View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13562_low_4 (Length: 753)

Name: NF13562_low_4
Description: NF13562
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13562_low_4
NF13562_low_4
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (417-735)||(38608241-38608559)
chr8 (417-735)||(38793024-38793342)
chr8 (153-426)||(6311097-6311375)
chr8 (417-729)||(38121564-38121876)
chr8 (155-426)||(7289933-7290211)
chr8 (156-426)||(4760093-4760366)
chr8 (156-426)||(36979184-36979456)
chr8 (156-426)||(30655448-30655725)
chr8 (147-426)||(10689161-10689442)
chr8 (156-416)||(18870591-18870849)
chr8 (192-426)||(33037825-33038063)
chr8 (156-416)||(18853197-18853457)
chr8 (10-156)||(38613611-38613757)
chr8 (177-426)||(25328285-25328540)
chr8 (177-417)||(39784838-39785086)
chr8 (177-426)||(35745213-35745469)
chr8 (316-426)||(26287866-26287980)
chr8 (316-426)||(26301123-26301237)
chr8 (316-426)||(26313117-26313231)
chr8 (156-426)||(1261972-1262238)
chr8 (177-426)||(10684271-10684528)
chr8 (316-426)||(31071247-31071362)
chr8 (351-426)||(26403248-26403327)
chr8 (351-426)||(4456028-4456107)
chr8 (317-426)||(7412305-7412420)
chr8 (351-418)||(4696623-4696693)
chr8 (353-412)||(9765852-9765914)
chr8 (351-426)||(19175772-19175851)
chr8 (351-426)||(23799595-23799674)
chr8 (354-426)||(6127224-6127300)
chr8 (351-412)||(19752427-19752491)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (155-426)||(1457169-1457446)
chr5 (156-426)||(43592080-43592357)
chr5 (156-426)||(27444771-27445048)
chr5 (156-426)||(27449615-27449892)
chr5 (156-426)||(43598525-43598802)
chr5 (156-426)||(43604017-43604294)
chr5 (156-426)||(43609509-43609786)
chr5 (173-426)||(30631227-30631484)
chr5 (177-426)||(15044512-15044764)
chr5 (177-417)||(28807588-28807837)
chr5 (177-426)||(37556629-37556887)
chr5 (177-426)||(37561451-37561709)
chr5 (275-426)||(31180138-31180292)
chr5 (156-426)||(38191983-38192252)
chr5 (156-426)||(38219208-38219477)
chr5 (177-426)||(2785197-2785453)
chr5 (177-426)||(31397000-31397256)
chr5 (177-426)||(31401857-31402113)
chr5 (195-426)||(33791158-33791394)
chr5 (195-426)||(33768021-33768257)
chr5 (313-426)||(35387624-35387741)
chr5 (156-409)||(24135659-24135909)
chr5 (156-221)||(31180079-31180142)
chr5 (351-426)||(9353350-9353429)
chr5 (351-426)||(36932368-36932447)
chr5 (351-426)||(10281751-10281830)
chr5 (351-426)||(15464532-15464611)
chr5 (351-418)||(17003987-17004057)
chr5 (352-412)||(11917005-11917068)
chr5 (351-426)||(14520230-14520309)
chr5 (351-426)||(19588746-19588825)
chr5 (156-212)||(35387474-35387527)
chr5 (354-426)||(12084193-12084269)
chr5 (351-412)||(28832259-28832323)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (417-729)||(28731138-28731450)
chr4 (155-426)||(51520257-51520535)
chr4 (155-426)||(56146718-56146996)
chr4 (177-426)||(3813846-3814102)
chr4 (177-426)||(9224414-9224668)
chr4 (177-426)||(9229201-9229455)
chr4 (156-426)||(24741748-24742019)
chr4 (177-417)||(18855549-18855796)
chr4 (156-426)||(29760449-29760720)
chr4 (177-426)||(45347824-45348079)
chr4 (177-426)||(45357303-45357558)
chr4 (177-426)||(5732486-5732743)
chr4 (316-426)||(28468547-28468660)
chr4 (317-426)||(31985652-31985764)
chr4 (351-426)||(5396689-5396768)
chr4 (351-426)||(10047379-10047458)
chr4 (351-426)||(16623311-16623390)
chr4 (351-426)||(36315247-36315326)
chr4 (351-426)||(36329456-36329535)
chr4 (351-426)||(39245994-39246073)
chr4 (351-417)||(38152467-38152536)
chr4 (351-426)||(5269209-5269288)
chr4 (352-426)||(5143260-5143338)
chr4 (356-426)||(6743433-6743507)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (177-426)||(9649-9902)
scaffold0355 (177-325)||(1-143)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (177-426)||(24024333-24024589)
chr7 (177-426)||(12396735-12396989)
chr7 (177-426)||(12406155-12406409)
chr7 (177-426)||(4866553-4866808)
chr7 (177-426)||(31109590-31109844)
chr7 (156-426)||(20357566-20357837)
chr7 (177-426)||(19992135-19992391)
chr7 (154-426)||(2057763-2058044)
chr7 (177-417)||(21812254-21812501)
chr7 (537-726)||(34875819-34876008)
chr7 (156-426)||(1533462-1533730)
chr7 (156-426)||(21645818-21646085)
chr7 (313-412)||(21639770-21639872)
chr7 (177-426)||(24266209-24266466)
chr7 (313-426)||(18408726-18408842)
chr7 (316-426)||(18413606-18413718)
chr7 (177-426)||(24261330-24261587)
chr7 (177-417)||(16879894-16880142)
chr7 (177-417)||(16884750-16884998)
chr7 (351-426)||(47263678-47263755)
chr7 (351-426)||(29159803-29159882)
chr7 (352-426)||(21983285-21983363)
chr7 (351-426)||(46516328-46516407)
chr7 (351-426)||(49091661-49091740)
chr7 (351-426)||(55948-56026)
chr7 (351-412)||(9190041-9190105)
chr7 (351-412)||(20284089-20284153)
chr7 (352-412)||(21988909-21988970)
chr7 (351-426)||(44848702-44848781)
chr7 (351-426)||(2479337-2479415)
chr7 (156-231)||(2479148-2479221)
chr7 (351-412)||(2580390-2580454)
chr7 (351-412)||(33332483-33332547)
chr7 (152-231)||(47263485-47263562)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (154-426)||(7167049-7167323)
chr3 (177-426)||(22173202-22173456)
chr3 (156-426)||(2671604-2671876)
chr3 (156-426)||(8739081-8739354)
chr3 (156-426)||(9091319-9091592)
chr3 (156-426)||(28503883-28504145)
chr3 (177-426)||(18656256-18656513)
chr3 (155-426)||(8477170-8477441)
chr3 (177-426)||(2677094-2677351)
chr3 (313-426)||(40372813-40372929)
chr3 (177-426)||(2672938-2673195)
chr3 (177-426)||(8512037-8512295)
chr3 (177-426)||(8516917-8517175)
chr3 (177-397)||(10207755-10207981)
chr3 (316-412)||(1305914-1306012)
chr3 (203-426)||(24967957-24968185)
chr3 (177-417)||(32475306-32475554)
chr3 (177-417)||(32480163-32480412)
chr3 (317-426)||(26928609-26928721)
chr3 (156-259)||(40372986-40373085)
chr3 (317-426)||(32143287-32143400)
chr3 (317-426)||(27986454-27986567)
chr3 (316-375)||(1309819-1309878)
chr3 (351-426)||(8370494-8370573)
chr3 (351-426)||(27974960-27975039)
chr3 (317-426)||(27452924-27453037)
chr3 (351-426)||(16264350-16264429)
chr3 (351-426)||(18552891-18552970)
chr3 (351-426)||(21711223-21711302)
chr3 (351-426)||(33386674-33386753)
chr3 (351-418)||(30709807-30709877)
chr3 (352-426)||(36029094-36029172)
chr3 (392-426)||(28501716-28501750)
chr3 (354-426)||(1736313-1736389)
chr3 (351-426)||(3716010-3716089)
chr3 (351-426)||(40592790-40592869)
chr3 (351-410)||(25795781-25795843)
chr3 (351-412)||(1417513-1417577)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (177-426)||(22010704-22010958)
chr6 (177-417)||(6438324-6438570)
chr6 (177-426)||(14737583-14737838)
chr6 (177-426)||(14742443-14742697)
chr6 (177-426)||(11856795-11857052)
chr6 (177-426)||(28184325-28184583)
chr6 (177-426)||(28155576-28155832)
chr6 (156-426)||(5674788-5675057)
chr6 (177-426)||(6005239-6005495)
chr6 (177-426)||(16838566-16838822)
chr6 (195-426)||(33330452-33330690)
chr6 (177-426)||(33335949-33336207)
chr6 (195-388)||(5343322-5343519)
chr6 (156-301)||(30125940-30126084)
chr6 (351-426)||(5757496-5757575)
chr6 (351-426)||(21356036-21356115)
chr6 (317-426)||(22708984-22709097)
chr6 (351-426)||(31086491-31086570)
chr6 (351-412)||(4629954-4630018)
chr6 (351-426)||(5572259-5572338)
chr6 (351-426)||(10077183-10077262)
chr6 (351-426)||(22963700-22963778)
chr6 (351-426)||(23824615-23824693)
chr6 (351-412)||(31936587-31936651)
chr6 (351-412)||(31979513-31979577)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (177-426)||(44312631-44312885)
chr2 (154-426)||(11098945-11099219)
chr2 (156-426)||(14291295-14291567)
chr2 (156-426)||(9296419-9296691)
chr2 (177-426)||(32246607-32246866)
chr2 (177-426)||(39811995-39812250)
chr2 (177-426)||(19344243-19344499)
chr2 (177-426)||(19349101-19349357)
chr2 (156-426)||(25398305-25398574)
chr2 (156-426)||(25403443-25403712)
chr2 (316-426)||(3491716-3491829)
chr2 (317-426)||(40738810-40738921)
chr2 (351-426)||(21629944-21630022)
chr2 (351-426)||(8040060-8040139)
chr2 (354-426)||(13569331-13569407)
chr2 (351-426)||(28259195-28259274)
chr2 (351-418)||(14699034-14699104)
chr2 (351-412)||(10445477-10445541)
chr2 (351-412)||(34682367-34682431)
chr2 (351-426)||(17865203-17865282)
chr2 (351-426)||(20522220-20522299)
chr2 (352-426)||(34388859-34388937)
chr2 (354-426)||(8390168-8390244)
chr2 (351-412)||(31056044-31056108)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (177-426)||(35069-35323)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (177-426)||(25445096-25445352)
chr1 (177-417)||(44023889-44024135)
chr1 (177-417)||(39445322-39445569)
chr1 (177-426)||(41398060-41398314)
chr1 (177-417)||(1055027-1055274)
chr1 (192-426)||(24787383-24787624)
chr1 (537-726)||(31529212-31529401)
chr1 (537-726)||(51801280-51801469)
chr1 (253-426)||(41390488-41390659)
chr1 (195-426)||(43988471-43988709)
chr1 (156-426)||(24202787-24203054)
chr1 (177-255)||(41386571-41386650)
chr1 (316-426)||(19361450-19361564)
chr1 (316-426)||(19380090-19380204)
chr1 (316-426)||(19358861-19358975)
chr1 (351-426)||(26644915-26644994)
chr1 (351-426)||(47703954-47704033)
chr1 (351-418)||(9476261-9476331)
chr1 (351-412)||(19072928-19072992)
chr1 (351-412)||(19120818-19120882)
chr1 (351-412)||(3281708-3281772)
chr1 (351-426)||(13598398-13598477)
chr1 (351-426)||(16124534-16124613)
chr1 (351-426)||(27104390-27104469)
chr1 (351-426)||(29651811-29651890)
chr1 (351-426)||(37069770-37069849)
chr1 (156-212)||(19359079-19359132)
chr1 (351-412)||(775672-775736)
chr1 (351-412)||(47098857-47098921)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (177-417)||(185-432)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (155-383)||(300-528)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (177-426)||(148963-149219)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (177-426)||(2258-2514)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (156-426)||(24063-24331)
scaffold0188 (156-426)||(17970-18238)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (177-417)||(19181-19428)
scaffold0197 (177-426)||(14316-14573)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (177-417)||(181980-182228)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (177-255)||(34132-34211)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (177-238)||(13171-13233)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (351-426)||(8437-8516)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (352-412)||(85684-85747)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (351-426)||(43979-44058)
scaffold0087 (156-231)||(44174-44247)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (351-426)||(5683-5762)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (351-418)||(45253-45323)
[»] scaffold0082 (1 HSPs)
scaffold0082 (427-486)||(34106-34165)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (351-412)||(10729-10793)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 417 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 38608559 - 38608241
Alignment:
Q  417 gagaaagtgtagagacgaaaccttgaaggccgtgaacaacaaccattccgttgttgaatagatccggttgagcaatctcaacgcctccgatgaaaacttt 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38608559 gagaaagtgtagagacgaaaccttgaaggccgtgaacaacaaccattccgttgttgaatagatccggttgagcaatctcaacgcctccgatgaaaacttt 38608460  T
Q  517 tggagcaccgccggtagtaatgttcgaatgaatcgaatcggaagtgacggttatgcaacggcctggactgagcgtctcgaccttggtgccaaaaggaagc 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38608459 tggagcaccgccggtagtaatgttcgaatgaatcgaatcggaagtgacggttatgcaacggcctggactgagcgtctcgatcttggtgccaaaaggaagc 38608360  T
Q  617 gtacgcaaatactcgatagtgaataaacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgaagcatcggagg 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38608359 gtacgcaaatactcgatagtgaataaacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgaagcatcggagg 38608260  T
Q  717 gagcgaaaatggtagaagg 735  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38608259 gagcgaaaatggtagaagg 38608241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 417 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 38793342 - 38793024
Alignment:
Q  417 gagaaagtgtagagacgaaaccttgaaggccgtgaacaacaaccattccgttgttgaatagatccggttgagcaatctcaacgcctccgatgaaaacttt 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38793342 gagaaagtgtagagacgaaaccttgaaggccgtgaacaacaaccattccgttgttgaatagatccggttgagcaatctcaacgcctccgatgaaaacttt 38793243  T
Q  517 tggagcaccgccggtagtaatgttcgaatgaatcgaatcggaagtgacggttatgcaacggcctggactgagcgtctcgaccttggtgccaaaaggaagc 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38793242 tggagcaccgccggtagtaatgttcgaatgaatcgaatcggaagtgacggttatgcaacggcctggactgagcgtctcgatcttggtgccaaaaggaagc 38793143  T
Q  617 gtacgcaaatactcgatagtgaataaacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgaagcatcggagg 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38793142 gtacgcaaatactcgatagtgaataaacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgaagcatcggagg 38793043  T
Q  717 gagcgaaaatggtagaagg 735  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38793042 gagcgaaaatggtagaagg 38793024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Original strand, 6311097 - 6311375
Alignment:
Q  153 ttctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311097 ttctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca 6311196  T
Q  253 aacaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccga 349  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311197 aacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccga 6311296  T
Q  350 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311297 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 6311375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 417 - 729
Target Start/End: Original strand, 38121564 - 38121876
Alignment:
Q  417 gagaaagtgtagagacgaaaccttgaaggccgtgaacaacaaccattccgttgttgaatagatccggttgagcaatctcaacgcctccgatgaaaacttt 516  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38121564 gagaaagcttagaggcgaaaccttgaaggccgtgaacaacaaccattccgttgttgaatagatccggttgagtaatctcaacgcctccgatgaagacttt 38121663  T
Q  517 tggagcaccgccggtagtaatgttcgaatgaatcgaatcggaagtgacggttatgcaacggcctggactgagcgtctcgaccttggtgccaaaaggaagc 616  Q
    |||||||| ||||| |||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||     
T  38121664 tggagcactgccggaagtgttgttctgatgaatcgactcggaagtgacggttacgcaacggccgggactgagagtctcaatcttggtgccaaaagcaagt 38121763  T
Q  617 gtacgcaaatactcgatagtgaataaacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgaagcatcggagg 716  Q
       || | ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38121764 cgccgaagatattcgatggtgaatatacctggaactatgtgttcacgaaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgatgcatcagagg 38121863  T
Q  717 gagcgaaaatggt 729  Q
    |||||||||||||    
T  38121864 gagcgaaaatggt 38121876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 155 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 7290211 - 7289933
Alignment:
Q  155 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 253  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7290211 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaa 7290112  T
Q  254 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccga 349  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  7290111 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccga 7290012  T
Q  350 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7290011 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 7289933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4760366 - 4760093
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||      
T  4760366 tgttgtgaatccggttgaaactcacatcaatgaaa--aacaaagatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagcaaca 4760270  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4760269 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacatcaagaa 4760170  T
Q  353 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4760169 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 4760093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 36979184 - 36979456
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  36979184 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaaca 36979280  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36979281 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 36979379  T
Q  353 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36979380 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 36979456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 30655448 - 30655725
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  30655448 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaaca 30655543  T
Q  254 acaacaaaac-cagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaa----cacc 347  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  30655544 acaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacacc 30655643  T
Q  348 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30655644 aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgt 30655725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 147 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10689442 - 10689161
Alignment:
Q  147 ttttgcttctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttc 246  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  10689442 ttttgattgtgttgtgttttcggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttc 10689346  T
Q  247 caagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaa 343  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10689345 caagcaacaacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaaggaagaacaaaa 10689247  T
Q  344 caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10689246 caccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 10689161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 156 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18870849 - 18870591
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  18870849 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgagtt-aaatggtttccaagcaaac 18870754  T
Q  256 aacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 354  Q
    |||||||   |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18870753 aacaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaaga 18870655  T
Q  355 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatat 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18870654 ttgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 18870591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 192 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33038063 - 33037825
Alignment:
Q  192 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa--acaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaa 288  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||    
T  33038063 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaa 33037965  T
Q  289 agcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 387  Q
    | ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037964 accacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaagaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 33037866  T
Q  388 t--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037865 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 33037825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 156 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18853457 - 18853197
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18853457 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaacgaaacaaa----gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaac 18853363  T
Q  256 aacaaaacca---gccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 351  Q
    |||||||  |   |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18853362 aacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 18853264  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatat 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853263 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 18853197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Original strand, 38613611 - 38613757
Alignment:
Q  10 catcatcatcatctctggtcccaggtttcaaaattatgagtaattttaaacttgatactcattgtaatctccgttttcacctgcagggtcttaaatacat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38613611 catcatcatcttctctggtcccagctttcaaaattatgagtaattttaaacttgatactcattgtaatctccgttttcacctgcagggtcttaaatacat 38613710  T
Q  110 tgcacaaacaccgttgccaaggtttgaatctgctgaattttgcttct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38613711 tgcacaaacaccgttgccaaggtttgaatcagctcgattttgcttct 38613757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25328540 - 25328285
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 273  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || || ||||| |    
T  25328540 tcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacccta-a 25328442  T
Q  274 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaag-cataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttca 370  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||  ||||||| |||||| |   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328441 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttca 25328343  T
Q  371 gccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328342 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 25328285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39785086 - 39784838
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 273  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  || ||||||||      
T  39785086 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagccctaag 39784987  T
Q  274 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 369  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39784986 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 39784888  T
Q  370 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784887 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 39784838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 35745213 - 35745469
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  35745213 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 35745312  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35745313 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 35745409  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35745410 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 35745469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Original strand, 26287866 - 26287980
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26287866 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26287965  T
Q  413 atatga-gaaagtgt 426  Q
     ||||| ||||||||    
T  26287966 ctatgatgaaagtgt 26287980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Original strand, 26301123 - 26301237
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26301123 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26301222  T
Q  413 atatga-gaaagtgt 426  Q
     ||||| ||||||||    
T  26301223 ctatgatgaaagtgt 26301237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Original strand, 26313117 - 26313231
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26313117 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26313216  T
Q  413 atatga-gaaagtgt 426  Q
     ||||| ||||||||    
T  26313217 ctatgatgaaagtgt 26313231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1262238 - 1261972
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||  |  |||||||||| ||||| |  ||  || |||||||||      
T  1262238 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagtaaaagggagtggtaatctatgagta--aagtgtctccaagcaaca 1262144  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaa 352  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| | ||||   ||||   |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||    
T  1262143 acaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaagca--aacaagataagatagaaaggaagaacaaacacaccaaaaa 1262049  T
Q  353 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1262048 gattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 1261972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10684528 - 10684271
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  10684528 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 10684429  T
Q  272 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10684428 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 10684332  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10684331 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 10684271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31071362 - 31071247
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31071362 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 31071263  T
Q  412 aatatga-gaaagtgt 426  Q
    | ||||| ||||||||    
T  31071262 actatgatgaaagtgt 31071247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26403327 - 26403248
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26403327 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 26403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456107
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 4456107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 426
Target Start/End: Original strand, 7412305 - 7412420
Alignment:
Q  317 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcc 411  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  7412305 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 7412404  T
Q  412 aatatga-gaaagtgt 426  Q
    | ||||| ||||||||    
T  7412405 actatgatgaaagtgt 7412420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 4696693 - 4696623
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga 418  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||    
T  4696693 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatga 4696623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  353 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175772
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgt 19175772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23799674 - 23799595
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  23799674 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 23799595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 426
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127300
Alignment:
Q  354 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 6127300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19752491 - 19752427
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19752491 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatcca 19752427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 155 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1457446 - 1457169
Alignment:
Q  155 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 253  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1457446 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa 1457347  T
Q  254 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1457346 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaaggaagaacaaaacaccgag 1457247  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457246 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 1457169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 43592080 - 43592357
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 254  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43592080 tgttgtgaatccggttccaaagtcacatcaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa 43592179  T
Q  255 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43592180 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43592279  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592280 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 43592357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 27444771 - 27445048
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 254  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27444771 tgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaa 27444870  T
Q  255 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
    |||||  | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  27444871 caacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 27444970  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444971 aagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 27445048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 27449615 - 27449892
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 254  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27449615 tgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaa 27449714  T
Q  255 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
    |||||  | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  27449715 caacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 27449814  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449815 aagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 27449892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 43598525 - 43598802
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 254  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43598525 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43598624  T
Q  255 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43598625 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43598724  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598725 aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 43598802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 43604017 - 43604294
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 254  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43604017 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43604116  T
Q  255 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43604117 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43604216  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604217 aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 43604294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 43609509 - 43609786
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 254  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43609509 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43609608  T
Q  255 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43609609 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43609708  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609709 aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 43609786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 173 - 426
Target Start/End: Original strand, 30631227 - 30631484
Alignment:
Q  173 aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccct 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  30631227 aaactcacacaaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagcaacaacaacaaaac-agccct 30631325  T
Q  271 agactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttc 369  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | | || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30631326 agactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgactcagttc 30631425  T
Q  370 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631426 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 30631484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 15044512 - 15044764
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  || |||||||||||    
T  15044512 tcacaccaatgaaata--caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagccctagac 15044609  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15044610 tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagc 15044708  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044709 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 15044764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28807837 - 28807588
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  28807837 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 28807738  T
Q  275 tagtgtata--acaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 369  Q
    |||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28807737 tagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 28807638  T
Q  370 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807637 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 28807588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 37556887 - 37556629
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||   |    
T  37556887 tcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatg 37556788  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 369  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37556787 acttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 37556688  T
Q  370 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37556687 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgt 37556629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 37561709 - 37561451
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||   |    
T  37561709 tcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatg 37561610  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 369  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37561609 acttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 37561510  T
Q  370 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37561509 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgt 37561451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180292
Alignment:
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagcc 373  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaagaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagcc 31180237  T
Q  374 aatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180238 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 31180292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 38191983 - 38192252
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  38191983 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 38192077  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  38192078 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 38192174  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38192175 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 38192252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 38219208 - 38219477
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  38219208 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 38219302  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  38219303 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 38219399  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38219400 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 38219477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 2785197 - 2785453
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  2785197 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2785296  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2785297 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 2785393  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2785394 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 2785453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31397256 - 31397000
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || || ||  ||    
T  31397256 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatcctaag 31397157  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa---acaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| ||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31397156 cctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaa-aacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 31397060  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31397059 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 31397000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31402113 - 31401857
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  31402113 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 31402014  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31402013 cctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 31401917  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31401916 cagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 31401857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 426
Target Start/End: Original strand, 33791158 - 33791394
Alignment:
Q  195 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| ||||| ||    
T  33791158 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 33791257  T
Q  293 cacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 388  Q
    || | ||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33791258 catatagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 33791354  T
Q  389 --gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33791355 gggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 33791394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 426
Target Start/End: Original strand, 33768021 - 33768257
Alignment:
Q  195 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||   ||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| ||||| ||    
T  33768021 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 33768120  T
Q  293 cacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 388  Q
    || | ||||||||||||||||  || ||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33768121 catatagagctaacaagcata--caggataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 33768217  T
Q  389 --gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33768218 gggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 33768257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 426
Target Start/End: Original strand, 35387624 - 35387741
Alignment:
Q  313 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 409  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35387624 aaacgagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 35387723  T
Q  410 ccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    | | ||||| ||||||||    
T  35387724 ctactatgatgaaagtgt 35387741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 409
Target Start/End: Original strand, 24135659 - 24135909
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| | | |  || |||||||||||    
T  24135659 tgttgtgaatccggataaaactcacaccaatgaaa---ataaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaaga--gtctccaagcaaac 24135753  T
Q  256 aacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgaga 351  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| | ||| | ||||  |  |  ||  |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  24135754 aacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacaagataa--tacaaagca--aacaagataagctagaaaaggaagaacaaacacaccaaga 24135849  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  24135850 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaat 24135909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 31180079 - 31180142
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31180079 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--taacaatgatgtgtggagcaagagatagtg 31180142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353350
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 9353350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932368
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 36932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281830
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 10281830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464611
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 15464611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003987
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga 418  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17004057 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatga 17003987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11917005
Alignment:
Q  352 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcca 11917005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520309
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgt 14520309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588825
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 19588825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Original strand, 35387474 - 35387527
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  35387474 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 35387527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084193
Alignment:
Q  354 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 12084193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 28832259 - 28832323
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  28832259 aagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 28832323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 417 - 729
Target Start/End: Original strand, 28731138 - 28731450
Alignment:
Q  417 gagaaagtgtagagacgaaaccttgaaggccgtgaacaacaaccattccgttgttgaatagatccggttgagcaatctcaacgcctccgatgaaaacttt 516  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28731138 gagaaagcgtagaggcgaaaccttgaaggccgtgaacaacaaccattccgttgttgaatagatctggttgagtaatctcaacgcctccgatgaatacttt 28731237  T
Q  517 tggagcaccgccggtagtaatgttcgaatgaatcgaatcggaagtgacggttatgcaacggcctggactgagcgtctcgaccttggtgccaaaaggaagc 616  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||     
T  28731238 tggagcaccgccggaagtgctgttcggatgaatcgactcggaagtgacagttacgcaacggccgggactgagagtctcgatcttggtgccaaaagcaaga 28731337  T
Q  617 gtacgcaaatactcgatagtgaataaacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgaagcatcggagg 716  Q
       || | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||    
T  28731338 cgccggagatattcgatggtgaatatacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaaacaagtgcggatcgatgcatcagagg 28731437  T
Q  717 gagcgaaaatggt 729  Q
    |||||||||||||    
T  28731438 gagcgaaaatggt 28731450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 155 - 426
Target Start/End: Original strand, 51520257 - 51520535
Alignment:
Q  155 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 253  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51520257 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa 51520356  T
Q  254 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccga 349  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  51520357 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccga 51520456  T
Q  350 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520457 gaagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 51520535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 155 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 56146996 - 56146718
Alignment:
Q  155 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 253  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  56146996 ctgttgtgaatccggttccaaattcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaa 56146897  T
Q  254 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccga 349  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  56146896 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccga 56146797  T
Q  350 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146796 gaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 56146718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 3813846 - 3814102
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctaga 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||    
T  3813846 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctaga 3813945  T
Q  274 ctagtgtataac-aaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 371  Q
    |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  3813946 ctagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattgttgacccagttcag 3814045  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3814046 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgt 3814102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9224668 - 9224414
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9224668 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 9224569  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224568 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 9224470  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224469 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 9224414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9229455 - 9229201
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9229455 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 9229356  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9229355 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagc 9229257  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229256 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 9229201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 24741748 - 24742019
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  24741748 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaaca 24741843  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24741844 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 24741942  T
Q  353 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24741943 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 24742019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Original strand, 18855549 - 18855796
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  18855549 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 18855648  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18855649 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 18855748  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855749 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 18855796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 29760449 - 29760720
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||      
T  29760449 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaaca-aaatggtttccaagcaaca 29760545  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 352  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29760546 acaacaaaacaa-ccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 29760643  T
Q  353 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29760644 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 29760720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 45348079 - 45347824
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  || ||| |||||||    
T  45348079 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagac 45347980  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347979 tagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 45347881  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347880 ccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 45347824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 45357558 - 45357303
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  || ||| |||||||    
T  45357558 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagac 45357459  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357458 tagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 45357360  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357359 ccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 45357303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 5732486 - 5732743
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||  |    
T  5732486 tcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagc 5732584  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaac----aaaacaccg-agaagattgttgacccagt 367  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |   ||||| ||||||    ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  5732585 tagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagc--aaacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagt 5732682  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732683 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 5732743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28468660 - 28468547
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28468660 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatcca 28468562  T
Q  413 atatga-gaaagtgt 426  Q
     ||||| ||||||||    
T  28468561 ctatgatgaaagtgt 28468547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 317 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31985764 - 31985652
Alignment:
Q  317 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaa 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  31985764 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccac 31985666  T
Q  414 tatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||| ||||||||    
T  31985665 tatgatgaaagtgt 31985652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396689
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 5396689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 10047379 - 10047458
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  10047379 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 10047458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16623390 - 16623311
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16623390 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 16623311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 36315326 - 36315247
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36315326 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 36315247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 36329535 - 36329456
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36329535 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 36329456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 39245994 - 39246073
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  39245994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 39246073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 38152536 - 38152467
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38152536 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 38152467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5269288 - 5269209
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  5269288 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 5269209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 426
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143338
Alignment:
Q  352 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgt 5143338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743433
Alignment:
Q  356 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 6743433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9902 - 9649
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||      
T  9902 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaag 9803  T
Q  274 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagcc 373  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9802 ctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagcc 9704  T
Q  374 aatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9703 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 9649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 1
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 273  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||      
T  143 tcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagccctaag 50  T
Q  274 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 325  Q
    |||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  49 ctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcataaacaagataagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 8e-94; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24024589 - 24024333
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||   |||    
T  24024589 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcctatgac 24024490  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaag-aaaggaagaac-aaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 371  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24024489 tagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 24024390  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024389 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 24024333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 12396735 - 12396989
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12396735 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 12396834  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396835 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 12396933  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396934 caatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgt 12396989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 12406155 - 12406409
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12406155 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 12406254  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406255 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 12406353  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406354 caatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgt 12406409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 4866553 - 4866808
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  4866553 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagac 4866652  T
Q  275 tagtgtataac-aaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| || || | ||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866653 tagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 4866751  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866752 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 4866808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31109844 - 31109590
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||| ||    
T  31109844 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-ac 31109746  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31109745 tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 31109647  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109646 ccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 31109590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 20357837 - 20357566
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||    
T  20357837 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaac 20357742  T
Q  256 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgag 350  Q
    |||||   || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  20357741 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaataccaag 20357644  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357643 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 20357566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 19992135 - 19992391
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||  |    
T  19992135 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagc 19992234  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19992235 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 19992334  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19992335 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgt 19992391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 426
Target Start/End: Original strand, 2057763 - 2058044
Alignment:
Q  154 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  2057763 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaa 2057859  T
Q  254 acaacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaa----caagataagcaagaaa-ggaagaacaaaac 344  Q
    |||||||   || | |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||    |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2057860 acaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaac 2057959  T
Q  345 accgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2057960 accaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 2058044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21812501 - 21812254
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |    
T  21812501 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagc 21812402  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21812401 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 21812302  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21812301 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatg 21812254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 537 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 34876008 - 34875819
Alignment:
Q  537 tgttcgaatgaatcgaatcggaagtgacggttatgcaacggcctggactgagcgtctcgaccttggtgccaaaaggaagcgtacgcaaatactcgatagt 636  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    || | ||| ||||| ||    
T  34876008 tgttcggatgaatcgactcggaagtgatggttacgcaacggccgggactgagagtctcgatcttggtgccaaaagcaagtcgccggagatattcgatggt 34875909  T
Q  637 gaataaacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgaagcatcggagggagcgaaaat 726  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  34875908 gaatatacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgtgaagcgaagcatcaaagggagcaaaaat 34875819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1533730 - 1533462
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||      
T  1533730 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaagcaaca 1533636  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaa 352  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| | ||| | |||| | |||  ||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  1533635 acaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacaccacaaagagaa-tacaaagca--aacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaataa 1533539  T
Q  353 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1533538 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgt 1533462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 21645818 - 21646085
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |  ||  || |||||||||      
T  21645818 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagta--aagtgtctccaagcaaca 21645912  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaa 352  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| | ||||   ||||   ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21645913 acaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaa-acaaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaa 21646008  T
Q  353 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21646009 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 21646085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 313 - 412
Target Start/End: Original strand, 21639770 - 21639872
Alignment:
Q  313 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21639770 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 21639869  T
Q  410 cca 412  Q
    |||    
T  21639870 cca 21639872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24266466 - 24266209
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  24266466 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 24266367  T
Q  272 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24266366 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 24266270  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24266269 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 24266209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 313 - 426
Target Start/End: Original strand, 18408726 - 18408842
Alignment:
Q  313 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18408726 aaacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18408824  T
Q  410 ccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  18408825 ccagtatgatgaaagtgt 18408842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Original strand, 18413606 - 18413718
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaa 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18413606 caagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggagagagcagctctccaatccac 18413704  T
Q  414 tatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||| ||||||||    
T  18413705 tatgatgaaagtgt 18413718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24261587 - 24261330
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  24261587 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 24261488  T
Q  272 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24261487 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 24261391  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24261390 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 24261330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Original strand, 16879894 - 16880142
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  16879894 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 16879993  T
Q  272 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16879994 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 16880090  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880091 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 16880142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Original strand, 16884750 - 16884998
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  16884750 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 16884849  T
Q  272 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16884850 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 16884946  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884947 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 16884998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263755
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 47263755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 29159803 - 29159882
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29159803 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 29159882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 426
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983363
Alignment:
Q  352 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 21983363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 46516407 - 46516328
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  46516407 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 46516328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091740
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgt 49091740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 55948 - 56026
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  55948 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 56026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9190105 - 9190041
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9190105 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 9190041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 20284089 - 20284153
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20284089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 20284153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 412
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988970
Alignment:
Q  352 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagcaactctccaatcca 21988970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848702
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 44848702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479415
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggggagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgt 2479415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 231
Target Start/End: Original strand, 2479148 - 2479221
Alignment:
Q  156 tgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 231  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  2479148 tgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 2479221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 2580390 - 2580454
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2580390 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 2580454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 33332547 - 33332483
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  33332547 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 33332483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Original strand, 47263485 - 47263562
Alignment:
Q  152 cttctgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 231  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  47263485 cttctgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgcgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 47263562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 154 - 426
Target Start/End: Original strand, 7167049 - 7167323
Alignment:
Q  154 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  7167049 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaa 7167145  T
Q  254 --acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7167146 caacaacaaaac-agccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaag 7167244  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7167245 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 7167323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22173456 - 22173202
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  22173456 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 22173357  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173356 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 22173258  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173257 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 22173202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2671876 - 2671604
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  2671876 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaac 2671781  T
Q  256 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 351  Q
    |||||   || ||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2671780 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 2671682  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2671681 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 2671604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8739354 - 8739081
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa- 254  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  8739354 tgttgtgaattcggttgagactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaat 8739259  T
Q  255 --caacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
      |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8739258 aacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaag 8739160  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8739159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 8739081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9091592 - 9091319
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa- 254  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  9091592 tgttgtgaattcggttgagactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaat 9091497  T
Q  255 --caacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
      |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9091496 aacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaag 9091398  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9091397 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 9091319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28504145 - 28503883
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||      
T  28504145 tgttgtgaatccggtcttaactcacaccaatgaat--aacaatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagcaaca 28504049  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 352  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  28504048 acaacaaaac-agcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaaga---------aaggaagaacaaaacaccgagaa 28503959  T
Q  353 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503958 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 28503883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 18656256 - 18656513
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||  |    
T  18656256 tcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagc 18656354  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaac----aaaacaccg-agaagattgttgacccagt 367  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |   ||||| ||||||    ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  18656355 tagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagc--aaacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagt 18656452  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656453 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 18656513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 426
Target Start/End: Original strand, 8477170 - 8477441
Alignment:
Q  155 ctgttgtgattccggt-tgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 253  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||||||    
T  8477170 ctgttgtgaatccggtataaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaa-gtttcccaagcaa 8477265  T
Q  254 --acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgag 350  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | |  ||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  8477266 caacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaacaccacaaagataa-tacaaagca--aacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaag 8477362  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8477363 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 8477441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2677351 - 2677094
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  2677351 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2677252  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagat-aagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |||| |  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2677251 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat-aacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttgacccagtt 2677154  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2677153 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 2677094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 313 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 40372929 - 40372813
Alignment:
Q  313 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40372929 aaacaagataagcaagataggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 40372830  T
Q  411 caatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||| ||||||||    
T  40372829 caatatgatgaaagtgt 40372813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2673195 - 2672938
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  2673195 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2673096  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  2673095 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagtt 2672998  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2672997 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 2672938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 8512037 - 8512295
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  8512037 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 8512136  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataag-caagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
     ||| ||| || || || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||  | | ||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8512137 cctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 8512234  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8512235 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 8512295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 8516917 - 8517175
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  8516917 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 8517016  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataag-caagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
     ||| ||| || || || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||  | | ||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8517017 cctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 8517114  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8517115 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 8517175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 397
Target Start/End: Original strand, 10207755 - 10207981
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  10207755 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 10207854  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagat-aagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |||| |  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10207855 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat-aacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttgacccagtt 10207952  T
Q  369 cagccaatatggcctaatctgggagagag 397  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10207953 cagccaatgtggcctaatctgggggagag 10207981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 412
Target Start/End: Original strand, 1305914 - 1306012
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1305914 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatcca 1306012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 426
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968185
Alignment:
Q  203 tgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaaga 300  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaaga 24968056  T
Q  301 gctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggaga 394  Q
    |||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||    
T  24968057 gctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggaga 24968153  T
Q  395 gagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24968154 gagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 24968185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Original strand, 32475306 - 32475554
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||| | || ||||||  || |||||  |    
T  32475306 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcctaa 32475405  T
Q  272 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32475406 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 32475502  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475503 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 32475554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Original strand, 32480163 - 32480412
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa--caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagccct 270  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||| | || ||||||  || |||||      
T  32480163 tcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagccta 32480262  T
Q  271 agactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 366  Q
    || ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  32480263 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttgacccag 32480359  T
Q  367 ttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480360 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 32480412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26928721 - 26928609
Alignment:
Q  317 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaa 413  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  26928721 aagataagctagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccac 26928623  T
Q  414 tatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||| ||||||||    
T  26928622 tatgatgaaagtgt 26928609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40373085 - 40372986
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  40373085 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaac 40372990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 426
Target Start/End: Original strand, 32143287 - 32143400
Alignment:
Q  317 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32143287 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 32143385  T
Q  413 atatga-gaaagtgt 426  Q
     ||||| ||||||||    
T  32143386 ctatgatgaaagtgt 32143400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 317 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27986567 - 27986454
Alignment:
Q  317 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27986567 aagataagcaagaaagaatgaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 27986469  T
Q  413 atatga-gaaagtgt 426  Q
     ||||| ||||||||    
T  27986468 ctatgatgaaagtgt 27986454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 375
Target Start/End: Original strand, 1309819 - 1309878
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1309819 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaagattgttgacccagttcagccaa 1309878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370494
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 8370494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974960
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 27974960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 426
Target Start/End: Original strand, 27452924 - 27453037
Alignment:
Q  317 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  27452924 aagataagcaagaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatcca 27453022  T
Q  413 atatga-gaaagtgt 426  Q
     ||||| ||||||||    
T  27453023 ctatgatgaaagtgt 27453037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264429
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 16264429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552891
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 18552891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 21711223 - 21711302
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  21711223 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgt 21711302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386674
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 33386674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709807
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga 418  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatga 30709807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 352 - 426
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029172
Alignment:
Q  352 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagaga--gcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 36029172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501716
Alignment:
Q  392 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 28501716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736313
Alignment:
Q  354 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 1736313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 3716089 - 3716010
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  3716089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgt 3716010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 40592869 - 40592790
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  40592869 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgt 40592790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795843
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatc 410  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 25795843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1417577 - 1417513
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  1417577 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatcca 1417513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22010958 - 22010704
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  22010958 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagac 22010859  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 372  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010858 aagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 22010760  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010759 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 22010704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Original strand, 6438324 - 6438570
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  ||    
T  6438324 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagct 6438423  T
Q  276 agtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagc 372  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6438424 agtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagc 6438523  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438524 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 6438570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 14737838 - 14737583
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  14737838 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 14737739  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacac-aaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14737738 tagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgatccagttcag 14737640  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737639 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 14737583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 14742697 - 14742443
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  14742697 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagccctagac 14742598  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742597 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 14742499  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742498 caatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 14742443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 11856795 - 11857052
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  11856795 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 11856894  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaac---aaaacaccgagaagattgttgacccagttc 369  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| |||| |  |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11856895 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttc 11856993  T
Q  370 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856994 agccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 11857052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 28184325 - 28184583
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaa--tggtttccaagcaaacaacaa--aaccagcccta 271  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  28184325 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 28184424  T
Q  272 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagca--agaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagtt 368  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184425 gactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagtt 28184523  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28184524 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgt 28184583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28155832 - 28155576
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||  ||| |||||   |||    
T  28155832 tcacaccaatgcaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagcctatgac 28155733  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 371  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   |||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28155732 ttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 28155633  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155632 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 28155576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5675057 - 5674788
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||||||      
T  5675057 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaa-gtttcccaagcaaca 5674962  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaa 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||| | |||  ||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |    
T  5674961 acaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccacaaagagaa-tacaaagca--aacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaaaga 5674865  T
Q  353 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5674864 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 5674788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 6005239 - 6005495
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  6005239 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 6005338  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6005339 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 6005435  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6005436 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 6005495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 16838566 - 16838822
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  | ||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  16838566 tcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 16838665  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16838666 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 16838762  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16838763 cagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 16838822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33330690 - 33330452
Alignment:
Q  195 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagc- 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| ||||| |     
T  33330690 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaacc 33330591  T
Q  292 acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 387  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33330590 acactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 33330493  T
Q  388 t--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33330492 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 33330452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33336207 - 33335949
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||| | ||||||||  || |||||  ||    
T  33336207 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagcctaag 33336108  T
Q  273 actagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
     ||| ||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  33336107 cctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagt 33336010  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33336009 tcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 33335949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 388
Target Start/End: Original strand, 5343322 - 5343519
Alignment:
Q  195 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagc- 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  || |||  ||||| ||||| |     
T  5343322 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaaagtatagcaaaaacc 5343421  T
Q  292 acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 387  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5343422 acactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 5343518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30126084 - 30125940
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||    
T  30126084 tgttgtgaatccggttgaaaatcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgagc-caaatggtctccaagctaac 30125989  T
Q  256 ---aacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagag 301  Q
       ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  30125988 tacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757496
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 5757496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356115
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 21356115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 426
Target Start/End: Original strand, 22708984 - 22709097
Alignment:
Q  317 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||| |  |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22708984 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaaaattgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 22709082  T
Q  413 atatga-gaaagtgt 426  Q
     ||||| ||||||||    
T  22709083 ctatgatgaaagtgt 22709097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31086570 - 31086491
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31086570 aagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgt 31086491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630018
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatcca 4630018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5572338 - 5572259
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  5572338 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 5572259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10077262 - 10077183
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  10077262 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 10077183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 22963700 - 22963778
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  22963700 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 22963778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23824693 - 23824615
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  23824693 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 23824615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 31936587 - 31936651
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggaga--gagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31936587 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 31979513 - 31979577
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  31979513 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatcca 31979577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 44312885 - 44312631
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  44312885 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagac 44312786  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 372  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312785 aagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 44312687  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312686 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 44312631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 154 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 11099219 - 11098945
Alignment:
Q  154 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  11099219 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa 11099123  T
Q  254 --acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11099122 caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataaggaagaaaggaagaacaaaacaccaag 11099024  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11099023 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 11098945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 14291295 - 14291567
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  14291295 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaac 14291390  T
Q  256 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 351  Q
    |||||   || ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14291391 aacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 14291489  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14291490 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 14291567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9296691 - 9296419
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  9296691 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaac 9296596  T
Q  256 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 351  Q
    |||||   || ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9296595 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 9296497  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9296496 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 9296419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 32246607 - 32246866
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||| ||||||    
T  32246607 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtcctaga 32246706  T
Q  274 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa----ggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||    
T  32246707 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccttgt 32246805  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246806 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 32246866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 39812250 - 39811995
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 273  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||      
T  39812250 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 39812151  T
Q  274 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 371  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39812150 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgaaccagttcag 39812052  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812051 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 39811995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 19344243 - 19344499
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 273  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||     
T  19344243 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagc 19344342  T
Q  274 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 369  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19344343 ctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 19344440  T
Q  370 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19344441 agccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 19344499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 19349101 - 19349357
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 273  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||     
T  19349101 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagc 19349200  T
Q  274 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 369  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19349201 ctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 19349298  T
Q  370 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19349299 agccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 19349357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 25398305 - 25398574
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  25398305 tgttgtgaatctggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 25398399  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  25398400 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 25398496  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25398497 agattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 25398574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Original strand, 25403443 - 25403712
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  25403443 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 25403537  T
Q  254 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  25403538 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 25403634  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25403635 agattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 25403712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Original strand, 3491716 - 3491829
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3491716 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 3491814  T
Q  413 atatga-gaaagtgt 426  Q
     ||||| ||||||||    
T  3491815 ctatgatgaaagtgt 3491829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 317 - 426
Target Start/End: Original strand, 40738810 - 40738921
Alignment:
Q  317 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaat 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  40738810 aagataagctagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggggagagcagctctccaatccact 40738908  T
Q  415 atga-gaaagtgt 426  Q
    |||| ||||||||    
T  40738909 atgatgaaagtgt 40738921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 21629944 - 21630022
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21629944 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 21630022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040139
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 8040139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 354 - 426
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569407
Alignment:
Q  354 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 13569407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259195
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 28259195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 14699104 - 14699034
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga 418  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||    
T  14699104 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatga 14699034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10445541 - 10445477
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10445541 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 10445477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34682431 - 34682367
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34682431 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatcca 34682367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865282
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgt 17865282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 20522220 - 20522299
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20522220 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgt 20522299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 426
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388937
Alignment:
Q  352 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgt 34388937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390168
Alignment:
Q  354 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 8390168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056108
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatcca 31056108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 35323 - 35069
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  35323 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 35224  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35223 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagc 35125  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35124 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 35069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25445352 - 25445096
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  25445352 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 25445253  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25445252 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 25445153  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445152 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 25445096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 44024135 - 44023889
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  44024135 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 44024036  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagc 372  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44024035 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagc 44023936  T
Q  373 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023935 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 44023889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Original strand, 39445322 - 39445569
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  39445322 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 39445421  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39445422 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 39445521  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445522 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 39445569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Original strand, 41398060 - 41398314
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-----aaccagccct 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     || |||||||    
T  41398060 tcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagccct 41398159  T
Q  271 agactagtgtataacaaaag--cacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagt 367  Q
    | ||||||||||| |||||   ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41398160 a-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagg 41398253  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398254 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 41398314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1055274 - 1055027
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| || ||||||||  |    
T  1055274 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagc 1055175  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1055174 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 1055075  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1055074 ccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatg 1055027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24787624 - 24787383
Alignment:
Q  192 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-----acaacaaaac-cagccctagactagtgtataac 285  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||     |||||||||  ||||||||||||  |||| | |    
T  24787624 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagc 24787526  T
Q  286 aaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 383  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787525 aaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 24787428  T
Q  384 aatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787427 aatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 24787383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 537 - 726
Target Start/End: Original strand, 31529212 - 31529401
Alignment:
Q  537 tgttcgaatgaatcgaatcggaagtgacggttatgcaacggcctggactgagcgtctcgaccttggtgccaaaaggaagcgtacgcaaatactcgatagt 636  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||    || | ||| ||||| ||    
T  31529212 tgttcggatgaatcgactcggaagtgacggttacgcaacggccgggactgagagtctcaatcttggtgccaaaagcaagtcgccggagatattcgatggt 31529311  T
Q  637 gaataaacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgaagcatcggagggagcgaaaat 726  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31529312 gaatatacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgaagcatcagagggagcgaaaat 31529401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 537 - 726
Target Start/End: Original strand, 51801280 - 51801469
Alignment:
Q  537 tgttcgaatgaatcgaatcggaagtgacggttatgcaacggcctggactgagcgtctcgaccttggtgccaaaaggaagcgtacgcaaatactcgatagt 636  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    || |  || | ||| ||    
T  51801280 tgttcggatgaatcgaatcggaagtgacgattacgcaacggccgggactgagagtctcgatcttggtgccaaaagcaagtcgccggaggtatttgatggt 51801379  T
Q  637 gaataaacctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacagagcaagaaaagcaagtgcgaagcgaagcatcggagggagcgaaaat 726  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51801380 gaatatatctggaacgatgtgttcacggaggagattcggaacacagcaagaaaagcaagtgtgaagcgaagtatcagagggagcgaaaat 51801469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 253 - 426
Target Start/End: Original strand, 41390488 - 41390659
Alignment:
Q  253 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaag--cacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccga 349  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||    
T  41390488 aacaacaaaac-agcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacatcga 41390580  T
Q  350 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390581 gaagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 41390659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 43988709 - 43988471
Alignment:
Q  195 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| || || ||    
T  43988709 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 43988610  T
Q  293 cacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct- 388  Q
    ||| ||||||||||||||||| |  | | || || |||| |||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  43988609 cactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctg 43988510  T
Q  389 -gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43988509 ggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 43988471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24203054 - 24202787
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||||    
T  24203054 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaac 24202960  T
Q  256 aacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaa 352  Q
    |||||  || |||||||| ||||||||| | ||| | |||| | |||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24202959 aacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca-agagaa-tacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaa 24202864  T
Q  353 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24202863 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 24202787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 255
Target Start/End: Original strand, 41386571 - 41386650
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41386571 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 41386650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361450
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19361466  T
Q  412 aatatga-gaaagtgt 426  Q
    | ||||| ||||||||    
T  19361465 actatgatgaaagtgt 19361450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19380090
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19380106  T
Q  412 aatatga-gaaagtgt 426  Q
    | ||||| ||||||||    
T  19380105 actatgatgaaagtgt 19380090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19358975 - 19358861
Alignment:
Q  316 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19358975 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacatcaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19358877  T
Q  412 aatatga-gaaagtgt 426  Q
    | ||||| ||||||||    
T  19358876 actatgatgaaagtgt 19358861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644915
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgt 26644915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 47704033 - 47703954
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47704033 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 47703954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 418
Target Start/End: Original strand, 9476261 - 9476331
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga 418  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9476261 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatga 9476331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19072992
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 19072992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120882
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 19120882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281772
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 3281772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 13598398 - 13598477
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  13598398 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgt 13598477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16124613 - 16124534
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16124613 aagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgt 16124534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27104469 - 27104390
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27104469 aagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 27104390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 29651811 - 29651890
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  29651811 aagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgt 29651890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069849
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgt 37069849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19359132 - 19359079
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  19359132 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 19359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 775672 - 775736
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  775672 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatcca 775736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 47098921 - 47098857
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  47098921 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatcca 47098857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Original strand, 185 - 432
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 274  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  185 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 284  T
Q  275 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 371  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  285 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 384  T
Q  372 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  385 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 528 - 300
Alignment:
Q  155 ctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa- 253  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  528 ctgttgtgaatccatttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaac 432  T
Q  254 -acaacaaaac-cagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 350  Q
     |||||||||  |||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  431 aacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaagaaagaacaaaacaccaag 333  T
Q  351 aagattgttgacccagttcagccaatatggcct 383  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  332 aagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 149219 - 148963
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  149219 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 149120  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  149119 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 149023  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  149022 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 148963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2514 - 2258
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  2514 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2415  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2414 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 2318  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2317 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 2258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24331 - 24063
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  24331 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 24237  T
Q  254 acaacaaaa-ccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||   ||||   ||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |    
T  24236 acaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaaga-aaacaagataagaaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 24141  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24140 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 24063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 18238 - 17970
Alignment:
Q  156 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  18238 tgttgtgaatccggttaaaactcaaaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 18144  T
Q  254 acaacaaaa-ccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||| | |||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  18143 acaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca-agagaa-tacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 18048  T
Q  352 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18047 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 17970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19428 - 19181
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 272  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  19428 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 19329  T
Q  273 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 368  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | | ||| |||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19328 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagtt 19232  T
Q  369 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19231 cagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatg 19181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 14573 - 14316
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  14573 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 14474  T
Q  272 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14473 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 14377  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 426  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14376 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 14316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 182228 - 181980
Alignment:
Q  177 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  182228 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 182129  T
Q  272 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 367  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  182128 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 182032  T
Q  368 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 417  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  182031 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34211 - 34132
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34211 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13233
Alignment:
Q  177 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13171 tcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8437
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 8437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 412
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85747
Alignment:
Q  352 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatcca 85747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43979
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgt 43979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44247 - 44174
Alignment:
Q  156 tgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 231  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  44247 tgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 44174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Original strand, 5683 - 5762
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  5683 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgt 5762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 418
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45323
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga 418  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatga 45323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0082 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0082
Description:

Target: scaffold0082; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 486
Target Start/End: Original strand, 34106 - 34165
Alignment:
Q  427 agagacgaaaccttgaaggccgtgaacaacaaccattccgttgttgaatagatccggttg 486  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  34106 agagatgaaaccttgaaggccatgaataaccaccatgccgttgttgaagagatcaggttg 34165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 412
Target Start/End: Original strand, 10729 - 10793
Alignment:
Q  351 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 412  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  10729 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatcca 10793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University