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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF13555_high_6 (Length: 518)
Name: NF13555_high_6
Description: NF13555
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF13555_high_6 |
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Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 487; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 495
Target Start/End: Original strand, 37903507 - 37904001
Alignment:
| Q |
1 |
agtttttgaaaaccaccagccttaattataaccgcaacattgtcctgtcatacaaagcagttatgtcagaggcagcatatcaccaggcatcaatgattaa |
100 |
Q |
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| T |
37903507 |
agtttttgaaaaccaccagccttaattataaccgcaacattgtcctgtcatacaaagcagttatgtcagaggcagcatatcaccaggcatcaatgattaa |
37903606 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
37903607 |
taaagggccacatactatgctgaacgagtaaaaaacaaggaaactaacttcacctcattatcagccagaccatagagagcaaaagctgcgttgtgttgaa |
37903706 |
T |
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| Q |
201 |
cagaaccattctttgtgtcaagaagatcaagcagaggctctatacctccattataagcaataccagcttgattgtgtgagtcctaacatgaattatataa |
300 |
Q |
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| T |
37903707 |
cggaaccattctttgtgtcaagaagatcaagcagaggctctatacctccattataagcaataccagcttgattgtgtgagtcctaacatgaattatataa |
37903806 |
T |
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| Q |
301 |
acatttaggattgatttcgataaattaatttccatatacagataaatactggttgcaaatgataatcacctgtgccaacctcccaagtgcaaaagttgac |
400 |
Q |
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| T |
37903807 |
acatttaggattgatttcgataaattaattcccatatacagataaatactggttgcaaatgataatcacctgtgccaacctcccaagtgcaaaagttgac |
37903906 |
T |
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| Q |
401 |
atttccctaagctgtaaatctgaagacttaagcatctcaattaaggggtttatagcccctctttgggcaatgtgaatctgcatgaaccatgtatg |
495 |
Q |
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| T |
37903907 |
atttccctaagctgtaaatctgaagacttaagcatctcaattaaggggtttatagcccctctttgggcaatgtgaatctgcatgaaccatgtatg |
37904001 |
T |
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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 495
Target Start/End: Original strand, 37910018 - 37910512
Alignment:
| Q |
1 |
agtttttgaaaaccaccagccttaattataaccgcaacattgtcctgtcatacaaagcagttatgtcagaggcagcatatcaccaggcatcaatgattaa |
100 |
Q |
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| T |
37910018 |
agtttttgaaaaccaccagccttaattataaccgcaacattgtcctgtcatacaaagcagttatgtcagaggcagcatatcaccaggcatcaatgattaa |
37910117 |
T |
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| Q |
101 |
taaagggccacatactatgctgaacgagtaaaaaacaaggaaactaacttcacctcattatcagccagaccatagagagcaaaagctgcgttgtgttgaa |
200 |
Q |
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| T |
37910118 |
taaagggccacatactatgctgaacgagtaaaaaacaaggaaactaacttcacctcattatcagccagaccatagagagcaaaagctgcgttgtgttgaa |
37910217 |
T |
|
| Q |
201 |
cagaaccattctttgtgtcaagaagatcaagcagaggctctatacctccattataagcaataccagcttgattgtgtgagtcctaacatgaattatataa |
300 |
Q |
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| T |
37910218 |
cggaaccattctttgtgtcaagaagatcaagcagaggctctatacctccattataagcaataccagcttgattgtgtgagtcctaacatgaattatataa |
37910317 |
T |
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| Q |
301 |
acatttaggattgatttcgataaattaatttccatatacagataaatactggttgcaaatgataatcacctgtgccaacctcccaagtgcaaaagttgac |
400 |
Q |
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| T |
37910318 |
acatttaggattgatttcgataaattaattcccatatacagataaatactggttgcaaatgataatcacctgtgccaacctcccaagtgcaaaagttgac |
37910417 |
T |
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| Q |
401 |
atttccctaagctgtaaatctgaagacttaagcatctcaattaaggggtttatagcccctctttgggcaatgtgaatctgcatgaaccatgtatg |
495 |
Q |
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| T |
37910418 |
atttccctaagctgtaaatctgaagacttaagcatctcaattaaggggtttatagcccctctttgggcaatgtgaatctgcatgaaccatgtatg |
37910512 |
T |
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