||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||      
T  17298908 gtctatatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtcg 17299007  T
Q  130 tacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17299008 cacttaatgttccattaatcggactaactattctctggatattattatttataaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17299088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 24695709 - 24695765
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695709 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 24695765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 18807034 - 18807175
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcc-ttatgtt 105  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| || |||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||| ||    
T  18807034 atcatcagtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataatgtccattat-tt 18807132  T
Q  106 taatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaa 148  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18807133 taatggtgtctcacgattaagtcacacttaatgttccattaaa 18807175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 19714742 - 19714798
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714742 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19714798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 39538793 - 39538701
Alignment:
Q  9 catcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcctta 101  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  39538793 catcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaatagtgtcctta 39538701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 19707462 - 19707518
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707462 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19707518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21662412 - 21662300
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| |    
T  21662412 ataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggt 21662313  T
Q  406 atttcctacgctt 418  Q
     ||||||||||||    
T  21662312 ctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21665873 - 21665761
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| |    
T  21665873 ataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggt 21665774  T
Q  406 atttcctacgctt 418  Q
     ||||||||||||    
T  21665773 ctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 27347722 - 27347778
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27347722 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27347778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 585 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 28916506 - 28916434
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28916506 ggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaag 28916434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39537925 - 39537870
Alignment:
Q  251 atgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39537925 atgatacaaagctaaactcagtcaacatagattggctattagggcttaatccaaca 39537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 585 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 21680499 - 21680429
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatccca 655  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  21680499 ggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtacgtaaactctatcaacggtaggtgactatccca 21680429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Original strand, 33477389 - 33477479
Alignment:
Q  98 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 188  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||  | | |||||||| |||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33477389 cttatgattaatgaggtctcacgattagatcacacttaatgatccattaatcagcctaactattgtaaggactttattattttgaaacaaa 33477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 556 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 1053
Alignment:
Q  556 tgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcc 653  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  1150 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcc 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25244695 - 25244546
Alignment:
Q  335 caaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttt 434  Q
    ||||||||||||||||||    ||| || | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| || |||| | | ||||| ||||||||||| |    
T  25244695 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctct 25244596  T
Q  435 tgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 484  Q
    || | ||| |    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  25244595 tgcctactgtcacgcgctttcatcttcttctgaatcatcttaacattctc 25244546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25308847 - 25308698
Alignment:
Q  335 caaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttt 434  Q
    ||||||||||||||||||    ||| || | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| || |||| | | ||||| ||||||||||| |    
T  25308847 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctct 25308748  T
Q  435 tgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 484  Q
    || | ||| |    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  25308747 tgcctactgtcacgcgctttcatcttcttctgaatcatcttaacattctc 25308698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16066034 - 16065877
Alignment:
Q  334 tcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactctt 433  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || ||  ||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  16066034 tcaaagcacgcccaacaccagtcacgggattaactctaaaaaatacatgatcaccaacttggaattcaatatccttcctcctcttatcatgataactctt 16065935  T
Q  434 ttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttg 493  Q
     |  | | |||| || || |||||||  || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16065934 ctccctagtctgagatgccttcatct--tcctgaatcatcttaactttccctgtagtttg 16065877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 390
Target Start/End: Original strand, 21404858 - 21404934
Alignment:
Q  314 cggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctcctt 390  Q
    ||||||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21404858 cggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatgatctcctt 21404934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Original strand, 18570108 - 18570156
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18570108 catgatacaaagccaaacccaattaatatagattagctattagagctta 18570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11479489 - 11479420
Alignment:
Q  96 tccttatgtttaatg-gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||    
T  11479489 tccttatgtttaatgagggtctcacaatcaagtcacacttaatatttcattaaacacactaattattcta 11479420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Original strand, 17285948 - 17285996
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 298  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17285948 catgataaaaagttaaatccaataaatatagattagctattagggctta 17285996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 23063790 - 23064148
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23063790 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctccttcttgaaactcaagat 23063889  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  23063890 ctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttcaacaatctc 23063989  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23063990 tggtcctaagaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatacttgaa 23064089  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23064090 tgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctcc 23064148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 24675202 - 24675560
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24675202 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 24675301  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  24675302 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 24675401  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24675402 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 24675501  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675502 tgataactattattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 24675560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21325996 - 21325638
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21325996 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 21325897  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  21325896 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggtttgttgaacaatctc 21325797  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21325796 tggtcctaagaccactctttcacccgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccagataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 21325697  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21325696 taataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 21325638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 308 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 24708210 - 24707854
Alignment:
Q  308 aaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatat 407  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||      
T  24708210 aaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcc 24708111  T
Q  408 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctg 507  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  24708110 ttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttctg 24708011  T
Q  508 gtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatg 607  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24708010 gtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatg 24707911  T
Q  608 ataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24707910 ataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 24707854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 16924980 - 16925331
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16924980 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 16925079  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16925080 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16925179  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925180 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 16925279  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16925280 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16925331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 16998720 - 16999071
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16998720 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 16998819  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16998820 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16998919  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998920 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 16999019  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16999020 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16999071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 16981872 - 16982223
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  16981872 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttct 16981971  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16981972 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16982071  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982072 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 16982171  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16982172 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16982223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 17063437 - 17063788
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  17063437 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttct 17063536  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17063537 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17063636  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063637 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 17063736  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17063737 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 17063788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 17067095 - 17067446
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  17067095 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttct 17067194  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17067195 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17067294  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067295 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 17067394  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17067395 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 17067446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 24262090 - 24262441
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24262090 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcct 24262189  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24262190 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24262289  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24262290 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 24262389  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24262390 tattattgtatgtggactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctcc 24262441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 24709753 - 24710104
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  24709753 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 24709852  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24709853 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24709952  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24709953 aagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgataac 24710052  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24710053 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 24710104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 9609856 - 9610207
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9609856 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 9609955  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9609956 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 9610055  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610056 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 9610155  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9610156 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 9610207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 23188721 - 23189078
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||    
T  23188721 ataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagat 23188820  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  23188821 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctc 23188920  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23188921 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacac-acggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcctaaactagaa 23189019  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23189020 tgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 23189078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 27370989 - 27371340
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27370989 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 27371088  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27371089 acgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27371188  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27371189 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacatagttcttcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaac 27371288  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27371289 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 27371340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 24878718 - 24878367
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  24878718 tcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 24878619  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24878618 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24878519  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24878518 aagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgtcattccaatactataatgataac 24878419  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24878418 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 24878367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 10868570 - 10868921
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  10868570 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcct 10868669  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10868670 acgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10868769  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868770 aagaccaccctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 10868869  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10868870 tattgttataagtgaactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctcc 10868921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21145753 - 21145402
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  21145753 tcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 21145654  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  21145653 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctggacaatctttggtcct 21145554  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145553 aagaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttttgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataac 21145454  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21145453 tattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatggctatcccaagttcctcc 21145402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22757193 - 22756837
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22757193 ataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagat 22757094  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | || |||||||| ||    
T  22757093 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatctgttgaacaatctc 22756994  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22756993 tggtcctaagaccactctttctcctgactc--accaacacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcaaagggtgccattccaatactagaa 22756896  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
     | ||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  22756895 cggtaactgttattgtacgtgaagtctatcaacggaagatgactatccgaagtccctcc 22756837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 27217736 - 27218087
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  27217736 tcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 27217835  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27217836 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaaaatctctggtcct 27217935  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217936 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 27218035  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27218036 tattattataagtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctcc 27218087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 44386292 - 44385941
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||    
T  44386292 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttct 44386193  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44386192 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 44386093  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386092 aagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 44385993  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44385992 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctcc 44385941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22325579 - 22325228
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  22325579 tcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 22325480  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22325479 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggccct 22325380  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325379 aagaccgctctttctcctgattcaaaccaacaccacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 22325280  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22325279 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctcc 22325228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 306 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 24826012 - 24825657
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |  |||||||| |    
T  24826012 ataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggt 24825913  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24825912 ctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttc 24825813  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || || || || |||||||| |||| |||||||||| |||| || || ||| ||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24825812 tggtcccaaaactacactctcacctgactcaacccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacagagcttcaaaaggtgccataccaatactagaa 24825713  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24825712 tgttaactattattatacgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttcc 24825657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 21330248 - 21330455
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330248 atcatcagtccacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 21330347  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330348 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 21330447  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    || |||||    
T  21330448 tgtcttgt 21330455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 306 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 30211647 - 30211292
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30211647 ataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagat 30211548  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||| |     
T  30211547 ccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaataatgta 30211448  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||| ||  || || || |||   || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  ||  | |||||||||||||| ||||||    
T  30211447 tggtcttagtactacactctcattggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgtttcgaacggtgccattccaatgctagaa 30211348  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    || ||||| || || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30211347 tggtaactgttattgtaagtgaactcgaccaatggaagatgactatcccaagttcc 30211292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18796713 - 18796506
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||     
T  18796713 atcatcagtctacccacataatagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaataatatccttatgtta 18796614  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  18796613 aaagaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaataaa 18796514  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    | ||||||    
T  18796513 ttccttgt 18796506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 306 - 657
Target Start/End: Original strand, 23087163 - 23087514
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  23087163 ataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagga 23087262  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||  |||||||| ||  |||| ||  ||||||||||    
T  23087263 cctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttaaccttttcaatagtctgacgaacaatatc 23087362  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || |  || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||| | |||    
T  23087363 tggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttccgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatagtcgaa 23087462  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  23087463 tggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgataggtgactatcccaag 23087514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 45529230 - 45529582
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |       ||||||||||    
T  45529230 ataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataaacacatggtcttca------aactcaagat 45529323  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| || |||||||| ||    
T  45529324 ccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttcttagtagtctgttgaacaatgtc 45529423  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     ||||| || ||||| || ||||| || ||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| || || ||  | |||||||||||||| ||| ||    
T  45529424 cggtcccaataccacactctcaccggactcataccaacacaatggagttttgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatgctaaaa 45529523  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || ||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45529524 tggtaactgttattataaatgaactcgatcaatggaagatgattatcccaagttcctcc 45529582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 488 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 41608933 - 41608757
Alignment:
Q  488 agtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggt 587  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  41608933 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggt 41608834  T
Q  588 gccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41608833 gccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 41608757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 306 - 467
Target Start/End: Original strand, 23138750 - 23138911
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |    
T  23138750 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggt 23138849  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 467  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23138850 ctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 23138911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 306 - 467
Target Start/End: Original strand, 23550540 - 23550701
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |    
T  23550540 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggt 23550639  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 467  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23550640 ctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 23550701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 27365800 - 27365458
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||    
T  27365800 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 27365701  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   || | ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  27365700 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttattaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 27365601  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  27365600 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 27365501  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  27365500 ttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 27365458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 330 - 657
Target Start/End: Original strand, 23276513 - 23276840
Alignment:
Q  330 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataac 429  Q
    |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| | ||||| ||| ||||| || || || || ||||||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  23276513 gacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataac 23276612  T
Q  430 tcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacc 529  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || || || || ||    
T  23276613 tcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcatgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcc 23276712  T
Q  530 tgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaac 629  Q
    ||| |||||||| || ||   ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23276713 tgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaac 23276812  T
Q  630 tctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  23276813 tctatcaacggtagatgactatcccaag 23276840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18620011 - 18619807
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||  ||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  18620011 atcatcggcctacccacataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaataatatccttttgttt 18619912  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18619911 aatggg-tctcataattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattatagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaa 18619813  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    | ||||    
T  18619812 ttcctt 18619807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 12574073 - 12574417
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  || || || || | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    |||||    
T  12574073 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 12574172  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  12574173 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccc 12574272  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| | ||| || |||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12574273 aacacaacactttctcttgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataac 12574372  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  12574373 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactgtcccaag 12574417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 27787461 - 27787805
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  27787461 tcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 27787560  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  27787561 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccc 27787660  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  27787661 agcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgagtgataac 27787760  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27787761 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 27787805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 23293680 - 23294022
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  23293680 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 23293779  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |||||  |||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  23293780 gcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 23293879  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| ||||||| ||| ||  |||| ||  | ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  23293880 cacaacactctctcctgactcaaaccgacataaaggagtcctcaacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 23293979  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  23293980 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 23294022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 306 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27377201 - 27377102
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  27377201 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 27377102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276323
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||  | || ||||||| ||  || || |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  ||  |||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccagtcctaa 22276200  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||     
T  22276201 caaggcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactg 22276300  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  22276301 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 22276323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 208
Target Start/End: Original strand, 19692598 - 19692737
Alignment:
Q  69 ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggga 168  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| | |||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19692598 ttgactaaggatactttaagaataatttcctttagtttaatgagatctcatgattaagtcaggcttaatgttccattaaacagactaattattctaggga 19692697  T
Q  169 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692698 cttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19692737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 12640640 - 12640318
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||  | || ||||||| ||  ||||| |    
T  12640640 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 12640541  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  12640540 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 12640441  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| ||||     
T  12640440 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactg 12640341  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  12640340 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 12640318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 331 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 24570373 - 24570067
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || ||||| || ||  | || ||||||| ||  || || | |||||||||||| ||    
T  24570373 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 24570274  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| | || |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |  |  ||||  || |||||||| |  || ||||| |||    
T  24570273 cttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaacaaaacactttctcct 24570174  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
     | ||||||||||||||| | || || || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || || ||||    
T  24570173 aactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctctgacgatataaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 24570074  T
Q  631 ctatcaa 637  Q
    | |||||    
T  24570073 caatcaa 24570067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831583
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  ||| | |    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttc 24831809  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  24831808 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 24831709  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   |  | || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||| ||||     
T  24831708 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactaacatgaaaactg 24831609  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatgg 640  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||    
T  24831608 ttgttgtaagtaaactcaatcaatgg 24831583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 331 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 22762274 - 22761968
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| || ||  | || ||||||| || |||| | | ||| |||||||||||    
T  22762274 acttcaaaccacgactaacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataact 22762175  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | ||||| |||    
T  22762174 cttcttcctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctcct 22762075  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
    ||||||||||||||||||   || || || ||| ||||||| ||||| ||| | |||||||| || |||||||||||| |||| ||||| || || ||||    
T  22762074 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 22761975  T
Q  631 ctatcaa 637  Q
    | |||||    
T  22761974 caatcaa 22761968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 333 - 637
Target Start/End: Original strand, 25128387 - 25128691
Alignment:
Q  333 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactct 432  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||  |  ||||| |  | ||||||||||||||    
T  25128387 ttcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactct 25128486  T
Q  433 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctga 532  Q
    | |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || | |||||| |  || |||||||| ||    
T  25128487 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttggacaacctccgatcctaacaaaacactttcacccga 25128586  T
Q  533 ttcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactct 632  Q
     ||||||||||| ||| | || || || ||| ||||||| ||||| ||| | |||| ||| || ||||| |||||| |||| ||||| || || |||||     
T  25128587 ctcaaaccaacataacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcatcaaacggtgtcataccgatacttgaatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 25128686  T
Q  633 atcaa 637  Q
    |||||    
T  25128687 atcaa 25128691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20978084 - 20977957
Alignment:
Q  22 acataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 121  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  20978084 acataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataatttccttatttttaatgggatctcatga 20977985  T
Q  122 ttaagttatacttaatgttccattaaac 149  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20977984 ttaaattattcttaatgttccattaaac 20977957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 417 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 23817672 - 23817449
Alignment:
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |    
T  23817672 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaaca 23817573  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
       | ||||  | ||| ||||||||||||||| | || || |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| |||| ||    
T  23817572 aagcactttatcttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacatctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgtt 23817473  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaatgg 640  Q
    ||| || || ||||| ||||||||    
T  23817472 gttgtaagtaaactcaatcaatgg 23817449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 11358595 - 11358253
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  11358595 ggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctcc 11358496  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| ||    
T  11358495 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaa 11358396  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  11358395 cacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 11358296  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  |||||||||||||    
T  11358295 ttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaag 11358253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 416 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368391
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 27368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Original strand, 31830380 - 31830525
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| || || || || || |||||||  || || |    
T  31830380 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttc 31830479  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  31830480 gcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatctt 31830525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 309
Target Start/End: Original strand, 21330493 - 21330552
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacataa 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330493 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacataa 21330552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 1063473 - 1063795
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  1063473 ggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 1063572  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  || || | ||||||||| ||    
T  1063573 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatctggtcccaa 1063672  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||  || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||     
T  1063673 cacaacactctcacacgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatacttgaatgatagctg 1063772  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  1063773 ttgttataagtaaactcaatcaa 1063795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 20832707 - 20833049
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  20832707 ggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 20832806  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||   ||||   | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  20832807 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 20832906  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  20832907 tacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 20833006  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |  |||||||||||||    
T  20833007 ttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaag 20833049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36270373 - 36270199
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| || || |||||    
T  36270373 atcatcagtctacccacacaatagtctttatactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaatagtgtcattgtgttt 36270274  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatttt 180  Q
    ||||  ||||||| ||||||| | ||||||  || || ||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36270273 aatgatgtctcacgattaagtcacacttaacatttcatttaagtaaactaactattctagggactttattatttt 36270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18822290 - 18822115
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    ||||||||||||   |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||  ||  ||| |||||||| ||||| |||||    
T  18822290 atcatcagtctattgacataataatctatctgctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttgattacatatgttttaagaatagtgtccttgtgttt 18822191  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaa-tgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatttt 180  Q
    ||||| ||||||| ||||||  | |||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18822190 aatggtgtctcacgattaagccacacttaatttttccatttaaacgaactaacaattctatagactttattatttt 18822115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 407 - 501
Target Start/End: Original strand, 14708901 - 14708995
Alignment:
Q  407 tttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaa 501  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  14708901 tttcctccgcttatcatgataactcttctgtctactccacgatgctttcatcttcttctggatcatcttaaccttttatctagtttgctgaacaa 14708995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 433
Target Start/End: Original strand, 24654067 - 24654185
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  24654067 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 24654166  T
Q  415 gcttatcatgataactctt 433  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24654167 gcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 657
Target Start/End: Original strand, 24948581 - 24948653
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  24948581 ggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 24948653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 19652557 - 19652431
Alignment:
Q  528 cctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtga 627  Q
    ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||   | ||||    
T  19652557 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgt---atgtga 19652461  T
Q  628 actctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||    
T  19652460 actctatcaacggtaggtgactatcccaag 19652431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23817798 - 23817747
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatg 382  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  23817798 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatg 23817747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 382
Target Start/End: Original strand, 24945089 - 24945156
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatg 382  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| |||||    
T  24945089 ggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 24945156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Original strand, 28144701 - 28144752
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatg 382  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||||||||||||||    
T  28144701 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacacatg 28144752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 19692773 - 19692829
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19692773 catgatacaaaaccaaacctaataaatacagattggctattaaggcttactccaaca 19692829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 565 - 637
Target Start/End: Original strand, 23890754 - 23890826
Alignment:
Q  565 gaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| || || ||||| |||||    
T  23890754 gaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaa 23890826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 6136 - 6494
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  6136 ataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagat 6235  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  6236 ctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctt 6335  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6336 tggtcctaagaccactctttcaccagactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccattccaatactagaa 6435  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436 tgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 6494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 1708 - 1366
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||| |  | || ||||||||    |||||||    
T  1708 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccacctgaaactcaagggccttcctac 1609  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || |||||  |||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  1608 acttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 1509  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  ||||  |||| ||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  1508 tacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactcgaatggtaactg 1409  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  1408 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 1366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 548
Target Start/End: Original strand, 22816 - 23049
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  22916 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 23015  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaac 548  Q
     |   | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23016 caaagcactttcacctgactcaaaccaacacaac 23049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 98)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 25610196 - 25609838
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25610196 ataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagat 25610097  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25610096 ctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctc 25609997  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25609996 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcataaggtgccattccaatactagaa 25609897  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25609896 tgataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 25609838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18408278 - 18407919
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  18408278 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagat 18408179  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18408178 ctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctc 18408079  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408078 tggtcctaataccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 18407979  T
Q  606 tgataacta-ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407978 tgataactagtatttgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 18407919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 306 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 16963702 - 16963349
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16963702 ataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagat 16963603  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16963602 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtctgctgaacaatctc 16963503  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963502 tggtcctaagaccactctttctcctgactcaaatcaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 16963403  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtt 659  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  16963402 tgatagctattgttagacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagtt 16963349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 19864633 - 19864991
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19864633 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 19864732  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  19864733 cttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatctc 19864832  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||    
T  19864833 tggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagccgcaaaaggtgccattccaataccaaaa 19864932  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  19864933 tgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactagcccaggttcctcc 19864991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 306 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 16927975 - 16927620
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16927975 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 16927876  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  16927875 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtctgctgaacaatctc 16927776  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16927775 tggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 16927676  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  16927675 tgatagctattgttatacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagttcc 16927620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22079023 - 22078667
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22079023 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagat 22078924  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  22078923 ctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggtttgttgaacaatctc 22078824  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078823 tagtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 22078724  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
      ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078723 --ataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 22078667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 24313496 - 24313145
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24313496 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcct 24313397  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24313396 atgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24313297  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313296 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 24313197  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24313196 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctcc 24313145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29592248 - 29591897
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  29592248 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 29592149  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29592148 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 29592049  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592048 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 29591949  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29591948 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 29591897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16627045 - 16626694
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16627045 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 16626946  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16626945 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcaatagtttgctgaacaatctctggtcct 16626846  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16626845 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaac 16626746  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16626745 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16626694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 660
Target Start/End: Original strand, 12497972 - 12498326
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  12497972 ataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 12498071  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  12498072 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 12498171  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12498172 gggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaa 12498271  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12498272 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12498326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 12510929 - 12510575
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  12510929 ataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 12510830  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  12510829 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 12510730  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12510729 gggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaa 12510630  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12510629 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12510575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 23078415 - 23078773
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |    
T  23078415 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggt 23078514  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  23078515 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatttc 23078614  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23078615 tggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 23078714  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078715 tgataactgttattgtacgtgaactctataaatggaagatgactatcccaagttcctcc 23078773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22762790 - 22762432
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22762790 ataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagat 22762691  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  22762690 ctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctc 22762591  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22762590 tggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagtctcgtaaggtgccattccaatactagaa 22762491  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22762490 tgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatctcaagttcctcc 22762432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 306 - 660
Target Start/End: Original strand, 12505301 - 12505655
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  12505301 ataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 12505400  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  12505401 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatcatcttaacattctcagtagtatgatgaacaatctc 12505500  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12505501 gggtcctaagaccaatctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgacattccaatactagaa 12505600  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12505601 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27331768 - 27331410
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| |    
T  27331768 ataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggt 27331669  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||    
T  27331668 cttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctc 27331569  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331568 gggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 27331469  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331468 tgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 27331410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27392508 - 27392150
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| |    
T  27392508 ataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggt 27392409  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||    
T  27392408 cttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctc 27392309  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392308 gggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 27392209  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392208 tgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 27392150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28263525 - 28263174
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| ||| ||    
T  28263525 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttct 28263426  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28263425 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28263326  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263325 aagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataac 28263226  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28263225 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctcc 28263174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28342274 - 28341923
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| ||| ||    
T  28342274 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttct 28342175  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28342174 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28342075  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342074 aagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataac 28341975  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28341974 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctcc 28341923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1543412 - 1543061
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  1543412 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 1543313  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1543312 gcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 1543213  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1543212 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 1543113  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1543112 tattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctcc 1543061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 25112505 - 25112856
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  25112505 tcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 25112604  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  25112605 acgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacgatcgctggtcct 25112704  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112705 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcataacggaattctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataac 25112804  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25112805 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 25112856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28292700 - 28292349
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| ||| ||    
T  28292700 tcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttct 28292601  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28292600 acacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28292501  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28292500 aagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 28292401  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28292400 tattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactgtccgaagttcctcc 28292349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2875131 - 2874780
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || ||| ||    
T  2875131 tcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttct 2875032  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2875031 acgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 2874932  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2874931 aagaccactctttcacccgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 2874832  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2874831 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 2874780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 317 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 5839543 - 5839196
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  5839543 agtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgc 5839444  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5839443 ttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaaga 5839344  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5839343 ccaccctatctcctgattcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactatt 5839244  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5839243 attatacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 5839196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 27187389 - 27187740
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| ||| ||    
T  27187389 tcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttct 27187488  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27187489 tcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27187588  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27187589 aagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagc 27187688  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27187689 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 27187740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27261851 - 27261500
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| ||| ||    
T  27261851 tcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttct 27261752  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27261751 tcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27261652  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27261651 aagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagc 27261552  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27261551 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 27261500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 306 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 25765624 - 25765315
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25765624 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagc-gtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagat 25765526  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  25765525 cttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctttactttctcagtagtctgctgaacaatctc 25765426  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25765425 tggtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaa 25765326  T
Q  606 tgataactatt 616  Q
    |||||||||||    
T  25765325 tgataactatt 25765315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 27381252 - 27381459
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27381252 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgttt 27381351  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381352 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 27381451  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  27381452 tgccttgt 27381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 27471635 - 27471842
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27471635 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgttt 27471734  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471735 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 27471834  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  27471835 tgccttgt 27471842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 17684469 - 17684674
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684469 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 17684568  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684569 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 17684668  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  17684669 tgcctt 17684674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29309097 - 29308890
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309097 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 29308998  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308997 aatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 29308898  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  29308897 tgccttgt 29308890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29316057 - 29315850
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316057 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 29315958  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315957 aatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 29315858  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  29315857 tgccttgt 29315850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 16566320 - 16566525
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16566320 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 16566419  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566420 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 16566519  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  16566520 tgcctt 16566525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 418 - 663
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22434172
Alignment:
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 22434026  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22434027 cactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgtta 22434126  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctc 663  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22434127 ttgtaagtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 22434172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 17691440 - 17691647
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17691440 atcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 17691539  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17691540 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaagaaaacaaaatcaataaagaaa 17691639  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  17691640 tgccttgt 17691647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 188977 - 189182
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  188977 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaatagtttccttatgttt 189076  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189077 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 189176  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  189177 tgcctt 189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 25537159 - 25537364
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25537159 atcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgttt 25537258  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537259 aacggggtctcacaataaagttatacttaatgttccattaaacggactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 25537358  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  25537359 tgcctt 25537364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11651930 - 11651725
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  11651930 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaatagtttccttattttt 11651831  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11651830 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaa 11651731  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  11651730 tgcctt 11651725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 317 - 657
Target Start/End: Original strand, 25768148 - 25768488
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  25768148 agtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatccttcctacgc 25768247  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||    
T  25768248 ttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcaacttgaccttctccgtagtttgatgaactaaatccggtccaaaga 25768347  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||| | ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||    
T  25768348 ccacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaacagtt 25768447  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25768448 gttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 25768488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 15459291 - 15459633
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  15459291 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctac 15459390  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  15459391 gcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaa 15459490  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || ||||||||||| |   |||| || || ||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||     
T  15459491 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactg 15459590  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15459591 ttattgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaag 15459633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 21471554 - 21471898
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  21471554 tcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttct 21471653  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||     
T  21471654 acgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattaacttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtccc 21471753  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || ||  | ||||| || || ||||||||||||||  |||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  21471754 aacactgcactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgtccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 21471853  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  21471854 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaaatgactatcccaag 21471898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 306 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 18197882 - 18197607
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||| ||| ||| ||||| | ||| ||||| |||| ||| |    
T  18197882 ataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatgatatccctcttgaaacttaaggt 18197783  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||  |    
T  18197782 ctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttaccttctcagtagtctgttaaacaatcgc 18197683  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctca 581  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  18197682 tggtcctaaaaccacattctcacctgacttaaacgaacacaacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctca 18197607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 19879253 - 19879595
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||    
T  19879253 ggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 19879352  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||   || | ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  19879353 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatctgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggccccaa 19879452  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     | ||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19879453 catcacactttctcccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 19879552  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19879553 ttgttgtaagtaaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 19879595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 306 - 657
Target Start/End: Original strand, 1640718 - 1641069
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |  || ||||| |    
T  1640718 ataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaaggt 1640817  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||  || ||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  1640818 cctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttttctgtagtctgatgaactatatc 1640917  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || |  || |||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||  ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||    
T  1640918 tggtcccaacattacactttcacccgacttaaaccaacataacggagttctgcacctccgtccatgcaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaa 1641017  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1641018 tggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 1641069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 306 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21833316 - 21833172
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||||    
T  21833316 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagat 21833217  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 450  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833216 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 34645912 - 34645590
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||    
T  34645912 ggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 34645813  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  34645812 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 34645713  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  34645712 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 34645613  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    |||||||| || || ||||||||    
T  34645612 ttgttataagtaaattctatcaa 34645590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 13359269 - 13359474
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | |  ||||||||    
T  13359269 atcatcagtctatccatataatagtctctacgctttaatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataatgtttttatgttt 13359368  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13359369 aatggagtttcacgattaagttatacttaatgctccattaagcgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaataaataaataaa 13359468  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  13359469 tgcctt 13359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 18794643 - 18794987
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| | ||||||    
T  18794643 tcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcct 18794742  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||| ||||||||| || ||||| || || || || ||||| ||     
T  18794743 acgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgttgcactatgtctggcccc 18794842  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || | ||| ||||| ||| | ||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||| || || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  18794843 aacatcacactttctcctaactcaaaccaacacaaaggagttatgcaccttcgaccgtacaaggcttcaaatggtgccataccaatactcgaatggtaac 18794942  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  18794943 tattgttgtaggtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 18794987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 27560945 - 27560601
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  27560945 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 27560846  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  27560845 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaactaaatccggtccc 27560746  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27560745 aacacaacactttctcctgattcaaaccaacacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataac 27560646  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  27560645 tgttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 27560601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 11280831 - 11280489
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||    
T  11280831 ggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 11280732  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   || | ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  11280731 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 11280632  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||  || |||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  11280631 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgatcatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 11280532  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || || || ||| |||| || || |||||||||||||    
T  11280531 ttgttgtaagtaaattctgtcaacggtaggtgactatcccaag 11280489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 315 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 22796958 - 22796617
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  22796958 ggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 22796859  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||  ||    
T  22796858 gcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcgcaa 22796759  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||| ||| |||| || ||||| |   | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  22796758 cactacactctctcctgactcaaatcaacataaaggagtcctgcacctccgaccgtacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 22796659  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaa 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  22796658 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaa 22796617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 28283141 - 28282797
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  28283141 tcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 28283042  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  28283041 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccc 28282942  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28282941 agcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataac 28282842  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28282841 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 28282797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 21564460 - 21564116
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||    
T  21564460 tcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcct 21564361  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||   |||| ||||||||| |   |||| |||||||| || ||||||||     
T  21564360 acgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttttttagtctgctgaactatgtctggtccc 21564261  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || | ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  |||| | ||| ||| |||| || ||||| ||  | ||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  21564260 aacatcacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtccggcacctccgaccgtacaaagcttcgaacggaaccataccaatactcgaatggtaac 21564161  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| | || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21564160 tattgatgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 21564116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 17415441 - 17415783
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    || ||||    
T  17415441 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 17415540  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    ||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  17415541 gcttgccatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 17415640  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || |||||  |||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||| |||  ||||||| ||||| |||||     
T  17415641 cacaacactttcttctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcatatcaatactcgaatggtaactg 17415740  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  17415741 ttgttgtatgtgaactctatcgacggtaggtgactatcccaag 17415783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 25743413 - 25743110
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || |  | ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  25743413 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 25743314  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta- 513  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || |||||||     
T  25743313 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctac 25743214  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | | ||  ||||||||||| ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25743213 aaagca--ctttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacagctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccaatactagaatgaaaact 25743116  T
Q  614 attgtt 619  Q
     |||||    
T  25743115 gttgtt 25743110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 317 - 657
Target Start/End: Original strand, 18800899 - 18801239
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    |||||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||    |||||||||    
T  18800899 agtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggccttcctacgc 18800998  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || |    
T  18800999 ttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 18801098  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  18801099 caacactttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgaggccataccaatactcgaatggtaactgtt 18801198  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||| ||  |||||||||| || || || |||||||||||||    
T  18801199 gttgtaaatgaactctataaacggtaggtgactatcccaag 18801239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 11287924 - 11287680
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||    
T  11287924 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 11287825  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   || | ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  11287824 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 11287725  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgca 559  Q
     | ||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11287724 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgca 11287680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16382699 - 16382377
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  16382699 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 16382600  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  16382599 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 16382500  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| ||||     
T  16382499 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactg 16382400  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  16382399 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 16382377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 313 - 451
Target Start/End: Original strand, 25750762 - 25750900
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  25750762 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttct 25750861  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 451  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25750862 acgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 10469175 - 10468833
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  10469175 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 10469076  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  10469075 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 10468976  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  10468975 cacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 10468876  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  10468875 ttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaag 10468833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 317 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 14131503 - 14131361
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||| || |  |||||||||    
T  14131503 agtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcctgaaactccaggtccttcctacgc 14131404  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 459  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14131403 ttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 14131361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 14381793 - 14381447
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  14381793 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 14381694  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| | ||| ||    
T  14381693 gcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaa 14381594  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || | ||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  14381593 cacgacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 14381494  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  14381493 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaagttcc 14381447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 15078690 - 15078368
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||| || ||  | || ||||| | ||  || ||      
T  15078690 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctct 15078591  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  15078590 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 15078491  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||  | || ||| || |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15078490 caaggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcttacacctccgatcatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactg 15078391  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  15078390 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 15078368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098327
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| || ||  | || ||||||| ||  || || |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 16098204  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| ||||| ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| || |     
T  16098205 caaggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggagccataccgatactagaatgaaaattg 16098304  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  16098305 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 16098327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 366 - 466
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  366 actctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctt 465  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  466 g 466  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 331 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648788
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || | |||||||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |   |  | || ||     
T  1648994 cttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaataaagcattctctccg 1648895  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
    || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| || || ||||    
T  1648894 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 1648795  T
Q  631 ctatcaa 637  Q
    | |||||    
T  1648794 caatcaa 1648788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996525
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | || || |||||||| || || ||  |||| ||||||| ||  ||||| |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 23996402  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| || |||||| |  |||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  23996403 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacagtgccattccgatactagcatgaaaactg 23996502  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  23996503 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 23996525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 18838234 - 18837909
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||||| | || | |||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  18838234 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18838135  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||| ||||    
T  18838134 tcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtgctaa 18838035  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  18838034 catagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcggatactagaatgaaaactg 18837935  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatgg 640  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||    
T  18837934 ttgttgtaagtaaactcaatcaatgg 18837909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 331 - 619
Target Start/End: Original strand, 18571622 - 18571910
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||| || | || |||||||| ||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || | |||||||||||||||    
T  18571622 acttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 18571721  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || | ||  ||||||| ||| |   | |||||||||    
T  18571722 cttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaacattttccgtagtttcttgcataacttctggtcttaataaagcactttcacct 18571821  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgtt 619  Q
    || ||||||||||||||||| || || || |||  |||||| ||||||||| | || | |||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  18571822 gactcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagtcattccgatactagaatgaaaactgttgtt 18571910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 438
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751024
Alignment:
Q  314 cggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttccta 413  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||    
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtc 438  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 331 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21412966
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| |||| ||| || ||  | || ||||||| ||  || || | |||||||||||||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||  || ||||   | |||||||| |   | ||||| ||     
T  21413148 cttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactcccggtcctaacaatgcgctttctccg 21413049  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    |||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| |  ||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  21413048 gattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacagtgccataccgatattagaatgaaaact 21412966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 566 - 664
Target Start/End: Original strand, 17032589 - 17032687
Alignment:
Q  566 accatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17032589 accatataaagcttcaaaaggtgccattctgatactagaatgataactattagtgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 17032687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 451 - 657
Target Start/End: Original strand, 19453511 - 19453717
Alignment:
Q  451 ctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacag 550  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||  |    
T  19453511 ctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaagg 19453610  T
Q  551 agttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgacta 650  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| || | ||||||||||||||| || ||||||    
T  19453611 agtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtatgcgaactctatcaatggtaggtgacta 19453710  T
Q  651 tcccaag 657  Q
    |||||||    
T  19453711 tcccaag 19453717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 20553587 - 20553755
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||  |||| |||||| ||| |||  || ||||||||| |||| |||||| | | ||||| |||    
T  20553587 atcatcagtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataatattcttatattt 20553686  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatt 175  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20553687 aatgggatctcacgattaagtcgtacttaatatttcattaaacggactagctatcctagagactttatt 20553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 8766474 - 8766132
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |  |||| || ||| || |||| ||||||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  8766474 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 8766375  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||| |||||  |    
T  8766374 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccca 8766275  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| |||  |||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  8766274 cacgacactctctcctgactcaaaccagcataaatgagtcctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 8766175  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  8766174 ttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 8766132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 318 - 619
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233468
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||  ||  ||||||| |     
T  16233267 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccagtcctaacaa 16233366  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
      | || || || || ||||||||||||||| | || || || ||  ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  16233367 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 16233466  T
Q  618 tt 619  Q
    ||    
T  16233467 tt 16233468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 379
Target Start/End: Original strand, 17032515 - 17032581
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacac 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17032515 tcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaacac 17032581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 304
Target Start/End: Original strand, 17691683 - 17691737
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 304  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691683 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 17691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Original strand, 24364367 - 24364512
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  24364367 ggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctcc 24364466  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24364467 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 24364512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 478
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655601
Alignment:
Q  333 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactct 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |   || | ||||||||||||||||| || ||  | || |||||||  |  || || | ||||| |||||||||||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  433 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 478  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 25655601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 27381495 - 27381551
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381495 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27381551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 27471878 - 27471934
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471878 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27471934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29308854 - 29308798
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308854 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29308798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29315814 - 29315758
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315814 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29315758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 17850495 - 17850663
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||| |||| |||   ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| | |||    
T  17850495 atcatcagtctacccatataatagtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaatagtgtccttgttttt 17850593  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 176  Q
    ||| || | ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17850594 aattggatatcacaattaagtcttacataatgttccaacaaacaaactagctattatagggactttatta 17850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 17684712 - 17684768
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684712 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctattagggcttattccaaca 17684768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27925961 - 27925772
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    ||||||||| || | ||||||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||  || |||| |||||||  |||||||| |||||| ||| |||  ||||    
T  27925961 atcatcagtttatccacataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataattttctttagttt 27925862  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatac--ttaat---gttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 191  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | ||  |||||   ||||| ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27925861 aatggagtctcacgattaagtcacacacttaattatgttccgttaaacatactagttattctaaggactttattattttgaaacaaaaca 27925772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8510115 - 8509941
Alignment:
Q  22 acataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg-tctcaca 120  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||| || |||  || ||||||| |||||  ||||||| | ||||   |||| || |||||||||| ||||| |    
T  8510115 acataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataatatcatcctcatatttaatgggggtctcata 8510016  T
Q  121 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 195  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8510015 attaagtcgtacataatgttccatcaaatagactaattattctatagactttattattttaaaacaaaataaaat 8509941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11651684 - 11651630
Alignment:
Q  252 tgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651684 tgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 11651630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 25537405 - 25537461
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25537405 catgatacaaagccaaactcagtcaatatagattggctattagggcttaatccaaca 25537461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 585 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 27560044 - 27559972
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  27560044 ggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 27559972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 207
Target Start/End: Original strand, 31258065 - 31258120
Alignment:
Q  152 actaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 207  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31258065 actaattattttagagactttattattttgaaacaaaacaaaagcaataaagaaat 31258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 500
Target Start/End: Original strand, 26276888 - 26277071
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||  || ||  |  | ||||| ||||||||| | |||||  |||| ||||||| ||  |||||  | |    
T  26276888 gtcaacttcttagacttcaaagcacaaccaacactggttacgaggttaactctaaaaaacacaagatctccaacttgaaactcaatattcttcctctgtt 26276987  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc-tttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaaca 500  Q
    |||||||||||||||| || | |||| | || || |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| | |||||||||    
T  26276988 tatcatgataactcttctgcctactcagtgatgcctttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttctgtaatctgctgaaca 26277071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 5297261 - 5297191
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatccca 655  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  5297261 ggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatccca 5297191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Original strand, 13359512 - 13359560
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 298  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13359512 catgatacaaagtcaaacccaatgaatatagattggctattaggactta 13359560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Original strand, 16566563 - 16566611
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 298  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566563 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattagggctta 16566611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 307
Target Start/End: Original strand, 189221 - 189281
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaata---tagattggctattagggcttattccaacat 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  189221 catgatacaaagccaaacccaatcaatatactagattgattattagggcttactccaacat 189281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Original strand, 22259925 - 22259990
Alignment:
Q  133 ttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 198  Q
    ||||||||  |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22259925 ttaatgttatattaaatggactagttattttagggagtttattattttgcaacataacaaaatcaa 22259990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 565 - 637
Target Start/End: Original strand, 1652278 - 1652350
Alignment:
Q  565 gaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||| ||||| || || ||||| |||||    
T  1652278 gaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaa 1652350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 306 - 660
Target Start/End: Original strand, 65518 - 65872
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  65518 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 65617  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  65618 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 65717  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  65718 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 65817  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  65818 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 65872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 412 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39654
Alignment:
Q  412 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcc 511  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcc 39807  T
Q  512 taagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataa 611  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39806 taagaccactttttcacctgattcaaaccaacacgacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtaccattccaatactagaatgataa 39707  T
Q  612 ctattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39706 ctgttattgtatgtgaaatctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 39654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 39982 - 39924
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 364  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39982 ataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 20136875 - 20137233
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  20136875 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagat 20136974  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20136975 ctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctc 20137074  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  20137075 tggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccattcctatactagaa 20137174  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20137175 tgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctcc 20137233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 306 - 661
Target Start/End: Original strand, 20249947 - 20250302
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  20249947 ataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagat 20250046  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  20250047 cttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacgatctc 20250146  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250147 tggtcctaagaccactctttcgcttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 20250246  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250247 tgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 20250302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 306 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 17045277 - 17044923
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17045277 ataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagat 17045178  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  17045177 ccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 17045078  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17045077 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 17044978  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17044977 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 17044923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16350854 - 16350503
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16350854 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 16350755  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16350754 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 16350655  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350654 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 16350555  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16350554 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 16350503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 33391284 - 33390933
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  33391284 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 33391185  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33391184 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 33391085  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33391084 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaac 33390985  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33390984 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 33390933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 51333748 - 51333397
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  51333748 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttct 51333649  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  51333648 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 51333549  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333548 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 51333449  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51333448 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 51333397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 19106471 - 19106822
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  19106471 tcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 19106570  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19106571 ccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19106670  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106671 aagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagactcaaaaggtgccattccaatactagaatgataac 19106770  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19106771 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 19106822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 50620506 - 50620148
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||| |||||||| |    
T  50620506 ataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggt 50620407  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  50620406 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacaatctc 50620307  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50620306 aggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcaattccaatactagaa 50620207  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50620206 tgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaatttcctcc 50620148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 21830407 - 21830758
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |     
T  21830407 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcc 21830506  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21830507 acgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 21830606  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21830607 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 21830706  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21830707 tattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctcc 21830758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 21837054 - 21837405
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21837054 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttct 21837153  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  21837154 acgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactgtctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 21837253  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837254 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttgtgcatctccgaccatacaaagcgtcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 21837353  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21837354 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 21837405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 318 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 41354719 - 41354373
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| ||| |||||||    
T  41354719 gtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgct 41354620  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41354619 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagac 41354520  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  41354519 cactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctatta 41354420  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41354419 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 41354373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 19761128 - 19760770
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19761128 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggt 19761029  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19761028 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatatc 19760929  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || || || || |||||||| || |||||||||||| |||| || || ||| ||||||| | ||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19760928 tggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaaaggtgtcattccaatactagaa 19760829  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19760828 tgataactgttattgtacatgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 19760770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16078895 - 16078556
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||               
T  16078895 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg----------- 16078807  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16078806 --------cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 16078715  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16078714 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttaaaaggtgccattccaatactagaa 16078615  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16078614 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctcc 16078556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 16369394 - 16369752
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16369394 ataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttggaattcaaggt 16369493  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| ||    
T  16369494 ctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttaccttttcaatagtttgttgaacaatctc 16369593  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| |||||  | |||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||  |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  16369594 tggtcctaaaaccacattctcacctcactcaaaccaacacaacgaagttctgcacctcctaccatacaaagcctcaaaaagtgtcattccaatactagaa 16369693  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16369694 tgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccacgttcctcc 16369752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 306 - 616
Target Start/End: Original strand, 21747632 - 21747941
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| | ||||||||||    
T  21747632 ataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagat 21747731  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  21747732 ctttc-tacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctc 21747830  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21747831 tggtcctaagaccactctttcgcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgagcatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 21747930  T
Q  606 tgataactatt 616  Q
    |||||| ||||    
T  21747931 tgataattatt 21747941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18252237 - 18252030
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252237 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 18252138  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252137 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18252038  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  18252037 tgccttgt 18252030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 18532514 - 18532721
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532514 atcatcagtctatctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 18532613  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532614 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18532713  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  18532714 tgccttgt 18532721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 27131409 - 27131616
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131409 atcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaatagtttccttatgttt 27131508  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131509 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 27131608  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  27131609 tgccttgt 27131616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 21171233 - 21171438
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21171233 atcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttc 21171332  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171333 aacggggtctcacaattaagttatatttaatgttccatgaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 21171432  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  21171433 tgcctt 21171438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 27310577 - 27310782
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  27310577 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaatagtttccttatgttc 27310676  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310677 aacgtggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 27310776  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  27310777 tgcctt 27310782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 16359035 - 16359240
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359035 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaatagtttccttatgttt 16359134  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359135 aacggggtctcacaattaagttattcttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 16359234  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  16359235 tgcctt 16359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 36816633 - 36816834
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  36816633 atcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaataatgtccttatgttt 36816732  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816733 aacggagtctcacaattaatttatacttaatgttccattaaacagacgaactattctagggacttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 36816832  T
Q  207 tg 208  Q
    ||    
T  36816833 tg 36816834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 3855919 - 3856126
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  3855919 atcatcagtctacccacgtaatagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaataatgtccttatgttt 3856018  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3856019 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgggctaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaagaaa 3856118  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  3856119 tgccttgt 3856126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 22657221 - 22657429
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  22657221 atcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaattgtgtccttatgttt 22657320  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-aaaatcaataaagaa 205  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22657321 aaaggggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacagactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaaatcaataaagaa 22657420  T
Q  206 atgccttgt 214  Q
    ||| |||||    
T  22657421 atgtcttgt 22657429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 20940316 - 20939974
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  20940316 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 20940217  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || |||||  ||||||| ||||| | ||| ||||| ||    
T  20940216 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtttgatgaaccaaatccggtcccaa 20940117  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||| | || ||  |||| ||  | ||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||  ||||||| ||||| |||||     
T  20940116 cacaacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataacaatactcgaatggtaactg 20940017  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  20940016 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 20939974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 19854420 - 19854761
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  19854420 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 19854519  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  19854520 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 19854619  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| |  ||  |||| ||||| ||| ||| ||| ||||| ||  |  ||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  19854620 cacaacactctctcctgactcaaaccagcgtaaaggagtcctgcacctccgactatacaaagcttcgaaccgtgccataccaatactcgaatggtaactg 19854719  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  19854720 ttgttgtatgtgaactc-atcaacggtaggtgactatcccaag 19854761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 323 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 20836133 - 20835799
Alignment:
Q  323 cttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatca 422  Q
    |||||| ||||| || | |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| || || || |  |||| |||    |||| |||||| |||    
T  20836133 cttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgcttgtca 20836034  T
Q  423 tgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactc 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || || || |    
T  20836033 tgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaaaacaacac 20835934  T
Q  523 tttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttata 622  Q
    | || ||||| |||||||| || ||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  20835933 tctctcctgactcaaaccagcataaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgttgttgta 20835834  T
Q  623 cgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  20835833 cgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 20835799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 41307931 - 41308273
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    || ||||    
T  41307931 ggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttctac 41308030  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   || || || || ||||| ||||| || ||||| | |||  |||| ||    
T  41308031 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccagtcccaa 41308130  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||  ||||  |||| ||  ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||| |     
T  41308131 caccacactttctcccaactcaaaccaacataaaggagtcatgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgctaattg 41308230  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  41308231 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 41308273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19665129 - 19664900
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||   ||||||||    
T  19665129 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctac 19665030  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| | ||| ||    
T  19665029 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaa 19664930  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaaca 544  Q
     || || || || ||||| |||||||||||    
T  19664929 cacaacactctctcctgactcaaaccaaca 19664900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 653
Target Start/End: Original strand, 20294518 - 20294856
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  20294518 ggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttc 20294617  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||  | |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| ||    
T  20294618 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaa 20294717  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||||| || |||||||| || ||  |||| || || |||  |||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  20294718 cacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 20294817  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcc 653  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20294818 ttgttataagtgaactcaatcaatggaaggtgactatcc 20294856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 20831645 - 20831323
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  20831645 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20831546  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || || || ||    
T  20831545 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaa 20831446  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| || |||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| ||||     
T  20831445 caaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactg 20831346  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  20831345 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 20831323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 20857014 - 20856672
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| |||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||    
T  20857014 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctac 20856915  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||  ||||| |  ||  | || ||    
T  20856914 gcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtttcatgaaccaattccagccccaa 20856815  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || || ||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||||     
T  20856814 cacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccataccaacactcgaatggtaactg 20856715  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || || || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  20856714 ttgttgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaag 20856672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Original strand, 11382700 - 11382845
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  ||||| |    
T  11382700 ggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttc 11382799  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11382800 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 11382845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 27277557 - 27277756
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||  | ||    
T  27277557 atcatcggtctacccacataatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataatgtcatttcggtt 27277656  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||  || |||| | ||||||| | ||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27277657 aaaagg-tctcgcgattaagtcacact-aatgctccgttaaatggactaattattctagggacgttattattttgaaacaaaacaaaaacaacaaagaaa 27277754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 22433369 - 22433027
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||  |||||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  22433369 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctcc 22433270  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || || ||||| |  ||||| | ||  ||||| ||    
T  22433269 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaattcggtcccaa 22433170  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| ||  | ||||| |||||||| || ||  |||| || || |||  |||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  22433169 caccacactcgctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccatacctatactcgaatggtaactg 22433070  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||||||||   | || |||||||||||||    
T  22433069 ttgttatatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaag 22433027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Original strand, 12014284 - 12014457
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||  ||| ||||||   || ||||||||    
T  12014284 atcatcattctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataacatcattatgttt 12014383  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 180  Q
    |||||| ||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  12014384 aatgggatctaacgattaatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttattatttt 12014457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 608
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914609
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
      |||| |||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||| ||||    
T  20914416 atttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggttctaa 20914515  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatga 608  Q
     |   | ||||| || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  20914516 catagcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagtatga 20914609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 492
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46519004
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  ||||| |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 492  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 46519004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 306 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50612678 - 50612608
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612678 ataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa 50612608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 37677185 - 37677528
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa-aaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttccta 413  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||||| || || || || ||||| ||||  || ||     
T  37677185 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttctt 37677284  T
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| |    
T  37677285 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 37677384  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | || || || ||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  37677385 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 37677484  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || |  |||||||||||||    
T  37677485 gttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaag 37677528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 180
Target Start/End: Original strand, 12006563 - 12006712
Alignment:
Q  31 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 130  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||| ||  || ||||||||||| ||  ||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |     
T  12006563 tctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacgaatgttttaataataatgtccttatgtttcatggggtctcacgattaaggcac 12006662  T
Q  131 acttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 180  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12006663 acttaatattccattaaatagactaactattctagggactttattatttt 12006712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 308
Target Start/End: Original strand, 18532757 - 18532815
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 308  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532757 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 18532815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18251992 - 18251935
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251992 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18251935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 416 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 22135710 - 22135507
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |  |||||||  || ||||  |||||||||||     
T  22135710 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaatcatcttaacttttttcgtagtttcttgcacaacttctggtcctaac 22135611  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    |   | ||||||||||| ||||||||||||||  | || || || ||  ||||||| ||||||||| | ||||||||  | |||||||||| | |||| |    
T  22135610 aaagcactttcacctgactcaaaccaacacaatggcgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccatatcgatactagaataaaaactgt 22135511  T
Q  616 tgtt 619  Q
    ||||    
T  22135510 tgtt 22135507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 331 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202371
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||| |||||||||||| || | |||| | ||||||||||||| ||| || ||  | || ||||||| ||  ||  | | |||||||||||||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 484  Q
    ||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 21202371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 31550434 - 31550289
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  31550434 ggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 31550335  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  31550334 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatctt 31550289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 20075312 - 20075167
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||| ||||| || || || || |||||||||   || || |    
T  20075312 ggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacccttagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctcc 20075213  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  20075212 gcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcatctt 20075167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 202
Target Start/End: Original strand, 9917942 - 9918106
Alignment:
Q  31 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 130  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||  |||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||  ||||   || |||||||    
T  9917942 tctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataatgtccttatatttaatgga-tctcgtgatcaagttat 9918040  T
Q  131 acttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 202  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9918041 acttaatgttcgattaaacaaactaa------aagtgactttattattttgtaacaaaacaaaatcaataaa 9918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 27310821 - 27310877
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310821 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 618 - 664
Target Start/End: Original strand, 21749350 - 21749396
Alignment:
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749350 ttatacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 21749396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 16359280 - 16359336
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359280 catgatacaaatcctaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 16359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22142294 - 22142232
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaac 377  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22142294 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Original strand, 30720625 - 30720694
Alignment:
Q  139 ttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 208  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  30720625 ttccattaaacgaactaattattccaggaactttattattttaaaacaaaataaaaccaataaaaaaatg 30720694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 21171479 - 21171535
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21171479 catgatacaaagccaaactcaatccatatagattggctattagagcttactccaaca 21171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3403325 - 3403248
Alignment:
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 184  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3403325 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 184
Target Start/End: Original strand, 3443494 - 3443571
Alignment:
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 184  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3443494 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3443571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 298
Target Start/End: Original strand, 36816881 - 36816926
Alignment:
Q  253 gatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36816881 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattgaatattagggctta 36816926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 3856164 - 3856220
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  3856164 catgatacaaagtcaaacccaatcaagatggattggctattagggcctactccaaca 3856220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 19663119 - 19663047
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19663119 ggtgccataccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 19663047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 306
Target Start/End: Original strand, 22657469 - 22657521
Alignment:
Q  254 atacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22657469 atacaaagccaaactcaatcaatatatattggctattaaggcttactccaaca 22657521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 475
Target Start/End: Original strand, 20184345 - 20184448
Alignment:
Q  372 aaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatca 471  Q
    ||||||||||| || ||  |||| ||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||| || | |||||| ||| ||  |||||||||||| ||||    
T  20184345 aaaaacacatgatcacccacttgaaactcaatatctttcctcctcttatcattataactcttctgcctactctgagacactcacatcttctcttggatca 20184444  T
Q  472 tctt 475  Q
    ||||    
T  20184445 tctt 20184448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 24099577 - 24099514
Alignment:
Q  594 ccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  24099577 ccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 24099514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 27131652 - 27131704
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131652 catgatacaaagccaaacccaac----atagattggctattagggcttattccaaca 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 501
Target Start/End: Original strand, 15730887 - 15730923
Alignment:
Q  465 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaa 501  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15730887 tgaatcatcttaaccttttcggtagtctgctgaacaa 15730923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 27277800 - 27277856
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277800 catgatacaaagtcaaacataattaacatagattggctattagggcttactccaaca 27277856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 1252 - 1610
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  1252 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagat 1351  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1352 ctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctc 1451  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1452 tagtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccatttcaatactagaa 1551  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1552 tgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 1610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 306 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 886 - 531
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  886 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctcaaaa-cacgtggtctccttcttgaaacttaagat 788  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  787 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctc 688  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  687 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaa 588  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcct 662  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  587 tgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgattatctcaagttcct 531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 6127 - 6485
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  6127 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagat 6226  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  6227 cctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgcacaatctc 6326  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6327 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 6426  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||| | || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6427 tgataaatgttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 6485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1015 - 658
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1015 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagat 917  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  916 cttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctc 817  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  816 tggtcctaagatgactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactggaa 717  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||| | || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  716 tgataattgttattgtacgtgaactctatccatggaagatgactatcccaagttcctcc 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18495 - 18288
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18495 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 18396  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18395 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18296  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  18295 tgccttgt 18288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18196
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 5334 - 5692
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||    
T  5334 ataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagat 5433  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  5434 ctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctc 5533  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5534 tggtcctaagaccactctttcacctgaatcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccgatactggaa 5633  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5634 tgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 5692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 279023 - 278665
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  279023 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 278924  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  278923 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 278824  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  278823 ttgtcctaggaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 278724  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278723 tgataactattattgtatgcgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 278665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 306 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 164902 - 164548
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  164902 ataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagat 164803  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  164802 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttc 164703  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || |  || || |||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  164702 tggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaa 164603  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  164602 tgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttc 164548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 321 - 515
Target Start/End: Original strand, 308787 - 308981
Alignment:
Q  321 aacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  308787 aacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttat 308886  T
Q  421 catgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  308887 catgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaag 308981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 260428 - 260772
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||    || ||    
T  260428 tcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttct 260527  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| || || || ||||| | ||| |||||     
T  260528 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtccc 260627  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  260628 aatacaacactctctcctgactcaaaccagcataacagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaac 260727  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  260728 tgttgttgtaggtgaactctatcagtggtaggtgactgtcccaag 260772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 306 - 662
Target Start/End: Original strand, 789 - 1145
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  789 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagat 888  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  889 cttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 988  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  989 tggtcctaaaaccacactatcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaacatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 1088  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcct 662  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1089 tgataactattattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttcct 1145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 7903 - 8261
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  7903 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcaccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 8002  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  8003 ctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctc 8102  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8103 tggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 8202  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8203 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 64213 - 63867
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  64213 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgc 64114  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  64113 ttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctgctgaacaatatctggtcctaaga 64014  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  64013 ccactctttctcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgttaattgtt 63914  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctc 663  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  63913 attgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctc 63867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 180330 - 180688
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  180330 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagat 180429  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  180430 cctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatc 180529  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  180530 tggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaa 180629  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  180630 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 180688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 101464 - 101394
Alignment:
Q  587 tgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  101464 tgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 101394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 96)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 8707683 - 8708034
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8707683 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcct 8707782  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  8707783 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 8707882  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8707883 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaac 8707982  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8707983 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 8708034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15161249 - 15160898
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15161249 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcct 15161150  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15161149 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15161050  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15161049 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 15160950  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15160949 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 15160898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18551950 - 18551599
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18551950 tcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcct 18551851  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18551850 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18551751  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18551750 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaac 18551651  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18551650 tattattataagtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 18551599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 13686142 - 13686493
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13686142 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcct 13686241  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13686242 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 13686341  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13686342 aagaccactctttcacctgactcaaaccatcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataac 13686441  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13686442 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 13686493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 8198706 - 8199057
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  8198706 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttct 8198805  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8198806 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 8198905  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198906 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 8199005  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8199006 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 8199057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11553294 - 11552943
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||    
T  11553294 tcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttct 11553195  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11553194 gcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 11553095  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553094 aagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataac 11552995  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11552994 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 11552943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17515 - 17157
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17515 ataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 17416  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  17415 ccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttc 17316  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17315 gggtcctaagaccactctttcacctgactgaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 17216  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  17215 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaaactgactatcccaagttcctcc 17157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 44791543 - 44791192
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  44791543 tcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttct 44791444  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44791443 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 44791344  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791343 aagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 44791244  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44791243 tattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 44791192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15154851 - 15154498
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  15154851 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagat 15154752  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||       
T  15154751 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaat--- 15154655  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15154654 --ctcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggtgccatcccaatactagaa 15154557  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154556 tgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 15154498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 312 - 664
Target Start/End: Original strand, 10871072 - 10871424
Alignment:
Q  312 ctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcc 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |    
T  10871072 ctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttc 10871171  T
Q  412 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10871172 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcc 10871271  T
Q  512 taagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataa 611  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10871272 taagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataa 10871371  T
Q  612 ctattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10871372 ctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 10871424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 12687579 - 12687930
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  12687579 tcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcct 12687678  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  12687679 gcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttggacaatctctggtcct 12687778  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687779 aagaccattctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataac 12687878  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12687879 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 12687930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 14332475 - 14332826
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  14332475 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 14332574  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14332575 acgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 14332674  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332675 aagaccactctttctccttattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataac 14332774  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14332775 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 14332826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 18177820 - 18178171
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  18177820 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 18177919  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18177920 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatctaaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18178019  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18178020 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 18178119  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18178120 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 18178171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 318 - 664
Target Start/End: Original strand, 14954703 - 14955049
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || || ||||    
T  14954703 gtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgct 14954802  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14954803 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctggacaatctctggtcctaagac 14954902  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  14954903 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactatta 14955002  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14955003 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 14955049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11237405 - 11237054
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  11237405 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttct 11237306  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11237305 acgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattctctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 11237206  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11237205 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatggtaac 11237106  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11237105 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 11237054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 23516961 - 23516610
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||    
T  23516961 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttct 23516862  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23516861 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctcttgtcct 23516762  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23516761 aagaccactctttcacctgactcaaaccggcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagc 23516662  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23516661 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctcc 23516610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29327991 - 29327784
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327991 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 29327892  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327891 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 29327792  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  29327791 tgccttgt 29327784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 15203950 - 15204308
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15203950 ataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggt 15204049  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15204050 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagtttgctgaacaaaatc 15204149  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || || || || |||||| | || |||||||||||| |||| || || ||||||||||| |  || ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  15204150 tggtcccaaaactacactatcaccttactcgaaccaacacaacggagtcctacacctctgaccatacagcgcttcaaatggttccattccaatactagaa 15204249  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15204250 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactattccaagttcctcc 15204308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 11536062 - 11536269
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11536062 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgttt 11536161  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536162 aatggggtctcacaattaagttgtacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 11536261  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  11536262 tgccttgt 11536269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 11542980 - 11543187
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11542980 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgttt 11543079  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543080 aatggggtctgacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 11543179  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||| ||||    
T  11543180 tgcattgt 11543187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15152650 - 15152445
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15152650 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccgtatgttt 15152551  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15152550 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaa 15152451  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  15152450 tgcctt 15152445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 414 - 664
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596486
Alignment:
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtccta 9596335  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9596336 agaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaataatagaatgatgact 9596435  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9596436 attattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 9596486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15148349 - 15148144
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15148349 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgttt 15148250  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15148249 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttcaatcaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaa 15148150  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  15148149 tgcctt 15148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 15624623 - 15624981
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  15624623 ataaacctcggagtcaatttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggt 15624722  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||| || ||    
T  15624723 ctttcctaagcttatcatgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaacgatttc 15624822  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || |  || || |||||||| || |||||||||||  |||| || || ||| ||||||| |  || ||  | |||| ||||| ||||||||||    
T  15624823 tggtcccaaaattacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagtgcttcgaatggtgtcattctaatactagaa 15624922  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15624923 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaacagaagatgactatcccaagttcctcc 15624981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18561214 - 18561009
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18561214 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttcctaatgttt 18561115  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561114 aacggggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18561015  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  18561014 tgcctt 18561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 339 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964691
Alignment:
Q  339 gcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 438  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  439 gactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaa 538  Q
     |||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  || || || || || || ||| |    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctggtcccagtactacactatcgccagactcata 35964817  T
Q  539 ccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaat 638  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  35964816 ccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaat 35964717  T
Q  639 ggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  35964716 agaagatgactatcccaagttcctcc 35964691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12751033 - 12750828
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12751033 atcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttctttatgttt 12750934  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750933 aacgaggtctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 12750834  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  12750833 tgcctt 12750828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 373 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11772373 - 11772082
Alignment:
Q  373 aaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 472  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  11772373 aaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcat 11772274  T
Q  473 cttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatat 572  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||    ||| |     
T  11772273 cttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaatcaacacaacgaagttctgcaccttcttccacac 11772174  T
Q  573 aaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11772173 aaagccttaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtttctcc 11772082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 12206970 - 12206626
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||    
T  12206970 tcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttct 12206871  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  12206870 acacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttttatcaatttgaccttttctgtagtctgctgaactatatccggtccc 12206771  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || |  || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||| ||| || |||| ||| | ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12206770 aacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagtattgcacctccgatcatacaaaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 12206671  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  12206670 tattgttgtacgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaag 12206626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12738739 - 12738542
Alignment:
Q  11 tcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 110  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  12738739 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaaca 12738640  T
Q  111 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 208  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12738639 aggtctcacaattaagttataattaatgtttcattaaacaaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaataaaatcaataaagaaatg 12738542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 306 - 520
Target Start/End: Original strand, 14037878 - 14038092
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  14037878 ataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggt 14037977  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14037978 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttc 14038077  T
Q  506 tggtcctaagaccac 520  Q
    |||||| || |||||    
T  14038078 tggtcccaaaaccac 14038092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 306 - 520
Target Start/End: Original strand, 14347908 - 14348122
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  14347908 ataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggt 14348007  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14348008 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttc 14348107  T
Q  506 tggtcctaagaccac 520  Q
    |||||| || |||||    
T  14348108 tggtcccaaaaccac 14348122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 19147290 - 19147634
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||   ||||||    
T  19147290 tcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcct 19147389  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||     
T  19147390 acgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtccc 19147489  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| || || ||||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  19147490 aacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 19147589  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  19147590 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaag 19147634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 20746689 - 20747033
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||   ||||||    
T  20746689 tcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcct 20746788  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||     
T  20746789 acgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccc 20746888  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| || || ||||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  20746889 aacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 20746988  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  20746989 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaag 20747033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 18257842 - 18258047
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  18257842 atcatcaatctatccacataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataatgtccttgtgttt 18257941  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257942 aatggggtctcacaattaagtcatacttaatgttccattaaacagactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18258041  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  18258042 tgcctt 18258047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 342 - 657
Target Start/End: Original strand, 21662071 - 21662383
Alignment:
Q  342 cgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgac 441  Q
    ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21662071 cgtccaacaccggtaagaggggtgactctcaaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctac 21662167  T
Q  442 tctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaacca 541  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||| || ||  |||| || |||||||| |||||||| |  ||||| || ||||| || |||   ||    
T  21662168 tctgtgacgctttcatcttttctctaatcaacttaacattttcattagtctgttgaacaatgtctggtcccagtaccacactctcaccggactcatcaca 21662267  T
Q  542 acacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatgga 641  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||    
T  21662268 acacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactattattgtaagtgaactcgattaatgga 21662367  T
Q  642 agatgactatcccaag 657  Q
    ||||||||||||||||    
T  21662368 agatgactatcccaag 21662383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 14264412 - 14264070
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  14264412 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctac 14264313  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||  ||||| || ||||| | ||  ||||| ||    
T  14264312 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcgcttatcatcttgacattcttcgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaa 14264213  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  14264212 cactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 14264113  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  14264112 ttgttgtacgtgaactctatcaacagtagatgactatcccaag 14264070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 15102769 - 15102429
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  15102769 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 15102670  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||  | ||| ||||| ||    
T  15102669 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaaatccggtcccaa 15102570  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     | |||||  || ||||| || |||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  15102569 caacactc--tctcctgactcgaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 15102472  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  15102471 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 15102429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 11388597 - 11388254
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| | |  |||||    
T  11388597 tcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctcct-cttgaaactcatggtccttcct 11388499  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||| ||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  11388498 acgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtccc 11388399  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||  || |||| ||||| ||  | |||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  11388398 aacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaacatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaac 11388299  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  11388298 tattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 11388254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16072462 - 16072140
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| |    
T  16072462 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttc 16072363  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||  |||| ||  |||| | ||||||||| ||    
T  16072362 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccatagtctgacgaaccaaatctggtcccaa 16072263  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  16072262 cactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttatgcgcctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 16072163  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  16072162 ttgttgtacgtgaactctatcaa 16072140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 18054123 - 18053779
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||    |||||    
T  18054123 tcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 18054024  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || || ||||| | |||||| | ||| |||||     
T  18054023 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccc 18053924  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |   ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18053923 aacacaactctttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccctcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataac 18053824  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18053823 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 18053779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 525 - 664
Target Start/End: Original strand, 14039986 - 14040125
Alignment:
Q  525 tcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacg 624  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  14039986 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14040085  T
Q  625 tgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14040086 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctcc 14040125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 525 - 664
Target Start/End: Original strand, 14350016 - 14350155
Alignment:
Q  525 tcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacg 624  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  14350016 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14350115  T
Q  625 tgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14350116 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctcc 14350155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 331 - 637
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936749
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| || ||  | || |||||||  |  || || | |||||||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||  || |||||||| |   | | |||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccttagtttattgcacaacttccggtcctaacaaagcaccttcacct 14936642  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
    ||||||||||||||||||   || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || || ||||    
T  14936643 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 14936742  T
Q  631 ctatcaa 637  Q
    | |||||    
T  14936743 caatcaa 14936749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 23199913 - 23199569
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  23199913 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 23199814  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||| ||| || || || ||||| | ||| || | ||| |||||     
T  23199813 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtccc 23199714  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23199713 aacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataac 23199614  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23199613 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 23199569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 23506040 - 23505696
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||    
T  23506040 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 23505941  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||| ||| || || || ||||| | ||| || | ||| |||||     
T  23505940 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtccc 23505841  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23505840 aacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataac 23505741  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23505740 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 23505696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 14129952 - 14130296
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||    |||||    
T  14129952 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcct 14130051  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| ||  | |  ||||| | ||| |||||     
T  14130052 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtccc 14130151  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || ||||| || || ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  14130152 aacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaac 14130251  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14130252 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 14130296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 14433770 - 14434114
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||    |||||    
T  14433770 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcct 14433869  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| ||  | |  ||||| | ||| |||||     
T  14433870 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtccc 14433969  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || ||||| || || ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  14433970 aacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaac 14434069  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14434070 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 14434114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 7823980 - 7824302
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  7823980 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 7824079  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || || || ||    
T  7824080 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaa 7824179  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| || |||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| ||||     
T  7824180 caaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactg 7824279  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  7824280 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 7824302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 14286544 - 14286202
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  14286544 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggtctttctcc 14286445  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| || || || ||||| | ||| ||||| ||    
T  14286444 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 14286345  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || ||   ||| |||||||| |||||  |||| ||||| ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  14286344 cacaacactctctattgactcaaaccagcacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 14286245  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14286244 ttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 14286202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 27107964 - 27107642
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  27107964 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 27107865  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || || || ||    
T  27107864 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaa 27107765  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| || |||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| ||||     
T  27107764 caaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactg 27107665  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  27107664 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 27107642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 49152382 - 49152724
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  ||||| |    
T  49152382 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttc 49152481  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | | || ||||| ||||| |  || || | ||| ||||| ||    
T  49152482 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaa 49152581  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || |||||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  49152582 cacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 49152681  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  |||||||||||||    
T  49152682 ttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaag 49152724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 548
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440241
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||||| || ||  | || |||||||  |  ||||| |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || || |||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggccctaa 4440207  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaac 548  Q
     |   | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4440208 caaagcactttcacctgattcgaaccaacacaac 4440241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 499
Target Start/End: Original strand, 13665629 - 13665813
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||    |||||||    
T  13665629 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctac 13665728  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaac 499  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  13665729 gcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtttgatgaac 13665813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16950639 - 16950303
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| || || || || |||||| |    || || |    
T  16950639 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcatgggcctttctcc 16950540  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |  ||  |||| ||    
T  16950539 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtcctgtcccaa 16950440  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || |||||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  16950439 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 16950340  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactat 651  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  16950339 ttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactat 16950303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 21674723 - 21674419
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |  | ||||||||||||||||| || ||  |||| || ||||  |  ||||| |    
T  21674723 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcc 21674624  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  21674623 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttatatttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 21674524  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| ||||| |||||||||||||||   ||  | || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||     
T  21674523 caaagcactttctcctgactcaaaccaacacaacgttgtcttacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactg 21674424  T
Q  615 ttgtt 619  Q
    |||||    
T  21674423 ttgtt 21674419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 1575 - 1233
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| || ||| ||| ||| ||| ||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  1575 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 1476  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  1475 tcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 1376  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| || || ||||||||||| ||||| |   | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  1375 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctctgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 1276  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  1275 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 1233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 11306431 - 11306089
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  11306431 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 11306332  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  11306331 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaa 11306232  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || |  |||||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  11306231 cacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 11306132  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  |||||||||||||    
T  11306131 ttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaag 11306089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13392334 - 13392157
Alignment:
Q  30 gtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtta 129  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||| |||||||  |||||||| |||||| | |||||   ||||||||| |||||| ||||||| |    
T  13392334 gtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcacgattaagtca 13392236  T
Q  130 tacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 208  Q
     |||||||| |||||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13392235 cacttaatgctccattaagcagactaattgttctaggaactttattattttgaaacaaaacaaagtcaacaaagaaatg 13392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 331 - 637
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364342
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| || ||  | || |||||||  |  || || | |||||||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||  || ||||  || |||| ||| |   | ||||| |||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccttatttttttgcacaacttccggtcttaacatatcactttctcct 15364235  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
     |||||||||||||||||   || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| |||| ||||| || || ||||    
T  15364236 tattcaaaccaacacaacgtcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 15364335  T
Q  631 ctatcaa 637  Q
    | |||||    
T  15364336 caatcaa 15364342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 8212296 - 8212151
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  8212296 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 8212197  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8212196 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 8212151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 414 - 637
Target Start/End: Original strand, 13021537 - 13021760
Alignment:
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| |  || |||||||    
T  13021537 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccta 13021636  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | ||||| || |  ||||| ||||||||||| |   |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  13021637 acaccacactctttcctgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccataccaatactcgaatgatagct 13021736  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  13021737 gttgttataagtgaactctatcaa 13021760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 6413592 - 6413934
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||||||| || || || || |||||||     || || |    
T  6413592 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctcc 6413691  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | |||  | || ||    
T  6413692 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccagacccaa 6413791  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || |||||||||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  6413792 cacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 6413891  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  6413892 ttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 6413934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2365101 - 2364917
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||| |||| || ||| ||| || | ||||||||| ||| ||| |||||| | || ||  ||||    
T  2365101 atcatcagtcgacccacatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaataagg-ttgactacgaatattttaagaataatgtcatttagttt 2365003  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 192  Q
    |||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2365002 aatgggttctcacgattaagccacacttaatgttccattagaaagactaattattctagagactttattattttgaaacataacaa 2364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41011
Alignment:
Q  324 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcat 423  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| || || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  424 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactct 523  Q
    |||| ||||| |||| | | || || |||||||| | |||  ||||| | || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||  |  |    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcatttcctcccgaatcgttttgaccttctcggtcgtctgctgaacaatctctggtcccaacactgcaat 41128  T
Q  524 ttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatac 623  Q
     || || || ||  ||||||||||  | ||||  ||||||  |||||| || |||||| | |||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||     
T  41127 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccagtactagaatggaaactgttgttataa 41028  T
Q  624 gtgaactctatcaatgg 640  Q
    || ||||| || |||||    
T  41027 gtaaactcaattaatgg 41011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 333 - 577
Target Start/End: Original strand, 12193654 - 12193898
Alignment:
Q  333 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactct 432  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||| ||||| || ||  | || || ||||  |  ||||| | |||| ||||||||||||    
T  12193654 ttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaaatcaatgtcattcctcctcttaacatgataactct 12193753  T
Q  433 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctga 532  Q
    | || | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||  |  |||||||| |   |  ||||||||||    
T  12193754 tctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttcttgcacaaccttcggtcctaacaaagcattttcacctga 12193853  T
Q  533 ttcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagc 577  Q
     ||| ||||||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  12193854 ctcataccaacacaaaggagttctacacctccgaccatacaaagc 12193898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 26118773 - 26118451
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |    
T  26118773 ggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttc 26118674  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||   |||| | | || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  26118673 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 26118574  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || |||||||| || |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  26118573 cacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 26118474  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  26118473 ttgttataagtaaactcaatcaa 26118451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 331 - 637
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146957
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||| || ||  |||| ||| |||  |  ||||||| ||||| |||||||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || | ||  |  |||||||| |   | |||||||||    
T  45146751 cttctatttactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaacattttccgtagtctcttgcataaccttcggtcctaacaaagcactttcacct 45146850  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
    |||||||||||||||||  | || || || ||| ||||||| | ||||||  | |||| ||| || |||||||||||  |||| ||||| || || ||||    
T  45146851 gattcaaaccaacacaatggcgtcctacacctccgaccatacagagcctccaacggtgtcataccgatactagaatgcaaactgttgttgtaagtaaact 45146950  T
Q  631 ctatcaa 637  Q
    | |||||    
T  45146951 caatcaa 45146957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 315 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 12368766 - 12368473
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||  |||||| || | |||||||||||||| || || ||  | || || |||| ||  || || |    
T  12368766 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcc 12368667  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||  || ||||| ||    
T  12368666 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctcttggatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccggtccaaa 12368567  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatga 608  Q
     |   | ||||| || ||||| |||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  12368566 caaagcactttctccggattcgaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagccataccaatactagaatga 12368473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12738499 - 12738440
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacataa 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12738499 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacataa 12738440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 414 - 657
Target Start/End: Original strand, 15340611 - 15340854
Alignment:
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||    |||| ||| |||||||| || || || ||||| | ||| ||||| |    
T  15340611 cgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcagcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtccca 15340710  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | || || || || ||||| |||||| | || ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||| | ||  | |||||||| || ||||| ||||| ||| |    
T  15340711 atacaacactctctcctgactcaaactagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaaat 15340810  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15340811 gttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 15340854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39111905 - 39111819
Alignment:
Q  121 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 208  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39111905 attaagtcgtacttaatgtttcattaaacggactcgctattctagggactttatt-ttttgaaataaaacaaaattaataaagaaatg 39111819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 331 - 481
Target Start/End: Original strand, 13353247 - 13353397
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| | || ||   |||||||||||  |  ||||| | |||||||||||||||    
T  13353247 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacagtattcactctcagaaacacaagatcaccaatttggaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 13353346  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 481  Q
    ||| ||   |||||| || ||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  13353347 cttctgcgtactctgagatgctctcgtcttctcttaaatcatcttaacctt 13353397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 307
Target Start/End: Original strand, 2653275 - 2653332
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 307  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653275 catgatacaaagccaatcccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 2653332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 11543223 - 11543279
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543223 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11543279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 460
Target Start/End: Original strand, 12455787 - 12455928
Alignment:
Q  319 tcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgctt 418  Q
    |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||| ||    || || |||||    
T  12455787 tcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgctt 12455886  T
Q  419 atcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12455887 gtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 12455928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7396381 - 7396221
Alignment:
Q  22 acataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   |||  | ||| ||  || ||||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  7396381 acataatagtctctatgctttaatatcatcgtatttcacactaaggcttgactacatatgttttaagaataattttcttatgtttaatagggtctcaaga 7396282  T
Q  122 ttaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttg 181  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  7396281 ttaagtcatacttaatgttccatttaaatgaactaactattctagcgacatttttattttg 7396221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 11536305 - 11536361
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11536305 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagagtggctattagggcttattccaaca 11536361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12750789 - 12750733
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12750789 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattagctattagggcttactccaaca 12750733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15152406 - 15152350
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152406 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 15152350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 481
Target Start/End: Original strand, 20466877 - 20467028
Alignment:
Q  330 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataac 429  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||  ||| |  || | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  20466877 gacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataac 20466976  T
Q  430 tcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 481  Q
    | || || | |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20466977 tattctgcctactctgagattctttcatcttctcctgaatcatcataacctt 20467028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29327745 - 29327690
Alignment:
Q  251 atgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29327745 atgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 29327690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 490
Target Start/End: Original strand, 13378796 - 13378953
Alignment:
Q  333 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactct 432  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| | |||| | ||||||||||||||||| || ||  | || |||||||  |  || || | |||||||| ||||| ||    
T  13378796 ttcaaagcacgaccaactcaagttataggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaattttctttctcctcttatcataataacgct 13378895  T
Q  433 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 490  Q
    | |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  13378896 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagt 13378953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15148105 - 15148049
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15148105 catgatacaaaaccaaacccaattaatatagattggctattagggcttactccaaca 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3132791 - 3132748
Alignment:
Q  97 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgtt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3132791 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttacacttaatgtt 3132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 505
Target Start/End: Original strand, 5764588 - 5764763
Alignment:
Q  330 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataac 429  Q
    ||||||||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || | | |||| || || |  || ||||| |||||| |||||||||    
T  5764588 gacttcaaagcacgatcaacgcccatcactggagtgactctaaaaaacacatgatcccgtacttgaaattccaattacttccttcgcttaccatgataac 5764687  T
Q  430 tcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
    |||| || |   | ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||    
T  5764688 tcttctgcctgatttgcgatgccttcatcctctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgttgaacactatc 5764763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 17145428 - 17145282
Alignment:
Q  335 caaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttt 434  Q
    |||| ||||||||||||| || |||  | | ||||| |||||||||||  ||||  |||| ||||||| ||  ||| | | ||||||||||||||||||     
T  17145428 caaaacacgtccaacaccggttacattattcactcttaaaaacacatgagctccaacttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgataactcttc 17145329  T
Q  435 tgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 481  Q
    || | |||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  17145328 tgcctactctgagaagctttcatattttcttgaatcatcttcacctt 17145282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10234244 - 10234179
Alignment:
Q  99 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 164  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10234244 ttatgtttaatggaatctcatgattaagttatatttaatggttcattaaacggactaactattcta 10234179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 657
Target Start/End: Original strand, 13665864 - 13665960
Alignment:
Q  561 ctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  13665864 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 13665960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Original strand, 17923760 - 17923924
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-cacatggtctccttcttggaactcaagatatttccta 413  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || || ||| | ||||| ||||| |||||| || ||  | || |||||||  |   ||||     
T  17923760 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaccaccggttaccggattcactcttaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccatcctc 17923859  T
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 478  Q
    | |||||||||| ||||||| || | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17923860 ctcttatcatgacaactcttctgcctattctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 17923924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 661
Target Start/End: Original strand, 12456959 - 12457206
Alignment:
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   || | | | || ||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| |    
T  12456959 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatgaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 12457058  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | ||||| || || ||||| |||||| | || ||  |||| ||  | ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  12457059 acaccacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 12457158  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
     |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  12457159 gttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatctcaagttcc 12457206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13392085 - 13392030
Alignment:
Q  251 atgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13392085 atgatacaaagtcaaacacaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 13392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 26288106 - 26288060
Alignment:
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26288106 cgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatctt 26288060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 214
Target Start/End: Original strand, 2653207 - 2653239
Alignment:
Q  182 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653207 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 2653239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 18258087 - 18258143
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18258087 catgatacaaggccaaaaccaatcaatctagattggctatcagggcttactccaaca 18258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18560969 - 18560913
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18560969 catgatacaaagccaagcccaatcaacatagattgcctttaagggcttactccaaca 18560913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 4598 - 4240
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4598 ataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 4499  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||    
T  4498 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctc 4399  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4398 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaa 4299  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4298 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 4240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 8709 - 9067
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8709 ataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 8808  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||    
T  8809 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctc 8908  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8909 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaa 9008  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9009 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 9067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 33766 - 33408
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  33766 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 33667  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||    
T  33666 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctc 33567  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33566 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaa 33467  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33466 tgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 33408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 14473 - 14831
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  14473 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagat 14572  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  14573 ccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 14672  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14673 tggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 14772  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14773 tgatgactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 14831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 740 - 1091
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  740 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttct 839  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||   |||| ||||||||||| |||||||||    
T  840 acgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttcttactagtctgctgaacaatctctggtcct 939  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  940 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactttaatgataac 1039  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1040 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcctaagttcctcc 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 127392 - 127034
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  127392 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggt 127293  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  127292 ctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttc 127193  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  127192 tggtcctaaaaccacactctcacctgacttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 127093  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  127092 tgataactgttattgtacgcgaactctatcaatggacgatgactatcccaagtccctcc 127034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 308 - 664
Target Start/End: Original strand, 229158 - 229514
Alignment:
Q  308 aaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatat 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |    
T  229158 aaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtct 229257  T
Q  408 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctg 507  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  229258 tttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctg 229357  T
Q  508 gtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatg 607  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229358 gtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaaacctcataaggtgccattccaatactagaatg 229457  T
Q  608 ataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  229458 ataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgaatatcccaagttcctcc 229514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 219610 - 219252
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||| |    
T  219610 ataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggt 219511  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  219510 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttc 219411  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| |  |||||||||||| |||||||||| ||    ||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  219410 tggtcctaaaaccacactctcacctgacttgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccattcaaaacctcaaatggtgccattccaatactagaa 219311  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  219310 tgataactgttattgtacgtgaattctataaacggaagatgattatcccaagttcctcc 219252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 32877
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta- 513  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  ||||| ||||     
T  33079 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctgggcctaa 32980  T
Q  514 -agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
     | | ||||||    || || ||||||||||||||| | ||||| || |||  |||||| ||||||| | | |||||||| || ||||||| |||| |||    
T  32979 caaagcactct----ccggactcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagccttaaatggtgccataccgatactagcatgaaaac 32884  T
Q  613 tattgtt 619  Q
    | |||||    
T  32883 tgttgtt 32877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 21980 - 22338
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21980 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcgcaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 22079  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||| ||    
T  22080 ccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctc 22179  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22180 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagatctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaa 22279  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22280 tgataactgttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctcc 22338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 9456 - 9814
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  9456 ataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggt 9555  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  9556 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagtttgttaaacaatctc 9655  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9656 tggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgcccttccaatactagaa 9755  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||  || |||||||||| ||||||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  9756 tgataactatcattgtacgtgaactttatcaatggtagatgattaaccctagttcctcc 9814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 313 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 109997 - 109647
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  109997 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 109898  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  109897 acgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 109798  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109797 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccgttccaatactagaatgataac 109698  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctc 663  Q
    |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  109697 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 109647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 112681 - 113023
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  112681 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctac 112780  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   ||||  || ||||| |  |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  112781 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaagtttaccttttatgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 112880  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     | ||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  112881 catcacactttcccccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 112980  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  112981 ttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 113023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 96186 - 95844
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||||||||    
T  96186 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctac 96087  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| | |||| ||||| ||||| |  ||||| |  || || || ||    
T  96086 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcaccctaactttctccgtagtctcatgaaccaagtccggccccaa 95987  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || ||||||||||| |   ||||||| || ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  95986 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagttctacacctccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 95887  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  95886 ttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaag 95844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 318 - 664
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7868
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaagac 7721  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7722 cactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 7821  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7822 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 7868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 7058 - 7410
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-cacatggtctccttcttggaactcaagatatttcc 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  7058 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttc 7157  T
Q  412 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcc 511  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7158 cacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcc 7257  T
Q  512 taagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataa 611  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7258 taagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataa 7357  T
Q  612 ctattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7358 ctattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctcc 7410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 534 - 885
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||    
T  534 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttct 633  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  634 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 733  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  734 aagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgtcattccaatactagaatgataac 833  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  834 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctcc 885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 7497 - 7848
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  7497 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 7596  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| | || ||||||    
T  7597 acgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgttgaacagtctccggtcct 7696  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7697 aagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataac 7796  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7797 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 7848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 43274 - 43625
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  43274 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 43373  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43374 gcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 43473  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43474 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaacatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 43573  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  43574 tattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctcc 43625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 313 - 664
Target Start/End: Original strand, 8605 - 8956
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||| ||| ||    
T  8605 tcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttct 8704  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  8705 acgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctccggtcct 8804  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8805 aagaccactctttcacctaactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataac 8904  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8905 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 8956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 487 - 664
Target Start/End: Original strand, 15241 - 15418
Alignment:
Q  487 tagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataagg 586  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  15241 tagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaagg 15340  T
Q  587 tgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15341 tgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 15418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 50698 - 50356
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||    
T  50698 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 50599  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc--ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||     
T  50598 gcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtccc 50501  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  50500 aacatcacactttcccccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 50401  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  50400 tattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 50356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 359 - 483
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13956
Alignment:
Q  359 aggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 458  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  459 ttctcttgaatcatcttaaccttct 483  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttct 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 106757 - 106435
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||| | |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  106757 ggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 106658  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  106657 tcttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 106558  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| |  |||||||||||||||||| | || || || |||  |||||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||||     
T  106557 caaagcactttctctggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggagccataccgatactagaatgaaaactg 106458  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  106457 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 106435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 9083 - 9441
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |    
T  9083 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggt 9182  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  9183 ctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttc 9282  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||| |||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9283 tggtgctaaaaccagactctcacctgaatcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttctaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 9382  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9383 tgataactgttattgtatgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 9441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 354
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||| || ||  | || ||||||| ||  ||||| |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 478  Q
     |||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  417 tcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 331 - 213
Alignment:
Q  522 ctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttat 621  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | || || || ||  ||||| | ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| |||| ||||| |    
T  331 ctttcacctgaatcaaaccaacataaccgcgtcctacaccttcgaccacacaaagcctcaaatggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 232  T
Q  622 acgtgaactctatcaatgg 640  Q
    | || ||||| ||||||||    
T  231 aagtaaactcaatcaatgg 213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 306 - 661
Target Start/End: Original strand, 115 - 470
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||    
T  115 ataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctcttgaaactcaagat 214  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  215 cctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatc 314  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  315 tagtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 414  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    | |||| | || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  415 ttataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatggctatcacaagttcc 470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 32945 - 32587
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||    
T  32945 ataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagat 32846  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  32845 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagtttgttgaacaatttc 32746  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32745 tggccctaaaaccacactcccacctgactcaaaccaacacaacggagttcttcatctccgatcatacaaagcctcaaaagatgccattccaatactagaa 32646  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32645 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 32587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 49606 - 49964
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
      ||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49806 gagtcctaaaacaaccctttaacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 49905  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||    
T  49906 tgataactattattgtacgtgaacactatcaatggaggataactatcgaaagttcctcc 49964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 313 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 966 - 628
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  |||||||||| ||| ||    
T  966 tcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttccttaaactcaagatcttttct 867  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  866 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 767  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  766 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaacgataac 667  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactat 651  Q
    |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  666 tattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactat 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15262 - 14914
Alignment:
Q  316 gagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacg 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15262 gagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacg 15163  T
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||     
T  15162 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctggtcccaaa 15063  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    || || || |||||||| || ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15062 actacactctcacctgactcgaaccaacacaacgaagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgccattccaatactagaatgataactat 14963  T
Q  616 tgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14962 tattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 14914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 14990 - 15348
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  14990 ataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggt 15089  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  15090 ctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttc 15189  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||  ||||||||||  ||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  15190 tggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcacttcctaccatacaaagcctcaaatggtgccattccaatactggaa 15289  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15290 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgattatcccaagttcctcc 15348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 113356 - 113322
Alignment:
Q  630 tctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113356 tctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 113322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 4145 - 4502
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  4145 ataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggt 4244  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||    
T  4245 ctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacgatttc 4344  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4345 tggtcctaaaactacactctcacctgattcgaaccaacacaacgaagttctgcacttct-tccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaa 4443  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4444 tgataattgttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagtttctcc 4502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 6)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 2321 - 2528
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2321 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 2420  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2421 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 2520  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  2521 tgccttgt 2528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 11212 - 11419
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 11311  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 11411  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  11412 tgccttgt 11419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 318 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 25252 - 24912
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| |    
T  25252 gtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtt 25153  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || ||    
T  25152 tgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttattagcttaaccttttctgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacac 25053  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattg 617  Q
     || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||  | |||| ||| | |||||||||||||||||| |||    
T  25052 tacactttcacccgactcaaaccaacagaacggagttctgcacctccgaccatgcaaagcttcgaatggtgtcatccaaatactagaatgataactgttg 24953  T
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagt 658  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24952 ttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagt 24912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2620
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2564 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 2620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11511
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11455 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16355 - 16211
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| | |||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  |||| || || | ||  ||||| |    
T  16355 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacaaacaccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatccccaacttgaaagtctatatccttcctcc 16256  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 459  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  16255 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatct 16211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1470
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  1118 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggt 1217  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||     | ||    
T  1218 cttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttcactttttctt-aatcgtcttaaccttctcagtagtttgttg-----tctc 1311  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1312 tggtcctaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 1411  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1412 tgataaatgttatagtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaaattcctcc 1470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 26726 - 26368
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  26726 ataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggt 26627  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |     
T  26626 ctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaattta 26527  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    | ||||||| ||||| || |||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  26526 ttgtcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaa 26427  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  26426 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaacagaacatgactatcccaagttcctcc 26368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 195886 - 195545
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  195886 ggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 195788  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |  || ||||| ||    
T  195787 gcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaagtccggtcccaa 195688  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| | ||| |||||     
T  195687 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccataccaatactcggatggtaactg 195588  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  195587 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 195545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 121812
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||  || ||||  || | ||||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaaccttttccgtaatttcttgcacaacttccgttcctaa 121935  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |  || ||||| || |||||||||||||||||| | ||||| || |||  |||||| ||||||||| | || |||| ||| |||||||||||| || |     
T  121934 caaaacactttccccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccaatccgatactagaatgaaaattg 121835  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  121834 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 121812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 656
Target Start/End: Original strand, 148692 - 149033
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| || || |||| ||||| |||    || ||||    
T  148692 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctac 148791  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    | || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    |||||| | || |||||  |||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  148792 ggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcctgactttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 148891  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||  ||  | || ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  148892 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaggttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactg 148991  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaa 656  Q
     |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  148992 ctgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaa 149033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 637
Target Start/End: Original strand, 180147 - 180368
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  |  ||||||||     
T  180147 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttgcggtcctaac 180246  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    |  || ||||| || || ||||||||||||||  | || || || |||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  180247 aaaacactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgt 180346  T
Q  616 tgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    |||| || || ||||| |||||    
T  180347 tgttgtaagtaaactcaatcaa 180368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 68624 - 68575
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 364  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  68624 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 68575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 6934 - 7141
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6934 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 7033  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7034 aatagggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 7133  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  7134 tgccttgt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 13950 - 14157
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13950 atcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgttt 14049  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14050 aatggggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattgtagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 14149  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    ||||||||    
T  14150 tgccttgt 14157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7233
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7177 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 14193 - 14249
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 13170 - 12812
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13170 ataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagat 13071  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  13070 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttgctgaagaatttc 12971  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || ||  | || | |||||| || |||||||||||  |||| || || ||| ||||||| | ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  12970 tggtcccaaaactgcactctaacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaatggtgccattccaatactagaa 12871  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12870 tggtaactgttattatatgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttcctcc 12812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 306 - 661
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1376
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  1021 ataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggt 1120  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  1121 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatccacttaatcttctcagtagtttgctgaacgatatc 1220  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||    
T  1221 tggtcccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccattccaatactaaaa 1320  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1321 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatctcaagttcc 1376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 306 - 656
Target Start/End: Original strand, 17100 - 17450
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |    
T  17100 ataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggt 17199  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||  || ||    
T  17200 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagtttgttgaatgatttc 17299  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || || ||  | |||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17300 tggtcccaaaactacaatctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacctccgaccatacagagcctcaaaaggtgccattccaatgctagaa 17399  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaa 656  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17400 tgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaa 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 370 - 664
Target Start/End: Original strand, 15832 - 16126
Alignment:
Q  370 tcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 469  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  470 catcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgacca 569  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgtgtcctaaaaccaccctttcacctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16031  T
Q  570 tataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032 aaaaaagcctcataagatgccattccaatactagaatgataaatattattgtacgtgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 16126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 306 - 530
Target Start/End: Original strand, 15605 - 15829
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| || |    
T  15605 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggt 15704  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  15705 atttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15804  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
      ||||||| ||||| |||||||||    
T  15805 gagtcctaaaaccaccctttcacct 15829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7314 - 7107
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7314 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgttt 7215  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7214 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttctattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 7115  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    | ||||||    
T  7114 taccttgt 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7071 - 7015
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16609 - 16251
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||   |||||    
T  16609 ataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagat 16510  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  16509 cctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttc 16410  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    || || ||| ||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||   ||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  16409 tgttcttaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttttgcacctcgttccatacaaagcctcaaatggtgtcattgcaatactagaa 16310  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16309 tgataactattattgtacgtgaattctattaatggaagatgactatcccaagtccctcc 16251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1200 - 993
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1200 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttctttatgttt 1101  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1100 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 1001  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    || |||||    
T  1000 tgtcttgt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 900
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 3253 - 3611
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  3253 ataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggt 3352  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||    
T  3353 ctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgttgcacgatttc 3452  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    ||| || ||    || || |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  3453 tggccccaaatttacactctcacttgactcaaactaacacaatggagttctgcatctccggccatacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaa 3552  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || ||||| || || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3553 tggtaactgttattgtacatgaactctattaacggaagatgactatcccaagtttctcc 3611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 117098 - 116740
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||| |    
T  117098 ataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactctcaaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggt 116999  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |     
T  116998 ctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgattta 116899  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || || || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||| ||||||| | | | ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  116898 tggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacagagtcctacacctccgaccatacagaacttcaaatggtgtcattccaatactagaa 116799  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  116798 tgataactgttattgtacgtcaactctatcaacggaagatgactaacccaagttcctcc 116740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 619
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98441
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | || || |||||||| || || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  |||||||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctggtcctaa 98336  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |  || || || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||| ||||| | ||| |||| || ||||||| |||| ||||     
T  98337 caaaacactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaaacctcaaacggtaccataccgatactagcatgaaaactg 98436  T
Q  615 ttgtt 619  Q
    |||||    
T  98437 ttgtt 98441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23583
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatg 382  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatg 23583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Original strand, 112134 - 112492
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  112134 ataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggt 112233  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  112234 ccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagtttgttgaacgatatc 112333  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || || || || || ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||| ||| | |||| |||| |||||||||||    
T  112334 tggtcccaaaactacactctctcctgactcgaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgtcatttcaatactagaa 112433  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  112434 tgataactgttattgcatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 112492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 306 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 203661 - 203309
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  203661 ataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggt 203562  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||   || | ||||||||| |  ||||| || ||||||||||     
T  203561 ctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatatt 203462  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
     ||||| || || || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |   | ||||||||||| |||||||||    
T  203461 cggtcccaacactacactctcacccgactcaaaccaacataacagagttctgcacctccgaccatacaaagctttgaatggtgccattcctatactagaa 203362  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagt 658  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  203361 tggtaacttttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagt 203309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 322826 - 323168
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  322826 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 322925  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| || || ||    
T  322926 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggacccaa 323025  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || |||||||||||||| || ||  |||| ||||| ||| || |||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  323026 cacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgatcatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactggaatggtaactg 323125  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  323126 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 323168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 385939 - 386283
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||| |||  |||||||||||||| ||| | ||| ||||| ||||| ||||||||    || ||    
T  385939 tcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactctcagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttct 386038  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| | |||||||||     
T  386039 tcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaaccttctccgtagtctaatgaactaaatctggtccc 386138  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| || || ||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |   |  ||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  386139 aacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttagaacagtgccataccaatactcgaatggtaac 386238  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  386239 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 386283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 117690 - 118032
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  117690 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 117789  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  117790 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtatgatgaaccaaatccggtcccaa 117889  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| ||||||||||| ||  ||||  | || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  117890 cacaacactctctcctgactcaaaccaacataaaggagtcttacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 117989  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  117990 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactataccaag 118032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 328 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 25890 - 25557
Alignment:
Q  328 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgata 427  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  25890 ttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgata 25791  T
Q  428 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttca 527  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || |||    
T  25790 attcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctca 25691  T
Q  528 cctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtga 627  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25690 cctgactcgaaccaacacaacggagttctacacttctgaccatacaaagcttcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtga 25591  T
Q  628 actctatcaatggaagatgactatcccaagttcc 661  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25590 actctatcaacggaagatgactatcccaagttcc 25557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 25990 - 26197
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25990 atcatcagtctacctacataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 26089  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090 aatggggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaatggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 26189  T
Q  207 tgccttgt 214  Q
    || |||||    
T  26190 tgtcttgt 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 251 - 306
Target Start/End: Original strand, 26231 - 26286
Alignment:
Q  251 atgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26231 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgactattagggcttattccaaca 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 306 - 637
Target Start/End: Original strand, 448172 - 448503
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| |    
T  448172 ataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggt 448271  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  448272 ctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttc 448371  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||  || ||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  448372 tggtcaaaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaatggtgccattccaatactagaa 448471  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  448472 tgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 448503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 317 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 91114 - 90774
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||    
T  91114 agtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgc 91015  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||      
T  91014 ttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacg 90915  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  90914 ctacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgtt 90815  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  90814 gttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaag 90774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 306 - 476
Target Start/End: Original strand, 162226 - 162396
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  162226 ataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagat 162325  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca-tcttctcttgaatcatctta 476  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  162326 cttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcactctt-tcttaaatcatctta 162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78638
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | ||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 490  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||| || || ||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  78713 tcttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttctactgaatcatcataaccttttccgtagt 78638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 391069 - 391035
Alignment:
Q  630 tctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391069 tctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 391035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 555 - 657
Target Start/End: Original strand, 114542 - 114644
Alignment:
Q  555 ctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatccc 654  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| || || ||| | || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  114542 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtggtaagtgttattgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 114641  T
Q  655 aag 657  Q
    |||    
T  114642 aag 114644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 307 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16657 - 16375
Alignment:
Q  307 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagata 406  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |     
T  16657 taaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtc 16558  T
Q  407 tttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatct 506  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |    
T  16557 tttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaattttt 16458  T
Q  507 ggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgc 589  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  16457 ggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgc 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5736 - 5531
Alignment:
Q  7 atcatcagtctacctacataatggtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5736 atcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaataatttccttatgttt 5637  T
Q  107 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5636 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaataaatcaataaagaaa 5537  T
Q  207 tgcctt 212  Q
    ||||||    
T  5536 tgcctt 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5444
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 298  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5492 catgatacaaagccaaacccaaacaatatagattggctattagggctta 5444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 342 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 5747 - 5426
Alignment:
Q  342 cgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgac 441  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5747 cgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctac 5649  T
Q  442 tctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaacca 541  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||  |||||  | ||||| || ||| ||||    
T  5648 tctgcgacgctttcatcttctctctaatcaacttaaccttctctgttgtttgttgaacaatttcaggtcctagtaccacattctcaccggactcatacca 5549  T
Q  542 acacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatgga 641  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | || || ||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  5548 acacaacggagttctgcatctccgaccaaacaacgcttcgaacggtgtcattccaatgctagaatggtaactgttattatacgtgaactcaatcaatgga 5449  T
Q  642 agatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  5448 agattactatcccaagttcctcc 5426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 444 - 664
Target Start/End: Original strand, 12738 - 12958
Alignment:
Q  444 tgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaac 543  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12738 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaac 12837  T
Q  544 acaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaag 643  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  12838 acaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaag 12937  T
Q  644 atgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  12938 atgtctatcccaagttcctcc 12958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 150; Significance: 6e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 475 - 664
Target Start/End: Original strand, 6331 - 6520
Alignment:
Q  475 taaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataa 574  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||    
T  6331 taaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaa 6430  T
Q  575 agcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431 agcctcatagggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 6520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 306 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 86697 - 86339
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| |||| |||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  86697 ataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagat 86598  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||   |||| |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||    
T  86597 ccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaaaaatgtc 86498  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| |  |||||  | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  | ||| ||||| |||| ||||||    
T  86497 tggtcccagtaccacagtctcaccggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtaccattgcaatgctagaa 86398  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  86397 tggtaactgttattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 86339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 496 - 664
Target Start/End: Original strand, 46531 - 46699
Alignment:
Q  496 gaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattcc 595  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46531 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctcctaccatataaagcctcgaaaggtgccattcc 46630  T
Q  596 aatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46631 aatactagaatgataactattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 46699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 396 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 4557 - 4289
Alignment:
Q  396 aactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgct 495  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  4557 aactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagtttgtt 4458  T
Q  496 gaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattcc 595  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||  ||||||| ||  ||  |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  4457 gaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaaaggagttctacaaatccaaccatacaaagcctcaaatggtgccattcc 4358  T
Q  596 aatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  4357 aatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatggatgatgactagcccaagttactcc 4289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 408 - 664
Target Start/End: Original strand, 58969 - 59225
Alignment:
Q  408 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctg 507  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  |||||||  |  ||||| || |    
T  58969 ttcctacgctgatcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctcccaaatcaacttaaccttctgtgtagttttttcgacaatttccg 59068  T
Q  508 gtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatg 607  Q
    ||||||  |||||  | | ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || || ||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  59069 gtcctagtaccacattcttaccggattcataccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaatgcttcgaatggtgccatcccaatgctagaatg 59168  T
Q  608 ataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
     ||||| || || ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  59169 gtaactgttattgtacatgaactcgatcaatgagagatgactatcccaagttcctcc 59225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 577 - 660
Target Start/End: Original strand, 130532 - 130615
Alignment:
Q  577 cctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130532 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 130615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 577 - 660
Target Start/End: Original strand, 134626 - 134709
Alignment:
Q  577 cctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 660  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134626 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttc 134709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4618 - 4567
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4618 ataaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 306 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 453 - 206
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |    
T  453 ataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgt 354  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
     |||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  353 ctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgtacaatttc 254  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagt 553  Q
    |||||| || ||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  253 tggtcccaaaactgcactctcacctgattcgaaccaacacaacagagt 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 480 - 664
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1736
Alignment:
Q  480 ttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcct 579  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1552 ttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcct 1651  T
Q  580 cataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1652 cataaggtgccattccaacactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 1736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Original strand, 230365 - 230545
Alignment:
Q  31 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  230365 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggtttccttatgtttaa-ggggtctcacaattaagttat 230463  T
Q  131 acttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230464 acttaatgttccattaaacggactaactattataagaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 230545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 633
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24320
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| || ||  | || ||||||| ||  || || |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |  || ||||  |||||||||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccatagtctcttggacaacttctggtcctaa 24201  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || |||| ||| || ||| |||||||| | || || || ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| || ||    
T  24202 caaagcactctcacttgactcgaactaacacaacggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccgatactagaatgaaaatta 24301  T
Q  615 ttgttatacgtgaactcta 633  Q
    ||||| || || |||||||    
T  24302 ttgttgtaagtaaactcta 24320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 230584 - 230640
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  230584 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattattgcttactccaaca 230640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 516 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 8311 - 8163
Alignment:
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8311 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactgt 8212  T
Q  616 tgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211 tattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 8163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 9918 - 10257
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| |     ||||    
T  9918 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcct 10012  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||     
T  10013 acgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccc 10112  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  10113 aacaccacactttctcccgtctcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 10212  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10213 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 10257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4339
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||   ||||||    
T  3995 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaaggactttcct 4094  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||     
T  4095 acgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccc 4194  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| || || ||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||| ||  | |||||||| ||||||||  |||| ||||    
T  4195 aacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacgaagcttcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaac 4294  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4295 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 4339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 306 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 10932 - 10602
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10932 ataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgtaactcaagat 10833  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatc 505  Q
      || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  10832 cctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatca-attggccttctctgtagtctgttgaactatatc 10734  T
Q  506 tggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 605  Q
    |||||| || |  || |||||||| || ||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||    
T  10733 tggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacgtaacggagttctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaa 10634  T
Q  606 tgataactattgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  10633 tggtaactgttgttgtacgtaaacactatcaa 10602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 28953 - 28610
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||    
T  28953 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctac 28854  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttct-cttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||  || ||||| ||  |||| || ||||| |||| |||||| |    
T  28853 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttttctatagtctgatgaactatatatggtccca 28754  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | ||  | || |||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28753 acactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 28654  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28653 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 28610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 40944 - 40601
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||    
T  40944 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctac 40845  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttct-cttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||  || ||||| ||  |||| || ||||| |||| |||||| |    
T  40844 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttttctatagtctgatgaactatatatggtccca 40745  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | ||  | || |||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  40744 acactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 40645  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40644 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 40601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 6100 - 5756
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||    || ||    
T  6100 tcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctcttgaaactcaagggcctttct 6001  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||| ||||| || ||||||||  |||| | |||||||||     
T  6000 acgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaacttgaccttttctgtagtttgacgaactaaatctggtccc 5901  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  5900 aacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 5801  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5800 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 5756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 33863 - 33519
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||    
T  33863 tcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcct 33764  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc--ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtc 510  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  33763 acgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtc 33666  T
Q  511 ctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgata 610  Q
    | || | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33665 ccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggta 33566  T
Q  611 actattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  33565 actattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 33519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 40380 - 40702
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  40380 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 40479  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || || || ||    
T  40480 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaa 40579  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| || |||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| ||||     
T  40580 caaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactg 40679  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  40680 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 40702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 4872 - 5214
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    || ||||    
T  4872 ggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 4971  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||    
T  4972 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 5071  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  5072 caccacactttctcctgactcaaaccattataaaggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 5171  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  5172 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 5214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 18721 - 18379
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  18721 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 18622  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||    
T  18621 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaa 18522  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
      | || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  18521 ctctacactttctcctgactcaaatcaacataaaggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 18422  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18421 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 18379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16579 - 16523
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579 catgatataaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 16523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16648 - 16615
Alignment:
Q  181 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648 gaancaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 49217 - 48875
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  49217 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctac 49118  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||  |||| ||    
T  49117 gcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccagtcccaa 49018  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  49017 taccacactttcacgtgactcgaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgtacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 48918  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48917 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 48875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 58002 - 57659
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |  || ||||||||    || ||    
T  58002 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttct 57903  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||| |||| || || || ||||| | ||| |||||     
T  57902 ccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccctctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtccc 57804  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || || || ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  57803 aacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 57704  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  57703 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 57659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 52047 - 51705
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  52047 ggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 51948  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||    
T  51947 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtttgatgaaccaaatccggtcccaa 51848  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || ||||||||||||||  ||||  |||| ||| ||| ||| ||||| ||  | |||| ||| |||||||| ||||| |||||     
T  51847 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcatgcacctccgactatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactg 51748  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51747 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 51705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 523 - 664
Target Start/End: Original strand, 1 - 142
Alignment:
Q  523 tttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttata 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 tttcacctgattcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattata 100  T
Q  623 cgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 cgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 507 - 664
Target Start/End: Original strand, 10 - 167
Alignment:
Q  507 ggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaat 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacataatgaagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaat 109  T
Q  607 gataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110 gataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2258
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    ||||||     
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||   |||||||| ||| |||| ||||| ||  |||  | ||||||||| ||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctcttatcatcttgaccctctccgtagtctgaagaatcaaatctggtcccaa 2115  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  2116 caccacactttctcctgactcgaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 2215  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  2216 tagttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 2258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 47246 - 47588
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  47246 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 47345  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  47346 gcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatccggtcccaa 47445  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || || ||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||| ||| |||||||| ||||| |||||     
T  47446 cacaacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactg 47545  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  47546 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 47588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 7222 - 6878
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||  |||||||   ||| ||    
T  7222 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgacactcaagggcttttct 7123  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||| ||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||||||     
T  7122 acgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcaacttgaccttttctgtagtttgatgaactaaatctggtccc 7023  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || ||||| |||||    || ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| || || ||  | |||  ||| |||||||| ||||| |||     
T  7022 aacaccacactttctgtcgactcaaaccaacacaattgagttctgcacctccgaccatacaatgcttcgaacggtatcataccaatactcgaatggtaat 6923  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6922 tgttgttatacgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 6878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 313 - 651
Target Start/End: Original strand, 26262 - 26600
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    || ||    
T  26262 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttct 26361  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| | |||     
T  26362 acgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccgctccc 26461  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || ||  |||| || || ||||||| ||||||  ||||  |||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26462 aacactacattttctcccgactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactagaatggtaac 26561  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactat 651  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26562 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactat 26600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 652
Target Start/End: Original strand, 26865 - 26983
Alignment:
Q  534 tcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactcta 633  Q
    ||||||| ||||||  ||||  |||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26865 tcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactcta 26964  T
Q  634 tcaatggaagatgactatc 652  Q
    |||| || |||||||||||    
T  26965 tcaacggtagatgactatc 26983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 27641 - 27983
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||    |||||||    
T  27641 ggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctac 27740  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| ||||| || |||||   ||||||||| ||    
T  27741 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccgaatctggtcccaa 27840  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||| | ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  27841 cacaacactttctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 27940  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  27941 ttgttgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaag 27983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 1335 - 991
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||    
T  1335 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcct 1236  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||  ||||| || ||||| | |||||||||     
T  1235 acgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttcttcgtagtctgatgaactaaatctggtccc 1136  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || |||||  |||| | ||| ||||||||||| |   |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  1135 aacaccacattttctcttgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactcgaatggtaac 1036  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1035 tattgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 306 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 175 - 26
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  175 ataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggt 76  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 455  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  75 ctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 9925
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || |||||||| | ||||||||    
T  10267 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctac 10168  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  10167 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 10068  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || ||||| || ||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  10067 cacaacactttctcccgacccaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 9968  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9967 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 9925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 315 - 656
Target Start/End: Original strand, 6305 - 6647
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa-aaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttccta 413  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||  ||| |||||||| ||||| || |||||||| | |||||||    
T  6305 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaggaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttccta 6404  T
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| |    
T  6405 cgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 6504  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | || || ||||| ||  | |||||| | || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6505 acacaacactttctcccaactcaaacaagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaact 6604  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaa 656  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  6605 attgttgtatgtgaattctatcaatggtaggtgactatcccaa 6647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 324 - 657
Target Start/End: Original strand, 1 - 333
Alignment:
Q  324 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcat 423  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    ||||||||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  424 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactct 523  Q
    | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || || ||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacact 200  T
Q  524 ttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatac 623  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  || || ||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  201 ttctcctgactcaaaccaacataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttc-gaacgttccataacaatactcgaatggtaactgttgttgtac 299  T
Q  624 gtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  300 gtgaactctatcatcggtagatgactatcccaag 333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 18969 - 19313
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |    
T  18969 tcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcat 19068  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| || ||||| || ||||| || | ||| ||     
T  19069 acgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggcccc 19168  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || | ||| ||||| || || || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  19169 aacatcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 19268  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||| || || ||||||  ||| || || |||||||||||||    
T  19269 tattgttgtaagtaaactcttccaacggtaggtgactatcccaag 19313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 23131 - 23475
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |    
T  23131 tcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcat 23230  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| || ||||| || ||||| || | ||| ||     
T  23231 acgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggcccc 23330  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || | ||| ||||| || || || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  23331 aacatcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 23430  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||| || || ||||||  ||| || || |||||||||||||    
T  23431 tattgttgtaagtaaactcttccaacggtaggtgactatcccaag 23475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 306 - 457
Target Start/End: Original strand, 28080 - 28231
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  28080 ataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagat 28179  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 457  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28180 cctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 411 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 3807 - 3694
Alignment:
Q  411 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtc 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  3807 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctggtc 3708  T
Q  511 ctaagaccactctt 524  Q
    ||||||||||||||    
T  3707 ctaagaccactctt 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 621 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 3692 - 3649
Alignment:
Q  621 tacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3692 tacgtgaactctatgaacggaagatgactatccgaagttcctcc 3649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 37322 - 37666
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||   |||| |||||||     |||||    
T  37322 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctcccttgaaactcaatggccttcct 37421  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||| |||||     
T  37422 acgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtccc 37521  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || ||  |||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||     
T  37522 aacacaacagtttctcctgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcgataccaatactcgaatggtaat 37621  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  37622 tgttgttgtacgtgaactccatcaacggtagatgactatctcaag 37666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 38357 - 38183
Alignment:
Q  316 gagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacg 415  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    ||||||||    
T  38357 gagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacg 38258  T
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 490  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| || ||||| |||||    
T  38257 cttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 38183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27520 - 27376
Alignment:
Q  316 gagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacg 415  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    ||||||||    
T  27520 gagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacg 27421  T
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27420 cttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatctt 27376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 20105 - 20447
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    || ||||    
T  20105 ggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 20204  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    |||||||| |  |||||  |||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  20205 gcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcatcttttcccttatcatcttgagtttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 20304  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
    ||| || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||| ||| |||||||| ||||| |||||     
T  20305 gacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactt 20404  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  20405 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 20447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 13545 - 13207
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  13545 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 13446  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaa-caatatctggtccta 513  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || |||| |||| || ||||| |    
T  13445 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaat-tccggtccca 13347  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | || || || ||   ||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||  |||||    
T  13346 acacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaact 13247  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcc 653  Q
     ||||| || |||||||||||| | || || |||||||||    
T  13246 gttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcc 13207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 17315 - 16977
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || | ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  17315 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 17216  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaa-caatatctggtccta 513  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || |||| |||| || ||||| |    
T  17215 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaat-tccggtccca 17117  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | || || || ||   ||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||  |||||    
T  17116 acacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaact 17017  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcc 653  Q
     ||||| || |||||||||||| | || || |||||||||    
T  17016 gttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcc 16977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 49391 - 49049
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||||||    || || |    
T  49391 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcagaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 49292  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || || || ||||| |  ||||| | ||||||||| ||    
T  49291 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttttctgtagtctcatgaaccaaatctggtcccaa 49192  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  49191 caccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 49092  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  49091 ttgttgtatgtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaag 49049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 14085 - 13743
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||    || || |    
T  14085 ggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctcc 13986  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  13985 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 13886  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||||||| ||||||| || || ||  | |||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  13885 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcatctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaactg 13786  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  13785 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 13743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 5137 - 4795
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||  | || || ||||||||    |||||||    
T  5137 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctac 5038  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  5037 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaa 4938  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || | ||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||  ||  | |||||||| ||||||||  |||| |||||     
T  4937 cacaacactctctcttgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagattcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaactg 4838  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  4837 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 648 - 992
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||  || ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||    
T  648 tcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcct 747  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |   |||| ||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  748 acgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatctgttttcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtccc 847  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || | ||| ||||| || || |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  848 aacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaaaggagccataccaatactcgaatggtaac 947  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | || || || |||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  948 tgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcgcaag 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46598
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || |||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 46475  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  46476 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 46575  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  46576 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 46598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 306 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 58599 - 58445
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagat 405  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  58599 ataaacctcggagtcagtttctttgatttcagtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagat 58500  T
Q  406 atttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  58499 ccttcctatgcttatcatgataactcttttgtctactatgcgacgctttcatctt 58445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 19242 - 19584
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || |||||||| |  || || |    
T  19242 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcctgaaactcaaggtcctttctcc 19341  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  19342 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 19441  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || |  ||||| ||||||||  | ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||     
T  19442 tacaacactctatcctgactcaaaccagaataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactg 19541  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || ||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  19542 ttgttgtatgtgaactctatcaacagtaggtgactatcccaag 19584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 484
Target Start/End: Original strand, 74038 - 74191
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| ||||||||| ||  |  | || ||||||| || |||||| | |||||||||||| ||    
T  74038 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagct 74137  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 484  Q
    ||| || | |||||| || ||| || ||||||   |||||||||||||||||||    
T  74138 cttatgcctactctgagatgctctcgtcttcttgagaatcatcttaaccttctc 74191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 416 - 637
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71663
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaac 71541  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  71542 acaacactttctccagattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgt 71641  T
Q  616 tgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    |||| || || ||||| |||||    
T  71642 tgttgtaagtaaactcaatcaa 71663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 490
Target Start/End: Original strand, 13475 - 13548
Alignment:
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 490  Q
    ||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  13475 ttatcatgatagctcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttctgtagt 13548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 14435 - 14093
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || |  ||||||||    |||||||    
T  14435 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctac 14336  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  ||||  |||| || | ||| | ||| ||||| ||    
T  14335 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactatctctatagtctgataaaccaaatccggtcccaa 14236  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| ||||||||  | ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  14235 cacaacactctctcctgactcaaaccaggataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 14136  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  14135 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 14093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 23769 - 23825
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13352
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| || ||  | || ||||||| ||  || || |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 13229  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   |||| || || |||||||||||||||||  | || || || ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||     
T  13230 caaggctctctctccggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactg 13329  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  13330 ttgttgtaggtaaactcaatcaa 13352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7672
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  ||||| |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||  || ||||  |||||||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgcagtttcttgcacaacttctggtcctaa 7795  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   |  | || || || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  7794 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 7695  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  7694 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 7672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 583 - 241
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || | ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  583 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 484  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaa-caatatctggtccta 513  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || |||| |||| || ||||| |    
T  483 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaat-tccggtccca 385  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | || || || ||   ||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  384 acacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaact 285  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
     ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  284 gttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 653
Target Start/End: Original strand, 11010 - 11348
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || | ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  11010 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 11109  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaa-caatatctggtccta 513  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || |||| |||| || ||||| |    
T  11110 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaat-tccggtccca 11208  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | || || || ||   ||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||  |||||    
T  11209 acacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaact 11308  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcc 653  Q
     ||||| || |||||||||||| | || || |||||||||    
T  11309 gttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcc 11348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 39861 - 40202
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||||| |  || ||||    
T  39861 ggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctac 39960  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| || |||||| |||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  39961 gcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttataatcttgactttctcgttagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 40060  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||| ||  ||| |||||| ||| ||||||| | ||| ||| |   || ||| |||||||| ||||| |||||     
T  40061 taccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggag-tctgcacctccgaccatacagagcttcaaacattgtcataccaatactcgaatggtaactg 40159  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40160 ttgttgtacgtgaactctatcaaaggtagatgactatcccaag 40202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 408 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 3446 - 3197
Alignment:
Q  408 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctg 507  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||| |    
T  3446 ttcctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatccg 3347  T
Q  508 gtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatg 607  Q
     ||| || || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  3346 ttcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatg 3247  T
Q  608 ataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3246 gtaactgttgttctatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaag 3197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 220 - 562
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||     | ||||    
T  220 ggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctac 319  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  320 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 419  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| || || ||| |||| || ||||| ||  | |||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  420 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccgtacaaagcttcgaacggtgccatacgaatactcgaatggtaactg 519  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  520 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3603
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||  | || ||||| |  |  || || |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |  || ||||  || ||||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaacttccggtcctaa 3480  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| |||||||||||| |||||||| | ||  | |||||  ||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||     
T  3481 caaagcactttctcctgattcaaactaacacaacggtgtcttacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactg 3580  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  3581 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 3603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 27348 - 27689
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || |||||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||||| || |||||    |||||||    
T  27348 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcagaaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctac 27446  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||  ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||    
T  27447 gctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 27546  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || ||  |||| ||||| || ||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  27547 cacaacattttctcctgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 27646  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  27647 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 27689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 26383 - 26725
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || |||||||||   || || |    
T  26383 ggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 26482  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||| | |||| ||||| ||||| |  ||||| | ||||||||| ||    
T  26483 acttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctaactttctcagtagtctcatgaaccaaatctggtcccaa 26582  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || ||  |||||||||| ||||||||||| ||  |||| || || ||| ||||||| || || ||  | ||| |||| |||||||| || ||||| ||     
T  26583 cacaacattttcacctgactcaaaccaacataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtaccatcccaatactcgagtgatagctg 26682  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  26683 ttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaag 26725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 245
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||  | ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  |  ||||  || ||||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaa 371  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | |||||||| || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| || |     
T  370 caaagcactttcaccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgccattccgatacaagaatgaaaattg 271  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatgg 640  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||    
T  270 ttgttgtaagtaaactcaatcaatgg 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 633 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 4965 - 4934
Alignment:
Q  633 atcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4965 atcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 4934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14600
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||  |||||| || | || |||||||||||||| || ||  | || || |||| ||  || || |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  14821 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 14722  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | ||||| || |||||||||||||||||| | ||||| || |||  |||||| ||||||||| | || |||||||| ||| |||||||| ||||     
T  14721 caaagcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatagtagaatgaaaactg 14622  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatca 636  Q
    ||||| || || ||||| ||||    
T  14621 ttgttgtaagtaaactcaatca 14600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Original strand, 5333 - 5677
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||    |||||    
T  5333 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcct 5432  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |     |||||||| |||||||| || || || ||||| | ||| |||||     
T  5433 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttttccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtccc 5532  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || || || ||||| |||||||| || ||| |||| |||||  || ||||||| ||||| |   | |||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  5533 aacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccattactcgaatggtaac 5632  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  5633 tgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 5677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 313 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 21857 - 21513
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| |||||||  || ||||| ||||||||    || ||    
T  21857 tcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctcttgaaactcaagggcctttct 21758  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |  || |||||     
T  21757 ccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtccggtccc 21658  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || |   | ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  21657 aacacaacacccactcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 21558  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21557 tgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 21513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 416 - 619
Target Start/End: Original strand, 26029 - 26232
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||| ||     
T  26029 cttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccaaac 26128  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    |   | ||||| || |||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| |||| |    
T  26129 aaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgt 26228  T
Q  616 tgtt 619  Q
    ||||    
T  26229 tgtt 26232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 313 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 12967 - 12640
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||    || ||    
T  12967 tcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttct 12868  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
     ||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| || || || ||||| | ||||||||||    
T  12867 ccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatctggtcct 12768  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataac 612  Q
    || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  12767 aatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaac 12668  T
Q  613 tattgttatacgtgaactctatcaatgg 640  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||    
T  12667 tgttgttgtaggtgaactctatcaatgg 12640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 52363 - 52021
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  52363 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctcc 52264  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||| ||    
T  52263 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaa 52164  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  52163 caccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 52064  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  52063 ttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaag 52021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 61397 - 61055
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  61397 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctcc 61298  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||| ||    
T  61297 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaa 61198  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  61197 caccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 61098  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  61097 ttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaag 61055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 67785 - 67443
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  67785 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctcc 67686  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||| ||    
T  67685 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaa 67586  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  67585 caccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 67486  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  67485 ttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaag 67443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 2873 - 3215
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||    || ||||    
T  2873 ggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctcttgaaactcaagggcctttctac 2972  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    |||||||| || ||||| || || || ||||| | ||| ||||| ||    
T  2973 gcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 3072  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |   | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  3073 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 3172  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  3173 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 330 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 13364 - 13192
Alignment:
Q  330 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataac 429  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |   ||||||| || ||||||||||| |    
T  13364 gacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggattgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaatgatttccttcgtttatcatgatagc 13265  T
Q  430 tcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaat 502  Q
    |||| |||| ||| || || ||||||||  ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13264 tcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtttgctgaacaat 13192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 42517 - 42175
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  42517 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 42418  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||  ||||| ||    
T  42417 gcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaa 42318  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  42317 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 42218  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  42217 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 42175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 47583 - 47246
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||  ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||    |||||||    
T  47583 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 47484  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||  ||||| ||    
T  47483 gcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaa 47384  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  47383 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 47284  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatc 652  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||    
T  47283 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatc 47246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 664
Target Start/End: Original strand, 2337 - 2392
Alignment:
Q  609 taactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2337 taactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactaccccaagttcctcc 2392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 373
Target Start/End: Original strand, 2263 - 2330
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 373  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2263 ataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactctcaa 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 331 - 619
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14949
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| || ||  | || |||||||  |  ||||| | |||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |  || |||||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaaacactttcacct 14860  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgtt 619  Q
    || |||||| ||||||||    | || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || |||| ||||||| |||| |||||    
T  14861 gactcaaacaaacacaacgacatcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacaagaatgaaaactgttgtt 14949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 313 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 5188 - 4924
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||  || ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    || ||    
T  5188 tcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttct 5089  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcct 512  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| || || || ||||| | || |||| |     
T  5088 acgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtctgatgaactaaatatggttcc 4989  T
Q  513 aagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagc 577  Q
    || ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  4988 aacaccacactttctccccactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagc 4924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 1887 - 1814
Alignment:
Q  584 aggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||| |  || |||||||||||||    
T  1887 aggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactttatcaacgacaggtgactatcccaag 1814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 315 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 1353 - 1121
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  1353 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 1254  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   || ||||| |||||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  1253 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttctcttattatcttgaccttctccgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaa 1154  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaa 547  Q
     |  || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  1153 cataacactttctcctgactcgaaccaacacaa 1121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 315 - 490
Target Start/End: Original strand, 4013 - 4188
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||    
T  4013 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctac 4112  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 490  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  4113 gcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagt 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 7422 - 7080
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||| || ||| || |||| ||| ||||| || || || || |||| |||    |||||||    
T  7422 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaacttaagggccttcctac 7323  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||  || ||||| | ||| ||||| ||    
T  7322 gcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagactgatgaaccaaatccggtcccaa 7223  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || |  || |||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  7222 cacaacaccctctcctgacacaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggcgccataccaatacttgaatggtaactg 7123  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  7122 ttgttgtacgtgaactctatcaacgttagatgactatcccaag 7080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 313 - 499
Target Start/End: Original strand, 14205 - 14391
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    || ||    
T  14205 tcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttct 14304  T
Q  413 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaac 499  Q
    | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  14305 atgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgacattctccgtagtctgatgaac 14391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 26049 - 25707
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||    || ||||    
T  26049 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctac 25950  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| ||||| || || || | ||| ||||| |     
T  25949 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttcccttatcatctttaccttctccgtagtctgatggaccaaatccggtcccag 25850  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     || || || || ||| | |||||||| || ||  || |  |||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  25849 cacaacactctctcctaactcaaaccagcataaaggattcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 25750  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  25749 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 25707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Original strand, 16798 - 16943
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || |||||||||   || || |    
T  16798 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 16897  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  16898 gcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatctt 16943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 28450 - 28218
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||  || || |    
T  28450 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaatatcctttctcc 28351  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  |  ||||||||    
T  28350 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaa 28251  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaa 547  Q
     |   | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28250 caaagcactttcacctgactcaaaccaacacaa 28218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 331 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 916
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || ||  |  | ||||||| || ||| || | |||||||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | |||||||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcacct 1023  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
     | |||||||||||||   | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||| |||| ||||| || || ||||    
T  1022 aactcaaaccaacacattggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattctgatacttgtatgaaaactgttgttgtaagtaaact 923  T
Q  631 ctatcaa 637  Q
    | |||||    
T  922 caatcaa 916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 657
Target Start/End: Original strand, 104 - 353
Alignment:
Q  408 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctg 507  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | |||||    
T  104 ttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctg 203  T
Q  508 gtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatg 607  Q
    |||| || || || || || ||||| |||||||| || ||  || | ||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| | |||||| |||||    
T  204 gtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccatacaaatactcgaatg 303  T
Q  608 ataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
     ||||  ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  304 gtaacggttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 940
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 469  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 464
Target Start/End: Original strand, 313 - 462
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||||||| | ||| |||| |||||| || |||| ||| |||||||| || || || |||||||| | ||||||||    
T  313 ggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctac 412  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  413 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 348 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1076
Alignment:
Q  348 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 447  Q
    ||||| |||| |||||| || |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  448 acgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaa 547  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||| || || || || || ||||| || |  || ||||| || ||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttctcccgtctcgaaccagcataa 1186  T
Q  548 cagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatga 647  Q
      |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || || ||||||||||| || |||    
T  1185 aggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtaaattctatcaatggtaggtga 1086  T
Q  648 ctatcccaag 657  Q
    || |||||||    
T  1085 ctgtcccaag 1076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 317 - 637
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23838
Alignment:
Q  317 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgc 416  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || || |   |||| ||||||| ||  || || | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  417 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaaga 516  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |    
T  23618 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacctccggtcctaaca 23717  T
Q  517 ccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactatt 616  Q
       | || || || || ||||||||||| ||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| || | ||    
T  23718 aagcactctctccagactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaaatgtt 23817  T
Q  617 gttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||| || || ||||| |||||    
T  23818 gttgtaagtaaactcaatcaa 23838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 416 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 1507 - 1283
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  1507 cttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaac 1408  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    |   | ||||||||||| |||||| |||||||| | || || || ||| | ||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| |||| |    
T  1407 aaggcactttcacctgactcaaactaacacaacggtgtcctacacctcagtccatacaaagcctcaaacggtgtcattccgatactagaatgaaaactgt 1308  T
Q  616 tgttatacgtgaactctatcaatgg 640  Q
    |||| || |||||||  ||||||||    
T  1307 tgttgtaagtgaacttaatcaatgg 1283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10493 - 10426
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatg 382  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  10493 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacccatg 10426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3737
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||  |  | || ||||||| ||  || || |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  ||  | |||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccaggcctaa 3860  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     |   | || || |  |||||||||||||||||  | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| ||||     
T  3859 caaagcactctctctggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactg 3760  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||| || || ||||| |||||    
T  3759 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 3737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 451 - 637
Target Start/End: Original strand, 7426 - 7612
Alignment:
Q  451 ctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacag 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   | ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7426 ctttcatcttctcttgaatcatcttctctttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacgg 7525  T
Q  551 agttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||| || || ||||| |||||    
T  7526 agttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaa 7612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Original strand, 17070 - 17142
Alignment:
Q  306 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaaca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17070 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 19883 - 19837
Alignment:
Q  618 ttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19883 ttatacatgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctcc 19837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 331 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 9059 - 8748
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| || | || |||||||||| ||| || ||  | || |||||||  |  ||||| | |||||||||||||||    
T  9059 acttcaaagcacgaccaacaccggtgacatgattcaccctcaaaaacagatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 8960  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | |||||  |     
T  8959 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcttcg 8860  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
    |||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||| ||| |||| |||| || || || || ||||    
T  8859 gattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaactgtgtcattccgatattagtatgaaaactgtttttgtaagtaaact 8760  T
Q  631 ctatcaatggaa 642  Q
    | ||||| ||||    
T  8759 caatcaacggaa 8748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 573 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 197404 - 197313
Alignment:
Q  573 aaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  197404 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 197313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 26240 - 26019
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  ||| |||||||     
T  26240 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctagtcctaac 26141  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    |     |||||||| |||| ||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||| |||| |    
T  26140 aaagaactttcaccggattaaaaccaacacaacggtgtcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgt 26041  T
Q  616 tgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
    |||| || || ||||| |||||    
T  26040 tgttgtaagtaaactcaatcaa 26019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 214
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8510
Alignment:
Q  150 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8446 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 8546 - 8602
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 catgatacaaagccgaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 331 - 622
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9416
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || ||||| || ||  | || ||||||| ||  || ||   |||||||||||| ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  ||  ||||||| |   | |||||||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagtctcttgcacaacttcctgtcctaacaaagcactttcacct 9324  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttata 622  Q
    || ||||||||||||||| |    || |||||  ||||||| ||||||||| | |||| |||  | |||||||||||| |||| ||||||||    
T  9325 gactcaaaccaacacaacggtaacctacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatcgcgatactagaatgaaaactgttgttata 9416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 315 - 490
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8392
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| ||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  8217 ggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8316  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 490  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8317 tcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcatattctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 8392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 585 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 19119 - 19040
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctcc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19119 ggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaaaggaagatgactatcctaagttcctcc 19040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 315 - 490
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14954
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || |    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 490  Q
     ||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  14879 tcttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagt 14954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 640
Target Start/End: Original strand, 43761 - 43985
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaag 515  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  43761 cttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaat 43860  T
Q  516 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactat 615  Q
    |   | ||||| || || ||||||||||||| | | ||  | || |||  |||||| ||||||||| | |||||||| |  |||||||||||| |||| |    
T  43861 aaagcactttctccggactcaaaccaacacagcggtgtcatacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccatactgatactagaatgaaaactgt 43960  T
Q  616 tgttatacgtgaactctatcaatgg 640  Q
    |||| || || ||||| ||||||||    
T  43961 tgttgtaagtaaactcaatcaatgg 43985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 20244 - 20586
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||||||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  20244 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 20343  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || || |  ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  20344 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgacttttttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 20443  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||| ||| ||||| ||  |   || ||| || ||||| ||||| |||||     
T  20444 caccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgactatacaaagcttcgaacaatgtcatacctatactcgaatggtaactg 20543  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || || || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  20544 ttattgtatgtgaactctatcagtggtaggtgactatcccaag 20586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 43627 - 43969
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || |||| |||||| || |||| ||||||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  43627 ggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 43726  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| || || ||||| |  ||||| | ||| | ||| ||    
T  43727 gcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttcccaa 43826  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||||| ||| |||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  43827 caccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 43926  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || || || | |||||||||||   | || |||||||||||||    
T  43927 ttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaag 43969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 44639 - 44981
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || |||| |||||| || |||| ||||||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  44639 ggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 44738  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| |||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| || || ||||| |  ||||| | ||| | ||| ||    
T  44739 gcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttcccaa 44838  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||||| ||| |||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  44839 caccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 44938  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || || || | |||||||||||   | || |||||||||||||    
T  44939 ttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaag 44981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 42905 - 43247
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||| ||||| || || || || ||||| ||  | || || |    
T  42905 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctcc 43004  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||  ||||| |  ||||| |  || ||||| ||    
T  43005 gcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaa 43104  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||||| |||||||| || |   |||| || || ||| ||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  43105 caccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctacacctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 43204  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  43205 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 43247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 414 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 5537 - 5294
Alignment:
Q  414 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtccta 513  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |||||  |||| |  ||||| | ||| ||||| |    
T  5537 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctcatgaaccaaatccggtccca 5438  T
Q  514 agaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 613  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||  ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5437 acaccacactctctcctgactcaaaccatcagaaaggagtcctacacctccgaccatccaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 5338  T
Q  614 attgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
     ||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  5337 gttgttgtatgtgaactctatcattggtaggtgactatcccaag 5294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 248735 - 249077
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||| ||  | || || |    
T  248735 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctcc 248834  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||  ||||| |  ||||| |  |  ||||| ||    
T  248835 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagttcggtcccaa 248934  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||||| |||||||| || ||  |||| || || |||  |||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  248935 caccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 249034  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    || || || |||||||||||||  || || |||||||||||||    
T  249035 ttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaag 249077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 331 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 3803
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   | | ||||||||||||||||| || ||  | || ||||||| ||  || || | |||||||||||||||    
T  4112 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 4013  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacct 530  Q
    ||| |||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |  || ||||  || |||| ||| |   | || || ||     
T  4012 cttatgtctactttgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccggtcttaacaaagcactctctccg 3913  T
Q  531 gattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaact 630  Q
    || ||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||| | |||| ||||| || || ||||    
T  3912 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggagccatgccgatactagaataaaaactgttgttgtaagtaaact 3813  T
Q  631 ctatcaatgg 640  Q
    | ||||||||    
T  3812 caatcaatgg 3803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 39071 - 38926
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| || || || || || |||||||  || || |    
T  39071 ggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttc 38972  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  38971 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttcatctt 38926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 331 - 463
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||  || || | |||||||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 463  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 331 - 463
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || |||||||||||||| || ||  ||||  |||||| ||  || || | |||||||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 463  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 608
Target Start/End: Original strand, 10781 - 11071
Alignment:
Q  318 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgct 417  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| || |||  | | ||||||||||||||||| || ||  | || |||||||  |  ||||| | ||    
T  10781 gtcaacttctaacacttgaaagcacgtccaacaccggttacaaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctct 10880  T
Q  418 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagac 517  Q
    ||||||| |||||||| || | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||  |  || ||||  |  |||||||| |     
T  10881 tatcatggtaactcttctgcctactatgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaacattttttgtagcctcttgcacaacctacggtcctaacaa 10980  T
Q  518 cactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatga 608  Q
    | | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||  |||||| |||| |||| | |||| ||| || ||||||||||||    
T  10981 cgcactttcacctgactcataccaacacaacagcgttctacacctcctaccatacaaagtctcaaacggtgtcatcccgatactagaatga 11071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16897 - 16752
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||||||||  || || |    
T  16897 ggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 16798  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 460  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16797 gcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatctt 16752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 331 - 463
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  331 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctacgcttatcatgataact 430  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || |||||||||||||| || ||  ||||  |||||| ||  || || | |||||||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  431 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 463  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 313 - 401
Target Start/End: Original strand, 1297 - 1385
Alignment:
Q  313 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactca 401  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1297 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 657
Target Start/End: Original strand, 10891 - 11233
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaagatatttcctac 414  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||| || ||| || || | ||||||||| || || || || ||||||||    || || |    
T  10891 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 10990  T
Q  415 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaa 514  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  10991 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 11090  T
Q  515 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 614  Q
     ||||| || || ||| | |||||||| || ||  |||| || || ||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| ||||| ||| |     
T  11091 caccacactctctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaaatg 11190  T
Q  615 ttgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    ||||| || |||||||||||||   | || |||||||||||||    
T  11191 ttgttgtatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaag 11233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 481
Target Start/End: Original strand, 18332 - 18397
Alignment:
Q  416 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 481  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18332 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 18397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 41 - 97
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9000 - 8944
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4323 - 4235
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttggaactcaag 403  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  4323 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 637
Target Start/End: Original strand, 14370 - 14581
Alignment:
Q  426 taactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactcttt 525  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| || |  |||||||  || || |  || |||||||| |     ||||    
T  14370 taactcttctgtctactctgagatgctttcattttctcttgattcatcttaacttttttcgtagtttcttgcacgacttccggtcctaacaaagaacttt 14469  T
Q  526 cacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctctgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgt 625  Q
    | || |||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||| || ||    
T  14470 ctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggcgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagt 14569  T
Q  626 gaactctatcaa 637  Q
     ||||| |||||    
T  14570 aaactcaatcaa 14581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 585 - 655
Target Start/End: Original strand, 33952 - 34022
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatccca 655  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  33952 ggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtacgtaaactctatcaacggtaggtgactatccca 34022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 637
Target Start/End: Original strand, 2828 - 3000
Alignment:
Q  465 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctct 564  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |   | ||||| || |||||||||||||||||| | ||||| || |||     
T  2828 tgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcc 2927  T
Q  565 gaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaa 637  Q
     |||||| ||||||||| || | |||||||  ||| |||||||| |||| ||||| || || ||||| |||||    
T  2928 taccatacaaagcctcaaaaagagccattctgatagtagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaa 3000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 306
Target Start/End: Original strand, 1 - 37
Alignment:
Q  270 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 304
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10256
Alignment:
Q  250 catgatacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 304  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10202 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattagagcttactccaa 10256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 195
Target Start/End: Original strand, 10127 - 10158
Alignment:
Q  164 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 5210 - 5140
Alignment:
Q  587 tgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  5210 tgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 5140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 657
Target Start/End: Original strand, 136302 - 136374
Alignment:
Q  585 ggtgccattccaatactagaatgataactattgttatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaag 657  Q
    |||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  136302 ggtgccataccaatactcgaattgtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaag 136374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13437 - 13380
Alignment:
Q  315 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 372  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  13437 ggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 92267 - 92194
Alignment:
Q  113 gtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttgaaac 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  92267 gtctcacgattaagttatacttaatgttccatttaaaataactagatattctagagactttattactttaaaac 92194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5930 - 5878
Alignment:
Q  254 atacaaagctaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 306  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5930 atacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattatgacttactccaaca 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University