View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1358_low_14 (Length: 602)

Name: NF1358_low_14
Description: NF1358
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1358_low_14
NF1358_low_14
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (111-593)||(24206349-24206833)
chr2 (111-593)||(6784106-6784581)
chr2 (174-582)||(14387923-14388331)
chr2 (145-589)||(2767799-2768235)
chr2 (174-589)||(6798420-6798827)
chr2 (177-589)||(17697124-17697528)
chr2 (192-584)||(34401010-34401394)
chr2 (248-589)||(44708644-44708977)
chr2 (174-475)||(16763860-16764153)
chr2 (314-581)||(42518258-42518525)
chr2 (192-479)||(39456091-39456370)
chr2 (178-383)||(19907308-19907504)
chr2 (118-348)||(40561083-40561305)
chr2 (311-433)||(4047377-4047499)
chr2 (309-433)||(20941733-20941856)
chr2 (119-232)||(37021388-37021501)
chr2 (481-589)||(39663887-39663995)
chr2 (311-433)||(26581545-26581667)
chr2 (311-433)||(161432-161554)
chr2 (363-430)||(38149339-38149406)
chr2 (355-426)||(7744707-7744778)
chr2 (286-349)||(19581960-19582023)
chr2 (490-535)||(11022125-11022170)
chr2 (490-535)||(28247629-28247674)
chr2 (311-385)||(11313399-11313473)
chr2 (547-589)||(19581912-19581954)
chr2 (490-535)||(38149490-38149535)
chr2 (495-535)||(10715876-10715916)
chr2 (405-433)||(11022252-11022280)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (111-593)||(15307124-15307598)
chr8 (111-593)||(15487493-15487967)
chr8 (111-593)||(27404962-27405435)
chr8 (116-593)||(29238031-29238500)
chr8 (174-589)||(41041407-41041813)
chr8 (174-589)||(40338495-40338909)
chr8 (174-479)||(5037331-5037628)
chr8 (118-426)||(27692005-27692305)
chr8 (174-426)||(33707795-33708039)
chr8 (185-434)||(13485114-13485351)
chr8 (240-457)||(3152485-3152702)
chr8 (174-348)||(22273154-22273328)
chr8 (118-348)||(42942633-42942855)
chr8 (449-589)||(9672123-9672263)
chr8 (309-433)||(11720354-11720478)
chr8 (116-219)||(600809-600912)
chr8 (116-220)||(33761642-33761746)
chr8 (311-430)||(12515887-12516006)
chr8 (116-220)||(35510253-35510357)
chr8 (174-349)||(7744193-7744360)
chr8 (543-590)||(7744143-7744190)
chr8 (543-590)||(26239454-26239501)
chr8 (363-430)||(28432939-28433006)
chr8 (363-433)||(25371236-25371306)
chr8 (543-589)||(41824684-41824730)
chr8 (174-349)||(26239504-26239671)
chr8 (240-349)||(41824733-41824834)
chr8 (214-286)||(9672292-9672364)
chr8 (311-394)||(24285797-24285880)
chr8 (490-535)||(28432810-28432855)
chr8 (490-535)||(40019748-40019793)
chr8 (391-433)||(10770940-10770982)
chr8 (118-203)||(8609007-8609092)
chr8 (355-427)||(44620116-44620188)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (111-593)||(42472301-42472775)
chr5 (174-593)||(21841896-21842308)
chr5 (249-589)||(28821364-28821696)
chr5 (118-589)||(2180613-2181073)
chr5 (332-593)||(17577011-17577273)
chr5 (332-593)||(17574980-17575242)
chr5 (332-593)||(17575700-17575962)
chr5 (328-589)||(18624137-18624398)
chr5 (118-426)||(2853253-2853553)
chr5 (174-383)||(12800823-12801023)
chr5 (118-369)||(30464679-30464922)
chr5 (174-383)||(12738000-12738200)
chr5 (174-348)||(8540566-8540732)
chr5 (174-348)||(32134897-32135063)
chr5 (472-590)||(34328108-34328226)
chr5 (119-232)||(40781430-40781543)
chr5 (311-430)||(1344229-1344348)
chr5 (119-231)||(29620912-29621024)
chr5 (311-433)||(28036377-28036499)
chr5 (313-430)||(1343744-1343861)
chr5 (364-426)||(18341213-18341275)
chr5 (174-231)||(28821275-28821332)
chr5 (355-427)||(27349967-27350039)
chr5 (254-290)||(41494555-41494591)
chr5 (490-535)||(42619875-42619920)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (174-593)||(26224363-26224782)
chr1 (174-593)||(27088183-27088592)
chr1 (174-593)||(33599961-33600381)
chr1 (174-589)||(50554925-50555331)
chr1 (118-479)||(25277299-25277660)
chr1 (174-589)||(15105341-15105748)
chr1 (174-463)||(6817664-6817945)
chr1 (174-479)||(45045435-45045732)
chr1 (174-479)||(37345231-37345528)
chr1 (374-589)||(37087316-37087531)
chr1 (118-426)||(46582573-46582873)
chr1 (174-348)||(3012516-3012682)
chr1 (118-369)||(31237556-31237791)
chr1 (174-348)||(51895228-51895394)
chr1 (174-290)||(2870494-2870610)
chr1 (119-232)||(9120813-9120926)
chr1 (116-220)||(8168514-8168618)
chr1 (127-232)||(1443408-1443513)
chr1 (119-232)||(47012213-47012326)
chr1 (364-433)||(42558848-42558917)
chr1 (311-433)||(3369967-3370089)
chr1 (543-589)||(52642649-52642695)
chr1 (174-349)||(52642698-52642865)
chr1 (355-427)||(51122987-51123059)
chr1 (490-535)||(5784321-5784366)
chr1 (118-203)||(34777337-34777422)
chr1 (546-589)||(6817623-6817666)
chr1 (490-535)||(11153136-11153181)
chr1 (364-433)||(32086004-32086073)
chr1 (405-433)||(5784211-5784239)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (118-593)||(18644112-18644587)
chr6 (174-593)||(32437900-32438309)
chr6 (174-589)||(7371806-7372212)
chr6 (198-589)||(11356119-11356497)
chr6 (174-479)||(32517766-32518063)
chr6 (306-589)||(9399137-9399420)
chr6 (118-426)||(20524226-20524526)
chr6 (254-480)||(33267809-33268027)
chr6 (447-584)||(20524587-20524724)
chr6 (127-232)||(32455022-32455127)
chr6 (254-349)||(10569375-10569462)
chr6 (174-349)||(7050654-7050821)
chr6 (365-433)||(17935548-17935616)
chr6 (214-290)||(6902085-6902161)
chr6 (543-586)||(7050824-7050867)
chr6 (543-589)||(10569465-10569511)
chr6 (543-588)||(6902215-6902260)
chr6 (490-535)||(34344779-34344824)
chr6 (490-531)||(17951156-17951197)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (174-593)||(51012822-51013233)
chr4 (174-589)||(11254753-11255159)
chr4 (174-589)||(35402493-35402897)
chr4 (118-501)||(41760637-41761012)
chr4 (174-480)||(49524027-49524325)
chr4 (254-532)||(2692165-2692435)
chr4 (111-370)||(834096-834347)
chr4 (174-426)||(43520333-43520577)
chr4 (310-589)||(11641112-11641391)
chr4 (372-589)||(41760422-41760638)
chr4 (111-370)||(5438616-5438863)
chr4 (174-410)||(42981515-42981743)
chr4 (475-593)||(5438863-5438984)
chr4 (475-593)||(833975-834096)
chr4 (438-589)||(42981746-42981897)
chr4 (116-220)||(319845-319949)
chr4 (116-220)||(4172685-4172789)
chr4 (116-220)||(33265422-33265526)
chr4 (116-220)||(43508065-43508169)
chr4 (174-349)||(48645809-48645976)
chr4 (363-430)||(32652934-32653001)
chr4 (311-433)||(28101484-28101606)
chr4 (363-433)||(4614585-4614655)
chr4 (320-433)||(7150446-7150559)
chr4 (214-349)||(54387076-54387203)
chr4 (543-589)||(54387206-54387252)
chr4 (543-589)||(48645760-48645806)
chr4 (490-534)||(44993401-44993445)
chr4 (378-433)||(27385571-27385626)
chr4 (376-430)||(13449570-13449624)
chr4 (490-535)||(32653085-32653130)
chr4 (490-535)||(39190273-39190318)
chr4 (490-535)||(39922461-39922506)
chr4 (490-535)||(42879876-42879921)
chr4 (490-535)||(43778979-43779024)
chr4 (355-417)||(10544170-10544232)
chr4 (240-290)||(11641016-11641066)
chr4 (174-220)||(41782417-41782463)
chr4 (490-535)||(5485506-5485551)
chr4 (490-535)||(39084606-39084651)
chr4 (189-218)||(43507646-43507675)
chr4 (490-530)||(10544259-10544299)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (174-593)||(53188518-53188929)
chr3 (120-589)||(27897937-27898397)
chr3 (118-589)||(30599030-30599492)
chr3 (174-589)||(46198634-46199041)
chr3 (174-585)||(21349609-21350012)
chr3 (174-584)||(44275045-44275445)
chr3 (118-524)||(17516169-17516565)
chr3 (174-584)||(43766036-43766438)
chr3 (174-475)||(54899348-54899649)
chr3 (118-589)||(2377855-2378311)
chr3 (310-593)||(35904567-35904850)
chr3 (118-410)||(2225165-2225457)
chr3 (118-426)||(2661073-2661373)
chr3 (118-426)||(44795058-44795358)
chr3 (214-457)||(610549-610784)
chr3 (214-457)||(46113422-46113657)
chr3 (174-348)||(23292232-23292398)
chr3 (118-279)||(35904849-35905010)
chr3 (313-432)||(13466205-13466324)
chr3 (116-220)||(38192456-38192560)
chr3 (116-220)||(53093196-53093300)
chr3 (116-217)||(46609724-46609825)
chr3 (116-220)||(46309848-46309952)
chr3 (365-433)||(32843436-32843504)
chr3 (366-433)||(23876220-23876287)
chr3 (363-430)||(41945412-41945479)
chr3 (327-433)||(35862440-35862546)
chr3 (254-349)||(48829886-48829973)
chr3 (214-349)||(51685546-51685673)
chr3 (452-589)||(13466364-13466507)
chr3 (543-589)||(42281798-42281844)
chr3 (543-589)||(48829837-48829883)
chr3 (363-416)||(2976359-2976412)
chr3 (214-290)||(42280443-42280519)
chr3 (543-585)||(51685676-51685718)
chr3 (355-427)||(49495067-49495139)
chr3 (490-535)||(37886367-37886412)
chr3 (491-531)||(2976210-2976250)
chr3 (363-427)||(33050905-33050969)
chr3 (118-203)||(41978587-41978672)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (118-590)||(38472946-38473409)
chr7 (120-589)||(22154741-22155202)
chr7 (120-589)||(22210656-22211117)
chr7 (118-593)||(35692168-35692635)
chr7 (145-589)||(45360203-45360638)
chr7 (118-589)||(46438331-46438795)
chr7 (118-586)||(34775788-34776246)
chr7 (174-589)||(47385029-47385444)
chr7 (174-589)||(24227243-24227650)
chr7 (174-463)||(6604420-6604701)
chr7 (174-431)||(23905232-23905481)
chr7 (295-485)||(69132-69322)
chr7 (174-426)||(27665031-27665275)
chr7 (174-426)||(29995501-29995745)
chr7 (286-532)||(48310947-48311194)
chr7 (178-383)||(39858271-39858467)
chr7 (174-348)||(37114591-37114757)
chr7 (118-290)||(13168922-13169094)
chr7 (490-593)||(77260-77363)
chr7 (447-589)||(48851293-48851435)
chr7 (311-433)||(11683621-11683743)
chr7 (119-232)||(20478921-20479034)
chr7 (311-434)||(32840488-32840610)
chr7 (363-430)||(4321800-4321867)
chr7 (311-418)||(7402914-7403021)
chr7 (313-416)||(23168648-23168751)
chr7 (116-220)||(35402544-35402647)
chr7 (355-427)||(34784575-34784647)
chr7 (363-430)||(34691871-34691938)
chr7 (118-212)||(69040-69134)
chr7 (356-433)||(40360951-40361028)
chr7 (355-421)||(13035927-13035993)
chr7 (543-589)||(38550267-38550313)
chr7 (254-349)||(38550316-38550419)
chr7 (366-430)||(48302873-48302936)
chr7 (432-479)||(23905122-23905169)
chr7 (240-287)||(37792150-37792197)
chr7 (490-535)||(30109185-30109230)
chr7 (546-589)||(6604699-6604742)
chr7 (344-383)||(13169123-13169162)
chr7 (490-535)||(48302744-48302789)
chr7 (355-427)||(1547112-1547184)
chr7 (363-403)||(27956815-27956855)
chr7 (491-535)||(34692023-34692067)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (198-589)||(472-858)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (174-478)||(9164-9460)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (174-589)||(107409-107814)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (286-530)||(1401-1643)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (174-262)||(4199-4287)
scaffold0058 (174-262)||(5371-5459)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24206833 - 24206349
Alignment:
Q  111 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnn--actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206833 atgtccaaaggatcaaattgatttctgttataataattcaaggaccaatttgatgatttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatat 24206734  T
Q  209 aattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  24206733 aattcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggactta 24206634  T
Q  309 gcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcca 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24206633 gaacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacataatcaactttatcca 24206534  T
Q  409 tcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcc 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206533 tcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattttttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcc 24206434  T
Q  509 taattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206433 taattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 24206349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6784581 - 6784106
Alignment:
Q  111 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnn-actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatata 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6784581 atgtccaaaggatccaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgtttttttttactaatttaaagatcgaaatgatggatatgaatata 6784482  T
Q  210 attcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttgg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||    
T  6784481 attcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttgg 6784390  T
Q  310 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6784389 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagttcacttcctaaacaatcaactttatccat 6784290  T
Q  410 caaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcct 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6784289 caaccttgccctccaaacctcttctttgcccctatcatttggcttctcgatcaactttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaatagcct 6784190  T
Q  510 aattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    |||||||||||||||||||||||  |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6784189 aattcttcagcttcatcaacccaaccaaaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 6784106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 174 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 14388331 - 14387923
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388331 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaagtttttttacataaaggtttgattcattcattgacaacctc 14388232  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14388231 ttttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 14388132  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14388131 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttagcttctccatcaaccttgcattt 14388032  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14388031 cttccattaccagcaccattgtttttaaaatagcctaattcctcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctgtacaatca 14387932  T
Q  574 aaagacaaa 582  Q
    |||||||||    
T  14387931 aaagacaaa 14387923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 145 - 589
Target Start/End: Original strand, 2767799 - 2768235
Alignment:
Q  145 aattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacag 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||     
T  2767799 aattcaaggaccaatttgatggtattttcactaaattgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaatttttttgacat 2767898  T
Q  245 aaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaa 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2767899 aaaggttttattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatgggtttggcacaatacaatagcattttaaacaacttaatcaaa 2767990  T
Q  345 caaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctat 444  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2767991 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagcttacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 2768090  T
Q  445 catttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnntt 544  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||    
T  2768091 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaattt 2768190  T
Q  545 acaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2768191 acaattttcaccatcatcctatataatcaaaagacaaaaccagta 2768235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Original strand, 6798420 - 6798827
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6798420 actaatttgaggatcgatttgatgaatatgtatacaattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacagaaaggtttgactcattcattgacaacctc 6798519  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6798520 ttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 6798611  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  6798612 cctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatctcttggcttctccgtcaaccttgcattt 6798711  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6798712 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctagttcgtcagcttcatcaacctacacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 6798811  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  6798812 aaagacaaaatcagta 6798827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 177 - 589
Target Start/End: Original strand, 17697124 - 17697528
Alignment:
Q  177 aatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttt 276  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17697124 aattttaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccagtttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcgttgacaacctcttt 17697223  T
Q  277 tcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacct 376  Q
    |||| ||||||        ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  17697224 tcataacaaca--------ttacatggacttggcataatacaatagcattttaaacaattcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaactt 17697315  T
Q  377 aagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttctt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17697316 aagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttctt 17697415  T
Q  477 ccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaa 576  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  17697416 ccatgaccaacaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacctacacaaaaaatctacaattttcacaaatatattatacaatcaaaa 17697515  T
Q  577 gacaaaatcagta 589  Q
    |||||||||||||    
T  17697516 gacaaaatcagta 17697528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 192 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34401394 - 34401010
Alignment:
Q  192 atgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattag 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34401394 atgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttaacaaaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta- 34401296  T
Q  292 aacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctac 391  Q
           |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34401295 -------catgaacttggcacaatgcaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaataatcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctac 34401203  T
Q  392 acaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatca 491  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  34401202 tcaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttctatttcttccatgaccagcacca 34401103  T
Q  492 ttgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaat 584  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34401102 ttatttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaactttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaat 34401010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 248 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 44708977 - 44708644
Alignment:
Q  248 ggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44708977 ggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcgcaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaa 44708886  T
Q  348 aatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcat 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  44708885 aatactcctatcaatatcttaatcaacctaagcccacttcctacacaattaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcct 44708786  T
Q  448 ttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttaca 547  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  44708785 ttggcttctccatcaaccttgcatgtgttccatgaccagcaccattatttttaaaataacctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttaca 44708686  T
Q  548 attttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44708685 attttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagta 44708644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 174 - 475
Target Start/End: Original strand, 16763860 - 16764153
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16763860 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctc 16763959  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16763960 ttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 16764051  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16764052 cctaagttcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctctaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 16764151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 314 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 42518525 - 42518258
Alignment:
Q  314 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaac 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42518525 atacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaataaacctaagatcacttcttacacaatcaactttatccatcaac 42518426  T
Q  414 cttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaatt 513  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  42518425 cttgccctccaaacttcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgatcagcaccattgtttttaaaatagcctagtt 42518326  T
Q  514 cttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaa 581  Q
    ||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42518325 ctttagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaa 42518258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 192 - 479
Target Start/End: Original strand, 39456091 - 39456370
Alignment:
Q  192 atgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattag 291  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||       |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  39456091 atgatgaatatgcatataattcaatgaccaatttgattgaatttttttgacaaaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca---- 39456186  T
Q  292 aacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctac 391  Q
        ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39456187 ----ttacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcttatcaatatcttaattaacctaagctcacttcctac 39456282  T
Q  392 acaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttcca 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39456283 acaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttttccatcaaccttgcatttcttcca 39456370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 178 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19907504 - 19907308
Alignment:
Q  178 atttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19907504 atttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaatggtttgattcattcattgataacctctttt 19907405  T
Q  278 cattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaaccta 377  Q
    |||||||||||||        |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19907404 cattacaacatta--------catggacttggcacaat-caataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaaccta 19907314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 118 - 348
Target Start/End: Original strand, 40561083 - 40561305
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  40561083 aaggatcacattgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatgtgcatataatttaagg 40561182  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| | ||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||    
T  40561183 accaatttaattgaaattttttaacaaaaaggtttgattcattcattgacaacatcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatac 40561274  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40561275 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 40561305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Original strand, 4047377 - 4047499
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  4047377 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttgtccatt 4047476  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4047477 aactttgccctccaaacctcttc 4047499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 309 - 433
Target Start/End: Original strand, 20941733 - 20941856
Alignment:
Q  309 gcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcca 408  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20941733 gcacaatacagtaacatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttgtcca 20941832  T
Q  409 tcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  20941833 tcaaccttg-catccaaacctcttc 20941856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Original strand, 37021388 - 37021501
Alignment:
Q  119 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 218  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37021388 aggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggttttttcattaatttgaggatcaaaatgatggatatgattataattcaagga 37021487  T
Q  219 ccaatgtgattgaa 232  Q
    ||||||||||||||    
T  37021488 ccaatgtgattgaa 37021501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 481 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 39663995 - 39663887
Alignment:
Q  481 gaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagaca 580  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39663995 gaccaacaccattgttttcaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccacataaaaaatttacaattttcactatcatcctatacaatcaaaagaca 39663896  T
Q  581 aaatcagta 589  Q
    |||||||||    
T  39663895 aaatcagta 39663887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26581667 - 26581545
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||   ||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26581667 acaatacagtagcatgttaaacaacccaaacaagcaaactatgactaacacatacttaatcaacctaagctcacttcatacacaatcaactttgtccatc 26581568  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    
T  26581567 aaccttcccctctaaacctcttc 26581545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Original strand, 161432 - 161554
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  161432 acaatagagtagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaaccaaacctcactttctacatagtcaactttgtccatc 161531  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  161532 aaccttgccctctaaacctcttc 161554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 430
Target Start/End: Original strand, 38149339 - 38149406
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 430  Q
    |||||||||| || || |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38149339 aacttaatcaccccaatctcactttttatacaatcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctc 38149406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 426
Target Start/End: Original strand, 7744707 - 7744778
Alignment:
Q  355 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 426  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  7744707 ctatcaaaaacttaataaacctaagctcaattcctaaagtatcaactttgtccatcaacctcaccctccaaa 7744778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19582023 - 19581960
Alignment:
Q  286 cattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 349  Q
    ||||| |||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19582023 cattacaacattacagagacttgacacaatacaataacattttaaacaattcaatcaaacaaaa 19581960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 11022170 - 11022125
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11022170 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 11022125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Original strand, 28247629 - 28247674
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28247629 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 28247674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11313473 - 11313399
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcact 385  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11313473 acaatacagtagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattataattatcaaaaacttaatcaacctaagctcact 11313399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 547 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19581954 - 19581912
Alignment:
Q  547 aattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19581954 aattttcaccatcatcctacacaattaaaagacaaaatcagta 19581912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Original strand, 38149490 - 38149535
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38149490 cattgtttttaaagtaacctagttcttcaacttcatcaacccacac 38149535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 495 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 10715916 - 10715876
Alignment:
Q  495 tttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10715916 tttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 10715876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11022280 - 11022252
Alignment:
Q  405 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11022280 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 11022252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 593
Target Start/End: Original strand, 15307124 - 15307598
Alignment:
Q  111 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 210  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307124 atgtacaaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 15307223  T
Q  211 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||    
T  15307224 ttcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggc 15307315  T
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307316 acaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 15307415  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307416 aaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 15307515  T
Q  511 attcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307516 attcttcagcttcatcaacccacgcaaaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 15307598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 593
Target Start/End: Original strand, 15487493 - 15487967
Alignment:
Q  111 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 210  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15487493 atgtacaaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 15487592  T
Q  211 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||    
T  15487593 ttcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggc 15487684  T
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15487685 acaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 15487784  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15487785 aaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 15487884  T
Q  511 attcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15487885 attcttcagcttcatcaacccacgcaaaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 15487967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27405435 - 27404962
Alignment:
Q  111 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27405435 atgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 27405336  T
Q  211 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||| |||||    
T  27405335 ttcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattacaacatta--------catggacttggc 27405244  T
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27405243 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagttcacttcctagacaatcaactttatccatc 27405144  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27405143 aaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttcttgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcct- 27405045  T
Q  511 attcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27405044 attcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacagttttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 27404962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 593
Target Start/End: Original strand, 29238031 - 29238500
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29238031 caaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgacggatatgaatataattcaa 29238130  T
Q  216 ggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaat 315  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||||    
T  29238131 ggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaat 29238222  T
Q  316 acaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacct 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29238223 acaatagcattttaaataactcaaccaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagcttacttcctacacaatcaactttatccaccaacct 29238322  T
Q  416 tgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattct 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29238323 tgcccttcaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctaattct 29238422  T
Q  516 tcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29238423 tcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 29238500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 41041813 - 41041407
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41041813 actaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaatttttg-gacagaaatgtttgattcattcattgacaacctc 41041715  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41041714 ttttcattacaacatta--------catggacttggcaaaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 41041623  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  41041622 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttctctccccctatcctttgccttctccatcaaccttgcattt 41041523  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41041522 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaataacatagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaattttacaattttcaccgtcatcctatacaatca 41041423  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  41041422 aaagacaaaatcagta 41041407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 40338909 - 40338495
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338909 actaatttgaggatcgatacgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 40338810  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||||| |         ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40338809 ttttcattacaacattaca---------ggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcag 40338719  T
Q  374 cctaagctcacttccta--------cacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaacc 465  Q
    |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  40338718 cctaagctcacttcctaacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccgtatcctctggcttctccatcaacc 40338619  T
Q  466 ttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatccta 565  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||       |||||||||| || |||||||||    
T  40338618 ttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagtctagttcttcagcttcatcaactcacacaaaaaaattacaatttttaccatcatccta 40338519  T
Q  566 tacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40338518 tacaatcaaaagacaaaatcagta 40338495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 174 - 479
Target Start/End: Original strand, 5037331 - 5037628
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5037331 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaatttctttgacataagggtttgattcattcattgacaacctc 5037430  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5037431 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 5037522  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5037523 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttgccttccaaacctcttctcttcccctatcatttggcttatccatcaaccttgcattt 5037622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 118 - 426
Target Start/End: Original strand, 27692005 - 27692305
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27692005 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaagg 27692104  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||    
T  27692105 accaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatac 27692196  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692197 aatatcatttttaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 27692296  T
Q  418 ccctccaaa 426  Q
     ||||||||    
T  27692297 tcctccaaa 27692305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 174 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33708039 - 33707795
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33708039 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaatgaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctc 33707940  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33707939 ttttcattacaacatta--------catagacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcttaatcaa 33707848  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33707847 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 33707795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 185 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13485351 - 13485114
Alignment:
Q  185 gatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattaca 284  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13485351 gatcgatatgatggatatgtacataattcaaggaccaatttgatt----ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattaca 13485256  T
Q  285 acattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcac 384  Q
    ||||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |    
T  13485255 acatta--------catggacttggtacaatacaatagcattttaaacaactcaatcgaataaaatactcatatcaatatcttaatcaacataagttcgc 13485164  T
Q  385 ttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13485163 ttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaaccttttct 13485114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 240 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 3152702 - 3152485
Alignment:
Q  240 gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaa 339  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   | ||| ||||||| |||| |||||||||| ||| ||    
T  3152702 gacagaagggttgaattcattcattgacaacttcttttcattataacattacaacattacacacacttgacacaataaaataacattttaaacgacttaa 3152603  T
Q  340 tcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacc 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3152602 tcaaacaaattactcctatcaatattttaatcaacctaagctcacttcctatacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaagcctcttctctaac 3152503  T
Q  440 cctatcatttggcttctc 457  Q
     ||||| |||||||||||    
T  3152502 actatcctttggcttctc 3152485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 348
Target Start/End: Original strand, 22273154 - 22273328
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| | |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22273154 actaatttgatgatcgatacgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgatagaaaggtttgattcatttattgacaacctc 22273253  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273254 ttttcattacaacattacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 22273328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 348
Target Start/End: Original strand, 42942633 - 42942855
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42942633 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcaataatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 42942732  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42942733 accaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattac--------aacattacatggacttggcacaatac 42942824  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42942825 aataacattttaaacaactcaatcaaacaaa 42942855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 449 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 9672263 - 9672123
Alignment:
Q  449 tggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaa 548  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  9672263 tggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgatcagcaccattgtttttaaaataacttagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaa 9672164  T
Q  549 ttttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9672163 ttttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcagta 9672123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 309 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11720478 - 11720354
Alignment:
Q  309 gcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcca 408  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11720478 gcacaatacagtagcatgttaaacaacttaaacaaacaaattactcctattaaatacttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttgtcca 11720379  T
Q  409 tcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11720378 tcaaccttgtccttcaaacctcttc 11720354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 600912 - 600809
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  600912 caaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgacggatatgaatataattcaa 600813  T
Q  216 ggac 219  Q
    ||||    
T  600812 ggac 600809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33761746 - 33761642
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33761746 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaatgaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 33761647  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  33761646 ggacc 33761642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12516006 - 12515887
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   |||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12516006 acaatacaatagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactattaaaaacttaatcaacctaagctcacttcccatacaatcaactttgtccatc 12515907  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctc 430  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  12515906 aacatttccctccaaacctc 12515887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Original strand, 35510253 - 35510357
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35510253 caaaggaccacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataatttaa 35510352  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  35510353 ggacc 35510357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7744360 - 7744193
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| |||  ||| |||||| ||||||||       ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  7744360 actaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaagaaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacagcctc 7744261  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 349  Q
    |||||||||||||||||      ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7744260 ttttcattacaacatta------taca--gacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 7744193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 543 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 7744190 - 7744143
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 590  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7744190 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 7744143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 543 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 26239501 - 26239454
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 590  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239501 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 26239454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28433006 - 28432939
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 430  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28433006 aacttaatcaccctcagctcacttcttatacaatcaactttgcccatcaaccttgccctccaaacctc 28432939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 25371306 - 25371236
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25371306 aacttattcaacctaagttcacttcctacacactcaactttgtccatcaatcttgctctccaaacatcttc 25371236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 41824730 - 41824684
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824730 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 41824684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26239671 - 26239504
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| |||  ||||||||||  |||||||       ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  26239671 actaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaattggattgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctc 26239572  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 349  Q
    |||||||||||||        ||||||  || |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26239571 ttttcattacaac--------attacacagacttgatacaatacaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 26239504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 41824834 - 41824733
Alignment:
Q  240 gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaa 339  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41824834 gacagaagggttaaattcattcattggcaacctcttttcattacaacatta--------cacaggcttggcacaatacaataacattttaaacaactcaa 41824743  T
Q  340 tcaaacaaaa 349  Q
    ||| ||||||    
T  41824742 tcacacaaaa 41824733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9672364 - 9672292
Alignment:
Q  214 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaac 286  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9672364 aaggaccaatttgattgaattttttcgacagaagggttggattcattcattgacaacatcttttcattacaac 9672292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 394
Target Start/End: Original strand, 24285797 - 24285880
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacaca 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24285797 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatatttaatcaacttaatctcacttcctacaca 24285880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 28432855 - 28432810
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28432855 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 28432810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 40019793 - 40019748
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40019793 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 40019748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 391 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10770982 - 10770940
Alignment:
Q  391 cacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10770982 cacagtcaactttgtccatcaaccttgccttccaaacctcttc 10770940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8609092 - 8609007
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatg 203  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8609092 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatg 8609007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Original strand, 44620116 - 44620188
Alignment:
Q  355 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 427  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||| ||| || ||||||||  ||||||||||    
T  44620116 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcaactcctaaagtatcaattttgtctatcaacctcaccctccaaac 44620188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 42472775 - 42472301
Alignment:
Q  111 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42472775 atgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 42472676  T
Q  211 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||| |||||    
T  42472675 ttcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattacaacatta--------catggacttggc 42472584  T
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42472583 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctagacaatcaactttatccatc 42472484  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42472483 aaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 42472384  T
Q  511 attcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42472383 attcttcagcttcatcaacccacacaaaaatattacagttttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 42472301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 174 - 593
Target Start/End: Original strand, 21841896 - 21842308
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841896 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 21841995  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21841996 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgccacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttagtcaa 21842087  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21842088 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttctctgcccctagcatttgacttctccatcaaccttgcattt 21842187  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac-nnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatc 572  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21842188 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaatttacaattttcacagttatcctatacaatc 21842287  T
Q  573 aaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  21842288 aaaagataaaatcagtataat 21842308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 249 - 589
Target Start/End: Original strand, 28821364 - 28821696
Alignment:
Q  249 gtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821364 gtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattaga--------tggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 28821455  T
Q  349 atactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatt 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||||| ||    
T  28821456 atactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacctttccctccaaacctcttatatccctctatcctt 28821555  T
Q  449 tggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaa 548  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  28821556 tggtttctccatcaaccttgcatttcttccttgaccaacaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaa 28821655  T
Q  549 ttttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28821656 ttttcaccatcatcctatgcaatcaatagacaaaatcagta 28821696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 118 - 589
Target Start/End: Original strand, 2180613 - 2181073
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2180613 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 2180712  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||| |    
T  2180713 accaatttgattgaaattttttgacacaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-c 2180803  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2180804 aataacattttaaa--actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttg 2180901  T
Q  418 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 517  Q
     |||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2180902 tcctccaaacctcttctttgcccctgtcctttgacttctccattaaccttgcatttctttcatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttc 2181001  T
Q  518 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    | |||||||||||||||        ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2181002 aacttcatcaacccacataaaaaatttacaattttcaccatcatcttatgcaatcaaaagacaaaatcagta 2181073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 332 - 593
Target Start/End: Original strand, 17577011 - 17577273
Alignment:
Q  332 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 430  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577011 caactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 17577110  T
Q  431 ttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacc 530  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577111 ttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacc 17577210  T
Q  531 cacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    |||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577211 cacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 17577273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 332 - 593
Target Start/End: Original strand, 17574980 - 17575242
Alignment:
Q  332 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaata-acttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacct 429  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17574980 caactcagtcaaacaaa-tactcctatcaatatacttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacct 17575078  T
Q  430 cttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaac 529  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575079 cttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaac 17575178  T
Q  530 ccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575179 ccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 17575242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 332 - 593
Target Start/End: Original strand, 17575700 - 17575962
Alignment:
Q  332 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 430  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575700 caactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 17575799  T
Q  431 ttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgttttt-aaaatagcctaattcttcagcttcatcaac 529  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575800 ttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaaatagcctaattcttcagcttcatcaac 17575899  T
Q  530 ccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575900 ccacac-aaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 17575962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 328 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18624398 - 18624137
Alignment:
Q  328 taaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 427  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18624398 taaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaacttcatccatcaaccttgtcatccaaac 18624299  T
Q  428 ctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatca 527  Q
    |||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18624298 ctcttctctgacactatcctttggattctctatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttctttagcttcatca 18624199  T
Q  528 acccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    |||||||        ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18624198 acccacataaaaaatttacaattttcactatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 18624137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 118 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2853553 - 2853253
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||        |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2853553 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaagacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaagg 2853454  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| | ||||||       |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||        |||||| |||||||| |||    
T  2853453 accaatttcattgaaatattttgacataaaggtttggttcattcattgacaatctattttcattacaacatta--------catggacttggcacattac 2853362  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2853361 aatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatattcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcttacacaatcaactttatccatcaaccttg 2853262  T
Q  418 ccctccaaa 426  Q
     ||||||||    
T  2853261 tcctccaaa 2853253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 174 - 383
Target Start/End: Original strand, 12800823 - 12801023
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12800823 actaatttgatgatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaatggtttgattcattcattgacaacctc 12800922  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12800923 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 12801013  T
Q  374 cctaagctca 383  Q
    ||||||||||    
T  12801014 cctaagctca 12801023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30464922 - 30464679
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30464922 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaattttaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 30464823  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  30464822 accaatttgattgaaattttttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaac--------attacatggacttggcacaatac 30464731  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaa 369  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30464730 aatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatgaatatcttaa 30464679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 174 - 383
Target Start/End: Original strand, 12738000 - 12738200
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12738000 actaatttgatgatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaatggtttgattcattcatcgacaacctc 12738099  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||| ||||||||||||        |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12738100 tttttattacaacatta--------catggacttggcacaat-caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 12738190  T
Q  374 cctaagctca 383  Q
    ||||||||||    
T  12738191 cctaagctca 12738200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 348
Target Start/End: Original strand, 8540566 - 8540732
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8540566 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggatcaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccta 8540665  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 348  Q
    ||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540666 ttttcattac--------aacattacatggatttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 8540732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32135063 - 32134897
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135063 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 32134964  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 348  Q
    |||||||||||||        ||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32134963 ttttcattacaac--------attacatcgacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaa 32134897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 590
Target Start/End: Original strand, 34328108 - 34328226
Alignment:
Q  472 ttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaat 571  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34328108 ttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcctcagcttcatcaacccacacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaat 34328207  T
Q  572 caaaagacaaaatcagtat 590  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34328208 caaaagacaaaatcagtat 34328226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Original strand, 40781430 - 40781543
Alignment:
Q  119 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 218  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40781430 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 40781529  T
Q  219 ccaatgtgattgaa 232  Q
    ||||||||||||||    
T  40781530 ccaatgtgattgaa 40781543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 430
Target Start/End: Original strand, 1344229 - 1344348
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   |||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1344229 acaatacagcagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactatgaaaaacttaatcagcctaagctcacttcctatacaatcaactttgtccatc 1344328  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctc 430  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1344329 aaccttgccctccaaacctc 1344348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29621024 - 29620912
Alignment:
Q  119 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 218  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29621024 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcaaaatgatggatatgattgtaattcaagga 29620925  T
Q  219 ccaatgtgattga 231  Q
    |||||||||||||    
T  29620924 ccaatgtgattga 29620912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28036499 - 28036377
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28036499 acaatacagtaacatgttaaataactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacataatcaatctaagctcacttcctacacaatcaattttgtccatc 28036400  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  28036399 aaccttgccctccaaacttcttc 28036377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1343861 - 1343744
Alignment:
Q  313 aatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaa 412  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  1343861 aatacagtagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactatcaaaaacttaatcagcataagctcactttctatacaatcaactttgtccatcaa 1343762  T
Q  413 ccttgccctccaaacctc 430  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  1343761 ccttgtccttcaaacctc 1343744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Original strand, 18341213 - 18341275
Alignment:
Q  364 acttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 426  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18341213 acttaatcaatttaagctcacttcctacacaatcaactttgtccatcaacattgccctccaaa 18341275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 28821275 - 28821332
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattga 231  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28821275 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattga 28821332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Original strand, 27349967 - 27350039
Alignment:
Q  355 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  27349967 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcaattcctaaagtatcaactttgtccatcaacctcaccctccaaac 27350039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 41494591 - 41494555
Alignment:
Q  254 attcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41494591 attcattcattgacaacctcttttcattactacatta 41494555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 42619920 - 42619875
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42619920 cattgtttttaaagtaacctagttcttcaacttcatcaacccacac 42619875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 174 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26224782 - 26224363
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224782 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctc 26224683  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26224682 ttttcagtacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 26224583  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  26224582 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttctcttcccctatcttttgtcttctccatcaaccttgcattt 26224483  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26224482 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcataattatcctatacaatca 26224383  T
Q  574 aaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26224382 aaagacaaaatcagtataat 26224363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 174 - 593
Target Start/End: Original strand, 27088183 - 27088592
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088183 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaattttt--gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 27088280  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27088281 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 27088372  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27088373 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttctctgcccctaacatttggcttctccatcaaccttgcattt 27088472  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27088473 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaattatcttatacaatca 27088572  T
Q  574 aaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27088573 aaagacaaaatcagtataat 27088592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 174 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 33600381 - 33599961
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnn-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacct 272  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33600381 actaatttgaggatcgaaaggatggatatgcatataattcaaggaccgatttgattgaattttttttgacagaaaggtt-gattcattcattgacaacct 33600283  T
Q  273 cttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatca 372  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33600282 cttttcattacaactttacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatca 33600183  T
Q  373 acctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatt 472  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33600182 acctaagctgccttcctagacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttccctgcccctatcatttgccttctctatcaaccttgcatt 33600083  T
Q  473 tcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac-nnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaat 571  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33600082 tcttccatgaccatcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagattcatcaacccacacaaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaat 33599983  T
Q  572 caaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33599982 caaaagacaaaatcagtataat 33599961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 50555331 - 50554925
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  50555331 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaatgatttgattcattcattgacaacctc 50555232  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50555231 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-caataacattttaaacaactccatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 50555141  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  50555140 cctaaactcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttctccatcaatcttgcattt 50555041  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50555040 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagtttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 50554941  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  50554940 aaagacaaaatcagta 50554925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 118 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25277660 - 25277299
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  25277660 aaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagg 25277561  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25277560 accaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttgacacaatac 25277461  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277460 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 25277361  T
Q  418 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttcca 479  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25277360 ccctccaaacctcttctttgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttcca 25277299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Original strand, 15105341 - 15105748
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| |||  |||||||||| ||||||||        |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15105341 actaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaaatttcttaacagaatggttggattcattcattgacaacctc 15105440  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        ||  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15105441 ttttcattacaacatta--------cacagacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaa 15105532  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15105533 cctaagctcatttcctacacaatcaacttcatccatcaaccttgtcatccaaacctcttctctgacactatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 15105632  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15105633 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaataacctaattcttcagcttcatcaacccacataaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 15105732  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||| ||||||||||    
T  15105733 aaagaaaaaatcagta 15105748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 174 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6817945 - 6817664
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6817945 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 6817846  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6817845 ttttcattacaacattata--------tgtacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaa 6817754  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaa 463  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  6817753 cctaagctcacttcttacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttctccatcaa 6817664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 174 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 45045732 - 45045435
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||       |||| || |||||| |||||||||||||||| ||    
T  45045732 actaatttgaagatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcattcattgacaacttc 45045633  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45045632 ttttcattacaacatta--------catggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 45045541  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45045540 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaagcttgccctccaaacctcttctttgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 45045441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 174 - 479
Target Start/End: Original strand, 37345231 - 37345528
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||       |||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  37345231 actaatttgaggatcggtatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctc 37345330  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37345331 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaa 37345422  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37345423 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccatatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 37345522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 374 - 589
Target Start/End: Original strand, 37087316 - 37087531
Alignment:
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37087316 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 37087415  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37087416 cttccatgaccagcaccattgttattaaaatagcctcattcctcaacttcatcaacccacacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 37087515  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  37087516 aaagacaaaatcagta 37087531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 118 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 46582873 - 46582573
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  46582873 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaagg 46582774  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||| ||||||||||||    
T  46582773 accaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacaata--------catggacttggcacaatac 46582682  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  46582681 aatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacaaaatcaagtttatccatcaaccttg 46582582  T
Q  418 ccctccaaa 426  Q
     ||||||||    
T  46582581 tcctccaaa 46582573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3012682 - 3012516
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3012682 actaatttgaggatcaatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccta 3012583  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 348  Q
    ||||||| ||        ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3012582 ttttcatcac--------aacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaataactcaatcaaacaaa 3012516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31237791 - 31237556
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  31237791 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaatttgaggatcgatataatggatatgcatataattcaagg 31237692  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||| |||| |||||||    
T  31237691 accaatttgattgaaattttttgatagaagggtttgattcattcattgacaacctctttt----------------cattacatggacttggtacaatac 31237608  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaa 369  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31237607 aatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaa 31237556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 174 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 51895394 - 51895228
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51895394 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagggccaatttgattgaatttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctc 51895295  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 348  Q
    |||||||||||||        ||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51895294 ttttcattacaac--------attacatggacatgacataatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaa 51895228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 290
Target Start/End: Original strand, 2870494 - 2870610
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2870494 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctc 2870593  T
Q  274 ttttcattacaacatta 290  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2870594 ttttcgttacaacatta 2870610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9120926 - 9120813
Alignment:
Q  119 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 218  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9120926 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 9120827  T
Q  219 ccaatgtgattgaa 232  Q
    ||||||||||||||    
T  9120826 ccaatgtgattgaa 9120813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8168618 - 8168514
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8168618 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaatgaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 8168519  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  8168518 ggacc 8168514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 232
Target Start/End: Original strand, 1443408 - 1443513
Alignment:
Q  127 attgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtg 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1443408 attgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaaggaccaatgtg 1443507  T
Q  227 attgaa 232  Q
    ||||||    
T  1443508 attgaa 1443513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47012326 - 47012213
Alignment:
Q  119 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 218  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47012326 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgattgatatgattataattcaagga 47012227  T
Q  219 ccaatgtgattgaa 232  Q
    ||||||||||||||    
T  47012226 ccaatgtgattgaa 47012213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 42558917 - 42558848
Alignment:
Q  364 acttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42558917 acttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttgtccatcaaccatgccctccaaacctcttc 42558848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 3370089 - 3369967
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||| ||   ||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||| ||||||    
T  3370089 acaatacagtagcaatggaaacaactcaaacaagcaaattatgactaacaaatacttaatcaaccaaagctcactccctacgtagtcaactttgtccatc 3369990  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  3369989 aaccttgtcctccaaacctcttc 3369967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 52642695 - 52642649
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52642695 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 52642649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 52642865 - 52642698
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||   ||  |||  || ||||||| ||||||||       ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  52642865 actaatttagggatcgatatgatggatagacatgcaatagaaagaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattggcaacctc 52642766  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 349  Q
    |||||||||||||||||        ||  || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  52642765 ttttcattacaacatta--------cacagacttggcacaatgcaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 52642698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Original strand, 51122987 - 51123059
Alignment:
Q  355 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  51122987 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcagttcctaaagtatcaactttgtccatctacctcaccctccaaac 51123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Original strand, 5784321 - 5784366
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5784321 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 5784366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34777422 - 34777337
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatg 203  Q
    |||||||| | |||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34777422 aaggatcacagtgatatctgttatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatg 34777337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 546 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 6817666 - 6817623
Alignment:
Q  546 caattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6817666 caattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaattagta 6817623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 11153181 - 11153136
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11153181 cattgtttttaaagtaacctagttcttcaacttcatcaacccacac 11153136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Original strand, 32086004 - 32086073
Alignment:
Q  364 acttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||    
T  32086004 acttgatcaatctaaactcacttactaaacaatcaactttgtccatcaacatttccttccaaaactcttc 32086073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 433
Target Start/End: Original strand, 5784211 - 5784239
Alignment:
Q  405 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5784211 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 5784239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 118 - 593
Target Start/End: Original strand, 18644112 - 18644587
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18644112 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgatgatcgaaataatggatatgcatataattcaagg 18644211  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  18644212 accaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaatctcttttcattacaacattacaacattacacagacttggcacaatac 18644311  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18644312 aatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagttcacttcctactcaatcaactttatccatcaaccttg 18644411  T
Q  418 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644412 ccctccaaacctcttctctgcccctagcatttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttc 18644511  T
Q  518 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    |||||||||||||| |||       |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644512 agcttcatcaaccctcacaaaaaaattacaattttcacaattatcttatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 18644587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 174 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 32438309 - 32437900
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32438309 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattaaaggaccaatatgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaatctc 32438210  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32438209 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatgcaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 32438118  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32438117 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacc-cttctttgcccctagcattt-gcttctccatcaaccttgcattt 32438020  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32438019 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaaaattatcctatacaatca 32437920  T
Q  574 aaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32437919 aaagacaaaatcagtataat 32437900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 7372212 - 7371806
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372212 actaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgatattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 7372113  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7372112 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatacaataccattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 7372021  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372020 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccttatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 7371921  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7371920 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcctcaacttcatcaacccacac-aaaatattacaattttcaccatcattctatacaatca 7371822  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  7371821 aaagacaaaatcagta 7371806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 198 - 589
Target Start/End: Original strand, 11356119 - 11356497
Alignment:
Q  198 gatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacatt 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11356119 gatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaactttttgacataagggtttgattcattcattgaccacctcttttcattacaacattacaacatt 11356218  T
Q  298 acatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatc 397  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||       
T  11356219 acatgaacttggcacaatagaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcgtaatcaacctaagctgacttcctacaca--- 11356315  T
Q  398 aactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgttt 497  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11356316 ----------atcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttctatgaccagcaccattgttt 11356405  T
Q  498 ttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11356406 ttaaaataacctagttcttcagcttcatcaactcacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagta 11356497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 174 - 479
Target Start/End: Original strand, 32517766 - 32518063
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||       |||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  32517766 actaatttgaggatcggtatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctc 32517865  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32517866 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaa 32517957  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32517958 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccatatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 32518057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 306 - 589
Target Start/End: Original strand, 9399137 - 9399420
Alignment:
Q  306 ttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttat 405  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9399137 ttggcacaataaaataacattctaaacaactcaaacaaacaaatcactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcatttcctacacaatcaactttat 9399236  T
Q  406 ccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaata 505  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9399237 ccatcaactttgccttccaaacctcttctctgccactatcctttggcttctccatcaaccttgcttttctaccatgaccagcacccttgtttttaaaata 9399336  T
Q  506 gcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9399337 acctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaagatttataattttcaccatcgtcctatacaatcaaaagacaaaattagta 9399420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 118 - 426
Target Start/End: Original strand, 20524226 - 20524526
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  20524226 aaggatcatagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatacatatataattcaagg 20524325  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| | ||||||||||||    
T  20524326 accaatttgattgaattttttttacataaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatgaacttggcacaatac 20524417  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524418 aatagcattttaaacaactcaataaaacaaaatactcatatcaatatcataatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 20524517  T
Q  418 ccctccaaa 426  Q
    |||||||||    
T  20524518 ccctccaaa 20524526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 254 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 33268027 - 33267809
Alignment:
Q  254 attcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatact 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  33268027 attcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaaca-------gacttggcacaatacaataacattttaaacagctcattcaaacaaattact 33267935  T
Q  354 cctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggct 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| || ||||| |||| ||    
T  33267934 cctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgacc-ccaaacctatactctgccactatcctttgcct 33267836  T
Q  454 tctcgatcaaccttgcatttcttccat 480  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  33267835 tcttcatcaaccttgcatttcttccat 33267809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 447 - 584
Target Start/End: Original strand, 20524587 - 20524724
Alignment:
Q  447 tttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttac 546  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  20524587 tttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgacgagcaccgttgtttttaaaatagcatagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttac 20524686  T
Q  547 aattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaat 584  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  20524687 aattttcaccatcatcctatacaagcagaagacaaaat 20524724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32455127 - 32455022
Alignment:
Q  127 attgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtg 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32455127 attgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaaggaccaatgta 32455028  T
Q  227 attgaa 232  Q
    ||||||    
T  32455027 attgaa 32455022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 349
Target Start/End: Original strand, 10569375 - 10569462
Alignment:
Q  254 attcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10569375 attcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catagacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 10569462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 349
Target Start/End: Original strand, 7050654 - 7050821
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| |||  |||||||||| ||||||||       |||| || ||||  |||||| |||||||||||||    
T  7050654 actaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaatttttttgacaaaagggttaaattcatccattgacaacctc 7050753  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 349  Q
    |||||||||||||||||        ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7050754 ttttcattacaacatta--------cacagacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 7050821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 433
Target Start/End: Original strand, 17935548 - 17935616
Alignment:
Q  365 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  17935548 cttaatcaacctaagctcacatcctactcagtcaactttgtccctcaaccttaccctccaaaactcttc 17935616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Original strand, 6902085 - 6902161
Alignment:
Q  214 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 290  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902085 aaggaccaatttgattgaatttttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 6902161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 586
Target Start/End: Original strand, 7050824 - 7050867
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatca 586  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050824 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatca 7050867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 543 - 589
Target Start/End: Original strand, 10569465 - 10569511
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10569465 ttacaattttcaccatcatcctgtacaatcaaaagacaaaatcagta 10569511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 588
Target Start/End: Original strand, 6902215 - 6902260
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagt 588  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902215 ttacaaatttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagt 6902260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Original strand, 34344779 - 34344824
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34344779 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 34344824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 17951197 - 17951156
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaaccc 531  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  17951197 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaaccc 17951156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 174 - 593
Target Start/End: Original strand, 51012822 - 51013233
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51012822 actaatttgaggattgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgatagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 51012921  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51012922 ttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaacccagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 51013013  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51013014 cctaagcttacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 51013113  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013114 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcattaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatca 51013213  T
Q  574 aaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  51013214 aaagacaaaatcagtataat 51013233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 11255159 - 11254753
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255159 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaacgatcaatttgattgaaattttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctc 11255060  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11255059 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatataatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 11254968  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11254967 cctaagctcacttcctacacaattaactttatccaacaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 11254868  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11254867 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcatagttcttcggcttcatcaacc-acacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 11254769  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  11254768 aaagacaaaatcagta 11254753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 35402897 - 35402493
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||       |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35402897 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagaaccaatttgattgaaattttttgacataagggtttgattcattcattgacaacctc 35402798  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35402797 ttttcattacaacatta--------cacggacttggcacagtacaatagcattttaaacaactcaatcaaaaaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 35402706  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  35402705 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttgccttctccatcaaccttgcattt 35402606  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||   ||||    
T  35402605 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctat---atca 35402509  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  35402508 aaagacaaaatcagta 35402493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 118 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 41761012 - 41760637
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  41761012 aaggatcacagtgatatctggtatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaagg 41760913  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||    
T  41760912 accaatttgattgaaattttttgccagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatac 41760821  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760820 aatagcattttcaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 41760721  T
Q  418 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaa 501  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41760720 ccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaa 41760637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 174 - 480
Target Start/End: Original strand, 49524027 - 49524325
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49524027 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaatgaccaatttgattgaaatattttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctc 49524126  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49524127 ttttcattacaaca--------ttacatgaacttggcacaatacaataatattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 49524218  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49524219 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 49524318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 254 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2692435 - 2692165
Alignment:
Q  254 attcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatact 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||        ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2692435 attcattcgttgacaacctcttttaattacaac--------attacagagacttggcacaatacaataacattttaaacaacttaatcaaacaaattact 2692344  T
Q  354 cctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggct 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||    
T  2692343 cctatcaatatcttaatcaacctaagctgacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgccactatcctttagct 2692244  T
Q  454 tctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaaccca 532  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2692243 tctccatcaaccttgcatttcttccatgacctgcatcattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaaccca 2692165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 111 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 834347 - 834096
Alignment:
Q  111 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  834347 atgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 834248  T
Q  211 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||||    
T  834247 ttcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattac--------aacattacatggacttggc 834156  T
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  834155 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaat 834096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 174 - 426
Target Start/End: Original strand, 43520333 - 43520577
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43520333 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctc 43520432  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43520433 ttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 43520524  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43520525 cctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgtcctccaaa 43520577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 310 - 589
Target Start/End: Original strand, 11641112 - 11641391
Alignment:
Q  310 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccat 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641112 cacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaacatcttaatcaacctaagttcacttcctacacaatcaactttatccat 11641211  T
Q  410 caaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcct 509  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |   |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  11641212 caaccttgccctccaatcctcttctttgctagtatcctttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccatcaccattgtttttaaaataacct 11641311  T
Q  510 aattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    | || |||||||||||||||||| ||       | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  11641312 agttattcagcttcatcaacccagacaaaaaattgacaattttcaccatcatcctatacaaagaaaattcaaaatcagta 11641391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 372 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 41760638 - 41760422
Alignment:
Q  372 aacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcat 471  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41760638 aacctaagctcacttcctacccaatcaactttatgcatcaaccttgccctccaaacctcttctct-cccctatcctttggcttctccatcaaccttgcat 41760540  T
Q  472 ttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaat 571  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41760539 ttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagctcagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaat 41760440  T
Q  572 caaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41760439 caaaagacaaaatcagta 41760422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 111 - 370
Target Start/End: Original strand, 5438616 - 5438863
Alignment:
Q  111 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5438616 atgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaagga----tttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 5438711  T
Q  211 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||||    
T  5438712 ttcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattac--------aacattacatggacttggc 5438803  T
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5438804 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaat 5438863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 174 - 410
Target Start/End: Original strand, 42981515 - 42981743
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42981515 actaatttaaggatcgatatgatagatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcatcgacaacctc 42981614  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||| ||        |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42981615 ttttcattacaacaata--------catgaacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatgaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 42981706  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42981707 tctaagctcatttcctacacaatcaactttatccatc 42981743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 475 - 593
Target Start/End: Original strand, 5438863 - 5438984
Alignment:
Q  475 ttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctataca---at 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  5438863 ttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacagttttcacaatcatcctatacaatcat 5438962  T
Q  572 caaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5438963 caaaagacaaaatcagtataat 5438984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 475 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 834096 - 833975
Alignment:
Q  475 ttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctataca---at 571  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  834096 ttccatgaccatcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacagttttcacaatcatcctatacaatcat 833997  T
Q  572 caaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  833996 caaaagacaaaatcagtataat 833975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 438 - 589
Target Start/End: Original strand, 42981746 - 42981897
Alignment:
Q  438 cccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnn 537  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||      
T  42981746 cccctatcctttggcttctccatcaacattggatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcaacttcatcaagccacacaa 42981845  T
Q  538 nnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
         |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42981846 aaaatttacaatttttaccttcatcctgtacaatcaaaaggcaaaatcagta 42981897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 319949 - 319845
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  319949 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 319850  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  319849 ggacc 319845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4172789 - 4172685
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4172789 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 4172690  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  4172689 ggacc 4172685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Original strand, 33265422 - 33265526
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33265422 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 33265521  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  33265522 ggacc 33265526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Original strand, 43508065 - 43508169
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43508065 caaaggatcacattgatatttgttatgataattcaaggaccaatttgatggtatcttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 43508164  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  43508165 ggacc 43508169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 48645976 - 48645809
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| |||  |||||||||| ||||||||       ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  48645976 actaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaattcatttattgacaacctc 48645877  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 349  Q
    |||||||||||||||||        ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48645876 ttttcattacaacatta--------catagacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 48645809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 430
Target Start/End: Original strand, 32652934 - 32653001
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 430  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32652934 aacttaatcaccctaagctcacttcctatacaatcaactttttccatcaaccttgccctccaaacctc 32653001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28101606 - 28101484
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || | | | ||   |||||||  |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||    
T  28101606 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacagatatattatgactatcaaatacttaatcaacctaagttcattttctacacagtcaactttgtccatc 28101507  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  28101506 gaccttgccctccaaacctcttc 28101484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 433
Target Start/End: Original strand, 4614585 - 4614655
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4614585 aacttaatcaacttaagctcacttcctacatagtcaactttgtccatcaaccatgccctccaaacctcttc 4614655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 433
Target Start/End: Original strand, 7150446 - 7150559
Alignment:
Q  320 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 419  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||| ||   |||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  7150446 tagcatgttaaacaactcaaaaaaccaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaacctcacttcttacatagtcaactttgtccatcaaccttgcc 7150545  T
Q  420 ctccaaacctcttc 433  Q
    ||| ||||||||||    
T  7150546 ctctaaacctcttc 7150559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 349
Target Start/End: Original strand, 54387076 - 54387203
Alignment:
Q  214 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcaca 313  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||  || ||||||||    
T  54387076 aaggaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattac--------aacattacacagacttggcaca 54387167  T
Q  314 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  54387168 atacaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 54387203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 589
Target Start/End: Original strand, 54387206 - 54387252
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54387206 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 54387252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 543 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 48645806 - 48645760
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48645806 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaaggcaaaatcagta 48645760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 44993445 - 44993401
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccaca 534  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44993445 cattgtttttaaagtaacctaattcttcagcttcatcaacccaca 44993401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 433
Target Start/End: Original strand, 27385571 - 27385626
Alignment:
Q  378 agctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27385571 agctcagttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgtcttccaaacctcttc 27385626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13449624 - 13449570
Alignment:
Q  376 taagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 430  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13449624 taagctcacttcatatgcaatcaactttgtccatcaactttgccctccaaacctc 13449570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Original strand, 32653085 - 32653130
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32653085 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 32653130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Original strand, 39190273 - 39190318
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39190273 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 39190318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Original strand, 39922461 - 39922506
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39922461 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 39922506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 42879921 - 42879876
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42879921 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 42879876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 43779024 - 43778979
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43779024 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 43778979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 417
Target Start/End: Original strand, 10544170 - 10544232
Alignment:
Q  355 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10544170 ctatcaaatacttaatgaatctaagctcactatctacacaatcaactttctccatcaatcttg 10544232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 290
Target Start/End: Original strand, 11641016 - 11641066
Alignment:
Q  240 gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 290  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11641016 gacagaatggttgaattcattcattgacaacatcttttctttacaacatta 11641066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Original strand, 41782417 - 41782463
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggacc 220  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41782417 actaatttgaggattgatatgatggatatgcatataattcaaggacc 41782463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Original strand, 5485506 - 5485551
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5485506 cattgtttttaaagtaacctagttcatcagcttcatcaacccacac 5485551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Original strand, 39084606 - 39084651
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39084606 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagtttcatcaacccacac 39084651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 218
Target Start/End: Original strand, 43507646 - 43507675
Alignment:
Q  189 gaaatgatggatatgaatataattcaagga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43507646 gaaatgatggatatgaatataattcaagga 43507675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 490 - 530
Target Start/End: Original strand, 10544259 - 10544299
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacc 530  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  10544259 cattgtttttaaagtatcctaattctccagcttcatcaacc 10544299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 174 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 53188929 - 53188518
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  53188929 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttcattcattcattgacaaccta 53188830  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53188829 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 53188738  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53188737 tctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaactttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 53188638  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53188637 cttccatgaccaacaccgttgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatca 53188538  T
Q  574 aaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  53188537 aaagacaaaatcagtataat 53188518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 120 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27898397 - 27897937
Alignment:
Q  120 ggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 219  Q
    |||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27898397 ggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggac 27898298  T
Q  220 caatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaa 319  Q
    |||  ||||||||       |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||| |||    
T  27898297 caacttgattgaatttttttgacaaaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-caa 27898207  T
Q  320 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 419  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898206 tagcattttaaacaacttaatcaaacaaaatactcctatcaatatattaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 27898107  T
Q  420 ctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcag 519  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||     
T  27898106 ctccaaacctcttctctgcccctatcatttgccttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcaa 27898007  T
Q  520 cttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898006 cttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 27897937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 118 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 30599492 - 30599030
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  30599492 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcaatatgatgaatatgtatataattcaagg 30599393  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||    
T  30599392 accaatttgattgaaattttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatac 30599302  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599301 aataacattttaaacaactcaatgaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 30599202  T
Q  418 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30599201 ccctccaaacctcttctctccccctatcctttgacttctccatcaatcttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagtctagttcttc 30599102  T
Q  518 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    | ||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30599101 aacttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaataagta 30599030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Original strand, 46198634 - 46199041
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46198634 actaatttgaggatcgatatgatagatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacataaatgtttgattcattcattgacaacctc 46198733  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46198734 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatataataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 46198825  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  46198826 cctaagtccacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgacttctccatcaaccttgcattt 46198925  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  46198926 cttccatgaccagaaccattgtttttaaaataggctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatta 46199025  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  46199026 aaagacaaaatcagta 46199041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 174 - 585
Target Start/End: Original strand, 21349609 - 21350012
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21349609 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaatgaccaatttgattgatttttttttacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 21349708  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  21349709 ttttcattacaaca--------ttacatggacttggcgcaatagaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatgtcttaatcaa 21349800  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21349801 cataagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgccctcaaaacttcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 21349900  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21349901 cttccatgaccatcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 21350000  T
Q  574 aaagacaaaatc 585  Q
    ||||||||||||    
T  21350001 aaagacaaaatc 21350012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 174 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 44275445 - 44275045
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275445 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtgtataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt--cagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 44275348  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44275347 ttttcattacaacatta--------catgaacttggcacaatacaataccattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 44275256  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44275255 cctaagctcccttccttcacaatcaaatttatccatcaaccttgccctccaaacgtcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttccattt 44275156  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44275155 cttcgatgaccagaaccattgtttgtaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 44275056  T
Q  574 aaagacaaaat 584  Q
    |||||||||||    
T  44275055 aaagacaaaat 44275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 118 - 524
Target Start/End: Original strand, 17516169 - 17516565
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17516169 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttttactaatttgagtatcgatatgatggatatga-tataattcaagg 17516267  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||    
T  17516268 accaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggaattggcacaatac 17516359  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516360 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 17516459  T
Q  418 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17516460 ccctccaaacctcttctct-cccccatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctagttcttc 17516558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 174 - 584
Target Start/End: Original strand, 43766036 - 43766438
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43766036 actaatttgatgatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgatagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 43766135  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||  |||        |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43766136 ttttcattacaatgtta--------catgaacttgacacaataaaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatattaatcaa 43766227  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43766228 tctaagctcacttcctacacaatcagctttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaatcttgcattt 43766327  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  43766328 catccatgaccagcaccattgtttttaaaattgcctagttcttcaacttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaataa 43766427  T
Q  574 aaagacaaaat 584  Q
    |||||||||||    
T  43766428 aaagacaaaat 43766438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 174 - 475
Target Start/End: Original strand, 54899348 - 54899649
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899348 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccgatgtgattgaatttttttgacggaaaggtttgattcattcattgacaacctc 54899447  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54899448 ttttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 54899547  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  54899548 cctaagctcacttcctacacaatcaactttacccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccttatcatttggcttctccatcaaccttgtattt 54899647  T
Q  474 ct 475  Q
    ||    
T  54899648 ct 54899649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 118 - 589
Target Start/End: Original strand, 2377855 - 2378311
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  2377855 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgttatgatggatatgcatataattcaagg 2377954  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||        ||| || |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||| |    
T  2377955 accaatttgattgaaattttttaacataagggtttgattcatt-----acaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-c 2378040  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2378041 aataacattttaaacaactcaatcaaa-aaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcatttcctacgcaatcaactttatccatcaaccttg 2378139  T
Q  418 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 517  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2378140 ctctccaaacctcttctctgcccctatcctttgacttatccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttc 2378239  T
Q  518 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378240 agcttcatcaacccacacaaaaattttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 2378311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 310 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 35904850 - 35904567
Alignment:
Q  310 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccat 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904850 cacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaaactcacttcctacacaatcaactttatccat 35904751  T
Q  410 caaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcct 509  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35904750 caaccttgccctccaaacctgttctctgcccctatcgtttgccttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcct 35904651  T
Q  510 aattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35904650 aattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaataaaaagacaaaatcagtataat 35904567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2225457 - 2225165
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2225457 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgtatataattcaagg 2225358  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    ||||||| || ||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2225357 accaatgcgaatgaatttttttgacagaaatgtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatac 2225258  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225257 aataacattttaaacaactcagtcaagcaaaatactcctatcaatatattaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 2225165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 118 - 426
Target Start/End: Original strand, 2661073 - 2661373
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       || ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  2661073 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaaccaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaagg 2661172  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||| ||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||  |||||||||||    
T  2661173 accaatttgattaaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacatggcacaatac 2661264  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661265 aatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacccctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 2661364  T
Q  418 ccctccaaa 426  Q
     ||||||||    
T  2661365 tcctccaaa 2661373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 118 - 426
Target Start/End: Original strand, 44795058 - 44795358
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  44795058 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatggatataattcaaga 44795157  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||| |||||    
T  44795158 accaatttgattgaaatattttgacataatggtttggttcattcatcgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcataatac 44795249  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795250 aatattattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 44795349  T
Q  418 ccctccaaa 426  Q
     ||||||||    
T  44795350 tcctccaaa 44795358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 214 - 457
Target Start/End: Original strand, 610549 - 610784
Alignment:
Q  214 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcaca 313  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      |||  | ||||||||    
T  610549 aaggaccaatttgattgaatttttttgacagaagggttgaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattaca------cat--acttggcaca 610640  T
Q  314 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaac 413  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  610641 atacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaataaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaac 610740  T
Q  414 cttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctc 457  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  610741 cttgccctccaagccttttctctaacactatcttttggcttctc 610784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 214 - 457
Target Start/End: Original strand, 46113422 - 46113657
Alignment:
Q  214 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcaca 313  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||  || ||| ||||    
T  46113422 aaggaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttggattcattccttgacaacctcttttcattacaacatta--------cacagacttgacaca 46113513  T
Q  314 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaac 413  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  46113514 atacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcccgcacaatcaactttatccatcagc 46113613  T
Q  414 cttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||    
T  46113614 cttgccctccaagcctcttctcgaacactatcatttgtcttctc 46113657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23292398 - 23292232
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23292398 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggatcaatttgattgaaattttttgacagaaaagtttgattcattcattgacaaccta 23292299  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 348  Q
    |||||||||||||        |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292298 ttttcattacaac--------attatatggacttgtcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 23292232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35905010 - 35904849
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35905010 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaagg 35904911  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttca 279  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904910 accaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttca 35904849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 313 - 432
Target Start/End: Original strand, 13466205 - 13466324
Alignment:
Q  313 aatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaa 412  Q
    |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13466205 aatacagtagcatgttaaacaatccaatcaaacaaattacacctatcaaatatttaatcaacctaaactcacttcctacacaatcaactttgtccatcaa 13466304  T
Q  413 ccttgccctccaaacctctt 432  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  13466305 cctttccctccaatcctctt 13466324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38192560 - 38192456
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192560 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 38192461  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  38192460 ggacc 38192456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 53093300 - 53093196
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53093300 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 53093201  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  53093200 ggacc 53093196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 46609825 - 46609724
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46609825 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 46609726  T
Q  216 gg 217  Q
    ||    
T  46609725 gg 46609724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Original strand, 46309848 - 46309952
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46309848 caaatgatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcat 46309947  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  46309948 ggacc 46309952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 365 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32843504 - 32843436
Alignment:
Q  365 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32843504 cttaatcaacctaagctcacatcctacacagtcaactttgtcgatcaaccttgccctccaaaactcttc 32843436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 366 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23876287 - 23876220
Alignment:
Q  366 ttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23876287 ttaatcaacctaaactcacttcatacagagtcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctcttc 23876220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 430
Target Start/End: Original strand, 41945412 - 41945479
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 430  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  41945412 aacttaatcaccctaagctcacttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgtcctctaaacctc 41945479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 35862546 - 35862440
Alignment:
Q  327 ttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 426  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||    ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  35862546 ttaaacaactcaaacaagcaaattatgattatcaaatacttaatcaacttaagctcgcttcctacacaatcaactttgttcatcaaccttgccatgcaaa 35862447  T
Q  427 cctcttc 433  Q
    |||||||    
T  35862446 cctcttc 35862440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 48829973 - 48829886
Alignment:
Q  254 attcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 349  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48829973 attcattcattgacaaccacttttcattacaacatta--------cacagacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 48829886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 349
Target Start/End: Original strand, 51685546 - 51685673
Alignment:
Q  214 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcaca 313  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||  || ||| ||||    
T  51685546 aaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggttaaattcattcattgacaacctcttttcattac--------aacattacacagacttgacaca 51685637  T
Q  314 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 349  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51685638 atacaataacatttcaaacaactcaatcacacaaaa 51685673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 452 - 589
Target Start/End: Original strand, 13466364 - 13466507
Alignment:
Q  452 cttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagca------tcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnntta 545  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||       |||    
T  13466364 cttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaccacaaattccattgtttttaaaataacctagctcttcagcttcatcaacccagacaaaaaattta 13466463  T
Q  546 caattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
     | ||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  13466464 tagttttcaccatcatcctatacaaagaaaattcaaaatcagta 13466507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 589
Target Start/End: Original strand, 42281798 - 42281844
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42281798 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 42281844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 48829883 - 48829837
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48829883 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 48829837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2976412 - 2976359
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacctt 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2976412 aacttaatcaacctaagctcaattcctacacactcaactttgtccatcaacctt 2976359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Original strand, 42280443 - 42280519
Alignment:
Q  214 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 290  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42280443 aaggaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 42280519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 543 - 585
Target Start/End: Original strand, 51685676 - 51685718
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatc 585  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51685676 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatc 51685718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 49495139 - 49495067
Alignment:
Q  355 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  49495139 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcagttcctaaaatatcaactttgtccatctacctcaccctccaaac 49495067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 37886412 - 37886367
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37886412 cattgtttttaaagtaatctagttcttcagcttcatcaacccacac 37886367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 491 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 2976250 - 2976210
Alignment:
Q  491 attgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaaccc 531  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  2976250 attgtttttaaagtatcctaattcttcagcttcattaaccc 2976210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 363 - 427
Target Start/End: Original strand, 33050905 - 33050969
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 427  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  33050905 aactcaatcaacctacgctcaattcctaaagtatcaactttgtccatcaatctcgccctccaaac 33050969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Original strand, 41978587 - 41978672
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatg 203  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41978587 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatg 41978672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 118 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 38473409 - 38472946
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  38473409 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgagtatgtatataattcaagg 38473310  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||| |||||    
T  38473309 accaatttgattgaaattttttgacaaaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcaaaatac 38473218  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38473217 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagttcacttcctacacaatcaactttatccatcaactttg 38473118  T
Q  418 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||    
T  38473117 ccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaattgcctagttattc 38473018  T
Q  518 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 590  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473017 agcttcatcaacccacac-aaaaaattacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 38472946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 120 - 589
Target Start/End: Original strand, 22154741 - 22155202
Alignment:
Q  120 ggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 219  Q
    |||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22154741 ggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggac 22154840  T
Q  220 caatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaa 319  Q
    |||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||    
T  22154841 caatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaa 22154932  T
Q  320 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 419  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22154933 taacattttaaacaattcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacgatcaactttatccatcaaccttgtc 22155032  T
Q  420 ctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcag 519  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  22155033 ctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaataacctagttcttcaa 22155132  T
Q  520 cttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22155133 cttcatcaacccacaaaaaaatattacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaggacaaattcagta 22155202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 120 - 589
Target Start/End: Original strand, 22210656 - 22211117
Alignment:
Q  120 ggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 219  Q
    |||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22210656 ggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggac 22210755  T
Q  220 caatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaa 319  Q
    |||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||    
T  22210756 caatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaa 22210847  T
Q  320 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 419  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22210848 taacattttaaacaattcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacgatcaactttatccatcaaccttgtc 22210947  T
Q  420 ctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcag 519  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  22210948 ctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaataacctagttcttcaa 22211047  T
Q  520 cttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22211048 cttcatcaacccacaaaaaaatattacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaggacaaattcagta 22211117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 118 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 35692635 - 35692168
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  35692635 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 35692536  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||    
T  35692535 accaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatac 35692444  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35692443 aatagcattt-aaacaacacaatcaaacaaaatacttttatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccaccaaccttg 35692345  T
Q  418 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgttttt-aaaatagcctaattctt 516  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  35692344 ccctccaaacctcttctctgtccccatcatttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccgttgtttttaaaaatagtctagttctt 35692245  T
Q  517 cagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 593  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35692244 cagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcaatataat 35692168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 145 - 589
Target Start/End: Original strand, 45360203 - 45360638
Alignment:
Q  145 aattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacag 244  Q
    |||||||||||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||     
T  45360203 aattcaaagacctatttgatggtattttcactaattttaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacat 45360302  T
Q  245 aaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaa 344  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  45360303 aagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-cattagcattttaaacaactcaatccaa 45360393  T
Q  345 caaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctat 444  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45360394 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaaactcacttcctatacaatcaactttttccatcaaccttgccctccaaacctcttctccgcccctat 45360493  T
Q  445 catttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnntt 544  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||       ||    
T  45360494 cctttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagtttttcagcttcatccacccacacaaaaaattt 45360593  T
Q  545 acaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45360594 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 45360638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 118 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 46438795 - 46438331
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||||| |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  46438795 aaggatcaaagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcacttatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaagg 46438696  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||||||       |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        |||||| ||||||||||||    
T  46438695 accaatttgattgaaattttttgacatataggtttgattcattcgttgacaacctcttttcagtacaacatta--------catggacttggcacaatac 46438604  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46438603 aatagcattttaaacaactcaaccaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttatccatcaaccttg 46438504  T
Q  418 ccctccaaacctcttctct-acccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattctt 516  Q
     ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  46438503 tcctccaaacttcttctctcccccctatcctttggcttctctatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttctt 46438404  T
Q  517 cagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    || ||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  46438403 caacttcatcaacccacacaaaaaaattacaattttcaccatcatccaatgcaatcaaaagacaaattcagta 46438331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 118 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34776246 - 34775788
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||| | |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34776246 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaagatctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 34776147  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 317  Q
    |||||| ||||| ||       |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||| ||||| |    
T  34776146 accaatttgattaaaaaaatttgacagaagagtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttgggacaat-c 34776056  T
Q  318 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34776055 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacacctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttg 34775956  T
Q  418 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 517  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  34775955 ccctccaaacctcttctttgcccctatcatttggcttctccatcaaccttacatttcttccatgactagtaccattatttttaaaataacctagttcttc 34775856  T
Q  518 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatca 586  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34775855 agcttcatcaacccacac-aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaaccaaaagacaaaatca 34775788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 47385444 - 47385029
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   |||||||  |||||||||| ||||||||       ||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  47385444 actaatttggggatcgatatgatggatagacatataatagaaggaccaatttgattgaatttttttgacagaaaggttgaattcattcattgacaaccac 47385345  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  47385344 tgttcattacaacattacagcattacacagacttggcacaataaaataaaattctaaacaactcaatcaaacaaatcactcctatcaatatcttaatcaa 47385245  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47385244 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccttccaaacctcttctctgccactatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 47385145  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  47385144 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaagatttacaattttcaccattatcctgtacaatca 47385045  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  47385044 aaagacaaaatcagta 47385029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24227650 - 24227243
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24227650 actaatttgaggattgatatgatggatgtgtatataatttaaggacatatttgattgaaattttttgacaacaaggtttgattcattcattgacaacctc 24227551  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24227550 ttttcattgcaacatta--------catggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatgaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 24227459  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  24227458 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacttcttctctccccttatcgtttgacttctccatcaaacttgcattt 24227359  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       | ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  24227358 cttccatgactagtaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaattcacaatttccaccgtcatcctatacaatca 24227259  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  24227258 aaagacaaaatcagta 24227243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 174 - 463
Target Start/End: Original strand, 6604420 - 6604701
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604420 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 6604519  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6604520 ttttcattacaaca--------ttacatgaacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctcaatcaa 6604611  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaa 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  6604612 cctaagctcacttcctatacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttctttgcccctatcctttggcttctccatcaa 6604701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 174 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23905481 - 23905232
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23905481 actaatttgaggatcgatatgattgatatgcatataattcaatgaccaatttgatttaaattttttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctc 23905382  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23905381 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactgaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 23905290  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctct 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23905289 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctct 23905232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 485
Target Start/End: Original strand, 69132 - 69322
Alignment:
Q  295 attacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacaca 394  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69132 attacatggacttggcacagtacaatagtatttaaaacaactcaatcaaacaaaatactcatattaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacaca 69231  T
Q  395 atcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgacca 485  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  69232 atgaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgacca 69322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 174 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27665275 - 27665031
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27665275 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattaaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctc 27665176  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27665175 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 27665084  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27665083 cctaagctcacttcctacacagttaattttatccatcaaccttgtcctccaaa 27665031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 174 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 29995745 - 29995501
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||       |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  29995745 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataatttaaggatcaatttgattgaaatattttgacagaaatgtttggttcattcattgaaaacctc 29995646  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    | |||||||||||||||        ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29995645 tgttcattacaacatta--------catagacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 29995554  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29995553 cctaagctcacttcctacacagtcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 29995501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 286 - 532
Target Start/End: Original strand, 48310947 - 48311194
Alignment:
Q  286 cattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcact 385  Q
    ||||| |||||||||  || ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  48310947 cattacaacattacacagacttgacataatataatagcattttaaacaattcaatcaaacaaattactcatgtcaatatcttaatcaacctaagttcact 48311046  T
Q  386 tcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgacca 485  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||  || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  48311047 tcctacacaatcgactttatccatcaacattgccctccaaacctcttctccgccactattcttaggcttctccattaaccttgcattccttccatgacca 48311146  T
Q  486 gcatcattgttt-ttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaaccca 532  Q
    ||| |||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  48311147 gcaccattgtttataaaaataacatagttcttcagcttcatcaaccca 48311194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 178 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 39858467 - 39858271
Alignment:
Q  178 atttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858467 atttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaatggtttgattcattcattgacaacctctttt 39858368  T
Q  278 cattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaaccta 377  Q
    |||||||||||||        |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39858367 cattacaacatta--------catggacttggcacaat-caataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaaccta 39858277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 174 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37114757 - 37114591
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37114757 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacaaaaagatttgattcattcattgacaacctc 37114658  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 348  Q
    |||||| |||        ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114657 ttttcaatac--------aacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 37114591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 290
Target Start/End: Original strand, 13168922 - 13169094
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 217  Q
    |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13168922 aaggatcacattgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatgttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 13169021  T
Q  218 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 290  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13169022 accaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 13169094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 490 - 593
Target Start/End: Original strand, 77260 - 77363
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77260 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 77359  T
Q  590 taat 593  Q
    ||||    
T  77360 taat 77363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 447 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 48851435 - 48851293
Alignment:
Q  447 tttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttac 546  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  48851435 tttggtttctccatcaaccttgcatttcttccattaccagcaccattgtttttgaaataatctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttac 48851336  T
Q  547 aattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48851335 aattttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcagta 48851293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Original strand, 11683621 - 11683743
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  11683621 acaatacaatagcatgttaaaaaactcaaacaagtaaattatgactatcaaaaacttaatcaacctaagctcacttcctatacactcaactttgtccatc 11683720  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11683721 aaccttgccctccaaacctcttc 11683743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Original strand, 20478921 - 20479034
Alignment:
Q  119 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 218  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20478921 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 20479020  T
Q  219 ccaatgtgattgaa 232  Q
    ||||||||||||||    
T  20479021 ccaatgtgattgaa 20479034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 434
Target Start/End: Original strand, 32840488 - 32840610
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||| ||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32840488 acaatacaataacatgttaaaaaattcaaacaagcaaattatgcctatcaaatacttaatcatc-taagttcacttcctacacaatcaactttgtccatc 32840586  T
Q  411 aaccttgccctccaaacctcttct 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  32840587 aaccttgccctccaaacctattct 32840610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 4321867 - 4321800
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 430  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4321867 aacttaatcaccctaagcttacttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctc 4321800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 418
Target Start/End: Original strand, 7402914 - 7403021
Alignment:
Q  311 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 410  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||   |||||||  ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||    
T  7402914 acaatacagtagcatgttaaacaacccaaacaaacaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaatcttacatcctacacaatcaactttgtccatc 7403013  T
Q  411 aaccttgc 418  Q
    ||||||||    
T  7403014 aaccttgc 7403021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 416
Target Start/End: Original strand, 23168648 - 23168751
Alignment:
Q  313 aatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaa 412  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| || |||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23168648 aatacaataacatgttaaacaatccaatcaaacgaattacttctatcaaatacttaatcaatctaaactcacttcgtacacaatcaactttatccgtcaa 23168747  T
Q  413 cctt 416  Q
    ||||    
T  23168748 cctt 23168751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35402647 - 35402544
Alignment:
Q  116 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35402647 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatgatattttcactaatttgaggatcgaaatgatggat-tgaatataattcaa 35402549  T
Q  216 ggacc 220  Q
    |||||    
T  35402548 ggacc 35402544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34784647 - 34784575
Alignment:
Q  355 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  34784647 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcacttcttatacaatcaactttgtccatcaacattgcccttcaaac 34784575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 430
Target Start/End: Original strand, 34691871 - 34691938
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 430  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34691871 aacttaatcaacctaagttcacttcatatacaatcaactttgtccatcaacgttgccctccaaacctc 34691938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Original strand, 69040 - 69134
Alignment:
Q  118 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataatt 212  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  69040 aaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataatt 69134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 433
Target Start/End: Original strand, 40360951 - 40361028
Alignment:
Q  356 tatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 433  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40360951 tatcaattactttatcaatctaagctcactttctaaacaatcaactttgtccatcaaccttgctctccaaacttcttc 40361028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 355 - 421
Target Start/End: Original strand, 13035927 - 13035993
Alignment:
Q  355 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccct 421  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  13035927 ctatcaaatacttaatcaacctaatctcacttcctacatagtcaactttctccatcaaccttcccct 13035993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 543 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 38550313 - 38550267
Alignment:
Q  543 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38550313 ttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagta 38550267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 38550419 - 38550316
Alignment:
Q  254 attcattcattgacaacctcttttcattacaacat--------tagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaac 345  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||        || |||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  38550419 attcatttattgacaacctcttttcattacaacataacaactttacaacattacacagactttgcacaatacaataacattttaaacaactcaataacac 38550320  T
Q  346 aaaa 349  Q
    ||||    
T  38550319 aaaa 38550316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 48302936 - 48302873
Alignment:
Q  366 ttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  48302936 ttaatcaccctaagctcacttcctgtacaatcaactttgtccatcaacgttg-cctccaaacctc 48302873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 432 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23905169 - 23905122
Alignment:
Q  432 tctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttcca 479  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23905169 tctctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttcca 23905122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37792197 - 37792150
Alignment:
Q  240 gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca 287  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37792197 gacagaagggttgaattcattcattgacaacctcttttcattacaaca 37792150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 30109230 - 30109185
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30109230 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 30109185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 546 - 589
Target Start/End: Original strand, 6604699 - 6604742
Alignment:
Q  546 caattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6604699 caattttcaccatcatcctatacaatcaaaagataaaataagta 6604742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 383
Target Start/End: Original strand, 13169123 - 13169162
Alignment:
Q  344 acaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctca 383  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13169123 acaaaatattcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 13169162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 48302789 - 48302744
Alignment:
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48302789 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagctttatcaacccacac 48302744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Original strand, 1547112 - 1547184
Alignment:
Q  355 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |  || |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  1547112 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctaaattcttaaagtataaactttgtccatcaacctcaccctccaaac 1547184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 363 - 403
Target Start/End: Original strand, 27956815 - 27956855
Alignment:
Q  363 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaacttt 403  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27956815 aacttaatcaacataagctcacttcctacacgctcaacttt 27956855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 491 - 535
Target Start/End: Original strand, 34692023 - 34692067
Alignment:
Q  491 attgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 535  Q
    |||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34692023 attgttttgaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 34692067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 198 - 589
Target Start/End: Original strand, 472 - 858
Alignment:
Q  198 gatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacatt 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  472 gatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaactttttgacataagggtttgattcattcattgaccacctcttttcattacaacattacaacatt 571  T
Q  298 aca--------tggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcct 389  Q
    |||        || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  572 acaacattacatgaacttggcacaatagaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcgtaatcaacctaagctgacttcct 671  T
Q  390 acacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcat 489  Q
    |||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  672 acacaatca-------------accttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttctatgaccagcac 758  T
Q  490 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 589  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  759 cattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaactcacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagta 858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 174 - 478
Target Start/End: Original strand, 9164 - 9460
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||       |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9164 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggactaatttgattgaatttttttgacataagggtttgattcattcattgacaacctc 9263  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9264 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 9355  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9356 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttgccctccaaacctcttctctgctcctatcatttggcttctccatcaaccttacattt 9455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 174 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 107814 - 107409
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 273  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||   ||| |||  || ||||||| ||||||||       ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  107814 actaatttagggatcgatatgatggatagacatacaatagaatgaccaatttgattgaaattttttgacagaagggtt-gattcattcattgacaacctt 107716  T
Q  274 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 373  Q
    |||||||||| |||||| |  |        | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  107715 ttttcattactacattacacaa--------acttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaa 107624  T
Q  374 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  107623 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctcaaaacctcttcgctgacactatcctttggcttcttcatcaaccttgcattt 107524  T
Q  474 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 573  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  107523 cttccatgaccagcaccattg-ttttaaactaacctagttcttcaacttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 107425  T
Q  574 aaagacaaaatcagta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  107424 aaagacaaaatcagta 107409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 286 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 1643 - 1401
Alignment:
Q  286 cattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcact 385  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||  |||||    
T  1643 cattacaacattacatagacttggcataatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaacatcttaatcagcctaaattcact 1544  T
Q  386 tcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgacca 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |   |||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  1543 tcctacacaatcaactttatccat--accttgccctccaaacctcttctttgcaagtatcctttgacttctgcatcaaccttgcatttcttccatgctca 1446  T
Q  486 gcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacc 530  Q
     || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1445 tcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacc 1401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Original strand, 4199 - 4287
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattca 262  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||    
T  4199 actaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattca 4287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Original strand, 5371 - 5459
Alignment:
Q  174 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattca 262  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||    
T  5371 actaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattca 5459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University