View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1358_low_146 (Length: 251)

Name: NF1358_low_146
Description: NF1358
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1358_low_146
NF1358_low_146
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-231)||(10314-10544)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-231)||(15353-15584)
scaffold0114 (63-227)||(7295-7459)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (1-231)||(16199534-16199765)
chr8 (1-231)||(31971257-31971488)
chr8 (1-231)||(45130886-45131117)
chr8 (18-231)||(21389358-21389571)
chr8 (18-231)||(21395888-21396101)
chr8 (18-231)||(21790381-21790594)
chr8 (31-231)||(21778697-21778897)
chr8 (1-231)||(21918888-21919121)
chr8 (2-231)||(18879126-18879352)
chr8 (1-231)||(20536208-20536441)
chr8 (18-231)||(22626736-22626951)
chr8 (1-231)||(18818297-18818530)
chr8 (1-231)||(21923816-21924049)
chr8 (3-230)||(28648934-28649164)
chr8 (18-231)||(7372778-7372986)
chr8 (18-231)||(23406379-23406597)
chr8 (3-234)||(6759255-6759487)
chr8 (18-231)||(22875065-22875281)
chr8 (18-231)||(16092246-16092463)
chr8 (135-231)||(5866297-5866395)
chr8 (135-231)||(17140916-17141014)
chr8 (1-230)||(23648554-23648786)
chr8 (136-231)||(21490995-21491092)
chr8 (115-231)||(6520368-6520486)
chr8 (159-231)||(38855300-38855372)
chr8 (159-231)||(23760893-23760962)
chr8 (114-212)||(21285616-21285716)
chr8 (135-231)||(21249384-21249483)
chr8 (135-231)||(21255222-21255321)
chr8 (82-228)||(14409459-14409606)
chr8 (1-95)||(25363028-25363123)
chr8 (68-212)||(16413316-16413462)
chr8 (159-212)||(983455-983508)
chr8 (135-224)||(13508108-13508199)
chr8 (133-228)||(20046261-20046357)
chr8 (114-215)||(20498578-20498681)
chr8 (159-227)||(26355747-26355815)
chr8 (82-228)||(1484402-1484549)
chr8 (82-228)||(5853307-5853454)
chr8 (135-231)||(17612133-17612231)
chr8 (82-228)||(20403227-20403374)
chr8 (82-228)||(22001753-22001900)
chr8 (160-215)||(24353036-24353091)
chr8 (160-215)||(37116363-37116418)
chr8 (158-215)||(19154935-19154992)
chr8 (160-215)||(17267044-17267099)
chr8 (82-228)||(41598188-41598335)
chr8 (135-224)||(13597640-13597731)
chr8 (133-228)||(15203297-15203393)
chr8 (82-228)||(4483281-4483427)
chr8 (169-228)||(4542477-4542535)
chr8 (160-215)||(17439557-17439612)
chr8 (169-228)||(19896265-19896323)
chr8 (112-229)||(18678102-18678221)
chr8 (178-228)||(26225359-26225409)
chr8 (133-215)||(19801448-19801530)
chr8 (163-212)||(21673723-21673772)
chr8 (114-212)||(26219733-26219831)
chr8 (133-212)||(15070574-15070654)
chr8 (178-234)||(19937118-19937174)
chr8 (133-212)||(45290761-45290841)
chr8 (112-229)||(32121734-32121853)
chr8 (149-227)||(17353983-17354060)
chr8 (162-216)||(20502154-20502207)
chr8 (178-228)||(25484380-25484430)
chr8 (160-216)||(22525573-22525628)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (1-231)||(17046487-17046717)
chr4 (1-231)||(14053190-14053422)
chr4 (1-231)||(12902757-12902990)
chr4 (1-231)||(7088877-7089110)
chr4 (1-231)||(44052829-44053062)
chr4 (18-229)||(22636437-22636650)
chr4 (1-224)||(23374247-23374473)
chr4 (22-231)||(16270145-16270356)
chr4 (3-228)||(16377413-16377639)
chr4 (1-231)||(7893703-7893933)
chr4 (50-231)||(7798774-7798958)
chr4 (1-231)||(16239858-16240090)
chr4 (19-226)||(14038653-14038863)
chr4 (62-231)||(6899891-6900062)
chr4 (112-231)||(52873367-52873488)
chr4 (135-231)||(15551817-15551915)
chr4 (150-231)||(3096293-3096373)
chr4 (5-105)||(3096772-3096872)
chr4 (82-229)||(22353835-22353984)
chr4 (62-215)||(13800-13956)
chr4 (159-227)||(12774011-12774079)
chr4 (59-227)||(15121749-15121917)
chr4 (159-231)||(39706337-39706409)
chr4 (114-228)||(14280316-14280431)
chr4 (59-178)||(43256106-43256227)
chr4 (159-212)||(12288259-12288312)
chr4 (159-212)||(52243245-52243298)
chr4 (82-228)||(18215289-18215436)
chr4 (82-228)||(44928894-44929042)
chr4 (114-228)||(54798756-54798872)
chr4 (68-228)||(23803265-23803427)
chr4 (159-227)||(8846360-8846428)
chr4 (68-234)||(19242693-19242861)
chr4 (68-230)||(19618172-19618336)
chr4 (82-228)||(12322-12469)
chr4 (132-214)||(6190479-6190564)
chr4 (82-228)||(15118367-15118514)
chr4 (82-228)||(44615288-44615435)
chr4 (82-228)||(52312510-52312657)
chr4 (68-228)||(3515007-3515169)
chr4 (166-212)||(43198611-43198657)
chr4 (68-228)||(51463868-51464030)
chr4 (114-212)||(8574871-8574969)
chr4 (158-215)||(46640504-46640561)
chr4 (62-228)||(1837503-1837671)
chr4 (20-95)||(17047979-17048055)
chr4 (133-228)||(44773153-44773249)
chr4 (82-228)||(18239434-18239581)
chr4 (82-228)||(50222354-50222501)
chr4 (160-215)||(53082202-53082257)
chr4 (68-228)||(12610950-12611105)
chr4 (133-212)||(15355391-15355471)
chr4 (169-228)||(7641286-7641344)
chr4 (133-231)||(15367690-15367789)
chr4 (133-231)||(15370018-15370117)
chr4 (133-231)||(15371202-15371301)
chr4 (133-231)||(15373483-15373582)
chr4 (133-231)||(15402703-15402802)
chr4 (178-228)||(44102214-44102264)
chr4 (178-231)||(16223532-16223585)
chr4 (68-212)||(14970707-14970853)
chr4 (135-193)||(16596686-16596746)
chr4 (180-215)||(21815699-21815734)
chr4 (160-216)||(17333292-17333347)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (1-231)||(20309108-20309338)
chr2 (1-231)||(38004-38235)
chr2 (1-231)||(23285865-23286094)
chr2 (1-231)||(22731122-22731355)
chr2 (1-231)||(23654274-23654507)
chr2 (1-228)||(298702-298933)
chr2 (4-231)||(23060513-23060742)
chr2 (1-231)||(22738068-22738300)
chr2 (18-231)||(23076442-23076658)
chr2 (1-231)||(22337115-22337348)
chr2 (114-231)||(23103399-23103516)
chr2 (18-231)||(23660023-23660238)
chr2 (19-212)||(23708524-23708721)
chr2 (82-228)||(22105412-22105560)
chr2 (135-231)||(23071972-23072070)
chr2 (27-227)||(40622123-40622327)
chr2 (115-227)||(7679589-7679702)
chr2 (114-215)||(7735-7838)
chr2 (155-231)||(8946657-8946732)
chr2 (135-231)||(19671830-19671928)
chr2 (82-228)||(26505379-26505526)
chr2 (82-228)||(26507857-26508004)
chr2 (159-226)||(28405981-28406048)
chr2 (158-215)||(23207293-23207350)
chr2 (82-225)||(21155075-21155219)
chr2 (167-231)||(23040247-23040310)
chr2 (159-227)||(25175854-25175922)
chr2 (68-230)||(32214921-32215085)
chr2 (82-228)||(18808943-18809090)
chr2 (159-230)||(22134256-22134326)
chr2 (82-228)||(23130862-23131009)
chr2 (82-228)||(23133329-23133476)
chr2 (82-228)||(23135590-23135737)
chr2 (82-228)||(23709547-23709694)
chr2 (82-228)||(23712028-23712175)
chr2 (82-228)||(34402537-34402684)
chr2 (82-228)||(39682313-39682460)
chr2 (133-228)||(571397-571493)
chr2 (133-228)||(6725995-6726091)
chr2 (1-81)||(27753728-27753808)
chr2 (160-215)||(20520243-20520298)
chr2 (82-212)||(24367790-24367921)
chr2 (132-214)||(32451948-32452033)
chr2 (82-228)||(45029869-45030016)
chr2 (133-226)||(43137301-43137395)
chr2 (159-212)||(18786952-18787005)
chr2 (158-215)||(22413186-22413243)
chr2 (82-228)||(24898210-24898358)
chr2 (82-228)||(24900693-24900841)
chr2 (82-228)||(24903170-24903318)
chr2 (82-228)||(24905647-24905795)
chr2 (82-228)||(24908122-24908270)
chr2 (160-215)||(23004764-23004819)
chr2 (160-215)||(25108903-25108958)
chr2 (82-228)||(32039513-32039660)
chr2 (178-228)||(28577099-28577149)
chr2 (178-228)||(38967374-38967424)
chr2 (160-216)||(23287378-23287433)
chr2 (133-228)||(24529595-24529691)
chr2 (169-225)||(24643054-24643109)
chr2 (160-215)||(23791289-23791344)
chr2 (161-216)||(26392397-26392451)
chr2 (112-204)||(22799126-22799220)
chr2 (112-212)||(25616204-25616306)
chr2 (160-215)||(24697657-24697712)
chr2 (112-158)||(23019706-23019752)
chr2 (150-210)||(23038048-23038107)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-231)||(32067-32297)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-231)||(16282-16512)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (1-229)||(40443393-40443622)
chr7 (1-231)||(27847721-27847951)
chr7 (18-231)||(12698831-12699048)
chr7 (1-231)||(10589039-10589271)
chr7 (1-231)||(9509189-9509422)
chr7 (1-231)||(26211995-26212229)
chr7 (1-231)||(16386135-16386369)
chr7 (19-228)||(18456319-18456530)
chr7 (1-231)||(38227481-38227713)
chr7 (3-228)||(3564254-3564482)
chr7 (135-231)||(16495402-16495500)
chr7 (135-231)||(28505321-28505419)
chr7 (135-231)||(34200786-34200884)
chr7 (82-231)||(13647325-13647476)
chr7 (62-228)||(16213684-16213852)
chr7 (27-227)||(17137978-17138177)
chr7 (159-231)||(67745-67817)
chr7 (136-231)||(11996051-11996148)
chr7 (112-231)||(16219717-16219835)
chr7 (27-227)||(12187019-12187218)
chr7 (114-228)||(48273392-48273508)
chr7 (82-228)||(24704688-24704832)
chr7 (159-227)||(811180-811248)
chr7 (159-227)||(18005650-18005718)
chr7 (159-227)||(44014182-44014250)
chr7 (159-231)||(47831807-47831879)
chr7 (135-231)||(15754910-15755008)
chr7 (82-228)||(24702238-24702385)
chr7 (82-231)||(18430709-18430859)
chr7 (114-212)||(2280121-2280221)
chr7 (133-228)||(44116509-44116605)
chr7 (82-228)||(456321-456468)
chr7 (82-228)||(11972496-11972643)
chr7 (82-228)||(14949137-14949284)
chr7 (82-228)||(15376728-15376875)
chr7 (114-212)||(16056347-16056446)
chr7 (82-228)||(16232520-16232667)
chr7 (82-228)||(18640272-18640419)
chr7 (82-228)||(20385138-20385285)
chr7 (82-228)||(21189610-21189757)
chr7 (82-212)||(24275187-24275318)
chr7 (82-228)||(32125491-32125638)
chr7 (82-228)||(41522917-41523064)
chr7 (82-228)||(41525379-41525526)
chr7 (113-178)||(2530139-2530205)
chr7 (82-227)||(11393302-11393448)
chr7 (133-228)||(17061981-17062077)
chr7 (133-228)||(16410059-16410155)
chr7 (163-231)||(22072913-22072981)
chr7 (135-231)||(10063841-10063939)
chr7 (82-228)||(27216860-27217007)
chr7 (155-212)||(12901342-12901399)
chr7 (133-228)||(13869346-13869442)
chr7 (160-212)||(14044765-14044817)
chr7 (160-212)||(14354795-14354847)
chr7 (169-228)||(3386333-3386391)
chr7 (135-231)||(19486767-19486865)
chr7 (160-215)||(20220238-20220293)
chr7 (158-212)||(1868043-1868097)
chr7 (159-209)||(12255842-12255892)
chr7 (150-212)||(18154882-18154943)
chr7 (178-228)||(20110556-20110606)
chr7 (136-228)||(13831373-13831466)
chr7 (158-215)||(15008547-15008604)
chr7 (158-215)||(48991196-48991253)
chr7 (168-212)||(15144096-15144139)
chr7 (160-203)||(14036282-14036325)
chr7 (160-203)||(14346312-14346355)
chr7 (125-227)||(14932747-14932851)
chr7 (125-227)||(15356182-15356286)
chr7 (125-227)||(15360296-15360400)
chr7 (162-216)||(9177718-9177772)
chr7 (178-212)||(38898489-38898523)
chr7 (178-227)||(19649557-19649606)
chr7 (178-230)||(2832509-2832561)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-231)||(940-1170)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (24-231)||(46995-47202)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-231)||(1289-1519)
scaffold0106 (1-231)||(7266-7496)
scaffold0106 (162-228)||(15291-15356)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-231)||(13497-13728)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (1-231)||(16920521-16920751)
chr6 (59-231)||(35245586-35245758)
chr6 (1-231)||(22831503-22831735)
chr6 (1-231)||(20360848-20361081)
chr6 (1-219)||(11185517-11185735)
chr6 (1-231)||(20638171-20638404)
chr6 (19-231)||(29060540-29060755)
chr6 (18-231)||(19303446-19303661)
chr6 (81-231)||(16496244-16496396)
chr6 (2-231)||(22780116-22780348)
chr6 (18-231)||(17287701-17287917)
chr6 (3-231)||(20593773-20594004)
chr6 (3-230)||(18409717-18409947)
chr6 (18-231)||(25629260-25629476)
chr6 (67-231)||(20076700-20076863)
chr6 (159-231)||(27333267-27333339)
chr6 (159-231)||(27394007-27394079)
chr6 (135-231)||(28496494-28496592)
chr6 (135-231)||(29808905-29809003)
chr6 (86-212)||(20109157-20109285)
chr6 (133-228)||(25656629-25656725)
chr6 (135-231)||(1561303-1561401)
chr6 (86-228)||(1595549-1595692)
chr6 (82-228)||(2291195-2291342)
chr6 (114-212)||(25644339-25644440)
chr6 (68-228)||(25754809-25754971)
chr6 (59-178)||(27415887-27416008)
chr6 (159-212)||(9098563-9098616)
chr6 (114-231)||(23019408-23019525)
chr6 (159-227)||(19652199-19652267)
chr6 (133-228)||(22782227-22782323)
chr6 (68-230)||(30676710-30676874)
chr6 (82-228)||(12742317-12742464)
chr6 (82-228)||(18334607-18334754)
chr6 (82-228)||(19005046-19005193)
chr6 (82-228)||(19858934-19859081)
chr6 (82-228)||(24422547-24422694)
chr6 (82-228)||(33861794-33861941)
chr6 (82-228)||(33864278-33864425)
chr6 (68-230)||(34963371-34963535)
chr6 (82-228)||(1540926-1541073)
chr6 (82-228)||(8055029-8055176)
chr6 (82-228)||(26924655-26924802)
chr6 (82-215)||(18456732-18456866)
chr6 (82-215)||(18461892-18462026)
chr6 (166-212)||(19668390-19668436)
chr6 (169-231)||(25714417-25714478)
chr6 (118-208)||(4185827-4185919)
chr6 (160-213)||(23076748-23076801)
chr6 (160-213)||(35008166-35008219)
chr6 (133-212)||(25688518-25688598)
chr6 (135-231)||(8227534-8227632)
chr6 (184-231)||(22080799-22080846)
chr6 (169-215)||(18821904-18821949)
chr6 (158-216)||(33443062-33443119)
chr6 (133-225)||(16448593-16448686)
chr6 (133-228)||(20556958-20557054)
chr6 (169-228)||(3852121-3852179)
chr6 (118-208)||(4186390-4186482)
chr6 (150-227)||(19873120-19873196)
chr6 (150-227)||(22432249-22432325)
chr6 (150-227)||(22438799-22438875)
chr6 (27-204)||(15041465-15041644)
chr6 (165-216)||(18199473-18199523)
chr6 (178-227)||(19862978-19863027)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (1-231)||(21292858-21293090)
chr5 (1-231)||(23390384-23390617)
chr5 (1-231)||(22075018-22075252)
chr5 (1-231)||(8286730-8286964)
chr5 (3-231)||(25421532-25421763)
chr5 (1-231)||(24493569-24493801)
chr5 (3-211)||(25431414-25431625)
chr5 (3-231)||(9077952-9078183)
chr5 (67-231)||(21808343-21808510)
chr5 (1-231)||(13025311-13025543)
chr5 (1-231)||(13095495-13095727)
chr5 (81-231)||(21729033-21729185)
chr5 (5-228)||(24529223-24529449)
chr5 (114-224)||(37723910-37724020)
chr5 (18-231)||(1096467-1096683)
chr5 (133-231)||(21997555-21997655)
chr5 (135-231)||(36314577-36314675)
chr5 (159-231)||(19660884-19660956)
chr5 (115-231)||(21329500-21329618)
chr5 (115-215)||(20026942-20027046)
chr5 (27-227)||(22032323-22032520)
chr5 (27-227)||(18769919-18770118)
chr5 (1-96)||(22107261-22107357)
chr5 (114-215)||(22144065-22144168)
chr5 (159-227)||(22959581-22959649)
chr5 (116-227)||(21565546-21565659)
chr5 (59-178)||(18356367-18356488)
chr5 (159-231)||(21502205-21502277)
chr5 (59-131)||(23572180-23572252)
chr5 (19-228)||(22412187-22412388)
chr5 (82-228)||(29329934-29330081)
chr5 (133-212)||(26012056-26012137)
chr5 (133-228)||(11581265-11581361)
chr5 (82-228)||(264783-264930)
chr5 (82-228)||(10732955-10733102)
chr5 (82-228)||(20909012-20909159)
chr5 (82-228)||(39363384-39363531)
chr5 (59-178)||(20910745-20910866)
chr5 (19-212)||(18418599-18418793)
chr5 (159-231)||(19668898-19668970)
chr5 (133-212)||(20902075-20902155)
chr5 (133-228)||(39245136-39245232)
chr5 (82-228)||(42245380-42245527)
chr5 (82-228)||(36154798-36154942)
chr5 (158-215)||(22178269-22178326)
chr5 (133-228)||(2154680-2154776)
chr5 (169-228)||(20918052-20918110)
chr5 (82-228)||(29345980-29346127)
chr5 (178-228)||(38619434-38619484)
chr5 (133-225)||(18319100-18319193)
chr5 (178-227)||(23064512-23064561)
chr5 (180-228)||(10775790-10775838)
chr5 (133-228)||(31061068-31061164)
chr5 (82-228)||(29348453-29348600)
chr5 (82-228)||(29350926-29351073)
chr5 (82-228)||(32027393-32027540)
chr5 (135-231)||(40725853-40725951)
chr5 (162-216)||(15796434-15796487)
chr5 (150-212)||(26704090-26704151)
chr5 (161-215)||(26740697-26740750)
chr5 (150-212)||(26973823-26973884)
chr5 (161-210)||(26732884-26732932)
chr5 (153-204)||(21873277-21873327)
chr5 (178-228)||(20806854-20806904)
chr5 (162-216)||(23469818-23469871)
chr5 (185-215)||(27989004-27989034)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-231)||(51582-51812)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-228)||(5019-5246)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-231)||(4712-4944)
scaffold0358 (1-156)||(13-168)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-231)||(38801279-38801508)
chr1 (16-231)||(27250632-27250850)
chr1 (1-231)||(21026680-21026913)
chr1 (3-230)||(50210103-50210333)
chr1 (3-228)||(34509783-34510011)
chr1 (3-231)||(22532269-22532500)
chr1 (1-156)||(22354460-22354616)
chr1 (18-230)||(20135188-20135403)
chr1 (20-230)||(22468604-22468816)
chr1 (135-231)||(14295574-14295672)
chr1 (137-231)||(45574912-45575008)
chr1 (155-231)||(20847200-20847275)
chr1 (114-215)||(21896258-21896361)
chr1 (159-227)||(22921918-22921986)
chr1 (159-231)||(33681010-33681079)
chr1 (59-178)||(33797573-33797694)
chr1 (18-95)||(48603652-48603730)
chr1 (135-212)||(20918623-20918702)
chr1 (114-215)||(21861572-21861675)
chr1 (1-122)||(22356062-22356185)
chr1 (1-122)||(22357748-22357871)
chr1 (82-228)||(433012-433157)
chr1 (133-212)||(21754064-21754145)
chr1 (114-231)||(22237630-22237746)
chr1 (68-228)||(23593735-23593897)
chr1 (159-212)||(16758668-16758721)
chr1 (133-215)||(35261099-35261183)
chr1 (82-228)||(13988866-13989013)
chr1 (68-229)||(21840766-21840929)
chr1 (82-228)||(21923306-21923453)
chr1 (82-228)||(29776688-29776835)
chr1 (82-228)||(31612313-31612460)
chr1 (160-215)||(50614167-50614222)
chr1 (160-215)||(50621995-50622050)
chr1 (159-231)||(52928019-52928088)
chr1 (162-215)||(16368338-16368391)
chr1 (159-227)||(20248283-20248351)
chr1 (162-230)||(20454606-20454673)
chr1 (133-212)||(22123133-22123214)
chr1 (133-231)||(13212928-13213027)
chr1 (136-234)||(15860078-15860177)
chr1 (82-228)||(21475102-21475249)
chr1 (133-234)||(21342090-21342192)
chr1 (158-215)||(41050084-41050141)
chr1 (68-230)||(16361915-16362079)
chr1 (133-228)||(21346961-21347057)
chr1 (169-228)||(29298137-29298195)
chr1 (131-228)||(16275428-16275526)
chr1 (178-228)||(21707167-21707217)
chr1 (178-228)||(21711709-21711759)
chr1 (161-215)||(50686627-50686681)
chr1 (150-227)||(21714546-21714622)
chr1 (158-213)||(16093933-16093988)
chr1 (160-215)||(26064954-26065009)
chr1 (169-227)||(21161720-21161778)
chr1 (186-216)||(21533948-21533978)
chr1 (178-230)||(24783160-24783212)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (1-231)||(20698324-20698556)
chr3 (1-231)||(13442274-13442507)
chr3 (1-231)||(17487856-17488089)
chr3 (1-231)||(17499338-17499571)
chr3 (16-231)||(12399209-12399427)
chr3 (3-231)||(14972854-14973085)
chr3 (1-231)||(23083249-23083482)
chr3 (1-212)||(14576721-14576934)
chr3 (18-231)||(26686887-26687103)
chr3 (18-231)||(43840932-43841148)
chr3 (3-231)||(18438534-18438765)
chr3 (19-228)||(24153115-24153326)
chr3 (18-231)||(25476290-25476506)
chr3 (1-212)||(14572608-14572821)
chr3 (18-231)||(11424668-11424880)
chr3 (3-228)||(40213611-40213838)
chr3 (135-231)||(13210350-13210448)
chr3 (18-212)||(42386429-42386627)
chr3 (159-227)||(49668125-49668193)
chr3 (133-231)||(43550544-43550644)
chr3 (114-231)||(15470927-15471043)
chr3 (159-227)||(9512924-9512992)
chr3 (159-227)||(9520899-9520967)
chr3 (159-227)||(12174308-12174376)
chr3 (63-227)||(856140-856304)
chr3 (18-95)||(14179570-14179648)
chr3 (114-228)||(27165250-27165366)
chr3 (159-212)||(32307696-32307749)
chr3 (159-215)||(52523778-52523834)
chr3 (82-228)||(9707622-9707769)
chr3 (115-231)||(14234487-14234605)
chr3 (135-231)||(24340746-24340844)
chr3 (82-228)||(29172598-29172745)
chr3 (68-228)||(17672626-17672788)
chr3 (166-228)||(28194693-28194755)
chr3 (68-212)||(50242838-50242984)
chr3 (82-215)||(53070668-53070802)
chr3 (133-228)||(53301572-53301669)
chr3 (114-228)||(36166598-36166712)
chr3 (163-227)||(16097332-16097396)
chr3 (159-227)||(16103784-16103852)
chr3 (82-228)||(7781362-7781509)
chr3 (68-229)||(13544024-13544187)
chr3 (82-228)||(17463178-17463325)
chr3 (160-215)||(22110402-22110457)
chr3 (82-228)||(28848626-28848773)
chr3 (82-228)||(34159326-34159473)
chr3 (160-215)||(43925974-43926029)
chr3 (82-228)||(45606922-45607069)
chr3 (82-228)||(55476491-55476638)
chr3 (68-212)||(12567576-12567722)
chr3 (158-227)||(37251216-37251283)
chr3 (116-228)||(55500942-55501055)
chr3 (133-228)||(6469200-6469296)
chr3 (133-228)||(8499518-8499614)
chr3 (133-228)||(15977515-15977611)
chr3 (82-228)||(8899094-8899241)
chr3 (82-228)||(16454296-16454443)
chr3 (1-95)||(16796685-16796780)
chr3 (82-212)||(38961906-38962037)
chr3 (112-229)||(46822267-46822386)
chr3 (162-215)||(606378-606431)
chr3 (114-212)||(21618465-21618563)
chr3 (133-228)||(12119791-12119887)
chr3 (158-214)||(12377938-12377994)
chr3 (82-228)||(13151805-13151953)
chr3 (82-228)||(13154270-13154418)
chr3 (133-228)||(15412429-15412525)
chr3 (135-212)||(23274706-23274785)
chr3 (82-228)||(10247738-10247885)
chr3 (136-226)||(16282880-16282971)
chr3 (82-228)||(17446670-17446816)
chr3 (169-228)||(17737236-17737294)
chr3 (135-231)||(37642288-37642386)
chr3 (178-228)||(10556985-10557035)
chr3 (178-228)||(45577950-45578000)
chr3 (113-229)||(12511059-12511177)
chr3 (178-226)||(41123892-41123940)
chr3 (133-228)||(44494809-44494905)
chr3 (150-227)||(15878092-15878168)
chr3 (160-216)||(13919344-13919399)
chr3 (149-227)||(23077517-23077594)
chr3 (178-230)||(14665398-14665450)
chr3 (178-230)||(14668554-14668606)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-231)||(937-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-231)||(167867-168099)
scaffold0011 (1-231)||(51913-52146)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-231)||(13211-13444)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-231)||(1851-2084)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-231)||(1952-2185)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-231)||(3470-3703)
scaffold0292 (18-231)||(343-558)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (24-231)||(4849-5059)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-231)||(6009-6245)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-231)||(20910-21144)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (18-212)||(24206-24405)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (3-231)||(3041-3271)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-231)||(38761-38993)
scaffold0145 (22-231)||(32942-33153)
scaffold0145 (133-233)||(9744-9845)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (18-231)||(8438-8650)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (3-229)||(39479-39707)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (3-229)||(75105-75333)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (3-228)||(339840-340065)
scaffold0003 (59-178)||(71353-71474)
scaffold0003 (82-228)||(158465-158612)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (3-230)||(17105-17337)
scaffold0056 (169-215)||(79388-79433)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (114-230)||(174767-174883)
scaffold0021 (1-143)||(124675-124818)
scaffold0021 (161-231)||(121766-121835)
scaffold0021 (155-215)||(136414-136474)
scaffold0021 (155-215)||(145122-145182)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (3-224)||(25955-26179)
scaffold0122 (114-228)||(44709-44825)
scaffold0122 (3-79)||(33385-33461)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (18-231)||(25896-26111)
scaffold0026 (18-231)||(39858-40073)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (3-231)||(39913-40143)
scaffold0080 (158-215)||(19933-19990)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (3-228)||(22886-23113)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (30-230)||(3103-3306)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (95-231)||(28414-28552)
scaffold0046 (135-231)||(11292-11390)
scaffold0046 (135-231)||(1997-2095)
scaffold0046 (175-231)||(4552-4608)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-171)||(6669-6843)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (3-231)||(16490-16721)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-231)||(8479-8708)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (3-231)||(4508-4738)
scaffold0228 (3-231)||(12090-12320)
scaffold0228 (3-231)||(22042-22272)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (116-231)||(11447-11564)
scaffold0235 (1-40)||(11401-11440)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (59-231)||(32904-33077)
scaffold0120 (59-231)||(45928-46101)
scaffold0120 (23-231)||(16113-16323)
scaffold0120 (169-231)||(17389-17450)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (27-215)||(26840-27027)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (18-181)||(13141-13308)
scaffold0175 (135-231)||(34123-34221)
scaffold0175 (178-231)||(273-326)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (135-231)||(1092-1190)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (159-231)||(119875-119947)
scaffold0023 (114-227)||(100378-100493)
scaffold0023 (82-228)||(44454-44602)
scaffold0023 (160-227)||(40224-40291)
scaffold0023 (82-228)||(94411-94558)
scaffold0023 (68-212)||(17440-17586)
scaffold0023 (159-227)||(101503-101571)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (63-227)||(1881-2045)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (27-227)||(21721-21920)
scaffold0210 (27-227)||(29613-29812)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (114-215)||(1048-1151)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (114-227)||(2808-2923)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (159-231)||(6535-6607)
scaffold0621 (86-212)||(8485-8613)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (135-228)||(15664-15759)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (159-231)||(6611-6683)
scaffold0333 (159-231)||(13991-14063)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (159-231)||(6172-6244)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (159-227)||(19268-19336)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (159-231)||(15826-15898)
scaffold0020 (178-212)||(178913-178947)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (68-212)||(4710-4856)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (114-231)||(10543-10659)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (159-231)||(23932-24001)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (18-210)||(4545-4739)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (3-151)||(27912-28061)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (62-215)||(53498-53654)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (114-228)||(38704-38820)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (133-227)||(160688-160784)
scaffold0001 (68-212)||(501100-501246)
scaffold0001 (133-228)||(85646-85742)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (159-215)||(6828-6884)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (159-231)||(1083-1155)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (114-215)||(12584-12687)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (159-227)||(2694-2762)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (82-215)||(20394-20527)
scaffold0031 (67-231)||(128751-128917)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (59-131)||(12859-12931)
scaffold0029 (68-211)||(11305-11450)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (68-225)||(4300-4459)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-95)||(1052-1147)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (160-227)||(14747-14814)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (59-178)||(15362-15483)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (114-231)||(22672-22788)
scaffold0037 (68-228)||(82072-82234)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (133-212)||(32555-32636)
scaffold0034 (132-214)||(51903-51987)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (159-212)||(1101-1154)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (159-212)||(5662-5715)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (155-212)||(8119-8176)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (115-231)||(12942-13057)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (114-212)||(129924-130024)
scaffold0010 (155-215)||(60761-60821)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (114-215)||(13144-13247)
scaffold0357 (133-212)||(16121-16202)
scaffold0357 (160-215)||(2677-2732)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (133-228)||(16784-16880)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (159-227)||(45841-45909)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (167-227)||(132662-132722)
scaffold0028 (82-228)||(136680-136827)
scaffold0028 (82-228)||(139149-139296)
scaffold0028 (82-228)||(144087-144234)
scaffold0028 (159-212)||(62217-62270)
scaffold0028 (82-228)||(134211-134358)
scaffold0028 (82-228)||(141618-141765)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (115-231)||(12766-12884)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (135-231)||(11464-11562)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (68-229)||(10772-10935)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (82-228)||(13392-13539)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (82-228)||(20747-20894)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (135-231)||(18050-18148)
scaffold0247 (133-212)||(2195-2275)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (82-228)||(37821-37968)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (135-231)||(38279-38377)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (160-215)||(129021-129075)
scaffold0022 (162-215)||(78338-78391)
scaffold0022 (114-228)||(116430-116544)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (68-228)||(106-268)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (1-75)||(3640-3714)
scaffold0165 (1-75)||(7704-7778)
scaffold0165 (133-212)||(27770-27851)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (158-212)||(25125-25179)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (162-215)||(566-619)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (158-215)||(6332-6389)
scaffold0420 (165-215)||(13793-13843)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (114-212)||(10546-10646)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (159-227)||(133-201)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (18-156)||(3434-3574)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (167-227)||(32102-32162)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (164-231)||(4888-4954)
scaffold0395 (31-171)||(881-1021)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (82-228)||(13947-14094)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (3-74)||(10323-10394)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (158-208)||(38339-38389)
scaffold0139 (178-227)||(19980-20029)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (159-227)||(28818-28887)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (158-215)||(2691-2748)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (133-212)||(29948-30028)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (133-228)||(40400-40496)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (133-228)||(161156-161252)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (68-229)||(9241-9404)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (160-215)||(97021-97076)
scaffold0006 (160-215)||(106299-106354)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (169-215)||(11979-12024)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (112-215)||(8059-8166)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (150-227)||(23843-23919)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (158-215)||(267676-267733)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (133-228)||(4214-4310)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (68-230)||(12249-12413)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (158-212)||(103679-103733)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (82-228)||(12064-12205)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (178-227)||(36454-36503)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (150-227)||(69794-69870)
scaffold0004 (27-96)||(69930-70000)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (112-227)||(4804-4921)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (178-225)||(1393-1440)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (160-210)||(206575-206624)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (186-215)||(1874-1903)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-54)||(17875-17928)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (162-227)||(10575-10639)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (125-204)||(29117-29198)


Alignment Details
Target: scaffold0456 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10314 - 10544
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10314 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 10413  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10414 atttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatg 10513  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10514 agtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15353 - 15584
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15353 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaat 15452  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15453 atttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgca 15551  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15552 tgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7295
Alignment:
Q  63 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattg-at-attattatgtcatgttgttgtat 160  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||   ||||||||||     
T  7459 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttgtataattatcatg-attgttgttgtaa 7361  T
Q  161 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7360 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16199534 - 16199765
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16199534 taagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaat 16199633  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199634 atttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 16199733  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199734 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31971488 - 31971257
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31971488 taagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat 31971389  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31971388 atttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 31971290  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31971289 tgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 45130886 - 45131117
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45130886 taagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat 45130985  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45130986 aattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 45131084  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131085 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 117  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21389457  T
Q  118 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 217  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21389557  T
Q  218 gaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||    
T  21389558 gaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21395987  T
Q  118 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 217  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21396087  T
Q  218 gaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||    
T  21396088 gaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21790480  T
Q  118 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 217  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21790580  T
Q  218 gaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||    
T  21790581 gaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  31 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  131 aattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21918888 - 21919121
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaa- 99  Q
    ||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21918888 taagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat 21918987  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21918988 tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 21919086  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919087 catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 18879126 - 18879352
Alignment:
Q  2 aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaa 99  Q
    |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  18879126 aagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaa 18879223  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18879224 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcat 18879320  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18879321 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20536441 - 20536208
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  20536441 taagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa 20536342  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20536341 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg-ttgttatttaactaagctg 20536243  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20536242 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22626951 - 22626736
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  22626951 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaaga 22626852  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22626851 tgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22626753  T
Q  215 gttgaagatgatgatgt 231  Q
    | |||||||||||||||    
T  22626752 gatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18818297 - 18818530
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| |    
T  18818297 taagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagta 18818396  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    || ||| |||  ||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18818397 taattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctg 18818495  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18818496 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21923816 - 21924049
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  | |||| | | | |||||||||||||| |    
T  21923816 taagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagta 21923915  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    || ||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21923916 taattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctg 21924014  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21924015 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 28648934 - 28649164
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||     
T  28648934 agacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatg 28649033  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28649034 aatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgca 28649132  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28649133 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7372986 - 7372778
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  7372986 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagat 7372894  T
Q  118 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    | || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7372893 gatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7372795  T
Q  215 gttgaagatgatgatgt 231  Q
    | |||||||||||||||    
T  7372794 gatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406379
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23406597 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23406498  T
Q  117 tgtt--gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    || |  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406497 tgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23406399  T
Q  212 gatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23406398 gttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6759487 - 6759255
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat 100  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||  ||    
T  6759487 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattat 6759388  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
       ||||||  | |||||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6759387 gagtgtataattgagatgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgc 6759292  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 234  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6759291 atgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875065
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  116 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  214 tgttgaagatgatgatgt 231  Q
    || |||||||||||||||    
T  22875082 tgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 16092246 - 16092463
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 115  Q
    |||||||||||| || |||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||  | ||    
T  16092246 gttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgag 16092345  T
Q  116 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092346 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16092444  T
Q  213 atgttgaagatgatgatgt 231  Q
     || |||||||||||||||    
T  16092445 ttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866395
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140916
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23648786 - 23648554
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    |||||| |||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||      
T  23648786 taagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagtt 23648687  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |  ||| |||  |||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||    
T  23648686 ttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttaattaactaagttg 23648588  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  23648587 catgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  136 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  115 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  213 atgttgaagatgatgatgt 231  Q
     || | |||||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285616
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  21285616 g 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21249483 - 21249384
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249483 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21255321 - 21255222
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255321 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 14409459 - 14409606
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 14409557  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14409558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 25363028 - 25363123
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 95  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  25363028 taagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413462
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508199
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 224  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 20046261 - 20046357
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046261 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| | || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  212 gatg 215  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1484549 - 1484402
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1484451  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1484450 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 5853307 - 5853454
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 5853405  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5853406 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 17612133 - 17612231
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612133 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20403374 - 20403227
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20403374 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20403276  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20403275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22001900 - 22001753
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22001802  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22001801 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41598335 - 41598188
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||||||||||    
T  41598335 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 41598237  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41598236 -gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Original strand, 13597640 - 13597731
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 224  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597640 gatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 15203297 - 15203393
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203297 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4483427 - 4483281
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  4483427 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 4483329  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483328 -gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 18678102 - 18678221
Alignment:
Q  112 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 208  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 18678200  T
Q  209 taagatgttgaagatgatgat 229  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  18678201 taagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Original strand, 19801448 - 19801530
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801448 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  163 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  | ||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15070654 - 15070574
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070654 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290841
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32121853 - 32121734
Alignment:
Q  112 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 208  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattc 32121755  T
Q  209 taagatgttgaagatgatgat 229  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  32121754 taagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 17353983 - 17354060
Alignment:
Q  149 atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  17353983 atgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17046717 - 17046487
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17046717 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaat 17046618  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046617 gtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 17046518  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046517 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14053190 - 14053422
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14053190 taagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat 14053289  T
Q  101 atttgtatacataag-atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  14053290 atttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgca 14053389  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053390 tgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12902990 - 12902757
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  12902990 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataa 12902891  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12902890 tatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 12902792  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902791 catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7089110 - 7088877
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  7089110 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataa 7089011  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7089010 tatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 7088912  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7088911 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44053062 - 44052829
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaaga 98  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  44053062 taagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaaga 44052964  T
Q  99 atatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 195  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  44052963 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagct 44052865  T
Q  196 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  44052864 gcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22636650 - 22636437
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22636650 gttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22636552  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22636551 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22636453  T
Q  214 tgttgaagatgatgat 229  Q
    || |||||||||||||    
T  22636452 tgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 23374247 - 23374473
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |     
T  23374247 taagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaat 23374346  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23374347 tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 23374445  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatg 224  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23374446 catgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 231
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  22 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  121 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 218  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  219 aagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 16377413 - 16377639
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||     
T  16377413 agacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 16377512  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16377513 aatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatg 16377611  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  16377612 agtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7893933 - 7893703
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||   |||||||||| |||||| | | |||||||||||||| |    
T  7893933 taagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgat---tatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagta 7893837  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    || ||| |||  ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7893836 taattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctg 7893738  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7893737 catgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  50 tgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc 148  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  149 atgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16239858 - 16240090
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||| |    
T  16239858 taagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagta 16239957  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    || ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||    
T  16239958 taattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgc 16240056  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  16240057 atgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14038863 - 14038653
Alignment:
Q  19 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | ||||    
T  14038863 ttaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagat 14038764  T
Q  118 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    |||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14038763 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 14038665  T
Q  215 gttgaagatgat 226  Q
    | ||||||||||    
T  14038664 gatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  62 ttatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--g 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||  |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttg 6899964  T
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  112 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 208  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  209 taagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15551915 - 15551817
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551915 gatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3096373 - 3096293
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096373 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3096872 - 3096772
Alignment:
Q  5 acttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatattt 104  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3096872 acttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatattt 3096773  T
Q  105 g 105  Q
    |    
T  3096772 g 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22353984 - 22353835
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg-tata--ctgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  22353984 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt 22353885  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353884 -gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13956
Alignment:
Q  62 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 158  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 13899  T
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13900 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 227
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121917
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg----ttg 154  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||    |||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattattg 15121845  T
Q  155 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||  ||||||||| || |  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  15121846 ttgtaatctgcctatgctgat-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 210  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  211 agatgttgaagatgatga 228  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 178
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256227
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 156  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 43256204  T
Q  157 -gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  43256205 ggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288312
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243298
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 18215289 - 18215436
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  18215289 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 18215387  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18215388 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 44928894 - 44929042
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  44928894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt 44928993  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44928994 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 210  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  211 agatgttgaagatgatga 228  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 234  Q
    |  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||  || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12469
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12322 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12420  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12421 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6190564 - 6190479
Alignment:
Q  132 attgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    ||||||||| ||||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190564 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 15118367 - 15118514
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15118465  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15118466 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44615435 - 44615288
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  44615435 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44615337  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44615336 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52312657 - 52312510
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  52312657 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 52312559  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  52312558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| || ||||   |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 212
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  166 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  62 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 157  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||   |    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 95
Target Start/End: Original strand, 17047979 - 17048055
Alignment:
Q  20 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 95  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17047979 taattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 44773153 - 44773249
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44773153 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239533 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 50222354 - 50222501
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||  | ||||||||||    
T  50222354 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt 50222452  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222453 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcc 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |    ||      
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt----tgt- 12611011  T
Q  167 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611010 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 15355391 - 15355471
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355391 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15367789 - 15367690
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15367789 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15367692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15370117 - 15370018
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15370117 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15370020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15371301 - 15371202
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15371301 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15371204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15373582 - 15373483
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15373582 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15373485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15402802 - 15402703
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15402802 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15402705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970853
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970807 gc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16596746 - 16596686
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 193  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596746 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 215
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20309338 - 20309108
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20309338 taagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaat 20309239  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20309238 atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatg 20309139  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309138 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 38004 - 38235
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38004 taagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat 38103  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38104 gtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 38202  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38203 tgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23286094 - 23285865
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23286094 taagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaa 23285995  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23285994 catttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcat 23285897  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23285896 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22731122 - 22731355
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  22731122 taagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa 22731221  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22731222 tatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 22731320  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22731321 catgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23654274 - 23654507
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||    
T  23654274 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaa 23654373  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  23654374 tacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagctg 23654472  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23654473 catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 298702 - 298933
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |     
T  298702 taagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaat 298801  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298802 tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 298901  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  298902 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23060742 - 23060513
Alignment:
Q  4 gacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatat 102  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||     
T  23060742 gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23060644  T
Q  103 ttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
    ||  |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23060643 tttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcat 23060545  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23060544 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22738068 - 22738300
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  22738068 taagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa 22738167  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  22738168 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctg 22738265  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22738266 catgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076442
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23076460  T
Q  214 tgttgaagatgatgatgt 231  Q
     | |||||||||||||||    
T  23076459 ggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22337348 - 22337115
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  |    
T  22337348 taagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatta 22337249  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |   ||||||  | |||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22337248 tgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctg 22337150  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22337149 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  213 atgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23660238 - 23660023
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||  ||| |||  |||||    
T  23660238 gttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaaga 23660139  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  23660138 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagtt 23660040  T
Q  215 gttgaagatgatgatgt 231  Q
    | |||||||||||||||    
T  23660039 gatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 23708524 - 23708721
Alignment:
Q  19 ttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| ||   | |||    
T  23708524 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgaga 23708623  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708624 tgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22105560 - 22105412
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22105560 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 22105461  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22105460 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622327
Alignment:
Q  27 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatt-----tgtatacataagatgttg 121  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttg 40622221  T
Q  122 atgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 219  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |    
T  40622222 atgaattg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatta 40622319  T
Q  220 agatgatg 227  Q
    ||||||||    
T  40622320 agatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679589
Alignment:
Q  115 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7679702 gatgttgatgactt-acattgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 7679604  T
Q  213 atgttgaagatgatg 227  Q
     || | |||||||||    
T  7679603 ttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  212 gatg 215  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  155 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19671928 - 19671830
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671928 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26505526 - 26505379
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26505428  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26505427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26508004 - 26507857
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26507906  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26507905 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 21155075 - 21155219
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21155075 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21155173  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155174 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  167 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  32215021 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18809090 - 18808943
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18808992  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18808991 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 230
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23131009 - 23130862
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23131009 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23130911  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23130910 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23133476 - 23133329
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23133476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23133378  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23133377 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23135638 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 23709547 - 23709694
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23709547 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23709645  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23709646 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 23712028 - 23712175
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23712126  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23712127 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 34402537 - 34402684
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34402537 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34402635  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34402636 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39682460 - 39682313
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39682460 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39682362  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39682361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 571493 - 571397
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  571493 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6726091 - 6725995
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726091 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 27753808 - 27753728
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat 81  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27753808 taagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgat 27753728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24367921 - 24367790
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24367921 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24367823  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367822 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 32451948 - 32452033
Alignment:
Q  132 attgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    ||||||||| ||||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451948 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 45029869 - 45030016
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  | ||||| ||||    
T  45029869 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgtt 45029967  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029968 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43137395 - 43137301
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137395 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 24898210 - 24898358
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24898308  T
Q  179 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24898309 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 24900693 - 24900841
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24900791  T
Q  179 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24900792 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 24903170 - 24903318
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24903268  T
Q  179 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24903269 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 24905647 - 24905795
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24905745  T
Q  179 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24905746 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 24908122 - 24908270
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24908220  T
Q  179 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24908221 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 32039513 - 32039660
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||| |||||    
T  32039513 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt 32039611  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039612 -gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 225
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  161 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Original strand, 22799126 - 22799220
Alignment:
Q  112 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||   |||||||   ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22799126 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25616306 - 25616204
Alignment:
Q  112 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 208  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  25616306 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gtaatttaactaagttgcatgagtcagtc 25616208  T
Q  209 taag 212  Q
    ||||    
T  25616207 taag 25616204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 158
Target Start/End: Original strand, 23019706 - 23019752
Alignment:
Q  112 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23019706 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgt 23019752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23038107 - 23038048
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 210  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038107 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32297 - 32067
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32297 taagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat 32198  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32197 atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcat 32099  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32098 gagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16512 - 16282
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16512 taagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaat 16413  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16412 gtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatg 16313  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16312 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40443622 - 40443393
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40443622 taagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat 40443523  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40443522 atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcac 40443423  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443422 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27847721 - 27847951
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27847721 taagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaat 27847820  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27847821 gtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatg 27847920  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847921 aatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12699048 - 12698831
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  12699048 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 12698949  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698948 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12698850  T
Q  213 atgttgaagatgatgatgt 231  Q
     || |||||||||||||||    
T  12698849 ttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10589271 - 10589039
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10589271 taagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaat 10589172  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    ||||| | |   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10589171 atttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgttatttaactaagctgc 10589073  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10589072 atgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9509422 - 9509189
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  9509422 taagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaa 9509323  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9509322 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactg-ttgttatttaactaagctg 9509224  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9509223 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26212229 - 26211995
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |     
T  26212229 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaat 26212130  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26212129 tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttg 26212031  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 231  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26212030 tatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16386135 - 16386369
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |     
T  16386135 taagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaat 16386234  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    | |||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16386235 tgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctg 16386334  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386335 catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  19 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  118 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  216 ttgaagatgatga 228  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38227713 - 38227481
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| |    
T  38227713 taagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagta 38227614  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    || ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  38227613 taattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgc 38227515  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  38227514 atgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 3564254 - 3564482
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||  ||     
T  3564254 agacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatg 3564353  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3564354 aatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgca 3564452  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3564453 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495402
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200786
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13647476 - 13647325
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  13647476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 13647377  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647376 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  62 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 157  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 17137978 - 17138177
Alignment:
Q  27 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 126  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17137978 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 17138076  T
Q  127 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 224  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  17138077 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 17138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  136 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  112 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 209  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  210 aagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12187218 - 12187019
Alignment:
Q  27 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 126  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||   | ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12187218 aatctgtgaagctg-ataagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 12187120  T
Q  127 ttgaaattgatattattatgtcatg-ttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 222  Q
    ||| ||||| ||| ||||  ||||| |||   |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  12187119 ttg-aattggtataatta--tcatgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaaga 12187024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 210  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  211 agatgttgaagatgatga 228  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24704832 - 24704688
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 181  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||| ||    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gt 24704735  T
Q  182 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24704734 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 15754910 - 15755008
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754910 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24702385 - 24702238
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24702287  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702286 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18430859 - 18430709
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||  | ||||||||||    
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 18430761  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430760 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44116605 - 44116509
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44116605 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 456468 - 456321
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  456468 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 456370  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  456369 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11972643 - 11972496
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11972643 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11972545  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11972544 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 14949137 - 14949284
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 14949235  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14949236 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 15376728 - 15376875
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15376826  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15376827 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16232667 - 16232520
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16232667 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16232569  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16232568 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18640419 - 18640272
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18640321  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18640320 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 20385138 - 20385285
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20385236  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20385237 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 21189610 - 21189757
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21189708  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21189709 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275187
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275219 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32125638 - 32125491
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 32125540  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32125539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41523064 - 41522917
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41523064 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41522966  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41522965 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41525526 - 41525379
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41525526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41525428  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41525427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 178
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  113 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 227
Target Start/End: Original strand, 11393302 - 11393448
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11393302 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11393400  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11393401 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 17061981 - 17062077
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17061981 ttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16410155 - 16410059
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16410155 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  163 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27217007 - 27216860
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  27217007 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 27216909  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  27216908 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  155 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13869442 - 13869346
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869442 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 19486767 - 19486865
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486767 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 212
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 209  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Original strand, 18154882 - 18154943
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154882 tgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13831466 - 13831373
Alignment:
Q  136 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831466 atattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 212
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144139
Alignment:
Q  168 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 227
Target Start/End: Original strand, 14932747 - 14932851
Alignment:
Q  125 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  14932747 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaag 14932845  T
Q  222 atgatg 227  Q
    ||||||    
T  14932846 atgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 227
Target Start/End: Original strand, 15356182 - 15356286
Alignment:
Q  125 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  15356182 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaag 15356280  T
Q  222 atgatg 227  Q
    ||||||    
T  15356281 atgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 227
Target Start/End: Original strand, 15360296 - 15360400
Alignment:
Q  125 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  15360296 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaag 15360394  T
Q  222 atgatg 227  Q
    ||||||    
T  15360395 atgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 212
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898523
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 227
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 940 - 1170
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  940 taagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaat 1039  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1040 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatg 1139  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1140 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46995
Alignment:
Q  24 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgat 47103  T
Q  124 gaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47102 gaattgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagat 47003  T
Q  224 gatgatgt 231  Q
    ||||||||    
T  47002 gatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1519 - 1289
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1519 taagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaat 1420  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1419 gtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 1320  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1319 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7496 - 7266
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7496 taagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaat 7397  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7396 gtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatg 7297  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7296 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 228
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13728 - 13497
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13728 taagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat 13629  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13628 gtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 13530  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13529 tgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16920521 - 16920751
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16920521 taagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaat 16920620  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920621 atttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatg 16920720  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16920721 agtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 59 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22831735 - 22831503
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22831735 taagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaat 22831636  T
Q  101 atttgtatacat--aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831635 gtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 22831536  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22831535 tgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20360848 - 20361081
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20360848 taagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaa 20360947  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20360948 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 20361046  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  20361047 catgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11185735 - 11185517
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||||| | |||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11185735 taagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaat 11185636  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11185635 gtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatg 11185536  T
Q  201 agtcggtctaagatgttga 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11185535 agtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20638171 - 20638404
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  20638171 taagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaa 20638270  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    | |||| |||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20638271 tgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctg 20638369  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20638370 catgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29060755 - 29060540
Alignment:
Q  19 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||| | ||||    
T  29060755 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagat 29060656  T
Q  118 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagct 29060557  T
Q  215 gttgaagatgatgatgt 231  Q
    | |||||||||||||||    
T  29060556 gatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 19303446 - 19303661
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  19303446 gttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgag 19303544  T
Q  116 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303545 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 19303643  T
Q  214 tgttgaagatgatgatgt 231  Q
    || |||||||||||||||    
T  19303644 tgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16496396 - 16496244
Alignment:
Q  81 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 177  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  16496396 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 16496297  T
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496296 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 22780116 - 22780348
Alignment:
Q  2 aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||| ||    
T  22780116 aagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtat 22780215  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    | ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  22780216 aattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttg-ttgttatttaactaagctgc 22780314  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  22780315 atgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 17287701 - 17287917
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  | |||||||| | ||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  17287701 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 17287800  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17287801 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17287899  T
Q  214 tgttgaagatgatgatgt 231  Q
    || | |||||||||||||    
T  17287900 tgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20594004 - 20593773
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | || |||||||||||   ||     
T  20594004 agacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatg 20593905  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
     |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20593904 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgca 20593806  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  20593805 tgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 18409717 - 18409947
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||  ||     
T  18409717 agacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatg 18409816  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      || ||   | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18409817 aatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgca 18409915  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18409916 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 25629260 - 25629476
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  25629260 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 25629359  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||   ||||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25629360 tgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25629458  T
Q  214 tgttgaagatgatgatgt 231  Q
    || |||||||||||||||    
T  25629459 tgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  67 atgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatact 163  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttact 20076767  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496592
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29809003
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109157
Alignment:
Q  86 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 183  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 20109186  T
Q  184 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109185 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25656725 - 25656629
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25656725 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1561401 - 1561303
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561401 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  86 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 182  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctg-ttgtt 1595595  T
Q  183 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  1595594 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 2291195 - 2291342
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 2291293  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291294 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644339
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 210  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||   |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  211 ag 212  Q
    ||    
T  25644340 ag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 178
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416008
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 155  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  156 tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  212 gatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22782323 - 22782227
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22782323 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12742464 - 12742317
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12742464 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12742366  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12742365 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 18334607 - 18334754
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18334705  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18334706 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19005193 - 19005046
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19005193 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19005095  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19005094 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 19858934 - 19859081
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19859032  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19859033 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24422694 - 24422547
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24422596  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24422595 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33861941 - 33861794
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33861843  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33861842 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33864425 - 33864278
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33864327  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33864326 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  34963435 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541025 -gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8055176 - 8055029
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  8055176 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt 8055078  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055077 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 26924655 - 26924802
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  26924655 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 26924753  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924754 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18456866 - 18456732
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18456866 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18456768  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461892
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  166 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 208
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  118 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 208  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 8227534 - 8227632
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227534 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  184 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Original strand, 16448593 - 16448686
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448593 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 20556958 - 20557054
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20556958 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  118 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 208  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19873196 - 19873120
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873196 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22432325 - 22432249
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432325 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22438875 - 22438799
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438875 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Original strand, 15041465 - 15041644
Alignment:
Q  27 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatat-ttgtatacataagatgttgatga 125  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||| || | |||||  | |||||||||||| || | | ||| |||| |||||||||  |||    
T  15041465 aatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgtatgtgcattacttga-gattttattgaatacttaagatgttattga 15041563  T
Q  126 attgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 204  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||   |||||||   ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15041564 attgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactatt-gttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  165 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21292858 - 21293090
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21292858 taagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat 21292957  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaa-attgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21292958 aattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgc 21293056  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293057 atgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23390384 - 23390617
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  23390384 taagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa 23390483  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23390484 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 23390582  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23390583 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22075252 - 22075018
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |     
T  22075252 taagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaat 22075153  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22075152 tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 22075054  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 231  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22075053 aatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8286730 - 8286964
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  8286730 taagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa 8286829  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 195  Q
    | ||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8286830 tgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagct 8286928  T
Q  196 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8286929 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25421763 - 25421532
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    
T  25421763 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 25421664  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
     ||| |||  ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25421663 attgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgca 25421565  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25421564 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24493801 - 24493569
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |    
T  24493801 taagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagta 24493702  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    || ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  24493701 taattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgc 24493603  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24493602 atgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25431625 - 25431414
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    
T  25431625 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 25431526  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
     ||| | |  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25431525 attgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgca 25431427  T
Q  199 tgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||||    
T  25431426 tgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9078183 - 9077952
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||     
T  9078183 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatg 9078084  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9078083 aatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgca 9077985  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    || ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  9077984 tgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  67 atgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatac 162  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  163 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13025543 - 13025311
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaaga 98  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||     
T  13025543 taagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagt 13025445  T
Q  99 atatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  13025444 ataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctg 13025346  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13025345 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13095727 - 13095495
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaaga 98  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||     
T  13095727 taagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagt 13095629  T
Q  99 atatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  13095628 ataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctg 13095530  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13095529 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Original strand, 21729033 - 21729185
Alignment:
Q  81 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 177  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  21729033 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 21729132  T
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729133 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24529449 - 24529223
Alignment:
Q  5 acttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatt 103  Q
    ||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||       
T  24529449 acttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaa 24529350  T
Q  104 tgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
    ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24529349 tgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatg 24529251  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  24529250 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37724020 - 37723910
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37724020 agatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaaga 37723921  T
Q  214 tgttgaagatg 224  Q
    |||||||||||    
T  37723920 tgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1096683 - 1096467
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  1096683 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgaga 1096584  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1096583 tgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1096485  T
Q  214 tgttgaagatgatgatgt 231  Q
    || |||||||| ||||||    
T  1096484 tgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997655
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 21997653  T
Q  230 gt 231  Q
    ||    
T  21997654 gt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  115 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  213 atgttgaagatgatgatgt 231  Q
     || | |||||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 215
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  115 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt----tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 210  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  211 agatg 215  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22032520 - 22032323
Alignment:
Q  27 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 126  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22032520 aatctgtgaagctg-atacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 22032422  T
Q  127 ttgaaattgatattattatgtcatg-ttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 224  Q
    ||| ||||| ||| ||||  ||||| ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  22032421 ttg-aattggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 18769919 - 18770118
Alignment:
Q  27 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 126  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18769919 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 18770017  T
Q  127 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 224  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  18770018 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 18770115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 22107261 - 22107357
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat-gattatgcattacttgaa 96  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22107261 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22144168 - 22144065
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144168 agatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22144069  T
Q  212 gatg 215  Q
    ||||    
T  22144068 gatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565546
Alignment:
Q  116 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  214 tgttgaagatgatg 227  Q
    || ||| |||||||    
T  21565559 tgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tt 156  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  157 gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502277
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572180
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 131  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 23572180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  19 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   ||||||  | |||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagatg 22412298  T
Q  119 ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  22412297 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 22412199  T
Q  217 tgaagatgatga 228  Q
    | ||||||||||    
T  22412198 ttaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29330081 - 29329934
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29330081 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29329983  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29329982 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 26012056 - 26012137
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012056 ttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 11581265 - 11581361
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581265 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 264783 - 264930
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 264881  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  264882 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 10732955 - 10733102
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 10733053  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10733054 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20909159 - 20909012
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| ||    
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tt 20909062  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39363531 - 39363384
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39363531 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39363433  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39363432 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 178
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910866
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 155  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 20910843  T
Q  156 tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  20910844 tgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418599
Alignment:
Q  19 ttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatat-taaga 18418695  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39245232 - 39245136
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 42245380 - 42245527
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 42245478  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42245479 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 36154798 - 36154942
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||    |    
T  36154798 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----t 36154892  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154893 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154776
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29346127 - 29345980
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29346127 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29346029  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346028 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Original strand, 18319100 - 18319193
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319100 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31061164 - 31061068
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29348600 - 29348453
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29348600 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29348502  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29348501 c-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29351073 - 29350926
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29351073 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29350975  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29350974 c-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32027540 - 32027393
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  32027540 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt 32027442  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32027441 -gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40725951 - 40725853
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725951 gatattattatatcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26704151 - 26704090
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704151 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  161 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26973884 - 26973823
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973884 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 210
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  161 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 210  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21873327 - 21873277
Alignment:
Q  153 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 204  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873327 tgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 215
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  185 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51812 - 51582
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  51812 taagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggat 51713  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51712 atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 51613  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51612 agtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5019 - 5246
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5019 taagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaat 5118  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5119 gtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatg 5218  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5219 agtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4944 - 4712
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4944 taagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaat 4845  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4844 atttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgc 4746  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4745 atgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 168 - 13
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  168 taagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaat 69  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||    
T  68 atttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 38801279 - 38801508
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38801279 taagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaat 38801378  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 200  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801379 aattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 38801478  T
Q  201 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801479 agtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Original strand, 27250632 - 27250850
Alignment:
Q  16 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  27250632 aggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaa 27250731  T
Q  115 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250732 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27250830  T
Q  212 gatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  27250831 gttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21026913 - 21026680
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |     
T  21026913 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaat 21026814  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21026813 tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctg-ttgttatttaactaagctg 21026715  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21026714 catgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 50210103 - 50210333
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||     
T  50210103 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatg 50210202  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50210203 aatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 50210301  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50210302 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34510011 - 34509783
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||     
T  34510011 agacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatg 34509912  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34509911 aatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgca 34509813  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34509812 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22532500 - 22532269
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||     
T  22532500 agacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatg 22532401  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      || |||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  22532400 aatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgca 22532302  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  22532301 tgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22354460 - 22354616
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  22354460 taagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaa 22354559  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 156  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  22354560 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20135403 - 20135188
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||    
T  20135403 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaaga 20135304  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||     
T  20135303 tgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 20135205  T
Q  214 tgttgaagatgatgatg 230  Q
    || | |||||| |||||    
T  20135204 tgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  20 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  119 ttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  216 ttgaagatgatgatg 230  Q
     | |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295672
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Original strand, 45574912 - 45575008
Alignment:
Q  137 tattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Original strand, 20847200 - 20847275
Alignment:
Q  155 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20847200 ttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  212 gatg 215  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797573
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 155  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 33797596  T
Q  156 tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  33797595 tgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918623
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  212 gatg 215  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 22356062 - 22356185
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaaga 98  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  22356062 taagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga 22356161  T
Q  99 atatttgtatacataagatgttga 122  Q
    || |||| |||  || ||||||||    
T  22356162 atgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 22357748 - 22357871
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaaga 98  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  22357748 taagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga 22357847  T
Q  99 atatttgtatacataagatgttga 122  Q
    || |||| |||  || ||||||||    
T  22357848 atgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 433157 - 433012
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||        
T  433157 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---- 433062  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  433061 cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21754145 - 21754064
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754145 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237630
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  212 gatgttgaagatgatgatgt 231  Q
       |||||||||||||||||    
T  22237646 ---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Original strand, 35261099 - 35261183
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261099 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13989013 - 13988866
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13988915  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13988914 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 21923306 - 21923453
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21923404  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21923405 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29776835 - 29776688
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29776835 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29776737  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776736 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31612460 - 31612313
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  31612460 tatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 31612362  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31612361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 22123133 - 22123214
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123133 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 13212928 - 13213027
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  13212928 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 13213025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860177
Alignment:
Q  136 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtc 232  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtc 15860175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 21475102 - 21475249
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21475102 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21475200  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  21475201 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21342192 - 21342090
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  21342192 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 21342095  T
Q  230 gtcca 234  Q
    |||||    
T  21342094 gtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21347057 - 21346961
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347057 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 228
Target Start/End: Original strand, 16275428 - 16275526
Alignment:
Q  131 aattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16275428 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16275525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  161 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21714622 - 21714546
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714622 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161720
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||| |||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 216
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533978
Alignment:
Q  186 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20698324 - 20698556
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20698324 taagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat 20698423  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20698424 atttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgc 20698522  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20698523 atgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13442507 - 13442274
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  13442507 taagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa 13442408  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13442407 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-ttgttatttaactaagctg 13442309  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13442308 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17488089 - 17487856
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17488089 taagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaa 17487990  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17487989 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctg 17487891  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17487890 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17499571 - 17499338
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17499571 taagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaa 17499472  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17499471 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctg 17499373  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17499372 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12399427 - 12399209
Alignment:
Q  16 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatga-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||    
T  12399427 aggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 12399328  T
Q  115 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399327 gatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 12399229  T
Q  212 gatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  12399228 gttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14973085 - 14972854
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||     
T  14973085 agacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatg 14972986  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      |||||| || |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14972985 aatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgca 14972887  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14972886 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23083249 - 23083482
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||| | || | |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |    
T  23083249 taagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagta 23083348  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
     | ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23083349 aaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctg 23083447  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23083448 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14576721 - 14576934
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  14576721 taagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagta 14576820  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    || ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  14576821 taattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttga 14576919  T
Q  198 atgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||    
T  14576920 atgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26687103 - 26686887
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  26687103 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaaga 26687004  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26687003 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26686905  T
Q  214 tgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  26686904 tgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43841148 - 43840932
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  43841148 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 43841049  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  43841048 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 43840950  T
Q  214 tgttgaagatgatgatgt 231  Q
    || ||||||| |||||||    
T  43840949 tgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18438765 - 18438534
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||     
T  18438765 agacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatg 18438666  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      |||||| | ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18438665 aatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctaca 18438567  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18438566 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  19 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  118 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  216 ttgaagatgatga 228  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 25476290 - 25476506
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataag 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||   ||||||| | ||    
T  25476290 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatg-ttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgag 25476388  T
Q  116 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25476389 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaag 25476487  T
Q  213 atgttgaagatgatgatgt 231  Q
     || |||||||||||||||    
T  25476488 ttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14572821 - 14572608
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg-cattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||  || || |||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| |    
T  14572821 taagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagta 14572722  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    || ||| |||  |||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14572721 taattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgc 14572623  T
Q  198 atgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||    
T  14572622 atgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 11424668 - 11424880
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   || |||  | |||    
T  11424668 gttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga 11424767  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    |||||||   |||  ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11424768 tgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 11424863  T
Q  215 gttgaagatgatgatgt 231  Q
    | |||||||||||||||    
T  11424864 gatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 40213611 - 40213838
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |  ||     
T  40213611 agacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatg 40213710  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  40213711 aatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatg-ttgttatttaactaagctaca 40213808  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40213809 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 13210350 - 13210448
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210350 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42386627 - 42386429
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||   || |||  | ||    
T  42386627 gttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgag 42386528  T
Q  116 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386527 atgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 43550544 - 43550644
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550544 ttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 43550642  T
Q  230 gt 231  Q
    ||    
T  43550643 gt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  212 gatgttgaagatgatgatgt 231  Q
       |||||||||||||||||    
T  15470943 ---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  63 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 160  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 856206  T
Q  161 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856205 tctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27165366 - 27165250
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165366 agatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27165267  T
Q  212 gatgttgaagatgatga 228  Q
    | || | ||||||||||    
T  27165266 gttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 9707622 - 9707769
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  9707622 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 9707720  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  9707721 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  115 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  213 atgttgaagatgatgatgt 231  Q
     || | |||||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340844
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 29172598 - 29172745
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  29172598 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 29172696  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29172697 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  166 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242838
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
     | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 215
Target Start/End: Original strand, 53070668 - 53070802
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||   ||||||||  ||||||||||||    
T  53070668 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt 53070766  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 53301572 - 53301669
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301572 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  212 gatgttgaagatgatga 228  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  163 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 7781362 - 7781509
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  7781362 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 7781460  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7781461 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17463325 - 17463178
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17463227  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17463226 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28848725 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34159473 - 34159326
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34159375  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34159374 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 45606922 - 45607069
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  45606922 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 45607020  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45607021 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55476638 - 55476491
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  55476638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 55476540  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55476539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567576
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  116 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  213 atgttgaagatgatga 228  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 6469200 - 6469296
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6469200 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8499614 - 8499518
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499614 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15977611 - 15977515
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977611 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8899241 - 8899094
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  8899241 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 8899143  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  8899142 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 16454296 - 16454443
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16454296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16454394  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16454395 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16796780 - 16796685
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 95  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16796780 taagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 212
Target Start/End: Original strand, 38961906 - 38962037
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  38961906 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 38962004  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962005 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46822386 - 46822267
Alignment:
Q  112 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 208  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  46822386 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 46822288  T
Q  209 taagatgttgaagatgatgat 229  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  46822287 taagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 12119791 - 12119887
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119791 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 13151805 - 13151953
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13151903  T
Q  179 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13151904 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 13154270 - 13154418
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13154368  T
Q  179 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13154369 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15412525 - 15412429
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412525 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23274785 - 23274706
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274785 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 10247738 - 10247885
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  10247738 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 10247836  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247837 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 226
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282971
Alignment:
Q  136 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 226  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 17446670 - 17446816
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17446670 tatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17446768  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17446769 -gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 37642288 - 37642386
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642288 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12511177 - 12511059
Alignment:
Q  113 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 209  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  12511177 aagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattct 12511079  T
Q  210 aagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||| || | |||||| ||||    
T  12511078 aagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878168
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 23077517 - 23077594
Alignment:
Q  149 atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  23077517 atgttgttgtgatctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 937 - 1169
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  937 taagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataat 1036  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1037 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgc 1135  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1136 atgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 167867 - 168099
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  167867 taagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataat 167966  T
Q  101 atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  167967 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgc 168065  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  168066 atgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52146 - 51913
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| |    
T  52146 taagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagta 52047  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    || ||| |||  ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52046 taattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctg 51948  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  51947 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13444 - 13211
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13444 taagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaa 13345  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13344 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 13246  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13245 catgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2084 - 1851
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  2084 taagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa 1985  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1984 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 1886  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1885 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2185 - 1952
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  2185 taagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataa 2086  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    | |||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  2085 tgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctg 1987  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1986 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3703 - 3470
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  3703 taagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaa 3604  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  3603 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagcta 3505  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3504 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 558 - 343
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  558 gttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaaga 459  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    ||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  458 tgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 360  T
Q  215 gttgaagatgatgatgt 231  Q
    | | |||||||||||||    
T  359 gataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4849
Alignment:
Q  24 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||||     
T  5059 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgt 4960  T
Q  123 tgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4959 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttga 4861  T
Q  220 agatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||    
T  4860 agatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6009 - 6245
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  6009 taagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa 6108  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgt--ttgttatttaactaagc 194  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  6109 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagc 6208  T
Q  195 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6209 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21144 - 20910
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  21144 taagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaa 21045  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
     ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  21044 catttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctt 20945  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
     |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20944 tatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24405
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga-ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  24206 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 24305  T
Q  116 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 atgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 3041 - 3271
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||     
T  3041 agacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatg 3140  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcat 3239  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3240 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38993 - 38761
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |    
T  38993 taagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagta 38894  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 197  Q
    || ||| |||  |||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  38893 taattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgc 38795  T
Q  198 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  38794 atgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  22 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  121 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 218  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  219 aagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9744
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 9748  T
Q  230 gtcc 233  Q
    ||||    
T  9747 gtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8650
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  8438 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 8537  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8538 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8633  T
Q  215 gttgaagatgatgatgt 231  Q
    | |||||||||||||||    
T  8634 gatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39707 - 39479
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||     
T  39707 agacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatg 39608  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39607 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcat 39509  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39508 gagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 75105 - 75333
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||     
T  75105 agacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatg 75204  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  75205 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcat 75303  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  75304 gagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 339840 - 340065
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||     
T  339840 agacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatg 339939  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
      ||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  339940 aatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg--tgttatttaactaagctgcat 340036  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  340037 gagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71353
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 155  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 71376  T
Q  156 tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  71375 tgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 158465 - 158612
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  158465 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 158563  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  158564 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 17105 - 17337
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||     
T  17105 agacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatg 17204  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg-----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
      ||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17205 aatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 17303  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17304 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 174883 - 174767
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 213  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174883 agatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 174784  T
Q  214 tgttgaagatgatgatg 230  Q
    |||||||| ||||||||    
T  174783 tgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 124818 - 124675
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  124818 taagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaa 124719  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatt 143  Q
    |||||| |||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  124718 tatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  161 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  155 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  155 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 25955 - 26179
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||     
T  25955 agacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatg 26054  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||| | ||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26055 aatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 26153  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatg 224  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  26154 tgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 210  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  211 agatgttgaagatgatga 228  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 33385 - 33461
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg 79  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33385 agacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatg 33461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26111 - 25896
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |||    
T  26111 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 26012  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    ||||| | | ||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26011 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 25913  T
Q  215 gttgaagatgatgatgt 231  Q
    | ||||||| |||||||    
T  25912 gatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40073 - 39858
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  | |||    
T  40073 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 39974  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    ||||| | | ||| | ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  39973 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagtt 39875  T
Q  215 gttgaagatgatgatgt 231  Q
    | |||||||||||||||    
T  39874 gatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40143 - 39913
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    
T  40143 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 40044  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 199  Q
     |   |||  |||||||||  |||  || | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  40043 atcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcat 39945  T
Q  200 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  39944 gagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19990
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23113 - 22886
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    
T  23113 agacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 23014  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
     ||| |||  |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23013 attgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgca 22916  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22915 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  30 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat-gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 128  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  129 gaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 225  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  226 tgatg 230  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  95 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 191  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaacta 28454  T
Q  192 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28453 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11292
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1997
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  175 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6843 - 6669
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  6843 taagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataa 6744  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgt 171  Q
    | |||| |||  |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6743 tgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 16490 - 16721
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||     
T  16490 agacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 16589  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||| | ||||| || ||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16590 aatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgca 16688  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16689 tgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8708 - 8479
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaa 99  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||    ||||| | | |||||||||||||| |    
T  8708 taagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagta 8613  T
Q  100 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 196  Q
     | ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8612 cacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctg 8514  T
Q  197 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8513 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4738 - 4508
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||     
T  4738 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 4639  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4638 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gca 4541  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  4540 tgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12320 - 12090
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||     
T  12320 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 12221  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12220 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gca 12123  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  12122 tgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22272 - 22042
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||     
T  22272 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 22173  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 198  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22172 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gca 22075  T
Q  199 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  22074 tgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  116 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  213 atgttgaagatgatgatgt 231  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 11401 - 11440
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 40  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11401 taagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctg 11440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 231
Target Start/End: Original strand, 32904 - 33077
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 156  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  32904 tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 33002  T
Q  157 -gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33003 tgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46101 - 45928
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 156  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  46101 tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 46003  T
Q  157 -gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46002 tgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  23 ttataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttg 121  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||| || |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||   ||   ||||||| | ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  122 atgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 218  Q
     ||  ||| | |||||||||| || || || ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  219 aagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26840
Alignment:
Q  27 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 126  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 26929  T
Q  127 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  26928 ttg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13308 - 13141
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  13308 gttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 13209  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 181  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13208 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34221 - 34123
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34221 gatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1190
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100378
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  212 gatgttgaagatgatg 227  Q
    | || ||| |||||||    
T  100393 gttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt----gtatactgcctatgttgctgt 177  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44503 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 94558 - 94411
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 94460  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  94459 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17586
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540 gc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  63 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 160  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 1947  T
Q  161 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1946 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  27 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 126  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 21819  T
Q  127 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 224  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  21820 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 21917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  27 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 126  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 29711  T
Q  127 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 224  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  29712 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| | | | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  212 gatg 215  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2923
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  212 gatgttgaagatgatg 227  Q
    |||| ||| |||||||    
T  2908 gatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8485
Alignment:
Q  86 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 183  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  184 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15664
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4710
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10659
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  212 gatgttgaagatgatgatgt 231  Q
       |||||||||| ||||||    
T  10643 ---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4739 - 4545
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 116  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | | | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||  |||||    
T  4739 gttaattataatttgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaaga 4641  T
Q  117 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 210  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||| || ||    || ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4640 tgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28061 - 27912
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaata 101  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||     
T  28061 agacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatg 27962  T
Q  102 tttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 151  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  27961 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53654
Alignment:
Q  62 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 158  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 53597  T
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53598 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  212 gatgttgaagatgatga 228  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 160784 - 160688
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160784 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501100
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 85646 - 85742
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85646 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  212 gatg 215  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 215
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20527
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgttt 179  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||     
T  20394 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt- 20491  T
Q  180 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  67 atgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatac 162  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  || | |      
T  128917 atgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttt 128819  T
Q  163 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    |   | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgct-tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12859
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 131  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 12859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11305
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11350 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||  ||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 225  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 1052
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 95  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1147 taagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 178
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15483
Alignment:
Q  59 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 155  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 15460  T
Q  156 tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  15461 tgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22788
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  212 gatgttgaagatgatgatgt 231  Q
       ||||||| |||||||||    
T  22772 ---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82134 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32555
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32636 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 51903 - 51987
Alignment:
Q  132 attgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||   || ||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51903 attgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  155 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  115 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  213 atgttgaagatgatgatgt 231  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129924
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  129924 g 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  155 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  212 gatg 215  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16202
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16121 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16880 - 16784
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16880 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  167 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 136827 - 136680
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 136729  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  136728 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 139296 - 139149
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 139198  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  139197 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 144234 - 144087
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 144136  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  144135 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 134358 - 134211
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 134260  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  134259 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 141765 - 141618
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 141667  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  141666 -gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  115 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  213 atgttgaagatgatgatgt 231  Q
     || |||  ||||||||||    
T  12784 ttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11562 - 11464
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11562 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13440 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20747
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20796  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20795 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18148
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 2195 - 2275
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2195 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37821
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  37968 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 37870  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37869 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 38279 - 38377
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38279 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  212 gatgttgaagatgatga 228  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
       | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 3714 - 3640
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 75  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3714 taagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7704
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 75  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7778 taagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 27770 - 27851
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27770 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  165 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10546
Alignment:
Q  114 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 211  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  10546 g 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3574
Alignment:
Q  18 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  116 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 156  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  167 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Original strand, 881 - 1021
Alignment:
Q  31 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 129  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  ||  ||| |||  | |||| ||| ||| |||    
T  881 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg 980  T
Q  130 aaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgt 171  Q
     | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  981 ca-ttgatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13947
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14094 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13996  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13995 -gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 10394 - 10323
Alignment:
Q  3 agacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 74  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10394 agacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  159 atactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40496 - 40400
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40496 ttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 161156 - 161252
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161156 ttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   |||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 229  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  169 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  112 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 207  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  208 ctaagatg 215  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23919 - 23843
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23919 tgttgttgtaatctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4310 - 4214
Alignment:
Q  133 ttgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4310 ttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  68 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 163  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | || || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  164 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 230  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 212
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  158 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 212  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12064
Alignment:
Q  82 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 178  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  12205 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgtt 12107  T
Q  179 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 228  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12106 t-------aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 69870 - 69794
Alignment:
Q  150 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69870 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69930
Alignment:
Q  27 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta--tgcattacttgaa 96  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 4804 - 4921
Alignment:
Q  112 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 208  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||   ||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||  |     
T  4804 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgct-attattatttaactaagttgcatgagtcaata 4902  T
Q  209 taagatgttgaagatgatg 227  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  4903 taagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  178 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  160 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 210  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 215
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  186 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 17875 - 17928
Alignment:
Q  1 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 54  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17875 taagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  162 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 227  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29198 - 29117
Alignment:
Q  125 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29198 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University