View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13551_high_5 (Length: 226)

Name: NF13551_high_5
Description: NF13551
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13551_high_5
NF13551_high_5
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (18-226)||(6750-6957)
scaffold0390 (18-226)||(13766-13973)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (18-226)||(2137-2344)
scaffold0234 (18-226)||(11028-11235)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (18-226)||(18472-18679)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (18-226)||(21940849-21941056)
chr8 (18-226)||(22171671-22171878)
chr8 (18-226)||(6094307-6094514)
chr8 (18-226)||(24642833-24643039)
chr8 (18-186)||(15326422-15326589)
chr8 (18-186)||(15506791-15506958)
chr8 (18-226)||(14983739-14983943)
chr8 (37-174)||(24797224-24797359)
chr8 (19-226)||(21969337-21969539)
chr8 (98-226)||(38232272-38232400)
chr8 (19-226)||(12562127-12562329)
chr8 (19-174)||(25611250-25611401)
chr8 (19-226)||(22130705-22130907)
chr8 (19-226)||(27007613-27007815)
chr8 (19-226)||(27014756-27014958)
chr8 (19-226)||(27880583-27880785)
chr8 (19-226)||(28020764-28020966)
chr8 (19-226)||(8371349-8371551)
chr8 (19-226)||(21916680-21916882)
chr8 (19-215)||(8781971-8782162)
chr8 (19-226)||(18835354-18835556)
chr8 (19-162)||(22659590-22659729)
chr8 (63-162)||(26240551-26240646)
chr8 (63-226)||(45534413-45534571)
chr8 (87-207)||(2375214-2375332)
chr8 (18-63)||(28548393-28548438)
chr8 (103-199)||(32872741-32872837)
chr8 (95-162)||(6430953-6431020)
chr8 (133-226)||(29645538-29645631)
chr8 (156-211)||(24535514-24535569)
chr8 (96-162)||(2963105-2963171)
chr8 (131-183)||(10920427-10920479)
chr8 (97-156)||(34659059-34659118)
chr8 (123-162)||(36970332-36970371)
chr8 (26-72)||(29645674-29645720)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (18-226)||(15152627-15152834)
chr7 (18-226)||(29327968-29328175)
chr7 (18-226)||(11542796-11543003)
chr7 (18-226)||(11535878-11536085)
chr7 (21-226)||(12751010-12751214)
chr7 (18-226)||(12738720-12738927)
chr7 (18-226)||(18561191-18561389)
chr7 (18-208)||(13392352-13392541)
chr7 (19-226)||(18257661-18257865)
chr7 (19-226)||(8465003-8465205)
chr7 (19-226)||(2204556-2204758)
chr7 (19-226)||(18400108-18400310)
chr7 (19-226)||(18407092-18407294)
chr7 (19-226)||(48808592-48808794)
chr7 (19-226)||(19230892-19231094)
chr7 (63-226)||(30254142-30254300)
chr7 (98-211)||(10235361-10235474)
chr7 (19-226)||(18139434-18139636)
chr7 (18-163)||(2365169-2365311)
chr7 (107-225)||(7662569-7662686)
chr7 (63-226)||(15729755-15729913)
chr7 (19-162)||(41681064-41681203)
chr7 (95-226)||(10669070-10669200)
chr7 (19-155)||(14591924-14592056)
chr7 (19-155)||(16011515-16011647)
chr7 (121-226)||(47833875-47833980)
chr7 (19-226)||(24443423-24443625)
chr7 (21-148)||(31190537-31190660)
chr7 (19-155)||(19388626-19388762)
chr7 (22-155)||(22969024-22969153)
chr7 (19-151)||(25845572-25845700)
chr7 (19-151)||(25845991-25846119)
chr7 (19-162)||(19393520-19393659)
chr7 (130-226)||(19859126-19859221)
chr7 (19-162)||(47166955-47167094)
chr7 (97-214)||(3132870-3132986)
chr7 (152-211)||(7396391-7396450)
chr7 (96-155)||(34128647-34128706)
chr7 (96-162)||(28130628-28130694)
chr7 (189-226)||(15148326-15148363)
chr7 (123-165)||(7396469-7396511)
chr7 (141-191)||(29983184-29983234)
chr7 (18-71)||(22948521-22948574)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (18-226)||(17684285-17684492)
chr6 (18-226)||(27381068-27381275)
chr6 (18-226)||(27471451-27471658)
chr6 (18-226)||(17691256-17691463)
chr6 (18-226)||(29309074-29309281)
chr6 (18-226)||(29316034-29316241)
chr6 (18-226)||(188793-189000)
chr6 (18-226)||(11651907-11652114)
chr6 (18-190)||(16394261-16394432)
chr6 (18-162)||(27296877-27297020)
chr6 (20-164)||(25537009-25537152)
chr6 (18-145)||(16559288-16559414)
chr6 (140-226)||(16566257-16566343)
chr6 (18-214)||(13359089-13359280)
chr6 (107-212)||(28172754-28172859)
chr6 (19-226)||(16789075-16789277)
chr6 (63-226)||(18019981-18020139)
chr6 (19-226)||(22859984-22860186)
chr6 (19-223)||(27508443-27508642)
chr6 (19-223)||(27528029-27528228)
chr6 (98-226)||(2669477-2669605)
chr6 (100-226)||(17850392-17850518)
chr6 (101-226)||(27925938-27926062)
chr6 (63-226)||(1586248-1586406)
chr6 (95-226)||(14074484-14074614)
chr6 (19-160)||(20736425-20736562)
chr6 (19-162)||(10359147-10359285)
chr6 (106-223)||(20553492-20553607)
chr6 (19-162)||(21994655-21994794)
chr6 (96-162)||(8612982-8613048)
chr6 (95-216)||(19347092-19347212)
chr6 (96-155)||(5758650-5758709)
chr6 (135-226)||(13995151-13995241)
chr6 (18-177)||(8510155-8510311)
chr6 (50-162)||(22560311-22560419)
chr6 (19-226)||(19218433-19218630)
chr6 (196-226)||(25537152-25537182)
chr6 (18-63)||(28172899-28172945)
chr6 (25-70)||(17850321-17850366)
chr6 (19-153)||(4073652-4073781)
chr6 (19-162)||(17120601-17120740)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (18-226)||(24695282-24695489)
chr5 (18-226)||(19714314-19714521)
chr5 (18-226)||(18569677-18569886)
chr5 (28-226)||(19707044-19707241)
chr5 (44-226)||(39538772-39538953)
chr5 (18-226)||(18806852-18807057)
chr5 (18-214)||(17285566-17285759)
chr5 (18-189)||(17298717-17298885)
chr5 (87-226)||(22546902-22547039)
chr5 (19-226)||(20941031-20941233)
chr5 (19-226)||(31903-32105)
chr5 (19-226)||(23545926-23546128)
chr5 (63-226)||(25805525-25805683)
chr5 (19-226)||(12789759-12789961)
chr5 (19-162)||(22941317-22941456)
chr5 (18-148)||(18806492-18806619)
chr5 (18-148)||(18806672-18806799)
chr5 (19-226)||(20100339-20100541)
chr5 (63-226)||(24933446-24933604)
chr5 (18-172)||(18829379-18829530)
chr5 (63-226)||(31096820-31096978)
chr5 (95-226)||(12765162-12765292)
chr5 (18-97)||(27347351-27347428)
chr5 (19-226)||(5097655-5097857)
chr5 (96-155)||(9811906-9811965)
chr5 (96-155)||(12704047-12704106)
chr5 (96-162)||(7865603-7865669)
chr5 (150-208)||(27347425-27347483)
chr5 (19-162)||(26129789-26129928)
chr5 (96-162)||(26245169-26245235)
chr5 (98-174)||(33477193-33477269)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (18-226)||(18262396-18262603)
chr4 (18-226)||(18269257-18269464)
chr4 (18-226)||(55612867-55613074)
chr4 (18-226)||(26963824-26964031)
chr4 (18-226)||(26970647-26970854)
chr4 (18-226)||(868781-868988)
chr4 (18-226)||(5707504-5707711)
chr4 (18-226)||(5714132-5714339)
chr4 (18-226)||(10621149-10621356)
chr4 (18-226)||(10628228-10628435)
chr4 (18-226)||(19926576-19926783)
chr4 (18-226)||(8858351-8858558)
chr4 (18-226)||(28392950-28393157)
chr4 (18-226)||(8845387-8845594)
chr4 (18-226)||(4426432-4426627)
chr4 (18-226)||(35223744-35223951)
chr4 (18-226)||(5667943-5668148)
chr4 (18-155)||(10677398-10677534)
chr4 (18-155)||(10891038-10891174)
chr4 (20-226)||(20311476-20311679)
chr4 (23-174)||(21453961-21454110)
chr4 (98-226)||(56516240-56516368)
chr4 (19-226)||(15461501-15461703)
chr4 (19-226)||(2677017-2677219)
chr4 (19-226)||(15815025-15815227)
chr4 (19-226)||(17300055-17300257)
chr4 (19-226)||(18111139-18111341)
chr4 (19-226)||(34975555-34975757)
chr4 (19-226)||(3369119-3369321)
chr4 (19-226)||(5870422-5870624)
chr4 (148-226)||(24700213-24700291)
chr4 (19-226)||(26531617-26531819)
chr4 (99-209)||(32646697-32646807)
chr4 (19-162)||(19365586-19365726)
chr4 (63-226)||(4676123-4676281)
chr4 (63-226)||(18163166-18163324)
chr4 (63-226)||(20243941-20244099)
chr4 (24-161)||(32636552-32636685)
chr4 (19-162)||(1941791-1941930)
chr4 (19-162)||(19362477-19362616)
chr4 (19-155)||(9487625-9487757)
chr4 (19-143)||(30040585-30040705)
chr4 (19-162)||(4546147-4546286)
chr4 (19-174)||(33888594-33888743)
chr4 (101-183)||(34777893-34777975)
chr4 (19-155)||(5616469-5616601)
chr4 (46-162)||(5528602-5528714)
chr4 (98-155)||(9538033-9538090)
chr4 (19-140)||(11421096-11421213)
chr4 (186-226)||(10677538-10677578)
chr4 (186-226)||(10891178-10891218)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (18-226)||(6110248-6110455)
chr3 (18-226)||(15600700-15600907)
chr3 (18-226)||(15607245-15607452)
chr3 (18-226)||(16482299-16482506)
chr3 (18-224)||(8490681-8490886)
chr3 (18-226)||(10572408-10572615)
chr3 (18-226)||(10579171-10579378)
chr3 (18-226)||(18520159-18520366)
chr3 (18-226)||(18522847-18523054)
chr3 (18-226)||(15357402-15357609)
chr3 (18-226)||(17780934-17781141)
chr3 (18-226)||(13211486-13211693)
chr3 (18-226)||(13248791-13248998)
chr3 (18-226)||(15342035-15342242)
chr3 (18-226)||(32056715-32056923)
chr3 (18-226)||(17200000-17200207)
chr3 (18-226)||(13516995-13517198)
chr3 (20-226)||(1647339-1647544)
chr3 (18-226)||(17136543-17136744)
chr3 (18-226)||(29925155-29925362)
chr3 (18-226)||(29974308-29974515)
chr3 (18-213)||(16200627-16200821)
chr3 (19-226)||(15846632-15846834)
chr3 (19-226)||(21034242-21034444)
chr3 (63-226)||(14890395-14890553)
chr3 (19-226)||(20147650-20147852)
chr3 (18-226)||(24253208-24253411)
chr3 (19-174)||(21398847-21398998)
chr3 (19-226)||(12299915-12300116)
chr3 (63-226)||(55427025-55427183)
chr3 (20-226)||(14147025-14147226)
chr3 (19-162)||(25978824-25978963)
chr3 (95-162)||(11787654-11787721)
chr3 (119-212)||(8251933-8252026)
chr3 (55-189)||(32280313-32280444)
chr3 (96-162)||(15317342-15317408)
chr3 (171-213)||(16200321-16200363)
chr3 (19-155)||(15526827-15526959)
chr3 (61-191)||(28953965-28954093)
chr3 (145-226)||(9504467-9504548)
chr3 (196-226)||(19089738-19089768)
chr3 (19-71)||(30464151-30464203)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (18-226)||(18252214-18252421)
chr1 (18-226)||(27131225-27131432)
chr1 (18-226)||(18532330-18532537)
chr1 (18-226)||(27310393-27310600)
chr1 (18-226)||(16358851-16359058)
chr1 (50-226)||(21171081-21171256)
chr1 (18-226)||(36816450-36816656)
chr1 (18-226)||(3855735-3855942)
chr1 (18-226)||(27277374-27277580)
chr1 (18-204)||(22641690-22641871)
chr1 (90-214)||(22657108-22657232)
chr1 (98-224)||(12014179-12014305)
chr1 (22-214)||(23507096-23507285)
chr1 (19-224)||(28134819-28135019)
chr1 (19-226)||(19706535-19706737)
chr1 (19-226)||(43802461-43802663)
chr1 (19-226)||(9456120-9456322)
chr1 (19-226)||(20779741-20779943)
chr1 (19-226)||(22670353-22670555)
chr1 (19-226)||(42817085-42817287)
chr1 (121-222)||(9917837-9917937)
chr1 (19-226)||(20391335-20391537)
chr1 (19-174)||(22612547-22612698)
chr1 (125-214)||(12006461-12006550)
chr1 (19-162)||(634001-634140)
chr1 (18-115)||(9916593-9916688)
chr1 (19-155)||(8727741-8727873)
chr1 (121-226)||(47667668-47667772)
chr1 (19-162)||(29096789-29096928)
chr1 (98-162)||(35930649-35930713)
chr1 (22-155)||(21881475-21881604)
chr1 (102-155)||(51997353-51997406)
chr1 (96-222)||(26923553-26923678)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (18-226)||(7291-7498)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (18-226)||(25806-26013)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (18-226)||(21330064-21330271)
chr2 (18-226)||(18796690-18796897)
chr2 (18-226)||(18619988-18620194)
chr2 (17-225)||(6991929-6992136)
chr2 (18-194)||(20978091-20978264)
chr2 (23-226)||(36270350-36270549)
chr2 (24-226)||(22183308-22183506)
chr2 (22-214)||(18822279-18822468)
chr2 (100-226)||(18851956-18852082)
chr2 (19-226)||(24250128-24250330)
chr2 (19-226)||(30174381-30174583)
chr2 (98-212)||(19279486-19279600)
chr2 (19-162)||(15342098-15342237)
chr2 (46-226)||(24229338-24229513)
chr2 (121-224)||(36801899-36802003)
chr2 (19-155)||(29800545-29800677)
chr2 (19-155)||(19616509-19616641)
chr2 (20-155)||(40301034-40301164)
chr2 (19-155)||(21626824-21626955)
chr2 (18-86)||(17241034-17241100)
chr2 (121-226)||(28741220-28741324)
chr2 (96-159)||(28718943-28719006)
chr2 (19-69)||(36799775-36799826)
chr2 (121-162)||(24763751-24763792)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (18-226)||(1177-1384)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (18-179)||(230207-230367)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (58-226)||(5713-5881)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (19-226)||(8309-8511)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (19-226)||(187-389)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (19-226)||(3771-3973)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (19-226)||(119734-119936)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (19-226)||(130320-130522)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (19-162)||(26609-26748)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (19-226)||(40084-40286)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (19-162)||(13045-13184)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (107-222)||(90019-90135)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (19-162)||(67470-67609)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (23-153)||(8807-8933)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (19-155)||(83111-83243)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (96-155)||(11699-11758)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (100-216)||(45931-46051)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (96-162)||(53832-53898)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (22-113)||(102-189)


Alignment Details
Target: scaffold0390 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 6750 - 6957
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6750 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 6848  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6849 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 6948  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  6949 acataatag 6957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 13766 - 13973
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13766 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggc 13864  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13865 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 13964  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  13965 acataatag 13973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 2137 - 2344
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 2235  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2236 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 2335  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  2336 acataatag 2344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 11028 - 11235
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11028 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 11126  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11127 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 11226  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  11227 acataatag 11235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18679 - 18472
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18679 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 18581  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18580 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 18481  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  18480 acataatag 18472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21941056 - 21940849
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941056 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 21940958  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21940957 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 21940858  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  21940857 acataatag 21940849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22171878 - 22171671
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171878 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 22171780  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22171779 ggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtctacct 22171680  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  22171679 acataatag 22171671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6094514 - 6094307
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6094514 acatagtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggc 6094416  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  6094415 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcactctaccc 6094316  T
Q  218 acataatag 226  Q
    | |||||||    
T  6094315 atataatag 6094307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24643039 - 24642833
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  24643039 acatagtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatgga 24642942  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  24642941 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 24642842  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  24642841 acataatag 24642833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15326589 - 15326422
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326589 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 15326491  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326490 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15506958 - 15506791
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506958 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 15506860  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506859 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 14983739 - 14983943
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14983739 acatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataa-cttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatgg 14983834  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacc 216  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  14983835 cgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatgatccgtgagatatgatcattagtctacc 14983933  T
Q  217 tacataatag 226  Q
     |||||||||    
T  14983934 cacataatag 14983943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797359
Alignment:
Q  37 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaat 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaat 24797321  T
Q  137 attactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 174  Q
     |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  24797322 tttactcataatatttatacctacgtgaagacatgata 24797359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21969539 - 21969337
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  21969539 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 21969444  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| ||||||  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  21969443 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacata 21969345  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  21969344 cataatag 21969337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Original strand, 38232272 - 38232400
Alignment:
Q  98 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaag 197  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||    
T  38232272 ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaatattacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgag 38232371  T
Q  198 atgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  38232372 atgtgattatcagtctacccacaaaatag 38232400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12562329 - 12562127
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  12562329 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 12562234  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  12562233 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 12562135  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  12562134 cataatag 12562127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25611401 - 25611250
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  25611401 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacagttt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 25611306  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 174  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25611305 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 25611250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 22130705 - 22130907
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  22130705 catagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 22130800  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  22130801 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 22130899  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  22130900 cataatag 22130907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 27007613 - 27007815
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  27007613 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 27007708  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  27007709 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 27007807  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  27007808 cataatag 27007815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 27014756 - 27014958
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  27014756 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 27014851  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  27014852 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 27014950  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  27014951 cataatag 27014958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 27880583 - 27880785
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  27880583 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 27880678  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  27880679 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 27880777  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  27880778 cataatag 27880785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 28020764 - 28020966
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  28020764 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 28020859  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  28020860 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 28020958  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  28020959 cataatag 28020966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 8371349 - 8371551
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  8371349 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 8371444  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  8371445 ggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 8371543  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  8371544 cataatag 8371551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21916882 - 21916680
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  21916882 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--acaatgtagtattctcacagtg 21916787  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  21916786 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 21916688  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  21916687 cataatag 21916680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 8781971 - 8782162
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| || |    
T  8781971 catagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacag--actatgtagtattctcacggtg 8782066  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctac 215  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   |||||  |||||  ||| |||  ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  8782067 gatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttatgcttatgtatagactaaatatctc-atatccatgacctataagacgtggtcatcagtctac 8782162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835354
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatat-cttatgacatttttaa-aacat--actatgtagtattctcacggtg 18835461  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||||| | |||||||||| ||    
T  18835460 ggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacata 18835362  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  18835361 cataatag 18835354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 22659590 - 22659729
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  22659590 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 22659685  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22659686 ggtcaatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgt 22659729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26240646 - 26240551
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26240646 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 26240551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 45534413 - 45534571
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45534413 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 45534508  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  45534509 atagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 45534571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2375332 - 2375214
Alignment:
Q  87 cataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 186  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||    
T  2375332 cataactttt--tatgtagaattataatggagggtcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatcca 2375235  T
Q  187 tgatctgtaagatgtgatcat 207  Q
    ||||  ||  |||||||||||    
T  2375234 tgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 28548438 - 28548393
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548438 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 199
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872837
Alignment:
Q  103 tagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagat 199  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagat 32872837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6431020 - 6430953
Alignment:
Q  95 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6431020 ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645538
Alignment:
Q  133 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  | ||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaatag 29645538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24535569 - 24535514
Alignment:
Q  156 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagt 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24535569 tctatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagt 24535514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Original strand, 2963105 - 2963171
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    |||||||||||||||||  ||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2963105 tactatgtagtattctcgcggtaggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  131 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34659118 - 34659059
Alignment:
Q  97 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 156  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34659118 actatttagtatttgcatggtggataaatccaatataaatattagtcctaatatatatat 34659059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970332
Alignment:
Q  123 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 36970332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 29645720 - 29645674
Alignment:
Q  26 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatt 72  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  29645720 gtttcaggtcgaatggtgaagtacatcactatcactatgagaatatt 29645674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15152834 - 15152627
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152834 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 15152736  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15152735 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 15152636  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  15152635 acataatag 15152627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29328175 - 29327968
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328175 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 29328077  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29328076 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 29327977  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  29327976 acataatag 29327968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 11542796 - 11543003
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11542796 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggc 11542894  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11542895 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 11542994  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  11542995 acataatag 11543003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 11535878 - 11536085
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535878 acatagtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 11535976  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11535977 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 11536076  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  11536077 acataatag 11536085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12751214 - 12751010
Alignment:
Q  21 tagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751214 tagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 12751116  T
Q  121 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctaca 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  12751115 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccaca 12751016  T
Q  221 taatag 226  Q
    ||||||    
T  12751015 taatag 12751010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12738927 - 12738720
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738927 acatagtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 12738829  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  12738828 ggatcaatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcttcagtctaccc 12738729  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  12738728 acataatag 12738720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18561389 - 18561191
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18561389 acatagtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat----------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcataga 18561300  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18561299 gggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 18561200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13392541 - 13392352
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||     
T  13392541 acatagtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggt 13392443  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatc 208  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  13392442 gggtcaatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatc 13392352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 18257661 - 18257865
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||| | || |    
T  18257661 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatat-cttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacggtg 18257757  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |    
T  18257758 ggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcaatctatcca 18257857  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  18257858 cataatag 18257865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8465205 - 8465003
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  8465205 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 8465110  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  8465109 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 8465011  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  8465010 cataatag 8465003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2204758 - 2204556
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  2204758 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 2204663  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  2204662 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 2204564  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  2204563 cataatag 2204556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18400310 - 18400108
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  18400310 catagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 18400215  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  18400214 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 18400116  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  18400115 cataatag 18400108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18407294 - 18407092
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  18407294 catagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 18407199  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  18407198 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 18407100  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  18407099 cataatag 18407092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 48808592 - 48808794
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  48808592 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 48808687  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  48808688 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 48808786  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  48808787 cataatag 48808794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19231094 - 19230892
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| || |    
T  19231094 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataacttat--tatgtagtattctcacggtg 19230999  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  19230998 ggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 19230900  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  19230899 cataatag 19230892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30254300 - 30254142
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254300 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgt 30254205  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  30254204 atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 30254142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10235474 - 10235361
Alignment:
Q  98 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaag 197  Q
    |||||||  |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10235474 ctatgtataattctcatggtgagtcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgag 10235375  T
Q  198 atgtgatcatcagt 211  Q
    ||||||||||||||    
T  10235374 atgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 18139434 - 18139636
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  18139434 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 18139529  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  18139530 ggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 18139628  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  18139629 cataatag 18139636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2365311 - 2365169
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||    
T  2365311 acatagtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataa-cttatgaca-tttacataacttc--ctatgtagcattttcatgg 2365216  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 163  Q
     || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2365215 tgggtcaatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662686
Alignment:
Q  107 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatca 206  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  207 tcagtctacctacataata 225  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataata 7662686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15729913 - 15729755
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15729913 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 15729818  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  15729817 atagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 15729755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 41681064 - 41681203
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  41681064 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 41681159  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681160 ggtcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Original strand, 10669070 - 10669200
Alignment:
Q  95 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 194  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  10669070 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 10669168  T
Q  195 aagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
     ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  10669169 gagatgcggtcatcagtctacatacataatag 10669200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||| || |    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatat-cttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtg 14591961  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591960 ggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||    ||| | |||||||||||||| |    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtg 16011552  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011551 ggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833980
Alignment:
Q  121 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctaca 220  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  221 taatag 226  Q
    ||||||    
T  47833975 taatag 47833980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 24443423 - 24443625
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |    
T  24443423 cataatggtttcaagtctaagagtgttatacaccattatcactgtgagaataa-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcacggtg 24443518  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | | |||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||| || | ||| ||||| |  | ||||||| |||||||||||| ||    
T  24443519 ggttaatctagtataaatattactcctaatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacata 24443617  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  24443618 cataatag 24443625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Original strand, 31190537 - 31190660
Alignment:
Q  21 tagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 120  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||     
T  31190537 tagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatat-cttaagaca-tattcataacat--acaatgtagtattctcatggtggg 31190632  T
Q  121 tcaatccaatataaatattactcctaat 148  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190633 tcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19388762 - 19388626
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataactt--ttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |   |||||||||||||||||     
T  19388762 cataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatat-cttatgacacttt-cataacatactatatatgtagtattctcatga 19388665  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
      |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19388664 ttgggcaatccagtataaatattactcctaatatttata 19388626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  22 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 121  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggt 22969058  T
Q  122 caatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969057 caatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Original strand, 25845572 - 25845700
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||| ||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  25845572 cataatggtttcaggtctaagagtggtatacatcattattattttgagaatat-cttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtg 25845667  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatt 151  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25845668 tgtcaatccagtataaatattactcctaatatt 25845700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Original strand, 25845991 - 25846119
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||| ||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  25845991 cataatggtttcaggtctaagagtggtatacatcattattattttgagaatat-cttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtg 25846086  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatt 151  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25846087 tgtcaatccagtataaatattactcctaatatt 25846119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 19393520 - 19393659
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||      
T  19393520 catactggattcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtc 19393615  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19393616 ggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 19393659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859126
Alignment:
Q  130 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 19859126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 47166955 - 47167094
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  47166955 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 47167050  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | || ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47167051 ggtctatctagtataaatattactcataatatttatacctatgt 47167094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132870
Alignment:
Q  97 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaa 196  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||| | |    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  197 gatgtgatcatcagtcta 214  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtcta 3132870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396391
Alignment:
Q  152 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagt 211  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagt 7396391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34128706 - 34128647
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    ||||||||||||||||||    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128706 tactatgtagtattctcacaatggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28130694 - 28130628
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28130694 tactatgtaatattctcacagtgggtcaatccagtataaatattactcctgatatttatacctatgt 28130628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148326
Alignment:
Q  189 atctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 15148326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7396511 - 7396469
Alignment:
Q  123 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396511 aatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983184
Alignment:
Q  141 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 191  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatc 29983184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Original strand, 22948521 - 22948574
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 71  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948521 acatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 17684285 - 17684492
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684285 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 17684383  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17684384 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 17684483  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  17684484 acataatag 17684492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 27381068 - 27381275
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381068 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 27381166  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27381167 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 27381266  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  27381267 acataatag 27381275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 27471451 - 27471658
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471451 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 27471549  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27471550 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 27471649  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  27471650 acataatag 27471658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 17691256 - 17691463
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691256 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 17691354  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17691355 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacct 17691454  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  17691455 acataatag 17691463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29309281 - 29309074
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309281 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 29309183  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29309182 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacct 29309083  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  29309082 acataatag 29309074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29316241 - 29316034
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316241 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 29316143  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316142 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacct 29316043  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  29316042 acataatag 29316034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 188793 - 189000
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188793 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 188891  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  188892 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccc 188991  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  188992 acataatag 189000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11652114 - 11651907
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652114 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 11652016  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  11652015 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 11651916  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  11651915 acataatag 11651907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 16394261 - 16394432
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16394261 acatagtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatat-cttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggt 16394359  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 190  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16394360 gggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgat 16394432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27297020 - 27296877
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297020 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 27296922  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296921 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Original strand, 25537009 - 25537152
Alignment:
Q  20 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537009 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 25537107  T
Q  120 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 164  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537108 atcaatccaatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 16559288 - 16559414
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16559288 acatagcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggt 16559386  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559387 ggatcaatccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 226
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566343
Alignment:
Q  140 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 16566343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 13359089 - 13359280
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||| |  |||||||||||  ||||    
T  13359089 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataat-ttatgaca-tttacataattttca--atgtagtattc--atgg 13359182  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtcta 214  Q
     |   |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13359183 tgagacaattcaatataaatactacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcgagatgtgatcatcagtcta 13359280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172754
Alignment:
Q  107 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatca 206  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  207 tcagtc 212  Q
    ||||||    
T  28172759 tcagtc 28172754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16789277 - 16789075
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  16789277 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 16789182  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  16789181 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 16789083  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  16789082 cataatag 16789075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 18019981 - 18020139
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18019981 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 18020076  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  18020077 atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 18020139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 22859984 - 22860186
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  22859984 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 22860079  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  22860080 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 22860178  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  22860179 cataatag 22860186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Original strand, 27508443 - 27508642
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  27508443 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtg 27508538  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  27508539 ggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 27508637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Original strand, 27528029 - 27528228
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  27528029 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtg 27528124  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  27528125 ggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 27528223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2669605 - 2669477
Alignment:
Q  98 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaag 197  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   | ||    
T  2669605 ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgag 2669506  T
Q  198 atgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  2669505 atgtgatcatcaatctacccatataatag 2669477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 226
Target Start/End: Original strand, 17850392 - 17850518
Alignment:
Q  100 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagat 199  Q
    |||||||||||| | || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| ||||||    
T  17850392 atgtagtattcttaaggagggtcaatccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagat 17850491  T
Q  200 gtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
     |||||||||||||||| | |||||||    
T  17850492 atgatcatcagtctacccatataatag 17850518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925938
Alignment:
Q  101 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatg 200  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatg 27925964  T
Q  201 tgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
     |||||||||| || | |||||||||    
T  27925963 agatcatcagtttatccacataatag 27925938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 1586248 - 1586406
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1586248 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 1586343  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  1586344 atagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 1586406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14074614 - 14074484
Alignment:
Q  95 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 194  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  14074614 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccattataaatattactcccaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 14074516  T
Q  195 aagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
     ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  14074515 gagatgcggtcatcagtctacatacataatag 14074484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 20736425 - 20736562
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |  | ||||||||||||||| |  |    
T  20736425 catagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatat-cttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagtattctcacgatg 20736520  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20736521 gatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 10359147 - 10359285
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| || |    
T  10359147 catagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatat-cttatgacactt--cataacat--actatgtagtattttcacggtg 10359241  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | || ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10359242 ggtcgatccagtataaatattacctataatatttatatctatgt 10359285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553607
Alignment:
Q  106 tattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatc 205  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  206 atcagtctacctacataa 223  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataa 20553607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtg 21994699  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994698 ggtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8613048 - 8612982
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8613048 tactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 8612982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  95 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| | ||||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatatta-ttctaatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  195 aagatgtgatcatcagtctacc 216  Q
     |||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Original strand, 5758650 - 5758709
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758650 tactatgtagtattctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995241
Alignment:
Q  135 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 13995241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8510311 - 8510155
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| ||  || |||||||||  |||||| ||  |||||||||||| |||| |     
T  8510311 acatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaa-ctaatgacactta-cataacatt--ctatgtagtattatcattgt 8510216  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataact 177  Q
     | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  8510215 aggtcaatcaaatataaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataact 8510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560419
Alignment:
Q  50 accactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaata 149  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||| |  | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaata 22560406  T
Q  150 tttatatctatgt 162  Q
    |||| | ||||||    
T  22560407 tttaaacctatgt 22560419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19218630 - 19218433
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| | ||||||||| ||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  19218630 catagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatat-cttatgaaa-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtg 19218535  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | |     |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  | || |||| |||||||||||| ||    
T  19218534 ggt-----caatataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atattcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacata 19218441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 226
Target Start/End: Original strand, 25537152 - 25537182
Alignment:
Q  196 agatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 agatgtgatcatcagtctacctacataatag 25537182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 28172945 - 28172899
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 63  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172945 acatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850366
Alignment:
Q  25 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 70  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaata 17850366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4073781 - 4073652
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||| | |  ||||||||||||||| ||      
T  4073781 catagtggttttaggtctaagattggtatacatcgttatcattatgagaatat-cttatgaa--ttttcataacatat--tatgtagtattctcacggta 4073687  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatattta 153  Q
    | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  4073686 ggtcaatcaaatataaatattacctctaatattta 4073652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 17120601 - 17120740
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||||||  | |    
T  17120601 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata-tcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtg 17120696  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17120697 ggtcaatccagtataaatactactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 24695282 - 24695489
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695282 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 24695380  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24695381 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 24695480  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  24695481 acataatag 24695489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 19714314 - 19714521
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714314 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 19714412  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  19714413 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 19714512  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  19714513 acataatag 19714521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 18569677 - 18569886
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569677 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 18569775  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctt--tatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctac 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18569776 gggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctac 18569875  T
Q  216 ctacataatag 226  Q
    | |||||||||    
T  18569876 caacataatag 18569886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 226
Target Start/End: Original strand, 19707044 - 19707241
Alignment:
Q  28 ttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707044 ttcaggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcc 19707142  T
Q  128 aatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19707143 aatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatag 19707241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538772
Alignment:
Q  44 gaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactc 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatatt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactc 39538855  T
Q  144 ctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  39538854 ctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatag 39538772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 18806852 - 18807057
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||  || ||||||  |||||||  ||||||||||    
T  18806852 acatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataa-cttatgacagtta-caaaacttt--ctatgtatcattctcatgg 18806947  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacc 216  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||    
T  18806948 tggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaaatgtgatcatcagtctacc 18807047  T
Q  217 tacataatag 226  Q
      ||||||||    
T  18807048 cgcataatag 18807057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 17285566 - 17285759
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  17285566 acatattgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataa-cttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattg 17285661  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtcta 214  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  17285662 tgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcagtcta 17285759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 17298717 - 17298885
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  17298717 acatattggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataa-cttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatgg 17298812  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 189  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17298813 tgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatga 17298885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 226
Target Start/End: Original strand, 22546902 - 22547039
Alignment:
Q  87 cataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 186  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22546902 cataactttt--tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatatgaaaacttgataactctttatcca 22546999  T
Q  187 tgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22547000 tgatttgtgagatgtgatcatcggtctatccacataatag 22547039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20941233 - 20941031
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  20941233 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 20941138  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  20941137 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 20941039  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  20941038 cataatag 20941031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32105 - 31903
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  32105 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 32010  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  32009 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 31911  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  31910 cataatag 31903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23546128 - 23545926
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  23546128 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 23546033  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  23546032 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 23545934  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  23545933 cataatag 23545926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 25805525 - 25805683
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805525 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 25805620  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  25805621 atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 25805683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 12789759 - 12789961
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  12789759 catagtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 12789854  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  12789855 ggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 12789953  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  12789954 cataatag 12789961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22941456 - 22941317
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  22941456 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 22941361  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941360 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 22941317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 18806492 - 18806619
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||||||||||    
T  18806492 acatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaata-acttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcattctcatgg 18806587  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaat 148  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806588 tggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 18806672 - 18806799
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||||||||||    
T  18806672 acatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaata-acttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcattctcatgg 18806767  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaat 148  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806768 tggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 20100339 - 20100541
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| |  |    
T  20100339 catagtggtttcatgtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaata-tcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttg 20100434  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  | |||||||||||||||||||| ||    
T  20100435 ggtcaagccagtataagtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacata 20100533  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  20100534 cataatag 20100541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 24933446 - 24933604
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24933446 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 24933541  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  24933542 atagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 24933604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 18829379 - 18829530
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||||  |||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  18829379 acatagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataa-cttatggaactta-cataacttt--ctatgtatcattctcatgg 18829474  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 172  Q
     || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829475 tgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31096978 - 31096820
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  31096978 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctataatttatacctatgt 31096883  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  31096882 atagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 31096820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Original strand, 12765162 - 12765292
Alignment:
Q  95 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 194  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  |    
T  12765162 ttactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccat 12765260  T
Q  195 aagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12765261 gagatgtggtcatcagtctacatacataatag 12765292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 97
Target Start/End: Original strand, 27347351 - 27347428
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataactttta 97  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaata-tcttatgacac-tttcataactttta 27347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5097857 - 5097655
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||  ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  5097857 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataa-cttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtg 5097762  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||||  |||||||||||| ||    
T  5097761 ggttaatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacata 5097663  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  5097662 cataatag 5097655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Original strand, 9811906 - 9811965
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9811906 tactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttata 9811965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Original strand, 12704047 - 12704106
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704047 tactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttata 12704106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Original strand, 7865603 - 7865669
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7865603 tactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 7865669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347483
Alignment:
Q  150 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatc 208  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatc 27347483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 26129789 - 26129928
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |  ||||||| ||||| ||| || |    
T  26129789 catagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatat-cttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129885 ggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26245235 - 26245169
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||| |||||||| |  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26245235 tactatgcagtattctgacagtggatcaatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26245169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 174
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477269
Alignment:
Q  98 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgata 33477269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18262603 - 18262396
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262603 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 18262505  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18262504 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 18262405  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  18262404 acataatag 18262396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18269464 - 18269257
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269464 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 18269366  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18269365 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 18269266  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  18269265 acataatag 18269257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 55613074 - 55612867
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613074 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 55612976  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55612975 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 55612876  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  55612875 acataatag 55612867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26964031 - 26963824
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964031 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 26963933  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26963932 ggatcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 26963833  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  26963832 acataatag 26963824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26970854 - 26970647
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970854 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 26970756  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26970755 ggatcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 26970656  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  26970655 acataatag 26970647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 868988 - 868781
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868988 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 868890  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  868889 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 868790  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  868789 acataatag 868781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5707711 - 5707504
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707711 acatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 5707613  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5707612 ggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 5707513  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  5707512 acataatag 5707504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5714339 - 5714132
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714339 acatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 5714241  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5714240 ggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 5714141  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  5714140 acataatag 5714132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 10621149 - 10621356
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621149 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 10621247  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10621248 ggatcaatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 10621347  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  10621348 acataatag 10621356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 10628228 - 10628435
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628228 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 10628326  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10628327 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 10628426  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  10628427 acataatag 10628435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 19926576 - 19926783
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926576 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 19926674  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19926675 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 19926774  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  19926775 acataatag 19926783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8858558 - 8858351
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858558 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 8858460  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  8858459 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctaccc 8858360  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  8858359 acataatag 8858351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 28392950 - 28393157
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392950 acatagtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 28393048  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  28393049 ggatcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccc 28393148  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  28393149 acataatag 28393157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8845594 - 8845387
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845594 acatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatata-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 8845496  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  8845495 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctaccc 8845396  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  8845395 acataatag 8845387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 4426432 - 4426627
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4426432 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaa-------------cttttcatagattttactatgtagtattctcatggc 4426518  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4426519 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 4426618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35223951 - 35223744
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  35223951 acatcgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggt 35223853  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||     
T  35223852 ggttcaatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatccgtctaccc 35223753  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  35223752 acataatag 35223744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 5667943 - 5668148
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5667943 acatagtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggt 5668041  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||| ||||| |     
T  5668042 gagtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatccgtgaga--tgatcatcggtctatcc 5668139  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  5668140 acataatag 5668148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 10677398 - 10677534
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  10677398 acatagtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagt 10677496  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677497 gggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 10891038 - 10891174
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  10891038 acatagtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagt 10891136  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891137 gggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20311679 - 20311476
Alignment:
Q  20 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| | ||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |     
T  20311679 atagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgt-atgatagtta-cataactgt--ctatgtagtattctcatgaca 20311584  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||| |    
T  20311583 ggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatgatatgtgatcatcaatctaccca 20311484  T
Q  219 cataatag 226  Q
    || |||||    
T  20311483 caaaatag 20311476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 174
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  23 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 122  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | ||| |||||||  || |||||||||||||||||| || ||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatat-cttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtc 21454058  T
Q  123 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 174  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454059 aattcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516240
Alignment:
Q  98 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaag 197  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  198 atgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatag 56516240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15461703 - 15461501
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  15461703 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 15461608  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  15461607 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 15461509  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  15461508 cataatag 15461501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2677219 - 2677017
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  2677219 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 2677124  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  2677123 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 2677025  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  2677024 cataatag 2677017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15815227 - 15815025
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  15815227 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 15815132  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  15815131 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 15815033  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  15815032 cataatag 15815025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 17300055 - 17300257
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  17300055 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 17300150  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  17300151 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 17300249  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  17300250 cataatag 17300257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 18111139 - 18111341
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  18111139 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 18111234  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  18111235 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 18111333  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  18111334 cataatag 18111341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34975757 - 34975555
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  34975757 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 34975662  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  34975661 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 34975563  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  34975562 cataatag 34975555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 3369119 - 3369321
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  3369119 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 3369214  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  3369215 ggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 3369313  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  3369314 cataatag 3369321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5870624 - 5870422
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | |    
T  5870624 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata-tcatatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtg 5870529  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  5870528 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 5870430  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  5870429 cataatag 5870422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700213
Alignment:
Q  148 tatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataatag 24700213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26531819 - 26531617
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  26531819 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 26531724  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  26531723 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 26531625  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  26531624 cataatag 26531617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Original strand, 32646697 - 32646807
Alignment:
Q  99 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaaga 198  Q
    ||||||| ||||| ||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| || |||    
T  32646697 tatgtagcattcttatggtaggtcaatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgaga 32646796  T
Q  199 tgtgatcatca 209  Q
    |||||||||||    
T  32646797 tgtgatcatca 32646807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19365726 - 19365586
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcacta-tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| ||     
T  19365726 cataatggtttcaggtctaagagtggtatacaccattatcattggtgagaatat-cttatgacacttt-cataacat--actatgtagtactctcacggt 19365631  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19365630 gggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 19365586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 4676123 - 4676281
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4676123 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 4676218  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  4676219 atagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 4676281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18163324 - 18163166
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18163324 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtgaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 18163229  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18163228 atagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacataatag 18163166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20244099 - 20243941
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20244099 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 20244004  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  20244003 atagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 20243941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636552
Alignment:
Q  24 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 123  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    || |||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacattgggtca 32636590  T
Q  124 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatg 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32636589 atccaatataaatattactcataatatttatacctatg 32636552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1941930 - 1941791
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||| ||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  1941930 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata-tctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtg 1941835  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1941834 ggttaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 1941791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19362616 - 19362477
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  |    
T  19362616 catagtggtttcaggtttaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatat-cttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatg 19362521  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19362520 ggtcaatccagtataaatattactcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9487757 - 9487625
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |  |    
T  9487757 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacgatg 9487662  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9487661 ggtctatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 30040585 - 30040705
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |    
T  30040585 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcatggtg 30040680  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactc 143  Q
    | |||||| | ||||||||||||||    
T  30040681 ggtcaatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4546286 - 4546147
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  4546286 catagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 4546191  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4546190 ggtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 4546147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | ||| ||||| ||||||| ||||| |  |  ||||| ||||| |||||| |    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattat-cttatcacactttacataaatcat--tatgtggtattatcatggtg 33888647  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 174  Q
    | ||||| ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33888646 ggtcaattca---taaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 183
Target Start/End: Original strand, 34777893 - 34777975
Alignment:
Q  101 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 183  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777893 tgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttatacatatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5616601 - 5616469
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||      
T  5616601 catagtggtttcagatctaagattggtatacaccattatcattgtaagaatat-cttatgacacttt-cataa--taaactctgtagtattctcacggtt 5616506  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5616505 ggtcaatccagtataaatattacttctaatatttata 5616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Original strand, 5528602 - 5528714
Alignment:
Q  46 atacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcct 145  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| |||||||||||| ||||||    
T  5528602 atacaccattatcattatgagaatat-cttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatatcactcct 5528697  T
Q  146 aatatttatatctatgt 162  Q
    |||||||||| ||||||    
T  5528698 aatatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9538090 - 9538033
Alignment:
Q  98 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9538090 ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatattactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11421213 - 11421096
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| | || |    
T  11421213 catagtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataata-tcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctaacggtg 11421118  T
Q  119 gatcaatccaatataaatatta 140  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  11421117 ggtcaatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677578
Alignment:
Q  186 atgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatag 10677578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891218
Alignment:
Q  186 atgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatag 10891218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6110455 - 6110248
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110455 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 6110357  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6110356 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 6110257  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  6110256 acataatag 6110248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 15600700 - 15600907
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600700 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 15600798  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15600799 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 15600898  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  15600899 acataatag 15600907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 15607245 - 15607452
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607245 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 15607343  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15607344 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 15607443  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  15607444 acataatag 15607452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 16482299 - 16482506
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482299 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 16482397  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16482398 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 16482497  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  16482498 acataatag 16482506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8490886 - 8490681
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490886 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 8490788  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8490787 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 8490688  T
Q  218 acataat 224  Q
    |||||||    
T  8490687 acataat 8490681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 10572408 - 10572615
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572408 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 10572506  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10572507 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 10572606  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  10572607 acataatag 10572615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 10579171 - 10579378
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10579171 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggc 10579269  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10579270 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 10579369  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  10579370 acataatag 10579378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18520366 - 18520159
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520366 acatagtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 18520268  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18520267 ggatcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 18520168  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  18520167 acataatag 18520159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18523054 - 18522847
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18523054 acatagtggtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggc 18522956  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18522955 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 18522856  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  18522855 acataatag 18522847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 15357402 - 15357609
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357402 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 15357500  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15357501 ggatcaacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 15357600  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  15357601 acataatag 15357609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 17780934 - 17781141
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17780934 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggc 17781032  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17781033 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacct 17781132  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  17781133 acataatag 17781141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13211693 - 13211486
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13211693 acataatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatata-ttatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggc 13211595  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13211594 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacct 13211495  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  13211494 acataatag 13211486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13248998 - 13248791
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13248998 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatata-ttatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggc 13248900  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13248899 gaatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacct 13248800  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  13248799 acataatag 13248791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 15342035 - 15342242
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15342035 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgac 15342133  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15342134 ggatcaatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 15342233  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  15342234 acataatag 15342242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 32056715 - 32056923
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056715 acatagtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 32056813  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32056814 ggatcaatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagtctacc 32056913  T
Q  217 tacataatag 226  Q
     |||||||||    
T  32056914 cacataatag 32056923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 17200000 - 17200207
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagc 17200098  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  17200099 gggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 17200198  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  17200199 acataatag 17200207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13517198 - 13516995
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  13517198 acatagtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatgga 13517104  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  13517103 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 13517004  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  13517003 acataatag 13516995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Original strand, 1647339 - 1647544
Alignment:
Q  20 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1647339 atagtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatat-cgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcga 1647437  T
Q  120 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctac 219  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  1647438 gtcaatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccac 1647537  T
Q  220 ataatag 226  Q
    |||||||    
T  1647538 ataatag 1647544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17136744 - 17136543
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17136744 acatagtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggt 17136646  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  17136645 gggtcaatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatgtgatcatcagtctaccc 17136552  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  17136551 acataatag 17136543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29925362 - 29925155
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||     
T  29925362 acataatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggt 29925264  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |     
T  29925263 gggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatcc 29925164  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  29925163 acataatag 29925155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29974515 - 29974308
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||     
T  29974515 acataatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggt 29974417  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |     
T  29974416 gggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatcc 29974317  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  29974316 acataatag 29974308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16200821 - 16200627
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  16200821 acatagtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggt 16200723  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtct 213  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16200722 gggtcaatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtct 16200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 15846632 - 15846834
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  15846632 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 15846727  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  15846728 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 15846826  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  15846827 cataatag 15846834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21034444 - 21034242
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  21034444 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 21034349  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  21034348 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 21034250  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  21034249 cataatag 21034242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14890553 - 14890395
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890553 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 14890458  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  14890457 atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 14890395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 20147650 - 20147852
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  20147650 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 20147745  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  20147746 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 20147844  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  20147845 cataatag 20147852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 24253208 - 24253411
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | |||||||||||     
T  24253208 acatagtggttttaggtcgaatg-tggaatacaccgttatcactatgagaataa-cttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcattattctcatgga 24253302  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||||| ||||||||     
T  24253303 gggtcaaaccaatataaatataactcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatcattagtctaccg 24253402  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  24253403 acataatag 24253411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21398998 - 21398847
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | |||||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  21398998 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaata-tcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtg 21398903  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 174  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  21398902 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgata 21398847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12300116 - 12299915
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  12300116 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 12300021  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  12300020 ggtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 12299923  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  12299922 cataatag 12299915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 55427183 - 55427025
Alignment:
Q  63 tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55427183 tgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 55427088  T
Q  163 gaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
      |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  55427087 atagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 55427025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147025
Alignment:
Q  20 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 119  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |    
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatat-cttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcag 14147131  T
Q  120 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctac 219  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  | ||||||| |||||||||||| ||     
T  14147130 gtcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatat 14147032  T
Q  220 ataatag 226  Q
    |||||||    
T  14147031 ataatag 14147025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 25978824 - 25978963
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  25978824 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 25978919  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978920 ggtctatccagtataaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11787721 - 11787654
Alignment:
Q  95 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11787721 ttactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252026
Alignment:
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtc 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatcttcagtc 8252026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32280444 - 32280313
Alignment:
Q  55 tatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttat 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||   |||||||| ||||||||| | || |||| | | | ||||||||| || ||||  ||||    
T  32280444 tatcactatgagaatat-cttatgacactttacatgactc--actatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattat 32280348  T
Q  155 atctatgtgaagacttgataactctttatccatga 189  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280347 acctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Original strand, 15317342 - 15317408
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15317342 tactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15317408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16200363 - 16200321
Alignment:
Q  171 gataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16200363 gataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtct 16200321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15526959 - 15526827
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || | | ||||||| ||||||||| |||||||| | |  ||||| ||||| ||||| |  |    
T  15526959 catagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccattaacattgtaagaatat-cttatgaca-ttttcatagcat--actatttagtactctcacgatg 15526864  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15526863 ggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  61 tatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatcta 159  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  ||    
T  28954093 tatgagaatat-catatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacata 28953997  T
Q  160 tgtgaagacttgataactctttatccatgatc 191  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953996 tgtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504467
Alignment:
Q  145 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | || ||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatag 9504467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 226
Target Start/End: Original strand, 19089738 - 19089768
Alignment:
Q  196 agatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089738 agatgtgatcatcagtctacctacataatag 19089768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 30464203 - 30464151
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 71  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  30464203 catagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatcattatgagaatat 30464151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18252421 - 18252214
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252421 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 18252323  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18252322 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 18252223  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  18252222 acataatag 18252214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 27131225 - 27131432
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131225 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 27131323  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27131324 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 27131423  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  27131424 acataatag 27131432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 18532330 - 18532537
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532330 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 18532428  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18532429 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatct 18532528  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  18532529 acataatag 18532537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 27310393 - 27310600
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310393 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 27310491  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  27310492 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 27310591  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  27310592 acataatag 27310600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 16358851 - 16359058
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358851 acatggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggc 16358949  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  16358950 ggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 16359049  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  16359050 acataatag 16359058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171256
Alignment:
Q  50 accactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaata 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaata 21171179  T
Q  150 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21171180 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatag 21171256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 36816450 - 36816656
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36816450 acatagtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataatttt--tatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggt 36816547  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  36816548 gggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatcc 36816647  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  36816648 acataatag 36816656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 3855735 - 3855942
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3855735 acatagtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatat-cttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgc 3855833  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  3855834 gggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcagtctaccc 3855933  T
Q  218 acataatag 226  Q
    || ||||||    
T  3855934 acgtaatag 3855942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 27277374 - 27277580
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||     
T  27277374 acatagtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatat-cttatggcacttt-catgacttttactatgcaatattcttatggt 27277471  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||     
T  27277472 gggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggtctaccc 27277571  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  27277572 acataatag 27277580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 22641690 - 22641871
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22641690 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaata-tcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggt 22641787  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgat 204  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22641788 gggtcaatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 214
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657232
Alignment:
Q  90 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  190 tctgtaagatgtgatcatcagtcta 214  Q
     || | |||||||||||||||||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtcta 22657232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 224
Target Start/End: Original strand, 12014179 - 12014305
Alignment:
Q  98 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaag 197  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  12014179 ctatgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgag 12014278  T
Q  198 atgtgatcatcagtctacctacataat 224  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||    
T  12014279 atgtgatcatcattctacccacataat 12014305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23507285 - 23507096
Alignment:
Q  22 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||  |||||| |  ||| || ||| ||  || ||||| ||||| |||| ||     
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataa-cttatg-ctttttacacaacgtt--ctctgtagcattctaatggtggg 23507190  T
Q  121 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtcta 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23507189 ttaatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatcatcagtcta 23507096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 28134819 - 28135019
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  28134819 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 28134914  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  28134915 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 28135013  T
Q  219 cataat 224  Q
    ||||||    
T  28135014 cataat 28135019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 19706535 - 19706737
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  19706535 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 19706630  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  19706631 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 19706729  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  19706730 cataatag 19706737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 43802461 - 43802663
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  43802461 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 43802556  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  43802557 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 43802655  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  43802656 cataatag 43802663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9456322 - 9456120
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  9456322 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 9456227  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  9456226 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 9456128  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  9456127 cataatag 9456120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 20779741 - 20779943
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  20779741 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 20779836  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  20779837 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 20779935  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  20779936 cataatag 20779943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 22670353 - 22670555
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  22670353 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 22670448  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  22670449 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 22670547  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  22670548 cataatag 22670555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 42817085 - 42817287
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  42817085 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 42817180  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  42817181 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 42817279  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  42817280 cataatag 42817287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 222
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917937
Alignment:
Q  121 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctaca 220  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  221 ta 222  Q
    ||    
T  9917936 ta 9917937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 20391335 - 20391537
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  20391335 catagtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatat-cttatgaaaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 20391430  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  20391431 ggtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 20391529  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  20391530 cataatag 20391537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22612698 - 22612547
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  22612698 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 22612603  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 174  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22612602 ggtcaatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgata 22612547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 214
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006550
Alignment:
Q  125 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtcta 214  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtcta 12006550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 634140 - 634001
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  634140 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 634045  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  634044 ggttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 634001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 115
Target Start/End: Original strand, 9916593 - 9916688
Alignment:
Q  18 acatagtggttt-caggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9916593 acatagtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataat-ttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatg 9916688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8727873 - 8727741
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  8727873 catagtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatat-cttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtg 8727778  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8727777 gatcaatccagtataaatattacttctaatatttata 8727741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 47667668 - 47667772
Alignment:
Q  121 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctaca 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||    
T  47667668 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacataca 47667766  T
Q  221 taatag 226  Q
    ||||||    
T  47667767 taatag 47667772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29096928 - 29096789
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||| || || |    
T  29096928 catagtggtttcatgtctaagagtgtgaaacaccattatcattatgagaatat-cttatgaca-ttttcataacatg--ctatgtagtattcacacggtg 29096833  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  29096832 gatcaatctagtataaatattattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930649
Alignment:
Q  98 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 35930649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  22 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 121  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggt 21881570  T
Q  122 caatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881571 caatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  102 gtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 222
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgta 195  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |     
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  196 agatgtgatcatcagtctacctacata 222  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7498 - 7291
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7498 acatagttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 7400  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7399 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 7300  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  7299 acataatag 7291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 25806 - 26013
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 25904  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25905 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 26004  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  26005 acataatag 26013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 21330064 - 21330271
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330064 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 21330162  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21330163 ggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtccacct 21330262  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  21330263 acataatag 21330271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18796897 - 18796690
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18796897 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcataga 18796799  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18796798 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 18796699  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  18796698 acataatag 18796690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18620194 - 18619988
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18620194 acatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatat-cttatgacacttt-cataacttttactatgtagtattctcatggt 18620097  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | |||||     
T  18620096 gggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggcctaccc 18619997  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  18619996 acataatag 18619988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Original strand, 6991929 - 6992136
Alignment:
Q  17 aacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 115  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||| |||  ||||||||  |||| |||    
T  6991929 aacatagtgatttcaggccgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagt-ttatgtcactta-cataatttt--ctatgtagcgttcttatg 6992024  T
Q  116 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag--acttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtct 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||| |||| ||||||| |||||    
T  6992025 gaggatcaatccaatataaatattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgtgagatatgatcattagtct 6992124  T
Q  214 acctacataata 225  Q
    ||| | ||||||    
T  6992125 acccatataata 6992136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20978264 - 20978091
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 116  Q
    ||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||  | || ||  ||||||||||    
T  20978264 acatagtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataa-cttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattctcatgg 20978169  T
Q  117 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978168 cgggtcaatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36270549 - 36270350
Alignment:
Q  23 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 121  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||| |||| ||||| |||  |||||||  ||||||||||||  |    
T  36270549 gtggttttaggtcgaagggtg-aatacaccacttatcactatgagaatga-cttgtgac-ctttacataatttt--ctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  122 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||   || ||||||||||||||||||||| |||     
T  36270454 caatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgagatgtgatcatcagtctacccacac 36270355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 226
Target Start/End: Original strand, 22183308 - 22183506
Alignment:
Q  24 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||  ||| |||||| ||   ||||||  ||| ||||||||| ||    
T  22183308 tggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctg-tgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggtc 22183403  T
Q  123 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacata 222  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||    
T  22183404 aatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtgagatttgatcatcaatctacccacgta 22183502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18822468 - 18822279
Alignment:
Q  22 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||   |||  ||  |||| |||||| |||  ||||||  | ||||||||| ||    
T  18822468 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatga-cttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcaga 18822373  T
Q  121 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  18822372 tcaatccaatataaatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatatgtgatcatcagtcta 18822279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 226
Target Start/End: Original strand, 18851956 - 18852082
Alignment:
Q  100 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagat 199  Q
    ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  18851956 atgtaatattcttatagcgagtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagat 18852055  T
Q  200 gtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||    
T  18852056 gggatcattagtctaccgacataatag 18852082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 24250128 - 24250330
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  24250128 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 24250223  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  24250224 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 24250322  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  24250323 cataatag 24250330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30174583 - 30174381
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  30174583 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 30174488  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  30174487 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 30174389  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  30174388 cataatag 30174381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279486
Alignment:
Q  98 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaag 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  || ||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  198 atgtgatcatcagtc 212  Q
    |||||||||| ||||    
T  19279500 atgtgatcattagtc 19279486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 15342098 - 15342237
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||| || |    
T  15342098 catagtggtttcaggtctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactat-cttatgacacttt-cataacat--actatgtagtattttcacggtg 15342193  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342194 ggttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 226
Target Start/End: Original strand, 24229338 - 24229513
Alignment:
Q  46 atacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcct 145  Q
    |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  24229338 atacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcct 24229433  T
Q  146 aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  24229434 aatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatag 24229513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 224
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  121 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctac 219  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  220 ataat 224  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29800677 - 29800545
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | ||||||||| | | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  29800677 catagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatat-catgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtg 29800582  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800581 ggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 29800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19616641 - 19616509
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||| || |    
T  19616641 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatat-catatgaca-ttttcataaaat--actatgtagtattctcacggtg 19616546  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    | ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19616545 ggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttata 19616509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  20 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 119  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | |  |||||||||||||||||| ||    
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactat-cttatgacactt--cataacatgt--tatgtagtattctcatggtgg 40301128  T
Q  120 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
     ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301129 gtcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |   |||||||||||||||| |    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatat-cttatgacacttt-cataacat--agcgtgtagtattctcatggtg 21626860  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626859 g-tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17241100 - 17241034
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacactttt 86  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17241100 acatagtggttttaggtcgaagg-tgaaatacaccattatcactatgagaata-tcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741324
Alignment:
Q  121 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctaca 220  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  ||| |||||    | |||||||||||||||||||| ||||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctc-atattcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  221 taatag 226  Q
    ||||||    
T  28741319 taatag 28741324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 159
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 159  Q
    |||| ||||||||||||| |  |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Original strand, 36799775 - 36799826
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 69  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799775 catagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763792
Alignment:
Q  121 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 24763792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1384 - 1177
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1384 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 1286  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacct 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1285 agatcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 1186  T
Q  218 acataatag 226  Q
    |||||||||    
T  1185 acataatag 1177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Original strand, 230207 - 230367
Alignment:
Q  18 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230207 acataatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 230305  T
Q  118 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 179  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230306 agatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5881 - 5713
Alignment:
Q  58 cactatgagaatattcttatgacactttt-cataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5881 cactatgagaatat-cttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 5783  T
Q  157 ctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctacctacataatag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5782 ctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatag 5713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8309
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 8416  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  8415 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 8317  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  8316 cataatag 8309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 389 - 187
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  389 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 294  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||||| ||||||||| || ||    
T  293 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacata 195  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  194 cataatag 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 3771 - 3973
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  3771 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 3866  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  3867 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 3965  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  3966 cataatag 3973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 119936 - 119734
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  119936 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 119841  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  119840 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgta 119742  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  119741 cataatag 119734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 130320 - 130522
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  130320 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtg 130415  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  | ||||| | |||||||||||| ||    
T  130416 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 130514  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  130515 cataatag 130522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26748 - 26609
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| || |    
T  26748 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtg 26653  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26652 ggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 40084 - 40286
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||  | |    
T  40084 catagtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacagtg 40179  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtaagatgtgatcatcagtctaccta 218  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  | |||||||  ||||||||||| ||    
T  40180 ggtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacata 40278  T
Q  219 cataatag 226  Q
    ||||||||    
T  40279 cataatag 40286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 13045 - 13184
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  13045 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattatgagaatat-cttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtg 13140  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13141 ggtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgt 13184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Original strand, 90019 - 90135
Alignment:
Q  107 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactc-tttatccatgatctgtaagatgtgatc 205  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  90019 attctcatcgcgtgtcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgatt 90118  T
Q  206 atcagtctacctacata 222  Q
    ||||||||| |||||||    
T  90119 atcagtctatctacata 90135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 67470 - 67609
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||| ||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  67470 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata-tctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtg 67565  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  67566 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 67609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8933 - 8807
Alignment:
Q  23 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 122  Q
    ||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  |||| ||||||||||||| | || ||    
T  8933 gtggtttcaggtctaggagtggtatacaccattatcactatgagaatat-cttatgaca-tcttcataacat--actaagtagtattctcattgggggtc 8838  T
Q  123 aatccaatataaatattactcctaatattta 153  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8837 aatctagtataaatattactcctaatattta 8807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  19 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 118  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| || | |||| |  |||||||||||||||||| | |    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatat-cttatgacacctt-cgtaacat--actatgtagtattctcattgtg 83206  T
Q  119 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83207 ggtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Original strand, 11699 - 11758
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 155  Q
    ||||||||||||||||||  | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11699 tactatgtagtattctcacagtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45931
Alignment:
Q  100 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta----atatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgta 195  Q
    |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||   |    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatccaca 45952  T
Q  196 agatgtgatcatcagtctacc 216  Q
    |||  ||||||||| ||||||    
T  45951 agacatgatcatcaatctacc 45931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 53898 - 53832
Alignment:
Q  96 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 162  Q
    |||||||||||||||||| || || |||| ||| | | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53898 tactatgtagtattctcacggtgggtcaacccagtgtgaatattactcttaatatttatacctatgt 53832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 102
Alignment:
Q  22 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 113  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University